View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8903_high_45 (Length: 217)

Name: NF8903_high_45
Description: NF8903
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8903_high_45
NF8903_high_45
[»] chr7 (108 HSPs)
chr7 (1-205)||(13919093-13919297)
chr7 (1-205)||(39721545-39721749)
chr7 (1-204)||(15083476-15083679)
chr7 (1-205)||(2832795-2832999)
chr7 (1-205)||(1859422-1859626)
chr7 (1-196)||(12705257-12705452)
chr7 (1-201)||(2530752-2530952)
chr7 (1-201)||(26291680-26291880)
chr7 (32-195)||(7519669-7519832)
chr7 (1-195)||(25927839-25928035)
chr7 (1-205)||(20487109-20487304)
chr7 (1-201)||(18424972-18425168)
chr7 (1-196)||(45170629-45170815)
chr7 (1-196)||(71365-71552)
chr7 (1-196)||(75474-75661)
chr7 (1-196)||(16907809-16907996)
chr7 (1-196)||(18278724-18278911)
chr7 (1-196)||(18282687-18282874)
chr7 (1-201)||(32425-32617)
chr7 (1-196)||(12717989-12718176)
chr7 (1-196)||(12722900-12723087)
chr7 (1-201)||(16113557-16113749)
chr7 (1-201)||(16116710-16116902)
chr7 (1-125)||(18301685-18301809)
chr7 (59-196)||(12714285-12714413)
chr7 (1-121)||(14257822-14257950)
chr7 (1-120)||(16585087-16585214)
chr7 (153-205)||(45170852-45170904)
chr7 (1-166)||(16579147-16579315)
chr7 (151-205)||(26291516-26291570)
chr7 (1-62)||(24274797-24274858)
chr7 (1-166)||(16586347-16586515)
chr7 (151-205)||(18278595-18278649)
chr7 (151-205)||(18282558-18282612)
chr7 (1-120)||(20585135-20585262)
chr7 (151-201)||(26291560-26291610)
chr7 (153-206)||(12717899-12717952)
chr7 (153-206)||(12722810-12722863)
chr7 (1-62)||(14257922-14257983)
chr7 (153-205)||(32261-32313)
chr7 (153-205)||(12705569-12705621)
chr7 (153-205)||(12714076-12714128)
chr7 (153-205)||(16116666-16116718)
chr7 (57-205)||(32300667-32300810)
chr7 (151-201)||(71547-71597)
chr7 (151-201)||(71627-71677)
chr7 (151-205)||(71707-71761)
chr7 (151-201)||(75656-75706)
chr7 (151-201)||(75736-75786)
chr7 (151-205)||(75816-75870)
chr7 (151-201)||(12705447-12705497)
chr7 (151-201)||(12714200-12714250)
chr7 (151-201)||(18278679-18278729)
chr7 (151-201)||(26291600-26291650)
chr7 (151-201)||(26291640-26291690)
chr7 (153-201)||(32305-32353)
chr7 (153-205)||(16113513-16113565)
chr7 (154-205)||(18424807-18424858)
chr7 (151-201)||(32345-32395)
chr7 (151-201)||(12705527-12705577)
chr7 (151-201)||(12714120-12714170)
chr7 (151-201)||(12717944-12717994)
chr7 (151-201)||(12722855-12722905)
chr7 (151-201)||(16908070-16908120)
chr7 (151-201)||(45170810-45170860)
chr7 (1-62)||(12466490-12466551)
chr7 (153-205)||(16908112-16908165)
chr7 (1-40)||(14933119-14933158)
chr7 (1-40)||(15356554-15356593)
chr7 (1-40)||(15360668-15360707)
chr7 (1-44)||(16461517-16461560)
chr7 (154-201)||(18424891-18424938)
chr7 (27-106)||(14933112-14933199)
chr7 (27-106)||(15356547-15356634)
chr7 (27-106)||(15360661-15360748)
chr7 (151-201)||(16907991-16908040)
chr7 (151-201)||(18278639-18278689)
chr7 (151-201)||(18282602-18282652)
chr7 (151-201)||(18282642-18282692)
chr7 (151-192)||(18424940-18424982)
chr7 (1-39)||(24274787-24274825)
chr7 (151-196)||(71587-71632)
chr7 (151-196)||(71667-71712)
chr7 (151-196)||(75696-75741)
chr7 (151-196)||(75776-75821)
chr7 (151-196)||(12705487-12705532)
chr7 (151-196)||(12714165-12714210)
chr7 (151-196)||(16908030-16908075)
chr7 (151-192)||(18424860-18424901)
chr7 (1-45)||(15605890-15605934)
chr7 (57-120)||(14183867-14183930)
chr7 (133-191)||(14257603-14257664)
chr7 (159-198)||(14933278-14933317)
chr7 (159-198)||(15356713-15356752)
chr7 (159-198)||(15360827-15360866)
chr7 (159-198)||(15360871-15360910)
chr7 (133-191)||(16461733-16461794)
chr7 (1-40)||(32300802-32300841)
chr7 (151-196)||(32390-32435)
chr7 (135-200)||(8852469-8852534)
chr7 (151-196)||(12714245-12714290)
chr7 (57-106)||(15082374-15082423)
chr7 (133-198)||(16461593-16461658)
chr7 (12-40)||(14183847-14183875)
chr7 (159-191)||(16578979-16579011)
chr7 (159-191)||(16584878-16584910)
chr7 (174-206)||(16586491-16586523)
chr7 (159-191)||(16586651-16586683)
[»] chr4 (85 HSPs)
chr4 (1-205)||(20160469-20160673)
chr4 (1-205)||(20157793-20157997)
chr4 (1-205)||(20163247-20163451)
chr4 (2-201)||(15224354-15224549)
chr4 (1-196)||(14954790-14954976)
chr4 (1-196)||(5757528-5757715)
chr4 (1-196)||(9555851-9556038)
chr4 (1-196)||(12487006-12487193)
chr4 (1-196)||(33741701-33741888)
chr4 (1-196)||(14758025-14758212)
chr4 (1-196)||(4561923-4562110)
chr4 (33-196)||(25689224-25689378)
chr4 (1-120)||(10712244-10712363)
chr4 (1-120)||(10926014-10926133)
chr4 (1-125)||(631351-631475)
chr4 (33-201)||(27533327-27533486)
chr4 (1-125)||(17048707-17048831)
chr4 (1-120)||(37018300-37018419)
chr4 (72-196)||(17807449-17807564)
chr4 (131-201)||(10712186-10712256)
chr4 (131-201)||(10925956-10926026)
chr4 (1-75)||(17809707-17809782)
chr4 (1-120)||(35812649-35812776)
chr4 (1-106)||(3484747-3484863)
chr4 (151-205)||(17807320-17807374)
chr4 (151-205)||(25689055-25689109)
chr4 (151-205)||(27533083-27533137)
chr4 (153-205)||(9555682-9555734)
chr4 (153-205)||(12486837-12486889)
chr4 (153-205)||(14758328-14758380)
chr4 (153-205)||(14955093-14955145)
chr4 (151-201)||(4562105-4562155)
chr4 (151-205)||(4562185-4562239)
chr4 (151-205)||(5757710-5757764)
chr4 (151-201)||(9555806-9555856)
chr4 (151-201)||(12486961-12487011)
chr4 (1-120)||(14548411-14548538)
chr4 (151-201)||(14758286-14758336)
chr4 (151-201)||(15224130-15224180)
chr4 (1-120)||(16997226-16997353)
chr4 (151-201)||(25689099-25689149)
chr4 (151-201)||(25689179-25689229)
chr4 (151-201)||(33741576-33741626)
chr4 (151-201)||(33741656-33741706)
chr4 (1-62)||(13592552-13592613)
chr4 (151-196)||(17807409-17807454)
chr4 (151-199)||(27533169-27533217)
chr4 (154-205)||(15224005-15224056)
chr4 (151-206)||(33741491-33741546)
chr4 (151-201)||(9555726-9555776)
chr4 (151-201)||(12486881-12486931)
chr4 (151-201)||(14954971-14955021)
chr4 (151-201)||(14955051-14955101)
chr4 (151-201)||(27533247-27533297)
chr4 (151-201)||(27533287-27533337)
chr4 (151-196)||(33741541-33741586)
chr4 (151-196)||(33741621-33741666)
chr4 (153-205)||(33741452-33741504)
chr4 (1-40)||(13592585-13592624)
chr4 (1-40)||(15042340-15042379)
chr4 (1-40)||(15112045-15112084)
chr4 (154-201)||(15224170-15224217)
chr4 (154-201)||(15224282-15224329)
chr4 (1-40)||(25090441-25090480)
chr4 (151-201)||(14758246-14758296)
chr4 (151-201)||(15224090-15224140)
chr4 (151-201)||(15224242-15224292)
chr4 (151-196)||(9555771-9555816)
chr4 (151-196)||(12486926-12486971)
chr4 (151-196)||(14955011-14955056)
chr4 (153-198)||(15224205-15224250)
chr4 (153-198)||(15224317-15224362)
chr4 (151-196)||(25689144-25689189)
chr4 (153-198)||(33185512-33185557)
chr4 (159-199)||(13592740-13592780)
chr4 (153-201)||(14758209-14758256)
chr4 (153-192)||(15224058-15224098)
chr4 (153-201)||(27533207-27533255)
chr4 (159-198)||(16997191-16997230)
chr4 (159-198)||(25090351-25090390)
chr4 (33-71)||(4561922-4561960)
chr4 (135-204)||(16997152-16997222)
chr4 (151-196)||(4562145-4562190)
chr4 (135-200)||(19561726-19561791)
chr4 (135-184)||(33185494-33185543)
[»] chr3 (140 HSPs)
chr3 (1-205)||(14664957-14665161)
chr3 (1-203)||(15464408-15464610)
chr3 (1-198)||(14668120-14668317)
chr3 (1-201)||(19774878-19775078)
chr3 (1-205)||(12339007-12339211)
chr3 (1-201)||(4589511-4589711)
chr3 (1-195)||(37440235-37440420)
chr3 (1-201)||(17317726-17317926)
chr3 (1-205)||(14670369-14670581)
chr3 (1-201)||(8489785-8489982)
chr3 (1-205)||(14681891-14682103)
chr3 (1-196)||(15964269-15964455)
chr3 (1-196)||(15968193-15968379)
chr3 (1-196)||(15972117-15972303)
chr3 (1-201)||(16750939-16751135)
chr3 (1-205)||(4107997-4108193)
chr3 (1-205)||(4111849-4112045)
chr3 (1-196)||(55022189-55022376)
chr3 (1-196)||(14498649-14498836)
chr3 (1-196)||(22320988-22321175)
chr3 (1-196)||(22336043-22336230)
chr3 (1-196)||(27410242-27410429)
chr3 (1-196)||(7109020-7109207)
chr3 (1-196)||(7112955-7113142)
chr3 (1-196)||(11069392-11069579)
chr3 (1-196)||(28949046-28949233)
chr3 (1-196)||(11166127-11166313)
chr3 (1-125)||(12852908-12853032)
chr3 (1-125)||(16795895-16796019)
chr3 (1-119)||(15616766-15616885)
chr3 (82-201)||(5220463-5220573)
chr3 (33-187)||(30065313-30065459)
chr3 (119-205)||(11301027-11301114)
chr3 (119-205)||(11854146-11854233)
chr3 (1-128)||(14440975-14441103)
chr3 (1-73)||(5222761-5222833)
chr3 (151-205)||(8489972-8490026)
chr3 (1-166)||(10543031-10543199)
chr3 (21-84)||(14067289-14067352)
chr3 (1-120)||(2842678-2842805)
chr3 (151-205)||(5220310-5220364)
chr3 (1-120)||(18700886-18701016)
chr3 (151-205)||(28948997-28949051)
chr3 (1-120)||(43890229-43890356)
chr3 (153-198)||(30065042-30065087)
chr3 (153-205)||(4589743-4589795)
chr3 (153-205)||(7108851-7108903)
chr3 (153-205)||(7112786-7112838)
chr3 (153-205)||(11069303-11069355)
chr3 (153-205)||(11166430-11166482)
chr3 (153-205)||(22320819-22320871)
chr3 (153-205)||(22335874-22335926)
chr3 (151-206)||(5220349-5220404)
chr3 (1-60)||(13520979-13521038)
chr3 (151-198)||(16751184-16751231)
chr3 (151-201)||(11166308-11166358)
chr3 (151-205)||(17318036-17318090)
chr3 (151-201)||(19774838-19774888)
chr3 (151-201)||(22320943-22320993)
chr3 (151-201)||(22335998-22336048)
chr3 (151-201)||(27410424-27410474)
chr3 (151-205)||(27410824-27410878)
chr3 (1-62)||(15565309-15565370)
chr3 (153-198)||(19774761-19774806)
chr3 (153-201)||(15964184-15964232)
chr3 (153-201)||(15968108-15968156)
chr3 (153-201)||(15972032-15972080)
chr3 (135-198)||(5214576-5214639)
chr3 (154-205)||(16751472-16751523)
chr3 (151-201)||(4589701-4589751)
chr3 (151-201)||(5220423-5220473)
chr3 (151-201)||(7108895-7108945)
chr3 (151-201)||(7108975-7109025)
chr3 (151-201)||(7112830-7112880)
chr3 (151-201)||(7112910-7112960)
chr3 (151-201)||(11069347-11069397)
chr3 (151-201)||(11166388-11166438)
chr3 (151-205)||(14498560-14498614)
chr3 (151-201)||(15964224-15964274)
chr3 (151-201)||(15968148-15968198)
chr3 (151-201)||(15972072-15972122)
chr3 (151-197)||(17317956-17318002)
chr3 (151-201)||(22320863-22320913)
chr3 (151-201)||(22335918-22335968)
chr3 (151-205)||(55022140-55022194)
chr3 (1-62)||(14441075-14441136)
chr3 (151-196)||(14498609-14498654)
chr3 (154-203)||(16751340-16751389)
chr3 (151-203)||(16751125-16751177)
chr3 (153-201)||(30065219-30065267)
chr3 (153-192)||(14067516-14067555)
chr3 (1-40)||(15565298-15565337)
chr3 (154-201)||(16751219-16751266)
chr3 (151-194)||(17317916-17317959)
chr3 (161-204)||(19774683-19774726)
chr3 (153-196)||(27410766-27410809)
chr3 (158-205)||(30065003-30065050)
chr3 (1-40)||(35353358-35353397)
chr3 (1-39)||(13543677-13543715)
chr3 (151-201)||(19774798-19774848)
chr3 (1-39)||(19884824-19884862)
chr3 (151-201)||(27410464-27410514)
chr3 (151-201)||(27410644-27410694)
chr3 (1-55)||(46821903-46821957)
chr3 (151-196)||(11166348-11166393)
chr3 (154-199)||(19774728-19774773)
chr3 (58-198)||(19884859-19885004)
chr3 (151-196)||(22320908-22320953)
chr3 (151-196)||(22335963-22336008)
chr3 (1-62)||(43890196-43890257)
chr3 (151-191)||(16751256-16751296)
chr3 (153-192)||(16751430-16751470)
chr3 (153-201)||(30065259-30065307)
chr3 (159-198)||(2842801-2842840)
chr3 (159-198)||(5214608-5214647)
chr3 (1-40)||(10562476-10562515)
chr3 (154-201)||(14067397-14067444)
chr3 (154-201)||(16751391-16751438)
chr3 (153-192)||(27410506-27410545)
chr3 (153-192)||(27410586-27410625)
chr3 (153-192)||(27410686-27410725)
chr3 (154-201)||(30065179-30065226)
chr3 (57-120)||(35353303-35353366)
chr3 (1-36)||(42353696-42353731)
chr3 (135-205)||(44269294-44269365)
chr3 (159-198)||(44269334-44269373)
chr3 (33-71)||(4589510-4589548)
chr3 (170-204)||(10543249-10543283)
chr3 (159-205)||(10562379-10562425)
chr3 (151-201)||(14067474-14067524)
chr3 (159-201)||(17318004-17318046)
chr3 (154-196)||(30065144-30065186)
chr3 (135-184)||(2842809-2842858)
chr3 (151-196)||(7108940-7108985)
chr3 (151-196)||(7112875-7112920)
chr3 (153-206)||(14067436-14067489)
chr3 (12-40)||(5214698-5214726)
chr3 (1-37)||(5214723-5214759)
chr3 (58-106)||(13543632-13543680)
chr3 (157-201)||(27410550-27410594)
[»] chr6 (135 HSPs)
chr6 (1-201)||(22074584-22074784)
chr6 (1-201)||(23414213-23414413)
chr6 (1-205)||(2076776-2076980)
chr6 (1-201)||(1643818-1644018)
chr6 (1-201)||(31478582-31478782)
chr6 (1-201)||(16623662-16623862)
chr6 (1-196)||(11566183-11566370)
chr6 (1-196)||(12619440-12619627)
chr6 (1-201)||(14471530-14471721)
chr6 (1-196)||(22862267-22862454)
chr6 (1-196)||(23394389-23394576)
chr6 (1-201)||(23989236-23989428)
chr6 (1-196)||(8243154-8243341)
chr6 (26-201)||(27556000-27556159)
chr6 (33-196)||(22948438-22948592)
chr6 (33-196)||(22952394-22952548)
chr6 (33-196)||(23870882-23871036)
chr6 (33-196)||(23874838-23874992)
chr6 (1-196)||(16759558-16759745)
chr6 (1-201)||(19869905-19870098)
chr6 (33-201)||(18918006-18918165)
chr6 (1-195)||(17742675-17742877)
chr6 (1-128)||(19656763-19656891)
chr6 (1-205)||(19774077-19774284)
chr6 (1-110)||(22805373-22805490)
chr6 (1-108)||(15705986-15706101)
chr6 (151-205)||(27555956-27556010)
chr6 (151-205)||(1643694-1643748)
chr6 (151-205)||(8243026-8243080)
chr6 (151-205)||(14471446-14471500)
chr6 (151-205)||(16623288-16623342)
chr6 (151-205)||(18918275-18918329)
chr6 (1-62)||(17742849-17742910)
chr6 (153-205)||(11566014-11566066)
chr6 (153-205)||(16759389-16759441)
chr6 (153-205)||(19869781-19869833)
chr6 (1-128)||(20182303-20182439)
chr6 (1-128)||(22153552-22153688)
chr6 (153-205)||(22862098-22862150)
chr6 (153-205)||(22948269-22948321)
chr6 (153-205)||(22952225-22952277)
chr6 (153-205)||(23394220-23394272)
chr6 (153-205)||(23870713-23870765)
chr6 (153-205)||(23874669-23874721)
chr6 (153-205)||(23989112-23989164)
chr6 (151-198)||(31478772-31478819)
chr6 (151-201)||(1643738-1643788)
chr6 (151-201)||(1643778-1643828)
chr6 (151-201)||(11566138-11566188)
chr6 (151-201)||(12619622-12619672)
chr6 (1-59)||(15705953-15706011)
chr6 (151-201)||(16623401-16623451)
chr6 (151-201)||(16759513-16759563)
chr6 (151-201)||(18952947-18952997)
chr6 (151-201)||(18952987-18953037)
chr6 (151-201)||(18953067-18953117)
chr6 (151-205)||(18953107-18953161)
chr6 (151-201)||(22862222-22862272)
chr6 (151-201)||(22948393-22948443)
chr6 (151-201)||(22952349-22952399)
chr6 (151-201)||(23394344-23394394)
chr6 (1-51)||(23538235-23538285)
chr6 (151-201)||(23870837-23870887)
chr6 (151-201)||(23874793-23874843)
chr6 (153-198)||(16623625-16623670)
chr6 (1-62)||(17105329-17105390)
chr6 (1-62)||(19656638-19656699)
chr6 (153-198)||(31478886-31478931)
chr6 (151-204)||(31479116-31479169)
chr6 (153-205)||(12619744-12619796)
chr6 (153-201)||(23401132-23401180)
chr6 (151-201)||(11566058-11566108)
chr6 (151-201)||(12619702-12619752)
chr6 (151-201)||(14471490-14471540)
chr6 (1-71)||(16759708-16759778)
chr6 (151-201)||(18953027-18953077)
chr6 (151-201)||(19869825-19869875)
chr6 (151-201)||(22862142-22862192)
chr6 (151-201)||(22948313-22948363)
chr6 (151-201)||(22952269-22952319)
chr6 (151-201)||(23394264-23394314)
chr6 (151-205)||(23401049-23401103)
chr6 (151-201)||(23870757-23870807)
chr6 (151-201)||(23874713-23874763)
chr6 (151-201)||(23989156-23989206)
chr6 (1-43)||(27126623-27126665)
chr6 (151-196)||(12619662-12619707)
chr6 (151-196)||(18918195-18918240)
chr6 (153-201)||(16623441-16623489)
chr6 (153-201)||(18918157-18918205)
chr6 (17-61)||(19656746-19656790)
chr6 (153-201)||(31478958-31479006)
chr6 (153-201)||(31479038-31479086)
chr6 (154-201)||(16623521-16623568)
chr6 (1-40)||(19656696-19656735)
chr6 (20-71)||(20182402-20182453)
chr6 (20-71)||(22153538-22153589)
chr6 (154-201)||(31478807-31478854)
chr6 (154-201)||(31478919-31478966)
chr6 (151-201)||(8243070-8243120)
chr6 (151-201)||(16623361-16623411)
chr6 (151-201)||(16623481-16623531)
chr6 (151-201)||(16759433-16759483)
chr6 (1-39)||(23992125-23992163)
chr6 (151-201)||(31478844-31478894)
chr6 (151-201)||(31479076-31479126)
chr6 (1-39)||(34963068-34963106)
chr6 (151-196)||(11566103-11566148)
chr6 (151-196)||(16759478-16759523)
chr6 (135-192)||(17742614-17742671)
chr6 (151-196)||(19869870-19869915)
chr6 (151-196)||(22862187-22862232)
chr6 (151-196)||(23394309-23394354)
chr6 (151-196)||(23401098-23401142)
chr6 (151-196)||(23989201-23989246)
chr6 (153-201)||(8243110-8243157)
chr6 (154-198)||(23401207-23401251)
chr6 (159-205)||(7825335-7825382)
chr6 (1-40)||(7825433-7825472)
chr6 (163-198)||(16623556-16623591)
chr6 (159-198)||(19656967-19657006)
chr6 (1-43)||(17105315-17105357)
chr6 (151-201)||(18918235-18918285)
chr6 (151-201)||(31478996-31479046)
chr6 (135-200)||(17319374-17319439)
chr6 (151-196)||(22948358-22948403)
chr6 (151-196)||(22952314-22952359)
chr6 (151-196)||(23870802-23870847)
chr6 (151-196)||(23874758-23874803)
chr6 (135-188)||(27126724-27126777)
chr6 (33-62)||(27416523-27416552)
chr6 (159-191)||(15706129-15706161)
chr6 (159-191)||(22805106-22805138)
chr6 (58-106)||(23992080-23992128)
chr6 (64-120)||(27126664-27126720)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (1-201)||(21828637-21828837)
chr8 (1-205)||(21410229-21410433)
chr8 (1-205)||(21804721-21804925)
chr8 (1-205)||(23913575-23913779)
chr8 (1-201)||(14398446-14398644)
chr8 (1-196)||(18863268-18863463)
chr8 (1-201)||(21386641-21386841)
chr8 (1-196)||(30940700-30940886)
chr8 (1-196)||(43251132-43251319)
chr8 (1-196)||(21977270-21977457)
chr8 (1-201)||(22111247-22111439)
chr8 (1-196)||(21973179-21973366)
chr8 (1-198)||(44385244-44385436)
chr8 (115-201)||(15923999-15924085)
chr8 (1-106)||(16413777-16413882)
chr8 (1-128)||(5760109-5760236)
chr8 (151-205)||(14398634-14398688)
chr8 (151-205)||(21386597-21386651)
chr8 (1-62)||(32121451-32121512)
chr8 (151-205)||(18863458-18863512)
chr8 (1-120)||(42819124-42819251)
chr8 (153-205)||(22111203-22111255)
chr8 (153-201)||(30940923-30940971)
chr8 (151-201)||(15924075-15924125)
chr8 (151-201)||(15924115-15924165)
chr8 (151-205)||(15924155-15924209)
chr8 (151-201)||(21973361-21973411)
chr8 (151-201)||(21977452-21977502)
chr8 (151-201)||(43251087-43251137)
chr8 (1-62)||(18833089-18833150)
chr8 (153-205)||(43250963-43251015)
chr8 (131-198)||(18832968-18833035)
chr8 (151-205)||(21973441-21973495)
chr8 (151-205)||(21977532-21977586)
chr8 (151-201)||(30940881-30940931)
chr8 (151-201)||(43251007-43251057)
chr8 (1-40)||(37515198-37515237)
chr8 (12-62)||(6102831-6102881)
chr8 (1-39)||(32121441-32121479)
chr8 (21-62)||(5760208-5760249)
chr8 (151-196)||(21973401-21973446)
chr8 (151-196)||(21977492-21977537)
chr8 (151-196)||(43251052-43251097)
chr8 (4-40)||(6102856-6102892)
chr8 (135-198)||(18832936-18832999)
chr8 (1-40)||(18833078-18833117)
chr8 (132-198)||(21399089-21399158)
chr8 (132-198)||(21793582-21793651)
chr8 (159-198)||(42819247-42819286)
chr8 (57-123)||(37515140-37515206)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (1-195)||(11230435-11230629)
chr5 (1-195)||(11224623-11224817)
chr5 (1-195)||(11220037-11220231)
chr5 (1-195)||(11228446-11228640)
chr5 (1-190)||(18355536-18355725)
chr5 (33-205)||(24767898-24768070)
chr5 (5-201)||(15237436-15237632)
chr5 (1-194)||(40724214-40724398)
chr5 (33-201)||(20911531-20911698)
chr5 (1-201)||(10752504-10752698)
chr5 (33-196)||(19473315-19473469)
chr5 (1-105)||(11226546-11226650)
chr5 (1-120)||(20295235-20295355)
chr5 (33-125)||(22108009-22108101)
chr5 (151-205)||(40724435-40724489)
chr5 (152-205)||(20911689-20911742)
chr5 (153-205)||(19473586-19473638)
chr5 (153-205)||(20295053-20295105)
chr5 (151-201)||(19473464-19473514)
chr5 (131-201)||(20295177-20295247)
chr5 (153-202)||(15237696-15237745)
chr5 (152-194)||(18355493-18355535)
chr5 (151-201)||(19473544-19473594)
chr5 (151-201)||(40724395-40724445)
chr5 (151-204)||(10752189-10752242)
chr5 (153-198)||(10752347-10752392)
chr5 (153-198)||(15237624-15237669)
chr5 (153-201)||(10752272-10752320)
chr5 (153-201)||(10752464-10752512)
chr5 (151-201)||(10752232-10752282)
chr5 (151-201)||(10752424-10752474)
chr5 (151-201)||(20295097-20295147)
chr5 (151-196)||(19473504-19473549)
chr5 (151-196)||(20295142-20295187)
chr5 (59-110)||(33896167-33896218)
chr5 (133-205)||(33896322-33896398)
chr5 (151-201)||(10752384-10752434)
chr5 (159-193)||(33896395-33896429)
chr5 (157-201)||(10752312-10752356)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (1-205)||(6489-6693)
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (1-201)||(1282696-1282896)
chr2 (1-203)||(31344444-31344645)
chr2 (1-205)||(9784314-9784518)
chr2 (1-196)||(30345614-30345800)
chr2 (1-196)||(41531603-41531789)
chr2 (1-196)||(24629077-24629264)
chr2 (1-196)||(27380030-27380217)
chr2 (1-196)||(27384076-27384263)
chr2 (1-196)||(24648676-24648863)
chr2 (1-196)||(27601113-27601300)
chr2 (1-206)||(10102251-10102442)
chr2 (1-83)||(12902114-12902196)
chr2 (1-62)||(32215413-32215474)
chr2 (1-120)||(17306187-17306314)
chr2 (1-120)||(36838904-36839031)
chr2 (153-205)||(24629381-24629433)
chr2 (153-205)||(27380254-27380306)
chr2 (153-205)||(27384300-27384352)
chr2 (153-205)||(27600984-27601036)
chr2 (153-205)||(30345917-30345969)
chr2 (151-205)||(12902285-12902339)
chr2 (151-201)||(24648631-24648681)
chr2 (151-201)||(27601068-27601118)
chr2 (151-201)||(30345795-30345845)
chr2 (151-201)||(41531784-41531834)
chr2 (151-196)||(10102628-10102673)
chr2 (153-201)||(10102710-10102758)
chr2 (153-205)||(24648507-24648559)
chr2 (151-201)||(24629259-24629309)
chr2 (151-201)||(24629339-24629389)
chr2 (151-201)||(24648551-24648601)
chr2 (151-201)||(27380212-27380262)
chr2 (151-201)||(27384258-27384308)
chr2 (151-201)||(30345875-30345925)
chr2 (135-184)||(357664-357713)
chr2 (151-206)||(10102548-10102603)
chr2 (153-196)||(12902227-12902270)
chr2 (1-40)||(24514974-24515013)
chr2 (1-40)||(28653727-28653766)
chr2 (154-196)||(10102511-10102553)
chr2 (151-201)||(10102668-10102718)
chr2 (1-39)||(32215446-32215484)
chr2 (151-196)||(24629299-24629344)
chr2 (151-196)||(24648596-24648641)
chr2 (151-196)||(30345835-30345880)
chr2 (151-206)||(10102427-10102482)
chr2 (159-198)||(17306152-17306191)
chr2 (57-120)||(24514919-24514982)
chr2 (159-198)||(28653817-28653856)
chr2 (135-205)||(28653825-28653896)
chr2 (159-198)||(36838869-36838908)
chr2 (151-201)||(27601028-27601078)
chr2 (57-106)||(24367393-24367442)
chr2 (135-184)||(36838851-36838900)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (1-205)||(11275-11478)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (1-205)||(114-319)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-205)||(36709-36913)
[»] scaffold0109 (6 HSPs)
scaffold0109 (1-196)||(36587-36782)
scaffold0109 (1-62)||(1076-1137)
scaffold0109 (151-205)||(36857-36911)
scaffold0109 (151-201)||(36817-36867)
scaffold0109 (151-201)||(36777-36827)
scaffold0109 (1-39)||(1109-1147)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (33-205)||(10395-10567)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (1-190)||(208211-208400)
scaffold0016 (152-205)||(208401-208454)
[»] chr1 (71 HSPs)
chr1 (1-201)||(20229605-20229805)
chr1 (1-201)||(21406664-21406864)
chr1 (1-199)||(33796830-33797027)
chr1 (1-201)||(39244517-39244717)
chr1 (1-201)||(39248072-39248272)
chr1 (1-201)||(41388617-41388813)
chr1 (1-149)||(41781896-41782044)
chr1 (1-196)||(1925752-1925938)
chr1 (1-196)||(20924766-20924952)
chr1 (1-196)||(1010044-1010231)
chr1 (1-198)||(22131478-22131669)
chr1 (1-200)||(48602796-48602989)
chr1 (1-120)||(16376056-16376176)
chr1 (1-119)||(52638930-52639049)
chr1 (1-128)||(23967335-23967470)
chr1 (1-120)||(42911750-42911877)
chr1 (1-195)||(48519783-48519974)
chr1 (1-62)||(48519946-48520007)
chr1 (131-201)||(16376164-16376234)
chr1 (151-205)||(20229795-20229849)
chr1 (151-205)||(21406620-21406674)
chr1 (145-203)||(41800899-41800957)
chr1 (153-205)||(1009875-1009927)
chr1 (153-205)||(1926055-1926107)
chr1 (15-106)||(14238730-14238832)
chr1 (153-205)||(20925069-20925121)
chr1 (153-205)||(52634946-52634998)
chr1 (151-198)||(41388862-41388909)
chr1 (151-201)||(1009999-1010049)
chr1 (151-201)||(1925933-1925983)
chr1 (151-201)||(20924947-20924997)
chr1 (151-201)||(52635070-52635120)
chr1 (152-205)||(33796784-33796837)
chr1 (153-198)||(39244709-39244754)
chr1 (153-198)||(39248264-39248309)
chr1 (153-205)||(16376306-16376358)
chr1 (151-203)||(41388803-41388855)
chr1 (154-205)||(39244742-39244793)
chr1 (154-205)||(39248297-39248348)
chr1 (154-205)||(41389190-41389241)
chr1 (151-201)||(1009919-1009969)
chr1 (151-201)||(1926013-1926063)
chr1 (151-201)||(20925027-20925077)
chr1 (151-201)||(41388934-41388984)
chr1 (154-203)||(41389058-41389107)
chr1 (150-195)||(48519679-48519724)
chr1 (1-40)||(19675540-19675579)
chr1 (154-201)||(41388897-41388944)
chr1 (1-39)||(14238749-14238787)
chr1 (151-201)||(16376264-16376314)
chr1 (151-201)||(41388974-41389024)
chr1 (151-201)||(52634990-52635040)
chr1 (151-196)||(1009964-1010009)
chr1 (151-196)||(1925973-1926018)
chr1 (151-196)||(16376224-16376269)
chr1 (57-126)||(20241555-20241624)
chr1 (151-196)||(20924987-20925032)
chr1 (151-196)||(52635035-52635080)
chr1 (153-192)||(41389016-41389056)
chr1 (153-192)||(41389148-41389188)
chr1 (135-205)||(20241489-20241560)
chr1 (1-40)||(20241616-20241655)
chr1 (154-201)||(41389109-41389156)
chr1 (135-205)||(42911675-42911746)
chr1 (159-198)||(42911715-42911754)
chr1 (159-198)||(48519812-48519851)
chr1 (158-196)||(52635115-52635153)
chr1 (57-110)||(4597107-4597160)
chr1 (135-200)||(20634944-20635009)
chr1 (158-198)||(4597165-4597205)
chr1 (158-198)||(20241529-20241569)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-205)||(20802-21010)
[»] scaffold0486 (3 HSPs)
scaffold0486 (1-195)||(9165-9360)
scaffold0486 (1-119)||(8117-8243)
scaffold0486 (151-201)||(9119-9169)
[»] scaffold0029 (9 HSPs)
scaffold0029 (1-206)||(79844-80050)
scaffold0029 (1-196)||(62206-62392)
scaffold0029 (1-196)||(66122-66308)
scaffold0029 (151-205)||(62427-62480)
scaffold0029 (151-205)||(66343-66396)
scaffold0029 (151-205)||(79725-79779)
scaffold0029 (153-201)||(66305-66353)
scaffold0029 (153-201)||(62389-62437)
scaffold0029 (154-201)||(79809-79856)
[»] scaffold0141 (3 HSPs)
scaffold0141 (1-196)||(14710-14896)
scaffold0141 (153-199)||(14933-14979)
scaffold0141 (151-201)||(14891-14941)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-149)||(190000-190148)
[»] scaffold0157 (5 HSPs)
scaffold0157 (1-196)||(33284-33471)
scaffold0157 (153-205)||(33588-33640)
scaffold0157 (151-201)||(33466-33516)
scaffold0157 (151-201)||(33546-33596)
scaffold0157 (151-196)||(33506-33551)
[»] scaffold0061 (4 HSPs)
scaffold0061 (1-196)||(67899-68086)
scaffold0061 (1-40)||(19663-19702)
scaffold0061 (1-120)||(19630-19757)
scaffold0061 (151-205)||(68081-68134)
[»] scaffold0372 (3 HSPs)
scaffold0372 (1-196)||(5697-5884)
scaffold0372 (151-205)||(5919-5973)
scaffold0372 (151-196)||(5879-5924)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (1-196)||(11743-11930)
scaffold0349 (153-205)||(11654-11706)
scaffold0349 (151-201)||(11698-11748)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (50-201)||(51300-51451)
scaffold0074 (153-198)||(51443-51488)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (1-140)||(73917-74056)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (1-196)||(59317-59504)
scaffold0028 (151-201)||(59499-59549)
scaffold0028 (151-201)||(59580-59630)
scaffold0028 (151-196)||(59660-59705)
scaffold0028 (151-196)||(59620-59665)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (1-198)||(8188-8379)
[»] scaffold0601 (2 HSPs)
scaffold0601 (4-125)||(8090-8211)
scaffold0601 (1-71)||(8054-8124)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-125)||(25194-25318)
scaffold0124 (154-194)||(25341-25381)
[»] scaffold0484 (2 HSPs)
scaffold0484 (1-128)||(241-368)
scaffold0484 (33-70)||(332-369)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (1-125)||(3115-3239)
scaffold0165 (1-125)||(7178-7302)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (1-125)||(7141-7273)
scaffold0278 (1-70)||(7237-7303)
[»] scaffold0292 (3 HSPs)
scaffold0292 (1-120)||(4329-4448)
scaffold0292 (1-62)||(4420-4481)
scaffold0292 (133-188)||(4113-4171)
[»] scaffold0525 (5 HSPs)
scaffold0525 (1-83)||(4467-4549)
scaffold0525 (151-205)||(4758-4812)
scaffold0525 (153-196)||(4700-4743)
scaffold0525 (153-201)||(4580-4628)
scaffold0525 (157-201)||(4664-4708)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (121-204)||(6335-6419)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (1-205)||(13930-14137)
[»] scaffold0207 (7 HSPs)
scaffold0207 (1-62)||(15558-15619)
scaffold0207 (1-62)||(15690-15751)
scaffold0207 (1-62)||(15657-15718)
scaffold0207 (1-62)||(15591-15652)
scaffold0207 (1-62)||(15624-15685)
scaffold0207 (1-52)||(15723-15774)
scaffold0207 (1-40)||(15756-15795)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (1-62)||(10664-10725)
scaffold0546 (1-39)||(10654-10692)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (1-62)||(12722-12783)
scaffold0494 (1-39)||(12755-12793)
[»] scaffold0205 (4 HSPs)
scaffold0205 (1-62)||(29259-29320)
scaffold0205 (135-198)||(29113-29176)
scaffold0205 (1-40)||(29248-29287)
scaffold0205 (159-198)||(29069-29108)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (1-62)||(19287-19348)
scaffold0203 (1-39)||(19320-19358)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (1-62)||(18076-18137)
scaffold0023 (1-39)||(18109-18147)
[»] scaffold0111 (4 HSPs)
scaffold0111 (1-120)||(20027-20154)
scaffold0111 (159-198)||(20150-20189)
scaffold0111 (64-110)||(7053-7099)
scaffold0111 (64-110)||(14172-14218)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (1-62)||(845-906)
scaffold0058 (131-198)||(993-1060)
scaffold0058 (4-62)||(881-939)
scaffold0058 (12-41)||(922-951)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (1-62)||(63467-63528)
scaffold0032 (4-39)||(63503-63538)
[»] scaffold1662 (2 HSPs)
scaffold1662 (1-62)||(646-707)
scaffold1662 (1-40)||(679-718)
[»] scaffold1633 (2 HSPs)
scaffold1633 (1-59)||(37-95)
scaffold1633 (1-43)||(20-62)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (119-200)||(13261-13334)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (1-40)||(10704-10743)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (12-59)||(20943-20990)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (1-40)||(102322-102361)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (1-40)||(28796-28835)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (57-97)||(116585-116625)
scaffold0034 (1-40)||(116617-116656)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (33-62)||(70809-70838)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (161-205)||(145608-145652)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 108)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 13919093 - 13919297
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13919093 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 13919192  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13919193 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 13919292  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  13919293 gatgt 13919297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39721749 - 39721545
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39721749 ttgttaatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 39721650  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39721649 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 39721550  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  39721549 gatgt 39721545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15083679 - 15083476
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15083679 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaaatatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 15083580  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15083579 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttattat 15083480  T
Q  201 gatg 204  Q
    ||||    
T  15083479 gatg 15083476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 2832795 - 2832999
