View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8906_low_5 (Length: 682)

Name: NF8906_low_5
Description: NF8906
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8906_low_5
NF8906_low_5
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (5-666)||(103-765)
[»] chr5 (65 HSPs)
chr5 (5-666)||(22462610-22463270)
chr5 (5-666)||(20822111-20822772)
chr5 (5-666)||(28893991-28894652)
chr5 (5-666)||(28915462-28916123)
chr5 (5-666)||(28922817-28923478)
chr5 (47-666)||(20774417-20775036)
chr5 (5-614)||(21679827-21680436)
chr5 (5-667)||(22234969-22235631)
chr5 (5-667)||(23079138-23079800)
chr5 (5-667)||(24619344-24620006)
chr5 (5-667)||(24715575-24716237)
chr5 (5-667)||(24748603-24749265)
chr5 (10-666)||(17268388-17269044)
chr5 (130-667)||(21889933-21890470)
chr5 (5-665)||(25848734-25849394)
chr5 (5-665)||(20342941-20343601)
chr5 (43-667)||(21563060-21563684)
chr5 (5-667)||(24797446-24798108)
chr5 (5-667)||(14886040-14886702)
chr5 (73-667)||(21830878-21831472)
chr5 (5-665)||(37542430-37543090)
chr5 (40-665)||(22503338-22503963)
chr5 (19-660)||(27667553-27668194)
chr5 (5-221)||(28930730-28930946)
chr5 (19-660)||(22331950-22332591)
chr5 (19-641)||(22135369-22135991)
chr5 (19-660)||(14998802-14999443)
chr5 (19-660)||(16357184-16357825)
chr5 (19-660)||(27519089-27519729)
chr5 (19-660)||(27611036-27611677)
chr5 (19-660)||(27684463-27685104)
chr5 (19-660)||(34567176-34567817)
chr5 (5-660)||(19770642-19771297)
chr5 (22-641)||(26737793-26738412)
chr5 (37-660)||(29475154-29475777)
chr5 (19-641)||(40709481-40710103)
chr5 (22-641)||(23574438-23575049)
chr5 (317-617)||(21496780-21497080)
chr5 (10-660)||(41771524-41772174)
chr5 (37-569)||(23440983-23441515)
chr5 (40-641)||(23471930-23472530)
chr5 (10-660)||(37290550-37291200)
chr5 (37-641)||(20467179-20467782)
chr5 (35-641)||(21407839-21408445)
chr5 (37-569)||(21881722-21882254)
chr5 (37-641)||(21338378-21338982)
chr5 (35-284)||(25427491-25427740)
chr5 (10-281)||(18776857-18777128)
chr5 (100-473)||(23517395-23517768)
chr5 (10-90)||(843-923)
chr5 (331-569)||(25423962-25424199)
chr5 (363-641)||(22349124-22349402)
chr5 (10-110)||(21497156-21497256)
chr5 (10-122)||(21872104-21872216)
chr5 (10-122)||(21876384-21876496)
chr5 (214-665)||(20800125-20800576)
chr5 (364-569)||(18776543-18776748)
chr5 (616-667)||(22381856-22381907)
chr5 (582-630)||(21936814-21936862)
chr5 (582-630)||(24581904-24581952)
chr5 (5-51)||(20777186-20777232)
chr5 (514-564)||(25243908-25243958)
chr5 (514-564)||(25308060-25308110)
chr5 (22-80)||(20800659-20800717)
chr5 (582-626)||(27011782-27011826)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (5-666)||(27901130-27901791)
chr4 (10-667)||(15002236-15002893)
chr4 (11-667)||(15246667-15247323)
chr4 (37-667)||(33223666-33224296)
chr4 (5-663)||(1648144-1648802)
chr4 (43-667)||(8706661-8707287)
chr4 (5-665)||(11206098-11206758)
chr4 (5-665)||(3263661-3264321)
chr4 (22-667)||(15413910-15414555)
chr4 (37-548)||(15358019-15358530)
chr4 (128-666)||(15078379-15078917)
chr4 (5-665)||(20891727-20892387)
chr4 (13-665)||(44660741-44661393)
chr4 (5-541)||(16148580-16149116)
chr4 (5-541)||(16152726-16153262)
chr4 (5-665)||(29452404-29453064)
chr4 (5-666)||(15319895-15320541)
chr4 (19-660)||(12477350-12477991)
chr4 (19-660)||(14302599-14303240)
chr4 (37-641)||(14850005-14850609)
chr4 (19-569)||(8052244-8052794)
chr4 (19-569)||(19777414-19777964)
chr4 (10-660)||(23956497-23957147)
chr4 (19-660)||(8387162-8387803)
chr4 (19-660)||(29038025-29038666)
chr4 (10-660)||(40473790-40474440)
chr4 (5-660)||(27712086-27712741)
chr4 (19-660)||(18297955-18298596)
chr4 (5-569)||(14160311-14160875)
chr4 (10-569)||(14681408-14681967)
chr4 (37-472)||(14695051-14695486)
chr4 (10-303)||(51605664-51605957)
chr4 (37-569)||(15146524-15147056)
chr4 (10-569)||(18226058-18226617)
chr4 (10-569)||(12524517-12525076)
chr4 (10-164)||(15071605-15071759)
chr4 (22-569)||(16354069-16354616)
chr4 (40-305)||(18614466-18614731)
chr4 (337-641)||(1639364-1639668)
chr4 (517-641)||(14691671-14691795)
chr4 (585-667)||(15358537-15358619)
chr4 (331-569)||(7091273-7091511)
chr4 (582-630)||(15292602-15292650)
chr4 (591-630)||(12342317-12342356)
chr4 (582-626)||(9291619-9291663)
chr4 (537-575)||(16146459-16146497)
chr4 (520-564)||(12342247-12342291)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (5-666)||(68145-68806)
scaffold0034 (5-667)||(3823-4485)
scaffold0034 (5-667)||(12778-13433)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (5-666)||(27209579-27210240)
chr2 (5-661)||(23294315-23294971)
chr2 (5-667)||(23277150-23277812)
chr2 (5-667)||(24948963-24949626)
chr2 (5-667)||(19651457-19652121)
chr2 (10-666)||(27788116-27788771)
chr2 (10-666)||(12574728-12575384)
chr2 (235-666)||(27364716-27365147)
chr2 (5-665)||(31831034-31831694)
chr2 (40-392)||(23099460-23099812)
chr2 (5-665)||(1064127-1064787)
chr2 (43-667)||(23111109-23111734)
chr2 (5-665)||(20828635-20829295)
chr2 (19-660)||(24710415-24711056)
chr2 (19-660)||(16925741-16926382)
chr2 (19-660)||(16999381-17000022)
chr2 (370-665)||(11357646-11357941)
chr2 (314-665)||(20833361-20833712)
chr2 (19-660)||(27371650-27372291)
chr2 (10-641)||(10869250-10869881)
chr2 (19-569)||(41607806-41608356)
chr2 (19-660)||(16923270-16923911)
chr2 (19-660)||(16982533-16983174)
chr2 (19-660)||(17064098-17064739)
chr2 (19-660)||(27218397-27219038)
chr2 (508-667)||(24642116-24642275)
chr2 (19-660)||(22324277-22324918)
chr2 (37-569)||(21144480-21145012)
chr2 (22-497)||(44384993-44385468)
chr2 (35-577)||(30210355-30210895)
chr2 (363-641)||(45529911-45530189)
chr2 (19-660)||(24262751-24263392)
chr2 (37-569)||(24876188-24876720)
chr2 (10-641)||(24675889-24676520)
chr2 (35-563)||(23066869-23067396)
chr2 (37-641)||(23107169-23107773)
chr2 (442-664)||(21125003-21125225)
chr2 (10-569)||(21324678-21325237)
chr2 (263-641)||(24819351-24819729)
chr2 (148-569)||(21890268-21890689)
chr2 (22-569)||(24706906-24707453)
chr2 (209-660)||(9610517-9610968)
chr2 (209-660)||(17067756-17068207)
chr2 (35-294)||(45533091-45533351)
chr2 (239-569)||(22756106-22756436)
chr2 (35-227)||(30011621-30011811)
chr2 (10-73)||(25264022-25264085)
chr2 (55-162)||(12639690-12639797)
chr2 (582-629)||(24831171-24831218)
chr2 (582-630)||(12640217-12640265)
chr2 (582-630)||(22761553-22761601)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (5-666)||(658-1319)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (5-666)||(20855699-20856361)
chr1 (5-667)||(20939002-20939664)
chr1 (5-667)||(19855063-19855725)
chr1 (40-667)||(24098577-24099204)
chr1 (5-667)||(19662076-19662742)
chr1 (5-667)||(20834839-20835489)
chr1 (5-656)||(21951678-21952329)
chr1 (5-665)||(20295172-20295832)
chr1 (5-665)||(31538936-31539596)
chr1 (5-665)||(37677840-37678500)
chr1 (5-414)||(23197185-23197594)
chr1 (19-576)||(16373378-16373936)
chr1 (10-641)||(41352606-41353237)
chr1 (5-291)||(20060891-20061177)
chr1 (43-569)||(21749797-21750322)
chr1 (19-660)||(21831068-21831709)
chr1 (19-660)||(51332446-51333087)
chr1 (19-660)||(21837715-21838356)
chr1 (37-575)||(22109872-22110410)
chr1 (37-575)||(22113721-22114259)
chr1 (10-569)||(33389973-33390532)
chr1 (68-569)||(22361246-22361747)
chr1 (19-641)||(16349549-16350174)
chr1 (10-569)||(19107224-19107783)
chr1 (550-663)||(22432600-22432713)
chr1 (154-569)||(50619332-50619747)
chr1 (37-522)||(21025076-21025561)
chr1 (40-563)||(16077630-16078153)
chr1 (331-665)||(20139590-20139924)
chr1 (19-305)||(21234684-21234970)
chr1 (10-136)||(21744496-21744622)
chr1 (40-284)||(431090-431334)
chr1 (37-544)||(19759844-19760351)
chr1 (262-569)||(20250658-20250964)
chr1 (10-305)||(17043959-17044254)
chr1 (37-107)||(24793588-24793658)
chr1 (582-630)||(20830908-20830956)
chr1 (364-497)||(17044313-17044446)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (5-659)||(15459951-15460605)
chr6 (40-666)||(21563179-21563805)
chr6 (40-666)||(21569038-21569664)
chr6 (5-667)||(19454027-19454689)
chr6 (5-667)||(8761945-8762607)
chr6 (5-666)||(18795298-18795959)
chr6 (40-667)||(5296253-5296880)
chr6 (13-656)||(19879916-19880559)
chr6 (5-665)||(10467861-10468521)
chr6 (5-667)||(14380479-14381141)
chr6 (5-667)||(21472208-21472870)
chr6 (13-666)||(34644606-34645259)
chr6 (10-666)||(28281830-28282486)
chr6 (46-623)||(19435653-19436230)
chr6 (112-643)||(25768822-25769353)
chr6 (5-665)||(24365021-24365681)
chr6 (43-614)||(19488322-19488893)
chr6 (37-563)||(22442978-22443504)
chr6 (37-563)||(22434580-22435106)
chr6 (10-563)||(27188147-27188700)
chr6 (10-563)||(27260540-27261093)
chr6 (43-569)||(20636351-20636877)
chr6 (43-569)||(22761505-22762031)
chr6 (19-641)||(29590946-29591568)
chr6 (19-569)||(16625743-16626293)
chr6 (19-660)||(24312194-24312835)
chr6 (10-641)||(1542101-1542732)
chr6 (22-641)||(19865320-19865939)
chr6 (64-641)||(5838290-5838867)
chr6 (37-576)||(15896792-15897331)
chr6 (19-569)||(2873829-2874379)
chr6 (5-452)||(14378929-14379376)
chr6 (10-660)||(28262214-28262864)
chr6 (10-660)||(28340963-28341613)
chr6 (40-568)||(23079175-23079703)
chr6 (22-641)||(18196762-18197376)
chr6 (5-569)||(25113257-25113821)
chr6 (508-666)||(27560132-27560290)
chr6 (35-569)||(25608903-25609437)
chr6 (35-569)||(18406986-18407518)
chr6 (64-569)||(22077761-22078266)
chr6 (508-667)||(22796147-22796306)
chr6 (10-569)||(16962462-16963021)
chr6 (22-605)||(18966324-18966904)
chr6 (37-306)||(27564865-27565134)
chr6 (97-569)||(27330537-27331009)
chr6 (97-569)||(27391277-27391749)
chr6 (40-569)||(16926687-16927216)
chr6 (364-641)||(27566351-27566628)
chr6 (580-667)||(17416093-17416180)
chr6 (314-569)||(18436310-18436569)
chr6 (35-191)||(18449593-18449749)
chr6 (444-660)||(28291823-28292039)
chr6 (582-630)||(16381962-16382010)
chr6 (582-630)||(1648403-1648451)
chr6 (582-630)||(14624946-14624994)
chr6 (591-630)||(16233672-16233711)
chr6 (591-629)||(23996893-23996931)
chr6 (598-626)||(16098698-16098726)
chr6 (427-491)||(16098833-16098897)
chr6 (582-626)||(18572299-18572343)
chr6 (582-626)||(18837497-18837541)
chr6 (582-630)||(23027305-23027353)
[»] chr3 (79 HSPs)
chr3 (5-643)||(10419140-10419778)
chr3 (5-666)||(14087046-14087707)
chr3 (40-667)||(17493002-17493629)
chr3 (5-666)||(13971215-13971876)
chr3 (5-667)||(12359622-12360299)
chr3 (10-667)||(14574295-14574952)
chr3 (40-667)||(18133476-18134103)
chr3 (10-667)||(16827303-16827960)
chr3 (10-666)||(16835610-16836266)
chr3 (5-611)||(31694281-31694887)
chr3 (5-611)||(31939331-31939937)
chr3 (10-666)||(41177895-41178551)
chr3 (10-666)||(16380028-16380684)
chr3 (10-666)||(13942397-13943053)
chr3 (10-655)||(44777631-44778276)
chr3 (40-666)||(11960299-11960925)
chr3 (89-667)||(11302952-11303530)
chr3 (5-665)||(16337607-16338267)
chr3 (73-666)||(4678811-4679404)
chr3 (5-665)||(28754692-28755352)
chr3 (5-665)||(47124318-47124978)
chr3 (43-667)||(15228021-15228645)
chr3 (5-530)||(13319597-13320122)
chr3 (229-666)||(8758402-8758838)
chr3 (5-665)||(16328755-16329416)
chr3 (314-665)||(10384342-10384693)
chr3 (19-660)||(5424050-5424691)
chr3 (10-660)||(20061165-20061815)
chr3 (10-660)||(15588503-15589153)
chr3 (19-660)||(10906579-10907220)
chr3 (13-487)||(14580056-14580530)
chr3 (19-569)||(10006060-10006610)
chr3 (19-660)||(16636142-16636783)
chr3 (19-660)||(43163466-43164107)
chr3 (43-416)||(15234140-15234513)
chr3 (19-641)||(15339657-15340279)
chr3 (10-569)||(15347356-15347915)
chr3 (37-660)||(15724072-15724695)
chr3 (19-569)||(13253150-13253700)
chr3 (19-641)||(48425835-48426457)
chr3 (10-660)||(53384129-53384779)
chr3 (40-569)||(17490310-17490839)
chr3 (10-660)||(6601105-6601755)
chr3 (19-522)||(15401637-15402140)
chr3 (10-660)||(16411393-16412043)
chr3 (40-569)||(16491322-16491851)
chr3 (41-641)||(15014898-15015498)
chr3 (5-249)||(17187164-17187408)
chr3 (22-641)||(12498636-12499255)
chr3 (118-660)||(26791618-26792160)
chr3 (37-281)||(15260378-15260622)
chr3 (37-665)||(14875637-14876264)
chr3 (363-569)||(15248607-15248813)
chr3 (37-305)||(14125732-14126000)
chr3 (37-174)||(16693019-16693156)
chr3 (71-660)||(16755757-16756346)
chr3 (389-641)||(15209279-15209531)
chr3 (268-454)||(13299880-13300066)
chr3 (268-454)||(13310538-13310724)
chr3 (406-641)||(9523107-9523342)
chr3 (37-204)||(16806085-16806252)
chr3 (566-666)||(13322308-13322408)
chr3 (325-641)||(16371801-16372116)
chr3 (37-164)||(15062583-15062710)
chr3 (5-122)||(12179255-12179372)
chr3 (340-569)||(15062204-15062433)
chr3 (364-569)||(16692624-16692829)
chr3 (364-569)||(16806391-16806596)
chr3 (582-630)||(13967023-13967071)
chr3 (582-630)||(30138215-30138263)
chr3 (582-630)||(30147766-30147814)
chr3 (591-630)||(8274091-8274130)
chr3 (613-667)||(15952671-15952725)
chr3 (582-630)||(16257553-16257601)
chr3 (582-630)||(16742386-16742434)
chr3 (55-150)||(13966500-13966595)
chr3 (55-174)||(15610968-15611087)
chr3 (514-563)||(6712024-6712073)
chr3 (514-563)||(17193570-17193619)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (10-667)||(11387287-11387944)
chr7 (5-666)||(19613409-19614070)
chr7 (5-666)||(15341165-15341826)
chr7 (5-667)||(13666270-13666932)
chr7 (10-667)||(19147944-19148601)
chr7 (10-667)||(20747343-20748000)
chr7 (10-667)||(15101462-15102119)
chr7 (5-666)||(14285230-14285891)
chr7 (40-667)||(16949361-16949987)
chr7 (5-667)||(13022090-13022752)
chr7 (40-667)||(295-923)
chr7 (10-667)||(14263103-14263760)
chr7 (10-667)||(16071154-16071810)
chr7 (5-666)||(23504724-23505385)
chr7 (10-666)||(18052812-18053468)
chr7 (91-666)||(14434425-14435000)
chr7 (10-667)||(12457373-12458030)
chr7 (5-665)||(11305117-11305777)
chr7 (43-669)||(12205692-12206318)
chr7 (158-667)||(12456435-12456944)
chr7 (5-665)||(26117459-26118119)
chr7 (5-665)||(13967522-13968182)
chr7 (5-665)||(49153036-49153696)
chr7 (371-666)||(14130607-14130902)
chr7 (22-641)||(11771134-11771753)
chr7 (19-660)||(10871734-10872375)
chr7 (19-660)||(44790241-44790882)
chr7 (19-660)||(8708344-8708985)
chr7 (35-641)||(320943-321549)
chr7 (369-665)||(8211346-8211642)
chr7 (37-576)||(15204442-15204981)
chr7 (19-660)||(8199367-8200008)
chr7 (5-660)||(18178481-18179136)
chr7 (19-569)||(14333227-14333776)
chr7 (19-660)||(11236103-11236744)
chr7 (19-660)||(15159947-15160588)
chr7 (19-660)||(18550648-18551289)
chr7 (51-643)||(15625308-15625902)
chr7 (19-660)||(13686803-13687444)
chr7 (37-569)||(9596887-9597419)
chr7 (10-474)||(14955483-14955943)
chr7 (5-641)||(23202489-23203125)
chr7 (5-641)||(23508616-23509252)
chr7 (42-641)||(12688259-12688857)
chr7 (427-641)||(21662719-21662933)
chr7 (10-569)||(16199-16756)
chr7 (68-563)||(14040531-14041026)
chr7 (68-563)||(14350561-14351056)
chr7 (552-666)||(6414245-6414359)
chr7 (10-660)||(11551983-11552633)
chr7 (10-497)||(14212576-14213063)
chr7 (331-563)||(15153859-15154091)
chr7 (64-281)||(15147820-15148037)
chr7 (582-630)||(27107227-27107275)
chr7 (582-630)||(7824669-7824717)
chr7 (514-566)||(17144646-17144698)
chr7 (17-125)||(40034-40142)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (10-667)||(19894-20551)
scaffold0058 (35-90)||(58091-58146)
scaffold0058 (514-566)||(75433-75485)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (5-667)||(46269-46931)
scaffold0010 (5-665)||(41203-41863)
scaffold0010 (41-641)||(2721-3314)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (5-666)||(45292-45953)
scaffold0114 (10-593)||(20748-21318)
scaffold0114 (508-666)||(44280-44438)
scaffold0114 (43-569)||(19249-19775)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (13-666)||(99-752)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (10-666)||(4327-4983)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (5-667)||(19623-20285)
scaffold0090 (5-667)||(23785-24447)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (5-666)||(32547-33208)
scaffold0076 (5-667)||(55770-56432)
scaffold0076 (582-630)||(41069-41117)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (40-667)||(31415816-31416446)
chr8 (5-667)||(23655736-23656398)
chr8 (13-666)||(22051673-22052326)
chr8 (5-666)||(20974966-20975622)
chr8 (40-652)||(1267062-1267674)
chr8 (10-667)||(21841226-21841883)
chr8 (5-667)||(19852220-19852882)
chr8 (10-666)||(31570157-31570813)
chr8 (5-667)||(19858256-19858918)
chr8 (5-667)||(20009231-20009891)
chr8 (10-667)||(22371749-22372397)
chr8 (5-667)||(29302736-29303398)
chr8 (43-667)||(20388908-20389532)
chr8 (5-665)||(14565953-14566613)
chr8 (5-665)||(16270534-16271194)
chr8 (5-667)||(6604467-6605129)
chr8 (10-495)||(20984862-20985347)
chr8 (40-665)||(6679922-6680547)
chr8 (5-665)||(12305569-12306229)
chr8 (5-665)||(27355359-27356007)
chr8 (86-665)||(803064-803643)
chr8 (10-641)||(19483379-19484010)
chr8 (22-641)||(22376781-22377400)
chr8 (22-641)||(22382956-22383575)
chr8 (37-664)||(20395474-20396094)
chr8 (37-569)||(19978874-19979406)
chr8 (19-569)||(17673347-17673897)
chr8 (10-641)||(19113525-19114156)
chr8 (19-497)||(18857556-18858034)
chr8 (40-563)||(21165883-21166406)
chr8 (19-569)||(22128282-22128832)
chr8 (37-569)||(21393207-21393739)
chr8 (37-569)||(21787701-21788233)
chr8 (507-659)||(22061245-22061397)
chr8 (40-637)||(22247778-22248359)
chr8 (10-641)||(21043280-21043911)
chr8 (35-569)||(21921076-21921610)
chr8 (19-284)||(20017587-20017852)
chr8 (10-569)||(30312459-30313018)
chr8 (35-563)||(23650954-23651482)
chr8 (154-569)||(22988103-22988518)
chr8 (40-569)||(21251848-21252380)
chr8 (10-660)||(22040675-22041325)
chr8 (19-474)||(22119498-22119953)
chr8 (10-224)||(21324584-21324797)
chr8 (19-467)||(15534392-15534840)
chr8 (37-288)||(23886212-23886463)
chr8 (366-641)||(23949754-23950029)
chr8 (10-569)||(32601051-32601610)
chr8 (189-641)||(16407539-16407992)
chr8 (40-569)||(22132386-22132915)
chr8 (427-468)||(22623596-22623637)
chr8 (582-630)||(16876982-16877030)
chr8 (58-122)||(22623399-22623463)
chr8 (514-564)||(22283916-22283966)
chr8 (514-564)||(25283042-25283092)
chr8 (514-564)||(25283268-25283318)
chr8 (17-125)||(19869044-19869152)
chr8 (591-630)||(22366561-22366600)
chr8 (37-134)||(22435645-22435742)
chr8 (447-563)||(12274441-12274557)
chr8 (589-641)||(21166432-21166484)
chr8 (582-630)||(21850224-21850272)
[»] scaffold0067 (5 HSPs)
scaffold0067 (10-666)||(51055-51711)
scaffold0067 (10-666)||(60089-60745)
scaffold0067 (10-666)||(66477-67133)
scaffold0067 (10-344)||(27722-28055)
scaffold0067 (363-452)||(26389-26478)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (5-666)||(49384-50045)
scaffold0028 (19-641)||(43954-44573)
scaffold0028 (37-641)||(9274-9878)
scaffold0028 (37-522)||(15855-16340)
scaffold0028 (237-482)||(718-963)
scaffold0028 (582-626)||(106020-106064)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (5-643)||(10927-11565)
scaffold0298 (5-643)||(14697-15335)
scaffold0298 (5-666)||(20758-21419)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (13-667)||(2233-2887)
scaffold0222 (5-667)||(7834-8496)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (5-667)||(194574-195236)
scaffold0011 (5-666)||(149345-150005)
scaffold0011 (41-641)||(25439-26039)
scaffold0011 (582-626)||(180739-180783)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (5-666)||(41692-42353)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (5-667)||(323478-324140)
scaffold0004 (43-666)||(202376-202999)
scaffold0004 (547-667)||(118342-118462)
scaffold0004 (37-204)||(118463-118630)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (10-666)||(5211-5866)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (5-667)||(6108-6770)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (10-667)||(5204-5861)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (5-666)||(5988-6649)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (5-643)||(12996-13636)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (10-667)||(5524-6181)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (10-667)||(47909-48566)
scaffold0053 (5-666)||(56717-57378)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (43-667)||(27298-27922)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (5-669)||(43555-44219)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (10-669)||(10565-11224)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (5-667)||(13169-13831)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (5-666)||(80702-81363)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (5-666)||(261083-261744)
scaffold0005 (22-569)||(277717-278264)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (5-666)||(113334-113995)
scaffold0029 (178-643)||(95045-95510)
scaffold0029 (35-563)||(108711-109239)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (40-667)||(249387-250014)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (10-667)||(848-1504)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (10-667)||(28831-29488)
scaffold0026 (35-563)||(29823-30351)
scaffold0026 (10-83)||(50168-50241)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (10-667)||(18122-18780)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (5-667)||(10327-10989)
scaffold0235 (5-667)||(20541-21203)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (5-667)||(3525-4185)
scaffold0035 (35-227)||(43007-43199)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (10-667)||(32184-32842)
scaffold0106 (457-641)||(14839-15023)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (5-667)||(20168-20830)
scaffold0104 (5-667)||(22988-23650)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (10-667)||(50750-51395)
[»] scaffold0751 (2 HSPs)
scaffold0751 (10-596)||(3021-3607)
scaffold0751 (520-667)||(2568-2715)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (10-635)||(4582-5207)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (5-666)||(11656-12316)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (10-667)||(643-1300)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (74-665)||(1-591)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (5-667)||(2362-3024)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (5-667)||(24746-25397)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (142-667)||(27999-28524)
scaffold0156 (40-122)||(35432-35514)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (40-667)||(32224-32851)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (5-643)||(7015-7653)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (14-659)||(47906-48531)
[»] scaffold0232 (2 HSPs)
scaffold0232 (5-599)||(558-1150)
scaffold0232 (595-667)||(2337-2409)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (10-667)||(100437-101084)
scaffold0020 (85-641)||(180999-181555)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (10-497)||(89320-89807)
scaffold0001 (10-497)||(89998-90485)
scaffold0001 (580-667)||(114959-115046)
scaffold0001 (426-569)||(390491-390634)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (43-666)||(23987-24602)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (97-666)||(48168-48738)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (5-564)||(2200-2759)
scaffold0476 (473-569)||(10189-10285)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (40-667)||(9713-10340)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (5-663)||(15583-16241)
scaffold0089 (45-377)||(10501-10833)
[»] scaffold0518 (2 HSPs)
scaffold0518 (55-482)||(11692-12119)
scaffold0518 (519-660)||(11550-11691)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (70-643)||(39694-40267)
scaffold0064 (457-643)||(28090-28276)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (72-667)||(95-681)
scaffold0139 (5-482)||(28176-28653)
scaffold0139 (5-482)||(34429-34906)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (187-667)||(3565-4045)
scaffold0403 (37-641)||(7172-7776)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (388-666)||(639-917)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (278-667)||(22519-22908)
scaffold0261 (278-667)||(14340-14729)
scaffold0261 (10-172)||(14175-14336)
scaffold0261 (10-172)||(22354-22515)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (161-630)||(20467-20936)
scaffold0077 (582-630)||(27713-27761)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (10-488)||(2360-2838)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (10-438)||(1729-2157)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (10-416)||(3-409)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (13-422)||(6563-6972)
scaffold0117 (598-630)||(887-919)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (5-471)||(422-887)
scaffold0120 (492-667)||(881-1056)
scaffold0120 (43-569)||(12930-13456)
scaffold0120 (43-569)||(6895-7418)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (142-665)||(27037-27560)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (37-641)||(15677-16281)
scaffold0040 (43-641)||(112396-112993)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (55-641)||(4831-5417)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (89-272)||(16449-16632)
scaffold0348 (427-666)||(6959-7198)
scaffold0348 (5-110)||(10759-10864)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (22-641)||(9770-10388)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (22-641)||(4671-5290)
scaffold0270 (22-641)||(11801-12420)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (37-638)||(218319-218920)
scaffold0012 (331-569)||(229915-230153)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (10-266)||(15287-15543)
scaffold0266 (582-626)||(9308-9352)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (37-560)||(16879-17402)
[»] scaffold0585 (2 HSPs)
scaffold0585 (5-347)||(5959-6303)
scaffold0585 (430-666)||(6331-6567)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (19-660)||(7720-8361)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (13-358)||(40781-41126)
scaffold0102 (403-667)||(40512-40776)
[»] scaffold0149 (4 HSPs)
scaffold0149 (409-667)||(6510-6769)
scaffold0149 (409-667)||(10941-11200)
scaffold0149 (69-303)||(6264-6498)
scaffold0149 (69-303)||(10695-10929)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (37-569)||(969-1501)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (37-641)||(1708-2312)
scaffold0647 (43-107)||(8567-8631)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (5-438)||(4-437)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (5-350)||(3142-3487)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (5-350)||(30155-30500)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (37-569)||(102105-102637)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (10-641)||(6814-7445)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (128-665)||(17457-17993)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (37-569)||(7989-8521)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (37-641)||(38722-39326)
scaffold0042 (19-560)||(66286-66827)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (363-614)||(34015-34266)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (40-630)||(18120-18707)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (64-569)||(50304-50809)
scaffold0081 (37-569)||(19474-20006)
scaffold0081 (37-569)||(34898-35430)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (40-641)||(6849-7450)
scaffold0358 (64-306)||(3538-3780)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (37-569)||(16527-17058)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (64-544)||(25873-26353)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (37-641)||(31655-32259)
scaffold0180 (5-222)||(12397-12614)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (37-641)||(115807-116411)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (440-667)||(17842-18069)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (40-640)||(85424-86023)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (263-641)||(3940-4318)
scaffold0074 (19-173)||(4380-4534)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (40-569)||(7236-7765)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (64-569)||(2137-2646)
scaffold0319 (43-204)||(3-164)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (100-641)||(4557-5097)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (37-641)||(8166-8770)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (22-569)||(79381-79928)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (40-522)||(4258-4740)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (37-554)||(1780-2297)
scaffold0413 (589-641)||(1693-1745)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (37-569)||(13340-13872)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (68-569)||(6093-6594)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (5-398)||(1-398)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (41-569)||(3066-3594)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (37-641)||(6793-7397)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (40-503)||(14116-14579)
scaffold0324 (139-639)||(19006-19506)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (70-569)||(130979-131477)
scaffold0023 (37-641)||(3358-3963)
scaffold0023 (35-667)||(59529-60159)
scaffold0023 (40-164)||(28273-28397)
scaffold0023 (364-641)||(28601-28878)
scaffold0023 (582-626)||(55347-55391)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (22-305)||(177149-177432)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (426-665)||(25010-25249)
scaffold0100 (37-257)||(23087-23307)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (10-260)||(96345-96595)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (13-474)||(8364-8825)
scaffold0080 (148-305)||(49319-49476)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (88-563)||(574-1049)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (5-437)||(27937-28369)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (154-569)||(1548-1963)
[»] scaffold0282 (2 HSPs)
scaffold0282 (22-305)||(15369-15652)
scaffold0282 (454-641)||(15742-15922)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (43-224)||(7561-7742)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (263-641)||(11325-11703)
scaffold0018 (263-641)||(17517-17895)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (37-641)||(13983-14585)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (19-563)||(3289-3833)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (37-281)||(29473-29717)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (19-563)||(9474-10018)
scaffold0109 (10-563)||(32448-33001)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (37-569)||(25846-26378)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (37-569)||(62933-63465)
scaffold0031 (10-214)||(108857-109061)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (5-235)||(1704-1934)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (37-545)||(18969-19477)
scaffold0017 (19-563)||(56895-57439)
scaffold0017 (10-563)||(196353-196906)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (37-353)||(24555-24871)
scaffold0198 (442-569)||(24370-24497)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (37-233)||(1626-1822)
scaffold0044 (37-233)||(15366-15562)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (43-305)||(2572-2834)
scaffold0621 (430-569)||(2339-2478)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (517-641)||(12294-12418)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (10-281)||(39539-39810)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (35-161)||(38848-38974)
scaffold0122 (364-449)||(39132-39217)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (35-224)||(39774-39963)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (37-480)||(9918-10361)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (37-116)||(12894-12973)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (364-569)||(3246-3451)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (442-569)||(1-128)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (607-666)||(49547-49606)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (10-68)||(19-77)
[»] scaffold0719 (1 HSPs)
scaffold0719 (209-522)||(8-321)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (364-563)||(3043-3242)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (37-116)||(23975-24054)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (389-569)||(22739-22919)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (378-497)||(1358-1477)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (582-630)||(3322-3370)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (582-630)||(24205-24253)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (582-626)||(3391-3435)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (582-630)||(44349-44397)
scaffold0132 (582-626)||(15471-15515)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (40-95)||(343-398)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (76-174)||(10561-10659)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (592-630)||(3969-4007)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (363-473)||(51-161)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (76-174)||(8532-8630)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (582-626)||(45312-45356)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (582-626)||(46969-47013)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (582-630)||(460-508)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (76-174)||(25229-25327)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (514-563)||(24758-24807)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (598-626)||(5990-6018)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (582-626)||(18862-18906)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (582-626)||(13723-13767)


Alignment Details
Target: scaffold0465 (Bit Score: 487; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Original strand, 103 - 765
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  103 acatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaaataccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtag 202  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  203 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcagagtgtg 302  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  303 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 402  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttga-ttt 403  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  403 aagcggagaatagtgatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 502  T
Q  404 tagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||   ||    
T  503 tagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttagtggtctggtttgaagaagga 602  T
Q  504 cgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgg 603  Q
     |||||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| || || ||||||    
T  603 tgtcgctcggtttgtgtatgcgtgtttgacttatcggaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcaggtttgttgacaccgttggaagtaccagagtgg 702  T
Q  604 aagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  703 aaatgggataacatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatgat 765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 482; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 22463270 - 22462610
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22463270 acatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtag 22463171  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22463170 gaagacgttgcacatgtcggccttaatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtg 22463071  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22463070 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttgctggtaatc 22462971  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462970 aagcagagaatagtgatttcaaggttgat-aacaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 22462872  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||   |      
T  22462871 ggaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaagaaggct 22462772  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||||||    
T  22462771 gtcgctcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcaggtttgttgacaccgttggaggtaccagagtgga 22462672  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  22462671 aatgggatatcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatgat 22462610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 20822772 - 20822111
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20822772 acatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 20822673  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||||    
T  20822672 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagtttagagacttaagtctagtgtgtgagttatcatctcaaagtgtg 20822573  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||||||||    
T  20822572 cagttgggtatgttgaagatcaatagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtagatttgatagtcgctagtaatc 20822473  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||  || |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20822472 aagctgaagatggtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtattgagatttagaggcagaatttgtgttcccgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 20822373  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||   ||     
T  20822372 agaagaaagtcataagagtaatttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtccggattgaagaaggat 20822273  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  20822272 gtcgcacggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcgggattgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 20822173  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  20822172 aatgggatagtatttctatggatttcgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatgat 20822111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Original strand, 28893991 - 28894652
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28893991 acatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtag 28894090  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||     
T  28894091 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgta 28894190  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    ||||||    
T  28894191 cagttgggtatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgttaagttcgtggatttgatggttgtgggtaatc 28894290  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28894291 aagccgaggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgatttt 28894390  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||   ||     
T  28894391 agaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggat 28894490  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  28894491 gtcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 28894590  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||    
T  28894591 aatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttgcctaatactccgagaggacatgat 28894652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Original strand, 28915462 - 28916123
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28915462 acatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtag 28915561  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||     
T  28915562 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgta 28915661  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    ||||||    
T  28915662 cagttgggtatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgttaagttcgtggatttgatggttgtgggtaatc 28915761  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28915762 aagccgaggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgatttt 28915861  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||   ||     
T  28915862 agaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggat 28915961  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  28915962 gtcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 28916061  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||    
T  28916062 aatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttgcctaatactccgagaggacatgat 28916123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Original strand, 28922817 - 28923478
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28922817 acatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtag 28922916  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||     
T  28922917 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgta 28923016  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    ||||||    
T  28923017 cagttgggtatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgttaagttcgtggatttgatggttgtgggtaatc 28923116  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28923117 aagccgaggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgatttt 28923216  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||   ||     
T  28923217 agaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggat 28923316  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  28923317 gtcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 28923416  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||    
T  28923417 aatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttgcctaatactccgagaggacatgat 28923478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 20775036 - 20774417
Alignment:
Q  47 attttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttga 146  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  20775036 attttggcttgaactaccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcga 20774937  T
Q  147 attgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagt 246  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20774936 gttgcttgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgggtagt 20774837  T
Q  247 atcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20774836 atcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttgtgagtaatcaagccgaggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgt 20774737  T
Q  347 tgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagc 446  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  20774736 tgagatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacctgggagc 20774637  T
Q  447 tacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtct 546  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||   || |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20774636 tacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtct 20774537  T
Q  547 aaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaa 646  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||  |    
T  20774536 aaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgtcaagtttaccta 20774437  T
Q  647 acactccgagagggcatgat 666  Q
    | ||| ||||||| ||||||    
T  20774436 atacttcgagaggacatgat 20774417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 5 - 614
Target Start/End: Original strand, 21679827 - 21680436
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21679827 acatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtag 21679926  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||| | || ||||||    
T  21679927 gaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 21680026  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21680027 cagttgggtatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatc 21680126  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  || |||| || |||||| ||||||||||| || ||  | || | |||||||||    
T  21680127 aagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagataaaaaggttgatttt 21680226  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||     
T  21680227 ggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgat 21680326  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  21680327 gttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtgga 21680426  T
Q  605 agtgggatag 614  Q
    | ||||||||    
T  21680427 aatgggatag 21680436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 22234969 - 22235631
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22234969 acatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggactatgaatttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtag 22235068  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||| ||||| || |||||||| |  || ||||| ||| | || |||||||| |||||||| || || |||||| || || |||| ||| |     
T  22235069 gaaaacgttgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatt 22235168  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||     
T  22235169 cagttggggatgctaaagattaacagtgatttcttgaataatatccgagaagcgcagcaggtagatgtgaagtttgttgatttgatggttgttggtaatg 22235268  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| ||||| || | ||||||||| || ||||  | ||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22235269 aagctgaggatagtgactttaaggtcgatgatcaggatgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcatgataatgaagagttgaaaaagttaatttt 22235368  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||    
T  22235369 agaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggagctacaaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttagtggtctggtttgaagcgtgac 22235468  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22235469 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgtagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 22235568  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22235569 agtgagatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 22235631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 23079138 - 23079800
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||    
T  23079138 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagcag 23079237  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| ||||| || ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||  ||| ||| |     
T  23079238 gaaaacattacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacttcagagtata 23079337  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
     ||||||| ||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| |||  |||| |||||     
T  23079338 tagttggggatgttgaagattaacagtaatttcttgaatagtatctgagaagctcaacaagtagatttgaagtttgttgatttgatgactactggtaatg 23079437  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  ||||| ||| ||| |||||||||||||| || |||||  |||| || ||||  | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  23079438 acacggaggataatgacttcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattct 23079537  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||| ||||| || || |  |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23079538 tgaagagagtcacaaaagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgcgac 23079637  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23079638 gtagctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 23079737  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||| ||| |  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23079738 agtcggacaatatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatg 23079800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 24619344 - 24620006
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||| | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  24619344 acatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcag 24619443  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || || |||||||| ||  ||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || |  |||||  || || |||| |||||     
T  24619444 gaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgtt 24619543  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||     
T  24619544 cagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcttagcaagtcgatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatg 24619643  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| |||| || |||||||||||||  || |||||  |||| || ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  24619644 acactgaggatagcgatttcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgatttt 24619743  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||    
T  24619744 agaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttggtggtccggtttgaaacgtgac 24619843  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  24619844 gttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcccgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 24619943  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    | ||||| |  ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24619944 aatgggacattatttctatggatttcgtgacgagtttagcaaacactccgagagggcatgatg 24620006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 24715575 - 24716237
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||| | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  24715575 acatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcag 24715674  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || || |||||||| ||  ||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || |  |||||  || || |||| |||||     
T  24715675 gaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgtt 24715774  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||     
T  24715775 cagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcttagcaagtcgatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatg 24715874  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| |||| || |||||||||||||  || |||||  |||| || ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  24715875 acactgaggatagcgatttcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgatttt 24715974  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||    
T  24715975 agaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttggtggtccggtttgaaacgtgac 24716074  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  24716075 gttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcccgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 24716174  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    | ||||| |  ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24716175 aatgggacattatttctatggatttcgtgacgagtttagcaaacactccgagagggcatgatg 24716237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 24748603 - 24749265
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||| | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  24748603 acatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcag 24748702  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || || |||||||| ||  ||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || |  |||||  || || |||| |||||     
T  24748703 gaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgtt 24748802  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||     
T  24748803 cagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcttagcaagtcgatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatg 24748902  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| |||| || |||||||||||||  || |||||  |||| || ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  24748903 acactgaggatagcgatttcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgatttt 24749002  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||    
T  24749003 agaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttggtggtccggtttgaaacgtgac 24749102  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||    
T  24749103 gttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcccgcagggttgttgacaccgttggatgtactggagtgga 24749202  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    | ||||| |  ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24749203 aatgggacattatttctatggatttcgtgacgagtttagcaaacactccgagagggcatgatg 24749265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 10 - 666
Target Start/End: Original strand, 17268388 - 17269044
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  17268388 aggcagaggagatggcttgagctgttaaaatattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaaga 17268487  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    || |||| ||||| ||  ||||| |||  || || || ||||| ||||||||||| ||| ||||| | || |||||  ||||  ||||||| || |||||    
T  17268488 cactgcatatgtctgctatgatgataaaagaattcgatttgctggaacagtttagagacatgagtttggtatgtgagttgtcgcctcaaagcgtacagtt 17268587  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||||||  ||| ||||||| |||||||||| || || ||||| |||||||| ||| | |||||| || |||||          
T  17268588 ggggatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagcacagcaggtggatgtcaagtttgttgatctgatggttgctggtaatggcatt 17268687  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  |||| |    
T  17268688 gaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagagg 17268787  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  17268788 aaagtcacaagagtagcttgagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgtcgc 17268887  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||| |||    
T  17268888 tcattttgtgtatgcatgtttaacttgccagaagtctaaggttgaccatcagaaacctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccagagtggaaatgg 17268987  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  17268988 gatagcatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgaggggacatgat 17269044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 130 - 667
Target Start/End: Original strand, 21889933 - 21890470
Alignment:
Q  130 atggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaata 229  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||| || | |||  ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21889933 atggtaaaggagtttgagttgctagagaagtttagagacttgagtcttgtttatgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagatcaata 21890032  T
Q  230 gtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggt 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |  |  ||||||| ||||||||    
T  21890033 gtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgtcgatttaatggttgctagtaatcaaactaaatatagtgacttcaaggt 21890132  T
Q  330 tgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttg 429  Q
    || ||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| || || || | |||     
T  21890133 tggtgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgagtttggaagaaagccacaaaagtagcttt 21890232  T
Q  430 agtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtt 529  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| ||||| ||||||||||    
T  21890233 agtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacatgatgttgctcagtttgtttatgcatgtt 21890332  T
Q  530 tgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattt 629  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21890333 cgacttgtcaaaagtctaaggttgagcatcagaagcctgaagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattt 21890432  T
Q  630 tatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21890433 tgtgacgagtttacaaaatactccgagagggcatgatg 21890470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 25849394 - 25848734
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  25849394 acatgaggcagaggagatggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcag 25849295  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| |  || ||||||||||| ||| |||| || ||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||| |     
T  25849294 gaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgctagaatagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtata 25849195  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||  |||| ||| | |||||| | ||||| |||  | |  |||||     
T  25849194 cagttggggatgctaaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagtggatttgaagtttattgatttgatgacttcaggtaatg 25849095  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| || ||||||||||| || |||||  |||| || ||||  | | | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  25849094 acactgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtatgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattct 25848995  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||||||||| |  |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  25848994 tgatgatagtcataagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagat 25848895  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  25848894 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgaattgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 25848795  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  25848794 agtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagagcatga 25848734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 20343601 - 20342941
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||| ||||| ||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  20343601 acatgaggcataggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcag 20343502  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||| | |  || ||||||||| | |||||||| || ||| ||||||| || | |||| |||||||||| ||| |     
T  20343501 gaaaactttgcacatgtctgctttgatgatgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctatgaattgtcatctcagagtata 20343402  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||| ||  |||| ||| | |||||||| ||||| |||  | |  |||||     
T  20343401 cagttggggatgctgaagattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagctcagaaagtggatttgaagtttgttgatttgatgacttcaggtaatg 20343302  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||  | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  20343301 acactgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattct 20343202  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  20343201 tgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatataccatgatttgaagaaactgttttggtggtccagtttgaaaagagat 20343102  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  20343101 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggacgtaccggagtgga 20343002  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20343001 agtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 20342941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 43 - 667
Target Start/End: Original strand, 21563060 - 21563684
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||  ||||||| |  ||||    
T  21563060 tatgattttagtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtatgctatgatggttaaagagt 21563159  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||  || | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  21563160 ttgagttgcttgaacagtttagagacctgagtctcgtttgtgagttgtcgccttagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaa 21563259  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggt 342  Q
     ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| | ||  || |||| |||||||||||||| ||| ||    
T  21563260 cagtatcaaagaagcacagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcaacgt 21563359  T
Q  343 gtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgg 442  Q
    |||||||||||  || ||| ||||||||||||| | ||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  || | ||| ||||||||| | |    
T  21563360 gtgttgagattccgacacataatttgtattccttataattatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccag 21563459  T
Q  443 gagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaa 542  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||||||||||| ||| || ||    
T  21563460 gagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgccataa 21563559  T
Q  543 gtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttta 642  Q
     ||||| |||||||||||||| | ||  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||    
T  21563560 atctaaagttgaacatcagaaacttgttgggttgttgacaccattggatgtgccggagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacaagttta 21563659  T
Q  643 caaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |  || ||||| |||||||| ||||    
T  21563660 ccgaatactccaagagggcacgatg 21563684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 24797446 - 24798108
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  24797446 acatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggtagctgatgctttgagtag 24797545  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||| | |||||||| || ||  ||||||| || |||||| ||||| | || ||| |     
T  24797546 gaagactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtata 24797645  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||| ||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | |||||||| ||||| |||  | || |||||     
T  24797646 cagttgggaatgttgaaaattgatagggatttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagaagatttgaagtttgttgatttgatgacttctggtaatg 24797745  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||  | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24797746 acactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcaaggtgttttgaggttcagaggtagagtttgcattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattct 24797845  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  24797846 tgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagat 24797945  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24797946 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 24798045  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | ||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||    
T  24798046 agtgggacagtatctccatggattttgtaacgagtttaccgaacacttcgaaaggacatgatg 24798108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 14886040 - 14886702
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  14886040 acatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtag 14886139  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||| | |||||||| || ||  ||||||| || |||||| ||||| | || ||| |     
T  14886140 gaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtata 14886239  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | || ||||| ||||| |||  | || |||||     
T  14886240 cagttgggaatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagaagatttgaaatttgttgatttgatgacttctggtaatg 14886339  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| ||||| |||||||| || || ||| |||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14886340 acactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggggtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattct 14886439  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  14886440 tgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagat 14886539  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  14886540 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 14886639  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | ||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||    
T  14886640 agtgggacagtatctccatggattttgtaacgagtttaccgaacacttcgaaaggacatgatg 14886702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 73 - 667
Target Start/End: Original strand, 21830878 - 21831472
Alignment:
Q  73 aaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttga 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||  ||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  21830878 aaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtttgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctga 21830977  T
Q  173 gtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 272  Q
    ||||||| |||||  ||||  || | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| | ||| | |||||| ||  ||||||||||    
T  21830978 gtctcgtttgtgagttgtcgcctaagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaacaatattaaagaagcgcagaaagttgatgt 21831077  T
Q  273 taagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtatt 372  Q
    ||||||||| || ||  ||||| ||||||||||| |  |  || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||     
T  21831078 taagtttgtagaattgttggttgctagtaatcaaactaaagatggtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattctgaggcagaatttgtatc 21831177  T
Q  373 cctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaaga 472  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |  || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21831178 cctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaagtagtttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaaga 21831277  T
Q  473 agctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagg 572  Q
    |  ||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  21831278 aattgttttggtggtccggattgaagcgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcaaaaatctaaagttgaacatcagaagcctactgg 21831377  T
Q  573 gttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |  ||||||||| | || || ||||  || |||||||||||||||||||    
T  21831378 gttgttgacaccgttagatgtgccggagtgaaaatgagatagcatatgcatggattttgtaacaagattaccgaatactccgagagggcatgatg 21831472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Original strand, 37542430 - 37543090
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||    
T  37542430 acatgaggcagaggaggtggttagagttattgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgacgctttaagtag 37542529  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || |||||| |||| || |||||||| | ||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||| || |||||| ||||| | || ||| |     
T  37542530 gaaaactttgcacgtgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtata 37542629  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| || |||||| ||||||| ||  |||  ||| | |||||||| ||||| |||  | || |||||     
T  37542630 cagttgggaatgttgaaaattgatagtaacttcttaaacagtatccgagaagctcagaaagaggatttgaagtttgttgatttgatgacttctggtaatg 37542729  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||  |||| || ||||  | | |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |    
T  37542730 acactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaacgaagagttgaagaaattgattct 37542829  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  | ||     
T  37542830 tgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtatgaaaagggat 37542929  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||    
T  37542930 gttgctcagtttgtttatgcctgtttggtttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccagagtgga 37543029  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| |  || |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37543030 agtgggacattatctctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 37543090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 40 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 22503963 - 22503338
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||  |    
T  22503963 gattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctgctttaatggtaaaag 22503864  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    | || || ||| | ||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||    
T  22503863 aattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtctagtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttggggatgctgaagattgatagtaatttctt 22503764  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| |||||| |||||||  |  |||  ||| | || || || ||||| |||  |||| ||| | |  | ||| | | ||| || ||||||||||| ||     
T  22503763 gaacagtatccgagaagcttagaaagcagatttgaaattggttgatttgatgactactggtagtgacactgaggacaatgattttaaggttgatgatcag 22503664  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    |||||  |||| || ||||  | | | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || || ||||||||||| |  |||||||||||      
T  22503663 ggtgttctgaggttcagaggaagagtatgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattcttgaggagagtcataagagtaggttgagtattcagc 22503564  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || || | ||||||    
T  22503563 ccggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttagtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcttgcttaatttgtca 22503464  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  22503463 gaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgtcaccgttggatgtatcggagtggaagtgggacagtatttctatggattttgtgacgagt 22503364  T
Q  640 ttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||    
T  22503363 ttaccgaacactccgaaagggcatga 22503338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Original strand, 27667553 - 27668194
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27667553 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 27667652  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| | || ||||||  | || |||| |||||| | |||||||||||    
T  27667653 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgct 27667752  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| || |||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  |||| || ||  | |||    
T  27667753 gaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcaggctgaagacagt 27667852  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| ||||| |||||||||||| |||  | |||||| ||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  27667853 gattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagatttcgaggaagaatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 27667952  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  27667953 gaagtagcttgagtattcacccgggatctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 27668052  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| || || ||| ||     ||| || || |||||  | ||||| |||||||| ||     
T  27668053 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccaaaatggaaatgggatagtata 27668152  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  27668153 tccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 27668194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 28930730 - 28930946
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28930730 acatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtag 28930829  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||     
T  28930830 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgta 28930929  T
Q  205 cagttgggtatgctgaa 221  Q
    |||||||||||| ||||    
T  28930930 cagttgggtatgttgaa 28930946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Original strand, 22331950 - 22332591
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22331950 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 22332049  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  22332050 tgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 22332149  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  22332150 gaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 22332249  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  22332250 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 22332349  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| || ||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  22332350 gaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaataagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 22332449  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   ||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  22332450 gtattcctgtttagtttgccagaaatcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccggaatggaagtgggatagtata 22332549  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  22332550 tccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 22332591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 22135991 - 22135369
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22135991 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 22135892  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  |||||||  | |||||  ||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| || | |||||| |  ||||||||||    
T  22135891 tgtccgctatgatggtcggagagttcaaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcaccttagagtgtgaaactgggtatgct 22135792  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||  ||||| ||||||||||  | ||  | |||    
T  22135791 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagaaagt 22135692  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  22135691 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagaaaggatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattctagaagagagtcata 22135592  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || |  || || || |||||    
T  22135591 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgaggtgtggcacagtttgt 22135492  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| ||||| || ||| | ||  ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||     
T  22135491 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaaaaacctactggagtgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtata 22135392  T
Q  619 tctatggattttatgacgagttt 641  Q
    || ||||||||| ||||||||||    
T  22135391 tcaatggattttgtgacgagttt 22135369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Original strand, 14998802 - 14999443
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  14998802 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 14998901  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  14998902 tgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 14999001  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  14999002 gaagattcatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcgcagaaagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 14999101  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||  | ||| |||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  14999102 gattttaaaatcgacaatcaaagtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 14999201  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  14999202 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 14999301  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  14999302 gtattcctgtttagtttgtcagaagtctaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 14999401  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  14999402 tccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 14999443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 16357825 - 16357184
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16357825 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 16357726  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  16357725 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 16357626  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  ||||  ||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||  ||||  | ||  | |||    
T  16357625 gaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagt 16357526  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  16357525 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 16357426  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  16357425 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 16357326  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  16357325 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 16357226  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  16357225 tcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 16357184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 27519729 - 27519089
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27519729 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 27519630  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  27519629 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtg-aactgggtatgct 27519531  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||  ||||  | ||  | |||    
T  27519530 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagt 27519431  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  27519430 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 27519331  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  27519330 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 27519231  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  27519230 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 27519131  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  27519130 tcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 27519089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 27611677 - 27611036
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27611677 agatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 27611578  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| ||| | || ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| | |||||||||||    
T  27611577 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaactacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgct 27611478  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  |||| || ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||  ||||  | ||  | |||    
T  27611477 gaagattgatagcgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagt 27611378  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||| | |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  27611377 gattttaaaatcgataatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 27611278  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  27611277 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 27611178  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| || || ||| ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||     
T  27611177 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtata 27611078  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  27611077 tcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 27611036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Original strand, 27684463 - 27685104
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27684463 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 27684562  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  27684563 tgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 27684662  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  27684663 gaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcgcagaaagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 27684762  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||  | |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| |  |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  27684763 gattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 27684862  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  27684863 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 27684962  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  27684963 gtattcctgtttagtttgtcagaagtctaaaattgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 27685062  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  27685063 tccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 27685104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 34567817 - 34567176
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  34567817 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 34567718  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  34567717 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 34567618  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  ||||  ||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||  ||||  | ||  | |||    
T  34567617 gaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagt 34567518  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  34567517 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 34567418  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  34567417 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 34567318  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  34567317 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 34567218  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  34567217 tcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 34567176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 19771297 - 19770642
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||| | |||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19771297 acatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtag 19771198  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || |||||||| || ||  ||||| | || ||||||  | || |||| || |||    
T  19771197 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggacacctcagagcgtg 19771098  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
     |  ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| || |||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  |||    
T  19771097 aaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatc 19770998  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    | || ||  | ||||| || ||  | ||  | |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| |    
T  19770997 aggctgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattct 19770898  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||| |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || ||     
T  19770897 tgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagat 19770798  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || || || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||     ||| || || ||||| || ||||    
T  19770797 gtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatgga 19770698  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    | |||||||| || || ||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  19770697 aatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccaaatactccgagaggg 19770642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 641
Target Start/End: Original strand, 26737793 - 26738412
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  26737793 tggcttgagttgttgaaagactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgt 26737892  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    | ||  |||||||||  ||||| || ||| | || |||||||| || |||||| | || || ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||||||||    
T  26737893 ccgctatgatggtaaaagagttcgagttgttggagcagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaa 26737992  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    |||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||||  |||  |||||||||||||||||||||| ||  || || ||||||||||  | ||  || ||||     
T  26737993 gattgatagtgaatttctgaaaagtattaaagaaagacataaagttgatgttaagtttgtggacttgttgattgctagtaatcagactgaagatggtgat 26738092  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    || ||  | ||||| || |||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  |    
T  26738093 tttaaaatcgatgatcatggtgcgttgagatttcgaggaagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaa 26738192  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgta 521  Q
    | | |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||    
T  26738193 gtagcttgagtattcatcagggagctacgaaaatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgta 26738292  T
Q  522 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttct 621  Q
    | | ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||     | | || ||||| || |||||||| || |||||||| ||     
T  26738293 ttcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtatctttagatgtaccagagtggaaatgtgatagcatatcc 26738392  T
Q  622 atggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  26738393 atggattttgtgacgagttt 26738412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 660
Target Start/End: Original strand, 29475154 - 29475777
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  29475154 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 29475253  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| |||||||| |||||| |||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  29475254 gagagttcgaattgcttgaacagattagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatt 29475353  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| |||||||  ||||| ||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | ||||| || ||  | |||||     
T  29475354 tctgaaaagtatcaaggaagcgcagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgat 29475453  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||    
T  29475454 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 29475553  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | |  || ||||| |||||||| || || || || || ||||||||| |||||||   |||    
T  29475554 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagatttcctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcatgtttagtttg 29475653  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||| |||||    
T  29475654 tcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 29475753  T
Q  637 agtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||||    
T  29475754 agtttgccaaatactcctagaggg 29475777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 40710103 - 40709481
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  40710103 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 40710004  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||  | ||  ||||| | || ||||||  |||| |||| || ||| |  |||||||| |    
T  40710003 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgtt 40709904  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  ||||  | |||    
T  40709903 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagacggaagacagt 40709804  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  40709803 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 40709704  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  40709703 gaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 40709604  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| || || ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  40709603 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 40709504  T
Q  619 tctatggattttatgacgagttt 641  Q
    || ||||||||| ||||||||||    
T  40709503 tccatggattttgtgacgagttt 40709481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 23575049 - 23574438
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  23575049 tggctcgaattaatgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaggcattgcatatgt 23574950  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    | ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||  | || |||||   |||| |||| |||||| |  |||| ||||||||    
T  23574949 ccgctatgatggttagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaa 23574850  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    |||  ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||    ||| || ||||     
T  23574849 gattgatagtgaattcctgaagagtatcaaagaagcacaaaaaattgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagattgaggatggtgat 23574750  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||   ||||     |||||||  || || | ||||| |||||||  |    
T  23574749 tttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggccgaatttgtattcctg---atga-----tgaagaaaatgtttattgaagagagtcatagaa 23574658  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgta 521  Q
    | | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || ||||||||    
T  23574657 gtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgta 23574558  T
Q  522 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttct 621  Q
    | | |||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||  ||     | | || |||||||| |||||||| |||||||| || ||     
T  23574557 ttcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatcc 23574458  T
Q  622 atggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  23574457 atggattttgtgacgagttt 23574438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 317 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 21497080 - 21496780
Alignment:
Q  317 gtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtca 416  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21497080 gtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctaataaggatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtca 21496981  T
Q  417 taagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcatttt 516  Q
     |  || | ||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||    
T  21496980 cagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacctgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagttt 21496881  T
Q  517 gtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagca 616  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  21496880 gtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaaaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgagacagca 21496781  T
Q  617 t 617  Q
    |    
T  21496780 t 21496780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 41772174 - 41771524
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41772174 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 41772075  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||  ||||| | || | ||||  |||| |||| || ||| |  |    
T  41772074 cattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttatgaatggtcacctcagagcgtgaaact 41771975  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
     |||||||| |||||  ||||||| || ||||| | ||||   ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  |     
T  41771974 aggtatgctcaagattgatagtgaatttttgaaaaatatctaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagact 41771875  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  41771874 gaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaag 41771775  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  41771774 agagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 41771675  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||    
T  41771674 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgg 41771575  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  41771574 gatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 41771524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 23441515 - 23440983
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  23441515 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 23441416  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||| | || ||||||  | || |||| |||||| |  |||| |||||||||||  ||||||| ||    
T  23441415 gagagttcgaattacttgaacagtttagagatttgagtttagtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaagtgggaatgctgaagattgatagtgaatt 23441316  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  || |||| || || || |||||     
T  23441315 tatgaagagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgac 23441216  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || ||||||||||||||  |||     ||||| |||| |||| |||||||  |||||||  ||||| | || || |||||||  || | |||||||||||    
T  23441215 catggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcgtgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattc 23441116  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||| | |||||   |||    
T  23441115 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtagcacaatttgtgtattcttgtttagtttg 23441016  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  23441015 tcataagtcgaagattgaacatcagaaacctgc 23440983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 23472530 - 23471930
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  |    
T  23472530 gattatgattttgggttaaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaag 23472431  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| || |||||| | || || ||||||||| |||| |||||| || |||| ||||| |||||  ||| | | |||||    
T  23472430 agttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaaatgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgata-taaattctt 23472332  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||  | ||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| | || ||  ||| ||| || ||  | |||||        
T  23472331 gagcaatatcaaagaagcacagaaaactgatgttaagtttgtggacttgttggatactagtaattaggctgaagataatgattttaaaatcgatgatttg 23472232  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    || |||||| | ||| ||| || |||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| | | |||  || | ||| |||||||||     
T  23472231 ggagtgttgcgttttcgaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagatttatagaagtagcttaagtattcatc 23472132  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||  | || ||  | || || ||| | |||||||  |||||    
