View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8903_low_80 (Length: 277)

Name: NF8903_low_80
Description: NF8903
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8903_low_80
NF8903_low_80
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (19-277)||(218-476)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (19-277)||(27023-27281)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (21-277)||(1660404-1660660)
chr6 (35-277)||(17786674-17786916)
chr6 (21-277)||(16103769-16104025)
chr6 (94-277)||(18421101-18421284)
chr6 (21-277)||(21412087-21412343)
chr6 (21-275)||(16378936-16379190)
chr6 (21-167)||(16646640-16646786)
chr6 (25-275)||(22364927-22365177)
chr6 (14-245)||(14149854-14150085)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (21-277)||(15000254-15000509)
chr4 (21-275)||(15289576-15289830)
chr4 (78-147)||(28266083-28266152)
chr4 (21-169)||(12339398-12339546)
chr4 (25-245)||(18272690-18272910)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (19-262)||(20928667-20928910)
chr1 (19-277)||(20528666-20528924)
chr1 (21-275)||(20827882-20828136)
chr1 (25-193)||(22129011-22129179)
chr1 (21-74)||(21200262-21200315)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (21-275)||(372-626)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (19-277)||(7855-8113)
[»] chr3 (8 HSPs)
chr3 (19-277)||(15943250-15943508)
chr3 (21-277)||(6149508-6149764)
chr3 (21-277)||(25768444-25768700)
chr3 (21-245)||(8271086-8271310)
chr3 (21-275)||(30150586-30150840)
chr3 (21-245)||(13964042-13964266)
chr3 (25-243)||(17201869-17202087)
chr3 (14-275)||(22149403-22149664)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (21-277)||(21847196-21847452)
chr8 (21-277)||(20649214-20649470)
chr8 (21-205)||(16415751-16415935)
chr8 (25-277)||(21193411-21193663)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (21-277)||(40-296)
scaffold0467 (21-277)||(12750-13006)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (19-277)||(22281334-22281592)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (19-277)||(23509187-23509445)
chr5 (21-167)||(24584714-24584860)
chr5 (28-99)||(33314011-33314082)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (19-277)||(6276-6537)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (19-277)||(130905-131166)
scaffold0008 (24-277)||(27408-27661)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (21-277)||(4790-5045)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (21-277)||(8808-9064)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (21-277)||(3340-3596)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (23-214)||(91133-91324)
scaffold0021 (21-277)||(8786-9042)
scaffold0021 (25-245)||(20327-20547)
scaffold0021 (25-245)||(29903-30123)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (19-193)||(12128-12302)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (21-277)||(3345-3601)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (21-277)||(25808-26063)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (21-277)||(97154-97410)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (150-277)||(3168-3295)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (170-277)||(73144-73251)
scaffold0011 (170-277)||(77525-77632)
[»] chr7 (4 HSPs)
chr7 (21-275)||(27104201-27104455)
chr7 (21-275)||(27173870-27174124)
chr7 (21-275)||(7827489-7827743)
chr7 (14-112)||(4443505-4443603)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (21-276)||(4226-4481)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (21-127)||(16530-16636)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (25-193)||(25203-25371)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (21-82)||(24592-24653)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (25-112)||(2209-2296)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (25-118)||(35751-35844)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (16-74)||(78045-78103)


Alignment Details
Target: scaffold1140 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 218 - 476
Alignment:
Q  19 atcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattca 118  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  218 atcataccatcctcaacattgatgtagggacaaaacctcgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgtttcagattca 317  T
Q  119 gaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  318 gaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttacgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccacgtcaccacataacctcccaactc 417  T
Q  219 aagccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  418 aagccttcctttggcattagtccatcagtgctctgcttcctcagctagcatatgagtcg 476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 27023 - 27281
Alignment:
Q  19 atcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattca 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27023 atcatagcatcctcaacattgatgtagggacaaaacctagaaagttcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattca 27122  T
Q  119 gaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27123 gaaactcaatctccttcttggtcctcaagtctttcgggaaataattcctcaagaattcaaacttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctc 27222  T
Q  219 aagccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27223 aagtcttcctttggcattggtccaccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcg 27281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1660660 - 1660404
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1660660 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagttcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 1660561  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1660560 aactcaacctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcaccgcccaactcaa 1660461  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  1660460 gcctgcccttggcattgatccaccagtactctgcttcctcagcaaacatatgagtcg 1660404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Original strand, 17786674 - 17786916