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2832795 ttgttgatgaattatcatccatgatttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacc 2832894  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2832895 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaaaatattgattatgatatcgttatgttgttat 2832994  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  2832995 gatgt 2832999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 1859422 - 1859626
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1859422 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctacgagttgtcgagttgttttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 1859521  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1859522 tatgaaggttatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctat 1859621  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  1859622 gatgt 1859626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 12705257 - 12705452
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12705257 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 12705356  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  12705357 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 12705452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 2530752 - 2530952
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2530752 ttgttgatgaattatcatccatgaattgttaagttgttgatgaattatcatctaagagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 2530851  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2530852 catgaagattatacgatgtttatgatgtgaattataagatattgattatgatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgctatgttgttat 2530951  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  2530952 g 2530952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26291880 - 26291680
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26291880 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacc 26291781  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26291780 tacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgttgctatgttgtttaaggtgttgattatgatattgttatgttgctat 26291681  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  26291680 g 26291680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 195
Target Start/End: Original strand, 7519669 - 7519832
Alignment:
Q  32 agttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaa 131  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7519669 agttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaa 7519768  T
Q  132 ttatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7519769 ttatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 7519832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 25927839 - 25928035
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgtt--gatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagta 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25927839 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagtttttttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagta 25927938  T
Q  99 cctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 195  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25927939 cctatgaagattatatgatgtttatgacgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtctatgatattgattatgatattgttatgtt 25928035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20487304 - 20487109
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20487304 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 20487205  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||         | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20487204 tatgaagat---------tatatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttatctatgatattgattatgatattgttattttgttat 20487114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18425168 - 18424972
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18425168 ttgttgatgagttatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacc 18425069  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18425068 tacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgat----attattatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctat 18424973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 45170629 - 45170815
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45170629 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgttttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 45170728  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    || ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  45170729 tacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 45170815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 71365 - 71552
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  71365 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 71464  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  71465 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 71552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 75474 - 75661
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  75474 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 75573  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  75574 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 75661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 16907809 - 16907996
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907809 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 16907908  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16907909 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 16907996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18278911 - 18278724
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18278911 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 18278812  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18278811 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 18278724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18282874 - 18282687
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18282874 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 18282775  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18282774 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 18282687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32617 - 32425
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32617 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtac 32518  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtta 199  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32517 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctacgttgtttaaaatattgattatgatattgttatgttgcta 32427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12718176 - 12717989
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12718176 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtattgttaaagaagtac 12718077  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  12718076 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 12717989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12723087 - 12722900
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12723087 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtattgttaaagaagtac 12722988  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  12722987 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 12722900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16113749 - 16113557
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16113749 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtac 16113650  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtta 199  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||    
T  16113649 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgcta 16113559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16116902 - 16116710
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16116902 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtac 16116803  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtta 199  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||    
T  16116802 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgcta 16116712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18301809 - 18301685
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301809 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttaatgaattatcatctatgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacc 18301710  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatga 125  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||    
T  18301709 tatgaagattacacgatgttcatga 18301685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12714413 - 12714285
Alignment:
Q  59 ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgct 158  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12714413 ttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt---------gaattatatgatgttgactaaaatattgct 12714323  T
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714322 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 12714285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 14257950 - 14257822
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  14257950 ttgttgaggaattgtcatccatgagttgttaagttgttgacgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaat 14257851  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgttt 121  Q
    ||||| | |||||||||| || |||||||    
T  14257850 gaagtgcttatgaagattatatgatgttt 14257822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 16585214 - 16585087
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16585214 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaat 16585115  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  16585114 gaagtgcttatgaagattatatgatgtt 16585087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 45170852 - 45170904
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45170852 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 45170904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16579315 - 16579147
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||        |||||| ||||||||||||||||| |||||||||      
T  16579315 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgttgagttgtcttctacccaggtgttgttatc 16579216  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtt 166  Q
    ||||| | |||||||||| || |||| ||||||    |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  16579215 gaagtgcttatgaagattatatgatg-ttatga----agctatatgatgttgattatgatgttgttatgttgtt 16579147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26291570 - 26291516
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26291570 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttaagttgttatgatgt 26291516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 24274858 - 24274797
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24274858 ttgttgaggaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgt 24274797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 16586347 - 16586515
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||        |||||| ||||||||||||||||| |||||||||      
T  16586347 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgttgagttgtcttctacccaggtgttgttatc 16586446  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtt 166  Q
    ||||| |  ||||||||| || |||| ||||||    |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  16586447 gaagtgctgatgaagattatatgatg-ttatga----agctatatgatgttgattatgatgttgttatgttgtt 16586515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18278649 - 18278595
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18278649 atgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 18278595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18282612 - 18282558
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18282612 atgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 18282558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 20585262 - 20585135
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||        |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||     
T  20585262 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctatccacatgttgttaat 20585163  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  20585162 gaagtgcttatgaagattatatgatgtt 20585135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26291610 - 26291560
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26291610 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 26291560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12717952 - 12717899
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12717952 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgtc 12717899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12722863 - 12722810
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtc 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12722863 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgtc 12722810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 14257983 - 14257922
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14257983 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgaggaattgtcatccatgagttgt 14257922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32313 - 32261
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32313 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 32261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 12705569 - 12705621
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12705569 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 12705621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12714128 - 12714076
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12714128 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 12714076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16116718 - 16116666
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16116718 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 16116666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32300810 - 32300667
Alignment:
Q  57 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttg 156  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| ||||||    |  ||||||||||||| || |||||||    
T  32300810 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatacgatg-ttatga----agctatatgatgttgattatgatgttg 32300716  T
Q  157 ctatgttgtttaagatattgattatgatattg-ttatgttgttatgatgt 205  Q
     ||||||  ||| ||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  32300715 ttatgtt-attatgatgttgtttatgatattgattataatgttatgatgt 32300667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 71547 - 71597
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  71547 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 71597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 71627 - 71677
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  71627 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 71677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 71707 - 71761
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  71707 atgttgctacgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 71761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 75656 - 75706
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  75656 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 75706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 75736 - 75786
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  75736 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 75786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 75816 - 75870
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  75816 atgttgctacgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 75870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 12705447 - 12705497
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12705447 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 12705497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12714250 - 12714200
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12714250 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 12714200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18278729 - 18278679
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18278729 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 18278679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26291650 - 26291600
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26291650 atgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatg 26291600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26291690 - 26291640
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26291690 atgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatg 26291640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32353 - 32305
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32353 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 32305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16113565 - 16113513
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16113565 gttgctatgctgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 16113513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18424858 - 18424807
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18424858 ttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttaagttgttatgatgt 18424807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32395 - 32345
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32395 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 32345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 12705527 - 12705577
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12705527 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 12705577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12714170 - 12714120
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12714170 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 12714120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12717994 - 12717944
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12717994 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 12717944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12722905 - 12722855
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12722905 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 12722855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 16908070 - 16908120
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16908070 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 16908120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 45170810 - 45170860
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  45170810 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 45170860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 12466490 - 12466551
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||    
T  12466490 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgtggatgagttgtcatacatgagttgt 12466551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 16908112 - 16908165
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgttt-aagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16908112 gttgctatgttgttttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 16908165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 14933119 - 14933158
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14933119 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttga 14933158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 15356554 - 15356593
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15356554 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttga 15356593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 15360668 - 15360707
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15360668 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttga 15360707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 16461517 - 16461560
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaa 44  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16461517 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttaatgaa 16461560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18424938 - 18424891
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18424938 ttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatg 18424891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 106
Target Start/End: Original strand, 14933112 - 14933199
Alignment:
Q  27 tgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||        |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  14933112 tgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaataaagtacttatgaa 14933199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 106
Target Start/End: Original strand, 15356547 - 15356634
Alignment:
Q  27 tgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||        |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  15356547 tgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaataaagtacttatgaa 15356634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 106
Target Start/End: Original strand, 15360661 - 15360748
Alignment:
Q  27 tgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||        |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  15360661 tgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaataaagtacttatgaa 15360748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 16907991 - 16908040
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16907991 atgttgctacgttgtt-aagatattgattatgatattgttatgttgctatg 16908040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18278689 - 18278639
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18278689 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctatg 18278639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18282652 - 18282602
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18282652 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctatg 18282602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18282692 - 18282642
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18282692 atgttgctacgttgtttacgatattgattatgatattgctatgttgctatg 18282642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18424982 - 18424940
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatat-tgattatgatattgttat 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18424982 atgttgctatgttgtttaagatatatgattatgatattgttat 18424940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 24274825 - 24274787
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttg 39  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24274825 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttg 24274787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 71587 - 71632
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  71587 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 71632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 71667 - 71712
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  71667 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 71712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 75696 - 75741
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  75696 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 75741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 75776 - 75821
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  75776 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 75821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 12705487 - 12705532
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  12705487 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 12705532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12714210 - 12714165
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  12714210 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 12714165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 16908030 - 16908075
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  16908030 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 16908075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18424901 - 18424860
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttat 192  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18424901 atgttgctatgttatttaacatattgattatgatattgttat 18424860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 15605890 - 15605934
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaat 45  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15605890 ttgttgatgaattatcatccatgagtttttgagttgttgatgaat 15605934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 120
Target Start/End: Original strand, 14183867 - 14183930
Alignment:
Q  57 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  14183867 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 14183930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14257664 - 14257603
Alignment:
Q  133 tatatgatgttgactaagatgttgctatg---ttgtttaagatattgattatgatattgtta 191  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14257664 tatatgatgttgattatgatgttgttatgatgttgtttatgatattgattatgatattgtta 14257603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Original strand, 14933278 - 14933317
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14933278 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 14933317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Original strand, 15356713 - 15356752
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15356713 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 15356752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Original strand, 15360827 - 15360866
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15360827 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 15360866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Original strand, 15360871 - 15360910
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15360871 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 15360910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 191
Target Start/End: Original strand, 16461733 - 16461794
Alignment:
Q  133 tatatgatgttgactaagatgttgctatg---ttgtttaagatattgattatgatattgtta 191  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16461733 tatatgatgttgattatgatgttgttatgatgttgtttatgatattgattatgatattgtta 16461794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 32300841 - 32300802
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32300841 ttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgttga 32300802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32435 - 32390
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  32435 atgttgctatgttgtttaacatgttgattttgatactgttatgttg 32390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 8852469 - 8852534
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  8852469 tatgatgttgattatgatgttgttatgttgtttatgatgttgtttatgatgtgattatgttgttat 8852534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12714290 - 12714245
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  12714290 atgttgctatattgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 12714245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 106
Target Start/End: Original strand, 15082374 - 15082423
Alignment:
Q  57 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 106  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  15082374 agttgttgagttgtcttctatccatgtgttattaatgaagtacttatgaa 15082423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 198
Target Start/End: Original strand, 16461593 - 16461658
Alignment:
Q  133 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||||| || || | ||||||||    
T  16461593 tatatgatgttgattatgatgttgttatgatgtttatgatattgattataatgttatgatgttgtt 16461658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 40
Target Start/End: Original strand, 14183847 - 14183875
Alignment:
Q  12 ttgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14183847 ttgtcatccatgagttgttaagttgttga 14183875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16579011 - 16578979
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgtta 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16579011 atgttgtttatgatattgattatgatattgtta 16578979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16584910 - 16584878
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgtta 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16584910 atgttgtttatgatattgattatgatattgtta 16584878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 206
Target Start/End: Original strand, 16586491 - 16586523
Alignment:
Q  174 ttgattatgatattgttatgttgttatgatgtc 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16586491 ttgattatgatgttgttatgttgttatgatgtc 16586523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 191
Target Start/End: Original strand, 16586651 - 16586683
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgtta 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16586651 atgttgtttatgatattgattatgatattgtta 16586683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 85)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 20160469 - 20160673
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20160469 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgaattgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 20160568  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20160569 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 20160668  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  20160669 gatgt 20160673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 20157793 - 20157997
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20157793 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaataagtacc 20157892  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20157893 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactgagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 20157992  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  20157993 gatgt 20157997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 20163247 - 20163451
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20163247 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgggttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacc 20163346  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20163347 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgtttctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 20163446  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  20163447 gatgt 20163451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15224549 - 15224354
Alignment:
Q  2 tgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacct 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15224549 tgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacct 15224450  T
Q  102 atgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15224449 acgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatattg----ttatgttgctatgttgtttaacatcttgattatgatattgttacgttgctatg 15224354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 14954790 - 14954976
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954790 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctataagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 14954889  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    || ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14954890 tacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 14954976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 5757528 - 5757715
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757528 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 5757627  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5757628 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 5757715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9556038 - 9555851