T  23472131 cgggagctagaacgatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgttatgtggcatagttggtatattcctgtttgatatgtca 23472032  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||| || ||| | ||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  23472031 gaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgataacacctttagatataccatagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagt 23471932  T
Q  640 tt 641  Q
    ||    
T  23471931 tt 23471930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 660
Target Start/End: Original strand, 37290550 - 37291200
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  37290550 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 37290649  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||  ||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || ||||||  ||||||| | |||||| |  |    
T  37290650 cattgcatatgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcatcttagagtgtgaaact 37290749  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||   |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||   ||||  |     
T  37290750 gggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaagaaagcacaaaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctaaagatcagact 37290849  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||  | ||  | |||| ||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||| ||||||  | | |||| ||||| | ||||    
T  37290850 gaagacagtgattttaaaatcgacaatcaagctgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacattgaagagattaggaagatgattcttgaag 37290949  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||| | || || |||||  ||||||| || || || ||    
T  37290950 agagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagccacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctagtttgaaacgagatgtggc 37291049  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | |||||    ||||||||||  || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| |||    
T  37291050 acagtttgtgtattcctgtttagtctgtcagaagtagaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgg 37291149  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  37291150 gatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaacactcctagaggg 37291200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 641
Target Start/End: Original strand, 20467179 - 20467782
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | || ||||| ||  ||||| | |    
T  20467179 aaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtcggaaaactctacatatgtccgctatgatgatca 20467278  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      ||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||||| | || |||||  ||||| |||| || ||| |||| || ||||| |||||  ||||||| ||    
T  20467279 aagagttagagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtttgtgagttgtcacctcagagcgtgaagttaggaatgctaaagattgatagtgaatt 20467378  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      ||| |||||| | | |||  ||  |||| ||||| |||||||| |||||| |  ||  | | |||||  | ||  ||||||| || ||||| |||||     
T  20467379 tctgactagtattaaaaaagg-cagaaagtggatgtaaagtttgtagatttatttattggtggaaatcagactgaagatagtgactttaaggtcgatgat 20467477  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || || |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| ||| | |  || | |||||||||||    
T  20467478 cagggagtgttgcgatttcgaggcaaaatttgtattcctgatgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtaacagaagtagcttgagtattc 20467577  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || ||||| || || || || || ||||| ||| ||||||||| |||    
T  20467578 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttggtttggtggtcggggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtatattcatgtttgatttg 20467677  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    | | ||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||||   ||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||     
T  20467678 ttaaaagtcaaaagttgagcattagaaacctgctgggttgatgacatctttagaagtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgaca 20467777  T
Q  637 agttt 641  Q
    |||||    
T  20467778 agttt 20467782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 21408445 - 21407839
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| || ||||| ||  |||||||    
T  21408445 taaaggattatgaattcggattgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatactttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggt 21408346  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgat 234  Q
     |  ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| | || |||||| ||||  | || ||| |  | ||||| ||| | || ||||| | |||     
T  21408345 taaagagttggagttgcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgcagagtctaaaattgggaatgtttaatatcaacattgaa 21408246  T
Q  235 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatg 334  Q
    || || ||||||||||  ||||| ||  | ||  |||| ||||| || ||||| ||||||   |  ||||| ||  |  ||||||| || || |||||||    
T  21408245 ttttttaatagtatcaaggaagctcagaaggtatatgtgaagttggtagattttatggttgggaacaatcaggctcaagatagtgactttaaagttgatg 21408146  T
Q  335 agcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtat 434  Q
    | ||||| |||||| | | | |  | |  ||||||||||||||  ||  || | |||| ||| ||||| ||||| ||||||| |  || || ||||||||    
T  21408145 atcaaggagtgttgcggtgtcggtatagcatttgtattcctgatgatacaggaatgaaaaagatgattctagaacaaagtcacagaagtaatttgagtat 21408046  T
Q  435 tcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgact 534  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| | |    
T  21408045 tcatgcaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaatttattttggtggtccgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatt 21407946  T
Q  535 tgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatga 634  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  || ||||  ||||| || ||| | || ||||||||||||||||  || || ||||||||| |||    
T  21407945 tgtcagaagtcaaaagttgaacaccagaaacctgttggtttgttgacacctttagatattccagagtggaagtgggataatatatccatggattttgtga 21407846  T
Q  635 cgagttt 641  Q
    |||||||    
T  21407845 cgagttt 21407839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 21882254 - 21881722
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||| |    
T  21882254 aaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagtaggaagacattgaatatgtccgctatgatggtta 21882155  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||  ||  |||| || || |||||   |||| |||| |||||| |  || | |||||||||||  ||||||| ||    
T  21882154 gagagtttgagttgcttgaacagtttacagatatgagcctagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgtgaatgctgaagattgatagtgaatt 21882055  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||  | ||  ||||| ||||||||||  | ||  || |||| || || || |||||     
T  21882054 tctgaagagtatcaaagaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtatacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaatgtcgatgac 21881955  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || ||||||||||| ||  |||     ||||||||||||||  ||| |||  |||||||  ||||| | ||| | |||||||  || | |||||||||||    
T  21881954 catggtgtgttgagtttccgaggtcgtatttgtattcctgattatgtagagatgaagaaaatgattcttgaatagagtcatagaagtagcttgagtattc 21881855  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    |  || ||||||| || ||||||||| || |||||||| | || || ||||| || ||||| | ||| ||||| || ||||||||| | |||||   |||    
T  21881854 acccgagagctacgaagatgtatcataatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacacgatgtcgcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 21881755  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  21881754 tcagaagtcaaagattgaacatcagaaacctgc 21881722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 641
Target Start/End: Original strand, 21338378 - 21338982
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||   |||| ||||| ||  ||||||| |    
T  21338378 aaagactatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagcaggaagatgctgcatatgtcagctatgatggtta 21338477  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      ||| | || ||||| ||||||||||  || |||||| | || ||  | ||||||||||| | |||| || | || |||| ||||||  ||| ||| ||    
T  21338478 aagagctcgagttgctggaacagtttaaagatttgagtttagtttgcaagatgtcatctcagaatgtgaagctaggaatgcagaagattgataatgaatt 21338577  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | || || | ||| || ||  | |||||     
T  21338578 tctgaaaagtattaaagaagcgcagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaaaacaatgattttaaaatcgatgat 21338677  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || || || ||||||||  |||  | |||||||||||  ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||    
T  21338678 cagggagtattgagattccgaggtagaatttgtattctagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 21338777  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||| || || || || || || |||||| | ||||| | |||    
T  21338778 acccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttcgtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagttcgtgtattcttgtttaatttg 21338877  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||| ||| | ||| ||     | | || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  21338878 tcaaaagtcgaaagttgagcatcagaaacctacggggatgatggtatctttagatgtgccagattggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacg 21338977  T
Q  637 agttt 641  Q
    |||||    
T  21338978 agttt 21338982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25427740 - 25427491
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  25427740 taaaagattatgattttgagttgagctatcatccgtgtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 25427641  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgat 234  Q
    || |||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||| | || ||||||||||||||| |||||||  || | || ||  |||||||  ||| |||     
T  25427640 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagaaatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtatagctaggaatcatgaagattgataatgaa 25427541  T
Q  235 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtgga 284  Q
    ||  |||| ||||| | ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||    
T  25427540 tttctgaagagtattaaagaagaacataaagttcatgttaagtttgtgga 25427491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18777128 - 18776857
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  18777128 aggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgattttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaaga 18777029  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || || || |||||||| || || |||||| | || ||||||  |||| |||| |  ||| |  |    
T  18777028 cattgcatatgtctgctttgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaact 18776929  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgt 281  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||| || ||  |||||||||| ||||||||    
T  18776928 gggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggctcagaaagttgatgtcaagtttgt 18776857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 23517768 - 23517395
Alignment:
Q  100 agtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaa 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||||  | || |||||    ||| |||| |    
T  23517768 agtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtgatcacctcaga 23517669  T
Q  200 gtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactag 299  Q
    ||||| |  |||| |||||||||||  ||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||    
T  23517668 gtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaagaagcacataaagttgatgtcaagtttgtagacttattggttgctag 23517569  T
Q  300 taatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttg 399  Q
    ||||||  | ||  || |||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||  |||    ||||||||||||| |  |||||||  |||||||  ||    
T  23517568 taatcagacagaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctaaagatgaagagatgaagaaaatg 23517469  T
Q  400 attttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaa 473  Q
    ||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||| |||||||    
T  23517468 attcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctatgaagatgtatcatgatctgaagaa 23517395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 90
Target Start/End: Original strand, 843 - 923
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgca 90  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  843 aggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgca 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 331 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 25424199 - 25423962
Alignment:
Q  331 gatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 430  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||| |||  |  ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || || ||||    
T  25424199 gatgatcaacgtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaa-ttga 25424101  T
Q  431 gtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgttt 530  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||| | |||||    
T  25424100 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgatgttgcacagtttgtgtattcttgttt 25424001  T
Q  531 gacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    || ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  25424000 gatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgc 25423962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 363 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 22349402 - 22349124
Alignment:
Q  363 aatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcat 462  Q
    |||||||||||  |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||   ||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  22349402 aatttgtattctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacgggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 22349303  T
Q  463 gatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaga 562  Q
    ||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||    
T  22349302 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 22349203  T
Q  563 agcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    | ||||| ||  ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  22349202 aacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacgagttt 22349124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 21497256 - 21497156
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21497256 aggcaaagaagatggcttgagttgttggaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaaga 21497157  T
Q  110 c 110  Q
    |    
T  21497156 c 21497156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 21872104 - 21872216
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||    
T  21872104 aggcagagaagatgacttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaaga 21872203  T
Q  110 cattgcacatgtc 122  Q
    | |||||||||||    
T  21872204 cgttgcacatgtc 21872216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 21876384 - 21876496
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||    
T  21876384 aggcagagaagatgacttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaaga 21876483  T
Q  110 cattgcacatgtc 122  Q
    | |||||||||||    
T  21876484 cgttgcacatgtc 21876496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 214 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 20800576 - 20800125
Alignment:
Q  214 atgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggaga 313  Q
    |||||||||||  | ||||| ||  |||| ||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||      
T  20800576 atgctgaagattgacagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaag 20800477  T
Q  314 atagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaag 413  Q
    || |||| || || || ||||| || ||||||||||||||  |||    |||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| | ||||| ||    
T  20800476 atggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagag 20800377  T
Q  414 tcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcat 513  Q
    |||||  || ||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| || ||||| || || || || ||     
T  20800376 tcatagaagtaacctgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacag 20800277  T
Q  514 tttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggata 613  Q
    ||||||||| | |||||   |||||||| ||| ||| || ||||| |||| ||||| ||  ||     | | || |||||||| |||||||| |||||||    
T  20800276 tttgtgtattcctgtttagtttgtcagaggtcgaagattaaacattagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggata 20800177  T
Q  614 gcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    | || || ||||||||| ||||| ||||||  || ||||| |||||| ||||    
T  20800176 gtatatccatggattttgtgacgcgtttaccgaatactcctagagggaatga 20800125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 364 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 18776748 - 18776543
Alignment:
Q  364 atttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatg 463  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |    
T  18776748 atttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacg 18776649  T
Q  464 atttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    |||| |||||| | || || ||||  |||||||| || || || || || ||||||||| | |||||   |||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  18776648 atttaaagaagattttctggtggtttggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcttgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaa 18776549  T
Q  564 gcctgc 569  Q
     |||||    
T  18776548 acctgc 18776543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 22381907 - 22381856
Alignment:
Q  616 atttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22381907 atttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatg 22381856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Original strand, 21936814 - 21936862
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21936814 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 21936862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 24581952 - 24581904
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24581952 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 24581904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 20777232 - 20777186
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgatttt 51  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20777232 acatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgatttt 20777186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 514 - 564
Target Start/End: Original strand, 25243908 - 25243958
Alignment:
Q  514 tttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaag 564  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25243908 tttgtgcatgcttgtttgatttgtcagaagtctaagattgaacatcagaag 25243958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 514 - 564
Target Start/End: Original strand, 25308060 - 25308110
Alignment:
Q  514 tttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaag 564  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25308060 tttgtgcatgcttgtttgatttgtcagaagtctaagattgaacatcagaag 25308110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20800717 - 20800659
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaa 80  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||||||    
T  20800717 tggctcgaattattgaaagattatgactttgatttgaattatcatccaggtaaagctaa 20800659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 27011826 - 27011782
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27011826 accgttgtttgtgccagagtggaagtgagatagcatttctatgga 27011782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 474; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 27901791 - 27901130
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27901791 acatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 27901692  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||     
T  27901691 gaagacattgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattacttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgta 27901592  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27901591 aagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtataagagaagcacaacaagttgatgcaaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 27901492  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27901491 aagctgaggatagagatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 27901392  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||     
T  27901391 agaagaaagtcataagagtaacttgagtattcatccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagagggat 27901292  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  27901291 gtcgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 27901192  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  27901191 aatgggacagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatgat 27901130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Original strand, 15002236 - 15002893
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  15002236 aggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 15002335  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||| || |||||  ||||| |||| ||||| |||||    
T  15002336 cgttgcacatgtcggctatgatggtaaaagagtttgagttgctatagcagtttagagactttagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagtt 15002435  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |     
T  15002436 gggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagatgatgtcaagtttgtggatttaatggttgctagtaatgaaact 15002535  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| ||||||    
T  15002536 gaagataatgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaaattgattctagaag 15002635  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| || || || ||    
T  15002636 aaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgc 15002735  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  15002736 tcattttgtctatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagtgttgttgacaccgttagatgtgccagagcggaagtgg 15002835  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    || | |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15002836 gagatcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 15002893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 11 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 15247323 - 15246667
Alignment:
Q  11 ggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagac 110  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  15247323 ggcagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgactttggtttgaattaccattcgggtaaagctaatgtggttgcagatgttttgagcaggaagac 15247224  T
Q  111 attgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttg 210  Q
     ||||||||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || | |||  || ||  ||| ||||| ||||||    
T  15247223 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgacacttcagagtgtacagttg 15247124  T
Q  211 ggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcgg 310  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| || ||||| |  | |    
T  15247123 gggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgacactg 15247024  T
Q  311 agaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaaga 410  Q
    |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |  | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | || ||    
T  15247023 aagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcaggggaagaatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattctggagga 15246924  T
Q  411 aagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgct 510  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |   |||| || || || |||    
T  15246923 aagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgagctgaaacgtgatgttgct 15246824  T
Q  511 cattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtggg 610  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15246823 cagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaagtggg 15246724  T
Q  611 atagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15246723 atagcatttctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 15246667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 37 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 33224296 - 33223666
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  33224296 aaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattacatatgtctgctttgatggtga 33224197  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
     ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || || |||||  || || |||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  33224196 aggaatttgaattgttagaacagtttagggacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaggattaatagtgattt 33224097  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
    ||||||||||| | ||||||| || ||||| ||  | |||||||| ||||| |||  |||||||||| |  | ||| |||  || ||||||||||||||     
T  33224096 cttgaatagtacccgagaagctcagcaagtagacttgaagtttgttgatttgatgactactagtaatgacactgaggataacgacttcaaggttgatgat 33223997  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || |||||  || | || ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  33223996 cagggtgttctgtggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcataagagtaggttgagtattc 33223897  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    |  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33223896 acccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccagtttgaaacgagatgttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttg 33223797  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||||    
T  33223796 tcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggaatggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacg 33223697  T
Q  637 agtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33223696 agtttaccgaacactccgagagggcatgatg 33223666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 5 - 663
Target Start/End: Original strand, 1648144 - 1648802
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||| ||||||||||| | ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||   ||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  1648144 acatgaggtagaggagatggttagagctgttgaaagactatgactttggtttgaattaccaccctaataaggctaatgttgtggcggatgcgttgagtag 1648243  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||||| ||| | || |||||  ||||| |||||||| |     
T  1648244 gaagacattgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagcttagagacttaagtttagtttgtgagttgtcacctcaaagtatt 1648343  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
     | || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| || || |||||     
T  1648344 aaatttgggatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcaacaggtggatgtaaaatttgttgatttaatgattgctggtaatg 1648443  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||| |    
T  1648444 aaactgagaatggtgatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagattcagaagcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaggttaattct 1648543  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||     
T  1648544 agaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagagggat 1648643  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||    
T  1648644 gtcgcacagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatatactggagtgga 1648743  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcat 663  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  1648744 aatgggacagcatttctatggattttgtaacgagtttacctaatactccgagagggcat 1648802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 43 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 8707287 - 8706661
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| || ||||    
T  8707287 tatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggttagagagt 8707188  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8707187 ttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcatagtgtgaagttgggtatgctgaagatcaacagtgagttcttgaa 8707088  T
Q  243 tagtatcagagaagcac--aacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaag 340  Q
     | ||| | |||||| |  |  |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| | ||  || |||| |||||||||||||| ||||    
T  8707087 caatattaaagaagcgcgcagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcaag 8706988  T
Q  341 gtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattc 440  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||| |    
T  8706987 gtgtgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaagtaacttaagtattcatcc 8706888  T
Q  441 gggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcag 540  Q
    | |||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8706887 gagagctacaaagatgtatcatgacttaaagaaattgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcag 8706788  T
Q  541 aagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtt 640  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||| | || ||||    
T  8706787 aaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaaatgagatagcatatccatggattttgtaacaagtt 8706688  T
Q  641 tacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||  || ||||| |||||||||||||    
T  8706687 taccgaatactccaagagggcatgatg 8706661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Original strand, 11206098 - 11206758
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||| ||||||| ||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  11206098 acatgaggtagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcag 11206197  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| |  || ||||||||| | |||||||| || ||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||| |     
T  11206198 gaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtata 11206297  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||| ||| | |||||||| ||||| |||  | |  |||||     
T  11206298 cagttggggatgttgaagattgatagtgatttcttgaacagtatctgagaagctcagaaagtggatttaaagtttgttgatttgatgacttcaggtaatg 11206397  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||  |   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  11206398 acaccgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagggtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattct 11206497  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| || || |  |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  11206498 tgaggagagtcacaatagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagat 11206597  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  11206598 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 11206697  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11206698 agtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 11206758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Original strand, 3263661 - 3264321
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  3263661 acatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtag 3263760  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||| | |||||||| || ||  ||||||| || |||||| ||||| | || ||| |     
T  3263761 gaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtata 3263860  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | |||||||| ||||| |||  | || |||||     
T  3263861 cagttgggaatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagaagatttgaagtttgttgatttgatgacttctggtaatg 3263960  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  3263961 acactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattct 3264060  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  3264061 tgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagat 3264160  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  3264161 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 3264260  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3264261 agtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 3264321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 667
Target Start/End: Original strand, 15413910 - 15414555
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  15413910 tggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatatgt 15414009  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    | ||  ||||||| |  || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15414010 cagctatgatggttaaagaatttgagttgctggagcattttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaa 15414109  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||||| | ||  | |||||     
T  15414110 gatcaatagtgagttcttgaatagtattaaagaagcacagaaggttgatattaagtttgtggatttgttggttgttagtaatcaaactgaagaaagtgat 15414209  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||  | ||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |    
T  15414210 ttcaaggttcatgatcagggtgtgttgagattctgaggaagaatttgtattcctcataatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaa 15414309  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgta 521  Q
    | |  || ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| || || || || || || ||||| ||    
T  15414310 gtagtttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggttttaaacgtgatgttgcacagtttgtata 15414409  T
Q  522 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttct 621  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||   | ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  15414410 tgcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgctgaaaccattagatgtgccagagtggaaatgggatagcatatcc 15414509  T
Q  622 atggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||| ||| | || |||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  15414510 atggactttgtaacaagtttactgaatacttcgagagggcatgatg 15414555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 37 - 548
Target Start/End: Original strand, 15358019 - 15358530
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||    
T  15358019 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaa 15358118  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
     ||| ||||| ||  |  | ||| |||| ||||||||||| || |||||| || || |||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||    
T  15358119 aggaatttgatttaatatagcagcttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcatagtgtacagttagggatgctgaagattaatagtgactt 15358218  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||    | ||| ||||||| || |||||||||||     
T  15358219 cttgaatagtatccgagaagcacagcaagtagatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgatgat 15358318  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  15358319 cagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagagtaaagtcacaagagtagcttaagtattc 15358418  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15358419 atccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaaactattttggtggtctggtttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttg 15358518  T
Q  537 tcagaagtctaa 548  Q
    ||||||||||||    
T  15358519 tcagaagtctaa 15358530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 128 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 15078917 - 15078379
Alignment:
Q  128 tgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaa 227  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15078917 tgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaa 15078818  T
Q  228 tagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaag 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||  |    || ||||||    
T  15078817 tagtgaattcttgaatagtatcagggaagcacagaaaattgatgtcaagtttgtggatttaatggatgctagtaatcaaactgaagaggaagatttcaag 15078718  T
Q  328 gttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaact 427  Q
    || |||||||| |||||||| || || ||||  | |||||| |||| ||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||  || | ||    
T  15078717 gtcgatgagcagggtgtgttaaggttcagaggaagaatttgcattcttgatagtgatgagttgaaaaagttgattctggaagaaagtcatagaagtagct 15078618  T
Q  428 tgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatg 527  Q
    | ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||| |||| ||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  15078617 taagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattattttggtggttcggattgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatg 15078518  T
Q  528 tttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggat 627  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  15078517 tttgatttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttaatgacaccattagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggat 15078418  T
Q  628 tttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  15078417 tttgtgacgagtttatcgaatactccgagagggcatgat 15078379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 20892387 - 20891727
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  20892387 acatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcag 20892288  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| |||||||| ||||| || || |||||||  || ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||| |     
T  20892287 gaaaacattgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttggaacagtttagagacttgagtctggtctgtgaattgtcacctcagagtata 20892188  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| |||||||||||   |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | || ||||| ||||| |||  |||| ||| |     
T  20892187 cagttggggatgctgaagattgttagtaatttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagcagatttgaaatttgttgatttgatgactactggtagtg 20892088  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    | || ||| ||||||| || ||||||||||| || ||| |  |||| || ||||| | | |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||| |    
T  20892087 acgctgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtttcctgaggttcagagaaagagtttgtatttctgacaacgatgatttgaagaagttgattct 20891988  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  20891987 tgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagat 20891888  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||||||||||    
T  20891887 gttgctcagtttgtttatgcttgcttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctacagggttgatgacaccgttggatgtaccggagtgga 20891788  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  20891787 agtgggacagtatctctatggatttcgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatga 20891727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 665
Target Start/End: Original strand, 44660741 - 44661393
Alignment:
Q  13 cagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 112  Q
    |||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| | ||| || |    
T  44660741 cagaggaggtggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaagaaaactt 44660840  T
Q  113 tgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttggg 212  Q
    |||| ||||| || || ||||||| ||| ||||||||| | |||||||| || ||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||||||    
T  44660841 tgcatatgtctgctttaatggtaaaggaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggg 44660940  T
Q  213 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggag 312  Q
     ||| |||| ||  |||| || |||||||| |||||| ||||||| ||  |||| ||| | |||||||| ||||| |||  | |  ||||| |  | |||    
T  44660941 aatgttgaaaattgatagcgacttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagtggatttgaagtttgttgatttgatgacttcaggtaatgataccgag 44661040  T
Q  313 aatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaa 412  Q
     ||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||  | | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || || |    
T  44661041 gatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggaga 44661140  T
Q  413 gtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctca 512  Q
    |||| ||||| |  |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | || || |||||    
T  44661141 gtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgctca 44661240  T
Q  513 ttttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggat 612  Q
     ||  | ||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44661241 gttcttttatgcctgtttgatctgtcagaagtccaaggctgagcatcagaagcctgcggggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggat 44661340  T
Q  613 agcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    || || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44661341 agtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 44661393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 16149116 - 16148580
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||| ||||||||||| | ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  16149116 acatgaggtagaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcag 16149017  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||  || || || ||| | || |||||||| |||||||| || || |||||| || || |||| ||| |     
T  16149016 gaagacattgcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtata 16148917  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||     
T  16148916 cagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatacgagaaactcagcaagtagatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatg 16148817  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || | ||  | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |    
T  16148816 gcactgaggatagtgactttaaagtcgatgatcagggtgtgttgaggttcataggaagaatttgtattcctgacaatgaagggttgaaaaagttgactct 16148717  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || |||||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  16148716 ggaggaaagtcacaagagcagcttaagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtccggcttgaagcgtgac 16148617  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaga 541  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16148616 gtcgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaga 16148580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 16153262 - 16152726
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||| ||||||||||| | ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  16153262 acatgaggtagaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcag 16153163  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||  || || || ||| | || |||||||| |||||||| || || |||||| || || |||| ||| |     
T  16153162 gaagacattgcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtata 16153063  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||     
T  16153062 cagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatacgagaaactcagcaagtagatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatg 16152963  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || | ||  | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |    
T  16152962 gcactgaggatagtgactttaaagtcgatgatcagggtgtgttgaggttcataggaagaatttgtattcctgacaatgaagggttgaaaaagttgactct 16152863  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || |||||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  16152862 ggaggaaagtcacaagagcagcttaagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtccggcttgaagcgtgac 16152763  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaga 541  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16152762 gtcgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaga 16152726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Original strand, 29452404 - 29453064
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  29452404 acatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtag 29452503  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||| | |||||||| || ||  ||||||| || |||||| ||||| | || ||| |     
T  29452504 gaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtata 29452603  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | |||||||| ||||| |||  | |  |||||     
T  29452604 cagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagaagatttgaagtttgttgatttgatgacttcaggtaatg 29452703  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||| ||| ||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||  | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  29452704 acactgaggataatgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattct 29452803  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  | ||     
T  29452804 tgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagagat 29452903  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||| | || || ||||| ||||||  |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  29452904 gttgctaagttcgtttatgcctgtttggtttgtcagaagtccaaggtggagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 29453003  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  29453004 agtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatga 29453064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 15320541 - 15319895
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| || ||||| || || || || ||||||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||    
T  15320541 acatgaggcagagaaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttggtatgaattatcacccaggtaaagctaatgtgattgcagatgctttgagcag 15320442  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || | |||  ||||| |||| ||||||    
T  15320441 gaagacgttgcacatgtctgctttgatggtaaaggattttgagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttatgagttgtcacctcagagtgtg 15320342  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||              ||  ||||| ||  || ||||||| | ||||||||||||||| |||||  |||||     
T  15320341 tagttgggtatgttgaagatcaatagtgat--------------caaggaagctcagaaaattgatgtcaggtttgtggatttaatagttacccgtaatt 15320256  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | ||  || ||||  ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||  |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  15320255 aaactgaagatggtgacctcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttacattcctgataatgatgagttgaaaaagttgatttt 15320156  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    | |||||||||| |  || | ||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||     
T  15320155 aaaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggacctacaaagatgtatcacgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgat 15320056  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||    
T  15320055 gttgcatagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttgaa-atcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgcgagagtgga 15319957  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  15319956 agtgggacaacatctccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgat 15319895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 12477991 - 12477350
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  12477991 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 12477892  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  12477891 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 12477792  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  12477791 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 12477692  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  12477691 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 12477592  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  12477591 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 12477492  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  12477491 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 12477392  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  12477391 tcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 12477350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Original strand, 14302599 - 14303240
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  14302599 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagatattgcata 14302698  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| | |||||||||||    
T  14302699 tgtccgctatgatggtcagagagttcgaatttcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgct 14302798  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||  | ||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  14302799 gaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaagggagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 14302898  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||| |||| || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  14302899 gattttaaaatcgatgaccaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaataaagagtttaagaagatgattcttgaagagagtcata 14302998  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  14302999 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 14303098  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||     
T  14303099 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtata 14303198  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  14303199 tccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 14303240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 641
Target Start/End: Original strand, 14850005 - 14850609
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||    
T  14850005 aaagactatgattttgggtttaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgctttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctgtgatggtaa 14850104  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      |||||||| ||||| || |||||||| ||  ||||  | || || ||  ||||| |||| |||||  |  || | ||||| |||||  ||||||| ||    
T  14850105 aagagtttgagttgcttgagcagtttagagatctgaggttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtaaaactgtgaatgctaaagattgatagtgaatt 14850204  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||    ||  |||| || || ||||| |||||     
T  14850205 cttgaacagtatcaaagaagcgcagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagattgaagatagagactttaaggtcgatgat 14850304  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| | |||||  || | |||||||||||    
T  14850305 caaggcgtgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagattcatagaagtagcttgagtattc 14850404  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||||| |||    
T  14850405 atccgggagctatgaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttg 14850504  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||| || ||||| || |||||||| ||||||| ||| || ||| ||||| ||| |    
T  14850505 tcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtggaaatgggataacatatccatgtattttgtgatg 14850604  T
Q  637 agttt 641  Q
    |||||    
T  14850605 agttt 14850609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 569
Target Start/End: Original strand, 8052244 - 8052794
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  8052244 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 8052343  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| | |||||||||||    
T  8052344 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgct 8052443  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  |  ||    
T  8052444 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacggt 8052543  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| | |||||    
T  8052544 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagattcata 8052643  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  8052644 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 8052743  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  8052744 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 8052794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 569
Target Start/End: Original strand, 19777414 - 19777964
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  19777414 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 19777513  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  19777514 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 19777613  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  19777614 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 19777713  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  19777714 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 19777813  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  19777814 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgattttaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 19777913  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  19777914 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 19777964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 23957147 - 23956497
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23957147 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 23957048  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| |  |    
T  23957047 cattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaact 23956948  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  | || |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  |     
T  23956947 gggtatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagact 23956848  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| |  |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  23956847 gaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatccaggacaatgaagagattaagaagatgattcttgaag 23956748  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  23956747 agagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 23956648  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| |||    
T  23956647 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgg 23956548  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  23956547 gatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 23956497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 8387803 - 8387162
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  8387803 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 8387704  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  8387703 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 8387604  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||   ||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||  ||||  | ||  | |||    
T  8387603 gaagattgatagtgaatttctgagaggtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagt 8387504  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  8387503 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 8387404  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  8387403 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 8387304  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  8387303 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 8387204  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  8387203 tcgatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 8387162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Original strand, 29038025 - 29038666
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  29038025 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 29038124  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  29038125 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 29038224  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  ||||  ||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||  ||||  | ||  | |||    
T  29038225 gaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagt 29038324  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  29038325 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 29038424  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  29038425 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 29038524  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  29038525 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 29038624  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  29038625 tcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 29038666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 40474440 - 40473790
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  40474440 aggcagcgtagatggctagacttactgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaga 40474341  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||  ||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  |    
T  40474340 cattgcatatgtccgctatgatggtcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaact 40474241  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
     ||||||||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  |     
T  40474240 aggtatgctgaaaattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacataaagctgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagact 40474141  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  40474140 gaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaag 40474041  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  40474040 agagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctatgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 40473941  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || |||||||| || ||||| |||    
T  40473940 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgg 40473841  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  40473840 gatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 40473790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 27712741 - 27712086
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||| | |||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  27712741 acatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtag 27712642  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || |||||||| || ||  ||||| | || ||||||  | || |||| || |||    
T  27712641 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggacacctcagagcgtg 27712542  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
     |  ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| || |||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  |||    
T  27712541 aaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatc 27712442  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    | || ||  | ||||| || ||  | ||  | |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| |    
T  27712441 aggctgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattct 27712342  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||| |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || ||     
T  27712341 tgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagat 27712242  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || || || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |  || ||     ||| || || ||||| || ||||    
T  27712241 gtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctactaggatgatggtacctttagacgtgccagaatgga 27712142  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    | |||||||| || || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  27712141 aatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 27712086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 18298596 - 18297955
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  18298596 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 18298497  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||  | ||  ||||| | || ||||||  |||| |||| || ||| |  ||||||||||    
T  18298496 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgct 18298397  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  ||||  | |||    
T  18298396 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagacggaagacagt 18298297  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| ||||||||||| |||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  18298296 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgtttagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 18298197  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  18298196 gaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 18298097  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   ||||| |||||| || || || |||||||| || || ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  18298096 gtattcctgtttagtttgtcggaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 18297997  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  18297996 tccatgaattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 18297955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 14160875 - 14160311
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  14160875 acatgaggcagagaagatggcttgagttactgaaggattttgattttggcttgaattatcatccgggtaaagcgaatgtcgtagctgatgccttaagtag 14160776  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
     ||||| ||||| ||||| ||  ||||||| | ||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||| | || || ||| |||| ||||| |||||     
T  14160775 aaagaccttgcatatgtccgctatgatggttaaggagtttgaattgctagaataatttagagatttgagtttggtctgcgaattgtcgtctcagagtgta 14160676  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
     |||| || |||||||||||  ||| ||| ||  | || ||||| |  ||||||||  ||| ||||||||| |||||||| ||  ||||| ||  |||||    
T  14160675 aagttaggaatgctgaagattgataatgaatttctaaagagtattaaggaagcacagaaagatgatgttaaatttgtggacttgttggttgctgataatc 14160576  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||  ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||  | |  | |||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||| |    
T  14160575 agtcagaagatagtgactttaaagttgatgaccaaggagtgttgagattccgcggtagaatttgtattccagacaatgatgagatgaagaagatgattct 14160476  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||| || |||  ||| | ||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || ||     
T  14160475 tgaagagagccatcggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgat 14160376  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    || || || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  14160375 gtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 14160311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 14681967 - 14681408
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||  ||||| || || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14681967 aggcagaggatgtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 14681868  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| || || || |||||||| || ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  |    
T  14681867 cattgcatatgtccgttttgatggttagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaact 14681768  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  | ||| ||||  ||||  |     
T  14681767 gggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttagtttctagagatcagact 14681668  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  14681667 gaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaag 14681568  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||| | |||||||| || || || ||    
T  14681567 agagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggcctggtttgaaacgagatgtggc 14681468  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  14681467 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgc 14681408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 14695486 - 14695051
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| ||  ||||| |||    
T  14695486 aaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagaagttgcatatgtccgctatgatgttaa 14695387  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      |||||||| |||||  || | ||||| || |||||| | || || ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||||| |||||  ||||||| ||    
T  14695386 aagagtttgagttgcttaaaaaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtgaatt 14695287  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
    |||||| ||||||| ||||||  |  || | ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||| || | ||  ||||||| || ||  | |||||     
T  14695286 cttgaacagtatcaaagaagcgtagaaaatagatgttaagtttgtggacttgttggtttctagtaattaaactgaagatagtgattttaaaatcgatgat 14695187  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || || |||||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||| ||    
T  14695186 cagggagtgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatataagtagcttgagtactc 14695087  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaaga 472  Q
    || |||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  14695086 atccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaaga 14695051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 51605664 - 51605957
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  51605664 aggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaaga 51605763  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    || | || ||||| ||  ||||| | |  || ||||| ||  | ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||  ||||  |||||||  | |||||    
T  51605764 cactccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagtttggtgtgtgagttgtcgcctcaaagcatacagtt 51605863  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaat 303  Q
    ||| ||||| ||||| || || |||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||| |||||    
T  51605864 ggggatgctaaagattaacagcgatttcctgaatagtattcgagaagcacagcaagtggatgtcaagttggttgatctaatggttactggtaat 51605957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Original strand, 15146524 - 15147056
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  15146524 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtta 15146623  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||  | || |||||   ||||||||| |||||| |  | || ||| |||||||  ||||||| ||    
T  15146624 aagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcatctcagagtgtgaaactaggaatgttgaagattgatagtgaatt 15146723  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||| |  ||||||||  |||||||||| |||||||| || ||| ||||  ||||||||||  | ||  |  ||||||| ||||| ||| |     
T  15146724 tctgaaaagtatgaaggaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttattggtagctagtaatcagactgaagaaggtgaatttaaggtcgataaa 15146823  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || ||||||||||||||  |||    ||| |||||||||||  |||||||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||    
T  15146824 catggtgtgttgagattccgaggtcgaatatgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 15146923  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || |||||||||||| |||||||| | || || | ||| || |||||  |||| || || || ||||||||| | | ||||  |||    
T  15146924 atccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagatattctggtcgtctggattgaaatgcgatgtggcacagtttgtgtattcctatttggtttg 15147023  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  15147024 tcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgc 15147056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 569
Target Start/End: Original strand, 18226058 - 18226617
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| || || || ||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  18226058 aggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactatggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaaga 18226157  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||  ||||||| || || |||| ||| || || |||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| | ||    
T  18226158 cattgcatatgtcagctttgatggttagaaagtttgagttacttgaacggttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaatt 18226257  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||| |||||  || ||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  |     
T  18226258 gggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacataaatttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagact 18226357  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  |  |||| || || || || ||||| ||||||||||||||  |||     ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||    
T  18226358 gaagacggtgactttaaagtcgacgagcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagatatgaagaaaatgattcttgaag 18226457  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||  |||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  18226458 agagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacaatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 18226557  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  18226558 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgc 18226617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 12525076 - 12524517
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| || ||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12525076 aggcagagaagatggcttgaattgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 12524977  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||  ||  ||||||| || ||||| || || || |||||||| || ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  |    
T  12524976 cattgcatatgttcgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaact 12524877  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  |     
T  12524876 gggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagact 12524777  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
     |  | ||||| || ||  | |||||  ||||||||||||||||  |||  | |||||||||||| ||| ||| |||  | ||| || ||||| | ||||    
T  12524776 aaagacagtgattttaaaatcgatgatgaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacgatggagagattaaggagatgattcttgaag 12524677  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | ||||| |  || | ||||||||| ||| ||| |||||| || |||||||| ||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  12524676 agagtcacagaagtagcttgagtatccatccggaagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 12524577  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
     |  ||||||||| | ||||||  |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  12524576 acggtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 12524517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15071759 - 15071605
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15071759 aggcagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaaga 15071660  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttag 164  Q
    | ||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||    
T  15071659 cgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttag 15071605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 569
Target Start/End: Original strand, 16354069 - 16354616
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16354069 tggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 16354168  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    | ||  ||||||| || ||||| || || ||  | |||||||| ||  ||||  | || |||||   |||| |||| |||||| |  |||| ||||||||    
T  16354169 ccgctatgatggttagagagttcgagttacttaagcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaa 16354268  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    |||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||  ||| ||||||  | ||  || ||||     
T  16354269 gattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggtagctaataatcagaccgaagatggtgac 16354368  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    || ||||| ||||| || | |||||| |||||  |||   | ||||| |||||| ||  ||||||  |||||||  | ||| | ||||| |||||||  |    
T  16354369 tttaaggtcgatgaccatgatgtgttaagattccgaggtcagatttgaattcctaacggtgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaa 16354468  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgta 521  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||| | | || || ||||| || ||||| || || || || || ||||||||    
T  16354469 gtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagatgattttctggtggtctggattgaaacgagatgtggcacagtttgtgta 16354568  T
Q  522 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    | | | |||   |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  16354569 ttcctatttagtttgtcacaagtcgaagattgaacatcagaaacctgc 16354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 305
Target Start/End: Original strand, 18614466 - 18614731
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  18614466 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagcatgaagacattgcatatgtccgctttgatggttagag 18614565  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    ||||||| || || ||||| || || || |||||| |  | ||||||  |||| |||| |  ||| |  |||| |||||||||||  ||||||| ||  |    
T  18614566 agtttgagttacttgaacaattcagagatttgagtttaatttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttct 18614665  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatca 305  Q
    ||| ||||| | ||| |||||  || ||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  18614666 gaagagtattaaagaggcacagaaatttgatgtcaagtttgtagatttattggttgctagtaatca 18614731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 337 - 641
Target Start/End: Original strand, 1639364 - 1639668
Alignment:
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    |||||||||||||| ||| |||  | |||||||||| | |||||||||||  | ||| || ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||    
T  1639364 caaggtgtgttgaggtttcgaggtagaatttgtatttcagacaatgaagagattaaggagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 1639463  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    |  || ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| || || || ||  ||||||||||| | ||||||  |||    
T  1639464 acccgagagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcatattttgtgtattcttgtttggtttg 1639563  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    ||| ||||| || || || |||||||| ||||| ||  ||     ||| || ||| | || |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  1639564 tcaaaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatataccagagtggaagtgggatagcatatccatggattttgtgacg 1639663  T
Q  637 agttt 641  Q
    |||||    
T  1639664 agttt 1639668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 517 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 14691795 - 14691671
Alignment:
Q  517 gtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagca 616  Q
    |||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  14691795 gtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcaaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgatgacaccgttagatgtaccagagtggaaatgggatagca 14691696  T
Q  617 tttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    | || ||||||||| ||||||||||    
T  14691695 tatccatggattttgtgacgagttt 14691671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 585 - 667
Target Start/End: Original strand, 15358537 - 15358619
Alignment:
Q  585 gttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15358537 gttggatgtgccggagtggaaatgggacagtatttctatggattttctgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 15358619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 331 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 7091511 - 7091273
Alignment:
Q  331 gatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 430  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||  |  ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| || ||||  || ||||| |    
T  7091511 gatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtatgatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattattgaagagagccatagaagtaacttaa 7091412  T
Q  431 gtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgttt 530  Q
    ||||| || |||||||||| || |||||||||||| | |||| | ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | |||||    
T  7091411 gtatttatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaggttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacaatttgtgtattcttgttt 7091312  T
Q  531 gacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    || || |||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  7091311 gatttatcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgc 7091273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Original strand, 15292602 - 15292650
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15292602 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 15292650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 630
Target Start/End: Original strand, 12342317 - 12342356
Alignment:
Q  591 tgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12342317 tgtgccggagtggaagtgggatagcatctctatggatttt 12342356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 582 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 9291663 - 9291619
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9291663 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 9291619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 537 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16146497 - 16146459
Alignment:
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggtt 575  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16146497 tcagaagtctaaggtagaacgtcagaagcctgcagggtt 16146459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 520 - 564
Target Start/End: Original strand, 12342247 - 12342291
Alignment:
Q  520 tatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaag 564  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12342247 tatgcttgtttgatttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaag 12342291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 466; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 68806 - 68145
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68806 acatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 68707  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||     
T  68706 gaagacattgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaatttcttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcagagtgta 68607  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68606 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgctaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 68507  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68506 aagctgaggatagagatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 68407  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | ||     
T  68406 agaagaaagtcataagagtaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgtttttgtggtctggtttgaagagggat 68307  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||| | ||||||||    
T  68306 gtcgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctacagggttgttgacaccgttggatgtactggagtgga 68207  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | ||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  68206 aatgggacaacatttctatggactttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatgat 68145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 3823 - 4485
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3823 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccacccgggtaaagctaatgtggttgcagatgccttgagtag 3922  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
     ||||| ||||| ||||| || |||||||| |  || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||| || || || | |||||     
T  3923 caagacgttgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagagcattttagagacttgagtcttgtttgtgaattgacaccttagagtgta 4022  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| || |||||     
T  4023 cagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaactagtagatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatg 4122  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||||| || || || | ||| |||||    
T  4123 gcactgaggatagtgagtttaaggtggatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttcaaaaggttaatttt 4222  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4223 agaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcattcgggagctacaaagatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgac 4322  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4323 gtcgctcaatttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaaaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 4422  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4423 agtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 4485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 12778 - 13433
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12778 acatgaggcagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcag 12877  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||| |||||  | |||||||| | | | ||||||||||| |||| ||||||       ||||| || |||||  ||||| |||| ||| |     
T  12878 gaagacattgcatatgtctcctttgatggtgaagcaatttgaattgctagaactgtttag-------agtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtata 12970  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |  |||||     
T  12971 cagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatacgagaagcacaacaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgcgggtaatg 13070  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  | |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  13071 gcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgatttt 13170  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  13171 agaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgat 13270  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||    
T  13271 gttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcacaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacgccgttagatgtgccggagtgga 13370  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||| | || |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13371 agtgggacaatatttctatggattttgtaacaagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 13433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Original strand, 27209579 - 27210240
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27209579 acatgaggcaaaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagtcgcagatgcgttgagtag 27209678  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  27209679 aaagacattgcacatgtccgccttgatggtaaaggaattcgaattgctcgaatagtttagagacttgagtctcgtatgtgaattatcatctcaaagtgtg 27209778  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27209779 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgtggattttatggttactagtaatc 27209878  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    | || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27209879 aggctgagaatagtgatttcaagattgatgagcaaggtgtgttgagatttagaggcaaaatctgtattcctgacaataaagaattgaagaagttgatatt 27209978  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||   ||     
T  27209979 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggat 27210078  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  27210079 gtcgctcgttttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 27210178  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||  || |||||||| |||||||||    
T  27210179 aatgggatagcatttatatggattttgtgataagtttacctaatactccgagggggcatgat 27210240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 23294971 - 23294315
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||| ||    
T  23294971 acatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatttggtggcagatgcgttgagcag 23294872  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||| ||||| || || |||||||  || ||||| ||| |  | |||||||| |||||||| || || |||||| || || |||| ||| |     
T  23294871 gaagacgttgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgatttgttatagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatt 23294772  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
     ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||     
T  23294771 aagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcagtaagtggatgtgaagtttgtggatttaatggttgctggtaatg 23294672  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||  ||||  | ||||| ||||| ||| |    
T  23294671 aagctgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcctgatgatgataatttgaaaaagttaattct 23294572  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  23294571 agaggaaagtcacaagagtagcttgaatattcatccgggagcaacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagtgtgac 23294472  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  23294471 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgaa 23294372  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggc 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23294371 agtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttacctaacactccgagagggc 23294315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 23277812 - 23277150
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23277812 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtag 23277713  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||||||  || |||||  ||||  | |||||||| ||||||||||| || |||||  || || |||| |||||     
T  23277712 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatctgctatagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtt 23277613  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||     
T  23277612 cagttggggattctgaagattaacagtgacttcttgaatagtatccgagaagcgcagcaagtagatgtgaagttcgttgatttgatggttgttggtaatg 23277513  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | ||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  23277512 aaactgaagatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaatttt 23277413  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||    
T  23277412 agaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccggtttgaagcatgac 23277313  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  23277312 gtcgctcaatttgtatatgcgtgcttgagttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacactgttagatgtgccggaatgga 23277213  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  23277212 agtgggatagcatttctatggattttgtgacgattttaccgaacactccaagagggcatgatg 23277150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 24949626 - 24948963
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24949626 acatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtag 24949527  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| |  || ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || || |||||| || ||  ||| |||||     
T  24949526 gaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacttcagagtgtt 24949427  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||| |||  |||||| |||| || |||||     
T  24949426 cagttggggatgctgaagattatcagtgatttcttagatagtatccgagaagcacagaaagtggatgtgaagtatgttaatttaagggttgctggtaatg 24949327  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggt-gtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattt 403  Q
       |  || || |||| |||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||  | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||||||||    
T  24949326 gcactaaggatcgtgacttcaaggttgatgatcatggttgtgatgagattcagaggaagaatttgcattcctcatgatgatggtttgaaaaagttgattt 24949227  T
Q  404 tagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcga 503  Q
    |||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  24949226 tagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccagtttgaagcgtga 24949127  T
Q  504 cgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgg 603  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| |    
T  24949126 cgttgctcattttgtgtatgcatgtttgacttatcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgatatcgttggatgtgccggagttg 24949027  T
Q  604 aagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24949026 aaatgggataggatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 24948963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 19651457 - 19652121
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  19651457 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcctaggaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtag 19651556  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| ||  |||| ||||| || |  ||||| |  || || || |||||  | ||||| || || |||||||| || |||||| || || |||| |||||     
T  19651557 gaaaacgctgcatatgtctgcttcaatggtgaaagaattcgatttgctatagcagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtt 19651656  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||| || |||||     
T  19651657 caattggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgcagcaagtggatgtgaagtttgttgatttgatagttgctggtaatg 19651756  T
Q  305 aagcggagaatagtg--aattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatt 402  Q
         ||| ||||||  | |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||  | |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  19651757 gcattgaggatagtgtgacttcaaggtggatgatcggggtgtattgagattcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgatt 19651856  T
Q  403 ttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcg 502  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  19651857 ttagaagaaagtcacaagagtagcttgaatattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgatttggtggtccggtttgaagcgtg 19651956  T
Q  503 acgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtg 602  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19651957 atgttgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaacgttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtg 19652056  T
Q  603 gaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  19652057 gaagtgggacagtatttctatggatttagtgacaagtataccgaacactccgagagggcatgatg 19652121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 10 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 27788771 - 27788116
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  27788771 aggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaaga 27788672  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    || | || ||||| ||  ||||| | |  || ||||| ||  | ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||  ||||  |||||||  | |||||    
T  27788671 cact-catatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagtttggtgtgtgagttgtcgcctcaaagcatacagtt 27788573  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||||| ||||| || || |||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||| |||||          
T  27788572 ggggatgctaaagattaacagcgatttcctgaatagtattcgagaagcacagcaagtggatgtcaagttggttgatctaatggttactggtaatagtatt 27788473  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  |||| |    
T  27788472 gaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagagg 27788373  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||    
T  27788372 aaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgc 27788273  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  27788272 tcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgg 27788173  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  27788172 gatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgat 27788116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 12575384 - 12574728
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  12575384 aggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaaga 12575285  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    || |||| ||||| ||  ||||| | |  || ||||| ||  | ||||||||||| ||| ||||| | || |||||  ||||  ||||||| || |||||    
T  12575284 cactgcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagtttggtatgtgagttgtcgcctcaaagcgtacagtt 12575185  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||| || ||| |          
T  12575184 ggggatgctaaagattaacagtgatttcctgaatagaatccgagaagcacaacaagtggatgtcaagttagttgatctaatggttgctggtagtggtatt 12575085  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||  | | ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  |||| |    
T  12575084 gaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgcttagattcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagagg 12574985  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||||| || || ||    
T  12574984 aaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaagagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgc 12574885  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  12574884 tcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgg 12574785  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  12574784 gatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgat 12574728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 235 - 666
