View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8906_low_26 (Length: 363)

Name: NF8906_low_26
Description: NF8906
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8906_low_26
NF8906_low_26
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (19-350)||(30394-30725)
[»] chr3 (89 HSPs)
chr3 (19-344)||(28194760-28195076)
chr3 (225-350)||(23371406-23371530)
chr3 (225-350)||(51300624-51300748)
chr3 (229-350)||(14763664-14763784)
chr3 (225-350)||(9577687-9577809)
chr3 (225-350)||(324297-324421)
chr3 (225-350)||(12339768-12339892)
chr3 (225-350)||(14179433-14179557)
chr3 (225-350)||(14670985-14671109)
chr3 (225-350)||(14682484-14682608)
chr3 (225-350)||(43889560-43889684)
chr3 (225-350)||(52989656-52989780)
chr3 (225-341)||(10834038-10834152)
chr3 (225-350)||(14966231-14966355)
chr3 (225-350)||(16796548-16796672)
chr3 (231-355)||(37427772-37427895)
chr3 (235-350)||(15465137-15465251)
chr3 (226-340)||(54876322-54876435)
chr3 (225-350)||(5223366-5223490)
chr3 (225-342)||(10542366-10542482)
chr3 (225-338)||(12469975-12470087)
chr3 (225-344)||(16643240-16643358)
chr3 (226-350)||(17691644-17691766)
chr3 (229-325)||(44494893-44494988)
chr3 (231-350)||(18700247-18700365)
chr3 (225-316)||(50242996-50243086)
chr3 (225-350)||(21837487-21837610)
chr3 (225-316)||(43550376-43550466)
chr3 (227-338)||(15246093-15246204)
chr3 (227-338)||(15265214-15265325)
chr3 (225-288)||(9533419-9533482)
chr3 (227-309)||(15207040-15207122)
chr3 (225-334)||(32402893-32403002)
chr3 (227-329)||(316202-316304)
chr3 (226-285)||(23318650-23318709)
chr3 (231-344)||(8928369-8928481)
chr3 (231-344)||(34852596-34852708)
chr3 (225-335)||(13919408-13919516)
chr3 (273-350)||(3264997-3265073)
chr3 (273-350)||(36527806-36527882)
chr3 (231-300)||(14568899-14568970)
chr3 (226-282)||(17248221-17248276)
chr3 (226-282)||(24340657-24340713)
chr3 (226-282)||(37642199-37642255)
chr3 (225-280)||(37251101-37251156)
chr3 (224-282)||(8899221-8899278)
chr3 (229-282)||(29172565-29172618)
chr3 (231-283)||(2051138-2051190)
chr3 (302-350)||(4588864-4588912)
chr3 (302-350)||(11854703-11854751)
chr3 (231-283)||(52523666-52523718)
chr3 (226-282)||(53070633-53070688)
chr3 (215-282)||(43550447-43550513)
chr3 (215-282)||(50242949-50243015)
chr3 (224-282)||(7781325-7781382)
chr3 (224-282)||(9707585-9707642)
chr3 (224-282)||(10247701-10247758)
chr3 (278-340)||(11914003-11914064)
chr3 (224-282)||(13151768-13151825)
chr3 (224-282)||(13154233-13154290)
chr3 (224-282)||(16282789-16282846)
chr3 (224-282)||(16454259-16454316)
chr3 (224-282)||(17463305-17463362)
chr3 (224-282)||(34159453-34159510)
chr3 (268-330)||(38311759-38311820)
chr3 (224-282)||(38961869-38961926)
chr3 (224-282)||(41124014-41124071)
chr3 (224-282)||(45606885-45606942)
chr3 (224-282)||(55476618-55476675)
chr3 (302-355)||(15617339-15617392)
chr3 (302-355)||(30065911-30065964)
chr3 (302-350)||(4107488-4107536)
chr3 (302-350)||(4111340-4111388)
chr3 (302-350)||(7109668-7109716)
chr3 (302-350)||(7113603-7113651)
chr3 (302-350)||(11070038-11070086)
chr3 (302-350)||(11165620-11165668)
chr3 (226-270)||(12119704-12119747)
chr3 (302-350)||(15964939-15964987)
chr3 (302-350)||(15968863-15968911)
chr3 (302-350)||(15972787-15972835)
chr3 (226-282)||(17672753-17672808)
chr3 (234-282)||(22147467-22147515)
chr3 (302-350)||(22321634-22321682)
chr3 (302-350)||(22336689-22336737)
chr3 (302-350)||(27409735-27409783)
chr3 (302-350)||(28949694-28949742)
chr3 (302-350)||(37439727-37439775)
chr3 (302-350)||(55022837-55022885)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (19-270)||(36314690-36314940)
chr5 (225-350)||(42960605-42960729)
chr5 (225-350)||(37598816-37598940)
chr5 (225-350)||(28370955-28371079)
chr5 (225-349)||(25574403-25574525)
chr5 (225-349)||(25575596-25575718)
chr5 (225-340)||(6765901-6766015)
chr5 (225-350)||(23469866-23469989)
chr5 (225-349)||(25576789-25576911)
chr5 (225-340)||(30138862-30138976)
chr5 (243-350)||(22107386-22107492)
chr5 (226-342)||(26732768-26732882)
chr5 (225-306)||(33895589-33895670)
chr5 (223-343)||(21809513-21809632)
chr5 (226-342)||(26740581-26740695)
chr5 (226-350)||(21328150-21328273)
chr5 (223-343)||(21731393-21731512)
chr5 (268-350)||(22336630-22336711)
chr5 (268-350)||(22340168-22340249)
chr5 (229-280)||(38145441-38145492)
chr5 (232-344)||(10816471-10816582)
chr5 (232-344)||(23538497-23538608)
chr5 (226-273)||(20572025-20572072)
chr5 (226-339)||(15796494-15796607)
chr5 (226-282)||(2154593-2154648)
chr5 (226-282)||(20901988-20902043)
chr5 (234-339)||(27988869-27988978)
chr5 (226-282)||(40725984-40726040)
chr5 (225-288)||(22178153-22178216)
chr5 (226-280)||(25743852-25743908)
chr5 (224-282)||(264746-264803)
chr5 (224-282)||(20909139-20909196)
chr5 (268-330)||(22750264-22750325)
chr5 (224-282)||(29330061-29330118)
chr5 (224-282)||(29346107-29346164)
chr5 (224-282)||(29348580-29348637)
chr5 (224-282)||(29351053-29351110)
chr5 (225-279)||(29448137-29448191)
chr5 (224-282)||(32027520-32027577)
chr5 (224-282)||(39363511-39363568)
chr5 (224-282)||(42245343-42245400)
chr5 (285-350)||(18356259-18356323)
chr5 (226-283)||(22144179-22144236)
chr5 (302-350)||(10753331-10753379)
chr5 (302-350)||(15236871-15236919)
chr5 (302-350)||(15236926-15236974)
chr5 (302-350)||(19472811-19472859)
chr5 (302-350)||(20295814-20295862)
chr5 (302-350)||(20910926-20910974)
chr5 (226-282)||(36154763-36154818)
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (19-270)||(14295283-14295533)
chr1 (19-270)||(51130703-51130953)
chr1 (225-350)||(635916-636040)
chr1 (225-350)||(22124348-22124472)
chr1 (225-350)||(20958171-20958295)
chr1 (225-350)||(21043215-21043339)
chr1 (225-338)||(52940811-52940923)
chr1 (225-344)||(28312583-28312701)
chr1 (225-350)||(20437926-20438051)
chr1 (225-350)||(13881315-13881439)
chr1 (225-350)||(27653156-27653280)
chr1 (225-350)||(48603515-48603639)
chr1 (225-344)||(14800598-14800721)
chr1 (225-344)||(14809472-14809595)
chr1 (226-300)||(47190713-47190787)
chr1 (225-316)||(45574740-45574830)
chr1 (226-343)||(21533808-21533923)
chr1 (225-316)||(22130764-22130853)
chr1 (225-350)||(41781523-41781646)
chr1 (225-343)||(48520581-48520698)
chr1 (268-350)||(16372060-16372141)
chr1 (231-344)||(32649780-32649892)
chr1 (225-288)||(41049969-41050032)
chr1 (241-300)||(20329121-20329181)
chr1 (242-297)||(11945571-11945626)
chr1 (225-281)||(16368220-16368276)
chr1 (224-283)||(21896188-21896247)
chr1 (225-288)||(50614049-50614112)
chr1 (225-288)||(50621877-50621940)
chr1 (225-283)||(16758780-16758838)
chr1 (231-344)||(29534617-29534729)
chr1 (226-280)||(35261015-35261069)
chr1 (231-343)||(2332914-2333025)
chr1 (226-282)||(433137-433193)
chr1 (251-339)||(16381256-16381346)
chr1 (224-283)||(21861502-21861561)
chr1 (228-283)||(26065068-26065123)
chr1 (215-282)||(45574811-45574877)
chr1 (233-288)||(50686737-50686792)
chr1 (226-280)||(13212841-13212894)
chr1 (224-282)||(13988993-13989050)
chr1 (226-280)||(21347091-21347144)
chr1 (224-282)||(21475065-21475122)
chr1 (224-282)||(21923269-21923326)
chr1 (224-282)||(29776815-29776872)
chr1 (224-282)||(31612440-31612497)
chr1 (302-350)||(1010690-1010738)
chr1 (302-350)||(1925220-1925268)
chr1 (302-350)||(20228900-20228948)
chr1 (302-350)||(20924234-20924282)
chr1 (302-350)||(21407322-21407370)
chr1 (226-270)||(21477659-21477703)
chr1 (302-350)||(23819389-23819437)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (19-270)||(801-1051)
[»] chr7 (91 HSPs)
chr7 (19-270)||(16495541-16495791)
chr7 (225-350)||(20619443-20619568)
chr7 (225-350)||(130750-130875)
chr7 (225-350)||(11525497-11525622)
chr7 (225-350)||(11661335-11661459)
chr7 (225-350)||(14566231-14566355)
chr7 (229-350)||(16008607-16008727)
chr7 (225-350)||(18872389-18872513)
chr7 (225-350)||(18607516-18607640)
chr7 (229-350)||(42462012-42462132)
chr7 (227-350)||(9033281-9033404)
chr7 (225-350)||(10501357-10501481)
chr7 (225-350)||(38519435-38519559)
chr7 (225-349)||(11768852-11768977)
chr7 (225-350)||(32301350-32301474)
chr7 (225-350)||(46580609-46580733)
chr7 (225-347)||(14157038-14157159)
chr7 (225-350)||(14422013-14422138)
chr7 (225-350)||(14258513-14258637)
chr7 (225-350)||(14273577-14273701)
chr7 (225-350)||(16460699-16460823)
chr7 (225-350)||(16996285-16996408)
chr7 (225-350)||(16998655-16998779)
chr7 (225-350)||(1858765-1858889)
chr7 (225-350)||(16579821-16579945)
chr7 (225-350)||(16585718-16585842)
chr7 (225-350)||(20487604-20487728)
chr7 (225-350)||(25927185-25927306)
chr7 (226-344)||(9177600-9177717)
chr7 (225-316)||(13647503-13647593)
chr7 (226-344)||(17060358-17060476)
chr7 (227-300)||(9725595-9725668)
chr7 (225-350)||(13918459-13918583)
chr7 (225-344)||(17017401-17017519)
chr7 (225-329)||(14929154-14929257)
chr7 (225-329)||(15352620-15352723)
chr7 (226-288)||(1867929-1867991)
chr7 (226-288)||(15008433-15008495)
chr7 (231-344)||(16109453-16109565)
chr7 (225-329)||(48991266-48991367)
chr7 (225-288)||(147708-147771)
chr7 (225-288)||(2529987-2530050)
chr7 (226-288)||(20220124-20220186)
chr7 (246-344)||(837311-837408)
chr7 (246-344)||(1202491-1202588)
chr7 (267-340)||(15720068-15720140)
chr7 (235-344)||(16091827-16091934)
chr7 (231-343)||(38828298-38828409)
chr7 (259-339)||(18203887-18203965)
chr7 (246-344)||(833315-833412)
chr7 (246-344)||(1198495-1198592)
chr7 (215-282)||(13647456-13647522)
chr7 (215-282)||(15081918-15081984)
chr7 (226-283)||(2280053-2280110)
chr7 (278-350)||(8940312-8940383)
chr7 (226-282)||(17061895-17061950)
chr7 (302-350)||(18279370-18279418)
chr7 (302-350)||(18283333-18283381)
chr7 (226-282)||(19486678-19486734)
chr7 (224-282)||(456448-456505)
chr7 (268-330)||(10896687-10896748)
chr7 (224-282)||(11393265-11393322)
chr7 (224-282)||(11972623-11972680)
chr7 (224-282)||(14949100-14949157)
chr7 (268-330)||(15167285-15167346)
chr7 (224-282)||(15376691-15376748)
chr7 (224-282)||(16232647-16232704)
chr7 (224-282)||(18430839-18430896)
chr7 (224-282)||(20385101-20385158)
chr7 (224-282)||(21189573-21189630)
chr7 (224-282)||(24702365-24702422)
chr7 (224-282)||(24704812-24704869)
chr7 (224-282)||(27216987-27217044)
chr7 (224-282)||(32125618-32125675)
chr7 (224-282)||(41523044-41523101)
chr7 (224-282)||(41525506-41525563)
chr7 (302-350)||(33074-33122)
chr7 (302-350)||(70856-70904)
chr7 (302-350)||(74965-75013)
chr7 (302-350)||(8468780-8468828)
chr7 (231-283)||(12255730-12255782)
chr7 (302-350)||(12704750-12704798)
chr7 (302-350)||(12714831-12714879)
chr7 (302-350)||(12718635-12718683)
chr7 (302-350)||(12723546-12723594)
chr7 (226-270)||(12756651-12756694)
chr7 (302-350)||(14270036-14270084)
chr7 (302-350)||(16907292-16907340)
chr7 (302-350)||(39722233-39722281)
chr7 (226-282)||(44116636-44116691)
chr7 (302-350)||(45170097-45170145)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (225-350)||(1001-1126)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (225-350)||(142644-142769)
scaffold0020 (244-350)||(169702-169807)
[»] chr8 (64 HSPs)
chr8 (225-350)||(17438150-17438275)
chr8 (225-350)||(5083087-5083212)
chr8 (225-350)||(17086087-17086211)
chr8 (227-350)||(37515768-37515890)
chr8 (225-349)||(23667872-23667996)
chr8 (225-350)||(18833625-18833749)
chr8 (225-345)||(25363136-25363255)
chr8 (225-346)||(17460986-17461106)
chr8 (225-350)||(20502035-20502159)
chr8 (225-346)||(22237953-22238073)
chr8 (225-350)||(23659470-23659594)
chr8 (225-340)||(19808296-19808410)
chr8 (225-344)||(23943927-23944045)
chr8 (225-327)||(25484173-25484274)
chr8 (225-350)||(14397796-14397920)
chr8 (230-343)||(22963351-22963464)
chr8 (225-344)||(22253099-22253217)
chr8 (226-338)||(16799561-16799673)
chr8 (226-329)||(22995927-22996029)
chr8 (225-288)||(27941588-27941651)
chr8 (225-339)||(19154819-19154932)
chr8 (226-327)||(28397635-28397735)
chr8 (226-288)||(37116473-37116535)
chr8 (225-297)||(21346166-21346239)
chr8 (235-339)||(20533352-20533455)
chr8 (226-288)||(2418808-2418870)
chr8 (226-288)||(35026797-35026859)
chr8 (234-343)||(14103167-14103275)
chr8 (225-288)||(17439439-17439502)
chr8 (277-350)||(23409858-23409930)
chr8 (226-282)||(13508019-13508075)
chr8 (226-282)||(13597551-13597607)
chr8 (267-350)||(23914100-23914183)
chr8 (225-288)||(17266926-17266989)
chr8 (225-288)||(22364786-22364849)
chr8 (225-283)||(20498692-20498750)
chr8 (226-280)||(22419349-22419403)
chr8 (226-282)||(41598315-41598370)
chr8 (234-353)||(13665189-13665307)
chr8 (234-353)||(13724464-13724582)
chr8 (226-269)||(22525659-22525702)
chr8 (225-288)||(24353145-24353208)
chr8 (215-282)||(25484244-25484310)
chr8 (224-282)||(1484529-1484586)
chr8 (224-282)||(4483407-4483464)
chr8 (224-282)||(5853270-5853327)
chr8 (224-282)||(14409422-14409479)
chr8 (224-282)||(15203209-15203266)
chr8 (224-282)||(19896395-19896452)
chr8 (224-282)||(20046173-20046230)
chr8 (224-282)||(20403354-20403411)
chr8 (224-282)||(22001880-22001937)
chr8 (224-282)||(24486022-24486079)
chr8 (224-282)||(32810058-32810115)
chr8 (268-330)||(44476753-44476814)
chr8 (268-330)||(44480015-44480076)
chr8 (302-350)||(18862736-18862784)
chr8 (302-350)||(19278374-19278422)
chr8 (302-350)||(21410917-21410965)
chr8 (302-350)||(21805409-21805457)
chr8 (302-350)||(21828105-21828153)
chr8 (302-350)||(21972676-21972724)
chr8 (302-350)||(21976761-21976809)
chr8 (302-350)||(43251780-43251828)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (225-344)||(3025-3144)
[»] chr2 (71 HSPs)
chr2 (225-350)||(19201908-19202033)
chr2 (229-344)||(21237821-21237936)
chr2 (225-350)||(9241989-9242113)
chr2 (225-350)||(19662354-19662478)
chr2 (225-350)||(34137003-34137127)
chr2 (225-344)||(21073426-21073544)
chr2 (229-350)||(30643984-30644104)
chr2 (225-340)||(18358667-18358781)
chr2 (229-350)||(6261081-6261202)
chr2 (225-350)||(21081670-21081794)
chr2 (225-340)||(23069217-23069331)
chr2 (225-340)||(27472492-27472606)
chr2 (235-350)||(31345179-31345293)
chr2 (225-340)||(34874146-34874260)
chr2 (225-316)||(22173727-22173817)
chr2 (225-350)||(9784744-9784867)
chr2 (241-339)||(23287438-23287534)
chr2 (234-342)||(26392453-26392559)
chr2 (230-338)||(18546883-18546991)
chr2 (226-329)||(43947306-43947408)
chr2 (226-288)||(20520127-20520189)
chr2 (231-344)||(22703167-22703279)
chr2 (232-344)||(13101577-13101689)
chr2 (225-283)||(23791404-23791462)
chr2 (226-283)||(24529508-24529564)
chr2 (215-282)||(22173798-22173864)
chr2 (225-280)||(23207410-23207465)
chr2 (215-282)||(24642825-24642891)
chr2 (225-288)||(25109013-25109076)
chr2 (226-280)||(22413070-22413124)
chr2 (278-340)||(24671068-24671129)
chr2 (224-282)||(32039476-32039533)
chr2 (278-350)||(23707275-23707346)
chr2 (226-282)||(23708553-23708609)
chr2 (234-274)||(24834804-24834844)
chr2 (278-350)||(24918173-24918244)
chr2 (231-282)||(19671960-19672010)
chr2 (225-288)||(23004874-23004937)
chr2 (225-283)||(7666-7724)
chr2 (224-282)||(571524-571581)
chr2 (224-282)||(6726122-6726179)
chr2 (224-282)||(18809070-18809127)
chr2 (224-282)||(21155038-21155095)
chr2 (224-282)||(22105540-22105597)
chr2 (224-282)||(23130989-23131046)
chr2 (224-282)||(23133456-23133513)
chr2 (224-282)||(23709510-23709567)
chr2 (224-282)||(23711991-23712048)
chr2 (224-282)||(24367901-24367958)
chr2 (225-283)||(24697539-24697597)
chr2 (224-282)||(24898173-24898230)
chr2 (224-282)||(24900656-24900713)
chr2 (224-282)||(24903133-24903190)
chr2 (224-282)||(24905610-24905667)
chr2 (224-282)||(24908085-24908142)
chr2 (224-282)||(26505506-26505563)
chr2 (224-282)||(26507984-26508041)
chr2 (224-282)||(28577226-28577283)
chr2 (224-282)||(34402500-34402557)
chr2 (224-282)||(39682440-39682497)
chr2 (302-350)||(1283356-1283404)
chr2 (302-350)||(12901603-12901651)
chr2 (302-350)||(24628570-24628618)
chr2 (302-350)||(24649324-24649372)
chr2 (278-350)||(24681477-24681548)
chr2 (234-274)||(26903443-26903483)
chr2 (302-350)||(27379524-27379572)
chr2 (302-350)||(27383570-27383618)
chr2 (302-350)||(27601763-27601811)
chr2 (302-350)||(30345082-30345130)
chr2 (302-350)||(41531095-41531143)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (225-344)||(2604-2723)
scaffold0507 (225-283)||(7992-8050)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (225-350)||(7494-7617)
scaffold0111 (225-350)||(14613-14736)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (225-344)||(15041895-15042014)
chr4 (225-344)||(15112410-15112529)
chr4 (225-350)||(18212795-18212919)
chr4 (225-350)||(24047233-24047357)
chr4 (225-349)||(14852809-14852933)
chr4 (225-349)||(32306929-32307052)
chr4 (227-350)||(13591862-13591984)
chr4 (225-350)||(10056701-10056825)
chr4 (226-338)||(16043087-16043198)
chr4 (225-350)||(17048068-17048192)
chr4 (225-350)||(26050409-26050532)
chr4 (230-350)||(40907134-40907253)
chr4 (225-339)||(17333352-17333467)
chr4 (225-316)||(51463766-51463856)
chr4 (225-314)||(23803163-23803251)
chr4 (231-344)||(40906983-40907094)
chr4 (226-329)||(15791857-15791960)
chr4 (229-310)||(26789440-26789521)
chr4 (225-316)||(630602-630692)
chr4 (227-329)||(14825551-14825653)
chr4 (225-316)||(12611117-12611204)
chr4 (231-344)||(4831475-4831587)
chr4 (231-344)||(4834770-4834882)
chr4 (231-344)||(14047708-14047820)
chr4 (231-346)||(30146453-30146567)
chr4 (225-288)||(53082085-53082148)
chr4 (221-283)||(13780-13842)
chr4 (225-288)||(46640389-46640452)
chr4 (215-282)||(51463837-51463903)
chr4 (224-282)||(18215252-18215309)
chr4 (265-350)||(26045268-26045351)
chr4 (226-283)||(52243128-52243185)
chr4 (215-282)||(12611070-12611136)
chr4 (279-350)||(14185042-14185112)
chr4 (224-282)||(1837487-1837544)
chr4 (224-282)||(7641170-7641227)
chr4 (278-340)||(14746570-14746631)
chr4 (224-282)||(15118330-15118387)
chr4 (224-282)||(15355302-15355359)
chr4 (225-283)||(43198486-43198544)
chr4 (224-282)||(44615415-44615472)
chr4 (224-282)||(52312637-52312694)
chr4 (302-350)||(4561425-4561473)
chr4 (302-350)||(5757029-5757077)
chr4 (302-350)||(9556497-9556545)
chr4 (302-350)||(10712823-10712871)
chr4 (302-350)||(10926593-10926641)
chr4 (302-350)||(12487678-12487726)
chr4 (302-350)||(14757513-14757561)
chr4 (302-350)||(14954258-14954306)
chr4 (234-274)||(15365208-15365248)
chr4 (226-282)||(15367821-15367876)
chr4 (226-282)||(15371333-15371388)
chr4 (226-282)||(15373614-15373669)
chr4 (226-282)||(15402834-15402889)
chr4 (302-350)||(25689837-25689885)
chr4 (302-350)||(27533993-27534041)
chr4 (234-274)||(27996050-27996090)
chr4 (226-282)||(44102341-44102396)
chr4 (224-280)||(44773065-44773120)
chr4 (226-282)||(44928858-44928914)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (225-350)||(7422-7547)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (225-350)||(1957-2081)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (225-350)||(110716-110840)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (225-350)||(23838237-23838361)
chr6 (229-350)||(4476887-4477007)
chr6 (225-350)||(18453245-18453369)
chr6 (225-340)||(15817455-15817569)
chr6 (225-340)||(19773476-19773590)
chr6 (225-350)||(14979321-14979445)
chr6 (225-350)||(23414947-23415071)
chr6 (225-350)||(28103832-28103956)
chr6 (225-339)||(33443122-33443232)
chr6 (225-340)||(15705377-15705491)
chr6 (226-350)||(20136733-20136855)
chr6 (226-350)||(22196014-22196136)
chr6 (225-316)||(20556792-20556882)
chr6 (225-340)||(25619656-25619770)
chr6 (225-350)||(22805995-22806118)
chr6 (226-339)||(23076806-23076918)
chr6 (225-316)||(25754983-25755073)
chr6 (225-350)||(27556705-27556829)
chr6 (223-343)||(16493216-16493335)
chr6 (226-339)||(18177606-18177719)
chr6 (226-339)||(18199350-18199463)
chr6 (226-339)||(18204152-18204265)
chr6 (228-297)||(18896252-18896321)
chr6 (226-339)||(35008224-35008336)
chr6 (226-338)||(20224018-20224129)
chr6 (226-338)||(22118002-22118113)
chr6 (226-350)||(23539032-23539155)
chr6 (225-288)||(25752840-25752903)
chr6 (241-350)||(20182856-20182962)
chr6 (241-350)||(22153029-22153135)
chr6 (226-300)||(23528041-23528115)
chr6 (226-297)||(19362540-19362611)
chr6 (226-339)||(23538884-23538996)
chr6 (232-344)||(29416845-29416956)
chr6 (225-294)||(18706423-18706492)
chr6 (226-282)||(8227445-8227501)
chr6 (226-282)||(19847929-19847984)
chr6 (225-288)||(18696611-18696674)
chr6 (215-282)||(20556863-20556929)
chr6 (226-280)||(17105864-17105918)
chr6 (234-274)||(15896074-15896114)
chr6 (226-282)||(18456846-18456901)
chr6 (224-280)||(22782356-22782411)
chr6 (215-282)||(25754936-25755002)
chr6 (224-282)||(2291158-2291215)
chr6 (224-282)||(8055156-8055213)
chr6 (224-282)||(12742444-12742501)
chr6 (224-282)||(18334570-18334627)
chr6 (224-282)||(19005173-19005230)
chr6 (224-282)||(24422674-24422731)
chr6 (231-344)||(25738450-25738561)
chr6 (224-282)||(26924618-26924675)
chr6 (224-282)||(33861921-33861978)
chr6 (224-282)||(33864405-33864462)
chr6 (229-282)||(19858902-19858954)
chr6 (226-283)||(25644451-25644508)
chr6 (302-350)||(11566829-11566877)
chr6 (302-350)||(14472238-14472286)
chr6 (302-350)||(16760262-16760310)
chr6 (302-350)||(18917357-18917405)
chr6 (302-350)||(18955854-18955902)
chr6 (234-274)||(19656075-19656115)
chr6 (302-350)||(19870557-19870605)
chr6 (302-350)||(22862913-22862961)
chr6 (302-350)||(22949075-22949123)
chr6 (302-350)||(22953031-22953079)
chr6 (302-350)||(23395035-23395083)
chr6 (302-350)||(23871519-23871567)
chr6 (302-350)||(23875475-23875523)
chr6 (302-350)||(23989887-23989935)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (225-349)||(55618-55742)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (225-350)||(36243-36367)
scaffold0107 (225-350)||(10018-10142)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (225-350)||(710-834)
scaffold0010 (226-283)||(60649-60706)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (229-340)||(490-600)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (225-348)||(8096-8218)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (225-344)||(132985-133103)
scaffold0019 (225-288)||(29325-29388)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (225-343)||(17572-17689)
scaffold0293 (225-350)||(20144-20268)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (225-350)||(6093-6217)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (231-344)||(10232-10344)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (225-350)||(18101-18225)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (225-350)||(21229-21353)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (225-350)||(24531-24655)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (225-350)||(105143-105267)
scaffold0023 (224-282)||(94538-94595)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (225-350)||(126018-126142)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (225-349)||(29357-29481)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (227-350)||(696-818)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (227-350)||(221143-221264)
scaffold0012 (226-283)||(225536-225593)
scaffold0012 (302-350)||(189468-189516)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (225-350)||(3930-4055)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (225-350)||(222-346)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (225-350)||(20813-20937)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (234-346)||(15809-15920)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (225-344)||(921-1039)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (225-350)||(9655-9778)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (225-350)||(1808-1932)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (225-350)||(39315-39439)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (226-350)||(75763-75886)
[»] scaffold1419 (2 HSPs)
scaffold1419 (226-335)||(101-209)
scaffold1419 (226-266)||(1-41)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (225-350)||(17636-17760)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (225-350)||(31186-31310)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (225-340)||(6684-6798)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (227-344)||(19582-19698)
scaffold0106 (278-350)||(15225-15296)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (228-350)||(120071-120192)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (226-339)||(206459-206570)
[»] scaffold1439 (2 HSPs)
scaffold1439 (225-316)||(280-370)
scaffold1439 (215-282)||(233-299)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (225-316)||(124-214)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (225-331)||(67342-67447)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (234-350)||(11209-11323)
scaffold0040 (234-350)||(22309-22423)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (225-288)||(2426-2489)
[»] scaffold0394 (2 HSPs)
scaffold0394 (225-316)||(12232-12322)
scaffold0394 (215-282)||(12185-12251)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (256-350)||(15030-15123)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (225-347)||(4630-4751)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (229-314)||(3265-3349)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (246-350)||(7897-8000)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (230-329)||(1785-1884)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (234-350)||(10536-10651)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (229-297)||(26016-26084)
scaffold0046 (234-297)||(16861-16924)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (227-329)||(22361-22463)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (227-329)||(14056-14158)
scaffold0005 (225-288)||(267785-267848)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (225-316)||(82246-82340)
scaffold0037 (302-350)||(80426-80474)
scaffold0037 (215-282)||(82199-82265)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (244-350)||(85608-85713)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (224-349)||(332380-332503)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (225-297)||(2360-2432)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (237-332)||(6116-6210)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (234-347)||(29738-29851)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (231-344)||(146254-146366)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (226-288)||(97131-97193)
scaffold0006 (226-288)||(106409-106471)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (226-295)||(3712-3781)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (229-297)||(57931-57999)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (225-302)||(13432-13507)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (231-344)||(48396-48508)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (226-288)||(128904-128966)
scaffold0022 (225-281)||(78453-78509)
scaffold0022 (278-350)||(53825-53896)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (234-343)||(604-712)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (225-288)||(6216-6279)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (225-288)||(661-724)
scaffold0123 (225-275)||(6330-6379)
scaffold0123 (228-288)||(25231-25290)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (221-283)||(53478-53540)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (226-282)||(11595-11651)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (226-286)||(16034-16094)
scaffold0357 (226-283)||(13259-13316)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (226-282)||(17961-18017)
scaffold0247 (226-280)||(2108-2161)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (226-282)||(38190-38246)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (225-288)||(38442-38505)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (225-288)||(18171-18234)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (215-282)||(1249-1315)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (226-288)||(130-192)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (228-282)||(9877-9930)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (278-350)||(4256-4327)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (226-282)||(30059-30114)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (226-282)||(79264-79319)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (302-350)||(58810-58858)
scaffold0028 (224-282)||(134338-134395)
scaffold0028 (224-282)||(136807-136864)
scaffold0028 (224-282)||(139276-139333)
scaffold0028 (224-282)||(141745-141802)
scaffold0028 (224-282)||(144214-144271)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (234-274)||(446631-446671)