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556038 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 9555939  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9555938 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 9555851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12487193 - 12487006
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12487193 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 12487094  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12487093 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 12487006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33741888 - 33741701
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33741888 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 33741789  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33741788 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 33741701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 14758025 - 14758212
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758025 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 14758124  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  14758125 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttg 14758212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 4561923 - 4562110
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4561923 ttgttgatgaattatcatccatgagttgtcaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 4562022  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| || |||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  4562023 ctacgaggattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 4562110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25689378 - 25689224
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||         ||||| |||    
T  25689378 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtaaat 25689288  T
Q  133 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25689287 tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 25689224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 10712363 - 10712244
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10712363 ttgttgatgaattatcatccacgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttttacccatgtgttgttaaagaagtacc 10712264  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  10712263 tatgaagattatacgatgtt 10712244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 10926133 - 10926014
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10926133 ttgttgatgaattatcatccacgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttttacccatgtgttgttaaagaagtacc 10926034  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  10926033 tatgaagattatacgatgtt 10926014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 631351 - 631475
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  631351 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttaatgaattatcatctatgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacc 631450  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatga 125  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||    
T  631451 tatgaagattatacgatgttcatga 631475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27533486 - 27533327
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaat 132  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||         |||||||||    
T  27533486 gttgtcgatgaattatcatccatgagttgtcgagttgcgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaat 27533396  T
Q  133 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27533395 tatatgatgttgactaaaatgttgctatgttgtttaagataatgaatatgatattgttatgttgctatg 27533327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 17048707 - 17048831
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17048707 ttgttgatgaattatcatccacgagttgttaagttgttaacgaattatcatctatgagttgctgagttgtattatacccatgtgttgttaaagaagtacc 17048806  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatga 125  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||    
T  17048807 tatgaagattatacgatgttcatga 17048831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 37018419 - 37018300
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||     
T  37018419 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccataagttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttcatgaagtact 37018320  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    |||||||||| || ||||||    
T  37018319 tatgaagattatatgatgtt 37018300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17807564 - 17807449
Alignment:
Q  72 ttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaaga 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |    
T  17807564 ttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattttacgatgt---------gaattatatgatgttgactaaaatattgctaagttgtttaaca 17807474  T
Q  172 tattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  17807473 tgttgattatgatattgttatgttg 17807449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10712256 - 10712186
Alignment:
Q  131 attatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10712256 attatacgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatattgttatg 10712186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10926026 - 10925956
Alignment:
Q  131 attatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10926026 attatacgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatattgttatg 10925956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 17809782 - 17809707
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttct 75  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17809782 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttct 17809707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 35812649 - 35812776
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||        |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  35812649 ttgttgatgagtcgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgaattgttaagttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaat 35812748  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  35812749 gaagtgcttatgaagattatatgatgtt 35812776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 3484863 - 3484747
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatga-----------gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgtt 89  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||           ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3484863 ttgttgatgaattatcatccatgagctgttaagttgttgttgaattatcatccatgagttgttaagttgttgttgagttgtcttctatccatgtgttgtt 3484764  T
Q  90 aaagaagtacctatgaa 106  Q
    || ||||||| ||||||    
T  3484763 aatgaagtacttatgaa 3484747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17807374 - 17807320
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17807374 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttaagttgttatgatgt 17807320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25689109 - 25689055
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25689109 atgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 25689055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27533137 - 27533083
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27533137 atgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattgttaagttgttatgatgt 27533083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9555734 - 9555682
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9555734 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 9555682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12486889 - 12486837
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12486889 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 12486837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 14758328 - 14758380
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14758328 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 14758380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 14955093 - 14955145
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14955093 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 14955145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 4562105 - 4562155
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4562105 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 4562155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 4562185 - 4562239
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4562185 atgttgctacgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 4562239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 5757710 - 5757764
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5757710 atgttgctacgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 5757764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9555856 - 9555806
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9555856 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 9555806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12487011 - 12486961
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12487011 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 12486961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 14548538 - 14548411
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||        |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  14548538 ttgttgatgagttgtcatccttgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgctaagttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaat 14548439  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    ||||| | |||||| ||| || ||||||    
T  14548438 gaagtgcttatgaaaattatatgatgtt 14548411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 14758286 - 14758336
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14758286 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 14758336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15224180 - 15224130
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15224180 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatg 15224130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 16997353 - 16997226
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatga--------gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||        ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  16997353 ttgttaatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgacatccatgagttgttaggttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaat 16997254  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  16997253 gaagtgcttatgaagattatatgatgtt 16997226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25689149 - 25689099
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25689149 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 25689099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25689229 - 25689179
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25689229 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 25689179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33741626 - 33741576
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33741626 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 33741576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33741706 - 33741656
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33741706 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 33741656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 13592552 - 13592613
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  13592552 ttgttgatgagtcgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt 13592613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17807454 - 17807409
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17807454 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 17807409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27533217 - 27533169
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27533217 atgttgctatgttgtttaacatattgatcatgatattgttatgttgtta 27533169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15224056 - 15224005
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15224056 ttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttaagttgttatgatgt 15224005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33741546 - 33741491
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtc 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  33741546 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtc 33741491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9555776 - 9555726
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9555776 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 9555726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12486931 - 12486881
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12486931 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 12486881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 14954971 - 14955021
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14954971 atgttgctactttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 14955021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 14955051 - 14955101
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14955051 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 14955101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27533297 - 27533247
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27533297 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatg 27533247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27533337 - 27533287
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27533337 atgttgctatgttgtttaacatattgatcatgatattgttatgttgctatg 27533287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33741586 - 33741541
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33741586 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 33741541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33741666 - 33741621
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33741666 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 33741621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33741504 - 33741452
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33741504 gttgctatgttgtctaagataatgattatgattttgttaagttgttatgatgt 33741452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 13592585 - 13592624
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13592585 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttga 13592624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 15042340 - 15042379
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15042340 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttga 15042379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 15112084 - 15112045
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15112084 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttga 15112045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15224217 - 15224170
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15224217 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatg 15224170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15224329 - 15224282
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15224329 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatg 15224282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 25090480 - 25090441
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25090480 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttga 25090441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 14758246 - 14758296
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14758246 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctatg 14758296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15224140 - 15224090
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15224140 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 15224090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15224292 - 15224242
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15224292 atgttgctatgttgtttaacatcttgattatgatattgttacgttgctatg 15224242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9555816 - 9555771
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  9555816 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 9555771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12486971 - 12486926
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  12486971 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 12486926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 14955011 - 14955056
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  14955011 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 14955056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15224250 - 15224205
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15224250 gttgctatgttatttaagataatgattatgatattgctatgttgtt 15224205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15224362 - 15224317
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15224362 gttgctatgttatttaagataatgattatgatattgctatgttgtt 15224317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25689189 - 25689144
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  25689189 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 25689144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33185557 - 33185512
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33185557 gttgttatgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 33185512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 199
Target Start/End: Original strand, 13592740 - 13592780
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtta 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13592740 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtta 13592780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Original strand, 14758209 - 14758256
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14758209 gttgctacgttgtt-aagatattgattatgatattgttatgttgctatg 14758256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15224098 - 15224058
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatat-tgattatgatattgttat 192  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15224098 gttgctatgttgtttaagatatatgattatgatattgttat 15224058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27533255 - 27533207
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  27533255 gttgctatgttgtttaagataatgaatataatattgttatgttgctatg 27533207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16997230 - 16997191
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16997230 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 16997191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25090390 - 25090351
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25090390 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 25090351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 71
Target Start/End: Original strand, 4561922 - 4561960
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc 71  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4561922 gttgttgatgaattatcatccatgagttgtcaagttgtc 4561960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16997222 - 16997152
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattg-ttatgttgttatgatg 204  Q
    |||||| |||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16997222 tatgatattgattatgatgttgttatgttgtttatgatgttgtttatgatattgattatgatgttatgatg 16997152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 4562145 - 4562190
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  4562145 atgttgctatgttatttaacatgttaattatgatattgttatgttg 4562190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 19561726 - 19561791
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  19561726 tatgatgttgattatgatgttgttatgttgtttatgatgttgtttatgatgtgattatgttgttat 19561791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33185543 - 33185494
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgat 184  Q
    |||||| |||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33185543 tatgatattgattatgatgttgttatgttgtttatgatattgattatgat 33185494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 140)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14665161 - 14664957
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665161 ttgttgatgaattatcattcatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 14665062  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665061 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 14664962  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  14664961 gatgt 14664957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15464610 - 15464408
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15464610 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctacgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 15464511  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15464510 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 15464411  T
Q  201 gat 203  Q
    |||    
T  15464410 gat 15464408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14668317 - 14668120
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668317 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttatcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 14668218  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14668217 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgatgtt 14668120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19775078 - 19774878
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19775078 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacc 19774979  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19774978 tacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctat 19774879  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  19774878 g 19774878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12339211 - 12339007
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12339211 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacc-atgtgttgttaaagaagtacc 12339113  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgttt-aagatattgattatgatattgttatgttgtta 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339112 tatgaagattttacgatgtttatgatgtgaattatataatgttgactaagatgtttctatgttgtttaaaggtattgattatgatattgttatgttgtta 12339013  T
Q  200 tgatgt 205  Q
    ||||||    
T  12339012 tgatgt 12339007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 4589511 - 4589711
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4589511 ttgttgatgaattatcatctatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacc 4589610  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  4589611 tacgaaggttatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttcactaagatgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttatgttgctat 4589710  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  4589711 g 4589711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 37440235 - 37440420
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37440235 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 37440334  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 195  Q
    |||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37440335 tatgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 37440420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 17317726 - 17317926
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  17317726 ttgttgatgaattatcatccatgaattgttaagtcgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatatgttgttaaagaagtacc 17317825  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
     | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  17317826 aacgaatattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgacaaagatgttgctatgttgtttaacatattggttatgatattgttatgttgctat 17317925  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  17317926 g 17317926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14670581 - 14670369
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgt--------cttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||        |||| |||||||||||||||||    
T  14670581 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgacgagttgtcatccatgagttgttgagttgttgagttgtcttcaacccatgtgttgttaaa 14670482  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttat 192  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14670481 gaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatatgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttatgatattgattatgatattgttat 14670382  T
Q  193 gttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||||||    
T  14670381 gttgttatgatgt 14670369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 8489785 - 8489982
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8489785 ttgttgatgaattttcatccatgagttgttaagttg---atgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 8489881  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8489882 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatactgattataatgttatgatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctat 8489981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14682103 - 14681891
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtc--------gagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682103 ttgttgatgaattgtcatgcatgagttgttaagttgttgacaagttgtcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 14682004  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttat 192  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14682003 gaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatatgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtctatgatattgattatgatattgttat 14681904  T
Q  193 gttgttatgatgt 205  Q
    ||| |||||||||    
T  14681903 gttcttatgatgt 14681891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15964455 - 15964269
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15964455 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 15964356  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    || ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  15964355 tacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 15964269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15968379 - 15968193
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15968379 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 15968280  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    || ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  15968279 tacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 15968193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15972303 - 15972117
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15972303 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 15972204  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    || ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  15972203 tacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 15972117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 16750939 - 16751135
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16750939 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcaatgaattatcatctatgagttgttaagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacc 16751038  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16751039 tacgaagattatacgatgttcatgatgtgaattatatgat----attattatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctat 16751134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 4107997 - 4108193
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4107997 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 4108096  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtta 199  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4108097 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctacgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgtta 4108187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 4111849 - 4112045
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4111849 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 4111948  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtta 199  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4111949 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctacgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgtta 4112039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 55022376 - 55022189
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55022376 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtac 55022277  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  55022276 ctacgaagattgtacg---------atgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 55022189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14498836 - 14498649
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14498836 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 14498737  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14498736 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 14498649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22321175 - 22320988
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321175 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 22321076  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22321075 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 22320988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22336230 - 22336043
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336230 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 22336131  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22336130 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 22336043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 27410242 - 27410429
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27410242 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 27410341  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27410342 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 27410429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7109207 - 7109020
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7109207 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtac 7109108  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7109107 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 7109020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7113142 - 7112955
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7113142 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtac 7113043  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7113042 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 7112955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11069579 - 11069392
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11069579 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 11069480  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  11069479 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgtcatgttg 11069392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 28949233 - 28949046
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28949233 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 28949134  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28949133 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgaccaaaattttgctatgttgtttaagatgttgattatgatactgttatgttg 28949046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 11166127 - 11166313
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11166127 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 11166226  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    |||  |||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  11166227 ctacaaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgatt-tgatattgttatgttg 11166313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 12852908 - 12853032
