View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8903_low_16 (Length: 531)

Name: NF8903_low_16
Description: NF8903
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8903_low_16
NF8903_low_16
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (17-361)||(4334021-4334365)
chr4 (17-361)||(4322291-4322635)
chr4 (17-361)||(4125629-4125970)
chr4 (22-361)||(4358884-4359223)
chr4 (22-350)||(4343415-4343743)
chr4 (28-361)||(4351709-4352042)
chr4 (22-361)||(4134970-4135310)
chr4 (425-522)||(4334429-4334526)
chr4 (42-331)||(6547109-6547398)
chr4 (22-250)||(6499634-6499862)
chr4 (28-305)||(6751305-6751582)
chr4 (28-305)||(6814232-6814509)
chr4 (42-305)||(6674477-6674740)
chr4 (22-193)||(25568468-25568639)
chr4 (36-233)||(6649521-6649718)
chr4 (34-305)||(6834632-6834903)
chr4 (42-256)||(6794916-6795130)
chr4 (71-305)||(6756966-6757200)
chr4 (22-331)||(6623635-6623944)
chr4 (22-305)||(6589269-6589552)
chr4 (45-185)||(6771681-6771821)
chr4 (34-146)||(6714275-6714387)
chr4 (28-275)||(6726391-6726638)
chr4 (22-331)||(6534858-6535167)
chr4 (453-494)||(4352152-4352193)
chr4 (458-510)||(4359343-4359395)
chr4 (71-137)||(6501917-6501983)
chr4 (71-137)||(6592831-6592897)
chr4 (449-494)||(4322126-4322170)
chr4 (458-510)||(4343880-4343932)
chr4 (32-112)||(7888181-7888261)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (22-351)||(5342168-5342497)
chr6 (22-355)||(5094515-5094848)
chr6 (22-355)||(5424227-5424560)
chr6 (22-355)||(5104067-5104400)
chr6 (28-361)||(5355805-5356138)
chr6 (22-355)||(5368934-5369267)
chr6 (22-355)||(5068269-5068602)
chr6 (22-353)||(5074931-5075259)
chr6 (22-351)||(5395517-5395846)
chr6 (23-324)||(5382124-5382424)
chr6 (22-361)||(5175340-5175679)
chr6 (22-319)||(5277167-5277464)
chr6 (17-355)||(5158696-5159034)
chr6 (24-355)||(5348851-5349184)
chr6 (22-337)||(5183165-5183480)
chr6 (22-359)||(5133096-5133433)
chr6 (22-355)||(5148154-5148487)
chr6 (22-350)||(5261346-5261674)
chr6 (22-331)||(5285364-5285671)
chr6 (22-354)||(5445554-5445883)
chr6 (24-271)||(5691390-5691637)
chr6 (24-361)||(5431883-5432220)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (22-351)||(36215091-36215420)
chr7 (30-253)||(34727031-34727254)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (23-328)||(9890-10195)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (17-306)||(8876270-8876561)
chr5 (210-351)||(15801829-15801970)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (71-350)||(22585521-22585800)
[»] scaffold0373 (1 HSPs)
scaffold0373 (42-256)||(11171-11385)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (133-354)||(3326071-3326292)
chr8 (133-256)||(7165853-7165976)
chr8 (210-351)||(3313695-3313836)
chr8 (213-265)||(3392763-3392815)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (127-331)||(5263-5467)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Original strand, 4334021 - 4334365
Alignment:
Q  17 acatcagaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaat 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4334021 acataagaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaat 4334120  T
Q  117 gatgttattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4334121 gatgttattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagc 4334220  T
Q  217 ttggcatgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgagga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4334221 ttggcatgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcatgagga 4334320  T
Q  317 tgtgcttgatgtattgtcagaacatactgtaagaacttcttatac 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4334321 tgtgcttgatgtattgtcagaacatactgtaagaacttcttatac 4334365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4322635 - 4322291
Alignment:
Q  17 acatcagaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4322635 acatcagaagttaaaaataagctacgatggcttaaatgatgatacagagaaatcaatattccttgacattgcttgtttctttattgggatggatcgaaat 4322536  T
Q  117 gatgttattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagc 216  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4322535 gatgtcattcatatattaaatggttctggatttttcgcagaaattggaataagtgtccttgttgagagaagccttgtaacggttgatgataagaacaagc 4322436  T
Q  217 ttggcatgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgagga 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4322435 ttggcatgcatgatttgctgcgagatatgggaagggaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcatgatga 4322336  T
Q  317 tgtgcttgatgtattgtcagaacatactgtaagaacttcttatac 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4322335 tgtgcttgatgtattgtcagaacatactgtaagaacttcatatac 4322291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4125970 - 4125629
Alignment:
Q  17 acatcagaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaat 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4125970 acataagaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgat---acagaaaaatcaatattccttgacatagcttgtttcttaattgggatggaccgaaat 4125874  T
Q  117 gatgttattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagc 216  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  4125873 gatgttattcttattttaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgaacgaagccttgtaacagttgatgataagaacaagc 4125774  T
Q  217 ttggcatgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgagga 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  4125773 ttggcatgcatgatttgctgcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtatcatgagga 4125674  T
Q  317 tgtgcttgatgtattgtcagaacatactgtaagaacttcttatac 361  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  4125673 tgtgattgatatattgtcagaacatacggtaagaatttcatatac 4125629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 361
Target Start/End: Original strand, 4358884 - 4359223
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4358884 agaagttaaaaataagttatgatggtttaaatgatgatacacagaaagaaatattccttgacatatcttgtttctttattggaatggaccggaatgatgt 4358983  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    |||||  |||||| ||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4358984 tattcgtatattagatggctgtggattttttgcaggaattggaataagtgtccttgttgagagaagccttgtaacggttgatgataagaacaagcttggc 4359083  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  4359084 atgcatgatttgctccgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaaaggagcctgaggaacatagtaggctgtggtttcatgaggatgtga 4359183  T
Q  322 ttgatgtattgtcagaacatactgtaagaacttcttatac 361  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4359184 ttgatgtcttgttagaacataccgtaagaacttcatatac 4359223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 350
Target Start/End: Original strand, 4343415 - 4343743
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4343415 agaagttaaaaataagctacgatggtttaaatgatgatacacagaaagaaatattcctcgacatatcttgtttctttattgggatggatcgaaatgatgt 4343514  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    |||||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  4343515 tattcgtatactaaatggctgtggatttttcgcagaaatcggcataagtgtccttgttgagagaagccttgtaatggttgatgataagaacaagcttggc 4343614  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  4343615 atgcatgatttgctgcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcgccaaaggagcctgaggaacatagtaggttgtggtttcatgaagacgtgc 4343714  T