scaffold0001 (226-280)||(85559-85612)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (225-288)||(1731-1794)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (278-340)||(632-693)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (278-340)||(1279-1340)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (278-340)||(15070-15131)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (224-282)||(20874-20931)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (224-282)||(14074-14131)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (224-282)||(37948-38005)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (284-350)||(3320-3385)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (226-280)||(164570-164623)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (225-270)||(19818-19863)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (229-282)||(158433-158485)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (302-350)||(417-465)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (302-350)||(3966-4014)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (302-350)||(362-410)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (226-274)||(14547-14595)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (302-350)||(5192-5240)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (302-350)||(12389-12437)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (302-350)||(11592-11640)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (226-270)||(27683-27727)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (302-350)||(32751-32799)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (226-282)||(16911-16966)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (302-350)||(36033-36081)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (302-350)||(36177-36225)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (302-350)||(207593-207641)


Alignment Details
Target: scaffold0013 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 19 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30725 - 30394
Alignment:
Q  19 gctacactagtaattatttacgtatcgtggctaatttcaaataggctataaactgagtatccttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaata 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30725 gctacactagtaattatttacgtgtcgtggctaatttcaaataggttataaacttagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaata 30626  T
Q  119 tttgctgctattttggccaaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgat 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30625 tttgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttatgtgat 30526  T
Q  219 tttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgaca 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30525 tttgttcatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgttgattgattattatttgaca 30426  T
Q  319 ttattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    || |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  30425 ttgttatgtcttgagatgtttatgtgatgcct 30394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 89)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28195076 - 28194760
Alignment:
Q  19 gctacactagtaattatttacgtatcgtggctaatttcaaataggctataaactgagtatccttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaata 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28195076 gctacactagtaattatttacgtgtcgtggctaatttcaaataggttataaactgagtatacttctaaaggattatatgcatatgtatgagcaccgaata 28194977  T
Q  119 tttgctgctattttggccaaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgat 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28194976 tttgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatta---------atgtttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgtt 28194886  T
Q  219 tttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgaca 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194885 tttgttcatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgaca 28194786  T
Q  319 ttattatatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  28194785 ttgttatatcttgagatgtttatgtg 28194760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 23371406 - 23371530
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  23371406 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 23371504  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  23371505 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 23371530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 51300748 - 51300624
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  51300748 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 51300650  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  51300649 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 51300624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 229 - 350
Target Start/End: Original strand, 14763664 - 14763784
Alignment:
Q  229 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  14763664 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatc 14763762  T
Q  329 ttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  14763763 ttgagatgtttatgtgctgcct 14763784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9577809 - 9577687
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||| ||| |||    
T  9577809 tatgatttgatgttgttagtaatgtgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggtgttg-ttgattatcatttgatattgtta 9577711  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||    
T  9577710 tatcttgaga--tttatgtgttgcct 9577687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 324421 - 324297
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  324421 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 324323  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  324322 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 324297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12339892 - 12339768
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  12339892 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 12339794  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  12339793 tatcttgagatgtttacgtgtcgcct 12339768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14179557 - 14179433
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  14179557 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 14179459  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  14179458 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 14179433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14671109 - 14670985
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || |||    
T  14671109 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgtta 14671011  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  14671010 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 14670985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14682608 - 14682484
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || |||    
T  14682608 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatcttgtta 14682510  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  14682509 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 14682484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 43889560 - 43889684
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  43889560 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 43889658  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  43889659 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 43889684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 52989656 - 52989780
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  52989656 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 52989754  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  52989755 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 52989780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 341
Target Start/End: Original strand, 10834038 - 10834152
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  10834038 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt-gtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 10834135  T
Q  325 tatcttgagatgtttat 341  Q
    |||||||||||||||||    
T  10834136 tatcttgagatgtttat 10834152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14966355 - 14966231
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  14966355 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaattgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 14966257  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  14966256 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 14966231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16796672 - 16796548
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  16796672 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 16796574  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  16796573 tatcttgaaatgtttacgtgctgcct 16796548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 231 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37427895 - 37427772
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||| | | |||||||||    
T  37427895 ttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttga-tgattatcatttgatactgttatatctt 37427797  T
Q  331 gagatgtttatgtgttgcctctgct 355  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37427796 gagatgtttatgtgctgcctgtgct 37427772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15465251 - 15465137
Alignment:
Q  235 tgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgaga 334  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  15465251 tgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgcttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgaga 15465153  T
Q  335 tgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||| |||| ||||    
T  15465152 tgtttacgtgtcgcct 15465137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 226 - 340
Target Start/End: Original strand, 54876322 - 54876435
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||    
T  54876322 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 54876420  T
Q  326 atcttgagatgttta 340  Q
    |||||||||||||||    
T  54876421 atcttgagatgttta 54876435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5223490 - 5223366
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  5223490 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 5223392  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  5223391 tatcttgagatgtttacgtgtcgcct 5223366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 342
Target Start/End: Original strand, 10542366 - 10542482
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || |||    
T  10542366 tatgatttgatgtcgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgtta 10542464  T
Q  325 tatcttgagatgtttatg 342  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10542465 tatcttgagatgtttatg 10542482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12470087 - 12469975
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  12470087 tatgatgtgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 12469989  T
Q  325 tatcttgagatgtt 338  Q
    ||||||||||||||    
T  12469988 tatcttgagatgtt 12469975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16643358 - 16643240
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  16643358 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataggatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 16643260  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    |||||  |||||||||||||    
T  16643259 tatctcaagatgtttatgtg 16643240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 350
Target Start/End: Original strand, 17691644 - 17691766
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||  |||||||    
T  17691644 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgataatcatttgatgttattat 17691742  T
Q  326 atcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||    
T  17691743 atc-tgagatgtttacgtgctgcct 17691766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 229 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44494988 - 44494893
Alignment:
Q  229 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  44494988 atttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattattat 44494893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 350
Target Start/End: Original strand, 18700247 - 18700365
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 330  Q
    ||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  18700247 ttgatgttgatggtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttaattatcatttgatattgttatatctt 18700345  T
Q  331 gagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||| ||| |||||    
T  18700346 gagatgtttacgtgctgcct 18700365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 50243086 - 50242996
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  50243086 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttga 50242996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21837610 - 21837487
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| ||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  21837610 tatgatttaatgatgatagtaatgtaataaatttgtatatgcatt-tgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 21837513  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  21837512 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 21837487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 316
Target Start/End: Original strand, 43550376 - 43550466
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  43550376 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg-ttgattatgatttga 43550466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15246204 - 15246093
Alignment:
Q  227 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||    
T  15246204 tgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcctttgatattgttat 15246106  T
Q  326 atcttgagatgtt 338  Q
     ||| || |||||    
T  15246105 gtctggatatgtt 15246093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15265325 - 15265214
Alignment:
Q  227 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||    
T  15265325 tgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcctttgatattgttat 15265227  T
Q  326 atcttgagatgtt 338  Q
     ||| || |||||    
T  15265226 gtctggatatgtt 15265214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9533482 - 9533419
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9533482 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 9533419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15207122 - 15207040
Alignment:
Q  227 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgcttaagttgatgattgattat 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15207122 tgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatg-ttgattat 15207040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 334
Target Start/End: Original strand, 32402893 - 32403002
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgctt-aagttgatgattgattattatttgacattatt 323  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||||| ||| ||    
T  32402893 tatgatttgttgttgcgagtaatgtgatatagttttatatgcattatgtgaattatctaagatgtttaaagttgct-attgattattatttgatattgtt 32402991  T
Q  324 atatcttgaga 334  Q
    |||||||||||    
T  32402992 atatcttgaga 32403002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 316304 - 316202
Alignment:
Q  227 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||    
T  316304 tgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatg-ttgattattcttggatattgttat 316206  T
Q  326 atct 329  Q
    ||||    
T  316205 atct 316202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 23318650 - 23318709
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 285  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23318650 atgatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 23318709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Original strand, 8928369 - 8928481
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 329  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  8928369 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 8928466  T
Q  330 tgagatgtttatgtg 344  Q
    |||||||| ||||||    
T  8928467 tgagatgtctatgtg 8928481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Original strand, 34852596 - 34852708
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 329  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  34852596 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 34852693  T
Q  330 tgagatgtttatgtg 344  Q
    |||||||| ||||||    
T  34852694 tgagatgtctatgtg 34852708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13919516 - 13919408
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||  |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| | | |||    
T  13919516 tatgatttaatgtttatagcgatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaag-tgttg-ttgattattatgtgataatgtta 13919419  T
Q  325 tatcttgagat 335  Q
    |||||||||||    
T  13919418 tatcttgagat 13919408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 273 - 350
Target Start/End: Original strand, 3264997 - 3265073
Alignment:
Q  273 tgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3264997 tgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcatgagatgtttatgtgttgcct 3265073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 273 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36527882 - 36527806
Alignment:
Q  273 tgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36527882 tgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatatttatgtgttgcct 36527806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 300
Target Start/End: Original strand, 14568899 - 14568970
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatat--ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatg 300  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  14568899 ttgatgttgttgttaatgtgatatataattgtatatgcgttatgtgaattatatatgatgtttaggttgatg 14568970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 17248221 - 17248276
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17248221 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 17248276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 24340657 - 24340713
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24340657 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24340713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 37642199 - 37642255
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  37642199 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 37642255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 280
Target Start/End: Original strand, 37251101 - 37251156
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  37251101 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 37251156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8899278 - 8899221
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8899278 ttatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 8899221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 282
Target Start/End: Original strand, 29172565 - 29172618
Alignment:
Q  229 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29172565 atttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29172618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051190
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 2051190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 4588864 - 4588912
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4588864 ttgattatcatttgaaattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcct 4588912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11854751 - 11854703
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11854751 ttgattattatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 11854703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523718
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 52523718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 53070633 - 53070688
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  53070633 atgatttgatgttgttag-attgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 53070688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 43550447 - 43550513
Alignment:
Q  215 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  43550447 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatacattacttgaattatat 43550513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 50243015 - 50242949
Alignment:
Q  215 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  50243015 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 50242949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 7781325 - 7781382
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7781325 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 7781382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 9707585 - 9707642
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  9707585 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 9707642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 10247701 - 10247758
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  10247701 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 10247758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Original strand, 11914003 - 11914064
Alignment:
Q  278 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 340  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  11914003 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 11914064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 13151768 - 13151825
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13151768 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13151825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 13154233 - 13154290
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13154233 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13154290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 16282789 - 16282846
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16282789 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 16282846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 16454259 - 16454316
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16454259 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 16454316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17463362 - 17463305
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17463362 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 17463305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 34159510 - 34159453
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  34159510 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 34159453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 330
Target Start/End: Original strand, 38311759 - 38311820
Alignment:
Q  268 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 330  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  38311759 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 38311820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 38961869 - 38961926
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  38961869 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 38961926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41124071 - 41124014
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  41124071 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 41124014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 45606885 - 45606942
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  45606885 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 45606942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 55476675 - 55476618
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  55476675 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 55476618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15617392 - 15617339
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcctctgct 355  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  15617392 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgct 15617339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30065964 - 30065911
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcctctgct 355  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  30065964 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgct 30065911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 4107488 - 4107536
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4107488 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 4107536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 4111340 - 4111388
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4111340 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 4111388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7109716 - 7109668
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7109716 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 7109668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7113651 - 7113603
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7113651 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 7113603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11070086 - 11070038
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11070086 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 11070038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 11165620 - 11165668
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11165620 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 11165668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 270
Target Start/End: Original strand, 12119704 - 12119747
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 270  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  12119704 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcatta 12119747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15964987 - 15964939
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15964987 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 15964939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15968911 - 15968863
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15968911 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 15968863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15972835 - 15972787
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15972835 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 15972787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17672808 - 17672753
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  17672808 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattatatatgcattatttgaattatat 17672753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 282
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147515
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 22147515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22321682 - 22321634
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22321682 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 22321634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22336737 - 22336689
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22336737 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 22336689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 27409735 - 27409783
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27409735 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 27409783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28949742 - 28949694
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28949742 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 28949694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 37439727 - 37439775
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  37439727 ttgattattatttgatatggttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 37439775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 55022885 - 55022837
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  55022885 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 55022837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 36314940 - 36314690
Alignment:
Q  19 gctacactagtaattatttacgtatcgtggctaatttcaaataggctataaactgagtatccttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaata 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314940 gctacactagtaattatttacgtgtcttggctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaata 36314841  T
Q  119 tttgctgctattttggccaaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgat 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  36314840 tttgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgat 36314741  T
Q  219 tttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 270  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  36314740 tttgttcataatttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacatta 36314690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42960729 - 42960605
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  42960729 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 42960631  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  42960630 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 42960605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 37598816 - 37598940
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  37598816 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 37598914  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  37598915 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 37598940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 28370955 - 28371079