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12852908 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttaatgaattatcatctttgagtttcttagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 12853007  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatga 125  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||    
T  12853008 tatgaagattatacgatgttcatga 12853032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16796019 - 16795895
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16796019 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttattaatgaattatcatctatgagttgctgagttgtattctactcatgtgttgttaaagaagtacc 16795920  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatga 125  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||    
T  16795919 tatgaagattatacgatgttcatga 16795895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15616885 - 15616766
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15616885 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttatgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 15616786  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgt 119  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  15616785 ctacgaagattatacgatgt 15616766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5220573 - 5220463
Alignment:
Q  82 gtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5220573 gtgttgttaaagaagtacctatgaagattata---------tgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 5220483  T
Q  182 gatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
T  5220482 gatcttgttatgttgctatg 5220463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30065459 - 30065313
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaa 131  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||         ||||||||    
T  30065459 gttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagtggtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaa 30065369  T
Q  132 ttatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatatt 187  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30065368 ttatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatatt 30065313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 205
Target Start/End: Original strand, 11301027 - 11301114
Alignment:
Q  119 tttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgttt-aagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11301027 tttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgctgtttaaaggtattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 11301114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11854233 - 11854146
Alignment:
Q  119 tttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgttt-aagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11854233 tttatgatgagaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaaaggtattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 11854146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14441103 - 14440975
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatc-atctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  || ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |    
T  14441103 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatttgtcttctatccatgagttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaataaagtgc 14441004  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgt 128  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||    
T  14441003 ttatgaagattatacgatgtttatgatgt 14440975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 5222833 - 5222761
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtctt 73  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5222833 ttgttgataaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagtagtctt 5222761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 8489972 - 8490026
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8489972 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 8490026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 10543031 - 10543199
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatcta--------tgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |        | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  10543031 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccacgattcgttaaattgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaat 10543130  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtt 166  Q
    ||||| | |||||||||| || |||| ||||||    |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  10543131 gaagtgcttatgaagattatatgatg-ttatga----agctatatgatgttgattatgatgttgttatgttgtt 10543199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 84
Target Start/End: Original strand, 14067289 - 14067352
Alignment:
Q  21 atgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtg 84  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14067289 atgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagttgtcgagttgtgttctacccatgtg 14067352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 2842678 - 2842805
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||        |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  2842678 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgtaaagttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaat 2842777  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  2842778 gaagtgcttatgaagattatatgatgtt 2842805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5220364 - 5220310
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5220364 atgttgctatgttgtctaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 5220310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 18700886 - 18701016
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatga-----------gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgtt 89  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||           ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18700886 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgttgagttgtcttctacccatgtgttgtt 18700985  T
Q  90 aaagaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    || ||||| |  ||||||||| || ||||||    
T  18700986 aatgaagtgctcatgaagattatatgatgtt 18701016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28949051 - 28948997
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28949051 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatactgttatgttgttatgatgt 28948997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 43890229 - 43890356
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgag--------ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||        |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  43890229 ttgttgacgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcattcatgagtcgttaatttgttgagttgtcttctacccatgtgttgtttat 43890328  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  43890329 gaagtgcttatgaagattatatgatgtt 43890356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30065087 - 30065042
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30065087 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 30065042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 4589743 - 4589795
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4589743 gttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattgttaagttgttatgatgt 4589795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7108903 - 7108851
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7108903 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 7108851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7112838 - 7112786
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7112838 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 7112786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11069355 - 11069303
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11069355 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 11069303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 11166430 - 11166482
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11166430 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 11166482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22320871 - 22320819
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22320871 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 22320819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22335926 - 22335874
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22335926 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 22335874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5220404 - 5220349
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtc 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5220404 atgttgctatgttgtttaaaatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtc 5220349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 13520979 - 13521038
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt 60  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  13520979 ttgttgatgaattttcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtt 13521038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 16751184 - 16751231
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16751184 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgctatgttgtt 16751231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 11166308 - 11166358
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11166308 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 11166358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 17318036 - 17318090
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17318036 atgttgctatgttgtgaaagatattgattatgatattgttaagttgttatgatgt 17318090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19774888 - 19774838
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19774888 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatg 19774838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22320993 - 22320943
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22320993 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 22320943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22336048 - 22335998
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22336048 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 22335998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 27410424 - 27410474
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27410424 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 27410474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 27410824 - 27410878
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27410824 atgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattgttaagttgttaggatgt 27410878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 15565370 - 15565309
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  15565370 ttgttgatgaattgtcatccgtgagttgttaggttgttgatgaattgtcatccacgagttgt 15565309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19774806 - 19774761
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19774806 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgctatgttgtt 19774761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15964232 - 15964184
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15964232 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttctattgttatg 15964184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15968156 - 15968108
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15968156 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttctattgttatg 15968108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15972080 - 15972032
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15972080 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttctattgttatg 15972032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5214639 - 5214576
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||| |||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5214639 tatgatattgattatgatgttgttatgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 5214576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 16751472 - 16751523
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16751472 ttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttaagttgttatgatgt 16751523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 4589701 - 4589751
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4589701 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatg 4589751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5220473 - 5220423
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5220473 atgttgctatgttgtttaaaatattgattatgatcttgttatgttgctatg 5220423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7108945 - 7108895
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7108945 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 7108895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7109025 - 7108975
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7109025 atgttgctacgttgtttaaaatattgattatgatattgttatgttgctatg 7108975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7112880 - 7112830
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7112880 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 7112830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7112960 - 7112910
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7112960 atgttgctacgttgtttaaaatattgattatgatattgttatgttgctatg 7112910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11069397 - 11069347
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11069397 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 11069347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 11166388 - 11166438
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11166388 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 11166438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14498614 - 14498560
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14498614 atgttgctacgttgtttaagataatggttatgatattgttaagttgttatgatgt 14498560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15964274 - 15964224
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15964274 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 15964224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15968198 - 15968148
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15968198 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 15968148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15972122 - 15972072
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15972122 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 15972072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 197
Target Start/End: Original strand, 17317956 - 17318002
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgt 197  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17317956 atgtagctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgt 17318002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22320913 - 22320863
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22320913 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 22320863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22335968 - 22335918
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22335968 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 22335918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 55022194 - 55022140
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55022194 atgttgctacgttgtttaagataataattatgatattgttaagttgttatgatgt 55022140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 14441136 - 14441075
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14441136 ttgtcgatgagttgttatccatgagctgttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttgt 14441075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14498654 - 14498609
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14498654 atgttgctacattgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 14498609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 203
Target Start/End: Original strand, 16751340 - 16751389
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgat 203  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16751340 ttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttattatgat 16751389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 203
Target Start/End: Original strand, 16751125 - 16751177
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgat 203  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16751125 atgttgctatgttatttaacatgttgattatgatattgttatgttattatgat 16751177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30065267 - 30065219
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30065267 gttgctatgtcgtttaagatattgattatgatattgttatattgctatg 30065219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Original strand, 14067516 - 14067555
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttat 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14067516 gttgctatgttgcttaagatattgattatgatattgttat 14067555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 15565337 - 15565298
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15565337 ttgttgatgaattgtcatccacgagttgttaagttgttga 15565298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Original strand, 16751219 - 16751266
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16751219 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatg 16751266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 194
Target Start/End: Original strand, 17317916 - 17317959
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17317916 atgttgctatgttgtttaagatgctgattatgatattgttatgt 17317959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19774726 - 19774683
Alignment:
Q  161 gttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatg 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19774726 gttgtttaacatattgattatgatattgttaagttgttatgatg 19774683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 196
Target Start/End: Original strand, 27410766 - 27410809
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27410766 gttgctatgttgtttaacatattgattatgatattattatgttg 27410809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30065050 - 30065003
Alignment:
Q  158 tatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30065050 tatgttgtttaacatgttgattatgatattgttaagttgttatgatgt 30065003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 35353397 - 35353358
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35353397 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttga 35353358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 13543715 - 13543677
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttg 39  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13543715 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttg 13543677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19774848 - 19774798
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19774848 atgttgctatgttgtttaaaatgttgattatgatattgttacgttgctatg 19774798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 19884824 - 19884862
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttg 39  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19884824 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttg 19884862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 27410464 - 27410514
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27410464 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 27410514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 27410644 - 27410694
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27410644 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 27410694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 46821957 - 46821903
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctat 55  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  46821957 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttattgagttatcttctat 46821903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 11166348 - 11166393
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  11166348 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 11166393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19774773 - 19774728
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtta 199  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  19774773 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgtta 19774728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 198
Target Start/End: Original strand, 19884859 - 19885004
Alignment:
Q  58 gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacga---tgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgt 154  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||||||| || ||   |||||||||| |  ||  ||||||||||| || |||||    
T  19884859 gttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgttgtttatgatattgat--tatgatgttgattatgatgt 19884956  T
Q  155 tgct----atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    || |    |||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||    
T  19884957 tgtttatgatgttgtttatgatattgattatgatgttctgatgttgtt 19885004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22320953 - 22320908
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  22320953 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 22320908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22336008 - 22335963
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  22336008 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 22335963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 43890196 - 43890257
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  43890196 ttgttgatgagttgtcatccatggattgttaagttgttgacgagttgtcatccatgagttgt 43890257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 191
Target Start/End: Original strand, 16751256 - 16751296
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtta 191  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16751256 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgtta 16751296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Original strand, 16751430 - 16751470
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatat-tgattatgatattgttat 192  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16751430 gttgctatgttgtttaagatatatgattatgatattgttat 16751470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30065307 - 30065259
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  30065307 gttgctatgtcgtttaagatattgattatggtattgttacgttgctatg 30065259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Original strand, 2842801 - 2842840
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2842801 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 2842840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5214647 - 5214608
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5214647 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 5214608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 10562515 - 10562476
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10562515 ttgttgatgagttgtcatccatgagttattaagttgttga 10562476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Original strand, 14067397 - 14067444
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14067397 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 14067444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Original strand, 16751391 - 16751438
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16751391 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 16751438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Original strand, 27410506 - 27410545
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttat 192  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27410506 gttgctatgttgtttaagatatagattatgatatggttat 27410545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Original strand, 27410586 - 27410625
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttat 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27410586 gttgctatgttgtttaacatattgattatgatattattat 27410625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Original strand, 27410686 - 27410725
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttat 192  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27410686 gttgctatgttgtttaagatatagattatgatatggttat 27410725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30065226 - 30065179
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30065226 ttgctatgttgtttaacagattgattatgatattgttatattgctatg 30065179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 35353366 - 35353303
Alignment:
Q  57 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  35353366 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 35353303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 42353696 - 42353731
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttg 36  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42353696 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttg 42353731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44269365 - 44269294
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattg-ttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||| |||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  44269365 tatgatattgattatgatgttgttatgttgtttatgatgttgtttatgatattgattatgatgttatgatgt 44269294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 44269373 - 44269334
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44269373 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 44269334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 71
Target Start/End: Original strand, 4589510 - 4589548
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4589510 gttgttgatgaattatcatctatgagttgttaagttgtc 4589548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 204
Target Start/End: Original strand, 10543249 - 10543283
Alignment:
Q  170 gatattgattatgatattgttatgttgttatgatg 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10543249 gatattgattatgatgttgttatgttgttatgatg 10543283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10562425 - 10562379
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10562425 atgttgtttatgatgttgattatgatgttgttaagttgttatgatgt 10562379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 14067474 - 14067524
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14067474 atgttgctatgttgtctaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 14067524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 201
Target Start/End: Original strand, 17318004 - 17318046
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17318004 atgttgtttaagatgttggttatgatattgttatgttgctatg 17318046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30065186 - 30065144
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  30065186 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttg 30065144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 184
Target Start/End: Original strand, 2842809 - 2842858
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgat 184  Q
    |||||| |||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2842809 tatgatattgattatgatgttgttatgttgtttatgatattgattatgat 2842858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7108985 - 7108940
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  7108985 atgttgctatgttgtttaacatgttgattttgatactgttatgttg 7108940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7112920 - 7112875
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  7112920 atgttgctatgttgtttaacatgttgattttgatactgttatgttg 7112875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 206
Target Start/End: Original strand, 14067436 - 14067489
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtc 206  Q
    ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14067436 gttgctatgttctctaacatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtc 14067489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 5214726 - 5214698
Alignment:
Q  12 ttgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5214726 ttgtcatccatgagttgttaagttgttga 5214698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 5214759 - 5214723
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgt 37  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5214759 ttgttgatgagttgtcatccatgagttattaagttgt 5214723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13543680 - 13543632
Alignment:
Q  58 gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 106  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  13543680 gttgttgagttgtcttctatccatgtgtagttaatgaagtacttatgaa 13543632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 201
Target Start/End: Original strand, 27410550 - 27410594
Alignment:
Q  157 ctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27410550 ctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 27410594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 135)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 22074584 - 22074784
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074584 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttatcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 22074683  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074684 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 22074783  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  22074784 g 22074784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23414413 - 23414213
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414413 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 23414314  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414313 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 23414214  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  23414213 g 23414213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2076980 - 2076776
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2076980 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 2076881  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2076880 tatgaagattgcatgatgtttatgatgtgaattttatgatgttgactaagatgttgctatgttgtctatgatattgattatgatattgttatgttgttat 2076781  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  2076780 gatgt 2076776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1644018 - 1643818
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1644018 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacc 1643919  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1643918 tacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctat 1643819  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  1643818 g 1643818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 31478582 - 31478782
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  31478582 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtaca 31478681  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31478682 tacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctat 31478781  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  31478782 g 31478782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16623862 - 16623662
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16623862 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaaaaagtacc 16623763  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| |||    
T  16623762 tacgaaaattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgctgactaagatgttgctatgttgtttaacatgttgattacgatattgttacgttgctat 16623663  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  16623662 g 16623662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11566370 - 11566183