Q  322 ttgatgtattgtcagaacatactgtaaga 350  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4343715 ttgatgtcttgttagaacatactgtaaga 4343743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Original strand, 4351709 - 4352042
Alignment:
Q  28 taaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattca 127  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||      
T  4351709 taaaaataagctaccatggtttaaatgatgacacggagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatagacagaaatgatgttatttg 4351808  T
Q  128 aatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcatgcat 227  Q
     ||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4351809 tatattaaatagctgcagacttttcacagaaattggaataaaggttcttgttgagagaagccttgtaatcgttgatgataaaaacaagcttggcatgcat 4351908  T
Q  228 gatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgcttgatg 327  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  4351909 gatttgctgcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaaaggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcacggggatgtgcttgatg 4352008  T
Q  328 tattgtcagaacatactgtaagaacttcttatac 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4352009 tattgtcaaaacatactgtaagaacttcatatac 4352042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4135310 - 4134970
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4135310 agaagttgaaaataagctatgatggtttaaatgatgacaccgagagagatatattccttgacattgcttttttctttattgggatggaccgaaacgatgt 4135211  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    |||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||     
T  4135210 tatggatatattaaatggttgtggtctttttgctgaaatcggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaactattgatgataaaaacaagcttgga 4135111  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| | | |  ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  4135110 atgcatgatttgctacgagatatgggaagagagatcatccgacagaaatcaccaaagaaactcgagaagcgtagtaggttatggtttcatgaggatgttc 4135011  T
Q  322 ttgatgta-ttgtcagaacatactgtaagaacttcttatac 361  Q
     ||||||| |||||| |||| | ||||||||| ||||||||    
T  4135010 atgatgtatttgtcataacaaaatgtaagaacgtcttatac 4134970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 425 - 522
Target Start/End: Original strand, 4334429 - 4334526
Alignment:
Q  425 atctcaaactttaaaagcaaaatacatttgtgctgttgttagcgcaaaagctttgaatattagtttggttattaatcattttgtgcatctgtgctcct 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4334429 atctcaaactttaaaagcaaaatacatttgtgctgttgttagcgcaaaagctttgaatattagtttggttattaatcattttgtgcttctgtgctcct 4334526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6547398 - 6547109
Alignment:
Q  42 gatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattcaaatattaaatggct 141  Q
    ||||||||||| |||| ||| || |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||| |    
T  6547398 gatggtttaaaagatgttacagacaaacaaatattccttgatatagcttgtttctttattgggatggacaaaaatgatgcaatacaaatattaaatgggt 6547299  T
Q  142 gtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcatgcatgatttgcttcgaga 241  Q
    || || |||| ||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| || ||   || |||||||||| | |||||||||||| |  ||||    
T  6547298 gtagattttttgctgatattggaattaaagtccttgtagagcgaagccttgtaactgttgacaataggaacaagcttagaatgcatgatttgttgagaga 6547199  T
Q  242 tatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgcttgatgtatt 331  Q
     ||||||||| |||| |||  |||| |||| ||| | || || ||| | || ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  6547198 catgggaagacaaataatttatgaggaatcgccatttgatccggagaaccgcagtaggttgtggcgccgtgaggatgcgcttgatgtatt 6547109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6499862 - 6499634
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||| ||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6499862 agaagttaaaagtaagctttgatggcttaaaagatgttacagagaaacacatattccttgatatagcttgcttctttattgggatggaccgaaatgatgt 6499763  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
     || |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |  |||||||| |||||||||||| |||   | ||   || |||||||||| |     
T  6499762 aatacaaatattaaatgggtgtggattttttgctgatattggaattaaagtccttgtagagcgaagccttttaattattgacaataggaacaagcttaga 6499663  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaag 250  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  6499662 atgcatgatttgttgagagatatgggaag 6499634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 305
Target Start/End: Original strand, 6751305 - 6751582
Alignment:
Q  28 taaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattca 127  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6751305 taaaagtaagcttcgatggtttaaagtatgttacggagaaacaaatattccttgatatagcctgtttctttattggaatggaccgaaatgatgtaattca 6751404  T
Q  128 aatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcatgcat 227  Q
    |||||||||||| |||||  |||| |||||   |||||| |  |||||| | |||||||| |||||||| || ||   |  |||||||||| | ||||||    
T  6751405 aatattaaatgggtgtgggttttttgctgattctggaatgaaagtccttttagagcgaagtcttgtaactgttgacaatgggaacaagcttagaatgcat 6751504  T
Q  228 gatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtgg 305  Q
    |||||| |  |||| ||||||||| |||| |||  |||| |||||||| |||| |||||| | || ||||||||||||    
T  6751505 gatttgttgagagacatgggaagacaaataatttatgaggaatcaccactggatcctgagaatcgcagtaggttgtgg 6751582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 305
Target Start/End: Original strand, 6814232 - 6814509
Alignment:
Q  28 taaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattca 127  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||  ||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |     
T  6814232 taaaagtaagcttcgatggtttaaaagattttacagagaaacaaatattccttgatatagcttgtttctttattgggagggaccgaaatgatgtaatacg 6814331  T
Q  128 aatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcatgcat 227  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||| || ||   || |||||||||| | ||||||    
T  6814332 aatattaaatgggtgtggatattttgctgatattggaattaaagtccttgttgagcgagcccttgtaactgttgacaataggaacaagcttagaatgcat 6814431  T
Q  228 gatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtgg 305  Q
    ||||||    |||| ||||||||| |||| |||  |||| ||||||||   || |||||| | || ||||||||||||    
T  6814432 gatttgtgaagagacatgggaagacaaataatttatgaggaatcaccatcagatcctgagaagcgcagtaggttgtgg 6814509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 305
Target Start/End: Original strand, 6674477 - 6674740
Alignment:
Q  42 gatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattcaaatattaaatggct 141  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |    
T  6674477 gatggtttaaaagatgttacagagaaacaaatattccttgatatagcttgcttctttattgggatggaccgaaatgatgcaatacaaatattaaatgggt 6674576  T
Q  142 gtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcatgcatgatttgcttcgaga 241  Q
