View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8903_low_50 (Length: 347)

Name: NF8903_low_50
Description: NF8903
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8903_low_50
NF8903_low_50
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (1-347)||(14579789-14580135)
chr3 (7-347)||(5423783-5424123)
chr3 (7-347)||(16636710-16637050)
chr3 (7-347)||(43164034-43164374)
chr3 (8-347)||(15401371-15401710)
chr3 (7-347)||(15588245-15588585)
chr3 (7-347)||(20060907-20061247)
chr3 (7-347)||(48426384-48426724)
chr3 (7-347)||(13253627-13253967)
chr3 (7-347)||(15340206-15340546)
chr3 (7-347)||(14875352-14875692)
chr3 (7-347)||(15347098-15347438)
chr3 (7-343)||(15723787-15724123)
chr3 (10-347)||(53383874-53384211)
chr3 (7-347)||(10006537-10006877)
chr3 (7-347)||(10907147-10907487)
chr3 (7-347)||(17490787-17491127)
chr3 (10-347)||(6601673-6602010)
chr3 (10-330)||(3686897-3687217)
chr3 (7-347)||(16693101-16693441)
chr3 (10-347)||(16827048-16827385)
chr3 (7-347)||(16411134-16411475)
chr3 (6-347)||(16805799-16806140)
chr3 (6-347)||(12499185-12499526)
chr3 (6-347)||(15260567-15260908)
chr3 (7-270)||(5109464-5109727)
chr3 (10-347)||(10418890-10419227)
chr3 (19-344)||(16835364-16835689)
chr3 (7-347)||(15228596-15228936)
chr3 (7-347)||(15234464-15234804)
chr3 (19-338)||(13942980-13943299)
chr3 (19-338)||(41178478-41178797)
chr3 (19-338)||(44778203-44778522)
chr3 (10-347)||(12359372-12359709)
chr3 (19-344)||(16379782-16380107)
chr3 (10-347)||(31939850-31940187)
chr3 (11-347)||(12179285-12179621)
chr3 (10-345)||(18133191-18133526)
chr3 (10-347)||(31694030-31694368)
chr3 (10-347)||(13970965-13971302)
chr3 (113-343)||(16491140-16491370)
chr3 (10-347)||(17187321-17187658)
chr3 (16-344)||(11960020-11960348)
chr3 (10-344)||(13319347-13319681)
chr3 (10-347)||(14087620-14087957)
chr3 (10-344)||(16328505-16328839)
chr3 (10-344)||(28755268-28755602)
chr3 (10-211)||(16755557-16755758)
chr3 (192-347)||(14574870-14575025)
chr3 (153-347)||(14125593-14125787)
chr3 (10-344)||(47124894-47125228)
chr3 (7-342)||(15014609-15014944)
chr3 (166-341)||(15062661-15062836)
chr3 (7-134)||(12887859-12887986)
chr3 (16-344)||(30138756-30139084)
chr3 (16-344)||(30148307-30148635)
chr3 (10-233)||(10384732-10384955)
chr3 (16-279)||(17194109-17194372)
chr3 (16-344)||(8273261-8273589)
chr3 (140-329)||(16337487-16337676)
chr3 (16-279)||(15611118-15611381)
chr3 (16-275)||(18750963-18751221)
chr3 (16-344)||(13966206-13966534)
chr3 (16-344)||(16741565-16741893)
chr3 (16-344)||(6151715-6152043)
chr3 (16-284)||(25767328-25767596)
chr3 (52-279)||(12793156-12793383)
chr3 (52-279)||(16258159-16258386)
chr3 (87-279)||(55514651-55514843)
chr3 (16-266)||(6711274-6711524)
chr3 (202-272)||(15096028-15096098)
chr3 (261-347)||(17493577-17493663)
chr3 (14-59)||(11950757-11950802)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (7-347)||(20017320-20017660)
chr8 (7-347)||(17673080-17673420)
chr8 (7-347)||(18857961-18858301)
chr8 (7-347)||(19114074-19114414)
chr8 (7-347)||(22119232-22119571)
chr8 (7-347)||(22128016-22128355)
chr8 (7-347)||(23651425-23651765)
chr8 (7-347)||(21920793-21921133)
chr8 (7-347)||(21392922-21393262)
chr8 (7-347)||(21787416-21787756)
chr8 (15-347)||(30312209-30312541)
chr8 (10-347)||(19483124-19483461)
chr8 (6-347)||(15534767-15535108)
chr8 (6-347)||(19979351-19979692)
chr8 (10-347)||(21165598-21165935)
chr8 (7-347)||(20389483-20389823)
chr8 (7-347)||(21252328-21252668)
chr8 (15-344)||(22041246-22041579)
chr8 (7-347)||(21043829-21044169)
chr8 (6-342)||(22132097-22132433)
chr8 (6-347)||(32601528-32601869)
chr8 (7-347)||(20008978-20009317)
chr8 (10-347)||(21324329-21324666)
chr8 (13-347)||(23656311-23656645)
chr8 (7-347)||(22372315-22372655)
chr8 (40-347)||(20984637-20984944)
chr8 (19-338)||(31569911-31570230)
chr8 (6-347)||(20395188-20395529)
chr8 (23-344)||(22052250-22052571)
chr8 (49-347)||(21841801-21842099)
chr8 (6-347)||(22247489-22247830)
chr8 (32-302)||(16407199-16407469)
chr8 (10-347)||(29302486-29302823)
chr8 (10-347)||(23886408-23886745)
chr8 (7-266)||(19860900-19861159)
chr8 (10-347)||(20974716-20975053)
chr8 (6-347)||(22376509-22376851)
chr8 (6-347)||(22382684-22383026)
chr8 (10-344)||(31415531-31415865)
chr8 (10-344)||(16270284-16270618)
chr8 (16-344)||(6605045-6605373)
chr8 (10-343)||(27355924-27356257)
chr8 (10-344)||(14566529-14566863)
chr8 (7-140)||(22422949-22423082)
chr8 (16-344)||(16876161-16876489)
chr8 (25-279)||(20651408-20651662)
chr8 (52-307)||(19869117-19869372)
chr8 (16-279)||(21849403-21849666)
chr8 (16-275)||(23156106-23156365)
chr8 (187-344)||(12306145-12306302)
chr8 (14-279)||(23901639-23901904)
chr8 (16-347)||(22435687-22436018)
chr8 (16-272)||(22316650-22316906)
chr8 (262-347)||(19852795-19852880)
chr8 (262-347)||(19858831-19858916)
chr8 (86-279)||(21195638-21195831)
chr8 (142-347)||(22623235-22623433)
chr8 (295-347)||(1267622-1267674)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (7-347)||(8199935-8200275)
chr7 (7-347)||(8708912-8709252)
chr7 (7-347)||(14333703-14334043)
chr7 (7-345)||(13687373-13687711)
chr7 (7-347)||(11235836-11236176)
chr7 (7-347)||(15159680-15160020)
chr7 (7-347)||(18550381-18550721)
chr7 (7-347)||(44789974-44790314)
chr7 (6-347)||(15147507-15147848)
chr7 (7-347)||(19148519-19148859)
chr7 (7-347)||(20747918-20748258)
chr7 (6-347)||(11770863-11771204)
chr7 (26-347)||(23202255-23202576)
chr7 (26-347)||(23508382-23508703)
chr7 (6-343)||(14041006-14041343)
chr7 (6-343)||(14351036-14351373)
chr7 (7-347)||(14955861-14956201)
chr7 (10-344)||(320663-320997)
chr7 (6-347)||(15940-16281)
chr7 (15-347)||(9597364-9597696)
chr7 (7-347)||(11551725-11552065)
chr7 (10-347)||(15101207-15101544)
chr7 (8-347)||(12688807-12689147)
chr7 (7-347)||(18179049-18179392)
chr7 (25-347)||(14212981-14213303)
chr7 (10-347)||(14262848-14263185)
chr7 (10-343)||(16070899-16071232)
chr7 (19-338)||(23504483-23504802)
chr7 (7-347)||(12205401-12205741)
chr7 (19-338)||(18052566-18052885)
chr7 (19-344)||(15341742-15342067)
chr7 (13-343)||(11387035-11387365)
chr7 (10-344)||(14284980-14285314)
chr7 (6-347)||(15204926-15205267)
chr7 (10-345)||(13666847-13667182)
chr7 (10-347)||(19613983-19614320)
chr7 (164-347)||(10872302-10872485)
chr7 (16-344)||(13022668-13022996)
chr7 (10-344)||(10-344)
chr7 (10-344)||(12457951-12458285)
chr7 (10-344)||(16949076-16949410)
chr7 (10-344)||(13967272-13967606)
chr7 (10-344)||(11304867-11305201)
chr7 (6-284)||(15625895-15626173)
chr7 (10-344)||(49153612-49153946)
chr7 (16-344)||(7825210-7825538)
chr7 (10-341)||(26117194-26117540)
chr7 (16-344)||(27106406-27106734)
chr7 (16-344)||(27171591-27171919)
chr7 (52-307)||(39814-40069)
chr7 (19-191)||(14139143-14139315)
chr7 (14-274)||(17925031-17925291)
chr7 (16-279)||(4441303-4441566)
chr7 (16-279)||(14937722-14937984)
chr7 (16-279)||(15365315-15365577)
chr7 (112-277)||(23642820-23642985)
chr7 (160-262)||(15717679-15717781)
chr7 (162-272)||(21673312-21673422)
chr7 (202-278)||(13354525-13354601)
chr7 (202-275)||(17144080-17144153)
chr7 (310-347)||(15625861-15625898)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (7-347)||(8051977-8052317)
chr4 (8-347)||(14302333-14302672)
chr4 (7-347)||(23957065-23957405)
chr4 (7-347)||(29037758-29038098)
chr4 (7-344)||(27712657-27712994)
chr4 (6-343)||(15146238-15146575)
chr4 (7-347)||(8387730-8388070)
chr4 (7-347)||(12477918-12478258)
chr4 (7-347)||(19777147-19777487)
chr4 (7-347)||(18298523-18298863)
chr4 (25-344)||(18614196-18614515)
chr4 (7-347)||(12524994-12525334)
chr4 (7-347)||(40474358-40474698)
chr4 (7-347)||(14681885-14682225)
chr4 (10-347)||(15247242-15247579)
chr4 (10-347)||(15001981-15002318)
chr4 (6-347)||(18225799-18226140)
chr4 (7-347)||(15071677-15072017)
chr4 (6-338)||(14160797-14161129)
chr4 (7-347)||(14849720-14850060)
chr4 (6-230)||(56566144-56566368)
chr4 (70-347)||(16353862-16354139)
chr4 (7-347)||(8707238-8707569)
chr4 (19-338)||(51605418-51605737)
chr4 (10-347)||(27901704-27902041)
chr4 (6-347)||(14695431-14695772)
chr4 (10-347)||(15357737-15358074)
chr4 (10-347)||(16149029-16149366)
chr4 (10-347)||(16153175-16153512)
chr4 (10-341)||(1647894-1648225)
chr4 (105-344)||(33224244-33224483)
chr4 (10-344)||(3263411-3263745)
chr4 (10-344)||(44660483-44660817)
chr4 (10-344)||(29452154-29452488)
chr4 (10-344)||(11205848-11206182)
chr4 (55-307)||(18548721-18548973)
chr4 (16-279)||(9292221-9292484)
chr4 (202-347)||(15320454-15320599)
chr4 (16-344)||(14998637-14998964)
chr4 (16-344)||(15291781-15292109)
chr4 (220-347)||(15413853-15413980)
chr4 (112-272)||(12341584-12341744)
chr4 (7-47)||(15320610-15320650)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (8-347)||(8288-8627)
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (8-347)||(21831636-21831975)
chr1 (8-347)||(21838283-21838623)
chr1 (6-347)||(19107701-19108042)
chr1 (7-347)||(33389715-33390055)
chr1 (7-347)||(430802-431142)
chr1 (10-347)||(16349285-16349622)
chr1 (7-347)||(51332179-51332519)
chr1 (6-347)||(21234416-21234757)
chr1 (10-347)||(41352351-41352688)
chr1 (6-344)||(24793302-24793640)
chr1 (6-347)||(21025506-21025847)
chr1 (10-347)||(21750273-21750610)
chr1 (10-347)||(21744241-21744578)
chr1 (7-347)||(22360930-22361270)
chr1 (6-347)||(17043700-17044041)
chr1 (10-344)||(23196938-23197269)
chr1 (10-347)||(19855638-19855975)
chr1 (10-347)||(20855449-20855786)
chr1 (10-347)||(20834589-20834926)
chr1 (10-344)||(24098292-24098626)
chr1 (10-347)||(19661825-19662163)
chr1 (7-347)||(20060638-20060978)
chr1 (10-347)||(20938752-20939089)
chr1 (16-344)||(21952245-21952573)
chr1 (7-233)||(16377589-16377815)
chr1 (10-344)||(31538686-31539020)
chr1 (57-246)||(50619121-50619309)
chr1 (171-347)||(22110355-22110531)
chr1 (171-347)||(22114204-22114380)
chr1 (10-343)||(37678417-37678750)
chr1 (10-344)||(20295748-20296082)
chr1 (236-347)||(16373863-16373974)
chr1 (16-344)||(20830087-20830415)
chr1 (201-347)||(19759753-19759899)
chr1 (6-164)||(22116429-22116587)
chr1 (16-245)||(52987206-52987436)
chr1 (16-344)||(22134252-22134580)
chr1 (16-279)||(20915002-20915265)
chr1 (16-279)||(41216552-41216815)
chr1 (295-347)||(16077630-16077682)
chr1 (10-95)||(48424489-48424574)
chr1 (6-45)||(50619083-50619122)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (7-347)||(2873562-2873902)
chr6 (7-347)||(25608620-25608960)
chr6 (6-347)||(22435051-22435392)
chr6 (6-347)||(22443449-22443790)
chr6 (6-344)||(19865872-19866210)
chr6 (7-347)||(29590679-29591019)
chr6 (10-347)||(27188618-27188955)
chr6 (10-347)||(27260285-27260622)
chr6 (7-347)||(25113734-25114074)
chr6 (7-343)||(18406703-18407039)
chr6 (7-347)||(22761214-22761554)
chr6 (10-343)||(16962207-16962540)
chr6 (10-347)||(28261959-28262296)
chr6 (10-347)||(28340708-28341045)
chr6 (7-347)||(21472783-21473123)
chr6 (7-347)||(23079651-23079991)
chr6 (10-347)||(16926400-16926739)
chr6 (13-347)||(27564596-27564920)
chr6 (7-342)||(18196492-18196827)
chr6 (7-270)||(16621839-16622102)
chr6 (10-347)||(5837981-5838318)
chr6 (86-347)||(24312006-24312267)
chr6 (7-347)||(19488031-19488371)
chr6 (10-343)||(5295968-5296301)
chr6 (10-347)||(15460518-15460855)
chr6 (22-338)||(28281587-28281903)
chr6 (13-347)||(21568756-21569090)
chr6 (11-347)||(34644349-34644685)
chr6 (10-347)||(18795872-18796209)
chr6 (6-341)||(18966053-18966388)
chr6 (6-266)||(21754481-21754737)
chr6 (10-344)||(10467611-10467945)
chr6 (7-347)||(19880480-19880820)
chr6 (10-347)||(14378678-14379016)
chr6 (10-347)||(14380228-14380566)
chr6 (157-347)||(1541993-1542183)
chr6 (113-347)||(21562997-21563231)
chr6 (6-215)||(25763986-25764195)
chr6 (10-344)||(19436187-19436521)
chr6 (7-187)||(20634699-20634879)
chr6 (10-344)||(24365597-24365931)
chr6 (175-347)||(15897276-15897447)
chr6 (182-347)||(20636235-20636400)
chr6 (6-345)||(18449694-18450028)
chr6 (16-344)||(16381141-16381469)
chr6 (160-347)||(19454602-19454789)
chr6 (16-272)||(1647582-1647838)
chr6 (16-344)||(16648737-16649065)
chr6 (16-279)||(16099259-16099522)
chr6 (16-279)||(23997498-23997761)
chr6 (16-279)||(35274854-35275117)
chr6 (16-279)||(23026484-23026747)
chr6 (16-343)||(14129655-14129982)
chr6 (52-279)||(16234278-16234505)
chr6 (11-90)||(24294545-24294624)
chr6 (52-279)||(18574439-18574666)
chr6 (165-279)||(14624274-14624388)
chr6 (14-275)||(21928459-21928720)
chr6 (267-347)||(16625736-16625816)
chr6 (16-344)||(18836676-18837004)
chr6 (16-278)||(19986184-19986452)
chr6 (249-347)||(8761934-8762032)
chr6 (8-59)||(23086505-23086556)
chr6 (10-50)||(28283917-28283957)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (7-347)||(27611604-27611944)
chr5 (7-347)||(27684196-27684536)
chr5 (7-347)||(14998535-14998875)
chr5 (7-347)||(22135918-22136258)
chr5 (7-347)||(22331683-22332023)
chr5 (7-347)||(27667286-27667626)
chr5 (7-347)||(34567744-34568084)
chr5 (7-347)||(16357752-16358092)
chr5 (7-347)||(29474869-29475209)
chr5 (7-344)||(19771213-19771550)
chr5 (7-347)||(27519656-27519996)
chr5 (7-347)||(40710030-40710370)
chr5 (7-347)||(41772092-41772432)
chr5 (7-347)||(25427683-25428023)
chr5 (7-347)||(37290292-37290632)
chr5 (35-347)||(18777046-18777358)
chr5 (7-347)||(21562769-21563109)
chr5 (6-347)||(23441460-23441799)
chr5 (6-335)||(20800659-20800988)
chr5 (10-345)||(21338096-21338431)
chr5 (35-347)||(23574979-23575291)
chr5 (10-347)||(20822685-20823022)
chr5 (10-347)||(24619094-24619431)
chr5 (10-347)||(24715325-24715662)
chr5 (10-347)||(24748353-24748690)
chr5 (6-347)||(26737522-26737863)
chr5 (10-347)||(21871850-21872186)
chr5 (10-347)||(21876130-21876466)
chr5 (14-347)||(22463183-22463516)
chr5 (19-338)||(17268142-17268461)
chr5 (10-347)||(28893741-28894078)
chr5 (10-347)||(28922567-28922904)
chr5 (7-347)||(20466895-20467234)
chr5 (6-347)||(23472478-23472818)
chr5 (10-347)||(28915212-28915549)
chr5 (10-347)||(28930480-28930817)
chr5 (10-306)||(20777186-20777482)
chr5 (10-347)||(21679577-21679914)
chr5 (10-347)||(22234719-22235056)
chr5 (10-338)||(24797196-24797524)
chr5 (10-344)||(14885790-14886124)
chr5 (10-344)||(22503914-22504248)
chr5 (82-344)||(23078960-23079222)
chr5 (10-344)||(37542180-37542514)
chr5 (10-344)||(20343517-20343851)
chr5 (6-347)||(21408388-21408729)
chr5 (16-344)||(25849310-25849638)
chr5 (242-345)||(820-923)
chr5 (16-344)||(21935993-21936321)
chr5 (16-344)||(24582445-24582773)
chr5 (7-97)||(22349419-22349509)
chr5 (16-279)||(23504544-23504807)
chr5 (258-347)||(21497174-21497263)
chr5 (16-344)||(27012319-27012647)
chr5 (253-343)||(21882203-21882293)
chr5 (118-284)||(21624125-21624291)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (7-347)||(22324010-22324350)
chr2 (7-347)||(24263319-24263659)
chr2 (7-347)||(27372218-27372558)
chr2 (7-347)||(24710983-24711323)
chr2 (7-347)||(41607539-41607879)
chr2 (7-347)||(44384723-44385063)
chr2 (7-347)||(27218965-27219305)
chr2 (7-347)||(10869799-10870139)
chr2 (7-347)||(16926309-16926649)
chr2 (7-347)||(16999949-17000289)
chr2 (7-347)||(21144195-21144535)
chr2 (6-343)||(21324419-21324756)
chr2 (7-347)||(23106883-23107224)
chr2 (7-347)||(24875904-24876243)
chr2 (6-347)||(24676438-24676779)
chr2 (14-328)||(25264022-25264336)
chr2 (7-347)||(23111685-23112025)
chr2 (6-347)||(24706635-24706976)
chr2 (7-275)||(23072884-23073152)
chr2 (10-347)||(27209329-27209666)
chr2 (20-347)||(23099185-23099512)
chr2 (19-338)||(27788698-27789017)
chr2 (22-338)||(12575311-12575627)
chr2 (10-332)||(23294899-23295221)
chr2 (10-347)||(19651207-19651544)
chr2 (10-347)||(23277725-23278062)
chr2 (114-347)||(16923838-16924071)
chr2 (114-347)||(16983101-16983334)
chr2 (10-347)||(24949539-24949876)
chr2 (9-347)||(30011340-30011678)
chr2 (10-344)||(20829211-20829545)
chr2 (6-347)||(45533294-45533635)
chr2 (10-344)||(1064703-1065037)
chr2 (10-344)||(31831610-31831944)
chr2 (9-347)||(30210074-30210412)
chr2 (198-347)||(17064666-17064815)
chr2 (16-347)||(12639396-12639727)
chr2 (7-103)||(9485409-9485505)
chr2 (16-275)||(25129630-25129889)
chr2 (16-279)||(24830351-24830614)
chr2 (52-279)||(22279122-22279349)
chr2 (16-279)||(22760732-22760995)
chr2 (20-279)||(24568835-24569094)
chr2 (10-95)||(19718174-19718259)
chr2 (279-347)||(23067340-23067407)
chr2 (202-252)||(25133742-25133792)
chr2 (223-307)||(17967134-17967218)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (6-347)||(17003-17344)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (7-347)||(8746-9086)
scaffold0080 (7-305)||(49481-49779)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (7-347)||(30294-30634)
scaffold0026 (7-338)||(50168-50499)
scaffold0026 (177-347)||(29406-29576)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (7-347)||(8715-9055)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (6-347)||(29187-29528)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (6-347)||(102582-102923)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (7-347)||(16285-16625)
scaffold0028 (7-347)||(44500-44840)
scaffold0028 (7-347)||(9823-10163)
scaffold0028 (10-347)||(49134-49471)
scaffold0028 (16-277)||(105199-105460)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (10-347)||(1218-1555)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (7-347)||(5125-5465)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (7-347)||(13828-14168)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (7-347)||(38565-38905)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (6-347)||(38436-38777)
scaffold0042 (10-347)||(66754-67091)
scaffold0042 (6-68)||(22333-22395)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (7-347)||(7369-7709)
scaffold0120 (7-347)||(13407-13751)
scaffold0120 (16-347)||(178-509)
scaffold0120 (16-279)||(23593-23856)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (6-347)||(3543-3884)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (10-343)||(18702-19035)
scaffold0244 (16-279)||(25403-25666)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (6-343)||(19955-20292)
scaffold0081 (6-343)||(35379-35716)
scaffold0081 (92-347)||(50781-51036)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (6-347)||(112104-112445)
scaffold0040 (10-347)||(16226-16563)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (7-347)||(15461-15801)
scaffold0266 (16-344)||(8487-8815)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (7-338)||(2889-3220)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (7-338)||(29902-30233)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (7-347)||(6948-7288)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (7-347)||(7398-7738)
scaffold0358 (7-184)||(16757-16934)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (7-347)||(115-455)
scaffold0319 (7-347)||(2618-2958)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (7-347)||(7704-8044)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (7-345)||(8276-8614)
scaffold0647 (6-347)||(2257-2591)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (6-344)||(2788-3126)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (25-347)||(32208-32530)
scaffold0109 (155-344)||(9948-10137)
scaffold0109 (6-146)||(39703-39843)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (10-347)||(2105-2442)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (6-347)||(25561-25901)
scaffold0243 (202-279)||(899-976)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (7-347)||(5779-6119)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (7-347)||(18958-19298)
scaffold0114 (11-344)||(21239-21572)
scaffold0114 (113-344)||(45869-46100)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (15-343)||(57370-57698)
scaffold0017 (6-347)||(18683-19024)
scaffold0017 (6-341)||(196103-196429)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (8-347)||(27986-28325)
scaffold0023 (6-236)||(3121-3351)
scaffold0023 (17-347)||(60102-60432)
scaffold0023 (7-120)||(150690-150799)
scaffold0023 (25-279)||(54576-54830)
scaffold0023 (292-347)||(3358-3413)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (10-347)||(7273-7610)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (6-347)||(3969-4310)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (10-347)||(47654-47991)
scaffold0053 (16-344)||(56473-56801)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (6-343)||(1771-2108)
scaffold0044 (6-343)||(15511-15848)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (7-347)||(11142-11482)
scaffold0309 (7-233)||(16103-16329)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (7-347)||(108428-108768)
scaffold0029 (7-347)||(113908-114248)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (10-344)||(32763-33097)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (6-347)||(7363-7704)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (8-345)||(23697-24034)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (10-347)||(48453-48790)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (10-343)||(108983-109316)
scaffold0031 (6-275)||(55607-55876)
scaffold0031 (271-347)||(62912-62988)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (7-343)||(50492-50828)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (7-347)||(202085-202425)
scaffold0004 (10-347)||(324053-324390)
scaffold0004 (50-347)||(118575-118872)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (8-347)||(23691-24030)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (10-347)||(1232-1569)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (10-347)||(6099-6436)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (14-343)||(27977-28306)
scaffold0067 (10-323)||(50800-51113)
scaffold0067 (10-323)||(66222-66535)
scaffold0067 (10-323)||(59834-60147)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (6-347)||(683-1024)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (6-347)||(2242-2583)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (11-347)||(3525-3861)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (11-347)||(6570-6906)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (8-347)||(327-666)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (7-338)||(5706-6037)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (10-347)||(1474-1811)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (6-347)||(16593-16934)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (10-347)||(593-930)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (10-347)||(68719-69056)
scaffold0034 (12-347)||(3575-3910)
scaffold0034 (10-347)||(12528-12865)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (7-347)||(7721-8061)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (7-347)||(41047-41386)
scaffold0102 (52-266)||(47075-47288)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (10-347)||(34819-35156)
scaffold0139 (253-347)||(28566-28660)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (12-347)||(13549-13884)
scaffold0124 (16-279)||(6434-6697)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (10-344)||(80452-80786)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (6-347)||(13817-14158)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (10-347)||(4098-4435)
scaffold0035 (7-347)||(42724-43064)
scaffold0035 (52-307)||(11858-12113)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (7-347)||(39377-39716)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (6-347)||(5220-5561)
scaffold0270 (6-347)||(12350-12691)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (10-347)||(308-644)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (66-347)||(39906-40187)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (10-347)||(22805-23142)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (6-347)||(25149-25490)
scaffold0011 (10-347)||(149919-150255)
scaffold0011 (10-338)||(194324-194652)
scaffold0011 (16-340)||(181280-181604)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (16-344)||(6771-7099)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (7-307)||(2970-3270)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (7-347)||(9425-9765)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (10-344)||(676-1010)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (10-344)||(11406-11740)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (7-347)||(218037-218374)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (6-347)||(3263-3604)
scaffold0010 (10-345)||(46019-46354)
scaffold0010 (10-344)||(40953-41287)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (10-347)||(6509-6848)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (10-347)||(10677-11014)
scaffold0298 (10-347)||(14447-14784)
scaffold0298 (10-317)||(21362-21669)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (7-347)||(27873-28214)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (7-344)||(4464-4801)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (7-206)||(1393-1592)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (97-347)||(31460-31710)
scaffold0180 (7-275)||(34368-34636)
scaffold0180 (10-347)||(12155-12484)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (10-347)||(1975-2312)
scaffold0222 (10-347)||(8409-8747)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (10-343)||(23567-23900)
scaffold0104 (199-343)||(20747-20891)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (10-347)||(55520-55857)
scaffold0076 (10-347)||(32297-32634)
scaffold0076 (16-344)||(41610-41938)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (10-344)||(44135-44469)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (10-344)||(20472-20806)
scaffold0058 (169-345)||(57970-58146)
scaffold0058 (6-120)||(27863-27977)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (6-275)||(473-742)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (10-323)||(19-332)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (10-347)||(35462-35799)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (10-347)||(42266-42603)
[»] scaffold0509 (2 HSPs)
scaffold0509 (7-289)||(1607-1889)
scaffold0509 (7-289)||(8035-8317)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (10-344)||(249965-250299)
[»] scaffold0367 (2 HSPs)
scaffold0367 (10-347)||(5858-6195)
scaffold0367 (182-266)||(4-88)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (6-206)||(8309-8509)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (10-347)||(350-680)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (10-344)||(6565-6899)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (10-344)||(4956-5290)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (10-344)||(31939-32273)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (16-347)||(100188-100519)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (10-344)||(10509-10843)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (6-248)||(1-243)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (6-347)||(15097-15439)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (10-347)||(13702-14038)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (10-347)||(10077-10414)
scaffold0235 (10-347)||(20291-20628)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (10-347)||(12919-13256)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (10-303)||(5970-6261)
scaffold0149 (10-303)||(10401-10692)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (10-347)||(115525-115862)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (10-347)||(20198-20535)
scaffold0090 (10-347)||(24360-24697)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (136-347)||(79240-79451)
scaffold0022 (57-233)||(55232-55407)
scaffold0022 (6-45)||(55406-55445)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (102-344)||(261660-261902)
scaffold0005 (154-347)||(277594-277787)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (7-344)||(6310-6639)
scaffold0117 (214-279)||(248-313)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (180-347)||(10318-10485)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (10-344)||(314-648)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (10-344)||(1454-1788)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (7-347)||(9650-9973)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (155-344)||(3170-3359)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (10-343)||(28286-28619)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (6-347)||(17833-18172)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (157-347)||(12759-12949)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (142-347)||(177014-177219)
scaffold0016 (9-72)||(176925-176988)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (7-347)||(85136-85476)
scaffold0007 (188-284)||(92829-92925)
[»] scaffold0077 (4 HSPs)
scaffold0077 (10-265)||(20197-20452)
scaffold0077 (16-279)||(26892-27155)
scaffold0077 (165-279)||(25657-25771)
scaffold0077 (165-344)||(16339-16518)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (9-161)||(3461-3613)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (10-207)||(13959-14156)
scaffold0261 (10-207)||(22138-22335)
scaffold0261 (241-323)||(14151-14233)
scaffold0261 (241-323)||(22330-22412)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (10-344)||(15333-15667)
scaffold0089 (277-347)||(10786-10856)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (6-212)||(492389-492595)
scaffold0001 (256-347)||(89311-89402)
scaffold0001 (256-347)||(89989-90080)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (166-347)||(2937-3118)
[»] scaffold0405 (2 HSPs)
scaffold0405 (8-141)||(93-226)
scaffold0405 (187-281)||(1-95)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (16-344)||(6526-6854)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (189-343)||(39732-39886)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (16-344)||(2501-2829)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (16-344)||(24746-25074)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (16-344)||(14260-14588)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (16-347)||(346-677)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (19-173)||(194769-194923)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (16-279)||(879-1142)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (238-338)||(96522-96622)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (20-279)||(72606-72864)
scaffold0021 (16-279)||(6628-6894)
scaffold0021 (112-279)||(15848-16015)
scaffold0021 (112-279)||(25379-25546)
scaffold0021 (20-275)||(32043-32298)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (16-279)||(25243-25506)
scaffold0008 (188-279)||(133287-133378)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (16-275)||(2579-2837)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (249-344)||(4311-4406)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (201-347)||(2141-2287)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (16-279)||(8682-8945)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (16-266)||(1428-1678)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (213-347)||(24699-24833)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (221-347)||(64-190)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (85-279)||(19464-19658)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (16-276)||(15478-15738)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (11-146)||(622-757)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (172-344)||(7672-7844)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (286-347)||(24816-24877)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (145-218)||(34692-34765)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (112-279)||(10711-10878)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (52-279)||(11372-11599)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (292-347)||(26323-26378)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (10-74)||(24735-24799)
[»] scaffold0876 (2 HSPs)
scaffold0876 (112-279)||(3961-4128)
scaffold0876 (16-128)||(1572-1684)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (165-264)||(13589-13688)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (25-143)||(33638-33756)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (54-101)||(5747-5794)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (310-347)||(5380-5417)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 14579789 - 14580135
Alignment:
Q  1 taacgcgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14579789 taacgcgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagac 14579888  T
Q  101 agttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14579889 agttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgag 14579988  T
Q  201 atttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14579989 atttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattat 14580088  T
Q  301 gattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14580089 gattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 14580135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 5423783 - 5424123
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5423783 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaaggaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacaattga 5423882  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423883 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcagctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 5423982  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  5423983 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 5424082  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5424083 ggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 5424123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16637050 - 16636710
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16637050 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 16636951  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16636950 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 16636851  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  16636850 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 16636751  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16636750 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 16636710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 43164374 - 43164034
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43164374 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 43164275  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43164274 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 43164175  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  43164174 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 43164075  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43164074 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 43164034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 15401371 - 15401710
Alignment:
Q  8 atgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgag 107  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15401371 atgaaacttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgag 15401470  T
Q  108 gattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaa 207  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15401471 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 15401570  T
Q  208 gtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttg 307  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  15401571 gagtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttg 15401670  T
Q  308 gtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15401671 gtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 15401710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 15588245 - 15588585
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15588245 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 15588344  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15588345 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 15588444  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  15588445 agtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 15588544  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15588545 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 15588585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 20060907 - 20061247
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20060907 gatgaaccttttgtggtctattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaggaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 20061006  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20061007 gggttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 20061106  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  20061107 agtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 20061206  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20061207 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 20061247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 48426724 - 48426384
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48426724 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 48426625  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48426624 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttga 48426525  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  48426524 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaggattatgacttt 48426425  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48426424 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 48426384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13253967 - 13253627
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  13253967 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaggtggtagcttacgcttcaagacagttga 13253868  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13253867 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 13253768  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  13253767 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 13253668  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13253667 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcaga 13253627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15340546 - 15340206
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15340546 gatgaaacttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaagttaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 15340447  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15340446 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 15340347  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  15340346 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 15340247  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15340246 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgctgttgcaga 15340206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 14875352 - 14875692
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14875352 gatgaaccttttgtggtatactgtgatgcgtccaagttgagtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 14875451  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14875452 gaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcagctgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 14875551  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | ||||||||||| |||    
T  14875552 ggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaatgaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgacttt 14875651  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14875652 gatttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 14875692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 15347098 - 15347438
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15347098 gatgaaccttttgtggtatattttgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcatatgcttcaagacagttga 15347197  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15347198 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggcagtagtctttgtatcgaagatatggagacattacttgtttggttcgagatttga 15347297  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || |||    
T  15347298 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggcttgagttgctaaaggattacgacttt 15347397  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15347398 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 15347438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 15723787 - 15724123
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15723787 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtctaaactgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 15723886  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15723887 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 15723986  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  15723987 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatagcttgaattgttgaaagattatgacttt 15724086  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15724087 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttg 15724123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 53383874 - 53384211
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  53383874 gaaccttttgtggtatatggtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagag 53383973  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  53383974 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtgttgaaaatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 53384073  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  53384074 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 53384173  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53384174 ttgaattaacatccgggtaaagctaatgttattgcaga 53384211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10006877 - 10006537
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10006877 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 10006778  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10006777 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcagctgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttga 10006678  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| ||     
T  10006677 ggtgtttagtgatcacaagagtttaaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttc 10006578  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10006577 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 10006537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10907487 - 10907147
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10907487 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 10907388  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10907387 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttga 10907288  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| ||     
T  10907287 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtattttttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttc 10907188  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10907187 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 10907147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17491127 - 17490787
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17491127 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 17491028  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17491027 gaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtagtctttgtattgaatatatggagacattatttgtatggttcgagatttga 17490928  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| ||| | || ||||||||||||    
T  17490927 ggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagattgcttgaattgcttaatgattatgatttt 17490828  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17490827 gagttgagctatcatcctggtaaagctaatgttgttgcaga 17490787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6602010 - 6601673
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||      
T  6602010 gaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgctttaagacagttgagag 6601911  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  6601910 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 6601811  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  6601810 gtttaatgatcacaagagattgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 6601711  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6601710 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 6601673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3687217 - 3686897
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||      
T  3687217 gaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaggtggtagcttacgcttcaagacagttgagag 3687118  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3687117 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 3687018  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||    
T  3687017 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggt 3686918  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaa 330  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  3686917 ttgaattatcatccaggtaaa 3686897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16693441 - 16693101
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  16693441 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtctaagttggctttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgctactagacagttga 16693342  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| || || || ||||| || |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16693341 gaattcatgagaagaattacccgacacatgatttagaattagcgactgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttga 16693242  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||| ||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||| ||||||||||| |||    
T  16693241 ggtgtttattgatcataagagtttgaagtatctgtttgaccagaaggaattgaatatgagacagcgtagatggatagaattgttgaaagattatgacttt 16693142  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16693141 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcaga 16693101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 16827048 - 16827385
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||    
T  16827048 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaaga 16827147  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  16827148 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagt 16827247  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||    
T  16827248 gtttagtgatcacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgacttgttgaaggattatgattttagt 16827347  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16827348 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtgtttgcaga 16827385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 16411134 - 16411475
Alignment:
Q  7 gatgaacc-ttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  16411134 gatgaaccgttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtaacttatgcttcaaggcagttg 16411233  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16411234 agagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcagccgtagtctttgtattgaagatatggagacactacttgtatggttcgagatttg 16411333  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| | |||||||| || ||    
T  16411334 aggtctttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaacagaaggaattgaatattaggcagagaagatggctagaattgctgaaagattacgactt 16411433  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16411434 tggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcaga 16411475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 16805799 - 16806140
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  16805799 cgatgagctttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcgagacaattg 16805898  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16805899 agaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttg 16805998  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| | || ||| | ||||||||||| ||    
T  16805999 aggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggatagaattgctgaaagattatgactt 16806098  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16806099 tgctttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcaga 16806140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12499526 - 12499185
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12499526 cgatgaacctttcgtggtttactatgatgcttccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcctcaagacagttg 12499427  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||||| ||| || ||||| ||||| || || ||   |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12499426 agaattcatgagaagagttacccgacgcatgatttagaattggcgactgtggtctttgatttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttg 12499327  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  12499326 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagtcaaagaaggtggctcgagttattgaaagattatgactt 12499227  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||    
T  12499226 tggtttgaattatcatctaggtaaagctaacgtcgttgcaga 12499185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15260908 - 15260567
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||    
T  15260908 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagtttggcttaggtggtgtgcttatggaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacaattg 15260809  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    ||||||||||| || ||| | || |||| ||  |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15260808 aggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgatttagttgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattacttgtatggttcgagattta 15260709  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15260708 aagtgttcagcgaccacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattt 15260609  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15260608 tgagttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcaga 15260567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 5109464 - 5109727
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5109464 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 5109563  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5109564 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 5109663  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacag 270  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5109664 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattttttcgatcagaaggaattgaatatgagacag 5109727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 10418890 - 10419227
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  | |||     
T  10418890 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctagacaactaaggg 10418989  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  10418990 ttcatgaaaagaattatcctactcatgacctggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagt 10419089  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10419090 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggt 10419189  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10419190 ttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcaga 10419227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 16835364 - 16835689
Alignment:
Q  19 gttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgaga 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||| | ||||| |    
T  16835364 gttgtttattgtgatgcgtctaagttgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagggtacatgaaa 16835463  T
Q  119 agaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtga 218  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| || | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16835464 agaattatcccactcacgatttggagttagctgcagtggtttttgttttgaagatttagaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtga 16835563  T
Q  219 ccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattat 318  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16835564 tcacaagagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattac 16835663  T
Q  319 catccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    ||||| | |||||| ||||| |||||    
T  16835664 catcctgataaagccaatgtagttgc 16835689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15228936 - 15228596
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15228936 gatgaacctttggttgtatactatgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaggtagtagcttatgcttcgagacagttga 15228837  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  15228836 ggattcatgagcggaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgtgttgaaaatttggagacattatttatatggttccagatttga 15228737  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || || |||||||| ||  | |||||||| || |||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  15228736 ggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgatttt 15228637  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15228636 agtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcaga 15228596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15234804 - 15234464
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15234804 gatgaacctttggttgtatactatgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaggtagtagcttatgcttcgagacagttga 15234705  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  15234704 ggattcatgagcggaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgtgttgaaaatttggagacattatttatatggttccagatttga 15234605  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || || |||||||| ||  | |||||||| || |||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  15234604 ggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgatttt 15234505  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15234504 agtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcaga 15234464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13943299 - 13942980
Alignment:
Q  19 gttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgaga 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||   |||| | ||||| |    
T  13943299 gttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaaccgagggtgcatgaaa 13943200  T
Q  119 agaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtga 218  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13943199 agaattatcccactcacgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtga 13943100  T
Q  219 ccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattat 318  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  13943099 ccacaagagcttgaaatacttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattac 13943000  T
Q  319 catccgggtaaagctaatgt 338  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  13942999 catccgggaaaagctaatgt 13942980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41178797 - 41178478
Alignment:
Q  19 gttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgaga 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||  ||||| | || || |    
T  41178797 gttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaa 41178698  T
Q  119 agaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtga 218  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  41178697 agaattatcccactcatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtga 41178598  T
Q  219 ccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattat 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  41178597 ccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattac 41178498  T
Q  319 catccgggtaaagctaatgt 338  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  41178497 catccgggaaaagctaatgt 41178478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 44778522 - 44778203
Alignment:
Q  19 gttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgaga 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||  ||||| | ||||| |    
T  44778522 gttgtttattgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcatgaaa 44778423  T
Q  119 agaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtga 218  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44778422 agaattatcccactcatgatttagagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtga 44778323  T
Q  219 ccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattat 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  44778322 ccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattac 44778223  T
Q  319 catccgggtaaagctaatgt 338  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  44778222 catccgggcaaagctaatgt 44778203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 12359372 - 12359709
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  12359372 gaaccttttgatgtttactgtaatgtgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcatatgcttctaggcagttgagga 12359471  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12359472 tccatgagaagaattatcctacacatgatttcgagttagctgcggtggtttttactttgaaaatttggaggcattacttgtatggttccagatttgaagt 12359571  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  12359572 atttagtaatcacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggatagagctgttgaaggattatgattttggc 12359671  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12359672 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 12359709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 16379782 - 16380107
Alignment:
Q  19 gttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgaga 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||| | ||| | |    
T  16379782 gttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagggtacataaaa 16379881  T
Q  119 agaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtga 218  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16379882 agaattatcccactcacgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtga 16379981  T
Q  219 ccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattat 318  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16379982 tcacaagagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattac 16380081  T
Q  319 catccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||  | |||||||| || |||||    
T  16380082 catcctagcaaagctaacgtagttgc 16380107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31940187 - 31939850
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  31940187 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcatctagacagttgagga 31940088  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31940087 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagt 31939988  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| | ||| |||| || |||||||| ||||||    
T  31939987 atttagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggt 31939888  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  31939887 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcaga 31939850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12179621 - 12179285
Alignment:
Q  11 aaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggat 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||||||    
T  12179621 aaccttttgttgtttattctgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaagtagttgaggat 12179522  T
Q  111 tcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtg 210  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||  ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||     
T  12179521 tcatgaaaagaattatcctacacatgatttgtagttggctgcggtggtttttattttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaagta 12179422  T
Q  211 tttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtt 310  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||    
T  12179421 tttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtt 12179322  T
Q  311 tgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  12179321 tgaattaccagccgggcaaagccaatgtggttgcaga 12179285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Original strand, 18133191 - 18133526
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||||    
T  18133191 gaaccttttgtggtttactgtgatgcgtctaagttgggtttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggttgcgtatgcttctagacagttgagga 18133290  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18133291 tacatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggctttatttgtatggttccagatttgaagt 18133390  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | || ||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  18133391 attcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaatggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggc 18133490  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgca 345  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18133491 atgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgca 18133526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 31694030 - 31694368
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttagg-tggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagg 108  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  31694030 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttggggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcatctagatagttgagg 31694129  T
Q  109 attcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaag 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31694130 attcatgaaaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcggtggtttttattttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaag 31694229  T
Q  209 tgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttgg 308  Q
    | || ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| | ||| |||| || |||||||| |||||    
T  31694230 tattcagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttgg 31694329  T
Q  309 tttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  31694330 tttgaattaacatcctggtaaagccaatgtagttgcaga 31694368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 13970965 - 13971302
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||      
T  13970965 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggttgtagcgtatgcttctaggcagctgagag 13971064  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  13971065 tgcatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtctttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagt 13971164  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||| | || || |||||||| |||||     
T  13971165 gttcagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgactttggg 13971264  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13971265 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcaga 13971302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 113 - 343
Target Start/End: Original strand, 16491140 - 16491370
Alignment:
Q  113 atgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtt 212  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16491140 atgagaagaattaacctacgcatgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtt 16491239  T
Q  213 tagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttg 312  Q
    |||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | || |||||||||||||| |||    
T  16491240 tagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgattttgggttg 16491339  T
Q  313 aattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16491340 agctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 16491370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17187658 - 17187321
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||  |||||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||| || ||| |||||     
T  17187658 gaaccgtttgttgtttactttgatgcgtctaagctgggtttagtaggtgtttttatgcaagttggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagctgaggg 17187559  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||   ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  17187558 tacatgagaagaattatcctacttacgatttggagttggcttcggtggtttttgttttgaagatttgtaggcactacttgtatggttccagatttgaagt 17187459  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||| | || || |||||||||||| ||    
T  17187458 gttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcaaaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttagt 17187359  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17187358 ttgaactatcacccgggtaaagccaatgtggttgcaga 17187321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 11960020 - 11960348
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  11960020 tttgttgtttactgtgatgcatataagctgggcttaggtggtgttctaatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgaggattcatg 11960119  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  11960120 agaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcggtggtatttgttttaaaaatttggaggcattacttgtacggttccagatttgaggtgttcag 11960219  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | | ||  |  | || |||||||||||||| ||||||    
T  11960220 tgatcataagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagattgttagaactactgaaggattatgattttggcttgaat 11960319  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    || |||||  |||| || ||||| |||||    
T  11960320 taccatcctagtaaggccaatgtggttgc 11960348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 13319347 - 13319681
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| ||||      
T  13319347 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttctaagttcggcttgggtggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttctaggcagctgagag 13319446  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||    
T  13319447 ttcatgaaaagaattatcgtacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatatggaggcactatctgtatggttctagatttgaagt 13319546  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || || ||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || |||||||| ||||||    
T  13319547 gttcagtgatcataaaagcttgaggtatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgactttggt 13319646  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  13319647 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgc 13319681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14087957 - 14087620
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||      
T  14087957 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagag 14087858  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  14087857 tgcatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagt 14087758  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||| | || || ||||||||||||||     
T  14087757 gttcagtgaccataagagcttgaaatatttatctgattagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggg 14087658  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14087657 ttaaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcaga 14087620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 16328505 - 16328839
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| ||     
T  16328505 gaaccgtttgttgtttattatgatgcatcgaagttgggcgtaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcggg 16328604  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||| |||| || ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  16328605 ttcatgagaagaactatcctacacatgatctggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 16328704  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| | |||||  | || ||||| ||||||||     
T  16328705 gttcagtgataataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcacaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggc 16328804  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  16328805 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 16328839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28755602 - 28755268
