View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8905A_low_212 (Length: 246)

Name: NF8905A_low_212
Description: NF8905A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8905A_low_212
NF8905A_low_212
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (9-233)||(31447510-31447740)
chr5 (63-237)||(27604554-27604728)
chr5 (45-237)||(5291657-5291849)
chr5 (65-237)||(40399989-40400161)
chr5 (64-237)||(39361270-39361443)
chr5 (60-237)||(15768362-15768539)
chr5 (60-237)||(37731057-37731234)
chr5 (60-237)||(6985320-6985497)
chr5 (60-237)||(9345562-9345739)
chr5 (60-237)||(14039619-14039796)
chr5 (60-237)||(14448131-14448308)
chr5 (60-237)||(14559163-14559340)
chr5 (60-237)||(17616641-17616818)
chr5 (60-237)||(17728498-17728675)
chr5 (60-237)||(22685025-22685202)
chr5 (60-237)||(23305868-23306045)
chr5 (60-237)||(23371531-23371708)
chr5 (60-237)||(23706378-23706555)
chr5 (60-237)||(27043314-27043491)
chr5 (60-237)||(27469583-27469760)
chr5 (60-237)||(31358115-31358292)
chr5 (60-237)||(36583604-36583781)
chr5 (60-237)||(42052390-42052567)
chr5 (60-237)||(24589159-24589336)
chr5 (60-237)||(30228551-30228728)
chr5 (60-237)||(39491992-39492169)
chr5 (60-237)||(24817946-24818123)
chr5 (67-237)||(22156074-22156244)
chr5 (60-237)||(35225084-35225261)
chr5 (61-237)||(15994389-15994565)
chr5 (61-237)||(31842987-31843163)
chr5 (62-208)||(1110295-1110441)
chr5 (62-230)||(20796650-20796818)
chr5 (60-151)||(36697303-36697394)
chr5 (121-237)||(36697196-36697312)
chr5 (66-125)||(19477001-19477060)
chr5 (65-225)||(23405405-23405565)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (45-237)||(21001956-21002148)
chr7 (9-235)||(19992966-19993197)
chr7 (45-237)||(9434409-9434601)
chr7 (63-237)||(5686723-5686897)
chr7 (63-237)||(6876791-6876965)
chr7 (60-237)||(1988726-1988903)
chr7 (60-237)||(8011635-8011812)
chr7 (65-237)||(22090372-22090544)
chr7 (60-237)||(24735911-24736088)
chr7 (61-237)||(2715185-2715361)
chr7 (67-237)||(4213219-4213389)
chr7 (67-237)||(17959623-17959793)
chr7 (60-237)||(9086415-9086592)
chr7 (60-237)||(26399644-26399821)
chr7 (60-237)||(40051652-40051829)
chr7 (60-237)||(11097198-11097376)
chr7 (60-237)||(11006375-11006552)
chr7 (60-237)||(26698677-26698854)
chr7 (60-237)||(42867016-42867193)
chr7 (69-237)||(8618587-8618755)
chr7 (67-237)||(168090-168260)
chr7 (60-237)||(466541-466718)
chr7 (66-225)||(15887206-15887365)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (45-237)||(9122013-9122205)
chr6 (9-237)||(27373873-27374107)
chr6 (9-237)||(27464226-27464460)
chr6 (63-235)||(25590360-25590532)
chr6 (61-237)||(12856097-12856273)
chr6 (61-237)||(26865940-26866116)
chr6 (60-237)||(3662491-3662668)
chr6 (60-237)||(12726317-12726494)
chr6 (60-237)||(17983618-17983795)
chr6 (60-237)||(25788875-25789052)
chr6 (60-237)||(26026566-26026743)
chr6 (60-237)||(27342874-27343051)
chr6 (60-237)||(27403614-27403791)
chr6 (60-237)||(16931541-16931718)
chr6 (67-237)||(34816655-34816825)
chr6 (69-237)||(32971358-32971526)
chr6 (63-154)||(7669375-7669466)
chr6 (66-225)||(12359298-12359457)
chr6 (121-237)||(27385644-27385760)
chr6 (121-237)||(27476057-27476173)
chr6 (60-151)||(4632036-4632127)
chr6 (60-151)||(27385562-27385653)
chr6 (60-151)||(27475975-27476066)
chr6 (60-151)||(32310650-32310741)
chr6 (121-237)||(4632118-4632234)
chr6 (121-237)||(32310543-32310659)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (9-235)||(16390427-16390659)
chr3 (63-237)||(37867664-37867838)
chr3 (63-237)||(37876182-37876356)
chr3 (64-237)||(19779600-19779773)
chr3 (65-237)||(6219538-6219710)
chr3 (61-237)||(6499864-6500040)
chr3 (44-237)||(9992794-9992987)
chr3 (67-237)||(20682617-20682787)
chr3 (61-237)||(13382153-13382329)
chr3 (61-237)||(13392747-13392923)
chr3 (60-237)||(4744897-4745074)
chr3 (60-237)||(5511853-5512030)
chr3 (60-237)||(5546505-5546682)
chr3 (60-237)||(24661074-24661251)
chr3 (60-237)||(5626861-5627038)
chr3 (60-237)||(5875146-5875323)
chr3 (60-237)||(12295704-12295881)
chr3 (60-237)||(16477438-16477615)
chr3 (60-237)||(24392956-24393133)
chr3 (60-237)||(41684833-41685010)
chr3 (67-237)||(14466815-14466985)
chr3 (60-237)||(8775863-8776040)
chr3 (60-237)||(18485196-18485373)
chr3 (60-237)||(38195930-38196107)
chr3 (60-237)||(39373260-39373437)
chr3 (61-237)||(23758440-23758616)
chr3 (67-237)||(13122889-13123059)
chr3 (60-237)||(28323701-28323878)
chr3 (62-230)||(29470675-29470843)
chr3 (61-237)||(12248329-12248505)
chr3 (143-237)||(10635920-10636014)
chr3 (60-147)||(10654248-10654335)
chr3 (65-125)||(13072979-13073039)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (63-237)||(43083835-43084009)
chr2 (63-237)||(29245393-29245567)
chr2 (65-237)||(24337264-24337436)
chr2 (61-237)||(40223475-40223651)
chr2 (60-237)||(11404345-11404522)
chr2 (60-237)||(43346540-43346717)
chr2 (68-237)||(4211085-4211254)
chr2 (60-237)||(10268123-10268300)
chr2 (60-237)||(10278700-10278877)
chr2 (60-237)||(27222561-27222738)
chr2 (60-237)||(35254174-35254351)
chr2 (60-237)||(35264783-35264960)
chr2 (67-237)||(22959203-22959373)
chr2 (61-237)||(9907060-9907236)
chr2 (61-237)||(9772231-9772407)
chr2 (61-207)||(34803301-34803447)
chr2 (203-237)||(34799692-34799726)
chr2 (65-230)||(21171305-21171470)
chr2 (65-230)||(28730751-28730916)
chr2 (204-237)||(35759242-35759275)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (63-237)||(19129938-19130112)
chr8 (63-237)||(26112468-26112642)
chr8 (60-237)||(15766081-15766258)
chr8 (60-237)||(15790218-15790395)
chr8 (60-237)||(36294108-36294285)
chr8 (9-237)||(242944-243168)
chr8 (9-237)||(796314-796538)
chr8 (60-237)||(209087-209264)
chr8 (60-237)||(722710-722887)
chr8 (60-237)||(3358139-3358316)
chr8 (60-237)||(9342313-9342490)
chr8 (60-237)||(29077889-29078066)
chr8 (60-237)||(32087203-32087380)
chr8 (60-237)||(13687498-13687675)
chr8 (60-237)||(36079113-36079290)
chr8 (67-237)||(6152292-6152462)
chr8 (66-225)||(19226134-19226293)
chr8 (66-225)||(30324174-30324333)
chr8 (60-151)||(44482305-44482396)
chr8 (121-237)||(44482387-44482503)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (63-237)||(4168401-4168575)
chr1 (45-237)||(19180067-19180259)
chr1 (65-237)||(5649257-5649429)
chr1 (65-237)||(21864824-21864996)
chr1 (60-237)||(38096206-38096383)
chr1 (60-237)||(51655375-51655552)
chr1 (60-237)||(7508420-7508597)
chr1 (60-237)||(36245931-36246108)
chr1 (60-237)||(35400043-35400220)
chr1 (60-237)||(35647568-35647745)
chr1 (60-237)||(47617437-47617614)
chr1 (67-237)||(12622677-12622847)
chr1 (60-237)||(5834347-5834524)
chr1 (60-237)||(3172743-3172920)
chr1 (61-237)||(12731631-12731807)
chr1 (61-237)||(12742224-12742400)
chr1 (62-230)||(153158-153326)
[»] scaffold1216 (1 HSPs)
scaffold1216 (6-235)||(205-439)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (63-237)||(24026926-24027100)
chr4 (65-237)||(17919294-17919466)
chr4 (6-223)||(40469494-40469716)
chr4 (63-237)||(19953843-19954017)
chr4 (60-237)||(55754716-55754893)
chr4 (60-237)||(10750056-10750233)
chr4 (60-237)||(10963825-10964002)
chr4 (60-237)||(18761969-18762146)
chr4 (60-237)||(24641490-24641667)
chr4 (60-237)||(36019510-36019687)
chr4 (67-237)||(16257112-16257282)
chr4 (61-237)||(21997592-21997768)
chr4 (60-237)||(27657823-27658000)
chr4 (61-237)||(451752-451928)
chr4 (61-237)||(30935979-30936155)
chr4 (65-125)||(16306388-16306448)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (60-237)||(32312-32489)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (60-237)||(46482-46659)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (62-230)||(52481-52649)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (62-237)||(3424-3599)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (162-235)||(3556-3629)
[»] scaffold0398 (2 HSPs)
scaffold0398 (62-225)||(3253-3416)
scaffold0398 (62-140)||(11593-11671)
[»] scaffold1002 (1 HSPs)
scaffold1002 (62-151)||(2863-2952)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (66-133)||(23758-23825)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (60-151)||(2444-2535)
scaffold0454 (121-237)||(2526-2642)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31447740 - 31447510
Alignment:
Q  9 aagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaa------caagcaaggaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31447740 aagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaattaaaacaagcaaagaatgttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgtt 31447641  T
Q  103 ccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgat 202  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    
T  31447640 ccaaaatatacttaatttgctcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattctagcagcccttgtaat 31447541  T
Q  203 gtactcttcttctggatagaaagtagtgatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31447540 gtactcttcttctggatagaaaggagtgatg 31447510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 27604554 - 27604728
Alignment:
Q  63 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604554 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 27604653  T
Q  163 ttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27604654 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagtccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 27604728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Original strand, 5291657 - 5291849
Alignment:
Q  45 aaaacaagcaaggaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 144  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5291657 aaaacaagcaaagaaaactgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctattccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 5291756  T
Q  145 catccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5291757 catccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttataatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 5291849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40400161 - 40399989
Alignment:
Q  65 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 164  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40400161 ggtgtgcaactagggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 40400062  T
Q  165 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40400061 cttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtaatgtattcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 40399989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39361443 - 39361270
Alignment:
Q  64 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattct 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39361443 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatcattcttcttgagtagctcatccttttccctcattct 39361344  T
Q  164 tcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39361343 tcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctgggtagaaaggagtgatgtcca 39361270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15768539 - 15768362
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15768539 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 15768440  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15768439 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 15768362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 37731057 - 37731234
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37731057 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 37731156  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37731157 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 37731234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6985497 - 6985320