    ||  | |||| ||||| |||||||| |  |||||| | |||||||||||| |||| || ||   || |||||||||| | |||||||||||  |  ||||    
T  6674577 gtcaattttttgctgatattggaattaaagtccttttagagcgaagccttctaactgttgacaataggaacaagcttagaatgcatgatttattgagaga 6674676  T
Q  242 tatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtgg 305  Q
     ||||||||| |||| ||   |||| |||||||| | || |||||| | || ||||||||||||    
T  6674677 catgggaagacaaataatatatgaggaatcaccatttgatcctgagaaccgcagtaggttgtgg 6674740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Original strand, 25568468 - 25568639
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  25568468 agaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatactcaggaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggttggtccgaaataatgt 25568567  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgt 193  Q
     || || ||||| ||||| |||| |||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25568568 aatacatatattgaatggttgtgaactttatgcagaaattggaataaacgtccttgttgagcgaagccttgt 25568639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 233
Target Start/End: Original strand, 6649521 - 6649718
Alignment:
Q  36 agctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattcaaatattaa 135  Q
    |||| |||||||||||| ||||  || ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  6649521 agctttgatggtttaaaagatgtaacagagaaacaaatattccttgatattgcttgtttctttattggaatggaccgaaatgatgcaatacaaatattaa 6649620  T
Q  136 atggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcatgcatgatttg 233  Q
    ||||  ||||| |||| ||||| |||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||| || ||   || |||||||||| | ||||||||||||    
T  6649621 atgggagtggattttttgctgatattggaattaaagtccttgtagagagaagccttgtaactgttgacaataggaacaagcttagaatgcatgatttg 6649718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 6834632 - 6834903
Alignment:
Q  34 taagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattcaaatatt 133  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||  |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6834632 taagctttgatggtttaaaagatgttacagagcaacaaatatttctcgatatagcctgtttctttattgggatggaccaaaatgatgtaattcaaatatt 6834731  T
Q  134 aaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcatgcatgatttg 233  Q
    |||||| |||||  |||| |||||   |||||| |   ||||| | ||||||||||||||||| || ||   |  |||||||||| |  |||||||||||    
T  6834732 aaatgggtgtgggttttttgctgattctggaatgaaaatccttttagagcgaagccttgtaactgttgacaatgggaacaagcttagagtgcatgatttg 6834831  T
Q  234 cttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtgg 305  Q
     |  |||| ||||||||| |||| |||  |||| |||||||  |||| |||||| | || ||||||||||||    
T  6834832 ttgagagacatgggaagacaaataatttatgaggaatcaccgttggatcctgagaaccgcagtaggttgtgg 6834903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 6794916 - 6795130
Alignment:
Q  42 gatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattcaaatattaaatggct 141  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  6794916 gatggtttaaaagattttactgagaaacaaatatttcttgatatagcttgcttctttattgggatggatcaaaatgatgcaattcaaatattaaatgggt 6795015  T
Q  142 gtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcatgcatgatttgcttcgaga 241  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |  || ||||||||  ||  ||||||||| || ||   ||| ||||||||| | |||||||||||| |  ||||    
T  6795016 gtggattttttgctgatattggaattaaagttcttgttgaaagagcccttgtaactgttgacaataataacaagcttagaatgcatgatttgttaagaga 6795115  T
Q  242 tatgggaagagaaat 256  Q
     ||||||||| ||||    
T  6795116 catgggaagacaaat 6795130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 305
Target Start/End: Original strand, 6756966 - 6757200
Alignment:
Q  71 aatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagt 170  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |      
T  6756966 aatattccttgatatagcttgtttctttattgggaaggacagaaatgatgtaatacaaatattaaatgggtgtggattttttgctgatattggaattaaa 6757065  T
Q  171 gtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcatgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaat 270  Q
    || ||||| ||| ||| ||||||||| || ||    | |||||||||| | ||||||| |||| |  |||| ||||||||| |||| ||   |||| |||    
T  6757066 gttcttgtagagtgaacccttgtaaccgttgacaacaggaacaagcttagaatgcatggtttgttgagagacatgggaagacaaataatctttgaggaat 6757165  T
Q  271 caccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtgg 305  Q
    ||||  | || |||||| | ||||||||| |||||    
T  6757166 caccgtttgatcctgagaagcgtagtaggctgtgg 6757200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6623944 - 6623635
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   ||||||||     
T  6623944 agaagctaaaagtaagctttgatggtttaaaagatgttacagagcaacaaatattccttgatatagcctgtttcttgattggaatggataaaaatgatgc 6623845  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
     ||  ||||||||||||| |||||  |||| || || |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| || ||   || |||||||||| |     
T  6623844 aataaaaatattaaatgggtgtgggttttttgcggatattggaattaaagtccttgtagagcgaagccttgtaactgttgacaataggaacaagcttaga 6623745  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||  |||| ||   |||  |||||||| | || |||||| | || ||||||||||||   |||||||| |||     
T  6623744 atgcatgacttgttgagagatatgggaaggcaaataatctatgaagaatcaccatttgatcctgagaaccgcagtaggttgtggcgccgtgaggaagtgt 6623645  T
Q  322 ttgatgtatt 331  Q
     |||||||||    
T  6623644 atgatgtatt 6623635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6589552 - 6589269
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||| ||||| ||||||   |||||||||| |||  ||| ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  6589552 agaagctaaaagtaagcttccatggtttaaaagattttacagagaaacaaatattccttgatattgcttgtttctttattgggatggacaaaaaggatgt 6589453  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
     || || ||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||| || |  || ||||||||||||  ||||||||| || ||   || |||||||||  |     
T  6589452 aatacagatattaaatggttgtgggttttttgctgatattgggattaaagttcttgttgagcgagcccttgtaactgttgacaataggaacaagctaaga 6589353  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtgg 305  Q
    ||||||||| || |  |||||||||||||| |||| |||  |||| || |||||   || |||||| | || ||||||||||||    
T  6589352 atgcatgatctgttaagagatatgggaagacaaataatttatgaggaagcaccatcagatcctgagaagcgcagtaggttgtgg 6589269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 185
Target Start/End: Original strand, 6771681 - 6771821
Alignment:
Q  45 ggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattcaaatattaaatggctgtg 144  Q
    |||||||| ||| |||  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  6771681 ggtttaaaagattatatggagaaacaaatattccttgatatagcttgtttctttattggggtagacaaaaaggatgtaatacaaatattaaatgggtgtg 6771780  T
Q  145 gacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcga 185  Q
    || |||| ||||| |||||||| |  |||||| ||||||||    
T  6771781 gattttttgctgatattggaattaaagtccttcttgagcga 6771821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 146
Target Start/End: Original strand, 6714275 - 6714387
Alignment:
Q  34 taagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattcaaatatt 133  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||  ||||||| | || ||||||||    
T  6714275 taagctttgatggtttaaaagatgttacagagaaacaaatattctttgatattgcttgtttctttatcgggatggacaaaaatgatataatacaaatatt 6714374  T
Q  134 aaatggctgtgga 146  Q
    |||||| ||||||    
T  6714375 aaatgggtgtgga 6714387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 6726391 - 6726638
Alignment:
Q  28 taaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattca 127  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||  ||  ||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  || ||    
T  6726391 taaaagtaagctttcatggtttaaaacattttacagagaaacaaatatttcttgatatagcttgtttctttattgggatggacaaaaaggatgcgatcca 6726490  T
Q  128 aatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcatgcat 227  Q
    |||||| ||||| |||||  |||| |||||   |||||| |  |||||||||||| ||  ||||||||| || ||   | ||||||| ||| | ||||||    
T  6726491 aatattgaatgggtgtgggttttttgctgatgatggaattaaagtccttgttgagagagcccttgtaactgttgacaatgagaacaaacttagaatgcat 6726590  T
Q  228 gatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcacca 275  Q
    |||||| |  |||| ||||||||  ||||||||  |||| ||||||||    
T  6726591 gatttgttgagagacatgggaaggcaaatcatttttgaggaatcacca 6726638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6535167 - 6534858
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||||||||| |||| ||| ||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   || |||||     
T  6535167 agaagctaagaataagttttgatggtttaaaagatgttacagagcaacaaatattccttgatatagcctgtttcttgattggaatggataaaactgatgc 6535068  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
     ||  ||||||||||||| |||||  |||| |||||  ||||| | |  ||||| || |||||||||||||| || || ||   ||  ||||| ||| |     
T  6535067 aataaaaatattaaatgggtgtgggttttttgctgatgttggagttaaagtcctggtagagcgaagccttgttactgttgacaatagaaacaaacttaga 6534968  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    |||||||||||| |  |||| ||||||||  | || |||  |||| |||||||| |||| |||||| | || ||||||||||||  ||||||||| | ||    
T  6534967 atgcatgatttgttgagagacatgggaaggcagataatttatgaggaatcaccattggatcctgagaaccgaagtaggttgtggcgtcgtgaggaagcgc 6534868  T
Q  322 ttgatgtatt 331  Q
    ||||| ||||    
T  6534867 ttgatatatt 6534858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 494
Target Start/End: Original strand, 4352152 - 4352193
Alignment:
Q  453 tgtgctgttgttagcgcaaaagctttgaatattagtttggtt 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4352152 tgtgctgttgttagcgcaaaagctttcaatattagtttggtt 4352193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 458 - 510
Target Start/End: Original strand, 4359343 - 4359395
Alignment:
Q  458 tgttgttagcgcaaaagctttgaatattagtttggttattaatcattttgtgc 510  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4359343 tgttgttagcacagaagttttgaatattagtttggttgtgaatcattttgtgc 4359395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 6501983 - 6501917
Alignment:
Q  71 aatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattcaaatattaaat 137  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||  |||||| |||||||    
T  6501983 aatattctttgacatagcatgtttctttatcgggatgagccaaaatgatgtacttcaaacattaaat 6501917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 6592897 - 6592831
Alignment:
Q  71 aatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattcaaatattaaat 137  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||    
T  6592897 aatattccttgatatagcatgtctctttgttgggatgaacctaaatgatgtaaagcaaatattaaat 6592831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 4322170 - 4322126
Alignment:
Q  449 catttgtgctgttgttagcgcaaaagctttgaatattagtttggtt 494  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4322170 catttgttctgttgttagcacaaaagctttgaat-ttagtttggtt 4322126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 458 - 510
Target Start/End: Original strand, 4343880 - 4343932
Alignment:
Q  458 tgttgttagcgcaaaagctttgaatattagtttggttattaatcattttgtgc 510  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  4343880 tgttgttagcacagaagttttgaatattagtttggttgtgaatcagtttgtgc 4343932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 7888261 - 7888181
Alignment:
Q  32 aataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccg 112  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||  || ||||   ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  7888261 aataagttttgatggtttaagtgatgatgatgtgaaagatatattccttgatattgcttttttctttattggtatggaccg 7888181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 351
Target Start/End: Original strand, 5342168 - 5342497
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5342168 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgacgagactgagaaagaaatatttcttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 5342267  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||  | |||||||| |||||     
T  5342268 catacaaatattaaatggctgtggactttttgcagaaattggaataagtgttcttgttgagcgaagccttgtaattgttgacagcaagaacaaacttgga 5342367  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| |||||||| |||   ||||||||||    
T  5342368 atgcacgatttgctgcgagatatgggaagagaaatcgttcgtgagaaatcaccaaaggagcttggggagcgtagcaggttgtgctttaaggaggatgtgc 5342467  T
Q  322 ttgatgtattgtcagaacatactgtaagaa 351  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||    
T  5342468 ttgatgtattatcagaacaaaccgtaagaa 5342497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 355
Target Start/End: Original strand, 5094515 - 5094848
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5094515 agaagttaagaataagctatgatgctttaaatgatgacattgagaaagaaatattccttgatgtagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgacgt 5094614  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    ||  |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||| ||||||||| |||||     
T  5094615 tacacttatattaaatggatgtggactttttgctgaaattggaataagtatccttgttgagcgtagtcttgtaactgttgatgataagaacaaacttgga 5094714  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||||    
T  5094715 atgcatgatttgttgcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccagaggagctcgaggagcgttgcaggttgtggtttcatgatgatgtgc 5094814  T
Q  322 ttgatgtattgtcagaacatactgtaagaacttc 355  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5094815 ttcatgtattatcagaacaaactgtaagaacttc 5094848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 355
Target Start/End: Original strand, 5424227 - 5424560
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5424227 agaagttaagaataagctatgatgctttaaatgatgatactgagaaagaaatattccttgacatagcttgtttctttattggaatggacagaaatgatgt 5424326  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    ||  |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |||||     
T  5424327 tacacttatattaaatggatgtggactttttgctgaaattggaataagtatccttgttgagcggagtcttgtcactgttgatgataataacaaacttgga 5424426  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||  ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  5424427 atgcatgatttgttgcgagatatgggaagagaaatcattcgtgggaaatcaccagaagagctcgaggagcgttgcaggttgtggtttcatgaggatgtgc 5424526  T