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |      
T  28755602 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtagtagcatatgcttctagacaattgcgtg 28755503  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  28755502 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 28755403  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | || |||| ||||||||||    
T  28755402 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggt 28755303  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  28755302 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 28755268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 211
Target Start/End: Original strand, 16755557 - 16755758
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  16755557 gaaccttttgtggtgtattgtgacgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagag 16755656  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  16755657 ttaatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 16755756  T
Q  210 gt 211  Q
    ||    
T  16755757 gt 16755758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 192 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14575025 - 14574870
Alignment:
Q  192 tggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgtta 291  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14575025 tggttccaggtttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgtta 14574926  T
Q  292 aaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14574925 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 14574870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 153 - 347
Target Start/End: Original strand, 14125593 - 14125787
Alignment:
Q  153 tgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaag 252  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||    
T  14125593 tgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgtttaatgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcaaaag 14125692  T
Q  253 gaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14125693 gaattgaatatgaggcagcttagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 14125787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 47125228 - 47124894
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||  | |    
T  47125228 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttacgta 47125129  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  47125128 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 47125029  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | || |||| |||||||||     
T  47125028 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 47124929  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  47124928 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 47124894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 15014609 - 15014944
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| || || |||||||    
T  15014609 gatgagccatttgttgtatattgtgatgcatctaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaggataatgaagtagtagcttatgcatcgaggcagttga 15014708  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    ||||||||||    ||||||||||| || ||| | ||||||||||   |||  |||||| | ||||| ||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  15014709 ggattcatgaatgcaattatcctactcatgatcttgagttagctgcattggcttttgtaatcaaaatttggaggcattatctatatgtttctagatttga 15014808  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||| ||||| || || ||| |||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||  ||||||||||     
T  15014809 agtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttatttgactagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgctaaagaattatgatttc 15014908  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgtt 342  Q
     | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15014909 aggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgtt 15014944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 166 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15062836 - 15062661
Alignment:
Q  166 ttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatga 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15062836 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggttttaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 15062737  T
Q  266 gacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgt 341  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  15062736 gacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatcaagttaaagctaatgttgt 15062661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12887986 - 12887859
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12887986 gatgaaccttttgtggtgtattgtggtgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttga 12887887  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgca 134  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12887886 gaattcatgagaagaattatcctacgca 12887859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30139084 - 30138756
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  30139084 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 30138985  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  30138984 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 30138885  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  30138884 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 30138785  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  30138784 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 30138756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30148635 - 30148307
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  30148635 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 30148536  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  30148535 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 30148436  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  30148435 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 30148336  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  30148335 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 30148307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10384955 - 10384732
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||  |||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| |      
T  10384955 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcatctaagctgggcctaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtg 10384856  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  10384855 ttcatgagaagaattatcctacacatgacttggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 10384756  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaa 233  Q
    ||| ||||| || || ||||||||    
T  10384755 gttcagtgatcataaaagtttgaa 10384732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17194372 - 17194109
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || |||||||||||||| |||||||   | ||||    
T  17194372 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatg 17194273  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  17194272 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcag 17194173  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  17194172 tgaccacaagagtttgaaatacttgcttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 17194109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 8273261 - 8273589
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  8273261 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 8273360  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || ||||| || ||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  8273361 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 8273460  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  8273461 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 8273560  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  8273561 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 8273589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 329
Target Start/End: Original strand, 16337487 - 16337676
Alignment:
Q  140 tggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatattt 239  Q
    ||||||| | || |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  16337487 tggagttggttgttgtggtgtttgttttaaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatattt 16337586  T
Q  240 gtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaa 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16337587 gtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaa 16337676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15611381 - 15611118
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| || || | || |||||||||||||| || |||||||  || ||||    
T  15611381 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcaaaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcagttgaaaatgcatg 15611282  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| |     
T  15611281 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcaa 15611182  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  15611181 tgaccacaagagttcgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatgg 15611118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18751221 - 18750963
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || |||||||||| ||| |||||||   | ||||    
T  18751221 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgctttaaggcagttgaaagtgcatg 18751122  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || ||||| |||||  | |||||||| |  ||||||||||||||    
T  18751121 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagat-tggaggcattatctatatggttctaagtttgaagtgtttag 18751023  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaag 275  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  18751022 tgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaag 18750963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 13966206 - 13966534
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  13966206 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 13966305  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||| || || |  || || | |  |||||  || ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  13966306 agaagaattatccgactcataatttggaattggcagccgttgtgtatacattgacgatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 13966405  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  13966406 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgatttttagttgagt 13966505  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  13966506 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 13966534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 16741565 - 16741893
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || |  ||||   | ||||    
T  16741565 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcgattgaaagtacatg 16741664  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || ||||| || ||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  16741665 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 16741764  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||   | || |||| |||||||   |||| |    
T  16741765 tgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagt 16741864  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  16741865 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 16741893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 6151715 - 6152043
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || |||||||||||||| || ||||   | ||||    
T  6151715 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcaattgaaagtgcatg 6151814  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || |||||| ||  |||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  6151815 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagattcggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 6151914  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  6151915 tgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatataaggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 6152014  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  6152015 tatcatcccgggaaggctaatgttgttgc 6152043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25767596 - 25767328
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||| ||||||||  || || |  | || ||||||||||  || ||||||| | | ||||    
T  25767596 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtacttatgcagaatcgttagtttgtggcttatgctttgaggcagttgaaggtgcatg 25767497  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  25767496 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 25767397  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttga 284  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25767396 tgaccacaagagcttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgagacaaagaagatggtttga 25767328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12793383 - 12793156
Alignment:
Q  52 ggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctg 151  Q
    |||||||||||||||||  || || | || || ||||||||||| || |||||||   | ||||||||||||||||| || || |||||||| || || |    
T  12793383 ggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcgg 12793284  T
Q  152 atgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaa 251  Q
      || || | || ||||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12793283 ccgttgtgtatgcattgaaaatttggaggcactatctgtatggttctaattttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaa 12793184  T
Q  252 ggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
     || ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  12793183 agagttgaatacgaggcagaggagatgg 12793156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16258386 - 16258159
Alignment:
Q  52 ggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctg 151  Q
    |||||||||||||||||| || || | || || || ||||||||||| |||||||   | |||||||| |||||||| || || |||||||| || |  |    
T  16258386 ggtggtgtgcttatgcaaaatcgtcaggttgtggcgtatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaacaattatccgactcatgatttggaattggtag 16258287  T
Q  152 atgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaa 251  Q
      || || | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16258286 ccgttgtgtatacattgaagatctggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaa 16258187  T
Q  252 ggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
     || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  16258186 agagttgaatatgaggcagaggagatgg 16258159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 279
Target Start/End: Original strand, 55514651 - 55514843
Alignment:
Q  87 ttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattac 186  Q
    ||||||||| || |||||||   | ||||||||||| ||||| ||  | |||||||| || || | ||| || | ||| ||||| || ||||| |||||     
T  55514651 ttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaactatccgacttatgatttggaattggcggctgttgtgtatgtgttgaagatttggaggcattat 55514750  T
Q  187 ttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
     |||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  55514751 ctgtatggttctaaatttaaagtgttaagtgatcacaagagtttgaagtatatgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatgg 55514843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Original strand, 6711274 - 6711524
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||| | |||||  || || | || ||  ||||||| || || |||||||   | ||||    
T  6711274 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgttaatgcagaatcgtcaggttgtgacttatgcgtcgaggcagttgaaagtgcatg 6711373  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||| || || |   | || | ||| ||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  |||||| |||| ||    
T  6711374 agaagaactatccaactcatgatttggaattggcggccattgtgtatgtgttgaagatttggagccattatctgtatggttctaagtttgaaatgttcag 6711473  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgag 266  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  6711474 tgaccacaagagattgaagtacttgtttgaccagaaagagttgaatatgag 6711524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15096098 - 15096028
Alignment:
Q  202 tttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagag 272  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15096098 tttgaattgttcagcgaccacaagagtttgaagtacttgttcgatcagaaggagttgaatatgaggcagag 15096028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17493663 - 17493577
Alignment:
Q  261 tatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||| |||||||||||| |  || |||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  17493663 tatgaggcagagaagatggttaaagctgttgaaggattatgattttggtttgagttaccatccgggtaaagccaacgtggttgcaga 17493577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 59
Target Start/End: Original strand, 11950757 - 11950802
Alignment:
Q  14 cttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgt 59  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  11950757 cttttgttgtttactgtgatgcgtctaagttgggattgggtggtgt 11950802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 20017320 - 20017660
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20017320 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 20017419  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017420 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 20017519  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  20017520 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 20017619  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20017620 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 20017660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 17673080 - 17673420
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17673080 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 17673179  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17673180 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 17673279  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  17673280 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 17673379  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17673380 ggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 17673420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18858301 - 18857961
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18858301 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaaattgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 18858202  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858201 caattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 18858102  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  18858101 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 18858002  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18858001 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcaga 18857961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19114414 - 19114074
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19114414 gatgaactttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 19114315  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19114314 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 19114215  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  19114214 agtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgacttt 19114115  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19114114 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 19114074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 22119232 - 22119571
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22119232 gatgaaccttttgtgtaatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagatagttga 22119331  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22119332 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggc-gtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 22119430  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  22119431 agtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 22119530  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22119531 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 22119571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 22128016 - 22128355
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22128016 gatgaaccttttgtgtaatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagatagttga 22128115  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22128116 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggc-gtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 22128214  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  22128215 agtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 22128314  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22128315 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 22128355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23651765 - 23651425
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23651765 gatgaaccttttatggtatattgtgatgcgttcaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 23651666  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23651665 gaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 23651566  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     || |||| ||| ||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  23651565 ggtatttactgatcacaagagtctgaagtatctgttcgatctgaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaatttctaaaagattatgatttt 23651466  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23651465 gagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 23651425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 21920793 - 21921133
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21920793 gatgaaccttttgtggtatattatgatgcatccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 21920892  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21920893 gaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatttga 21920992  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || |||| |||||| ||| || | ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  21920993 ggtgtttagtgatcataagattttgaagtatctgctcgatcagaaggaattgaacatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaatattatgatttt 21921092  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21921093 gagttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 21921133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 21392922 - 21393262
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21392922 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 21393021  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21393022 gaatttatgagaagaattatcccacacacgatttagagttggcggctgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 21393121  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | ||||||| |||||||    
T  21393122 ggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattctgatttt 21393221  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21393222 gagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 21393262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 21787416 - 21787756
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21787416 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 21787515  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21787516 gaatttatgagaagaattatcccacacacgatttagagttggcggctgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 21787615  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | ||||||| |||||||    
T  21787616 ggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattctgatttt 21787715  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21787716 gagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 21787756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 30312209 - 30312541
Alignment:
Q  15 ttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcat 114  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30312209 ttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagatgggtttaggcggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcat 30312308  T
Q  115 gagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttta 214  Q
    ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30312309 gaggagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgttta 30312408  T
Q  215 gtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaa 314  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  30312409 gcgatcacaagagcttgaattatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaa 30312508  T
Q  315 ttatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30312509 ttatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 30312541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 19483124 - 19483461
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||      
T  19483124 gaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtgatagcttatgcttcaagacagttgagag 19483223  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  19483224 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggcagtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 19483323  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||     
T  19483324 gtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaagattatgactttggg 19483423  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19483424 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 19483461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15535108 - 15534767
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  15535108 cgatgagctttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcaagatagttg 15535009  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15535008 agaattcatgagaagaattacccgacgcacgatttagaattggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttg 15534909  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | |||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||| ||    
T  15534908 aggtgtttagcgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgagacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactt 15534809  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15534808 tggtttgaattatgatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 15534767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19979692 - 19979351
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19979692 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 19979593  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||| ||||||||||| || || || |||||  |||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19979592 agaattcacgagaagaattaccccacacatgatttatagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 19979493  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| || || || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||| || ||| | ||||||||||| ||    
T  19979492 aggtgtttagtgatcataaaagcttgaaatatatgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtacatggctggaattgctgaaagattatgactt 19979393  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19979392 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 19979351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 21165598 - 21165935
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21165598 gaaccttttgtggtatactgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatcgtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaa 21165697  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21165698 ttcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggt 21165797  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | || |||||||| ||||||    
T  21165798 gtttagtgatcataagagtttgaaatacttgttcgatcaaaaagagttgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgactttggt 21165897  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21165898 ttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 21165935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20389823 - 20389483
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||    
T  20389823 gatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggcttatgtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttggagacagttga 20389724  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  20389723 gaattcatgagcagaattatcccacgcacgatttggagttggctgttgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttga 20389624  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||| || || |||||||||    
T  20389623 ggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcaaaaggaattaaatatgaggcagcgaaggtggcttcaattgttgaaggactatgatttt 20389524  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20389523 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 20389483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21252668 - 21252328
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21252668 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtctaagctgggtttgggtggtgtgcttatgcaagatagaaaagtagtagtttatgcttcgagacagttga 21252569  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  21252568 gaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttagctgctgtggtctttgtattgaagatatggagatattacttgtatggttcgagattcga 21252469  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||   |||| |||||| ||| | || ||||||||||||    
T  21252468 ggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcaatcagaaggaattgaatatgaggcagcatagatagcttgaattgctgaaggattatgatttt 21252369  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21252368 gagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 21252328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22041579 - 22041246
Alignment:
Q  15 ttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgc----ttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggat 110  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22041579 ttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaat 22041480  T
Q  111 tcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtg 210  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22041479 tcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtg 22041380  T
Q  211 tttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtt 310  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  22041379 tttagcgatcacaagagttggaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtt 22041280  T
Q  311 tgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22041279 tgaattatcatccaggtaaagccaatgttgttgc 22041246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21044169 - 21043829
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21044169 gatgaaccttttgtggtatattgcaatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagtcga 21044070  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21044069 gaattcatgagaagaattaccttacgcacgatttagagttggctgatgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttga 21043970  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | || || |||||||||    
T  21043969 ggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctcgaattgctgaaggactatgatttt 21043870  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21043869 gagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 21043829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Original strand, 22132097 - 22132433
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||| | |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  22132097 cgatgagctttttgtggtgtattgtgatgcgcccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcgagacagttg 22132196  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22132197 agaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattaattgtatggttcgaggtttg 22132296  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | | |||||| |||||| | || |||||||| ||    
T  22132297 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtaaatggctagagttgctgaaggattatgactt 22132396  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgtt 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22132397 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgatgtt 22132433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 32601869 - 32601528
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32601869 cgatgagctttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtctaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcaagacagttg 32601770  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  32601769 agaattcatgagaaaaattacccggcgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttg 32601670  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||| || ||||| || ||    
T  32601669 aggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaggattacgactt 32601570  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32601569 tggtttgaatcatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 32601528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 20008978 - 20009317
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  20008978 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttga 20009077  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  20009078 ggattcatgaaaagaattatcctacccatgatttggagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttcctgatttga 20009177  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||    
T  20009178 agtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattaaacatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactgtgatttt 20009277  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||    
T  20009278 ggtttgaattatcaccccggtaaa-ctaatgtggttgcaga 20009317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 21324329 - 21324666
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||  | ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21324329 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaggatggcaaggtagtagcttatgcttctagacagttgagga 21324428  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  21324429 tacatgaaaataattatcctatgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagt 21324528  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21324529 atttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattacgattttggt 21324628  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  21324629 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcaga 21324666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23656645 - 23656311
Alignment:
Q  13 ccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattc 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  23656645 ccttttgttttttattgtgatgcgtccaagttaggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgaggattc 23656546  T
Q  113 atgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtt 212  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  23656545 atgaaaagaattatcctacacatgatttggagtttgctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggtatt 23656446  T
Q  213 tagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttg 312  Q
     ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23656445 cagtgatcacaaaagcttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggtagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttg 23656346  T
Q  313 aattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23656345 aattactatccgggtaaagccaatgtggttgcaga 23656311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22372655 - 22372315
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  22372655 gatgaaccttttgttgtttattctgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttataggcagttga 22372556  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22372555 ggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttga 22372456  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||| | ||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  22372455 agtgtttagtgatcataaaagtttgaagtatctatttgaccaaaaataattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattattgaaggactatgatttt 22372356  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22372355 agtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcaga 22372315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 40 - 347
Target Start/End: Original strand, 20984637 - 20984944
Alignment:
Q  40 aagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatt 139  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20984637 aagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcctacgcatgatt 20984736  T
Q  140 tggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatattt 239  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||| |    
T  20984737 tggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatttggagacattatttgtacggttctagatttgaggtgcttagtgatcataaaagtttgaaatatct 20984836  T
Q  240 gtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgtt 339  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20984837 gtttgaccaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtt 20984936  T
Q  340 gttgcaga 347  Q
    ||||||||    
T  20984937 gttgcaga 20984944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Original strand, 31569911 - 31570230
Alignment:
Q  19 gttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgaga 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||  ||||| | || || |    
T  31569911 gttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaa 31570010  T
Q  119 agaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtga 218  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31570011 agaattatcccactcatgatttagagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtga 31570110  T
Q  219 ccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattat 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  31570111 ccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattac 31570210  T
Q  319 catccgggtaaagctaatgt 338  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  31570211 catccgggaaaagctaatgt 31570230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 20395188 - 20395529
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||   || |||||||||||||| || || ||||||    
T  20395188 cgatgaaccttttgtcgtgtattgtgatgcatccaagttgggtttaggtggtgtggttatgaagaataacaaggtagtagcttatgcatctaggcagttg 20395287  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||    ||||||||||| || ||| | |||||||||   || ||||||||  |  | || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  20395288 agaattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgagttagctacagtagtctttgtgcttgagatttggagacgttatttgtatggttctagatttg 20395387  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20395388 aagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattt 20395487  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20395488 tgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 20395529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22052571 - 22052250
Alignment:
Q  23 tttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaa 122  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  22052571 tttattatgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagagggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaa 22052472  T
Q  123 ttatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccac 222  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| || || || |||    
T  22052471 ttatcctacacatgatttggagttggctgcagtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtatggtttcagatttgaagtattcagcgatcac 22052372  T
Q  223 aagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatc 322  Q
    | |||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22052371 aggagtctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgagacagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatc 22052272  T
Q  323 cgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    | ||||||||||| || |||||    
T  22052271 ctggtaaagctaacgtagttgc 22052250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21842099 - 21841801
Alignment:
Q  49 ttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttag 148  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  21842099 ttaggtggtgtattgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcggttgaggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttgg 21842000  T
Q  149 ctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatca 248  Q
    |||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||    
T  21841999 ctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaaggttgaaatatttatttgatca 21841900  T
Q  249 gaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     || |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21841899 aaaagaattgaatatgaggcaaagaagatggcttgagatgttgaaggattatgatttctgtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 21841801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 22247489 - 22247830
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||  || |||||||||||||| |  |||||||||    
T  22247489 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtacttttgcaggatgacaaggtagtagcttatgcattgagacagttg 22247588  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| || ||| | || |||||||  ||| |||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22247589 aggattcatgaacaaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtgctctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttg 22247688  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||| || || || || ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  22247689 aagtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattaaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaggattatgattt 22247788  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22247789 tgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcaga 22247830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 302
Target Start/End: Original strand, 16407199 - 16407469
Alignment:
Q  32 atgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctac 131  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  16407199 atgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagatagttgagaattcatgagaagaattacccgac 16407298  T
Q  132 gcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttg 231  Q
    ||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||     
T  16407299 gcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagctta 16407398  T
Q  232 aaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatga 302  Q
    || |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||  |||| ||||| || || || |||||||||||    
T  16407399 aagtatttgttcgatcaaaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggctcgaattattgaaagattatga 16407469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 29302486 - 29302823
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  29302486 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtgatgttctgatgcaagatggtaaagtggtagcatatgcttctaggcagttgagga 29302585  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||    
T  29302586 tacatgagaagaattatcctacgcatgatctggaattggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagattcgaggt 29302685  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || |||||||||||||||    
T  29302686 gttcagtgatcacaagagtctaaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggt 29302785  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  29302786 ttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgcaga 29302823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23886745 - 23886408
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||||| || ||||| ||||| |    
T  23886745 gaaccttttgttgtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatgacaaggtagtggcttatgcatcgagacaattgagaa 23886646  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||    ||||||||||| || ||| | || ||||||   |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23886645 ttcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctacagtggtctttgtgctcaagatttggagacattatttgtatggttctagatttgaagt 23886546  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    |||  |||| || || |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||     
T  23886545 gttcggtgatcataaaagtcagaagtatttgtttgatctgaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggctttaattgttgaaagattatgattttggg 23886446  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23886445 ttgaattatcatcctggtaaaactaatgttgttgcaga 23886408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19861159 - 19860900
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||    
T  19861159 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtggtagcttatacttctaggcagttga 19861060  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19861059 ggattcatgaaatgaattatcctacgcatgatttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttga 19860960  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgag 266  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19860959 agtatttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgag 19860900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 20974716 - 20975053
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||| | || |    
T  20974716 gaaccgtttgttgttttctgtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctaagaa 20974815  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20974816 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 20974915  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || || || |||||||||    
T  20974916 attcagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgataagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggt 20975015  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  20975016 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcaga 20975053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 22376509 - 22376851
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| || ||| |||||    
T  22376509 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgtaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagatagttg 22376608  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    ||||||||||| || ||| | || |||||||  |||||||||||  | || |||||||||||||| ||  | ||||| |||||||    
T  22376609 aggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttaaacggttctagatttg 22376708  T
Q  206 aagtgtttagtgacca-caagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatt 304  Q
    ||||||| |  || ||  || ||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  22376709 aagtgttcaacgatcataaaaagtctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgatt 22376808  T
Q  305 ttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  22376809 ttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcaga 22376851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 22382684 - 22383026
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| || ||| |||||    
T  22382684 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgtaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagatagttg 22382783  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    ||||||||||| || ||| | || |||||||  |||||||||||  | || |||||||||||||| ||  | ||||| |||||||    
T  22382784 aggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttaaacggttctagatttg 22382883  T
Q  206 aagtgtttagtgacca-caagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatt 304  Q
    ||||||| |  || ||  || ||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  22382884 aagtgttcaacgatcataaaaagtctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgatt 22382983  T
Q  305 ttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  22382984 ttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcaga 22383026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 31415531 - 31415865
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||  || || |||||||    
T  31415531 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagacggtaaggtggtagcttatgcttataggcaattgagga 31415630  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  31415631 tacatgagaagaattatcctacgcatgatctgaagttggctgcagtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 31415730  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||  ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||  |||| || ||||||||||||||     
T  31415731 gtccagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggc 31415830  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||    
T  31415831 ttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgc 31415865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 16270284 - 16270618
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| |||||||| || || ||| |      
T  16270284 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaagatggtagcatatgcttctaggcaattgcgtg 16270383  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    || ||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  16270384 tttatgagaagaattatcctacacatgatttagaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggt 16270483  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||  |||| ||||||||||||||     
T  16270484 gttcagtgaccataaaagtttgaaatatctgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactaaaggattatgattttggc 16270583  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  16270584 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 16270618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6605373 - 6605045
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||| ||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| || || ||| |  ||||||    
T  6605373 tttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttatgtggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtgttcatg 6605274  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  6605273 agaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcag 6605174  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    ||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||  | ||||||| ||||||||| ||||||    
T  6605173 tgatcataaaagtttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaat 6605074  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    || ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  6605073 taccatcctggtaaggccaatgtggttgc 6605045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27356257 - 27355924
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||| |||||||| || || ||| |      
T  27356257 gaaccgtttgttgtgtactgcgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtgttagcatatgcttctaggcaattgcgtg 27356158  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  27356157 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggt 27356058  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  27356057 gttcagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgaccagaaggaactaaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggc 27355958  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  27355957 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 27355924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14566863 - 14566529
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||| |      
T  14566863 gaaccgtttattgtgtattgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgtcctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtg 14566764  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||    
T  14566763 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacgattccagatttgaggt 14566664  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | || |||| |||||||||     
T  14566663 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaacagaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 14566564  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  14566563 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 14566529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Original strand, 22422949 - 22423082
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  22422949 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttga 22423048  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgattt 140  Q
    | |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  22423049 gaattcatgagcggaattaccctacgcacgattt 22423082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 16876161 - 16876489
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  16876161 tttgtggtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 16876260  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || | ||| || | || |||||| || | ||| |||||  |||||||||| | |||||| ||||| ||    
T  16876261 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggctgttgtgtatgcattgaagatttagaggcattatctgtatggttctaaatttgaggtgttcag 16876360  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  16876361 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 16876460  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  16876461 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 16876489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Original strand, 20651408 - 20651662
Alignment:
Q  25 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaatt 124  Q
    ||||||||||| || ||| ||||  | |||||||||||||||||  || || | || || ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||    
T  20651408 tattgtgatgcttctaagatggggcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaagacagttgaaagtgcatgagaagaatt 20651507  T
Q  125 atcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaa 224  Q
    |||| || || |||||||| ||||| |  || || | || |||||| || ||||| |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| | |||||||||    
T  20651508 atccgactcatgatttggaattagcggtcgttgtgtctgcattgaagatttggaggcattacctgtatggttctaagtttgaggtgttcaatgaccacaa 20651607  T
Q  225 gagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  20651608 gagtttgaagtaattgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 20651662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19869372 - 19869117
Alignment:
Q  52 ggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctg 151  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | || || |||||||| || |||||  | | ||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||      
T  19869372 ggtggtgcgcttatgcaagatgggcatgtggtggcttatgcctcgagacaactaaagattcatgagaggaattacccgacacatgatttggagttagcat 19869273  T
Q  152 atgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaa 251  Q
     ||| || |||||  | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  19869272 ctgtagtgtttgttcttaaggtatggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatacttgtttgatcaaaa 19869173  T
Q  252 ggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttg 307  Q
     || ||||||||||||||| | |||||| | ||||| ||||| || ||||||||||    
T  19869172 tgagttgaatatgagacagcggagatggttggagttcttaaaggactatgattttg 19869117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Original strand, 21849403 - 21849666
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || |||||||   | ||||    
T  21849403 tttgtggtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatg 21849502  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || | ||| || | |  ||| || || ||||| |||||  | ||||||||    ||||||||||| ||    
T  21849503 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggctgttgtgtatacattaaagatttggaggcattatctttatggttcttagtttgaagtgttcag 21849602  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21849603 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcagaggagatgg 21849666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 23156106 - 23156365
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || |||||||||||||| |||||||   | ||||    
T  23156106 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaattgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatg 23156205  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    |||||||||||||  | || |||||||| || || |   | || | || |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  23156206 agaagaattatccggctcatgatttggaattggcggcaattgtgtatgcattgaagatttggaggcattatttgtatggttctaagtttgaagtgttcag 23156305  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaag 275  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  23156306 tgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaag 23156365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12306302 - 12306145
Alignment:
Q  187 ttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagt 286  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |  |||    
T  12306302 ttgtacggttctagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagtttgaaatatctgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttatagt 12306203  T
Q  287 tgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  12306202 tactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 12306145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23901904 - 23901639
Alignment:
Q  14 cttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||| || |  | |||||||||||||||||  || || | || || | |||| ||||||| |||||||   | ||    
T  23901904 cttttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgaggcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggtttattcttcaaggcagttgaaagtgca 23901805  T
Q  114 tgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || |||||||| ||  | |  || || | || |||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  |||||||||||     
T  23901804 tgagaagaactatccgactcatgatttggaattgacggcggttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttc 23901705  T
Q  214 agtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  23901704 agtgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgagacaaagaagatgg 23901639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22436018 - 22435687
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | ||  | |||||||||||||| |||||||   | || |    
T  22436018 tttgttgtgtattgcgatgcttttaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttatggcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcacg 22435919  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||| || || |   | || | || |||||| || ||||| |||||  ||||| |||| |  ||||| ||||| ||    
T  22435918 agaggaattatccgactcatgatttggaattggcggccattgtgtatgcattgaagatttggaggcattatatgtatagttctaactttgaggtgttcag 22435819  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |   | ||||||| |||||||   |||| |    
T  22435818 tgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaggagttgaatatgaggcaaagaagatggttggaatatcttaaagattttgattttcagttgagt 22435719  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  22435718 tatcatcctgggaaggctaatgttgttgcaga 22435687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22316906 - 22316650
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||| | | |||||||||||||||||  || || | || || |||||||| || || |||||||   | ||||    
T  22316906 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatggttcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcgtcgaggcagttgaaagtgcatg 22316807  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||| ||||| || ||  ||||||| || || |  || || | || |||||| || ||||| |||||  ||||||| || |  ||||||||||||||    
T  22316806 agaagaactatccaactcattatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggctctaagtttgaagtgtttag 22316707  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagag 272  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  22316706 tgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagag 22316650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19852880 - 19852795
Alignment:
Q  262 atgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  19852880 atgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcaga 19852795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19858916 - 19858831
Alignment:
Q  262 atgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  19858916 atgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcaga 19858831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 279
Target Start/End: Original strand, 21195638 - 21195831
Alignment:
Q  86 cttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacatta 185  Q
    ||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || ||||| |||||    
T  21195638 cttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcatta 21195737  T
Q  186 cttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
      |||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||    
T  21195738 tctgtatggttctaaatttgaagttttcagtgaccataagagtttgaagtacttatttgatcagaaaaagttgaatatgaggcaaagaagatgg 21195831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 347
Target Start/End: Original strand, 22623235 - 22623433
Alignment:
Q  142 gagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgt 241  Q
    ||||||||||  || || |||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||  | || ||| |||| ||||| |    
T  22623235 gagttagctgcagtagtttttgtacttaaaatttggagacattatctgtatggttctagatttgaagtgttcagtgattataaaagtatgaagtatttat 22623334  T
Q  242 ttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgt 341  Q
    ||||  |||| ||||| |||||||| |       | ||||   ||||||||| ||||||||||   | || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22623335 ttgactagaaagaattaaatatgaggc-------aaggctaatgttgttaaaggattatgattacaggttaaattaccatccgggtaaggctaatgttgt 22623427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1267674 - 1267622
Alignment:
Q  295 gattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  1267674 gattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagtcaatgtggttgcaga 1267622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8200275 - 8199935
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8200275 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 8200176  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8200175 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 8200076  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  8200075 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 8199976  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8199975 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 8199935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8709252 - 8708912
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8709252 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 8709153  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8709152 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 8709053  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  8709052 agtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgacttt 8708953  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8708952 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 8708912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14334043 - 14333703
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14334043 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 14333944  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14333943 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 14333844  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  14333843 ggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 14333744  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14333743 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 14333703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13687711 - 13687373
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13687711 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 13687612  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13687611 ggattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 13687512  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  13687511 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 13687412  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgca 345  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13687411 ggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgca 13687373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 11235836 - 11236176
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11235836 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 11235935  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  11235936 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtcgtctttgtattgaagatatggaggcattacttgtatggttcgagatttaa 11236035  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  11236036 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 11236135  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11236136 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 11236176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 15159680 - 15160020
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15159680 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 15159779  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159780 ggattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 15159879  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  15159880 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttattcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 15159979  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15159980 ggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 15160020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 18550381 - 18550721
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18550381 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 18550480  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18550481 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagataaggagacattacttgtatgattcgagatttga 18550580  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  18550581 agtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgacttt 18550680  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18550681 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 18550721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 44789974 - 44790314
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44789974 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttacgcttcaagacagttga 44790073  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  | |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44790074 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttgacggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 44790173  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  44790174 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 44790273  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44790274 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 44790314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 15147507 - 15147848
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  15147507 cgatgaaccttttgtggtaaattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaaggagtagcctatgcttcaagacggttg 15147606  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15147607 agaattcacgagaagaattaccctacgcacgatttagaattagttgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 15147706  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||| | ||||| | ||||||    
T  15147707 aagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaaagaatttgattt 15147806  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15147807 tgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 15147848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19148859 - 19148519