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11566370 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 11566271  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11566270 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 11566183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 12619440 - 12619627
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12619440 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 12619539  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12619540 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 12619627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14471721 - 14471530
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14471721 ttgttgatgaactatcatctatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtcgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 14471622  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    || ||||||| |||         ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14471621 tacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatattgactaagatgatgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctat 14471531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22862454 - 22862267
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22862454 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 22862355  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22862354 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 22862267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23394576 - 23394389
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23394576 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 23394477  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23394476 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 23394389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23989428 - 23989236
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989428 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 23989329  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtta 199  Q
    ||  ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  23989328 ctgcgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgcta 23989238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 8243341 - 8243154
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8243341 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 8243242  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||         |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  8243241 ctacgaagat---------tttacgatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttg 8243154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27556159 - 27556000
Alignment:
Q  26 ttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatga 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||         
T  27556159 ttgttaagttgatgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgttttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt----- 27556065  T
Q  126 tgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27556064 -----------tgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 27556000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22948592 - 22948438
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||         ||||| |||    
T  22948592 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtaaat 22948502  T
Q  133 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22948501 tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 22948438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22952548 - 22952394
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||         ||||| |||    
T  22952548 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtaaat 22952458  T
Q  133 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22952457 tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 22952394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23871036 - 23870882
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||         ||||| |||    
T  23871036 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtaaat 23870946  T
Q  133 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23870945 tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 23870882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23874992 - 23874838
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||         ||||| |||    
T  23874992 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtaaat 23874902  T
Q  133 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23874901 tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 23874838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16759745 - 16759558
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16759745 ttgtcgatgaattatcatccattagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 16759646  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  16759645 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatcatattcttatgttg 16759558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19870098 - 19869905
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttct-acccatgtgttgttaaagaagta 98  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||    
T  19870098 ttgttgatgaattatcatccacgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttatgttataacccatgtgttgttaaagaagta 19869999  T
Q  99 cctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  19869998 cctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgct 19869908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 201
Target Start/End: Original strand, 18918006 - 18918165
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaat 132  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||         |||||    
T  18918006 gttggtgatgaattatcatccatgggtgatcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatg---------tgaat 18918096  T
Q  133 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18918097 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 18918165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17742877 - 17742675
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtc--------gagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||         ||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  17742877 ttgttgatgaattgacatccatgagttgtaaagttgttgatgaattgtcctccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaat 17742778  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtt--tatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtt 190  Q
    ||||| | |||||||||| || ||||||  ||||||||   |||||  ||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  17742777 gaagtgcttatgaagattatatgatgttattatgatgttgtttata--atgttgattatgatgttgttatgttgtttatgatattgattatgacgttgtt 17742680  T
Q  191 atgtt 195  Q
    |||||    
T  17742679 atgtt 17742675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 19656763 - 19656891
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga--tgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagta 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  || | ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||     
T  19656763 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgctaagttgttgagttgtcttct-atccatgagttgttgagttgtcttctatctatgtgttgttaatgaagtg 19656861  T
Q  99 cctatgaagattgtacgatgtttatgatgt 128  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  19656862 cttatgaagattatacgatgtttatgatgt 19656891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 19774077 - 19774284
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19774077 ttgttgatgacttgtcatccatgagttgttaagttgttgacgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaat 19774176  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattg-tta 191  Q
    ||||| | |||||||||| || |||| ||||||    |  ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| |||    
T  19774177 gaagtgcttatgaagattatatgatg-ttatga----agctatatgatgttgattatgatgttgttatgttg-ttatgatgttgtttatgatattgatta 19774270  T
Q  192 tgttgttatgatgt 205  Q
    |  |||||||||||    
T  19774271 taatgttatgatgt 19774284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 22805490 - 22805373
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  22805490 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaat 22805391  T
Q  93 gaagtacctatgaagatt 110  Q
    ||||| | ||||||||||    
T  22805390 gaagtgcttatgaagatt 22805373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 15705986 - 15706101
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15705986 ttgttgatgagttgtcatccatgagtggttaagttgttgatgagttgtcatctatgagtcgttaagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaat 15706085  T
Q  93 gaagtacctatgaaga 108  Q
    ||||| | ||||||||    
T  15706086 gaagtgcttatgaaga 15706101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27556010 - 27555956
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556010 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 27555956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1643748 - 1643694
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1643748 atgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattgttaagttgttatgatgt 1643694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8243080 - 8243026
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8243080 atgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 8243026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14471500 - 14471446
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14471500 atgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattgttaagttgttatgatgt 14471446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16623342 - 16623288
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16623342 atgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttaagttgttatgatgt 16623288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 18918275 - 18918329
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18918275 atgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattgttaagttgttatgatgt 18918329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 17742910 - 17742849
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  17742910 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattgacatccatgagttgt 17742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11566066 - 11566014
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11566066 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 11566014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16759441 - 16759389
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16759441 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 16759389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19869833 - 19869781
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19869833 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 19869781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20182439 - 20182303
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg---------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||  |||         |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20182439 ttgttgatgaattgtcatccacgagttgttgagttgtcgatgaattgtcatacatgagttgttaaagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgtaaa 20182340  T
Q  92 agaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgt 128  Q
     ||||| | |||||||| | |||  ||||||||||||    
T  20182339 tgaagtgcttatgaagagtatacactgtttatgatgt 20182303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 22153552 - 22153688
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg---------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||  |||         |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22153552 ttgttgatgaattgtcatccacgagttgttgagttgtcgatgaattgtcatacatgagttgttaaagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgtaaa 22153651  T
Q  92 agaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgt 128  Q
     ||||| | |||||||| | |||  ||||||||||||    
T  22153652 tgaagtgcttatgaagagtatacactgtttatgatgt 22153688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22862150 - 22862098
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22862150 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 22862098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22948321 - 22948269
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22948321 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 22948269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22952277 - 22952225
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22952277 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 22952225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23394272 - 23394220
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23394272 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 23394220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23870765 - 23870713
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23870765 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 23870713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23874721 - 23874669
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23874721 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 23874669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23989164 - 23989112
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23989164 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 23989112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 31478772 - 31478819
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31478772 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgctatgttgtt 31478819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1643788 - 1643738
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1643788 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatg 1643738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1643828 - 1643778
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1643828 atgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatg 1643778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11566188 - 11566138
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11566188 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 11566138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 12619622 - 12619672
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12619622 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 12619672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 15705953 - 15706011
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagt 59  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  15705953 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagt 15706011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16623451 - 16623401
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16623451 atgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatg 16623401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16759563 - 16759513
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16759563 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 16759513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 18952947 - 18952997
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18952947 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatg 18952997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 18952987 - 18953037
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18952987 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatg 18953037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 18953067 - 18953117
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18953067 atgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatg 18953117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 18953107 - 18953161
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18953107 atgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattattaagttgttatgatgt 18953161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22862272 - 22862222
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22862272 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 22862222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22948443 - 22948393
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22948443 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 22948393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22952399 - 22952349
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22952399 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 22952349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23394394 - 23394344
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23394394 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 23394344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 23538285 - 23538235
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcat 51  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23538285 ttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgttgatgaattatcat 23538235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23870887 - 23870837
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23870887 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 23870837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23874843 - 23874793
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23874843 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 23874793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16623670 - 16623625
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16623670 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgctatgttgtt 16623625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 17105390 - 17105329
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||    
T  17105390 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgtcgatgagttggcatccatgagttgt 17105329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 19656638 - 19656699
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  19656638 ttgtcgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgatgatgaattctcatccatgagttgt 19656699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Original strand, 31478886 - 31478931
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31478886 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgctatgttgtt 31478931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 204
Target Start/End: Original strand, 31479116 - 31479169
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatg 204  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31479116 atgttgctatgttgtgtaagatgttgattatgatattgttaagttgttatgatg 31479169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 12619744 - 12619796
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12619744 gttgctatgttgtttaagataatgattatgattttgttaagttgttatgatgt 12619796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23401180 - 23401132
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23401180 gttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatg 23401132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11566108 - 11566058
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11566108 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 11566058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 12619702 - 12619752
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12619702 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 12619752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14471540 - 14471490
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14471540 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatgttgttatgttgctatg 14471490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 16759778 - 16759708
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc 71  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||  |||||||    
T  16759778 ttgttgatgaattatcatccattagctgttaagttgtcgatgaattatcatccattagttgttaagttgtc 16759708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 18953027 - 18953077
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18953027 atgttgctatgttgttaaagatgttgattatgatattgttatgttgctatg 18953077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19869875 - 19869825
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19869875 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 19869825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22862192 - 22862142
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22862192 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 22862142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22948363 - 22948313
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22948363 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 22948313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22952319 - 22952269
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22952319 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 22952269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23394314 - 23394264
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23394314 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 23394264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23401103 - 23401049
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23401103 atgttgctacgttgtttaacatattaattatgatattgttaagttgttatgatgt 23401049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23870807 - 23870757
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23870807 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 23870757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23874763 - 23874713
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23874763 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 23874713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23989206 - 23989156
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23989206 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 23989156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 27126623 - 27126665
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatga 43  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27126623 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatga 27126665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 12619662 - 12619707
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12619662 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 12619707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 18918195 - 18918240
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18918195 atgttgctatgttgtttaacatattgatcatgatattgttatgttg 18918240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16623489 - 16623441
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16623489 gttgctatgttatttaagataatgattatgatattgttatgttgctatg 16623441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Original strand, 18918157 - 18918205
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18918157 gttgctatgttgtttaagataatgaatatgatattgttatgttgctatg 18918205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 19656746 - 19656790
Alignment:
Q  17 atccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttg 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19656746 atccatgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttg 19656790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Original strand, 31478958 - 31479006
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31478958 gttgctatgttatttaagataatgattatgatattgttatgttgctatg 31479006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Original strand, 31479038 - 31479086
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31479038 gttgctatgttatttaagataatgattatgatattgttatgttgctatg 31479086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16623568 - 16623521
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16623568 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatg 16623521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 19656696 - 19656735
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19656696 ttgttgataaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 19656735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 20182453 - 20182402
Alignment:
Q  20 catgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  20182453 catgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccacgagttgttgagttgtc 20182402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 71
Target Start/End: Original strand, 22153538 - 22153589
Alignment:
Q  20 catgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  22153538 catgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccacgagttgttgagttgtc 22153589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Original strand, 31478807 - 31478854
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31478807 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatg 31478854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Original strand, 31478919 - 31478966
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  31478919 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatg 31478966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8243120 - 8243070
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8243120 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctatg 8243070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16623411 - 16623361
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16623411 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 16623361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16623531 - 16623481
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16623531 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 16623481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16759483 - 16759433
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16759483 atgttgctacgttgtttaagacattgattatgatattgttacgttgctatg 16759433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 23992163 - 23992125
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttg 39  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23992163 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttg 23992125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 31478844 - 31478894
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  31478844 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 31478894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 31479076 - 31479126
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  31479076 atgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgatatgttgctatg 31479126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 34963106 - 34963068
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttg 39  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34963106 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttg 34963068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11566148 - 11566103
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  11566148 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 11566103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16759523 - 16759478
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  16759523 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 16759478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17742671 - 17742614
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttat 192  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17742671 tatgatgttgattatgacgttgttatgttgtttatgatattgattatgatgttgttat 17742614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19869915 - 19869870
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  19869915 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 19869870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22862232 - 22862187
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  22862232 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 22862187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23394354 - 23394309
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  23394354 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 23394309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23401142 - 23401098
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23401142 atgttgctatgttgtttaagata-tggttatgatattgttatgttg 23401098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23989246 - 23989201
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  23989246 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 23989201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8243157 - 8243110
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8243157 gttgctacgttgtt-aagatattgattatgatattgttatgttgctatg 8243110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23401251 - 23401207
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  23401251 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgtt 23401207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7825382 - 7825335
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg-ttatgatgt 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7825382 atgttgtttatgatattgattatgattttgttatgttgcttatgatgt 7825335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 7825472 - 7825433
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7825472 ttgttgatgagttgtcatccacgagttgttaagttgttga 7825433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16623591 - 16623556
Alignment:
Q  163 tgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16623591 tgtttaagatattgattatgatattgctatgttgtt 16623556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Original strand, 19656967 - 19657006
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19656967 atgttgattatgatattgattatgatattgttatgttgtt 19657006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 17105357 - 17105315
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatga 43  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17105357 ttgtcgatgagttggcatccatgagttgttaagttgttgatga 17105315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 18918235 - 18918285
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||    
T  18918235 atgttgctaagttgtttaagatgttgattatgatatgtttatgttgctatg 18918285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 31478996 - 31479046
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  31478996 atgttgctatgttgtttaacatcttgattatgatattcttacgttgctatg 31479046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 17319374 - 17319439
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  17319374 tatgatgttgattatgatgttgttatgttgtttatgatgttgtttatgatgtgattatgttgttat 17319439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22948403 - 22948358
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||    
T  22948403 atgttgctatgttgtttaacatgttgcttatgatactgttatgttg 22948358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22952359 - 22952314
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||    
T  22952359 atgttgctatgttgtttaacatgttgcttatgatactgttatgttg 22952314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23870847 - 23870802
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||    
T  23870847 atgttgctatgttgtttaacatgttgcttatgatactgttatgttg 23870802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23874803 - 23874758
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||    
T  23874803 atgttgctatgttgtttaacatgttgcttatgatactgttatgttg 23874758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 188
Target Start/End: Original strand, 27126724 - 27126777
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattg 188  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  27126724 tatgatattgattaagatgttgttatgttgtttatgatgttgtttatgatattg 27126777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 62
Target Start/End: Original strand, 27416523 - 27416552
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27416523 gttgttgatgaattatcatctatgagttgt 27416552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 191
