View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8905A_low_53 (Length: 355)

Name: NF8905A_low_53
Description: NF8905A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8905A_low_53
NF8905A_low_53
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (13-355)||(15229280-15229622)
chr4 (13-355)||(1901668-1902010)
chr4 (13-355)||(15283446-15283788)
chr4 (13-351)||(15389896-15390234)
chr4 (13-342)||(6571277-6571606)
chr4 (14-342)||(34187479-34187807)
chr4 (14-351)||(14666433-14666770)
chr4 (14-351)||(24590874-24591211)
chr4 (14-342)||(36343034-36343362)
chr4 (13-336)||(31125036-31125359)
chr4 (13-342)||(5007297-5007626)
chr4 (13-342)||(39852062-39852391)
chr4 (14-342)||(14761823-14762151)
chr4 (13-336)||(30755184-30755507)
chr4 (13-336)||(33672316-33672639)
chr4 (52-342)||(18799170-18799460)
chr4 (14-351)||(24114077-24114414)
chr4 (13-342)||(54834811-54835140)
chr4 (13-336)||(14099971-14100294)
chr4 (13-336)||(21971131-21971454)
chr4 (13-336)||(27161834-27162157)
chr4 (52-336)||(40104195-40104479)
chr4 (14-258)||(17014551-17014795)
chr4 (13-81)||(24460281-24460349)
chr4 (267-330)||(14731187-14731250)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (13-355)||(19454929-19455270)
chr2 (13-355)||(21701671-21702013)
chr2 (14-342)||(37376566-37376894)
chr2 (13-336)||(27805118-27805441)
chr2 (13-342)||(27778627-27778956)
chr2 (14-351)||(28883610-28883947)
chr2 (13-342)||(34287759-34288088)
chr2 (13-342)||(34292819-34293148)
chr2 (13-336)||(9348489-9348812)
chr2 (13-336)||(12588221-12588544)
chr2 (13-336)||(16827845-16828168)
chr2 (13-336)||(16893313-16893636)
chr2 (13-336)||(32051209-32051532)
chr2 (13-342)||(40234916-40235245)
chr2 (13-336)||(19415006-19415329)
chr2 (13-336)||(13935051-13935374)
chr2 (52-342)||(27818385-27818675)
chr2 (13-342)||(259260-259589)
chr2 (14-351)||(23127074-23127411)
chr2 (13-336)||(12715109-12715432)
chr2 (13-342)||(11633692-11634021)
chr2 (14-351)||(27432952-27433289)
chr2 (13-342)||(39050329-39050658)
chr2 (14-351)||(12656938-12657275)
chr2 (14-258)||(20839390-20839634)
chr2 (13-336)||(21675689-21676012)
chr2 (13-336)||(31877692-31878015)
chr2 (13-81)||(34302968-34303036)
chr2 (13-335)||(34863092-34863414)
chr2 (13-336)||(39891485-39891808)
chr2 (13-342)||(37949829-37950158)
chr2 (13-81)||(3785162-3785230)
chr2 (13-81)||(27119196-27119264)
chr2 (13-81)||(31890993-31891061)
chr2 (13-81)||(34157518-34157586)
chr2 (248-342)||(11640117-11640211)
chr2 (13-125)||(37926992-37927104)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (13-355)||(16625160-16625502)
chr3 (13-355)||(18531745-18532087)
chr3 (14-351)||(8297333-8297670)
chr3 (13-342)||(20575406-20575735)
chr3 (14-342)||(7074582-7074910)
chr3 (14-342)||(20067413-20067741)
chr3 (13-342)||(10397503-10397832)
chr3 (14-351)||(18052623-18052960)
chr3 (14-351)||(22386138-22386475)
chr3 (44-351)||(6193676-6193983)
chr3 (13-336)||(18226567-18226890)
chr3 (14-351)||(15891266-15891603)
chr3 (13-342)||(28114513-28114842)
chr3 (13-336)||(29663529-29663852)
chr3 (14-351)||(4722992-4723329)
chr3 (14-351)||(15739654-15739991)
chr3 (14-351)||(35882127-35882464)
chr3 (13-336)||(5607881-5608204)
chr3 (14-342)||(18290913-18291241)
chr3 (14-342)||(18306214-18306542)
chr3 (14-351)||(8288031-8288368)
chr3 (13-342)||(11108908-11109237)
chr3 (14-351)||(29147315-29147652)
chr3 (14-342)||(18275612-18275940)
chr3 (14-342)||(32440524-32440852)
chr3 (13-336)||(4345246-4345569)
chr3 (13-336)||(5015088-5015411)
chr3 (13-335)||(5468362-5468684)
chr3 (13-342)||(5594916-5595245)
chr3 (52-342)||(48467297-48467587)
chr3 (14-343)||(18331997-18332326)
chr3 (52-336)||(18244115-18244399)
chr3 (13-336)||(22869415-22869738)
chr3 (13-336)||(22884474-22884797)
chr3 (13-336)||(31963032-31963355)
chr3 (104-351)||(4795303-4795550)
chr3 (13-342)||(4418289-4418618)
chr3 (13-342)||(8213108-8213437)
chr3 (13-342)||(21676063-21676392)
chr3 (13-336)||(10644446-10644769)
chr3 (13-336)||(17983515-17983838)
chr3 (13-336)||(24329535-24329858)
chr3 (13-336)||(51783399-51783722)
chr3 (13-336)||(6541021-6541344)
chr3 (13-336)||(7997938-7998261)
chr3 (13-336)||(47024829-47025152)
chr3 (13-81)||(5652860-5652928)
chr3 (13-81)||(4626417-4626485)
chr3 (13-81)||(5713700-5713768)
chr3 (13-81)||(5724610-5724678)
chr3 (13-81)||(5767690-5767758)
chr3 (13-81)||(17993501-17993569)
chr3 (53-342)||(28022645-28022934)
chr3 (267-330)||(7090873-7090936)
chr3 (254-329)||(20441500-20441575)
chr3 (254-329)||(41438626-41438701)
chr3 (13-125)||(28340766-28340878)
chr3 (13-125)||(36995759-36995871)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (13-355)||(22889874-22890216)
chr5 (13-355)||(25200434-25200776)
chr5 (13-258)||(25264686-25264931)
chr5 (14-351)||(23893615-23893952)
chr5 (14-351)||(15657176-15657513)
chr5 (14-342)||(41676127-41676455)
chr5 (14-351)||(11550763-11551100)
chr5 (14-351)||(30936042-30936379)
chr5 (14-342)||(33293943-33294271)
chr5 (13-342)||(9318869-9319198)
chr5 (14-351)||(24686573-24686910)
chr5 (14-351)||(24971427-24971764)
chr5 (14-351)||(33778896-33779233)
chr5 (13-342)||(12133573-12133902)
chr5 (14-351)||(23750866-23751203)
chr5 (13-342)||(26481809-26482138)
chr5 (15-336)||(33517780-33518101)
chr5 (13-336)||(40471964-40472287)
chr5 (13-342)||(18499145-18499474)
chr5 (14-351)||(22997530-22997867)
chr5 (14-351)||(23716404-23716741)
chr5 (13-342)||(28650653-28650982)
chr5 (13-342)||(43079670-43079999)
chr5 (13-336)||(24682864-24683187)
chr5 (13-336)||(24725391-24725714)
chr5 (13-336)||(15757272-15757595)
chr5 (13-342)||(3790959-3791288)
chr5 (13-336)||(8663890-8664213)
chr5 (13-336)||(13323244-13323567)
chr5 (14-342)||(18125811-18126139)
chr5 (52-336)||(37669937-37670221)
chr5 (13-336)||(30169893-30170216)
chr5 (13-336)||(37357058-37357381)
chr5 (13-342)||(28958201-28958530)
chr5 (13-336)||(30030839-30031162)
chr5 (13-336)||(30153442-30153765)
chr5 (13-336)||(37756404-37756727)
chr5 (13-336)||(6875729-6876052)
chr5 (13-336)||(31824822-31825145)
chr5 (13-336)||(34617942-34618265)
chr5 (52-336)||(37769441-37769725)
chr5 (13-336)||(31432864-31433187)
chr5 (13-336)||(2512475-2512798)
chr5 (13-81)||(13440067-13440135)
chr5 (13-81)||(9548116-9548184)
chr5 (13-81)||(11326315-11326383)
chr5 (13-81)||(13184222-13184290)
chr5 (14-83)||(20390438-20390507)
chr5 (13-125)||(18373950-18374062)
chr5 (254-329)||(34467047-34467122)
chr5 (13-125)||(5639422-5639534)
chr5 (13-125)||(32594689-32594801)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (13-354)||(16042721-16043062)
chr7 (13-355)||(16448402-16448744)
chr7 (14-351)||(5129393-5129730)
chr7 (13-342)||(5145744-5146073)
chr7 (14-351)||(5160920-5161257)
chr7 (54-351)||(10915313-10915610)
chr7 (14-351)||(16501806-16502143)
chr7 (6-342)||(26318266-26318602)
chr7 (14-351)||(11423182-11423519)
chr7 (13-342)||(26536274-26536603)
chr7 (52-342)||(26436667-26436957)
chr7 (14-351)||(2155974-2156311)
chr7 (14-351)||(16516842-16517179)
chr7 (13-336)||(26514197-26514520)
chr7 (13-336)||(31126336-31126659)
chr7 (13-336)||(31562794-31563117)
chr7 (13-336)||(3446722-3447045)
chr7 (13-336)||(9620067-9620390)
chr7 (13-336)||(11442295-11442618)
chr7 (13-336)||(26273498-26273821)
chr7 (13-336)||(16734864-16735187)
chr7 (13-336)||(16749918-16750241)
chr7 (13-336)||(17524948-17525271)
chr7 (13-336)||(17527944-17528267)
chr7 (13-336)||(24590945-24591268)
chr7 (13-335)||(26668318-26668640)
chr7 (13-81)||(2108567-2108635)
chr7 (13-81)||(45733973-45734041)
chr7 (20-81)||(31088033-31088094)
chr7 (13-81)||(4201060-4201128)
chr7 (13-183)||(45388789-45388959)
chr7 (254-329)||(800159-800234)
chr7 (260-342)||(18542209-18542291)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (13-349)||(16206549-16206885)
chr1 (180-355)||(20462480-20462655)
chr1 (13-336)||(10964084-10964407)
chr1 (13-336)||(51639632-51639955)
chr1 (13-336)||(28586395-28586718)
chr1 (13-336)||(41791826-41792149)
chr1 (13-75)||(20462656-20462718)
chr1 (13-336)||(10946493-10946816)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (13-354)||(17090907-17091248)
chr6 (14-342)||(29550881-29551209)
chr6 (52-355)||(27628206-27628509)
chr6 (13-342)||(16675545-16675874)
chr6 (14-351)||(22933342-22933679)
chr6 (14-351)||(23855787-23856124)
chr6 (14-351)||(24303080-24303417)
chr6 (14-351)||(15422779-15423116)
chr6 (13-336)||(26776071-26776394)
chr6 (14-328)||(26919800-26920114)
chr6 (14-351)||(27020535-27020873)
chr6 (13-342)||(3697487-3697816)
chr6 (14-351)||(13297413-13297750)
chr6 (14-351)||(24865114-24865451)
chr6 (14-351)||(16751251-16751588)
chr6 (50-335)||(27271078-27271363)
chr6 (13-188)||(20162176-20162351)
chr6 (13-188)||(22170480-22170655)
chr6 (13-342)||(29502821-29503150)
chr6 (13-342)||(27045794-27046123)
chr6 (260-355)||(20162084-20162179)
chr6 (260-355)||(22170652-22170747)
chr6 (13-351)||(27288831-27289169)
chr6 (52-336)||(26114910-26115194)
chr6 (13-336)||(27009142-27009465)
chr6 (52-336)||(27486541-27486825)
chr6 (52-336)||(28208866-28209150)
chr6 (13-336)||(30556477-30556800)
chr6 (13-336)||(4759176-4759499)
chr6 (13-336)||(4544236-4544559)
chr6 (13-336)||(4526698-4527021)
chr6 (13-336)||(16942488-16942811)
chr6 (14-351)||(26990286-26990624)
chr6 (52-336)||(4722634-4722918)
chr6 (26-258)||(34913563-34913795)
chr6 (13-342)||(29574419-29574748)
chr6 (13-81)||(8891930-8891998)
chr6 (13-81)||(8903165-8903233)
chr6 (13-81)||(28163166-28163234)
chr6 (13-81)||(33373875-33373943)
chr6 (13-125)||(4774506-4774618)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (13-355)||(22079379-22079721)
chr8 (14-351)||(16284849-16285186)
chr8 (14-351)||(27607383-27607720)
chr8 (14-351)||(18792107-18792444)
chr8 (13-336)||(19675856-19676179)
chr8 (14-351)||(14559024-14559361)
chr8 (13-342)||(19206837-19207166)
chr8 (14-351)||(19689498-19689835)
chr8 (14-351)||(16278954-16279290)
chr8 (14-351)||(2135737-2136074)
chr8 (13-336)||(9356038-9356361)
chr8 (13-336)||(3327984-3328307)
chr8 (13-336)||(29830737-29831060)
chr8 (13-336)||(33260138-33260461)
chr8 (52-336)||(12091240-12091524)
chr8 (13-336)||(31355940-31356263)
chr8 (52-336)||(28360471-28360755)
chr8 (13-81)||(33245177-33245245)
chr8 (13-81)||(19658675-19658743)
chr8 (13-183)||(31488350-31488520)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (13-111)||(46134-46232)
scaffold0124 (14-351)||(31853-32190)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (14-351)||(31157-31494)
scaffold0089 (14-351)||(45504-45841)
scaffold0089 (26-351)||(38600-38925)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (13-336)||(5755-6078)
[»] scaffold1697 (1 HSPs)
scaffold1697 (13-342)||(958-1287)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (14-351)||(28693-29030)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (52-342)||(10975-11265)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (13-336)||(7430-7753)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (52-336)||(9364-9648)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (13-336)||(13448-13771)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (13-336)||(24719-25042)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (13-81)||(22073-22141)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (13-81)||(119574-119642)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (13-125)||(7707-7819)
scaffold0159 (13-125)||(21260-21372)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15229622 - 15229280
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15229622 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 15229523  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15229522 atagcagtcccagtcttcttaggctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaagagaaagatgaca 15229423  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15229422 gctggctaaccaaatatgcctcttctccatggactgtaacaagttttccattctttacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcgccagc 15229323  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 355  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15229322 atcgtgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 15229280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1902010 - 1901668
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1902010 gagaccttccttgtgcttattctcacggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 1901911  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1901910 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcggcagatccagcttcaatgcaagagaaagatgaca 1901811  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1901810 gctggctaaccaaatatgcctcctctccatggactgtaacaagctttccattctttacaaacttcaatttcttatgcagggtagaggttactgcgccagc 1901711  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 355  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1901710 atcgtgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 1901668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Original strand, 15283446 - 15283788
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15283446 gagaccttctttgtgcttattcccgcggagttgtattaacttgccctagccgacagcctgtccttcttggacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 15283545  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15283546 atagcagccccagccttcttaggctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaagagaaagatgaca 15283645  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15283646 gctggctaaccaaatatgtctcttctccatggattgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 15283745  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 355  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15283746 atcatgtgtccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 15283788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 351
Target Start/End: Original strand, 15389896 - 15390234
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    |||||| ||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||| || || ||||| |||    
T  15389896 gagaccctctctgtgcttattcttaaggagttgtattaacttgccccagccggtagcttgaccttcttggacagccctctgagcatccttcaaagaggcc 15389995  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||||||  |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||  |||| || ||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |    
T  15389996 atagcagctccagccctcttgggctccgtaccttcgatagtcaaaccctgaaaagcggttccttctgcagaccctgcttcaatgcaagagaaagatgata 15390095  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||| ||||  || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15390096 gctggctaaccaaatatgcctcctctccatggattgtaacgagctttccattctttacaaactttaacttctggtgcagggtagaggtcactgccccagc 15390195  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
     ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  15390196 gtcatgtatccacggtctttctaggagacagctataaga 15390234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6571606 - 6571277
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  6571606 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 6571507  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  6571506 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 6571407  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  6571406 gctggctgactaagtatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgc 6571307  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  6571306 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 6571277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Original strand, 34187479 - 34187807
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  34187479 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 34187578  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | |||||  ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||    
T  34187579 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagtcaatccttgaaaagcagtcccctctgcagaccctgcttctatgcaggagaaagatgatag 34187678  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| |||||  || |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  34187679 ctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 34187778  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  34187779 tcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 34187807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14666770 - 14666433
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| ||||||| |||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  14666770 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccatccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 14666671  T
Q  114 tagcagtcccagtct-tcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    | ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |    
T  14666670 tggcagttcca-tctctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgata 14666572  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  ||||||||||| || || ||    
T  14666571 gctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggttaccgctcccgc 14666472  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  14666471 gtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 14666433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 24590874 - 24591211
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || || || ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  24590874 agaccttccttatgtttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 24590973  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  24590974 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 24591073  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  24591074 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 24591173  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    || |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  24591174 tcgtgtatccaaggtctccccaagagacagctgtaaga 24591211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Original strand, 36343034 - 36343362
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || || || ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  36343034 agaccttccttatgtttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 36343133  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  36343134 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 36343233  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  36343234 ctggctaaccaagtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 36343333  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  36343334 tcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 36343362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 31125036 - 31125359
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| || || |||| | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  31125036 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 31125135  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |    
T  31125136 atagcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatggtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagata 31125235  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||    
T  31125236 gctggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgc 31125335  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  31125336 atcgtgtatccacggtcttcccag 31125359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5007626 - 5007297
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  5007626 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 5007527  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||| ||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| |||||||| || ||||    
T  5007526 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccctcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcctcaatacaagagaaggaagaca 5007427  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  5007426 gctggctgactaagtatgcctcttccccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgc 5007327  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  5007326 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 5007297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 39852391 - 39852062
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  39852391 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 39852292  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  39852291 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 39852192  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| || || || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  39852191 gctggctgactaagtatgcttcttcaccgtgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgc 39852092  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  39852091 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 39852062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Original strand, 14761823 - 14762151
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  14761823 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 14761922  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  ||||||  | ||||| ||||||| ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  14761923 tggcagttccatccttcttaggttccgttccttcaacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 14762022  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  14762023 ctggctaaccaagtatgccttctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 14762122  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  14762123 tcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 14762151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30755507 - 30755184
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  30755507 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccatccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 30755408  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  30755407 atagcagccccagctttcttaggctccgcaccttcaatggtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 30755308  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  30755307 gctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacgagctttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 30755208  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  30755207 atcgtgtatccacggtcttcccag 30755184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 33672316 - 33672639
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  33672316 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 33672415  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  33672416 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagaca 33672515  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  33672516 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 33672615  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  33672616 atcgtgtatccacggtcttcccag 33672639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 342
Target Start/End: Original strand, 18799170 - 18799460
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  18799170 cttgccccagccggcagtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 18799269  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || ||  |||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  18799270 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccccgcttcaatacaagaaaaggacaacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 18799369  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  18799370 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaggtaaccgcgcccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 18799460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24114414 - 24114077
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  24114414 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 24114315  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | | ||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || |||||  |||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  24114314 ttgcagttccatcccttttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctacagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 24114215  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| |||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  24114214 ctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 24114115  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  24114114 tcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaaga 24114077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 54835140 - 54834811
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | || ||||||| ||||| || ||||||    
T  54835140 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccctctgagcatctttcaatgaagcc 54835041  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||  |||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  54835040 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatgatcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 54834941  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  54834940 gctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgc 54834841  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  54834840 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 54834811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14100294 - 14099971