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  19148859 gatgaaccttttgctgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttga 19148760  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19148759 ggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttga 19148660  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  19148659 agtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgatttt 19148560  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19148559 ggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 19148519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20748258 - 20747918
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  20748258 gatgaaccttttgctgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcatatgcttctaggcagttga 20748159  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  20748158 ggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttga 20748059  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  20748058 agtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgatttt 20747959  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20747958 ggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 20747918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 11770863 - 11771204
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11770863 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaagtagtagcttatgcatcaagacagttg 11770962  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
     ||||||||||    ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11770963 gggattcatgaacgaaattaccctatgcatgatttagagttagctgcagtggtttttgtacttaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 11771062  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| || || || ||||| ||||||||    
T  11771063 aagtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatctatttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggctcgaatttttgaaagactatgattt 11771162  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11771163 tgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 11771204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 26 - 347
Target Start/End: Original strand, 23202255 - 23202576
Alignment:
Q  26 attgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaatta 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23202255 attgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcgagacagttgagagttcatgagaagaatta 23202354  T
Q  126 tcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaag 225  Q
    ||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  23202355 tcctacgcatgatcttgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgagatttggggtgtttagtgatcacaag 23202454  T
Q  226 agtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgg 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23202455 agtttgaaatatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgg 23202554  T
Q  326 gtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  23202555 gtaaagctaatgatgttgcaga 23202576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 26 - 347
Target Start/End: Original strand, 23508382 - 23508703
Alignment:
Q  26 attgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaatta 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23508382 attgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcgagacagttgagagttcatgagaagaatta 23508481  T
Q  126 tcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaag 225  Q
    ||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  23508482 tcctacgcatgatcttgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgagatttggggtgtttagtgatcacaag 23508581  T
Q  226 agtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgg 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23508582 agtttgaaatatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgg 23508681  T
Q  326 gtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  23508682 gtaaagctaatgatgttgcaga 23508703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14041343 - 14041006
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  14041343 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcgtcgagacagttg 14041244  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||    ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14041243 agaattcatgaacgaaattaccctacgcacgatttagagttagctgcagtggtcgttgtacttaaaatatggagacattacttgtatggttccagatttg 14041144  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14041143 aagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattt 14041044  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    ||  || |  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  14041043 tgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttg 14041006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14351373 - 14351036
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  14351373 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcgtcgagacagttg 14351274  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||    ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14351273 agaattcatgaacgaaattaccctacgcacgatttagagttagctgcagtggtcgttgtacttaaaatatggagacattacttgtatggttccagatttg 14351174  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14351173 aagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattt 14351074  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    ||  || |  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  14351073 tgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttg 14351036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14956201 - 14955861
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14956201 gatgagccttttgtagtatattgtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaaaaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttga 14956102  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |  ||||| ||| | ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14956101 gaattcatgagaagaattacctgacgcatgatctagagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatgggtcgagatttga 14956002  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  14956001 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgatttt 14955902  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14955901 gggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 14955861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 320663 - 320997
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  320663 gaaccttttgtagtatattgtgatgcgttcaagttgggcttaggtggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaa 320762  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| || | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  320763 ttcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatgaagacattacttgtatggttccagatttgaggt 320862  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| | || ||| ||||||||||||||||||      
T  320863 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaa 320962  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  320963 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 320997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 15940 - 16281
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15940 cgatgagctttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagagggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 16039  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||| |||||||||||| || || || ||||| ||||| || | | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16040 agaattcgtgagaagaattacccgacacatgatttagagttggcggctctagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttg 16139  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  16140 aggtgtttagcgatcacaacagtttgaagtatttgtttgatcagaagaaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactt 16239  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16240 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 16281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9597696 - 9597364
Alignment:
Q  15 ttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcat 114  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9597696 ttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcat 9597597  T
Q  115 gagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttta 214  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  9597596 gagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcagctgtggtctttgtattgaagatattgagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgttta 9597497  T
Q  215 gtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaa 314  Q
    | || |||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| ||  |  | ||||||||||| |||||||||||    
T  9597496 gcgatcacaagagcttgaggtatttgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaactactgaaagattatgactttggtttgaa 9597397  T
Q  315 ttatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9597396 ttatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 9597364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 11551725 - 11552065
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  11551725 gatgagccttttgtagtgtattgtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcgagacagttga 11551824  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| || || || ||| | ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11551825 gaattcatgagaagaattacccgacacatgatctagagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggaaacattacttgtatggtttgagatttga 11551924  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||| | |||    
T  11551925 ggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattgctgaaggattataacttt 11552024  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11552025 ggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcaga 11552065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 15101207 - 15101544
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  15101207 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttaatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 15101306  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
     |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||  ||| | ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  15101307 atcatgaaaagaattatcctacacatgatttagagttagctgcggtgatttttgttttataaatttggaggcattatttgtacgattccagatttgaagt 15101406  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||    
T  15101407 atttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggt 15101506  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15101507 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 15101544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12689147 - 12688807
Alignment:
Q  8 atgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgag 107  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12689147 atgagccttttgtagtatattgtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttgag 12689048  T
Q  108 gattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaa 207  Q
     ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  12689047 aattcatgagaagaattacccgacgcatgatctagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtctgaa 12688948  T
Q  208 gtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaaga-ttatgatttt 306  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||| || || |||||| |||    
T  12688947 gtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgttcaatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaggatttatgacttt 12688848  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12688847 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 12688807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18179392 - 18179049
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttagg--tggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagtt 104  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18179392 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaaggatggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagtt 18179293  T
Q  105 gagga-ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatt 203  Q
    || || ||||||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18179292 gatgagttcatgagatgaattatcccacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtt 18179193  T
Q  204 tgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgat 303  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||| | |||||||||||     
T  18179192 tgaggtgtttagtgattacaagagtttgaagtatttgttctatcagaaggaattgaacatgaggcagtgtagatggctagagttgctgaaagattatgac 18179093  T
Q  304 tttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18179092 tttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 18179049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14213303 - 14212981
Alignment:
Q  25 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaatt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14213303 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgaaagatggtaaagtggtagcttatgtctcaagacagttgagaattcatgagaagaatt 14213204  T
Q  125 atcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaa 224  Q
    | || ||||| || || || || || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||    
T  14213203 acccgacgcatgacttagaattggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattagttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaa 14213104  T
Q  225 gagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccg 324  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  14213103 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaaaatgaggcaaagaagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatcca 14213004  T
Q  325 ggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  14213003 ggtaaagctaattttgttgcaga 14212981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 14262848 - 14263185
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  14262848 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttagatggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgagga 14262947  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14262948 ttcatgaaaagaattatcttacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagt 14263047  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| || || |||||| ||||| |||||||| | || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  14263048 gtttagtgatcataaaagtttgtaatatctgtttgataaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggg 14263147  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14263148 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 14263185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 16070899 - 16071232
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | |||| |||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  16070899 gaaccttttgttatttattgtgatgcatccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcgagatgacaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 16070998  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  16070999 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagt 16071098  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| | |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16071099 gtttagtgatcataaaagtttgaaatatctatttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggt 16071198  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  16071199 ttgaattaccattctggtaaagctaatgtggttg 16071232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Original strand, 23504483 - 23504802
Alignment:
Q  19 gttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgaga 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||  ||||| | ||||| |    
T  23504483 gttgtttattgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcatgaaa 23504582  T
Q  119 agaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtga 218  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23504583 agaattatcccactcacgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtga 23504682  T
Q  219 ccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattat 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23504683 ccacaagagcttgaaatatttgtttgatcagaaggaattaaacatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattac 23504782  T
Q  319 catccgggtaaagctaatgt 338  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  23504783 catccgggcaaagctaatgt 23504802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 12205401 - 12205741
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12205401 gatgaaccttttgttgtatactgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatagtaaggtggtagcttatgcttcgagacaattga 12205500  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  12205501 ggattcatgagcggaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgtgttaaaaatttggagaccttatttgtacggttccagatttga 12205600  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || || |||||||| ||  | |||||||| || |||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  12205601 ggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgatttt 12205700  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12205701 agtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcaga 12205741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Original strand, 18052566 - 18052885
Alignment:
Q  19 gttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgaga 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||  ||||| | || || |    
T  18052566 gttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttaatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaa 18052665  T
Q  119 agaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtga 218  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18052666 agaattatcccactcatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtga 18052765  T
Q  219 ccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattat 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  18052766 ccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattac 18052865  T
Q  319 catccgggtaaagctaatgt 338  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  18052866 catccgggcaaagctaatgt 18052885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15342067 - 15341742
Alignment:
Q  19 gttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgaga 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  15342067 gttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagagggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgatgattcatgaaa 15341968  T
Q  119 agaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtga 218  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||| | |||||| ||||| |||||    
T  15341967 agaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatctgtatggttccaaatttgaggtgttcagtga 15341868  T
Q  219 ccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattat 318  Q
     ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15341867 tcacaagagtctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattattattttggtttgaattac 15341768  T
Q  319 catccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||    
T  15341767 catcctggtaaagctaatgtagttgc 15341742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 11387035 - 11387365
Alignment:
Q  13 ccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattc 112  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||  ||||  |||    
T  11387035 cctttcgttggttattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctagacaactgagagttc 11387134  T
Q  113 atgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtt 212  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||    
T  11387135 atgagaagaattatcctacccatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtt 11387234  T
Q  213 tagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttg 312  Q
    ||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| |||    
T  11387235 tagcgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagagaaggtggcttgaattattgaaggattatgattttggattg 11387334  T
Q  313 aattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11387335 aattaccatccgggtaaagctaatgtagttg 11387365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 14284980 - 14285314
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||| |||||     
T  14284980 gaaccgtttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgaggg 14285079  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  14285080 ttcatgaaaagaattatcctactcacgatttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgtagt 14285179  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||     
T  14285180 attcagtgatcacaagagtctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttaaaagattatgattttggg 14285279  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  14285280 ttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgc 14285314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15205267 - 15204926
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  15205267 cgatgaaccttttgttgtgtattgtgatgcgcccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggataataatgtagttgcttatgcatcgaggcagttg 15205168  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||    ||||||||||| || ||| | || |||||||  |||||||||||  | || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15205167 agaattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttg 15205068  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||| | ||||| || || ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  15205067 aagtgctcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggctcgaattgctgaaagattatgattt 15204968  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15204967 tgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcaga 15204926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13667182 - 13666847
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13667182 gaaccttttgttgtttactatgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctagacagttgagga 13667083  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13667082 tacatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 13666983  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| | ||| |||| || |||||||||||| ||    
T  13666982 attcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttagt 13666883  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgca 345  Q
    |||||||| |||||  ||||||| || || ||||||    
T  13666882 ttgaattaccatcctagtaaagccaacgtggttgca 13666847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19614320 - 19613983
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||      
T  19614320 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagag 19614221  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  19614220 tgcatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagt 19614121  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||| | || || ||||||||||||||     
T  19614120 gttcagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggg 19614021  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19614020 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcaga 19613983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 164 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10872485 - 10872302
Alignment:
Q  164 tattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatat 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10872485 tattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatat 10872386  T
Q  264 gagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10872385 gagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttgggttggattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 10872302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13022996 - 13022668
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  13022996 tttgttgtttactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttcttatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgaggattcatg 13022897  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    |||||||||||| ||| || ||| || |||| |||   ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| ||    
T  13022896 agaagaattatcttactcatgatctgtagttggcttcggtggtgtttgtttttaaaatttggaggcattatttgtacgtttccagatttgatgtgttcag 13022797  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    ||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||||    
T  13022796 tgatcataaaagcttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaat 13022697  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    || || || |||||||| ||||| |||||    
T  13022696 taccaccctggtaaagccaatgtggttgc 13022668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 10 - 344
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |||| |||||| ||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||    
T  10 gaaccgtttgttgtttactatgatgcgtctaagctgggcttaggttgtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaattgagga 109  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||  | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| || ||    
T  110 tacatgagaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcggtattgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttcctgattcgaggt 209  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||  |||| || ||||||||||||||     
T  210 gttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgattagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggc 309  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  310 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgttgttgc 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12458285 - 12457951
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||  || ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  12458285 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggtttaggtggtgttctgatgcaggatggtatggtggtagcatatgcttctaggcagttgagga 12458186  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||    
T  12458185 tacatgagaagaattatcctacgcatgatctagagttggctgcggtggtatttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttaaggt 12458086  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| | |||||  | || ||||||||||||||     
T  12458085 gttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaaaatgaggcaaaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggc 12457986  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  12457985 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtagttgc 12457951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 16949076 - 16949410
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||| || |||||| ||||||| || ||||||||      
T  16949076 gaaccatttgttgtttattgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagctaatgcttctaggcagttgagag 16949175  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||   ||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  16949176 ttcatgagaagaattatcccactcatgatttggagttggctacggtggtgtttgttttaaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 16949275  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  16949276 gttcagtgatcataaaagcttgaaatatttattttatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggc 16949375  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||||| |||||    
T  16949376 ttgaattaccatcctggtaaaaccaatgtggttgc 16949410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 13967272 - 13967606
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| |      
T  13967272 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtg 13967371  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  |    
T  13967372 ttcatgagaagaattatcctacacatgatctggaattggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgagat 13967471  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||| | ||||| || || ||||||||||||||     
T  13967472 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttattgaaggattatgattttggc 13967571  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  13967572 ttaaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgc 13967606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 11304867 - 11305201
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| |      
T  11304867 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtg 11304966  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  11304967 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggt 11305066  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | || |||| |||||||||     
T  11305067 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 11305166  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  11305167 ttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgc 11305201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15626173 - 15625895
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||   || | ||| || ||||| ||||||||||||    
T  15626173 cgatgaaccttttgttgtgtattgtgatgcgtccaaattgggtttaggtggtgtgcttatgcagaataacaaggcagtggcctatgcatcaagacagttg 15626074  T
Q  106 aggattcatgagaagaatt-atcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagattt 204  Q
    ||||||||||| | ||||| || |||| || ||  | ||||||| ||  |||||||||||  | || || ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  15626073 aggattcatga-acgaatttattctactcatgaacttgagttagatgcagtggtctttgtgcttaagatttggagacattatttatatggttctagattt 15625975  T
Q  205 gaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttga 284  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||    
T  15625974 gaagtgttcagtgatcacaaaagtctaaagtatttgtttgatcagaaggaattaaatacgaggcagggaaggtggcttga 15625895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 49153946 - 49153612
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| |||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||||  |      
T  49153946 gaaccgtttgttgtatactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcctctaggcagttacgtg 49153847  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  49153846 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtagtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaggt 49153747  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | ||||||| |||||||||     
T  49153746 gttcagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaagattttgattttggc 49153647  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  49153646 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 49153612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7825538 - 7825210
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  7825538 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 7825439  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  7825438 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 7825339  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  7825338 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 7825239  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  7825238 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 7825210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 341
Target Start/End: Original strand, 26117194 - 26117540
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||| |      
T  26117194 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtg 26117293  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttc------------ 197  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||                
T  26117294 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 26117393  T
Q  198 ---gagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaa 294  Q
        |||||||| ||||| ||||| || || ||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| | |||||  | ||     
T  26117394 gttcagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaag 26117493  T
Q  295 gattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgt 341  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  26117494 gattatgattttggcttgaattaccatccgggttaagccaatgttgt 26117540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 27106406 - 27106734
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  27106406 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 27106505  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  27106506 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 27106605  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  27106606 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 27106705  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  27106706 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 27106734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27171919 - 27171591
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  27171919 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 27171820  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  27171819 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 27171720  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  27171719 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 27171620  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  27171619 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 27171591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 307
Target Start/End: Original strand, 39814 - 40069
Alignment:
Q  52 ggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || || |||||||| || |||||  | | ||||||||||| |||||| || || || ||| |||||||||| |    
T  39814 ggtggtgtgcttatgcaagatgggcatgtggtggcttatgcctcgagacaactaaagattcatgagaggaattacccgacacatgatatggagttagcag 39913  T
Q  152 atgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaa 251  Q
     ||| || |||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  39914 ctgtagtgtttgtacttaaggtatggagacattatttgtatgggtcaaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaa 40013  T
Q  252 ggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttg 307  Q
    ||| ||||||||||||||| | |||||| | || || ||||| || ||||||||||    
T  40014 ggagttgaatatgagacagcggagatggttggaattcttaaaggactatgattttg 40069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14139315 - 14139143
Alignment:
Q  19 gttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgaga 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||| | ||||| |    
T  14139315 gttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagggtacatgaaa 14139216  T
Q  119 agaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgta 191  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  14139215 agaattatcccactcacgatttggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgta 14139143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17925291 - 17925031
Alignment:
Q  14 cttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || |||||||||||||| |||||||   | ||    
T  17925291 cttttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtgca 17925192  T
Q  114 tgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttt 213  Q
    ||||||||| ||||  || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || ||||| |||||  ||| |||||| |  |||||||||||     
T  17925191 tgagaagaactatctgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtttggttctaagtttgaagtgttc 17925092  T
Q  214 agtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaa 274  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  17925091 agtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaa 17925031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4441566 - 4441303
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||| ||||||||||||  || || | || || |||||||||||||| || ||||   | ||||    
T  4441566 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtgatgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcaattgaaagtgcatg 4441467  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||| ||||| || || ||||| || || ||    || || | || |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  4441466 agaagaactatccgactcatgatttagaattggcaacagttgtgtatgcattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaagtgtttag 4441367  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||    
T  4441366 tgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggccaagaagatgg 4441303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14937984 - 14937722
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || |||||||||||||| |||||||   | ||||    
T  14937984 tttgttgtatattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatg 14937885  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||| || || |  || |  | || ||||| | | ||||| |||||  | |||||||| |  ||||||||||| ||    
T  14937884 agaagaactatccgactcatgatttggaattggcggcagttgagtatgcattgagatt-tggaggcattatctttatggttctaagtttgaagtgttcag 14937786  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  14937785 tgaccacaaaagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatgg 14937722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15365577 - 15365315
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||| ||  || || | || || |||||||||||||| |||||||   | ||||    
T  15365577 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatacagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatg 15365478  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||| || || |  || |  | || ||||| | | ||||| |||||  | |||||||| |  ||||||||||| ||    
T  15365477 agaagaaatatccgactcatgatttggaattggcggcagttgagtatgcattgagatt-tggaggcattatctttatggttctaagtttgaagtgttcag 15365379  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  15365378 tgaccacaaaagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatgg 15365315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23642985 - 23642820
Alignment:
Q  112 catgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgt 211  Q
    ||||||||||||||||| || || | |||||| || ||||  || || ||||| ||||| || ||  | ||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  23642985 catgagaagaattatccgactcatgttttggaattggctgcagttgtgtttgtgttgaagatttgacggcattatttgtatggttctaagtttgaagtgt 23642886  T
Q  212 ttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagat 277  Q
    | ||||| ||||  |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23642885 tcagtgatcacacaagtttgaagtatttgtttgactagaaggagttgaatatgagacagagaagat 23642820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 262
Target Start/End: Original strand, 15717679 - 15717781
Alignment:
Q  160 tttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattga 259  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||   |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  15717679 tttgtgttgaagatttggaggcactacttgtatggttctaagtttgaagtgttcgatgaccacaagagtttgaagtacttgttcgatcagaaggagttga 15717778  T
Q  260 ata 262  Q
    |||    
T  15717779 ata 15717781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 272
Target Start/End: Original strand, 21673312 - 21673422
Alignment:
Q  162 tgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaat 261  Q
    ||||||||| || | ||| |||||  |||||||||| |  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||    
T  21673312 tgtattgaagatttagaggcattatctgtatggttctaagttttaagtgttcagtgactacaagagtttgaagtacttgtttgataagaaagagttgaat 21673411  T
Q  262 atgagacagag 272  Q
    ||||| |||||    
T  21673412 atgaggcagag 21673422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 202 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13354601 - 13354525
Alignment:
Q  202 tttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatg 278  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||| || ||||||||    
T  13354601 tttgaagtgttcagcgacaacaagagtttgaagtatttgtttgatcataaatagttgaatatgaggcaaagaagatg 13354525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 275
Target Start/End: Original strand, 17144080 - 17144153
Alignment:
Q  202 tttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaag 275  Q
    ||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17144080 tttgaagtgtgcagtgatcataagagtttgaagtatctgtttgactagaaggagttgaatatgagagagagaag 17144153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15625898 - 15625861
Alignment:
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15625898 ttgaattatcatccaggtaaagataatgttgttgcaga 15625861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 8051977 - 8052317
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8051977 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 8052076  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8052077 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 8052176  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  8052177 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 8052276  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8052277 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 8052317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 14302333 - 14302672
Alignment:
Q  8 atgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgag 107  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14302333 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgag 14302432  T
Q  108 gattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaa 207  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14302433 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtaatctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 14302532  T
Q  208 gtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttg 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  14302533 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttg 14302632  T
Q  308 gtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14302633 gtttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcaga 14302672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23957405 - 23957065
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23957405 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 23957306  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23957305 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggcagtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 23957206  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || |||    
T  23957205 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgacttt 23957106  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23957105 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 23957065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 29037758 - 29038098
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29037758 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 29037857  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29037858 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 29037957  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  29037958 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 29038057  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29038058 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 29038098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27712994 - 27712657
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27712994 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaaggaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 27712895  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27712894 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttga 27712795  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || |||    
T  27712794 ggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgacttt 27712695  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27712694 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 27712657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 343
Target Start/End: Original strand, 15146238 - 15146575
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15146238 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcatccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcgagacagttg 15146337  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146338 agaattcatgagaagaattatcccacgcatgatttagagttagccgccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 15146437  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  15146438 aggtgtttagtgatcacgagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggcggcttgaattgttgaaagattatgactt 15146537  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15146538 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttg 15146575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8388070 - 8387730
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8388070 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 8387971  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8387970 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttga 8387871  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  8387870 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 8387771  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8387770 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 8387730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12478258 - 12477918
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12478258 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 12478159  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12478158 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttga 12478059  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  12478058 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 12477959  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12477958 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 12477918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 19777147 - 19777487
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19777147 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 19777246  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19777247 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttga 19777346  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  19777347 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 19777446  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19777447 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 19777487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18298863 - 18298523
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18298863 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 18298764  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| || | ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18298763 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgacctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttga 18298664  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  18298663 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 18298564  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18298563 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 18298523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 25 - 344
Target Start/End: Original strand, 18614196 - 18614515
Alignment:
Q  25 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaatt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18614196 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaatt 18614295  T
Q  125 atcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaa 224  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||    
T  18614296 acccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcataa 18614395  T
Q  225 gagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccg 324  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  18614396 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggatagaactgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatcca 18614495  T
Q  325 ggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18614496 ggtaaagctaatgttgttgc 18614515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12525334 - 12524994
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  12525334 gatgagccttttgtagtgtattgtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcgagacagttga 12525235  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12525234 gaattcatgagaagaattacccgacgcatgatctagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 12525135  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     || |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||    
T  12525134 ggtatttagtgatcacaagagtttgcagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattgctgaaggattatgacttt 12525035  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12525034 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 12524994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40474698 - 40474358
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  40474698 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagatagttga 40474599  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40474598 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttga 40474499  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||  | ||||||||||| |||    
T  40474498 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagacttactgaaagattatgacttt 40474399  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40474398 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcaga 40474358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14682225 - 14681885
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14682225 gatgagccttttgtagtatattgtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttga 14682126  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| || |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682125 gaattcatgagaagaattacccgacgcatgatctagagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 14682026  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  14682025 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggatgtggcttgaattgttgaaggattatgacttt 14681926  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14681925 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 14681885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15247579 - 15247242
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |    
T  15247579 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagaaggtaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgagaa 15247480  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
     |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  15247479 ctcatgaaaagaattatcctacgcatgacttggagttagctgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggtattatttgtacggttccagatttgaagt 15247380  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15247379 gtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatccgaaggaattgaatatggggcagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgactttggt 15247280  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15247279 ttgaattaccattcgggtaaagctaatgtggttgcaga 15247242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 15001981 - 15002318
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||    
T  15001981 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatggttctaggcagttgagga 15002080  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  15002081 ttcataaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagt 15002180  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15002181 gtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgattagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggt 15002280  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15002281 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 15002318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 18225799 - 18226140
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18225799 cgatgacctttttgtggtgtattatgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 18225898  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18225899 agaattcatgagaagaagtacccgacacatgatttagagttggcggctgtggtctttgtatttaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttg 18225998  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |     
T  18225999 aggtgtttagcgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcaaaaggaattaaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgacta 18226098  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18226099 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 18226140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15072017 - 15071677
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15072017 gatgaaacttttgttgtttattattatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctagacagttga 15071918  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  15071917 ggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggctctagatttga 15071818  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  15071817 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttttttgaccaaaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattattgaaggactatgatttt 15071718  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15071717 agtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcaga 15071677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14161129 - 14160797
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || | |||||  || |||||||||    
T  14161129 cgatgaaccttttgttgtgtactgtgatgcatccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagacggcaaggtggttggttatgtgtcgagacagttg 14161030  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14161029 agaattcatgagaagaattaccctacgcatgatttagagttggccgcagtagtctttgtattgaagatatggagacattacttatatggttcgaggtttg 14160930  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||    
T  14160929 aagtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgagttactgaaggattttgattt 14160830  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgt 338  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14160829 tggcttgaattatcatccgggtaaagcgaatgt 14160797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 14849720 - 14850060
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  14849720 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttga 14849819  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    ||||||||||    ||||||||||| || ||| | || |||||||  |||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  14849820 ggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtacttaagatatggagacattatttgtacgattctagatttga 14849919  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||    
T  14849920 agtgtttagcgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaatttgtgaaagactatgatttt 14850019  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14850020 gggtttaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcaga 14850060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 230
Target Start/End: Original strand, 56566144 - 56566368
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  56566144 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtataggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 56566243  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56566244 agaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttagctgctgtggtctttgtattgaagatatggagaaattacttgtatggttcgagatttg 56566343  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagttt 230  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  56566344 aggtgtttagtgatcacaagagttt 56566368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 70 - 347
Target Start/End: Original strand, 16353862 - 16354139
Alignment:
Q  70 gatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattga 169  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||| ||||    
T  16353862 gatgataaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgttttga 16353961  T
Q  170 aaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagaca 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  16353962 agatatggagacattacttgtatggttcgagattcgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggca 16354061  T
Q  270 gagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    | |||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16354062 gcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 16354139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8707569 - 8707238
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||    
T  8707569 gatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgagcttaggtggtgtgcttatgcaagatggta--------gcttatgcttcgagacagttga 8707478  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  8707477 gaattcatgagcggaattatccaacgcatgatttagagttggctgctgtggtttttgcgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttga 8707378  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  8707377 ggtgtttatcgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgag-cagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgatttt 8707279  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8707278 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 8707238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Original strand, 51605418 - 51605737
Alignment:
Q  19 gttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgaga 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||  ||||| | || || |    
T  51605418 gttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaa 51605517  T
Q  119 agaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtga 218  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  51605518 agaattatcccactcatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtga 51605617  T
Q  219 ccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattat 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  51605618 ccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattac 51605717  T
Q  319 catccgggtaaagctaatgt 338  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  51605718 catccgggaaaagctaatgt 51605737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27902041 - 27901704
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||   |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||| |   || ||||      
T  27902041 gaaccttttgtaaattattgtgatgcttctaagttcggtttgggtggtgtgttgatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttctaagtagctgagag 27901942  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  27901941 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggaattggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagt 27901842  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  27901841 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatatgtttgaacaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggc 27901742  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27901741 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcaga 27901704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14695772 - 14695431
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| || |||||||||    
T  14695772 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttaggcttaagtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtaatagcttatgcatcgagacagttg 14695673  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    ||||||||||| ||  || | || |||||||  |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  14695672 aggattcatgaacgaaattatcctactcattatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttg 14695573  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||| |  || || || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14695572 aagtgttcaacgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattggatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattt 14695473  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14695472 tgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 14695431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 15357737 - 15358074
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||| || ||||||||||||||  |  |||| || |    
T  15357737 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatcgtaaggtggtagcttatgcttcttggtagttaagaa 15357836  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  15357837 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagt 15357936  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||||| || || ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||||||     
T  15357937 atttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggtgagagctgttgaaagattatgattttggc 15358036  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15358037 ttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcaga 15358074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16149366 - 16149029
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||      
T  16149366 gaaccgtttgtcgtgtattgcgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggaaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagag 16149267  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16149266 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 16149167  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| | |||||||| || || ||||||||||||    
T  16149166 attcagtgatcacatgagtttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggtagaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggt 16149067  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  16149066 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcaga 16149029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16153512 - 16153175
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||      
T  16153512 gaaccgtttgtcgtgtattgcgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggaaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagag 16153413  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16153412 ttcatgaaaagaattaccctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 16153313  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| | |||||||| || || ||||||||||||    
T  16153312 attcagtgatcacatgagtttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggtagaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggt 16153213  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  16153212 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcaga 16153175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 341
Target Start/End: Original strand, 1647894 - 1648225
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||| ||||      
T  1647894 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttctaagttcggtttgggtggtgggttgatgcaagatggcaaggtggtagcttacgcttctaggcagctgagag 1647993  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1647994 ttcatgaaaagaattaccctacttatgatttggagttggctgcagtggtttttgtcttgaagatttggaggcactacttgtatggttcacgatttgaagt 1648093  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||  |||| |||||| | ||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  1648094 atttagtgaccacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggagctgaacatgaggtagaggagatggttagagctgttgaaagactatgactttggt 1648193  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgt 341  Q
    |||||||| || ||   ||| |||||||||||    
T  1648194 ttgaattaccaccctaataaggctaatgttgt 1648225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 105 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33224483 - 33224244
Alignment:
Q  105 gaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagattt 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||    
T  33224483 gaggatacatgagaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgctgtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattacttgtacggtttcagattt 33224384  T
Q  205 gaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatt 304  Q
    || ||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||| |||| |||||||||||||    
T  33224383 gaggtgttcagtgatcataaaagcttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttagagctgttgaaagattatgatt 33224284  T
Q  305 ttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  33224283 ttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgc 33224244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 3263411 - 3263745
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||| |      
T  3263411 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtg 3263510  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  3263511 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 3263610  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | || |||| |||||||||     
T  3263611 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 3263710  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  3263711 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 3263745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 44660483 - 44660817
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| |      
T  44660483 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttgggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtg 44660582  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  44660583 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttgaaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 44660682  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||| | |||||  | |||||||||||||||||     
T  44660683 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgagacagaggaggtggttagagttactgaaagattatgattttggc 44660782  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  44660783 ttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgc 44660817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 29452154 - 29452488
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| || || ||| |      
T  29452154 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtg 29452253  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  29452254 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 29452353  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | || |||| |||||||||     
T  29452354 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 29452453  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  29452454 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 29452488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 11205848 - 11206182
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| |      
T  11205848 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtg 11205947  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||| | || || ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||    
T  11205948 ttcatgagaaaaattatcctacacatgatctagaattggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattctttgtacggttccagatttgaggt 11206047  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||  |||| || ||| | |||||  | || ||||||||||||||     
T  11206048 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggtagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggc 11206147  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  11206148 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgc 11206182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 307
Target Start/End: Original strand, 18548721 - 18548973
Alignment:
Q  55 ggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatg 154  Q
    ||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||   ||    
T  18548721 ggtgtgcttatgcaagatgggcatgcggtagcttatgcttcgagacaactgaagattcatgagaggaattacccgacacatgatttggagttagcaactg 18548820  T
Q  155 tggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaagga 254  Q
    | || |||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  18548821 tagtgtttgtacttaaggtatggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaaaga 18548920  T