Target Start/End: Original strand, 15706129 - 15706161
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgtta 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15706129 atgttgtttatgatattgattatgatattgtta 15706161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22805138 - 22805106
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgtta 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22805138 atgttgtttatgatattgattatgatattgtta 22805106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23992128 - 23992080
Alignment:
Q  58 gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 106  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  23992128 gttgttgagttgtcttctatccatgtgtagttaatgaagtacttatgaa 23992080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Original strand, 27126664 - 27126720
Alignment:
Q  64 gagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  27126664 gagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 27126720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 21828637 - 21828837
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828637 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 21828736  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21828737 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatattgttat 21828836  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  21828837 g 21828837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21410433 - 21410229
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21410433 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgatttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 21410334  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21410333 tatgacgattatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 21410234  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  21410233 gatgt 21410229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21804925 - 21804721
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21804925 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgatttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 21804826  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21804825 tatgacgattatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 21804726  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  21804725 gatgt 21804721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23913779 - 23913575
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23913779 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttaatttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 23913680  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23913679 tatgaagattacatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtctatgatattgattatgatattgttatgttgttat 23913580  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  23913579 gatgt 23913575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 14398446 - 14398644
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  14398446 ttgttgatgaattatcatccatgaattgttaagttgttgatgaattatcatct--gagttgtcgagttgttttctacccatgtgttgttaaagaagtaca 14398543  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14398544 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctat 14398643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 18863268 - 18863463
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18863268 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 18863367  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  18863368 tatgaagattatacgatgtttacgatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 18863463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21386841 - 21386641
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21386841 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgataaattatcatctttgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtact 21386742  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21386741 tataaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatactgattataatgttatgatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctat 21386642  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  21386641 g 21386641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 30940700 - 30940886
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30940700 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 30940799  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    || ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  30940800 tacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 30940886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43251319 - 43251132
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251319 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 43251220  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  43251219 ctacgaagattgtacg---------atgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 43251132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 21977270 - 21977457
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21977270 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttgaagaagtac 21977369  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21977370 ctatgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgaccaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 21977457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22111439 - 22111247
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111439 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttatgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 22111340  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtta 199  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||    
T  22111339 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgcta 22111249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 21973179 - 21973366
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21973179 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttgaagaagtac 21973278  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  21973279 ctatgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgaccaaaatattgctatgttgtttaacatgttgtttatgatattgttatgttg 21973366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 44385244 - 44385436
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa-gaagtac 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  44385244 ttgttgatgaattatcattcatgagttgttaagttgttaatgaattatcatctatgtgttgttgagttgtcttctacccatgtgttattaaagggagtac 44385343  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||      | | | ||||  || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44385344 ctatgaagattatacgatgttcatgatgt------tgtcaagttgcttatgatgttgttatgttgtttatgatattgattatgatgtttttatgttgtt 44385436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 201
Target Start/End: Original strand, 15923999 - 15924085
Alignment:
Q  115 gatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15923999 gatgtttatgatgtgaattatatgatgttgaccaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatg 15924085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 16413777 - 16413882
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||     
T  16413777 ttgttgatgaattatcatacatgagttattaagttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcttctatccatgtgtagttaatgaagtact 16413876  T
Q  101 tatgaa 106  Q
    ||||||    
T  16413877 tatgaa 16413882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5760236 - 5760109
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatc-atctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || ||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  5760236 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgagttatcttctatccatgagttgtt-agttgtcttctatccatgtgttgttaatgaagtgc 5760138  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgt 128  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5760137 ttatgaagattatacgatgtttatgatgt 5760109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 14398634 - 14398688
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14398634 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 14398688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21386651 - 21386597
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21386651 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgctatgttgttatgatgt 21386597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 32121512 - 32121451
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32121512 ttgttgaggaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgt 32121451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 18863458 - 18863512
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18863458 atgttgctccgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 18863512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 42819124 - 42819251
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||        |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||     
T  42819124 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctatccacatgttgttaat 42819223  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  42819224 gaagtgcttatgaagattatatgatgtt 42819251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22111255 - 22111203
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22111255 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 22111203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Original strand, 30940923 - 30940971
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30940923 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatattgttatg 30940971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 15924075 - 15924125
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15924075 atgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatg 15924125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 15924115 - 15924165
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15924115 atgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatg 15924165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 15924155 - 15924209
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15924155 atgttgctatgttgagtaagatattgattatgatattgttaagttgttatgatgt 15924209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 21973361 - 21973411
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21973361 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 21973411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 21977452 - 21977502
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21977452 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 21977502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 43251137 - 43251087
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43251137 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 43251087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 18833150 - 18833089
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  18833150 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgacgagttgtcatccatgagttgt 18833089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 43251015 - 43250963
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43251015 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaaattgttatgatgt 43250963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18833035 - 18832968
Alignment:
Q  131 attatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| |||| || || |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18833035 attatatgatattgattatgacgttgttatgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 18832968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 21973441 - 21973495
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21973441 atgttgctacattgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 21973495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 21977532 - 21977586
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21977532 atgttgctacattgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 21977586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 30940881 - 30940931
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30940881 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 30940931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 43251057 - 43251007
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  43251057 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 43251007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 37515237 - 37515198
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37515237 ttgttgatgaattgtcattcatgagttgttaagttgttga 37515198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Original strand, 6102831 - 6102881
Alignment:
Q  12 ttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||    
T  6102831 ttgtcatccatgagttgttaagtttttgatgagttgtcatccatgagttgt 6102881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 32121479 - 32121441
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttg 39  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32121479 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttg 32121441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 5760249 - 5760208
Alignment:
Q  21 atgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5760249 atgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttgt 5760208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 21973401 - 21973446
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  21973401 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 21973446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 21977492 - 21977537
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  21977492 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 21977537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43251097 - 43251052
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  43251097 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 43251052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 40
Target Start/End: Original strand, 6102856 - 6102892
Alignment:
Q  4 ttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6102856 ttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttga 6102892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18832999 - 18832936
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||| |||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  18832999 tatgatattgattatgatgttgttatgttgtttatgatgttgattatgacgttgttatgttgtt 18832936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 18833117 - 18833078
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18833117 ttgttgacgagttgtcatccatgagttgttaagttgttga 18833078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21399158 - 21399089
Alignment:
Q  132 ttatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtt---taagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||| ||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21399158 ttatatgatgttgattatgatgttgttatgatgttgattatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 21399089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21793651 - 21793582
Alignment:
Q  132 ttatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtt---taagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||| ||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21793651 ttatatgatgttgattatgatgttgttatgatgttgattatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 21793582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Original strand, 42819247 - 42819286
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42819247 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 42819286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 37515206 - 37515140
Alignment:
Q  57 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | | | |||||||||| ||||||| ||||    
T  37515206 agttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaatgtattgcttatgaagattatacgatgattat 37515140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11230629 - 11230435
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11230629 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 11230530  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 195  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11230529 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 11230435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11224817 - 11224623
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11224817 ttgttgatgaattatcatccatgatttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 11224718  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 195  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11224717 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 11224623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11220231 - 11220037
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11220231 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgacgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtagc 11220132  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 195  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11220131 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 11220037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11228640 - 11228446
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11228640 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgacgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 11228541  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 195  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11228540 taggaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 11228446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18355725 - 18355536
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18355725 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 18355626  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtt 190  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18355625 tatgaagattatacgatatttatgatgtgaattatataaagttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattacgatattgtt 18355536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 33 - 205
Target Start/End: Original strand, 24767898 - 24768070
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaat 132  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24767898 gttgttgatgaattatcatctgtgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaat 24767997  T
Q  133 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24767998 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 24768070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 15237436 - 15237632
Alignment:
Q  5 tgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatg 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  15237436 tgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacg 15237535  T
Q  105 aagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  15237536 aagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatattgattatgatattgttatgttgtttaacatattggttatgatattgttacgttgctatg 15237632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 40724214 - 40724398
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40724214 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 40724313  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgt 194  Q
    || ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40724314 tacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgt 40724398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 33 - 201
Target Start/End: Original strand, 20911531 - 20911698
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaat 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  20911531 gttgttgatgaattatcatctattagttgacgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaaa 20911630  T
Q  133 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20911631 tatataatgttgactaagatatcgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtt-tgttgttatg 20911698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10752698 - 10752504
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  10752698 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatct--gagttgtcgagttgtcttctacctatatgttgttaaagaagtaca 10752601  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||    
T  10752600 tacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatattg----ttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctat 10752505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Original strand, 19473315 - 19473469
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||         |||||||||    
T  19473315 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaat 19473405  T
Q  133 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19473406 tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 19473469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11226650 - 11226546
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11226650 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtagc 11226551  T
Q  101 tatga 105  Q
    |||||    
T  11226550 tatga 11226546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 20295355 - 20295235
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295355 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 20295256  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  20295255 ctacgaagattatacgatgtt 20295235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 125
Target Start/End: Original strand, 22108009 - 22108101
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatga 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22108009 gttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 22108101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 40724435 - 40724489
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40724435 atgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattgttaagttgttatgatgt 40724489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 205
Target Start/End: Original strand, 20911689 - 20911742
Alignment:
Q  152 tgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20911689 tgttgttatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttataatgt 20911742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 19473586 - 19473638
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19473586 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 19473638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20295105 - 20295053
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20295105 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 20295053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 19473464 - 19473514
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19473464 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 19473514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20295247 - 20295177
Alignment:
Q  131 attatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20295247 attatacgatgttgactaaaatattgctatgttttttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatg 20295177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 202
Target Start/End: Original strand, 15237696 - 15237745
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15237696 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatga 15237745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18355535 - 18355493
Alignment:
Q  152 tgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18355535 tgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgt 18355493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 19473544 - 19473594
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19473544 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 19473594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 40724395 - 40724445
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40724395 atgtcgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatg 40724445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10752242 - 10752189
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatg 204  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10752242 atgttgctatgttgtgtaagatgttgattatgatattgttaagttattatgatg 10752189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10752392 - 10752347
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10752392 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatatttctatgttgtt 10752347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Original strand, 15237624 - 15237669
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15237624 gttgctatgttgtttaaaatattgagtatgatattgttatgttgtt 15237669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10752320 - 10752272
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10752320 gttgctatgttatttaagataatgattatgatattgttatgttgctatg 10752272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10752512 - 10752464
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10752512 gttgctatgttatttaagataatgattatgatattgttatgttgctatg 10752464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10752282 - 10752232
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  10752282 atgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgatatgttgctatg 10752232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10752474 - 10752424
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10752474 atgttgctatgttatttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatg 10752424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20295147 - 20295097
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  20295147 atgttgctacgttgtttaagatattgattttgatattgttacgttgctatg 20295097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 19473504 - 19473549
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  19473504 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 19473549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20295187 - 20295142
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  20295187 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 20295142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 110
Target Start/End: Original strand, 33896167 - 33896218
Alignment:
Q  59 ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  33896167 ttgttgagttatcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagatt 33896218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 205
Target Start/End: Original strand, 33896322 - 33896398
Alignment:
Q  133 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtt----atgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  33896322 tatatgatgttgattatgatgttgttatgttgtttatgatattatttatgatgttgtttatgatgttgttatgatgt 33896398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10752434 - 10752384
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10752434 atgttgctatgttatttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 10752384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 193
Target Start/End: Original strand, 33896395 - 33896429
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatg 193  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33896395 atgttgtttatgatattgattatgatattgttatg 33896429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10752356 - 10752312
Alignment:
Q  157 ctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10752356 ctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 10752312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 6489 - 6693
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6489 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 6588  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6589 tatgaagattatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtctatgatattgattatgatattgttatgttgttat 6688  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  6689 gatgt 6693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1282896 - 1282696
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1282896 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctataagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 1282797  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1282796 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatattgttat 1282697  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  1282696 g 1282696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31344645 - 31344444
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31344645 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt-gatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 31344547  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31344546 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaactatataaagttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 31344447  T
Q  201 gat 203  Q
    |||    
T  31344446 gat 31344444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9784518 - 9784314
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784518 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttttcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 9784419  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784418 tatgaagtttatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgaccaagatgttgccatgttgtctatgatattgattatgatattgttatgttgttat 9784319  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  9784318 gatgt 9784314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 30345614 - 30345800
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30345614 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 30345713  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    || ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30345714 tacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 30345800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 41531603 - 41531789
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41531603 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 41531702  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    || ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  41531703 tacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaagattgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 41531789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 24629077 - 24629264
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24629077 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 24629176  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24629177 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 24629264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 27380030 - 27380217
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27380030 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 27380129  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27380130 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 27380217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 27384076 - 27384263
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27384076 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 27384175  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27384176 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 27384263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24648863 - 24648676
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24648863 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 24648764  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||    
T  24648763 ctacgaagattgtacg---------atgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttggttatgatattgtcatgttg 24648676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27601300 - 27601113
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601300 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 27601201  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  27601200 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 27601113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 10102251 - 10102442