Target Start/End: Original strand, 27364716 - 27365147
Alignment:
Q  235 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatg 334  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  27364716 ttcttgaatagtatcaaagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatg 27364815  T
Q  335 agcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtat 434  Q
    | |||||||||||||  || |||| || |||||| ||||||||||| || ||  |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27364816 aacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtat 27364915  T
Q  435 tcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgact 534  Q
     ||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27364916 ccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgact 27365015  T
Q  535 tgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatga 634  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  27365016 tgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatataccggagtggaaatgggatagtatttctatggattttgtga 27365115  T
Q  635 cgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  27365116 caagtttacctaatactccgagaggacatgat 27365147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 31831694 - 31831034
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  31831694 acatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtag 31831595  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || || |||||||| || |||||||| | ||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||| || |||||| ||||| | || ||| |     
T  31831594 gaaaactttacacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtata 31831495  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||  |||  ||| | |||||||| ||||| |||  | || |||||     
T  31831494 cagttgggaatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgaggagctcagaaagaagatttgaagtttgttgatttgatgacttctggtaatg 31831395  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||  | | ||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |    
T  31831394 acactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaggagttaaagaagttgattct 31831295  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||     
T  31831294 tgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtatgaaaagagat 31831195  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  31831194 gttgctcagtttgtttatgcatgtttgatttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 31831095  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  31831094 agtgggacagtatctccatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagggggcatga 31831034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 40 - 392
Target Start/End: Original strand, 23099460 - 23099812
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  23099460 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaagg 23099559  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23099560 aatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctggtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtgatttctt 23099659  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||    
T  23099660 gaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtcaagtttgtggatttattggttactagtaatcaagctgaggctagtgatttcaaggttgatgaacaa 23099759  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaa 392  Q
    || |||||||| || |||| || ||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23099760 ggcgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaa 23099812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 1064787 - 1064127
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  1064787 acatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtag 1064688  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||| | |||||||| || ||  ||||||| || |||||| ||||| | || ||| |     
T  1064687 gaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtata 1064588  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||  ||||||| ||  |||  ||| | |||||||| ||||| |||  | |  |||||     
T  1064587 cagttgggaatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagctcagaaagaggatttgaagtttgttgatttgatgacttcaggtaatg 1064488  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||  |||| || ||||  | | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  1064487 acactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctaacaatgaagagttgaagaagttgattct 1064388  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  1064387 tgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggat 1064288  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  1064287 gttgctcagtttgtttatgcctgtttggtttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 1064188  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1064187 agtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 1064127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 43 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 23111734 - 23111109
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  ||||    
T  23111734 tatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagccaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagt 23111635  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    || | ||||| ||| ||||||| ||  ||||||| || |||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  23111634 tttagttgcttgaagagtttagagatctgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagattgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgaattcttgaa 23111535  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggaga-atagtgaattcaaggttgatgagcaagg 341  Q
     ||||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |  ||| || |||| |||||||||||||| || ||    
T  23111534 cagtattaaagaagcacagaaatttgatgttaagtttgtggatttgttggttgctagtaatcaaact-agagatggtgacttcaaggttgatgatcaggg 23111436  T
Q  342 tgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga-gtattcattc 440  Q
    | ||||||||||  ||| || |||||  |||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |  || | ||| | |||||||| |    
T  23111435 tatgttgagattctgaggcagaattttcattcttgacagtgatgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacataagtagctttaagtattcatcc 23111336  T
Q  441 gggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcag 540  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| || ||| | || || || || ||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  23111335 gggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggatttaagtgtgatgttgcacagtttgtatatgcatatttgacttgccag 23111236  T
Q  541 aagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtt 640  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||| | || ||||    
T  23111235 aaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaaatgggataacatatccatggattttgtaacaagtt 23111136  T
Q  641 tacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||  || ||||| |||||||||||||    
T  23111135 tacccaatactccaagagggcatgatg 23111109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 20829295 - 20828635
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  20829295 acatgaggcagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtgaggccaatgtggttgctgatgctttgagtag 20829196  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||| | |||||||| || ||  ||||||| || |||||| ||||| | || ||| |     
T  20829195 gaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtata 20829096  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | |||||||| ||| | |||  | || ||||      
T  20829095 cagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagaagatttgaagtttgttgatctgatgacttctggtaacg 20828996  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  20828995 acactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattct 20828896  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||     
T  20828895 tgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttaaaaagggat 20828796  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  20828795 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgttagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 20828696  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||    
T  20828695 agtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagggggcatga 20828635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 24711056 - 24710415
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24711056 agatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 24710957  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  24710956 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 24710857  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  24710856 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacaaaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 24710757  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||  | |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  24710756 gattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 24710657  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  24710656 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 24710557  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||     
T  24710556 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtata 24710457  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  24710456 tcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 24710415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 16926382 - 16925741
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16926382 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 16926283  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  16926282 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagtgtgaaactgggtatgct 16926183  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  16926182 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 16926083  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  16926082 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 16925983  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  16925982 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtagcacagtttgt 16925883  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| || || ||| ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||     
T  16925882 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtata 16925783  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
     | ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  16925782 acgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 16925741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 17000022 - 16999381
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  17000022 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 16999923  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  16999922 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagtgtgaaactgggtatgct 16999823  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  16999822 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 16999723  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  16999722 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 16999623  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  16999622 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtagcacagtttgt 16999523  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| || || ||| ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||     
T  16999522 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtata 16999423  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
     | ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  16999422 acgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 16999381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 370 - 665
Target Start/End: Original strand, 11357646 - 11357941
Alignment:
Q  370 attcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttga 469  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |  |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||    
T  11357646 attcctgacattgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgacttga 11357745  T
Q  470 agaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11357746 agaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgc 11357845  T
Q  570 agggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11357846 agggttgttggcaccgttagatgtaccggagtggaagtgggatagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 11357941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 314 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 20833712 - 20833361
Alignment:
Q  314 atagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaag 413  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||    
T  20833712 atagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagag 20833613  T
Q  414 tcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcat 513  Q
    ||| ||||| |  |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | || || |||||     
T  20833612 tcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttaaaaagggatgttgctcag 20833513  T
Q  514 tttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggata 613  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  20833512 tttgtttatgcctgtttgatttgttagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggaca 20833413  T
Q  614 gcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||    
T  20833412 gtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagggggcatga 20833361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 27372291 - 27371650
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27372291 agatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 27372192  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  27372191 tgtccgccatgatggtcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 27372092  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| | |||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  27372091 gaagattgatagtgaatttctgaaaaatatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 27371992  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  27371991 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 27371892  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  27371891 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 27371792  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  27371791 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 27371692  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  27371691 tccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 27371650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 10869881 - 10869250
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | ||||||||||| || || || |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  10869881 aggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtctgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 10869782  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| || ||| |  |    
T  10869781 cattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagagtgaaact 10869682  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||  ||||  |     
T  10869681 gggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagact 10869582  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || ||| |||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  10869581 gaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaag 10869482  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  10869481 agagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 10869382  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||    
T  10869381 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgg 10869282  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  10869281 gatagtatatcgatggattttgtgacgagttt 10869250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 569
Target Start/End: Original strand, 41607806 - 41608356
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  41607806 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 41607905  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  41607906 tgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 41608005  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  41608006 gaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcgcagaaagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 41608105  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||  | |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  41608106 gattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 41608205  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  41608206 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacaatttgt 41608305  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  41608306 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgc 41608356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 16923911 - 16923270
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16923911 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 16923812  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  16923811 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 16923712  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  ||||  ||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||  ||||  | ||  | |||    
T  16923711 gaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcacaggaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagt 16923612  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  16923611 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 16923512  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  16923511 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 16923412  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| || || ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  16923411 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 16923312  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  16923311 tccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 16923270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 16983174 - 16982533
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16983174 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 16983075  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  16983074 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 16982975  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  ||||  ||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||  ||||  | ||  | |||    
T  16982974 gaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcacaggaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagt 16982875  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  16982874 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 16982775  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  16982774 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 16982675  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| || || ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  16982674 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 16982575  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  16982574 tccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 16982533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 17064739 - 17064098
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  17064739 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 17064640  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  17064639 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 17064540  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  ||||  ||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||  ||||  | ||  | |||    
T  17064539 gaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcacaggaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagt 17064440  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  17064439 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 17064340  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  17064339 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 17064240  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| || || ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  17064239 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 17064140  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  17064139 tccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 17064098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 27219038 - 27218397
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27219038 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 27218939  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| || ||| |  |||||||| |    
T  27218938 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaatagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgtt 27218839  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  ||||  | |||    
T  27218838 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagacggaagacagt 27218739  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  27218738 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 27218639  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| ||||| || || || || || || |||||    
T  27218638 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttaaaacgagatgtggcacagtttgt 27218539  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||     ||| ||  | ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  27218538 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttacacgtgccagaatggaaatgggatagtata 27218439  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  27218438 tcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 27218397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 508 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 24642275 - 24642116
Alignment:
Q  508 gctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagt 607  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  24642275 gctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttggcaccgttggatgtgccggagtggaagt 24642176  T
Q  608 gggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24642175 gggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 24642116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Original strand, 22324277 - 22324918
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22324277 agatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 22324376  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||  ||||| | || ||||||  |||| |||| || ||| |  | ||||||||    
T  22324377 tgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactaggtatgct 22324476  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  |||| || ||  | |||    
T  22324477 gaagattgatagtgaatttctgaacagtatcaaggaagcgcagaaagttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcaggctgaagacagt 22324576  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||  | |||||||||||||||||  |||  | ||||||| | || || ||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  22324577 gattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtgtcccagataatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 22324676  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || |  |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  22324677 gaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 22324776  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  22324777 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 22324876  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  22324877 tccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 22324918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Original strand, 21144480 - 21145012
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  21144480 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 21144579  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| || || || |||||||| || ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||  |||| || ||    
T  21144580 gagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagcgaatt 21144679  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||  | ||  | ||||| || ||  | |||||     
T  21144680 tctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttattggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgat 21144779  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    |||||||||||||||||  |||  | |||||||||||| |||||||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||    
T  21144780 caaggtgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacaatgaggagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 21144879  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || ||||||||| | |||||   |||    
T  21144880 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 21144979  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  21144980 tcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgc 21145012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 497
Target Start/End: Original strand, 44384993 - 44385468
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  44384993 tggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 44385092  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    | ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  |||||||||| ||    
T  44385093 ccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctaaa 44385192  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    |||  ||||||| ||  |||| | |||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||||     
T  44385193 gattgatagtgaatttctgaaaaatatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgat 44385292  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    || ||  | ||||| ||||||||||||| |||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  |    
T  44385293 tttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaaattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaa 44385392  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaa 497  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| ||||||||    
T  44385393 gtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 44385468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 577
Target Start/End: Original strand, 30210355 - 30210895
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||  || ||||| ||  |||||||    
T  30210355 taaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtatggctaatgttgttacagatgctttaagtaggaaaacata-catatgtctgctatgatggt 30210453  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgat 234  Q
     || ||||| || |||||  ||||||| || ||||||||| | || |||||| ||||  | || |||||| | ||||| ||| |||||||||| |   |     
T  30210454 tagagagttggagttgctttaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacagagtgtgaaattggggatgttgaagatcaacaacaaa 30210553  T
Q  235 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatg 334  Q
    || ||| ||||||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||| ||||||   | ||||||  | ||  ||||||| || || |||||||    
T  30210554 tttttggatagtatcaaagaggctcagaaggtggatgtgaagttggtagatttcatggttggcaataatcagactgaagatagtgattttaaagttgatg 30210653  T
Q  335 agcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtat 434  Q
    | ||||| |||||| | |||   || | |||||||||||||||  ||  |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| || || || ||||||||    
T  30210654 atcaaggagtgttgcggtttcaggatagaatttgtattcctgatgatacagaaatgaaaaagatgattctagaagaaagtcacaaaagtaatttgagtat 30210753  T
Q  435 tcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgact 534  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| | |    
T  30210754 tcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttg-tttggtggtccgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatt 30210852  T
Q  535 tgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgt 577  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30210853 tgtcagaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgctgggttgt 30210895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 363 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 45530189 - 45529911
Alignment:
Q  363 aatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcat 462  Q
    |||||||||||||||  ||  |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |  || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45530189 aatttgtattcctgatgatacagaaatgaaaaagatgattctagaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcat 45530090  T
Q  463 gatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaga 562  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  45530089 gatttgaagaagttgttttggtggtccgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgaacatcaga 45529990  T
Q  563 agcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    | ||||| |||||||  ||||| || ||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  45529989 aacctgctgggttgttgacacctttagatgttctagagtggaagtgggatagtatgtccatggattttgtgacgagttt 45529911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 24263392 - 24262751
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24263392 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 24263293  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  |||||   || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| || | |||||| | |||||||||||    
T  24263292 tgtccgctatgatgaccagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcaccttagagtgtgaaattgggtatgct 24263193  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  24263192 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 24263093  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||  | |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | |||||  ||||||    
T  24263092 gattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagggtcata 24262993  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  24262992 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 24262893  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  24262892 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 24262793  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  24262792 tccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 24262751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Original strand, 24876188 - 24876720
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  24876188 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 24876287  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| ||||| || |||||||| || ||  ||||| | || || |||   ||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  24876288 gagagttcgaattacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatgatcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatt 24876387  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  |||   | ||  ||||||| || ||  | |||||     
T  24876388 tctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcggaccgaagatagtgattttaaaatcgatgat 24876487  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    |||||||||||||||||  |||  | |||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| | ||| | |||||||||||    
T  24876488 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtattc 24876587  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||  |||||||| || || || || || ||||||||| | |||||   |||    
T  24876588 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtttggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 24876687  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  24876688 tcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgc 24876720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 24676520 - 24675889
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24676520 aggcagcgtagatggctcgaattatttaaaaattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 24676421  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| || || || ||||||||||| ||  ||||  | || |||||   |||| |||| |||||| |  |    
T  24676420 cattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaact 24676321  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| ||  | || ||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  |     
T  24676320 gggaatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagact 24676221  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  || |||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||  |||||||  |||||||  ||||| | ||||    
T  24676220 gaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggccgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaag 24676121  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | | ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||| | || || ||||| || ||||| ||||| || ||    
T  24676120 agagtcatagaagtagcctgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggc 24676021  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | ||||||  |||||  ||||| ||| |||| ||| |||| | ||| ||  ||     | | || |||||||| |||||||| |||    
T  24676020 acagtttgtgtattcctgtttggtttgtctaaagtcgaagattgagcattagaaacttgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgg 24675921  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
     ||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  24675920 aatagcatatccatggattttgtgacgagttt 24675889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 23067396 - 23066869
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  23067396 taaaagattatgattttgagttgact-atcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 23067298  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgat 234  Q
    || |||||| || ||||| |||||||| || || |||||| | || ||||||||||||| | | |||||| || | || |||||||||||  |||  ||     
T  23067297 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatttgagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataacgaa 23067198  T
Q  235 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatg 334  Q
    ||  | || ||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||| ||||  | ||  |  |||| || ||  | ||||    
T  23067197 tttctaaagagtattaaagaagcacggaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggtttctagtgatcagactgaagacggtgattttaaaatcgatg 23067098  T
Q  335 agcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtat 434  Q
    | |||||||||||| | ||| |||  |  ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || |||||||||||    
T  23067097 atcaaggtgtgttgcggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtat 23066998  T
Q  435 tcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgact 534  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||  | || || |||||||||   ||||||| |    
T  23066997 tcatccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgatattgcacagtttgtgtattattgtttgatt 23066898  T
Q  535 tgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23066897 tgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaa 23066869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 641
Target Start/End: Original strand, 23107169 - 23107773
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||  ||||  || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||    
T  23107169 aaagattatgattttgagttgagctatcatccgcgtaaagctaatgttgttacagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaa 23107268  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      ||||| || || || |||||||| || || |||||  | |||||||||||||||||  |||||||| || | || |||||||||||  ||| ||| ||    
T  23107269 aagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatccgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatt 23107368  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||| | ||| |||||  ||| |||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||| ||||  | ||  | | ||| || ||  |||||||     
T  23107369 tctgaaaagtattaaagaggcacataaagctgatgtaatgtttgtggacttgttggttgctagtgatcagactgaagacaatgattttaaaattgatgat 23107468  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    ||||||||| |||| ||| |||     |||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||   ||||| || ||||  || ||||||||||||     
T  23107469 caaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaaaatgattcctgaagagagccatagaagtaacttgagtatta 23107568  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || ||  |||| || ||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||||  |||    
T  23107569 atccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggcggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttg 23107668  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||  ||     | | || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| |||||    
T  23107669 tcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 23107768  T
Q  637 agttt 641  Q
    |||||    
T  23107769 agttt 23107773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 442 - 664
Target Start/End: Original strand, 21125003 - 21125225
Alignment:
Q  442 ggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaga 541  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || ||||| || ||  | ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21125003 ggagctacagagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatcttgctcaatttgtttatgcatgtttggcttgtcaga 21125102  T
Q  542 agtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21125103 agtctaaggttgagcatcacaagtctacagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagttt 21125202  T
Q  642 acaaaacactccgagagggcatg 664  Q
    ||  || ||||||||||| ||||    
T  21125203 accgaatactccgagaggacatg 21125225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 569
Target Start/End: Original strand, 21324678 - 21325237
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||    
T  21324678 aggcagcgaagatggcttgaattgttaaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgttgttgtagacgccttgagtaggaaga 21324777  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| || || || ||||||||||| ||  ||||| | || || ||   |||| |||| |||||| |  |    
T  21324778 ctttgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgagtggtcacctcagagtgtgaaact 21324877  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||  || || ||||||||||  |     
T  21324878 gggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttgattgctagtaatcagact 21324977  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  || |||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||  |||    |||||||||||||||  |||||||  |||||||  ||||| | ||||    
T  21324978 gaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaag 21325077  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | || || ||||| || ||||| || || || ||    
T  21325078 agagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgttgc 21325177  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
     || || || ||| | |||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  21325178 acaattcgtatattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgc 21325237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 263 - 641
Target Start/End: Original strand, 24819351 - 24819729
Alignment:
Q  263 aagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaa 362  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||   | ||  ||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||  |     
T  24819351 aagtagatgttaagtttgtggatttgttggttgctagtaatccgactgaagatagtgacttcaaagtcgatgatcaaggagtgttgagattctgaggtag 24819450  T
Q  363 aatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcat 462  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||  |||||||| ||| | |  |||| ||||| |  || | ||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  24819451 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcat 24819550  T
Q  463 gatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaga 562  Q
     ||||||||| | ||||||| |||||  | |||||  |  | || || || ||||||||| | ||||||  |||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  24819551 tatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagtaatgtggcacaatttgtgtattcctgtttgctttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcaga 24819650  T
Q  563 agcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    | ||||||||||||   ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  24819651 aacctgcagggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagttt 24819729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 569
Target Start/End: Original strand, 21890268 - 21890689
Alignment:
Q  148 ttgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagta 247  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||  ||| ||| ||  |||| ||||    
T  21890268 ttgcttgaacagttcagagatttgagtctagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagttaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaagagta 21890367  T
Q  248 tcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgtt 347  Q
    | | ||| || ||| ||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||  | ||     |||| || ||  | ||||| |||||||||||    
T  21890368 ttaaagaggcgcaaaaagttgatgttaagtttatggacttgttggttgctagtaatcagactgaaggaggtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgtt 21890467  T
Q  348 gagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagct 447  Q
    ||| ||| |||  |  ||||||||||  ||| | || ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||||   ||||||    
T  21890468 gaggtttcgaggtaggatttgtattctagacgacgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctaggagct 21890567  T
Q  448 acaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtcta 547  Q
    || || ||||| || ||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |    
T  21890568 acgaagatgtaccacgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaagcgcgatgttgcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcga 21890667  T
Q  548 aggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  21890668 aggttgaacattagaaacctgc 21890689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 569
Target Start/End: Original strand, 24706906 - 24707453
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||  |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  24706906 tggctcgaattattgaaagattatgactttggtttgaattattatccaagtaaggctaatgtttttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgt 24707005  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    | || |||||||| || ||||| || || || ||||||||||| ||  ||||  | || |||||   |||| |||| |||||| |  |||| ||||||||    
T  24707006 ccgcattgatggttagagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaa 24707105  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    |||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||| |  ||||  | |||  |||||||||  | ||  || ||||     
T  24707106 gattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacataaagttgatgtcaagtttttttatttgttagttgttagtaatcagactgaagatggtgac 24707205  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||  |||    |||||||||||||||  |||||    |||||||  || || | ||||| |||||||  |    
T  24707206 tttaaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgatgatgaattgatgaagaaaatggttcttgaagagagtcatagaa 24707305  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgta 521  Q
    | | ||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||| |||||| | || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||    
T  24707306 gtagcttgagtattcacccgggatctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtccggattgaaacgcgatgtggcacaatttgtgta 24707405  T
Q  522 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    | | |||||   |||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  24707406 ttcttgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacattagaaacctgc 24707453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 209 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 9610968 - 9610517
Alignment:
Q  209 tgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagc 308  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||  ||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||  ||||  |    
T  9610968 tgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagac 9610869  T
Q  309 ggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaa 408  Q
     ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | |||    
T  9610868 tgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaa 9610769  T
Q  409 gaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcg 508  Q
    || |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || |    
T  9610768 gagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtgg 9610669  T
Q  509 ctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtg 608  Q
    | || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| ||    
T  9610668 cacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatg 9610569  T
Q  609 ggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    |||||| || || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  9610568 ggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 9610517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 209 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 17068207 - 17067756
Alignment:
Q  209 tgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagc 308  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||  ||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||  ||||  |    
T  17068207 tgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcacaggaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagac 17068108  T
Q  309 ggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaa 408  Q
     ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | |||    
T  17068107 tgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaa 17068008  T
Q  409 gaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcg 508  Q
    || |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || |    
T  17068007 gagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtgg 17067908  T
Q  509 ctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtg 608  Q
    | || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| || || ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| ||    
T  17067907 cacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatg 17067808  T
Q  609 ggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    |||||| || || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  17067807 ggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 17067756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 45533351 - 45533091
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||  | ||||| ||  |||||||    
T  45533351 taaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattaaatatgtctgctatgatggt 45533252  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtg-a 233  Q
     || ||||| || ||||| ||| |||| || ||||||||| | || |||||| ||||  | || |||||| | ||||| ||| |||||||||| |  | |    
T  45533251 tagagagttggagttgcttgaatagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacagagtgtgaaattggggatgttgaagatcaacaacgaa 45533152  T
Q  234 tttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggtt 294  Q
    ||| ||| ||||||||| ||| || ||| | || ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  45533151 ttttttggatagtatcaaagaggctcaaaaggtggatgtgaagttggtagatttaatggtt 45533091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 239 - 569
Target Start/End: Original strand, 22756106 - 22756436
Alignment:
Q  239 tgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagca 338  Q
    |||| |||||||  ||||||||  ||||| |||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  || |||| || ||||| ||||| ||    
T  22756106 tgaaaagtatcaatgaagcacataaagtttatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgacca 22756205  T
Q  339 aggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcat 438  Q
     ||||||||||||||  |||    |||||||||||||||  |||||||  |||||||  | ||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||     
T  22756206 tggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcaa 22756305  T
Q  439 tcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtc 538  Q
     |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || |||||  | ||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||||  ||||     
T  22756306 ccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctagattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgta 22756405  T
Q  539 agaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  22756406 agaagtcgaagattgaacatcagaaacctgc 22756436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 227
Target Start/End: Original strand, 30011621 - 30011811
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    |||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  || |||||||| |||||  ||||||| ||  |||||||    
T  30011621 taaaggattatgatttcgggttaaattaccatccgagtaaggctaatgttgttgcagatgttttaagtaggaaaacatt--acatgtctgctatgatggt 30011718  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaa 227  Q
     || ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| | || |||||| ||||  | || |||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  30011719 tagagagttggagttgcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacagagtgtgaaattggggatgttgaagatcaa 30011811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 25264085 - 25264022
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggta 73  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25264085 aggcagaggagatggcttgagttgttaaaagactatgattttggtttgaattaccatccgggta 25264022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 162
Target Start/End: Original strand, 12639690 - 12639797
Alignment:
Q  55 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcg 154  Q
    |||| ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||||| | |    
T  12639690 ttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcagatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattg 12639789  T
Q  155 aacagttt 162  Q
    ||||||||    
T  12639790 aacagttt 12639797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 582 - 629
Target Start/End: Original strand, 24831171 - 24831218
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattt 629  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24831171 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggattt 24831218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Original strand, 12640217 - 12640265
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12640217 accgttgtttgtgccaaagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 12640265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Original strand, 22761553 - 22761601
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22761553 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatatcatctctatggatttt 22761601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 454; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 1319 - 658
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1319 acatgaggcagaggagatgacttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 1220  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  1219 aaagacattgcacatgtcggccatgatggtgaaggaattcgaattgcttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgtg 1120  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1119 cagttgggtatattgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgtggattttatggttactagtaatc 1020  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1019 aagctgagaatagtgatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 920  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||   ||     
T  919 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggat 820  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||    
T  819 gtcgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtataaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacgccgttggatgtaccggagtgga 720  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||| ||||||||||||    
T  719 aatgggacaacatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccaagagggcatgat 658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 447; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Original strand, 20855699 - 20856361
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20855699 acatgaggcagaggagatggcttgagttattaaatgattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtag 20855798  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20855799 gaagacgttgcacatgtcggccttaatggtaaaggagttttaattgctcgaacagtttagggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtg 20855898  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  20855899 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttggatagtatcagagaagcgcaacaagttgatgttaagtttgtggatttgatggtcgctagtaatc 20855998  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20855999 tagcggagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagattaagaggcagaatttgtattcctgacaatgaggaattgaagaagttgatttt 20856098  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaa-gcgcga 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |   ||    
T  20856099 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctggttttaaagaagga 20856198  T
Q  504 cgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgg 603  Q
     |||||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| || || ||||||    
T  20856199 tgtcgctcggtttgtgtatgcgtgtttcacttgttagaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcaggtttgttgacaccgttggaggtaccagagtgg 20856298  T
Q  604 aagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  20856299 aaatgggatatcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatgat 20856361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 20939002 - 20939664
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20939002 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtag 20939101  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| |  ||||| ||||| || ||||||||||  || ||||| ||| |  | |||||||| |||||||| || || |||||| || || |||| |||||     
T  20939102 gaaaatgttgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttatagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgta 20939201  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| || |||||     
T  20939202 caattggggatgctgaaaattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtgaaggttgttgatttaatggttgctggtaatg 20939301  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   | |||||| ||||||||  |||| || || || ||||| |||||    
T  20939302 gcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattcagaagaagaatttgcattcctgatgatgatgatttaaaaaagttaatttt 20939401  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20939402 agaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccggtttgaagcgtgac 20939501  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20939502 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 20939601  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  20939602 agtgggattttatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacgctccgagagggcatgatg 20939664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 19855725 - 19855063
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19855725 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcag 19855626  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| |  || ||||| || || || |||||||| |||||||| || || |||||| || || |||| |||||     
T  19855625 gaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttactagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgta 19855526  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| || |||||     
T  19855525 cagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgttaagtttgttgatttgattgttgctggtaatg 19855426  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||  |  |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  19855425 gcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtattgaggttcagaggaaggatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgatttt 19855326  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||  | ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| || ||     
T  19855325 agaggaaagtcacaagaatagcttaagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagacgctgttttggtggtctgggttgaaacgggat 19855226  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
     | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  19855225 attgctcaaattgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcggggttgttgacaccgttggatgtgccagagtgga 19855126  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19855125 agtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 19855063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 40 - 667
Target Start/End: Original strand, 24098577 - 24099204
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||    
T  24098577 gattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaagg 24098676  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||  || || |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24098677 aatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtgatttctt 24098776  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |  | ||| ||||||| ||||||||||| || ||     
T  24098777 gaatagtatccgagaagctcagcaagtggatttgaagtttgttgatttgatgattactggtaatgacactgaggatagtgacttcaaggttgacgatcag 24098876  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    ||||| ||||| || ||||  | ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||      
T  24098877 ggtgttttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgggttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcacc 24098976  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  24098977 cgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcatgatgttgctcattttgtttatgcttgcttgacttgtca 24099076  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| |||    
T  24099077 gaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaaatgggacagtatttctatggattttgtgacaagt 24099176  T
Q  640 ttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  24099177 ttaccgaacactacgagagggcatgatg 24099204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 19662076 - 19662742
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||| | || || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19662076 acatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtag 19662175  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| |  || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||| || || | || |||||     
T  19662176 gaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacaccccagagtgta 19662275  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| ||| | || ||||| |||||| || |||||     
T  19662276 cagttggggatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaggaagtggatgtcaagctggttgatttgatggttgctggtaatg 19662375  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       |  || ||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  19662376 gcactaaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtattgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgatttt 19662475  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  19662476 agaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcgtccggaagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgat 19662575  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgt----gccggag 600  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    |||||||    
T  19662576 gtcgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgtctgaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagagttgttgacaccgttggatgtgccggccggag 19662675  T
Q  601 tggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19662676 tggaagtggtatagcatttttatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 19662742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 20834839 - 20835489
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20834839 acatgaggcagaggagatggttggagttgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtag 20834938  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| ||  |||| ||||| || || ||||| |  || || || ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| |  || |||| |||||     
T  20834939 gaaaacgctgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattaacacctcagagtgtt 20835038  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| || |||||     
T  20835039 cagttggggatgctgaagattaataatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaactagtggatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatg 20835138  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| ||||| ||  |||| ||           || ||      
T  20835139 gcactgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcccgatgatgatga-----------tggttc- 20835226  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||     
T  20835227 agaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgat 20835326  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20835327 gttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagatgtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 20835426  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20835427 agtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttacctaacactccgagagggcatgatg 20835489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 21952329 - 21951678
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  21952329 acatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcgttgagcag 21952230  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||| ||| |     
T  21952229 gaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaactgtcatctcagagtata 21952130  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| ||||| |||||  ||||||| ||  |||  ||| | || || || ||||| |||  |||| ||| |     
T  21952129 cagttggggatgctgaagattgatagtaattttttgaacagtattcgagaagcccagaaagcagatttgaaattggttgatttgatgactactggtagtg 21952030  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| | ||||| || ||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  | | ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  |    
T  21952029 acactgaggacagtgattttaaggtggatgatcagggtgtactgagattcagaggaagagtttgtattcctaacaatgatgatttgaagaagttgatcct 21951930  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  21951929 tgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaatatgtttcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggat 21951830  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21951829 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 21951730  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgag 656  Q
    ||||||| || || |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  21951729 agtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttgccgaacactccgag 21951678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 20295832 - 20295172
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  20295832 acatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcag 20295733  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||  |  || ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| |||| ||| |     
T  20295732 gaaaactttgcacatgtctgctttgatggcgaaagaatttgaattgttagaatagtttagagacttgagtttggtctgtgaattgtcacctcagagtatt 20295633  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||||| || || || ||||  |||   ||| ||| |     
T  20295632 cagttggggatgctgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagcggatgtgaaattggttgattggatgacgactggtagtg 20295533  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| | ||||| || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||  | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  20295532 acaccgaggacagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattct 20295433  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  20295432 tgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagat 20295333  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  20295332 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggactgga 20295233  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| |  || |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20295232 agtgggacattatctctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 20295172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Original strand, 31538936 - 31539596
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  31538936 acatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtag 31539035  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || |||||| |||| || |||||||| |  |||||||| ||| | |||||||| || ||  ||||||| || |||||| ||||| |||| ||| |     
T  31539036 gaaaacgttgcacgtgtcagctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtata 31539135  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | |||||||| |||||  ||  | || |||||     
T  31539136 cagttgggaatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagaagatttgaagtttgttgatttggtgacttctggtaatg 31539235  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | | | ||||||| |||||  ||||||| || |||||| |||| || | ||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  31539236 acactggggatagtgatttcaaaattgatgatcagggtgtgctgaggttcacaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattct 31539335  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  31539336 ggaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacgaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggat 31539435  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  31539436 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 31539535  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  31539536 agtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttgccgaacactccgagggggcatga 31539596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 37678500 - 37677840
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| | || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  37678500 acatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggtttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgttgatgctttgagtag 37678401  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||| | |||||||| || ||  ||||||| || |||||| ||||| |||| ||| |     
T  37678400 gaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtata 37678301  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | |||||||| ||||| |||  | |  |||||     
T  37678300 cagttgggaatgttgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagaagatttgaagtttgttgatttgatgacttccggtaatg 37678201  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||  |||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  37678200 acactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattct 37678101  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  37678100 tgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggat 37678001  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||| | ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  37678000 gttgcttagtttgtttatgcctgtttgatctgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 37677901  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37677900 agtgggatagtatctctatggattttgtaactagtttaccgaacactccgagagggcatga 37677840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 414
Target Start/End: Original strand, 23197185 - 23197594
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  23197185 acatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgctgatgcgttgagcag 23197284  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||| || || |||| |||||     
T  23197285 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgta 23197384  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||| |     
T  23197385 cagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgtgaagcacagcaagtggatgttaagtttgtggatttgatggttgctggtagtg 23197484  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | ||  ||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  23197485 aaactgaagatagtgactttaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgatttt 23197584  T
Q  405 agaagaaagt 414  Q
    ||| ||||||    
T  23197585 agaggaaagt 23197594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 16373936 - 16373378
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  16373936 agatggcttgaattgttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcata 16373837  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  ||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| || |||| |||||    
T  16373836 tgtctgctatgatggttaaggagttcgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgct 16373737  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaag-cacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatag 317  Q
    ||||||  ||||||| |||||||| ||||| | | ||| | ||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | ||  | ||    
T  16373736 gaagattgatagtgaattcttgaaaagtattaaaaaagacgcagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacag 16373637  T
Q  318 tgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcat 417  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  16373636 tgactttaaggtcgatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggtagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcat 16373537  T
Q  418 aagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttg 517  Q
    |  || | ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || |||||  | || ||||    
T  16373536 agaagtagcttgagtattcatccgggagctgcgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgacgtgacacaatttg 16373437  T
Q  518 tgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttg 576  Q
    ||||| | || |||| || | ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16373436 tgtattcttgcttgatttttaagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgcagggttg 16373378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 641
Target Start/End: Original strand, 41352606 - 41353237
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41352606 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaagattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 41352705  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||  | ||  ||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| |  |    
T  41352706 cattgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaact 41352805  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  |||  || |||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  ||||  |     
T  41352806 gggtatgctgaagattgatagtgattttctgagaagcatcaaagaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcagact 41352905  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||  |||  |  ||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  41352906 gaagacagtgattttaagatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaaggatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaag 41353005  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  41353006 agagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 41353105  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||    
T  41353106 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgg 41353205  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  41353206 gatagtatatcgatggattttgtgacgagttt 41353237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 291
Target Start/End: Original strand, 20060891 - 20061177
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060891 acatgaggcagaggagatgacttgaattattaaaggattatgattttggcttgaactaccattcgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 20060990  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||  ||| | | || ||||||    
T  20060991 gaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgagcattttagagatttgagccttgtttgtgatttgttaccccagagtgtg 20061090  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatg 291  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20061091 cagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacagattgatgtcaagtttgtggatttaatg 20061177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 21750322 - 21749797
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||    
T  21750322 tatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagt 21750223  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    | || ||||| |||||||| || || |||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||| || |||||||||||  ||| ||| ||  ||||    
T  21750222 tcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtatgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagttagggatgctgaagattgataatgaatttctgaa 21750123  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggt 342  Q
     ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||| || |  | ||  | || || || ||  | ||||| ||||||    
T  21750122 gagtattaaagaagcacaaaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggtggctagtgattagactgaagacagagattttaaaatcgatgatcaaggt 21750023  T
Q  343 gtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgg 442  Q
    |||||||||||| |||  |  ||||||||||| ||  || | ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||    
T  21750022 gtgttgagatttcgaggtaggatttgtattccagatgat-atgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgg 21749924  T
Q  443 gagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaa 542  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  21749923 gagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaa 21749824  T
Q  543 gtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  21749823 gtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 21749797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 21831709 - 21831068
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  21831709 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 21831610  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  21831609 tgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 21831510  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  21831509 gaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcacagagagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 21831410  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| |  |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  21831409 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 21831310  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||  |||||||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  21831309 gaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatttatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 21831210  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||     
T  21831209 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaagcctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtata 21831110  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  21831109 tccatggattttgtgacgagttttccaaatactcctagaggg 21831068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Original strand, 51332446 - 51333087
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  51332446 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgattaggaagacattgcata 51332545  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  ||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| | |||||||||||    
T  51332546 tgtccgctatgatggtcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgct 51332645  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  ||||  | |||    
T  51332646 gaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagacggaagacagt 51332745  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  51332746 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 51332845  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  51332846 gaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 51332945  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| || || ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  51332946 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 51333045  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  51333046 tccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 51333087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 21838356 - 21837715
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  21838356 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 21838257  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  21838256 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 21838157  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| | |||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | | |    
T  21838156 gaagattgatagtgaatttctgaaaaatatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggtttctagagatcagactgaagacaat 21838057  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||  | |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | || ||| ||||| | ||||| |||||||    
T  21838056 gattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaataagatgattcttgaagagagtcata 21837957  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  21837956 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 21837857  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  21837856 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 21837757  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  21837756 tccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcccagaggg 21837715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22110410 - 22109872
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |  |||||||||    
T  22110410 aaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtcctctatgatggtaa 22110311  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      |||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||| | || || |||||||||  ||| |||||| || |||| ||||| |||||  ||||||| ||    
T  22110310 aagagtttgagttgcttgaatagtttagagatttgagtttagtatgcgaaatgtcacatcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtgaatt 22110211  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||  || | ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | ||  ||||||| || ||| | |||||     
T  22110210 cttgaacagtattaaagaagcgcataaaatcgatgttaagtttgtggacttgttggttcctagtaatcagactgaagatagtgattttaagatcgatgac 22110111  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  22110110 caaggagtgttgagattccgaggcagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattc 22110011  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    |  |||||||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||| |  || || || || ||||||||| | ||||||| |||    
T  22110010 acccgggagctacgaagatgtaccacgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacatgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttg 22109911  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggtt 575  Q
    | ||||||  || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  22109910 ttagaagttgaaagttgagcatcaaaaacctgcagggtt 22109872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22114259 - 22113721
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |  |||||||||    
T  22114259 aaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtcctctatgatggtaa 22114160  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      |||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||| | || || |||||||||  ||| |||||| || |||| ||||| |||||  ||||||| ||    
T  22114159 aagagtttgagttgcttgaatagtttagagatttgagtttagtatgcgaaatgtcacatcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtgaatt 22114060  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||  || | ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | ||  ||||||| || ||| | |||||     
T  22114059 cttgaacagtattaaagaagcgcataaaatcgatgttaagtttgtggacttgttggttcctagtaatcagactgaagatagtgattttaagatcgatgac 22113960  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  22113959 caaggagtgttgagattccgaggcagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattc 22113860  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    |  |||||||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||| |  || || || || ||||||||| | ||||||| |||    
T  22113859 acccgggagctacgaagatgtaccacgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacatgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttg 22113760  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggtt 575  Q
    | ||||||  || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  22113759 ttagaagttgaaagttgagcatcaaaaacctgcagggtt 22113721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 569
Target Start/End: Original strand, 33389973 - 33390532
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | ||||| || |||||  |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33389973 aggcagcgaagatgactagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 33390072  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| |  |    
T  33390073 cattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaact 33390172  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  | || |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  |     
T  33390173 gggtatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagact 33390272  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||  | ||  | |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  33390273 gaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattctcgaag 33390372  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  33390373 agagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 33390472  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
     || ||||||||| | |||||   ||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  33390473 acagtttgtgtattcctgtttagtttgccagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 33390532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 68 - 569
Target Start/End: Original strand, 22361246 - 22361747
Alignment:
Q  68 cgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttaggga 167  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||  |||||||||   |||| || ||||| |||||||| || ||    
T  22361246 cgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatatctgctatgatggtaaaatagttcgagttgcttgaacagttcagaga 22361345  T
Q  168 cttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagtt 267  Q
     |||||| | || ||||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||||  ||| ||| || ||||| ||||| | ||||||| || |||||    
T  22361346 tttgagtttagtttgtgaaatgtcatcttaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttttgaagagtattaaagaagcataaaaagtt 22361445  T
Q  268 gatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaattt 367  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||| ||||| ||||  | ||  |  |||| || ||  | ||||| ||||||||| |||| ||| |||  |  ||||    
T  22361446 gatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtgatcagactgaagacggtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtaggattt 22361545  T
Q  368 gtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgattt 467  Q
    |||||||  || |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |    
T  22361546 gtattccaaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagaaacttgagtattcatccgggagctacgaagatctatcatgatct 22361645  T
Q  468 gaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcct 567  Q
     |||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  22361646 aaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgacgttgcatagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacct 22361745  T
Q  568 gc 569  Q
    ||    
T  22361746 gc 22361747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 641
Target Start/End: Original strand, 16349549 - 16350174
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16349549 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 16349648  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||  | ||  ||||| | || ||||||  |||| |||| || ||| |  |||||||| |    
T  16349649 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgtt 16349748  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagt-atc-agagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaata 316  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| ||| ||| ||  |||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  ||||  | |    
T  16349749 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtaatcaaggaaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagacggaagaca 16349848  T
Q  317 gtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttaga-gacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtc 415  Q
    |||| || ||  | ||| | |||||||||||||||||  || ||   ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| ||||    
T  16349849 gtgattttaaaatcgataatcaaggtgtgttgagattccgaggaagtaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 16349948  T
Q  416 ataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattt 515  Q
    |||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || ||    
T  16349949 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 16350048  T
Q  516 tgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagc 615  Q
    ||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| ||||||||     
T  16350049 tgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagt 16350148  T
Q  616 atttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    || || ||||||||| ||||||||||    
T  16350149 atatcgatggattttgtgacgagttt 16350174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 19107783 - 19107224
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19107783 aggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 19107684  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||| | ||||| ||  ||||||| || ||||| || || || |||||||| || ||  ||||| | || || |||  ||||||||| |||||| |  |    
T  19107683 cattgtatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcatctcagagtgtgaaact 19107584  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||  | ||| ||||  | ||  |     
T  19107583 gggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttaatgtaaagtttgtggacttgttagttgctagagaacagact 19107484  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
     |  | ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  19107483 aaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaag 19107384  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | || || | ||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||  ||||||||||| || || ||    
T  19107383 agagccacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtttggtttgaagcgagatgtggc 19107284  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
     || ||||||||| |||||||   |||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  19107283 acagtttgtgtattcatgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgc 19107224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 550 - 663
Target Start/End: Original strand, 22432600 - 22432713
Alignment:
Q  550 gttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaaca 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22432600 gttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccagagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaaca 22432699  T
Q  650 ctccgagagggcat 663  Q
    ||||||||||||||    
T  22432700 ctccgagagggcat 22432713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 569
Target Start/End: Original strand, 50619332 - 50619747
Alignment:
Q  154 gaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagag 253  Q
    ||||||||||| || |||||| | || |||||| ||||| |||| |||||| || |  | |||||||||||  ||||||| ||  |||| ||||| |  |    
T  50619332 gaacagtttagagatttgagtttagtatgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctaagaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaagg 50619431  T
Q  254 aagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatt 353  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||  | ||  | ||  | || ||  | ||||| |||||||||||||| ||    
T  50619432 aagcagagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttactagtaatcagactgaagacagatattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtt 50619531  T
Q  354 tagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaa 453  Q
    | |||  | ||||||||||||  ||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| ||     
T  50619532 tcgaggtagaatttgtattccatacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaag 50619631  T
Q  454 atgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttg 553  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| || ||||    
T  50619632 atgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcgaaagttg 50619731  T
Q  554 aacatcagaagcctgc 569  Q
    | |||||||| |||||    
T  50619732 agcatcagaaacctgc 50619747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 21025561 - 21025076
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  21025561 aaagattatgaatttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatggtgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 21025462  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||  | || |||||   |||| |||| |||||| |  |||| |||||||| ||  ||||||| ||    
T  21025461 gagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaatt 21025362  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      | || ||||| | ||| |||||  || ||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  || |||| || |||||  ||||     
T  21025361 tctaaaaagtattaaagaggcacagaaaattgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcaatgac 21025262  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || ||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||  ||||||    ||||||  ||||| | ||| | |||||||  || | |||||||||||    
T  21025261 catggtgtgttgagattccgaggccgaatttgtattcctgatgatgaagggaggaagaaaatgattcttgaaaagagtcatagaagtagcttgagtattc 21025162  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtat 522  Q
    |  |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||    
T  21025161 acccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtat 21025076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 563
Target Start/End: Original strand, 16077630 - 16078153
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  16077630 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccttgaggaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagag 16077729  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    ||||||| || || |||||||| || || |||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| |  |||| |||||||||||  ||||||| ||  |    
T  16077730 agtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttct 16077829  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| ||||| | ||| ||| |  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  |  |||| || || || ||||| ||     
T  16077830 gaagagtattaaagaggcatagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgatgaccac 16077929  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    ||||||||||||||   ||     ||||| || |||||| ||| |||  |||||||  | ||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||||     
T  16077930 ggtgtgttgagattccaaggtcggatttgcatccctgacgatgcagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatc 16078029  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | || |  ||||| ||||||||  | || || || || ||||||||| | |||||    |||||    
T  16078030 cgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaatgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtctgtca 16078129  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||    
T  16078130 gaagtcgaagattgagcatcagaa 16078153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 331 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 20139924 - 20139590
Alignment:
Q  331 gatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 430  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  ||  |  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  20139924 gatgaccaaggtgtgttgaggtttcaaggtaggatttgtattccagactatgaagaaatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 20139825  T
Q  431 gtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgttt 530  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||| ||| | |||||    