Alignment:
Q  35 cattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaatctcctt 134  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17786674 catttatgtaaggataaaacctcgaaagttcctcgaacttcgccgcatattcggctacagacatgcttccttgtttcagattcagaaactcaatctcctt 17786773  T
Q  135 cttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaagccttcccttggca 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  17786774 cttggtcctcaagtcttcagggaaatatttcctcaagaattcgaccttgaacttagcctaggtcaccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggca 17786873  T
Q  235 ttggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17786874 ttagtccaccagtgcccttcttcctcagctagcatatgagtcg 17786916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Original strand, 16103769 - 16104025
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||    
T  16103769 catagcatcttcagcattgatgtagggaaaaaacctggaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgcttccttgattcaaattcaga 16103868  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  16103869 aactcaacctccttcttagtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcagctttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatttcaa 16103968  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  16103969 gtcttcctttggcattagtccaccagtgctccgcttcctcagcaagcacatgagtcg 16104025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 277
Target Start/End: Original strand, 18421101 - 18421284
Alignment:
Q  94 gacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagccc 193  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18421101 gacatgatcccttgttatagattcagaaactcaatctccttgttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaacctggaacttagccc 18421200  T
Q  194 gggtcaccacatcacctcccaactcaagccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  18421201 aggtcacaacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccagtgctctgcttccttagcaagcatatgagtcg 18421284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21412343 - 21412087
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | || || ||||| ||||||    
T  21412343 catagcatcttcagcattgatgtacggacaaaacttcgaaagctcctcaaacttcgcctcatactcggctacagacatgcttccctgcttcaggttcaga 21412244  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    || || | ||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||| || || ||||||| |||||    
T  21412243 aattccacctccttcctagttctcaaatcttcagggaaatacttccttaagaattctgctttgaacttcgcccaggtcacaacttctcctcccatctcaa 21412144  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
      ||||| ||| |||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||||    
T  21412143 atcttcctttgacattagtccaccagtactcagcctcctcagcaagcatatgagtcg 21412087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16379190 - 16378936
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||||||     
T  16379190 catagcatcctccgcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgcttcaaattcagg 16379091  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||| |  |||||| | |||||||| || || || || |||||||| || || ||| |||||||| | | ||  ||||| || || || || | |||||    
T  16379090 aactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctccaccaatctcaa 16378991  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagt 275  Q
    | |||||||| |||||||||||||| | |||  | |||||||| ||||| |||||    
T  16378990 gtcttcccttagcattggtccaccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagt 16378936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16646786 - 16646640
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||||||     
T  16646786 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacggacatactcccttgcttcaaattcagg 16646687  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttcct 167  Q
    ||||| |  |||||| | |||||||| || || || || ||||||||    
T  16646686 aactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcct 16646640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22365177 - 22364927
Alignment:
Q  25 gcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaact 124  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||| |||| || ||||| || || |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| | ||  ||||  ||||    
T  22365177 gcatcttcaacattgatgtatggaaaaaatctcgaaagctcttcaaacttcgccgtatactcagctacagacatgctcccttgctacaagttcaagaact 22365078  T
Q  125 caatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaagcct 224  Q
    | |  |||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| || || || || | |||||| ||    
T  22365077 ctacttccttcctggtcctcaaaccttcagggaaatacttcctcaagaactcaactttgaactttgcccaagtcacaacttctccaccaatctcaagtct 22364978  T
Q  225 tcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagt 275  Q
    |||||| | ||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||| |||||    
T  22364977 tcccttagaattagtccaccaatactcggcctcctcagcaagcatgtgagt 22364927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 14149854 - 14150085
Alignment:
Q  14 tggacatcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcag 113  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| || || |||||  ||||||| ||||     
T  14149854 tggacaccatcgcatcctcagcattgatgtacggacaaaacctcgacagctcctcaaacatcgccgcatactcagccacggacatactcccttgcttcaa 14149953  T
Q  114 attcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctccc 213  Q
     ||||  ||||| | ||||||| | |||||||| || ||  | || |||||||| || || ||   ||||||||||||||  ||||| || || || ||     
T  14149954 gttcaagaactccacctccttcctagtcctcaaatcctctagaaagtacttcctcaaaaactcggtcttgaacttagcccaagtcacaacctctccacca 14150053  T
Q  214 aactcaagccttcccttggcattggtccacca 245  Q
    | ||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  14150054 atctcaagttttcccttagcattagtccacca 14150085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Original strand, 15000254 - 15000509