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10102251 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgtcgttaaagaagtac 10102350  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtta 199  Q
    ||| ||||||| |||         ||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10102351 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgtt------gatattgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgcta 10102435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 12902114 - 12902196
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgt 83  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12902114 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt 12902196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 32215413 - 32215474
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32215413 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgt 32215474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 17306314 - 17306187
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||        ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||     
T  17306314 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttcagttgtcttctatccacgtgttgttaat 17306215  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  17306214 gaagtgcttatgaagattatatgatgtt 17306187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 36839031 - 36838904
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||        |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  36839031 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcattcatgagttgttaagttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaat 36838932  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  36838931 gaagtgcttatgaagattatatgatgtt 36838904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 24629381 - 24629433
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24629381 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 24629433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 27380254 - 27380306
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27380254 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 27380306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 27384300 - 27384352
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27384300 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 27384352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27601036 - 27600984
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27601036 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 27600984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 30345917 - 30345969
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30345917 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 30345969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 12902285 - 12902339
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12902285 atgttgctatgttatgtaagatattgattatgatattgttaagttgttatgatgt 12902339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24648681 - 24648631
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24648681 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 24648631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27601118 - 27601068
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27601118 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 27601068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 30345795 - 30345845
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30345795 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 30345845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 41531784 - 41531834
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41531784 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatattgttatg 41531834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 10102628 - 10102673
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10102628 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 10102673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Original strand, 10102710 - 10102758
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10102710 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatg 10102758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24648559 - 24648507
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24648559 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaaattgttatgatgt 24648507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 24629259 - 24629309
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24629259 atgttgctactttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 24629309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 24629339 - 24629389
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24629339 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 24629389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24648601 - 24648551
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24648601 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 24648551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 27380212 - 27380262
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27380212 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 27380262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 27384258 - 27384308
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27384258 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 27384308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 30345875 - 30345925
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30345875 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 30345925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 357713 - 357664
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgat 184  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  357713 tatgatgttgattacgatgttgctatgttgtttatgatattgattatgat 357664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 206
Target Start/End: Original strand, 10102548 - 10102603
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtc 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  10102548 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgatatattgctatgttgtc 10102603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 196
Target Start/End: Original strand, 12902227 - 12902270
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12902227 gttgctatgttgtttaacatattgattatgatattattatgttg 12902270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 24515013 - 24514974
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24515013 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttga 24514974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 28653727 - 28653766
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28653727 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttga 28653766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 196
Target Start/End: Original strand, 10102511 - 10102553
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10102511 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 10102553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 10102668 - 10102718
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10102668 atgttgctacgttgtttaagatgttgattatgatattgttacgttgctatg 10102718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 32215446 - 32215484
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttg 39  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32215446 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttg 32215484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 24629299 - 24629344
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  24629299 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 24629344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24648641 - 24648596
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  24648641 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 24648596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 30345835 - 30345880
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  30345835 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 30345880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 206
Target Start/End: Original strand, 10102427 - 10102482
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtc 206  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  10102427 atgttgctatgttgtctaacatgttgattacgatattgttatgttgctatgttgtc 10102482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17306191 - 17306152
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17306191 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 17306152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 24514982 - 24514919
Alignment:
Q  57 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  24514982 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 24514919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Original strand, 28653817 - 28653856
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28653817 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 28653856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 28653825 - 28653896
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattg-ttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||| |||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28653825 tatgatattgattatgatgttgttatgttgtttatgatgttgtttatgatattgattatgatgttatgatgt 28653896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36838908 - 36838869
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36838908 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 36838869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27601078 - 27601028
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  27601078 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttacgttgctatg 27601028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 24367442 - 24367393
Alignment:
Q  57 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaa 106  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24367442 agttgttgagctgtcttctatccatgtgttgttaatgaagtacttatgaa 24367393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 36838900 - 36838851
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgat 184  Q
    |||||| |||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36838900 tatgatattgattatgatgttgttatgttgtttatgatattgattatgat 36838851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11478 - 11275
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11478 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctacgagttgtcgagttgtcttctacccatgtcttgttaaagaagtacc 11379  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11378 tatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatattgctatg-tgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 11280  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  11279 gatgt 11275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 114 - 319
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 213  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtta 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  214 ctatgaagattatacgatgtttacgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctgtgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtta 313  T
Q  200 tgatgt 205  Q
    ||||||    
T  314 tgatgt 319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 173; Significance: 3e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 36709 - 36913
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36709 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 36808  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36809 tatgaagattatatgatgtttatgatatgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtctatgatattgattatgatatttttatgttgttat 36908  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  36909 gatgt 36913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 6)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 36587 - 36782
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36587 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacc 36686  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36687 tacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttg 36782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 1076 - 1137
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1076 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattaccatccatgagttgt 1137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 36857 - 36911
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36857 atgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattgttaagttgttatgatgt 36911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 36817 - 36867
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36817 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatg 36867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 36777 - 36827
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36777 atgttgctgtgttgtttaagatgttgattatgatatcgttatgttgctatg 36827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 1109 - 1147
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttg 39  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1109 ttgttgatgaattaccatccatgagttgttaagttgttg 1147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 33 - 205
Target Start/End: Original strand, 10395 - 10567
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaat 132  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10395 gttgttgatgaattatcatctgtgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaat 10494  T
Q  133 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10495 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 10567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 208211 - 208400
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  208211 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgacttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 208310  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtt 190  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  208311 tatgaagattatacgatatttatgatgtgaattatataaagttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattacgatattgtt 208400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 205
Target Start/End: Original strand, 208401 - 208454
Alignment:
Q  152 tgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  208401 tgttgataagttgtttaagatattgattatgatattgttatgtcgttatgatgt 208454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 71)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 20229605 - 20229805
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  20229605 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttccgcctatgtgttgttaaagaagtacc 20229704  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20229705 tacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctat 20229804  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  20229805 g 20229805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21406864 - 21406664
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21406864 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagctgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacc 21406765  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21406764 tacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagaggttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctat 21406665  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  21406664 g 21406664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33797027 - 33796830
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33797027 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgataaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttccacccatgtgttattaaagaagtacc 33796928  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtta 199  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33796927 tatgaagattatacgatatttatgatgtgaattatataaagttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattacgatattgtt-tgttgtta 33796830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 39244517 - 39244717
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39244517 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacc 39244616  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| |||    
T  39244617 tacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgctgactaagatgttgctatgttgtttaacatgttgattacgatattgttacgttgctat 39244716  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  39244717 g 39244717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 39248072 - 39248272
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39248072 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacc 39248171  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| |||    
T  39248172 tacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgctgactaagatgttgctatgttgtttaacatgttgattacgatattgttacgttgctat 39248271  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  39248272 g 39248272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 41388617 - 41388813
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41388617 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacc 41388716  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41388717 tacgaagattatacgatgttcatggtgtgaattatatgat----attattatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctat 41388812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 41781896 - 41782044
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41781896 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 41781995  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa 149  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41781996 tatgaagattatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa 41782044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 1925752 - 1925938
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1925752 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 1925851  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    || ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1925852 tacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 1925938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 20924766 - 20924952
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20924766 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 20924865  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    || ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20924866 tacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 20924952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1010231 - 1010044
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010231 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 1010132  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1010131 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 1010044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 22131478 - 22131669
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131478 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagctgtcatctacccatgtgttgttaaagaagtacc 22131577  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||      | | | ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22131578 tatgaagattatacgatgttcatgacgt------tgtcaagttgcttatgatgttgctatgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 22131669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 48602989 - 48602796
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48602989 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagctgttaatgaattatcatctatgagttgctgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 48602890  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||      | | | ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  48602889 tatgaagattatacgatgttcatgacgt------tgtcaagttgcttatgatgttgctatgttgtttatgatattgattgtgatgttattatgttgttat 48602796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 16376056 - 16376176
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376056 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 16376155  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  16376156 ctacgaagattatacgatgtt 16376176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 52639049 - 52638930
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52639049 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 52638950  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgt 119  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  52638949 ctacgaagattatacgatgt 52638930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23967470 - 23967335
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt--------gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||        || ||||||||||||||  ||||||||||||     
T  23967470 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgctgaattgtcatccatgagttgttaagtagttgagttgtcttctacatatgtgttgttaat 23967371  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgt 128  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23967370 gaagtacttatgaagattatacgatgtttatgatgt 23967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 42911877 - 42911750
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||        |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  42911877 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaat 42911778  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  42911777 gaagtgcttatgaagattatatgatgtt 42911750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 48519974 - 48519783
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||        |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  48519974 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaggttgttgacgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaat 48519875  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttat 192  Q
    ||||| | |||||||||| || ||||||            | |||||| |||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  48519874 gaagtgcttatgaagattatatgatgtt-----------gtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtttatgatattgattatgatgttgttat 48519786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 48520007 - 48519946
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  48520007 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttgt 48519946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 201
Target Start/End: Original strand, 16376164 - 16376234
Alignment:
Q  131 attatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16376164 attatacgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatg 16376234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 20229795 - 20229849
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20229795 atgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatgatgt 20229849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21406674 - 21406620
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21406674 atgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttaagttgttatgatgt 21406620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 203
Target Start/End: Original strand, 41800899 - 41800957
Alignment:
Q  145 actaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41800899 actaagatgttgctatgttgtctacgatattgattatgatattattatgttgttatgat 41800957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1009927 - 1009875
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1009927 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 1009875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 1926055 - 1926107
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1926055 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 1926107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 106
Target Start/End: Original strand, 14238730 - 14238832
Alignment:
Q  15 tcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatga-----------gttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  14238730 tcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaatgaagtacttat 14238829  T
Q  104 gaa 106  Q
    |||    
T  14238830 gaa 14238832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 20925069 - 20925121
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20925069 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 20925121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 52634998 - 52634946
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52634998 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 52634946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 41388862 - 41388909
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41388862 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgctatgttgtt 41388909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1010049 - 1009999
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1010049 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 1009999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 1925933 - 1925983
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1925933 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 1925983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 20924947 - 20924997
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20924947 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 20924997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 52635120 - 52635070
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52635120 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 52635070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33796837 - 33796784
Alignment:
Q  152 tgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33796837 tgttgttacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtcgttatgatgt 33796784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Original strand, 39244709 - 39244754
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39244709 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgctatgttgtt 39244754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Original strand, 39248264 - 39248309
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39248264 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgctatgttgtt 39248309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 16376306 - 16376358
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16376306 gttgctatgttgtttaaaataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 16376358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 203
Target Start/End: Original strand, 41388803 - 41388855
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41388803 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttattatgat 41388855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 39244742 - 39244793
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39244742 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttaagttgttatgatgt 39244793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 39248297 - 39248348
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39248297 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttaagttgttatgatgt 39248348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 41389190 - 41389241
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41389190 ttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttaagttgttatgatgt 41389241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1009969 - 1009919
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1009969 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 1009919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 1926013 - 1926063
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1926013 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 1926063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 20925027 - 20925077
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20925027 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 20925077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 41388934 - 41388984
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41388934 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatg 41388984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 203
Target Start/End: Original strand, 41389058 - 41389107
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgat 203  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41389058 ttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttattatgat 41389107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 48519724 - 48519679
Alignment:
Q  150 gatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48519724 gatgttgctatgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgtt 48519679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 19675579 - 19675540
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19675579 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttga 19675540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Original strand, 41388897 - 41388944
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41388897 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatg 41388944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 14238749 - 14238787
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttg 39  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14238749 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttg 14238787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 16376264 - 16376314
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  16376264 atgttgctacgttgtttaagatattgattttgatattgttacgttgctatg 16376314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 41388974 - 41389024
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  41388974 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 41389024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 52635040 - 52634990
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  52635040 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatatttttacgttgctatg 52634990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1010009 - 1009964
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  1010009 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 1009964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 1925973 - 1926018
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  1925973 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 1926018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 16376224 - 16376269
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  16376224 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 16376269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20241624 - 20241555
Alignment:
Q  57 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgat 126  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||| |||| || ||||||||||||    
T  20241624 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaggattatatgatgtttatgat 20241555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 20924987 - 20925032
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  20924987 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 20925032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 52635080 - 52635035
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  52635080 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 52635035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Original strand, 41389016 - 41389056
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatat-tgattatgatattgttat 192  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41389016 gttgctatgttgtttaagatatatgattatgatattgttat 41389056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 192
Target Start/End: Original strand, 41389148 - 41389188