T  20139824 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtctattcttgttt 20139725  T
Q  531 gacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    || |||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||  ||     | | || |||||||  |||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  20139724 gatttgtcaaaagtcgaaagttgagcattagaaacctgctggtatgatggtatcattagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggatttt 20139625  T
Q  631 atgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
     |||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||    
T  20139624 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaatga 20139590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 21234684 - 21234970
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  21234684 agatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcata 21234783  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| || |||||||| || ||||| || || || |||||||| || || |||||| | || ||||||  |||| |||| |  ||| | ||| | |||||    
T  21234784 tgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaattgagaatgct 21234883  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatca 305  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  21234884 gaagatagatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagtaatca 21234970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 21744496 - 21744622
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21744496 aggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagtaggaaga 21744595  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    | ||||||||||| ||  |||||||||    
T  21744596 cgttgcacatgtctgctatgatggtaa 21744622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 284
Target Start/End: Original strand, 431090 - 431334
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  |    
T  431090 gattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaag 431189  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    | || || ||||| |||||||| || || |||||  | |||||||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||||  ||| ||| ||  |    
T  431190 aattcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttct 431289  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtgga 284  Q
    ||| ||||| | ||| |||||  ||| |||||| |||||||||||    
T  431290 gaaaagtattaaagaggcacagaaagctgatgtgaagtttgtgga 431334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 544
Target Start/End: Original strand, 19759844 - 19760351
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | || ||||| ||  ||||| |      
T  19759844 aaagattatgattttgggttgaattatcatccaggaaaagctaatgttgttgcagatgcgttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgatct 19759943  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      || || ||  |||| ||||||||||| || |||||| | || |||||| ||||| |||| |||||| |||| |  |||||||||||  ||||||| ||    
T  19759944 aagaattggagctgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttagaaatgctgaagattgatagtgaatt 19760043  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||||||||| | |||||||||  | | |||||| |||||||| |||||| |  ||    | | |||  | ||  ||||||| || ||||| |||||     
T  19760044 tatgaatagtataaaagaagcacagaaggctgatgtaaagtttgtagatttatttattggagggactcagactgaagatagtgactttaaggtcgatgat 19760143  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || || |||||| ||||  |||  | |||||||||||||||| | || ||  |||  ||| ||||| | ||||| ||||| |  || | ||||||||| |    
T  19760144 cagggagtgttgcgattccgaggtagaatttgtattcctgacgacgatgagatgagaaagatgattcttgaagagagtcacataagtagcttgagtatcc 19760243  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||| ||| ||||||||| |||    
T  19760244 atccaggagctataaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtatattcatgtttgatttg 19760343  T
Q  537 tcagaagt 544  Q
    ||| ||||    
T  19760344 tcaaaagt 19760351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 20250964 - 20250658
Alignment:
Q  262 caagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagaca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||   | ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||| ||||||| ||| |||  |    
T  20250964 caagttgatgttaagtttgtggacttgttggtggctagtaatcggactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtatgttgaggttttgaggta 20250865  T
Q  362 aaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatca 461  Q
      ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20250864 ggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatca 20250765  T
Q  462 tgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcag 561  Q
    |||| | |||||| ||||||| ||||  ||  |||| || || || || || ||||||||| | | ||||| |||||||||||| || ||||| ||||||    
T  20250764 tgatctaaagaagttgttttggtggt-tggactgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttatttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcag 20250666  T
Q  562 aagcctgc 569  Q
    || |||||    
T  20250665 aaacctgc 20250658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 305
Target Start/End: Original strand, 17043959 - 17044254
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  17043959 aggcagcgtagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttgagcaggaaga 17044058  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || || || ||||| || || || |||||| | || | ||||  |||| |||| |  ||| |  |    
T  17044059 cattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacaattcagagatttgagtttggtttatgaatggtcacctcagaaagtgaaact 17044158  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatca 305  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| ||  | || ||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||    
T  17044159 gggaatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatca 17044254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 107
Target Start/End: Original strand, 24793588 - 24793658
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaa 107  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  24793588 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaa 24793658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Original strand, 20830908 - 20830956
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20830908 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 20830956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 497
Target Start/End: Original strand, 17044313 - 17044446
Alignment:
Q  364 atttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatg 463  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||| ||  |||||||||| || |||||||| |    
T  17044313 atttgtattcccgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccacccgggagctacgaagatgtatcacg 17044412  T
Q  464 atttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaa 497  Q
    |||| |||||| | || || ||||| ||||||||    
T  17044413 atttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 17044446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 415; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 15460605 - 15459951
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15460605 acatgaggcagaggagatggctagaattattaaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 15460506  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15460505 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgaattgcttgaacagtttagagacttgagtctagtgtgtgaattgtcatcgcaaagtgtg 15460406  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15460405 catttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagcacaacgagttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatc 15460306  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||| || |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15460305 aagctgaggatggtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtattgagatttagaggcagaatttgtattcccgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 15460206  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||   ||     
T  15460205 agaagaaagtcataagagcaatttgagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggattgaagaaggat 15460106  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  15460105 gtcgcgcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagattgaacatcagaagcctgcaggattgttgacaccgttggatataccggagtgga 15460006  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagg 659  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  || |||||||||||    
T  15460005 aatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagg 15459951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 40 - 666
Target Start/End: Original strand, 21563179 - 21563805
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  21563179 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaagg 21563278  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21563279 aatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtgatttctt 21563378  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||    
T  21563379 gaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtcaagtttgtggatatattggttactagtaatcaagctgaggctagtgatttcaaggttgatgaacaa 21563478  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| |||||||| ||||| || | ||| ||||| || || |||     
T  21563479 ggcgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaacagttaattttagaggaaagccacaggagtaacttaagcatccatc 21563578  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  21563579 cgggagctacgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatatttgacttgcca 21563678  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  21563679 gaagtctaaggtcgaacatcagaagcttgcagggttgttgacatcgttggatgtgccggagtggaaatgggataacatttctatggattttgtgacaagt 21563778  T
Q  640 ttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21563779 ttaccaaacactccgagaggacatgat 21563805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 40 - 666
Target Start/End: Original strand, 21569038 - 21569664
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  21569038 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaagg 21569137  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21569138 aatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtgatttctt 21569237  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||    
T  21569238 gaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtcaagtttgtggatgtattggttactagtaatcaagctgaggctagtgatttcaaggttgatgaacaa 21569337  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| |||||||| ||||| || | ||| ||||| || || |||     
T  21569338 ggcgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaacagttaattttagaggaaagccacaggagtaacttaagcatccatc 21569437  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  21569438 cgggagctacgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatatttgacttgcca 21569537  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  21569538 gaagtctaaggtcgaacatcagaagcttgcagggttgttgacatcgttggatgtgccggagtggaaatgggataacatttctatggattttgtgacaagt 21569637  T
Q  640 ttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21569638 ttaccaaacactccgagaggacatgat 21569664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 19454689 - 19454027
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19454689 acatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcag 19454590  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| |  || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| || |||||| || || |||| ||||||    
T  19454589 gaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcaatttagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtg 19454490  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||     
T  19454489 cagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaataatatcagagaagcacaacaagtggatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatg 19454390  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||  |||| || ||||| || ||||||||    
T  19454389 gcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgacgagttgaaaaaattgatttt 19454290  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19454289 cgaggaaagtcacaagagtaacttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtaacatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgac 19454190  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19454189 gtcgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgttagaagtctaaggttgaacatcagaagtctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 19454090  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19454089 attgggatatcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 19454027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 8761945 - 8762607
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8761945 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtag 8762044  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| ||  |||| ||||| || || ||||| |  || || || ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| || || |||| |||||     
T  8762045 gaaaacgctgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtt 8762144  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| | || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  |||||     
T  8762145 cagttggggatgctgaaaattaatagtgatttcctgaatagtatccgagaaccgcagcaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatg 8762244  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8762245 aaacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgatttt 8762344  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||| ||||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  8762345 agaataaagtcacaaaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgac 8762444  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8762445 gtcgctcattttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 8762544  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8762545 agtgggacgacatttatatggattttgtgacgagtttaccgaacactcagagagggcatgatg 8762607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 18795959 - 18795298
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18795959 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtag 18795860  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||||    
T  18795859 gaagacgttacacatgtcggctttaatggtaaaggaatttgagttgcttgaatagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtg 18795760  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  18795759 cagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatgttttatagtaatc 18795660  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||  | |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  18795659 aatctgaagatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaggttcagaggtagaatttgtattccggacaatgatgagttgaaaaagttgatctt 18795560  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  18795559 ggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgat 18795460  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||| || ||||| || |||||||    
T  18795459 gttgctcaatttgtgtatgcgtgtttgacttgccagaagtctaaggtcgagcatcagaagcctgcagggttgttgataccattagatgttccagagtgga 18795360  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| || ||||||    
T  18795359 agtgggacaacatttctatggattttgtgacaattttaccaaacactccgaggggacatgat 18795298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 40 - 667
Target Start/End: Original strand, 5296253 - 5296880
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||  |    
T  5296253 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaag 5296352  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    | ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||  | ||| |||| ||| | || ||||| |||||||  || || |||||||||||    
T  5296353 aatttgagttgctagagcagtttagagacttgagccttgtttgtgagttatcacctcagagtatacaattggggatgctgagaattaacagtgatttctt 5296452  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||| || |  ||||| || | ||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  5296453 gaatagtatccgagaagcgcaacaactggatgtaaagtttgttgatttaatgtttgcgggtaatgaaacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcag 5296552  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    ||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||      
T  5296553 ggtgtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagttacaagagtagcttgagtattcacc 5296652  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  5296653 cgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttatca 5296752  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  5296753 gaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgactagt 5296852  T
Q  640 ttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5296853 ttaccaaacactccgagagggcatgatg 5296880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 13 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 19880559 - 19879916
Alignment:
Q  13 cagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 112  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  19880559 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaacgtagttgcagatgctttgagtagaaagacgt 19880460  T
Q  113 tgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttggg 212  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| ||||| | || ||||||||||||||    
T  19880459 tgcacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 19880360  T
Q  213 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggag 312  Q
     ||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||  | ||     
T  19880359 catgttgaaaatcaataatgaattcttgagtagtatcagagaagcacaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcagactgaa 19880260  T
Q  313 aatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaa 412  Q
     ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| || ||||||||||||| |||| || ||  |||| | ||||||||| |||||||    
T  19880259 gatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctaacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaa 19880160  T
Q  413 gtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctca 512  Q
    | || ||||| | ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| || || |||||    
T  19880159 gccacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttagtggtctggtttgaagcgtgatgttgctca 19880060  T
Q  513 ttttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggat 612  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||| ||||||    
T  19880059 atttgtgtatgcctgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccagagtggaaatgggat 19879960  T
Q  613 agcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgag 656  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  19879959 agcatttctatggatttcgtgacgagtctaccaaacactccgag 19879916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Original strand, 10467861 - 10468521
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  10467861 acatgaggcagaggagatggttagagttactgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcag 10467960  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
     || |||||||| ||||| || |||||| |||  || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||| ||||| |||| ||| |     
T  10467961 aaaaacattgcatatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaatttagagacttgagtcttgtctgagaattgtcacctcagagtata 10468060  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  |||||     
T  10468061 cagttggggatgctgaagattgatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatg 10468160  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||  | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  10468161 agacagaggatagtgacttcaaagttgatgatcagggtgttttgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattct 10468260  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||| ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||     
T  10468261 agaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcatgat 10468360  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  10468361 gttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 10468460  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || ||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10468461 agtgggacagtatctctatagatttcgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 10468521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 14380479 - 14381141
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||| | || || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  14380479 acatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtag 14380578  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| |  || || || ||||| ||  |||| || || |||||||| || |||||| || || |||| |||||     
T  14380579 gaaaacgctgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtt 14380678  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||| || |||||     
T  14380679 caattggggatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcgcagcaagtggatgtgaagtttgttgatttgatagttgctggtaatg 14380778  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| | ||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||| || ||||  | ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  14380779 gcactgaggaaagtgacttcatggtggatgatcagggtgtattgaggttcagaggaagaatttgtattcgtgacaatgatgagttgaaaaagttaatttt 14380878  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  14380879 agaggaaagtcacaagagtagcttgagtgttcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgat 14380978  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14380979 gttgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 14381078  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14381079 agtgagatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatg 14381141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 21472870 - 21472208
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  21472870 acatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 21472771  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||  || || |||| ||||||    
T  21472770 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttccttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgcgagttgccacctcagagtgtg 21472671  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  || ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21472670 cagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtattagggaagcgcagaaaattgatgtcaagtttgtggatttgatggttgctagtaatc 21472571  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | ||  ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||  | |||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  21472570 aaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggcgtgttgaggttcagaggaataatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgatttt 21472471  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  21472470 agaagaaagtcacagaagcagcttaagtattcacccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagat 21472371  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  21472370 gttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 21472271  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||| || || || ||| |||||  |||||||||||  || ||||| |||||||||||||    
T  21472270 agtgggacagtatctccatgaattttgcgacgagtttaccgaatactccaagagggcatgatg 21472208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 666
Target Start/End: Original strand, 34644606 - 34645259
Alignment:
Q  13 cagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  34644606 cagaggagatggctagagttattgaaggattatgagtttgggttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 34644705  T
Q  113 tgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttggg 212  Q
    | |||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||  ||||| | || ||||||||||||||    
T  34644706 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgcgagttgtcaccccagagtgtgcagttggg 34644805  T
Q  213 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggag 312  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||| ||  ||| |||||| | ||     
T  34644806 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttggatagtattagagaagcgcaactagtggacgtcaagtttgtggatttaatgattgatagcaatcaaactgaa 34644905  T
Q  313 aatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaa 412  Q
     || |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||| || |||||| |||||||| || || ||  |||| |  |||||||| |||||||    
T  34644906 gatggtgatttcaaggttgatgaacacggtgtgttgagattcagaggcagaatttgcattcctgataacgatgagatgaaaagattgattttggaagaaa 34645005  T
Q  413 gtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctca 512  Q
    |||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| |||   ||||||||||| || || |||||    
T  34645006 gtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtaccacgacttgaaaaagctgttttggtgggttggtttgaagcgtgatgttgctca 34645105  T
Q  513 ttttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggat 612  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34645106 gtttgtatatgcgtgtttgacttgtcagaagtcaaaggttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggat 34645205  T
Q  613 agcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34645206 agtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggacatgat 34645259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 10 - 666
Target Start/End: Original strand, 28281830 - 28282486
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  28281830 aggcagaggagatggcttgagttgttaaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagcaaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaaga 28281929  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    || | || ||||| ||  ||||| | |  || ||||| ||  | ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||  ||||  |||||||  | |||||    
T  28281930 cactccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagtttggtgtgtgagttgtcgcctcaaagcatacagtt 28282029  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||||| ||||| || || |||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||| |||||          
T  28282030 ggggatgctaaagattaacagcgatttcctgaatagtattcgagaagcacagcaagtggatgtcaagttggttgatctaatggttactggtaatagtatt 28282129  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  |||| |    
T  28282130 gaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagagg 28282229  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||    
T  28282230 aaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgc 28282329  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  28282330 tcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgg 28282429  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  28282430 gatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgat 28282486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 46 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 19436230 - 19435653
Alignment:
Q  46 gattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttg 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||   ||| || |    
T  19436230 gattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagccggaagacattgcatatgtctgctttgatggtggaggaattcg 19436131  T
Q  146 aattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatag 245  Q
    | ||||| || ||||| |  || |||||||| || |||||| || || |||| ||||| || ||  | |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  19436130 atttgctagagcagttcaaagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattcaggatgctgaaaattcatagtgatttcttgaatag 19436031  T
Q  246 tatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtg 345  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||| || |||||    | ||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  19436030 tatctgagaagctcagcaagtggatgtgaagtttgttgatttgatagttgctggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggtggatgatcagggtgtg 19435931  T
Q  346 ttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggag 445  Q
    |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  19435930 ttgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaataaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggag 19435831  T
Q  446 ctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtc 545  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19435830 ctacaaagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcagtttatgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtc 19435731  T
Q  546 taaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctat 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19435730 taaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatttctat 19435653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 112 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 25769353 - 25768822
Alignment:
Q  112 ttgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgg 211  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  | |||||  | ||| |||| |||||||||| ||    
T  25769353 ttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttctttgtgagttatcacctcagagtgtgcagtagg 25769254  T
Q  212 gtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcgga 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||    
T  25769253 gtatgttgaagatcaatagtgatttcttaaacaatatcagggaagcgcagaaaattgatgtcaagtttgtggatttaatggttgctagtaatcaaaatga 25769154  T
Q  312 gaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaa 411  Q
      || |||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  25769153 agatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaagaatttgtattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttggaagaa 25769054  T
Q  412 agtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctc 511  Q
    ||||| |  || | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||    
T  25769053 agtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgattttaagaaattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctc 25768954  T
Q  512 attttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtggga 611  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  25768953 agtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaagtggga 25768854  T
Q  612 tagcatttctatggattttatgacgagtttac 643  Q
     || ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25768853 cagtatttccatggattttgtgacgagtttac 25768822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 24365681 - 24365021
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||    
T  24365681 acatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcag 24365582  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||||||||| | |||||||| || ||| | ||||| || |||||| |||||||||| ||| |     
T  24365581 gaaaaccttgcacatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacattagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtata 24365482  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||  |||| ||| | |||||||| ||||| |||  | |  |||||     
T  24365481 cagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagtggatttgaagtttgttgatttgatgacttcaggtaatg 24365382  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||  | | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  24365381 acaccgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattct 24365282  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| || || |  |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  24365281 tgaggagagtcacaatagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagat 24365182  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| || || ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  24365181 gttgctcagttcgtttatgcctgtttgatctgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 24365082  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24365081 agtgggacagtatatctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 24365021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 43 - 614
Target Start/End: Original strand, 19488322 - 19488893
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||| ||  ||||||| |  ||||    
T  19488322 tatgattttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgaatatgtctgctatgatggttaaagagt 19488421  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||  || || ||||||||    
T  19488422 ttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtgaagttaggtatgttgaagatcagcagagagttcttgaa 19488521  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggt 342  Q
    |||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| | ||  || |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  19488522 tagtattaaagaagcgcagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttccaggttgatgatcaaggt 19488621  T
Q  343 gtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgg 442  Q
    |||||||||||  ||| || |||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  || | ||| ||||||||| |||    
T  19488622 gtgttgagattccgaggcagaattcgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgg 19488721  T
Q  443 gagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaa 542  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19488722 gagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaa 19488821  T
Q  543 gtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatag 614  Q
     ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19488822 atctaaagttgatcattagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgtgccggagtggaaatgggatag 19488893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 22443504 - 22442978
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| || |    
T  22443504 aaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatagtta 22443405  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||  | || |||||   |||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  22443404 gagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatt 22443305  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||||| |||||||||   ||||||||| |||||||| || ||  ||||| |||||||| |  | ||  || |||| |||||||| |||||     
T  22443304 tctgaagagtatcaaagaagcacagatagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaattagactgaagatggtgacttcaaggtcgatgac 22443205  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || ||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||   |||||||| |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||    
T  22443204 cacggtgtgttgagattccgagatcgaatttgtattcctgttgatgaagaaatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 22443105  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||  | ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||| | |||    
T  22443104 atccgggagctacaaagatgtttcatgatctgaagaaaatattttggtggtccggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttaatttg 22443005  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22443004 tcagaagtcgaaggttgagcatcagaa 22442978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 22435106 - 22434580
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| || |    
T  22435106 aaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatagtta 22435007  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||  | || |||||   |||| |||| |||||| |  |||| |||||||||||  ||||||| ||    
T  22435006 gagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatt 22434907  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||||| |||||||||   ||||||||| |||||||| || ||  ||||| |||||||| |  | ||  || |||| |||||||| |||||     
T  22434906 tctgaagagtatcaaagaagcacagagagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaattagactgaagatggtgacttcaaggtcgatgac 22434807  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || ||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||   |||||||| |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||    
T  22434806 cacggtgtgttgagattccgagatcgaatttgtattcctgttgatgaagaaatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 22434707  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||  | ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||| | |||    
T  22434706 atccgggagctacaaagatgtttcatgatctgaagaaaatattttggtggtccggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttaatttg 22434607  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22434606 tcagaagtcgaaggttgagcatcagaa 22434580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 27188700 - 27188147
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27188700 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 27188601  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||  | || ||||||||  | ||  ||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| | ||    
T  27188600 cgttgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagctacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaatt 27188501  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| || |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||     
T  27188500 gggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcacaaagagttgatgtaaagtttgtggatttattggttgctagagatcaggct 27188401  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | || || || |   | |||||  |||| |||||||||||  |||  | |||||| ||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  27188400 gaagacagcgattttagaatcgatgatgaaggcgtgttgagattccgaggaagaatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaag 27188301  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  27188300 agagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 27188201  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    ||| ||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  27188200 tcagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaa 27188147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 563
Target Start/End: Original strand, 27260540 - 27261093
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27260540 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 27260639  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||  | || ||||||||  | ||  ||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| | ||    
T  27260640 cgttgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagctacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaatt 27260739  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| || |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||     
T  27260740 gggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcacaaagagttgatgtaaagtttgtggatttattggttgctagagatcaggct 27260839  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | || || || |   | |||||  |||| |||||||||||  |||  | |||||| ||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  27260840 gaagacagcgattttagaatcgatgatgaaggcgtgttgagattccgaggaagaatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaag 27260939  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  27260940 agagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 27261039  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    ||| ||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  27261040 tcagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaa 27261093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 43 - 569
Target Start/End: Original strand, 20636351 - 20636877
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||  ||  ||||||||| |||||    
T  20636351 tatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttacatatgttcgctatgatggtaaaggagt 20636450  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    | || ||||| |||||||| || || |||||| | || ||||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||||  ||| ||| ||  ||||    
T  20636451 tcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaa 20636550  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggt 342  Q
     ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | ||    ||||| || ||  | ||||| ||||||    
T  20636551 gagtattaaagaagcgcaaaaggttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaaggcagtgattttaaaatcgatgatcaaggt 20636650  T
Q  343 gtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgg 442  Q
    |||||||| ||| |||  |  |||| |||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||    
T  20636651 gtgttgaggtttcgaggtaggatttttattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgg 20636750  T
Q  443 gagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaa 542  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  20636751 gagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaa 20636850  T
Q  543 gtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
     || |||||||| |||||||| |||||    
T  20636851 atcgaaggttgagcatcagaaacctgc 20636877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 43 - 569
Target Start/End: Original strand, 22761505 - 22762031
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  22761505 tatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatggtaaaggagt 22761604  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    | || ||||| ||||| || || || |||||| | || |||||||||| |||| |||||||| || | || |||||||||||  ||| ||| ||| ||||    
T  22761605 tcgagttgcttgaacaattcagagatttgagtttagtttgtgaaatgttatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaattcctgaa 22761704  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggt 342  Q
     ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||| ||||  | ||  | ||||| || ||  | ||||| ||||||    
T  22761705 gagtattaaagaagcgcaaaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgactttaaaatcgatgatcaaggt 22761804  T
Q  343 gtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgg 442  Q
    |||||||| ||| |||  |  ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||    
T  22761805 gtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgg 22761904  T
Q  443 gagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaa 542  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||| ||||| | ||||||| || ||||||    
T  22761905 gagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgatgttgcacagtttatgtattcttgtttgatttttcagaa 22762004  T
Q  543 gtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  22762005 gtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 22762031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 641
Target Start/End: Original strand, 29590946 - 29591568
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  29590946 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 29591045  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  29591046 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 29591145  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  ||||  ||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||  ||||  | ||  | |||    
T  29591146 gaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagt 29591245  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||| | |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  29591246 gattttaaaatcgataatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 29591345  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  29591346 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 29591445  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  29591446 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 29591545  T
Q  619 tctatggattttatgacgagttt 641  Q
    || ||||||||| ||||||||||    
T  29591546 tccatggattttgtgacgagttt 29591568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 569
Target Start/End: Original strand, 16625743 - 16626293
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16625743 agatgactcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 16625842  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  16625843 tgtccgccatgatggtcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 16625942  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| | |||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  16625943 gaagattgatagtgaatttctgaaaaatatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 16626042  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  16626043 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 16626142  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  16626143 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 16626242  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  16626243 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 16626293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Original strand, 24312194 - 24312835
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  24312194 agatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtttcagattccttgagtaggaagacattgcata 24312293  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| |||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  24312294 tgtccgccatgattgttagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 24312393  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| || ||||| || ||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  24312394 gaagattgatagtgaatttttgaaaagcatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 24312493  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||  | |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  24312494 gattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 24312593  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || |  ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  24312594 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 24312693  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  24312694 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 24312793  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  24312794 tccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 24312835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 641
Target Start/End: Original strand, 1542101 - 1542732
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  1542101 aggcagcgtagatggcttgaattgttaaaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaaga 1542200  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| || || || ||||||||||| ||  ||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| |  |    
T  1542201 cattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaact 1542300  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||| | ||  |     
T  1542301 gggtatgctgaagattgatagtgagttcctgaagagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagtgaccagact 1542400  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  1542401 gaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtctgttgagattccgagagagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaag 1542500  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | ||||| |  || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  1542501 agagtcacagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 1542600  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
      | ||||||||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||  ||     ||| || |||||||| || ||||| |||    
T  1542601 atagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgg 1542700  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  1542701 gatagtatatcaatggattttgtgacgagttt 1542732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 19865939 - 19865320
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  19865939 tggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgt 19865840  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    | ||  ||||||| |  ||||| ||  |||| ||||||||||| ||  ||||  | || |||||   |||||||||||||||| |  |||| ||||||||    
T  19865839 ctgctatgatggttaaagagttcgagctgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgactggtcatctcaaagtgtgaaactgggaatgctgaa 19865740  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    |||  ||||||| ||  | || |||||||  ||||||||  |||||||||| |||||| | || ||  ||||| ||||||||||  | ||  || ||||     
T  19865739 gattgatagtgaatttctaaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtcaagtttatagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgac 19865640  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||    |||||||||||||||  |||||||  |||||||  ||||| | ||||| ||||||| ||    
T  19865639 tttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagatttcgagttcgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagga 19865540  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgta 521  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| || |||||||| | || || ||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||    
T  19865539 gtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcattatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgta 19865440  T
Q  522 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttct 621  Q
    | | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||  ||     | | || |||||||| |||||||| |||||||| || ||     
T  19865439 ttcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatcc 19865340  T
Q  622 atggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  19865339 atggattttgtgacgagttt 19865320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 641
Target Start/End: Original strand, 5838290 - 5838867
Alignment:
Q  64 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagttta 163  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| || || || || |||||||    
T  5838290 catccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgagcagttta 5838389  T
Q  164 gggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaaca 263  Q
    | ||  ||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||  |    
T  5838390 gagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcatagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgattttctgaatagtatcaaggaagcacagaa 5838489  T
Q  264 agttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaa 363  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  | ||  ||||||||||  | ||  || |||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||   ||   ||    
T  5838490 agttgatgtcaagtttgtggatttgttagtcgctagtaatcagactgaagatggtgattttaaggtcgatgaccatggtgtgttaagattccaaggtcaa 5838589  T
Q  364 atttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatg 463  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | || || |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||    
T  5838590 atttgtatccctgacaatgaagagatgaagaaaatgattctcgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatg 5838689  T
Q  464 atttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||  || ||||| || || || || || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  5838690 atttgaagaagttattttggtggtttggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcagaa 5838789  T
Q  564 gcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
     ||||| ||  ||     | |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||| |||| |||||    
T  5838790 acctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccggaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgactagttt 5838867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 15897331 - 15896792
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||  | || ||||| ||  ||||| | |    
T  15897331 aaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgcgatgatgatca 15897232  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||  | || |||||| ||||| |||| |||||| |||| || |||||||||||  ||||||| ||    
T  15897231 aagaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtgaatt 15897132  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| | |||  | | |||||  | ||  ||||||| || |||||||||||     
T  15897131 cttgaacagtattaaagaagcacaaaaagttgatgtaaagtttgtagatttacttgttggtggaaatcagactgaagatagtgactttaaggttgatgat 15897032  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || || |||||| ||||  ||| || |||| ||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||| |  |||| ||||| |  || | ||||||||| |    
T  15897031 cagggagtgttgcgattacgaggcagaattcgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttaaagagagtcacacaagtatcttgagtatcc 15896932  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||| ||| ||||| | | |||    
T  15896931 atccaggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaggttattttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtatattcatgtctaatttg 15896832  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttg 576  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  15896831 tcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgctgggttg 15896792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 569
Target Start/End: Original strand, 2873829 - 2874379
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  2873829 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 2873928  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  2873929 tgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 2874028  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| | |||||  ||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | | |    
T  2874029 gaagattgatagtgagtttctgaaaaatatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgaggacttgttggttgctagagatcagactgaagacaat 2874128  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || ||||||| |||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  2874129 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatggagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 2874228  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  2874229 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttttggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 2874328  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  2874329 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 2874379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 452
Target Start/End: Original strand, 14378929 - 14379376
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||| | || || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  14378929 acatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtag 14379028  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| |  || || || ||||| ||  |||| || || |||||||| || |||||| || || |||| |||||     
T  14379029 gaaaacgctgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtt 14379128  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||| || |||||     
T  14379129 caattggggatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcgcagcaagtggatgtgaagtttgttgatttgatagttgctggtaatg 14379228  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| | ||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||| || ||||  | ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  14379229 gcactgaggaaagtgacttcatggtggatgatcagggtgtattgaggttcagaggaagaatttgtattcgtgacaatgatgagttgaaaaagttaatttt 14379328  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaa 452  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14379329 agaggaaagtcacaagagtagcttgagtgttcatccgggagctacaaa 14379376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 660
Target Start/End: Original strand, 28262214 - 28262864
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28262214 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 28262313  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || |||||||| || ||  ||||| | || ||||||  |||  |||| |||||| |  |    
T  28262314 cattgcatatgtctgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcgcctcagagtgtgaaact 28262413  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| || |||| |||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||  |||| ||     
T  28262414 gggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcacagaaagttgatgtgaagttcgtggatttgttggttgctagagatcaggct 28262513  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
     |    ||||| || ||  | ||||| ||||| |||||||||||  |||  | |||||||||||| ||| | |||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  28262514 caaggcagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaag 28262613  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| ||||||||  | || || ||    
T  28262614 agagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaggagatgtggc 28262713  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||| ||     ||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  28262714 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccggaatggaaatgg 28262813  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  28262814 gatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 28262864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 660
Target Start/End: Original strand, 28340963 - 28341613
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28340963 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 28341062  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || |||||||| || ||  ||||| | || ||||||  |||  |||| |||||| |  |    
T  28341063 cattgcatatgtctgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcgcctcagagtgtgaaact 28341162  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| || |||| |||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||  |||| ||     
T  28341163 gggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcacagaaagttgatgtgaagttcgtggatttgttggttgctagagatcaggct 28341262  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
     |    ||||| || ||  | ||||| ||||| |||||||||||  |||  | |||||||||||| ||| | |||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  28341263 caaggcagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaag 28341362  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| ||||||||  | || || ||    
T  28341363 agagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaggagatgtggc 28341462  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||| ||     ||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  28341463 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccggaatggaaatgg 28341562  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  28341563 gatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 28341613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 23079703 - 23079175
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||| | || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  |    
T  23079703 gattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaag 23079604  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    ||||| | || || ||||||||||| || |||||| | || || ||  |||||||||| ||||||  | | || |||||||| ||  ||||||| ||  |    
T  23079603 agtttaattttctggaacagtttagagatttgagtttagtctgcgagttgtcatctcagagtgtgaggctaggaatgctgaaaattgatagtgaatttct 23079504  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| ||||| | |||||| ||  |||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||  | ||  ||||||| || ||  | ||||| |||    
T  23079503 gaaaagtattaaagaagcgcataaagttgatgttaggtttgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaa 23079404  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    || |||||||||||  |||  | ||||| |||||||||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||| |||     
T  23079403 ggagtgttgagattccgagggagaatttctattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatc 23079304  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| || ||||| || || || ||  | ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  23079303 cgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtagcataatttgtgtattcctgtttgatttgtca 23079204  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctg 568  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  23079203 gaagtcgaaagttgagcatcagaaacctg 23079175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 641
Target Start/End: Original strand, 18196762 - 18197376
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| |||  |||||| || ||||||||||| || || ||||    
T  18196762 tggctcgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttatagatgccttaagtaggaagactttacatatgt 18196861  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
     |   | ||||          |||| || || |||||| |||| || |||||| | || || ||| |||||||||| |||||| || | || ||||||||    
T  18196862 tgttgtagatgcc--------ttgagttacttgaacaggttagagatttgagtttagtttgcgaattgtcatctcagagtgtgaagctaggaatgctgaa 18196953  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  |  || |||||||     
T  18196954 gattgatagtgatttcttgaaaagtattattgaagcgcagaaagttgacgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcacactaaggatagtgac 18197053  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||| | || ||  |||||||| ||||| | ||||| ||||| |  |    
T  18197054 tttaaggtcgatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggtagaatttgtattccagacgacgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaa 18197153  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccgg---tttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||    ||||| || || || || || |||||    
T  18197154 gtagcttgagtattcatccgggagctaccaagatgtatcatgatttgaaaaatttgttttggtggtcgggattattgaaacgtgatgtggcacagtttgt 18197253  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | ||||||| ||   ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||| || ||| | || |||||||| |||||||||||     
T  18197254 gtattcctgtttgattttctagaagtcaaaggttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatataccagagtggaaatgggatagcata 18197353  T
Q  619 tctatggattttatgacgagttt 641  Q
    |  ||||||||| ||||||||||    
T  18197354 tgcatggattttgtgacgagttt 18197376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 25113821 - 25113257
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25113821 acatgaggcagcgtagatggctagagttgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 25113722  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| || || || |||||||| || ||  ||||| | || || |||  |||| |||| || ||     
T  25113721 gaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagcgta 25113622  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
     |  ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||  |||||||  ||||||||  |||| ||||| || |||||||| ||  ||||| ||||  |||    
T  25113621 aaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgagaagtatcaaggaagcacagaaagtcgatgtaaaatttgtggacttgttggttgctagagatc 25113522  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| |    
T  25113521 agactgaagacagtgattttaaattcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattct 25113422  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||| |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || ||     
T  25113421 tgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagat 25113322  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    || || || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  25113321 gtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgc 25113257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 508 - 666
Target Start/End: Original strand, 27560132 - 27560290
Alignment:
Q  508 gctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagt 607  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| ||||||||||| |    
T  27560132 gctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcaggattgttgacgccattggatgtaccggagtggaaat 27560231  T
Q  608 gggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  27560232 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgaggggacatgat 27560290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 569
Target Start/End: Original strand, 25608903 - 25609437
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  25608903 taaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggt 25609002  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgat 234  Q
     || ||||| || ||| | ||||||||||| || |||||| | || ||||||  |||| |||| | |||  || | || |||||||||||  |||||||     
T  25609003 tagagagttcgagttgttggaacagtttagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagattgtaaagctaggaatgctgaagattgatagtgaa 25609102  T
Q  235 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatg 334  Q
    ||  |||  | ||| | ||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | ||  |  |||| || ||| | ||||    
T  25609103 tttctgagaaatattaaagaagcatagaaagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaagatcgatg 25609202  T
Q  335 agcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtat 434  Q
    | |||||||| ||||| ||| |||  |  ||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||    
T  25609203 accaaggtgtattgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgaagagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtat 25609302  T
Q  435 tcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgact 534  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| || |||||  | || || || |  ||||||||| | ||||||| |    
T  25609303 tcatccgggagctacaaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaatgtgatgttgcaccgtttgtgtattcttgtttgatt 25609402  T
Q  535 tgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  25609403 tgtcaaaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 25609437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 569
Target Start/End: Original strand, 18406986 - 18407518
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  18406986 taaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaacgttgttgtagacgctttgagcaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 18407085  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgat 234  Q
    || |||||| || ||||| |||||||| || || |||||| | || ||||||||||||||| | ||||   || | || |||||||||||  |||| ||     
T  18407086 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgagagtga--agctaggaatgctgaagattgatagcgaa 18407183  T
Q  235 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagc-ggagaatagtgaattcaaggttgat 333  Q
    ||  | || ||||| | ||| | |||  |||| |||||||||||||| || ||  ||||| ||||| ||||  | |||||  ||||| || ||  | |||    
T  18407184 tttctaaagagtattaaagaggaacagaaagtcgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtgatcagactggagac-agtgattttaaaatcgat 18407282  T
Q  334 gagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagta 433  Q
    || |||||||||||||| ||| |||  |  ||||||||||| ||  |||||||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || ||||||||||    
T  18407283 gatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagta 18407382  T
Q  434 ttcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgac 533  Q
    |||||  ||||||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| || ||||| ||||| || || || ||| ||||| | |||||||     
T  18407383 ttcatctgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttgctagtctggattgaaacgcgatgttgcacagtttttgtattcttgtttgat 18407482  T
Q  534 ttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  18407483 ttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 18407518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 569
Target Start/End: Original strand, 22077761 - 22078266
Alignment:
Q  64 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagttta 163  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||| ||| |||||| || ||||| |||||||| |    
T  22077761 catccgagtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttca 22077860  T
Q  164 gggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcacaac 262  Q
    | || |||||| | || || || ||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||  ||| || ||||| |||| ||||| | |||||||||      
T  22077861 gagatttgagtttagtttgcgagatgtcatctgagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatattgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcacata 22077959  T
Q  263 aagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaa 362  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||  |  |  || |||| || ||  ||||||| |||||| ||||||| ||| |||  |     
T  22077960 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactaaagatggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaag 22078059  T
Q  363 aatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcat 462  Q
    |||||||| ||  ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  22078060 aatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcat 22078159  T
Q  463 gatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaga 562  Q
    ||| | || ||  | ||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22078160 gatctaaaaaaattattttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcaga 22078259  T
Q  563 agcctgc 569  Q
    | |||||    
T  22078260 aacctgc 22078266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 508 - 667
Target Start/End: Original strand, 22796147 - 22796306
Alignment:
Q  508 gctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagt 607  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  22796147 gctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccaaagtggaagt 22796246  T
Q  608 gggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    || | | ||| |  ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  22796247 ggaacaacatatacatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatg 22796306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 569
Target Start/End: Original strand, 16962462 - 16963021
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| || ||  |||| |||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||     
T  16962462 aggcagcgtagatggcttgaattgctaaaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttggagatgcattgagtaggaagt 16962561  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||  ||||| || || || ||||||||||| ||  ||||| | || ||||||  || |  ||| |||||| |  |    
T  16962562 cattgcacatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttactggaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaacggttacgtcagagtgtgaaact 16962661  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| ||  |||| ||||| | | | |||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  |     
T  16962662 gggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaaaaggcacataaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagact 16962761  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  || |||| || || || ||||| || || |||||||||||  |||     ||||| ||||||||| ||| |||  ||| |||  ||||| | ||||    
T  16962762 gaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggcgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaggaaaatgattcttgaag 16962861  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||| | |||||  | ||||| ||||| || ||||||||||| || ||    
T  16962862 agagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaatatattttggtggtctggattgaagcgcgatgtggc 16962961  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
     || ||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  16962962 acagtttgtgtactcttgtttgatttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgc 16963021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 605
Target Start/End: Original strand, 18966324 - 18966904
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||| || ||   |||||| || |||||||| ||  | || ||||    
T  18966324 tggcttgaattattgaaagattatgatttttggttgaattatcatctaggtaaagctaacgttgt---agatgctttaagtaggaaaactctacatatgt 18966420  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    | ||  ||||||  |  ||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||||| | || | |||| ||||| |||| |||||| |||| || ||||||||    
T  18966421 ctgctatgatggctaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtctatgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaa 18966520  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    |||  ||||||| ||  | |||||||| | |||||| ||  ||||  |||| |||||||| |||||| |  ||  | | |||||  |  |  |||||||     
T  18966521 gattgatagtgaatttctcaatagtattaaagaagcgcagaaagtgaatgtaaagtttgtagatttatttattggtggaaatcagactaaagatagtgac 18966620  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    || ||||||||||| || || |||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||| | ||||| ||||| |  |    
T  18966621 tttaaggttgatgatcagggagtgttgtgatttcgaggtagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaggaagatgattcttgaagagagtcacagaa 18966720  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgta 521  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | |||||  | || ||  | || ||||||||    
T  18966721 gtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaaaaatttgttttgctggtctaggttgaatagtgatgtgccacaatttgtgta 18966820  T
Q  522 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaa 605  Q
    | ||||||||| |||||||||||| || | ||| ||||| || ||||  ||||||   ||||| || |||||||| ||||||||    
T  18966821 ttcatgtttgatttgtcagaagtcaaaaggtgagcatcataaacctggtgggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaa 18966904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Original strand, 27564865 - 27565134
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  27564865 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggtta 27564964  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    |  |||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||  | || ||||||  |||| |||| |||||| |  |||| |||||||||||  ||||||| ||    
T  27564965 gaaagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgaatagtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatt 27565064  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaa 306  Q
      ||||  |||| | ||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| |||||||||||    
T  27565065 tctgaagggtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcaa 27565134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 569
Target Start/End: Original strand, 27330537 - 27331009
Alignment:
Q  97 ttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctc 196  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||||| |||||| || ||||| ||| |||| |  || ||||| || || || || |||||||||     
T  27330537 ttgagtaggaagacttttcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaatagttcaaagatttgagcctagtttgcgagatgtcatcta 27330636  T
Q  197 aaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttac 296  Q
    | ||| || || | || |||||||||||  ||| ||| ||  |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||  ||||| |    
T  27330637 agagtttgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgc 27330736  T
Q  297 tagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaag 396  Q
    |||||||||  | ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||| |||  | | | ||| |||||||| ||| |||| ||  ||||||||    
T  27330737 tagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcaaaatagaatatgtattccagacgatgatgagatgaagaag 27330836  T
Q  397 ttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttga 496  Q
     ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||  |||||||| | || ||||| |||||| | |||||| | ||||| ||||| || ||||    
T  27330837 atgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctgcgaagatgtaacatgatctaaagaagttattttggtggtctgggttga 27330936  T
Q  497 agcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    | ||| | || || || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  27330937 aacgcaatgtggcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 27331009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 569
Target Start/End: Original strand, 27391277 - 27391749
Alignment:
Q  97 ttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctc 196  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||||| |||||| || ||||| ||| |||| |  || ||||| || || || || |||||||||     
T  27391277 ttgagtaggaagacttttcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaatagttcaaagatttgagcctagtttgcgagatgtcatcta 27391376  T
Q  197 aaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttac 296  Q
    | ||| || || | || |||||||||||  ||| ||| ||  |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||  ||||| |    
T  27391377 agagtttgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaaaagtattaaagaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgc 27391476  T
Q  297 tagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaag 396  Q
    |||||||||  | ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||| |||  | | | ||| |||||||| ||| |||| ||  ||||||||    
T  27391477 tagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcaaaatagaatatgtattccagacgatgatgagatgaagaag 27391576  T
Q  397 ttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttga 496  Q
     ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||  |||||||| | || ||||| |||||| | |||||| | ||||| ||||| || ||||    
T  27391577 atgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctgcgaagatgtaacatgatctaaagaagttattttggtggtctgggttga 27391676  T
Q  497 agcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    | ||| | || || || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  27391677 aacgcaatgtggcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 27391749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 569
Target Start/End: Original strand, 16926687 - 16927216
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  |    
T  16926687 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaaaag 16926786  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    |||| || || || ||||||||||| ||  ||||| | || ||||||  || | |||| | |||| |  |||| |||| ||||||  ||||||| ||  |    
T  16926787 agttcgagttactggaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaacggttacctcagaatgtgaaactgggaatgcggaagattgatagtgaatttct 16926886  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| ||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| |||||||| |  | ||  || |||| || || || ||||| ||     
T  16926887 gaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaattagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccat 16926986  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    ||||||||||||||  |||     ||||| ||||||||| ||| |||  ||| |||  ||||| | ||||| ||||| |  || | ||||||||||||      
T  16926987 ggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaggaaaatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcacc 16927086  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | ||||||   ||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | | ||||| |||| |    
T  16927087 cgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaagagattttggtggtctggattgaagcgcgatgtggcacagtttgtgtactcttatttgatttgtta 16927186  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||||| ||  |||| |||||||| |||||    
T  16927187 gaagtcgaaaattgagcatcagaaacctgc 16927216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 364 - 641
Target Start/End: Original strand, 27566351 - 27566628
Alignment:
Q  364 atttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatg 463  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27566351 atttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatg 27566450  T
Q  464 atttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    |||| |||||| | || || ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | |||||   |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27566451 atttaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaa 27566550  T
Q  564 gcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
     ||||| ||  ||     | | || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  27566551 acctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaagtgggatagtatatccatggattttgtgacgagttt 27566628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 580 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 17416180 - 17416093
Alignment:
Q  580 acaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  17416180 acaccgttggatgtgccggagtggaagtgggataacatttctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagaggacatgatg 17416093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 314 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 18436569 - 18436310
Alignment:
Q  314 atagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaag 413  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||| | ||| |  | | |||||||||||||||  ||  |||| | || ||||||||| | ||||||||    
T  18436569 atagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaatagaatttgtattcctgatgatacagaaatcaaaaagttgattctggaagaaag 18436470  T
Q  414 tcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtc----cggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||| |  || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||     || |||||| | || || ||    
T  18436469 tcacagaagtaatttgagtattcatccgggacctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttattttggtggtctgggtgggttgaagtgagatgtggc 18436370  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
     || ||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18436369 acaatttgtgtatgcgtgtttaatttgttagaagtctaaagttgaacatcagaaacctgc 18436310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18449749 - 18449593
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||| || ||||| ||  |||||||    
T  18449749 taaaggattataatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcatatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggt 18449650  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtc 191  Q
     |  ||||| || ||||| | |||||| |  ||||||||| | || |||||| ||||    
T  18449649 taaagagttggagttgcttgcacagttcaaagacttgagtttggtttgtgaagtgtc 18449593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 444 - 660
Target Start/End: Original strand, 28291823 - 28292039
Alignment:
Q  444 agctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaag 543  Q
    |||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| ||||||||  | || || || || ||||||||| | |||||   ||||||||||    
T  28291823 agctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaagagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaag 28291922  T
Q  544 tctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttac 643  Q
    || ||||| || |||||||| || || ||| ||     ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||| |||||||||| |    
T  28291923 tcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccggaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgc 28292022  T
Q  644 aaaacactccgagaggg 660  Q
      || ||||||||||||    
T  28292023 cgaatactccgagaggg 28292039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Original strand, 16381962 - 16382010
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16381962 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 16382010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Original strand, 1648403 - 1648451
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1648403 accgttgtttgtgccagagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 1648451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Original strand, 14624946 - 14624994
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14624946 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctattgatttt 14624994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 16233711 - 16233672
Alignment:
Q  591 tgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16233711 tgtgccagagtggaagtgggatagcatttccatggatttt 16233672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 23996931 - 23996893
Alignment:
Q  591 tgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattt 629  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23996931 tgtgccagagtggaaatgggatagcatttctatggattt 23996893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 16098726 - 16098698
Alignment:
Q  598 gagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16098726 gagtggaagtgggatagcatttctatgga 16098698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 16098897 - 16098833
Alignment:
Q  427 ttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccgg 491  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  16098897 ttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaagttgttttggtggcccgg 16098833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 18572343 - 18572299
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18572343 accgttgtttgtgccagagtggaagtgagatagcatttctatgga 18572299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 626
Target Start/End: Original strand, 18837497 - 18837541
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18837497 accgttgtttgtgccagagtggacgtgggatagcatttctatgga 18837541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Original strand, 23027305 - 23027353
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23027305 accgttgtttgtgccggagtggaagtgggatagtatctttatggatttt 23027353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 79)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 643
Target Start/End: Original strand, 10419140 - 10419778
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10419140 acatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 10419239  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  10419240 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtg 10419339  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10419340 cagttgggtatgttgaagatcaatagtgacttcttgaatagtatcagagaagcacaacgagttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatc 10419439  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||| || |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10419440 aagctgaggatggtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtattgagatttagaggcagaatttgtgttcccgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 10419539  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  | ||||||   ||     
T  10419540 agaagaaagtcataagagtaatttgagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctagattgaagaaggat 10419639  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  10419640 gtcgcgcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcgggattgttgacaccgttggatataccggagtgga 10419739  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttac 643  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10419740 aatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttac 10419778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 14087707 - 14087046
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14087707 acatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttaaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtag 14087608  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||| | || |||| |    
T  14087607 gaagacattacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgag 14087508  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14087507 aagttgggtatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatc 14087408  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  || |||| || |||||| ||||| ||||| || ||  |||| | |||||||||    
T  14087407 aagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattccagacaacgatgagatgaaaaggttgatttt 14087308  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||     
T  14087307 ggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgat 14087208  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  14087207 gttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtgga 14087108  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  14087107 aatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatgat 14087046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 40 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 17493629 - 17493002
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| || |    
T  17493629 gattatgattttggtttgagttaccatccgggtaaagccaacgtggttgcagatgccttgaggaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtgagag 17493530  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||| || || |||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17493529 aatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcgtgtctgtgaattgacacctcagagtgtacatttggggatgctgaagattaatagtgatttctt 17493430  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| || ||| | |  | ||  ||||||| || ||||||||||| ||     
T  17493429 gaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtagtgacactgaagatagtgacttaaaggttgatgatcag 17493330  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  17493329 ggtgtgttgaggtttagaggaagaatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatt 17493230  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17493229 ctggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcaatttttgtatgcatgtttgacttgtca 17493130  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17493129 gaaatctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccagagttgaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagt 17493030  T
Q  640 ttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  17493029 ttaccgaacactccaagagggcatgatg 17493002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Original strand, 13971215 - 13971876
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13971215 acatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgactttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 13971314  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||| | || ||||||    
T  13971315 gaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 13971414  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13971415 cagttgggtatgttaaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcaaataagcgcaacaggttgatgtcgagtttgtggatttaatagttaatagtaatc 13971514  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  || |||| || |||||| ||||| ||||| || ||  |||| | |||||||||    
T  13971515 aagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattcccgacaacgatgagatgaaaaggttgatttt 13971614  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||     
T  13971615 ggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgat 13971714  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | ||||||||||    
T  13971715 gttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatataccggagtgga 13971814  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  13971815 aatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatgat 13971876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 12359622 - 12360299
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  12359622 acatgaggcagagaagatggatagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagattccttgagtag 12359721  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
     ||||| ||||| ||||| || |||||||| |   | ||||| ||| | || |||||||| |||||||| || || |||||| || || |||| |||||     
T  12359722 aaagacgttgcatatgtctgctttgatggtgaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgta 12359821  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||     
T  12359822 cagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtagatgtgaagtttgttgatttaatggttgttggtaatg 12359921  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaag---------------aatt 389  Q
       | ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||  |||| |               | ||    
T  12359922 gcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcctgatgatgatgttcctgatgatgatgattt 12360021  T
Q  390 gaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtcc 489  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12360022 gaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtcc 12360121  T
Q  490 ggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttgg 589  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  12360122 ggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctcaggttgaatattagaagcctgcagggttgttgacacagttgg 12360221  T
Q  590 atgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12360222 atgtgccggagtggaagtgggataacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 12360299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 14574952 - 14574295
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  14574952 aggcagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 14574853  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||| ||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||  ||||| |||| |||||||||||    
T  14574852 cgttgcatatgtctgctatgatggtaaatgaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgcgagttgtcacctcagagtgtgcagtt 14574753  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| || ||| | || |     
T  14574752 gggtatgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtagtgaaact 14574653  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| ||||||    