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6985497 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 6985398  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6985397 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 6985320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9345739 - 9345562
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9345739 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctaaagtagctcatccttttccctca 9345640  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9345639 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 9345562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14039796 - 14039619
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14039796 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 14039697  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14039696 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 14039619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 14448131 - 14448308
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14448131 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 14448230  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14448231 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 14448308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 14559163 - 14559340
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14559163 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 14559262  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14559263 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 14559340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17616818 - 17616641
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17616818 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 17616719  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||  | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17616718 ttcttcttttgtatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 17616641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17728675 - 17728498
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17728675 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 17728576  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||  | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17728575 ttcttcttttgtatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 17728498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22685202 - 22685025
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22685202 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 22685103  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22685102 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 22685025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23306045 - 23305868
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23306045 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 23305946  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23305945 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 23305868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23371708 - 23371531
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23371708 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 23371609  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23371608 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 23371531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23706555 - 23706378
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23706555 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 23706456  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23706455 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 23706378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 27043314 - 27043491
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27043314 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 27043413  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27043414 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 27043491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27469760 - 27469583
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27469760 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 27469661  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27469660 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 27469583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31358292 - 31358115
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31358292 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 31358193  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||  | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31358192 ttcttcttttgtatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 31358115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 36583604 - 36583781
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36583604 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 36583703  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36583704 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 36583781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42052567 - 42052390
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  42052567 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 42052468  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42052467 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 42052390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 24589159 - 24589336
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  24589159 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttacctca 24589258  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24589259 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 24589336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 30228551 - 30228728
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30228551 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 30228650  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  30228651 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtaatgtcca 30228728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 39491992 - 39492169
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  39491992 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatcctttttcctca 39492091  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39492092 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 39492169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 24817946 - 24818123
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24817946 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 24818045  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24818046 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggattgatgtcca 24818123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22156244 - 22156074
Alignment:
Q  67 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  22156244 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 22156145  T
Q  167 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22156144 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 22156074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35225261 - 35225084
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35225261 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 35225162  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  35225161 ttcttcttacatgcccagcatgaatccttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 35225084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Original strand, 15994389 - 15994565
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || |     
T  15994389 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatcattttcccttaa 15994488  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  15994489 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagagatgtcca 15994565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31843163 - 31842987
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |  ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  31843163 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactattctaagaaatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 31843064  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31843063 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtgatgtcca 31842987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 208
Target Start/End: Original strand, 1110295 - 1110441
Alignment:
Q  62 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcatt 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| |    
T  1110295 ttgggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacaactgttccaatagatacttaatttgctcatccttcttctgaagttgttcatcctttgctctcagt 1110394  T
Q  162 cttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactc 208  Q
    || ||||| |||||| |||| ||||| |||| |||||  ||||||||    
T  1110395 ctacttttcaacccagcatgaattctagcagtccttgaaatgtactc 1110441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20796818 - 20796650
Alignment:
Q  62 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcatt 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| |    
T  20796818 ttgggtgtgcaactaaggtttggctagcttatacatctgttccaaaagatatttaatctgctcatccttcttctgaagttgttcatcctttgctctcagt 20796719  T
Q  162 cttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtg 230  Q
    |||||||| |||||  | || |||||  |||  ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20796718 cttcttttcaacccggcttgaattctaacagttcttgaaatgtactcatcttctggatagaaaggagtg 20796650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 36697394 - 36697303
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatcctt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||     |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36697394 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 36697303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36697312 - 36697196
Alignment:
Q  121 gctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggata 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |   | || |||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  36697312 gctcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcataaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggata 36697213  T
Q  221 gaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||| |||||||||||    
T  36697212 gaaaggagtgatgtcca 36697196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19477060 - 19477001
Alignment:
Q  66 gtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctca 125  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  19477060 gtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccataaagtatttaatctgctca 19477001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23405565 - 23405405
Alignment:
Q  65 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 164  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||  |||||||| | ||| ||||| ||||||  || ||||| ||||   ||||||||  |||||| ||||    
T  23405565 ggtgtgcaactaaggtttggatagcttagacacttgttccaataagtatttaatctgctcagactgcttctgaagttcttcatccttggctctcagtctt 23405466  T
Q  165 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaag 225  Q
    ||| | | |||  | || |||||  ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  23405465 cttctcagcccttcttgaattctatcagcccttgagatgtaatcagcttctggatagaaag 23405405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21002148 - 21001956
Alignment:
Q  45 aaaacaagcaaggaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 144  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21002148 aaaacaagcaaagaaaattgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 21002049  T
Q  145 catccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21002048 catccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 21001956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19993197 - 19992966
Alignment:
Q  9 aagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaa-----caagcaaggaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19993197 aagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaattaaacaagcaaagagtgttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttc 19993098  T
Q  104 caaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatg 203  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  19993097 caagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtaactcatccttttctctcattcttcttttgaatccagcatgaattctagcagcccttgtgatg 19992998  T
Q  204 tactcttcttctggatagaaagtagtgatgtc 235  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19992997 tactcttcttctggatagaaaggagtgatgtc 19992966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Original strand, 9434409 - 9434601
Alignment:
Q  45 aaaacaagcaaggaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 144  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9434409 aaaacaagcaaagaaaaatgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 9434508  T
Q  145 catccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9434509 catccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 9434601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 5686723 - 5686897
Alignment:
Q  63 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5686723 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 5686822  T
Q  163 ttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5686823 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 5686897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6876965 - 6876791
Alignment:
Q  63 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876965 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 6876866  T
Q  163 ttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6876865 ttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 6876791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 1988726 - 1988903
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1988726 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 1988825  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1988826 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 1988903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8011812 - 8011635
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8011812 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 8011713  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8011712 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 8011635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 22090372 - 22090544
Alignment:
Q  65 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22090372 ggtgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcattctt 22090471  T
Q  165 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22090472 cttttatacccagcatgaattctggttgcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 22090544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 24735911 - 24736088
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24735911 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 24736010  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24736011 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 24736088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2715361 - 2715185
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  2715361 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttttgaagtagctcatccttttccctcat 2715262  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2715261 tcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtgatgtcca 2715185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 4213219 - 4213389
Alignment:
Q  67 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4213219 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgattttctcatccttcttcttgagtagctcatcattttccctcattcttct 4213318  T
Q  167 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||| ||||| |||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4213319 tttatacccagcatgaattcttgatgcccttgtaatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 4213389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17959793 - 17959623
Alignment:
Q  67 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17959793 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcattcttct 17959694  T
Q  167 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17959693 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 17959623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 9086415 - 9086592
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9086415 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 9086514  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9086515 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 9086592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26399821 - 26399644
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26399821 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaacagttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 26399722  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26399721 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 26399644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40051829 - 40051652
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40051829 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 40051730  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    || |||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40051729 ttattcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 40051652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 11097198 - 11097376
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11097198 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 11097297  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcc-cttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11097298 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccactagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 11097376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 11006375 - 11006552
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11006375 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 11006474  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11006475 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 11006552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26698854 - 26698677
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26698854 agttggatgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactattctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 26698755  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26698754 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 26698677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 42867016 - 42867193
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42867016 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 42867115  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  42867116 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 42867193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Original strand, 8618587 - 8618755
Alignment:
Q  69 tgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttt 168  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  8618587 tgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcattcttattt 8618686  T
Q  169 taaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |  ||||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8618687 tgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 8618755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 168090 - 168260
Alignment:
Q  67 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  168090 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 168189  T
Q  167 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  168190 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 168260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 466718 - 466541
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  466718 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttccctta 466619  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
     | | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  466618 atttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagagatgtcca 466541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15887365 - 15887206
Alignment:
Q  66 gtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttc 165  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| || || ||||  |||||||| ||||||| |||| | || | || | |||||| |||||    
T  15887365 gtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccaatagatatttaacctgctcatcattcttctgaagttgttctttctgtgctctcagtcttc 15887266  T
Q  166 ttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaag 225  Q
    |||| | |||| | || |||||  |||||||||   |||| || ||||||||||| ||||    
T  15887265 ttttcagcccagcttgaattctatcagcccttgaagtgtaatcatcttctggataaaaag 15887206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9122205 - 9122013
Alignment:
Q  45 aaaacaagcaaggaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 144  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9122205 aaaacaagcaaagaaaattgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 9122106  T
Q  145 catccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9122105 catccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 9122013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 27373873 - 27374107
Alignment:
Q  9 aagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaa------caagcaaggaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgtt 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373873 aagatacaaaggcaaaactactaacaacttagaacaaaaattaaaacaagcaaagagtgttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgtt 27373972  T
Q  103 ccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgat 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27373973 ccaaaaggtacttaatttgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgat 27374072  T
Q  203 gtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27374073 atactcttcttctagatagaaaggagtgatgtcca 27374107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 27464226 - 27464460
Alignment:
Q  9 aagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaa------caagcaaggaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgtt 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27464226 aagatacaaaggcaaaactactaacaacttagaacaaaaattaaaacaagcaaagagtgttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgtt 27464325  T
Q  103 ccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgat 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27464326 ccaaaaggtacttaatttgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgat 27464425  T
Q  203 gtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27464426 atactcttcttctagatagaaaggagtgatgtcca 27464460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 63 - 235
Target Start/End: Original strand, 25590360 - 25590532