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  28370955 tatgatctgatgttgttagtaatgagatatatttgcatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 28371053  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  28371054 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 28371079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 349
Target Start/End: Original strand, 25574403 - 25574525
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||    
T  25574403 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatta-ttgaaatagtta 25574500  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcc 349  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  25574501 tatcttgagatgtttatgtgctgcc 25574525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 349
Target Start/End: Original strand, 25575596 - 25575718
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||    
T  25575596 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatta-ttgaaatagtta 25575693  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcc 349  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  25575694 tatcttgagatgtttatgtgctgcc 25575718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6766015 - 6765901
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||    
T  6766015 tatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatg-ttgattattatttgatgttgtta 6765917  T
Q  325 tatcttgagatgttta 340  Q
    ||||||||||||||||    
T  6765916 tatcttgagatgttta 6765901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23469989 - 23469866
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | |  ||    
T  23469989 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgata-tggta 23469892  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  23469891 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 23469866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 349
Target Start/End: Original strand, 25576789 - 25576911
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||    
T  25576789 tatgattttatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcatgatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatta-ttgatattgtta 25576886  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcc 349  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  25576887 tatcttgagatgtttatgtgctgcc 25576911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Original strand, 30138862 - 30138976
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || |||    
T  30138862 tatgatttaatgttcgtagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgtta 30138960  T
Q  325 tatcttgagatgttta 340  Q
    ||||||||||||||||    
T  30138961 tatcttgagatgttta 30138976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 350
Target Start/End: Original strand, 22107386 - 22107492
Alignment:
Q  243 gtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatg 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| |    
T  22107386 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttagg 22107484  T
Q  343 tgttgcct 350  Q
    || |||||    
T  22107485 tgctgcct 22107492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 226 - 342
Target Start/End: Original strand, 26732768 - 26732882
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||   |  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  26732768 atgatttaatgttgatagaaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaagt--gtcgttgattattatttgatattgttat 26732865  T
Q  326 atcttgagatgtttatg 342  Q
    ||| |||||||||||||    
T  26732866 atcctgagatgtttatg 26732882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 306
Target Start/End: Original strand, 33895589 - 33895670
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgat 306  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  33895589 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgtttgat 33895670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 343
Target Start/End: Original strand, 21809513 - 21809632
Alignment:
Q  223 tttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattat 322  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |  | |||||||||   || |    
T  21809513 tttatgaattgaggttgttagtaatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgt 21809611  T
Q  323 tatatcttgagatgtttatgt 343  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  21809612 tctatcttgagatgtttatgt 21809632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 342
Target Start/End: Original strand, 26740581 - 26740695
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| ||||    
T  26740581 atgatttaatgttgatagaaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaag-tgttg-ttgattattatttgatattgttat 26740678  T
Q  326 atcttgagatgtttatg 342  Q
    ||| | |||||||||||    
T  26740679 atccttagatgtttatg 26740695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 350
Target Start/End: Original strand, 21328150 - 21328273
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||  |||    
T  21328150 atgatttgatgttataaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgctat 21328248  T
Q  326 atcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||  | |||||| |||| |||||    
T  21328249 atctgaatatgtttttgtgctgcct 21328273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 343
Target Start/End: Original strand, 21731393 - 21731512
Alignment:
Q  223 tttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattat 322  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |  | |||||||||   || |    
T  21731393 tttatgaattgaggttgttagtaatgagatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgt 21731491  T
Q  323 tatatcttgagatgtttatgt 343  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  21731492 tctatcttgagatgtttatgt 21731512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22336711 - 22336630
Alignment:
Q  268 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22336711 ttatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 22336630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22340249 - 22340168
Alignment:
Q  268 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22340249 ttatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 22340168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 229 - 280
Target Start/End: Original strand, 38145441 - 38145492
Alignment:
Q  229 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 280  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38145441 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattat 38145492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 232 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10816582 - 10816471
Alignment:
Q  232 tgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 330  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  10816582 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggagttatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatctt 10816485  T
Q  331 gagatgtttatgtg 344  Q
    ||||||| ||||||    
T  10816484 gagatgtctatgtg 10816471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 232 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 23538608 - 23538497
Alignment:
Q  232 tgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 330  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  23538608 tgatgttgttaacgatgtggtatatttgaaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatgatttgatattgttatatctt 23538511  T
Q  331 gagatgtttatgtg 344  Q
    ||||||| ||||||    
T  23538510 gagatgtctatgtg 23538497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20572072 - 20572025
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20572072 atgatttgatgttgttagtaatgtaatatagttgtatatgcattatgt 20572025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15796607 - 15796494
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaag-ttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||  ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||  ||    
T  15796607 atgatttgatgttgctaataatgtgatataattgtatatacagtatgcgaattataagagatgtttaagattgatg-ttgattatcatttgatattgcta 15796509  T
Q  325 tatcttgagatgttt 339  Q
    |||| |||| |||||    
T  15796508 tatcatgagctgttt 15796494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 2154593 - 2154648
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2154593 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 2154648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 20901988 - 20902043
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20901988 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 20902043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 234 - 339
Target Start/End: Original strand, 27988869 - 27988978
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatata--tttgtatatgcatt-atgtgaattatataagatgcttaa--gttgatgattgattattatttgacattattatatc 328  Q
    |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||    
T  27988869 atgttgttaagaatgtgatataaatttgtatatgcattgatgtgaattatacaagatgtttaaatgttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatc 27988967  T
Q  329 ttgagatgttt 339  Q
     |||| |||||    
T  27988968 atgagctgttt 27988978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40726040 - 40725984
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  40726040 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 40725984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 22178153 - 22178216
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  22178153 tatgattggatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 22178216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25743908 - 25743852
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtga--tatatttgtatatgcattatgtgaattat 280  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25743908 atgatttggtgttgttattaatgtgacatatatttatatatgcattatgtgaattat 25743852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 264746 - 264803
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  264746 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 264803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20909196 - 20909139
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20909196 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20909139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22750325 - 22750264
Alignment:
Q  268 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 330  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  22750325 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 22750264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29330118 - 29330061
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29330118 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29330061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29346164 - 29346107
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29346164 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29346107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29348637 - 29348580
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29348637 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29348580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29351110 - 29351053
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29351110 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29351053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 29448191 - 29448137
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatta 279  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  29448191 tatgatttgatgttgataataaggtgatgtatttgtatatgcattacatgaatta 29448137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32027577 - 32027520
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  32027577 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 32027520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 39363568 - 39363511
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  39363568 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 39363511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 42245343 - 42245400
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  42245343 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 42245400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18356323 - 18356259
Alignment:
Q  285 gatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18356323 gatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 18356259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22144236 - 22144179
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  22144236 atgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 22144179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10753379 - 10753331
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10753379 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacatgttgcct 10753331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 15236871 - 15236919
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15236871 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 15236919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 15236926 - 15236974
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15236926 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 15236974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 19472811 - 19472859
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19472811 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 19472859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20295862 - 20295814
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20295862 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 20295814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 20910926 - 20910974
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20910926 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 20910974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 36154763 - 36154818
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  36154763 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 36154818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 270
Target Start/End: Original strand, 14295283 - 14295533
Alignment:
Q  19 gctacactagtaattatttacgtatcgtggctaatttcaaataggctataaactgagtatccttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaata 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295283 gctacactagtaattatttacgtgtcttggctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaata 14295382  T
Q  119 tttgctgctattttggccaaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgat 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14295383 tttgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgat 14295482  T
Q  219 tttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 270  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  14295483 tttgttcataatttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacatta 14295533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 51130953 - 51130703
Alignment:
Q  19 gctacactagtaattatttacgtatcgtggctaatttcaaataggctataaactgagtatccttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaata 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51130953 gctacactagtaattatttacgtgtcttggctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaata 51130854  T
Q  119 tttgctgctattttggccaaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgat 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  51130853 tttgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgat 51130754  T
Q  219 tttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 270  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  51130753 tttgttcataatttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacatta 51130703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 635916 - 636040
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  635916 tatgatttgatgttgttagcaatgtgat-tatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgatgattgaatattatttgacattgtta 636014  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| || |||||||| |||||    
T  636015 tatcttgaaatatttatgtgctgcct 636040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22124472 - 22124348
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  22124472 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 22124374  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  22124373 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 22124348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20958295 - 20958171
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| | |    
T  20958295 tatgttttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtca 20958197  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  20958196 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 20958171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 21043215 - 21043339
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||| ||| |||    
T  21043215 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-ttttattatcatttgatattgtta 21043313  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  21043314 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 21043339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 338
Target Start/End: Original strand, 52940811 - 52940923
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||    
T  52940811 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattattatttggtattgtta 52940909  T
Q  325 tatcttgagatgtt 338  Q
    ||||||||||||||    
T  52940910 tatcttgagatgtt 52940923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28312701 - 28312583
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  28312701 tatgatttgatgtttttagtaatgagatatatttgtatatacattatgtggattttataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 28312603  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28312602 tatcttgagatgtttatgtg 28312583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 20437926 - 20438051
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattatt 323  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||    
T  20437926 tatgatttgatgctgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtt 20438024  T
Q  324 atatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  20438025 atatcttgaggtgtttatgtgctgcct 20438051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 13881315 - 13881439
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  13881315 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 13881413  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||    
T  13881414 tatctcaagatgtttatgtgatgcct 13881439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 27653156 - 27653280
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  27653156 tatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgagaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 27653254  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  27653255 tatcttgagatgtttaagtgctgcct 27653280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48603639 - 48603515
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  48603639 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatacattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 48603541  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||    
T  48603540 gatcttgagatgtttacgtgctgcct 48603515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14800721 - 14800598
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgtta-gtaatgtgatatat----ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacat 319  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14800721 tatgatttgatgttgttaagtaacgtgatatatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattattatttgatat 14800623  T
Q  320 tattatatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  14800622 tgttatatcttgatatgtttatgtg 14800598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14809595 - 14809472
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgtta-gtaatgtgatatat----ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacat 319  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14809595 tatgatttgatgttgttaagtaacgtgatatatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattattatttgatat 14809497  T
Q  320 tattatatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  14809496 tgttatatcttgatatgtttatgtg 14809472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 226 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 47190787 - 47190713
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  47190787 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtaaattatataagatgtttaagttgatg 47190713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 316
Target Start/End: Original strand, 45574740 - 45574830
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  45574740 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg-ttgattatgatttga 45574830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 226 - 343
Target Start/End: Original strand, 21533808 - 21533923
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| ||||    
T  21533808 atgatttaatgttgatagaaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttg-ttgattattatttgatattgttat 21533905  T
Q  326 atcttgagatgtttatgt 343  Q
    ||| | ||| ||||||||    
T  21533906 atcctaagaagtttatgt 21533923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 316
Target Start/End: Original strand, 22130764 - 22130853
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||    
T  22130764 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg--tgattatgatttga 22130853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 41781523 - 41781646
Alignment:
Q  225 tatgatttgat-gttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatt 323  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| ||||||  || ||    
T  41781523 tatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttg-ttgattatcatttgatgttgtt 41781619  T
Q  324 atatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41781620 atatcttgaaatgtttatgtgctgcct 41781646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 48520698 - 48520581
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattatt 323  Q
    ||||| |||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||    
T  48520698 tatgaattgatgttataaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatg-ttgtttattatttgatattgtt 48520600  T
Q  324 atatcttgagatgtttatgt 343  Q
    ||||| ||||||||| ||||    
T  48520599 atatc-tgagatgttcatgt 48520581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16372141 - 16372060
Alignment:
Q  268 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16372141 ttatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 16372060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32649892 - 32649780
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 329  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  32649892 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 32649795  T
Q  330 tgagatgtttatgtg 344  Q
    |||||||| ||||||    
T  32649794 tgagatgtctatgtg 32649780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 41049969 - 41050032
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  41049969 tatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg 41050032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20329181 - 20329121
Alignment:
Q  241 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  20329181 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgttttaagttgatg 20329121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11945626 - 11945571
Alignment:
Q  242 agtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttg 297  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11945626 agtaatgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagttg 11945571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 281
Target Start/End: Original strand, 16368220 - 16368276
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattata 281  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  16368220 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 16368276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 283
Target Start/End: Original strand, 21896188 - 21896247
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  21896188 ttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatata 21896247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 50614049 - 50614112
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  50614049 tatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatg 50614112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 50621877 - 50621940
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  50621877 tatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatg 50621940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16758838 - 16758780
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  16758838 tatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 16758780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29534729 - 29534617
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 329  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||  | |||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||  ||||||||    
T  29534729 ttgatgttgttaatgatgtggtatattttcaaatgcattatgtggaattttatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatatcgttatatct 29534632  T
Q  330 tgagatgtttatgtg 344  Q
    |||||||| ||||||    
T  29534631 tgagatgtctatgtg 29534617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Original strand, 35261015 - 35261069
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 280  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  35261015 atgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattat 35261069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 343
Target Start/End: Original strand, 2332914 - 2333025
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 329  Q
    |||||||||||| | | ||| || ||||| | |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  2332914 ttgatgttgttaatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 2333011  T
Q  330 tgagatgtttatgt 343  Q
    |||||||| |||||    
T  2333012 tgagatgtctatgt 2333025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 433193 - 433137
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  433193 atgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 433137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16381346 - 16381256
Alignment:
Q  251 atatatttgtatatgcatt-atgtgaattatataagatgcttaa--gttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttt 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||  ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||||    
T  16381346 atatatttgtatatgcattgatgtgaattatacaatatgtttaaatgttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 16381256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 283
Target Start/End: Original strand, 21861502 - 21861561
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  21861502 ttatgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 21861561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26065123 - 26065068
Alignment:
Q  228 gatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26065123 gatttgatgtcattaataatgtgatatatttgtatatgtattacttgaattatata 26065068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 45574811 - 45574877
Alignment:
Q  215 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  45574811 tgatgttgattatgatttgatgttctta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 45574877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 50686792 - 50686737
Alignment:
Q  233 gatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  50686792 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 50686737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Original strand, 13212841 - 13212894
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 280  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  13212841 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 13212894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13989050 - 13988993
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13989050 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13988993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21347144 - 21347091
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 280  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  21347144 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 21347091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 21475065 - 21475122
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  21475065 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 21475122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 21923269 - 21923326
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  21923269 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 21923326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29776872 - 29776815
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29776872 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29776815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31612497 - 31612440