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || |||||||||    
T  14100294 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaaagaagcc 14100195  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  14100194 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 14100096  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  14100095 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 14099996  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  14099995 catcgtgtatccacggtcttcccag 14099971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 21971454 - 21971131
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  21971454 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 21971355  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  21971354 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccctggaacgcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 21971256  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  21971255 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 21971156  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  21971155 catcgtgtatccatggtcttcccag 21971131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 27161834 - 27162157
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  27161834 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 27161933  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  27161934 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 27162032  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  27162033 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 27162132  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  27162133 catcgtgtatccacggtcttcccag 27162157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 336
Target Start/End: Original strand, 40104195 - 40104479
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||   ||| | |||||||||     
T  40104195 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttagactctgcaccttcaatg 40104294  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  40104295 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 40104394  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  40104395 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccag 40104479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17014795 - 17014551
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  17014795 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 17014696  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| || || ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  17014695 tggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcggaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 17014596  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagctt 258  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  |||||||||||    
T  17014595 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctt 17014551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 24460281 - 24460349
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24460281 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 24460349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 267 - 330
Target Start/End: Original strand, 14731187 - 14731250
Alignment:
Q  267 ttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtct 330  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  14731187 ttacaaacttcaatttctgatggagagtagatgtcactgccccagcgtcatgaatccatggtct 14731250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Original strand, 19454929 - 19455270
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19454929 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccatccggcagcctgtccttcttggacagccttctaagcgtcttttaaagaagcc 19455028  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19455029 atagcagccccagccttcttaggctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaaga-aaagatgaca 19455127  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19455128 gctggctaaccaaatatgtctcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccaac 19455227  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19455228 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 19455270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Original strand, 21701671 - 21702013
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21701671 gagaccttctttgtgcttattctcacggagttgtattaacttgccccggccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 21701770  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  21701771 atagcagtcccagtcttcttgagctccataccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatacaagagaaagacgaca 21701870  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21701871 actggctaaccaaatatgcctcttctccatggactgtaacaagctttccattctttacaaacttaaaattctgatgcagggtagaggttactgcgccagc 21701970  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 355  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21701971 atcgtgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 21702013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37376894 - 37376566
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  37376894 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtactaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 37376795  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  37376794 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 37376695  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  37376694 ctggctaaccaagtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 37376595  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  37376594 tcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 37376566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27805441 - 27805118
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  27805441 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 27805342  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  27805341 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 27805242  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || ||    
T  27805241 gctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtagggtggaggttaccgcacccgc 27805142  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  27805141 atcgtgtatccacggtcttcccag 27805118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27778956 - 27778627
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  27778956 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 27778857  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | |||| |||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  27778856 atagcagccccagctttcttaggctctgcacctccaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 27778757  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  27778756 gctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgc 27778657  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  27778656 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 27778627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28883947 - 28883610
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  28883947 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 28883848  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| ||||||| || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  28883847 tggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaggcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 28883748  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  28883747 ctggctagccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcg 28883648  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  28883647 tcatgtatccaaggtctacccaagagacagctgtaaga 28883610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34288088 - 34287759
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | || ||||||| ||||| || ||||||    
T  34288088 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccctctgagcatctttcaatgaagcc 34287989  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || | ||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||    
T  34287988 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagtagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagaca 34287889  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  34287888 gctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgc 34287789  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  34287788 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 34287759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34293148 - 34292819
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | || ||||||| ||||| || ||||||    
T  34293148 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccctctgagcatctttcaatgaagcc 34293049  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || | ||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||    
T  34293048 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagtagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagaca 34292949  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  34292948 gctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgc 34292849  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  34292848 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 34292819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 9348489 - 9348812
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  9348489 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 9348588  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  9348589 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 9348688  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  9348689 gctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccgttccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgc 9348788  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  9348789 atcgtgtatccacggtcttcccag 9348812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12588544 - 12588221
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  12588544 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 12588445  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  12588444 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 12588345  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    |||| || || || |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  12588344 gctgactgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgc 12588245  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  12588244 atcgtgtatccacggtcttcccag 12588221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 16827845 - 16828168
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| || || |||| | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  16827845 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 16827944  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |    
T  16827945 atagcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatggtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagata 16828044  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||    
T  16828045 gctggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgc 16828144  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  16828145 atcgtgtatccacggtcttcccag 16828168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16893636 - 16893313
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| || || |||| | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  16893636 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 16893537  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |    
T  16893536 atagcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatggtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagata 16893437  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||    
T  16893436 gctggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgc 16893337  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  16893336 atcgtgtatccacggtcttcccag 16893313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 32051532 - 32051209
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| || || |||| | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  32051532 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 32051433  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |    
T  32051432 atagcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatggtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagata 32051333  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||    
T  32051332 gctggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgc 32051233  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  32051232 atcgtgtatccacggtcttcccag 32051209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40235245 - 40234916
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  40235245 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 40235146  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  40235145 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 40235046  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  40235045 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgc 40234946  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  40234945 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 40234916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 19415006 - 19415329
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || |||||||||    
T  19415006 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtattaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaaagaagcc 19415105  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  19415106 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccctcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 19415204  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||| | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||||| || |    
T  19415205 aattggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaactgcacctg 19415304  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  19415305 catcgtgtatccacggtcttcccag 19415329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 13935051 - 13935374
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  13935051 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 13935150  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  13935151 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 13935250  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  13935251 gctggctgactaaatatgcttcttcaccatggattgtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgc 13935350  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  13935351 atcgtgtatccacggtcttcccag 13935374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27818675 - 27818385
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||| ||||     
T  27818675 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcacctccaatg 27818576  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |  |||||||| || || |||| |||||||||||| || ||||    
T  27818575 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtgagctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaa 27818476  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  27818475 caagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 27818385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 259260 - 259589
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  259260 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 259359  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  259360 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaacccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 259459  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  259460 gctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgc 259559  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  259560 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 259589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 23127074 - 23127411
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |  || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  23127074 agaccttccttatgcttgttctcacaaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 23127173  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | |||||||||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||| ||    
T  23127174 ttgcagtcccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagatcctgcccctatgcaagagaaagatgatag 23127273  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| |||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  23127274 ctggctaaccaggtatgcctcctctccatgtatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcg 23127373  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  23127374 tcatgtatccaaggtctccccaagagacagctgtaaga 23127411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 12715109 - 12715432
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  12715109 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 12715208  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  12715209 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagaca 12715308  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  12715309 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 12715408  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  12715409 atcgtgtatccacggtcttcccag 12715432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 11633692 - 11634021
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| || || |||| | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  11633692 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 11633791  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  || ||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  11633792 atagcagccccagcttttttaggctccgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 11633891  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || | |||||  ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || |  || |||||||| || || ||    
T  11633892 gctggctgactaggtatgcctcttcaccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaagtggaggttaccgcacccgc 11633991  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  11633992 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 11634021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 27432952 - 27433289
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  27432952 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 27433051  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | | ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  27433052 tggcagttccatcccttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 27433151  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  ||| |||| || || |  ||     
T  27433152 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtaaaggtcaccgctctcgcg 27433251  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  27433252 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 27433289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 39050329 - 39050658
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  39050329 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 39050428  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  | || | ||||||||||||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  39050429 atagcagccccagctttcttaggttctgcaccttcaatagtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 39050528  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  39050529 gctggctgactaaatatgcttcttcaccatggattgtaacaagcttttcattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgc 39050628  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  39050629 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 39050658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12657275 - 12656938
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  12657275 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 12657176  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | | ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| ||||||| || ||||| | ||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  12657175 tggcagttccatcccttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaggcggtcccctctgtagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 12657076  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  12657075 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcg 12656976  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    | ||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  12656975 ttatgtatccacggtctccccaagagacagctgtaaga 12656938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20839634 - 20839390
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  20839634 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 20839535  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | |||||||||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  20839534 ttgcagtcccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 20839435  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagctt 258  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  |||||||||||    
T  20839434 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctt 20839390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 21675689 - 21676012
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||| | ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  21675689 gagaccttctttacgcttgttctcgcagagctgtatcaccttgccccagccggcggtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 21675788  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  21675789 atagcagccccag-cttctttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 21675887  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  21675888 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 21675987  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  21675988 catcgtgtatccacggtcttcccag 21676012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 31878015 - 31877692
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  31878015 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccgacagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 31877916  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  31877915 atagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccctcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagaca 31877816  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
      ||||| || ||||| | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||||| || ||    
T  31877815 attggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaactgcacctgc 31877716  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  31877715 atcgtgtatccacggtcttcccag 31877692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 34302968 - 34303036
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34302968 gagaccctctttgtgcttattctcgcggagttgtattaacttaccccagccggcagcctgtccttcttg 34303036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34863414 - 34863092
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  34863414 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 34863315  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  34863314 atagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagaca 34863215  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
      ||||| || ||||| | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  34863214 attggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 34863115  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttccca 335  Q
    ||| |||||||| ||||||||||    
T  34863114 atcgtgtatccacggtcttccca 34863092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 39891808 - 39891485
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  39891808 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 39891709  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | || ||||||  |||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  39891708 atagcagccccag-cttccttagactctgcactttcaatgatcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 39891610  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || || ||||| || |    
T  39891609 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaagtggaagtaactgcacctg 39891510  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  39891509 catcgtgtatccacggtcttcccag 39891485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 37949829 - 37950158
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| || || || |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  37949829 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccctcctggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 37949928  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    | ||||| ||| |  |||||  |||| | | ||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  |||||||| || ||||    