T  14574652 gaagatagtgacttcaaggttgatgatcatggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattctagaag 14574553  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| ||||| || ||||| || || || ||    
T  14574552 aaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcacgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgagatgttgc 14574453  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  14574452 tcggtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacatcgttagatgtgccagagtggaagtgg 14574353  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14574352 gatagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 14574295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 40 - 667
Target Start/End: Original strand, 18133476 - 18134103
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | || |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  |    
T  18133476 gattatgattttggcatgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcatataccttaagtaggaaaacgttgcatatgtctgctttgatggtaaaag 18133575  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    | ||||| ||| | || | |||||| |||||||| ||||| |||||| || || |||| ||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  18133576 aatttgatttgttagagccgtttagagacttgagcctcgtctgtgaattgacacctcatagtgttcagttggcgatgctaaagattaacagtgatttctt 18133675  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||||| |||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||| ||  | ||||| || | ||| ||||||| || ||||||||||| ||     
T  18133676 gaataatatccgagaagcgcagcaagtagatgtgaagtttgttcatttgatgattgttggtaatgaaactgaggatagtgactttaaggttgatgatcag 18133775  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    |||||||| || || ||||  | |||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||     
T  18133776 ggtgtgttaaggttcagaggaagaattagtattcctgataatgacgagttgaaaaagttaattttggaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatc 18133875  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18133876 caggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 18133975  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18133976 gaagtctaaggttgaacattagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttcaatggattttgtgacgagt 18134075  T
Q  640 ttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18134076 ttaccaaacactccgagagggcatgatg 18134103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Original strand, 16827303 - 16827960
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| || || || || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||    
T  16827303 aggcagagaagatggcttgacttgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtgtttgcagatgctttgagcaggaaga 16827402  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||  ||||| ||||  |||| |||||    
T  16827403 cgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagaccattttagagacttgagtcttatctgtgagttgtcacctcagggtgtacagtt 16827502  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| || |     
T  16827503 gggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacatcaagttgatgtcaagtttgttgatttgatggttgctagtaatgaaact 16827602  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  16827603 gaagataatgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcagaggaaaaatttgtattcatgataatgatgatttgaaaaagttgattttagagg 16827702  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    |||  || || || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| || || || ||    
T  16827703 aaacccacaaaagtagcttaagtattcatcagggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgc 16827802  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16827803 tcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgg 16827902  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    || | |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16827903 gacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaacactctgagagggcatgatg 16827960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 10 - 666
Target Start/End: Original strand, 16835610 - 16836266
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  16835610 aggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtagttgcggatgcgttgagcagaaaga 16835709  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  || || |  | ||||| |||||    
T  16835710 ctttgcacatgtctgcattaatggtaagagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtcttgtgtgtgagttgacaccgaagagtgttcagtt 16835809  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||| |||| || || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||| ||||| || ||| | || ||| || |||||    |     
T  16835810 gggtatgttgaaaattaacagtgatttcttgagtagtatccgagaagcacagcaggtggatgtcaagttggttgatctgattgttgctggtaatggcact 16835909  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| ||||| |||||||| || || || || ||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |    
T  16835910 gaagatagtgacttcaaagttgatgatcagggagtattaagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaatcaaaaaagttaattttagagg 16836009  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  16836010 aaagtcacaagagtagcttgagtattcatcccggagctacgaagatgtatcatgagttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgc 16836109  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16836110 tcattttgtgtatgcgtgcttcacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaaatgg 16836209  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  16836210 gatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccaagaggacatgat 16836266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 5 - 611
Target Start/End: Original strand, 31694281 - 31694887
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||| | || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31694281 acatgaggcagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaacatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtag 31694380  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| ||  |||| ||||| || |||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||  || || |||||| || || |||| |||||     
T  31694381 gaaaacgctgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgaaccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtt 31694480  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||| || |||||     
T  31694481 cagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattcgagaagcacagcaagtggatgtgaagtttgttgacttaatggttgctggtaatg 31694580  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  31694581 gcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcctgatgatgacgaattgaaaaagttgatttt 31694680  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||    
T  31694681 agaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtattatgatctgaagaagttgttttggtggtccggtttgaaacgtgac 31694780  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  31694781 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttaaatgtgccggagtgga 31694880  T
Q  605 agtggga 611  Q
    |||||||    
T  31694881 agtggga 31694887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 5 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 31939937 - 31939331
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31939937 acatgaggcagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtag 31939838  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| ||  |||| ||||| || |||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| || |  |||||| || || |||| |||||     
T  31939837 gaaaacgctgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagtttagagactcgagccttgcctgtgaattgacacctcagagtgtt 31939738  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||| || |||||     
T  31939737 cagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattcgagaagcacagcaagtggatgtgaagtttgttgacttaatggttgctggtaatg 31939638  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  31939637 gcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcctgatgatgacgaattgaaaaagttgatttt 31939538  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||| | | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  31939537 agaggaaagtcacaagggtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtattatgatctgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgac 31939438  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  31939437 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagccttcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtgga 31939338  T
Q  605 agtggga 611  Q
    |||||||    
T  31939337 agtggga 31939331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 41178551 - 41177895
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41178551 aggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaaga 41178452  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    || | || ||||| ||  ||||| | |  || ||||| ||  | ||||||||||| ||| ||||| | || |||||  ||||  |||||||||| |||||    
T  41178451 cactccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagtttggtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtacagtt 41178352  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| | |||||| || |||||   |      
T  41178351 ggggatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtcaagttggttgatctgatggttgctggtaatggcgtt 41178252  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||| |    
T  41178251 gaagatagtgacttcaaggttgatgaacagggtgtgttgagaatcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttgatcctagagg 41178152  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||    
T  41178151 aaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgc 41178052  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  41178051 tcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgg 41177952  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  41177951 gatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgat 41177895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 10 - 666
Target Start/End: Original strand, 16380028 - 16380684
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  16380028 aggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagcaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaaga 16380127  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    || |||| ||||| ||  ||||| |||  || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| | || |||||  ||||  |||||||  | |||||    
T  16380128 cactgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtttggtatgtgagttgtcgcctcaaagcatacagtt 16380227  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    |     
T  16380228 gggcatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagcacaacaggtggatgtcaagttggttgatttgattgttactggtaatggcact 16380327  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  16380328 gaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagagg 16380427  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||  | || |||||    
T  16380428 aaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtacgggttgaattgagatgtcgc 16380527  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||| || |||||||| |||    
T  16380528 tcattttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcaaaagcctgcaggattgttgacgccgttggatgtaccagagtggaaatgg 16380627  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16380628 gatagcatttctatggatttcgtgacaagcttaccaaacactccgagaggacatgat 16380684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 10 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 13943053 - 13942397
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  13943053 aggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaaga 13942954  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    || |||| ||||| ||  ||||| |||  || || || ||||| ||||||||||| ||| ||||| | || |||||  |||| |||||||| || |||||    
T  13942953 cactgcatatgtctgctatgatgataaaagaattcgatttgctggaacagtttagagacatgagtttggtatgtgagttgtcgtctcaaagcgtacagtt 13942854  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| | || ||| |||||||| || |||||          
T  13942853 ggggatgctaaagattaacagtgatttcctgaatagtatccgggaagcacaacaagtggatgtcaagctggttgatctaatggttgctggtaatggcatt 13942754  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| ||| |||||||||| || |||||| | ||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  |||| |    
T  13942753 gaagatagtgacttccaggttgatgatcagggtgtgctaagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagagg 13942654  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||    
T  13942653 aaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgc 13942554  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| | |||||||| ||||||||||| |||    
T  13942553 tcatttcgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcaggattgttgacatcattggatgtaccggagtggaaatgg 13942454  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  13942453 gatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgat 13942397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 10 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 44778276 - 44777631
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  44778276 aggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaaga 44778177  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    || |||| ||||| ||  ||||| | |  || ||||| || || ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||  ||||  |||| ||  | |||||    
T  44778176 cactgcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagagacatgagtttggtgtgtgagttgtcgcctcagagcatacagtt 44778077  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatca-agc 308  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||| |||||||| || |||||   | |    
T  44778076 ggggatgctaaagattaacagtgatttcctgaatagtatccgggaagcgcagcaagtggatgtcaagttggttgatctaatggttgctggtaatggtatc 44777977  T
Q  309 ggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaa 408  Q
    | ||| | |||| |||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  ||||     
T  44777976 gaaga-tggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgctaagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagag 44777878  T
Q  409 gaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcg 508  Q
    |||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || |    
T  44777877 gaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttg 44777778  T
Q  509 ctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtg 608  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  44777777 ctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcccgcaggattgttgacaccattggatgtaccagagtggaaatg 44777678  T
Q  609 ggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccga 655  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  44777677 ggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccga 44777631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 40 - 666
Target Start/End: Original strand, 11960299 - 11960925
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  11960299 gattatgattttggcttgaattaccatcctagtaaggccaatgtggttgctgatgcattgaggaggaaaacattgcatatgtctgctttgatggtaaagg 11960398  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||| | |||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||    
T  11960399 aatttgagttgctagagcagtttagggacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgatgaggattgatagtgatttctt 11960498  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| |||||| ||||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||| |||  |||| ||||| |  | ||| ||||||| || ||||||||||| ||     
T  11960499 gaacagtatccgagaagctcagcaagtagatttgaagtttgttgatttgatgactactggtaatgacactgaggatagtgactttaaggttgatgatcag 11960598  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    |||||| |||| || ||||  | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| |||||  | || |  |||||||||||      
T  11960599 ggtgtgctgaggttcagaggaagattttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtcacgatagtagtttgagtattcacc 11960698  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    | || |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11960699 caggggctataaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtca 11960798  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  11960799 gaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgagacagtatttctatggattttgtgacgagt 11960898  T
Q  640 ttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||    
T  11960899 tttccaaacactccgagaggacatgat 11960925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 89 - 667
Target Start/End: Original strand, 11302952 - 11303530
Alignment:
Q  89 cagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaat 188  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||| |  || |||||  |||| || |||||||| || |||||||| || |||||| |    
T  11302952 cagatgcgttgagcagcaagacattgcatatctctgctttgatggtgaaagaatttgatctgctagagcagtttagagatttgagtcttgtctgtgaatt 11303051  T
Q  189 gtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggattta 288  Q
    | || |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  11303052 gacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtagatgttaagtttgttgatttg 11303151  T
Q  289 atggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaat 388  Q
    ||||||| | |||||    | ||| ||||||| || ||||||||||| || |||||||| || || ||||  | |||||| |||||||| ||||| || |    
T  11303152 atggttaatggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttaaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatt 11303251  T
Q  389 tgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtc 488  Q
    | || | ||||| |||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11303252 tcaaaaggttgagtttagaggaaaggcacaagagtagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtc 11303351  T
Q  489 cggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttg 588  Q
    ||| |||||  | || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  11303352 cgggttgaaatgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcttgtagggttgttgacaccgttg 11303451  T
Q  589 gatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11303452 gatgtgccggagtggaagtgggacaacatttctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 11303530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Original strand, 16337607 - 16338267
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  16337607 acatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccgatgtggttgctgatgcattgagcag 16337706  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| ||||| || ||||| || |||||||| | ||| || |||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||| |     
T  16337707 gaaaacattacatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgttagaacagtttagagacttgagtctggtatgtgaattgtcacctcagagtata 16337806  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||   | | |||||||| ||||| |||  | |  |||||     
T  16337807 cagttgggaatgttgaggattgatagtgatttcttgaacagtatcagagaagctcagcaggtatttttgaagtttgttgatttgatgacttcaggtaatg 16337906  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||  | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  16337907 acactgagaatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattct 16338006  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||||||||| |  |||||||||||   ||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||     
T  16338007 tgaggagagtcataagagtaggttgagtattcacctgggggctacaaagatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagat 16338106  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  16338107 gttgctcagtttgtttatgcttgtttgacttgttagaagtctaaagttgagcatcagaagcctgcagggttgttcacaccgttggatgtaccggagtgga 16338206  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| |  || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  16338207 agtgggacaatatctctatggatttcgtgacgagtttaccgaacactccaagagggcatga 16338267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 73 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 4679404 - 4678811
Alignment:
Q  73 aaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttga 172  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||  ||||| | |  || ||||| ||  | ||||||||||| ||| |||    
T  4679404 aaagctaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatga 4679305  T
Q  173 gtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 272  Q
    || | || |||||  ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  4679304 gtttggtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtacagttggggatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagcacagcaagtggatgt 4679205  T
Q  273 taagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtatt 372  Q
     ||||| || ||| | |||||| || |||||   |  ||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||    
T  4679204 caagttggttgatctgatggttgctggtaatggcgttgaagatagtgacttcaaggttgatgaacagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtatt 4679105  T
Q  373 cctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaaga 472  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  4679104 cctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaa 4679005  T
Q  473 agctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagg 572  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4679004 agctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcagg 4678905  T
Q  573 gttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
     ||||  ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  4678904 attgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgat 4678811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 28755352 - 28754692
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| | || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28755352 acatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggtttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgcggatgctttgagtag 28755253  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||| | |||||||| || ||  ||||||| || |||||| ||||| | || ||| |     
T  28755252 gaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtata 28755153  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | |||||||| ||||| |||  | || |||||     
T  28755152 cagttgggaatgttgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagaggatttgaagtttgttgatttgatgacttctggtaatg 28755053  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  28755052 acactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattct 28754953  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  28754952 tgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggat 28754853  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  28754852 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 28754753  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  28754752 agtgggacagtatctctatggattttgtaacgagtttaccgaacaccccgagagggcatga 28754692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 47124978 - 47124318
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  47124978 acatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtag 47124879  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||| | |||||||| || ||  ||||||| || |||||| ||||| | || ||| |     
T  47124878 gaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtata 47124779  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | |||||||| ||||| |||  | || |||||     
T  47124778 cagttgggaatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagaagatttgaagtttgttgatttgatgacttctggtaatg 47124679  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||  | | |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  47124678 acactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggtagagtttgcattcctgacaatgaggagttgaagaagttgattct 47124579  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  47124578 tgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaaagggat 47124479  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  47124478 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 47124379  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||  |||||||    
T  47124378 agtgggacagtatctctatggattttgtgacaagtttaccgaacactccgaggaggcatga 47124318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 43 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 15228645 - 15228021
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||  |||| || |  || |    
T  15228645 tatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatagttaaagatt 15228546  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  15228545 ttgagttgcttgagcaatttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaa 15228446  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggt 342  Q
    |||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15228445 tagtattaaagaagcacagaaggttgatgttaagtttgtggatttgttggtggctagtaaccaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggt 15228346  T
Q  343 gtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgg 442  Q
    |||||||||||  |||  | ||||| ||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |  || | ||| ||||||||| |||    
T  15228345 gtgttgagattccgagtaagaatttctattcctgataatgatgagttgaaaacgttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgg 15228246  T
Q  443 gagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaa 542  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15228245 gagctataaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaa 15228146  T
Q  543 gtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttta 642  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||  ||||  || || || || ||  |||| ||||||||||| || ||||| ||| | || ||||||    
T  15228145 atctaaagttgaacatcagaagcttgttgggttgttgacactattagaagtaccagaaaggaaatgggatagcatatccatggactttgtaacaagttta 15228046  T
Q  643 caaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |  || |||||||||||||||||||    
T  15228045 ccgaatactccgagagggcatgatg 15228021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 530
Target Start/End: Original strand, 13319597 - 13320122
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||    
T  13319597 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcgaatgcgttgagcag 13319696  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| || || ||||| ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || || |||||| ||||| |||||||| |     
T  13319697 gaagaccttacatatgtctgcactgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttaaagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcaaagtatt 13319796  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||| || || || ||     
T  13319797 cagtcggggatgttgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgtgaagctcagcaggtagatgtaaaatttgttgatttaatgattgctggttatg 13319896  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||  |||| |  ||||| |||||||||||    
T  13319897 aaactgagaatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgatttt 13319996  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| |  |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  13319997 agaggaaagtcacaagagtagattgagtattcacccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgac 13320096  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgttt 530  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||    
T  13320097 gtcgctcagtttgtgtatgcgtgttt 13320122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 229 - 666
Target Start/End: Original strand, 8758402 - 8758838
Alignment:
Q  229 agtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaagg 328  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| | |||||| || |||||   |  || |||||||| |||||||    
T  8758402 agtgatttct-gagtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtcaagttagttgatctgatggttgctggtaatggcgttgaaaatagtgacttcaagg 8758500  T
Q  329 ttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaactt 428  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| | |||    
T  8758501 ttgatgaacagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagagtagctt 8758600  T
Q  429 gagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgt 528  Q
     || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  8758601 aagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtatgcatgt 8758700  T
Q  529 ttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatt 628  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8758701 ttaacttgtcagaagtctaaagttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatt 8758800  T
Q  629 ttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    || |||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  8758801 ttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgat 8758838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Original strand, 16328755 - 16329416
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  16328755 acatgaggcacaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcag 16328854  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| ||||| || ||||| || || |||||||  || ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||| ||| |     
T  16328855 gaaaacattacatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgagttgttggaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcatctcagagtata 16328954  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | || ||||| ||||| |||  |||| ||| |     
T  16328955 cagttggggataatgaagattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagcagatttgaaatttgttgatttgatgactactggtagtg 16329054  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| | ||||| || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||  | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  16329055 acactgaggacagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattct 16329154  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  ||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||  | ||     
T  16329155 tgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccggggtctacaaagatgtaccatgatctgaagaaattattttggtggtccggtttgaaaagagat 16329254  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgtt-ggatgtgccggagtgg 603  Q
    || ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  16329255 gttgctcagtttgtttatgcttgcttgatttgtcaaaagtccaaggttgagcatcaaaagcttgcaaggttgttgacaccgttaggatgtaccggagtgg 16329354  T
Q  604 aagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    |||||||| || || |||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16329355 aagtgggacagtatctctatggatttcgtgacgagtctaccaaacactccgagagggcatga 16329416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 314 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 10384693 - 10384342
Alignment:
Q  314 atagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaag 413  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||    
T  10384693 atagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagag 10384594  T
Q  414 tcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcat 513  Q
    ||| ||||| |  |||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  | || || |||||     
T  10384593 tcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcag 10384494  T
Q  514 tttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggata 613  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  10384493 tttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggaca 10384394  T
Q  614 gcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  10384393 gtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatga 10384342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Original strand, 5424050 - 5424691
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  5424050 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 5424149  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| | || ||||||  | || |||| |||||| | |||||||||||    
T  5424150 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgct 5424249  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  5424250 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 5424349  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  5424350 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 5424449  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  5424450 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 5424549  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| || || ||| ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||     
T  5424550 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtata 5424649  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||| ||||| |  || ||||||||||||    
T  5424650 tcgatggattttgtgacaagtttgccgaatactccgagaggg 5424691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 660
Target Start/End: Original strand, 20061165 - 20061815
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20061165 aggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 20061264  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  |    
T  20061265 cattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaact 20061364  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  |     
T  20061365 gggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagact 20061464  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | || |    
T  20061465 gaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgagg 20061564  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  20061565 agagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 20061664  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||     ||| || |||||||| || ||||| |||    
T  20061665 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgg 20061764  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  20061765 gatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 20061815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 660
Target Start/End: Original strand, 15588503 - 15589153
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15588503 aggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 15588602  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  |    
T  15588603 cattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaact 15588702  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||  ||||  |     
T  15588703 gggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagact 15588802  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  15588803 gaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaag 15588902  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  15588903 agagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 15589002  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||    
T  15589003 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgg 15589102  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  15589103 gatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 15589153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 10907220 - 10906579
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10907220 agatggctcgaattgttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 10907121  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || || | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  10907120 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgctagaacagtttagagatatgtgtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 10907021  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  10907020 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 10906921  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  ||||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  10906920 gattttaaaattgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 10906821  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  10906820 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 10906721  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  10906720 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 10906621  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  10906620 tcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 10906579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 487
Target Start/End: Original strand, 14580056 - 14580530
Alignment:
Q  13 cagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 112  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |    
T  14580056 cagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaatt 14580155  T
Q  113 tgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttggg 212  Q
    | |||||||| ||  |||||||||  ||||| || ||||| |||||||| || || |||||| | || ||||||||||||||||| |||||  || | ||    
T  14580156 tacacatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtctgtgaaatgtcatctcagagtgttaagctagg 14580255  T
Q  213 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggag 312  Q
     ||| |||||||  ||| ||| || ||||| ||||| |  ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    ||     
T  14580256 aatgttgaagattgataatgaatttttgaaaagtattaaggaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtggatttgttggttactagtaatcagattgaa 14580355  T
Q  313 aatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaa 412  Q
     ||||||| |||||| | ||||| |||||||| || || ||| |||  | |||||||||||| ||| |||||||  | |||||| ||||| | || || |    
T  14580356 gatagtgatttcaagatcgatgatcaaggtgtattaaggtttcgaggtagaatttgtattccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaggaga 14580455  T
Q  413 gtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggt 487  Q
    |||| |  || | ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14580456 gtcacagaagtagcttgagtattcacccaggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggt 14580530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 10006610 - 10006060
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10006610 agatggctcgaattgttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 10006511  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  10006510 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 10006411  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  10006410 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 10006311  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || ||| |||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  10006310 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 10006211  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  10006210 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 10006111  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  10006110 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 10006060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 16636783 - 16636142
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16636783 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 16636684  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  16636683 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 16636584  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  ||||  ||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||  ||||  | ||  | |||    
T  16636583 gaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagt 16636484  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  16636483 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 16636384  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  16636383 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 16636284  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  16636283 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 16636184  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  16636183 tcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 16636142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 43164107 - 43163466
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  43164107 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 43164008  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  43164007 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 43163908  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  ||||  ||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||  ||||  | ||  | |||    
T  43163907 gaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagt 43163808  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  43163807 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 43163708  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  43163707 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 43163608  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  43163607 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 43163508  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  43163507 tcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 43163466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 15234513 - 15234140
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||  |||| || |  || |    
T  15234513 tatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatagttaaagatt 15234414  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  15234413 ttgagttgcttgagcaatttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaa 15234314  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggt 342  Q
    |||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15234313 tagtattaaagaagcacagaaggttgatgttaagtttgtggatttgttggtggctagtaaccaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggt 15234214  T
Q  343 gtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtca 416  Q
    |||||||||||  |||  | ||||| ||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15234213 gtgttgagattccgagtaagaatttctattcctgataatgatgagttgaaaacgttgattttagaagaaagtca 15234140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 15340279 - 15339657
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15340279 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgctgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 15340180  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  15340179 tgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 15340080  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | | |    
T  15340079 gaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcacagagagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacaat 15339980  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  15339979 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 15339880  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  15339879 gaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 15339780  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||  ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||     
T  15339779 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacccgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtata 15339680  T
Q  619 tctatggattttatgacgagttt 641  Q
    || ||||||||| ||||||||||    
T  15339679 tccatggattttgtgacgagttt 15339657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 569
Target Start/End: Original strand, 15347356 - 15347915
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15347356 aggcagcgaagatggcttgagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 15347455  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
     |||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || ||||||||||| || |||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| |  |    
T  15347456 aattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaact 15347555  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  | || |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  |     
T  15347556 gggtatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagact 15347655  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||  | ||  | |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  15347656 gaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattctcgaag 15347755  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  15347756 agagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 15347855  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  15347856 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 15347915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 660
Target Start/End: Original strand, 15724072 - 15724695
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  15724072 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 15724171  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  15724172 gagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatt 15724271  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| |||||||  ||||| ||  |||||||| | |||||||| || ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | ||||| || ||  | |||||     
T  15724272 tctgaaaagtatcaaggaagcgcagaaagttgatttcaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgat 15724371  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    |||||||||||||||||  |||  | ||| ||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||    
T  15724372 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatctgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 15724471  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || ||||||||| | |||||   |||    
T  15724472 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 15724571  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||| |||||    
T  15724572 tcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 15724671  T
Q  637 agtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||||    
T  15724672 agtttgccaaatactcctagaggg 15724695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 13253700 - 13253150
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13253700 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 13253601  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||   || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  13253600 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagttcggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 13253501  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    |||| |  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||  ||||  | ||  | |||    
T  13253500 gaaggttgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagt 13253401  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  13253400 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 13253301  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  13253300 gaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 13253201  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  13253200 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 13253150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 48426457 - 48425835
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  48426457 agatggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 48426358  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  48426357 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 48426258  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
     |||||  ||||||| || ||||| | |||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  48426257 caagattgatagtgaatttttgaaaaatatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 48426158  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  48426157 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 48426058  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  48426057 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 48425958  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||  | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| || || ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  48425957 gtaatcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 48425858  T
Q  619 tctatggattttatgacgagttt 641  Q
    || ||||||||| ||||||||||    
T  48425857 tccatggattttgtgacgagttt 48425835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 660
Target Start/End: Original strand, 53384129 - 53384779
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  53384129 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgttattgcagatgccttgagtaggaaga 53384228  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||  | ||  ||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| |  |    
T  53384229 cattgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaact 53384328  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| || |||| |||||||||    | |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  |||| ||     
T  53384329 gggtatgctgaagatggatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcacagagggatgatgtgaagtttgtggatttgttggttgctagagatcaggct 53384428  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||  | ||||| ||||| |||||||||||  |||  | |||||||||||| ||| | |||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  53384429 gaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaag 53384528  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  53384529 agagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 53384628  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | || ||   |||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||| ||     ||| ||||||||| |||| ||||| |||    
T  53384629 acagtttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtcaaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgtcggaatggaaatgg 53384728  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  53384729 gatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 53384779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 17490839 - 17490310
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||| |     
T  17490839 gattatgattttgagttgagctatcatcctggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagt 17490740  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    |||| || ||||| |||||||| || || |||||  | || ||||||||||||| | || ||||| || |  | ||| |||||||  ||| ||| ||  |    
T  17490739 agttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtttgtgaaatgtcatatgaatgtgtgaagctaagaatgttgaagattgataatgaatttct 17490640  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| ||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||  | ||  | | ||| || ||  | | ||| |||    
T  17490639 gaagagtattaaagaagcgcaaaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcagactgaagacaatgattttaaaatcgttgatcaa 17490540  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    ||||||||||| ||| |||  |  ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || |||||||||||||||     
T  17490539 ggtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatc 17490440  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  17490439 cgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcttagtttgtgtattcttgtttgatttgtca 17490340  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  17490339 gaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgc 17490310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 6601755 - 6601105
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6601755 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 6601656  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||  ||||| | || ||||||  | || |||| |||||| |  |    
T  6601655 cattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaact 6601556  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |  |||| |||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||  |||| ||     
T  6601555 gggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaaacatcaaagaagcacagagagttgatgtaaagtttgtggatttgctggttgccagagatcaggct 6601456  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||  | |||||  |||| |||||||||||  |||  | |||||| ||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  6601455 gaagacagtgattttaaaatcgatgatgaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgcattcccgacaatgaagagattaagaagatgattcttgaag 6601356  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | ||||| |||||  ||||||| |  || || ||    
T  6601355 agagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttttggtggtctagtttgaaacaagatgtggc 6601256  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||| ||     ||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  6601255 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccggaatggaaatgg 6601156  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    ||||| || || ||||||||| |||| ||||| |  || ||||||||||||    
T  6601155 gatagtatatcgatggattttgtgacaagttttccgaatactccgagaggg 6601105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 522
Target Start/End: Original strand, 15401637 - 15402140
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15401637 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 15401736  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  15401737 tgtccgctatgatggtcagagagttcgaatttcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 15401836  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  15401837 gaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcacagagagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 15401936  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  ||||||| |||||||||||||||||   ||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  15401937 gattttaaaattgatgatcaaggtgtgttgagattccaaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 15402036  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||  | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  15402037 gaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaatattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 15402136  T
Q  519 gtat 522  Q
    ||||    
T  15402137 gtat 15402140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 660
Target Start/End: Original strand, 16411393 - 16412043
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| || ||  | |||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  16411393 aggcagagaagatggctagaattgctgaaagattacgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaga 16411492  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| || || || |||||||| |||||  ||||| | || || |||  |||| |||| || ||| |  |    
T  16411493 cattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagggatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagcgtgaaact 16411592  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||| | ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  |     
T  16411593 gggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatttaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagtct 16411692  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  16411693 gaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagaggttaagaagatgattcttgaag 16411792  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  16411793 agagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 16411892  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||  ||     ||| || ||||||||  | ||||| |||    
T  16411893 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaaaatggaaatgg 16411992  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  16411993 gatagtatatccatggattttgtgacgagttttccaaatactcctagaggg 16412043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 569
Target Start/End: Original strand, 16491322 - 16491851
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  |    
T  16491322 gattatgattttgggttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgaagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaag 16491421  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    |||| || ||||| |||||||| || || |||||  | || ||||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||||  ||| ||| ||  |    
T  16491422 agttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtatgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttct 16491521  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| ||||| | ||| | |||  ||| ||||||||||||||||||  |  ||||| ||||| ||||  | ||  | ||||| || ||  | ||||  |||    
T  16491522 gaaaagtattaaagaggaacagaaagctgatgttaagtttgtggacctgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatggtcaa 16491621  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    ||||| ||||| ||| |||     ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||| ||||| | |||||    ||||| || |||||||||||||||     
T  16491622 ggtgtattgaggttttgaggtcggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagtaccataaaagtaacttgagtattcatc 16491721  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||| | ||| | |||||||| || || ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  16491722 cgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaatttgttttggtggtccagattgtaacgcgacgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtca 16491821  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  16491822 gaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 16491851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 641
Target Start/End: Original strand, 15014898 - 15015498
Alignment:
Q  41 attatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggga 140  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||| || |||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||| || ||    
T  15014898 attatgatttcaggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttacaaatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggttagaga 15014997  T
Q  141 gtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttg 240  Q
    |||  | ||||| |||||||| |  ||||||||| | || |||||| ||||    || |||||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||    
T  15014998 gttgcatttgcttgaacagttcaaagacttgagtttagtttgtgaagtgtcgcagcagagtgtgaaattagggatgctgaagatcaacagtgaatttttg 15015097  T
Q  241 aatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaag 340  Q
    |||||||| | |||| | ||  | |  ||||| ||||| || || |||||||||   |  ||| |  | ||  ||||||| || || |||||||| ||||    
T  15015098 aatagtattaaagaaactcagaaggaagatgtgaagttggtagacttaatggttgggaacaattagactgaagatagtgattttaaagttgatgatcaag 15015197  T
Q  341 gtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattc 440  Q
    | |||||| | ||| |  | | |||||||||||||||  ||  |||| |||||||| ||||| | ||||||| ||| |  || || |||||||||||| |    
T  15015198 gagtgttgcggtttcggaatagaatttgtattcctgatgatacagaaatgaagaagatgattatggaagaaattcacagaagtaatttgagtattcatcc 15015297  T
Q  441 gggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcag 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| | | |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  15015298 gggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttattttggtggttcaggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgtcag 15015397  T
Q  541 aagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtt 640  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||  ||| |||  ||| | || ||| | || ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||| |||||    
T  15015398 aagtcgaaagttgaacaccagaaacctgttgggatgttgacatctttagatattcccgagtggaagtgggatagtatatccatggattttgtgaagagtt 15015497  T
Q  641 t 641  Q
    |    
T  15015498 t 15015498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17187408 - 17187164
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||| | ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17187408 acatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttagtttgaactatcacccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcag 17187309  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||| |  || |||| ||||||    
T  17187308 gaaggcattgcatatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagttcagagacttgagtctggtttgtgaattaacacctcagagtgtg 17187209  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatc 249  Q
    |||||||||||| |||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  17187208 cagttgggtatgttgaaaattaacagtgatttcttgagtagtatc 17187164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 12499255 - 12498636
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  12499255 tggctcgagttattgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaacgtcgttgcagatggcttgagtaggaagacattgcatatgt 12499156  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    | ||  ||||||| || ||||| || || || ||||||||||| ||  ||||| | || |||||   |||| ||||||||||| |  |||| ||| ||||    
T  12499155 ccgctatgatggttagagagttcgatttacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgagtggtcacctcaaagtgtgaaactgggaatgttgaa 12499056  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    |||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||| |||||  || ||||||| |||||||| || ||  ||||| |||||||| |  | ||   | ||||     
T  12499055 gattgatagtgaatttctgaaaagtattaaagaggcacagaaatttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaattagactgaagttggtgac 12498956  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||  |||     ||||| ||||||||| |||||||  |||||||  ||||| | || || |||||||  |    
T  12498955 tttaaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcatagaa 12498856  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgta 521  Q
    | | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| || |||||  |||| || || || ||||||||    
T  12498855 gtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaatgcgatgtggcacaatttgtgta 12498756  T
Q  522 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttct 621  Q
    | | |||||   |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||  ||     | |||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||    
T  12498755 ttcttgtttagtttgtcagaagtcgaagattaaacatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatct 12498656  T
Q  622 atggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  12498655 atggattttgtgacgagttt 12498636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 660
Target Start/End: Original strand, 26791618 - 26792160
Alignment:
Q  118 atgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgc 217  Q
    ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  |||||||||    
T  26791618 atgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgc 26791717  T
Q  218 tgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatag 317  Q
    |||||||  ||||||| ||  |||| | |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | ||    
T  26791718 tgaagattgatagtgaatttctgaaaaatatcaaggaagcacaaaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacag 26791817  T
Q  318 tgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcat 417  Q
    ||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  26791818 tgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcat 26791917  T
Q  418 aagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttg 517  Q
    |  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || ||||    
T  26791918 agaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttg 26792017  T
Q  518 tgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcat 617  Q
    ||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  26792018 tgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtat 26792117  T
Q  618 ttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
     || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  26792118 atcgatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 26792160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15260622 - 15260378
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||    
T  15260622 aaagattatgattttgagttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtccgctatgatggtaa 15260523  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| | || || ||  ||||||||||||||||| || | || |||||||||||  ||||||| ||    
T  15260522 aagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtttgcgagttgtcatctcaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatt 15260423  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgt 281  Q
      |||| ||||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  15260422 tatgaaaagtattaaagaagcacataaagtagatgttaagtttgt 15260378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 665
Target Start/End: Original strand, 14875637 - 14876264
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |  |||| || |    
T  14875637 aaagattatgactttgatttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccactatgatagtta 14875736  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| || ||||| ||| ||||||| ||  ||||  | || |||||   |||| |||| |||||| |  |||| |||||||| ||  ||||||| ||    
T  14875737 gagagttcgagttgcttgaatagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaatt 14875836  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
     ||||| ||||| | ||| |||||| |||||||| | |||||||| || ||  ||||| | ||||||||  | ||  || |||| || ||||| |||||     
T  14875837 tttgaaaagtattaaagaggcacaaaaagttgatatcaagtttgtagacttgttggttgcaagtaatcagactgaagatggtgactt-aaggtcgatgac 14875935  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || ||||||||||||||  |||    |||||||||||||||  |||||||  |||||||  ||||| | ||| | ||| |||  || | |||||||||||    
T  14875936 catggtgtgttgagattccgaggttgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaaaagagttatagaagtagcttgagtattc 14876035  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    |  |||||||||| || |||||||||||| |||||||  | || || ||||| |||||||| || || || || || ||||||||| | |||||   ||     
T  14876036 acccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaaattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagttta 14876135  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| ||  ||     | | || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| |||||    
T  14876136 tcagaagttgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 14876235  T
Q  637 agtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||| || || ||||| |||||| ||||    
T  14876236 agtttgcagaatactcctagagggaatga 14876264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 363 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 15248813 - 15248607
Alignment:
Q  363 aatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcat 462  Q
    |||||||||||||||| | || ||  |||||||| ||||| | |||||||||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  15248813 aatttgtattcctgacgacgatgagatgaagaagatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 15248714  T
Q  463 gatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaga 562  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  15248713 gatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaaa 15248614  T
Q  563 agcctgc 569  Q
    | |||||    
T  15248613 aacctgc 15248607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 305
Target Start/End: Original strand, 14125732 - 14126000
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  14125732 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 14125831  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtg-att 235  Q
    | ||||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| |  |||| |||||||||||  |||||| |||    
T  14125832 gagagttcgaattacttgaaccgtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatt 14125931  T
Q  236 tcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatca 305  Q
    |||| || ||||| | ||| ||||||  ||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||    
T  14125932 tctt-aagagtattaaagaggcacaaatagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatca 14126000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16693156 - 16693019
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  16693156 aaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgccttgatggtta 16693057  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagt 174  Q
    | ||||| || || || |||||||| || |||||||||    
T  16693056 gagagttcgagttacttgaacagttcagagacttgagt 16693019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 660
Target Start/End: Original strand, 16755757 - 16756346
Alignment:
Q  71 gtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggactt 170  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||  |    
T  16755757 gtaaagcgaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttccgagatat 16755856  T
Q  171 gagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgat 270  Q
    |||| | || ||||||  | || |||| |||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| || ||||  ||||||||   || ||||    
T  16755857 gagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagcatcaaggaagcacagagagatgat 16755956  T
Q  271 gttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgta 370  Q
    || ||||||||||||||  ||||| | ||  ||||  | ||  | |  || || ||  | ||||| ||||| |||||||||||  |||  | |||||| |    
T  16755957 gtaaagtttgtggatttgttggttgccagagatcagactgaagacatcgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgca 16756056  T
Q  371 ttcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaa 470  Q
    |||| |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  16756057 ttccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaa 16756156  T
Q  471 gaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgca 570  Q
     ||| | || ||  |||| |||||||| || || || || || ||||||||| | |||||   ||||||| |||| ||||| || |||||||| || ||     
T  16756157 aaagattttctgggggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcaggagtcgaaggtcgagcatcagaaacccgct 16756256  T
Q  571 gggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    ||| ||     ||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  16756257 gggatgatggtacctttggatgtgctggaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 16756346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 389 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 15209531 - 15209279
Alignment:
Q  389 tgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtc 488  Q
    |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15209531 tgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggtgctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtc 15209432  T
Q  489 cggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttg 588  Q
     || ||||| || || || || || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||| ||     | | ||     
T  15209431 tgggttgaaacgtgatgtggcgcagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaaattgagcatcagaaacctgctgggatgatggtatcttta 15209332  T
Q  589 gatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  15209331 gatgtaccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagttt 15209279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 268 - 454
Target Start/End: Original strand, 13299880 - 13300066
Alignment:
Q  268 gatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaattt 367  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| || || || || || | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||    
T  13299880 gatgtaaaatttgttgatttaatgattgctggttatgaaactgagaatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaattt 13299979  T
Q  368 gtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaa 454  Q
    ||||||||||  |||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  13299980 gtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaa 13300066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 268 - 454
Target Start/End: Original strand, 13310538 - 13310724
Alignment:
Q  268 gatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaattt 367  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| || || || || || | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||    
T  13310538 gatgtaaaatttgttgatttaatgattgctggttatgaaactgagaatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaattt 13310637  T
Q  368 gtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaa 454  Q
    ||||||||||  |||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  13310638 gtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaa 13310724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 406 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 9523342 - 9523107
Alignment:
Q  406 gaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacg 505  Q
    ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||  |  | || || || |    
T  9523342 gaagagagtcatagaagtaacttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctagactcaaacgtgatg 9523243  T
Q  506 tcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaa 605  Q
    | || || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||   | ||| || |||||||| ||||||||    
T  9523242 ttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggtatgatgataccattagatgtgccagagtggaa 9523143  T
Q  606 gtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
     |||||||| || || ||||||||| |||| |||||    
T  9523142 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 9523107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 204
Target Start/End: Original strand, 16806085 - 16806252
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  16806085 aaagattatgactttgctttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggtta 16806184  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    | ||||| || || || |||||||| ||||| |||||| | || ||||||  |||| |||| ||||||    
T  16806185 gagagttcgagttacttgaacagttcagggatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 16806252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 566 - 666
Target Start/End: Original strand, 13322308 - 13322408
Alignment:
Q  566 ctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  13322308 ctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggacagcatctctatggattttgtgacgagtttacctaatactccgagaggacatga 13322407  T
Q  666 t 666  Q
    |    
T  13322408 t 13322408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 325 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 16372116 - 16371801
Alignment:
Q  325 aaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagca 424  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||  || ||||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || |    
T  16372116 aaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgagcccgaatttgtattcctgatgataaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagta 16372017  T
Q  425 acttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgc 524  Q
     ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||| |    
T  16372016 gcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctgg-ttgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattc 16371918  T
Q  525 atgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatg 624  Q
     |||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||  ||     | | || |||||||| |||||||| |||||||| || || |||    
T  16371917 ttgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatg 16371818  T
Q  625 gattttatgacgagttt 641  Q
    |||||| ||||||||||    
T  16371817 gattttgtgacgagttt 16371801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15062710 - 15062583
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||  | |||||||||||| || | |||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  15062710 aaagattatgactttggtttgaattatcatcaagttaaagctaatgttgtggtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 15062611  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttag 164  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15062610 gagagttcgaattgcttgaacagtttag 15062583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 12179372 - 12179255
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12179372 acatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccagccgggcaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcag 12179273  T
Q  105 gaagacattgcacatgtc 122  Q
    ||| || ||||| |||||    
T  12179272 gaaaacgttgcatatgtc 12179255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 15062433 - 15062204
Alignment:
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||| |||  ||||||   |||||||  ||||| | ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||      
T  15062433 ggtgtgttgagattccgaggccaaatttgtattcatgatgatgaagggatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcacc 15062334  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| || ||||| |  || || ||  | ||||||||| | |||||   ||||||    
T  15062333 cgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaacttgatgtggcatagtttgtgtattcttgtttagtttgtca 15062234  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  15062233 gaagtcgaagattgaacatcagaaacctgc 15062204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 16692829 - 16692624
Alignment:
Q  364 atttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatg 463  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||  |||| ||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||| || ||||||| || |||||||| |    
T  16692829 atttgcattcctgacgatgcagagatgaaaaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgagagctacgaagatgtatcagg 16692730  T
Q  464 atttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    | || |||||| | || || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||| | |||||   |||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  16692729 acttaaagaagattttctggtggtctggtttgaagcgagatgtggcgcagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaa 16692630  T
Q  564 gcctgc 569  Q
     |||||    
T  16692629 acctgc 16692624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 569
Target Start/End: Original strand, 16806391 - 16806596
Alignment:
Q  364 atttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatg 463  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||||   |||||||| || |||||||| |    
T  16806391 atttgcattcctgacgatccagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtatcacg 16806490  T
Q  464 atttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    |||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || ||||||||| | |||||   |||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  16806491 atttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaa 16806590  T
Q  564 gcctgc 569  Q
     |||||    
T  16806591 acctgc 16806596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Original strand, 13967023 - 13967071
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13967023 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 13967071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 30138263 - 30138215
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30138263 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 30138215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 30147814 - 30147766
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30147814 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 30147766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 630
Target Start/End: Original strand, 8274091 - 8274130
Alignment:
Q  591 tgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8274091 tgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 8274130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 613 - 667
Target Start/End: Original strand, 15952671 - 15952725
Alignment:
Q  613 agcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15952671 agcatttccatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 15952725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 16257601 - 16257553
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16257601 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggataacatttctatggatttt 16257553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Original strand, 16742386 - 16742434
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16742386 accgttgtttgtgccagagtggaagtggaatagcatttctatggatttt 16742434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 150
Target Start/End: Original strand, 13966500 - 13966595
Alignment:
Q  55 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattg 150  Q
    |||| ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||||    
T  13966500 ttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtttgaattg 13966595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15611087 - 15610968
Alignment:
Q  55 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcg 154  Q
    |||| ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||||| | |    
T  15611087 ttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtaggaagattttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattg 15610988  T
Q  155 aacagtttagggacttgagt 174  Q
    | |||||| | |||||||||    
T  15610987 agcagtttcgagacttgagt 15610968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 514 - 563
Target Start/End: Original strand, 6712024 - 6712073
Alignment:
Q  514 tttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6712024 tttgtttatgcttgtttggtttgtcagaagtctaagattgaacatcagaa 6712073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 514 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 17193619 - 17193570
Alignment:
Q  514 tttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17193619 tttgtttatgcttgtttgatttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaa 17193570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Original strand, 11387287 - 11387944
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11387287 aggcagagaaggtggcttgaattattgaaggattatgattttggattgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgtagatgctttgagtaggaaga 11387386  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  11387387 cgttgcacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagtt 11387486  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11387487 gggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtcaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagct 11387586  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  11387587 gaggatagtgatttcaaggttgatgaacaaggcgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttaattttagagg 11387686  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    |||| || | ||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  11387687 aaagccacaggagtaacttaagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgc 11387786  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  11387787 tcattttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaagtgg 11387886  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||    
T  11387887 gacaacatttctacggattttatgacgagtttaccgaatactccgatagggcatgatg 11387944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 19614070 - 19613409
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19614070 acatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtag 19613971  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||| | || ||||||    
T  19613970 gaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 19613871  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19613870 cagttgggtatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatc 19613771  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  || |||| || |||||| ||||||||||| || ||  |||| | |||||||||    
T  19613770 aagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgatttt 19613671  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||     
T  19613670 ggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgat 19613571  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  19613570 gttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtgga 19613471  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  19613470 aatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatgat 19613409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 15341826 - 15341165
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  15341826 acatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattattattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaatgtagttgctgatgcattgagcag 15341727  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||||||  |||| ||||| ||  ||||| |||  || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||  |||| ||| |     
T  15341726 gaagacgctgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaacagtttagggacatgagtctggtatgtgagttgtcgactcagagtata 15341627  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| | || ||||| ||| || || |||||     
T  15341626 cagttgggcatgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagcaaagcaagtggatgtcaagctggttgatttgatgattgctggtaatg 15341527  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
         || |||||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15341526 gcaaagaaaatagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaatttt 15341427  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  15341426 agaagaaattcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgac 15341327  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  15341326 gtagctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 15341227  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  15341226 aatgggatagcatttctatggattttatgacgagtttaccaaacaccccgagaggacatgat 15341165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 13666932 - 13666270
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||| | || || |||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| || || |||||| |||| ||||||||    
T  13666932 acatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatcctagtaaagccaacgtggttgcaaatgccttgagtag 13666833  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||| ||||| || ||||||||||   | ||||| ||| | || |||||||| ||||||||  | || |||||| || || ||||||||||     
T  13666832 gaaaacgttgcatatgtctgctttgatggtaaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagctttgtctgtgaattgacacctcaaagtgtt 13666733  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || |||||     
T  13666732 cagttggggatgctgaagattaacagttatttcttgaatagcatccgagaagcacaacaagtagatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatg 13666633  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       |  || ||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  13666632 gcactaaggatagtgactttaaggttgatgatcaggatgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaatttt 13666533  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  13666532 agaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgac 13666433  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  13666432 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtcgaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgatggatgtgccggagtgga 13666333  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13666332 agtgggatagcatttctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 13666270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 19148601 - 19147944
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  19148601 aggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 19148502  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||  ||||| |||| ||||| ||| |    
T  19148501 cgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagat 19148402  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  19148401 gggtatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtcaagtttgtgggtttaatggttgctagtaatcaaact 19148302  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||  | |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  19148301 gaagatggtgatttcaaggttgatgatcagggtatgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaag 19148202  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| |  |  | ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || ||||| || || || ||    
T  19148201 aaagtcacataaatagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgc 19148102  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19148101 tcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccagaatggaagtgg 19148002  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||    
T  19148001 gatagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactcctagagggtatgatg 19147944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 20748000 - 20747343
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  20748000 aggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 20747901  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||  ||||| |||| ||||| ||| |    
T  20747900 cgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagat 20747801  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  20747800 gggtatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtcaagtttgtgggtttaatggttgctagtaatcaaact 20747701  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||  | |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  20747700 gaagatggtgatttcaaggttgatgatcagggtatgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaag 20747601  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| |  |  | ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || ||||| || || || ||    
T  20747600 aaagtcacataaatagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgc 20747501  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20747500 tcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccagaatggaagtgg 20747401  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||    
T  20747400 gatagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccaagagggtatgatg 20747343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Original strand, 15101462 - 15102119
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||    
T  15101462 aggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctctgagcaggaaga 15101561  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||| ||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||| ||||| |||||    
T  15101562 cgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagtt 15101661  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||  | ||||| |  |     
T  15101662 gggtatgttgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtcaagtttattgatttgatggttgttggtaatgacact 15101761  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||| || ||||  | ||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |    
T  15101762 gaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataacgatgatttgaaaaagttgattttagagg 15101861  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||  |    
T  15101862 aaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtttc 15101961  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15101962 ttagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 15102061  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  15102062 gacaacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagacggcatgatg 15102119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Original strand, 14285230 - 14285891
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  14285230 acatgaggcagaggagatggttagagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcag 14285329  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||||||| |||| ||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| || || |||||  ||||  |||| ||| |     
T  14285330 gaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagcctggtatgtgagttgtcgcctcagagtata 14285429  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||| | ||||| ||| | || ||||| ||| || || |||||     
T  14285430 cagttgggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtattcgagaagcacagcaactggatgtcaagctggttgatttgatgattgctggtaatg 14285529  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  14285530 gcacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagagggaggatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgatttt 14285629  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  14285630 agaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcctggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgac 14285729  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14285730 gttgctcattttgtatacgcatacttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 14285829  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14285830 agtgggacagtatttctatggattttgtaacaagtttaccaaacactccgagaggacatgat 14285891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 40 - 667
Target Start/End: Original strand, 16949361 - 16949987
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| | ||    