Q  322 ttgatgtattgtcagaacatactgtaagaacttc 355  Q
    || ||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  5424527 ttcatgtattatcagatcaaactgtaagaacttc 5424560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5104400 - 5104067
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5104400 agaagttaagaataagctacgatggtttaaatgatgacattgagaaagaaatattcctcgatgtagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgacgt 5104301  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    ||  |  |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||| |||||     
T  5104300 tacacttatattagatggatgtggactttttgcagaaattggaataagtatccttgttgagcgaagtcttataactgttgatgataagaacaaacttgga 5104201  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||||    
T  5104200 atgcatgatttgttgcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccagaggagctcgaggagcgttgcaggttgtggtttcatgacgatgtgc 5104101  T
Q  322 ttgatgtattgtcagaacatactgtaagaacttc 355  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5104100 ttcatgtattgtcagaacatacggtaagaacttc 5104067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5356138 - 5355805
Alignment:
Q  28 taaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |     
T  5356138 taaaaataagctatgatggtttaaatgatgatgccgagaaagaaatatttcttgacatagcttgtttctttattgggatcgaccgaaatgatgctacact 5356039  T
Q  128 aatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcatgcat 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| | |||| | ||||||    
T  5356038 aatattaaatggatgtggactttatgctgaaattggaataagtattcttgttgagcgaagccttgtaactgttgatgataagaataggcttagaatgcat 5355939  T
Q  228 gatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgcttgatg 327  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||| || |||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  5355938 gatttgctacgagatatgggaagagaagtcgttcgtgagaaatcaccggaggaccctgaggcacgtagcagattgtggcttcatgatgatgtgcttgatg 5355839  T
Q  328 tattgtcagaacatactgtaagaacttcttatac 361  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  5355838 ttttatcagatcaatctgtaagaacttcatatac 5355805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 355
Target Start/End: Original strand, 5368934 - 5369267
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5368934 agaagttaagaataagctatgatgctttaaatgatgattatgagaaagaaatattccttgatgtagcttgtttctttattgggaaggaccgaaatgatgt 5369033  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    ||  |  |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||| |||||     
T  5369034 tacacttatattagatggatgtggactttttgctgaaattggaataagtatccttgttgagcgaagtcttgtcactgttgatgataagaacaaacttgga 5369133  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||  ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  5369134 atgcatgatttgttgcgagatatgggaagagaaatcattcgtgggaaatcaccagaagagctcgaggagcgttgcaggttgtggtttcatgaggatgtgc 5369233  T
Q  322 ttgatgtattgtcagaacatactgtaagaacttc 355  Q
    || ||||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  5369234 ttcatgtattatcagatcaaactgtaagatcttc 5369267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5068602 - 5068269
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5068602 agaagttaagaataagctatgatgctttaaatgatgatactgagaaagaaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 5068503  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    ||  |  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |  || |||   |||||||| |||||     
T  5068502 tacacttatattaaatggatgcggactttttgctgaaattggaataagtatccttgttgagcgaagtctggttattgttgataaaaagaacaaacttgga 5068403  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   ||||  ||||| ||| | |||||||||||||  ||||||| ||    
T  5068402 atgcatgatttgttgcgagatatgggaagagaaatcgttcgtgggaaatcaccagaagagctcgaggagcgttgcaggttgtggtttcaggaggatgcgc 5068303  T
Q  322 ttgatgtattgtcagaacatactgtaagaacttc 355  Q
    || | ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5068302 ttcaagtattatcagaacaaactgtaagaacttc 5068269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5075259 - 5074931
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5075259 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaacgatgacactgagaagaaaatattcctcgacatagcttgtttctttattgggatggatcgaaatgatgt 5075160  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    ||  |  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||     
T  5075159 tacacttatattaaatggatgtgaactttttgctgaaattggagtaagtgtacttgttgagcgaagccttgtaactgtcgatgataggaacaagcttgga 5075060  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |   ||||||||||  ||||| || || ||||||  | |||| |||     
T  5075059 atgcatgatttgctgcgtgatatgggaagagaaatcattcgtgaaaaatcagaa---gagcctgaggggcgtagcagattatggtttgataaggacgtgt 5074963  T
Q  322 ttgatgtattgtcagaacatactgtaagaact 353  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  5074962 ttgatgtattatcagaacaaaatgtaagaact 5074931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 351
Target Start/End: Original strand, 5395517 - 5395846
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  5395517 agaagttaaaaataagctatgatgctttaaatgatgacactgagaaagaaatattccttgacatagcttgtttttttattgggatggacaggaatgatgt 5395616  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    ||| || |||||||||||  | | |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||  ||||      
T  5395617 tatacatatattaaatggtagcgaactttttgcagaaattggagtaagtgtccttgttgagcgaagccttgtaactgttgatgataggaacagacttgca 5395716  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||  | | || ||||    
T  5395717 atgcatgatttgctaagagatatgggaagagaaatcgttcgtgagaagtcaccaaaagagcccgaggagcgtagcaggttgtggtttaataatgacgtgc 5395816  T
Q  322 ttgatgtattgtcagaacatactgtaagaa 351  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  5395817 tggatgtattatcagaacaaactgtaagaa 5395846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 324
Target Start/End: Original strand, 5382124 - 5382424
Alignment:
Q  23 gaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgtt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5382124 gaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgacgatagcgaaaaagaaatattccttgacatagcttgtttctttattgg-atggaccgaaacgatgtt 5382222  T
Q  123 attcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggca 222  Q
    |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||| |    
T  5382223 acacaaatattaaatgggtgtgggctttttgctgatatcggaataagtgtccttgttgagagaagccttgtaactgtcgatgataagaatacacttggaa 5382322  T
Q  223 tgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgct 322  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  5382323 tgcatgatttgttaagggatatgggaagagaaatcattcgtgaaaaatcaccaaaggatcctgaggagcgtagcaggttatggtttcatgaggatgtcct 5382422  T
Q  323 tg 324  Q
    ||    
T  5382423 tg 5382424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 361
Target Start/End: Original strand, 5175340 - 5175679
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5175340 agaagttaaaaataagctatgatggtttagacgatgattaccagaaatcaatattcctcgacgtagcttgtttctttattgggatggacagaaatgatgt 5175439  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||  ||| |||||||||||     