T  37949929 acagcagccccggctttcttaggctctgcatcttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagagaaggaagaca 37950028  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  37950029 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtgacgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgc 37950128  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  37950129 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 37950158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 3785230 - 3785162
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3785230 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 3785162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 27119264 - 27119196
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27119264 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 27119196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 31890993 - 31891061
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31890993 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 31891061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 34157586 - 34157518
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34157586 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 34157518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 342
Target Start/End: Original strand, 11640117 - 11640211
Alignment:
Q  248 gtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || |  || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  11640117 gtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaagtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 11640211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 37927104 - 37926992
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| || || || ||||||    
T  37927104 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatccttcaatgaagcc 37927005  T
Q  113 atagcagtcccag 125  Q
    ||||||| |||||    
T  37927004 atagcagccccag 37926992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Original strand, 16625160 - 16625502
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625160 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttggacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 16625259  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    | ||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16625260 acagcagccccagccttcttaggctctgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaagagaaagatgaca 16625359  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625360 gctggctaaccaaatatgcctcttatccatggactataacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 16625459  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16625460 atcatgtatccatggtcttcccaggatacagctataagaagca 16625502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18532087 - 18531745
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18532087 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagatgcc 18531988  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    || |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18531987 atggcagccccagtcttcttaggctccataccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcggtagatccagcttcaatgcaagagaaagatgaca 18531888  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18531887 gctggctaaccaaatatgtctcttctccatggattgtaacaagctttccattctttacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcgccagc 18531788  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 355  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531787 atcgtgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 18531745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8297670 - 8297333
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  8297670 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 8297571  T
Q  114 tagcagtcccagtct-tcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    | ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |    
T  8297570 tggcagttcca-tctctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgata 8297472  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || || || ||    
T  8297471 gctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtcaccgctcccgc 8297372  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8297371 gtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 8297333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 20575406 - 20575735
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | || ||||||| ||||| || ||||||    
T  20575406 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccctctgagcatctttcaatgaagcc 20575505  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  20575506 atagcagccccagctttcttaggctccgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 20575605  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  20575606 gctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgc 20575705  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  20575706 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 20575735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7074910 - 7074582
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  7074910 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 7074811  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||    
T  7074810 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagacgacag 7074711  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||| ||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  7074710 ctgactaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 7074611  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  7074610 tcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 7074582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20067741 - 20067413
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  20067741 agaccttccttatgcttattctcacgaagctgtattaacttgccccggccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 20067642  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  20067641 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgagagttaaaccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 20067542  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  20067541 ctggctaaccaagtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 20067442  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  20067441 tcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 20067413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10397832 - 10397503
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| |||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || |||||||||    
T  10397832 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcc 10397733  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | | ||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||    
T  10397732 atagcagccccagctttcttaggctctgcatcttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagaca 10397633  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||| ||    
T  10397632 gctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcgcccgc 10397533  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  10397532 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 10397503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18052960 - 18052623
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || ||||| ||||||||||    
T  18052960 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatctttcaaagaagcca 18052861  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  18052860 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 18052761  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  18052760 ctggctaaccagatatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 18052661  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  18052660 tcgtgtatccacggtctccccaggagacagctgtaaga 18052623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 22386138 - 22386475
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| |  || |||||||||||||    
T  22386138 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgtatcctttaaagaagcca 22386237  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| || || ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  22386238 tcgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcggaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 22386337  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| |||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || |||    
T  22386338 ctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgca 22386437  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  22386438 tcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 22386475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6193983 - 6193676
Alignment:
Q  44 tgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtac 143  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || || ||||| || || || ||||||||||||||||| |||  | ||||| |||||||||    
T  6193983 tgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctttctgtgcatccttcaaagaagccatagcagttccatccctcttgggctccgtac 6193884  T
Q  144 cttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatg 243  Q
    ||||   ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  6193883 cttcggcagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagacgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatg 6193784  T
Q  244 gactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacag 343  Q
     |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  6193783 aatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatccacggtcttcccaagagacag 6193684  T
Q  344 ctataaga 351  Q
    || |||||    
T  6193683 ctgtaaga 6193676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18226890 - 18226567
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| || || |||| | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  18226890 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 18226791  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |    
T  18226790 atagcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatggtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagata 18226691  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||    
T  18226690 gctggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgc 18226591  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  18226590 atcgtgtatccacggtcttcccag 18226567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 15891266 - 15891603
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  15891266 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 15891365  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  ||| ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  15891366 tggcagttccatcctttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 15891465  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  15891466 ctggctaaccagatatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcg 15891565  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  15891566 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 15891603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 28114513 - 28114842
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| || || |||| | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  28114513 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 28114612  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||| ||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| |||||||| || ||||    
T  28114613 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccctcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcctcaatacaagagaaggaagaca 28114712  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |  |||||||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||| ||    
T  28114713 gctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaacggtaacaagctttccattcctctcaaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcgcccgc 28114812  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  28114813 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 28114842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 29663529 - 29663852
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  29663529 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 29663628  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  29663629 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 29663728  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || || |||| |||||| ||||| || |||||||||||  ||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  29663729 gctggctgactaaatatgcttcttcaccatgaacggtaacaagcttttcattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgc 29663828  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  29663829 atcgtgtatccacggtcttcccag 29663852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4723329 - 4722992
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  4723329 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 4723230  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || |||||  |||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  4723229 tggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctacagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 4723130  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| |||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || |||    
T  4723129 ctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgca 4723030  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  4723029 tcatgtatccacggtctccccaagagacagctgtaaga 4722992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 15739654 - 15739991
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||  || || || ||||||||||    
T  15739654 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctatgcatccttcaaagaagcca 15739753  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| | ||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  15739754 tggcagttccatccctcttgggttccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 15739853  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| |||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || || || ||     
T  15739854 ctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtcaccgcccccgcg 15739953  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  15739954 tcatgtatccatggtctccctaagagacagctgtaaga 15739991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 35882464 - 35882127
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||| | || ||  | || || || || ||||||||||    
T  35882464 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctctcggacggctctatgtgcatccttcaaagaagcca 35882365  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | |||||||||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  35882364 ttgcagtcccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 35882265  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| |||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  35882264 ctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 35882165  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  35882164 tcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 35882127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 5607881 - 5608204
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  5607881 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 5607980  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||| | ||||||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  5607981 atagcagccccag-cttctttagactctgcaccttcaatggtcagaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 5608079  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  5608080 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 5608179  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  5608180 catcgtgtatccacggtcttcccag 5608204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Original strand, 18290913 - 18291241
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  18290913 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 18291012  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  ||||||  | ||||| ||||||| ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  18291013 tggcagttccatccttcttaggttccgttccttcaacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 18291112  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  18291113 ctggctaaccaagtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 18291212  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  18291213 tcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 18291241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Original strand, 18306214 - 18306542
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  18306214 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 18306313  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  ||||||  | ||||| ||||||| ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  18306314 tggcagttccatccttcttaggttccgttccttcaacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 18306413  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  18306414 ctggctaaccaagtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 18306513  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  18306514 tcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 18306542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 8288031 - 8288368
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||| ||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  8288031 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccagcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 8288130  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | | ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| || || ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  8288131 ttgcagttccatcccttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctccgccgaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 8288230  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  8288231 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcg 8288330  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8288331 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 8288368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 11108908 - 11109237
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  11108908 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 11109007  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  11109008 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaacccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 11109107  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  11109108 gctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgc 11109207  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  11109208 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 11109237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 29147315 - 29147652
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||| | || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  29147315 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcaacttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 29147414  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | |||||  |||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  29147415 ttgcagttccatccctcttggactccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccccgcctctatgcaagagaaagatgatag 29147514  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
     |||||||||| |||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  29147515 ttggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 29147614  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  29147615 tcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 29147652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Original strand, 18275612 - 18275940
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| ||| |||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  18275612 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgctccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 18275711  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  ||||||  | ||||| ||||||| ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  18275712 tggcagttccatccttcttaggttccgttccttcaacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 18275811  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  18275812 ctggctaaccaagtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 18275911  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  18275912 tcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 18275940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32440852 - 32440524
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  32440852 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 32440753  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| || || ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  32440752 tggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgccgaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 32440653  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||  | || |||    
T  32440652 ctggctaaccaggtatgcctcttctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccacacccgca 32440553  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  32440552 tcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 32440524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 4345246 - 4345569
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||||||||| || ||||||    
T  4345246 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcgtctttcaatgaagcc 4345345  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| || |  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  4345346 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggttaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 4345445  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||| ||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  4345446 gctggctaactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccatgcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 4345545  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  4345546 atcgtgtatccacggtcttcccag 4345569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 5015411 - 5015088
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  5015411 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 5015312  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5015311 atagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccctcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagaca 5015212  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
      ||||| || ||||| | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||||| || ||    
T  5015211 attggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaactgcacctgc 5015112  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  5015111 atcgtgtatccacggtcttcccag 5015088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5468684 - 5468362
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  5468684 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 5468585  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||  ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5468584 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaacggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagaca 5468485  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  5468484 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattctttacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 5468385  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttccca 335  Q
    ||| |||||||| ||||||||||    
T  5468384 atcgtgtatccacggtcttccca 5468362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 5594916 - 5595245
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  5594916 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 5595015  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||    
T  5595016 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagac 5595114  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  5595115 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 5595214  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5595215 catcgtgtatccatggtcttcccagcagaca 5595245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 48467587 - 48467297
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||| |||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||||||||||||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  48467587 cttgccccaaccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatagcagtcccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 48467488  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||| |    