Alignment:
Q  63 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |    
T  25590360 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttctaagaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagaagttcatccttctctctcatcc 25590459  T
Q  163 ttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtc 235  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25590460 ttcttttaaacccagcatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtc 25590532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Original strand, 12856097 - 12856273
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12856097 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcat 12856196  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12856197 tcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 12856273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Original strand, 26865940 - 26866116
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26865940 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcat 26866039  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||| | ||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26866040 tcttcttttatatccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 26866116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 3662491 - 3662668
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3662491 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 3662590  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3662591 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 3662668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12726494 - 12726317
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12726494 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 12726395  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12726394 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 12726317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17983795 - 17983618
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17983795 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 17983696  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17983695 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 17983618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 25788875 - 25789052
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25788875 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 25788974  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25788975 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 25789052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 26026566 - 26026743
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26026566 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 26026665  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26026666 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 26026743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 27342874 - 27343051
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27342874 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 27342973  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27342974 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 27343051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 27403614 - 27403791
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27403614 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 27403713  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27403714 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 27403791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 16931541 - 16931718
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16931541 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacnactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 16931640  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16931641 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 16931718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34816825 - 34816655
Alignment:
Q  67 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  34816825 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 34816726  T
Q  167 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34816725 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 34816655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32971526 - 32971358
Alignment:
Q  69 tgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttt 168  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  32971526 tgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatcattttccctcaatcttcttt 32971427  T
Q  169 taaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |  ||||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32971426 tgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 32971358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 7669466 - 7669375
Alignment:
Q  63 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7669466 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttgatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttc 7669375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 225
Target Start/End: Original strand, 12359298 - 12359457
Alignment:
Q  66 gtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttc 165  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||| ||||   |||| |||| |||||| ||| |    
T  12359298 gtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccaatagatatttaatctgatcatccttcttctgaagttcttcattctttgctctcaatctgc 12359397  T
Q  166 ttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaag 225  Q
    |||| | |||  | || |||||  |||||||||   |||| || ||||||||||||||||    
T  12359398 ttttcagccctgcttgaattctatcagcccttgaagtgtaatcatcttctggatagaaag 12359457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 237
Target Start/End: Original strand, 27385644 - 27385760
Alignment:
Q  121 gctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggata 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |   | || |||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  27385644 gctcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggata 27385743  T
Q  221 gaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||| |||||||||||    
T  27385744 gaaaggagtgatgtcca 27385760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 237
Target Start/End: Original strand, 27476057 - 27476173
Alignment:
Q  121 gctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggata 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |   | || |||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  27476057 gctcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggata 27476156  T
Q  221 gaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||| |||||||||||    
T  27476157 gaaaggagtgatgtcca 27476173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 151
Target Start/End: Original strand, 4632036 - 4632127
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatcctt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||     |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4632036 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 4632127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 151
Target Start/End: Original strand, 27385562 - 27385653
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatcctt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||     |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27385562 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 27385653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 151
Target Start/End: Original strand, 27475975 - 27476066
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatcctt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||     |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27475975 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 27476066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 32310741 - 32310650
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatcctt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||     |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32310741 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 32310650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 237
Target Start/End: Original strand, 4632118 - 4632234
Alignment:
Q  121 gctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggata 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |   | || |||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  4632118 gctcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcataaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggata 4632217  T
Q  221 gaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||| |||||||||||    
T  4632218 gaaaggagtgatgtcca 4632234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32310659 - 32310543
Alignment:
Q  121 gctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggata 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |   | || |||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  32310659 gctcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcataaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggata 32310560  T
Q  221 gaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||| |||||||||||    
T  32310559 gaaaggagtgatgtcca 32310543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16390659 - 16390427
Alignment:
Q  9 aagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaa------caagcaaggaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16390659 aagatacaaaggcaaagctactaacaacttagagcaaaaattaaaacaagcaaagaatgtcgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgtt 16390560  T
Q  103 ccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgat 202  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||    
T  16390559 ccaagagatacttaatttgctcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattctggctgcccttgtgat 16390460  T
Q  203 gtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16390459 gtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtc 16390427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 37867664 - 37867838
Alignment:
Q  63 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37867664 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctattccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 37867763  T
Q  163 ttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37867764 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 37867838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 37876182 - 37876356
Alignment:
Q  63 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37876182 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctattccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 37876281  T
Q  163 ttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37876282 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 37876356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Original strand, 19779600 - 19779773
Alignment:
Q  64 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattct 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19779600 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattct 19779699  T
Q  164 tcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19779700 tcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttatgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 19779773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6219710 - 6219538
Alignment:
Q  65 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6219710 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaagagatacttaatttgttcatccttctgcttaagtagctcatccttttctctcattctt 6219611  T
Q  165 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6219610 cttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 6219538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6500040 - 6499864
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6500040 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 6499941  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6499940 tcttcttttaagcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttcttgatagaaaggagtgatgtcca 6499864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9992987 - 9992794
Alignment:
Q  44 aaaaacaagcaaggaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagc 143  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  9992987 aaaaacaagctaagagtgttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatatgatcatccttcttcttaagtagc 9992888  T
Q  144 tcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9992887 tcatccttttctctcattcttcttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttcgggatagaaaggagtgatgtcca 9992794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20682787 - 20682617
Alignment:
Q  67 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20682787 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttccctcattcttct 20682688  T
Q  167 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||| ||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20682687 tttatacccagcatgaattcttgatgcccttgtgatgtactcttcttctgtatagaaaggagtgatgtcca 20682617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13382329 - 13382153
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13382329 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcat 13382230  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13382229 tcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcctctggatagaaaggagtgatgtcca 13382153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13392923 - 13392747
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13392923 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcat 13392824  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13392823 tcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcctctggatagaaaggagtgatgtcca 13392747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 4744897 - 4745074
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4744897 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 4744996  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4744997 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 4745074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 5511853 - 5512030
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5511853 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 5511952  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5511953 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 5512030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5546682 - 5546505
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5546682 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 5546583  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5546582 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 5546505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 24661074 - 24661251
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24661074 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 24661173  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24661174 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 24661251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5627038 - 5626861
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5627038 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 5626939  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5626938 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 5626861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5875323 - 5875146
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5875323 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 5875224  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||  |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5875223 ttctttgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 5875146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12295881 - 12295704
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12295881 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 12295782  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12295781 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 12295704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 16477438 - 16477615
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16477438 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 16477537  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16477538 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 16477615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24393133 - 24392956
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24393133 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 24393034  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24393033 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctgaatagaaaggagtgatgtcca 24392956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 41684833 - 41685010
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  41684833 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 41684932  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41684933 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 41685010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 14466815 - 14466985
Alignment:
Q  67 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14466815 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcaatcttct 14466914  T
Q  167 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14466915 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 14466985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 8775863 - 8776040
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8775863 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 8775962  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8775963 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 8776040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 18485196 - 18485373
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18485196 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 18485295  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18485296 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 18485373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 38195930 - 38196107
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38195930 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 38196029  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  38196030 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 38196107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 39373260 - 39373437
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39373260 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 39373359  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39373360 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 39373437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Original strand, 23758440 - 23758616
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  23758440 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 23758539  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23758540 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtgatgtcca 23758616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 13122889 - 13123059
Alignment:
Q  67 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13122889 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcaatcttct 13122988  T
Q  167 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||  |||||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13122989 tttgtacccagaatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 13123059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28323878 - 28323701
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28323878 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 28323779  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28323778 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgagatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 28323701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29470843 - 29470675
Alignment:
Q  62 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcatt 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| |    
T  29470843 ttgggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacaactgttccaatagatacttaatttgctcatccttcttctgaagttgttcatcctttgctctcagt 29470744  T
Q  162 cttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtg 230  Q
    || ||||| |||||| |||| ||||| |||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  29470743 ctacttttcaacccagcatgaattctagcagtccttgaaatgtcctcatcttctggatagaaaggagtg 29470675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12248505 - 12248329
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || | ||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  12248505 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttaaacaactgttctaagagatgcttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 12248406  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12248405 tttccttttatgcccagcatgaattctagcagcccttgtgatgtattcttcttctggatagtaaggagtgatgtcca 12248329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10636014 - 10635920
Alignment:
Q  143 ctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10636014 ctcatccttttctctcattttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtgatgtcca 10635920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10654335 - 10654248
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  10654335 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactattctaagagatacttgatttgatcatctttcttctgaagtagctcat 10654248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 125
Target Start/End: Original strand, 13072979 - 13073039
Alignment:
Q  65 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctca 125  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||  ||||||||||| ||||||    
T  13072979 ggtgtgcaactaaggtttggctagcttagacacttgttccattaggtacttaatctgctca 13073039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 43083835 - 43084009
Alignment:
Q  63 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43083835 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 43083934  T
Q  163 ttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43083935 ttcttttaaacccaacatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 43084009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 29245393 - 29245567
Alignment:
Q  63 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29245393 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 29245492  T
Q  163 ttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29245493 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtaatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 29245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24337436 - 24337264
Alignment:
Q  65 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24337436 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttctctcattctt 24337337  T