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  31612497 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 31612440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1010738 - 1010690
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1010738 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 1010690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 1925220 - 1925268
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1925220 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 1925268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 20228900 - 20228948
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20228900 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 20228948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 20924234 - 20924282
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20924234 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 20924282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21407370 - 21407322
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21407370 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 21407322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21477703 - 21477659
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 270  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21477703 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatacgcatta 21477659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 23819389 - 23819437
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23819389 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 23819437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 270
Target Start/End: Original strand, 801 - 1051
Alignment:
Q  19 gctacactagtaattatttacgtatcgtggctaatttcaaataggctataaactgagtatccttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaata 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  801 gctacactagtaattatttacgtgtcttggctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcatcgaata 900  T
Q  119 tttgctgctattttggccaaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgat 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  901 tttgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgat 1000  T
Q  219 tttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 270  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  1001 tttgttcataatttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacatta 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 91)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16495791 - 16495541
Alignment:
Q  19 gctacactagtaattatttacgtatcgtggctaatttcaaataggctataaactgagtatccttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaata 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16495791 gctacactagtaattatttacgtgtcttggctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcatcgaata 16495692  T
Q  119 tttgctgctattttggccaaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgat 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16495691 tttgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgat 16495592  T
Q  219 tttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 270  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16495591 tttgttcataatttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacatta 16495541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20619568 - 20619443
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20619568 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 20619469  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20619468 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 20619443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 130750 - 130875
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  130750 tatgatttgatgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataaggtgtttaagttgatgattgattattatttgatattgtta 130849  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||    
T  130850 tatcttgagatgtttctgtgctgcct 130875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 11525497 - 11525622
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11525497 tatgatatgatgttattagtaatttgatatattggtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgattgattattatttgatattgtta 11525596  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||    
T  11525597 tatcctgagatgtttatgtgctgcct 11525622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11661459 - 11661335
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  11661459 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 11661361  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  11661360 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 11661335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14566355 - 14566231
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  14566355 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 14566257  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  14566256 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 14566231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 229 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16008727 - 16008607
Alignment:
Q  229 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  16008727 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatc 16008629  T
Q  329 ttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16008628 ttgagatgtttatgtgttgcct 16008607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18872513 - 18872389
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  18872513 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 18872415  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  18872414 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 18872389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18607640 - 18607516
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  18607640 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattttta 18607542  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||    
T  18607541 tatattgagatgtttatgtgctgcct 18607516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 229 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42462132 - 42462012
Alignment:
Q  229 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||    
T  42462132 atttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatattcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatc 42462034  T
Q  329 ttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42462033 ttgagatgtttatgtgttgcct 42462012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 350
Target Start/End: Original strand, 9033281 - 9033404
Alignment:
Q  227 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattata 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||| |||||    
T  9033281 tgatttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgcattattatttgatattgttata 9033380  T
Q  327 tcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    || |||||| ||||||||||||||    
T  9033381 tcctgagatatttatgtgttgcct 9033404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 10501357 - 10501481
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  10501357 tatgatttgattttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 10501455  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10501456 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 10501481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38519559 - 38519435
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  38519559 tatgatttgatgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattgtataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 38519461  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  38519460 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 38519435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 349
Target Start/End: Original strand, 11768852 - 11768977
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattg--attattatttgacattat 322  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||| ||| |    
T  11768852 tatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgaaaatattatttgatattgt 11768950  T
Q  323 tatatcttgagatgtttatgtgttgcc 349  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11768951 tatatcttgagatgattatgtgctgcc 11768977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32301474 - 32301350
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  32301474 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatctttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 32301376  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  32301375 tatcttgagatgtttacgtgttgcct 32301350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 46580609 - 46580733
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  46580609 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 46580707  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  46580708 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 46580733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 347
Target Start/End: Original strand, 14157038 - 14157159
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  14157038 tatgatttgatatcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 14157136  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttg 347  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14157137 tatcttgagatgtttatgtgttg 14157159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14422138 - 14422013
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattatt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||    
T  14422138 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggatcatataagatgttttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtt 14422040  T
Q  324 atatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  14422039 atatcttgaggtgtttatgtgctgcct 14422013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14258637 - 14258513
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  14258637 tatgatttgatattgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 14258539  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  14258538 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 14258513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14273701 - 14273577
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  14273701 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 14273603  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  14273602 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 14273577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 16460699 - 16460823
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || |||    
T  16460699 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgtta 16460797  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  16460798 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 16460823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16996408 - 16996285
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || || |||||| | |||||| ||| |||    
T  16996408 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaa-atgttg-ttgattttcatttgatattgtta 16996311  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  16996310 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 16996285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16998779 - 16998655
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  16998779 tatgatttaatgttgataataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 16998681  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  16998680 tatcttgagatgtttaagtgctgcct 16998655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 1858765 - 1858889
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  1858765 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 1858863  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  1858864 tatcttgagatgtttacgtgtcgcct 1858889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16579945 - 16579821
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||  || |||    
T  16579945 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg-tttttgattatcatttgatgttgtta 16579847  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  16579846 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 16579821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 16585718 - 16585842
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||  || |||    
T  16585718 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg-tttttgattatcatttgatgttgtta 16585816  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  16585817 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 16585842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20487728 - 20487604
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || |||    
T  20487728 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgtta 20487630  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||    
T  20487629 tgtcttgagatatttatgtgctgcct 20487604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 25927185 - 25927306
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||| |||||| ||| |||    
T  25927185 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttg----ttgattatcatttgatattgtta 25927280  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  25927281 tatcttgagatgtttacgtgtcgcct 25927306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 226 - 344
Target Start/End: Original strand, 9177600 - 9177717
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  9177600 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattattat 9177698  T
Q  326 atcttgagatgtttatgtg 344  Q
    || | || ||||| |||||    
T  9177699 atttggatatgttaatgtg 9177717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13647593 - 13647503
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  13647593 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg-ttgattatgatttga 13647503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 344
Target Start/End: Original strand, 17060358 - 17060476
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||  ||||| ||| |||    
T  17060358 atgatttaatgttgatagtaatgtcaaatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgaag-ttgattatcgtttgatattgtta 17060456  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  17060457 tattttgagatgtttatgtg 17060476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 300
Target Start/End: Original strand, 9725595 - 9725668
Alignment:
Q  227 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatg 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9725595 tgatttaatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatg 9725668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 13918459 - 13918583
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| |||||| ||  |||    
T  13918459 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttaattatcatttgatatcgtta 13918557  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  13918558 tatcttgagatgtttacgtgtcgcct 13918583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 344
Target Start/End: Original strand, 17017401 - 17017519
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| | ||||  ||||||    
T  17017401 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatatgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatgttatta 17017499  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    ||||| || ||||| |||||    
T  17017500 tatctggatatgttaatgtg 17017519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 329
Target Start/End: Original strand, 14929154 - 14929257
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||     
T  14929154 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttg 14929252  T
Q  325 tatct 329  Q
    |||||    
T  14929253 tatct 14929257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 329
Target Start/End: Original strand, 15352620 - 15352723
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||     
T  15352620 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttg 15352718  T
Q  325 tatct 329  Q
    |||||    
T  15352719 tatct 15352723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 288
Target Start/End: Original strand, 1867929 - 1867991
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  1867929 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatg 1867991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 288
Target Start/End: Original strand, 15008433 - 15008495
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  15008433 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg 15008495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Original strand, 16109453 - 16109565
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 329  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| |||  |||||||    
T  16109453 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgctatatct 16109550  T
Q  330 tgagatgtttatgtg 344  Q
    |||||||| ||||||    
T  16109551 tgagatgtctatgtg 16109565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 48991367 - 48991266
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| | |||| |||||||    
T  48991367 tatgatttaatgttgatagtaat-tgatatatt-gtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatattatta 48991271  T
Q  325 tatct 329  Q
    |||||    
T  48991270 tatct 48991266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 147771 - 147708
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  147771 tatgatttgatgttgtgagtaatgagatatatttgtataagcattatgtggattatatgagatg 147708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 2529987 - 2530050
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2529987 tatgatttaatgttgatagtgatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatg 2530050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 288
Target Start/End: Original strand, 20220124 - 20220186
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  20220124 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatg 20220186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 344
Target Start/End: Original strand, 837311 - 837408
Alignment:
Q  246 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  837311 atgtgttatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 837408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 344
Target Start/End: Original strand, 1202491 - 1202588
Alignment:
Q  246 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1202491 atgtgttatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 1202588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15720140 - 15720068
Alignment:
Q  267 attatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 340  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  15720140 attaagtgaattagataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 15720068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16091934 - 16091827
Alignment:
Q  235 tgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgaga 334  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || || |||||||| |||||| |||||||||| | || |    
T  16091934 tgttgttaataatgttacatatttgtatacgcattatgtggattatatatgatgattaag-tgttg-ttgattatcatttgatattattatatttggata 16091837  T
Q  335 tgtttatgtg 344  Q
    |||| |||||    
T  16091836 tgttaatgtg 16091827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38828409 - 38828298
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 329  Q
    |||||||||||| | | ||| || ||||| | |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  38828409 ttgatgttgttaatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattattatatct 38828312  T
Q  330 tgagatgtttatgt 343  Q
    |||||||| |||||    
T  38828311 tgagatgtctatgt 38828298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18203965 - 18203887
Alignment:
Q  259 gtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttt 339  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18203965 gtatatgcattgtgtggattatatatgatgattaagt-gttg-ttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 18203887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 344
Target Start/End: Original strand, 833315 - 833412
Alignment:
Q  246 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  833315 atgtggtatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 833412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 344
Target Start/End: Original strand, 1198495 - 1198592
Alignment:
Q  246 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1198495 atgtggtatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 1198592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13647522 - 13647456
Alignment:
Q  215 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13647522 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13647456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 15081918 - 15081984
Alignment:
Q  215 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15081918 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 15081984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Original strand, 2280053 - 2280110
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  2280053 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatata 2280110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8940383 - 8940312
Alignment:
Q  278 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8940383 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 8940312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 17061895 - 17061950
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17061895 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 17061950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18279418 - 18279370
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18279418 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcct 18279370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18283381 - 18283333
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18283381 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcct 18283333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 19486678 - 19486734
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  19486678 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatat 19486734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 456505 - 456448
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  456505 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 456448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 330
Target Start/End: Original strand, 10896687 - 10896748
Alignment:
Q  268 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 330  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  10896687 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 10896748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 11393265 - 11393322
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11393265 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 11393322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11972680 - 11972623
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11972680 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 11972623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 14949100 - 14949157
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  14949100 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 14949157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15167346 - 15167285
Alignment:
Q  268 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 330  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  15167346 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 15167285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 15376691 - 15376748
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15376691 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 15376748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16232704 - 16232647
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16232704 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 16232647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18430896 - 18430839
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18430896 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18430839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 20385101 - 20385158
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20385101 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20385158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 21189573 - 21189630
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  21189573 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 21189630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24702422 - 24702365
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24702422 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24702365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24704869 - 24704812
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24704869 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24704812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27217044 - 27216987
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  27217044 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 27216987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32125675 - 32125618
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  32125675 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 32125618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41523101 - 41523044
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  41523101 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 41523044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41525563 - 41525506
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  41525563 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 41525506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33122 - 33074
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33122 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 33074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 70856 - 70904
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  70856 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 70904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 74965 - 75013
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  74965 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 75013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8468828 - 8468780
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8468828 ttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcct 8468780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255782
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatata 12255782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 12704750 - 12704798
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12704750 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 12704798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12714879 - 12714831
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12714879 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 12714831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12718683 - 12718635
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12718683 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 12718635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12723594 - 12723546
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12723594 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 12723546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 270
Target Start/End: Original strand, 12756651 - 12756694
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 270  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  12756651 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcatta 12756694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 14270036 - 14270084
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14270036 ttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcct 14270084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 16907292 - 16907340
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16907292 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 16907340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39722281 - 39722233
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  39722281 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 39722233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 44116691 - 44116636
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  44116691 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatat 44116636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 45170097 - 45170145
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  45170097 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 45170145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1126 - 1001
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1126 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattctta 1027  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1026 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 1001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 142769 - 142644