Q  255 attgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttg 307  Q
     ||||||||||||||| | |||||| | ||||| ||||| || ||||||||||    
T  18548921 gttgaatatgagacagcggagatggttggagttcttaaaggactatgattttg 18548973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 9292484 - 9292221
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  ||  | | || || ||||||||||| || |||||||   | ||||    
T  9292484 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcttcaggttgtggcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatg 9292385  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || | ||| || | |   ||||| || ||||| || || ||||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  9292384 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggctgttgtgtatacgttgaagatttggaggcactatttgtatggttctaagtttgaggtgttcag 9292285  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  9292284 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 9292221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 202 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15320599 - 15320454
Alignment:
Q  202 tttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatg 301  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  15320599 tttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatatttatttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagagaaggtggcttgaattgttgaaggattatg 15320500  T
Q  302 attttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||    
T  15320499 attttggtatgaattatcacccaggtaaagctaatgtgattgcaga 15320454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14998964 - 14998637
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || |||||||   | ||||    
T  14998964 tttgtggtgtattgtgatgcttctaagatgggttttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatg 14998865  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || ||||| || || ||||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  14998864 agaagaattatccaactcatgatttggaattggcggccgttgtatatgcattgaagatttggaggcactatttgtatggttctaagtttgaggtgttcag 14998765  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  14998764 tgacca-aagagtttaaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 14998666  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  14998665 tatcatcccgggaaggctaatgttgttgc 14998637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 15291781 - 15292109
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || |||||||   | ||||    
T  15291781 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatg 15291880  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || || || | ||| || | |  |||||| || ||||| || ||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  15291881 agaagaattatccgactcatgatttagaattggcggctgttgtgtatacattgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 15291980  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  15291981 tgaccataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 15292080  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  15292081 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 15292109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 347
Target Start/End: Original strand, 15413853 - 15413980
Alignment:
Q  220 cacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatc 319  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15413853 cacaaaagtttgaaatacctatttgataaaaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattatc 15413952  T
Q  320 atccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15413953 atccgggtaaagccaatgttgttgcaga 15413980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 272
Target Start/End: Original strand, 12341584 - 12341744
Alignment:
Q  112 catgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgt 211  Q
    ||||||||||||||| | || || |||||||| ||||| |  || || |||||  |||| || ||||| ||||| ||||||  ||| |  ||||||||||    
T  12341584 catgagaagaattattcgactcatgatttggaattagcggtggttgtgtttgtgatgaagatttggaggcattatttgtatcattctaagtttgaagtgt 12341683  T
Q  212 ttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagag 272  Q
    | || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12341684 tcagcgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcagag 12341744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 15320650 - 15320610
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttggg 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15320650 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttggg 15320610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8627 - 8288
Alignment:
Q  8 atgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgag 107  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8627 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgag 8528  T
Q  108 gattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaa 207  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8527 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 8428  T
Q  208 gtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttg 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  8427 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttg 8328  T
Q  308 gtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8327 gtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 8288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21831975 - 21831636
Alignment:
Q  8 atgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgag 107  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21831975 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgag 21831876  T
Q  108 gattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaa 207  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21831875 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 21831776  T
Q  208 gtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttg 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  21831775 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttg 21831676  T
Q  308 gtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21831675 gtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 21831636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21838623 - 21838283
Alignment:
Q  8 atgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgag 107  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21838623 atgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgag 21838524  T
Q  108 gattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaa 207  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21838523 agttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgag 21838424  T
Q  208 gtgtttagtgacca-caagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  21838423 gtgtttagtgatcagcaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 21838324  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21838323 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 21838283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19108042 - 19107701
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19108042 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 19107943  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19107942 aggattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 19107843  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  19107842 aggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactt 19107743  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19107742 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 19107701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 33389715 - 33390055
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33389715 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 33389814  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389815 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggcagtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 33389914  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| |||| ||||| || |||    
T  33389915 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatgactagagttgctaaaggattacgacttt 33390014  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33390015 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 33390055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 430802 - 431142
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  430802 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttggatttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 430901  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  430902 gaattcatgagaagaattatcccacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtacggttcgagatttga 431001  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | || ||||||||||||    
T  431002 agtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgatttt 431101  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  431102 gagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 431142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 16349285 - 16349622
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||      
T  16349285 gaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaggtggtagcttacgcttcaagacagttgagag 16349384  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16349385 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggt 16349484  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||    
T  16349485 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggt 16349584  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16349585 ttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 16349622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 51332179 - 51332519
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51332179 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 51332278  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||  |  |||| || | ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51332279 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgacctcaagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgagatttga 51332378  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  51332379 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 51332478  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51332479 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 51332519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 21234416 - 21234757
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21234416 cgatgagctttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagtttatgcttcaagacagttg 21234515  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21234516 agatttcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaagatttg 21234615  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||| ||    
T  21234616 aggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatattagttcgatcaaaaggaattgaatatgagacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactt 21234715  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21234716 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 21234757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 41352351 - 41352688
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||      
T  41352351 gaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtgatagcttatgcttcaagacagttgagag 41352450  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  41352451 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggcagtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 41352550  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||     
T  41352551 gtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaagattatgactttggg 41352650  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41352651 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 41352688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 344
Target Start/End: Original strand, 24793302 - 24793640
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24793302 cgatgagccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgagtttaggtggtgtacttatgcaagatgataaagtggtagcttatgcctcaagacagttg 24793401  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |  | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24793402 agaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggtggttgttgtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttg 24793501  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  24793502 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaacgaattgaacatgagacaacgaaggtggctagaattgttgaaagattatgactt 24793601  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24793602 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgc 24793640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21025847 - 21025506
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  21025847 cgatgaaccttttgtggtacactgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaggtagttg 21025748  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || | ||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21025747 agaattcatgagaagaattacccgacgcacgatttagagttggcggctgtggtcgttatattaaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttg 21025648  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  21025647 aggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgaatt 21025548  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21025547 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatggtgttgcaga 21025506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21750610 - 21750273
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21750610 gaacattttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaaaatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaa 21750511  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21750510 tacatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggaaaaattacttgtatggttcgagatttgaggt 21750411  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||| | ||  | ||||||||||      
T  21750410 gtttagtgaacataagagtttgaagtatctgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaagaactatgattttgag 21750311  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21750310 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 21750273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 21744241 - 21744578
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  21744241 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgagga 21744340  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  21744341 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctacggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtaaggttccagatttgaggt 21744440  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  21744441 gtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgattgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggg 21744540  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21744541 ttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcaga 21744578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 22360930 - 22361270
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22360930 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtcaaagctgggtttaggtactgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 22361029  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22361030 gaattcatgagaagaattaccctatgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 22361129  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
      |||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||| | || || |||||||||    
T  22361130 gatgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaagtaattgaatatgaggcagcgtagatgacttgaattgctgaaggactatgatttt 22361229  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22361230 gagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcaga 22361270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 17043700 - 17044041
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17043700 cgatgagctttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtctaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcaagacagttg 17043799  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||| || || || | ||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  17043800 agaattcatgagaaaaactacccgatgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagatattacttgtatggttcaaggtttg 17043899  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||| || ||||| || ||    
T  17043900 aggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgttggatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaggattacgactt 17043999  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17044000 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcaga 17044041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 23196938 - 23197269
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||||||||||    
T  23196938 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcataggtggtgttctt--gcaagatggcaaagtggtagcttatgtttctaggcagttgagga 23197035  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  23197036 ttcatgaaaagaattatcctactcacgatttggagttggctgcagtggt-tttgttttgaaaatttgaaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 23197134  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  23197135 gttcagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggc 23197234  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23197235 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgc 23197269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19855975 - 19855638
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  19855975 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgagga 19855876  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19855875 tacatgaaaagaattatcctactcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 19855776  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||||| || || ||| | |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || |||||||||||||||    
T  19855775 atttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggt 19855676  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19855675 ttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcaga 19855638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 20855449 - 20855786
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| | || |||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||||     
T  20855449 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttagtttaggaggtgtgttgatacaagatggaaaggtggtagcttatgcttctaggcagctgaggg 20855548  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||  ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  20855549 ctcatgaaaagaactatcctacgcatgatttggagctggctgcggtggtgtttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagt 20855648  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  20855649 gtttagtgaccacaaaagtttgaagtatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaatgattatgattttggc 20855748  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20855749 ttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcaga 20855786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 20834589 - 20834926
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||| | || |    
T  20834589 gaaccgtttgttgtttattgtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctaagaa 20834688  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20834689 ttcatgaaaagaattatcctactcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 20834788  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||||| || || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| || ||||||||||||||     
T  20834789 atttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagttgttgaaggattatgattttggc 20834888  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  20834889 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcaga 20834926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 24098292 - 24098626
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||    
T  24098292 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcatctaagctgggattaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaattgagga 24098391  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  24098392 tacatgagaagaattatcctacgcatgatctggagttagttgcggtggtgtttgttttaaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggt 24098491  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||  | || || ||||||||||||||     
T  24098492 gttcagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagatcttttgaaggattatgattttggc 24098591  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  24098592 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgc 24098626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 19661825 - 19662163
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || | ||||||||    
T  19661825 gaaccttttgtagtttattttgatgcgtctaagttgggcttaggtgttgttttaatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggctgttgagga 19661924  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttg-tattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaag 208  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| |||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  19661925 tacatgaaaagaattatcctactcatgatttggagttggctgcggtggtttttggttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagattcgaag 19662024  T
Q  209 tgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttgg 308  Q
    | |||||||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||| | ||| |||| || ||||||||||||||    
T  19662025 tatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttgg 19662124  T
Q  309 tttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19662125 tttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcaga 19662163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 20060638 - 20060978
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||  | |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||    
T  20060638 gatgaaccgtttgttgtctactgtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtagggtagtagcgtatgcttctagacagctga 20060737  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  20060738 gagtacatgaaaagaattatcctactcacgatttggagttggccgcggtggtttttgtattaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttga 20060837  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  20060838 agtgttcagtgaccataagagcttgaaatatctgtttgaccaaaacgaattgaacatgaggcagaggagatgacttgaattattaaaggattatgatttt 20060937  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20060938 ggcttgaactaccattcgggtaaagctaatgtagttgcaga 20060978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 20938752 - 20939089
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  20938752 gaaccatttgttgtgtattgtgatgcatctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtagtagcttatgcttctaggcagttaagaa 20938851  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  20938852 ttcatgaaaagaactatcctacgcatgatttggggttggctggggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttctagatttgaggt 20938951  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || |||||  |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  20938952 attcagtgattacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggc 20939051  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  20939052 ttaaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcaga 20939089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21952573 - 21952245
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || ||| ||    
T  21952573 tttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgggttcttg 21952474  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||  |    
T  21952473 agaagaattatcctacacatgatctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactatttgtacggttcaagatttgaggtgttctg 21952374  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||  | || ||||| |||||||| ||||||    
T  21952373 tgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaat 21952274  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    || ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  21952273 taccatcctggtaaggccaatgtggttgc 21952245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16377815 - 16377589
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  16377815 gatgaaccttttgttgtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggttgcttatgcatcaagacaattga 16377716  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||    ||||||||||| || ||| | |  |||||||  || || |||||  | || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377715 gaattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgtattagctgcagttgtatttgtgctcaagattgggagacattacttgtatggttcgagatttga 16377616  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaa 233  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16377615 ggtgttaagtgatcacaagagtttgaa 16377589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 31538686 - 31539020
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||  |      
T  31538686 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttacgtg 31538785  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  31538786 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 31538885  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||| |||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | || |||| |||||||||     
T  31538886 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccaaaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 31538985  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  31538986 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 31539020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 246
Target Start/End: Original strand, 50619121 - 50619309
Alignment:
Q  57 tgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtg 156  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||| |||  |||    
T  50619121 tgtgcttatgcaagatggcaaagtagtggcttatgcgtcgagacagttgagaattcatgagcggaattgccctacgcacgatttagagtta-ctgcagtg 50619219  T
Q  157 gtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgat 246  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| || |||||    
T  50619220 gtctttgtacttaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtctgaaatatctgcttgat 50619309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 171 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22110531 - 22110355
Alignment:
Q  171 aatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacag 270  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || || || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22110531 aatatggagacattatttgtacggttttagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatttgagacag 22110432  T
Q  271 agaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  22110431 cgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcaga 22110355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 171 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22114380 - 22114204
Alignment:
Q  171 aatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacag 270  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || || || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22114380 aatatggagacattatttgtacggttgtagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatttgagacag 22114281  T
Q  271 agaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  22114280 cgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcaga 22114204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 37678750 - 37678417
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| || || ||| |      
T  37678750 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtg 37678651  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  37678650 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 37678551  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || ||| |||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | || |||| ||||||||||    
T  37678550 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccaaaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggt 37678451  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  37678450 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 37678417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20296082 - 20295748
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||  | || ||| |      
T  20296082 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctcggcaattgcgtg 20295983  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||  ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||    
T  20295982 ttcatgagaagaattatcctacacatgatctggaattggctgtggtggtttttgttttggaaatttggagacattatttgtacggttccagatctgaggt 20295883  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| | ||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||   |||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  20295882 gttcaatgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggttctgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggc 20295783  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||| |||||    
T  20295782 ttgaattaccaccctggtaaggccaatgtagttgc 20295748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 236 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16373974 - 16373863
Alignment:
Q  236 atttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaa 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16373974 atttgtttgattagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaa 16373875  T
Q  336 tgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||    
T  16373874 tgttgttgcaga 16373863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 20830087 - 20830415
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  20830087 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 20830186  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  20830187 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 20830286  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  20830287 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 20830386  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  20830387 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 20830415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 201 - 347
Target Start/End: Original strand, 19759753 - 19759899
Alignment:
Q  201 atttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattat 300  Q
    |||||||||||||||||| || || ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||    
T  19759753 atttgaagtgtttagtgatcataaaagtctgaagtatttatttgatcagaatgaattgaatatgagacaacggaggtggcttgaattgttgaaagattat 19759852  T
Q  301 gattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19759853 gattttgggttgaattatcatccaggaaaagctaatgttgttgcaga 19759899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22116587 - 22116429
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||| |||||    
T  22116587 cgatgaaccttttgtggtgtattgggatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtagtagcttatgcattgagatagttg 22116488  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgt 164  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| || ||| | || |||||||  |||||||||||    
T  22116487 aggattcatgaacaaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgt 22116429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 52987436 - 52987206
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| |  ||||||    
T  52987436 tttgttgtgtattgtgatgcatctaagttgggcttaggtggtgttctaatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtgttcatg 52987337  T
Q  116 agaagaattatcctac-gcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttta 214  Q
    ||||||||||||||||   | ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  52987336 agaagaattatcctacattatgacctggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggtgttca 52987237  T
Q  215 gtgaccacaagagtttgaaatatttgtttga 245  Q
    |||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  52987236 gtgatcataaaagtttgaagtatttatttga 52987206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 22134252 - 22134580
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || ||||||||||||||  ||||||   | ||||    
T  22134252 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcataatcgttaggttgtggcttatgcttcaaggtagttgaaagtgcatg 22134351  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||  || || |||||||| || || | ||| || | || |||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  22134352 agaagaattatcacactcatgatttggaattggcagctgttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgatgtgttcag 22134451  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||   ||||   | || |||| |||||||   |||| |    
T  22134452 tgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaaggtggtcagagtaccttaaggattttgattttcagttgagt 22134551  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  22134552 tatcatcccgggaaggctaatgttgttgc 22134580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20915265 - 20915002
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || |||||||||||||| || ||||   | ||||    
T  20915265 tttgttgtgtattgtgttgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcaattgaaagtgcatg 20915166  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  20915165 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaagtgttcag 20915066  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  20915065 tgaccacaagagtttaaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatgg 20915002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Original strand, 41216552 - 41216815
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || ||||||||||||||  ||||||   |  |||    
T  41216552 tttgttgtgtattgtgatgcttataagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggtagttgaaagtatatg 41216651  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||| ||||  |   |||| ||||| || || |  || || | || |||||| || ||||| |||||  | |||||||| |  ||||||||||| ||    
T  41216652 agaagaactatcggagtaacgaattggaattggcagcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctatatggttctaagtttgaagtgttcag 41216751  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  41216752 tgaccataaaagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 41216815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 347
Target Start/End: Original strand, 16077630 - 16077682
Alignment:
Q  295 gattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16077630 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcaga 16077682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 48424574 - 48424489
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttc 95  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  48424574 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttc 48424489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 45
Target Start/End: Original strand, 50619083 - 50619122
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttg 45  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  50619083 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttg 50619122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 2873562 - 2873902
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2873562 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 2873661  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2873662 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 2873761  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  2873762 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 2873861  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2873862 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcaga 2873902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 25608620 - 25608960
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25608620 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 25608719  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25608720 gaattcatgagaagaattatcccacgcacgatttagagttagctgatgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 25608819  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     || |||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25608820 ggtatttagtgatcacaagagtctgaagtatctgttcgattagaaggaattgaatatgagacagcaaaggtggcttgaattgctaaaagattatgatttt 25608919  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25608920 gagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 25608960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22435392 - 22435051
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22435392 cgatgaacctttcgtggtatactgtgatgcatccatgttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttg 22435293  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22435292 aggattcatgagaagaattatcccacgcacgatttagagttggctgttgtggtttttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 22435193  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  22435192 aggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactt 22435093  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22435092 tggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 22435051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22443790 - 22443449
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22443790 cgatgaacctttcgtggtatactgtgatgcatccatgttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttg 22443691  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22443690 aggattcatgagaagaattatcccacgcacgatttagagttggctgttgtggtttttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 22443591  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  22443590 aggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactt 22443491  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22443490 tggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 22443449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19866210 - 19865872
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19866210 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcgagacagttg 19866111  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19866110 agaattcatgagaagaattatcccacgcacgattttgagttggcggctatggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttc 19866011  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| || || ||||||||||| ||    
T  19866010 aggtgtttagtgatcacaagagcctaaaatatttgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactt 19865911  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19865910 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgc 19865872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 29590679 - 29591019
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29590679 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 29590778  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| || | ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29590779 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgacctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttga 29590878  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  29590879 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 29590978  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29590979 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 29591019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27188955 - 27188618
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||      
T  27188955 gaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttgagag 27188856  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  27188855 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 27188756  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  27188755 gtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 27188656  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27188655 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 27188618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 27260285 - 27260622
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||      
T  27260285 gaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttgagag 27260384  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  27260385 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 27260484  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  27260485 gtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 27260584  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27260585 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 27260622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25114074 - 25113734
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25114074 gatgaaccttttgtggtgtattgcgatgcgcccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 25113975  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25113974 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgacctcgagttagcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttga 25113875  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  25113874 ggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgtagatggctagagttgttgaaagattatgacttt 25113775  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25113774 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 25113734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 18406703 - 18407039
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  18406703 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgctttgagacaattga 18406802  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18406803 gaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattaaaaatatggagacgttacttgtatggttcgagatttga 18406902  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18406903 tgtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaatggaacatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgatttt 18407002  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18407003 gagttgagctatcatccgggtaaagctaacgttgttg 18407039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 22761214 - 22761554
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22761214 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttatgtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagatagttga 22761313  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22761314 gaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 22761413  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
      | |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  22761414 gatatttagtgatcataagagtttgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtatatggcttgaattgttgaaggactatgatttt 22761513  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22761514 gagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 22761554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 16962207 - 16962540
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16962207 gaaccttttgtggtatattgggatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgattacgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaa 16962306  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16962307 ttcatgagaagaattacgcgacgctcgatttagagttagctgatgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaagt 16962406  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||      
T  16962407 gtttagtgatcacaagactttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgctaaaggattatgattttgag 16962506  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16962507 ttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttg 16962540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 28261959 - 28262296
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  28261959 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttgggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagag 28262058  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  28262059 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcagctgtagtctttgtgttaaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 28262158  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  28262159 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 28262258  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28262259 ttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcaga 28262296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 28340708 - 28341045
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  28340708 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttgggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagag 28340807  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  28340808 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcagctgtagtctttgtgttaaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggt 28340907  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  28340908 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggt 28341007  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28341008 ttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcaga 28341045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21473123 - 21472783
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  21473123 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttga 21473024  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  21473023 ggattcacgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggctctagatttga 21472924  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  21472923 ggtgtttagtgatcataagagattgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgatttt 21472824  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21472823 ggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 21472783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23079991 - 23079651
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23079991 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtagtagcttatgcttcgagacagttga 23079892  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||| ||| |  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  23079891 ggattcttgaaagaaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtggtttttgtattgaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttga 23079792  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||  | ||||| || ||||||||||||    
T  23079791 agtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatttgttttatcataaggaattgaatatgaaacagcgaaggtggctcaaattgttgaaggattatgatttt 23079692  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23079691 agtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 23079651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 16926400 - 16926739
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  16926400 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttacgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgacaa 16926499  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcg-agatttgaag 208  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16926500 ttcatgagaagaattacccgacgcacgatttagagttagctgttgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaaggtttgaag 16926599  T
Q  209 tgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaa-gattatgattttg 307  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  16926600 tgtttagtgatcacaagactttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatgtgagggagcgtagatggcttgaattgctaaaaggattatgattttg 16926699  T
Q  308 gtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
      ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16926700 agttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 16926739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Original strand, 27564596 - 27564920
Alignment:
Q  13 ccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattc 112  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||         
T  27564596 ccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagaaagttgag----- 27564690  T
Q  113 atgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtt 212  Q
         |||||||| || ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27564691 -----aagaattacccgacgcacgatttagagttggcagttgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtt 27564785  T
Q  213 tagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttg 312  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  27564786 tagcgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttg 27564885  T
Q  313 aattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27564886 aattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 27564920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 18196492 - 18196827
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  18196492 gatgaaccttttcttgtttactgtgatgcgtccaaattgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggttgcttatgcatcaagacacttga 18196591  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||    ||||||||||| || ||| | || |||||||  ||||| |||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18196592 gaattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtatttgtgcttaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttga 18196691  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  18196692 agtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggctcgaattgttgaaagattatgatttt 18196791  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgtt 342  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18196792 gggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgtt 18196827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 16621839 - 16622102
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16621839 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 16621938  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621939 gaactcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 16622038  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacag 270  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16622039 agtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacag 16622102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 5837981 - 5838318
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  5837981 gaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtctaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggttgcttatgcttcgaggcagttgagga 5838080  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  || || || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5838081 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatttagagttggccgcggtagttttcgtgttgaagatttggagacactacttgtatggttcgaggtttgaagt 5838180  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | | |||| || |||||||| |      
T  5838181 gtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaagaattgaatatgagacagagaaggtggctagaatcgctaaaggactatgatttcgaa 5838280  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5838281 ttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 5838318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 86 - 347
Target Start/End: Original strand, 24312006 - 24312267
Alignment:
Q  86 cttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacatta 185  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24312006 cttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacatta 24312105  T
Q  186 cttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  24312106 cttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaa 24312205  T
Q  286 ttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24312206 ttgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtttcaga 24312267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 19488031 - 19488371
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  19488031 gatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttacgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttcgagacagttga 19488130  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | | ||||||    
T  19488131 gaattcatgatcggaattatcctacgcatgatttagagttggctgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggccccatatttga 19488230  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||  |||| |||||||  ||||| || || |||||||||    
T  19488231 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttctttgataaaaaagaattgaatatgaggcaccgaaggtggcttggattgttgaaggactatgatttt 19488330  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19488331 ggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcaga 19488371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 5295968 - 5296301
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  5295968 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 5296067  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||   ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  5296068 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctacggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 5296167  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  5296168 gttcagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcaaagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggc 5296267  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5296268 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttg 5296301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15460855 - 15460518
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||     
T  15460855 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctagacaactgaggg 15460756  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15460755 ttcatgaaaagaattatcctactcatgatttggagttggctgcggtggtatttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagt 15460656  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  15460655 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggctagaattattaaaggattatgattttggt 15460556  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15460555 ttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcaga 15460518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 28281587 - 28281903
Alignment:
Q  22 gtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaaga 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| || || ||||| || ||||| || ||  ||||| | ||||| ||||    
T  28281587 gtttattgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcataggcttctaggcaactgagggtgcatgaaaaga 28281686  T
Q  122 attatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgacca 221  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  28281687 attatcccactcatgatttagagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccaggtttgaagtgttcagtgacca 28281786  T
Q  222 caagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcat 321  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  28281787 caagagcttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaggattatgattttgggttgaattaccat 28281886  T
Q  322 ccgggtaaagctaatgt 338  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  28281887 ccgggaaaagcaaatgt 28281903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Original strand, 21568756 - 21569090
Alignment:
Q  13 ccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattc 112  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| ||||| || ||||  |||||||| |||||  ||||  ||     
T  21568756 cctttcgttgtttattgtgatgtgtctaagttgggcttgggtggtgtcttgatgcaagagggtaaggtggtagtgtatgcttctagacaactgagagttt 21568855  T
Q  113 atgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtt 212  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||    
T  21568856 atgagaagaattatcctacccatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtt 21568955  T
Q  213 tagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttg 312  Q
    ||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  21568956 tagcgatcaaaaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgagacaaaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttggcttg 21569055  T
Q  313 aattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21569056 aattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcaga 21569090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 347
Target Start/End: Original strand, 34644349 - 34644685
Alignment:
Q  11 aaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggat 110  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||  |    
T  34644349 aaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaaactgggtctaggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtagtggcgtatgcttctagacagctgagagt 34644448  T
Q  111 tcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtg 210  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| || || ||||||    
T  34644449 acatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtctttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccaggttcgaagtg 34644548  T
Q  211 tttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtt 310  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |    
T  34644549 tttagtgaccataagagcttgaaatatttatttgaccagaaggagttgaacatgagacagaggagatggctagagttattgaaggattatgagtttgggt 34644648  T
Q  311 tgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34644649 tgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcaga 34644685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18796209 - 18795872
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | |||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||||     
T  18796209 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtttatgaggtgttttgatgcaagatggtaaggtagtagcgtatgcttctaggcagctgaggg 18796110  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  18796109 tacatgaaaagaattatcctactcacaatttggagttggctgcggtagtttttgttttgaagatttggaggcactacttgtatggttccaggtttgaagt 18796010  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || |||||||||||||||    
T  18796009 gtttagtgatcacaagagcttgaaatattcatttgatcaaaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggt 18795910  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18795909 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcaga 18795872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 18966053 - 18966388
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||   || |||||  ||||||| || |||||||||    
T  18966053 cgatgaaccttttgttgtgtattctgatgcgtccaagttggatttaggtggtgtgcttatgcagaataacaaggtagtgacttatgcatcgagacagttg 18966152  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    ||||||||||| || ||| | ||||||||||  |||||||||||  | || || |||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  18966153 aggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgagttagctgtagtggtctttgtgcttaagatttggagacattatctgtatggttctagatttg 18966252  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  18966253 aagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattt 18966352  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgt 341  Q
    | | |||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  18966353 ttggttgaattatcatctaggtaaagctaacgttgt 18966388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21754737 - 21754481
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||     | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21754737 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttagga----tacttatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 21754642  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754641 acaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgaggtctttgtattgaatatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 21754542  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgag 266  Q
    |||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  21754541 aagtgtttagcgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaactgaatatgag 21754481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 10467611 - 10467945
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  10467611 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgagga 10467710  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  10467711 tacatgagaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcggtggtatttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttctagatttgaggt 10467810  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||  | || ||||||||||||||     
T  10467811 gttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaatgattatgattttggc 10467910  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  10467911 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 10467945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19880820 - 19880480
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||    
T  19880820 gatgaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaaactgggtctaggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctagacagctga 19880721  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    || | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || || ||||| || |||||||||||||| || || ||    
T  19880720 gggtacatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgtcttaaagatttggaggcactacttgtatggttccaggttcga 19880621  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||| | || || ||||||||||||    
T  19880620 agtgtttagtgaccataagagcttgaaatatttatttgaccagaaggagttgaacatgagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgatttt 19880521  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  19880520 gggttgaactatcatccgggtaaagccaacgtagttgcaga 19880480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 14378678 - 14379016
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgctt-atgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagg 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  || ||||||||||| || || ||| | |||| ||| || |||||||||    
T  14378678 gaaccttttgttgtttactgtgatgcgtctaagttgggcttaggaggtgtttttgatgcaagatggaaaggtggtaccgtatgtttctaggcagttgagg 14378777  T
Q  109 attcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  14378778 attcatgagaagaattatcctacgcgtgatttggagttggctgcggtagtttttgtattgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgagg 14378877  T
Q  209 tgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttgg 308  Q
    |||| ||||| || |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| | ||| |||| || || |||||||||||    
T  14378878 tgttcagtgatcataagagtctaaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttgg 14378977  T
Q  309 tttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  14378978 tttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcaga 14379016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 14380228 - 14380566
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgctt-atgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagg 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  || ||||||||||| || || ||| | |||| ||| || |||||||||    
T  14380228 gaaccttttgttgtttactgtgatgcgtctaagttgggcttaggaggtgtttttgatgcaagatggaaaggtggtaccgtatgtttctaggcagttgagg 14380327  T
Q  109 attcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  14380328 attcatgagaagaattatcctacgcgtgatttggagttggctgcggtagtttttgtattgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgagg 14380427  T
Q  209 tgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttgg 308  Q
    |||| ||||| || |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| | ||| |||| || || |||||||||||    
T  14380428 tgttcagtgatcataagagtctaaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttgg 14380527  T
Q  309 tttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  14380528 tttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcaga 14380566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 157 - 347
Target Start/End: Original strand, 1541993 - 1542183
Alignment:
Q  157 gtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaat 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  1541993 gtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaat 1542092  T
Q  257 tgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1542093 tgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgttaaaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 1542183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 113 - 347
Target Start/End: Original strand, 21562997 - 21563231
Alignment:
Q  113 atgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtt 212  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||    
T  21562997 atgagaagaattatcctacccatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtt 21563096  T
Q  213 tagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttg 312  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  21563097 tagcgatcacaaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgagacaaaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttggcttg 21563196  T
Q  313 aattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21563197 aattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcaga 21563231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 25763986 - 25764195
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25763986 cgatgagccttttgtggtgtattgtgatgagtccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 25764085  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||||||||| |  || || ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25764086 agaattcatgagaagaattaccagacacatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttg 25764185  T
Q  206 aagtgtttag 215  Q
    | ||||||||    
T  25764186 aggtgtttag 25764195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19436521 - 19436187
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  19436521 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttgggcttaggcggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 19436422  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| | ||  ||||| ||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19436421 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatcgggagttcgatgcggtggtgtttgttttgaaaacttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 19436322  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     ||  |||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||| | ||| |||| || || || |||||||||    
T  19436321 attcggtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaatatgaggtagaggatatggttagagctgttgaaggactacgattttggt 19436222  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||    
T  19436221 ttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgc 19436187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 20634699 - 20634879
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20634699 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgtgtttaggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagatagttga 20634798  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattact 187  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20634799 gaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattact 20634879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24365931 - 24365597
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||| |      
T  24365931 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtg 24365832  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  24365831 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 24365732  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| | |||||  | || ||||||||||||||     
T  24365731 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttgtttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggc 24365632  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  24365631 ttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgc 24365597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 175 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15897447 - 15897276
