View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8903_low_34 (Length: 419)

Name: NF8903_low_34
Description: NF8903
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8903_low_34
NF8903_low_34
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (5-406)||(55292322-55292723)
chr3 (1-406)||(10554242-10554638)
chr3 (62-406)||(54973244-54973589)
chr3 (62-406)||(54975854-54976199)
chr3 (62-406)||(54978464-54978809)
chr3 (1-257)||(16799620-16799876)
chr3 (2-257)||(2035036-2035282)
chr3 (2-257)||(2038543-2038789)
chr3 (2-257)||(2042284-2042530)
chr3 (2-257)||(14037998-14038244)
chr3 (2-257)||(14041466-14041712)
chr3 (2-257)||(18958717-18958963)
chr3 (67-257)||(603698-603885)
chr3 (67-257)||(15010208-15010395)
chr3 (79-257)||(54046607-54046782)
chr3 (66-257)||(10989622-10989812)
chr3 (64-220)||(39230602-39230756)
chr3 (2-52)||(39230561-39230611)
chr3 (1-50)||(54973210-54973259)
chr3 (1-50)||(54975820-54975869)
chr3 (1-50)||(54978430-54978479)
chr3 (13-127)||(6805873-6805990)
chr3 (1-50)||(603875-603924)
chr3 (1-41)||(14951722-14951762)
chr3 (4-50)||(15010385-15010431)
chr3 (76-137)||(10834231-10834292)
chr3 (13-114)||(179573-179671)
chr3 (13-52)||(30206490-30206529)
chr3 (13-118)||(3394864-3394972)
chr3 (94-127)||(9533379-9533412)
chr3 (1-46)||(54046556-54046601)
chr3 (4-36)||(35984896-35984928)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (1-406)||(8522729-8523135)
chr6 (2-403)||(15686021-15686411)
chr6 (1-257)||(2287966-2288222)
chr6 (1-257)||(15539084-15539340)
chr6 (2-257)||(16829619-16829865)
chr6 (5-257)||(16812602-16812845)
chr6 (2-257)||(16102164-16102410)
chr6 (2-257)||(12595778-12596024)
chr6 (2-204)||(29492576-29492770)
chr6 (13-52)||(1590542-1590581)
chr6 (5-52)||(1639218-1639266)
chr6 (73-137)||(23838104-23838168)
chr6 (6-41)||(9185881-9185916)
chr6 (6-41)||(18137658-18137693)
chr6 (4-38)||(25749892-25749926)
chr6 (5-50)||(19472277-19472322)
chr6 (11-52)||(23621131-23621172)
chr6 (13-104)||(12389673-12389767)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (1-406)||(29325138-29325544)
chr5 (1-406)||(26495683-26496089)
chr5 (2-257)||(4397530-4397776)
chr5 (2-256)||(26361136-26361380)
chr5 (1-181)||(23693278-23693450)
chr5 (64-257)||(22758711-22758903)
chr5 (2-153)||(16256088-16256232)
chr5 (2-153)||(22589885-22590029)
chr5 (2-153)||(22593440-22593584)
chr5 (2-153)||(22596995-22597139)
chr5 (2-149)||(16259725-16259865)
chr5 (1-156)||(43120997-43121144)
chr5 (1-156)||(43124530-43124677)
chr5 (100-156)||(22880138-22880195)
chr5 (13-52)||(22758894-22758933)
chr5 (294-367)||(27869316-27869390)
chr5 (4-36)||(22357860-22357892)
chr5 (4-38)||(21495076-21495110)
chr5 (4-49)||(21980951-21980997)
chr5 (4-52)||(21559355-21559404)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (1-406)||(41791469-41791875)
chr4 (1-406)||(14698515-14698919)
chr4 (1-406)||(4170823-4171227)
chr4 (1-404)||(53387620-53388017)
chr4 (1-406)||(16278008-16278405)
chr4 (2-257)||(286911-287157)
chr4 (2-257)||(15280136-15280381)
chr4 (2-257)||(28382645-28382891)
chr4 (2-257)||(47126878-47127124)
chr4 (64-257)||(56115656-56115848)
chr4 (2-181)||(16359325-16359495)
chr4 (1-257)||(33848728-33848974)
chr4 (1-257)||(10313535-10313782)
chr4 (1-156)||(31117185-31117332)
chr4 (1-156)||(55502880-55503027)
chr4 (1-68)||(9388310-9388377)
chr4 (260-343)||(21189768-21189851)
chr4 (13-89)||(15242314-15242390)
chr4 (4-118)||(15990131-15990242)
chr4 (76-137)||(24047427-24047488)
chr4 (13-52)||(14942557-14942596)
chr4 (4-118)||(15448273-15448379)
chr4 (13-52)||(56115839-56115878)
chr4 (13-118)||(27027817-27027925)
chr4 (13-52)||(6511656-6511695)
chr4 (4-38)||(14821535-14821569)
chr4 (11-52)||(13881512-13881553)
chr4 (14-47)||(24047514-24047547)
chr4 (13-46)||(33662484-33662517)
chr4 (4-52)||(13886847-13886895)
chr4 (5-41)||(14048379-14048415)
chr4 (6-38)||(15075466-15075498)
chr4 (4-52)||(15244280-15244328)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (1-406)||(21241573-21241979)
chr2 (1-403)||(21239026-21239429)
chr2 (1-406)||(24504500-24504906)
chr2 (5-404)||(20591005-20591404)
chr2 (62-406)||(31506024-31506368)
chr2 (62-405)||(31503458-31503801)
chr2 (64-257)||(28348947-28349139)
chr2 (1-257)||(41684815-41685062)
chr2 (67-257)||(12627942-12628129)
chr2 (2-257)||(44620754-44620995)
chr2 (1-257)||(23339220-23339466)
chr2 (1-156)||(31755758-31755905)
chr2 (1-50)||(31503424-31503473)
chr2 (1-50)||(31505990-31506039)
chr2 (1-50)||(12628119-12628168)
chr2 (76-137)||(21073620-21073681)
chr2 (73-137)||(9241856-9241920)
chr2 (13-52)||(28348917-28348956)
chr2 (4-47)||(24274176-24274220)
chr2 (4-38)||(21123839-21123873)
chr2 (4-38)||(24669755-24669789)
chr2 (13-118)||(31518587-31518695)
chr2 (13-41)||(23375026-23375054)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (1-406)||(16006215-16006621)
chr7 (1-406)||(21743203-21743607)
chr7 (1-406)||(8776160-8776563)
chr7 (1-404)||(17505687-17506084)
chr7 (1-404)||(17547130-17547527)
chr7 (1-259)||(38828045-38828302)
chr7 (2-257)||(13395517-13395763)
chr7 (2-257)||(48785134-48785380)
chr7 (62-257)||(35366101-35366293)
chr7 (2-257)||(13733586-13733825)
chr7 (65-227)||(21065238-21065400)
chr7 (1-259)||(4993307-4993555)
chr7 (1-156)||(124324-124471)
chr7 (13-127)||(709467-709581)
chr7 (4-127)||(41055494-41055615)
chr7 (1-50)||(35366067-35366116)
chr7 (1-52)||(15725568-15725619)
chr7 (4-127)||(16462055-16462176)
chr7 (4-127)||(47975822-47975949)
chr7 (13-118)||(44190789-44190897)
chr7 (76-127)||(14421882-14421933)
chr7 (76-137)||(11661204-11661265)
chr7 (27-118)||(12755568-12755659)
chr7 (6-41)||(21519211-21519246)
chr7 (4-38)||(14255691-14255725)
chr7 (4-52)||(7507429-7507478)
chr7 (4-52)||(13894186-13894235)
chr7 (61-118)||(14416355-14416412)
chr7 (13-42)||(21065402-21065431)
chr7 (4-37)||(23442399-23442432)
chr7 (61-118)||(39431767-39431824)
chr7 (5-50)||(46625029-46625074)
chr7 (73-121)||(147595-147643)
chr7 (13-41)||(15690053-15690081)
chr7 (13-41)||(15697646-15697674)
chr7 (16-52)||(16573353-16573389)
chr7 (16-52)||(16592273-16592309)
[»] scaffold0525 (2 HSPs)
scaffold0525 (1-406)||(8968-9374)
scaffold0525 (2-257)||(10927-11173)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (1-406)||(45134823-45135229)
chr8 (1-406)||(6608172-6608576)
chr8 (62-406)||(7300980-7301322)
chr8 (2-257)||(24707859-24708106)
chr8 (64-257)||(363828-364020)
chr8 (256-406)||(21415144-21415294)
chr8 (2-257)||(22145439-22145680)
chr8 (1-257)||(17795218-17795464)
chr8 (64-257)||(44431901-44432093)
chr8 (2-153)||(17614740-17614884)
chr8 (64-257)||(22059443-22059633)
chr8 (1-257)||(28853772-28854018)
chr8 (2-52)||(22059624-22059674)
chr8 (1-50)||(7301307-7301356)
chr8 (141-257)||(10829505-10829619)
chr8 (13-52)||(363798-363837)
chr8 (13-52)||(44431871-44431910)
chr8 (5-52)||(22434531-22434579)
chr8 (6-41)||(15267297-15267332)
chr8 (4-50)||(20385304-20385351)
chr8 (13-52)||(21415478-21415517)
chr8 (6-41)||(22521830-22521865)
chr8 (13-47)||(362119-362153)
chr8 (13-47)||(43112134-43112168)
chr8 (61-118)||(18024576-18024633)
chr8 (4-52)||(19882058-19882107)
chr8 (13-50)||(32949725-32949762)
chr8 (73-121)||(27941716-27941764)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (62-406)||(20579321-20579668)
chr1 (5-259)||(2333021-2333274)
chr1 (2-257)||(20631137-20631383)
chr1 (2-257)||(37358293-37358538)
chr1 (2-257)||(36181396-36181642)
chr1 (64-257)||(294075-294267)
chr1 (2-257)||(14432406-14432647)
chr1 (2-153)||(22900406-22900550)
chr1 (1-257)||(45307111-45307357)
chr1 (79-257)||(24087311-24087485)
chr1 (1-227)||(296347-296558)
chr1 (1-50)||(20579287-20579336)
chr1 (1-50)||(20586980-20587029)
chr1 (1-49)||(24087260-24087308)
chr1 (76-137)||(28312446-28312507)
chr1 (13-52)||(294045-294084)
chr1 (4-55)||(7792752-7792803)
chr1 (76-127)||(20438131-20438182)
chr1 (5-52)||(32650339-32650386)
chr1 (64-118)||(16400803-16400857)
chr1 (13-46)||(28204639-28204672)
chr1 (6-38)||(24475494-24475526)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (64-257)||(8548-8740)
scaffold0395 (13-52)||(8731-8770)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (64-256)||(2379-2570)
scaffold0109 (13-52)||(2349-2388)
[»] scaffold0586 (2 HSPs)
scaffold0586 (260-406)||(1911-2057)
scaffold0586 (13-41)||(1684-1712)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (64-257)||(137815-138007)
scaffold0003 (16-52)||(137788-137824)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (2-205)||(1521-1716)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (96-256)||(162355-162515)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (65-251)||(134027-134209)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-156)||(32987-33134)
[»] scaffold0049 (3 HSPs)
scaffold0049 (1-156)||(81678-81825)
scaffold0049 (4-38)||(42900-42934)
scaffold0049 (4-38)||(45090-45124)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (4-52)||(33782-33831)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (4-127)||(21094-21221)
scaffold0026 (4-38)||(142810-142844)
[»] scaffold0453 (1 HSPs)
scaffold0453 (13-115)||(3123-3222)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (13-118)||(1668-1776)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (4-118)||(2786-2896)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (4-118)||(3807-3923)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (91-137)||(132864-132910)
[»] scaffold1276 (1 HSPs)
scaffold1276 (4-52)||(226-275)
[»] scaffold0491 (1 HSPs)
scaffold0491 (13-50)||(10571-10608)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (76-137)||(9847-9908)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (4-118)||(174688-174800)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (4-52)||(4922-4970)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (4-51)||(7205-7253)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (4-52)||(6004-6052)
scaffold0309 (4-52)||(8156-8204)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (13-52)||(5882-5921)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (6-41)||(29376-29411)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (6-41)||(384269-384304)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (14-52)||(11616-11654)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (14-52)||(13914-13952)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (4-38)||(25645-25679)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (13-47)||(2304-2338)
scaffold0151 (13-47)||(9148-9182)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (64-118)||(8193-8247)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (4-38)||(21715-21749)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (4-38)||(18140-18174)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (13-41)||(2871-2899)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (13-41)||(34821-34849)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (12-52)||(120977-121017)
scaffold0031 (12-52)||(131854-131894)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 55292723 - 55292322
Alignment:
Q  5 gactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactcc 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55292723 gactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactcc 55292624  T
Q  105 ccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55292623 ccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttggaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgc 55292524  T
Q  205 atttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcatataca 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55292523 atttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatataca 55292424  T
Q  305 acaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctctc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55292423 acaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctctc 55292324  T
Q  405 tg 406  Q
    ||    
T  55292323 tg 55292322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 10554242 - 10554638
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||       ||||||||||||| |   || |    
T  10554242 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggcaacgacaacgatc------gtgcataataactca---ctca 10554332  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10554333 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 10554432  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcata 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10554433 atgcatttatccataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataataagcagcgagacaacaacgataataaccatcata 10554532  T
Q  301 tacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10554533 tacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcaataaacattataaacatcc 10554632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 62 - 406
Target Start/End: Original strand, 54973244 - 54973589
Alignment:
Q  62 caacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 161  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54973244 caactacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 54973343  T
Q  162 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatat 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54973344 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 54973443  T
Q  261 aataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgtt 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54973444 aataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgtt 54973543  T
Q  361 catcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctctctg 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54973544 catcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatcctctctg 54973589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 62 - 406
Target Start/End: Original strand, 54975854 - 54976199
Alignment:
Q  62 caacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 161  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54975854 caactacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 54975953  T
Q  162 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatat 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54975954 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 54976053  T
Q  261 aataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgtt 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54976054 aataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgtt 54976153  T
Q  361 catcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctctctg 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54976154 catcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatcctctctg 54976199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 62 - 406
Target Start/End: Original strand, 54978464 - 54978809
Alignment:
Q  62 caacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 161  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54978464 caactacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 54978563  T
Q  162 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatat 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54978564 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 54978663  T
Q  261 aataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgtt 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54978664 aataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgtt 54978763  T
Q  361 catcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctctctg 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54978764 catcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatcctctctg 54978809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 16799620 - 16799876
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16799620 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 16799719  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  16799720 ctccccaacttggttaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatgga 16799819  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  16799820 atgcatttatgcataaaccaacaatcaacatcaaatcatattcaatcaacaacaaca 16799876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2035282 - 2035036