T  48467487 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtga 48467388  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    | || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  48467387 cgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 48467297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18332326 - 18331997
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| |||||  | || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||| ||    
T  18332326 agaccttccttatgcttgttctcaagaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagtca 18332227  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  18332226 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 18332127  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||| | |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||  || ||     
T  18332126 ctggctaaccaggtatgcttcctctccacgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgttcccgcg 18332027  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacag 343  Q
    || |||||||||||||| |||| |||||||    
T  18332026 tcgtgtatccatggtctccccaagagacag 18331997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18244399 - 18244115
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  18244399 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 18244300  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||||||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  18244299 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagatcctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 18244200  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  18244199 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccag 18244115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 22869415 - 22869738
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  22869415 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 22869514  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||    
T  22869515 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagac 22869613  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  22869614 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 22869713  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  22869714 catcgtgtatccacggtcttcccag 22869738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 22884474 - 22884797
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  22884474 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 22884573  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||    
T  22884574 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagac 22884672  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  22884673 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 22884772  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  22884773 catcgtgtatccacggtcttcccag 22884797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 31963032 - 31963355
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  31963032 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 31963131  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || |||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  31963132 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 31963230  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  31963231 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 31963330  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  31963331 catcgtgtatccacggtcttcccag 31963355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 351
Target Start/End: Original strand, 4795303 - 4795550
Alignment:
Q  104 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||    
T  4795303 aaagaagccatggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagaga 4795402  T
Q  204 aagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 303  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  4795403 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 4795502  T
Q  304 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
     || || || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  4795503 cgctcctgcgtcatgtatccaaggtctccccaagagacagctgtaaga 4795550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4418618 - 4418289
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| || || |||| | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  4418618 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 4418519  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  4418518 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 4418419  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || | |||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||| |||  || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||    
T  4418418 gctggctgactaggtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttcccttccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgc 4418319  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  4418318 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 4418289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8213437 - 8213108
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| || || || |||||||||    
T  8213437 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagcttgaccctcttggacggctttctgtgcatccttcaaagaagcc 8213338  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||||||  ||||  |||||  |||| | || |||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  8213337 atagcagctccagctttcttaggctctgcactttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 8213238  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| || || || ||    
T  8213237 gctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcgtcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaggtaaccgcacccgc 8213138  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  8213137 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 8213108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21676392 - 21676063
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| || || || |||||||||    
T  21676392 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccaaccggcagcttgaccctcttggacggctttctgtgcatccttcaaagaagcc 21676293  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | | ||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  21676292 atagcagccccagctttcttaggctctgcatcttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 21676193  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||| || |  || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  21676192 gctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtgacgatttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgc 21676093  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  21676092 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 21676063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10644769 - 10644446
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  10644769 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 10644670  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  10644669 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 10644571  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||||| || |    
T  10644570 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaactgcacctg 10644471  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| | |||||||||    
T  10644470 catcgtgtatccacgatcttcccag 10644446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 17983515 - 17983838
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  17983515 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 17983614  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  17983615 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 17983713  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  17983714 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 17983813  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  17983814 catcgtgtatccacggtcttcccag 17983838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24329858 - 24329535
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  24329858 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 24329759  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  24329758 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 24329660  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  24329659 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 24329560  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  24329559 catcgtgtatccacggtcttcccag 24329535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 51783722 - 51783399
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  51783722 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 51783623  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  51783622 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 51783524  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  51783523 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 51783424  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  51783423 catcgtgtatccacggtcttcccag 51783399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 6541021 - 6541344
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||| | ||||| || ||||||    
T  6541021 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgaacatctttcaatgaagcc 6541120  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | || |||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||    
T  6541121 atagcagccccag-cttccttagactctgcactttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagac 6541219  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  6541220 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 6541319  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  6541320 catcgtgtatccacggtcttcccag 6541344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7998261 - 7997938
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  7998261 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 7998162  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||| | ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  7998161 atagcggccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaacgcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 7998063  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||| | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  7998062 aactggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 7997963  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  7997962 catcgtgtatccacggtcttcccag 7997938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 47025152 - 47024829
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  47025152 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 47025053  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | || |||||| ||||  ||| | || |||||||| |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||    
T  47025052 atagcagccccag-cttccttagactctgcactttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagac 47024954  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || | ||| || || || || || |    
T  47024953 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttttgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 47024854  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||    
T  47024853 catcgtgtatccacggtctccccag 47024829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 5652928 - 5652860
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5652928 gagaccctctttgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 5652860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 4626485 - 4626417
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4626485 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 4626417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 5713768 - 5713700
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5713768 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 5713700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 5724678 - 5724610
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5724678 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 5724610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 5767690 - 5767758
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5767690 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 5767758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 17993501 - 17993569
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17993501 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 17993569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28022934 - 28022645
Alignment:
Q  53 ttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaata 151  Q
    |||||||||||||| | ||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | | |||||||     
T  28022934 ttgccccagccggcggtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcatcttcaatg 28022836  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||  |||||||| || |||| |||||| || ||||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  28022835 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcctcaacacaagagaaggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccacggattgtaa 28022736  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  28022735 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 28022645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 267 - 330
Target Start/End: Original strand, 7090873 - 7090936
Alignment:
Q  267 ttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtct 330  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  7090873 ttacaaacttcaatttctgatggagagtagatgtcactgccccagcgtcatgaatccatggtct 7090936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20441575 - 20441500
Alignment:
Q  254 agcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtc 329  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  20441575 agcttcccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtagacgttactgcccccgcttcatgaatccagggtc 20441500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41438701 - 41438626
Alignment:
Q  254 agcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtc 329  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  41438701 agcttcccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtagacgttactgcccccgcttcatgaatccagggtc 41438626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28340878 - 28340766
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  28340878 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttcccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 28340779  T
Q  113 atagcagtcccag 125  Q
    ||||||| |||||    
T  28340778 atagcagccccag 28340766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Original strand, 36995759 - 36995871
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  36995759 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 36995858  T
Q  113 atagcagtcccag 125  Q
    ||||||| |||||    
T  36995859 atagcagccccag 36995871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22890216 - 22889874
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22890216 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccagccgacagcttgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 22890117  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| || |    
T  22890116 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggtagttccttcagcagatcctgcttcaatgcaggagaaagacgata 22890017  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22890016 gctggctaaccaaatatgcttcttctccatggattgtaacaagctttccattctttacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcaccagc 22889917  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 355  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22889916 atcgtgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 22889874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 25200776 - 25200434
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25200776 gagaccttccttgtgcttattctcacggagttggattaacttgccccagccggcagcctgtccttcctgaatagccttctgagcgtctttaaaagaagcc 25200677  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  25200676 atagcagtcccagtcttcttaggttccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaggagaaagacgata 25200577  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25200576 gctggctaaccaaatatgcttcttctccatggactgtaacaagctttccattctttacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcgccagc 25200477  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 355  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25200476 atcgtgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 25200434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25264931 - 25264686
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25264931 gagaccttccttgtgcttattctcacggagttggattaacttgccccagccggcagcctgtccttcctgaatagccttctgagcgtctttaaaagaagcc 25264832  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  25264831 atagcagtcccagtcttcttaggttccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaggagaaagacgata 25264732  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagctt 258  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25264731 gctggctaaccaaatatgcttcttctccatggactgtaacaagctt 25264686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23893952 - 23893615
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| || || |||||||| || ||| | || || || || ||||||||||    
T  23893952 agaccttccttatgcttgttctcacggagttgtattaatctgccccagccggcggcttgaccttcttggacggccctatgtgcatccttcaaagaagcca 23893853  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    ||||||  | |  | | ||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || ||||| || ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  23893852 tagcagctcaatcccttttgggctccgtaccttcgacagttaaaccttgaaaagcggttccttctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 23893753  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||     
T  23893752 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaattgtaacgagctttccactctttgcaaactttaacttctggtgcagggtagaggtcaccgccccagcg 23893653  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  23893652 tcatgtatccacggtcttcctaagagacagctataaga 23893615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 15657176 - 15657513
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  15657176 agaccttccttatgcttattctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 15657275  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  15657276 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 15657375  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  15657376 ctggctaaccaagtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 15657475  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  15657476 tcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaaga 15657513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41676455 - 41676127
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  41676455 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 41676356  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | |||||  |||||||| ||||| ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  41676355 tggcagttccatccctcttggactccgtacattcaacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 41676256  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  41676255 ctggctgaccaagtatgcttcttctccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 41676156  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  41676155 tcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 41676127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11551100 - 11550763
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||| ||||    
T  11551100 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaggcca 11551001  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  11551000 tggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 11550901  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  11550900 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaacttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 11550801  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  11550800 tcgtgtatccatggtctccccacgagacagctgtaaga 11550763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30936379 - 30936042
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  30936379 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 30936280  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  30936279 tggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 30936180  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  30936179 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcg 30936080  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  30936079 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 30936042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33294271 - 33293943
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  33294271 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 33294172  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  33294171 tggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 33294072  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| |||||  || |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  33294071 ctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 33293972  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  33293971 tcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 33293943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9319198 - 9318869
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  9319198 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtaccaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 9319099  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||    
T  9319098 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagaca 9318999  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||| |||| || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||    
T  9318998 gctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttcccttccttacgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgc 9318899  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  9318898 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 9318869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 24686573 - 24686910
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||| |||| || || ||||| || ||  |||| || ||||| ||||||||||    
T  24686573 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccgacagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatctttcaaagaagcca 24686672  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| | ||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||    
T  24686673 ttgcagttccatccctcttgggttccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttatatgcaagagaaagatgatag 24686772  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  24686773 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcg 24686872  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24686873 ttatgtatccatggtctccccaggagacagctgtaaga 24686910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24971764 - 24971427
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  24971764 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 24971665  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| |||||||| |||||||| ||    
T  24971664 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaaaaagatgatag 24971565  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  24971564 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcg 24971465  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  24971464 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 24971427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 33779233 - 33778896
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  33779233 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 33779134  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| || ||    
T  33779133 tggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagacgatag 33779034  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  33779033 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatagtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 33778934  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  33778933 tcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 33778896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12133902 - 12133573
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  12133902 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 12133803  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||    