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15000254 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagttcctcaaacttcgccgtatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 15000353  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15000354 aactcaacctccttcttggtcctcaagtcttccggg-aatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcaccccccaactcaa 15000452  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15000453 gcctgcccttggcattggtccaccagtactctgcttcctcagctaacatatgagtcg 15000509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15289830 - 15289576
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||  |||| |||||      
T  15289830 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacggacatactcccttacttcaaattcaag 15289731  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||| |  |||||| | |||||||| || || || || |||||||| || || ||| |||||||| | | ||  ||||| || || || || | |||||    
T  15289730 aactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctccaccaatctcaa 15289631  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagt 275  Q
    | |||||||| |||||||||| ||| | |||  | |||||||| ||||| |||||    
T  15289630 gtcttcccttagcattggtccgccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagt 15289576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28266152 - 28266083
Alignment:
Q  78 cgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaatctccttcttggtcctcaag 147  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28266152 cgcatactcggctacagacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaag 28266083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12339546 - 12339398
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||  | || |||| | || | || ||||||||||      
T  12339546 catagcatcctcagcattgatgtaaggacaaaacctcgaaagtttctcgaacttagctgcatattccacaacagacaagttctcctgcttcagattcaag 12339447  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttcctta 169  Q
    ||||  |  ||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||    
T  12339446 aacttcacttccttcttggtcctcaaattctctggaaaatacttcctta 12339398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 18272690 - 18272910
Alignment:
Q  25 gcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaact 124  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||||  ||||  ||||    
T  18272690 gcatcctcagcattaatgtacgaacaaaacctcgatagctcctcaaacgtcgccgcatactcagctatggacatgctcccttgcttcaagttcaagaact 18272789  T
Q  125 caatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaagcct 224  Q
    | |  | |||| | ||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||| | |||||||| ||||  ||||| || || || || | |||||| ||    
T  18272790 ccactttcttcctagtccttaaatcttctggaaaatacttcctcaaaaactcagctttgaactttgcccaagtcacaacctctccaccaatctcaagtct 18272889  T
Q  225 tcccttggcattggtccacca 245  Q
    |||||| ||||| ||||||||    
T  18272890 tcccttagcattagtccacca 18272910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 262
Target Start/End: Original strand, 20928667 - 20928910
Alignment:
Q  19 atcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattca 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  20928667 atcatagcatcctgagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctacagacatgattcctttcttcagattca 20928766  T
Q  119 gaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  20928767 gaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcggggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcatctcccatctc 20928866  T
Q  219 aagccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcag 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20928867 aagccttcccttggcattggtccaccaatgctctgcttcctcag 20928910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 20528666 - 20528924
Alignment:
Q  19 atcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattca 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||    
T  20528666 atcatagcatcctcaacattgatgtagggaaaaaacctcgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctatagacatgattccttacttcagattca 20528765  T
Q  119 gaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactc 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  20528766 gaaactcaatgtccttcttggtcctcaagtcttcggggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcatctcccatctc 20528865  T
Q  219 aagccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  20528866 aagccttcctttggcattagtccaccagtgctctgcttcctcagtcaacatatgagtcg 20528924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20828136 - 20827882
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||||||     
T  20828136 catagcatcctccgcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgcttcaaattcagg 20828037  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||| |  |||||| | |||||||| || || || || |||||||| || || ||| |||||||| | | ||  ||||| || || || || | |||||    
T  20828036 aactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctccaccaatctcaa 20827937  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagt 275  Q
    | |||||||| |||||||||||||| | |||  | |||||||| ||||| |||||    
T  20827936 gtcttcccttagcattggtccaccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagt 20827882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22129179 - 22129011
Alignment:
Q  25 gcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaact 124  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||  | || |||||| ||||||| ||||  ||||  ||||    
T  22129179 gcatcctcagcattgatgtacgaacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcaaccacggacatgctcccttgcttcaagttcaagaact 22129080  T
Q  125 caatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagccc 193  Q
    | |  |||||| | |||||||| || || || || |||||||| || || ||| | |||||||||||||    
T  22129079 ccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagctttgaacttagccc 22129011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21200315 - 21200262