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  142769 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 142670  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  142669 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 142644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 244 - 350
Target Start/End: Original strand, 169702 - 169807
Alignment:
Q  244 taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgt 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||    
T  169702 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 169800  T
Q  344 gttgcct 350  Q
    | |||||    
T  169801 gctgcct 169807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 64)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 17438150 - 17438275
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17438150 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 17438249  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17438250 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 17438275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 5083087 - 5083212
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5083087 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatccttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 5083186  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  5083187 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 5083212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 17086087 - 17086211
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||    
T  17086087 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttgatg-ttgattattatttggtattgtta 17086185  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  17086186 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 17086211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37515890 - 37515768
Alignment:
Q  227 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattata 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||    
T  37515890 tgatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttata 37515792  T
Q  327 tcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||| ||||||||||| |||||    
T  37515791 tcttgatatgtttatgtgctgcct 37515768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23667996 - 23667872
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||| |||    
T  23667996 tatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgtttaagttgatgttaaaatattatttgatattgtta 23667897  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcc 349  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||    
T  23667896 tatcttgagatggttatgtgctgcc 23667872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18833749 - 18833625
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattatt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||    
T  18833749 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatgtgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatg-ttgtttattatttgatattgtt 18833651  T
Q  324 atatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18833650 atatc-tgagatgtttatgtgctgcct 18833625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 345
Target Start/End: Original strand, 25363136 - 25363255
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  25363136 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 25363234  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgt 345  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  25363235 tatcttgagatgtttacgtgt 25363255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 346
Target Start/End: Original strand, 17460986 - 17461106
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  17460986 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 17461084  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgtt 346  Q
    |||||  |||||||||||||||    
T  17461085 tatctctagatgtttatgtgtt 17461106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 20502035 - 20502159
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| |||| |||||| ||| |||    
T  20502035 tatgatttgatgttgttagtaatatgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgttg-ttggttatcatttgatattgtta 20502133  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||    
T  20502134 tatcttgagatatttatgtgctgcct 20502159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 346
Target Start/End: Original strand, 22237953 - 22238073
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  22237953 tatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 22238051  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgtt 346  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  22238052 tatcttgagatgtttacgtgtt 22238073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23659594 - 23659470
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  23659594 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 23659496  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||    
T  23659495 tatctcaagatgtttatgtgatgcct 23659470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Original strand, 19808296 - 19808410
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  19808296 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 19808394  T
Q  325 tatcttgagatgttta 340  Q
    ||||||||||||||||    
T  19808395 tatcttgagatgttta 19808410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 344
Target Start/End: Original strand, 23943927 - 23944045
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| | |||| |||||||    
T  23943927 tatgatttgatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatattatta 23944025  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    ||||| || ||||| |||||    
T  23944026 tatctggatatgttaatgtg 23944045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 327
Target Start/End: Original strand, 25484173 - 25484274
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||    
T  25484173 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttgatgttatta 25484271  T
Q  325 tat 327  Q
    |||    
T  25484272 tat 25484274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 14397796 - 14397920
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| | |||| ||| |||    
T  14397796 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgctg-ttgattatcaattgatattgtta 14397894  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  14397895 tatcttgagatgtttacgtgtcgcct 14397920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 343
Target Start/End: Original strand, 22963351 - 22963464
Alignment:
Q  230 tttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 329  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  22963351 tttgatgttgttggtaatgtgatataattgtatatgcattgtgtgaattataaaatatgttaaagttgatgttgaattattatttgatattgttatatct 22963450  T
Q  330 tgagatgtttatgt 343  Q
    ||||||||||||||    
T  22963451 tgagatgtttatgt 22963464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 344
Target Start/End: Original strand, 22253099 - 22253217
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||| |||    
T  22253099 tatgatttgatgttcttagtaatgtgataaagttatatatgcattatgtggatcacataagatgtttaagttgatg-ttaattatcatttgatattgtta 22253197  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  22253198 tatcttgagatgtatatgtg 22253217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 226 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16799673 - 16799561
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  16799673 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaaatatataagatgttttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 16799575  T
Q  325 tatcttgagatgtt 338  Q
    ||||| || |||||    
T  16799574 tatctggatatgtt 16799561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22996029 - 22995927
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    |||||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||    
T  22996029 atgatttgatgttaaaaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 22995931  T
Q  326 atct 329  Q
    ||||    
T  22995930 atct 22995927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 27941588 - 27941651
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27941588 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatatgagatg 27941651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 339
Target Start/End: Original strand, 19154819 - 19154932
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||  | |||| |||||||    
T  19154819 tatgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattagcacttgatattatta 19154917  T
Q  325 tatcttgagatgttt 339  Q
    ||||| || ||||||    
T  19154918 tatctggatatgttt 19154932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28397735 - 28397635
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| || || ||| |||    
T  28397735 atgatttaatgttgttaataatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatg-ttgattattcttggatattgtta 28397638  T
Q  325 tat 327  Q
    |||    
T  28397637 tat 28397635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37116535 - 37116473
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  37116535 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatg 37116473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 297
Target Start/End: Original strand, 21346166 - 21346239
Alignment:
Q  225 tatgatttgat-gttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttg 297  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21346166 tatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttg 21346239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 339
Target Start/End: Original strand, 20533352 - 20533455
Alignment:
Q  235 tgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgaga 334  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || | |||| |||||||||||| || |    
T  20533352 tgttgatagtaatgtaatataattgtatatgcattttgtgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgatcatcacttgatattattatatctggata 20533450  T
Q  335 tgttt 339  Q
    |||||    
T  20533451 tgttt 20533455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 288
Target Start/End: Original strand, 2418808 - 2418870
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2418808 atgatttgatgttgttaacaatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattatatatgatg 2418870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 288
Target Start/End: Original strand, 35026797 - 35026859
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35026797 atgatttgatgttgttaataatgtgatatgattttatatgcattatgtgaattatatatgatg 35026859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 234 - 343
Target Start/End: Original strand, 14103167 - 14103275
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgag 333  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||| ||    
T  14103167 atgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttaag 14103265  T
Q  334 atgtttatgt 343  Q
     |||| ||||    
T  14103266 ttgttaatgt 14103275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 17439439 - 17439502
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  17439439 tatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatg 17439502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23409930 - 23409858
Alignment:
Q  277 ttatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23409930 ttatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 23409858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 13508019 - 13508075
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13508019 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13508075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 13597551 - 13597607
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13597551 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13597607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 267 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23914183 - 23914100
Alignment:
Q  267 attatgtgaatta-tataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23914183 attatgtgaattaatataagatgtttaagttgttgct-gattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgatgcct 23914100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 17266926 - 17266989
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  17266926 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatg 17266989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22364849 - 22364786
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  22364849 tatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 22364786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20498750 - 20498692
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  20498750 tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 20498692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Original strand, 22419349 - 22419403
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 280  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22419349 atgatttaatgttgtcaataatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattat 22419403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41598370 - 41598315
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  41598370 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 41598315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 234 - 353
Target Start/End: Original strand, 13665189 - 13665307
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgag 333  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | | ||| || |||| | |||||| | |||| |||||  ||||| || |||| |  ||||    
T  13665189 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgcggaatatgtatgatgttgaagttg-ttattgtttattcattgacgttgttatgttatgag 13665287  T
Q  334 atgtttatgtgttgcctctg 353  Q
     |||||||||| ||||||||    
T  13665288 ttgtttatgtgctgcctctg 13665307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 234 - 353
Target Start/End: Original strand, 13724464 - 13724582
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgag 333  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | | ||| || |||| | |||||| | |||| |||||  ||||| || |||| |  ||||    
T  13724464 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgcggaatatgtatgatgttgaagttg-ttattgtttattcattgacgttgttatgttatgag 13724562  T
Q  334 atgtttatgtgttgcctctg 353  Q
     |||||||||| ||||||||    
T  13724563 ttgtttatgtgctgcctctg 13724582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22525702 - 22525659
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatt 269  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22525702 atgatttaatgttgttggtaatgtcatatatttgtatatgcatt 22525659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24353208 - 24353145
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||  |||||| |||| ||||    
T  24353208 tatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatg 24353145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 25484244 - 25484310
Alignment:
Q  215 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  25484244 tgatgttgattatgatttgatgttatta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 25484310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1484586 - 1484529
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1484586 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 1484529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4483464 - 4483407
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  4483464 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 4483407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 5853270 - 5853327
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  5853270 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 5853327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 14409422 - 14409479
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  14409422 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 14409479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 15203209 - 15203266
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15203209 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 15203266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19896452 - 19896395
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19896452 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 19896395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 20046173 - 20046230
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20046173 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20046230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20403411 - 20403354
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20403411 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20403354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22001937 - 22001880
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22001937 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 22001880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 24486022 - 24486079
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24486022 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24486079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32810115 - 32810058
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  32810115 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 32810058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 44476814 - 44476753
Alignment:
Q  268 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 330  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  44476814 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 44476753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 44480076 - 44480015
Alignment:
Q  268 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 330  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  44480076 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 44480015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 18862736 - 18862784
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18862736 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 18862784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 19278374 - 19278422
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19278374 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 19278422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21410965 - 21410917
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21410965 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 21410917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21805457 - 21805409
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21805457 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 21805409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 21828105 - 21828153
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21828105 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 21828153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 21972676 - 21972724
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21972676 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 21972724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 21976761 - 21976809
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21976761 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 21976809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43251828 - 43251780
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43251828 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 43251780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 225 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3144 - 3025
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3144 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 3045  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3044 tatcttgagatgtttatgtg 3025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 71)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 19201908 - 19202033
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19201908 tatgatttgaagttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 19202007  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19202008 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 19202033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 229 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21237936 - 21237821
Alignment:
Q  229 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  21237936 atttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgatgaattattatttgatattgttatatc 21237837  T
Q  329 ttgagatgtttatgtg 344  Q
    ||||||||||||||||    
T  21237836 ttgagatgtttatgtg 21237821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9242113 - 9241989
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  9242113 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 9242015  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  9242014 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 9241989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 19662354 - 19662478
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  19662354 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 19662452  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  19662453 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 19662478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34137127 - 34137003
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  34137127 tatgatgtgatgttactagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 34137029  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  34137028 tctcttgagatgtttatgtgttgcct 34137003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 344
Target Start/End: Original strand, 21073426 - 21073544
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  21073426 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatattcattatgtggattatataagatatttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 21073524  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21073525 tatcttgagatgtttatgtg 21073544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 229 - 350
Target Start/End: Original strand, 30643984 - 30644104
Alignment:
Q  229 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  30643984 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagtagat-attgattatcatttgatattgttatatc 30644082  T
Q  329 ttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||| ||||||||| |||||    
T  30644083 ttgagacgtttatgtgctgcct 30644104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Original strand, 18358667 - 18358781
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||    
T  18358667 tatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcaatatgtgaattatataagatgcttaagttgatg-ttgattattatttgatgttgtta 18358765  T
Q  325 tatcttgagatgttta 340  Q
    ||||||||||||||||    
T  18358766 tatcttgagatgttta 18358781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 229 - 350
Target Start/End: Original strand, 6261081 - 6261202
Alignment:
Q  229 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtata-tgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatat 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  6261081 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatattgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatat 6261179  T
Q  328 cttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  6261180 cttgagacgtttatgtgctgcct 6261202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 21081670 - 21081794
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  21081670 tatgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttttta 21081768  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||    
T  21081769 tatctttagatgtttacgtgctgcct 21081794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Original strand, 23069217 - 23069331
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  23069217 tatgatttgatgttgatggcaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 23069315  T
Q  325 tatcttgagatgttta 340  Q
    ||||||||||||||||    
T  23069316 tatcttgagatgttta 23069331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27472606 - 27472492
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  27472606 tatgatttaatgttgatagtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 27472508  T
Q  325 tatcttgagatgttta 340  Q
    ||||||||||||||||    
T  27472507 tatcttgagatgttta 27472492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 235 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31345293 - 31345179
Alignment:
Q  235 tgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgaga 334  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  31345293 tgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgaga 31345195  T
Q  335 tgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||| |||| ||||    
T  31345194 tgtttacgtgtcgcct 31345179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Original strand, 34874146 - 34874260
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  34874146 tatgatttaatgttgaaagtattgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 34874244  T
Q  325 tatcttgagatgttta 340  Q
    ||||||||||||||||    
T  34874245 tatcttgagatgttta 34874260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 316
Target Start/End: Original strand, 22173727 - 22173817
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22173727 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattaagtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttga 22173817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9784867 - 9784744
Alignment:
Q  225 tatgatttgat-gttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatt 323  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| ||| ||  || ||    
T  9784867 tatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttg-ttgattatcattggatgttgtt 9784771  T
Q  324 atatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9784770 atatcttgagatgtttatgtgctgcct 9784744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 241 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23287534 - 23287438
Alignment:
Q  241 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23287534 tagtaatgtgatatatttgtatatgcaatatgtggattatatatgatgattaag-tgttg-ttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 23287438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 234 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26392559 - 26392453
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgag 333  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  26392559 atgttgatagaaaggtgatatatttgtatatgcattatgtggattagataagatgtttaagt--attgttgattattatttgatattgttatatcctgag 26392462  T
Q  334 atgtttatg 342  Q
    |||||||||    
T  26392461 atgtttatg 26392453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 338
Target Start/End: Original strand, 18546883 - 18546991
Alignment:
Q  230 tttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||  |||||||||| ||||||||  ||||| ||| |||| ||    
T  18546883 tttgatgttgttagtaatgtgatacatttgtatatgcattatgtaaattaatgtaagatgtctaagttgatg-ttgattatcctttgatattgttatgtc 18546981  T
Q  329 ttgagatgtt 338  Q
    | || |||||    
T  18546982 tggatatgtt 18546991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 329
Target Start/End: Original strand, 43947306 - 43947408
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgct-taagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| || || ||| |||    
T  43947306 atgatttaatgttgttaataatgtgatata-ttgtatatgcactatgtgaattatatgagatgttgtaagttgatg-ttgattattcttggatattgtta 43947403  T
Q  325 tatct 329  Q
    |||||    
T  43947404 tatct 43947408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 288
Target Start/End: Original strand, 20520127 - 20520189
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  20520127 atgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg 20520189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22703279 - 22703167
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 329  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  22703279 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaaattg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 22703182  T
Q  330 tgagatgtttatgtg 344  Q
    |||||||| ||||||    
T  22703181 tgagatgtctatgtg 22703167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 344
Target Start/End: Original strand, 13101577 - 13101689
Alignment:
Q  232 tgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga-cattattatatct 329  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  13101577 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgataatttttatatct 13101674  T
Q  330 tgagatgtttatgtg 344  Q
    |||||||| ||||||    
T  13101675 tgagatgtctatgtg 13101689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23791462 - 23791404
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  23791462 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 23791404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Original strand, 24529508 - 24529564