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  2035282 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 2035190  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||    
T  2035189 tccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaa 2035091  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  2035090 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 2035036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2038789 - 2038543
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  2038789 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 2038697  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||    
T  2038696 tccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaa 2038598  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  2038597 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 2038543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2042530 - 2042284
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  2042530 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 2042438  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||    
T  2042437 tccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaa 2042339  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  2042338 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 2042284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 14037998 - 14038244
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  14037998 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 14038090  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||    
T  14038091 tccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaa 14038189  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  14038190 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 14038244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 14041466 - 14041712
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  14041466 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 14041558  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||    
T  14041559 tccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaa 14041657  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  14041658 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 14041712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 18958717 - 18958963
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  18958717 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 18958809  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||| ||||| | || |||||||    
T  18958810 tccccaactagatcaacatcaacaacctataactacgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacatattgtacattctaattgaa 18958908  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||| ||| | |||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  18958909 tgcaattaagtataatccagcgatcatcaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 18958963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 603885 - 603698
Alignment:
Q  67 acgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacctta 166  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  603885 acgacaacgaccgtgcataataact-atgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcaa-ctta 603788  T
Q  167 caacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    ||||  ||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  603787 caactcgaaccaacaccttatatattctaattgaatgcagttaagcataaacctgcaatcatcaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 603698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15010395 - 15010208
Alignment:
Q  67 acgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacctta 166  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  15010395 acgacaacgaccgtgcataataact-atgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactctcaa-ctta 15010298  T
Q  167 caacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    ||||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||| |||||    
T  15010297 caactcgaaccaacaccttgtatattctaattgaatgcagttaagcataaaccatcaatcatcaac-aatcataatcaatcaacaacaaca 15010208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 257
Target Start/End: Original strand, 54046607 - 54046782
Alignment:
Q  79 gtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaacca 178  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||    
T  54046607 gtgcataataact-atgacatactccccaacttggtcaacatcaacaaactatgactccgttacttagaacgacaactcgcaa-cttacaactcgaacca 54046704  T
Q  179 acatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||| |||||    
T  54046705 acaccttgtatattctaattgaatgcagttaagcataaaccaacaatcatcaac-aatcataatcaatcaacaacaaca 54046782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 66 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10989812 - 10989622
Alignment:
Q  66 aacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaac-ct 164  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  10989812 aacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcctttacttagaacgacaacttgcaacttt 10989714  T
Q  165 tacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    ||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  10989713 tacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaatcaacaatcagcaac-aatcatactcaatcaacagcaaca 10989622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 220
Target Start/End: Original strand, 39230602 - 39230756
Alignment:
Q  64 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacc 163  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  39230602 acaacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-c 39230699  T
Q  164 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 220  Q
    |||||||  |||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  39230700 ttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 39230756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 52
Target Start/End: Original strand, 39230561 - 39230611
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39230561 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaa 39230611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 54973210 - 54973259
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 50  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54973210 aaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 54973259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 54975820 - 54975869
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 50  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54975820 aaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 54975869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 54978430 - 54978479
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 50  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54978430 aaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 54978479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6805990 - 6805873
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggta---acaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||  |   ||||| |||| ||| ||| |||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  6805990 ttgtgtatatcaacatacaactcagcaacatcaacgacaatgtagacaacgacaacgacgacaacaactatgcataaataattatgacttactccacaac 6805891  T
Q  110 ttggtcaacatcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6805890 ttggtcaacatcaacaac 6805873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 603924 - 603875
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 50  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  603924 aaaggactcaacgtgtgtatatcagcatacaactcatctacgacaacgac 603875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 14951762 - 14951722
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 41  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14951762 aaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactac 14951722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 15010431 - 15010385
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 50  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15010431 ggactcaacgtgtgtatatcagcatacaactcatctacgacaacgac 15010385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10834292 - 10834231
Alignment:
Q  76 actgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 137  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  10834292 actgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcgacatcaacaacttaagactcc 10834231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 179671 - 179573
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||   ||||| || | ||| ||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  179671 ttgtgtatatcaacatacaactcagcaacatcaacgacaacatag---acaacgacaacaacaactttgcataaataattatgacttactccacaacttg 179575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 30206529 - 30206490
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30206529 ttgtgtatatcaacatacaactctcctacgacaacgacaa 30206490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 3394972 - 3394864
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacg---ataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||  |||  ||| ||||||   | ||| |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||    
T  3394972 ttgtgtatatcaacatacaactcagcaacatcaacgacaacgtagacaacgacaacgacaacaacaactgtgcataaataattatgatttactccacaac 3394873  T
Q  110 ttggtcaac 118  Q
    |||||||||    
T  3394872 ttggtcaac 3394864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 127
Target Start/End: Original strand, 9533379 - 9533412
Alignment:
Q  94 tgacttactccccaacttggtcaacatcaacaac 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9533379 tgacttactccacaacttggtcaacatcaacaac 9533412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 54046556 - 54046601
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaa 46  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  54046556 aaaggactcaacgtgtgtatattagcatacaactcatctacgacaa 54046601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 36
Target Start/End: Original strand, 35984896 - 35984928
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactca 36  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35984896 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactca 35984928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 8522729 - 8523135
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522729 aaaggactcgactcgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgactta 8522828  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522829 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 8522928  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8522929 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcat 8523028  T
Q  300 atacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8523029 atacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatc 8523128  T
Q  400 ctctctg 406  Q
    |||||||    
T  8523129 ctctctg 8523135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15686411 - 15686021
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |      |||||||||||||||||||||||||    
T  15686411 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaactacaacaa------ctgtgcataataacttatgacttac 15686318  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15686317 tccccaacttggtcaacatcaacaacctaggactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaaccggcaccaacatcttgtataatccaattgaa 15686218  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcatat 301  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  15686217 tgcgtttatgcataaaccaacaatcagcagcaaat-----tcaatcaacagcaacatataataataagcagcgagacaacagcaataataaccatcatat 15686123  T
Q  302 acaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcct 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15686122 acaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatatcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcct 15686023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2288222 - 2287966
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2288222 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 2288123  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  2288122 ctccccaacttggtcaacaccaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatgga 2288023  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2288022 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 2287966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 15539084 - 15539340
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15539084 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaacacaactacgacaacgacaacataggtaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatcactta 15539183  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15539184 ctccccaacttcgtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatcccatgga 15539283  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15539284 atgcatttatgcataaactaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 15539340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 16829619 - 16829865
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      ||||||| ||||||| || ||| ||    
T  16829619 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacga------ctgtgcacaataact-atcactcac 16829711  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16829712 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttataacgacaactaacaa-cttacaacccgaaccaacaccttgtatattctaattgaa 16829810  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| || ||| || | ||||||| |||||||||| |||||    
T  16829811 tgcagttaagtataaaccagcattcatcaac-aatcataatcaatcaacatcaaca 16829865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 257
Target Start/End: Original strand, 16812602 - 16812845
Alignment:
Q  5 gactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactcc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||      |||||| ||||||| |||||| |||||    
T  16812602 gactcaacttgtgtatatcatcataaaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgat------tgtgcacaataact-atgactcactcc 16812694  T
Q  105 ccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  16812695 ccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttataacgacaactcacaa-cttacaacccgaaccaacaccttgtatattctaattgaatac 16812793  T
Q  205 atttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    | ||| | ||||||||||| ||| || | ||||||| |||||||||| |||||    
T  16812794 agttaagtataaaccaacattcatcaac-aatcataatcaatcaacaacaaca 16812845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 16102164 - 16102410
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  16102164 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 16102256  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||    
T  16102257 tccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaa 16102355  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  16102356 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 16102410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 12595778 - 12596024
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  12595778 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacacctcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 12595870  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |  | |||||||  ||||| | || |||||||    
T  12595871 tccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacagctcggaccaacacattgtacattctaattgaa 12595969  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  12595970 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 12596024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 29492576 - 29492770
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||| ||| ||| | |||| ||    