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaactt 74  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  21200315 catagtatcctccgcattgatgtagggacaaaaccttaatatttcctcgaactt 21200262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 626 - 372
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  626 catagcatcctccgcattgatgtagagacaaaacctcgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgattccttgcttcagatttaga 527  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  526 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacgtagcccaggtcaccacatcacctcccaactcaa 427  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagt 275  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  426 gccttcctttggcgtttgtccaccagtgctctgcttcttcagctagcatatgagt 372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8113 - 7855
Alignment:
Q  19 atcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8113 atcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcaaaagttcctcgaacttcgccacatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattca 8014  T
Q  119 gaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactc 218  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  8013 gaaacttcatctccttcttggccctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacatagcccaggtcacctcatcacctcccaactc 7914  T
Q  219 aagccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7913 aagcctgcctttggcattggtccactagtgctatgcttcctcagctagcatatgagtcg 7855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15943508 - 15943250
Alignment:
Q  19 atcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| || |||||||    
T  15943508 atcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggccactgacaagattccttgctttagattca 15943409  T
Q  119 gaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactc 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15943408 gaaactcaatctcattcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcaccttccaactc 15943309  T
Q  219 aagccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  | |||||||||||    
T  15943308 aagccttcccttggcattggtccaccagtgctccgcttcctcagtcaacatatgagtcg 15943250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6149764 - 6149508
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||    
T  6149764 catagcatcctcagcattgatgtaggggcaaaacctcgaaagttcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatgcttccttgtttcagattcaga 6149665  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6149664 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttaaacttcgcccaggtcaccacatcacctcccatctcaa 6149565  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6149564 gtcttcctttggcattagtccaccagtgctctgcttcctcagcaagcatatgagtcg 6149508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Original strand, 25768444 - 25768700
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||   ||||| || ||| | ||||||||||  ||||||    
T  25768444 catagcatcttcagcattgatgtacggacaaaaccttgaaagctcctcaaacttttctgcatacgtagctacagatatgcttccttgtttcaagttcaga 25768543  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||| |||||| || || |||||||||||||    
T  25768544 aactcaacctccttcctggtcctcaaatcttcagggaaatacttcctcaagaactcagctttgaacttcgcccaggtcacaacttctcctcccaactcaa 25768643  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| || ||  | |||||||| |||||||||||||    
T  25768644 gtcttcctttggcattagtccaccaatgttcggcctcctcagcaagcatatgagtcg 25768700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8271310 - 8271086
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||||||     
T  8271310 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacggacatactcccttgcttcaaattcagg 8271211  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||| |  |||||| | |||||||| || || || || |||||||| || || ||| |||||||| | | ||  ||||| || || || || | |||||    
T  8271210 aactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctccaccaatctcaa 8271111  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccacca 245  Q
    | |||||||| ||||||||||||||    
T  8271110 gtcttcccttagcattggtccacca 8271086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 275
Target Start/End: Original strand, 30150586 - 30150840
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||||||     
T  30150586 catagcatcctccgcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgcttcaaattcagg 30150685  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||| |  |||||| | |||||||| || || || || |||||||| || || ||| |||||||| | | ||  ||||| || || || || | |||||    
T  30150686 aactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctccaccaatctcaa 30150785  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagt 275  Q
    | |||||||| |||||||||||||| | |||  | |||||||| ||||| |||||    
T  30150786 gtcttcccttagcattggtccaccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagt 30150840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13964266 - 13964042
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||||||     
T  13964266 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacggacatactcccttgcttcaaattcagg 13964167  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||| |  |||||| | |||||||| || || || || |||||||| || || ||| | |||||| | | ||  ||||| || || ||  | | |||||    
T  13964166 aactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagctttgaaccttgtccaagtcacaacctctccatcaatctcaa 13964067  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccacca 245  Q
    | |||||||| ||||||||||||||    
T  13964066 gtcttcccttagcattggtccacca 13964042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Original strand, 17201869 - 17202087
Alignment:
Q  25 gcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaact 124  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||  |||||| ||||||| ||||  ||||| ||||    
T  17201869 gcatcctcagcattgatgtacggacaaaacctcaaaagctcctcaaacttcgccacatacacagctatggacatgctcccttgcttcaagttcaggaact 17201968  T
Q  125 caatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaagcct 224  Q