Alignment:
Q  175 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaa 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  15897447 tggagacattacttgtatggttctagatt-gaagtgttcagtgatcataagagtctgaagtatttgtttgatcagaatgaattgaatatgagacaacgaa 15897349  T
Q  275 gatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15897348 ggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 15897276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 182 - 347
Target Start/End: Original strand, 20636235 - 20636400
Alignment:
Q  182 attacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  20636235 attacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggct 20636334  T
Q  282 tgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||| ||| | || || ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20636335 tgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 20636400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18450028 - 18449694
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  18450028 cgatgaaccatttgttgtatactgtaatgaatctaagttgggtttaggtggtgtgcatatgcaggatagtaaagtagtagcttatgcatcgag-cagttg 18449930  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||  | | ||||||||| || ||||| | |||    |  |  || |||||| | ||||| |||||   |||  |||||||||| |||||||    
T  18449929 aggattcatgaacatatttatcctactcatgattttgtgtt----gcagcagtttttgtacttaaaatttggaggagttatctgtatggttctagatttg 18449834  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||| || || || || |||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||  || |||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  18449833 aagtgttcagcgatcataaaagtttgaaatatttatttgacgagaaagaattaaatatgaggtagtgaaggtggcttgaattgctaaaggattataattt 18449734  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgca 345  Q
     || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18449733 cgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgca 18449694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 16381141 - 16381469
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  16381141 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 16381240  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  16381241 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 16381340  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  16381341 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 16381440  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  16381441 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 16381469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19454789 - 19454602
Alignment:
Q  160 tttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattga 259  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19454789 tttgttttgaagatttggaggcatgatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcaaaaggaattga 19454690  T
Q  260 atatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    | ||||| ||||| || ||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19454689 acatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcaga 19454602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 1647582 - 1647838
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || |||||||   | ||||    
T  1647582 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatg 1647681  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  1647682 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 1647781  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagag 272  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  1647782 tgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagag 1647838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 16648737 - 16649065
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  16648737 tttgtggtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaattgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 16648836  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || | ||| || | || |||||| || ||||| || ||  |  ||||||| | |||||| ||||| ||    
T  16648837 agaagaattatccaactcatgatttggaattggcggctgttgtgtatgcattgaagatttggaggcactatctacatggttctaaatttgaggtgttcag 16648936  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  16648937 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 16649036  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  16649037 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 16649065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16099522 - 16099259
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || | ||||||||| || |||||||   | ||||    
T  16099522 tttgttgtatattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggtttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatg 16099423  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || || || |  || || | || |||||| || ||||| |||||  |||||| ||| |  ||||| ||||| ||    
T  16099422 agaagaattatccaactcatgatttcgaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatgattctaagtttgaggtgttcag 16099323  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  16099322 tgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 16099259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23997761 - 23997498
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||| | | |||||||||||||||||  || || | || ||||||||||||||||| |||||||   | || |    
T  23997761 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatggatcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcacg 23997662  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || || || |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  23997661 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttgaaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 23997562  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  23997561 tgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatgg 23997498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Original strand, 35274854 - 35275117
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || | || || |||||| ||||||| |||||||   | ||||    
T  35274854 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgtagaatcgtgaggttgtggcttattcttcaaggcagttgaaagtgcatg 35274953  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| ||  ||| ||| || | |  |||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  35274954 agaagaattatccgactcatgatttggaattgtctgctgttgtgtattcattgaagatttggagtcattatctgtatggttctaagtttgatgtgttcag 35275053  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||| ||||    
T  35275054 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcaaagaacatgg 35275117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Original strand, 23026484 - 23026747
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||| ||  || || | || || |||||||||||||| |||||||   | ||||    
T  23026484 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttattcagtatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatg 23026583  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||| || || |  || || | || | |||| || ||||| |||||  |||||||||  |  ||||||||||| ||    
T  23026584 agaagaactatccgactcatgatttggaattggcagcagttgtgtatgcactgaagatttggaggcattatctgtatggttataagtttgaagtgttcag 23026683  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||    
T  23026684 tgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaagcaaagaagatgg 23026747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14129982 - 14129655
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||| ||||||||||  || || | || || ||||||||||  || |  ||||   | ||||    
T  14129982 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtttgcttatgcagaatcgtcaggttgttgcttatgctttgaggcttttgaaagtgcatg 14129883  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || ||||| |||||  ||| |||||| |  ||| ||||||| ||    
T  14129882 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatatgtttggttctaagttttaagtgttcag 14129783  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| | ||||   | || |||| |||||||   |||| |    
T  14129782 tgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagt 14129683  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |||||||| || || |||||||||||||    
T  14129682 tatcatcccgggaaggctaatgttgttg 14129655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16234505 - 16234278
Alignment:
Q  52 ggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctg 151  Q
    |||||||||||||||||  || || | || || ||||||||||| || |||||||   | ||||||||||||||||| |  || |||||||| || || |    
T  16234505 ggtggtgtgcttatgcagaatcgttaggttgtggcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccaaatcatgatttggaattggcgg 16234406  T
Q  152 atgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaa 251  Q
      || || | || |||||| || ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16234405 ccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaa 16234306  T
Q  252 ggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
     || ||||||||||| || |||||||||    
T  16234305 agagttgaatatgaggcaaagaagatgg 16234278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Original strand, 24294545 - 24294624
Alignment:
Q  11 aaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttat 90  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24294545 aaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttat 24294624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18574666 - 18574439
Alignment:
Q  52 ggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctg 151  Q
    |||||||||||||||||  || || | || || ||||||||||  || |||||||   | |||||||||||||||||||| || |||||||| || || |    
T  18574666 ggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgctttgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatcctactcatgatttggaattggcgg 18574567  T
Q  152 atgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaa 251  Q
      || || | || |||||| || ||||| |||||  |||||| ||| |  ||| | ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18574566 ccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatgattctaagtttaaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaa 18574467  T
Q  252 ggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
     || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  18574466 agagttgaatatgaggcagaggagatgg 18574439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 279
Target Start/End: Original strand, 14624274 - 14624388
Alignment:
Q  165 attgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 264  Q
    |||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14624274 attgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatg 14624373  T
Q  265 agacagagaagatgg 279  Q
    || ||||| ||||||    
T  14624374 aggcagaggagatgg 14624388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21928720 - 21928459
Alignment:
Q  14 cttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||| || | |||||||||||||||||  || || | || || |||||||| || || || ||||   | ||    
T  21928720 cttttgttgtgtattgtgatgcttctaagttgagtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcgtcgaggcaattgaaagtgca 21928621  T
Q  114 tgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttt 213  Q
    ||||||||| | ||| || || |||||||| || ||    || || | || |||||| || ||||  |||||  |||||||||| |  |||||||||||     
T  21928620 tgagaagaactgtccgactcatgatttggaattggcaacagttgtgtatgcattgaagatttggaagcattatatgtatggttctaagtttgaagtgttc 21928521  T
Q  214 agtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaag 275  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  21928520 agtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaatgagttcaatatgaggcagagaag 21928459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Original strand, 16625736 - 16625816
Alignment:
Q  267 acagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||| ||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16625736 acagcgaagatgactcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 16625816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 18836676 - 18837004
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| ||||  | |||||||||||||||||  || || | || || ||||||||||| || |||||||   | ||||    
T  18836676 tttgttgtgtattgtgaagcttctaagatgggacttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcgaggcagttgaaagtacatg 18836775  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |   | || | || |||||| || ||||| || ||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  18836776 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccattgtgtatgcattgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 18836875  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| || | || ||||||||||| || ||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  18836876 tgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatgaggaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 18836975  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  18836976 tatcatcccgggaaggctaatgttgttgc 18837004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 278
Target Start/End: Original strand, 19986184 - 19986452
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||  || || | || || |||||||||||||| |||||||   | ||||    
T  19986184 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtttgggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatg 19986283  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacatta-ct-----tgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || || || || || ||     | |||||||| |  ||||||||    
T  19986284 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttgcaggcactatctatatctatatggttctaagtttgaagt 19986383  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatg 278  Q
     || |||||||||||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  19986384 attcagtgaccacaagagtttgaagtacttcttcgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatg 19986452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 347
Target Start/End: Original strand, 8761934 - 8762032
Alignment:
Q  249 gaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  8761934 gaaggatttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcaga 8762032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 59
Target Start/End: Original strand, 23086505 - 23086556
Alignment:
Q  8 atgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgt 59  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23086505 atgaaccttttgttgtatattttgatgcatccaagttgggcttaggtggtgt 23086556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 28283957 - 28283917
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggttt 50  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28283957 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggttt 28283917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27611944 - 27611604
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27611944 gatgaaccttttgtggtatattgtgatacgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 27611845  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611844 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 27611745  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  27611744 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgacttt 27611645  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27611644 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 27611604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 27684196 - 27684536
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27684196 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 27684295  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27684296 ggattcatgagaagaattatcccacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 27684395  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  27684396 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 27684495  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27684496 ggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 27684536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 14998535 - 14998875
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14998535 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 14998634  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14998635 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtcttcgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 14998734  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  14998735 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 14998834  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14998835 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 14998875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22136258 - 22135918
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22136258 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaaattgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 22136159  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136158 gaattcatgagaagaattatcctatgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 22136059  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  22136058 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 22135959  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22135958 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 22135918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 22331683 - 22332023
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22331683 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagtaga 22331782  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |  |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22331783 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggtggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 22331882  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  22331883 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 22331982  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22331983 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 22332023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 27667286 - 27667626
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27667286 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtactaatgcaaggaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 27667385  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |  | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27667386 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggtggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 27667485  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  27667486 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 27667585  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27667586 ggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 27667626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34568084 - 34567744
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34568084 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 34567985  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34567984 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 34567885  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  34567884 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 34567785  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34567784 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 34567744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16358092 - 16357752
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16358092 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 16357993  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16357992 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 16357893  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  16357892 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggagttgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 16357793  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16357792 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 16357752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 29474869 - 29475209
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29474869 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaaactgggtttaggaggtgtagttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 29474968  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29474969 gaattcatgagaagaattaccctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 29475068  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  29475069 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaattatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatgacttgaattgttgaaagattatgacttt 29475168  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29475169 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 29475209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19771550 - 19771213
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19771550 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaaggaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 19771451  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19771450 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttga 19771351  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || |||    
T  19771350 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgacttt 19771251  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19771250 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 19771213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27519996 - 27519656
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27519996 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 27519897  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27519896 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttga 27519797  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  27519796 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 27519697  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27519696 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 27519656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40710370 - 40710030
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40710370 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 40710271  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  40710270 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttga 40710171  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  40710170 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 40710071  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40710070 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 40710030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41772432 - 41772092
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41772432 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 41772333  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  41772332 taattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttga 41772233  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| |||    
T  41772232 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgacttt 41772133  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41772132 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 41772092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25428023 - 25427683
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25428023 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaggatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 25427924  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  25427923 gaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgttgtggtttttgtattgaagatatggagactttacttttatggttccagatttga 25427824  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     || |||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25427823 ggtatttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaacatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgatttt 25427724  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25427723 gagttgagctatcatccgtgtaaagctaatgttgttgcaga 25427683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 37290292 - 37290632
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37290292 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaaaaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 37290391  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37290392 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 37290491  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| || ||||| || ||||| || |||    
T  37290492 ggtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgacttt 37290591  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37290592 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcaga 37290632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 35 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18777358 - 18777046
Alignment:
Q  35 cgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgca 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  18777358 cgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattacccgacgca 18777259  T
Q  135 cgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaa 234  Q
     ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||     
T  18777258 tgatctagagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaag 18777159  T
Q  235 tatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagcta 334  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18777158 tatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgattttggtttgaattatcatctaggtaaagcta 18777059  T
Q  335 atgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||    
T  18777058 atgttgttgcaga 18777046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 21562769 - 21563109
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21562769 gatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaggtggtagcttatgcttcaagacagttga 21562868  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || ||||||||    
T  21562869 gaattcatgagcggaattatcctacgcatgatttggagttggctgctgtggtttttggtttgaaaatttggaggcattatttgtacgactccagatttga 21562968  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||| || || |||||||||    
T  21562969 ggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaactgttgaaggactatgatttt 21563068  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21563069 agtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 21563109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23441799 - 23441460
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  23441799 cgatgaaccttttgtggtatactgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtg--cttatgtaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaggcagctg 23441702  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23441701 agaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttggagttggcggctgtggcctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttg 23441602  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  23441601 aagtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaactgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactt 23441502  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23441501 tggtttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgttgcaga 23441460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20800988 - 20800659
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  20800988 cgatgaaccttttgtggtttactgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagggagttg 20800889  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||| ||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20800888 agaattaatgagaagaattaccagacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttg 20800789  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  20800788 aggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactt 20800689  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaa 335  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20800688 tgatttgaattatcatccaggtaaagctaa 20800659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Original strand, 21338096 - 21338431
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  21338096 gaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacggttgagga 21338195  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |  ||||||||||| || ||| | ||||||||||  |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21338196 ttcatgaaagaaattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtggtctttgtacttaagatatagagacattacttgtattgttcgagatttgaagt 21338295  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||| | ||||| |||||||||||     
T  21338296 gttcagcgaacacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaatgtggcttgaattgctgaaagactatgattttggg 21338395  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgca 345  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21338396 ttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgca 21338431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23575291 - 23574979
Alignment:
Q  35 cgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgca 134  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  23575291 cgtccaagctgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttttgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattacccgacgca 23575192  T
Q  135 cgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaa 234  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||     
T  23575191 cgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaag 23575092  T
Q  235 tatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagcta 334  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23575091 tatttgttcaatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggctcgaattaatgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagcta 23574992  T
Q  335 atgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||    
T  23574991 atgttgttgcaga 23574979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20823022 - 20822685
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||      
T  20823022 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcttctaggcagctgagag 20822923  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  20822922 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagt 20822823  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  20822822 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatttgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggc 20822723  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20822722 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcaga 20822685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 24619094 - 24619431
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  24619094 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 24619193  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  24619194 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 24619293  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||      
T  24619294 gtttagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgac 24619393  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24619394 ttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcaga 24619431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 24715325 - 24715662
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  24715325 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 24715424  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  24715425 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 24715524  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||      
T  24715525 gtttagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgac 24715624  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24715625 ttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcaga 24715662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 24748353 - 24748690
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  24748353 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 24748452  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  24748453 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 24748552  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||      
T  24748553 gtttagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgac 24748652  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24748653 ttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcaga 24748690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 26737522 - 26737863
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  26737522 cgatcaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggcttatgtggtgtgcttatgcaagatggaaaggtagtagcttatgcatcgagacagttg 26737621  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    |||||||||||  | ||| | || |||||||  ||||| || ||| | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  26737622 aggattcatgaacgaaattatcctacttatgatcttgaattagctgcagtggttttcgtacttaaaatatggagacactatttgtatggttccagatttg 26737721  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26737722 aagtgtttagtgaccataagagtttaaaatacttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagggaaggtggcttgagttgttgaaagactatgattt 26737821  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26737822 tagtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcaga 26737863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 21871850 - 21872186
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  21871850 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagtttggcttaggcggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 21871949  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||  ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||    
T  21871950 ttcatgaaaagaactatccgacacatgatttggagttggctgcggtggtttttcttttgaaaatttggagacattattagtacggtttcagatttgaagt 21872049  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21872050 gtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatca-aaagaattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgttgaaggattatgattttggt 21872148  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21872149 ttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcaga 21872186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 21876130 - 21876466
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  21876130 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagtttggcttaggcggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 21876229  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||  ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||    
T  21876230 ttcatgaaaagaactatccgacacatgatttggagttggctgcggtggtttttcttttgaaaatttggagacattattagtacggtttcagatttgaagt 21876329  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21876330 gtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatca-aaagaattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgttgaaggattatgattttggt 21876428  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21876429 ttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcaga 21876466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22463516 - 22463183
Alignment:
Q  14 cttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattca 113  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| ||||| ||||    
T  22463516 cttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttaggaggtgtgttgatgcaagatggaaaggtggtagcttatgcttctaggcagctgagggttca 22463417  T
Q  114 tgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttt 213  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22463416 tgaaaagaattatcctacgcatgatttagagctggctgcggtggtgtttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgttt 22463317  T
Q  214 agtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttga 313  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22463316 agtgaccacaaaagtttgaagtatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttga 22463217  T
Q  314 attatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22463216 attaccatccgggtaaagttaatgtagttgcaga 22463183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Original strand, 17268142 - 17268461
Alignment:
Q  19 gttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgaga 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||  ||||| | ||||| |    
T  17268142 gttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttaatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaactgagggtacatgaaa 17268241  T
Q  119 agaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtga 218  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17268242 agaattatcccactcacgatttggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtga 17268341  T
Q  219 ccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattat 318  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  17268342 ccacaagagcttgaaatatttgtttgatcagacggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaatattatgattttgggttgaattac 17268441  T
Q  319 catccgggtaaagctaatgt 338  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  17268442 catccgggaaaagctaatgt 17268461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 28893741 - 28894078
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||  |||||     
T  28893741 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaactgaggg 28893840  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  28893841 tccatgaaaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagt 28893940  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28893941 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggt 28894040  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28894041 ttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcaga 28894078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 28922567 - 28922904
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||  |||||     
T  28922567 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaactgaggg 28922666  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  28922667 tccatgaaaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagt 28922766  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28922767 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggt 28922866  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28922867 ttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcaga 28922904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 20466895 - 20467234
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||   || ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  20466895 gatgaaccttttgttgtgtattgtgatgcg-ccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcagaataacaaggtagtggcttatgcatcgagacaattga 20466993  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| || ||| | || |||||||  |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20466994 ggattcatgaacaaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgcttaagatttggagacattatttgtatggttctagatttga 20467093  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||| ||||| || || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20467094 agtgttgagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgatttt 20467193  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20467194 gggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 20467234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23472818 - 23472478
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||| ||    
T  23472818 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcatccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatggtaaggtagtagcttatgcatcgaaacagctg 23472719  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    ||||||||||| || ||| | || |||||||  |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  23472718 aggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttg 23472619  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    |||||||||| || || || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  23472618 aagtgtttagcgatcataa-agtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaggattatgattt 23472520  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23472519 tgggttaaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcaga 23472478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 28915212 - 28915549
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||   ||||     
T  28915212 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaaccgaggg 28915311  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  28915312 tccatgaaaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagt 28915411  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28915412 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggt 28915511  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28915512 ttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcaga 28915549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 28930480 - 28930817
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||   ||||     
T  28930480 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaaccgaggg 28930579  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  28930580 tccatgaaaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagt 28930679  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28930680 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggt 28930779  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28930780 ttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcaga 28930817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20777482 - 20777186
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| ||||      
T  20777482 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagctgagag 20777383  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  20777382 ttcatgaaaagaattctcctacgcatgatttggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagt 20777283  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20777282 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatttgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgatttt 20777186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 21679577 - 21679914
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||      
T  21679577 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtctagggggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagag 21679676  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  21679677 tgcatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcagtacttgtatggttccagattcgaagt 21679776  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||| | || || ||||||||||||||     
T  21679777 gtttagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggg 21679876  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21679877 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcaga 21679914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 22234719 - 22235056
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |    
T  22234719 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttaagaa 22234818  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  22234819 ttcatgaaaagaattaccctactcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttagaggcattatttgtatggtttcagatttgaagt 22234918  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || || ||||| |||||     
T  22234919 attcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggactatgaatttggc 22235018  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  22235019 ttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcaga 22235056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 338
Target Start/End: Original strand, 24797196 - 24797524
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||  | |    
T  24797196 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtagtagcgtatgcttctaggcagttacgta 24797295  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  24797296 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 24797395  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | || |||| |||||||||     
T  24797396 gttcagtgaccataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 24797495  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgt 338  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  24797496 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgt 24797524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 14885790 - 14886124
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||  || ||||| |||||||| || |||||| | |    
T  14885790 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtagggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgta 14885889  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  14885890 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcagtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 14885989  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | || |||| |||||||||     
T  14885990 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 14886089  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  14886090 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 14886124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22504248 - 22503914
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||  || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| |      
T  22504248 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgtatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtg 22504149  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  22504148 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtacggttccagatttgaggt 22504049  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  22504048 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcaaagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggc 22503949  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  22503948 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 22503914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 344
Target Start/End: Original strand, 23078960 - 23079222
Alignment:
Q  82 gtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagac 181  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||  ||||| || ||||| ||||| |    
T  23078960 gtagcatatgcttctaggcagttgaggatacatgagaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcggtggggtttgttttaaaaatttggaggc 23079059  T
Q  182 attacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggct 281  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |    
T  23079060 attatttgtatggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattaaacatgaggcagaggagatggtt 23079159  T
Q  282 tgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
     ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  23079160 agagctgttgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgc 23079222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 37542180 - 37542514
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||  |      
T  37542180 gaaccgtttgttgtatactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttacgtg 37542279  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  37542280 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaggt 37542379  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||| | ||||| || || |||| |||||||||     
T  37542380 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttgtttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttattgaaggattttgattttggc 37542479  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  37542480 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 37542514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20343851 - 20343517
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| |      
T  20343851 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtg 20343752  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  20343751 ttcatgagaagaattatcctacacatgatttggaattggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 20343652  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| || || || ||| | |||||  | || ||||||||||||||     
T  20343651 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcataggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggc 20343552  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  20343551 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 20343517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21408729 - 21408388
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || || ||||||    
T  21408729 cgatgaaccatttattgtatactgtgatgcgtctaagttgggtttaggtgttgtgcttatgcaggataataaagtagtagcttatgcatcgaggcagttg 21408630  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    ||||||||||| || ||| | | ||||| ||  ||  | |||||| | ||||| ||||| |||||  |||||||||| | |||||    
T  21408629 aggattcatgaatgtaattatcctactcatgatcttgggttagttgcagtaatttttgtacttaaaatttggaggcattatctgtatggttctaaatttg 21408530  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||| || || || || ||| |||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||| |||   || |||||||| ||| |||| |||||||| ||    
T  21408529 acgtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatttatttgaccagaaataattaaatatgaggcagcataggtggcttgaattgctaaaggattatgaatt 21408430  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21408429 cggattgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcaga 21408388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25849638 - 25849310
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| || |||||||| || ||| | || |||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||| |  ||||||    
T  25849638 tttgttgtgtactgtgatgcatctaagctaggcttaggtggcgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggaaattgcgtgttcatg 25849539  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  25849538 agaagaattatcctacacatgacctggagttggctgcagtggtttttgttttaaaaatttggaggcatgatttgtacggttccagatttgaggtgttcag 25849439  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    ||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| | |||||  | ||||||||||||||||| ||||||    
T  25849438 tgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaat 25849339  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    || ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  25849338 taccatcctggtaaggccaatgtggttgc 25849310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 345
Target Start/End: Original strand, 820 - 923
Alignment:
Q  242 ttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgt 341  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  820 ttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggt 919  T
Q  342 tgca 345  Q
    ||||    
T  920 tgca 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 21935993 - 21936321
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  21935993 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 21936092  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  21936093 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 21936192  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  21936193 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 21936292  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  21936293 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 21936321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24582773 - 24582445
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  24582773 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 24582674  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || | ||| || | |  |||||| || |||||  | ||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  24582673 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggctgttgtgtatacattgaagatttggaggaactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 24582574  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  24582573 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 24582474  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  24582473 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 24582445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 22349509 - 22349419
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaa 97  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  22349509 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaatgtggtagcttatgcttcaa 22349419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23504807 - 23504544
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||    ||  | | || ||||||||||||||||| |||||||   | ||||    
T  23504807 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgatgaatcatcaggttgtagcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatg 23504708  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  23504707 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggtcgttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatttgtatggttctaagtttgaagtgttcag 23504608  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||||||||  || |||||||||    
T  23504607 tgaccataagagtttgaagtacttgttaaatcagaaagagttgaatatgaagcaaagaagatgg 23504544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21497263 - 21497174
Alignment:
Q  258 gaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21497263 gaatatgaggcaaagaagatggcttgagttgttggaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcaga 21497174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27012647 - 27012319
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | | |||||| ||||||||  || || | || |||||||||||||| ||  ||||||   | ||||    
T  27012647 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttgatggtgtacttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggtagttgaaagtgcatg 27012548  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || |  | ||| || | |  |||||| || ||||| || ||  |||||||||| |  || || ||||| ||    
T  27012547 agaagaattatccgactcatgatttggaattggtagctgttgtgtatacattgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagttcgaggtgttcag 27012448  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  27012447 tgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 27012348  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  27012347 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 27012319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21882293 - 21882203
Alignment:
Q  253 gaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21882293 gaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttg 21882203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21624291 - 21624125
Alignment:
Q  118 aagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtg 217  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  || || ||||  |||||||| ||||| ||| | ||||||||  | |  |||||||| ||||| |    
T  21624291 aagaattaccctacgcatgatctggagttagctgcagtcgtgtttgcgttgaaaatctggaggcatcatttgtatggagcaaagtttgaagtttttagcg 21624192  T
Q  218 accacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttga 284  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| | || ||||| || ||| ||||| ||||    
T  21624191 accacaagagtttaaagtacttgtttgatcaaaaggaactcaacatgaggcaaagacgatggattga 21624125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 22324010 - 22324350
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22324010 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagatagttga 22324109  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22324110 gaattcatgagaagaattatcctacacatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 22324209  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  22324210 agtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgacttt 22324309  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22324310 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 22324350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24263659 - 24263319
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24263659 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 24263560  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24263559 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 24263460  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  24263459 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 24263360  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24263359 ggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcaga 24263319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27372558 - 27372218
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27372558 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 27372459  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372458 gaactcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 27372359  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  27372358 agtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgacttt 27372259  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27372258 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 27372218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24711323 - 24710983
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24711323 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 24711224  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711223 gaatccatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtcttcgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 24711124  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  24711123 agtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgacttt 24711024  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24711023 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 24710983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 41607539 - 41607879
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  41607539 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtctaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaggacagttga 41607638  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41607639 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 41607738  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  41607739 ggtgtttagtgatcgcaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgacttt 41607838  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41607839 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 41607879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 44384723 - 44385063
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44384723 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 44384822  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384823 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 44384922  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  44384923 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggctcgaattgttgaaagattatgacttt 44385022  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44385023 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 44385063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27219305 - 27218965
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27219305 gatgaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 27219206  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27219205 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttga 27219106  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  27219105 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 27219006  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27219005 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 27218965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10870139 - 10869799
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10870139 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 10870040  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10870039 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 10869940  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  10869939 agtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 10869840  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10869839 ggtctgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 10869799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16926649 - 16926309
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16926649 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttacgcttcaagacagttga 16926550  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16926549 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 16926450  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  16926449 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 16926350  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16926349 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 16926309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17000289 - 16999949
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17000289 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttacgcttcaagacagttga 17000190  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000189 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 17000090  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  17000089 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttt 16999990  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16999989 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 16999949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 21144195 - 21144535
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21144195 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 21144294  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| |  |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21144295 gaattcatgagaagaattatcctacgcatgacctcgagttggtggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 21144394  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||| |||    
T  21144395 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgacttt 21144494  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21144495 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 21144535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 343
Target Start/End: Original strand, 21324419 - 21324756
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21324419 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttaggtttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 21324518  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21324519 agaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttagcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttg 21324618  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  21324619 aggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggcttgaattgttaaaagactatgactt 21324718  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21324719 tggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgttgttg 21324756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 23106883 - 23107224
Alignment:
Q  7 gatgaacctttt-gttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23106883 gatgaacctttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 23106982  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23106983 agaattcatgagaagaattatcccacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttg 23107082  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | | || ||| | ||||||||||||||    
T  23107083 aagtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctattcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatagatagaattgctgaaagattatgattt 23107182  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23107183 tgagttgagctatcatccgcgtaaagctaatgttgttacaga 23107224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 24875904 - 24876243
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24875904 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 24876003  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | || |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24876004 gg-ttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagctggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgagatttga 24876102  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | ||||||||||| |||    
T  24876103 ggtgtttagtgatcacaggagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgacttt 24876202  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24876203 ggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcaga 24876243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24676779 - 24676438
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24676779 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcgtatgcttcaagacagttg 24676680  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24676679 agaattcatgagaagaactacccgacgcatgatttagagttggcggctgtgatctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 24676580  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | || |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| || || || ||| ||||||| ||    
T  24676579 aggtatttagtgatcacaaaagcttgaaatatttgttcgatcagaaagagttgaatatgaggcagcgtagatggctcgaattatttaaaaattatgactt 24676480  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24676479 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 24676438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25264336 - 25264022
Alignment:
Q  14 cttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattca 113  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25264336 cttttgttatttattgtgatgcatccaagttgggcttaggtggtattttaatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattca 25264237  T
Q  114 tgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttt 213  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  25264236 tgaaaagaattatcctacacatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtattt 25264137  T
Q  214 agtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttga 313  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25264136 agtgatcacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagactatgattttggtttga 25264037  T
Q  314 attatcatccgggta 328  Q
    |||| ||||||||||    
T  25264036 attaccatccgggta 25264022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23112025 - 23111685
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  23112025 gatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtccttatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttcgagacagttga 23111926  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  23111925 gaattcatgagcagaattatcctacgcatgatttggagttggctgttgtggttttcgtgttgaaaattttgaggcattatttgtacggctccagatttga 23111826  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  23111825 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgatttt 23111726  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  23111725 agtttgaattatcatccaagtaaagccaatgttgttgcaga 23111685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 24706635 - 24706976
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24706635 cgatgaagcttttgtggtatattttgatgcgtccaagttgggtttagcaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 24706734  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706735 agaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 24706834  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||  |||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  24706835 aagtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagacagaattgaatatgaggcaacgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactt 24706934  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||    