Q  165 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24337336 cttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 24337264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Original strand, 40223475 - 40223651
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40223475 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcat 40223574  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40223575 tcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 40223651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11404522 - 11404345
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11404522 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 11404423  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11404422 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 11404345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 43346540 - 43346717
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43346540 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 43346639  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43346640 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 43346717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 237
Target Start/End: Original strand, 4211085 - 4211254
Alignment:
Q  68 gtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttctt 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4211085 gtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttctctcattcttctt 4211184  T
Q  168 ttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||  | ||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4211185 ttgtatccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 4211254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 10268123 - 10268300
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10268123 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatcctttttctgaagtagctcatccttttccctca 10268222  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10268223 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 10268300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 10278700 - 10278877
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10278700 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatcctttttctgaagtagctcatccttttccctca 10278799  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10278800 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 10278877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 27222561 - 27222738
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27222561 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 27222660  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27222661 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 27222738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 35254174 - 35254351
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35254174 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 35254273  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  35254274 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 35254351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 35264783 - 35264960
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35264783 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 35264882  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  35264883 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 35264960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22959373 - 22959203
Alignment:
Q  67 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  22959373 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 22959274  T
Q  167 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22959273 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 22959203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9907236 - 9907060
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  9907236 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttacttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 9907137  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9907136 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtgatgtcca 9907060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9772407 - 9772231
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  9772407 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 9772308  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9772307 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtgatgtcca 9772231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34803447 - 34803301
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  34803447 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagttcatccttttccctcat 34803348  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtact 207  Q
    |||||||||| ||||| | || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  34803347 tcttcttttatacccagcctgaattctagcaacccttgtgatgtact 34803301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34799726 - 34799692
Alignment:
Q  203 gtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34799726 gtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 34799692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21171470 - 21171305
Alignment:
Q  65 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 164  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||  |||||||| | ||| ||||| ||||||  || ||||| ||||   ||||||||  |||||| ||||    
T  21171470 ggtgtgcaactaaggtttggatagcttagacacttgttccaataagtatttaatctgctcagactgcttctgaagttcttcatccttggctctcagtctt 21171371  T
Q  165 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtg 230  Q
    ||| | | |||  | || |||||  ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  21171370 cttctcagcccttcttgaattctatcagcccttgagatgtaatcagcttctggatagaaaggagtg 21171305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28730916 - 28730751
Alignment:
Q  65 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 164  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||  |||||||| | ||| ||||| ||||||  || ||||| ||||   ||||||||  |||||| ||||    
T  28730916 ggtgtgcaactaaggtttggatagcttagacacttgttccaataagtatttaatctgctcagactacttctgaagttcttcatccttggctctcagtctt 28730817  T
Q  165 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtg 230  Q
    ||| | | |||  | || |||||  ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  28730816 cttctcagcccttcttgaattctatcagcccttgagatgtaatcagcttctggatagaaaggagtg 28730751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35759275 - 35759242
Alignment:
Q  204 tactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35759275 tactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 35759242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 19129938 - 19130112
Alignment:
Q  63 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19129938 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctgatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 19130037  T
Q  163 ttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19130038 ttcttttaaacccaacatgaattcttgcagcccttgtaatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 19130112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 26112468 - 26112642
Alignment:
Q  63 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26112468 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgttcatccttctgcttaagtagctcatccttttctctcattc 26112567  T
Q  163 ttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26112568 ttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 26112642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15766258 - 15766081
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  15766258 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctaaagtagctcattcttttccctca 15766159  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15766158 ttcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 15766081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15790395 - 15790218
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15790395 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatccgatcatccttcttctaaagtagctcatccttttccctca 15790296  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15790295 ttcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 15790218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 36294108 - 36294285
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36294108 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 36294207  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36294208 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 36294285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 242944 - 243168
Alignment:
Q  9 aagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaacaagcaaggaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaa 108  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||  || | |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  242944 aagatacaaagacacagctactaagaacaaagta-aaaaacaagctag---agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaaga 243039  T
Q  109 ggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactc 208  Q
    | ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  243040 gatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactc 243139  T
Q  209 ttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  243140 ttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 243168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 796314 - 796538
Alignment:
Q  9 aagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaacaagcaaggaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaa 108  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||  || | |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  796314 aagatacaaagacacagctactaagaacaaagta-aaaaacaagctag---agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaaga 796409  T
Q  109 ggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactc 208  Q
    | ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  796410 gatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactc 796509  T
Q  209 ttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  796510 ttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 796538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 209264 - 209087
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  209264 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 209165  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  209164 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 209087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 722887 - 722710
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  722887 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 722788  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  722787 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 722710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3358316 - 3358139
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3358316 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 3358217  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3358216 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 3358139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 9342313 - 9342490
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9342313 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 9342412  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9342413 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 9342490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 29077889 - 29078066