    | |  |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||  ||||| || || || || | |||||| ||    
T  17201969 ccacttccttcctggtcctcaaatcttcaggaaaatacttcctcaagaactcagctttgaactttgcccaagtcacaacttctccaccaatctcaagtct 17202068  T
Q  225 tcccttggcattggtccac 243  Q
    |||||| ||||| ||||||    
T  17202069 tcccttagcattagtccac 17202087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22149664 - 22149403
Alignment:
Q  14 tggacatcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcag 113  Q
    |||||| ||| |||| |||  ||||||||||  |||||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||| || |||||  | ||||| ||||     
T  22149664 tggacaccattgcattctcgacattgatgtacagacaaaaccttgcaaactcttcaaacttcgccgcatactcggccacagacatacttccttgcttcaa 22149565  T
Q  114 attcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctccc 213  Q
     || |  || || | | ||||| | |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||  |||||||| | ||||  |||||||| || ||  ||    
T  22149564 gtttaagaattctaccaccttccttgtcctcaaatcttccgaaaaatacttcctcaagaactcggccttgaaccttgcccaagtcaccacctccccctcc 22149465  T
Q  214 aactcaagccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagt 275  Q
    | |||||| ||||| |||||||| |||||| | | |||| | |||||||| |||||||||||    
T  22149464 atctcaagtcttcctttggcattagtccactaatactctgcctcctcagcaagcatatgagt 22149403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21847452 - 21847196
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21847452 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcaccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 21847353  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  21847352 aactcaacctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcacaacaccaccttccaactcaa 21847253  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    | || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21847252 gtctgcccttggcattggtccaccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcg 21847196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20649470 - 20649214
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| | |||||||    
T  20649470 catagcatcttcaacattgatgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgttttaaattcaga 20649371  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20649370 aactcaacctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaactttgaacttcgcccaggtcacaacatcacctcccaactcaa 20649271  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    | ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20649270 gtcttcctttggcattagtccacaagtgctctgcttcctcagcaagcatatgagtcg 20649214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 16415751 - 16415935
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16415751 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagttcctcaaacttcgccgcatattcggctacagacatgatccattgtttcagattcaga 16415850  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16415851 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcggggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagccgaggtcaccacat 16415935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21193663 - 21193411
Alignment:
Q  25 gcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaact 124  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||  |||||||||     
T  21193663 gcatcttcagcaatgatgtacggacaaaacctcgaaagcttctcgaacttcgccgcatactcggctacagagatgctcccttacttcaagttcagaaacg 21193564  T
Q  125 caatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaagcct 224  Q
    | | ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||  ||||| || || ||  | | |||||| ||    
T  21193563 ctacctccttcctggtcctcaaatcttcagggaaatacttcctcaagaactcagctttgaacttcgcccaagtcacgacttccccaacaatctcaagtct 21193464  T
Q  225 tcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||  | |||||||| |||||||||||||    
T  21193463 tcccttggcattggtccaccaatattcggcctcctcagcaagcatatgagtcg 21193411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 296 - 40
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  296 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgtttccttgtttcagattcaga 197  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  196 aactcaatttccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccagttcaccacatcacctcccatctcaa 97  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    | ||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  96 gtcttcctttggcattagcccaccagtgctctgcttcctcagctagcatatgagtcg 40  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13006 - 12750
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  13006 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgtttccttgtttcagattcaga 12907  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  12906 aactcaatttccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccagttcaccacatcacctcccatctcaa 12807  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    | ||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12806 gtcttcctttggcattagcccaccagtgctctgcttcctcagctagcatatgagtcg 12750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 22281334 - 22281592
Alignment:
Q  19 atcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  22281334 atcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacttcgaaagttcctcgaacttcgctgcatactcgactacagacatgattccttacttcagattca 22281433  T
Q  119 gaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactc 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  22281434 aaaactcaatctccttcttggtcctcaagtctttcgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggttaccacatcacctcccatctc 22281533  T
Q  219 aagccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  22281534 aagccttcctttggcattggtccaccagtgctctgcttcctcagtcaacatatgagtcg 22281592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 23509187 - 23509445
Alignment:
Q  19 atcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattca 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| || |||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  23509187 atcatagcatccttagcattgatgtatggacaaaacctcaaaagttcctcgaacttcaccacatgcttggctacagacatgattccttgcttcagattca 23509286  T
Q  119 gaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactc 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  23509287 gaaactcaatcgccttcttggtcctcaagtcttcggggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccaactt 23509386  T
Q  219 aagccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  23509387 aagccttcctttggcattggtccaccagtgctctgcttcctcagtcaacatatgagtcg 23509445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 24584714 - 24584860
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||||||     
T  24584714 catagcatcctcaacattgatgtagggacaaaaccttgcaagctccttaaacttcgccgcatactcggccacggacatactcccttgcttcaaattcagg 24584813  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttcct 167  Q
    ||||| |  |||||| | |||||||| || || || || ||||||||    
T  24584814 aactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcct 24584860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 33314082 - 33314011
Alignment:
Q  28 tcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatg 99  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33314082 tcctctgcattaatgtacggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcagctactgacatg 33314011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6537 - 6276
Alignment:
Q  19 atcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagt---tcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagat 115  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  6537 atcatagcatcctcaacattaatgtagggacagaacctcgaaagtaattcctcgaacttcgccgcatactcggccacagacatgattccttgcttcagat 6438  T
Q  116 tcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  6437 tcagaaactcaacctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcatttcccaa 6338  T
Q  216 ctcaagccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  6337 ctcaagccttcccttggcattggtccactagtgctctgcttcctcagtcaacatatgagtcg 6276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 131166 - 130905
Alignment:
Q  19 atcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagt---tcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagat 115  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  131166 atcatagcatcctcaacattaatgtagggacagaacctcgaaagtaattcctcgaacttcgccgcatactcggccacagacatgattccttgcttcagat 131067  T
Q  116 tcagaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  131066 tcagaaactcaacctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcatctcccaa 130967  T
Q  216 ctcaagccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  130966 ttcaagccttcccttggcattggtccactagtgctctgcttcctcagtcaacatatgagtcg 130905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 277
Target Start/End: Original strand, 27408 - 27661
Alignment:
Q  24 agcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaac 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27408 agcatcctcagcattgatatagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgtttcagattcagaaac 27507  T
Q  124 tcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaagcc 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  27508 tcaacctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaatttgactttgaacttagcccaggtccccacatcacctcccatctcaagtc 27607  T
Q  224 ttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||    
T  27608 ttcctttggcattagtccaccagtgctttgcttcctcagcaagcatataagtcg 27661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5045 - 4790
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5045 catagcatcctcagcattgatgtaggggcaaaacctcgaaggttcctcaaacttcgccgcatactcggcgaaagacatgatcccttgtttcagattcaga 4946  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4945 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctctagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctcaa 4846  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
     |||||| ||| |||| ||| || |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  4845 -ccttcctttgacattagtcaactagtgctctgcttcctcagcaagcatttgagtcg 4790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9064 - 8808
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  9064 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctagacagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgtttcagattcaga 8965  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  8964 aactcaacctccttattggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccaactcat 8865  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    | ||||| |||||  | ||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||||    
T  8864 gtcttcctttggcgctagtccaccagtgctctgcctcctcagtcaacatatgagtcg 8808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Original strand, 3340 - 3596
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  3340 catatcatcttcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgtttcagattcaga 3439  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3440 aactcaacctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaataattaagctttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctcaa 3539  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    | ||||| |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  3540 gtcttcctttggcattagtccactagttctctgcttcctcagcaagcatatgagtcg 3596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Original strand, 91133 - 91324
Alignment:
Q  23 tagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  91133 tagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccatgtttcagattcagaaa 91232  T
Q  123 ctcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctccca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  91233 ctcaatctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctccca 91324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Original strand, 8786 - 9042