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24529508 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatata 24529564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 22173798 - 22173864
Alignment:
Q  215 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22173798 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 22173864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23207465 - 23207410
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  23207465 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 23207410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 24642825 - 24642891
Alignment:
Q  215 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24642825 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24642891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25109076 - 25109013
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  25109076 tatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 25109013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Original strand, 22413070 - 22413124
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 280  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  22413070 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 22413124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24671129 - 24671068
Alignment:
Q  278 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 340  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24671129 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 24671068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 32039476 - 32039533
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  32039476 ttatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 32039533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Original strand, 23707275 - 23707346
Alignment:
Q  278 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23707275 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 23707346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 23708553 - 23708609
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23708553 atgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23708609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 274
Target Start/End: Original strand, 24834804 - 24834844
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 274  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24834804 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtg 24834844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24918244 - 24918173
Alignment:
Q  278 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24918244 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 24918173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671960
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19672010 ttgatgttgtta-taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 19671960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23004937 - 23004874
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||| | ||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23004937 tatgatttaacgttgttaatgatgttaaatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatg 23004874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Original strand, 7666 - 7724
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  7666 tatgatttaatgttgttgttaatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 7724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 571581 - 571524
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  571581 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 571524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6726179 - 6726122
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  6726179 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 6726122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18809127 - 18809070
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18809127 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18809070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 21155038 - 21155095
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  21155038 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 21155095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22105597 - 22105540
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22105597 ttataatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 22105540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23131046 - 23130989
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23131046 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23130989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23133513 - 23133456
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23133513 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23133456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 23709510 - 23709567
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23709510 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23709567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 23711991 - 23712048
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23711991 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23712048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24367958 - 24367901
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24367958 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24367901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Original strand, 24697539 - 24697597
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||    
T  24697539 tatgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtata 24697597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 24898173 - 24898230
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24898173 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24898230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 24900656 - 24900713
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24900656 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24900713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 24903133 - 24903190
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24903133 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24903190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 24905610 - 24905667
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24905610 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24905667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 24908085 - 24908142
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24908085 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24908142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26505563 - 26505506
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  26505563 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 26505506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26508041 - 26507984
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  26508041 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 26507984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28577283 - 28577226
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28577283 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 28577226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 34402500 - 34402557
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  34402500 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 34402557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 39682497 - 39682440
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  39682497 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 39682440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1283404 - 1283356
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1283404 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 1283356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 12901603 - 12901651
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12901603 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 12901651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 24628570 - 24628618
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24628570 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 24628618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24649372 - 24649324
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24649372 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 24649324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24681548 - 24681477
Alignment:
Q  278 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||||  || ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24681548 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgatcatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 24681477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26903483 - 26903443
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 274  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  26903483 atgttgttagtaatgtgatatacttatacatgcattatgtg 26903443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 27379524 - 27379572
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27379524 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 27379572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 27383570 - 27383618
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27383570 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 27383618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27601811 - 27601763
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27601811 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 27601763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 30345082 - 30345130
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30345082 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 30345130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 41531095 - 41531143
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  41531095 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 41531143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 225 - 344
Target Start/End: Original strand, 2604 - 2723
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  2604 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacatggata 2703  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2704 tatcttgagatgtttatgtg 2723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Original strand, 7992 - 8050
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||    
T  7992 tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatata 8050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7617 - 7494
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7617 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 7518  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||    
T  7517 tatctt--gatgtttatgtgctgcct 7494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14736 - 14613
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14736 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 14637  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||    
T  14636 tatctt--gatgtttatgtgctgcct 14613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 225 - 344
Target Start/End: Original strand, 15041895 - 15042014
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15041895 tatgatttgatgttcttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattgata 15041994  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  15041995 tatcttaagatgtttatgtg 15042014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 225 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15112529 - 15112410
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15112529 tatgatttgatgtttttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattgata 15112430  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  15112429 tatcttaagatgtttatgtg 15112410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18212919 - 18212795
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  18212919 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 18212821  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  18212820 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 18212795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 24047233 - 24047357
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  24047233 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 24047331  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||    
T  24047332 tatcttaagatgtttatgtgctgcct 24047357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 225 - 349
Target Start/End: Original strand, 14852809 - 14852933
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||| |||    
T  14852809 tatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtta 14852908  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcc 349  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  14852909 tatcttgagatgtttatgtgctgcc 14852933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 225 - 349
Target Start/End: Original strand, 32306929 - 32307052
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||    
T  32306929 tatggtttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattattatttaatattgtta 32307027  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcc 349  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  32307028 tatcttgagatgtttatgtgctgcc 32307052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 227 - 350
Target Start/End: Original strand, 13591862 - 13591984
Alignment:
Q  227 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattata 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||    
T  13591862 tgatttaatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttata 13591960  T
Q  327 tcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    | |||||||||||||||| |||||    
T  13591961 ttttgagatgtttatgtgctgcct 13591984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10056825 - 10056701
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  10056825 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 10056727  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  10056726 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 10056701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16043198 - 16043087
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||    
T  16043198 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 16043100  T
Q  326 atcttgagatgtt 338  Q
    |||||||||||||    
T  16043099 atcttgagatgtt 16043087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 17048068 - 17048192
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  17048068 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtacatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 17048166  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  17048167 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 17048192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 26050409 - 26050532
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || |||||| | |||||| ||| |||    
T  26050409 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttg-ttgattttcatttgatattgtta 26050506  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||    
T  26050507 tatcttgagatgtttttgtgctgcct 26050532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 230 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40907253 - 40907134
Alignment:
Q  230 tttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 329  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  40907253 tttgatgttgttaatgatgtgaaatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatg-ttgattatcatttgatatttttatatct 40907155  T
Q  330 tgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40907154 tgagatgtttatgtgttgcct 40907134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17333467 - 17333352
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaa--gttgatgattgattattatttgacattat 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||| ||||| |||||||||||| ||| |    
T  17333467 tatgatttaatgttgttagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgattaagtgttgttgatt-attattatttgatattgt 17333369  T
Q  323 tatatcttgagatgttt 339  Q
    |||||||||||||||||    
T  17333368 tatatcttgagatgttt 17333352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 316
Target Start/End: Original strand, 51463766 - 51463856
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  51463766 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttga 51463856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 314
Target Start/End: Original strand, 23803163 - 23803251
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattattt 314  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  23803163 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgattt 23803251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 40907094 - 40906983
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  40907094 ttgatgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcatgatgtggattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatctt 40906997  T
Q  331 gagatgtttatgtg 344  Q
    ||||||||||||||    
T  40906996 gagatgtttatgtg 40906983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15791960 - 15791857
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  |||||  ||||| ||| ||||    
T  15791960 atgatttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatacaagatgtttaagttgatgttgaattatcctttgatattgttat 15791861  T
Q  326 atct 329  Q
    ||||    
T  15791860 atct 15791857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26789521 - 26789440
Alignment:
Q  229 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgcttaagttgatgattgattatt 310  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26789521 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatg-ttgattatt 26789440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 316
Target Start/End: Original strand, 630602 - 630692
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  630602 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttaaagttgatg-ttgattatgatttga 630692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14825653 - 14825551
Alignment:
Q  227 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||    
T  14825653 tgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatg-ttgattattcttggatattgttat 14825555  T
Q  326 atct 329  Q
    ||||    
T  14825554 atct 14825551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12611204 - 12611117
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12611204 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatt---tgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttga 12611117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Original strand, 4831475 - 4831587
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 329  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  4831475 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 4831572  T
Q  330 tgagatgtttatgtg 344  Q
    |||||||| ||||||    
T  4831573 tgagatgtctatgtg 4831587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Original strand, 4834770 - 4834882
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 329  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  4834770 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 4834867  T
Q  330 tgagatgtttatgtg 344  Q
    |||||||| ||||||    
T  4834868 tgagatgtctatgtg 4834882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14047820 - 14047708
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 329  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  14047820 ttgatattgttaatgatgtggtatattcgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 14047723  T
Q  330 tgagatgtttatgtg 344  Q
    |||||||| ||||||    
T  14047722 tgagatgtctatgtg 14047708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30146567 - 30146453
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 329  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||| | |||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  30146567 ttgatattgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattaagtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 30146470  T
Q  330 tgagatgtttatgtgtt 346  Q
    |||||||| ||||||||    
T  30146469 tgagatgtctatgtgtt 30146453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 53082085 - 53082148
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  53082085 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 53082148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 283
Target Start/End: Original strand, 13780 - 13842
Alignment:
Q  221 tgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  13780 tgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 13842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 46640389 - 46640452
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  46640389 tatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 46640452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 51463837 - 51463903
Alignment:
Q  215 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  51463837 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattatttgaattatat 51463903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 18215252 - 18215309
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18215252 ttatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18215309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 350
Target Start/End: Original strand, 26045268 - 26045351
Alignment:
Q  265 gcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| | || |||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26045268 gcattatgtggattatataagatgtttaagt-gttg-ttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttttgtgctgcct 26045351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Original strand, 52243128 - 52243185
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||    
T  52243128 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatata 52243185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12611136 - 12611070
Alignment:
Q  215 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  12611136 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 12611070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 279 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14185112 - 14185042
Alignment:
Q  279 atataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14185112 atatgagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgatgttatatcttgagacgtttatgtgttgcct 14185042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 1837487 - 1837544
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||    
T  1837487 ttattatttgatgttgtta-taatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatat 1837544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 7641170 - 7641227
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7641170 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 7641227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Original strand, 14746570 - 14746631
Alignment:
Q  278 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 340  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  14746570 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 14746631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 15118330 - 15118387
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15118330 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 15118387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 15355302 - 15355359
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15355302 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 15355359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Original strand, 43198486 - 43198544
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  43198486 tatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 43198544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 44615472 - 44615415
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44615472 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 44615415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 52312694 - 52312637
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  52312694 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 52312637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 4561425 - 4561473
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4561425 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 4561473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 5757029 - 5757077
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5757029 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 5757077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9556545 - 9556497
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9556545 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 9556497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10712871 - 10712823
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10712871 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 10712823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10926641 - 10926593
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10926641 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 10926593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12487726 - 12487678
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12487726 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 12487678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 14757513 - 14757561
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14757513 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 14757561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 14954258 - 14954306
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14954258 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 14954306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15365248 - 15365208
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 274  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  15365248 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgaattatgtg 15365208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15367876 - 15367821
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  15367876 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatat 15367821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15371388 - 15371333
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  15371388 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatat 15371333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15373669 - 15373614
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  15373669 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatat 15373614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15402889 - 15402834
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  15402889 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatat 15402834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25689885 - 25689837
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25689885 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 25689837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27534041 - 27533993
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27534041 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 27533993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27996090 - 27996050
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 274  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  27996090 atgttgttagtaatgtgatacaattatatatgcattatgtg 27996050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 44102396 - 44102341
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44102396 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 44102341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 280
Target Start/End: Original strand, 44773065 - 44773120
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 280  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  44773065 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 44773120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 44928858 - 44928914
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44928858 atgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 44928914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 7422 - 7547
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7422 tatgattatatgctgttagtaatgtgatatatttgtgtatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgata 7521  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  7522 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 7547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2081 - 1957
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  2081 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 1983  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  1982 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 1957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 110840 - 110716