T  29492576 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcacaatgact-acgactcac 29492668  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  29492669 tccccaacttggtcaacgtcaacaacttatgactccgttacttataacgacatctcacaa-cttacaacccgaacccacaccttgtatattctaattgaa 29492767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 1590581 - 1590542
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1590581 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 1590542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 52
Target Start/End: Original strand, 1639218 - 1639266
Alignment:
Q  5 gactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1639218 gactcaactttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaacgacaa 1639266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 137
Target Start/End: Original strand, 23838104 - 23838168
Alignment:
Q  73 acgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 137  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23838104 acgactgtgcataaataattataacttactccacaacttggtcaacatcaacaacttaagactcc 23838168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 9185916 - 9185881
Alignment:
Q  6 actcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 41  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9185916 actccacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 9185881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 41
Target Start/End: Original strand, 18137658 - 18137693
Alignment:
Q  6 actcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 41  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18137658 actccacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 18137693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 38
Target Start/End: Original strand, 25749892 - 25749926
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaac 38  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25749892 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaac 25749926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 19472322 - 19472277
Alignment:
Q  5 gactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 50  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  19472322 gactccacttgtgtatatctacatacaactcaacaacaacaacgac 19472277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 23621172 - 23621131
Alignment:
Q  11 acttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  23621172 acttgtgtatatcaacatacaactcccctacaacaacgacaa 23621131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 12389673 - 12389767
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacg---ataacgactgtgcataataacttatgacttactcc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||  |||  ||| ||||||   | |||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  12389673 ttgtgtatatcaacatacaactcagcaacatcaacgacaacgtagacaacgacaacgacaacaacgactgtgcataaataattatgacttactcc 12389767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29325544 - 29325138
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325544 aaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgactta 29325445  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325444 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 29325345  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  29325344 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcat 29325245  T
Q  300 atacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  29325244 atacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacagacatc 29325145  T
Q  400 ctctctg 406  Q
    |||||||    
T  29325144 ctctctg 29325138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 26495683 - 26496089
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26495683 aaaggactcgactcgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgactta 26495782  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26495783 ctccccaacttggtcatcatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 26495882  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26495883 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcat 26495982  T
Q  300 atacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26495983 atacaacgagtaggactcatatcaacatcttacataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatc 26496082  T
Q  400 ctctctg 406  Q
    |||||||    
T  26496083 ctctctg 26496089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 4397530 - 4397776
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| ||    
T  4397530 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcacaataact-atgactcac 4397622  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  4397623 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgtttcttataacgacaactcacaa-cttacaacccgaaccaacaccttgtatattcgaattgaa 4397721  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| || ||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  4397722 tgcagttaagtataaaccagcattcatcaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 4397776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26361380 - 26361136
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||| ||||||| || ||| ||    
T  26361380 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacggcaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcacaataact-ataactcac 26361288  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  26361287 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgtttcttataacgacaactcacaa-cttacaacc-gaaccaacacattgtatattctaattgaa 26361190  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaac 256  Q
    |||| ||| | |||||||| || ||| || | ||||||| |||||||||||||||    
T  26361189 tgcagttaagtataaaccagcattcatcaac-aatcataatcaatcaacagcaac 26361136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 23693278 - 23693450
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  23693278 aaaggactcaacttgtgtatatcaggatacaactcaactacgacagcgacaatatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactca 23693370  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaaca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||    
T  23693371 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactttgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaaca 23693450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22758903 - 22758711
Alignment:
Q  64 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaac- 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22758903 acaacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctttgactccattacttagaacgacaacttgcaact 22758805  T
Q  163 cttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
     |||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||    
T  22758804 tttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaaccagcaatcagcaac-aatcatactcaatcaatagcaaca 22758711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16256232 - 16256088
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  16256232 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 16256140  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgaca 153  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16256139 tccccaactcgatcaacatcaaccacctatgactccgttacttggaacgaca 16256088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22590029 - 22589885
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  22590029 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 22589937  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgaca 153  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22589936 tccccaactcgatcaacatcaaccacctatgactccgttacttggaacgaca 22589885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22593584 - 22593440
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  22593584 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 22593492  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgaca 153  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22593491 tccccaactcgatcaacatcaaccacctatgactccgttacttggaacgaca 22593440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22597139 - 22596995
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  22597139 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 22597047  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgaca 153  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22597046 tccccaactcgatcaacatcaaccacctatgactccgttacttggaacgaca 22596995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16259865 - 16259725
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  16259865 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataac-tatgactcac 16259773  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaac 149  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16259772 tccccaactcgatcaacatcaaccacctatgactccgttacttggaac 16259725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 43120997 - 43121144
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||       ||||||||||||   | ||| |    
T  43120997 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgat------cgtgcataataac---tcactca 43121087  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaact 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  43121088 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 43121144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 43124530 - 43124677
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||       ||||||||||||   | ||| |    
T  43124530 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgat------cgtgcataataac---tcactca 43124620  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaact 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  43124621 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 43124677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 156
Target Start/End: Original strand, 22880138 - 22880195
Alignment:
Q  100 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaact 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22880138 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 22880195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 22758933 - 22758894
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22758933 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaa 22758894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27869390 - 27869316
Alignment:
Q  294 catcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttg-ttcatcaac 367  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | |||| |||||||||    
T  27869390 catcatatacaacaagtgtaactcatatcaacatctttcatgatatataattatttccacttttgattcatcaac 27869316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 22357892 - 22357860
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactca 36  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22357892 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactca 22357860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 38
Target Start/End: Original strand, 21495076 - 21495110
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaac 38  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21495076 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaac 21495110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 21980997 - 21980951
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacga 49  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21980997 ggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcatctacaacaacga 21980951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 21559404 - 21559355
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  21559404 ggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcatctacaacaatgacaa 21559355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 41791469 - 41791875
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41791469 aaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgactta 41791568  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41791569 ctccccaacctggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 41791668  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  41791669 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcat 41791768  T
Q  300 atacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41791769 atacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatc 41791868  T
Q  400 ctctctg 406  Q
    |||||||    
T  41791869 ctctctg 41791875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 14698515 - 14698919
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14698515 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgactta 14698614  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14698615 ctccccaacttggtcaacatcaacaatctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 14698714  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcata 300  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  14698715 atgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataatcatcata 14698814  T
Q  301 tacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14698815 tacaacaagtaggactcatatcaacatctttcatattatataactatcccctca-ttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcc 14698913  T
Q  401 tctctg 406  Q
    ||||||    
T  14698914 tctctg 14698919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 4170823 - 4171227
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4170823 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgactta 4170922  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4170923 ctccccaacttggtcaacatcaacaatctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 4171022  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcata 300  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  4171023 atgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataatcatcata 4171122  T
Q  301 tacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4171123 tacaacaagtaggactcatatcaacatttttcatattatataactatcccctca-ttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcc 4171221  T
Q  401 tctctg 406  Q
    ||||||    
T  4171222 tctctg 4171227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 53388017 - 53387620
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  53388017 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacatcgactgtgcataataacttatgactca 53387924  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53387923 ctccccaacttggccaacatcaacatcctctgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 53387824  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcata 300  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  53387823 atgcatgcatgcatacaccaacaatcagtagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataaccatcata 53387724  T
Q  301 tacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53387723 tacaacaagtaggactcatatcaacatctttcatattatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacattc 53387624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16278405 - 16278008
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||     || |||||||||||| |   || |    
T  16278405 aaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgat-----ct-tgcataataactca---ctca 16278315  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278314 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccattacttagaaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattg 16278215  T
Q  200 aatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcat 299  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  16278214 aatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataaccatcat 16278115  T
Q  300 atacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatc 399  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278114 atacaacaagtaggactcatataaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatc 16278015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 286911 - 287157
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  286911 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 287003  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||    