T  16949361 gattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaaaccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctctgatggtgaagg 16949460  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| || || |||| ||| | |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  16949461 aatttgaattgctagaacagtttagggacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttggggatgctgaggattaatagtgacttcta 16949560  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||| | ||||| |  | ||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  16949561 gaatagtatctgagaagctcagcaagtggatttgaagtttgttgatttaatgattattggtaatgacactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcag 16949660  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||      
T  16949661 ggtgttttgagatttagaggaagaatttgtattcctaacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcacc 16949760  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16949761 cgggagctacaaagatgtaccacgatttg-agaaactgttttggtggtccggtttcaagcgtgatgttgctcattttgtgtatgcatgcttgacttgtca 16949859  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  16949860 gaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttaacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgacgagt 16949959  T
Q  640 ttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
     |||  | ||||||||||||||||||||    
T  16949960 ctaccgagcactccgagagggcatgatg 16949987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 13022752 - 13022090
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  13022752 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcag 13022653  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| ||||| |||| ||| |     
T  13022652 gaaaacattacatatgtctgctttgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtata 13022553  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  |||||     
T  13022552 caattggggatgctgaagattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagcgcagcaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatg 13022453  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| ||||||||| |||| || |||||  |||| || ||||  | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  13022452 agacagaggatagtgacttcaaggtttatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattct 13022353  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | ||     
T  13022352 tgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccgttttgaagtgtgat 13022253  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  13022252 gttgctcagtttgtttatgcttgtttgacttgtcagaagtctaatgttgatcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 13022153  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  13022152 aatgggatagcatttctatggatttcgtgacgagttaaccaaacactccgagggggcatgatg 13022090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 40 - 667
Target Start/End: Original strand, 295 - 923
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgc-agatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||| | |    
T  295 gattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgttgttgctaaatgcgttgcgcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaag 394  T
Q  139 gagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttct 238  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||  || || |||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  395 gaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgacacctcagagtattcagttggggatgctgaagattaatagtgatttct 494  T
Q  239 tgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagca 338  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||| |||  |||  ||||| |  | ||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  495 tgaatagtatccgagaagctcagcaagtagatttgaagtttgttgatttgatgactacgggtaatgacactgaggatagtgacttcaaggttgatgatca 594  T
Q  339 aggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcat 438  Q
     |||||  |||| || |||   ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  595 gggtgttatgaggttcagaagaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcat 694  T
Q  439 tcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtc 538  Q
     ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  695 ccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtc 794  T
Q  539 agaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgag 638  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  || | ||    
T  795 agaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacatcgttagatgtgccggagtggaagtgggacaatatttctatggatttcgtgccaag 894  T
Q  639 tttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  895 tttaccgaacactccgagagggcatgatg 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Original strand, 14263103 - 14263760
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  14263103 aggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 14263202  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | || ||||||||  |  | ||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||  ||||| |||| ||| | |||||    
T  14263203 cgttacacatgtctactataatggtaaaggagtttgagttacttgaacagtttagagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtttacagtt 14263302  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |     
T  14263303 gggtatgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatcagagaagcacaacaagttgatgtcaagttcgttgatttaatggttactagtaatgaaact 14263402  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  14263403 gaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgatttgaaaaagttgattttagagg 14263502  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| |  |  | | | ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || ||    
T  14263503 aaagtcacagaaatagcctaagtattcatccaggaactacaaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgc 14263602  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14263603 tcagtttgtttatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcgtggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgg 14263702  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    || | |||||| ||| ||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  14263703 gacaacatttccatgaattttgtgacgagtttatcgaatactccgagagggcatgatg 14263760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Original strand, 16071154 - 16071810
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||    
T  16071154 aggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaaga 16071253  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||| ||||| |||||    
T  16071254 cattgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttactagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagtt 16071353  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  16071354 gggtatgctgaagattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagcacgtcaaatggatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaagct 16071453  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | ||||||||||| ||| ||||| | ||| || |||||||||||||| |    
T  16071454 gaagatggtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcatgataatgatg-atttaaaaagttgattttagagg 16071552  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    |||| ||||  || | ||| ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| |||||  | ||||| || || || |     
T  16071553 aaagccatagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatataccatgatttgaagaaattattttggtggtctaggttgaaacgtgatgttgg 16071652  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  16071653 tcagtttgtttatgcatgtttgactcgtcaaaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgctagagtggaagtgg 16071752  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    || | |||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  16071753 gacaacatttccatggattttgtgacgagtttatcgaacactcaaagagggcatgatg 16071810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Original strand, 23504724 - 23505385
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  23504724 acatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtag 23504823  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||||||  |||| ||||| ||  ||||| |||  || ||||| || || ||||||||||| ||| ||||| | || |||||  ||||  ||||||| ||     
T  23504824 gaagacgctgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttactggaacagtttagagacatgagtttggtatgtgagttgtcgcctcaaagcgta 23504923  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||| || |||||     
T  23504924 cagttggggatgctaaagattaacagcgatttcctgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtcaagttggttgatctaatggttgctggtaatg 23505023  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
         ||  ||| ||| |||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  |    
T  23505024 gtattgaagataatgacttcaaggttgatgatcagggtgtgctaagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcct 23505123  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||     
T  23505124 agaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagat 23505223  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || || |||||||| ||||||||||    
T  23505224 gttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcaggattgttgacgccattggatgtaccggagtgga 23505323  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  23505324 aatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgat 23505385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 10 - 666
Target Start/End: Original strand, 18052812 - 18053468
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  18052812 aggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgctttgagtaggaaga 18052911  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    || | || ||||| ||  ||||| | |  || ||||| ||  | ||||||||||| ||| ||||| | || |||||  ||||  |||||||||| |||||    
T  18052912 cactccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagtttggtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtacagtt 18053011  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| | |||||| || |||||   |      
T  18053012 ggggatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtcaagttggttgatctgatggttgctggtaatggcgtt 18053111  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| |    
T  18053112 gaagatagtgacttcaaggttgatgaacagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcttagagg 18053211  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||    
T  18053212 aaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgc 18053311  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  18053312 tcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgg 18053411  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||||||    
T  18053412 gatagcatttctatggattttgtgacgaatttaccaaacactccgaggggacatgat 18053468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 91 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 14435000 - 14434425
Alignment:
Q  91 gatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgt 190  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  ||||| |||  || ||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | || |||||  |||    
T  14435000 gatgcgttgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaatagtttagagacatgagtttggtatgtgagttgt 14434901  T
Q  191 catctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaat 290  Q
    |  |||||||  | |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| || || ||||| ||||| || ||| | ||    
T  14434900 cgcctcaaagcatacagttgggcatgctgaagattaacagtgatttcctgagtagtatccgagaagcacagcaggtggatgtcaagttggttgatctgat 14434801  T
Q  291 ggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattg 390  Q
     ||| || |||||    | ||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14434800 tgttgctggtaatggcactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattg 14434701  T
Q  391 aagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccg 490  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14434700 aaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccg 14434601  T
Q  491 gtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttgga 590  Q
     ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  14434600 ttttgaagcgtgatgtcgctcattttgtatatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttaga 14434501  T
Q  591 tgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14434500 tgtgccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgagaggacatgat 14434425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 12458030 - 12457373
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || |    
T  12458030 aggcaaaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcagaaaaa 12457931  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| || |||||| |||  || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||| |||| ||| |  ||||    
T  12457930 cattgcatatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaatttagagacttgagtcttgtccgtgaattgtcacctcagagtatatagtt 12457831  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| ||   |||  ||||| |  |     
T  12457830 ggggatgctgaagattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagctcagcaagtagatttgaagtttgtggatttgataaatacgggtaatgacact 12457731  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  | | |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |    
T  12457730 gaggatagtgattttaaggttgatgaccaaggtgtgctgaggtttagaggaagagtttgtattcctgacaacgatgatttgaagaagttgattcttgagg 12457631  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | || || ||    
T  12457630 agagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccgatttgaagtgagatgttgc 12457531  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12457530 tcagtttgtttatgcttgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgg 12457431  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    || || || |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12457430 gacagtatctctatggatttcgtgacgagtttacggaacactccgagagggcatgatg 12457373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Original strand, 11305117 - 11305777
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11305117 acatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgctgatgctttgagtag 11305216  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||| || |||||| ||||| | || ||| |     
T  11305217 gaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtata 11305316  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | |||||||| ||||| |||  | || ||||      
T  11305317 cagttgggaatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagaagatttgaagtttgttgatttgatgacttctggtaacg 11305416  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  11305417 acactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcaaggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattct 11305516  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  | ||     
T  11305517 tgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccgatttgaaaagggat 11305616  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  11305617 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 11305716  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  11305717 agtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatga 11305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 43 - 669
Target Start/End: Original strand, 12205692 - 12206318
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||  ||||||| |  || |    
T  12205692 tatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatatcagctatgatggttaaagaat 12205791  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    |||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||    
T  12205792 ttgagttgcttggtcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtgagtttttgaa 12205891  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggt 342  Q
    |||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||  |||| || ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12205892 tagtattaaagaagcacaggaggttgatgttaagtttgtggatttgttggtggctagcaaccaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggt 12205991  T
Q  343 gtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgg 442  Q
    |||||||||||  |||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |  || | ||| ||||||||| |||    
T  12205992 gtgttgagattccgaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaggttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgg 12206091  T
Q  443 gagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaa 542  Q
    |||||| ||| |||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12206092 gagctataaagatgtttcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaa 12206191  T
Q  543 gtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttta 642  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || ||||||    
T  12206192 atctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgttccagaatggaaatgggatagcatatccatggactttgtaacaagttta 12206291  T
Q  643 caaaacactccgagagggcatgatgtc 669  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  12206292 ccaaatactctgagagggcatgatgtc 12206318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 158 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 12456944 - 12456435
Alignment:
Q  158 agtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagc 257  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||  || || |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  12456944 agtttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaataatgatttcttgaatagtatccgagaagc 12456845  T
Q  258 acaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttaga 357  Q
     |  ||||| |||   |||||||| ||||| |||  |||| ||||| |    ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||  | || || |||    
T  12456844 tcggcaagtggattcgaagtttgttgatttgatgactactggtaatgacattgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttctaaggttcaga 12456745  T
Q  358 gacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgt 457  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  12456744 ggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgt 12456645  T
Q  458 atcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaaca 557  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12456644 accatgatttgaagaagctgttttggtggtccagtttgaaacgtgacgtagctcattttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagca 12456545  T
Q  558 tcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgaga 657  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  12456544 tcagaagcctgcatggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacaatatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactacgaga 12456445  T
Q  658 gggcatgatg 667  Q
    ||||||||||    
T  12456444 gggcatgatg 12456435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Original strand, 26117459 - 26118119
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || ||||| ||||| ||    
T  26117459 acatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggttaagccaatgttgtggctgatgctttgagcag 26117558  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || |||||| ||||||  || ||| |     
T  26117559 gaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacatttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcattccagagtata 26117658  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    || ||||| ||| |||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||  |||| ||| | |||||||| ||||| |||  | |  |||||     
T  26117659 catttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagtggatttgaagtttgttgatttgatgacttcaggtaatg 26117758  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  26117759 acactgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtaaagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattct 26117858  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  26117859 tgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagat 26117958  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| || || ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  26117959 gttgctcagttcgtttatgcctgtttgatctgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcggggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 26118058  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  26118059 agtgggatagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatga 26118119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Original strand, 13967522 - 13968182
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |   |    
T  13967522 acatgaggcagaggaggtggttagagttattgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttaacccg 13967621  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| |  || ||||||||| | |||||||| || ||| ||||||| || |||||| ||||| || | ||| |     
T  13967622 gaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccttagagtata 13967721  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | |||||||| ||||| |||  | |  |||||     
T  13967722 cagttggggatgctgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagcggatttgaagtttgttgatttgatgacttcaggtaatg 13967821  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| || || |||||||| || |||||| |||| || ||||  | | ||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||| |    
T  13967822 acactgaggatagtgattttaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcttgacagtgatgatttgaagaatttgattct 13967921  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  13967922 cgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagat 13968021  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13968022 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtcaaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggactgga 13968121  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13968122 agtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 13968182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 49153696 - 49153036
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||    
T  49153696 acatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgcggacgctttgagtag 49153597  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || ||| |||| || || ||||||  |||| | || ||| |     
T  49153596 gaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaggagttcgaattgctagaacagttcagagacatgagccttgtctgtgaatggtcaccccagagtatt 49153497  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||| ||  ||||| | || ||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | |||||||| |||||  ||  | || |||||     
T  49153496 cagttgggaatgttgaaaattgatagtaactttttgaacagtatccgagaagctcagaaagaggatttgaagtttgttgatttgttgacttctggtaatg 49153397  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||  |||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  49153396 acactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattct 49153297  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    ||     
T  49153296 tgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaaaagat 49153197  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  49153196 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaaatccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 49153097  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  49153096 agtgggacagtatctctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 49153036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 371 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 14130902 - 14130607
Alignment:
Q  371 ttcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaa 470  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  14130902 ttcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaa 14130803  T
Q  471 gaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgca 570  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14130802 aaagctgttttggtggtccgttttgaagcgtgatgtcgctcattttgtatatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgca 14130703  T
Q  571 gggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14130702 gggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgagaggacatgat 14130607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 641
Target Start/End: Original strand, 11771134 - 11771753
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||    
T  11771134 tggctcgaatttttgaaagactatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagatgttgcatatgt 11771233  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    | ||  |||||||||  ||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||  | || || ||  ||||| |||| |||||| |  |||| ||||||||    
T  11771234 ccgctatgatggtaaaagaaattgaattgcttgaacaatttagagatttgagcttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaa 11771333  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    |||  ||||||| ||  |||| ||||| | |||||| ||  || ||||||||||||||||||| ||  || || ||||||||||  | ||  |||||||     
T  11771334 gattgatagtgaatttctgaaaagtattaaagaagcgcagaaaattgatgttaagtttgtggacttgttgattgctagtaatcagactgaagatagtgat 11771433  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    || ||  | ||||| ||||| ||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  |    
T  11771434 tttaaaatcgatgatcaaggcgtggtgagatttcgaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaa 11771533  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgta 521  Q
    | | ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||    
T  11771534 gtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgta 11771633  T
Q  522 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttct 621  Q
    | | ||||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||   ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||     
T  11771634 ttcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcattagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtggaaatgggatagcatatcc 11771733  T
Q  622 atggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  11771734 atggattttgtgacgagttt 11771753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 10872375 - 10871734
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10872375 agatggctcgaattgttgaaagattatgactttgggttggattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 10872276  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| | || ||||||  | || |||| |||||| | |||| ||||||    
T  10872275 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattggatatgct 10872176  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||  ||||  | ||  | |||    
T  10872175 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagactgaagacagt 10872076  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  10872075 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 10871976  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  10871975 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacaatttgt 10871876  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||| ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||     
T  10871875 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtata 10871776  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  10871775 tcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 10871734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Original strand, 44790241 - 44790882
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  44790241 agatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 44790340  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  44790341 tgtccgccatgatggtcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagtgtgaaactgggtatgct 44790440  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  44790441 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 44790540  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  44790541 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 44790640  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  44790641 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtagcacagtttgt 44790740  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| || || ||| ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||     
T  44790741 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtata 44790840  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  44790841 tcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 44790882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 8708985 - 8708344
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  8708985 agatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcata 8708886  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  8708885 tgtccgccatgatggtcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 8708786  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| | |||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  8708785 gaagattgatagtgaatttctgaaaaatatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 8708686  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  8708685 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 8708586  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  8708585 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 8708486  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
     ||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  8708485 ttattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 8708386  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  8708385 tcgatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 8708344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 641
Target Start/End: Original strand, 320943 - 321549
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  320943 taaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggt 321042  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgat 234  Q
     | |||||| || ||||| ||  |||| || || |||||| | || ||| || |||||||| | |||||| |||| || |||||||||||  ||||||||    
T  321043 gaaggagttcgagttgctggagtagttcagagatttgagtttggtatgttaattgtcatctaagagtgtgaagttagggatgctgaagattgatagtgat 321142  T
Q  235 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatg 334  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  | ||||| || ||  ||||||    
T  321143 ttcttgaagagtattaaagaagcacaaaaagttgatgttaagcttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaattgatg 321242  T
Q  335 agcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtat 434  Q
    | |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||||||| |||  || | |||||||||    
T  321243 atcaaggtgtgttgagattccgagatagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaaagtgatagaagtagcttgagtat 321342  T
Q  435 tcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgact 534  Q
     ||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || || ||||| || || |  ||||| |||   ||||| | |    
T  321343 ccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatatttttgtttaatt 321442  T
Q  535 tgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatga 634  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  ||   ||| | || |||||||  |||||||| |||||||| || || ||||||||| |||    
T  321443 tgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatgacatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtga 321542  T
Q  635 cgagttt 641  Q
    | |||||    
T  321543 caagttt 321549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 369 - 665
Target Start/End: Original strand, 8211346 - 8211642
Alignment:
Q  369 tattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttg 468  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||     
T  8211346 tattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattctggaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgattta 8211445  T
Q  469 aagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctg 568  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8211446 aagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctg 8211545  T
Q  569 cagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    || ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  8211546 catggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgagacagtatctctatggattttgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatga 8211642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 15204981 - 15204442
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| |    
T  15204981 aaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatggtta 15204882  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      ||||| ||  |||||||| ||||||| ||| ||||| | || || ||| ||||  |||| ||| |  || | || |||||||||||  ||||||| ||    
T  15204881 aagagttggagctgctcgaatagtttagagacctgagtttagtctgcgaactgtcgcctcatagtataaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatt 15204782  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||| |  | ||  ||||||| |||||||| |||||     
T  15204781 cttgaacagtattaaagaagcgcataaagttgatgttaagtttgtgggcttgttggttgctagtaattagactgaagatagtgacttcaaggtcgatgat 15204682  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || ||  ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| || || | |||||||||||    
T  15204681 cagggaatgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgacgatgaagagataaagaagatgattcttgaagagagtcacaaaagtagcttgagtattc 15204582  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||| || || || || || ||||| ||| ||||||||| |||    
T  15204581 atccggaagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctaggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtatattcatgtttgatttg 15204482  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttg 576  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  15204481 tcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgctgggttg 15204442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 8200008 - 8199367
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  8200008 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 8199909  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  8199908 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 8199809  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  ||||  ||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  8199808 gaagattgatagtgaatttctgaaaggtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 8199709  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  8199708 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 8199609  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  8199608 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 8199509  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| || || ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  8199508 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 8199409  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  8199408 tccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 8199367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 18179136 - 18178481
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||| | |||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18179136 acatgaggcagtgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 18179037  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||  ||||| | || ||||||  |||| |||| || |||    
T  18179036 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattacttgaacatttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtg 18178937  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
     |  ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  |||    
T  18178936 aaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatc 18178837  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  |  |  | ||||| || |   | ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||| ||||| |||||||||||  | |||||| ||||| |    
T  18178836 agactaaagacagtgattttagaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattct 18178737  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     |||||||||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || ||     
T  18178736 tgaagaaagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagat 18178637  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || || || ||||||||| | || ||   |||||||||||| || || || |||||||| || || ||| ||     ||| |||||| |||| || ||||    
T  18178636 gtggcacaatttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatctgccagaatgga 18178537  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    | |||||||| || |||||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  18178536 aatgggatagtatatctatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 18178481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 14333776 - 14333227
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  14333776 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 14333677  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| | |||||||||||    
T  14333676 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgct 14333577  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  |  ||    
T  14333576 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtgtgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacggt 14333477  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| | |||||||||||||||  |||  | ||||||||| || | |||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  14333476 gattttaaaatcgatgatctaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccaggcaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 14333377  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | | ||| ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  14333376 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagatttcttg-tggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 14333278  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  14333277 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 14333227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Original strand, 11236103 - 11236744
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  11236103 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 11236202  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  11236203 tgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 11236302  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||| ||  ||||||| ||| |||| |||||||  ||||| ||    |||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  11236303 gaaaattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcgcagagggttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 11236402  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  11236403 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 11236502  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  11236503 gaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 11236602  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   ||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||     
T  11236603 gtattcttgtttagtttgtcagaaatcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtata 11236702  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  11236703 tccatggattttgtgacgagtttgcaaaatactcctagaggg 11236744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Original strand, 15159947 - 15160588
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15159947 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 15160046  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| ||||||    ||||||||||    
T  15160047 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgagactgggtatgct 15160146  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  15160147 gaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcgcagaaagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 15160246  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||  | ||||||||| |||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||  ||||| | ||||| |||||||    
T  15160247 gattttaaaatcgacaatcaaggtgtgctgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaaaatgattcttgaagagagtcata 15160346  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
     ||| |  || ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  15160347 ggagtatatttagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 15160446  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | || ||   ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  15160447 gtattcctgcttagtttgtcagaagtctaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 15160546  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  15160547 tccatggattttttgacgagtttgccaaatactcctagaggg 15160588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Original strand, 18550648 - 18551289
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  18550648 agatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcata 18550747  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  18550748 tgtccgccatgatggtcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 18550847  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| | |||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  18550848 gaagattgatagtgaatttctgaaaaatatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 18550947  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||  | |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| | ||| | ||||| |||||||    
T  18550948 gattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagataattcttgaagagagtcata 18551047  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  18551048 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcataatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 18551147  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  18551148 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 18551247  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  18551248 tcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 18551289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 15625902 - 15625308
Alignment:
Q  51 tggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattg 150  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||  | || ||||| ||  ||||||| |  ||||| ||  ||    
T  15625902 tggcttgaattatcatccaggtaaagataatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctgctatgatggttaaagagttggagctg 15625803  T
Q  151 ctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatca 250  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| || |||||| ||||| |||| | |||| |||| || |||||||||||  ||||||| ||  | |||||||| |    
T  15625802 ctcgaacagtttagagatctgagtctagtctgtgaattgtcacctcagattgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtgaatttctcaatagtatta 15625703  T
Q  251 gagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttga--tgagcaaggtgtgttg 348  Q
     |||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||    ||  | | |||||  | ||  ||||||| || ||||| ||  ||| || || ||||||    
T  15625702 aagaagcgcaaaaagtggatgtaaagtttgtagatttatatattggtggaaatcagactgaagatagtgactttaaggtcgagatgatcagggagtgttg 15625603  T
Q  349 agatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagcta 448  Q
     ||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||||||||| |  || | ||||||||||||| |||||||||    
T  15625602 cgatttcgaggcagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaaagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagcta 15625503  T
Q  449 caaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaa 548  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||  |  | || || || ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  15625502 caaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaatgtaatgtggcacagtttgtgtattcatgtttgatttgtcagaagtcaaa 15625403  T
Q  549 ggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttac 643  Q
     || || |||||||| ||||| ||||||   ||||| || |  ||||| |||||||| |||||||  || || ||||||||| ||||||||||||    
T  15625402 agtagagcatcagaaacctgctgggttgatgacacctttaggcgtgccagagtggaaatgggatactatatccatggattttgtgacgagtttac 15625308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 13687444 - 13686803
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  13687444 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcatatgccttgagtaggaagacattgcata 13687345  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||| |||| |||| ||||||    ||||||||||    
T  13687344 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaaaggtcacctcagagtgtgagactgggtatgct 13687245  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  | || |||||||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  13687244 gaagattgatagtgaatttctaaaaagtatcaaggaagcgcagaaagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 13687145  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||  | ||||||||| |||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||  ||||| | ||||| |||||||    
T  13687144 gattttaaaatcgacaatcaaggtgtgctgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaaaatgattcttgaagagagtcata 13687045  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  13687044 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 13686945  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | || ||   ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||     ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||     
T  13686944 gtattcctgcttagtttgtcagaagtctaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtata 13686845  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  13686844 tccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 13686803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 9597419 - 9596887
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  9597419 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcatgaagacattgcatatgtccgctttgatggtta 9597320  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| |  |||| |||||||||||  ||||||| ||    
T  9597319 gagagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatt 9597220  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||| | ||| |||||| ||| |||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  |  |||| || ||  | |||||     
T  9597219 tctgaagagtattaaagaggcacaaaaagctgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaaatcgatgac 9597120  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    |||||||||||||||||  |||     ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||    
T  9597119 caaggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 9597020  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || ||||||||| | |||||   |||    
T  9597019 atccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttatggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcctgtttagtttg 9596920  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||    
T  9596919 tcagaagtcgaagattgagcattagaaacctgc 9596887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14955943 - 14955483
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14955943 aggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 14955844  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| || || || |||||||| || ||  ||||| | || || |||  |||| || | |||||| |  |    
T  14955843 cattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcaccttagagtgtgaaact 14955744  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  |     
T  14955743 gggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagact 14955644  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  14955643 gaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaag 14955544  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaag 474  Q
    | ||||| | ||| | |||||||||||||    ||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  14955543 agagtcacaggagtagcttgagtattcat----gagctacgaagatgtatcatgatttaaagaag 14955483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 641
Target Start/End: Original strand, 23202489 - 23203125
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||| | |||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  23202489 acatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtag 23202588  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || |||||||| || ||  ||||| | || || |||  |||| |||| ||||||    
T  23202589 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtg 23202688  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
     |  ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |    |||| ||||  |||    
T  23202689 aaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagtagatgtgaagtttgtggactcgtcggttgctagagatc 23202788  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||  ||||||| || |     ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||| || ||||| |||||||||||  | |||||| ||||| |    
T  23202789 agactgaagatagtgattttagaaccgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatatgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattct 23202888  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||| |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || |  ||||| |||||||| || ||     
T  23202889 tgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaacgagat 23202988  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || || || ||||||||| | |||||   ||||||||| || || ||  |||||||||| || || ||| ||     ||| || |||||||| || ||||    
T  23202989 gtggcgcagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaaatcgaaagtcaaacatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatgga 23203088  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    | |||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  23203089 aatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagttt 23203125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 641
Target Start/End: Original strand, 23508616 - 23509252
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||| | |||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  23508616 acatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtag 23508715  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || |||||||| || ||  ||||| | || || |||  |||| |||| ||||||    
T  23508716 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtg 23508815  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
     |  ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |    |||| ||||  |||    
T  23508816 aaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagtagatgtgaagtttgtggactcgtcggttgctagagatc 23508915  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||  ||||||| || |     ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||| || ||||| |||||||||||  | |||||| ||||| |    
T  23508916 agactgaagatagtgattttagaaccgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatatgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattct 23509015  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||| |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || |  ||||| |||||||| || ||     
T  23509016 tgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaacgagat 23509115  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || || || ||||||||| | |||||   ||||||||| || || ||  |||||||||| || || ||| ||     ||| || |||||||| || ||||    
T  23509116 gtggcgcagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaaatcgaaagtcaaacatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatgga 23509215  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    | |||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  23509216 aatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagttt 23509252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 12688857 - 12688259
Alignment:
Q  42 ttatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggag 141  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| || |||    
T  12688857 ttatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagag 12688758  T
Q  142 tttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttga 241  Q
    || || || || |||||||| || ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  |||| |||||||||||  ||||||| ||  |||    
T  12688757 ttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctga 12688658  T
Q  242 atagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaagg 341  Q
    | |||||||  ||||||||  |||||||| | ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | | ||| || ||  | ||||| |||||    
T  12688657 aaagtatcaaggaagcacagaaagttgatttaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacattgattttaaaatcgatgatcaagg 12688558  T
Q  342 tgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcg 441  Q
    ||||||||||||  |||  | |||||||||||  ||| |||||||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| | ||| | ||||||||||||| ||    
T  12688557 tgtgttgagattccgaggaagaatttgtattctagac-atgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtattcatccg 12688459  T
Q  442 ggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaga 541  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||| ||| |  ||||||| || || || || || ||||||||| | |||||   ||||||||    
T  12688458 ggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttttggtggcctagtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcaga 12688359  T
Q  542 agtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    |||| || || || |||||||| ||||| ||  ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  12688358 agtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggagtgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagttt 12688259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 427 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 21662933 - 21662719
Alignment:
Q  427 ttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcat 526  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| |    
T  21662933 ttgagtattcatccgggagctacaaaaatatatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgt 21662834  T
Q  527 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||| | |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||  ||||| || ||||| || ||||||| ||||||||| || || |||||    
T  21662833 gtttaatttgtcaaaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgttgggttgttgacacctttagatgttccagagtggacgtgggatagtatatccatgga 21662734  T
Q  627 ttttatgacgagttt 641  Q
    |||| ||||||||||    
T  21662733 ttttgtgacgagttt 21662719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 569
Target Start/End: Original strand, 16199 - 16756
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  16199 aggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaaga 16298  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||| | || ||||||  |||| |||| || ||| |  |    
T  16299 cattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagagtgaaact 16398  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||| | | |  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  |     
T  16399 gggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggaaaagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagact 16498  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  |  |||| || || || || || ||  |||||||||||||  |||     ||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||    
T  16499 gaagacggtgactttaaagtcgacgatcacagtgtgttgagattccgaggtcggatttgtattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaag 16598  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  16599 agagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctac--gaatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 16696  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  16697 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgc 16756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 14041026 - 14040531
Alignment:
Q  68 cgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttaggga 167  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||  ||||| || ||| | ||||||||||  ||    
T  14041026 cgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatggtaaaagagttcgagttgttggaacagtttacaga 14040927  T
Q  168 cttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagtt 267  Q
     || ||| | || |||||  |||||||| | |||||| || | || |||||||||||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||||||| |  || ||    
T  14040926 tttaagtttagtatgtgagttgtcatcttagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaaagaagcagagaaattt 14040827  T
Q  268 gatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaattt 367  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||  | ||  ||||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||    
T  14040826 gatgttaagtttgtagatttgttggttgttagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaattt 14040727  T
Q  368 gtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgattt 467  Q
    ||||||| |||  ||| ||  |||||||  ||| | | ||||| |||||||  || |  |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  14040726 gtattccagacgctgatgagatgaagaaaatgaatcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgattt 14040627  T
Q  468 gaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    ||| ||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  14040626 gaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgatcattagaa 14040531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 14351056 - 14350561
Alignment:
Q  68 cgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttaggga 167  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||  ||||| || ||| | ||||||||||  ||    
T  14351056 cgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatggtaaaagagttcgagttgttggaacagtttacaga 14350957  T
Q  168 cttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagtt 267  Q
     || ||| | || |||||  |||||||| | |||||| || | || |||||||||||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||||||| |  || ||    
T  14350956 tttaagtttagtatgtgagttgtcatcttagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaaagaagcagagaaattt 14350857  T
Q  268 gatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaattt 367  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||  | ||  ||||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | |||||    
T  14350856 gatgttaagtttgtagatttgttggttgttagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaattt 14350757  T
Q  368 gtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgattt 467  Q
    ||||||| |||  ||| ||  |||||||  ||| | | ||||| |||||||  || |  |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  14350756 gtattccagacgctgatgagatgaagaaaatgaatcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgattt 14350657  T
Q  468 gaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    ||| ||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  14350656 gaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgatcattagaa 14350561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 552 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 6414359 - 6414245
Alignment:
Q  552 tgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacact 651  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  6414359 tgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagtatttctatggattttgtgacgagtttacctaacact 6414260  T
Q  652 ccgagagggcatgat 666  Q
    |||||||||||||||    
T  6414259 ccgagagggcatgat 6414245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 660
Target Start/End: Original strand, 11551983 - 11552633
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| || ||  | || |||||| | ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||    
T  11551983 aggcagagaagatggcttgaattgctgaaggattataactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaaaaaga 11552082  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| || ||  | |||||||| ||  |  ||||| | || ||  ||  |||| || | |||||| | ||    
T  11552083 cattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttagttgaacagttcagatatatgagtttggtttgcaaatggtcaccttagagtgtgaaatt 11552182  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  |     
T  11552183 gggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttcatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagacc 11552282  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||||||  ||||||||||  | |||||| ||||| | || |    
T  11552283 gaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccatacaatgaagagattaagaagatgattcttgagg 11552382  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | ||||| | ||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |||||| | || || ||| | |||||||| || || || ||    
T  11552383 agagtcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgattgaaagaagattttctggtggcctggtttgaaacgagatgtggc 11552482  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||| ||||| || || || |||||||| ||||| ||  ||     ||| || |||||||| || ||||| |||    
T  11552483 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcataagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgg 11552582  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  11552583 gatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 11552633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 14213063 - 14212576
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||| || |||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||    
T  14213063 aggcaaagaagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgctttgagcaggaaga 14212964  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||| || || || |||||  | || ||||||  |||| |||| |  ||| |  |    
T  14212963 cattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacaattcagagatttgagcttggtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaact 14212864  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| |||||||||||  ||| ||| ||  | || ||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  |     
T  14212863 gggaatgctgaagattgataatgaatttctaaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagact 14212764  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  |  |||| || || || ||||| || ||||||||||||||  |||     ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||  ||||| | ||||    
T  14212763 gaagacggtgactttaaagtcgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgtattcccgacgatgcagaaatgaagaaaatgattcttgaag 14212664  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaa 497  Q
    | ||||||   || | ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | || || ||||| ||||||||    
T  14212663 agagtcatcgaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 14212576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 331 - 563
Target Start/End: Original strand, 15153859 - 15154091
Alignment:
Q  331 gatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 430  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||  |  ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| ||||||| ||| | |||||    
T  15153859 gatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtagcttga 15153958  T
Q  431 gtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgttt 530  Q
    |||| ||| |||||||||  || |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | |||||    
T  15153959 gtatccatccgggagctatgaagatgtatcatgatctgaagaatttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgttt 15154058  T
Q  531 gacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    || |||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  15154059 gatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaa 15154091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 281
Target Start/End: Original strand, 15147820 - 15148037
Alignment:
Q  64 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagttta 163  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  15147820 catccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagggagttcgagttgcttgaacagttta 15147919  T
Q  164 gggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaaca 263  Q
    | || |||||  | || ||||||  |||| |||| |||||| |  | || |||||||||||  ||||||| ||  |||| | ||| | |||||||||  |    
T  15147920 gtgatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagaatattaaagaagcacataa 15148019  T
Q  264 agttgatgttaagtttgt 281  Q
     |||||||| ||||||||    
T  15148020 tgttgatgtcaagtttgt 15148037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Original strand, 27107227 - 27107275
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107227 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 27107275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 7824717 - 7824669
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7824717 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggataacatttctatggatttt 7824669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 514 - 566
Target Start/End: Original strand, 17144646 - 17144698
Alignment:
Q  514 tttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcc 566  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  17144646 tttgtgtatgcttgtttgatttgtcaaaagtctaagatttaacatcagaagcc 17144698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 40034 - 40142
Alignment:
Q  17 ggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgca 116  Q
    |||||||| | || || ||||| || ||||||||||   ||| ||| ||||| || || || |||||||| || ||||| |||||||||||| | |||||    
T  40034 ggagatggttggaattcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccaggaaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagtccttgca 40133  T
Q  117 catgtcggc 125  Q
    |||||||||    
T  40134 catgtcggc 40142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 20551 - 19894
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  20551 aggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaaga 20452  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| | ||| || || || || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||| || || |||| ||| | |||||    
T  20451 cattgcatatgtctgcgttgatggtgaaggaattcgatttactagaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtattcagtt 20352  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||     
T  20351 ggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatccgagaagcgcaacaagtggatgttaagtttgttgatttgatggttactggtaatgaagct 20252  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  20251 gaagatattgacttcaaagttgatgatcagggtgtattgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaag 20152  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | ||||| ||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20151 agagtcacaagagtagcttgagtattcatcctggagctactaatttgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgc 20052  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20051 tcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtcaaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgg 19952  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19951 gatagcatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgaaagggcatgatg 19894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 90
Target Start/End: Original strand, 58091 - 58146
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgca 90  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  58091 taaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgca 58146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 514 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 75485 - 75433
Alignment:
Q  514 tttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcc 566  Q
    ||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  75485 tttgtatatgcttgtttgctttgtcaaaagtctaagattgaacatcagaagcc 75433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 46269 - 46931
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  46269 acatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcacatgccttgagtag 46368  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||| ||||| || ||||||||||  || ||||| ||| | || |||||||| |||||||  || || |||||| || || |||| |||||     
T  46369 gaaaacgttgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgatccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtt 46468  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||     
T  46469 cagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtagatgtgaagtttgttgatttgatggttgctagtaatg 46568  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  46569 aagctgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatctgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaatttt 46668  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  46669 agaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctacaaaaatgaatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgac 46768  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  46769 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgaagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 46868  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46869 agtgggataacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 46931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Original strand, 41203 - 41863
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  41203 acatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtag 41302  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||| | |||||||| || ||  ||||||| || |||||| ||||| | || ||| |     
T  41303 gaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtata 41402  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | |||||||| ||||| |||  | || |||||     
T  41403 cagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagaagatttgaagtttgttgatttgatgacttctggtaatg 41502  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  41503 acactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattct 41602  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  41603 tgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagat 41702  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  41703 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 41802  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  41803 agtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatga 41863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 3314 - 2721
Alignment:
Q  41 attatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggga 140  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||  ||    
T  3314 attatgattgtgggttgaattattatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgcattgatggtaaaaga 3215  T
Q  141 gtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttg 240  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| | || || ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||     
T  3214 gtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtgaattctta 3115  T
Q  241 aatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaag 340  Q
    |||||||||| |||||| ||  ||   ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  | ||  ||||||| || ||  | ||||| || |    
T  3114 aatagtatcaaagaagcgcagaaaaccgatgttaagtttgtggacttgttggttactagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcagg 3015  T
Q  341 gtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattc 440  Q
    | |||||||||||  ||| || ||||||||||||| |  |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||  |    
T  3014 gggtgttgagattctgaggcagaatttgtattcctaatgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcaccc 2915  T
Q  441 gggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcag 540  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||||| ||||||     
T  2914 gggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtca- 2816  T
Q  541 aagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtt 640  Q
          || ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| ||  |||||||| |||||||||    
T  2815 ------aaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagaatggaaatgggatagcatatccgtggattttgtgacgagtt 2722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 45953 - 45292
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  45953 acatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttaagcag 45854  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||||||  | || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| ||||| |||| ||| |     
T  45853 gaagaccctacatatgtctgcgttgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtata 45754  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |   ||||     
T  45753 cagttgggaatgctgaagattaacagtaatttcttgaatagtatccgagaagcgcagcaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgcggataatg 45654  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||   | |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45653 aaacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagatgtagaatttgtaatcttgacaatgaagaattgaaaaagttgatttt 45554  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  45553 agaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgtttcggtggtccggtttgaaacgcgac 45454  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  45453 gttgctcagtttttgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaatttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 45354  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45353 aatgggatagcatttctatggattttgtaacgagtttaccaaacactccgagagggcatgat 45292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 10 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 21318 - 20748
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  21318 aggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaaga 21219  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | || || ||||| || ||||||||||| || |||||  | || ||||||||||| |||||||| || || | |||  ||||| ||             |    
T  21218 ccttacatatgtctgcgttgatggtaagagaatttgatcttctagaacagtttagagacttgagccttgtttctgagttgtcacct-------------t 21132  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| |  ||||| || |     
T  21131 ggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgcaacaagtggatgtaaagattgttgatttaatggttgcgggtaatgaaaca 21032  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21031 gaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggtagaatttgtattccttacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaag 20932  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| ||||| | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  20931 aaagtcacaagagtagcatgagtattcatccgggacctacaaaaatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgtagc 20832  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgt 593  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  20831 tcaatttatttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaaacctgcaaggttgttgacaccgttggatgt 20748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 508 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 44438 - 44280
Alignment:
Q  508 gctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagt 607  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44438 gctcagtttttgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaatttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 44339  T
Q  608 gggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44338 gggatagcatttctatggattttgtaacgagtttaccaaacactccgagagggcatgat 44280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 569
Target Start/End: Original strand, 19249 - 19775
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  ||||    
T  19249 tatgattttgtgttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagt 19348  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    |  | ||||| |||||||| |  || || ||  | |||||||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||||  ||| ||| || |||||    
T  19349 tcaagttgcttgaacagttcaaagatttaagattagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttttgaa 19448  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggt 342  Q
     ||||| | ||| |||||  ||| ||||||||||||||| || ||  ||||| ||||| ||||  | ||  | ||||| || ||  | ||||| ||||||    
T  19449 gagtattaaagaggcacagaaagctgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggt 19548  T
Q  343 gtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgg 442  Q
    ||  |||| ||| |||     ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| || ||||   | ||||||||||||||| |||    
T  19549 gtactgaggtttcgaggtcggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagatgtaacttgagtattcatccgg 19648  T
Q  443 gagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaa 542  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || |||||| | ||||||| |||||||||    
T  19649 gagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagttcgtgtattcttgtttgatttgtcagaa 19748  T
Q  543 gtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
     || |||||||| |||||||| |||||    
T  19749 atcgaaggttgagcatcagaaacctgc 19775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 752 - 99
Alignment:
Q  13 cagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 112  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  752 cagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacct 653  T
Q  113 tgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttggg 212  Q
    | || ||||| || ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||| |||| ||| | ||||||||    
T  652 tacatatgtctgcgttgatggtaaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 553  T
Q  213 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggag 312  Q
     |||||||  || ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||| || | |||    
T  552 gatgctgagaattaatagtgatttcttgaatagtatccaagaagcgcagcaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatgaaacagag 453  T
Q  313 aatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaa 412  Q
     ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  452 gatagtgacttcaaggttgatgaccagggtgtattgagattcagaggtagaatttatattcctgaaaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaa 353  T
Q  413 gtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctca 512  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  352 gtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacatgacgttgctca 253  T
Q  513 ttttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggat 612  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  252 gtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgtagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggat 153  T
Q  613 agcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  152 agcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgat 99  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 666
Target Start/End: Original strand, 4327 - 4983
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4327 aggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaaga 4426  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | || || ||||| || ||||||||||  || ||||| || || ||| ||||||| |||||||| || || |||||  ||||| |||| ||| | |||||    
T  4427 ccttacatatgtctgcattgatggtaaaagaatttgatttactagaatagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagtt 4526  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| |||||||  || ||||||||||||||||||| |||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||| || |     
T  4527 ggggatgctgagaattaatagtgatttcttgaataatattcgagaagcgcagcaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatgaaaca 4626  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4627 gaggataatgacttcaaggttgatgattagggtgtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaag 4726  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  4727 aaagtcataagagtagcttgagtattcatccggaagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgc 4826  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  4827 tcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtatcggagtggaaatgg 4926  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4927 gataacatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgat 4983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 20285 - 19623
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  20285 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcag 20186  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| || |||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||| | || ||||||    
T  20185 gaagacgttacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctggtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 20086  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20085 cagttgggtatgctgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttaatggtaatc 19986  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||    
T  19985 aagctgaagatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgcattcctgacaatgatgagatgaaaaagttaatttt 19886  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | ||     
T  19885 agaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagggggat 19786  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| || ||||    
T  19785 gttgcttaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggtcgaacatcagaagcctgcagggttgttgacacctttagatgtgccagaatgga 19686  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  19685 agtgggacaacatttctatggattttgtgacgagtttacccaatactccgagagggcatgatg 19623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 24447 - 23785
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  24447 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcag 24348  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| || |||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||| | || ||||||    
T  24347 gaagacgttacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 24248  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||||    
T  24247 cagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatgttttattgtaatc 24148  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||    
T  24147 aatctgaagatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgcattcctgacaatgatgagatgaaaaagttaatttt 24048  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | ||     
T  24047 agaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagggggat 23948  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| || ||||    
T  23947 gttgcttaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggtcgaacatcagaagcctgcagggttgttgacacctttagatgtgccagaatgga 23848  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  23847 agtgggacaacatttctatggattttgtgacgagtttacccaatactccgagagggcatgatg 23785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Original strand, 32547 - 33208
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32547 acatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtag 32646  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||| | || ||||||    
T  32647 gaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 32746  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32747 cagttgggtatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatc 32846  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  || |||| || |||||| ||||||||||| || ||  |||| | |||||||||    
T  32847 aagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgatttt 32946  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||     
T  32947 ggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgat 33046  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  33047 gttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtgga 33146  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  33147 aatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatgat 33208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 55770 - 56432
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  55770 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttcaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcag 55869  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||| ||| |     
T  55870 gaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtata 55969  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||  |||||||| ||||| ||  || || |||||     
T  55970 cagttggggatgctgaaaattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagctcagcaattggatgggaagtttgttgatttgataattgctggtaatg 56069  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  56070 gcactgaggatagtgacttcaaggtggatgatcagggtgtattgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgatttt 56169  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  56170 agaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgagagctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgaa 56269  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  56270 gttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 56369  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||||   | | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  56370 agtgagatagcatttctatggatttggagccaagtttaccaaacacttcgagagggtatgatg 56432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 41117 - 41069
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41117 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 41069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 40 - 667
Target Start/End: Original strand, 31415816 - 31416446
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggcc---ttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||    |||||||| |    
T  31415816 gattatgattttggcttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgctgacgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctgctttgatggtga 31415915  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||  || || |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  31415916 aggaatttgaattgctagaacagtttagggacttgagtcttgtcagtgagttgacacctcagagtgtgcagttggggatgctgaagattaatagtgaatt 31416015  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |  | ||| ||||||| ||||||||||||||     
T  31416016 cttgaatagtatccgagaagctcagcaagtggatttgaagtttgttgatttaatgattactggtaatgacactgaggatagtgacttcaaggttgatgat 31416115  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || || || |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  31416116 cagggcgtattgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattc 31416215  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31416216 atccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcattttgtttatgcatgcttgacttg 31416315  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31416316 tcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacg 31416415  T
Q  637 agtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  31416416 agtttaccgagcactccgagagggcatgatg 31416446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 23656398 - 23655736
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23656398 acatgaggtagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattactatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcag 23656299  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||| ||| |     
T  23656298 gaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtata 23656199  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||     
T  23656198 cagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagcacaacaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatg 23656099  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |    
T  23656098 aaactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattct 23655999  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     |||||| |||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  23655998 ggaagaaggtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgac 23655899  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||    
T  23655898 gttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttattaacaccgttagatgtgccggagtgga 23655799  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23655798 agtgggacaacatttccatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 23655736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 13 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 22052326 - 22051673
Alignment:
Q  13 cagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 112  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||     
T  22052326 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacac 22052227  T
Q  113 tgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttggg 212  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||  ||||  |||||||  |  |||||||    
T  22052226 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtcgcctcaaagcatatagttggg 22052127  T
Q  213 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggag 312  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| | || ||||||||| || ||||||||    |||||    
T  22052126 catgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtcaagctggttgatttaatgattgctagtaatggcacggag 22052027  T
Q  313 aatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaa 412  Q
     ||||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  22052026 gatagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaa 22051927  T
Q  413 gtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctca 512  Q
    |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22051926 gtcacaagagtaggttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctca 22051827  T
Q  513 ttttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggat 612  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22051826 ttttatgtatgcatgtttgacttgctagaagtctaacattgagcatcagaagcctgcagggttgttgacgccgttggatgtaccggagtggaaatgggat 22051727  T
Q  613 agcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  22051726 agcatttctatggattttgtgacaagtttactaaacactccgagaagacatgat 22051673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Original strand, 20974966 - 20975622
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20974966 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtag 20975065  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| ||  |||| ||||| ||     |||| |  || ||  | || || ||||||||||| || ||||| || || |||||| || || |||| |||||     
T  20975066 gaaaacgctgcatatgtctgc-----tggtgaaagaattccattttctagaacagtttagagagttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtt 20975160  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || |||||     
T  20975161 cagttggggatgctgaagattaaaagtgatttcttgaatagtataagagaagcaaaacaagtggatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatg 20975260  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| ||||||||  |||| |  ||||| |||||||||||    
T  20975261 gcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgatttt 20975360  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20975361 agaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatacgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaggaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgac 20975460  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20975461 gtcgctcattttgtatatgcatgtttgacttgctagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagtgttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 20975560  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||    
T  20975561 aatgggatagcatttctatggattttgtgacgaatttaccacatactccgagagggcatgat 20975622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 40 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 1267674 - 1267062
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || || ||  ||||| |||  |    
T  1267674 gattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagtcaatgtggttgcagatgcgttgaggaggaagacactgcatatatctgctatgatgataaaag 1267575  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    | ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||  | ||| |||||||| | || || || ||||||||||| || |||||||||||    
T  1267574 aatttgatttgctagagcagtttagagatttgagtctagtctgtgagttatcacctcaaagtatacaattagggatgctgaagattaacagtgatttctt 1267475  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||  |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||| || ||||| |  | ||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  1267474 gagcagtatccgagaagcacatcaagtggatgtcaagctggttgatttgatggttgctggtaatgacactgaggatagtgatttcaaggttgatgatcag 1267375  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||     
T  1267374 ggtgtgttgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatc 1267275  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  1267274 caggagctacaaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgcccattttgtgtatgcatgtttgactttcca 1267175  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1267174 gaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttcgtgacgagt 1267075  T
Q  640 ttacaaaacactc 652  Q
    |||| ||||||||    
T  1267074 ttaccaaacactc 1267062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 21841883 - 21841226