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatat-tgattatgatattgttat 192  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41389148 gttgctatgttgtttaagatatatgattatgatattgttat 41389188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20241560 - 20241489
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattg-ttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||| |||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20241560 tatgatattgattatgatgttgttatgttgtttatgatgttgtttatgatattgattatgatgttatgatgt 20241489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 20241655 - 20241616
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20241655 ttgttgatgagttgtcgtccatgagttgttaagttgttga 20241616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Original strand, 41389109 - 41389156
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  41389109 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 41389156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 42911746 - 42911675
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg-ttatgatgt 205  Q
    |||||| |||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  42911746 tatgatattgattatgatgttgttatgttgtttatgatattgattatgatgttatgatgttgcttatgatgt 42911675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42911754 - 42911715
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42911754 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 42911715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 48519851 - 48519812
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48519851 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 48519812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 52635153 - 52635115
Alignment:
Q  158 tatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  52635153 tatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 52635115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 110
Target Start/End: Original strand, 4597107 - 4597160
Alignment:
Q  57 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagatt 110  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  4597107 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagatt 4597160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 20634944 - 20635009
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  20634944 tatgatgttgattatgatgttgttatgttgtttatgatgttgtttatgatgtgattatgttgttat 20635009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 198
Target Start/End: Original strand, 4597165 - 4597205
Alignment:
Q  158 tatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4597165 tatgttgtttatgatattgattatgatgttgttatattgtt 4597205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20241569 - 20241529
Alignment:
Q  158 tatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20241569 tatgatgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 20241529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 20802 - 21010
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgtt--gatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa--gaag 96  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20802 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagtttttttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaaaagaag 20901  T
Q  97 tacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20902 tacctatgaagattatatgatgtttatgacgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtatatgatattgattatgatattgttatgttg 21001  T
Q  197 ttatgatgt 205  Q
    |||||||||    
T  21002 ttatgatgt 21010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9360 - 9165
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  9360 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatccaagaattgtcgagctgtcttatacctaagtgttgttaaagaagtacc 9261  T
Q  101 tatgaaga-ttgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 195  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9260 tatgaagaattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 9165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 8243 - 8117
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||        ||| || |||||||||||||||||||||||||| |     
T  8243 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcattcatgagtcgttaagtcgttgagttgtcttctacccatgtgttgtttat 8144  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgt 119  Q
    | ||| | |||||||||| || |||||    
T  8143 ggagtgcttatgaagattatatgatgt 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9169 - 9119
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9169 atgttcctatgttgtttaaaatattgattatgatattgttatgttgctatg 9119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 9)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 80050 - 79844
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  80050 ttgttgatgaattatcatccataagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacctatgtgttattaaagaagtac 79951  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtta 199  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  79950 ctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatggtgttgactaagatgttgctatgtcgtttaacatgttgattacgatattgttatattgcta 79851  T
Q  200 tgatgtc 206  Q
    || ||||    
T  79850 tgttgtc 79844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 62206 - 62392
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  62206 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatacatgagtcgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtagc 62305  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    || ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  62306 tacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttg 62392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 66122 - 66308
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  66122 ttgtttatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtcgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtagc 66221  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    || ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  66222 tacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttg 66308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 62427 - 62480
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  62427 atgttgctatgttgtttaagatgtt-attatgatattgttatgttgttatgatgt 62480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 66343 - 66396
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  66343 atgttgctatgttgtttaagatgtt-attatgatattgttatgttgttatgatgt 66396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 79779 - 79725
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  79779 atgttgctaggttgtgtaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 79725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Original strand, 66305 - 66353
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  66305 gttgctatattgtttaagataatgattatgatattgttatgttgctatg 66353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Original strand, 62389 - 62437
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  62389 gttgctatattgtttaagataatgattatggtattgttatgttgctatg 62437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 79856 - 79809
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  79856 ttgctatgttgtctaacatgttgattatgatattgttatattgttatg 79809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 14710 - 14896
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14710 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 14809  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    |||||||||         |||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  14810 tatgaagat---------tttacgatgtgaattatatgatgttgactaaattattgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 14896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 199
Target Start/End: Original strand, 14933 - 14979
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14933 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatattgtta 14979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 14891 - 14941
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14891 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 14941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 190000 - 190148
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  190000 ttgttgatgaattataatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcttcccatgtgttgttaaagaagtacc 190099  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa 149  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  190100 tatgaagattatacgatatttatgatgtgaattatataaagttgactaa 190148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 5)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 33284 - 33471
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33284 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 33383  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33384 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 33471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 33588 - 33640
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33588 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 33640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 33466 - 33516
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33466 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 33516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 33546 - 33596
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33546 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 33596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 33506 - 33551
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  33506 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 33551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 67899 - 68086
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  67899 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 67998  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  67999 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 68086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 19663 - 19702
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19663 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttga 19702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 19630 - 19757
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| |||        |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  19630 ttgttaatgagttgtcatccatgagttgctaatttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaat 19729  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    ||||| | | |||||||| || ||||||    
T  19730 gaagtgcttgtgaagattatatgatgtt 19757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 68081 - 68134
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  68081 atgttgctacgttgtt-aagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 68134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 5697 - 5884
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5697 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 5796  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  5797 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttgacatgttgattatgatattgttatgttg 5884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 5919 - 5973
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5919 atgttgctacgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 5973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 5879 - 5924
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5879 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 5924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11930 - 11743
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11930 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 11831  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  11830 ctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 11743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11706 - 11654
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11706 gttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgt 11654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11748 - 11698
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11748 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 11698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Original strand, 51300 - 51451
Alignment:
Q  50 atctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa 149  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51300 atctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgctgactaa 51399  T
Q  150 gatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  51400 gatgttgctatgttgtttaacatgttgattacgatattgttacgttgctatg 51451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Original strand, 51443 - 51488
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51443 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgctatgttgtt 51488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 73917 - 74056
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  73917 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttcagttgttgatgaattatcatctaagagttgtcgagttgtcttctacctaagtgttgttaaagaagtacc 74016  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgat 140  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  74017 tatgaagattatacgatgtttaagatgtgaattatatgat 74056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 59317 - 59504
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  59317 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtac 59416  T
Q  100 ctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||| || |||| |||         ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  59417 ctacgatgattatac---------gatgtgaattatatgatgttgaccaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 59504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 59499 - 59549
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  59499 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 59549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Original strand, 59580 - 59630
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  59580 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 59630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 59660 - 59705
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  59660 atgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttg 59705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 59620 - 59665
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  59620 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttg 59665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 8188 - 8379
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8188 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttaatgaattatcatctttgagttgctaagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 8287  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||      | | | ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8288 tatgaagattatacgatgttcatgacgt------tgtcaagttgcttatgatgttgctatgttgtttatgatattgattatgatgttattatgttgtt 8379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8211
Alignment:
Q  4 ttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctat 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8090 ttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattgtcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctat 8189  T
Q  104 gaagattgtacgatgtttatga 125  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  8190 gaagattatacgatgttcatga 8211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 8054 - 8124
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc 71  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  8054 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagtttttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtc 8124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 25194 - 25318
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25194 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttaatgaattatcatctacgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacc 25293  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatga 125  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||    
T  25294 tatgaagattatacgatgttcatga 25318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 194
Target Start/End: Original strand, 25341 - 25381
Alignment:
Q  154 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgt 194  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  25341 ttgctatgttgtttatgatattgattgtgatgttgttatgt 25381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 368 - 241
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  368 ttgttgatgaattatcatccatgagttgtcaagttgttaatgaattatcatctatgagttgctgagttttattctacccatgtgttgttaaagaagtacc 269  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatgatgt 128  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  268 tatgaagattatacgatgttcatgatgt 241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 369 - 332
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgt 70  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  369 gttgttgatgaattatcatccatgagttgtcaagttgt 332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3239 - 3115
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3239 ttgttgatgaattatcatccatgtgttgctaagttgttaacgaattatcatctatgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacc 3140  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatga 125  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||    
T  3139 tatgaagattatacgatgttcatga 3115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 7302 - 7178
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7302 ttgttgatgaattatcatccatgtgttgctaagttgttaacgaattatcatctatgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacc 7203  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtttatga 125  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||    
T  7202 tatgaagattatacgatgttcatga 7178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 7273 - 7141
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgag--------ttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||        |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7273 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgtcaagttgttgatgaattgtcatctatgagttgttaagttgttgagttgtctgctacccctgtgttgttaaa 7174  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtttatga 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7173 gaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 7303 - 7237
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgt 70  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  7303 ttgttgatgaattatcatccatgagtt---aagttgttgatgaattgtcatccatgagttgtcaagttgt 7237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 4448 - 4329
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  4448 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgct 4349  T
Q  101 tatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    |||||||||| || ||||||    
T  4348 tatgaagattatatgatgtt 4329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 4481 - 4420
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  4481 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt 4420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4171 - 4113
Alignment:
Q  133 tatatgatgttgactaagatgttgctatg---ttgtttaagatattgattatgatattg 188  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4171 tatatgatgttgattatgatgttgttatgatgttgtttatgatattgattatgatattg 4113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 5)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 4467 - 4549
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgt 83  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4467 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt 4549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 4758 - 4812
Alignment:
Q  151 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4758 atgttgctatgttatgtaagatattgattatgatattgttaagttgttatgatgt 4812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 196
Target Start/End: Original strand, 4700 - 4743
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4700 gttgctatgttgtttaacatattgattatgatattattatgttg 4743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Original strand, 4580 - 4628
Alignment:
Q  153 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4580 gttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 4628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 201
Target Start/End: Original strand, 4664 - 4708
Alignment:
Q  157 ctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 201  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4664 ctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 4708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6419 - 6335
Alignment:
Q  121 tatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgttt-aagatattgattatgatattgttatgttgttatgatg 204  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6419 tatgatgtgaattatataatgctgactaagatgttgctatgttgtttaaaggtattgattatgatattgttatgttgttatgatg 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 13930 - 14137
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||        |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  13930 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgttgagttatcttctacccatgtgttgttaat 14029  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattg-tta 191  Q
    ||||| | |||||||||| || |||| ||||||    |  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| |||    
T  14030 gaagtgcttatgaagattatatgatg-ttatga----agctacatgatgttgattatgatgttgttatgttg-ttatgatgttgtttatgatattgatta 14123  T
Q  192 tgttgttatgatgt 205  Q
    |  |||||||||||    
T  14124 taatgttatgatgt 14137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 7)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 15558 - 15619
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15558 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttgt 15619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 15690 - 15751
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  15690 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccgtgagttgt 15751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 15657 - 15718
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15657 ttgttgatgaattgtgatccatgagttgtttagttgttgatgaattgtcatccatgagttgt 15718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 15591 - 15652
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  15591 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgtttagttgttcatgaattgtcgtccatgagttgt 15652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 15624 - 15685
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  15624 ttgttcatgaattgtcgtccatgagttgttaagttgttgatgaattgtgatccatgagttgt 15685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 15723 - 15774
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatc 52  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15723 ttgttgatgaattgtcatccgtgagttgttaggttgttgatgaattgtcatc 15774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 15756 - 15795
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15756 ttgttgatgaattgtcatccacgagtcgttaagttgttga 15795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 10725 - 10664
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10725 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattaccatccatgagttgt 10664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 10692 - 10654
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttg 39  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10692 ttgttgatgaattaccatccatgagttgttaagttgttg 10654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 12722 - 12783
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  12722 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgtattatcatccatgagttgt 12783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 12755 - 12793
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttg 39  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12755 ttgttgatgtattatcatccatgagttgttaagttgttg 12793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 29320 - 29259
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29320 ttgttgatgaattattatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgt 29259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29176 - 29113
Alignment:
Q  135 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29176 tatgatattgattatgatgttgctatgtagtttatgatattgattatgacgttgttatgttgtt 29113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 29287 - 29248
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29287 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttga 29248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29108 - 29069
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29108 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 29069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 19287 - 19348
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  19287 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt 19348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 19320 - 19358
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttg 39  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19320 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttg 19358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 18076 - 18137
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18076 ttgttgatgaattatcatccttgagttgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgt 18137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 18109 - 18147
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttg 39  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18109 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttg 18147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 20027 - 20154
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaa 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||        |||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||     
T  20027 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctatccacgtgtcgttaat 20126  T
Q  93 gaagtacctatgaagattgtacgatgtt 120  Q
    ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  20127 gaagtgcttatgaagattatatgatgtt 20154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Original strand, 20150 - 20189
Alignment:
Q  159 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20150 atgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttgtt 20189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 7099 - 7053
Alignment:
Q  64 gagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagatt 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  7099 gagttgtcttctatccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagatt 7053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14218 - 14172
Alignment:
Q  64 gagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagatt 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  14218 gagttgtcttctatccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagatt 14172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 845 - 906
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  845 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttattgaggaattgtcatccatgagttgt 906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 198
Target Start/End: Original strand, 993 - 1060
Alignment:
Q  131 attatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgtt 198  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  993 attatgtgatattgattaagatgttgctatgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgatgtt 1060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Original strand, 881 - 939
Alignment:
Q  4 ttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||    
T  881 ttgaggaattgtcatccatgagttgttaagttgtagacgagttgtcatccatgagttgt 939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 41
Target Start/End: Original strand, 922 - 951
Alignment:
Q  12 ttgtcatccatgagttgttaagttgttgat 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  922 ttgtcatccatgagttgttaagttgttgat 951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 63467 - 63528
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||    
T  63467 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttcttgatgaattgtcaaccatgagttgt 63528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 39
Target Start/End: Original strand, 63503 - 63538
Alignment:
Q  4 ttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttg 39  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  63503 ttgatgaattgtcaaccatgagttgttaagttgttg 63538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 646 - 707
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  646 ttgttgatgagttctcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt 707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 679 - 718
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  679 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttga 718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 95 - 37
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagt 59  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  95 ttgttcatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagt 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 62 - 20
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatga 43  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  62 ttgttgatgagttgtcatccatgagtggttaagttgttgatga 20  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13334 - 13261
Alignment:
Q  119 tttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  13334 tttatgatgtgaattatatgatgt--------atgttgctatgttgtttatgatattgattctgatgttgttatgatgttat 13261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 10743 - 10704
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10743 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttga 10704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 20990 - 20943
Alignment:
Q  12 ttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagt 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  20990 ttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagt 20943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 102322 - 102361
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  102322 ttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttga 102361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 28835 - 28796
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28835 ttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttga 28796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 116625 - 116585
Alignment:
Q  57 agttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagt 97  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  116625 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagt 116585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 116656 - 116617
Alignment:
Q  1 ttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttga 40  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  116656 ttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgttga 116617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 70838 - 70809
Alignment:
Q  33 gttgttgatgaattatcatctatgagttgt 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70838 gttgttgatgaattatcatctatgagttgt 70809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 145652 - 145608
Alignment:
Q  161 gttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgt 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  145652 gttgtttatgatattgattatgatgttatgatgttgttatgatgt 145608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University