T  287004 tccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaa 287102  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  287103 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 287157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15280381 - 15280136
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| ||    
T  15280381 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcacaataact-atgactcac 15280289  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  15280288 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccattacttataacgacaactcacaa-cttacaacc-gaaccaacacattgtatattctaattgaa 15280191  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| || ||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  15280190 tgcagttaagtataaaccagcattcatcaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 15280136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 28382645 - 28382891
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  28382645 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 28382737  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||    
T  28382738 tccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaa 28382836  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  28382837 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 28382891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 47127124 - 47126878
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  47127124 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 47127032  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||    
T  47127031 tctccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaa 47126933  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  47126932 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 47126878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 56115848 - 56115656
Alignment:
Q  64 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaac- 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  56115848 acaacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaact 56115750  T
Q  163 cttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
     |||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| ||||||| |||  ||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  56115749 tttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaactagcaatcagcaac-aatcatactcaatcaacagcaaca 56115656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 181
Target Start/End: Original strand, 16359325 - 16359495
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| ||    
T  16359325 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcacaataact-atgactcac 16359417  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaaca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  16359418 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttataacgacaactcacaa-cttacaacc-gaaccaaca 16359495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 33848728 - 33848974
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||       ||||||||||||| |   || |    
T  33848728 aaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggcaacgacaacgatc------gtgcataataactca---ctca 33848818  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||    
T  33848819 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattg 33848917  T
Q  200 aatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||  | | ||||||| ||||| ||||||||||    
T  33848918 aatgcagttaagtataaaccaacgatcattaac-aatcataatcaataaacagcaaca 33848974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 10313535 - 10313782
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||      | ||| ||||||||| |||||| |    
T  10313535 aaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaattcaactacgacagcgacaacataggcaacaacaacga------ccgtgtataataact-atgactca 10313627  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | | |||||||   |||||||||  ||||| | || ||||||    
T  10313628 ctcctcaacttggtcaacatcaacaacctatgacttcgttgcttagaacgacaactcacca-cttacaattagaaccaacacattgtacattctaattga 10313726  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    ||||| ||| | |||||||| | ||||  | |||| |||| ||||||||||||||||    
T  10313727 atgcagttaagtataaaccagcgatcattaacaaa-cataatcaatcaacagcaaca 10313782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31117332 - 31117185
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||       ||||||||||||   | ||| |    
T  31117332 aaaggactccacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgat------cgtgcataataac---tcactca 31117242  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaact 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31117241 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 31117185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 55503027 - 55502880
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||      |||||||||||||| |   || |    
T  55503027 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgat------tgtgcataataactca---ctca 55502937  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaact 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  55502936 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 55502880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 9388377 - 9388310
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaac 68  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  9388377 aaagaactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaac 9388310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21189851 - 21189768
Alignment:
Q  260 taataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataa 343  Q
    ||||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21189851 taataataagcagcaagtcaccaacaataataatcatcatatacaacaagtataactgatatcaacatctttcataacatataa 21189768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 15242390 - 15242314
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataa 89  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  15242390 ttgtgtatatcagcatataactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgacaacaactttgcatcataa 15242314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 118
Target Start/End: Original strand, 15990131 - 15990242
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttact 102  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||  |||  ||| |||||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15990131 ggactcaactttgtgtatattaacatacaactcagcaacatcaacgacaacgtagacaacgacaac---aacaactgtgcataataa-ttatgacttact 15990226  T
Q  103 ccccaacttggtcaac 118  Q
    || |||||||||||||    
T  15990227 ccacaacttggtcaac 15990242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24047488 - 24047427
Alignment:
Q  76 actgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 137  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24047488 actgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaacatcaacaacttaagactcc 24047427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 14942596 - 14942557
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14942596 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaacgacaa 14942557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15448379 - 15448273
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttact 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||         ||||||| | ||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  15448379 ggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcaacaacatcaacgacaa---------caacaacaacaacaactgtgcataaataattatgacttact 15448289  T
Q  103 ccccaacttggtcaac 118  Q
    || |||||||||||||    
T  15448288 ccacaacttggtcaac 15448273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 56115878 - 56115839
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  56115878 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaa 56115839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Original strand, 27027817 - 27027925
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacg---ataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||  ||| ||||||   | ||| |||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  27027817 ttgtgtatatcaacatacaactcaacaacatcaacgacaacgtagacaacgacaacgacaacaacaactgtgcataaataattatgtcttactccacaac 27027916  T
Q  110 ttggtcaac 118  Q
    |||||||||    
T  27027917 ttggtcaac 27027925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 52
Target Start/End: Original strand, 6511656 - 6511695
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6511656 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacatcaacgacaa 6511695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 38
Target Start/End: Original strand, 14821535 - 14821569
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaac 38  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14821535 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaac 14821569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Original strand, 13881512 - 13881553
Alignment:
Q  11 acttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  13881512 acttgtgtatatcaacatacaactcccctacaacaacgacaa 13881553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 24047547 - 24047514
Alignment:
Q  14 tgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaac 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24047547 tgtgtatatcaacatacaactcaacaacgacaac 24047514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 33662517 - 33662484
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaa 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33662517 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaa 33662484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Original strand, 13886847 - 13886895
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||    
T  13886847 ggactccacttgtgtatatctacatacaactcaacgacagcaacgacaa 13886895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 41
Target Start/End: Original strand, 14048379 - 14048415
Alignment:
Q  5 gactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 41  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14048379 gactccacttgtgtatatctacatacaactcaactac 14048415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 15075466 - 15075498
Alignment:
Q  6 actcaacttgtgtatatcaacatacaactcaac 38  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15075466 actccacttgtgtatatcaacatacaactcaac 15075498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Original strand, 15244280 - 15244328
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||    
T  15244280 ggactccacttgtgtatatctacatacaactcaacaacagcaacgacaa 15244328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21241979 - 21241573
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21241979 aaaggactcgactcgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgactta 21241880  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21241879 ctccccaacttggtcatcatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 21241780  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21241779 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcat 21241680  T
Q  300 atacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21241679 atacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatc 21241580  T
Q  400 ctctctg 406  Q
    |||||||    
T  21241579 ctctctg 21241573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21239429 - 21239026
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239429 aaaggactcgactcgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgactta 21239330  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239329 ctccccaacttggtcatcatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 21239230  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21239229 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcat 21239130  T
Q  300 atacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21239129 atacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatc 21239030  T
Q  400 ctct 403  Q
    ||||    
T  21239029 ctct 21239026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 24504500 - 24504906
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24504500 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgactta 24504599  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24504600 ctccccaacttggtcaacatcaacaatctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 24504699  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24504700 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcat 24504799  T
Q  300 atacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24504800 atacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacatcattaaacattacaaacatc 24504899  T
Q  400 ctctctg 406  Q
    |||||||    
T  24504900 ctctctg 24504906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 5 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 20591404 - 20591005
Alignment:
Q  5 gactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactcc 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    |    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20591404 gactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaactttttcattttcaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactcc 20591305  T
Q  105 ccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20591304 ccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcagccttacaacctaaaccaacatcttgtataatccaattgaatgc 20591205  T
Q  205 atttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcatataca 304  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20591204 atttatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataaccatcatataca 20591105  T
Q  305 acaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctctc 404  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20591104 acaagtaggactcatatcaaaatctttcatattatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacattctctc 20591005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 62 - 406
Target Start/End: Original strand, 31506024 - 31506368
Alignment:
Q  62 caacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 161  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31506024 caactacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 31506123  T
Q  162 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatata 261  Q
    |||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31506124 ccttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatata 31506223  T
Q  262 ataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttc 361  Q
    |||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31506224 ataacaagcagcgagacaacaataataataatcatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatatttcataatatataactatctcctcatttgttc 31506323  T
Q  362 atcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctctctg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31506324 atcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctctctg 31506368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 62 - 405
Target Start/End: Original strand, 31503458 - 31503801
Alignment:
Q  62 caacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 161  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31503458 caactacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 31503557  T
Q  162 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatata 261  Q
    |||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31503558 ccttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatata 31503657  T
Q  262 ataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttc 361  Q
    |||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31503658 ataacaagcagcgagacaacaataataataatcatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatatttcataatatataactatctcctcatttgttc 31503757  T
Q  362 atcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctctct 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31503758 atcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctctct 31503801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 257