T  12133802 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagaca 12133703  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||| |||| || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||    
T  12133702 gctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttcccttccttacgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgc 12133603  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  12133602 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 12133573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 23750866 - 23751203
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  23750866 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 23750965  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  23750966 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 23751065  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| |||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  23751066 ctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 23751165  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    || |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  23751166 tcgtgtatccaaggtctccccaagagacagctgtaaga 23751203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26482138 - 26481809
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  26482138 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 26482039  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |    
T  26482038 atagcagccccagctttcttaagctccgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagata 26481939  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||    
T  26481938 gctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgc 26481839  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  26481838 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 26481809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 33518101 - 33517780
Alignment:
Q  15 gaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccat 114  Q
    ||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| || || |||| | |||||||||| ||||| || ||||||||    
T  33518101 gaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagccat 33518002  T
Q  115 agcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagc 214  Q
    |||||||||||  |||||  |||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |||    
T  33518001 agcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatggtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagatagc 33517902  T
Q  215 tggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcat 314  Q
    |||||||| |||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||||    
T  33517901 tggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgcat 33517802  T
Q  315 catgtatccatggtcttcccag 336  Q
    | |||||||| |||||||||||    
T  33517801 cgtgtatccacggtcttcccag 33517780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 40471964 - 40472287
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  40471964 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 40472063  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||| | |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  40472064 atagcggccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 40472163  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  40472164 gctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccgttccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgc 40472263  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  40472264 atcgtgtatccacggtcttcccag 40472287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 18499145 - 18499474
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||    
T  18499145 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagcttgaccctcttggacggctttctgtgcatctttcaaagaagcc 18499244  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | | ||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  18499245 atagcagccccagctttcttaggctctgcatcttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 18499344  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  18499345 gctggctgactaagtatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgc 18499444  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  18499445 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 18499474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 22997530 - 22997867
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||| ||||    
T  22997530 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaggcca 22997629  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| |||||||||||||   ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  22997630 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcggcagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 22997729  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| |||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  22997730 ctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 22997829  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  22997830 tcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 22997867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 23716404 - 23716741
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  23716404 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 23716503  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | | ||  ||||||||||||| | ||  |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  23716504 tggcagttccatcccttttaggctccgtaccttcgacagctaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 23716603  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| |||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || || || ||     
T  23716604 ctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtcaccgcccccgcg 23716703  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  23716704 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 23716741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28650982 - 28650653
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  28650982 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 28650883  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  28650882 atagcagccccagcttcctttggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 28650783  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| || || || ||    
T  28650782 gctggctaactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaggtgaccgcacccgc 28650683  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  28650682 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 28650653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43079999 - 43079670
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  43079999 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 43079900  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  43079899 atagcagccccagcttcctttggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 43079800  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| || || || ||    
T  43079799 gctggctaactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaggtgaccgcacccgc 43079700  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  43079699 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 43079670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24683187 - 24682864
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  24683187 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 24683088  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24683087 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagaca 24682988  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  24682987 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 24682888  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  24682887 atcgtgtatccacggtcttcccag 24682864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24725714 - 24725391
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  24725714 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 24725615  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24725614 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagaca 24725515  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  24725514 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 24725415  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  24725414 atcgtgtatccacggtcttcccag 24725391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 15757272 - 15757595
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  15757272 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 15757371  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || |||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  15757372 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 15757470  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||||| || |    
T  15757471 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaactgcacctg 15757570  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  15757571 catcgtgtatccacggtcttcccag 15757595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3791288 - 3790959
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | ||||| |||| ||||| || |||| |    
T  3791288 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttccgagcatctttcaatgaagtc 3791189  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||  |||||  |||||  |||| | ||| ||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  3791188 atagcaaccccagctttcttaggctctgcaccctcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 3791089  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  3791088 gctggctgactaaatatgcttcttctccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgc 3790989  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  3790988 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 3790959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 8663890 - 8664213
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||||| ||||||    
T  8663890 gagaccttctttacgcttgttctcgcagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatcctttaatgaagcc 8663989  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||  |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  8663990 atagcagccccaa-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 8664088  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  8664089 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 8664188  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  8664189 catcgtgtatccacggtcttcccag 8664213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 13323244 - 13323567
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  13323244 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 13323343  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||    
T  13323344 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagac 13323442  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  13323443 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcataaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 13323542  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  13323543 catcgtgtatccacggtcttcccag 13323567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Original strand, 18125811 - 18126139
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  18125811 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 18125910  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | || || |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||  |||| || || ||||| || || ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  18125911 tggcggttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccctgaaaagcggtcccctctgccgaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 18126010  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||| |||| |||||  |||| |||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  18126011 ctggctgaccaggtatgcctcttttccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 18126110  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  18126111 tcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 18126139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 336
Target Start/End: Original strand, 37669937 - 37670221
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  37669937 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 37670036  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  37670037 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 37670136  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37670137 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccag 37670221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30170216 - 30169893
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  30170216 gagaccttctttgcgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 30170117  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  30170116 atagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagaca 30170017  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
      ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  30170016 attggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 30169917  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  30169916 atcgtgtatccacggtcttcccag 30169893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 37357058 - 37357381
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  37357058 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 37357157  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| ||||    
T  37357158 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagaca 37357257  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  37357258 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 37357357  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  37357358 atcgtgtatccacggtcttcccag 37357381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 28958201 - 28958530
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  28958201 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 28958300  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | | ||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||  |||||||| || ||||    
T  28958301 atagcagccccagctttcttaggctctgcatcttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcctcaacacaagagaaggaagaca 28958400  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  28958401 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 28958500  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  28958501 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 28958530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30031162 - 30030839
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||||| ||||||    
T  30031162 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatcctttaatgaagcc 30031063  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  30031062 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 30030964  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  30030963 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 30030864  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  30030863 catcgtgtatccacggtcttcccag 30030839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30153765 - 30153442
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  30153765 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 30153666  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  30153665 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 30153567  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  30153566 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 30153467  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  30153466 catcgtgtatccacggtcttcccag 30153442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 37756727 - 37756404
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  37756727 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 37756628  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| ||||    
T  37756627 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagaca 37756528  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  37756527 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 37756428  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||    
T  37756427 atcgtgtatccacggtctccccag 37756404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 6876052 - 6875729
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  6876052 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 6875953  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||| ||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  6875952 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagtagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 6875854  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  6875853 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 6875754  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  6875753 catcgtgtatccacggtcttcccag 6875729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 31824822 - 31825145
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  31824822 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 31824921  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  31824922 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 31825020  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  31825021 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 31825120  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  31825121 catcgtgtatccacggtcttcccag 31825145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 34618265 - 34617942
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  34618265 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 34618166  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || |||    
T  34618165 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagac 34618067  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  34618066 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 34617967  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  34617966 catcgtgtatccacggtcttcccag 34617942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 336
Target Start/End: Original strand, 37769441 - 37769725
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 150  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  || |||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  37769441 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctccgagcatctttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 37769539  T
Q  151 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgta 250  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  37769540 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 37769639  T
Q  251 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37769640 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccag 37769725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 31433187 - 31432864
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  31433187 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 31433088  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||     
T  31433087 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagat 31432989  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  31432988 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 31432889  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||    
T  31432888 catcgtgtatccacggtctccccag 31432864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2512798 - 2512475
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  2512798 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 2512699  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| || |  ||| | || ||||| || |||| ||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  2512698 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggttaaaccttggaaagcagtcccttcagtagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 2512600  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || |||| || |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  2512599 aattggctgactaagtgtgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 2512500  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  2512499 catcgtgtatccacggtcttcccag 2512475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 13440067 - 13440135
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13440067 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccggcagcttgtccttcttg 13440135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 9548116 - 9548184
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9548116 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 9548184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 11326383 - 11326315
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11326383 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 11326315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 13184222 - 13184290
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13184222 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 13184290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 20390438 - 20390507
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaa 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||||    
T  20390438 agaccttctttgtgcttgttctcgggcagctgtactaacttcccccagccttcagcttttccttcttgaa 20390507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Original strand, 18373950 - 18374062
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  18373950 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 18374049  T
Q  113 atagcagtcccag 125  Q
    ||||||| |||||    
T  18374050 atagcagccccag 18374062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34467122 - 34467047
Alignment:
Q  254 agcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtc 329  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  34467122 agcttcccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtagacgttactgcccccgcttcatgaatccagggtc 34467047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5639534 - 5639422
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  5639534 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 5639435  T
Q  113 atagcagtcccag 125  Q
    ||||||| |||||    
T  5639434 atagcagccccag 5639422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Original strand, 32594689 - 32594801
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  32594689 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 32594788  T
Q  113 atagcagtcccag 125  Q
    ||||||| |||||    
T  32594789 atagcagccccag 32594801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16043062 - 16042721
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  16043062 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacaaccttctgagcatctttaaaagaagcc 16042963  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16042962 atagtagccccagtcttcttaggctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaagagaaagatgaca 16042863  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16042862 gctggctaaccaaatatgcctcttctccatggaccgtaacgagctttccattcttcacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttattgcgccagc 16042763  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagc 354  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16042762 atcgtgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagc 16042721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Original strand, 16448402 - 16448744
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16448402 gagaccttctttgtgcttattctcacggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaaacc 16448501  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| ||||||||||||||||  ||| | |||| |||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  16448502 atagcagccccagctttcttaggctctgtaccttcaatagtcaaaccttggaaggtagtttcttcagcagatccagattcaatgctagagaaagatgaca 16448601  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16448602 gctggctaaccaaatatgcttcttctccatggaccgtaacaagctttccattctttacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcgccagc 16448701  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448702 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 16448744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5129730 - 5129393
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  5129730 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 5129631  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  5129630 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 5129531  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| |||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || || || ||     
T  5129530 ctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtcaccgcccccgcg 5129431  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  5129430 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 5129393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 5145744 - 5146073