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  8786 catagcatctttagcattgatgtacggataaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgtttcagattcaga 8885  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| | |||||||| |||| |||||| || | |||||||| |||||    
T  8886 aactcaacctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcatcaagaattcagctttgaacttcgcccaggtcacaactttacctcccatctcaa 8985  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
      ||||| |||||||| |||||  |||||||  |||||||| | |||||| ||||||    
T  8986 ttcttcctttggcattagtccaatagtgctcagcttcctcaacaagcatacgagtcg 9042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20547 - 20327
Alignment:
Q  25 gcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaact 124  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| ||||  ||||  ||||    
T  20547 gcatccttagcattaatgtacggacaaaacctcacaagctcctcaaacttcgccgcatactcagccacggacatactcccttgcttcaagttcaagaact 20448  T
Q  125 caatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaagcct 224  Q
    | |  |||||| | |||||||| || || || || |||||||| || || ||| |||||||| ||||||  | |||||| |  || || | |||||| ||    
T  20447 ccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaacctagcccaaggcaccacctatccaccaatctcaagtct 20348  T
Q  225 tcccttggcattggtccacca 245  Q
    |||||| ||||| ||||||||    
T  20347 tcccttagcattagtccacca 20327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30123 - 29903
Alignment:
Q  25 gcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaact 124  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| ||||  ||||  ||||    
T  30123 gcatccttagcattaatgtacggacaaaacctcacaagctcctcaaacttcgccgcatactcagccacggacatactcccttgcttcaagttcaagaact 30024  T
Q  125 caatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaagcct 224  Q
    | |  |||||| | |||||||| || || || || |||||||| || || ||| |||||||| ||||||  | |||||| |  || || | |||||| ||    
T  30023 ccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaacctagcccaaggcaccacctatccaccaatctcaagtct 29924  T
Q  225 tcccttggcattggtccacca 245  Q
    |||||| ||||| ||||||||    
T  29923 tcccttagcattagtccacca 29903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12302 - 12128
Alignment:
Q  19 atcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12302 atcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagttgctcgaacttcgccgcatactcggctacagacatgattccttgtttcagattca 12203  T
Q  119 gaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagccc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12202 gaaactcaatctccttcttggtcctcaagtcttcggggaaatacttcctcaataattcaaccttgaacttagccc 12128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3601 - 3345
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||| |    
T  3601 cataacatcttcagcattgatgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctatagacatgcttccttgtttcagattcaaa 3502  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||| |||||| || ||||||||||  ||||    
T  3501 aactcaacctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcagctttgaacttttcccaggtcacaacttcacctcccatatcaa 3402  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  3401 gtcttcccttggcattagtccaccagtgctccgcttcctcagtaagcatatgagtcg 3345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Original strand, 25808 - 26063
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  25808 catagcatcttcagcattgatgtaaggacaaaacctcgaaagcttcttaaacttcgccgcatactcggctacaaacatgcttccttgtttcagattcaga 25907  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||    
T  25908 aactcaacctccttcttagttctcaagtcttcagggaaatacttcc-caagaattcaactttgaacttagcccaagtcaccacattacctcccatctcaa 26006  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  26007 gtcttcctttggcattagtccaccagtgctctgcttcctcaacaagcatatgagtcg 26063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Original strand, 97154 - 97410
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |    
T  97154 cataacatcttcaacattgatgtacggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgcctcatactcggctacagacatgcttccttgtttcagattcaaa 97253  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| | || |||||| || ||  | || |||||||    
T  97254 aactcaacctccttcttggtcctcaagtcttcagggaaatatttcctcaagaattcagctttgaactttgtccaggtcacaacttcttcaccaaactcaa 97353  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    | ||||  |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  97354 gtcttcttttggcattagtccaccactgctcagcttcctcagcaagcatatgagtcg 97410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 277
Target Start/End: Original strand, 3168 - 3295
Alignment:
Q  150 ttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaagccttcccttggcattggtccaccagtgc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3168 ttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagccttcccttggcattggtccaccaatgc 3267  T
Q  250 tcttcttcctcagctagcatatgagtcg 277  Q
    ||| |||||||||  | |||||||||||    
T  3268 tctgcttcctcagtcaacatatgagtcg 3295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 73251 - 73144
Alignment:
Q  170 agaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaagccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcat 269  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  73251 agaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagccttcctttggcgttagtccaccagtgctctgcttcctcggctagcat 73152  T
Q  270 atgagtcg 277  Q
    ||||||||    
T  73151 atgagtcg 73144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 77632 - 77525
Alignment:
Q  170 agaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaagccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcat 269  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  77632 agaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagccttcctttggcgttagtccaccagtgctctgcttcctcggctagcat 77533  T
Q  270 atgagtcg 277  Q
    ||||||||    
T  77532 atgagtcg 77525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 4)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27104455 - 27104201