Target Start/End: Original strand, 28348947 - 28349139
Alignment:
Q  64 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacc 163  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28348947 acaacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaact 28349045  T
Q  164 t-tacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    | ||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28349046 tctacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcataaaccagcaatcagcaac-aatcatattcaatcaacagcaaca 28349139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41685062 - 41684815
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  41685062 aaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactca 41684970  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || ||||||    
T  41684969 ctccccaacttgatcaacgtcaacaacctatgactccgttacctagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattga 41684871  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    ||| | ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  41684870 atgtagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 41684815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12628129 - 12627942
Alignment:
Q  67 acgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacctta 166  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12628129 acgacaacgaccgtgcataataact-atgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcaa-ctta 12628032  T
Q  167 caacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    ||||  ||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||| |||||    
T  12628031 caactcgaaccaacaccttgtatgttctaattgaatgcagttaagcataaaccagcaatcatcaac-aatcataatcaatcaacaacaaca 12627942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 44620754 - 44620995
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  44620754 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaac-----------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 44620841  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||    
T  44620842 tccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaa 44620940  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  44620941 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 44620995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23339466 - 23339220
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||       ||||||||||||| |   || |    
T  23339466 aaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatc------gtgcataataactca---ctca 23339376  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||    
T  23339375 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattg 23339277  T
Q  200 aatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||  | | ||||||| ||||| ||||||||||    
T  23339276 aatgcagttaagtataaaccaacgatcattaac-aatcataatcaataaacagcaaca 23339220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 31755758 - 31755905
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||||||||      |||||||||||||| |   || |    
T  31755758 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaataacaacataggtgacgacaacgat------tgtgcataataactca---ctca 31755848  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaact 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31755849 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 31755905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 31503424 - 31503473
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 50  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31503424 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgac 31503473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 31505990 - 31506039
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 50  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31505990 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgac 31506039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 12628168 - 12628119
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 50  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12628168 aaaggactcaacgtgtgtatatcagcatacaactcatctacgacaacgac 12628119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 21073681 - 21073620
Alignment:
Q  76 actgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 137  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21073681 actgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaacatcaacaacttaagactcc 21073620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 137
Target Start/End: Original strand, 9241856 - 9241920
Alignment:
Q  73 acgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 137  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9241856 acgactgtgcataaataattataacttactccacaacttggtcaacatcaacaacttaagactcc 9241920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 52
Target Start/End: Original strand, 28348917 - 28348956
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28348917 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaa 28348956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 24274220 - 24274176
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaac 47  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24274220 ggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaac 24274176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 21123873 - 21123839
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaac 38  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21123873 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaac 21123839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 24669789 - 24669755
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaac 38  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24669789 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaac 24669755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Original strand, 31518587 - 31518695
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacg---ataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||  |||  ||| ||||||   | ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||     
T  31518587 ttgtgtatatcaacatacaactcagcaacatcaacgacaacgtagacaacgacaacgacaacaacaactgtgcataaataattatgacttactccacaaa 31518686  T
Q  110 ttggtcaac 118  Q
    |||||||||    
T  31518687 ttggtcaac 31518695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 41
Target Start/End: Original strand, 23375026 - 23375054
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactac 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23375026 ttgtgtatatcaacatacaactcaactac 23375054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 16006215 - 16006621
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16006215 aaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgactta 16006314  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16006315 ctccccaacttggtcaacatcaacaacttatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 16006414  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  16006415 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagactacaacaataataaccatcat 16006514  T
Q  300 atacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16006515 atacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataatatataattatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatc 16006614  T
Q  400 ctctctg 406  Q
    |||||||    
T  16006615 ctctctg 16006621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21743607 - 21743203
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21743607 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgactta 21743508  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21743507 ctccccaacttggtcaacatcaacaatctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 21743408  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcata 300  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  21743407 atgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataatcatcata 21743308  T
Q  301 tacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21743307 tacaacaagtaggactcatatcaacatctttcatattatataactatcccctca-ttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcc 21743209  T
Q  401 tctctg 406  Q
    ||||||    
T  21743208 tctctg 21743203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 8776160 - 8776563
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8776160 aaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacgtaggcaacaacaacgacaacgactgtgaataataacttatgactta 8776259  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8776260 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttaccacttgaaccaacatcttgtataattcaattga 8776359  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  8776360 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaat--tcaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcata 8776457  T
Q  301 tacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcc 400  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8776458 tacaacgagtaggactcatattaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatcc 8776557  T
Q  401 tctctg 406  Q
    | ||||    
T  8776558 tttctg 8776563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17506084 - 17505687
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17506084 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgactgtgcagaataacttatgactca 17505991  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17505990 ctccccaacttggtcaacatcaacaccctctgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 17505891  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcata 300  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  17505890 atgcatgtatgcatacaccaacaatcagtagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataaccatcata 17505791  T
Q  301 tacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17505790 tacaacaagtaggactcatatcaacatctttcatattatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacattc 17505691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 17547130 - 17547527
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17547130 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgactgtgcagaataacttatgactca 17547223  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17547224 ctccccaacttggtcaacatcaacaccctctgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 17547323  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcata 300  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  17547324 atgcatgtatgcatacaccaacaatcagtagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataaccatcata 17547423  T
Q  301 tacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17547424 tacaacaagtaggactcatatcaacatctttcatattatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacattc 17547523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 38828045 - 38828302
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  38828045 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatgggcaacgacaaccacaacgatggtgcataataact-atgactta 38828143  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||    
T  38828144 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaactttacaactcgaacccacaccttgtatattctaattga 38828243  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacata 259  Q
    |||||  |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38828244 atgcagctatgcacaaaccagcagtcagcaacaaatcatattcaatcaatagcaacata 38828302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13395763 - 13395517
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  13395763 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 13395671  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||    
T  13395670 tccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaa 13395572  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  13395571 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 13395517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 48785134 - 48785380
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  48785134 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 48785226  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||    
T  48785227 tccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaa 48785325  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  48785326 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 48785380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 257
Target Start/End: Original strand, 35366101 - 35366293
Alignment:
Q  62 caacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 161  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  35366101 caactacgacaacgactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaac-tcaaa 35366198  T
Q  162 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
     ||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  35366199 acttacaactcgaaccaacaccttgtatattctaattgaatgcaattaagcataaaccagcaatcatcaac-aatcatattcaatcaacagcaaca 35366293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13733825 - 13733586
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      |||||      |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| ||    
T  13733825 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaac------atagg------caacgacaacgaccgtgcacaataact-atgactcac 13733739  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  13733738 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttataacgacaactcacaa-cttacaacc-gaaccaacacattgtatattctaattgaa 13733641  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| || ||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  13733640 tgcagttaagtataaaccagcattcatcaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 13733586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21065400 - 21065238
Alignment:
Q  65 caacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaac-c 163  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  21065400 caacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaactt 21065302  T
Q  164 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatca 227  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| ||||||| ||| ||| ||| || ||||||    
T  21065301 ttacaacgcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcacaaatcagcaatca 21065238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 4993307 - 4993555
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||   |||| ||| ||||||||       ||||||| ||||| |   || |    
T  4993307 aaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacatcttaggcaacgacaacgatc------gtgcatattaactca---ctca 4993397  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||    
T  4993398 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattg 4993496  T
Q  200 aatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacata 259  Q
    |||||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4993497 aatgcagttaagtataaaccatcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaacata 4993555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 124471 - 124324
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||      |||||||||||||| |   || |    
T  124471 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgat------tgtgcataataactca---ctca 124381  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaact 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  124380 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 124324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 709581 - 709467
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||  |||  ||| ||||| | ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  709581 ttgtgtatatcaacatacaactcagcaacatcaacgacaacgtagacaacgacaacaacaacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttg 709482  T
Q  113 gtcaacatcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||    
T  709481 gtcaacatcaacaac 709467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 127