T  24706935 tggtttgaattattatccaagtaaggctaatgtttttgcaga 24706976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23073152 - 23072884
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  23073152 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggattaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagatga 23073053  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | || | ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23073052 gaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggttgttatggtcttcgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 23072953  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaag 275  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23072952 ggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaag 23072884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 27209329 - 27209666
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||| ||  || ||||      
T  27209329 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttaggtggtgtgttgatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttctaggtagctgagag 27209428  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  27209429 ttcatgaaaagaactatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagt 27209528  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  27209529 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcaaaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggc 27209628  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  27209629 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagtcgcaga 27209666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 347
Target Start/End: Original strand, 23099185 - 23099512
Alignment:
Q  20 ttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23099185 ttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatccaagagggcaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaa 23099284  T
Q  120 gaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgac 219  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||     
T  23099285 gaattatcctacccatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatctggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgat 23099384  T
Q  220 cacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatc 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||||| |    
T  23099385 cacaaaagtttgaaatatttgtttgattaaaaggaattgaatatgagacaaaggaggtggcttgaattgatgaaggattatgattttggcttgaattacc 23099484  T
Q  320 atccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23099485 atccgggtaaagctaatgtagttgcaga 23099512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27789017 - 27788698
Alignment:
Q  19 gttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgaga 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||  | ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||  ||||| | || || |    
T  27789017 gttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtttgggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaa 27788918  T
Q  119 agaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtga 218  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27788917 agaattatcccactcatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtga 27788818  T
Q  219 ccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattat 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27788817 ccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattac 27788718  T
Q  319 catccgggtaaagctaatgt 338  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  27788717 catccgggaaaagctaatgt 27788698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12575627 - 12575311
Alignment:
Q  22 gtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaaga 121  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||  ||||| | || || ||||    
T  12575627 gtttactgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaaaga 12575528  T
Q  122 attatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgacca 221  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12575527 attatcccactcatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttatatggttccagatttgaagtgttcagtgacca 12575428  T
Q  222 caagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcat 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  12575427 caagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccat 12575328  T
Q  322 ccgggtaaagctaatgt 338  Q
    ||||| |||||||||||    
T  12575327 ccgggcaaagctaatgt 12575311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23295221 - 23294899
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || ||||| || |    
T  23295221 gaaccttttgttgtttactgtgatgcgtcgaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatgttaaggtagtagcgtatgcttctaggcagttaagaa 23295122  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  23295121 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatatggaggcaatatttgtatggttccagatttgaagt 23295022  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  23295021 attcagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggc 23294922  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagc 332  Q
    |||||||| ||||| ||||||||    
T  23294921 ttgaattaccatcctggtaaagc 23294899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 19651207 - 19651544
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19651207 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggttgtagcgtatgcttctagacagttgagga 19651306  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  19651307 tacatgagaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 19651406  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  19651407 gttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaagactatgattttggt 19651506  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  19651507 ttgaattaccatcctaggaaagctaatgtggttgcaga 19651544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23278062 - 23277725
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||      
T  23278062 gaaccgtttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgagag 23277963  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  23277962 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattacttgtacggatccagatttgaagt 23277863  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || |||||||||||||||    
T  23277862 atttagttatcacaaaagtttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggt 23277763  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  23277762 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcaga 23277725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 114 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16924071 - 16923838
Alignment:
Q  114 tgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttt 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||  || |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16924071 tgagaagaattatcctacgcatgatctcgagtgggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgttt 16923972  T
Q  214 agtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttga 313  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  16923971 agtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttga 16923872  T
Q  314 attatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16923871 attatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 16923838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 114 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16983334 - 16983101
Alignment:
Q  114 tgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttt 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||  || |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16983334 tgagaagaattatcctacgcatgatctcgagtgggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgttt 16983235  T
Q  214 agtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttga 313  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  16983234 agtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttga 16983135  T
Q  314 attatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16983134 attatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 16983101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24949876 - 24949539
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||||     
T  24949876 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttggcattgggtggtgttttgatgcaagacggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgaggg 24949777  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  24949776 ttcatgaaaagaattatcctacgcaggatttagagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttaaagt 24949677  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| | || || |||||||||||||||    
T  24949676 attcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggt 24949577  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||    
T  24949576 ttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgcaga 24949539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 30011340 - 30011678
Alignment:
Q  9 tgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagg 108  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||| |  ||  ||||||||    
T  30011340 tgaaccatttgttgtatattgtgatgcgtctaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcagaataataaggtagtagcttatgcattgaggtagttgagg 30011439  T
Q  109 attcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaag 208  Q
    ||||||||     |||||||||| || ||| | ||||||||||  ||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30011440 attcatgaacgtgattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtggtttttgtacttaaaatttggagacattatttgtatggttctagatttgaag 30011539  T
Q  209 tgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttgg 308  Q
    |||| |  || || || | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||    
T  30011540 tgttcaacgatcataaaattttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgg 30011639  T
Q  309 tttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     || ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30011640 gttaaattaccatccgagtaaggctaatgttgttgcaga 30011678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20829545 - 20829211
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| || | ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| || || ||| |      
T  20829545 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcatctaagctgcgcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtg 20829446  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  20829445 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgtcttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 20829346  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||  | ||||||| |||||||||     
T  20829345 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggc 20829246  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||    
T  20829245 ttgaattaccatcctggtgaggccaatgtggttgc 20829211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 45533635 - 45533294
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||| |||||||| || |  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||  || ||||||||||| || || ||||||    
T  45533635 cgatgaaccatttgttgtatagtaagatatgtctaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcagaataatatggtggtagcttatgcatcgaggcagttg 45533536  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    ||||||||||| || ||| | ||||||||||  ||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45533535 aggattcatgaacgtaattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtggtttttgtacttaaaatttggagacattatttgtatggttctagatttg 45533436  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||| || || || || |||||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||| |||| ||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  45533435 aagtgttcagcgatcataaaagtttgaagtatttatttgacaagaaagaattaaatatgaggcagcgaaggtggtttgaattgctaaaggattatgattt 45533336  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45533335 cgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcaga 45533294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1065037 - 1064703
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |      
T  1065037 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtagtagcgtatgcttctaggcagttgcgtg 1064938  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  1064937 tacatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggt 1064838  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | || |||| |||||||||     
T  1064837 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 1064738  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  1064737 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 1064703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31831944 - 31831610
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||  | |    
T  31831944 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttacgta 31831845  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  31831844 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 31831745  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | || |||| |||||||||     
T  31831744 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 31831645  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  31831644 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 31831610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 30210074 - 30210412
Alignment:
Q  9 tgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagg 108  Q
    |||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||| | |  || |||||||||    
T  30210074 tgaaccatttgttgtatactttgatgcgtctaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcagaataataaggtagtagcttatacattgaggcagttgagg 30210173  T
Q  109 attcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaag 208  Q
    ||||||||    ||||||||||  || ||| |  |||||||||  ||||| |||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  30210174 attcatgaacgtaattatcctattcatgatcttaagttagctgtagtggtttttgtacttaaaatttggagacattatctgtatggttctagatttgaag 30210273  T
Q  209 tgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttgg 308  Q
    |||| |  || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| ||  |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||    
T  30210274 tgttcaacgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatacgaggcatcgaaggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgg 30210373  T
Q  309 tttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     |||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  30210374 gttgaattaccatccgggtatggctaatgttgttacaga 30210412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 198 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17064815 - 17064666
Alignment:
Q  198 gagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagat 297  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||    
T  17064815 gagattggaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggat 17064716  T
Q  298 tatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17064715 tatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 17064666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 347
Target Start/End: Original strand, 12639396 - 12639727
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || ||||||||||| || ||||||    | ||||    
T  12639396 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcgaggcagttggaagtgcatg 12639495  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || | ||| || | || |||||| || ||||| || ||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  12639496 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagctgttgtgtatgcattgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 12639595  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  12639596 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcaattgagt 12639695  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  12639696 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcaga 12639727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 9485505 - 9485409
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagt 103  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9485505 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagt 9485409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25129889 - 25129630
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || | || || |||||||||||||| | |||||   | ||||    
T  25129889 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtctcggtggcgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcggttgaaagtgcatg 25129790  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  25129789 agaagaactatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcag 25129690  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaag 275  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||    
T  25129689 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgaccaaaaagagttgaatatgaggcagagaag 25129630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Original strand, 24830351 - 24830614
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || |||||||   | || |    
T  24830351 tttgtggtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcacg 24830450  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||  || || |||||||| || || |  ||  | | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  24830451 agaagaattatctgactcatgatttggaattggcagccgttatgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 24830550  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  24830551 tgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatgg 24830614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22279349 - 22279122
Alignment:
Q  52 ggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctg 151  Q
    |||||||||||||||||  || || | || || ||||||||||| ||  ||||||   | ||||||||||||||||| || || |||||||| || || |    
T  22279349 ggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcgaggtagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcag 22279250  T
Q  152 atgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaa 251  Q
      || || | || |||||| || ||||| || ||  |||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  22279249 ccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatatatttgatcagaa 22279150  T
Q  252 ggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22279149 agaattgaatatgaggcagagaagatgg 22279122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Original strand, 22760732 - 22760995
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || ||   || || |||||||||| |||  ||||||   | ||||    
T  22760732 tttgctgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtccggttgtggcttatgctttaaggtagttgaaagtgcatg 22760831  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  ||||| | || |||||| || ||||| |||||  |||||||||  |  ||||| ||||| ||    
T  22760832 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgtggtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggttataagtttgaggtgttcag 22760931  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||    
T  22760932 tgaccaaaagagtttgaagtacttgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagaaaagatgg 22760995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 279
Target Start/End: Original strand, 24568835 - 24569094
Alignment:
Q  20 ttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaa 119  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||| ||||||||  || || | || || |||||||||||||| |||||||   | | ||||||    
T  24568835 ttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtacttatgcagaatagtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcgtgagaa 24568934  T
Q  120 gaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgac 219  Q
    ||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || || || |||||  |||||||||| |  ||||| || || ||||||    
T  24568935 gaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttgaaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtattaagtgac 24569034  T
Q  220 cacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||  |  |||||||||| || |||||||||    
T  24569035 cacaagagtttgaagtacttgtttgatcaaaaaaagatgaatatgaggcaaagaagatgg 24569094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 95
Target Start/End: Original strand, 19718174 - 19718259
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttc 95  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19718174 gaaccatttgttgtgtattgtgttgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttc 19718259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23067407 - 23067340
Alignment:
Q  279 gcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23067407 gcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgact-atcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 23067340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 252
Target Start/End: Original strand, 25133742 - 25133792
Alignment:
Q  202 tttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaag 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  25133742 tttgaagtgtttagtgaccacaatagtttgaagtacttgtttgattagaag 25133792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 307
Target Start/End: Original strand, 17967134 - 17967218
Alignment:
Q  223 aagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttg 307  Q
    |||||| |||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  17967134 aagagtctgaagtatctctttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatgtttggagtttttaaaggattatgattttg 17967218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17344 - 17003
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17344 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatacgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagattgaaaagtagtagcttatacttcgagacagttg 17245  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17244 agaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttagctgcagtggtcttcgtgttgaagatatggagacattacttgtatcgttcgagatttg 17145  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17144 aggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattt 17045  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17044 tgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgtagcaga 17003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9086 - 8746
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  9086 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgttcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaacacagttaa 8987  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8986 ggattcatgagaagaattatcctacacatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 8887  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  8886 ggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgattagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgacttt 8787  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8786 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 8746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 49779 - 49481
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49779 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 49680  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49679 gaattcatgagaagaattatcccacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttga 49580  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  49579 ggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagatggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgattt 49481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30634 - 30294
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  30634 gatgaaccttttgtggtatattgtgacgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagtttatgctttgagacagttga 30535  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30534 gaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagtttgctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 30435  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  30434 ggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgatttt 30335  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  30334 gagttgagctatcatccaggtaaagctaatgtttttgcaga 30294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 50499 - 50168
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  50499 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtagtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttga 50400  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  | ||| ||||| || ||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  50399 ggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggcggtttttgtttttaaaagttggagacattatttgtacggttccagatttga 50300  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| || |  ||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  50299 agtgtttagtgatcatacaagtttaaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgatttt 50200  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50199 ggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgt 50168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 177 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29576 - 29406
Alignment:
Q  177 gagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaaga 276  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  29576 gagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcatacaagtttaaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaaga 29477  T
Q  277 tggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29476 tggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 29406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9055 - 8715
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9055 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 8956  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8955 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 8856  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | ||||||||||| |||    
T  8855 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattttttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgacttt 8756  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8755 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 8715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 29187 - 29528
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  29187 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtccttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaggtagttg 29286  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29287 agagttcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttagcggcaatggtctttgtattgaacatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 29386  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  || |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  29387 aggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaggaattaaacatgaggtagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactt 29486  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29487 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 29528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 102923 - 102582
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||||| || ||||| |||    
T  102923 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaggtggtaacttatgcgtcgagacaattg 102824  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  102823 agaattcatgagcggaattaccctacgcacgatttagagttgggtgctgtggtttttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 102724  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  102723 aagtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattt 102624  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  102623 tggtttgaactatcatccaggtaaagctaattttgttgcaga 102582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16625 - 16285
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16625 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 16526  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16525 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatcttgagttggcagccatagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttaa 16426  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | ||||||||||| |||    
T  16425 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgacttt 16326  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16325 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 16285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44840 - 44500
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  44840 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcacgacagttga 44741  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44740 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 44641  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  44640 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcatagatggcttgaattgttaaaggattacgacttt 44541  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44540 ggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 44500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10163 - 9823
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10163 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttga 10064  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  |||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10063 gagttcacgagaagaattatactacgcatgatcttgagttggcagccatagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 9964  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| || ||| | ||||||||||| |||    
T  9963 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgattatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgacttt 9864  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9863 ggtttgaattatcatccaggtaaagctagtgttgttgcaga 9823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 49134 - 49471
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||  | ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||| |||||     
T  49134 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggaaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgaggg 49233  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||  ||||| ||||| || || || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  49234 tgcatgaaaagaattatcctactcacgatttatagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagattcgaagt 49333  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||| | || || ||||||||||||||     
T  49334 gttcagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggg 49433  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  49434 ttgaactatcattcgggtaaagccaatgtagttgcaga 49471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 277
Target Start/End: Original strand, 105199 - 105460
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||| ||||||||||||  || || | || || |||||||||||||| |||||||   | ||||    
T  105199 tttgttgtgtattgtgatgcttcaaagatgggtcttggtgatgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtacatg 105298  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    | ||||||||| |  | || |||||||| || || |  || || | || |||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  105299 aaaagaattattcggctcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 105398  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagat 277  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  105399 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttaatcagaaagagttgaatatgagacaaagaagat 105460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1555 - 1218
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  1555 gaacctttcgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 1456  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  1455 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgtttcgaaaatttggagacattatttgtacggttccaggtttgaagt 1356  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1355 gtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaaaatggcttgagttgttaaaggattatgattttggt 1256  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1255 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5465 - 5125
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||| |||| || |||||||    
T  5465 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatgttaaagtggtagcttattcttctaggcagttga 5366  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  5365 ggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgctgtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttga 5266  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5265 ggtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgatttt 5166  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5165 ggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 5125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 13828 - 14168
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13828 gatgaaccttttgtggtatattgcgatgcgtccaagctgggtttgggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgaggcagttga 13927  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13928 gaattcatgagaagaattatcccacgcacgatttagagttggctgatgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatgtga 14027  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | || ||||||||||||    
T  14028 ggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgttcgaacagaaggaattgaatatgaggcagggtagatggctagaattgctgaaggattatgatttt 14127  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14128 gagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 14168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 38565 - 38905
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |    
T  38565 gatgaaccttttgtggtatattatgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcgagacaattca 38664  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38665 gaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 38764  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38765 ggtatttagtgagcataacagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgagacatcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgatttt 38864  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38865 gagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 38905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 38436 - 38777
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  38436 cgatgagccttttgtagtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtatttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagtcagttg 38535  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  38536 agaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggttgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacctgtatggttcgaggtttg 38635  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |  ||| | ||||||||||| ||    
T  38636 aggtgtttagtgatcagaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctggtattgctgaaagattatgactt 38735  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38736 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 38777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 67091 - 66754
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  67091 gaactttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggattaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcaagacagttgagaa 66992  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  66991 ttcatgagaagaattacccgacgcacgatttagagttggcagatgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggt 66892  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    |||||| || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  66891 gtttagcgatcacaagagttcgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatattagacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggt 66792  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  66791 ttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 66754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 22395 - 22333
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgca 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  22395 cgatgaaccttttgttgtatattgtgatgcttccaagttggacttaggtggtgtacttatgca 22333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7709 - 7369
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7709 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgtgtccaagctgggtttaggtggtgtggttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 7610  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7609 gaattcatgagaagaattatcctacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 7510  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     || |||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||| | || || |||||||||    
T  7509 ggtatttagtgatcataagagcttgaagtatctgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcatagatggcttgaattgctgaaggactatgatttt 7410  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7409 gagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 7369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13751 - 13407
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13751 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgtttttgcatgatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 13652  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttg----tattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagat 202  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | | ||||| |    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13651 gaattcatgagaagaattaccctacacacgatttagagttggctgctatagtcttcgatcgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagat 13552  T
Q  203 ttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatga 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || || |||||    
T  13551 ttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggactatga 13452  T
Q  303 ttttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||  ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13451 ttttgagttgagctatcatccgggtcaagctaatgttgttgcaga 13407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 347
Target Start/End: Original strand, 178 - 509
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  178 tttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgtttcgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagaattcatg 277  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  278 aaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttatacggttccagatttgaagtatttag 377  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    ||| || || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  378 tgatcataaaagtctaaaatatttatttgataagaaggaattgaacatgaggcagaggagatgcttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaat 477  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  478 taccatccgggtaaagccaatgtggttgcaga 509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23856 - 23593
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| || |||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||||  || || | || || |||||||||||||| |||||||   | ||||    
T  23856 tttgttgtgtaatgtgatgcttctaagatgggttttggtggtgtacttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtacatg 23757  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || ||    || || | || |||||| || || || |||||  |||||||||| |  ||| | ||||| ||    
T  23756 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcaaccgttgtgtatgcattgaagatttgaaggcattatctgtatggttctaagttttaggtgttcag 23657  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  23656 tgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatgg 23593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3884 - 3543
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3884 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcttccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 3785  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3784 agagttcatgagaagaattacccgacgcatgatttagaattagccgccgtggtttttgtgttgaagatttggagacattacttatatggttcgagatttg 3685  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||    
T  3684 aggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaatattatgactt 3585  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3584 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttacaga 3543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19035 - 18702
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19035 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaattagtagcttatgcttctagacagttgagga 18936  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || | ||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  18935 ttcatgaaaagaattatcctacggatgatttggaattggttgcagtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagt 18836  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18835 gtttagtgatcataaaagtttgaaatatttattcgatctgaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggt 18736  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18735 tttaattaccatccgggtaaagctaatgtcgttg 18702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Original strand, 25403 - 25666
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || ||||||||||| || |||||||   | |||     
T  25403 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatt 25502  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || ||||| || ||  |||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  25503 agaagaattatccgactcatgatttggaattggccgcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgtttag 25602  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  25603 tgaccacaatagtttgaagtaattgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 25666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20292 - 19955
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  20292 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttagaaggtgtacttatgtaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaggcaattg 20193  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20192 agaattcatgagaagaattatccgacgcatgatttagagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgaggtttg 20093  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | ||||||||||| ||    
T  20092 aggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatattttttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactt 19993  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19992 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttg 19955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 35716 - 35379
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  35716 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttagaaggtgtacttatgtaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaggcatttg 35617  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35616 agaattcatgagaagaattatccgacgcatgatttagagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgaggtttg 35517  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | ||||||||||| ||    
T  35516 aggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatattttttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactt 35417  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35416 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttg 35379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 92 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 51036 - 50781
Alignment:
Q  92 cttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgta 191  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  51036 cttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctacgcacaatttagcgttggctgcggtggtctttgtattgaagatatggagaaattacttgta 50937  T
Q  192 tggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgtta 291  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | || |||||||| ||| |     
T  50936 tgattcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgtttgattagaaggaattgcatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctg 50837  T
Q  292 aaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || || || |||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50836 aaggactacgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 50781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 112104 - 112445
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  112104 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcatcgagacagttg 112203  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112204 agaattcatgaaaggaattaccctacgcacgatttagagttagccgttgtggtttttgtacttaagataaggagacattacttgtatggttcgagatttg 112303  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||| ||| | || || ||||||||    
T  112304 aagtatttagtgatcacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtaagtggcttgaattgctgaacgactatgattt 112403  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||  ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  112404 tgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgtagcaga 112445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16563 - 16226
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  16563 gaaccctttgttgtttattgcgatgcatccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagataataaagtagttgcttatgcatcgagacagttgagaa 16464  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||    |||||||||||  | ||| | || |||||||  ||| |||||||  | || || |||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  16463 ttcatgaacgaaattatcctactgatgatcttgaattagctgcagtgatctttgtgcttaagatttggagacactatttgtatgattcgagatttgaagt 16364  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |  | ||||| |||||||||||||||||     
T  16363 gttcagtgatcataagagtctgaagtatttgtttgatcagaagcaattgaatatgagacagcgaaggtggatcaaattgttgaaagattatgattttggg 16264  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16263 ttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 16226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15801 - 15461
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||    
T  15801 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgattctaggcagttga 15702  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  15701 gaattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggatttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttga 15602  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15601 agtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgatttt 15502  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15501 gggttgaattaccatctgggtaaagctaatgtggttgcaga 15461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 8487 - 8815
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  ||  | | || || ||||||||||| || |||||||   | ||||    
T  8487 tttgttgtgtattgtgatgcttcaaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcatcaggttgtggcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatg 8586  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || ||||| || ||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  8587 agaagaattatccgactcaagatttggaattggccgccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 8686  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  8687 tgaccacaagagtttgaagtatctgtttaatcagaaagagttgaatatgaggcacagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 8786  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  8787 tatcatcccgggaaggctaatgttgttgc 8815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 2889 - 3220
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2889 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtagtagcttatgcttctaggcagttga 2988  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  2989 ggattcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttga 3088  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3089 ggtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatatttgtctgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgatttt 3188  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgt 338  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| |||||||    
T  3189 ggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgt 3220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 29902 - 30233
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  29902 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtagtagcttatgcttctaggcagttga 30001  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  30002 ggattcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttga 30101  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30102 ggtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatatttgtctgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgatttt 30201  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgt 338  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| |||||||    
T  30202 ggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgt 30233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 6948 - 7288
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6948 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtctaagctgggtttaggtggtgtgcatatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcatcgagacagttga 7047  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  7048 gaattcatgagaagaattaccctacgcatgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtaaggttcgagatttaa 7147  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  7148 ggtgtttagtgaccattagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggaagcgtagatggcttgaattgctgaaggattatgatttt 7247  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7248 gagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 7288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7738 - 7398
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7738 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtctaagctaggtttaggtggtgtgcttatccaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 7639  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7638 gaattcatgagaagaattaccctacgcatgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattgcttgtacggttcgagatttga 7539  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  7538 ggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggattatgatttt 7439  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7438 gagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 7398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16934 - 16757
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtctaagctaggtttaggtggtgtgcttatccaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 16835  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacatt 184  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16834 gaattcatgagaagaattaccctacgcatgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacatt 16757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 455 - 115
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  455 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaacatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 356  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  355 taattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtactgtttgagatttga 256  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| ||| | || || |||||||||    
T  255 ggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatagcttgaattgctgaaggactatgatttt 156  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155 gagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2958 - 2618
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2958 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaacatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 2859  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  2858 taattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtactgtttgagatttga 2759  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| ||| | || |||| |||||||    
T  2758 ggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagattgcttgaattgctgaatgattttgatttt 2659  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2658 gagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 2618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 7704 - 8044
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||    
T  7704 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcatcgagacagttga 7803  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7804 gaattcatgagcggaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttctagattcga 7903  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||    
T  7904 ggtgtttaatgatcacaagagtctgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgctgaaagactatgatttt 8003  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8004 gagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 8044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 345
Target Start/End: Original strand, 8276 - 8614
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8276 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 8375  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8376 gaatttatgagaagaattaccctacgcatgatttagagttgactgatgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatttga 8475  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| | |  || |||||||||    
T  8476 ggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaacatgagacagcgtagatggcttgaattgctgatggactatgatttt 8575  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgca 345  Q
    |  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8576 gagttgagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgca 8614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2591 - 2257
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   || ||||| |||||||| || ||||||| |    
T  2591 cgatgaaccttttgttgtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcagaataacaaggtagtggcttatgcatcgagacagtcg 2492  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    ||||||||||| || ||| | ||||||||||  || ||||||||  | || || ||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  2491 aggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtagtctttgtgcttaagatttggagacattatttctatggttctagatttg 2392  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    |||||||       || || ||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2391 aagtgtt-------cataaaagtctgaagtattcatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattt 2299  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2298 cgggctgaattatcatccaggtaaagctaatgttcttgcaga 2257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3126 - 2788
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3126 cgatgaaccttttgtggtgtattgttatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaaaatggcaaggtagtagcttatgcttcgagacagttg 3027  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3026 agaattcatgaaaagaattaccctacacacgatttagagttggctgttgtggtctttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 2927  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | || |||||||| ||| | || || ||||||||    
T  2926 aagtgattagtgatcataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggtagcgtaggtggcttgaattgctgaaggactatgattt 2827  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    ||  ||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2826 tgagttgagctatcatccaggtaaagttaatgttgttgc 2788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 25 - 347
Target Start/End: Original strand, 32208 - 32530
Alignment:
Q  25 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaatt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32208 tattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaactggtagctgatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaatt 32307  T
Q  125 atcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaa 224  Q
    | || | ||| || || ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  32308 acccgatgcatgacttagagttggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgagcacaa 32407  T
Q  225 gagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccg 324  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  32408 gagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatcca 32507  T
Q  325 ggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32508 ggtaaagctaatgttgttgcaga 32530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 155 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10137 - 9948
Alignment:
Q  155 tggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaagga 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10137 tggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggattgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttatttgatcagaagga 10038  T
Q  255 attgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10037 attgaatatgagacagcttagatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgc 9948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 39843 - 39703
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||| | |||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39843 cgatgagctttttgtggtgtattgtgctgcgtctaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 39744  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagtt 146  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  39743 agaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagtt 39703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 2105 - 2442
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  2105 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttaggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 2204  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  || || ||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  2205 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttagctgcggtagtttttgttttgaaattttggaggcattatttgtacggctccagatttgaagt 2304  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  2305 gtttagtgatcccaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggctagagttgttgaaggattatgattttggt 2404  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2405 ttgaattaccatccgggtgaagctaatgtggttgcaga 2442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 25561 - 25901
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25561 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcttcgagacaggtg 25660  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25661 agaattcatgacaagaattaccctacgcatgatttagagttggctgttgtggtctttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 25760  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||| | || |||||||| ||  | || ||||| |||||    
T  25761 aggtgtttaatgatcacaagagtttgaaatatttgtttgattagagggaattgaatattaggcagcgtaggtggcttgaattactgaaggatta-gattt 25859  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25860 tgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 25901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 976 - 899
Alignment:
Q  202 tttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  976 tttgaagagttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgcttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6119 - 5779
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||  ||||||    
T  6119 gatgaaccttttattgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggcagcttatgcttctaggaagttga 6020  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  6019 ggattcatgaaaggaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccaaatttga 5920  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5919 agtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgataaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgatttt 5820  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5819 ggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 5779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 18958 - 19298
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18958 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtctaagttggggttaggtggggtgcttgtgcaagatgggaaagtagtatcttatgcttcgagacagttga 19057  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19058 gaattcatgagaagaattaccctacgcatgatttagagttggatgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtaaggttcgagatttga 19157  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || || |||||||||    
T  19158 ggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatatgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggactatgatttt 19257  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19258 gtgttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 19298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21572 - 21239
Alignment:
Q  11 aaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggat 110  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21572 aaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggcttaggaggtgttcttatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctagacagttgaggat 21473  T
Q  111 tcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtg 210  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||  ||   ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  |||    
T  21472 tcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttgactacggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgtggtg 21373  T
Q  211 tttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtt 310  Q
    || || || ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21372 ttcagcgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtt 21273  T
Q  311 tgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  21272 tgaattaccatcctagtaaagctaatgtggttgc 21239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 113 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 46100 - 45869
Alignment:
Q  113 atgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtt 212  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||    
T  46100 atgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtttggttctagatttgaggtgtt 46001  T
Q  213 tagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttg 312  Q
     ||||| || || || |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46000 cagtgatcataaaagcttgaaacatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttg 45901  T
Q  313 aattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  45900 aattaccatcctggtaaagccaatgtggttgc 45869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 57698 - 57370
Alignment:
Q  15 ttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcat 114  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  57698 ttttgtggtgtactgtgatgcgtccaagttgggcttaggcggcgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcat 57599  T
Q  115 gagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttta 214  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  57598 gagaagaattacccaacgcatgatttagagttggcggctgttgtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgttta 57499  T
Q  215 gtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaa 314  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  57498 gtgatcacaagagttcgaagtatttgttcgaccagaaggaattaaatatgagacaacgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaa 57399  T
Q  315 ttatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  57398 ttatcatccaggtaaagctaatgttgttg 57370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 18683 - 19024
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18683 cgatgaaccttttgtggtttactgtgatgcatccaagctgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 18782  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  18783 agaattcattagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaatatatggagacattacttgtatggttcaaggtttc 18882  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | |||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||   |||||||| || ||| | ||||||||||| ||    
T  18883 aggtgtttagcgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcatagatggctagaattgctgaaagattatgactt 18982  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18983 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 19024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 196103 - 196429
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||    
T  196103 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgtgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtcaagtggtagcttatgcttcgaggcagttg 196202  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    ||  |||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         ||    
T  196203 agagttcatgagaagaattacccgacacatgatttagagttagctgttgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatgg---------tg 196293  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| || |||||||| || ||  |||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  196294 aggtgtttagtgatcataagagtttaaagtacctgttcgaccagaaagaattgaatatgaggcagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactt 196393  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgt 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  196394 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 196429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 27986 - 28325
Alignment:
Q  8 atgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgag 107  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27986 atgaaccttttgtggtatactgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagatgttaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgag 28085  T
Q  108 gattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaa 207  Q
     ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  28086 aattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtcgtctttatattgaagatatggagacactacttgtatggttcgagatttgag 28185  T
Q  208 gtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttg 307  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | || |||||||| ||||    
T  28186 gtgtttagtgatcataagagtttgaaatacttgttcgaccagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgactttg 28285  T
Q  308 gtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28286 gtttcaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 28325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 236
Target Start/End: Original strand, 3121 - 3351
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||    
T  3121 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtcaaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagacggcaaggtagtagcttatgcgtcgagacaattg 3220  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  3221 agaattcatgagcggaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtgatttttgtgttgaaaatatggagacattatttgtacggttctagatttg 3320  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaata 236  Q
    ||||||| || || || |||||| |||||||    
T  3321 aagtgttcagcgatcataagagtctgaaata 3351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 60432 - 60102
Alignment:
Q  17 ttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatga 116  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||| || ||  |||| | |||||||||    
T  60432 ttgttgtatattgtgatgcatctaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaggataataatctagtagcttatgcatcgaggtagtttacgattcatga 60333  T
Q  117 gaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagt 216  Q