T  5175440 tatacatatattaaatggctgtggattttttgcagaagatggaataagtgtcctggttgagcgaagcttagtaacggttgataataaaaacaagcttgga 5175539  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    |||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| || | ||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||      
T  5175540 atgcataatttgttgcgggatatgggaagagaaatcatttgtaataaaccacgaatggagcctgaggagcgtagcaggttgtggtttcttgaggatgttg 5175639  T
Q  322 ttgatgtattgtcagaacatactgtaagaacttcttatac 361  Q
     |||||| ||  ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  5175640 atgatgtgttagcaggacaaaccgtaagaacttcttatac 5175679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 319
Target Start/End: Original strand, 5277167 - 5277464
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5277167 agaagttaaaaataagctatgatggtttagacgatgattaccagaaatcaatattcctcgacgtagcttgtttctttattgggatggacagaaatgatgt 5277266  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||| |||||||||||     
T  5277267 tatacatatattaaatggctgtggattttttgcagaagatggaataagtgtccttgttgagcgaagcttagtaacggttgataataaaaacaagcttgga 5277366  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgt 319  Q
    |||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| || | ||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5277367 atgcataatttgttgcgggatatgggaagagaaatcatttgtaataaaccacgaatggagcctgaggagcgtagcaggttgtggtttcttgaggatgt 5277464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5159034 - 5158696
Alignment:
Q  17 acatcagaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaat 116  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||   |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5159034 acataagaagttacgaataagctacgatgctttaaatgatgactttgagaaagaaatattccttgatgtagcttgtttctttatagggatggaccgaaat 5158935  T
Q  117 gatgttattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagc 216  Q
    || ||||  |  ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |    
T  5158934 gacgttacacttatattaaatggatgtgaactttttggtgaaattggaataagcatccttgttgagcgtagtcttgttactgttgatggtaagaacaaac 5158835  T
Q  217 ttggcatgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgagga 316  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||| ||| | ||||||||||||| ||| ||    
T  5158834 ttggaatgcatgatttgttgcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccagaggagatcgaggagcgttgcaggttgtggtttcatgacga 5158735  T
Q  317 tgtgcttgatgtattgtcagaacatactgtaagaacttc 355  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5158734 tgtgcttcatgtattatcagaacaaactgtaagaacttc 5158696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 355
Target Start/End: Original strand, 5348851 - 5349184
Alignment:
Q  24 aagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgtta 123  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348851 aagttaagaataagctacgatgctttgaatgatgatactgagaaagaaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgtta 5348950  T
Q  124 ttcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcat 223  Q
      |  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||| || || |||| ||||||||| ||||| ||    
T  5348951 cacttatattaaatggatgtgaactttttgctgaaattggaataagtatctttgttgatcgaagtcttgtcactgttgatgataagaacaaacttggaat 5349050  T
Q  224 gc--atgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    ||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||  ||||| ||| | ||||| |||||||  ||||||||||    
T  5349051 gcatatgatttgttgcgagatatgggaagagaaatcattcgtgggaaatcaccagaagagctcgaggagcgttgcaggttctggtttcaggaggatgtgc 5349150  T
Q  322 ttgatgtattgtcagaacatactgtaagaacttc 355  Q
    || |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  5349151 ttcatgttttatcagatcaaactgtaagaacttc 5349184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5183480 - 5183165
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  5183480 agaagttaaaaataagctacgatgctctaagtgatgacaccgagaaagaaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggacaggaatgatgt 5183381  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    ||| || |||||||||||  | | | |||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||| ||        
T  5183380 tatacatatattaaatggtagcgaattttttgcagaaattggagtaagtgtccttgttgagagaagccttgtaactgttgatgataggaacaaactgcaa 5183281  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||    ||||||||     
T  5183280 atgcatgatttgctaagagatatgggaagagaaatcgttcgtgagaagtcaccaaaagagcctgaggagcgtagcaggttgtggtttaacaaggatgtga 5183181  T
Q  322 ttgatgtattgtcaga 337  Q
    |||| ||||| |||||    
T  5183180 ttgacgtattatcaga 5183165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5133433 - 5133096
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||  |||||||||    
T  5133433 agaagctaaaaataagctatgatgctttaaatgaagatattgagaaagaaatattccttaacatagcttgtttttttattgatatggacacaaatgatgt 5133334  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    ||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||     
T  5133333 tacacatatattaaatggttgtggactttttgccgaaattggaataagtattcttattgagagaagccttgtaactgttgatgctaaggacaggcttgga 5133234  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||   || |  |||||| ||| | ||  |||||||||  ||||||||||    
T  5133233 atgcatgatttgttgagagatatgggaagagaaattattcgtgaagaatcaccggaggtgtttgaggagcgttgcagactgtggtttcacgaggatgtgc 5133134  T
Q  322 ttgatgtattgtcagaacatactgtaagaacttcttat 359  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||    
T  5133133 ttgatgtactatcaaaacaaacagtaagaacttcttat 5133096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5148487 - 5148154
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5148487 agaagttaaaaataagctatgacgatttaaatgatgttcttgtgaaagaaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 5148388  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
     || || |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| || || |||| || |||   ||||||     
T  5148387 catacatatattaaatggctgtgaactttatgcagaaattggaataaatgtcctactggagcgaagccttgtgactgttgatgatatgaatcggcttgga 5148288  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||  |||  |||| | || ||||| ||||||||| ||  ||||||||    
T  5148287 atgcatgatttgttgcgagacatggcaagagaaatcatacgcgaggaatcaccaaaagaggttgagaatcggagtagattgtggtttagtacggatgtgc 5148188  T
Q  322 ttgatgtattgtcagaacatactgtaagaacttc 355  Q
    || |||| || || ||||| |||||||| |||||    
T  5148187 ttaatgtgttatctgaacaaactgtaagtacttc 5148154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5261674 - 5261346
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||   |||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5261674 agaagttaagaataagttatgatgatttgaaagatgacgatgagcaagaaatatttcttgacatagcttgtttcttaattggaatggaccgaaatgatgt 5261575  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    ||| |   ||||||||| ||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |  || |||| |||||||| ||||||     
T  5261574 tatactcgtattaaatgactgtggacttcatgcagaaattggaataagcgtccttgttgagagaagccttgtgagtgttgatgataagaacatgcttgga 5261475  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||   ||  |||||||||     