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  110840 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 110742  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  110741 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 110716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23838361 - 23838237
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  23838361 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 23838263  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  23838262 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 23838237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 229 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4477007 - 4476887
Alignment:
Q  229 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  4477007 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatc 4476909  T
Q  329 ttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  4476908 ttgagatgtttatgtgctgcct 4476887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18453369 - 18453245
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  18453369 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgattttgtta 18453271  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  18453270 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 18453245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Original strand, 15817455 - 15817569
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||| |||    
T  15817455 tatgatttgatgttgttagtaatgtggtatatttgaatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttaattatcatttgatattgtta 15817553  T
Q  325 tatcttgagatgttta 340  Q
    ||||||||||||||||    
T  15817554 tatcttgagatgttta 15817569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Original strand, 19773476 - 19773590
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||| ||| |||    
T  19773476 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg-ttcttgattatcatttgatattgtta 19773574  T
Q  325 tatcttgagatgttta 340  Q
    ||||||||||||||||    
T  19773575 tatcttgagatgttta 19773590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 14979321 - 14979445
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  14979321 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 14979419  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||  ||||||||| ||| |||||    
T  14979420 tatctcaagatgtttaagtgatgcct 14979445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23415071 - 23414947
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  23415071 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 23414973  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  23414972 tatcttgagatgtttacgtgtcgcct 23414947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 28103832 - 28103956
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  28103832 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattatataagttgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 28103930  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||    
T  28103931 taccttgagatgtttacgtgctgcct 28103956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33443232 - 33443122
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    ||||||||||||||| ||| |||    
T  33443232 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttg----ttgattattatttgatattgtta 33443137  T
Q  325 tatcttgagatgttt 339  Q
    |||||||||||||||    
T  33443136 tatcttgagatgttt 33443122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Original strand, 15705377 - 15705491
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||| |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  15705377 tatggtttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtttatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 15705475  T
Q  325 tatcttgagatgttta 340  Q
    ||||||||||||||||    
T  15705476 tatcttgagatgttta 15705491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20136855 - 20136733
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||    
T  20136855 atgatttgatgttgttagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 20136758  T
Q  326 atcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||    
T  20136757 atcttgagatgtttacgtgctgcct 20136733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 350
Target Start/End: Original strand, 22196014 - 22196136
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||    
T  22196014 atgatttgatgttgttagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 22196111  T
Q  326 atcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||    
T  22196112 atcttgagatgtttacgtgctgcct 22196136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 316
Target Start/End: Original strand, 20556792 - 20556882
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20556792 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttga 20556882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Original strand, 25619656 - 25619770
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  25619656 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatttttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 25619754  T
Q  325 tatcttgagatgttta 340  Q
    |||||  |||||||||    
T  25619755 tatctcaagatgttta 25619770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22806118 - 22805995
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  22806118 tatgatttaatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 22806021  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||    
T  22806020 tatcttgtgatgtttacgtgctgcct 22805995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23076918 - 23076806
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| | |||| ||||||||    
T  23076918 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatattattat 23076820  T
Q  326 atcttgagatgttt 339  Q
    |||| || ||||||    
T  23076819 atctggatatgttt 23076806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25755073 - 25754983
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25755073 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattttataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttga 25754983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27556829 - 27556705
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| || ||||||  || |||    
T  27556829 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgatcatcatttgatgttgtta 27556731  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  27556730 tatattgagatgtttacgtgtcgcct 27556705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16493335 - 16493216
Alignment:
Q  223 tttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattat 322  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |  | |||||||||   || |    
T  16493335 tttatgaattgaggttgttagtaatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgt 16493237  T
Q  323 tatatcttgagatgtttatgt 343  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  16493236 tctatcttgagatgtttatgt 16493216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 339
Target Start/End: Original strand, 18177606 - 18177719
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaag-ttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  18177606 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatg-ttgattatcatttgatattgtta 18177704  T
Q  325 tatcttgagatgttt 339  Q
    |||| |||| |||||    
T  18177705 tatcatgagttgttt 18177719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 339
Target Start/End: Original strand, 18199350 - 18199463
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaag-ttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  18199350 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatg-ttgattatcatttgatattgtta 18199448  T
Q  325 tatcttgagatgttt 339  Q
    |||| |||| |||||    
T  18199449 tatcatgagttgttt 18199463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18204265 - 18204152
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaag-ttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  18204265 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatg-ttgattatcatttgatattgtta 18204167  T
Q  325 tatcttgagatgttt 339  Q
    |||| |||| |||||    
T  18204166 tatcatgagttgttt 18204152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 297
Target Start/End: Original strand, 18896252 - 18896321
Alignment:
Q  228 gatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttg 297  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18896252 gatttaatgttgttagtaatgggatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 18896321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 35008336 - 35008224
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||| | |||| ||||||||    
T  35008336 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttg-tttttgattatcacttgatattattat 35008238  T
Q  326 atcttgagatgttt 339  Q
    |||| || ||||||    
T  35008237 atctggatatgttt 35008224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20224129 - 20224018
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| | |||| ||||||||    
T  20224129 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatattattat 20224031  T
Q  326 atcttgagatgtt 338  Q
    |||| || |||||    
T  20224030 atctggatatgtt 20224018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22118113 - 22118002
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| | |||| ||||||||    
T  22118113 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatattattat 22118015  T
Q  326 atcttgagatgtt 338  Q
    |||| || |||||    
T  22118014 atctggatatgtt 22118002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23539155 - 23539032
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||| |||||  || ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| || ||||| |||||| ||| ||||    
T  23539155 atgatttaatgttaataataaggtgatatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatg-ttaattatcatttgatattgttat 23539057  T
Q  326 atcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||| |||||| |||||    
T  23539056 atcttgagatgtatatgtgctgcct 23539032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25752903 - 25752840
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25752903 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 25752840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 241 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20182962 - 20182856
Alignment:
Q  241 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 340  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||| |||||||| || || ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20182962 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttg-ttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 20182866  T
Q  341 tgtgttgcct 350  Q
    |||| |||||    
T  20182865 tgtgctgcct 20182856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 241 - 350
Target Start/End: Original strand, 22153029 - 22153135
Alignment:
Q  241 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 340  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||| |||||||| || || ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22153029 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttg-ttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 22153125  T
Q  341 tgtgttgcct 350  Q
    |||| |||||    
T  22153126 tgtgctgcct 22153135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 226 - 300
Target Start/End: Original strand, 23528041 - 23528115
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatg 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  23528041 atgatttgatgttgatagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagtcgatg 23528115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19362611 - 19362540
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  19362611 atgatttaatgttgttagtaatgtgatataattttatatgcattatgtgaattatttaagatgttcaagttg 19362540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23538996 - 23538884
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |||||| | |||||| ||| ||||    
T  23538996 atgaattgatgttgttgttaatgtgatatagttgtatatgcgttatgtgaatgatatatgatgtttaggttgatg-ttgattgtcatttgatattgttat 23538898  T
Q  326 atcttgagatgttt 339  Q
    ||| |||| |||||    
T  23538897 atcatgagctgttt 23538884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 232 - 344
Target Start/End: Original strand, 29416845 - 29416956
Alignment:
Q  232 tgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 330  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || || ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  29416845 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttaattatcatttgatattgttatatctt 29416942  T
Q  331 gagatgtttatgtg 344  Q
    ||||||| ||||||    
T  29416943 gagatgtctatgtg 29416956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18706492 - 18706423
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaag 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  18706492 tatgatttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaag 18706423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 8227445 - 8227501
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8227445 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 8227501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 19847929 - 19847984
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19847929 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 19847984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18696674 - 18696611
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  18696674 tatgatttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 18696611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 20556863 - 20556929
Alignment:
Q  215 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20556863 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20556929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17105918 - 17105864
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 280  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17105918 atgaattgatgttgttaataacgtgatatagttgtatatgaattatgtgaattat 17105864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15896114 - 15896074
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 274  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15896114 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtg 15896074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18456901 - 18456846
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18456901 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18456846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22782411 - 22782356
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 280  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  22782411 ttatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 22782356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25755002 - 25754936
Alignment:
Q  215 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  25755002 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 25754936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 2291158 - 2291215
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  2291158 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 2291215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8055213 - 8055156
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8055213 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 8055156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12742501 - 12742444
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12742501 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 12742444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 18334570 - 18334627
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18334570 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18334627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19005230 - 19005173
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19005230 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 19005173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24422731 - 24422674
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24422731 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24422674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25738561 - 25738450
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 330  Q
    |||||||||||| |  | || |||||||| | |||||||||||| |||||  | |||| |||||||||   |||||||||| |||| ||| | |||||||    
T  25738561 ttgatgttgttaatgctatggtatatttgcaaatgcattatgtggattatgaatgatgtttaagttgag--ttgattattaattgatattgtcatatctt 25738464  T
Q  331 gagatgtttatgtg 344  Q
    ||||||| ||||||    
T  25738463 gagatgtctatgtg 25738450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 26924618 - 26924675
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  26924618 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 26924675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33861978 - 33861921
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  33861978 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 33861921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33864462 - 33864405
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  33864462 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 33864405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 282
Target Start/End: Original strand, 19858902 - 19858954
Alignment:
Q  229 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19858902 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 19858954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25644508 - 25644451
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  25644508 atgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatata 25644451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11566877 - 11566829
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11566877 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 11566829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14472286 - 14472238
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14472286 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 14472238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16760310 - 16760262
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16760310 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 16760262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 18917357 - 18917405
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18917357 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 18917405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 18955854 - 18955902
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18955854 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 18955902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 274
Target Start/End: Original strand, 19656075 - 19656115
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 274  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  19656075 atgttgttagtaatgtgatatacttatacatgcattatgtg 19656115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19870605 - 19870557
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19870605 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 19870557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22862961 - 22862913
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22862961 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 22862913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22949123 - 22949075
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22949123 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 22949075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22953079 - 22953031
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22953079 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 22953031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23395083 - 23395035
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23395083 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 23395035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23871567 - 23871519
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23871567 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 23871519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23875523 - 23875475
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23875523 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 23875475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23989935 - 23989887
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23989935 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 23989887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 225 - 349
Target Start/End: Original strand, 55618 - 55742
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||| |||    
T  55618 tatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtta 55717  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcc 349  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  55718 tatcttgagatgtttatgtgctgcc 55742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36367 - 36243
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||| ||| |||    
T  36367 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg-tcgttgattatcatttgatattgtta 36269  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  36268 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 36243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 10018 - 10142
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  10018 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagatgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 10116  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  10117 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 10142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 834 - 710
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |   | | |    
T  834 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattattatttcatgatgtga 736  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  735 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Original strand, 60649 - 60706
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  60649 atgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatata 60706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 229 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 600 - 490
Alignment:
Q  229 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||| ||| |||||||    
T  600 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatg-ttaattatcatttgatattgttatatc 502  T
Q  329 ttgagatgttta 340  Q
    ||||||||||||    
T  501 ttgagatgttta 490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8218 - 8096
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  8218 tatgatttgatgtcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 8120  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgc 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8119 tatcttgagatgtttatgtgttgc 8096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 133103 - 132985
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  133103 tatgatttgatgttgttagtaataagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 133005  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  133004 tatcttgaaatgtttatgtg 132985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 29388 - 29325
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29388 tatgatttactgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaagtatttaagatg 29325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17689 - 17572
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  17689 tatgatttgaagttgttggtaatgtgatatagttgtatatgccttatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 17591  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgt 343  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17590 tatcttgagatgtttatgt 17572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 20144 - 20268
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||  |||||| ||| |||    
T  20144 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttttatatgcactatgtgaattatatataatgtttaagttgttg-ttgattagcatttgatattgtta 20242  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||    
T  20243 aatcttgagatgtttacgtgtcgcct 20268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 6093 - 6217
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || |||    
T  6093 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgtta 6191  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  6192 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 6217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10344 - 10232
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 330  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  10344 ttgatgttgttagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatga-tgattattatttgatattgttacatctt 10246  T
Q  331 gagatgtttatgtg 344  Q
    ||||||||||||||    
T  10245 gagatgtttatgtg 10232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 18101 - 18225
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||| |||    
T  18101 tatgatttgatattgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-tttattatcatttgatattgtta 18199  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18200 tatcttgagatatttatgtgctgcct 18225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21353 - 21229
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  21353 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 21255  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  21254 tatcttgagatgtttatgtgctgcct 21229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 24531 - 24655
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  24531 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 24629  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||    
T  24630 tatcttgaaatgtttaagtgttgcct 24655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 105267 - 105143
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||| ||| |||    
T  105267 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattttttgaattatataagatgtttaatttgatg-ttaattatcatttgatattgtta 105169  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  105168 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 105143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 94595 - 94538
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  94595 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 94538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 126142 - 126018
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  126142 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 126044  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  126043 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 126018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 349
Target Start/End: Original strand, 29357 - 29481
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||| |||    
T  29357 tatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgcatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtta 29456  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcc 349  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||    
T  29457 tatcttgagaagtttatgtgctgcc 29481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 350
Target Start/End: Original strand, 696 - 818
Alignment:
Q  227 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattata 326  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||| ||| |||||    
T  696 tgatctgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcttttgatattgttata 794  T
Q  327 tcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||| || |||||    
T  795 tcttgagatgtttatatgctgcct 818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 350
Target Start/End: Original strand, 221143 - 221264
Alignment:
Q  227 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattata 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||    
T  221143 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataaga-ctttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttata 221240  T
Q  327 tcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  221241 tcttgagatgtttatgtgctgcct 221264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 225593 - 225536
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  225593 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 225536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 189468 - 189516
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  189468 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 189516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4055 - 3930
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattatt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||  | | ||    
T  4055 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatg-ttgattatcatttggtaatgtt 3957  T