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||| || |||||||| ||| | || || |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  21841883 aggcaaagaagatggcttgagatgttgaaggattatgatttctgtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 21841784  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||  ||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||  ||||| |||| ||||| |||||    
T  21841783 cgttaaacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagtt 21841684  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |     
T  21841683 gggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgctagtaattaaact 21841584  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  |  |||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  21841583 gaagagggtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaag 21841484  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| |  || | ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || ||||| || || || ||    
T  21841483 aaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgc 21841384  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    |   ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21841383 tatgtttgtttatgcatgtttgacttgttagaagtctaaggttgagcattagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgg 21841284  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    || | |||||| ||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  21841283 gacaacatttccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggcatgatg 21841226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 19852882 - 19852220
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  19852882 acatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 19852783  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||| |||||     
T  19852782 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgta 19852683  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  19852682 caattgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcgcagaaaattgatgtcaagtttgtggatttaatgattgctagtattc 19852583  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | ||  || |||| ||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  19852582 aaactgaagatggtgatttcaaggatgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgatttt 19852483  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||| |  || | ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||     
T  19852482 agaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgat 19852383  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||    
T  19852382 gttgctcagtttttttatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgttcgatgtgccagagtgga 19852283  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| |  || ||||| |||||||||||||    
T  19852282 agtgggacagcatttccatggattttgagacgagtttgccgaatactccaagagggcatgatg 19852220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 10 - 666
Target Start/End: Original strand, 31570157 - 31570813
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31570157 aggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaaga 31570256  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    || | || ||||| ||  ||||| | |  || ||||| || || ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||  ||||  |||||||  | |||||    
T  31570257 cacttcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagagacatgagtttggtgtgtgagttgtcgcctcaaagcatacagtt 31570356  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||||| ||||| || || |||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||| |||||          
T  31570357 ggggatgctaaagattaacagcgatttcctgaatagtattcgagaagcacagcaagtggatgtcaagttggttgatctaatggttactggtaatagtatt 31570456  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  |||| |    
T  31570457 gaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagagg 31570556  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||    
T  31570557 aaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgc 31570656  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  31570657 tcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgg 31570756  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  31570757 gatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgat 31570813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 19858918 - 19858256
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  19858918 acatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 19858819  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||  ||||| |||| |||||     
T  19858818 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagttcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgta 19858719  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  19858718 caattgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcgcagaaaattgatgtcaagtttgtggatttaatgattgctagtattc 19858619  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | ||  || |||| ||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  19858618 aaactgaagatggtgatttcaaggatgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgatttt 19858519  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||| |  || | ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||     
T  19858518 agaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgat 19858419  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||    
T  19858418 gttgctcagtttttttatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgttcgatgtgccagagtgga 19858319  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| |  || ||||| |||||||||||||    
T  19858318 agtgggacagcatttccatggattttgagacgagtttgccgaatactccaagagggcatgatg 19858256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 20009231 - 20009891
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || || || || | ||||||||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  20009231 acatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactgtgattttggtttgaattatcaccccggtaaa-ctaatgtggttgcagatgctttgagcag 20009329  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||  ||||| |||| ||||||    
T  20009330 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagttcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtg 20009429  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||  || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20009430 caattgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaacaatatcatagaagcgcagaaaattgatgtcaagcttgtggatttaatggttactagtaatc 20009529  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
     | | ||  |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  | ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  20009530 gaactgaagagggtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcttgataatgatgagttgaaaaagttgatttt 20009629  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||| |  || | ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||| || ||     
T  20009630 agaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaatatgtatcatgatttgaagaaattattttggtggtccg-tttgaaacgtgat 20009728  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||    
T  20009729 gttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccattagatgtgccagagtgga 20009828  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |  || ||||| |||||| ||||||    
T  20009829 agtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaagagggaatgatg 20009891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 22372397 - 22371749
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22372397 aggcagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaaga 22372298  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||    |||||||||| |||||||||||    
T  22372297 cgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctgagtcttgtttgtttgttgtcatctcagagtgtgcagtt 22372198  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  || |         ||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  22372197 gggtatgttgaagatcaatagtgatttcttaaacagtatcagagaagcgcagaaact---------gtttgtggatttaatggttgctagtaatcaaacc 22372107  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    || ||  |||| |||||||||||||| |   |||||||||| || ||||  | ||| |  |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| ||||||    
T  22372106 gaaaagggtgatttcaaggttgatgatctgtgtgtgttgaggttcagaggaagaatattcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattatagaag 22372007  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| |  || | ||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||| | ||||| |  || || ||    
T  22372006 aaagtcacagaagtagcttaagtattcacctgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattattttggtggtccagattgaaacatgatgttgc 22371907  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22371906 tcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgcctgagtggaagtgg 22371807  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    || | |||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||| |||||||||||||    
T  22371806 gacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccaagagggcatgatg 22371749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 29302736 - 29303398
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||    
T  29302736 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgcagatgcgttaagcag 29302835  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| |||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||| |     
T  29302836 gaaaacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttggaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtata 29302935  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    | |||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||| ||||||| || ||| | ||| | |||||||| ||||| |||    || | |||     
T  29302936 cggttggggatgctgaagattgatagtgatttcttaaacagtatccgagaagctcagcaaatagatttgaagtttgttgatttgatgacatctggcaatg 29303035  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| || |||   | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |    
T  29303036 acactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagatgaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaaattgattct 29303135  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     | ||| ||||| ||||| |  ||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||     
T  29303136 tgtagagagtcacaagagtaggttgagcattcacccgggggctacaaagatgtatcatgatttgaaggaactgttttggtggtccggtttgaaacgagat 29303235  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  29303236 gttgctcagtttgtgtatgcatgtttgactttccagaagtctaaagtggaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 29303335  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||||| || |||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29303336 agtgggatagtatctctatggatttcgtgacgaatttaccaaacacttcgagagggcatgatg 29303398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 43 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 20389532 - 20388908
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |  ||||    
T  20389532 tatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaagagt 20389433  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  ||||  |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20389432 tttatttgcttgaacagtttagggacttgagcctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaa 20389333  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggt 342  Q
     | ||||| ||||||| |  | |||||| |||||||||| || ||  ||||| |||||| |||| | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20389332 caatatcaaagaagcatagaaggttgatattaagtttgtcgacttgttggttgctagtattcaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggt 20389233  T
Q  343 gtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgg 442  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |   | | ||| ||||||||| |||    
T  20389232 gtgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacatacgtagcttaagtattcatccgg 20389133  T
Q  443 gagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaa 542  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||| |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20389132 gagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttagtggtccggattgaagcgtgatgttgtacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaa 20389033  T
Q  543 gtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttta 642  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| | |||| ||||||    
T  20389032 atctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgtgccggagtggaaatgggatagcatatccatggattgtgtgacaagttta 20388933  T
Q  643 caaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |  || |||||||||||||||||||    
T  20388932 ccgaatactccgagagggcatgatg 20388908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 14566613 - 14565953
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  14566613 acatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtag 14566514  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||| || |||||| ||||| | || ||| |     
T  14566513 gaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtata 14566414  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | |||||||| ||||| |||  | || ||||      
T  14566413 cagttgggaatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagaagatttgaagtttgttgatttgatgacttctggtaacg 14566314  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| || || |||||||| || |||||| |||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14566313 acactgaggatagtgattttaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattct 14566214  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| || || |  |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  14566213 tgaggagagtcacaaaagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggat 14566114  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  14566113 gttgctcagtttgtttatgcctgtttaatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 14566014  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14566013 agtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 14565953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Original strand, 16270534 - 16271194
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  16270534 acatgaggcagaggagatggttagagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcag 16270633  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| |||||||||||||| || || |||||||  || || || ||| | ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||| |     
T  16270634 gaaaacattgcacatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtata 16270733  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||||| || || || ||||| |||   ||| ||| |     
T  16270734 cagttggggatgctgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagcggatgtgaaattggttgatttgatgacaactggtagtg 16270833  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| |  |||| || ||||||||||| || |||||  |||| || ||||  | | | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  16270834 acaccgaggaccgtgattttaaggttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggaagagtatgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattct 16270933  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  16270934 tgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaaagagat 16271033  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  16271034 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcaaggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 16271133  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16271134 agtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 16271194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 6605129 - 6604467
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  6605129 acatgaggcagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtag 6605030  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| |  ||||| || ||| | |||||||| || ||| ||||||| || |||||| ||||| | || ||| |     
T  6605029 gaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagttcgagttgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtata 6604930  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| | |  ||| | |||||||| |||||  ||  | |  |||||     
T  6604929 cagttgggaatgttgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagctcaaaaggaggatttgaagtttgttgatttggtgacttcaggtaatg 6604830  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||| || || |  | | | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  6604829 acactgaggatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcaggggtagagtctgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattct 6604730  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  6604729 tgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagat 6604630  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  6604629 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 6604530  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6604529 agtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 6604467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 495
Target Start/End: Original strand, 20984862 - 20985347
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  20984862 aggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaaga 20984961  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  20984962 cgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctatagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagtt 20985061  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| || |     
T  20985062 gggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacagaaagttgatgtcaagtttgttgatttaatagttactagtaatgaaact 20985161  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  20985162 gaagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaagaatttgtattcctaaaaatgatgagttgaaaaagttgattttggaag 20985261  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttg 495  Q
    ||||||| |  || | ||| ||||||||  || |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  20985262 aaagtcacagaagtatcttaagtattcacccgagagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctggtttg 20985347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 40 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 6680547 - 6679922
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |  |    
T  6680547 gattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaag 6680448  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    |||| || ||| | |||||||| || ||| ||||||| || |||||| ||||| | || ||| | |||||||| ||| |||| ||  ||||||| |||||    
T  6680447 agttcgagttgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttctt 6680348  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| | |  ||| | |||||||| |||||  ||  | |  ||||| |  | ||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  6680347 gaacagtatccgagaagctcaaaaggaggatttgaagtttgttgatttggtgacttcaggtaatgacactgaggatagtgatttcaaggttgatgatcag 6680248  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    |||||| |||| || || |  | | | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |  |||||||||||      
T  6680247 ggtgtgctgaggttcaggggtagagtctgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacc 6680148  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  6680147 cggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtca 6680048  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  6680047 gaagtccaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagt 6679948  T
Q  640 ttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||    
T  6679947 ttaccgaacactccgagagggcatga 6679922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 12306229 - 12305569
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  |    
T  12306229 acatgaggcagaggagatggttatagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagctg 12306130  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
     || |||||||| ||||| || || |||||||  || || || ||| | ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||| |     
T  12306129 taaaacattgcatatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtctagtctgtgaattgtcacctcagagtata 12306030  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | || || || ||||| |||  |||| ||| |     
T  12306029 cagttggggatgttgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagcagatttgaaattggttgatttgatgactactggtagtg 12305930  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| | ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||   | | | || |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |    
T  12305929 acactgaggacagtgattttaaggttgatgatcagggtgttttgaggttcagatgaagagtatgcattcctgacaatgatgagttgaagaagttaattct 12305830  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||| ||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  12305829 tgaagagagtcataagagtaggttgagtattcacccgggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaattgtgat 12305730  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  12305729 gttgctcagtttttttatgcttgttttatttgtcagaagtctaaggttgatcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 12305630  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||  ||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||    
T  12305629 agtgggacagtatctctatggatttcgtgacgaccttaccgaacactccgagagggtatga 12305569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 27356007 - 27355359
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||           || ||    
T  27356007 acatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg-----------agcag 27355919  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| |||||||||||||| || || ||||| |  || || || ||| | ||||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||||| |||| ||| |     
T  27355918 gaaaacattgcacatgtctgctttaatggtgaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacctgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtata 27355819  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||  ||| | || ||||| |||||||||  |||| ||| |     
T  27355818 cagttggggatgctgaagattgatagtaatttcttgaatagtatccgagaagctcagaaagcagatttgaaatttgttgatttaatgactactggtagtg 27355719  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    | || ||| | ||||| || ||||||||||| || |||||  ||||||| ||||  | | |||||||||||||||  || || ||||||  ||||||| |    
T  27355718 acgctgaggacagtgactttaaggttgatgatcagggtgtactgagattcagagggagagtttgtattcctgacagcgatgagttgaagg-gttgattct 27355620  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  27355619 tgaagatagtcacaagagtagattgagtatacacccgggggctacaaagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagat 27355520  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| | ||||||||    
T  27355519 gttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggtttttgacaccgttagatgtactggagtgga 27355420  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  27355419 agtgggacagtatctctatggattttgtgacgaatttaccgaacactccgagagggcatga 27355359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 665
Target Start/End: Original strand, 803064 - 803643
Alignment:
Q  86 ttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtga 185  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||| | |||||||| || ||  ||||||| || |||||    
T  803064 ttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtga 803163  T
Q  186 aatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggat 285  Q
    | ||||| | || ||| | |||||||| ||| |||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||  |||  ||| | |||||||| |||    
T  803164 attgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagaagatttgaagtttgttgat 803263  T
Q  286 ttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaag 385  Q
    || |||  | || ||||  |  | ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  803264 ttgatgacttctggtaacgacactgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaag 803363  T
Q  386 aattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctg 485  Q
    | ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| |  |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  803364 agttgaagaagttgattctagaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 803463  T
Q  486 gtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccg 585  Q
    ||| ||||||||  | || || ||| | || || ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  803464 gtctggtttgaaaagagatgttgctaagttcgtttatgcctgtttggtttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 803563  T
Q  586 ttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  803564 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctacggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatga 803643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 641
Target Start/End: Original strand, 19483379 - 19484010
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19483379 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaagattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 19483478  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||  | ||  ||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| |  |    
T  19483479 cattgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaact 19483578  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  |||  || |||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  ||||  |     
T  19483579 gggtatgctgaagattgatagtgattttctgagaagcatcaaagaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcagact 19483678  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||  |||  |  ||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  19483679 gaagacagtgattttaagatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaaggatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaag 19483778  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  19483779 agagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 19483878  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||    
T  19483879 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgg 19483978  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  19483979 gatagtatatcgatggattttgtgacgagttt 19484010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 641
Target Start/End: Original strand, 22376781 - 22377400
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||   ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||  ||||| ||||    
T  22376781 tggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgt 22376880  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    | ||  |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| | || |||||| ||||| |||| |||||| || || | ||||| ||    
T  22376881 ccgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgctaaa 22376980  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    |||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||  || ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||  | ||  |||||||     
T  22376981 gattgatagtgaattcttgaacagtatcaaagaagcgcagaaaattgatgttaagtttgtgcacttgttggtttctagtaatcagactgaagatagtgat 22377080  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    || ||  | ||||| |  || |||||||||||  ||| || ||||||||||||| || |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  |    
T  22377081 tttaaaatcgatgatctgggagtgttgagattctgaggcagaatttgtattcctaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaa 22377180  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgta 521  Q
      | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| | ||| || || || ||||||||    
T  22377181 atagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacacgatgtggcacagtttgtgta 22377280  T
Q  522 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttct 621  Q
    | | ||||||| |||||| || || |  ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||||| ||     
T  22377281 ttcctgtttgatttgtcataaatcaatagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtgggaatgggatagcatatcc 22377380  T
Q  622 atggattttatgacgagttt 641  Q
    ||| ||||| ||||||||||    
T  22377381 atgaattttgtgacgagttt 22377400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 641
Target Start/End: Original strand, 22382956 - 22383575
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||   ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||  ||||| ||||    
T  22382956 tggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgt 22383055  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    | ||  |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| | || |||||| ||||| |||| |||||| || || | ||||| ||    
T  22383056 ccgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgctaaa 22383155  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    |||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||  || ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||  | ||  |||||||     
T  22383156 gattgatagtgaattcttgaacagtatcaaagaagcgcagaaaattgatgttaagtttgtgcacttgttggtttctagtaatcagactgaagatagtgat 22383255  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    || ||  | ||||| |  || |||||||||||  ||| || ||||||||||||| || |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  |    
T  22383256 tttaaaatcgatgatcggggagtgttgagattctgaggcagaatttgtattcctaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaa 22383355  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgta 521  Q
      | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| | ||| || || || ||||||||    
T  22383356 atagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacacgatgtggcacagtttgtgta 22383455  T
Q  522 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttct 621  Q
    | | ||||||| |||||| || || |  ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||||| ||     
T  22383456 ttcctgtttgatttgtcataaatcaatagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtgggaatgggatagcatatcc 22383555  T
Q  622 atggattttatgacgagttt 641  Q
    ||| ||||| ||||||||||    
T  22383556 atgaattttgtgacgagttt 22383575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 664
Target Start/End: Original strand, 20395474 - 20396094
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |   ||||||| |    
T  20395474 aaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtcagttatgatggtta 20395573  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      ||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||||| | || |||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||    
T  20395574 aagagttggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtgaatt 20395673  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
     ||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||   || ||  | | |||||  | ||| || |||| || || ||||||||     
T  20395674 tttgaatagtattaaggaagcacagaaagtggatgtaaagtttgtagattatttgattggtgggaatcagactgaggatggtgacttaaaagttgatgat 20395773  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || ||  ||||| ||||| ||| || ||||| |||||| |||||||| ||  | |||||| ||||| | ||||||||||| |  || | |||||||||||    
T  20395774 cagggattgttgcgatttcgaggcagaatttatattcccgacaatgatgagataaagaagatgattcttgaagaaagtcacagaagtagcttgagtattc 20395873  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||| ||| ||||||||| |||    
T  20395874 atccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtttattcatgtttgatttg 20395973  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    |||       || ||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||| |||||    
T  20395974 tca-------aaagttgagcatcagaaacctgctgggttgttgacaccgttagatgtgccagagtgaaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 20396066  T
Q  637 agtttacaaaacactccgagagggcatg 664  Q
    ||||| |  || ||||| ||||||||||    
T  20396067 agtttgccgaatactccaagagggcatg 20396094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 19979406 - 19978874
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  19979406 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtataaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 19979307  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||  | || |||||   |||| |||| |||||| |  |||| |||||||| ||  ||||||| ||    
T  19979306 gagagtttgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaatt 19979207  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
     ||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| |||||||||| || ||  || |||| || ||||| |||||     
T  19979206 tttgaagagtatcaaagaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcaggctgaagatggtgactttaaggtcgatgac 19979107  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || ||||| ||||||||  |||    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||    
T  19979106 catggtgtattgagattccgaggtcgaatttgtattcttgacaatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 19979007  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| || || || || || || || || ||||||||| | ||||||  |||    
T  19979006 atccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattaaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttg 19978907  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  19978906 tcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgc 19978874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 569
Target Start/End: Original strand, 17673347 - 17673897
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  17673347 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 17673446  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||| | || |  |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  17673447 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagtttggtttccgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 17673546  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  17673547 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 17673646  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||  | |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  17673647 gattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 17673746  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  17673747 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgattttaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 17673846  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  17673847 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 17673897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 19114156 - 19113525
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19114156 aggcagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 19114057  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  |    
T  19114056 cattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaact 19113957  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||  ||||  |     
T  19113956 gggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttgattgctagagatcagact 19113857  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
     |  | ||||| || ||  | ||| | |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||    
T  19113856 aaagacagtgattttaaaatcgataatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaag 19113757  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  19113756 agagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 19113657  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||     ||| || || ||||| || ||||| |||    
T  19113656 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgg 19113557  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  19113556 gatagtatatcgatggattttgtgacgagttt 19113525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18858034 - 18857556
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  18858034 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcata 18857935  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  18857934 tgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 18857835  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| ||||| |  ||||||||   ||||||||| |||||||| |||||  ||||| |||||||||   | ||  | |||    
T  18857834 gaagattgatagtgaatttatgaaaagtattaaggaagcacagagagttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagtaatcggactgaagaaagt 18857735  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  |  ||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  18857734 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaaggatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattctagaagagagtcata 18857635  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaa 497  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| ||||||||    
T  18857634 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 18857556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 563
Target Start/End: Original strand, 21165883 - 21166406
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  21165883 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagag 21165982  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| ||  ||||  | ||||||||   |||| |||| |||||| |  |||| |||||||||||  ||||||| ||  |    
T  21165983 agttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtgtgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttct 21166082  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| ||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  || | || || ||||| ||||| ||     
T  21166083 gaagagtatcaaagaagcacataaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggagactttaaggtcgatgaccat 21166182  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    ||||||||||||||  |||    ||||||||||||  || |||||||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||      
T  21166183 ggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcccaacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacc 21166282  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || |||||  | ||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||||  || |||    
T  21166283 cgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctagattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttatca 21166382  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    |||||| ||| |||||||||||||    
T  21166383 gaagtcgaagattgaacatcagaa 21166406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 569
Target Start/End: Original strand, 22128282 - 22128832
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |    
T  22128282 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcata 22128381  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  22128382 tgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 22128481  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||   ||||||||| |||||||| |||||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  22128482 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagagagttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 22128581  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  22128582 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagatattaagaagatgattcttgaagagagtcata 22128681  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || |  |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  22128682 gaagtagtttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 22128781  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||| | |||||   ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  22128782 gtattcctgtttagtttgtcagaaatcaaaagttgagcatcagaagcctgc 22128832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Original strand, 21393207 - 21393739
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||| ||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||  |||||||||    
T  21393207 aaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaa 21393306  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
     |||||| || ||||| |||||||| || || |||||  | |||||||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||||  ||| ||| ||    
T  21393307 aggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgagtt 21393406  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||| | ||| |||||  ||| |||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | | ||| || ||  | |||||     
T  21393407 tctgaaaagtattaaagaggcacagaaagctgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatgat 21393506  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    ||||||||| |||| ||| |||     ||||||||||||||| |||| ||  ||||| |  ||||| | ||||| || ||||  || |||||||||||||    
T  21393507 caaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacgatgatgagatgaaggaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattc 21393606  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || | |||||||| || |||| ||||||| | |||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||    
T  21393607 atccaggagctacgaagatgtgtcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtatgcttgtttgatttg 21393706  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
     |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  21393707 ccagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 21393739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Original strand, 21787701 - 21788233
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||| ||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||  |||||||||    
T  21787701 aaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaa 21787800  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
     |||||| || ||||| |||||||| || || |||||  | |||||||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||||  ||| ||| ||    
T  21787801 aggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgagtt 21787900  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||| | ||| |||||  ||| |||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | | ||| || ||  | |||||     
T  21787901 tctgaaaagtattaaagaggcacagaaagctgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatgat 21788000  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    ||||||||| |||| ||| |||     ||||||||||||||| |||| ||  ||||| |  ||||| | ||||| || ||||  || |||||||||||||    
T  21788001 caaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacgatgatgagatgaaggaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattc 21788100  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || | |||||||| || |||| ||||||| | |||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||    
T  21788101 atccaggagctacgaagatgtgtcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtatgcttgtttgatttg 21788200  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
     |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  21788201 ccagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 21788233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 507 - 659
Target Start/End: Original strand, 22061245 - 22061397
Alignment:
Q  507 cgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaag 606  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||     
T  22061245 cgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtttaaggttgaacatcagaagcctgcagggttattgacaccgttggatgtaccggagtggaaa 22061344  T
Q  607 tgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagg 659  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  22061345 tgggatagcatttctatggattttgtgatgagtttaccaaacactacgagagg 22061397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 637
Target Start/End: Original strand, 22247778 - 22248359
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||                  
T  22247778 gattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgc-------------- 22247863  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
      | ||| ||||| ||||||||||| || |||||| | ||  |  || ||||| |||| |||||| || | || ||||| |||||  ||||||| |||||    
T  22247864 --tatgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtcggcaaattgtcacctcagagtgtgaagctaggaatgctaaagattgatagtgaattctt 22247961  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| ||||||| |||||  ||  || ||||||||||||||||||| ||  || || ||||||||||  | ||  ||||||| || ||  | ||||| ||     
T  22247962 gaacagtatcaaagaagtgcagaaaattgatgttaagtttgtggacttgttgattgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcag 22248061  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    || |||||||||||   || || ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||| ||||||||     
T  22248062 ggagtgttgagattccaaggcagaatttgtattcctgacattgacgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgtgtattcatc 22248161  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  22248162 cgggagctacgaggatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtca 22248261  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacga 637  Q
     ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  22248262 aaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgataacacctttagatgtaccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacga 22248359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 21043911 - 21043280
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | ||||||||||| ||  | || || ||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  21043911 aggcagcgtagatggctcgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctctgagtaggaaga 21043812  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||| ||||| ||  ||||||| |  ||||| || ||||| |||||||| || ||  ||||  | |||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  21043811 ccttgcatatgtctgctatgatggtgaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatctgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagct 21043712  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
     || ||| |||||||  ||| ||| ||  |||| ||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||  |     
T  21043711 aggaatgatgaagattgataatgaatttctgaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgcaagtaatcagact 21043612  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  | ||||| || ||  | ||||| ||| | ||| |||| ||| |||  |  ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||    
T  21043611 gaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaagagtgctgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaag 21043512  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | || ||||  || ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  21043511 agagccatagaagtaacttgagtattcatccgagagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtccggattgaaatgcgacgttgc 21043412  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | ||||||  ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||  || |     | || |||||||| |||||||| |||    
T  21043411 acaatttgtgtattcttgtttggtttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgacggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgg 21043312  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  21043311 gatagtatatccatggattttgtgacgagttt 21043280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 569
Target Start/End: Original strand, 21921076 - 21921610
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  21921076 taaaatattatgattttgagttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacttttcacatgtctgccatgatggt 21921175  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgat 234  Q
    || ||||||  | ||||| ||| |||| || || |||| | | || ||||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||||||  |||  ||     
T  21921176 aaaggagttcaagttgcttgaatagttcagagatttgactttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctagttatgctgaagattgataacgaa 21921275  T
Q  235 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatg 334  Q
    ||  | || ||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  | |  || || ||  | ||||    
T  21921276 tttctaaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacaacgattttaaaatcgatg 21921375  T
Q  335 agcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtat 434  Q
    | ||||||||| |||| ||| |||  |  ||||||||||  ||| |||| ||  | |||||  ||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  21921376 atcaaggtgtgctgaggtttcgaggtaggatttgtattcaagacgatgatgagataaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtaacttgagtat 21921475  T
Q  435 tcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgact 534  Q
    |||| |||||||||| || ||||| || ||| | |||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | ||||||| |    
T  21921476 tcatccgggagctacgaagatgtaccacgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatt 21921575  T
Q  535 tgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  21921576 tgtcagaaatcaaaggttgagcatcagaaacctgc 21921610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Original strand, 20017587 - 20017852
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  20017587 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 20017686  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| | |||||||||||    
T  20017687 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgct 20017786  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtgga 284  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  20017787 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacaggaagttgatgtaaagtttgtgga 20017852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 569
Target Start/End: Original strand, 30312459 - 30313018
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  30312459 aggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaaga 30312558  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || || || |||||||| || || |||||| | || ||||||  |||| |||| |  ||| |  |    
T  30312559 cattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaact 30312658  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||  | ||| ||||||||||  |     
T  30312659 gggaatgctgaagattaatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacataaagttgatgtcaagtttgtagatttgttagttgctagtaatcagact 30312758  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  |  |||| || || || || || || ||||||||||||||  |||     ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||    
T  30312759 gaagacggtgactttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaag 30312858  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | || || ||||| ||||||||  | || || ||    
T  30312859 agagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaagagatgtggc 30312958  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
     || ||||| ||| | |||||   |||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  30312959 acagtttgtctattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgc 30313018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 23651482 - 23650954
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  23651482 taaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggt 23651383  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgat 234  Q
     |||||||| || ||| | ||||||||||| || |||||  | || ||||||  |||| |||| |||||| |  | || ||||||||| |  |||||||     
T  23651382 tagggagttcgagttgttggaacagtttagagatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactaggaatgctgaagcttgatagtgaa 23651283  T
Q  235 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatg 334  Q
    ||  |||| | ||| | |||||||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  |  |  | ||||| || ||| | ||||    
T  23651282 tttctgaaaaatattaaagaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactaaagacagtgattttaagatcgatg 23651183  T
Q  335 agcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtat 434  Q
    | ||| |||||||||| ||| |||  |  |||||||||   ||| |||||||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||    
T  23651182 atcaatgtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattttagacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtatcttgagtat 23651083  T
Q  435 tcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgact 534  Q
    ||||  ||||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | |||| || |    
T  23651082 tcatctgggagctacgaagatgtatcatgatctgaaaaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgttggatt 23650983  T
Q  535 tgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  23650982 tgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaa 23650954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 154 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 22988518 - 22988103
Alignment:
Q  154 gaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagag 253  Q
    ||||| ||||| || |||||| | || || ||| |||||||||| |||||  |||| || |||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||| | ||    
T  22988518 gaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcatctcagagtgtaaagttaggaatgctgaagattgatagtgaattcctgaagagtattaaag 22988419  T
Q  254 aagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatt 353  Q
    |||| ||  || ||||||||||||||||||| ||  || || ||||||||||  | ||  ||||||| || ||  | ||||| ||||| |||||||||||    
T  22988418 aagcgcataaaattgatgttaagtttgtggaattgttgatttctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagatt 22988319  T
Q  354 tagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaa 453  Q
      ||| || ||||| ||||||| || |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22988318 ccgaggcagaatttctattccttacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaa 22988219  T
Q  454 atgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttg 553  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||| || ||  | || || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  22988218 atgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatatggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttg 22988119  T
Q  554 aacatcagaagcctgc 569  Q
    | |||||||| |||||    
T  22988118 agcatcagaaacctgc 22988103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 21252380 - 21251848
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  |    
T  21252380 gattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaag 21252281  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    |||| || ||||| |||||||| || || |||||  | |||||||||||||||||| |||||||  || | || |||||||||||  ||| ||| ||       
T  21252280 agttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtaaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttca 21252181  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| ||||| | ||| |||||  |||  ||||||||||||||||| ||  |||||  |||  ||||  | ||  | ||||| || ||  | ||||| |||    
T  21252180 gaaaagtattaaagaggcacagaaagccgatgttaagtttgtggacttgttggttgttagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaa 21252081  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    |||||| |||| ||| |||     ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| || || |  || ||| |||||||||||     
T  21252080 ggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccacagaagtaacctgagtattcatc 21251981  T
Q  440 cgggagct---acaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    ||||||||   || || |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||  | || ||||| ||| | ||||||| |||    
T  21251980 cgggagctacgacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttacacagtttgtatattcttgtttgatttg 21251881  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  21251880 tcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 21251848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 22041325 - 22040675
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22041325 aggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagccaatgttgttgcggatgccttgagcaggaaga 22041226  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| |  |    
T  22041225 cattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacagttcagtgatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaact 22041126  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| || ||||||||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  ||    
T  22041125 gggaatcctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagacg 22041026  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  |   ||| || || || ||||| || ||||||||||||||  |||     ||||| ||||||||| ||| | |  |||||||  ||||| | ||||    
T  22041025 gaagacgatgactttaaagtcgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcaaatatgaagaaaatgattcttgaag 22040926  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | |||||||||||||   |||||||| || |||||||| ||||| |||||| | || || ||||| || ||||| || || || ||    
T  22040925 agagtcatagaagtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgtggc 22040826  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | |||||   |||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||| ||  ||     | | || ||||||||||| ||||| |||    
T  22040825 acagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaatctgctggtatgatggtatctttagatgtgccggaatggaaatgg 22040726  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  22040725 gatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 22040675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 474
Target Start/End: Original strand, 22119498 - 22119953
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |    
T  22119498 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatggcttgagtaggaagacgttgcata 22119597  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  22119598 tgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaaagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 22119697  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||| ||   ||||||||| |||||||| |||||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  22119698 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcgcagagagttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 22119797  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||| ||||||||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||| ||||| | ||| | |||||||    
T  22119798 gattttaaaatcgatgatcaaggtatgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagatattaagaagatgattcttgaatagagtcata 22119897  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaag 474  Q
      ||   ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  22119898 gaagttgcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaag 22119953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 21324584 - 21324797
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  21324584 aggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaa 21324683  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | |||||  |||| | ||||||||| |  || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||| || || |||| |||||  ||||    
T  21324684 cgttgcatgtgtctg-cttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtttagtt 21324782  T
Q  210 gggtatgctgaagat 224  Q
    ||| |||||||||||    
T  21324783 ggggatgctgaagat 21324797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 15534840 - 15534392
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15534840 agatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatgatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcaca 15534741  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| || |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || |||||| | || || |||  |||| |||| |  ||| |  |||| |||||    
T  15534740 tgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacaatttagagatttgagtttggtttgcgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgct 15534641  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||| |||||  |||| ||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  |  ||    
T  15534640 gaagattgatagtgaatttctgaagagtattatagaggcacagaaagtagatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggt 15534541  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || || || ||||| || ||||||||||||||  |||     ||||| |||| |||  ||| |||| | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  15534540 gactttaaagtcgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcatgatgatgcagaaataaagaagatgattcttgaagagagtcata 15534441  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgattt 467  Q
      || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||    
T  15534440 gaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgattt 15534392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23886463 - 23886212
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||| ||| ||||| | |    
T  23886463 aaagattatgattttgggttgaattatcatcctggtaaaactaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacacatgtccgccatgatgatca 23886364  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      ||||| ||  |||| ||||| ||||| || |||||| | || |||||| ||||| |||| |||||| |||| || |||||||||||  ||||||| ||    
T  23886363 aagagttggagctgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtgaatt 23886264  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggattta 288  Q
      |||||||||| | ||| || ||  |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  23886263 tctgaatagtattaaagaggcgcatgaagtggatgtaaagtttgtagattta 23886212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 366 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 23950029 - 23949754
Alignment:
Q  366 ttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgat 465  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||| | ||||| ||||| |  || | ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  23950029 ttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagacgattcttgaagagagtcacataagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgat 23949930  T
Q  466 ttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagc 565  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || |||||  | || || || || ||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || || || |||||||| |    
T  23949929 ttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaaagtgatgtggcacagtttgtatattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagtcgagcatcagaaac 23949830  T
Q  566 ctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
     ||| ||||||   | | | || ||||||||  ||||||| |||||||  || || ||||||||| |||| |||||    
T  23949829 ttgctgggttgatgatatctttagatgtgccaaagtggaaatgggataatatatccatggattttgtgacaagttt 23949754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 32601610 - 32601051
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  32601610 aggcagcgtagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaatcatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaaga 32601511  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || || || ||||| || || || |||||| | || ||||||  |||| |||| |  ||| |  |    
T  32601510 cattgcatatgtccgctttgatggttatagagttcgagttacttgaacaattcagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaact 32601411  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| ||  | || ||||| | ||| |||||| |||||||||| |||| ||| |||||  ||||| ||||||||||  |     
T  32601410 gggaatgctgaagattgatagtgaatttctaaaaagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtcaagtatgtagatttgttggttgctagtaatcagact 32601311  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  |  |||| || || || ||||| || ||||||||||||||  |||     ||||||||||| ||| ||| |||  ||||| |  ||||| | ||||    
T  32601310 gaagacggtgactttaaagtcgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgtattcccgacgatgcagagatgaaggaaatgattcttgaag 32601211  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||| | || ||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  32601210 agagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatataaataagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 32601111  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
      | ||||||||| | || ||   |||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  32601110 aaagtttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacctgc 32601051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 641
Target Start/End: Original strand, 16407539 - 16407992
Alignment:
Q  189 gtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggattta 288  Q
    ||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| || ||     
T  16407539 gtcatctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattaatagtgaatttctgaagagtattaaagaagcacaaaaagttgatgtcaagtttgtagacttg 16407638  T
Q  289 atggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaat 388  Q
     ||||| ||||||||||  | ||  || |||| || || || ||||| || ||||||||||||||  |||     ||||| ||||||||| |||||||      
T  16407639 ttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgaagaga 16407738  T
Q  389 tgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtc 488  Q
    |||| ||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || | |||    
T  16407739 tgaataaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccaggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtagtc 16407838  T
Q  489 cgg-tttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgtt 587  Q
     || |||||| || || |  || || ||||||||| | | |||   |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||  ||     | ||||    
T  16407839 tggatttgaaacgagatgcggcacagtttgtgtattcctatttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatcgtt 16407938  T
Q  588 ggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  16407939 agacgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagttt 16407992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 569
Target Start/End: Original strand, 22132386 - 22132915
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || |    
T  22132386 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgatgttatagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttcatggttagag 22132485  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    ||||||| || || ||||  || || || |||||| | || ||||||  |||| || | |  ||| |  |||| |||||||||||  ||||||| ||  |    
T  22132486 agtttgagttacttgaaccattcagagatttgagtttagtctgtgaatggtcaccttagaaagtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttct 22132585  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| ||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  |  |||| || || || || || ||     
T  22132586 gaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgacgatcac 22132685  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    ||||||||||||||  |||     ||||| ||||| ||| ||| |||  |||||||  ||||| | || || ||||||   || | |||||||||||||     
T  22132686 ggtgtgttgagattctgaggtcggatttgcattcccgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcattgaagtagcttgagtattcatc 22132785  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||| || | || ||   ||||||    
T  22132786 cgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgaattcctgcttagtttgtca 22132885  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  22132886 gaagtcaaagattgagcatcagaaacctgc 22132915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 427 - 468
Target Start/End: Original strand, 22623596 - 22623637
Alignment:
Q  427 ttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttg 468  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22623596 ttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttg 22623637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Original strand, 16876982 - 16877030
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16876982 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 16877030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 122
Target Start/End: Original strand, 22623399 - 22623463
Alignment:
Q  58 aattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtc 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||    
T  22623399 aattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtc 22623463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 514 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 22283966 - 22283916
Alignment:
Q  514 tttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaag 564  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22283966 tttgtgtatgcttgtttgatctgtcagaagtctaagattgaacatcagaag 22283916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 514 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 25283092 - 25283042
Alignment:
Q  514 tttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaag 564  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25283092 tttgtgtatgcttgtttggtttgtcagaagtctaagattgaacatcagaag 25283042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 514 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 25283318 - 25283268
Alignment:
Q  514 tttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaag 564  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25283318 tttgtgtatgcttgtttggtttgtcagaagtctaagattgaacatcagaag 25283268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19869152 - 19869044
Alignment:
Q  17 ggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgca 116  Q
    |||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||   ||| ||| ||||| || || || |||||||| || ||||| |||||||||||| | |||||    
T  19869152 ggagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccagggaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagtccttgca 19869053  T
Q  117 catgtcggc 125  Q
    |||||||||    
T  19869052 catgtcggc 19869044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 630
Target Start/End: Original strand, 22366561 - 22366600
Alignment:
Q  591 tgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22366561 tgtgccggagtggaagtgggatagtatttcgatggatttt 22366600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22435742 - 22435645
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    ||||||| |||||||   |||| ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  22435742 aaagattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgcagatgctttgagtagaaaaactttgcatatgtctgctttgatggt 22435645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 563
Target Start/End: Original strand, 12274441 - 12274557
Alignment:
Q  447 tacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtct 546  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || ||||||||| | |||||   ||||||||||||     
T  12274441 tacaaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcg 12274540  T
Q  547 aaggttgaacatcagaa 563  Q
    || || || ||||||||    
T  12274541 aaagtcgagcatcagaa 12274557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 641
Target Start/End: Original strand, 21166432 - 21166484
Alignment:
Q  589 gatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  || || ||||||||| ||||||||||    
T  21166432 gatgtgccagagtggaagtgggataatatatccatggattttgtgacgagttt 21166484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Original strand, 21850224 - 21850272
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21850224 accgttgtttgtgccatagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 21850272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 666
Target Start/End: Original strand, 51055 - 51711
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||| | ||| ||||||||||  |||||||    
T  51055 aggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaaga 51154  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | || || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| ||||| |||| ||| | |||||    
T  51155 ccttacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagtt 51254  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||| |||  || |||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||    |     
T  51255 ggggatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaacaagtggatgtgaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcacc 51354  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51355 gaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaag 51454  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||    
T  51455 aaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacgtcgc 51554  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  51555 tcgttttgtatatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgg 51654  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51655 gatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgat 51711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 666
Target Start/End: Original strand, 60089 - 60745
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||| | ||| ||||||||||  |||||||    
T  60089 aggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaaga 60188  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | || || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| ||||| |||| ||| | |||||    
T  60189 ccttacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagtt 60288  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||| |||  || |||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||    |     
T  60289 ggggatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaacaagtggatgtgaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcacc 60388  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  60389 gaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaag 60488  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||    
T  60489 aaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacgtcgc 60588  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  60589 tcgttttgtatatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgg 60688  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  60689 gatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgat 60745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 666
Target Start/End: Original strand, 66477 - 67133
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||| | ||| ||||||||||  |||||||    
T  66477 aggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaaga 66576  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | || || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| ||||| |||| ||| | |||||    
T  66577 ccttacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagtt 66676  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||| |||  || |||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||    |     
T  66677 ggggatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaacaagtggatgtgaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcacc 66776  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  66777 gaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaag 66876  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||    
T  66877 aaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacgtcgc 66976  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  66977 tcgttttgtatatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgg 67076  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  67077 gatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgat 67133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28055 - 27722
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||| || ||||    
T  28055 aggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgtggttgtagatgctctgagcag-aaga 27957  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||| | ||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| || |||||||  ||||||||||| || || ||  ||||| || | ||||| |||||    
T  27956 cgttggatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttaaagacttgagtcttgtttgcgagttgtcaccttagagtgtacagtt 27857  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| || ||||| |  |     
T  27856 gggtatgttgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgacact 27757  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgt 344  Q
    ||  ||| ||| |||||||||||||| || |||||    
T  27756 gaagataatgacttcaaggttgatgatcagggtgt 27722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 363 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 26478 - 26389
Alignment:
Q  363 aatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaa 452  Q
    ||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26478 aatttgtattcctgataacgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaa 26389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Original strand, 49384 - 50045
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49384 acatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcattcgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtag 49483  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||| | || ||||||    
T  49484 gaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 49583  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  49584 cagttgggtatgtagaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatg 49683  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  || |||  || |||||| |||||||| || || ||  |||| | |||||||||    
T  49684 aagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagatgcagaatttgcattcctgataacgatgagatgaaaaggttgatttt 49783  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||     
T  49784 ggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgat 49883  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  49884 gttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtgga 49983  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  49984 aatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacataatactccgagaggacatgat 50045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 44573 - 43954
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  44573 agatggcttgaattgttaaaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcata 44474  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  ||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||  ||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  44473 tgtccgctatgatggttagagagttcgagttactcgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 44374  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |   ||||| ||||| | ||  | ||  | |||    
T  44373 gaagattgatagtgagttcctgaagagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtggact---tggttgctagtgaccagactgaagacagt 44277  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| |    
T  44276 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgagagagaatttgtattacagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcaca 44177  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  44176 gaagtagcttgagtattcactcgggagctacgaagatgtatcacgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 44077  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||  ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||     
T  44076 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtata 43977  T
Q  619 tctatggattttatgacgagttt 641  Q
    || ||||||||| ||||||||||    
T  43976 tcaatggattttgtgacgagttt 43954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 9878 - 9274
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  9878 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctagtgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 9779  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| ||||| || |||||||| || ||  ||||| | || || |||  |||| || | |||||| |  | ||||||||||||||  ||||||| ||    
T  9778 gagagttcgaattacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctgagagtgtgaaactaggtatgctgaagattgatagtgaatt 9679  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||| |||   | ||  | | ||| || ||  | |||||     
T  9678 tctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcggactgaagacaatgatttgaaaatcgatgat 9579  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    ||||||||| |||||||  |||  | |||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| | ||| | ||||||||| |    
T  9578 caaggtgtggtgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtatcc 9479  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || ||||||||| | ||| |   |||    
T  9478 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtctagtttg 9379  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    ||||||||| || || || |||||||| ||||| ||  ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||| |||||    
T  9378 tcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacg 9279  T
Q  637 agttt 641  Q
    |||||    
T  9278 agttt 9274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 16340 - 15855
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||  |  ||||||| |    
T  16340 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagttggaagacattgcatatgtcttctatgatggtca 16241  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtg-att 235  Q
    | ||||| ||||| || |||||||| || ||   |||| | || || |||  |||| || | |||||| |  | ||||||||||||||  |||||| |||    
T  16240 gagagttcgaattacttgaacagttcagagataagagtttggtttgcgaatggtcacctgagagtgtgaaactaggtatgctgaagattgatagtgaatt 16141  T
Q  236 tcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatga 335  Q
    |||| || |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  |||   | ||  | | ||| || ||  | |||||    
T  16140 tctt-aaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcggactgaagacaatgattttaaaatcgatga 16042  T
Q  336 gcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtatt 435  Q
     ||||||||| |||||||  |||  | |||||||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| | ||| | |||||||||     
T  16041 tcaaggtgtggtgagattccgaggaagaatttgtattccagacaataaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtatc 15942  T
Q  436 cattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtat 522  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||||||    
T  15941 catccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtat 15855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 237 - 482
Target Start/End: Original strand, 718 - 963
Alignment:
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||  | ||  | ||||| || ||  | |||||     
T  718 cttgaaaagtattaaagaagcacaaaaagttgatgtcaagtttgtggccttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgat 817  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || ||||| ||||| ||| |||  | |||||||||||  ||| |||||||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| || || | |||||||||||    
T  818 catggtgtattgaggtttcgaggtagaatttgtattctagacgatgaagagataaagaagatgattctggaagagagtcacaaaagtagcttgagtattc 917  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttg 482  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  918 atccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttg 963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 626
Target Start/End: Original strand, 106020 - 106064
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  106020 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggaaagcatttctatgga 106064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 643
Target Start/End: Original strand, 10927 - 11565
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10927 acatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtag 11026  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||||||||| ||   ||||||||  || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  || || |||| |||||     
T  11027 gaagacgttgcacatgtctgctacgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtt 11126  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||     
T  11127 cagttgggaatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtattcgagaagcgcagcaagtagatgtgaagtttgttgatttgatggttgctggtaatg 11226  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | ||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  | |||||| |||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||    
T  11227 aaactgaagatagtgactttaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattcaaaggaagaatttgcattcctgataatgatgatgtgaaaaagttgatttt 11326  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || ||||| || ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  11327 ggaggaaagccacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgat 11426  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11427 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 11526  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttac 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11527 agtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttac 11565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 643
Target Start/End: Original strand, 14697 - 15335
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14697 acatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtag 14796  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||||||||| ||   ||||||||  || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  || || |||| |||||     
T  14797 gaagacgttgcacatgtctgctaagatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtt 14896  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||     
T  14897 cagttgggaatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtattcgagaagcgcagcaagtagatgtgaagtttgttgatttgatggttgctggtaatg 14996  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | ||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  | |||||| |||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||    
T  14997 aaactgaagatagtgactttaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattcaaaggaagaatttgcattcctgataatgatgatgtgaaaaagttgatttt 15096  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || ||||| || ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  15097 ggaggaaagccacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgat 15196  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15197 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 15296  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttac 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15297 agtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttac 15335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 21419 - 20758
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || || ||  || ||||| |||| |     
T  21419 acatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatttggggaaagccaacgtggtgtcaaatgcgatgagcaa 21320  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    || ||| ||||| ||||| ||  ||||||| |  || ||||| ||||| || |  ||||| || |||||||| || |||||  || || |||| |||||     
T  21319 gaggacgttgcatatgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgctagagccatttagagaattgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtt 21220  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||     
T  21219 cagttgggaatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatg 21120  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    ||   ||  ||||||| ||||||||| |||| || ||| | ||||  || | ||  |  |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  21119 aaattgaagatagtgacttcaaggttaatgatcagggtatattgaagttcacaggaaggatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgatttt 21020  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| || ||     
T  21019 agaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggttgtctgggttgaaacgtgat 20920  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  20919 gttgctcagttggtgtatgcgtgttagacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctacagggttgatgacaccgttggatgtgccggagtgga 20820  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20819 agtgggacaacatttctatggattttatgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgat 20758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 13 - 667
Target Start/End: Original strand, 2233 - 2887
Alignment:
Q  13 cagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 112  Q
    |||||||||||| | ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || |    
T  2233 cagaggagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgcgtaggaaaacgt 2332  T
Q  113 tgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttggg 212  Q
    |||| |||||  |  |||||||||  || || || ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||  || || |||| ||||| ||||||||    
T  2333 tgcatatgtctactatgatggtaaaagaattcgatttgctagagcaatttagagacttgagtcttgtgtgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 2432  T
Q  213 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggag 312  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  | ||||| || | |||    
T  2433 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaacagtatccgagaagcgcaacaagtagatgtgaagtttgttgatttaatggttgttggtaatgaaacagag 2532  T
Q  313 aatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaa 412  Q
     ||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || || ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2533 gatagtgacttcaaggtcgatgatcagggtgtgttaaggttcagaggaaggatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaa 2632  T
Q  413 gtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctca 512  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2633 gtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctca 2732  T
Q  513 ttttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggat 612  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2733 tttcgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacataagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaagtgggat 2832  T
Q  613 agcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||    
T  2833 agtatttctatgaattttgtgacgagtatagcaaacactccaagagggcacgatg 2887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 8496 - 7834
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||    
T  8496 acatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgtcttgaatag 8397  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||| |||||  | || ||||| |  || || || ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| || || |||| |||||     
T  8396 gaagacgttgcatatgtctactttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtt 8297  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||      
T  8296 cagttggggatgctgaagattaacagtgacttcttgaatagtattcgagaagcgcagcatgtagatgtgaagtttgttgatttgatggttactggtaagg 8197  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | |||||  ||||||||  |||| |  ||||| ||||| |||||    
T  8196 gcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaagaattttcattcctgatgatgatggtttgaaaaagttaatttt 8097  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| || ||||| ||||| | |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  8096 agaggagagtcacaagagtagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaataagttgttttggtggtccagtttgaagcgtgac 7997  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7996 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttatcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 7897  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7896 agtgggatagcatttctctggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatg 7834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 194574 - 195236
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||   ||||| ||||||||    
T  194574 acatgaggcagaggagatggttggaggtgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttattgatgccttgagtag 194673  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  || ||||| ||||| ||  |||||||  |||||||||| || || ||| || || |||  |||||     
T  194674 gaagacgttgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagagtagtttagatacttgagtcttgtttgcgaattgacacctctgagtgta 194773  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||     
T  194774 cagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtattcgagaagcacaacaagtggatgtgaagtttgttgatttaatggttgttggtaatg 194873  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||  |||| || ||||| ||||| |||||    
T  194874 gcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcctgatgatgatgatttgaaaaagttaatttt 194973  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  194974 agaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcacgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgac 195073  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  195074 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctacagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 195173  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  195174 agttggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactctgagagggcatgatg 195236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 150005 - 149345