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  5145744 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaacgaagcc 5145843  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    | ||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  5145844 aaagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 5145943  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  5145944 gctggctgactaagtatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgc 5146043  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  5146044 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 5146073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5161257 - 5160920
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| |  ||  |||| || || || ||||||||||    
T  5161257 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttggccctcttggatggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 5161158  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | |||||  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  || | ||||||||||||||||| ||    
T  5161157 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagtcaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgctactatgcaagagaaagatgatag 5161058  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||| || ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  5161057 ctggctaatcaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 5160958  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5160957 tcgtgtatccatggtctccccaggagacagctgtaaga 5160920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Original strand, 10915313 - 10915610
Alignment:
Q  54 tgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagt 153  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | |||    
T  10915313 tgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagt 10915412  T
Q  154 caggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaaca 253  Q
     |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||    
T  10915413 taatccttgaaaagcggtcccctctgcagaacctgcctctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaattgtaaca 10915512  T
Q  254 agcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||| ||  | ||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  10915513 agctttccgctttttgcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtcaccgctcccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 10915610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 16501806 - 16502143
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  16501806 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 16501905  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  16501906 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 16502005  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||  | || ||     
T  16502006 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccacccccgcg 16502105  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  16502106 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 16502143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 342
Target Start/End: Original strand, 26318266 - 26318602
Alignment:
Q  6 agaaacagagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaa 105  Q
    |||||| ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| ||    
T  26318266 agaaaccgagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaa 26318365  T
Q  106 agaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaa 205  Q
     ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||     
T  26318366 tgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaag 26318465  T
Q  206 gatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactg 305  Q
    || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||| |||| || ||||| ||||| || | |||||||||||| |    
T  26318466 gaagacagctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttcccttccttacgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccg 26318565  T
Q  306 cgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    | || || || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  26318566 cacctgcgtcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 26318602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 11423182 - 11423519
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||| || || || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  11423182 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccagcggcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 11423281  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||| ||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  11423282 tggcagttccatccctcttgggcttcgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 11423381  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  11423382 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 11423481  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  11423482 tcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 11423519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 26536274 - 26536603
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  26536274 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 26536373  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  26536374 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggacgaca 26536473  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| || ||||| ||    
T  26536474 gctggctgactaagtatgcttcttcgccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaggtaaccgcgcccgc 26536573  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  26536574 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 26536603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26436957 - 26436667
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  26436957 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 26436858  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||| |    
T  26436857 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtga 26436758  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    | || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  26436757 cgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 26436667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2156311 - 2155974
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || || || ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||  |||| || || || ||||||||||    
T  2156311 agaccttccttatgtttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttgaacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 2156212  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    |  |||| |||  | ||||  | ||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  2156211 tgtcagttccatccctcttaggttccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctacctctatgcaagagaaagatgatag 2156112  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  2156111 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 2156012  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  2156011 tcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 2155974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 16516842 - 16517179
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || | || |||| ||||||||| |||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  16516842 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctttattaacctgccccagctggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 16516941  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  16516942 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 16517041  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||  | || ||     
T  16517042 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccacccccgcg 16517141  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  16517142 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 16517179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26514520 - 26514197
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  26514520 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 26514421  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  26514420 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagaca 26514321  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  26514320 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 26514221  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  26514220 atcgtgtatccacggtcttcccag 26514197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 31126659 - 31126336
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  31126659 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 31126560  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  31126559 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagaca 31126460  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  31126459 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcataaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 31126360  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  31126359 atcgtgtatccacggtcttcccag 31126336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 31562794 - 31563117
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  31562794 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 31562893  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| ||||    
T  31562894 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagaca 31562993  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  31562994 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 31563093  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  31563094 atcgtgtatccacggtcttcccag 31563117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 3447045 - 3446722
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  3447045 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 3446946  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  3446945 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 3446847  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  3446846 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 3446747  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  3446746 catcgtgtatccacggtcttcccag 3446722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9620390 - 9620067
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  9620390 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 9620291  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  9620290 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 9620192  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  9620191 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 9620092  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  9620091 catcgtgtatccacggtcttcccag 9620067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 11442618 - 11442295
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  11442618 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 11442519  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||| | |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || |||    
T  11442518 atagcagccccgg-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagac 11442420  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  11442419 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 11442320  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  11442319 catcgtgtatccacggtcttcccag 11442295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 26273498 - 26273821
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  26273498 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 26273597  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  26273598 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 26273696  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  26273697 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 26273796  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  26273797 catcgtgtatccacggtcttcccag 26273821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 16734864 - 16735187
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  16734864 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 16734963  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  16734964 atagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 16735063  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || | |||||  ||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  16735064 gctggctgactaggtatgcctcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 16735163  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  16735164 atcgtgtatccacggtcttcccag 16735187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 16749918 - 16750241
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  16749918 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 16750017  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  16750018 atagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 16750117  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || | |||||  ||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  16750118 gctggctgactaggtatgcctcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 16750217  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  16750218 atcgtgtatccacggtcttcccag 16750241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17525271 - 17524948
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  17525271 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 17525172  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  17525171 atagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 17525072  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || | |||||  ||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  17525071 gctggctgactaggtatgcctcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 17524972  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  17524971 atcgtgtatccacggtcttcccag 17524948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 17527944 - 17528267
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  17527944 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 17528043  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  17528044 atagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 17528143  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || | |||||  ||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  17528144 gctggctgactaggtatgcctcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 17528243  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  17528244 atcgtgtatccacggtcttcccag 17528267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 24590945 - 24591268
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||| | ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  24590945 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcggtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 24591044  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  24591045 atagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagaca 24591144  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
      ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  24591145 attggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 24591244  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  24591245 atcgtgtatccacggtcttcccag 24591268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 335
Target Start/End: Original strand, 26668318 - 26668640
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  || |||| || ||||| ||||||    
T  26668318 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctccgagcatcctttaatgaagcc 26668417  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  26668418 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 26668516  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||| | |||||| ||||||| |||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  26668517 aactggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccatttttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 26668616  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttccca 335  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  26668617 catcgtgtatccacggtcttccca 26668640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 2108567 - 2108635
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2108567 gagaccctctttgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 2108635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 45734041 - 45733973
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  45734041 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 45733973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 31088033 - 31088094
Alignment:
Q  20 tctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31088033 tctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 31088094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 4201128 - 4201060
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    ||||||||||||  |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4201128 gagaccttctttacgcttgttctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 4201060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 45388959 - 45388789
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  45388959 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 45388860  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcaga 183  Q
    ||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || |||||||||||||||||    
T  45388859 atagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccctcagcaga 45388789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 329
Target Start/End: Original strand, 800159 - 800234
Alignment:
Q  254 agcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtc 329  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  800159 agcttcccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtagacgttactgcccccgcttcatgaatccagggtc 800234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18542291 - 18542209
Alignment:
Q  260 ccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  18542291 ccattctttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 18542209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 349
Target Start/End: Original strand, 16206549 - 16206885
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16206549 gagaccttccttatgcttattctcacggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcctgaacagccttctgagcgtctttaaaagaagcc 16206648  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16206649 atagtagccccagtctttttgagctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccggcttcaatgcaagagaaagatgaca 16206748  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16206749 gctggctaaccaaatatgcctcttctccatggactgtaacaagctttccattcttcacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcgccagc 16206848  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataa 349  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16206849 atcgtgtatccatggtcttcccaagagacagctataa 16206885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20462655 - 20462480
Alignment:
Q  180 cagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaa 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20462655 cagatccagcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgcctcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaa 20462556  T
Q  280 tttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 355  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20462555 ttgttggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 20462480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10964407 - 10964084
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  10964407 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 10964308  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  10964307 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 10964209  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||||| || |    
T  10964208 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaactgcacctg 10964109  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  10964108 catcgtgtatccacggtcttcccag 10964084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 51639955 - 51639632
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  51639955 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 51639856  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||    
T  51639855 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagac 51639757  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || || ||||| || |    
T  51639756 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaagtggaagtaactgcacctg 51639657  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  51639656 catcgtgtatccacggtcttcccag 51639632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28586718 - 28586395
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  28586718 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 28586619  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  28586618 atagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccctcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagaca 28586519  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
      ||||| || ||||| | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  28586518 attggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 28586419  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  28586418 atcgtgtatccacggtcttcccag 28586395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 41791826 - 41792149
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  41791826 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 41791925  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||| ||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  41791926 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagtagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 41792024  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  41792025 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 41792124  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  41792125 catcgtgtatccacggtcttcccag 41792149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 20462718 - 20462656
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtcc 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20462718 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccatccggcagcctgtcc 20462656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10946816 - 10946493
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  || |||| || || || ||||||    
T  10946816 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctccgagcatccttcaatgaagcc 10946717  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  10946716 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 10946618  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||| | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  10946617 aactggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 10946518  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  10946517 catcgtgtatccacggtcttcccag 10946493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 354
Target Start/End: Original strand, 17090907 - 17091248
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  17090907 gagaccttctttgtgtttattctcatagagttgtatcaacttaccccaaccggcagcctgtccttcttgaatagccttctgagcgtccttcaaagaagcc 17091006  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||| || |||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||    
T  17091007 atagcagccctaaccttcttgggctccgtaccttcaatggtcaatccttgaaaagcagtcccttcagcagatcctgcttcaatacaggagaaggatgaca 17091106  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17091107 gttggctaactaagtatgcttcttcaccatggactgtgacgagctttccattcctcacaaactttaacttctggtgcagggtggaggttactgcgcccgc 17091206  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagc 354  Q
     ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  17091207 gtcatgtatccacggccttcccagaagacagctataagaagc 17091248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29551209 - 29550881
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  29551209 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtactaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 29551110  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  29551109 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 29551010  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || |||    
T  29551009 ctggctaaccaagtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgca 29550910  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||    
T  29550909 tcgtgtatccatggtcttcccagcagaca 29550881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 355
Target Start/End: Original strand, 27628206 - 27628509