        ||||||||||| || ||| | ||||||||||  ||||| |||||| | ||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  60332 acgcaattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtggtttttgtactcaaaatttggaggcattatctgtatggttctagatttgaagttttcagt 60233  T
Q  217 gaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaatt 316  Q
    |  || || ||| | || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  60232 ggtcataaaagtataaagtatttatttgaccagaagaaattgaatatgaggcagcaaaggtggctagaattgctaaaggattatgatttcggattgaatt 60133  T
Q  317 atcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  60132 accatccgggtaagggtaatgttgttgcaga 60102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 150799 - 150690
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  150799 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgtgtttaggtggtgtgcttat----gatggaaaagtagtagcttatgcttcgaggcagttga 150704  T
Q  107 ggattcatgagaag 120  Q
    | ||||||||||||    
T  150703 gaattcatgagaag 150690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Original strand, 54576 - 54830
Alignment:
Q  25 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaatt 124  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || ||||||||||| || |||||||   | |||||||||||||    
T  54576 tattgtgatgcttcaaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaatt 54675  T
Q  125 atcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaa 224  Q
    |||| || || |||||||| || || | ||| || | |  |||||| || ||||| |||||  | |||||||| |  ||||| ||||| | |||||| ||    
T  54676 atccgactcatgatttggaattggcggctgttgtttattcattgaagatttggagtcattatctttatggttctatttttgaggtgttcattgaccataa 54775  T
Q  225 gagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  54776 gtgtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagcgaagatgg 54830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 347
Target Start/End: Original strand, 3358 - 3413
Alignment:
Q  292 aaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3358 aaagattacgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 3413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 7273 - 7610
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  7273 gaacattttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaaaatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaa 7372  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7373 tacatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggaaaaattacttgtatggttcgagatttgaggt 7472  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||| | ||  | ||||||||||      
T  7473 gtttagtgaacataagagtttgaagtatctgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaagaactatgattttgag 7572  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7573 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 7610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 3969 - 4310
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  3969 cgatgaaccttttgtggtatactgtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcgtatgcttcaagatagttg 4068  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4069 agaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttg 4168  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||| || ||| | || |||||||| ||    
T  4169 aggtgtttagtgatcataagagtttgaaatacttgttcaatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtaaatggctagaattgctgaaggattatgactt 4268  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4269 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 4310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 47654 - 47991
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||    
T  47654 gaaccttttgtagtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgatga 47753  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  47754 ttcatgaaaagaattatcctacccatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttaaagt 47853  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  47854 gtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggt 47953  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  47954 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggtcgcaga 47991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 56473 - 56801
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  56473 tttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctagacagttgaggattcatg 56572  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |     
T  56573 aaaaaaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgttcaa 56672  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    ||| || |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  56673 tgatcaaaagagtctaaagtatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttaaaggattatgattttggtttgaat 56772  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  56773 taccatccgggtaaagctaacgtagttgc 56801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2108 - 1771
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2108 cgatgagctttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 2009  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||| || || || || || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2008 agaattcatgagaagaattactcgacgcatgacttagaattggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttg 1909  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | ||||||||||| ||    
T  1908 aggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactt 1809  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1808 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttg 1771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15848 - 15511
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15848 cgatgagctttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 15749  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||| || || || || || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15748 agaattcatgagaagaattactcgacgcatgacttagaattggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttg 15649  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | ||||||||||| ||    
T  15648 aggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactt 15549  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15548 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttg 15511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11482 - 11142
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||| |||| || ||||| |    
T  11482 gatgaacctttttttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagaaggcaaagtggtagcttatacttctaggcagttaa 11383  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11382 ggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgtggtggtttttgtgttgaaaatttggagacattatttgtacggttctagatttga 11283  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  11282 agtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaggatggcttgagttgttgaaggattatgatttt 11183  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11182 ggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 11142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16329 - 16103
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16329 gatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggttttggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttga 16230  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16229 gaattcatgagaagaattatcctacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 16130  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaa 233  Q
     ||||||||||| || |||||||||||    
T  16129 ggtgtttagtgatcataagagtttgaa 16103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 108428 - 108768
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || |    
T  108428 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtgatagcttatgcttcaagacaattaa 108527  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |  || || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  108528 gagttcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcagccgtagtatttgtattgaagatagggagacattacttgtatggttcgaggtttga 108627  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||  | |||||| |||| |||||||| |||    
T  108628 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgtagatgattagagttgctaaaggattatgacttt 108727  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  108728 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 108768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 114248 - 113908
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||| | |    
T  114248 gatgaaccgtttgttgtttattgtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctaa 114149  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  | ||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||| ||||||| || |||||    
T  114148 gagtacatgtaaagaattattctactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcattacttgcatggttccaggtttga 114049  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||| | || || ||||||||||||    
T  114048 agtgttcagtgaccataagagcttgaaatatctgtttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgatttt 113949  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  113948 gggttgaactatcatccgggtaacgccaatgtagttgcaga 113908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33097 - 32763
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||    
T  33097 gaaccttttgatgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgatga 32998  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||  |||| |||||||||||    
T  32997 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggcattatctgtaccgttccagatttgaagt 32898  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||    
T  32897 atttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggt 32798  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  32797 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgc 32763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7704 - 7363
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7704 cgatgaaccttttgtggtatactttgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtaatgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 7605  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||    
T  7604 agaattcatgagaagaattatctgacgcatgatttagagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttttatggttctaggtttg 7505  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  7504 aggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagatttgaatatgaggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactt 7405  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7404 tggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 7363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Original strand, 23697 - 24034
Alignment:
Q  8 atgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgag 107  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   | || |||||||||||     
T  23697 atgaaccttttgttgtatattctgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaggtggtagctgtggtttaaagacagttgaa 23796  T
Q  108 gattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaa 207  Q
     |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  23797 aattcatgagcgaaattatcctacgcatgatttggagttggttgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaa 23896  T
Q  208 gtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  23897 gtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttattagatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttg 23996  T
Q  308 gtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgca 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23997 gtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgca 24034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 48790 - 48453
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||| |||||||  |||||||| || |||||||| |    
T  48790 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatccaagatggtaaggtagtagtctatgcttctaggcagttgagaa 48691  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  48690 ttcatgaaaagaattatcgtacacatgatttggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagt 48591  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  48590 gtttagtgatcacaaaagtctgagatatttgtttgatcaaaaagaattgaatatgagctagagaagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggt 48491  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48490 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 48453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 109316 - 108983
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  109316 gaaccttttgttgtttattgcgatgtgtccgagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 109217  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  109216 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttgaagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttctagatttgaagt 109117  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  109116 gtttagtgatcacaaaagtttgaaatatttatttgattagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagctgttgaaggattatgattttggt 109017  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  109016 ttgaattaacatccgggtaaagctaatgtggttg 108983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Original strand, 55607 - 55876
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55607 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtatttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 55706  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  55707 agagttcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttagctgccgtggtttttgtgttgaagatgtggagacattacttatatggttcgagttttg 55806  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaag 275  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  55807 aggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatatttattcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaag 55876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 62912 - 62988
Alignment:
Q  271 agaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  62912 agaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcaga 62988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 50492 - 50828
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  50492 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttga 50591  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  50592 ggattcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttga 50691  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    ||| || ||||| || || |||||||||||| |||||||| | || || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  50692 agtattcagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgataaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgaactgttgaaggattatgatttt 50791  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  50792 gggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttg 50828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 202085 - 202425
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  202085 gatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggcttatgtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttcgagacagttga 202184  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| |    
T  202185 gaattcatgagcggaattaccctacgcatgatttagagttggctgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttta 202284  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  202285 ggtgtttagtgatcacaggagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgatttt 202384  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  202385 ggtttgaattatcatccaggtaaagcaaatgttgttgcaga 202425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 324390 - 324053
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |    
T  324390 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctagacagttaagaa 324291  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  324290 ttcatgaaaagaattttcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttattttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaggt 324191  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || || ||||||||||||    
T  324190 gtttagtgatcacaagagtctcaaatatttatttgatcagaaggagttaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggt 324091  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  324090 ttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgcaga 324053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 118872 - 118575
Alignment:
Q  50 taggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagc 149  Q
    ||||||||||||||||||| |||   || ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||    ||||||||||| || ||| | || |||||    
T  118872 taggtggtgtgcttatgcaggataacaaggtagtggcgtatgcatcgagacagttgagaattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagc 118773  T
Q  150 tgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcag 249  Q
    ||  || ||||||||  | || || ||||||||||| ||||||||||| |||||   |||||| ||||| || || ||| |||| |||||||||||||||    
T  118772 tgcagttgtctttgtgcttaagatttggagacattatttgtatggttctagattattagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcag 118673  T
Q  250 aaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  118672 aaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcaga 118575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 23691 - 24030
Alignment:
Q  8 atgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgag 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23691 atgagccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttaggtttatgaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcgagacagttgag 23790  T
Q  108 gattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaa 207  Q
     ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  23791 aattcatgagaagaattacccgacgcatgatctagagttggcggacgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgag 23890  T
Q  208 gtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttg 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||     
T  23891 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaacagaaggaattgaatatgaggcagagaaggtggcttaaattgttgaaagattatgacttta 23990  T
Q  308 gtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  23991 ggttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgtcgcaga 24030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1569 - 1232
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||      
T  1569 gaaccttttgtagtctattgtgatgcttctaagttcggtttgggtggtgtgttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagctgagag 1470  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  1469 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagt 1370  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  1369 gtttagtgaccacaaaagtttgaaatatttgtttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatgacttgagttattaaaagattatgattttggc 1270  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1269 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcaga 1232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6436 - 6099
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  6436 gaaccttttgttgtttactgtgatgcgtccaagatgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatacttctaggcagttgagga 6337  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  6336 ttcatgagaagaattatcctacgcatgatttagagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggccttacttgtacggtttcagatttgaggt 6237  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6236 gttcagtgatcataaaagtttgaactatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgctaaaggattatgattttggt 6137  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6136 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 6099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28306 - 27977
Alignment:
Q  14 cttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattca 113  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28306 cttttgttttttattgtgatgcttccaagttgggcttaggtggtttttttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattca 28207  T
Q  114 tgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttt 213  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  28206 tgaaaagaattatcctacacatgatttggattttgctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtattt 28107  T
Q  214 agtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttga 313  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  28106 agtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttga 28007  T
Q  314 attatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  28006 attaccatccaggtaaagctaatgtggttg 27977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 323
Target Start/End: Original strand, 50800 - 51113
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  50800 gaaccttttgttgtttattgtgatgcttccaagttcggattgggtggtgttttgatgcaggatggcaaagtagtagcttatgcttctaggcagttgaggg 50899  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  50900 tacatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatatagaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 50999  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| || || ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51000 gttcagcgatcacaagagtctaaaatatttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 51099  T
Q  310 ttgaattatcatcc 323  Q
    |||||||| |||||    
T  51100 ttgaattaccatcc 51113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 323
Target Start/End: Original strand, 66222 - 66535
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  66222 gaaccttttgttgtttattgtgatgcttccaagttcggattgggtggtgttttgatgcaggatggcaaagtagtagcttatgcttctaggcagttgaggg 66321  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  66322 tacatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatatagaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 66421  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| || || ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66422 gttcagcgatcacaagagtctaaaatatttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 66521  T
Q  310 ttgaattatcatcc 323  Q
    |||||||| |||||    
T  66522 ttgaattaccatcc 66535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 323
Target Start/End: Original strand, 59834 - 60147
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  59834 gaaccttttgttgtttattgtgatgcttccaagttcggattgggtggtgttttgatgcaggatggcaaagtagtagcttatgcttctaggcagttgaggg 59933  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  59934 tacatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 60033  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| || || ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60034 gttcagcgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 60133  T
Q  310 ttgaattatcatcc 323  Q
    |||||||| |||||    
T  60134 ttgaattaccatcc 60147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 683 - 1024
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  683 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcatcgagacagttg 782  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  783 agaattcatgaaagaaattaccctacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtacttaagatatggagaaattacttgtatggttcgagatttg 882  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    |||| || || || ||||||||| | |||||||| |||||||  |||||||| |||||||| ||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  883 aagtattcagcgatcacaagagtctaaaatatttatttgatccaaaggaattcaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaagactatgattt 982  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||  ||||  |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  983 tgagttgagctatcatccaggtaaagctaatcttgtagcaga 1024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2583 - 2242
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2583 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaagtggtgtgcttatgcaagatgccaaagtagtagcttatgcttcgagacagttg 2484  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | || ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2483 agaattcatgaaaagaattaccctacgcacgatttagagttagccgctgtggtctttgtacttaagattcagagacattacttgtatggttcgagatttg 2384  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  2383 aagtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgctttatcagaaggaaatgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaaagattatgattt 2284  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||  ||||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2283 tgagttgagctatcatctaggtaaagctaatgttgtagcaga 2242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3861 - 3525
Alignment:
Q  11 aaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  3861 aaccttttgttgtttattgtgaagcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcatgatggcaaggtggtagcttatgcttctaggaagttgaggat 3762  T
Q  111 tcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtg 210  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  3761 tcatgaaaagaattattctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttgaagtg 3662  T
Q  211 tttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtt 310  Q
    |||||||| |||||   | ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3661 tttagtgatcacaaatatctgagatatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggtt 3562  T
Q  311 tgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3561 taaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 3525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6906 - 6570
Alignment:
Q  11 aaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggat 110  Q
    ||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  6906 aacctttcgtggtatattgtgatgtgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtggtagcttatgcttcgagacagttgataat 6807  T
Q  111 tcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtg 210  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  6806 tcatgagaagaattaccctatgcacgatttagagttggctaatgtggtctttatattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggta 6707  T
Q  211 tttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtt 310  Q
    ||||||||  | | ||||||||| ||| | || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| | ||||  |    
T  6706 tttagtgataatacgagtttgaagtatctattcgatcagaaggaatggaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattataactttgagt 6607  T
Q  311 tgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    | |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6606 taagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcaga 6570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 666 - 327
Alignment:
Q  8 atgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||    
T  666 atgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctgggcagttgag 567  T
Q  108 gattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaa 207  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  566 gattcatgaaaagaattagcctacacataatttggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatttggagatattatttgtacggttccagatttgaa 467  T
Q  208 gtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttg 307  Q
    ||||||||||| || || | |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  466 gtgtttagtgatcataaaattttgaaatatttatttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgattttg 367  T
Q  308 gtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  366 gtttgaattaccatccgggtaaagctaatatggttgcaga 327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 5706 - 6037
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||||    
T  5706 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgagtccaagttgggcttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaagtggtaggttatgcttctaaacagttga 5805  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||||    
T  5806 ggattcatgaaaagaattatgctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgtattgaaaatttggagacattatttgtacgactctagatttga 5905  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  5906 ggtgtttagcgataacaagagtttgaaatatttatttgaccaaaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggcttgaattgttgaaggactatgatttt 6005  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgt 338  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6006 ggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgt 6037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 1474 - 1811
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  1474 gaaccttttgtggtttattgtgatgcgtccaagttgagcttaggcggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcatttgagga 1573  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  1574 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacagttccagatttgaagt 1673  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||||| || || ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1674 atttagtgatcataaaagcctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggt 1773  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1774 ttgaattaccatccgggtaaagcaaatgtggttgcaga 1811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 16593 - 16934
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  16593 cgatgaaccttttgttgtgtattgtgatgcgtacaagttgggcttaggtagtgtgcttatgcaggatggtaaggtagtagcttatgcatcgagacagttg 16692  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    |||||| |||| || ||| | || |||||||  |||||| ||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16693 aggattcatgaacgaaattatgctactcatgatcttgaattagctgcagtggtccttgtactcaacatttggagacattacttgtatggttcgagatttg 16792  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16793 aagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattt 16892  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16893 tgagttgaattatcaaccaggtaaagctaatgttgttgcaga 16934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 593 - 930
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| |||||||| || |||||||||     
T  593 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgttcaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtgctagcgtatgcttctaggcagttgaggg 692  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  693 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttaaagt 792  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  793 atttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggt 892  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  893 ttaaattaccattcggttaaagctaatgtggttgcaga 930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 69056 - 68719
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||  || ||| ||||      
T  69056 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttctaagttcggtttgggtggtgtgttgatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttttaggcagctgagag 68957  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||  ||||||||||    
T  68956 ttcatgagatgaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcatgatttgaagt 68857  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  68856 gtttagtgaccacaaaagtttgaattatttgtttgatcataaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggc 68757  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  68756 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcaga 68719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Original strand, 3575 - 3910
Alignment:
Q  12 accttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggatt 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||  || ||||||||  ||    
T  3575 accttttgtggtttattgtgatgcgtctaaattgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttttaggcagttgagagtt 3674  T
Q  112 catgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgt 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||| |    
T  3675 catgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttgcagacttgaagtat 3774  T
Q  212 ttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggttt 311  Q
    | ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||    
T  3775 tcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggctt 3874  T
Q  312 gaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3875 gaattaccacccgggtaaagctaatgtggttgcaga 3910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 12528 - 12865
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| || ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||      
T  12528 gaaccgtttgttctgtattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagacggcaaagtggtagcgtatacttctaggcagttgagag 12627  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  12628 ttcatgaaaagaattatcctactcatgatttggagttggctgtggtggttttcgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggt 12727  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| | || || ||||||||||||||     
T  12728 gttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttggc 12827  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  12828 ttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcaga 12865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8061 - 7721
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  8061 gatgaaccttttgtggtatattgttatgcgtctaagctgggtttaggtggcgtgcttatgcaagatggaaaagtagttgcttatgcttcgagatagttga 7962  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  7961 gaattcatgagaagaattaccctacgcatgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggggacattatttgtacggttcaagatttga 7862  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
      |||||||||| || ||||||||||| | | |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  7861 gctgtttagtgatcataagagtttgaagtctctgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgatttt 7762  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7761 gagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 7721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41386 - 41047
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||| ||   ||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  41386 gatgatccttttgttgtttactatgatgcgtccaagttgggcttaggaggtgttttgatgcaaaatac-aaagtggtagcttatgcttctaggcagttga 41288  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||  ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  41287 ggattcatgaaaagaattaccctacccatgatttggagttggctgcggtgatttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttga 41188  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  41187 ggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgctaaaggattatgatttt 41088  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41087 ggttttgattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 41047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 266
Target Start/End: Original strand, 47075 - 47288
Alignment:
Q  52 ggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctg 151  Q
    ||||||||||||||| |  || || | || || ||||||||||| || |||||||   | ||||||||||||||||| || || ||||| || ||| | |    
T  47075 ggtggtgtgcttatgtagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttagaattaacgg 47174  T
Q  152 atgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaa 251  Q
       | || | || |||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47175 caattgtatatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagag-ttgaagtatttgtttgatcagaa 47273  T
Q  252 ggaattgaatatgag 266  Q
      | |||||||||||    
T  47274 atagttgaatatgag 47288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35156 - 34819
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  35156 gaaccttttgtggtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtagtagcttatgcttctaggcagttgagga 35057  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35056 ttcacgaaaagaattatcctactcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagt 34957  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || |||||||||||||||    
T  34956 attcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggt 34857  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34856 ttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcaga 34819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28660 - 28566
Alignment:
Q  253 gaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28660 gaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcaga 28566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13884 - 13549
Alignment:
Q  12 accttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||  ||    
T  13884 accttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgagagtt 13785  T
Q  112 catgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgt 211  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  13784 catgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtat 13685  T
Q  212 ttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggttt 311  Q
    ||||||| || || ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  13684 ttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggctt 13585  T
Q  312 gaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13584 gaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcaga 13549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Original strand, 6434 - 6697
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  6434 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggtcgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 6533  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  6534 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 6633  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  6634 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 6697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 80452 - 80786
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||      
T  80452 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaaactgggcttaggaggtgttctgatgcaagatggaaaggtggtagcttatgcttctaggcagttaagag 80551  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  80552 ttcatgaaaagaattatcctactcacgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagt 80651  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80652 attcagtgatcacaagagtatgaaatatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 80751  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  80752 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgc 80786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14158 - 13817
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  14158 cgatgaacctttcgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttg 14059  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    |||| |||||| || ||| | || |||||||  |||||||||||  | || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14058 aggattcatgaacgaaattgtcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttg 13959  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||| |  || || || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13958 aagtgttcaacgatcataaaagtctgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattt 13859  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  13858 tgggttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgtcgcaga 13817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4435 - 4098
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||  |||||||||    
T  4435 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgtttctaggtagttgagga 4336  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  4335 ttcatgaaaagaattatccaacacatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccaaatttgaagt 4236  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||    
T  4235 gtttagtgatcacaaaagtttgaactatttatttgatcagaaagaaatgaacatgaggcagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggt 4136  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  4135 ttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcaga 4098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 42724 - 43064
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || || |||||||    
T  42724 gatgaaccatttgttgtatatcgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcagaatgataaagtagtagcttatgcatcgaggcagttga 42823  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    ||||||||||    ||||||||||| || ||| | ||||||||||  || || |||||| |  |||| ||||| |||||  |||  ||||| ||||||||    
T  42824 ggattcatgaacgtaattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtagtttttgtacttcaaatttggaggcattatctgtgcggttctagatttga 42923  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  42924 agtgttcagtaatcataaaagtttgaagtatttattctaccagaaagaattaaacatgagacagcgaaggtggctagaattgctaaaagattatgacttt 43023  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43024 ggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcaga 43064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 307
Target Start/End: Original strand, 11858 - 12113
Alignment:
Q  52 ggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || || |||||||| || |||||  | | ||||||||||| |||||| || || || |||||||||||||| |    
T  11858 ggtggtgtgcttatgcaagatgggcatgtggtggcttatgcctcgagacaactaaagattcatgagaggaattacccgacacatgatttggagttagcag 11957  T
Q  152 atgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaa 251  Q
     ||| || |||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  11958 ctgtagtgtttgtacttaaggtatggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaa 12057  T
Q  252 ggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttg 307  Q
    ||| ||||||||||||||| | |||||| | ||||| ||||| || ||||||||||    
T  12058 ggagttgaatatgagacagcggagatggttggagttcttaaaggactatgattttg 12113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 39377 - 39716
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  39377 gatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtggtagctgatgcttcgagacaattga 39476  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
      |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  39477 aaattcatgagcggaattatcctacgcatgatttggagttggctgttgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttga 39576  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || | |||||||| ||||| || || ||||| |||    
T  39577 ggtgtttagcgatcacaagagtttgagatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgacggtggcttgaattgttgaaggactatga-ttt 39675  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
      ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39676 atttttaattatcatcaaggtaaagctaatgttgttgcaga 39716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5561 - 5220
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  5561 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggaggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttg 5462  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    ||||||||||| || ||| | || |||||||  ||| | |||||| | || |||||||||||||| |||||   ||| |||||||    
T  5461 aggattcatgaaggaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtgttttttgtactcaagatatggagacattatttgtacaattctagatttg 5362  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||| || || || || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  5361 aagtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattt 5262  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5261 tgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcaga 5220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12691 - 12350
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  12691 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggaggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttg 12592  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    ||||||||||| || ||| | || |||||||  ||| | |||||| | || |||||||||||||| |||||   ||| |||||||    
T  12591 aggattcatgaaggaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtgttttttgtactcaagatatggagacattatttgtacaattctagatttg 12492  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||| || || || || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  12491 aagtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattt 12392  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12391 tgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcaga 12350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 308 - 644
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||      
T  308 gaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagag 407  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||  | |||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  408 ttcatggaaggaattatcctacacatgatttggagttggctgcagtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttatacggttccagatttgaagt 507  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  508 atttagtgaccataaaagtttaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggctagagctgttgaaagattatgattttggt 607  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  608 ttgaattaccat-cgggtaaagcaaatgtggttgcaga 644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40187 - 39906
Alignment:
Q  66 gcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgta 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||  ||| ||||| |||    
T  40187 gcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctacacacaatttagagttggctactgtagtcttcgta 40088  T
Q  166 ttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatga 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  40087 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcataagagtttgaagtatctatttgatcagaaggaatggaatatga 39988  T
Q  266 gacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| |||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39987 gacagcgaaggtagcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccggttaaagctaatgttgttgcaga 39906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 22805 - 23142
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  22805 gaaccttttgttgtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtatgcttatgcagaataacaaggtagtggcttatgcatcgaggcagttgagga 22904  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||    ||||||||||| || ||| | ||||||||||  || ||||||||  | || ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22905 ttcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtagtctttgtgcttaagattaggagacattatttgtatggttctagatttgaagt 23004  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  23005 gtttagtgatcataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagactatgattttggg 23104  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  23105 ttgaattatcatccaggtaaagttaatgtggttgcaga 23142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 25149 - 25490
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  25149 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatacaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttg 25248  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    ||||||||||| || ||| | || |||||||  |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  25249 aggattcatgaacgaaattatcctactcatgatctagaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttg 25348  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||| || || || || ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  25349 aagtgttcagcgatcataaaagtttgaataatttatttgatcagaaagaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaatattatgattt 25448  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25449 tgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcaga 25490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 150255 - 149919
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || || |||||      
T  150255 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagtgtatgcttctaggcaattgagag 150156  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  150155 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattacttgtacggttcctgatttgaagt 150056  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     ||| | || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || |||||||||||||||    
T  150055 attttgggatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggt 149956  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  149955 ttgaattaccatccgggtaaagc-aatgtggttgcaga 149919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 338
Target Start/End: Original strand, 194324 - 194652
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  194324 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaaattgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtagtagcttatgcttctaggcagttaagaa 194423  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  194424 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagattttaagt 194523  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     ||  |||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  194524 attcggtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggaggtgttgaaggattatgattttggc 194623  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgt 338  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  194624 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgt 194652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 181604 - 181280
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || |||| |||||| || |||||||   | ||||    
T  181604 tttgttgtgtattgtgatgcttcaaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcataatcgttaggttgtggcttgtgcttcgaggcagttgaaagtacatg 181505  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||  | || |  || || | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  181504 agaagaattatccgactcatgatttggaactggcggccgttgtatattcattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 181405  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||| | ||||   | || |||| |||||||   |||| |    
T  181404 tgaccacaagattttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaatgaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagt 181305  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttg 340  Q
    |||||||| || || ||||||||||    
T  181304 tatcatcccgggaaggctaatgttg 181280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 6771 - 7099
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  6771 tttgttgtttactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgaggattcatg 6870  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  6871 agaagaattatcctacgcacgatctggagttggctgcggtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcag 6970  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||||    
T  6971 tgatcacaaaagcttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaat 7070  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  7071 taccatcctggtaaagccaatgtggttgc 7099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3270 - 2970
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||    
T  3270 gatgaaccgtttgtggtatattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatccaagatggcaaagtagtagcttctgcgtcgagatagttga 3171  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||| |  ||||| |||| ||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3170 gaattcatgaaagaaattaccctatgcacgatttagagttggctgctgtggtttttatattgaaaatatggagacattacttgtatgattcgagatttga 3071  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3070 ggtgttcagtgatcacacgagtttgaaatatttgttcgataagaaggagttgaatataaggcagcaaaggtggcttgaattgttgaaagattatgatttt 2971  T
Q  307 g 307  Q
    |    
T  2970 g 2970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 9425 - 9765
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||    
T  9425 gatgaaccttttgttgtatactgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggagtgcttatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttcgagaaagttga 9524  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  9525 ggattcatgagcggaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggcttttgtgttaaaaatttggagacattatttctacggttccagatttga 9624  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
     ||||||||||| || || ||| |||| ||  | |||||||| || |||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  9625 ggtgtttagtgatcataaaagtctgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggattgtgatttt 9724  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9725 agtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcaga 9765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1010 - 676
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||      
T  1010 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttaagag 911  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||     
T  910 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaagc 811  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  810 gttcagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgaccagaaggaatggaatatgagacagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggt 711  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  710 ttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgc 676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 11406 - 11740
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||      
T  11406 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggcttaggaggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcagttaagag 11505  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11506 ttcatgaaaagaattatcctactcacgatttggagttgggtgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggtattatttgtatggttcgagatttgaagt 11605  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11606 attcagtgatcacaagagtctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 11705  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| || |||||    
T  11706 ttgaattaccatcctagtaaagctaacgtagttgc 11740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 218037 - 218374
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  218037 gatgaaccttttgcggtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaagtagtagcttatgcatcgagacagttga 218136  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    ||||||||||    ||||||| ||| || ||| | || |||||||  ||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  218137 ggattcatgaacgaaattatcgtactcatgatcttgaattagctgcagtggtttttgtgcttaaaatatggagacattatttgtacggttctagatttga 218236  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||| ||   | |  | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  218237 agtgttcag---caatcatagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgatttt 218333  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  218334 gggttgaactataatccaggtaaagctaattttgttgcaga 218374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3604 - 3263
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  3604 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgttcaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttg 3505  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    |||||||||||  | ||| | || |||||||  |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  3504 aggattcatgaacgaaattatcctacttatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttg 3405  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    |||||||||| || || || ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||     
T  3404 aagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatgtgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaatattatgattg 3305  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3304 tgggttgaattattatccaggtaaagctaattttgttgcaga 3263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Original strand, 46019 - 46354
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  46019 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcatctaaattgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctagacagttgagga 46118  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  46119 tacatgaaaagaattatcctatgcatgatttggagttggctgtggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagt 46218  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  46219 attcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggc 46318  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgca 345  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  46319 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgca 46354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 40953 - 41287
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||| |      
T  40953 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtg 41052  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  41053 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 41152  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | || |||| |||||||||     
T  41153 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggc 41252  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  41253 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 41287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 6509 - 6848
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgttt--attgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgag 107  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| | || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  6509 gaaccttttgttgtgtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtgatgttcttatgcaggatagcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttgag 6608  T
Q  108 gattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaa 207  Q
     |||||||||   |||||||| || || ||| | || |||||||  |||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6609 aattcatgagcgaaattatcccactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgcttaagatttggagacattacttgtatggttctagatttgaa 6708  T
Q  208 gtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttg 307  Q
    ||||| ||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  6709 gtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaaggaaggtggcttgaattgttgaaagactatgattttg 6808  T
Q  308 gtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6809 ggttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcaga 6848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 10677 - 11014
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||||||||| |||||   ||| |||||||| || ||||||||      
T  10677 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggctcaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtgtaagcatatgcttctaggcagttgagag 10776  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  10777 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaattttgaggcattacttgtacggatccagatttgaagt 10876  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||  ||| || ||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||     
T  10877 atttagtgatcacaaaaatttaaaatatttatttgattggaaagagttgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggc 10976  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10977 ttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcaga 11014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 14447 - 14784
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||||||||| |||||   ||| |||||||| || ||||||||      
T  14447 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggctcaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtgtaagcatatgcttctaggcagttgagag 14546  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  14547 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaattttgaggcattacttgtacggatccagatttgaagt 14646  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||  ||| || ||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||     
T  14647 atttagtgatcacaaaaatttaaaatatttatttgattggaaagagttgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggc 14746  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14747 ttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcaga 14784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21669 - 21362
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |    
T  21669 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttaagaa 21570  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21569 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggttgtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagt 21470  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||||| || || ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21469 atttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggt 21370  T
Q  310 ttgaatta 317  Q
    ||||||||    
T  21369 ttgaatta 21362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28214 - 27873
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagta-gcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || ||| ||||||||||| || ||||||    
T  28214 gatgaaccttttattgtttattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaggtggtaagcttatgcttctaggcagttg 28115  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  28114 aggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttagtgttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcaatatttgtacggctccagatttg 28015  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  28014 aggtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctatttgaccaaaaggaattgaacatgaggcaaagaatatggcttgaattgttgaaggactatgattt 27915  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27914 tggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcaga 27873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4801 - 4464
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  4801 gatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcttccaagttaagcttaggtggtgagcttatgcaggatggcaagatagtagcttatgcatcgagacagttga 4702  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    ||||||||||    ||||||||||| || ||| | || ||||||   |||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4701 ggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctacagtggtctttgtgctcaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttga 4602  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||| ||||| || || ||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4601 agtgttcagtgatcataaaagtctgaattaattgtttgattagaaggaattgaatatgagacagcaaagatggcttgaattgttgaaagattatgatttt 4502  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  4501 gggttgaattatcaaacggttaaagctaatgttgttgc 4464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1592
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1393 gatgaaccttttgtggtatattatgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagatagttga 1492  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1493 gaattcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 1592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 97 - 347
Target Start/End: Original strand, 31460 - 31710
Alignment:
Q  97 agacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggtt 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31460 agacaattgagaattcatgagcggaattaccctacgcacgatttagagttggctgatgtggtttttgtgttgaaaatatggaaacattacttgtatggtt 31559  T
Q  197 cgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaaga 296  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||    
T  31560 ctagatttgaagtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgttagatcagaaggaattgaatatgagccagcgaaggtggcttgaattgttgaaaga 31659  T
Q  297 ttatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31660 ttatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgtggttgcaga 31710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 275
Target Start/End: Original strand, 34368 - 34636
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  34368 gatgaaccttttatagtgtattgtgatgcgtccaagttgggtttgggtggtgtgcttatgcaagataacaaggttgtagcgtatgcatcaaggcagttga 34467  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  34468 ggattcatgaatggaattatcctacgcatgatttggagttggctgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttga 34567  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaag 275  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34568 ggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaag 34636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 12155 - 12484
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||  | ||||||| |||||        ||||||||||| ||  |||||||||    
T  12155 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaaggtggta--------gcttatgcttctaggaagttgagga 12246  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12247 ttcatgaaaaaaattatcctacgcatgatctggagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 12346  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || ||||| || || || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||  |||| || || ||||||||||||    
T  12347 tttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgattagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagaactgttgaaggactatgattttggt 12446  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  12447 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcaga 12484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 1975 - 2312
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||| |||| || || ||| |||||||||| | |||||| || |    
T  1975 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaaaatggcaaggtggtatcttatgcttctacacagttaagaa 2074  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  2075 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcagtagtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 2174  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2175 gttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgagacagaggagatggttagagctgttgaaagattatgattttggt 2274  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  2275 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcaga 2312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8747 - 8409
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| | || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||  | |    
T  8747 gaacgttttgttgtttactgtgatgcgtctatgttgtgcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtcgtagcgtatgcttctaggcagttatgaa 8648  T
Q  110 ttcatgagaagaa-ttatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaag 208  Q
    ||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||    
T  8647 ttcttgaaaaaaaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatctggaggcactgtttgtatggttccagatttgaag 8548  T
Q  209 tgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttgg 308  Q
    | || ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || ||||||||||||||    
T  8547 tattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgg 8448  T
Q  309 tttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
     |||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  8447 cttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcaga 8409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23900 - 23567
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  23900 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagaa 23801  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  23800 tgcatgagaagaactatcctactcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 23701  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||| |||| |||||||||||||||||     
T  23700 gttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggc 23601  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  23600 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttg 23567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 199 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20891 - 20747
Alignment:
Q  199 agatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagatt 298  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||| |||| |||||||    
T  20891 agatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttcgagctgttgaaagatt 20792  T
Q  299 atgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  20791 atgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttg 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 55520 - 55857
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||| |||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  55520 gaaccgtttgttgtttactgcgatgcttctaagctgggcttaggaggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 55619  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  55620 ttcatgaaaagaattctcgtacgcatgatctggagttggctgcagtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 55719  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  55720 gttcagtgatcataagagtatgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggc 55819  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  55820 ttcaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcaga 55857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 32297 - 32634
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||      
T  32297 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagag 32396  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  32397 tgcatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagt 32496  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||| | || || ||||||||||||||     
T  32497 gttcagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggg 32596  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32597 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcaga 32634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41938 - 41610
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  41938 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 41839  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  41838 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 41739  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  41738 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 41639  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  41638 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 41610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 44469 - 44135
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||| |  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  44469 gaaccgttggttgtttactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtcttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 44370  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  44369 tacatgagaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 44270  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| | || || ||||||||||||||     
T  44269 gtttagtgatcataaaagtttgaattatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagcttttgaaggattatgattttggc 44170  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  44169 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgc 44135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20806 - 20472
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||| ||      
T  20806 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgattcaagatggcaaagtggtagcttatgcttataggcagttaagag 20707  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20706 ttcatgaaaagaattatcccactcatgatctggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 20607  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || ||||| || |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20606 attcagtgatcataagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggc 20507  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  20506 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgc 20472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 169 - 345
Target Start/End: Original strand, 57970 - 58146
Alignment:
Q  169 aaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagac 268  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  57970 aaaatttggagacattatctgtatggttttagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggc 58069  T
Q  269 agagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgca 345  Q
    || |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  58070 agcgaaggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgca 58146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 120
Target Start/End: Original strand, 27863 - 27977
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| || || ||||||    
T  27863 cgatgaaccatttgttgtatactgtgatgcgtctaagttgggtttaggtggcgtggttatgcagaatgataaagtagtagcttatgcatcgaggcagttg 27962  T
Q  106 aggattcatgagaag 120  Q
    |||||||||| ||||    
T  27963 aggattcatgtgaag 27977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 742 - 473
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  742 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcttccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaaactgttg 643  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    ||  |||||||||||||||| || |  || ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  642 agagttcatgagaagaattacccgagacatgatttagagttagccgccgttgtttttgtgttgaagatttggagacattacttatatggttcgagatttg 543  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaag 275  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  542 aggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaag 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 332 - 19
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||| |||||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||    
T  332 gaaccgtttgttgtttactgtgatgtgtctaagctgggcttaggaggtgttttgattcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggtagttgagga 233  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| ||||||| || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  232 ttcatgagaagaattatcccactcatgatctggagttggcggcagtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 133  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132 gttcagtgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 33  T
Q  310 ttgaattatcatcc 323  Q
    |||||||| |||||    
T  32 ttgaattaccatcc 19  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35799 - 35462
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||      
T  35799 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtgatagcgtatgcttctagacagttgagag 35700  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||| | |||||| ||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  35699 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagtaagccgcggtggtctttgtttagaaaatttggaagcattatttgtacggttccagatttgaagt 35600  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||||| ||||| ||| | |||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||   ||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||    
T  35599 atttagtgatcacaaaagtctaaaatattttttcaatcagaaagatttgaacatgaagtagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggt 35500  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35499 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 35462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42603 - 42266
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||      
T  42603 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggaaaggtagtagcttatgcttctaggcagttgagag 42504  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  42503 ttcatgaaaagaattatcctacgcaggatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgatgt 42404  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||||| || |||||| | |||||||| |||||| ||||||| || || ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || || ||||||||||||    
T  42403 ttttagtgatcataagagtcttaaatatttatttgattagaaggagtttaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggt 42304  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  42303 ttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcaga 42266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1889 - 1607
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  1889 gatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttcgagacaattga 1790  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  1789 gaattcatgagcggaattatcctacgcatgatttggagttggctacggtggtttttgtgttaaaaatttggagacattatttatacggttccagatttga 1690  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgt 289  Q
     ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  1689 ggtgtttagtgatcactaaagtttgaaatatttatttgatcaaaatgaattaaatatgaggcaacgaaggtggcttgagttgt 1607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8317 - 8035
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  8317 gatgaaccttttgttgtatattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttcgagacaattga 8218  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  8217 gaattcatgagcggaattatcctacgcatgatttggagttggctacggtggtttttgtgttaaaaatttggagacattatttatacggttccagatttga 8118  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgt 289  Q
     ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  8117 ggtgtttagtgatcactaaagtttgaaatatttatttgatcaaaatgaattaaatatgaggcaacgaaggtggcttgagttgt 8035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 250299 - 249965
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  250299 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgagga 250200  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  250199 tacatgagaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcggtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggtttcagatttgaagt 250100  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| || | || ||||||||||||||     
T  250099 gttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggc 250000  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  249999 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgc 249965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 5858 - 6195
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  5858 gaaccttttgtggtttattgtgatgcgtctcaattgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtagtagcgtatgcttctagacagttgagaa 5957  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||  ||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  5958 ttaatgaaaagaattatcctacgcatgatctagagttggctgcggtgatttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttaaagt 6057  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  6058 attcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagatgttgaaggattatgattttggc 6157  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  6158 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcaga 6195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 182 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 4
Alignment:
Q  182 attacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgag 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  88 attacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaagatttgaatatgag 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 206
Target Start/End: Original strand, 8309 - 8509
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  8309 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcatccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatggttcgagacagttg 8408  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8409 agaattcatgagaagaattacccgacgcacgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 8508  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  8509 a 8509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 680 - 350
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  680 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgagtt 581  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||   ||||| ||| | ||       ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  580 ttcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttagctacggtggtttttttctt-------tggaggcattatttgtacggttccagatttgaagt 488  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || |||||||||||| ||    
T  487 atttagtgatcacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgatttttgt 388  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  387 ttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggtagcaga 350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6899 - 6565
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||      
T  6899 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggcttaggaggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcagttaagag 6800  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||   ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  6799 tgcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctacggtggtgtttgttttgaaaatctggagccattatttgtacggttccagatttgaggt 6700  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6699 gttcagtgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgaggttttaaaagattatgattttggt 6600  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  6599 ttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgc 6565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 4956 - 5290
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||      
T  4956 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggcttaggaggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcagttaagag 5055  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  5056 ttcatgaaaagaattatcctacacaagatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 5155  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5156 gttcagtgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaggtaattgaatatgaggcagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggt 5255  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    ||| |||| ||||  |||||||| ||||| |||||    
T  5256 ttggattaccatcttggtaaagccaatgtagttgc 5290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 31939 - 32273
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||||||||    
T  31939 gaaccgtttgtggtttattgtgatgcgtctaagctgggtttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctatgcagttgagga 32038  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  32039 tacatgagaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgttgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 32138  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| | ||| || | || ||||||||||||||     
T  32139 gttcagtgatcataaaagcttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggtagagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggc 32238  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||    
T  32239 ttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgc 32273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 347
Target Start/End: Original strand, 100188 - 100519
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  100188 tttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatg 100287  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    | |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  100288 aaaagaattatcctacacatgatctggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcaatatttgtatggttccagatttgaagtattcag 100387  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    ||| ||  | || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||| | || || || ||  ||||||||||||||    
T  100388 tgatcattaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaatatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggactacaattttggtttgaat 100487  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || ||||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  100488 taccatcatggtaaagccaatgtggttgcaga 100519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 10509 - 10843
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||      
T  10509 gaaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaagctgggcttaggaggtgttctaatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcagttaagag 10608  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| |||||| ||||||| || |||||| |||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  10609 tccatgaaaagaatgatcctacacatgatttgcagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtatggttctagattggaggt 10708  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10709 gttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagcggagatggcttgagttcttaaaagattatgattttggt 10808  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||    
T  10809 ttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgc 10843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 243 - 1
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  243 cgatgagctttttgtggtgtattgtgatgcatccaagtttggtttaggcggtgtacttatgcaggatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttg 144  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  143 agaattcatgagaagaattacccgactcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgcggtttg 44  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatca 248  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  43 aggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 15097 - 15439
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    |||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||  |  |||||||||    
T  15097 cgatgaacctcttgtggtgtattgttatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtagtaggttatggattgagacagttg 15196  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    ||||||||||| || ||| | || |||||||  |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  15197 aggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttg 15296  T
Q  206 aagtgtttagtgacca-caagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatt 304  Q
    ||||||| |  || ||  || ||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  15297 aagtgttcaacgatcataaaaagtctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgatt 15396  T
Q  305 ttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15397 ttgggttgaattatcatccatgtaaagctaatgttgttgcaga 15439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 13702 - 14038
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  13702 gaaccttctgttgtgtattgtgatacgtccaagttggcttt-ggtggtgtgcttatgcaggataacaaggtagtggcttatgcatcgagacagttgagaa 13800  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||    ||||||||||| || ||| | ||||||||||  |||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  13801 ttcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtggtctttgtgcttaagatttggagacattatttgtatggctctagatttgaagt 13900  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||     
T  13901 gttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattaaatttgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatggttttggg 14000  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  14001 ttgaattatcatcctagtaaagctaacgttgttgcaga 14038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 10077 - 10414
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  10077 gaaccgtttgtggtatattgtgatgcgtctaaattgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcttctagacaattaagga 10176  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  10177 tacatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggttgcggtgatttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagagttgaagt 10276  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     ||| |||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  10277 atttcgtgatcataaaagtttgaaatattaatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggg 10376  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||    
T  10377 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacaga 10414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 20291 - 20628
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  20291 gaaccgtttgtggtatattgtgatgcgtctaaattgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcttctagacaattaagga 20390  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  20391 tacatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggttgcggtgatttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagagttgaagt 20490  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     ||| |||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  20491 atttcgtgatcataaaagtttgaaatattaatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggg 20590  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||    
T  20591 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacaga 20628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 12919 - 13256
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||      
T  12919 gaaccgtttgttgtgtattgtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggcaagatggtagcttatgcttctaggcagttgagag 13018  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13019 ttcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggcttcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 13118  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
     || ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || || || |||||||||    
T  13119 attcagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggt 13218  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||||||    
T  13219 ttgaattaccatcctgataaagccaatgtggttgcaga 13256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 5970 - 6261
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  5970 gaaccttttgttgtctattgtgatgcatc-aagttgcgcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 6068  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  | ||||| |||||||||||    
T  6069 ttcatgaaaagaattatcctacagatgatttggagttggctgtggtggtttttgttttgaaaatgtggaggcatta-tttaacggttccagatttgaagt 6167  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgat 303  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  6168 gtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgaagatggcttgagctgttgaaggattatgat 6261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 10401 - 10692
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  10401 gaaccttttgttgtctattgtgatgcatc-aagttgcgcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgagga 10499  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  | ||||| |||||||||||    
T  10500 ttcatgaaaagaattatcctacagatgatttggagttggctgtggtggtttttgttttgaaaatgtggaggcatta-tttaacggttccagatttgaagt 10598  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgat 303  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  10599 gtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgaagatggcttgagctgttgaaggattatgat 10692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 115525 - 115862
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   || |||||  ||||||| || ||||||||||| |    
T  115525 gaaccttttcttctgtattgtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggataacaaggtagtgacttatgcatcgagacagttgagaa 115624  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||    ||||||||||| || ||| | || |||||||  |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  115625 ttcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgcttaagatttggagacattatttgtatggttatagatttgaagt 115724  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  115725 gttcagtgatcataaaagtctgaagtatttttttgatcagaaggaattaaatatgagaccacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgga 115824  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  115825 ttgaattatcatccaggtaaggctaacgttgttgcaga 115862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20535 - 20198
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||| |||||     
T  20535 gaaccgtttgttgtgtactgtgacgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaggatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgaggg 20436  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  20435 tacatgaaaagaattatcctactcacgatttgaagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcactacttgtatggttctagattcgaagt 20336  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  20335 gttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcagaagcagttaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggg 20236  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  20235 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacaga 20198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24697 - 24360
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||| |||||     
T  24697 gaaccgtttgttgtgtactgtgacgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaggatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgaggg 24598  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  24597 tacatgaaaagaattatcctactcacgatttgaagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcactacttgtatggttctagattcgaagt 24498  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  24497 gttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcagaagcagttaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggg 24398  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  24397 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacaga 24360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 347
Target Start/End: Original strand, 79240 - 79451
Alignment:
Q  136 gatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaat 235  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  79240 gatttagagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacatcacttgtatggttcgaggttcgaggtgtttagtgatcacaagagattgaagt 79339  T
Q  236 atttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaa 335  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  79340 atttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaa 79439  T
Q  336 tgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||    
T  79440 tgttgttgcaga 79451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 55407 - 55232
Alignment:
Q  57 tgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtg 156  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||| |||  |||    
T  55407 tgtgcttatgcaagatggcaaagtagtggcttatgcgtcgagacagttgagaattcatgagcggaattgccctacgcacgatttagagtta-ctgcagtg 55309  T
Q  157 gtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaa 233  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  55308 gtctttgtacttaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtttgaa 55232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 55445 - 55406
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttg 45  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  55445 cgatgaaccttttgtggtatattgtgatgcgtccaagttg 55406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 102 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 261902 - 261660
Alignment:
Q  102 gttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgaga 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  261902 gttgaggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccaga 261803  T
Q  202 tttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatg 301  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| |||| || || ||||| || ||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  261802 tttgaagtattcagtgatcacaagagtctgaagtacttatttgaccaaaaggaattgaacatgaggtagaggagatggcttgagttgttaaaagattatg 261703  T
Q  302 attttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  261702 atttttgtttgaattaccatccaggtaaagctaacgtagttgc 261660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 154 - 347
Target Start/End: Original strand, 277594 - 277787
Alignment:
Q  154 gtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaagg 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||| |    
T  277594 gtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcggaaag 277693  T
Q  254 aattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  277694 aattgaatatgaggcagcgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 277787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 344
Target Start/End: Original strand, 6310 - 6639
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||  | |||||||||||||        || |||||||| || ||| | |    
T  6310 gatgaaccgtttgttgtttattgtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggta--------gcgtatgcttctaggcagctaa 6401  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    |  | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  6402 gagtgcatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttctagatttga 6501  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||| | || || ||||||||||||    
T  6502 agtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttatttgaacagaaggagttgaacatgagacagaggagatggttggagctattgaaggattatgatttt 6601  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6602 gggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgc 6639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 279
Target Start/End: Original strand, 248 - 313
Alignment:
Q  214 agtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  248 agtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcataaggagttgaatatgaggcaaagaagatgg 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 180 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10485 - 10318
Alignment:
Q  180 acattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  10485 acattacttgtatggttcgagatttcaagtgttcagcgatcataaaagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagttgg 10386  T
Q  280 cttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10385 ctcgaattgttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 10318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 648 - 314
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| ||     
T  648 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcggg 549  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  548 tacatgagaagaactatcctacgcatgatctggagttggttgtagtagtgtttgttttaaaaatttggagagattatttgtacggttccagatttgaggt 449  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | || ||||||||||||||     
T  448 gttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggc 349  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  348 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 1454 - 1788
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |  ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| ||     
T  1454 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatataagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcggg 1553  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || | |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  1554 ttcatgagaagaactatcctacgcatgatctggagttggccgctgtggtgtttgttttaaaaatttggagacattatttgtacggatccagatttgaggt 1653  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |  ||||  | || ||||| ||||||||     
T  1654 gttcagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttatagttactgaaggattacgattttggc 1753  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  1754 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 1788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 9650 - 9973
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttc-aagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  9650 gatgaaccttttgttgtgtattgtgatgcgtccaagttgggcttagatggtgtgcttatgcacgataacaaggtagtggcttatgcatctgagacagttg 9749  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    || ||||| ||    ||||||||||| || ||| | || |||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  9750 agaattcaggaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtaattaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttg 9849  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    |||||                  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9850 aagtg------------------ttgtagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattt 9931  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  9932 tgggttgaattatcatccaggtatagccaatgttgttgcaga 9973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 155 - 344
Target Start/End: Original strand, 3170 - 3359
Alignment:
Q  155 tggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaagga 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3170 tggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggattgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttatttgatcagaagga 3269  T
Q  255 attgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3270 attgaatatgagacagcttagatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgc 3359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28619 - 28286
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || || ||| |      
T  28619 gaaccatttgttgtgtactgtgatgcatctaagctgggcttaggtggtgttctgatgcaagatgataaggtagtagcatatgcttctaggcaattgcgtg 28520  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  28519 ttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggt 28420  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||     
T  28419 gttcagtgatcataaaagtttgaattatttatttgaccagaaggaacttaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggc 28320  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    |||||||| ||||  ||||| || ||||| ||||    
T  28319 ttgaattaccatcatggtaaggccaatgtggttg 28286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 347
Target Start/End: Original strand, 17833 - 18172
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||| ||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  | ||||| || |||||||| ||||| || ||| |||||    
T  17833 cgatgtaccttttgtggtgtactgtgatgcatccaagttgggcttaggtggtgtgcttgt--aggatggcaaggtagtagcatatgcatcgagagagttg 17930  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    ||||||||||| || ||| | || |||||||  || | ||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||      
T  17931 aggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtagactttgtgctaaagatatggagacattatttgtaaggttctagattaa 18030  T
Q  206 aagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattt 305  Q
    ||||||| |  || || || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  18031 aagtgttcaaagatcataaaagtatgaagtatatgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaggattgtgattt 18130  T
Q  306 tggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18131 tgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcaga 18172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 157 - 347
Target Start/End: Original strand, 12759 - 12949
Alignment:
Q  157 gtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaat 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  12759 gtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttaaagtatttgttcgatcagaaagaat 12858  T
Q  257 tgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||  |  |  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12859 tgaatatgaggcagcgtagatggctaaaaatactgaaagaatatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 12949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 142 - 347
Target Start/End: Original strand, 177014 - 177219
Alignment:
Q  142 gagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgt 241  Q
    ||||| |||| |||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  177014 gagttggctgttgtggtttttctgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttat 177113  T
Q  242 ttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgt 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  177114 ttgatcagaagaaattgaatatgaggcaacgaaggtggcttgagttgttgaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgtcgt 177213  T
Q  342 tgcaga 347  Q
    ||||||    
T  177214 tgcaga 177219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 176925 - 176988
Alignment:
Q  9 tgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagat 72  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||||    
T  176925 tgaaccttttgtagtgtattgtgatgcatccaagttgggtttggatgatgtgcttaagcaagat 176988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 85136 - 85476
Alignment:
Q  7 gatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttga 106  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| || || |||||||    
T  85136 gatgaaccatttgttgtatactgtgatgcgtctaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaggataataaagtaatagcttatgcatcgaggcagttga 85235  T
Q  107 ggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttga 206  Q
    ||||||||||    ||||||||||| || ||| | |||||||||   || || |||||| | ||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  85236 ggattcatgaacgtaattatcctactcatgatcttgagttagctacagtagtttttgtacttaaaatttggaggcattatctgtatggttctagatttga 85335  T
Q  207 agtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgatttt 306  Q
    | |||| || || || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||   ||| |||||||||||     
T  85336 attgttcagcgatcataaaagttttaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggcaacgaaggtggcttgaattaaaaaaggattatgatttc 85435  T
Q  307 ggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  85436 gggttgaattaccatccgggtaagactaatgttattgcaga 85476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 188 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 92925 - 92829
Alignment:
Q  188 tgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttga 284  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  92925 tgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtttga 92829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 20197 - 20452
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  20197 gaaccttttgttgtttattgtgacgcgtccaagttgggcttaggcggtgttttgatgcaagacggtaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgagag 20296  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20297 ttcatgaaaagaattatcctacacgtgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagt 20396  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatga 265  Q
     || ||||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  20397 attcagtgatcaaaaaagtctaaaatatttatttgatcataaggaattgaacatga 20452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Original strand, 26892 - 27155
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || ||||||||| |||| |||||||   | ||||    
T  26892 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgctccaaggcagttgaaagtgcatg 26991  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || ||||| || ||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  26992 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatacattgaagatttggaggcaatatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 27091  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  27092 tgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 27155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 279
Target Start/End: Original strand, 25657 - 25771
Alignment:
Q  165 attgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 264  Q
    |||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25657 attgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatg 25756  T
Q  265 agacagagaagatgg 279  Q
    || || |||||||||    
T  25757 aggcaaagaagatgg 25771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 344
Target Start/End: Original strand, 16339 - 16518
Alignment:
Q  165 attgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 264  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16339 attgaagatttggaggcattatttgtatggttctaagtttgaggcgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatg 16438  T
Q  265 agacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    || || ||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| ||||||||| || || ||||||||||||||    
T  16439 aggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgc 16518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3613 - 3461
Alignment:
Q  9 tgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagg 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  3613 tgaaccttttgtgatatattgtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacaattgaga 3514  T
Q  109 attcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctt 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||    
T  3513 attcatgagaagaattaccctacgcacgatttagagttggttgttgtggtctt 3461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Original strand, 13959 - 14156
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||    
T  13959 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtcgaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaaccggtagcttatgcttctaggcagttgagga 14058  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaa 207  Q
    |||| || |||||||||||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14059 ttcaagaaaagaattatcctacacatgatttagagttaactgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaa 14156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Original strand, 22138 - 22335
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||    
T  22138 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtcgaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaaccggtagcttatgcttctaggcagttgagga 22237  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaa 207  Q
    |||| || |||||||||||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  22238 ttcaagaaaagaattatcctacacatgatttagagttaactgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaa 22335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 241 - 323
Target Start/End: Original strand, 14151 - 14233
Alignment:
Q  241 tttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatcc 323  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14151 tttgaacagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcc 14233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 241 - 323
Target Start/End: Original strand, 22330 - 22412
Alignment:
Q  241 tttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatcc 323  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22330 tttgaacagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcc 22412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 15333 - 15667
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagga 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||| |||||||| || |||||| |      
T  15333 gaaccgtttgttgtgtactgtgatgcatctaatttgggcttaggtggtgttctgatgcaagattgtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtg 15432  T
Q  110 ttcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagt 209  Q
    ||| |   |||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  15433 ttctttttaagaattatcctacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggt 15532  T
Q  210 gtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggt 309  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | || ||||||||||||||     
T  15533 gttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggc 15632  T
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  15633 ttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgc 15667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10856 - 10786
Alignment:
Q  277 tggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10856 tggcttgaattgttgaaggactgtgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 10786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 492595 - 492389
Alignment:
Q  6 cgatgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttg 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  492595 cgatgaaccttttgtggtgtattgtgatgcgttgaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttg 492496  T
Q  106 aggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttg 205  Q
    |||||||||||    ||||||||||| || ||| | || |||||||  |||||||||||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  492495 aggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatgaagacattatttgtacggttctagatttg 492396  T
Q  206 aagtgtt 212  Q
    |||||||    
T  492395 aagtgtt 492389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Original strand, 89311 - 89402
Alignment:
Q  256 ttgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  89311 ttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 89402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Original strand, 89989 - 90080
Alignment:
Q  256 ttgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  89989 ttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaga 90080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3118 - 2937
Alignment:
Q  166 ttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatga 265  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||    
T  3118 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttaaaatatttatttgatcagaaataattgaacatga 3019  T
Q  266 gacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    | |||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||    
T  3018 ggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagccaatatggttgcaga 2937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 226 - 93
Alignment:
Q  8 atgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgag 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  226 atgaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgag 127  T
Q  108 gattcatgagaagaattatcctacgcacgatttg 141  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| || ||||||    
T  126 gattcatgaaaagagttatcctacacatgatttg 93  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 95 - 1
Alignment:
Q  187 ttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggct 281  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  95 ttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6854 - 6526
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  6854 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 6755  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || ||||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  6754 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcggtcgttgtgtatgcattgaaaatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 6655  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  6654 tgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 6555  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  6554 tatcatcctgggaaggctaatgttgttgc 6526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 39886 - 39732
Alignment:
Q  189 gtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttg 288  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| || |||    
T  39886 gtatggttcaaggtttgaggtgtttaacgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattg 39787  T
Q  289 ttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttg 343  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39786 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttg 39732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 2501 - 2829
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  2501 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 2600  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  2601 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 2700  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  2701 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 2800  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  2801 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 2829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25074 - 24746
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  25074 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 24975  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  24974 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 24875  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  24874 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 24775  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  24774 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 24746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14588 - 14260
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  14588 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatg 14489  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  14488 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcag 14389  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || |   | || |||| |||||||   |||| |    
T  14388 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagt 14289  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  14288 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgc 14260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 677 - 346
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||    
T  677 tttgttgtatattgtgatgcatctaagttgggtttaggcggtgtgcttatgcaggacaataaggtagtagcttatgcatcgaggaagttgaggatccatg 578  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    |    ||||| ||||| || ||| | ||||| || |   |||| |||||  | || || ||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  577 aacgtaattaccctactcatgatcttgagttggcagcaatggtttttgtgcttaagatttggaggcattatctgtattgttctagatttgaagtgttcag 478  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaat 315  Q
    ||| || || |||||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| || |||  ||| ||||||||||| || ||||||    
T  477 tgatcataaaagtttgaagtatttatttgactagaaagaattaaatatgaggcagcgaaggtggctggaattgccaaaggattatgatttcgggttgaat 378  T
Q  316 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  377 taccatccgggtaagactaatgttgttgcaga 346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 194923 - 194769
Alignment:
Q  19 gttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgaga 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  194923 gttgtttattgtgatgcgtctaagttgggcttcggtggtgttttgatgcaagagggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaa 194824  T
Q  119 agaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaat 173  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  194823 agaattatcctacacatgatttggagttagctgcggtggtgtttgttttgaaaat 194769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1142 - 879
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || |||||||||||||| || || ||||   | ||||    
T  1142 tttgtggtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcgaggcatttgaaagtgcatg 1043  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || ||||  || || | |  |||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  1042 agaagaattatccgactcatgatttggaattggctgccgttgtgtattcattgaatatttggagtcattatctgtatggttctaattttgaggtgttcag 943  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  942 tgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgg 879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 238 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 96622 - 96522
Alignment:
Q  238 ttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  96622 ttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatg 96523  T
Q  338 t 338  Q
    |    
T  96522 t 96522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 72864 - 72606
Alignment:
Q  20 ttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaa 119  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || |||||||||||||| |||||||   | ||||||||    
T  72864 ttgtgtattgtgatgcttcaaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgttaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaa 72765  T
Q  120 gaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgac 219  Q
    ||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || || ||| || ||||| |||||  |||||||||| |  ||| | ||||||||||||    
T  72764 gaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcat-gaagatttggaggcattatctgtatggttctaagttttaggtgtttagtgac 72666  T
Q  220 cacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  72665 cacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 72606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6894 - 6628
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagc---ttatgcttcaagacagttgaggattc 112  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||| ||||||||  || || |||| || ||   ||||||||||||  ||||||   | |    
T  6894 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgttcttatgcagaatcgtcaagttgtggcctattatgcttcaaggaagttgaaagtgc 6795  T
Q  113 atgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtt 212  Q
    || ||||||||||||| || || |||| ||| || || |  || || | || |||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  |||||  ||||    
T  6794 attagaagaattatccgactcatgattaggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgatttgtt 6695  T
Q  213 tagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||    
T  6694 tagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgcggcaaagaagatgg 6628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16015 - 15848
Alignment:
Q  112 catgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgt 211  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || || |  || ||   || |||||| || ||||| |||||| |||||||||  |  ||||||||||    
T  16015 catgagaagaattatccaactcatgatttggaattggcggccgttgtgaatgcattgaagatttggaggcattacatgtatggttttaagtttgaagtgt 15916  T
Q  212 ttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||    
T  15915 tcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaatagttgaatatgaggcaaagaagatgg 15848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25546 - 25379
Alignment:
Q  112 catgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgt 211  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || || |  || ||   || |||||| || ||||| |||||| |||||||||  |  ||||||||||    
T  25546 catgagaagaattatccaactcatgatttggaattggcggccgttgtgaatgcattgaagatttggaggcattacatgtatggttttaagtttgaagtgt 25447  T
Q  212 ttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||    
T  25446 tcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaatagttgaatatgaggcaaagaagatgg 25379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 275
Target Start/End: Original strand, 32043 - 32298
Alignment:
Q  20 ttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaa 119  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || ||||||||||| || |||||||   | | ||||||    
T  32043 ttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcttgagaa 32142  T
Q  120 gaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgac 219  Q
    ||| ||||  || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || ||||  |||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  32143 gaactatctgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaagcattatctgtatggttctaagtttgaagtgtttagtgac 32242  T
Q  220 cacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaag 275  Q
    ||||||| |||||| || |||||| ||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  32243 cacaagaatttgaagtacttgtttaatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaag 32298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25506 - 25243
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || |||||||||||||| |||||||   | ||||    
T  25506 tttgttgtatattgtgatgctgctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtacatg 25407  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||| | || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || ||||| |||||  | ||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  25406 agaagaattattcgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctttatggttcgaagtttgaggtgttcag 25307  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  25306 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatgg 25243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 279
Target Start/End: Original strand, 133287 - 133378
Alignment:
Q  188 tgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  133287 tgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatgg 133378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 2579 - 2837
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | || || |||||||||||||| |||||||   | ||||    
T  2579 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatg 2678  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || | |||||| || || |  || || | |  |||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  2679 agaagaattatccgactcatg-tttggaattggcggccgttgtgtatacattgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttaag 2777  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaag 275  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  2778 tgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaag 2837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 249 - 344
Target Start/End: Original strand, 4311 - 4406
Alignment:
Q  249 gaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  4311 gaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgc 4406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 201 - 347
Target Start/End: Original strand, 2141 - 2287
Alignment:
Q  201 atttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattat 300  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || ||||||    
T  2141 attttaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcaaaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattat 2240  T
Q  301 gattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2241 gattttagtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtggttgcaga 2287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8945 - 8682
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||| ||||||||  || || | || || ||||||||||| || |||||||   | ||||    
T  8945 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtacttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatg 8846  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || |||| ||| || | |  |||||  || | ||| ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  8845 agaagaattatccgactcatgatttggaattggctgctgttgtgtattcattgatgattttgaggcattatttgtatggttctaagtttgaggtgtttag 8746  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||||    
T  8745 tgaccataagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaatatgg 8682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Original strand, 1428 - 1678
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||  || |  |||| || ||||||||||| || |||||||   | ||||    
T  1428 tttgttgtgtattgtgatgcgtctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgctaagttgtggcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatg 1527  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttag 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || | ||||||||| ||||||||||| |  |||||| |||| ||    
T  1528 agaagaattatccgactcatgatttggaattggcagcagttgtgtatgcattgaagattttgagacattatttgtatggttctaagtttgaaatgttcag 1627  T
Q  216 tgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgag 266  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  1628 tgaccacaagagtttaaagtacttgtttgataagaaatagttgaatatgag 1678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 347
Target Start/End: Original strand, 24699 - 24833
Alignment:
Q  213 tagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttg 312  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24699 tagtgatcataaaagtttaaaatatttatttcatctgaaggaattgaacatgaggtagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttg 24798  T
Q  313 aattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24799 aattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcaga 24833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 64 - 190
Alignment:
Q  221 acaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatca 320  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  64 acaaaagtttgagatatctgtttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaaatacca 163  T
Q  321 tccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  164 tccagataaagctaaagtagttgcaga 190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19658 - 19464
Alignment:
Q  85 gcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacatt 184  Q
    ||||||||||| || |||||||   | ||||||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || |||||| || ||||||||||    
T  19658 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggagacatt 19559  T
Q  185 acttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    |  |||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||    
T  19558 atctgtatggttctaattttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaacagttgaatatgaggcaaagaagatgg 19464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15738 - 15478
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | ||  |  |||||||||| || |||||||   |  |||    
T  15738 tttgttgtgtattgtgatgcttctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatagtcaggttatgacttatgcttcgaggcagttgaaagtgaatg 15639  T
Q  116 agaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgat-gtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttta 214  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||| |||  || || | || |||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| |    
T  15638 agaagaattatccgactcatgatttggaattag-tgacagttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttca 15540  T
Q  215 gtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaaga 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||||||    
T  15539 gtgaccacaagagtttgaaatatttatttgattagaaagagttgaatattaggcagagaaga 15478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 622 - 757
Alignment:
Q  11 aaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggat 110  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||| |    
T  622 aaccgtttgttgtttactgtgatgcgtctaaactgggtctaggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtagtggcgtatgcttctagacagctgagggt 721  T
Q  111 tcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagtt 146  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  722 acatgaaaagaattatcctactcacgatttagagtt 757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 344
Target Start/End: Original strand, 7672 - 7844
Alignment:
Q  172 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaga 271  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||  ||||    
T  7672 atatgaagacattaactgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaagcaga 7771  T
Q  272 gaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 344  Q
    |||||||| | ||||   | || |||| |||||||   |||| ||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  7772 gaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgagaaggctaatgttgttgc 7844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24877 - 24816
Alignment:
Q  286 ttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24877 ttgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 24816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34765 - 34692
Alignment:
Q  145 ttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtga 218  Q
    |||||||  |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34765 ttagctgcagtggtctttgtgctgaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtga 34692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10878 - 10711
Alignment:
Q  112 catgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgt 211  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || || |  || || | || |||||  || ||||| ||| | ||||||||||| |  ||||| ||||    
T  10878 catgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaggatttggaggcataatttgtatggttctaagtttgaggtgt 10779  T
Q  212 ttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    | |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  10778 tcagtgaccaaaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcatagaagatgg 10711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 279
Target Start/End: Original strand, 11372 - 11599
Alignment:
Q  52 ggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctg 151  Q
    ||||| |||||||||||  || || | || || |||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||| || || |||||||| || || |    
T  11372 ggtggagtgcttatgcagaatcgtcaggttgtggcttatgcttcaagacagatgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggccg 11471  T
Q  152 atgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaa 251  Q
      || || | |  |||||| || | ||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11472 ccgttgtgtatacattgaagatttagaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgagcaaaagagtttgaagtatttatttgatcagaa 11571  T
Q  252 ggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
     || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11572 agagttgaatatgaggcagaggagatgg 11599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 292 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26378 - 26323
Alignment:
Q  292 aaagattatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26378 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaga 26323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24799 - 24735
Alignment:
Q  10 gaaccttttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatgg 74  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  24799 gaaccttttgtagtttattgtgatgcttccaagtttggtttgggtggtgtgttgatgcaagatgg 24735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4128 - 3961
Alignment:
Q  112 catgagaagaattatcctacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgt 211  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||    || || | || |||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||    
T  4128 catgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcctccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgt 4029  T
Q  212 ttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatgg 279  Q
    | | | |||||||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  4028 tcatttaccacaagagtttgaagtatttgttttatcaaaaagagttgaatatgaggcaaagaagatgg 3961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Original strand, 1572 - 1684
Alignment:
Q  16 tttgttgtttattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatg 115  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||  || || | ||  ||||||||||||| || |||||||   | || |    
T  1572 tttgttgtgtattgtgatgcgtctaagatgggtcttggtggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttatagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcacg 1671  T
Q  116 agaagaattatcc 128  Q
    |||||||||||||    
T  1672 agaagaattatcc 1684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 264
Target Start/End: Original strand, 13589 - 13688
Alignment:
Q  165 attgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 264  Q
    |||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || || |||||||||    
T  13589 attgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgttttatcaaaaagagttgaatatg 13688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 33756 - 33638
Alignment:
Q  25 tattgtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaatt 124  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| | | |||||||||||||||  || || | || ||||||||||||||||| |||||||   | || ||||||||||    
T  33756 tattgtgatgcttctaagatgggtcttgatggtgtgcttatgcagaatcgtcaggttgtagcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcacgagaagaatt 33657  T
Q  125 atcctacgcacgatttgga 143  Q
    |||| || || ||||||||    
T  33656 atccgactcatgatttgga 33638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 101
Target Start/End: Original strand, 5747 - 5794
Alignment:
Q  54 tggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagaca 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||    
T  5747 tggtgtgcttatgcaagatggtcaagttgtggctaatgcttcaagaca 5794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5417 - 5380
Alignment:
Q  310 ttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcaga 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5417 ttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcaga 5380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University