Target Start/End: Original strand, 41055494 - 41055615
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttact 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||  |||  ||| |||||   ||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  41055494 ggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcatcaacatcaacgacaacgtagacaacgacaac---aacaactgtgcataaataattatgacttact 41055590  T
Q  103 ccccaacttggtcaacatcaacaac 127  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  41055591 ccacaacttggtcaacatcaacaac 41055615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 35366067 - 35366116
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 50  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35366067 aaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgac 35366116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 15725568 - 15725619
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15725568 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaa 15725619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 127
Target Start/End: Original strand, 16462055 - 16462176
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttact 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||  |||  ||| |||||   ||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  16462055 ggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcagcaacatcaacgacaacgtagacaacgacaac---aacaactgtgcataaataattatgacttact 16462151  T
Q  103 ccccaacttggtcaacatcaacaac 127  Q
    || |||||||||||| |||||||||    
T  16462152 ccacaacttggtcaatatcaacaac 16462176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 47975949 - 47975822
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgac---tgtgcataataacttatgactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||  ||   ||| ||||||| ||| ||   |||||||||  | |||||||||    
T  47975949 ggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcagcaacatcaacgacaacgtaaacaacgacaacgacaacaacaactgtgcataaataattatgactt 47975850  T
Q  100 actccccaacttggtcaacatcaacaac 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47975849 actccacaacttggtcaacatcaacaac 47975822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 44190897 - 44190789
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgac---tgtgcataataacttatgacttactccccaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||  |||  ||| ||||||| ||||||   |||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  44190897 ttgtgtatatcaacatacaactcagcaacatcaacgacaacgtagacaacgacaacgacaacgacaactgtgcataaataattatgacttactccacaac 44190798  T
Q  110 ttggtcaac 118  Q
    |||||||||    
T  44190797 ttggtcaac 44190789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 127
Target Start/End: Original strand, 14421882 - 14421933
Alignment:
Q  76 actgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaac 127  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14421882 actgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaacatcaacaac 14421933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Original strand, 11661204 - 11661265
Alignment:
Q  76 actgtgcat-aataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 137  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11661204 actgtgcataaataac-tatgacttactccacaacttggtcaacatcaacaacttaagactcc 11661265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 12755659 - 12755568
Alignment:
Q  27 atacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaac 118  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||  |||  ||| |||| || ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12755659 atacaactcaacaacatcaacgacaacgtagacaacgacaatgacaacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaac 12755568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 21519246 - 21519211
Alignment:
Q  6 actcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 41  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21519246 actccacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 21519211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 14255725 - 14255691
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaac 38  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14255725 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaac 14255691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 7507478 - 7507429
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  7507478 ggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcatctacaagaacgacaa 7507429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Original strand, 13894186 - 13894235
Alignment:
Q  4 ggactcaac-ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  13894186 ggactcaacattgtgtatatcaacatacaactcaacaacatcaacgacaa 13894235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 14416412 - 14416355
Alignment:
Q  61 acaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaac 118  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14416412 acaacgacgacaacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaac 14416355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 21065431 - 21065402
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacg 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21065431 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacg 21065402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 37
Target Start/End: Original strand, 23442399 - 23442432
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaa 37  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23442399 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaa 23442432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 39431824 - 39431767
Alignment:
Q  61 acaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaac 118  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39431824 acaacgacgacaacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaac 39431767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 50
Target Start/End: Original strand, 46625029 - 46625074
Alignment:
Q  5 gactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 50  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  46625029 gactccacttgtgtatatctacatacaactcaacaacaacaacgac 46625074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 121
Target Start/End: Original strand, 147595 - 147643
Alignment:
Q  73 acgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatc 121  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  147595 acgactgtgcataaataattataacttactccacaacttggtcaacatc 147643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 41
Target Start/End: Original strand, 15690053 - 15690081
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactac 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15690053 ttgtgtatatcaacatacaactcaactac 15690081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 41
Target Start/End: Original strand, 15697646 - 15697674
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactac 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15697646 ttgtgtatatcaacatacaactcaactac 15697674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Original strand, 16573353 - 16573389
Alignment:
Q  16 tgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16573353 tgtatatcaacatacaactcaactacaacaacaacaa 16573389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 16592309 - 16592273
Alignment:
Q  16 tgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16592309 tgtatatcaacatacaactcaactacaacaacaacaa 16592273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 8968 - 9374
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8968 aaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgactta 9067  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9068 ctccccaacatggtcaacatcaacaacctatgactcagttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 9167  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9168 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcgaatcatattcaattcaacaacaacatataacaataagcagcgagacaacaacaataataaccatcat 9267  T
Q  300 atacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  9268 atacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaaccttaccaacatc 9367  T
Q  400 ctctctg 406  Q
    |||||||    
T  9368 ctctctg 9374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11173 - 10927
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      | |||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  11173 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------cgacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 11081  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||    
T  11080 tccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaa 10982  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  10981 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagtaaca 10927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 45135229 - 45134823
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45135229 aaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacgtaggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgactta 45135130  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45135129 cttcccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttaccacttgaaccaacatcttgtataattcaattga 45135030  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  45135029 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcat 45134930  T
Q  300 atacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45134929 atacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatc 45134830  T
Q  400 ctctctg 406  Q
    || ||||    
T  45134829 ctttctg 45134823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 6608576 - 6608172
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6608576 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaacttaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgactta 6608477  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6608476 ctccccaacttggtcaacatcaacaatctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattga 6608377  T
Q  201 atgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcata 300  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  6608376 atgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataatcatcata 6608277  T
Q  301 tacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6608276 tacaacaagtaggactcatatcaacatctttcatattatataactatcccctc-gttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcc 6608178  T
Q  401 tctctg 406  Q
    ||||||    
T  6608177 tctctg 6608172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 62 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 7301322 - 7300980
Alignment:
Q  62 caacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 161  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7301322 caactacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggccaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 7301223  T
Q  162 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatata 261  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||    
T  7301222 ccttacaacctgaactaacatcttgtataatctaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcaacagcaaatcatattcaat--tcaacaacatata 7301125  T
Q  262 ataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttc 361  Q
    |||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7301124 ataacaagcagcgagacaacgaccataataaccatcatatacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttc 7301025  T
Q  362 atcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctctctg 406  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7301024 atcaacctaagtcgatgtcattaaacattacaaacgtcctctctg 7300980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24708106 - 24707859
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      | ||||| ||||||| |||||| ||    
T  24708106 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacga------ccgtgcacaataact-atgactcac 24708014  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||| ||||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  24708013 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttataatgacaactcacaa-cttacaacccgaaccaacacattgtatattctaattgaa 24707915  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcat-attcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| || ||| || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  24707914 tgcagttaagtataaaccagcattcatcaac-aatcataattcaatcaacagcaaca 24707859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 257
Target Start/End: Original strand, 363828 - 364020
Alignment:
Q  64 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaac- 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  363828 acaacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaact 363926  T
Q  163 cttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
     |||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| ||||||| |||  ||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  363927 tttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaactagcaatcagcaac-aatcatactcaatcaacagcaaca 364020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 256 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21415294 - 21415144
Alignment:
Q  256 catataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcat 355  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21415294 catataataataagcagcaagtcaacaacaataataatcatcatatacaacaagtataactcatatcaacatctttcataatatttaactatctcctcat 21415195  T
Q  356 ttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctctctg 406  Q
    ||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21415194 ttgtttattaacttaaatcgacgtcattaaacattatatacatcctctctg 21415144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22145680 - 22145439
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||            |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  22145680 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgaccacgacaac-----------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 22145593  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||    
T  22145592 tccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaa 22145494  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  22145493 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 22145439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 17795218 - 17795464
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||       ||||||||||||| |   || |    
T  17795218 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacagcgacaacataggcaacgacaacgatc------gtgcataataactca---ctca 17795308  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||    
T  17795309 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattg 17795407  T
Q  200 aatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||||| ||| | | |||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  17795408 aatgcagttaagtagaaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 17795464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 257
Target Start/End: Original strand, 44431901 - 44432093
Alignment:
Q  64 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaac- 162  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  44431901 acaacgacaacaattgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacatatgactccgttatttagaacgacaacttgcaact 44431999  T
Q  163 cttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
     |||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| ||||| | |||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  44432000 tttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgtagttaaacataaaccatcaatcagcaac-aatcatactcaatcaacaacaaca 44432093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Original strand, 17614740 - 17614884