Q  324 atatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3956 atatcttgagatgtttatgtgctgcct 3930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 346 - 222
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  346 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatttgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 248  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||    
T  247 tatcttgatatgtttacgtgttgcct 222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20937 - 20813
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  20937 tatgatttgatgttaatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 20839  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  20838 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 20813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 234 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15920 - 15809
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgag 333  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||    
T  15920 atgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgag 15822  T
Q  334 atgtttatgtgtt 346  Q
    ||||||| |||||    
T  15821 atgtttacgtgtt 15809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1039 - 921
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  1039 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttatatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 941  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  940 tatcttgagatgtttatgtg 921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 9655 - 9778
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  9655 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattgtatggattatataagatgtttaag-tgatg-ttgattatcatttgatattgtta 9752  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||    
T  9753 tatcttgagatgtctatgtgctgcct 9778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 1808 - 1932
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||   | |||    
T  1808 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgatgtta 1906  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  1907 tatcttgagatgtttacgtgctgcct 1932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39439 - 39315
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  39439 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 39341  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  39340 tatcttgagatgtttacgtgtcgcct 39315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 226 - 350
Target Start/End: Original strand, 75763 - 75886
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||    
T  75763 atgatttgatgttgttagtaatgtgataaaattgtatttgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 75861  T
Q  326 atcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||    
T  75862 atcttgagatgtttacgtgctgcct 75886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 226 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 209 - 101
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||    
T  209 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgatga-tgtttatcatttgatattgttat 111  T
Q  326 atcttgagat 335  Q
    ||||||||||    
T  110 atcttgagat 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41 - 1
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgc 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17760 - 17636
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  17760 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgaattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 17662  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  17661 tatcttgagatgtttacgtgtcgcct 17636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31310 - 31186
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| |||||| ||| |||    
T  31310 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-tttattatcatttgatattgtta 31212  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  31211 tatcttgagatgtttacgtgtcgcct 31186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6798 - 6684
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  6798 tatgatttgaggttgatggtaatgtaatatatttgtatatgtagtatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 6700  T
Q  325 tatcttgagatgttta 340  Q
    ||||||||||||||||    
T  6699 tatcttgagatgttta 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 227 - 344
Target Start/End: Original strand, 19582 - 19698
Alignment:
Q  227 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga-tgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  19582 tgatttgatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagattttttaagttgatg-ttgattattgtttgacattgttat 19680  T
Q  326 atcttgagatgtttatgtg 344  Q
    || ||||||||||| ||||    
T  19681 at-ttgagatgtttctgtg 19698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Original strand, 15225 - 15296
Alignment:
Q  278 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15225 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 15296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 120192 - 120071
Alignment:
Q  228 gatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatat 327  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  120192 gatttgatgttgatgataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaactatatcagatgtttaagtt-attgttgattatcatttgatattgttatat 120094  T
Q  328 cttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  120093 cttgagatgtttacgtgttgcct 120071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 339
Target Start/End: Original strand, 206459 - 206570
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| ||||    
T  206459 atgatttaatattgttagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatacaagatgattaag-tgttg-ttgattattatttgatattgttat 206556  T
Q  326 atcttgagatgttt 339  Q
    ||||||||||||||    
T  206557 atcttgagatgttt 206570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 370 - 280
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  370 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagctgatg-ttgattatgatttga 280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 299 - 233
Alignment:
Q  215 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  299 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 214 - 124
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  214 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg-ttgattatgatttga 124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 67447 - 67342
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  67447 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattgtataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 67349  T
Q  325 tatcttg 331  Q
    |||||||    
T  67348 tatcttg 67342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 234 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11323 - 11209
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgag 333  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||    
T  11323 atgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatttggattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatcctgag 11226  T
Q  334 atgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||| |||||    
T  11225 atgtttatgtgctgcct 11209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 234 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22423 - 22309
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgag 333  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||    
T  22423 atgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatatggattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatcctgag 22326  T
Q  334 atgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22325 atgtttatgtgctgcct 22309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 2426 - 2489
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2426 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 2489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12322 - 12232
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 316  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  12322 tatggtttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgatg-ttgattatgatttga 12232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12251 - 12185
Alignment:
Q  215 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12251 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 12185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 350
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15123
Alignment:
Q  256 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15030 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 15123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 347
Target Start/End: Original strand, 4630 - 4751
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 324  Q
    |||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||    
T  4630 tatgatttaatgatgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttgaaatgtttaagttgttga-tgattatcatatgatattatta 4728  T
Q  325 tatcttgagatgtttatgtgttg 347  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  4729 tatctggatatgttaatgtgttg 4751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 314
Target Start/End: Original strand, 3265 - 3349
Alignment:
Q  229 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattattt 314  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  3265 atttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatg-ttgattatcattt 3349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8000 - 7897
Alignment:
Q  246 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtg 344  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8000 atgtaatatatttgtgtatggattatgtgaattatataagatgttttaagttgatg-ttgcttattatttgatattgttatatc-tgagatgtttatgtg 7903  T
Q  345 ttgcct 350  Q
    ||||||    
T  7902 ttgcct 7897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1884 - 1785
Alignment:
Q  230 tttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 328  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||    
T  1884 tttgatgttgttaatgatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattattataaggagtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatc 1786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10651 - 10536
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgag 333  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||| |||| |||    
T  10651 atgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttacatctagag 10553  T
Q  334 atgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||||||||||||    
T  10552 atgtttatgtgttgcct 10536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 229 - 297
Target Start/End: Original strand, 26016 - 26084
Alignment:
Q  229 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttg 297  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26016 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttg 26084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 297
Target Start/End: Original strand, 16861 - 16924
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttg 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16861 atgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttg 16924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22463 - 22361
Alignment:
Q  227 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||    
T  22463 tgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatg-ttgattattcttggatattgttat 22365  T
Q  326 atct 329  Q
    ||||    
T  22364 atct 22361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Original strand, 14056 - 14158
Alignment:
Q  227 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattattat 325  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||    
T  14056 tgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatg-ttgattattcttggatattgttat 14154  T
Q  326 atct 329  Q
    ||||    
T  14155 atct 14158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 267848 - 267785
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  267848 tatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 267785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 82340 - 82246
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcat----tatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  82340 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttga 82246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 80426 - 80474
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  80426 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcct 80474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 82265 - 82199
Alignment:
Q  215 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  82265 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 82199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 244 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 85713 - 85608
Alignment:
Q  244 taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgt 343  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||| |||||| ||    
T  85713 taatgtgatataatcgtatacgcattacatgaattatatatgatgcttaagttgatg-ttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagt 85615  T
Q  344 gttgcct 350  Q
    | |||||    
T  85614 gctgcct 85608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 224 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 332503 - 332380
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatt 323  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |  | ||||| |||| |||  |    
T  332503 ttatgattttatgttgaaagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattataaattatgtttaagttgatgttgaaatatta-ttgatatt-gt 332406  T
Q  324 atatcttgagatgtttatgtgttgcc 349  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  332405 atatcttgagatgttgatgtgctgcc 332380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 297
Target Start/End: Original strand, 2360 - 2432
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttg 297  Q
    |||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2360 tatgatttaatgttgatagtaatttaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttg 2432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6210 - 6116
Alignment:
Q  237 ttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttga 332  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  6210 ttgttaataatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgagga-tgtttatcatttgatattgttatatcttga 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29851 - 29738
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatattt-gtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttga 332  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| ||    
T  29851 atgttgatagtaatgtaatatattttgtatgtgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatctgga 29753  T
Q  333 gatgtttatgtgttg 347  Q
     |||||  |||||||    
T  29752 tatgttattgtgttg 29738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 146366 - 146254
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 329  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  146366 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 146269  T
Q  330 tgagatgtttatgtg 344  Q
    |||||||| ||||||    
T  146268 tgagatgtctatgtg 146254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 97193 - 97131
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  97193 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatg 97131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 106471 - 106409
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  106471 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatg 106409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3781 - 3712
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagt 295  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3781 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgtattatgtggattatataagatgtttaagt 3712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 229 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 57999 - 57931
Alignment:
Q  229 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttg 297  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||    
T  57999 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatttaaaatgttcaagttg 57931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 302
Target Start/End: Original strand, 13432 - 13507
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgat 302  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13432 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtat--gcattatctgaattatataagatgtttaagttgttgat 13507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 48508 - 48396
Alignment:
Q  231 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 329  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  48508 ttgatattgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 48411  T
Q  330 tgagatgtttatgtg 344  Q
    |||||||| ||||||    
T  48410 tgagatgtctatgtg 48396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 288
Target Start/End: Original strand, 128904 - 128966
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||    
T  128904 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatg 128966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 78509 - 78453
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattata 281  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  78509 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 78453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Original strand, 53825 - 53896
Alignment:
Q  278 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  53825 tatatatgatgtttaagtagatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 53896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 234 - 343
Target Start/End: Original strand, 604 - 712
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgag 333  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||| ||    
T  604 atgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttaag 702  T
Q  334 atgtttatgt 343  Q
     |||| ||||    
T  703 ttgttaatgt 712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 6216 - 6279
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  6216 tatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 6279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 724 - 661
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  724 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6379 - 6330
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtga 275  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6379 tatgatttggtgttgttaataatgtgatata-ttgtatatgcattatgtga 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25290 - 25231
Alignment:
Q  228 gatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||    
T  25290 gatttgatgttgtaa-taatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatg 25231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 283
Target Start/End: Original strand, 53478 - 53540
Alignment:
Q  221 tgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  53478 tgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 53540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11651 - 11595
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11651 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 11595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 16034 - 16094
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga 286  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16034 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataaga 16094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13316 - 13259
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 283  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  13316 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 13259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 17961 - 18017
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17961 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Original strand, 2108 - 2161
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 280  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  2108 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 2161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 38190 - 38246
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  38190 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 38246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 38505 - 38442
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  38505 tatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 38442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 18171 - 18234
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  18171 tatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 18234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 1249 - 1315
Alignment:
Q  215 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1249 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 1315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 192 - 130
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  192 atgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9930 - 9877
Alignment:
Q  228 gatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9930 gatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 9877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Original strand, 4256 - 4327
Alignment:
Q  278 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4256 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttgcct 4327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30114 - 30059
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30114 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatat 30059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 79264 - 79319
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  79264 atgatttgatgttgtta-tattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatat 79319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 58810 - 58858
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  58810 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcct 58858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 134395 - 134338
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  134395 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 134338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 136864 - 136807
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  136864 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 136807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 139333 - 139276
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  139333 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 139276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 141802 - 141745
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  141802 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 141745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 144271 - 144214
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  144271 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 144214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 446671 - 446631
Alignment:
Q  234 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 274  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  446671 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtg 446631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Original strand, 85559 - 85612
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 280  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  85559 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 85612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 1731 - 1794
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 288  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||| ||||    
T  1731 tatgatttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgatg 1794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 693 - 632
Alignment:
Q  278 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 340  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  693 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Original strand, 1279 - 1340
Alignment:
Q  278 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 340  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  1279 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 1340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15131 - 15070
Alignment:
Q  278 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 340  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  15131 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 15070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20931 - 20874
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20931 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14131 - 14074
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  14131 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 14074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38005 - 37948
Alignment:
Q  224 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  38005 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 37948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3385 - 3320
Alignment:
Q  284 agatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    ||||| || |||||||| |||||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3385 agatgtttcagttgatg-ttgattgtcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgttgcct 3320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Original strand, 164570 - 164623
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 280  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  164570 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 164623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 270
Target Start/End: Original strand, 19818 - 19863
Alignment:
Q  225 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 270  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  19818 tatgatttgatgttattaataatgtgatataaatgtatatgcatta 19863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 282
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158485
Alignment:
Q  229 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  158433 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 158485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 465 - 417
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  465 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 3966 - 4014
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  3966 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 4014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 410 - 362
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  410 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Original strand, 14547 - 14595
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 274  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14547 atgatttaaagttgttggtaatgtgatataattatatatgcattatgtg 14595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 5192 - 5240
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5192 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 5240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12437 - 12389
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12437 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 12389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 11592 - 11640
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11592 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 11640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 270
Target Start/End: Original strand, 27683 - 27727
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 270  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27683 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcatta 27727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 32751 - 32799
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32751 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 32799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16966 - 16911
Alignment:
Q  226 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 282  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16966 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 16911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 36033 - 36081
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36033 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 36081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 36177 - 36225
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36177 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcct 36225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 207593 - 207641
Alignment:
Q  302 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttgcct 350  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  207593 ttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgtcgcct 207641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University