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  ||||||  ||||||||     
T  27628206 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaataaccctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctccgcgccttcaatg 27628305  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||    
T  27628306 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacagctggctgactaaatatgcttcttcaccatggactgtaa 27628405  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    | || || |||||||| |||||||| || ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || ||    
T  27628406 cgagttttccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtggaggttaccgcgcccgcgtcatgtatccaaggccttcccaagaggcagctgtatga 27628505  T
Q  352 agca 355  Q
    ||||    
T  27628506 agca 27628509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16675874 - 16675545
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  16675874 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 16675775  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  16675774 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 16675675  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  16675674 gctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgc 16675575  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  16675574 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 16675545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 22933342 - 22933679
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  22933342 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 22933441  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || |||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  22933442 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctcaacagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 22933541  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || ||     
T  22933542 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgtaaagtagaggtcaccgcccccgcg 22933641  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  22933642 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 22933679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 23855787 - 23856124
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  23855787 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 23855886  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || |||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  23855887 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctcaacagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 23855986  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || ||     
T  23855987 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgtaaagtagaggtcaccgcccccgcg 23856086  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  23856087 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 23856124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 24303080 - 24303417
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||  || || || ||||||||||    
T  24303080 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctatgcatccttcaaagaagcca 24303179  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  24303180 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 24303279  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  24303280 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcg 24303379  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  24303380 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 24303417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 15422779 - 15423116
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||  || || || ||||||||||    
T  15422779 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctatgcatccttcaaagaagcca 15422878  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | |||||||||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  15422879 ttgcagtcccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 15422978  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| |||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  15422979 ctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcctgcg 15423078  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  15423079 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 15423116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 26776071 - 26776394
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  26776071 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccatccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 26776170  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  26776171 atagcagccccagctttcttaagctccgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 26776270  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||| |  ||||| |||||  ||||| |||| || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||    
T  26776271 gctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaacgagcttttcattccttacgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgc 26776370  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  26776371 atcgtgtatccacggtcttcccag 26776394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26920114 - 26919800
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  26920114 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 26920015  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  26920014 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 26919915  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||| ||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  26919914 ctgactaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccattttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 26919815  T
Q  314 tcatgtatccatggt 328  Q
    || ||||||||||||    
T  26919814 tcgtgtatccatggt 26919800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27020873 - 27020535
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  27020873 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 27020774  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    | ||||| |||  | || | || |||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| |    
T  27020773 tggcagttccatccctccttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgata 27020674  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||    
T  27020673 gctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgc 27020574  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
     || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  27020573 gtcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 27020535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3697816 - 3697487
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  3697816 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 3697717  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  3697716 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 3697617  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || || |||| |||||| ||||||| ||| || || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| || || || || || ||    
T  3697616 gctggctgactaaatatgcttcttcaccatggattgtgacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctggtgtaaggtggaagtaaccgcacccgc 3697517  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  3697516 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 3697487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 13297413 - 13297750
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||  |||| || || || ||||||||||    
T  13297413 agaccttccttatgcttgttctcgcgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttgaacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 13297512  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | | ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| || || ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  13297513 tggcagttccatcccttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcggaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 13297612  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| |  || |  ||     
T  13297613 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcatcgctctcgcg 13297712  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  13297713 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 13297750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24865451 - 24865114
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| ||||||||||| |||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  24865451 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccgacagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 24865352  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||  ||||||| ||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  24865351 ttgcagttccatccctcttaggctccgttccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagacccggcttctatgcaagagaaagatgatag 24865252  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  24865251 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcg 24865152  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  24865151 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 24865114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16751588 - 16751251
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||| || || || ||||||||||    
T  16751588 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacagctctctgtgcatccttcaaagaagcca 16751489  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||  | ||| ||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  16751488 tggcagttccatccctcttaggttccataccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 16751389  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  16751388 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 16751289  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    || |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  16751288 tcgtgtatccacggtctccccaagagacagctgtaaga 16751251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 335
Target Start/End: Original strand, 27271078 - 27271363
Alignment:
Q  50 aacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaa 149  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| | || ||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||  | ||||  ||||   ||||||||    
T  27271078 aacttgccccaaccggcagtctgaccttcctgaataaccctctgagcatcttttaatgaagccatggcagctccatccctcttaggctctacaccttcaa 27271177  T
Q  150 tagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgt 249  Q
    | ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||    
T  27271178 tggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgt 27271277  T
Q  250 aacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttccca 335  Q
     || || || |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  27271278 gacgagttttccattcttcacaaactttaatttctgatgcaaggtggaggttaccgcgcccgcgtcatgtatccaaggccttccca 27271363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20162351 - 20162176
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| | |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  20162351 gagaccttcctttcgcttattctcacagagttggattaacttgccccagtcggcagcctgtccctcctgaacagccttctgggcgtccttcaaagaagcc 20162252  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccat 188  Q
    || ||||  |||  ||||||| |||| | |||||| |||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20162251 attgcagctccaaccttcttgggctctgcaccttccatagacaacccttgaaaagcagttccctcagcagatccat 20162176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Original strand, 22170480 - 22170655
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| | |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  22170480 gagaccttcctttcgcttattctcacagagttggattaacttgccccagtcggcagcctgtccctcctgaacagccttctgggcgtccttcaaagaagcc 22170579  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccat 188  Q
    || ||||  |||  ||||||| |||| | |||||| |||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22170580 attgcagctccaaccttcttgggctctgcaccttccatagacaacccttgaaaagcagttccctcagcagatccat 22170655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29503150 - 29502821
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  29503150 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 29503051  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||    
T  29503050 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagac 29502952  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  29502951 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 29502852  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  29502851 catcgtgtatccatggtcttcccagcagaca 29502821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27046123 - 27045794
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | || ||||||| ||||| || ||||||    
T  27046123 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccctctgagcatctttcaatgaagcc 27046024  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | | ||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  27046023 atagcagccccagctttcttaggctctgcatcttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagaca 27045924  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  27045923 gctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgc 27045824  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  27045823 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 27045794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20162179 - 20162084
Alignment:
Q  260 ccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 355  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20162179 ccattcttcacaaatttcaacttctggtgtagggtagaggttaccgcgccagcgtcatgtatccaaggtcttcccaggagacagctatacgaagca 20162084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 355
Target Start/End: Original strand, 22170652 - 22170747
Alignment:
Q  260 ccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 355  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22170652 ccattcttcacaaatttcaacttctggtgtagggtagaggttaccgcgccagcgtcatgtatccaaggtcttcccaggagacagctatacgaagca 22170747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 351
Target Start/End: Original strand, 27288831 - 27289169
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||  | ||||||||| || |||| ||| || ||||| || ||  |||| || ||||| |||||||||    
T  27288831 gagaccttctttacgcttgttctcacggagctgtatcaccttgccccacccagcagtctgaccctcttggacggctctctgcgcatctttcaaagaagcc 27288930  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    || ||||  |||  | | ||  |||| |||||||| | ||| |  ||| |||| || |||||||| ||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| |    
T  27288931 atggcagctccatcccttttaggctctgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggttccctctgcagaccctgcttctatgcaggagaaagatgata 27289030  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    | |||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||    
T  27289031 gttggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgc 27289130  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  27289131 gtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 27289169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 336
Target Start/End: Original strand, 26114910 - 26115194
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 150  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  26114910 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 26115008  T
Q  151 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgta 250  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||| || |||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  26115009 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagatcctgcttcaatacaagagaaggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 26115108  T
Q  251 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26115109 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccag 26115194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27009465 - 27009142
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  27009465 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 27009366  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||    
T  27009365 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagac 27009267  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  27009266 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcataaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 27009167  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  27009166 catcgtgtatccacggtcttcccag 27009142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27486825 - 27486541
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  27486825 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 27486726  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || || ||||||||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  27486725 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcggcagatcctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 27486626  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27486625 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccag 27486541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28209150 - 28208866
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  28209150 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 28209051  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  28209050 gtcaacccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 28208951  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  28208950 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccag 28208866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 30556477 - 30556800
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  30556477 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 30556576  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  30556577 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 30556675  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  30556676 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 30556775  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  30556776 catcgtgtatccacggtcttcccag 30556800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4759499 - 4759176
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  4759499 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 4759400  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||    
T  4759399 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagaca 4759300  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || || || || || ||    
T  4759299 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaagtggaagtaaccgcacctgc 4759200  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  4759199 atcgtgtatccacggtcttcccag 4759176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 4544236 - 4544559
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  4544236 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 4544335  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||| || ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||    
T  4544336 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcgatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagac 4544434  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  4544435 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 4544534  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  4544535 catcgtgtatccacggtcttcccag 4544559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4527021 - 4526698
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  4527021 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 4526922  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| |  |||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| ||||    
T  4526921 atagcagccccagcttccttaggctctgcgccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagaca 4526822  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || || || || || ||    
T  4526821 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaagtggaagtaaccgcacctgc 4526722  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  4526721 atcgtgtatccacggtcttcccag 4526698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 16942488 - 16942811
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  16942488 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 16942587  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||  ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  16942588 atagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaacggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagaca 16942687  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  16942688 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 16942787  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  16942788 atcgtgtatccacggtcttcccag 16942811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26990624 - 26990286
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || || || || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  26990624 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcctggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 26990525  T
Q  114 tag-cagtcccagtct-tcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    | | |||| ||| ||| |||||  ||||||||||||   ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||     
T  26990524 ttggcagttcca-tctctcttggactccgtaccttcggcagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagatcctgcctctatgcaagagaaagatgat 26990426  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    ||||||||||||| |||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || |    
T  26990425 agctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccg 26990326  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  26990325 cgtcatgtatccaaggtctccccaagagacagctgtaaga 26990286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 336
Target Start/End: Original strand, 4722634 - 4722918
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 150  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||| ||    
T  4722634 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcgat 4722732  T
Q  151 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgta 250  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  4722733 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 4722832  T
Q  251 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  4722833 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtctccccag 4722918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 258
Target Start/End: Original strand, 34913563 - 34913795
Alignment:
Q  26 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 125  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || |  ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  34913563 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgactctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 34913662  T
Q  126 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 225  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  34913663 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaatcag 34913762  T
Q  226 gtatgtttcttctccatggactgtaacaagctt 258  Q
    ||||| ||| |||||||| |  |||||||||||    
T  34913763 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctt 34913795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29574748 - 29574419
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  29574748 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 29574649  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  29574648 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 29574550  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || |||||||  ||||| || || | |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  29574549 aattggctgactaagtatgcctcttcaccgtgaattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 29574450  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  29574449 catcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 29574419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 8891930 - 8891998
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8891930 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 8891998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 8903165 - 8903233
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8903165 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 8903233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 28163234 - 28163166
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28163234 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 28163166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 33373875 - 33373943
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33373875 gagaccctctttatgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 33373943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 4774618 - 4774506