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  17614740 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcgactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 17614832  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgaca 153  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17614833 tccccaactcgatcaacatcaaccacctatgactccgttacttagaatgaca 17614884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22059633 - 22059443
Alignment:
Q  64 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacc 163  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  22059633 acaacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-c 22059536  T
Q  164 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||||||  |||| ||||  ||||| |||| ||||||||||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||  ||||||||||||||||    
T  22059535 ttacaactcgaactaacacattgtacaatctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcatgatcaatcaacagcaaca 22059443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 28853772 - 28854018
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||| |  ||  |||||||       |||||| |||||| |   || |    
T  28853772 aaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacatacgcgacggcaacgatc------gtgcatcataactca---ctca 28853862  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || | |||||||| ||||||||||  ||||| | || || ||    
T  28853863 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacccgcca-cttacaacttgaaccaacacattgtacattctaactg 28853961  T
Q  200 aatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  28853962 aatgcaattaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 28854018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 22059674 - 22059624
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22059674 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaa 22059624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 7301356 - 7301307
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 50  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7301356 aaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 7301307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10829619 - 10829505
Alignment:
Q  141 acttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcata 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| || |||||  || | |||||||||||||| |||||| || | |||||||    
T  10829619 acttagaacgacaactcgcaac-ttacaactcgaaccaacaccttgtatattctaattgtttgtagttatgcataaaccagcaatcatcaac-aatcata 10829522  T
Q  241 ttcaatcaacagcaaca 257  Q
     ||||||||||||||||    
T  10829521 atcaatcaacagcaaca 10829505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 52
Target Start/End: Original strand, 363798 - 363837
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  363798 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaa 363837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 52
Target Start/End: Original strand, 44431871 - 44431910
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44431871 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaa 44431910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 22434579 - 22434531
Alignment:
Q  5 gactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22434579 gactcaactttgtgtatatcaacatacaactcatctacaacaacgacaa 22434531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 41
Target Start/End: Original strand, 15267297 - 15267332
Alignment:
Q  6 actcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 41  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15267297 actccacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 15267332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 20385304 - 20385351
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 50  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20385304 ggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcatctacaacaacgac 20385351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 21415517 - 21415478
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21415517 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacatcgacaa 21415478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 22521865 - 22521830
Alignment:
Q  6 actcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 41  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22521865 actccacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 22521830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 362153 - 362119
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaac 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  362153 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaac 362119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 47
Target Start/End: Original strand, 43112134 - 43112168
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaac 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43112134 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaac 43112168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18024633 - 18024576
Alignment:
Q  61 acaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaac 118  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18024633 acaacgacgacaacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaac 18024576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Original strand, 19882058 - 19882107
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  19882058 ggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcaacaacatcaacgacaa 19882107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 50
Target Start/End: Original strand, 32949725 - 32949762
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 50  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32949725 ttgtgtatatcaacatataactcaactacaacaacgac 32949762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 27941764 - 27941716
Alignment:
Q  73 acgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatc 121  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27941764 acgactgtgcataaataattataacttactccacaacttggtcaacatc 27941716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 62 - 406
Target Start/End: Original strand, 20579321 - 20579668
Alignment:
Q  62 caacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 161  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20579321 caactacgacaacgactgtgcatagtaacttatgacttactccccaacttggccaacatcaacaacctatggctccgttacttagaacgacaacttgcaa 20579420  T
Q  162 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacagcaacat-- 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||      
T  20579421 ccttacaacccgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 20579520  T
Q  259 -ataataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcattt 357  Q
     ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20579521 aataataataagtagcgagac-acaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataacatataactatctcctcattt 20579619  T
Q  358 gttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctctctg 406  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20579620 gttcatcgacctaagtcgacgtcattaaacactacaaacatcctctctg 20579668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2333274 - 2333021
Alignment:
Q  5 gactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactcc 104  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||| ||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2333274 gactccacttgtgtatatcagcatacaacttaactacgacaacgacaacatgtgcaacgacaaccacaacgacggtgcataataact-atgacttactcc 2333176  T
Q  105 ccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||| |||||||| || ||||||||||    
T  2333175 ccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaactttacaactcgaactcacaccttgtatattctaattgaatgc 2333076  T
Q  205 atttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacata 259  Q
    | ||||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2333075 agttatgcacaaaccagcagtcagcaacaaaacatattcaatcaatagcaacata 2333021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 20631137 - 20631383
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  20631137 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 20631229  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||    
T  20631230 tccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaa 20631328  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  20631329 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 20631383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 37358293 - 37358538
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| ||    
T  37358293 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcacaataact-atgactcac 37358385  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||  ||||||| || || ||||    
T  37358386 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttataacgacaactcacaa-cttacaacc-gaaccaacacattgtatattctaactgaa 37358483  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| || ||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  37358484 tgcagttaagtataaaccagcattcatcaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 37358538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 36181396 - 36181642
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  36181396 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 36181488  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||    
T  36181489 tccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaa 36181587  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| |||||||||| |||||    
T  36181588 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacaacaaca 36181642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 257
Target Start/End: Original strand, 294075 - 294267
Alignment:
Q  64 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacc 163  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  294075 acaacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaact 294173  T
Q  164 t-tacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    | ||||||  ||||  ||| ||||| || || ||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  294174 tctacaactcgaacttacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcataaactagcaatcagcaac-aatcatattcaattaacagcaaca 294267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14432647 - 14432406
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         ||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  14432647 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacga---------taac--caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 14432560  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||| ||||  ||| | | || |||||||    
T  14432559 tccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaactaacacattgaacattctaattgaa 14432461  T
Q  202 tgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||| | ||||||||||||||||    
T  14432460 tgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcacaatcaatcaacagcaaca 14432406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22900550 - 22900406
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  22900550 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcac 22900458  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgaca 153  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22900457 tccccaactcgatcaacatcaaccacctatgactccgttacttggaacgaca 22900406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 45307111 - 45307357
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||       ||||||||||||| |   || |    
T  45307111 aaaggactcgacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatc------gtgcataataactca---ctca 45307201  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||    
T  45307202 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttggaaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattg 45307300  T
Q  200 aatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    |||||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  45307301 aatgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 45307357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 257
Target Start/End: Original strand, 24087311 - 24087485
Alignment:
Q  79 gtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaacca 178  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  ||||    
T  24087311 gtgcataataact-atgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcaa-cttacaa-ctcgacca 24087407  T
Q  179 acatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
    ||| |||||||| || ||||||||| | ||| |||||||||| |||  | || | ||||||| | ||||||||||||||    
T  24087408 acaccttgtatattctaattgaatgtagttaagcataaaccagcaaaaatcaac-aatcataattaatcaacagcaaca 24087485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 296347 - 296558
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||      |||||||       ||||||||||||| |   || |    
T  296347 aaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgatc------gtgcataataactca---ctca 296431  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||    
T  296432 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattg 296530  T
Q  200 aatgcatttatgcataaaccaacaatca 227  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||    
T  296531 aatgcagttaagtataaaccaacgatca 296558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 20579287 - 20579336
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 50  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20579287 aaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 20579336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 20586980 - 20587029
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 50  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20586980 aaaggactcgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 20587029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 24087260 - 24087308
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacga 49  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24087260 aaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcatctacgacaacga 24087308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Original strand, 28312446 - 28312507
Alignment:
Q  76 actgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 137  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28312446 actgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaacatcaacaacttaagactcc 28312507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 52
Target Start/End: Original strand, 294045 - 294084
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  294045 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaa 294084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 7792803 - 7792752
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatat 55  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  7792803 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaacaacaacaacaacaatat 7792752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20438182 - 20438131
Alignment:
Q  76 actgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaac 127  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20438182 actgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaacatcaacaac 20438131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 52
Target Start/End: Original strand, 32650339 - 32650386
Alignment:
Q  5 gactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  32650339 gactccacttgtgtatatctacatacaactcaacaacaacaacgacaa 32650386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 118
Target Start/End: Original strand, 16400803 - 16400857
Alignment:
Q  64 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaac 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||||    
T  16400803 acaacgacaacgactgtgcataaataattatgacttacttcacaacttggtcaac 16400857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 28204672 - 28204639
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaa 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28204672 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaa 28204639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 24475494 - 24475526