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||||||     
T  27104455 catagcatcctccgcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgcttcaaattcagg 27104356  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||| |  |||||| | |||||||| || || || || |||||||| || || ||| |||||||| | | ||  ||||| || || || || | |||||    
T  27104355 aactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctccaccaatctcaa 27104256  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagt 275  Q
    | |||||||| |||||||||||||| | |||  | |||||||| ||||| |||||    
T  27104255 gtcttcccttagcattggtccaccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagt 27104201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 275
Target Start/End: Original strand, 27173870 - 27174124
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||||||     
T  27173870 catagcatcctccgcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgcttcaaattcagg 27173969  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||| |  |||||| | |||||||| || || || || |||||||| || || ||| |||||||| | | ||  ||||| || || || || | |||||    
T  27173970 aactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctccaccaatctcaa 27174069  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagt 275  Q
    | |||||||| |||||||||||||| | |||  | |||||||| ||||| |||||    
T  27174070 gtcttcccttagcattggtccaccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagt 27174124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 275
Target Start/End: Original strand, 7827489 - 7827743
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||||||     
T  7827489 catagcatcctccgcattgatgtaggggcaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgcttcaaattcagg 7827588  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||| |  |||||| | |||||||| || || || || |||||||| || || ||| |||||||| | | ||  ||||| || || || || | |||||    
T  7827589 aactccacttccttcctagtcctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctccaccaatctcaa 7827688  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagt 275  Q
    | |||||||| |||||||||||||| | |||  | |||||||| ||||| |||||    
T  7827689 gtcttcccttagcattggtccaccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagt 7827743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Original strand, 4443505 - 4443603
Alignment:
Q  14 tggacatcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttca 112  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||    
T  4443505 tggacaccattgcatcctcaacattaatgtacgcataaaacctcgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcagccacagacatgctcccttgcttca 4443603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4481 - 4226
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||||||     
T  4481 catagcatcctccgcattgatgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgcttcaaattcagg 4382  T
Q  121 aactcaatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccgggtcaccacatcacctcccaactcaa 220  Q
    ||||| |  |||||| | || ||||| || || || || |||||||| || || ||| |||||||| |   ||  ||||| || || || || | |||||    
T  4381 aactccacttccttcctagttctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttatccaagtcacaacctccccaccaatctcaa 4282  T
Q  221 gccttcccttggcattggtccaccagtgctcttcttcctcagctagcatatgagtc 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| | |||| |||||| ||||| ||| ||||||    
T  4281 gtcttcccttagcattagtccaccaatactctgcttccttagctaccatgtgagtc 4226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 16530 - 16636
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcaga 120  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  16530 catagcatcctcaagattgatgtagggacaaaacctagacagctcctgaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgtttcagattcaga 16629  T
Q  121 aactcaa 127  Q
    |||||||    
T  16630 aactcaa 16636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25371 - 25203
Alignment:
Q  25 gcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaact 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||  ||||  ||||    
T  25371 gcatcctcagcattgatgtacggacaaaacctcggaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacgaacatgctcccttgcttcaagttcaagaact 25272  T
Q  125 caatctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagccc 193  Q
    | |  |||||| | ||||| || || || || || |||||||| || || ||| | |||||||||||||    
T  25271 ccacttccttcctagtccttaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagctttgaacttagccc 25203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Original strand, 24592 - 24653
Alignment:
Q  21 catagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcat 82  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  24592 catagcatcctccgcattgatgtaggggcaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcat 24653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Original strand, 2209 - 2296
Alignment:
Q  25 gcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttca 112  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||    
T  2209 gcatcttcaacattaatgtacggacaaatcctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcagccacggacatgctcccttgcttca 2296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 35844 - 35751
Alignment:
Q  25 gcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattca 118  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || || |||||  ||||||| |||| |||||    
T  35844 gcatcttcagcattaatgtatggacaaaacctcgaaagctcctcaaactttgctgcatactcagccacagacatactcccttgcttcaaattca 35751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 74
Target Start/End: Original strand, 78045 - 78103
Alignment:
Q  16 gacatcatagcatcctcagcattgatgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaactt 74  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  78045 gacaccatagcatcctcaacattaatgtagcgacaaaaccttgatagctcctcaaactt 78103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University