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29077889 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 29077988  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29077989 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 29078066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32087380 - 32087203
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32087380 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 32087281  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32087280 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 32087203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13687675 - 13687498
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13687675 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 13687576  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13687575 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 13687498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 36079113 - 36079290
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36079113 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 36079212  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36079213 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 36079290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 6152292 - 6152462
Alignment:
Q  67 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6152292 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcattcttctttttgagtagctcatccttttccctcaatcttct 6152391  T
Q  167 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6152392 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctcgatagaaaggagtgatgtcca 6152462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 225
Target Start/End: Original strand, 19226134 - 19226293
Alignment:
Q  66 gtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttc 165  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||| |||| | || | || | |||||| |||||    
T  19226134 gtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccaatagatatttaatctgctcatccttcttctgaagttgttctttctgtgctctcagtcttc 19226233  T
Q  166 ttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaag 225  Q
    |||| | |||| | || |||||  |||||||||   |||| || ||||||||||||||||    
T  19226234 ttttcagcccagcttgaattctatcagcccttgaagtgtaatcatcttctggatagaaag 19226293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30324333 - 30324174
Alignment:
Q  66 gtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttc 165  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||| | |||  || | |||||| |||||    
T  30324333 gtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccaaaagatatttaatctgctcatccttcttctgaagttgttcagtctgtgctctcactcttc 30324234  T
Q  166 ttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaag 225  Q
    |||| | |||| | || |||||  |||||||||   |||| || ||||||||||| ||||    
T  30324233 ttttcagcccagcttgaattctatcagcccttgaagtgtaatcatcttctggataaaaag 30324174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 151
Target Start/End: Original strand, 44482305 - 44482396
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatcctt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||     |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44482305 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcagctgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 44482396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 237
Target Start/End: Original strand, 44482387 - 44482503
Alignment:
Q  121 gctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggata 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |   | || |||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  44482387 gctcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcataaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggata 44482486  T
Q  221 gaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||| |||||||||||    
T  44482487 gaaaggagtgatgtcca 44482503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 4168401 - 4168575
Alignment:
Q  63 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4168401 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 4168500  T
Q  163 ttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4168501 ttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 4168575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Original strand, 19180067 - 19180259
Alignment:
Q  45 aaaacaagcaaggaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 144  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19180067 aaaacaagcaaagaaaactgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 19180166  T
Q  145 catccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19180167 catccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtaatatactcttcttctagatagaaaggagtgatgtcca 19180259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5649429 - 5649257
Alignment:
Q  65 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5649429 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatctgctcatccttcttattgagtagctcatccttttctctcattctt 5649330  T
Q  165 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5649329 cttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctgggtagaaaggagtgatgtcca 5649257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 21864824 - 21864996
Alignment:
Q  65 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21864824 ggtgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcattctt 21864923  T
Q  165 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21864924 cttttatacccagcatgaattcttgttgcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 21864996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 38096206 - 38096383
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38096206 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttttgaagtagctcatccttttctctca 38096305  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38096306 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 38096383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 51655552 - 51655375
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  51655552 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 51655453  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51655452 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 51655375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 7508420 - 7508597
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7508420 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 7508519  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7508520 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 7508597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36246108 - 36245931
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36246108 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 36246009  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  36246008 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttatggatagaaaggagtgatgtcca 36245931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35400220 - 35400043
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35400220 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 35400121  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  35400120 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 35400043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35647745 - 35647568
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35647745 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 35647646  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  35647645 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 35647568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47617614 - 47617437
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47617614 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 47617515  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  47617514 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 47617437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12622847 - 12622677
Alignment:
Q  67 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12622847 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcgtccttctttttgagtagctcatccttttccctcattcttct 12622748  T
Q  167 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||  | ||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12622747 tttgtatccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 12622677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 5834347 - 5834524
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5834347 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 5834446  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5834447 ttcttcttacatgcccagcatgaatccttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 5834524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 3172743 - 3172920
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3172743 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttctttttaagtagctcatccttttccctca 3172842  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3172843 ttcttcttacatgcccagcatgaatccttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 3172920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Original strand, 12731631 - 12731807
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  12731631 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 12731730  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  12731731 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagagatgtcca 12731807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Original strand, 12742224 - 12742400
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  12742224 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 12742323  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  12742324 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagagatgtcca 12742400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 153326 - 153158
Alignment:
Q  62 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcatt 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| |||||| |    
T  153326 ttgggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacaactgttccaatagatacttaatttgctcatccttcttctgaagttgttcattctttgctctcagt 153227  T
Q  162 cttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtg 230  Q
    || ||||| |||||| |||| ||||| |||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  153226 ctacttttcaacccagcatgaattctagcagtccttgaaatgtactcatcttctggatagaaaggagtg 153158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1216 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1216
Description:

Target: scaffold1216; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 235
Target Start/End: Original strand, 205 - 439
Alignment:
Q  6 gtcaagatacaaaggcaaagctactaaca-acttagaacaaaaa-----caagcaaggaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||     ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  205 gtcaagatacaaaggcaaagctactaaaatacttagaacaaaaattaaacaagcaaagaa-gatgggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacattt 303  T
Q  100 gttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  304 gttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaatccagcatgaattctagcagcccttgt 403  T
Q  200 gatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtc 235  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  404 aatgtactcttcttatggatagaaaggagtgttgtc 439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24027100 - 24026926