T  5261474 atgcatggtttgttgcgagatatgggaagagaaattgttcgtgaggaatcaccaaggaggcctgagaaacgtagcaggttgtgtgatcaggaggatgtga 5261375  T
Q  322 ttgatgtattgtcagaacatactgtaaga 350  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  5261374 ttgatgtattatcaaaacaaactgtaaga 5261346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5285671 - 5285364
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||| || ||| ||  |||| ||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  5285671 agaagttaagaataagttatgatgatttgaaagataatgatgagcaagaaatattccttgaca--gcttgtttcttaattggaatggacagaaatgatgt 5285574  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    ||| |   ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |  || |||| |||||||| ||||||     
T  5285573 tatactcgtattaaatgactgtggactttatgcagaaattggaataagcgtccttgttgagagaagccttgtgagtgttgatgataagaacatgcttgga 5285474  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||| ||  |||||||||     
T  5285473 atgcatggtttgctgcgagatatgggaagaggaattgttcgtgaggaatcaccaaggaggcctgagaaacgtagcaggttgtggtatccggaggatgtga 5285374  T
Q  322 ttgatgtatt 331  Q
    ||||||||||    
T  5285373 ttgatgtatt 5285364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 354
Target Start/End: Original strand, 5445554 - 5445883
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    |||||||||  || || ||||||||||||||| |||   ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  5445554 agaagttaaggatgagttatgatggtttaaatcatg---ctgagaaagaaatattccttcacattgcttgtttctttgtcgggatggaccaaaatgatgt 5445650  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    ||| |   |||||||||  || |||||||  || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||||||| ||||||     
T  5445651 tatacttttattaaatgattgcggactttctgcagaaattggaataagtgtccttgttgctcgaagccttgtgactgttgatgataagaacatgcttgga 5445750  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    ||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||     
T  5445751 atgcatggtcagctgcgagatatgggaagaggaatcgtttgtgaggaatcaccaaggaggcctgagaaacgtagtaggttgtgggatcaggaggatgtga 5445850  T
Q  322 ttgatgtattgtcagaacatactgtaagaactt 354  Q
    |||||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  5445851 ttgatgtattatcaagacaaactgtaagaactt 5445883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5691637 - 5691390
Alignment:
Q  24 aagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgtta 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  5691637 aagttaagaataagctatgatggtttaagtgattatacggagaaagaaatattccttgacgtggcttgtttctttattgggatggttcgaaatgatgttg 5691538  T
Q  124 ttcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcat 223  Q
    | || |||||| |||| ||||  ||||  || | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || || |||| || ||||| |||| | ||    
T  5691537 tacatatattagatggttgtgatctttatgcaggaattggaataaatgtccttgtggagcgaagccttgtgactgttgatgataggaacaggcttagaat 5691438  T
Q  224 gcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatc 271  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5691437 gcatgatttgttgcgagatatgggaagagaaatcgttcgtgagaaatc 5691390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 361
Target Start/End: Original strand, 5431883 - 5432220
Alignment:
Q  24 aagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgtta 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  5431883 aagttaaaaataagctatgatggtttagacgataaatcccagaaagcaatattccttgacatagcttgtttctttattggtaaggagcgaaatgatgtta 5431982  T
Q  124 ttcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcat 223  Q
    | || ||| ||||||||||| || | || ||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||    | |||| | | ||||||||||| ||    
T  5431983 tacatatactaaatggctgtcgattgtttgctgaagatggaataagagtccttgttgagcgtagcttagtatatattgatgatgataacaagcttggaat 5432082  T
Q  224 gcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgctt 323  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || | ||  |||||| ||| |||||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||   |    
T  5432083 gcatgatttgttgcgggatatgggaagagaaatcatttgtaataatccaccaaaggatcctgaggagcatagcaggttgtggcttcctgaggatgttgat 5432182  T
Q  324 gatgtattgtcagaacatactgtaagaacttcttatac 361  Q
    | ||||||  ||  ||| |||||||||||||| |||||    
T  5432183 ggtgtattagcaagacaaactgtaagaacttcatatac 5432220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 178; Significance: 9e-96; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 36215420 - 36215091
Alignment:
Q  22 agaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgt 121  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36215420 agaagttaaaaatgagctatgaaggtctaaatgatgacacggagaaagaaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggacagaaatgatgt 36215321  T
Q  122 tattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggc 221  Q
    ||| || |||||||||||  ||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||     
T  36215320 tatacatatattaaatggaagtgaactttttgcagaaattggagtaagtgttcttgtagagcgaagccttgtaactgttgatgataggaacaggcttgga 36215221  T
Q  222 atgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||  | |||| |||     
T  36215220 atgcatgatttgctgcgagatatgggaagagagatcattcgtgagaaatcaccaaaggagcttgaggagcgtagcaggttgtggtttaataaggacgtgg 36215121  T
Q  322 ttgatgtattgtcagaacatactgtaagaa 351  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36215120 ctgatgtattatcagaacaaactgtaagaa 36215091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34727254 - 34727031
Alignment:
Q  30 aaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattcaaa 129  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||   | || || | |  ||    
T  34727254 aaaataagctttgatggtttaagtgatgatgatgtgaaagaaatattccttgatattgcttttttctttattgggatggaccaggaagaggtaactacaa 34727155  T
Q  130 tattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcatgcatga 229  Q
    ||||  | |||||||| | ||| || || |||||||||||| |||| ||  |    ||||| ||||| || ||| | ||||||||| |||| ||||||||    
T  34727154 tattggaaggctgtgggcattttgcagatattggaataagtctcctagtacaaaagagcctcgtaactgttgataggaagaacaagattgggatgcatga 34727055  T
Q  230 tttgcttcgagatatgggaagaga 253  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||    
T  34727054 tttgctacgagacatgggacgaga 34727031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 10195 - 9890
Alignment:
Q  23 gaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgtt 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10195 gaagttaaaagtaagctatgatggtttaaatgatgatacagaaaaagatatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaacgatgtt 10096  T
Q  123 attcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggca 222  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |  ||||| |    
T  10095 acacaaatattaaatggatgtggactttttgctaatatcggaataagtgtccttgttgagcgaagccttctaactgtcgatgataagaatacacttggaa 9996  T
Q  223 tgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgct 322  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  9995 tgcatgatttattacgagatatgggaagggaaatcattcgtgaaaaatcaccaagggatcctgaggaccgtagtaggttatggtttcaagaggatgtgct 9896  T