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  4774618 gagaccttctttatgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 4774519  T
Q  113 atagcagtcccag 125  Q
    ||||||| |||||    
T  4774518 atagcagccccag 4774506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Original strand, 22079379 - 22079721
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||||| ||||||| || || ||||| |||    
T  22079379 gagaccctctctgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccggtagcttgaccttctaggacagccctctgagcatccttcaaagaggcc 22079478  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    |||||||  |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||  |||| || ||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |    
T  22079479 atagcagctccagccctcttgggctccgtaccttcgatagtcaaaccctgaaaagcggttccttctgcagaccctgcttcaatgcaagagaaagatgata 22079578  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22079579 gctggctaaccaaatatgcctcctctccatggactgtaacgagctttccattctttacaaactttaacttttggtgcagggtagaggtcactgccccagc 22079678  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagca 355  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22079679 gtcatgtatccacggtcttcctaggagacagctataagaagca 22079721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16285186 - 16284849
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||  || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  16285186 agaccttccttatgcttgttctcacgaagttgtattaacctgccccagccggcagcttgaccttcttagacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 16285087  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    ||||||| |||  | | ||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || |||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  16285086 tagcagttccatcccttttgggctccgtaccttcgacagttaaaccttgaaaagcggttccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 16284987  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||  | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || || |||||     
T  16284986 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaattgtaacaagctttccgctttttgcaaacttcaacttctggtgcaaggtagaggtcaccgccccagcg 16284887  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  16284886 tcatgtatccacggtcttcccaagagacagatataaga 16284849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 27607383 - 27607720
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  27607383 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 27607482  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| || ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  27607483 tggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttagtccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 27607582  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||||| |  |||||||| ||||| || ||     
T  27607583 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccattttttgcaaatttcaacttttggtgtaaagtagaggtcactgctcccgcg 27607682  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  27607683 tcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 27607720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18792444 - 18792107
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  18792444 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 18792345  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  18792344 tggcagttccatccctcttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 18792245  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  18792244 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 18792145  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  18792144 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 18792107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19676179 - 19675856
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  19676179 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 19676080  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  19676079 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctacttcaatacaagagaaagaagaca 19675980  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || |||||    
T  19675979 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcaccagc 19675880  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  19675879 atcgtgtatccacggtcttcccag 19675856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14559361 - 14559024
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || | ||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  14559361 agaccttccttatacttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 14559262  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| ||   | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  14559261 ttgcagttccctccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 14559162  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||| |||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||  | ||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || || || ||     
T  14559161 ctggttaaccaggtatgcttcctctccatgaattgtaacaagctttccgcttttggcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtcaccgctcccgcg 14559062  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  14559061 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 14559024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 19206837 - 19207166
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  19206837 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 19206936  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |    
T  19206937 atagcagccccagctttcttaagctccgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagata 19207036  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  19207037 gctggctgactaagtatgcctcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgc 19207136  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  19207137 atcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 19207166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19689835 - 19689498
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  19689835 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 19689736  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||  | ||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  19689735 tcgcagttccatccctcttaggttccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 19689636  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  19689635 ctggctaaccagatatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcg 19689536  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  19689535 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 19689498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16279290 - 16278954
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  16279290 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 16279191  T
Q  114 tagcagtcccagtct-tcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    | ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| ||||| | || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |    
T  16279190 tggcagttcca-tctctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaag-cggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgata 16279093  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    |||||||||||| |||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||    
T  16279092 gctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgc 16278993  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
     ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  16278992 gtcatgtatccaaggtctccccaagagacagctgtaaga 16278954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 2135737 - 2136074
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| ||||||| |||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  2135737 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccaaccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 2135836  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  2135837 ttgcagttccatccctcttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 2135936  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||  ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  2135937 ctggctaaccgggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcg 2136036  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||    
T  2136037 tcatgtatccatggtctccccaagagacaactgtaaga 2136074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9356361 - 9356038
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  9356361 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 9356262  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||    
T  9356261 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagac 9356163  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  9356162 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattctttacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 9356063  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  9356062 catcgtgtatccacggtcttcccag 9356038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 3327984 - 3328307
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  3327984 gagaccttctttacgcttgttctcacagagttgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagcc 3328083  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| ||||    
T  3328084 atagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagaca 3328183  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  3328184 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 3328283  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  3328284 atcgtgtatccacggtcttcccag 3328307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 29831060 - 29830737
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  29831060 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 29830961  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||  ||  ||||||| ||||||||||| |||    
T  29830960 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcaggccctgcttcaatacaagagaaagaagac 29830862  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  29830861 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 29830762  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  29830761 catcgtgtatccacggtcttcccag 29830737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 33260461 - 33260138
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| |||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || |||||||||    
T  33260461 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcc 33260362  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| || |  ||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  33260361 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggttaaaccttggaaagcagttccctcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagaca 33260262  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
      ||||| || ||||| | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  33260261 attggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 33260162  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  33260161 atcgtgtatccacggtcttcccag 33260138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 336
Target Start/End: Original strand, 12091240 - 12091524
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  12091240 cttgccccagccggtagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 12091339  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  12091340 gtcaacccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 12091439  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  12091440 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccag 12091524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 31356263 - 31355940
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  31356263 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 31356164  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  31356163 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 31356065  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  31356064 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 31355965  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  31355964 catcgtgtatccacggtcttcccag 31355940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 336
Target Start/End: Original strand, 28360471 - 28360755
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagc-tccgtaccttcaat 150  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||| | ||||| |||| | ||| || | |||||||||    
T  28360471 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcggccccag-cttccttagcctctgcaccttcaat 28360569  T
Q  151 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgta 250  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  28360570 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 28360669  T
Q  251 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  28360670 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccag 28360755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 33245245 - 33245177
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33245245 gagaccctctttgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 33245177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 19658675 - 19658743
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19658675 gagaccctctttgtgcttattctcaaggagttgtattatcttgccccagccagcagcttgtccttcttg 19658743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Original strand, 31488350 - 31488520
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  31488350 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 31488449  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcaga 183  Q
    ||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || |||||||||||||||||    
T  31488450 atagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccctcagcaga 31488520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 46134 - 46232
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46134 gagaccttctttgtgcttattctcacggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagc 46232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 32190 - 31853
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || |||||  |||| || || |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  32190 agaccttccttatgcttgctctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccttcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 32091  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  32090 tggcagttccatccctcttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatag 31991  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||     
T  31990 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcg 31891  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  31890 tcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 31853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31494 - 31157
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  31494 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 31395  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | | ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  31394 tggcagttccatcccttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 31295  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||||||||||  |||||||| || || || ||     
T  31294 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttctggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcg 31195  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  31194 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 31157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 45504 - 45841
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  45504 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 45603  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | |||||||||  | | ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| || || ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  45604 ttgcagtcccatcccttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcggaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 45703  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||     
T  45704 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagcttcccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcg 45803  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  45804 tcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 45841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Original strand, 38600 - 38925
Alignment:
Q  26 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 125  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  38600 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 38699  T
Q  126 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 225  Q
     | ||||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  38700 ccctcttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 38799  T
Q  226 gtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 325  Q
    ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || ||||||||||||    
T  38800 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcgtcatgtatccat 38899  T
Q  326 ggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  38900 ggtctccccaagagacagctgtaaga 38925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 5755 - 6078
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| || ||||| | | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  5755 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccctcttggataaccttctgagcatctttcaatgaagcc 5854  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  5855 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtca 5954  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| || || |||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  5955 gctggctgactaaatatgcttcttcaccatgaatggtaacaagttttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgc 6054  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  6055 atcgtgtatccatggtcttcccag 6078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1697 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1697
Description:

Target: scaffold1697; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 958 - 1287
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| || || ||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| | | |||||||| ||||| || ||||||    
T  958 gagaccttctttacgcttgttctcacgaagctgtatcaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctgaataactttctgagcatctttcaatgaagcc 1057  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  |||||  |||| | ||| ||||  ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||    
T  1058 atagcagccccagctttcttaggctctgcaccctcaaaggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagaca 1157  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||| ||| |||||||| || || ||    
T  1158 gctggctgaccaaatatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtggaggttaccgcacccgc 1257  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
     || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  1258 gtcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 1287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29030 - 28693
Alignment:
Q  14 agaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcca 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || | || |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||    
T  29030 agaccttccttatgcttgttctcacgaagctatattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagcca 28931  T
Q  114 tagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacag 213  Q
    | ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  28930 ttgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatag 28831  T
Q  214 ctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagca 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||| ||| || || || ||     
T  28830 ctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtaggggtcaccgcccccgcg 28731  T
Q  314 tcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 351  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  28730 tcatgtatccaaggtctccccaagagacagctgtaaga 28693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11265 - 10975
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  11265 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 11166  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  11165 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacagctagctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 11066  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagaca 342  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  11065 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccacatcgtgtatccacggtcttcccagcagaca 10975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7753 - 7430
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  || |||| || || || ||||||    
T  7753 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctccgagcatccttcaatgaagcc 7654  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  7653 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 7555  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    | |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  7554 aactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagctttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 7455  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  7454 catcgtgtatccacggtcttcccag 7430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9648 - 9364
Alignment:
Q  52 cttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 151  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  9648 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 9549  T
Q  152 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaa 251  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  9548 gtcaacccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 9449  T
Q  252 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9448 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccag 9364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 13448 - 13771
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  13448 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 13547  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgac 211  Q
    ||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  13548 atagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagac 13646  T
Q  212 agctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccag 311  Q
    |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || |    
T  13647 aattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctg 13746  T
Q  312 catcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  13747 catcgtgtatccacggtcttcccag 13771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 24719 - 25042
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  24719 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 24818  T
Q  113 atagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgaca 212  Q
    ||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||| ||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  24819 atagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagaca 24918  T
Q  213 gctggctaaccaagtatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagc 312  Q
     |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||    
T  24919 actggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgc 25018  T
Q  313 atcatgtatccatggtcttcccag 336  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  25019 atcgtgtatccacggtcttcccag 25042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22141 - 22073
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22141 gagaccctctttgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccggcagcttgtccttcttg 22073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 119574 - 119642
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttg 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  119574 gagaccctctttgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccggcagcttgtccttcttg 119642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Original strand, 7707 - 7819
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  7707 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 7806  T
Q  113 atagcagtcccag 125  Q
    ||||||| |||||    
T  7807 atagcagccccag 7819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Original strand, 21260 - 21372
Alignment:
Q  13 gagaccttctttgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagcc 112  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||    
T  21260 gagaccttctttacgcttgttctcacagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagcc 21359  T
Q  113 atagcagtcccag 125  Q
    ||||||| |||||    
T  21360 atagcagccccag 21372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University