Alignment:
Q  6 actcaacttgtgtatatcaacatacaactcaac 38  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24475494 actccacttgtgtatatcaacatacaactcaac 24475526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8740 - 8548
Alignment:
Q  64 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaac- 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8740 acaacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaact 8642  T
Q  163 cttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
     |||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  8641 tttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcataaaccagcaatcagcaac-aatcatattcaatcaacaacaaca 8548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 8770 - 8731
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8770 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaa 8731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 256
Target Start/End: Original strand, 2379 - 2570
Alignment:
Q  64 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaac- 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2379 acaacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaact 2477  T
Q  163 cttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaac 256  Q
     |||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| ||||| | |||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  2478 tttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgtagttaaacataaaccagcaatcagcaac-aatcatactcaatcaacagcaac 2570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 52
Target Start/End: Original strand, 2349 - 2388
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2349 ttgtgtatatcagcataaaactcaactacgacaacgacaa 2388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 260 - 406
Target Start/End: Original strand, 1911 - 2057
Alignment:
Q  260 taataataagcagcgggacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgt 359  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1911 taataataagcagcaagtcaacaacaataataatcatcatatacaacaagtataactcatatcaacatctttcataatatttaactatctcctcatttgt 2010  T
Q  360 tcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctctctg 406  Q
    | || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2011 ttattaacttaaatcgacgtcattaaacattatatacatcctctctg 2057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 41
Target Start/End: Original strand, 1684 - 1712
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactac 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1684 ttgtgtatatcaacatacaactcaactac 1712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 257
Target Start/End: Original strand, 137815 - 138007
Alignment:
Q  64 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgc-aac 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  137815 acaacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccattacttagaacgacaacttgcaaat 137913  T
Q  163 cttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 257  Q
     |||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| ||||| | |||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  137914 tttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgaagttaaacataaaccagcaatcagcaac-aatcatactcaatcaacagcaaca 138007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Original strand, 137788 - 137824
Alignment:
Q  16 tgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  137788 tgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaa 137824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 205
Target Start/End: Original strand, 1521 - 1716
Alignment:
Q  2 aaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  1521 aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataac-tatgactcac 1613  T
Q  102 tccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaa 201  Q
    |||| |||| | ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||    
T  1614 tcccaaactcgatcaacatcacccacctaagactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaa 1712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 256
Target Start/End: Original strand, 162355 - 162515
Alignment:
Q  96 acttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaac-cttacaacctgaaccaacatcttgtataatcc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||||| || ||     
T  162355 acttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattct 162454  T
Q  195 aattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaac 256  Q
    ||| ||||||| |||  ||||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  162455 aatggaatgcagttaaacataaactagcaatcagcaac-aatcataatcaatcaacagcaac 162515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 134209 - 134027
Alignment:
Q  65 caacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacct 164  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||    
T  134209 caacgacaacgaccgtgcacaataact-atgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgtttcttataacgacaactcacaa-ct 134112  T
Q  165 tacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaaca 251  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| || ||| || | ||||||| ||||||||||    
T  134111 tacaacc-gaaccaacacattgtatattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcattcatcaac-aatcataatcaatcaaca 134027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 32987 - 33134
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||       ||||||||||||| |   || |    
T  32987 aaaggactccacctgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatc------gtgcataataactca---ctca 33077  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaact 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33078 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 33134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 81825 - 81678
Alignment:
Q  1 aaaggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||       ||||||||||||| |   || |    
T  81825 aaaggactccacctgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatc------gtgcataataactca---ctca 81735  T
Q  101 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaact 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  81734 ctccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 81678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 42934 - 42900
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaac 38  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42934 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaac 42900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 45124 - 45090
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaac 38  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45124 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaac 45090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Original strand, 33782 - 33831
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33782 ggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaacgacaa 33831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 127
Target Start/End: Original strand, 21094 - 21221
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgac---tgtgcataataacttatgactt 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||  |||  ||| ||||||| ||| ||   |||||||||  | |||||||||    
T  21094 ggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcagtaacatcaacgacaacgtagacaacgacaacgacaacaacaactgtgcataaataattatgactt 21193  T
Q  100 actccccaacttggtcaacatcaacaac 127  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21194 actccacaacttggtcaacattaacaac 21221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 38
Target Start/End: Original strand, 142810 - 142844
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaac 38  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  142810 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaac 142844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 3123 - 3222
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||  |||   ||||| || ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  3123 ttgtgtatatcaacatacaactcagcaacatcaacgacaacgtag---acaacgacaataacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttg 3219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 1776 - 1668
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgac---tgtgcataataacttatgacttactccccaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||  ||| ||||||| ||||||    ||||||||  | |||| ||||||| | ||||    
T  1776 ttgtgtatatcaacatacaactcagctacaacaacgacaacctagacaacgacaacgacaacgacaatagtgcataaataattataacttacttcacaac 1677  T
Q  110 ttggtcaac 118  Q
    |||||||||    
T  1676 ttggtcaac 1668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 118
Target Start/End: Original strand, 2786 - 2896
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttact 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||  |||  ||| |||||    ||||||||||||||  | |||||||||||     
T  2786 ggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcagcaacaacaacgacaacgtagacaacgacaac----acgactgtgcataaataattatgacttac- 2880  T
Q  103 ccccaacttggtcaac 118  Q
    || |||||||||||||    
T  2881 ccacaacttggtcaac 2896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 3923 - 3807
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgata--acgactgtgcataataacttatgactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||  ||| ||||||| |  |||||| |||||||  | ||||||||||    
T  3923 ggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcaacaacatcaacgacaacgtagacaaccacaacgacaacacgactatgcataaataattatgactta 3824  T
Q  101 ctccccaacttggtcaac 118  Q
    | || |||||||||||||    
T  3823 c-ccacaacttggtcaac 3807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 137
Target Start/End: Original strand, 132864 - 132910
Alignment:
Q  91 ttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  132864 ttatgacttactccacaacttggtcaacatcaacaacttaagactcc 132910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Original strand, 226 - 275
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  226 ggactcaactttgtgtatatcaacataaaactcaactacaacaacgacaa 275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 50
Target Start/End: Original strand, 10571 - 10608
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgac 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10571 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaacgac 10608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9908 - 9847
Alignment:
Q  76 actgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 137  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9908 actgtgcataaataattataacttactccacaacttggtcaacatcaacaacttaagactcc 9847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 174800 - 174688
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttact 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||   ||||| || | ||| || ||||||||  | ||| ||||||||    
T  174800 ggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcagcaacatcaacgacaacatag---acaacgacaacaacaacagtgcataaataattaagacttact 174704  T
Q  103 ccccaacttggtcaac 118  Q
    || |||||||||||||    
T  174703 ccacaacttggtcaac 174688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Original strand, 4922 - 4970
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  4922 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaacaacaacaacaacaa 4970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Original strand, 7205 - 7253
Alignment:
Q  4 ggactcaactt-gtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgaca 51  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7205 ggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcatctacaacaacgaca 7253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Original strand, 6004 - 6052
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  6004 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaacaacaacaacaacaa 6052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Original strand, 8156 - 8204
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  8156 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaacaacaacaacaacaa 8204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 52
Target Start/End: Original strand, 5882 - 5921
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5882 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaacaacaa 5921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 41
Target Start/End: Original strand, 29376 - 29411
Alignment:
Q  6 actcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 41  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29376 actccacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 29411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 41
Target Start/End: Original strand, 384269 - 384304
Alignment:
Q  6 actcaacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 41  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  384269 actccacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 384304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 11654 - 11616
Alignment:
Q  14 tgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11654 tgtgtatatcaacatacaactcccctacgacaacgacaa 11616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 13952 - 13914
Alignment:
Q  14 tgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13952 tgtgtatatcaacatacaactcccctacgacaacgacaa 13914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 38
Target Start/End: Original strand, 25645 - 25679
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaac 38  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25645 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaac 25679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 47
Target Start/End: Original strand, 2304 - 2338
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaac 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2304 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaac 2338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 47
Target Start/End: Original strand, 9148 - 9182
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaac 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9148 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaac 9182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 118
Target Start/End: Original strand, 8193 - 8247
Alignment:
Q  64 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaac 118  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8193 acaacgacaacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaac 8247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 21749 - 21715
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaac 38  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21749 ggactccacttgtgtatatcaacatacaactcaac 21715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 18174 - 18140
Alignment:
Q  4 ggactcaacttgtgtatatcaacatacaactcaac 38  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18174 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaac 18140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 41
Target Start/End: Original strand, 2871 - 2899
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactac 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2871 ttgtgtatatcaacatacaactcaactac 2899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 34849 - 34821
Alignment:
Q  13 ttgtgtatatcaacatacaactcaactac 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34849 ttgtgtatatcaacatacaactcaactac 34821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 52
Target Start/End: Original strand, 120977 - 121017
Alignment:
Q  12 cttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  120977 cttgtgtatatctacatacaactcaacaacaacaacgacaa 121017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 52
Target Start/End: Original strand, 131854 - 131894
Alignment:
Q  12 cttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  131854 cttgtgtatatctacatacaactcaacaacaacaacgacaa 131894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University