Q  323 tgatgt 328  Q
    | ||||    
T  9895 taatgt 9890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 8876270 - 8876561
Alignment:
Q  17 acatcagaagttaaaaataagctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaat 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8876270 acatgagaagttaaaaataagctatgatggtctaaatgatgatattgcgaaagaaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaat 8876369  T
Q  117 gatgttattcaaata--ttaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaa 214  Q
    |||||||| || |||  |||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||  | ||| |     
T  8876370 gatgttatacatatattttaaatgggtgtgaactttatcctgaaattggaataagtgttcttgttgaacgaagccttgtaaccatggatgaaaggaatat 8876469  T
Q  215 gcttggcatgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggt 306  Q
    |||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  8876470 gcttggaatgcatgatttgttgacagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaaaggatcctgaggagcgtagcaggttgtggt 8876561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 351
Target Start/End: Original strand, 15801829 - 15801970
Alignment:
Q  210 aacaagcttggcatgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttc 309  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |  |||||   |||||||||| |||||| | | ||||||| |     
T  15801829 aacaagcttggaatgcatgctctgctacgagacatgggaagagaaattgttcgtgaaagttcacctgaggagcctgagaaacgtactcgattgtggtgtt 15801928  T
Q  310 gtgaggatgtgcttgatgtattgtcagaacatactgtaagaa 351  Q
     ||| |||||  |||||||| || | ||||| || |||||||    
T  15801929 ttgaagatgtagttgatgtactggccgaacaaaccgtaagaa 15801970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 71 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22585800 - 22585521
Alignment:
Q  71 aatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattcaaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagt 170  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||     
T  22585800 aatattccttgacatagcttttttcttaattggaatggaccgaaatgatgttatactcatattaaatgactgtggacttcatgcagaaattggaataagc 22585701  T
Q  171 gtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcatgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaat 270  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  || |||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||| |||| |||    
T  22585700 gtccttgttgagagaagccttgtgagtgttgatgataagaacaggcttggaatgcatgatttgctgcgagatatgggaagaggaattgttcttgaggaat 22585601  T
Q  271 caccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgcttgatgtattgtcagaacatactgtaaga 350  Q
    |||||| |   |||||| | ||||| ||||||| || ||  ||||||||| |||| ||||| ||| |||| |||||||||    
T  22585600 caccaaagagtcctgagaagcgtagcaggttgttgtatccggaggatgtgattgacgtattatcaaaacaaactgtaaga 22585521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0373 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0373
Description:

Target: scaffold0373; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11385 - 11171
Alignment:
Q  42 gatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattcaaatattaaatggct 141  Q
    ||||| ||||| |||  ||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  11385 gatgggttaaaagattgtactgagaaacaaatatttcttgatatagcttgcttctttattgggatggatcaaaatgatgcaattcaaatattaaatgggt 11286  T
Q  142 gtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcatgcatgatttgcttcgaga 241  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |  || ||||||||  ||  ||||||||| || ||   ||| ||||||||| | |||||||||||| |  ||||    
T  11285 gtggattttttgctgatattggaattaaagttcttgttgaaagagcccttgtaactgttgacaataataacaagcttagaatgcatgatttgttaagaga 11186  T
Q  242 tatgggaagagaaat 256  Q
     ||||||||| ||||    
T  11185 catgggaagacaaat 11171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 3326292 - 3326071
Alignment:
Q  133 taaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcatgcatgattt 232  Q
    ||||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||   | ||    || ||||||||||| ||||||  |||    
T  3326292 taaatggctgtggactttatgcaaatattggaataagtgttctcatagagcggagccttgtaaaaattgaaaagaataacaagcttggaatgcattgttt 3326193  T
Q  233 gcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgcttgatgtattg 332  Q
    | |  |||| |||||||||||||| |||||||| |  ||  |||  ||||||| | | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  | |||    
T  3326192 gataagagacatgggaagagaaattattcgtgaaagttctgcaaaagagcctgggaagcgtagtagattgtggtttcatgaggatgtgcatgacattttg 3326093  T
Q  333 tcagaacatactgtaagaactt 354  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  3326092 acaaaacatactgtaagaactt 3326071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7165976 - 7165853
Alignment:
Q  133 taaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcatgcatgattt 232  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||| |   | ||    || ||||||||||| |||||||||||    
T  7165976 taaatggttgtggactttatgctgacattggaataacggtcctcgtagagcggagccttgtgaaaattgaaaagaataacaagcttggaatgcatgattt 7165877  T
Q  233 gcttcgagatatgggaagagaaat 256  Q
    |||| |||| ||||||||||||||    
T  7165876 gcttagagacatgggaagagaaat 7165853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 210 - 351
Target Start/End: Original strand, 3313695 - 3313836
Alignment:
Q  210 aacaagcttggcatgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttc 309  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||  | ||||| |  |||||   |||||||||  | |||||| | ||||||| ||    
T  3313695 aacaagcttggaatgcatgatttactgcgagacatgggacgagaaattgtccgtgaaagttcacctgaggagcctgaaaagcgtagtcgattgtggtatc 3313794  T
Q  310 gtgaggatgtgcttgatgtattgtcagaacatactgtaagaa 351  Q
     |||||||||  |||||||| || | || |||||||||||||    
T  3313795 atgaggatgtagttgatgtactgaccgaccatactgtaagaa 3313836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3392815 - 3392763
Alignment:
Q  213 aagcttggcatgcatgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtga 265  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  3392815 aagcttggaatgcatgatttgctacgagacatgggaagggaaattgttcgtga 3392763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 331
Target Start/End: Original strand, 5263 - 5467
Alignment:
Q  127 aaatattaaatggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgtaacggtcgatggtaagaacaagcttggcatgca 226  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| || || |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| || ||   || |||||||||| | |||||    
T  5263 aaatattaaatgggtgtgggttttttgcggatattggaattaaagtccttgtagagcgaagccttgtaactgttgacaataggaacaagcttagaatgca 5362  T
Q  227 tgatttgcttcgagatatgggaagagaaatcattcgtgagaaatcaccaatggagcctgaggaacgtagtaggttgtggtttcgtgaggatgtgcttgat 326  Q
    ||| ||| |  |||||||||||||  |||| ||   |||  |||||||| | || |||||| | || ||||||||||||   |||||||| |||  ||||    
T  5363 tgacttgttgagagatatgggaaggcaaataatctatgaagaatcaccatttgatcctgagaaccgcagtaggttgtggcgccgtgaggaagtgtatgat 5462  T
Q  327 gtatt 331  Q
    |||||    
T  5463 gtatt 5467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University