Alignment:
Q  63 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24027100 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttgatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttccctcattc 24027001  T
Q  163 ttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24027000 ttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 24026926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 17919294 - 17919466
Alignment:
Q  65 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17919294 ggtgtgcaactaaggttgggctttcttgtacatctgttccaaaagatacttgatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttccctcattctt 17919393  T
Q  165 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17919394 cttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 17919466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40469716 - 40469494
Alignment:
Q  6 gtcaagatacaaaggcaaagctactaaca-acttagaacaaaaa-----caagcaaggaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||     |||||||  ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  40469716 gtcaagatacaaaggcaaagctactaaaatatttagaacaaaaattaaacaagcaaaaaaaat-gggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacattt 40469618  T
Q  100 gttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  40469617 gttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaatccagcatgaattctagcagcccttgt 40469518  T
Q  200 gatgtactcttcttctggatagaa 223  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  40469517 aatgtactcttcttctagatagaa 40469494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19954017 - 19953843
Alignment:
Q  63 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 162  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  19954017 tgggtgtgcaactaaggttggacttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttcccttattc 19953918  T
Q  163 ttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19953917 ttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactattcttctgggtagaaaggagtgatgtcca 19953843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 55754893 - 55754716
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55754893 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 55754794  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55754793 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 55754716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10750233 - 10750056
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10750233 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttagacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 10750134  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10750133 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 10750056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10964002 - 10963825
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10964002 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttagacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 10963903  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10963902 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 10963825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18762146 - 18761969
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18762146 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatttgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 18762047  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18762046 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagcccatgtgatgtattcctcttctggatagaaaggagtgatgtcca 18761969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 24641490 - 24641667
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24641490 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 24641589  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24641590 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 24641667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 36019510 - 36019687
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36019510 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaattgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 36019609  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36019610 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 36019687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 16257112 - 16257282
Alignment:
Q  67 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  16257112 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 16257211  T
Q  167 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16257212 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 16257282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Original strand, 21997592 - 21997768
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  21997592 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 21997691  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    | | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  21997692 tttccttttatgcccaacatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagagatgtcca 21997768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 27657823 - 27658000
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27657823 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttctttttaagtagctcatccttttccctca 27657922  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27657923 ttcttcttacatgcccagcatgaatccttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 27658000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Original strand, 451752 - 451928
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  451752 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 451851  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  451852 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagagatgtcca 451928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30936155 - 30935979
Alignment:
Q  61 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  30936155 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 30936056  T
Q  161 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  30936055 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagagatgtcca 30935979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 125
Target Start/End: Original strand, 16306388 - 16306448
Alignment:
Q  65 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctca 125  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||  ||||||||||| ||||||    
T  16306388 ggtgtgcaactaaggtttggctagcttagacacttgttccattaggtacttaatctgctca 16306448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 32312 - 32489
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  32312 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttttgaagtagctcatccttttccctca 32411  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32412 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 32489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 46659 - 46482
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46659 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 46560  T
Q  160 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  46559 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 46482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 52649 - 52481
Alignment:
Q  62 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcatt 161  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| |    
T  52649 ttgggtgtgcaactaaggtttgacttgcttatacatctgttccaatagatacttaatttgctcatccttcttctgaagttgttcatcctttgctctcagt 52550  T
Q  162 cttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtg 230  Q
    || ||||| |||||| |||| ||||| |||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  52549 ctacttttcaacccagcatgaattctagcagtccttgaaatgtactcatcttctggatagaaaggagtg 52481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3599 - 3424
Alignment:
Q  62 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcatt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || || ||  | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |    
T  3599 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgctctaagagatatctgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttcccttaat 3500  T
Q  162 cttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtcca 237  Q
     |||| |||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||    
T  3499 tttctcttatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtattcttcctctgggtagaagggagtgatatcca 3424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 235
Target Start/End: Original strand, 3556 - 3629
Alignment:
Q  162 cttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagtagtgatgtc 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3556 cttcttttaaacccagcatgtattcttgcagctcttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtc 3629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3416 - 3253
Alignment:
Q  62 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcatt 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||| |||| | |||| || | |||| | |    
T  3416 ttgggtgtgcaactaaggtttggctagcttatacatctgttccaatagatatttaatctgctcatccttcttctgaagttgttcattctgtgctcttagt 3317  T
Q  162 cttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaag 225  Q
    |||||||| | |||| | || |||||  |||| ||||  ||||| || ||||||||||| ||||    
T  3316 cttcttttcagcccagcttgaattctatcagctcttgaaatgtaatcatcttctggataaaaag 3253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11671 - 11593
Alignment:
Q  62 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagt 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11671 ttgggtgtgcaactaaggtttggctagcttatacatctgttccaatagatatttaatctgctcatccttcttctgaagt 11593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1002 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1002
Description:

Target: scaffold1002; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 2952 - 2863
Alignment:
Q  62 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatcctt 151  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  2952 ttgggtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccagtagatatttaatctgctcatccttcttctgaagttgttcatcctt 2863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 133
Target Start/End: Original strand, 23758 - 23825
Alignment:
Q  66 gtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttctt 133  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  23758 gtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccaaaagatatttaatctgctcatccttctt 23825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 151
Target Start/End: Original strand, 2444 - 2535
Alignment:
Q  60 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatcctt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||     |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2444 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 2535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 237
Target Start/End: Original strand, 2526 - 2642
Alignment:
Q  121 gctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggata 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |   | || |||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  2526 gctcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcataaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggata 2625  T
Q  221 gaaagtagtgatgtcca 237  Q
    ||||| |||||||||||    
T  2626 gaaaggagtgatgtcca 2642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University