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  150005 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagc-aatgtggttgcagatgcgttgagcag 149907  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||| | ||||| || |||||||| |  || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  || || |||| |||||     
T  149906 gaagacattgaatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtt 149807  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||| || |||||     
T  149806 cagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaactagtggatgtcaagtttgtggacttgatggttgctggtaatg 149707  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | ||| | ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |    
T  149706 aaactgaggaaagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaaaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattct 149607  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || |||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||     
T  149606 ggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgat 149507  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |    
T  149506 gttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaatgttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgctggagtgta 149407  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  149406 attgggacagcatttctatggattttgtgacgagtttactgaacactccgagagggcatgat 149345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 641
Target Start/End: Original strand, 25439 - 26039
Alignment:
Q  41 attatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggga 140  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  ||    
T  25439 attatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccctaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaaga 25538  T
Q  141 gtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttg 240  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || |||||| | || || ||||||||| |||| |||||| |  | || ||||| |||||  ||||||| ||| ||    
T  25539 gtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaaatgtcacctcagagtgtgaaacttggaatgctaaagattgatagtgaattcctg 25638  T
Q  241 aatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaag 340  Q
    || ||||| | | |||| ||  || ||||||||||||||||||| ||  || || ||||||||||  | ||  |||| || || ||  | |||||  | |    
T  25639 aacagtattaaaaaagcgcagaaaattgatgttaagtttgtggacttgttgattgctagtaatcagactgaagatagcgattttaaaatcgatgattagg 25738  T
Q  341 gtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattc 440  Q
    | |||||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||  |    
T  25739 gagtgttgcgttttcgagggagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcaccc 25838  T
Q  441 gggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcag 540  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| | ||| || || || ||||||||| | ||||||| ||||||     
T  25839 gggagctacgaagatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacacgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcaa 25938  T
Q  541 aagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtt 640  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | ||||||||||   ||||| || ||||| || |||||||| ||| ||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  25939 aagtcaaaagttgagcatcagaaacttgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtggaaatggcatagcatatccatggattttgtgacgagtt 26038  T
Q  641 t 641  Q
    |    
T  26039 t 26039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 180783 - 180739
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  180783 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggataacatttctatgga 180739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 42353 - 41692
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42353 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtag 42254  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| ||  |||| ||||| || || ||||| |  || || || ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| || || |||| ||| |     
T  42253 gaaaacgctgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtata 42154  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| || ||||| || |||||     
T  42153 cagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcagcaagtggatgtgaagtttgttgatatattggttgctggtaatg 42054  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
         ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||  | ||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||    
T  42053 gcatagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtccagaggaagaatttgtattcctaataatgacgagttgaaaaagttgatttt 41954  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  41953 agaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgac 41854  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  41853 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatatgccggagtgga 41754  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41753 agtgggatagcatttctatggatttcgtgacgagtttacctaacactccgagagggcatgat 41692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 324140 - 323478
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  324140 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtag 324041  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||| |   | ||||| ||| | || |||||||| |||||||| || || |||||| || || |||| |||||     
T  324040 gaagacgttgcacatgtctgctttaatggtgaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgacacctcagagtgtt 323941  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||| || |||||     
T  323940 cagttggggatgctgaagattaacaatgatttcttgaagagtatccgagaagcacaacaagtgggtgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatg 323841  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
         ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  | |||||| |||| |||  |||| || ||||| ||||| |||||    
T  323840 gcaatgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcttgatgatgatgatttgaaaaagttaatttt 323741  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  323740 ggaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgac 323641  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  323640 gtcactcattttgtgtacgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaaaagcttgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 323541  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  323540 agtgggataacatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatg 323478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 43 - 666
Target Start/End: Original strand, 202376 - 202999
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |  ||||    
T  202376 tatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagcaaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatggttaaagagt 202475  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||  ||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  202476 ttgagttgcttgaacattttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaa 202575  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggt 342  Q
     | ||| | |||||  ||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||  |||||| | ||  || |||| |||||||||||||| ||||||    
T  202576 caatattaaagaagtgcagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctaaaaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcaaggt 202675  T
Q  343 gtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgg 442  Q
    |||||||||||  | |  | ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||||||  ||    
T  202676 gtgttgagattccgcggtagaatttgtattcctgataatgatgagttaaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatcagg 202775  T
Q  443 gagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaa 542  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||  || || ||  | || || || ||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  202776 gagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccgcattcaaacgtaatgttgcacagtttgtatatgaatgtttgatttgtcagaa 202875  T
Q  543 gtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttta 642  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||| | || ||||||    
T  202876 atctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacatcgttagatgtgccggagtggaaataggatagcatatccatggattttgtaacaagttta 202975  T
Q  643 caaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    |  || ||||||||||||||||||    
T  202976 ccgaatactccgagagggcatgat 202999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 547 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 118462 - 118342
Alignment:
Q  547 aaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaa 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  118462 aaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggattttatttctatggattttgtgacgagtttaccta 118363  T
Q  647 acactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  118362 acactccgagagggcatgatg 118342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 118630 - 118463
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||  | || ||||| |   ||||| | |    
T  118630 aaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgttatgatgatca 118531  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
      ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||| |||||||||||| ||||    
T  118530 aagagttggagctgctcgaacagtttagagacttgagttttatttgtgaattgtcatctcaaaatgtg 118463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 666
Target Start/End: Original strand, 5211 - 5866
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5211 aggcagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttggattaccatcttggtaaagccaatgtagttgcggatgcgttgaggaggaaga 5310  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | || || ||||| || | ||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||| | |||||    
T  5311 ccttacatatgtctgcgtagatggtatgagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagtt 5410  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    ||| | || |     
T  5411 ggggatgctgaagattaacagtaatttcttgaatagtatccgagaagcgcagcaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgtatgtagtgaaaca 5510  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
     || ||||||| ||||| ||||||||  | || || |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5511 caggatagtgacttcaaagttgatgattagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaag 5610  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||| ||    
T  5611 aaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccacgatttgaa-aagctattttggtggtccagtttgaaacgtgacgtagc 5709  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5710 tcagtttgtgtatgcatgtttgtcttgttagaagtctaaagttgaatatcagaagcctacagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgg 5809  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5810 gatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgat 5866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 6108 - 6770
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6108 acatgaggcagagaagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtag 6207  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| |  ||||| ||||| || || ||||| |  || ||| | ||| | || |||||||| ||||| || || || |||||| || || |||  |||||     
T  6208 gaaaatgttgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattttatttgttagagcagtttagagacttaagccttgtatgtgaattgacacctctgagtgta 6307  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| | ||| ||||| || |||||||||||| || |||||     
T  6308 cagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaaagcaagtggctgtgaagttagttgatttaatggttgctggtaatg 6407  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||  |||| || ||||| ||||| |||||    
T  6408 gcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagatttagaggaagaatttgcattcctgatgatgatgatttgaaaaagttaatttt 6507  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  6508 agaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaagtgcatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgac 6607  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||    
T  6608 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgctggatgtaccggagtgga 6707  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  6708 agtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatg 6770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 5861 - 5204
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  5861 aggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagaaggaaga 5762  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||| ||||| |||||    
T  5761 cgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagtt 5662  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |     
T  5661 gggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaaaaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatggttactagtaatgaaact 5562  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  5561 gaagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagtcgattttggaag 5462  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    |||  || |  || | ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || || ||    
T  5461 aaatacacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaactgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgc 5362  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  5361 tcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccatagtggaagtgg 5262  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    || | ||| || ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  5261 gacaacatctccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatg 5204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 6649 - 5988
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  6649 acatgaggcagaggagatggcttgaggttttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcag 6550  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||||||| | || ||||  ||  |||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||  ||||  |||| ||  |     
T  6549 gaagacacttcatatgtatgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtcgcctcagagcata 6450  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| ||| || || |||||     
T  6449 cagttgggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtcaagctggttgatttgatgattgctggtaatg 6350  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6349 gcacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagagatagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaatttt 6250  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||     
T  6249 agaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctattttggtggtccagtttgaagcgagat 6150  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  6149 gtcgctcattttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 6050  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6049 aatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagaggacatgat 5988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 5 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 13636 - 12996
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13636 acatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtag 13537  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||||||||| ||   |||||| |  || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  || || || | |||||     
T  13536 gaagacgttgcacatgtctgctacgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacaccttagagtgta 13437  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| || |||||     
T  13436 cagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaactagtagatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatg 13337  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||||| || || || | ||| |||||    
T  13336 gcactgaggatagtgagtttaaggtggatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttcaaaaggttaatttt 13237  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcggga-gctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgct-ggtccggtttgaagcgcg 502  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  13236 agaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggaagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggttggtccggtttgaagcgtg 13137  T
Q  503 acgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtg 602  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13136 atgtcgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgtctgaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtg 13037  T
Q  603 gaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttac 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13036 gaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttac 12996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 6181 - 5524
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| ||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  6181 aggcagagaagatgacttgagttgctaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaa 6082  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||||||||  |   ||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || | |||  ||||| |||| ||||| |||||    
T  6081 cgttgcacatgtttgttatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgtcacctcagagtgtacagtt 5982  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || ||||| ||       
T  5981 gggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaatt 5882  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | ||||    
T  5881 gaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtatgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaag 5782  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| || || || ||    
T  5781 aaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgc 5682  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  5681 tcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagactggaagtgg 5582  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    || | |||||| ||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||||||||||    
T  5581 gacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaataatacgagagggcatgatg 5524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Original strand, 47909 - 48566
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  47909 aggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggtcgcagatgctttgagcaggaaga 48008  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||| |||||  ||||    
T  48009 cgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgttagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtatagtt 48108  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |     
T  48109 gggtatgttgaaaatcaatagtgatttcttgaacattatcagagaagcacagcaagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaact 48208  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  48209 gaagatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttggaag 48308  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    |||| |||| ||| | ||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  | ||||| |  || || ||    
T  48309 aaagccataggagtagcttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctaggttgaaacctgatgttgc 48408  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  48409 tcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtataaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatatgccagagtggaagtgg 48508  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    || | |||||| || |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  48509 gacaacatttccattgattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatg 48566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Original strand, 56717 - 57378
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |     
T  56717 acatgaggcagaggagatggttagagctgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaa 56816  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||||||  |||||||||| ||  ||||||||  |||   ||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||  ||||| |||| ||| |     
T  56817 gaagacgctgcacatgtctgctatgatggtataggaacatgatttgctagaacagtttagagagttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtata 56916  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||     
T  56917 cagttgggaatgctgagaattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgcaacaagtggatgtgaagtttgttgatttgatggttgttggtaatg 57016  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
         ||  ||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || || |  | |||||| ||||||||  ||||    ||||| ||||| |||||    
T  57017 gcattgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgaggttcaggggaagaatttgcattcctgatgatgacagtttgaaaaagttaatttt 57116  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  57117 agaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtgat 57216  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  57217 gtcgctcattttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 57316  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  57317 aatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagaggacatgat 57378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 43 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 27922 - 27298
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||  |||||||||  ||||    
T  27922 tatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgtttcacatgtctgctatgatggtaaaagagt 27823  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    ||||  | || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27822 ttgagctacttgaacaatttagagacttcagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaa 27723  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggt 342  Q
     |||||||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||  ||| ||||| |||||||| || |||    
T  27722 cagtatcagagaagcgcagaaaattgatgtcaagtttgtggatttaatggttgctagtaatcaaactgaaaatgatgacttcaatgttgatgatcagggt 27623  T
Q  343 gtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgg 442  Q
    |||||||| || ||||  | |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || | ||| ||||||||| |||    
T  27622 gtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgg 27523  T
Q  443 gagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaa 542  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27522 gagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaa 27423  T
Q  543 gtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttta 642  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27422 gtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacactgttagatgtgccagagtggaagtgggatagcatttccatggattttgtgacgagttta 27323  T
Q  643 caaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |  || ||||| |||||||||||||    
T  27322 ccgaatactccaagagggcatgatg 27298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 5 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 44219 - 43555
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||    
T  44219 acatgaggcagagaagatggttagagcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagtag 44120  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||  || || |||| |||||     
T  44119 gaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacattttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgtt 44020  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||| |||  | || |||||     
T  44019 cagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcagcaagtagatttgaagtttgttgatttgatgactgctggtaatg 43920  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |    
T  43919 acactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttaattct 43820  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||| ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  43819 agaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtacaatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacttgac 43720  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  43719 gtagctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcattagaagcctgcatggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 43620  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatgtc 669  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43619 agtgggacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgtc 43555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 10 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 11224 - 10565
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  11224 aggcagagaggatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 11125  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  ||||  |||| |||||||||||    
T  11124 cgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgcagtt 11025  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| ||| || |     
T  11024 gggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacataaagtttatgtaaagtttgttgatttaatggttgctagcaatgaaact 10925  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    || ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  |  ||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||    
T  10924 gaaaatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgcattcttgataatgatgatttgaaaaagttgattctagaag 10825  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| |  || | | | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||| || || || ||    
T  10824 aaagtcacagaagtagcctaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaactgttttggtggtctaggttgaaacgtgatgttgc 10725  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  10724 tcagtttgtttatgcatgtttgacttgttagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatatgccagagtggaagtgg 10625  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatgtc 669  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  || | |||||||||||||||||||    
T  10624 gatagcattttcatggattttgtgacgagtttaccgaatagtccgagagggcatgatgtc 10565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 13169 - 13831
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || || || |||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13169 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtggttgcagatgccttgagtag 13268  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| ||  |||| ||||  || || ||||| |  || || || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| || || || | |||||     
T  13269 gaaaacgctgcatatgtttgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacaatttagagacttgagccttgtctgtgaattgacaccttagagtgtt 13368  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  13369 cagttggggatgctgaaaattaaaagtaatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtgaagtttgttgatttaatggttgctagtaatg 13468  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||  | |||||| |||| |||  |||| || ||||| ||||| ||| |    
T  13469 gcactgaggatagtgacttcaaggttgatgaaaagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcttgatgatgatgatttgaaaaagttaattct 13568  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  13569 agaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgac 13668  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| || |||||||    
T  13669 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcaaggttgttgacaccgttggatgtaccagagtgga 13768  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13769 agtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatg 13831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Original strand, 80702 - 81363
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  80702 acatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcag 80801  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||||||| | || ||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||  |||   |||||||  |     
T  80802 gaagacactacatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtagcctcaaagaata 80901  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| | || ||||  ||| || || |||||     
T  80902 aagttgggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtcaagctggttgattcgatgattgctggtaatg 81001  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | ||| | ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  81002 aaacagaggacagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattct 81101  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  | |||    
T  81102 tgaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggcggtccggtttgaaatgtgac 81201  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  81202 gttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtgagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 81301  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  81302 aatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactacgagagggcatgat 81363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 261744 - 261083
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  261744 acatgaggtagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcag 261645  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||||||| |||| ||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||  |||| ||| |     
T  261644 gaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagggacatgagtctggtatgtgagttgtcgactcagagtata 261545  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| | || ||||| ||| || || |||||     
T  261544 cagttgggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcaaagcaagtggatgtcaagctggttgatttgatgattgctggtaatg 261445  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
         || ||||  || |||||||||||||| || || || |||||||| ||||  | ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  261444 gcaaagaaaataaagacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtgttcttgacaatgaagaattgaaaaagttaatttt 261345  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  261344 agaagaaggtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgac 261245  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||    
T  261244 gttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacgccgttggatgtaccggagtgga 261145  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  261144 aatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactctgagaggacatgat 261083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 569
Target Start/End: Original strand, 277717 - 278264
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  277717 tggctcgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 277816  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    | ||  ||||||| || ||||| || || || ||||||||||| ||| ||||| | || |||||   |||| |||| |||||  |  |||| ||||| ||    
T  277817 ccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagtttagagacatgagtttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtaaaactgggaatgcttaa 277916  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    |||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||| |||||  |||||||||| ||  |||| || |   ||||| ||||||||||  | ||  || ||||     
T  277917 gattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaaaattgtagactctttggttgctagtaatcagactgaagatggtgac 278016  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||  |||||||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  |    
T  278017 tttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggccgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaa 278116  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgta 521  Q
    | |  |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||    
T  278117 gtaggttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacaatttgtgta 278216  T
Q  522 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  278217 ttcatgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgc 278264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 113995 - 113334
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  113995 acatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaacgccaatgtagttgcagatgctttgagtag 113896  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||| ||||| | || ||||||    
T  113895 gaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgtgaattgtcaccccagagtgtg 113796  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  113795 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagcttgtggatttaatggttaatagtaatc 113696  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || | ||  ||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||  ||| || ||||||||||| |||||| || ||  |||| | | |||||||    
T  113695 aaactgaagatagtgattgcaaggttgatgaacacggtgtgttgagattcggaggcagaatttgtattcttgacaacgatgagatgaaaaggctgatttt 113596  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||||||||| ||||  | ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||     
T  113595 ggaagaaagtcacaagaatagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaagaagctattttggtggtctagtttgaagcgtgat 113496  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  113495 gttgcttagtttgtgtatgcatgtttaacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtgga 113396  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  113395 aatgggatagtatttctatggatttcgtgacgagtctaccaaacactccgagaggacatgat 113334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 178 - 643
Target Start/End: Original strand, 95045 - 95510
Alignment:
Q  178 gtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagt 277  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  95045 gtgtgtgaattgtcatcgcaaagtgtacagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagcatcagagaagcacaacaagttgacatcaagt 95144  T
Q  278 ttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctga 377  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |||| ||    
T  95145 ttgtggatttaatggttgatagtaatcaagctgaagatggtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtattgagatttagaggtagaatttgtgttcccga 95244  T
Q  378 caatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctg 477  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  95245 caatgaagaattaaagaagttaattttagaagaaagtcataagagcaatttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttg 95344  T
Q  478 ttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgt 577  Q
    ||||| ||||| |||||||||   || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  95345 ttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgt 95444  T
Q  578 ctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttac 643  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  95445 tgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggatttcgtgacaagtttac 95510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 563
Target Start/End: Original strand, 108711 - 109239
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||    
T  108711 taaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgctatgatggt 108810  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgat 234  Q
     || ||||| || || || |||||||| || ||  ||||| | || || |||  |||| |||| || ||| |  ||||||||||||||||  |||||||     
T  108811 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaa 108910  T
Q  235 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatg 334  Q
    ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | ||||| || ||  | ||||    
T  108911 tttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatg 109010  T
Q  335 agcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtat 434  Q
    | |||||||||||||||||  |||  | ||||| |||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||    
T  109011 atcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttatattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtat 109110  T
Q  435 tcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgact 534  Q
    |||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || ||||||||| | |||||   |    
T  109111 tcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtt 109210  T
Q  535 tgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||    
T  109211 tgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaa 109239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 40 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 250014 - 249387
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||| | ||    
T  250014 gattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacattacatatgtctgctttgatggtgaagg 249915  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||  || || |||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||| |||||||||    
T  249914 aatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttgcggatgctgaagattaataatgatttctt 249815  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    |||||| ||| ||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||  ||  |||| ||||| |  | ||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  249814 gaatagcatccgagaagctcagcaagtggatttgaagtttgttgatttggtgactactggtaatgacactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcag 249715  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    |||||  |||| || ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||      
T  249714 ggtgttctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaaaaaagtcacaagagtagtttgagtattcacc 249615  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  249614 cgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtagctcattttgtatatgcatgcttgacttgtca 249515  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  249514 gaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcatggttgttgacaccgttggatgtaccggagtcgaagtgggacagtatttctatggatttcgtgacgagt 249415  T
Q  640 ttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  249414 ttaccaaacactccgagagggcatgatg 249387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Original strand, 848 - 1504
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  848 aggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccattcggttaaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaaga 947  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||||| ||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  ||  | |||| ||||| |||||    
T  948 cgttgcacaagtctgctatgatggtaaatgactttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgaaacctcagagtgtacagtt 1047  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  |  |    
T  1048 gggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagccgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatggactg 1147  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
     ||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  1148 aaga-tagtgatttcaaggttgatgatcaaggagtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgagttgaaaatgttgattttagaag 1246  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    ||||||| |  || | ||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || ||||| || || || ||    
T  1247 aaagtcacagaagtagcttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgc 1346  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  1347 tcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaagtgg 1446  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  1447 gatagcatttccatggattttatgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatg 1504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 29488 - 28831
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  29488 aggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 29389  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||| || |||||||| || |||| ||| || |||||  ||||| |||| ||||| |||||    
T  29388 cgttgcacatgtctgctatgatggtaaagaagtttgagttgctagagcagtttagagagttgattcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagtt 29289  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |     
T  29288 gggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaataatatcagagaagcacagcaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatggttactagtaatgaaact 29189  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||  |||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  29188 gaagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaattttcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttggaag 29089  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    |||| || |  || | ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || ||||| || || || ||    
T  29088 aaagccacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgc 28989  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  28988 ttagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagaattagaagcctgcagggttgttaacactgttagatgtgccagagtggaagtgg 28889  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    || | |||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||| |||||||||||||    
T  28888 gacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccaagagggcatgatg 28831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 30351 - 29823
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||    
T  30351 taaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgtttttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtctgctatgatggt 30252  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgat 234  Q
    || |||||| || ||| | |||||||| || || |||||| | || ||||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||||  |||  ||     
T  30251 aaaggagttcgagttggttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataacgaa 30152  T
Q  235 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatg 334  Q
    ||  | || ||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||| ||||  | ||  | ||||| || ||| | ||||    
T  30151 tttctaaagagtataaaagaggcacaaaaagttgatgttaagtttgtacatttgttggtttctagtgatcagactgaagacagtgattttaagatcgatg 30052  T
Q  335 agcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtat 434  Q
    | ||| |||||||||| ||| |||  |  |||||||||||  || |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || |||||||||||    
T  30051 atcaacgtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccaaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtat 29952  T
Q  435 tcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgact 534  Q
    |||| |||||||||| || ||||| || ||| | |||| | ||||||  | ||| || ||||| ||||| || ||  | ||||||||| | ||||||| |    
T  29951 tcatccgggagctacgaagatgtaccacgatctaaagaggttgtttttgtcgtctggattgaaacgcgatgttgcagagtttgtgtattcttgtttgatt 29852  T
Q  535 tgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  29851 tgtcagaaatcgaaggttgaccatcagaa 29823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 50241 - 50168
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgt 83  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50241 aggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgt 50168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 18780 - 18122
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||    
T  18780 aggcagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggttttaattaccatccgggtaaagctaatgtcgttgtagatgctttgagcaggaaga 18681  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    |||| ||||| || ||  |||||||||  |||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| || |||||  |||||  ||||||||| |||||    
T  18680 catttcacatctctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagaatattttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacttcaaagtgtacagtt 18581  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |     
T  18580 gggtatgctgaaggttaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaact 18481  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||| ||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||    
T  18480 gaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcatgatagtgatgagttgaaaaagttgattctggaag 18381  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctg-ttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcg 508  Q
    ||||| | || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||  || |||||  | || || |    
T  18380 aaagtaacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatcatttgaagaaattgtttttgatggtttgggttgaaatgtgatgttg 18281  T
Q  509 ctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtg 608  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  18280 ctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtttaaggttgagcatcagaagccttcagggttgttgactccgttagatgtgccagagtggaagtg 18181  T
Q  609 ggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||| ||||||||    
T  18180 ggacatcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgtgagagcatgatg 18122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 10327 - 10989
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  10327 acatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtag 10426  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| ||  |||| ||||| || ||  |||| |  || ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| || || |||| | |||     
T  10427 gaaaacgctgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagattgtt 10526  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||  |||||||| ||||| ||||||| | |||||     
T  10527 caattggggatgctgaagattaatagtgatttcttaaatagtatccgagaagcgcaataagtggatgagaagtttgttgatttgatggttattggtaatg 10626  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||  | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||| |||||    
T  10627 acactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagagggagaatttgcattcctaatgatgatggtttgaaaaagttaatttt 10726  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  10727 agaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccagtttgaagcgtgac 10826  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  10827 gtcgctcatttcgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 10926  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  10927 agtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtctacctaacactccgagagggcatgatg 10989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 20541 - 21203
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  20541 acatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtag 20640  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| ||  |||| ||||| || ||  |||| |  || ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| || || |||| | |||     
T  20641 gaaaacgctgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagattgtt 20740  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||  |||||||| ||||| ||||||| | |||||     
T  20741 caattggggatgctgaagattaatagtgatttcttaaatagtatccgagaagcgcaataagtggatgagaagtttgttgatttgatggttattggtaatg 20840  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||  | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||| |||||    
T  20841 acactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagagggagaatttgcattcctaatgatgatggtttgaaaaagttaatttt 20940  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  20941 agaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccagtttgaagcgtgac 21040  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21041 gtcgctcatttcgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgga 21140  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  21141 agtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtctacctaacactccgagagggcatgatg 21203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 4185 - 3525
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |     
T  4185 acatgaggcagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcat 4086  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||| | ||||| ||||| ||  |||||||||  || ||  | ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||| |||       
T  4085 gaaggcgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaattcaatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagta-- 3988  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||     
T  3987 cagttgggaatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccaagaagcacagcaagtagatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatg 3888  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
         ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  3887 gcattgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgatttt 3788  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| || ||     
T  3787 agaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttagtggtctgggttgaaacgtgat 3688  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  3687 gttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagactgcagggttgttgacaccgttggatgtggcggaatgga 3588  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  3587 agtgggacagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactctgagagggcatgatg 3525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 227
Target Start/End: Original strand, 43007 - 43199
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |   |||||||    
T  43007 taaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgttatgatggt 43106  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaa 227  Q
     |  ||||| || || || |||||||| || ||||||||| | || |||||| | ||| | ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  43107 taaagagttggagtttcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtatcaccacaaagtgtgaaattgggaatgttgaagatcaa 43199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 32842 - 32184
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  |||| ||||| |    
T  32842 aggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcggatactctgagcaggaaaa 32743  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||| ||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| |  | |||||| || |||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| |||||    
T  32742 cgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagcgcggtttagagatttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtgtacagtt 32643  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| || ||||| || |     
T  32642 gggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccaagaagcgcaacaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaact 32543  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | || |    
T  32542 gaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggagg 32443  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctg-ttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcg 508  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| || ||||| || || || |    
T  32442 aaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaactgtttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttg 32343  T
Q  509 ctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtg 608  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32342 ctcagtttgtctatgcatgtttgacttgttagaagtctaaggttgagcatcagaatcctgtagggctgttgacaccgttggatgtgcaggagtggaagtg 32243  T
Q  609 ggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32242 ggacaacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 32184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 457 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 15023 - 14839
Alignment:
Q  457 tatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaac 556  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||| |    
T  15023 tatcatgatctaaagaagtttttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtatgcttgtttgatttgttagaagtcgaaggttgagc 14924  T
Q  557 atcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||||| ||||| ||  ||     | |||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| ||| ||||||    
T  14923 atcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgaagagttt 14839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 20830 - 20168
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  20830 acatgaggcagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgttgatgcgttgagcag 20731  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| || || || |||||  || || |||| |||||     
T  20730 gaagacattacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttaagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgtt 20631  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||  | |||||||| ||||| |||  ||||||||||     
T  20630 cagttggggatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcagcaagtagacttgaagtttgttgatttgatgactactagtaatg 20531  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| |||  || |||||||||||||| || |||||  |||| || | ||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |    
T  20530 acactgaggataacgacttcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcataggaagaatttgtattcctgagaatgatgatttgaagaagttgattct 20431  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||| ||||| ||||| |  |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  20430 agaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaatctgttttggtggtccggtttaaagcgtgat 20331  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  20330 gttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtgga 20231  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20230 agtgggacagtatttctatggatttcgtgacaagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 20168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 23650 - 22988
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  23650 acatgaggcagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgatgatgcgttgagcag 23551  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| || || || |||||  || || |||| |||||     
T  23550 gaagacattacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttaagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgtt 23451  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||  | |||||||| ||||| |||  ||||||||||     
T  23450 cagttggggatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcagcaagtagacttgaagtttgttgatttgatgactactagtaatg 23351  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| |||  || |||||||||||||| || |||||  |||| || | ||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |    
T  23350 acactgaggataacgacttcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcataggaagaatttgtattcctgagaatgatgatttgaagaagttgattct 23251  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||| ||||| ||||| |  |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  23250 agaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaatctgttttggtggtccggtttaaagcgtgat 23151  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  23150 gttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtgga 23051  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23050 agtgggacagtatttctatggatttcgtgacaagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 22988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Original strand, 50750 - 51395
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||  | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |    
T  50750 aggcagagaagatggcttgaactgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaaaa 50849  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||| ||||| |||||    
T  50850 cgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagtt 50949  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagc- 308  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||            ||||||| |||||||| || |     
T  50950 ggctatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattagagaagcacatcaagttgatgtcaa------------aatggtttctagtaatgaaact 51037  T
Q  309 ggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaa 408  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  51038 ggaga-tagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgatttgaaaaagttgattttagaa 51136  T
Q  409 gaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcg 508  Q
    |||||||| |  || ||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| || ||||| || || || |    
T  51137 gaaagtcacagaagtaacttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgatttgaagagattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttg 51236  T
Q  509 ctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtg 608  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  51237 ctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtg 51336  T
Q  609 ggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  51337 ggacagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagaaggcatgatg 51395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 10 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 3607 - 3021
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  3607 aggcagaggagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 3508  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||  ||||| || | |||||  ||||    
T  3507 cgttgcacatgtctgctattatggtaaaggagtttgagttgctagagcattttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctaagagtgtatagtt 3408  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |     
T  3407 gggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacagcaagttgatgccaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaact 3308  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  || |||| |||||||||||||   | ||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||| | ||||    
T  3307 gaagatggtgatttcaaggttgatggtgagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagatgattctggaag 3208  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    || |||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| || || || ||    
T  3207 aatgtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgc 3108  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgcc 596  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  3107 tcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgcc 3021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 520 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 2715 - 2568
Alignment:
Q  520 tatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcattt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| ||||||||| | |||||    
T  2715 tatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtagaagtgggacaacattt 2616  T
Q  620 ctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  2615 ccatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcacgatg 2568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 5207 - 4582
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||    
T  5207 aggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaagaaga 5108  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | |||||||| || ||  ||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||||||||| |||||    
T  5107 cgttgcacatttctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctggagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtacagtt 5008  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |     
T  5007 gagtatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaacc 4908  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  |  |||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||| | ||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  4907 gaagagggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctaataatgatgatttgataaagttgattttagaag 4808  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    |||| || |  || | ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||| ||||||||  ||||||| |||||  | ||||| || ||  | ||    
T  4807 aaagccacagaagtagcttaagtattcatccgggagctaaaaagatgattcatgacttgaagaaattgttttggtggtcttggttgaaacgtgatattgc 4708  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4707 tcagtttttttatgcgtgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgg 4608  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgac 635  Q
     ||||||| || ||||||||| ||||    
T  4607 tatagcatatccatggattttgtgac 4582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 666
Target Start/End: Original strand, 11656 - 12316
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  11656 acatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcag 11755  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||||||| |||| ||||| ||  |||||||||  || |||||  |||| ||||||||||| ||| ||||| | || |||||  ||||  |||| ||  |     
T  11756 gaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatatgctggaacagtttagagacatgagtgtggtatgtgagctgtcgcctcagagcata 11855  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| | || ||||| ||| || || |||||     
T  11856 cggttgggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcatatcaagtggatgtcaagctggttgatttgatgattgctggtaatg 11955  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11956 gcacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaatttt 12055  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  | ||     
T  12056 agatgaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggttcggtttgaattgtgat 12155  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||    
T  12156 gtcgctcattttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcattagaagcctgcagggttgttgac-ccgttggatgtaccagagtgga 12254  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12255 aatgggatagcatttctatggatttcgtgacgattttaccaaacactccgagaggacatgat 12316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 1300 - 643
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  1300 aggcagagaaaatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 1201  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | || ||||||||  |  ||||||||| ||||||||| || || ||| |||  || ||||||||||| || |||||  ||||  || | ||||| || ||    
T  1200 cgttacacatgtctactatgatggtaaaggagtttgagtttctagaatagtaaagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcgccttagagtgtacaatt 1101  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || |     
T  1100 gggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatgaaact 1001  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| | ||    
T  1000 gaagatggtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataacaatgatttgaaaaagttgattttggtag 901  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    |||| || |  || | ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||  || ||||| || || || ||    
T  900 aaagccacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtttgggttgaaacgtgatgttgc 801  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  800 tcagttcgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatttgccaaagtggaagtgg 701  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    || | |||||| ||||||||| ||||||||||||  || |||| ||||||||||||||    
T  700 gacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactctgagagggcatgatg 643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 74 - 665
Target Start/End: Original strand, 1 - 591
Alignment:
Q  74 aagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgag 173  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||| |||     
T  1 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacgtgac 100  T
Q  174 tctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtt 273  Q
    ||| || |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || |||||||     
T  101 tctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacaatatcagagaagcacataaaattgatgtc 200  T
Q  274 aagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattc 373  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  | || ||| ||||    
T  201 atgtttgtggatttaatggttgctagtaatcaaactgaagagggtgatttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcagaggaagaacttgcattc 300  T
Q  374 ctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaa 473  Q
     ||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  301 ttgatagtgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcatagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaa 400  T
Q  474 gctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcaggg 573  Q
      | ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  401 attattttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcatgca-gg 499  T
Q  574 ttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |  || |||||||||||||||||    
T  500 ttgttgacaccgttagatgtacctgagtggaagtgggatagcatttccatggattttgtgacaagtttgccgaatactccgagagggcatga 591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 3024 - 2362
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||    
T  3024 acatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagccaatatggttgcagatgcgctgagcag 2925  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||  ||||| ||||| ||  ||||||| |  || || || ||||| ||  ||||||| ||||||||||| || |||||| || || |||| |||||     
T  2924 gaagatgttgcatatgtctgctatgatggtgaaagaattcgatttgctagagtagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgta 2825  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||| |||||| || |||||     
T  2824 cagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtagatcttaagtttgatgatttgatggttgctggtaatg 2725  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| || |||||||||||  | |||||||| || || ||||  | |||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||    
T  2724 gcactgaggatagtgactttaaggttgatgattagggtgtgttaaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaaattgatttt 2625  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||     
T  2624 agaggaaagtcacaagagtagcttaattattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaaaagtgat 2525  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||    
T  2524 gttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgttgggtttttgacaccgtttgatgtgccggagtgga 2425  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2424 agtgggacagtatttctatggattttgtgacaagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 2362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 667
Target Start/End: Original strand, 24746 - 25397
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||| |||| |||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24746 acatgaggtagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcag 24845  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
     ||||| ||||| ||||  || |||||||| |  || || || ||||| || |||||||| || ||| |||| || |||||| || || || | |||||     
T  24846 aaagacgttgcatatgtttgctttgatggtgaaagaattcgatttgctagagcagtttagagatttgtgtcttgtctgtgaattgacacctgagagtgta 24945  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||     
T  24946 cagttggggatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacatcaagtagatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatg 25045  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       |  || ||||||| || ||||||||||| || |           || ||||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  25046 gcactaaggatagtgactttaaggttgatgatcagg-----------ttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaatttt 25134  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||     
T  25135 agaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcctgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgat 25234  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  25235 gttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagtctgcagggtttttgacaccgttggatgtgccggagtgga 25334  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25335 agtgggaaaacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 25397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 142 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 28524 - 27999
Alignment:
Q  142 tttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttga 241  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  || || |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28524 tttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttga 28425  T
Q  242 atagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaagg 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  | || ||| || ||||| || | ||| ||||||| |  ||||||||||| || ||    
T  28424 atagtatccgagaagcacaacaagtggatgtcaagtttgttgacctgatagttgctggtaatgaaactgaggatagtgactataaggttgatgatcaggg 28325  T
Q  342 tgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcg 441  Q
    |||||| || || ||||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||    
T  28324 tgtgttaaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccg 28225  T
Q  442 ggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaga 541  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28224 ggagctacaaaaatgtatcacgacttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgtcaga 28125  T
Q  542 agtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28124 agtctaaggttgagcatcagaagcctgcacggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagttt 28025  T
Q  642 acaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||    
T  28024 accgaacactccgagaggacatgatg 27999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 35514 - 35432
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtc 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35514 gattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagatgttgcacatgtc 35432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 40 - 667
Target Start/End: Original strand, 32224 - 32851
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| || |||||||| | ||    
T  32224 gattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcagcaaaacattacatatgtctgctttgatggtgaagg 32323  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    | || |||||| | ||| ||| ||| |||||||| || || |||||  || || |||| ||||| |||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  32324 aattcgaattgttagaatagtctagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgttgcggattaatagtgatttctt 32423  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| |||||| |||| || || || || ||| | |||||||| ||||| |||  |||| ||||| |  | ||| ||||||| |||||||| ||||| ||     
T  32424 gaacagtatccgagacgctcagcaggtagatttgaagtttgttgatttgatgactactggtaatgacactgaggatagtgacttcaaggtagatgatcag 32523  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    |||||  |||| || ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||      
T  32524 ggtgtaatgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacc 32623  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    |||| |||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32624 cgggggctacaaaaatgtaccgtgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtca 32723  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| |||    
T  32724 gaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgacaagt 32823  T
Q  640 ttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32824 ttaccaaacactccgagagggcatgatg 32851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 643
Target Start/End: Original strand, 7015 - 7653
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  7015 acatgaggcagaggagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcattgagcag 7114  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||| |||| || || |||||| ||||| |||| ||| |     
T  7115 gaaaacattgcatatgtctgctttaatggtaagagaattggatttgctagaacagtttagagacctgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtata 7214  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  |||||     
T  7215 cagttggggatgttgaagattaacagtaattttttgaatagtatccgagaagcgcagcaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatg 7314  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  | ||| ||||||| ||||||||| |||| || |||||  |||| || ||||  | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  7315 agacagaggatagtgacttcaaggtttatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattct 7414  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  7415 tgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgagggctacaaagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagat 7514  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||    
T  7515 gttgctcagtttgtttatgcttgcttgagttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtactggagtgga 7614  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttac 643  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7615 aatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttac 7653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 48531 - 47906
Alignment:
Q  14 agaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacatt 113  Q
    |||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  48531 agagaagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgtt 48432  T
Q  114 gcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggt 213  Q
    ||| ||||| ||  ||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  | ||| |||| ||||| |||||||||    
T  48431 gcatatgtctgctatgatggtaaaggattttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttgggt 48332  T
Q  214 atgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggaga 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||      
T  48331 atgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatcagagaagcacatcaggttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaactgaag 48232  T
Q  314 atagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaag 413  Q
    || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  48231 atggtgatttcaaggttgatgatgaaggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattctggaagaaag 48132  T
Q  414 tcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcat 513  Q
    ||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||                    ||||||| ||||| || ||||| || || || |||||     
T  48131 tcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacagaaat--------------------tgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcaa 48052  T
Q  514 tttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggata 613  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  48051 tttgtttatgcatgttagacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctacagggttgttgaccccgttagatgtgccagagtggaagtgggaca 47952  T
Q  614 gcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagg 659  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||    
T  47951 acatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagg 47906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 599
Target Start/End: Original strand, 558 - 1150
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||    
T  558 acatgaggcagaggagatggctagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatc-gggtaaagcaaatgtggttgcagatgccataagtag 656  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  || || |||| | |||     
T  657 gaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagactgta 756  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||||     
T  757 cagttggggatgatgaagattaat-gtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctaataatg 855  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    || ||||  ||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||| | ||| || ||| | ||||||||| |    
T  856 aaacggaagatattgacttcaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttggaaaagttgattct 955  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
    |||||||||||| ||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || ||     
T  956 agaagaaagtcacaagagtagctagagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgat 1055  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccgga 599  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  1056 gttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcttgcagggttgttgacaccgttagatgtgccgga 1150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 595 - 667
Target Start/End: Original strand, 2337 - 2409
Alignment:
Q  595 ccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2337 ccggagtggaagtgggacggcatttctatggattttgtgacgagtttacctaacactccgagagggcatgatg 2409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 10 - 667
Target Start/End: Original strand, 100437 - 101084
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| || || ||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  100437 aggcagaggagatggttagagctattgaaggactacaattttggtttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcattgagcaggaaga 100536  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| | ||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| || |||||| || || || | ||| | || ||    
T  100537 cattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgatttgctagagcagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacaccttagagtattcaatt 100636  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||| || |||||    |     
T  100637 ggggatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcagcaagtggatgtgaagtttgttgatttgatagttgctggtaatggcact 100736  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
     || ||||||| ||||||||             ||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  100737 aaggatagtgacttcaaggt-------------gtgttgagattcagaggaagaatttgtattcctaacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaag 100823  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtatt---cattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgt 506  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||||   |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||    
T  100824 aaagtcacaagagtagcttaagtattattcatctgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgatttgaagcgtgatgt 100923  T
Q  507 cgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaag 606  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  100924 tgctcagtttgtgtatgcgtgtttgatttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaag 101023  T
Q  607 tgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  101024 tgggacaatatttctatggattttgtgacgagtttgccaaacactccaagagggcatgatg 101084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 181555 - 180999
Alignment:
Q  85 gttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtg 184  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |  ||||| || ||||| |||||||| || || |||||  | || ||||    
T  181555 gttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgcttgaacagttgagagatttgagcttagtttgtg 181456  T
Q  185 aaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtgga 284  Q
    ||  ||||||||| |||||| |  |||| ||||| |||||  ||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||| ||    
T  181455 aatggtcatctcagagtgtgaaactgggaatgctaaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtaga 181356  T
Q  285 tttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaa 384  Q
     ||  ||||| ||| ||||||  | ||  || |||| || ||||| ||||| || |||||||||| |||  ||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  181355 cttgttggttgctaataatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgaaattccgaggccgaatttgtattcctgacgatgaa 181256  T
Q  385 gaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgct 484  Q
    ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||| | || || |    
T  181255 gagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagatattctggt 181156  T
Q  485 ggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacacc 584  Q
    |||| || ||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||  ||     | |    
T  181155 ggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagatcgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatc 181056  T
Q  585 gttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
     || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  181055 tttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagttt 180999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 10 - 497
Target Start/End: Original strand, 89320 - 89807
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  89320 aggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 89419  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||| ||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  | ||| |||| ||||| |||||    
T  89420 cgttgcatatgtctgctatgatggtaaacgaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagtt 89519  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| || |     
T  89520 gggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctagtaatgaaact 89619  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  89620 gaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgatttgaaaaagttgattttagaag 89719  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaa 497  Q
    ||||||| ||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  89720 aaagtcacaagagtagctaaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 89807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 10 - 497
Target Start/End: Original strand, 89998 - 90485
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  89998 aggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 90097  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||| ||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  | ||| |||| ||||| |||||    
T  90098 cgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagtt 90197  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| || |     
T  90198 gggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctagtaatgaaact 90297  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  90298 gaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgatttgaaaaagttgattttagaag 90397  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaa 497  Q
    ||||||| ||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  90398 aaagtcacaagagtagctaaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 90485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 580 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 115046 - 114959
Alignment:
Q  580 acaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  115046 acaccgttggatgtgctggagtggaagtggaatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 114959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 426 - 569
Target Start/End: Original strand, 390491 - 390634
Alignment:
Q  426 cttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgca 525  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| |     
T  390491 cttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttattttggtggtctggattgaaacgtgatgtagcacagtttgtgtattct 390590  T
Q  526 tgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  390591 tgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 390634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 43 - 666
Target Start/End: Original strand, 23987 - 24602
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||       ||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |  ||||    
T  23987 tatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgca-------tgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaagagt 24079  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||   |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  24080 ttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagatgtagcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaa 24179  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggt 342  Q
     | ||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| | ||  || |||| |||||||||||||| ||||||    
T  24180 caatattaaagaagcgcagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcaaggt 24279  T
Q  343 gtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgg 442  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || | ||| ||||||||| |||    
T  24280 gtgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgg 24379  T
Q  443 gagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaa 542  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  24380 gagctacaaagatgtataatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcttgtttgatttgtcagaa 24479  T
Q  543 gtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttta 642  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||||    
T  24480 atctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccgttagatgtgccgaagtggaaatgggatagta-ttccatggattttgtaacaagttta 24578  T
Q  643 caaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    |  || ||||| ||||||||||||    
T  24579 ccgaatactccaagagggcatgat 24602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 97 - 666
Target Start/End: Original strand, 48168 - 48738
Alignment:
Q  97 ttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctc 196  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||  ||||  |||    
T  48168 ttgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacggtttagagacttgagtctggtatgtgagttgtcgcctc 48267  T
Q  197 aaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttac 296  Q
    | ||| | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| | || ||||| ||| || |    
T  48268 agagtatacagttaggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaggcacaacaagtggatgtcaagctggttgatttgatgattgc 48367  T
Q  297 tagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaag 396  Q
    | ||||| || | ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48368 tggtaatgaaacagaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaag 48467  T
Q  397 ttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttga 496  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  48468 ttgattttagaggaaagtcataagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccacgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttga 48567  T
Q  497 agcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatg-tttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgc 595  Q
    | || ||||| ||||| ||||   | |  ||     | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |    
T  48568 aacgtgacgtagctcagtttgaaaaagtttgaaaaaagttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgcatggttgttgacaccgttggatgtac 48667  T
Q  596 cggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48668 cggagtggaaatgggatagcatttctatggatttagtgacaagtttaccaaacactccgagagggcatgat 48738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 564
Target Start/End: Original strand, 2200 - 2759
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  2200 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcag 2299  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||| || || |||| ||||||    
T  2300 gaaggcattgcatatgtcggcgttgatggtgaaagaatttgagttgcttgagcagttcagagacttgagtctggtttgtgaattgacacctcagagtgtg 2399  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||||||| |||| || || ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| | || ||| || |||||     
T  2400 cagttgggtatgttgaaaattaacagtgaattcttgagtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtcaagttggttgatctgattgttgctggtaatg 2499  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||| || ||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  2500 gcactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtatccctgacaatgatgggttgaaaaagttgatttt 2599  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||     
T  2600 ggaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttcgtggtccggtttgaagcgtgat 2699  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaag 564  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  2700 gttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtcttagctcgaacatcagaag 2759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 473 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 10285 - 10189
Alignment:
Q  473 agctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||| |||||    
T  10285 agctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacattttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcctcagaaacctgc 10189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 40 - 667
Target Start/End: Original strand, 9713 - 10340
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  |||| ||  ||||||| |  |    
T  9713 gattgtgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatttgtcagctatgatggttaaag 9812  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    | ||||| ||||| || |||||||  ||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  9813 aatttgagttgcttgagcagtttaaagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttctt 9912  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    | ||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |  |  ||||||| |||||||||||||| |      
T  9913 ggatagtattagagaagcacagaaggttgatgttaagtttgtggatttgttggttggtagtaatccaactaaagatagtgacttcaaggttgatgatctg 10012  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    ||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||||||     
T  10013 ggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatttctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatc 10112  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
     |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10113 agggagctaaaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgacttgtca 10212  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||    
T  10213 gaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgtgccagaatggaaatgggatagcatatccatggactttgtaacaagt 10312  T
Q  640 ttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    |||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  10313 ttaccaaatacctcgagagggcatgatg 10340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 663
Target Start/End: Original strand, 15583 - 16241
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  15583 acatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcag 15682  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||| ||||| || || |||||||  || ||||||||| | |||||||| || ||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||| |     
T  15683 gaagactttgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtata 15782  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
     ||||||| | | |||| ||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| | |||||||| ||||| |||  | |  |||||     
T  15783 tagttgggaaggttgaaaattgataatgacttcttgaatagtatccgagaagctcaaaaagtggatttgaagtttgttgatttgatgacttcaggtaatg 15882  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    |  |  || ||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||  | | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  15883 ataccaaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattct 15982  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgac 504  Q
     || || ||||| ||||| |  |||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  15983 tgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagat 16082  T
Q  505 gtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtgga 604  Q
    || ||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  16083 gttgctcagtttgtttatggctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtgga 16182  T
Q  605 agtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcat 663  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16183 agtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcat 16241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10833 - 10501
Alignment:
Q  45 tgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagttt 144  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||  ||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |  || |||    
T  10833 tgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatattttgagcgggaagacattgcatatgtcagctatgatggttaaagaattt 10734  T
Q  145 gaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaata 244  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||  |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  10733 gagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgtgtatgttgaagatcaacagtgaattcttgaaca 10634  T
Q  245 gtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgt 344  Q
    |||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| | ||  || |||| ||||||||||||||  |||||||    
T  10633 gtattaaagaagcgcagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatgaaggtgt 10534  T
Q  345 gttgagatttagagacaaaatttgtattcctga 377  Q
    ||||||||   ||| || ||||||||| |||||    
T  10533 gttgagataccgaggcagaatttgtatccctga 10501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 55 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 12119 - 11692
Alignment:
Q  55 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcg 154  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||  || ||||| ||||| |    
T  12119 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagaccttacatatgtctacgttgatggtaaaagaatttgatttgctag 12020  T
Q  155 aacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagaga 254  Q
    |||||||||| |||||||| || || |||||| ||||| |||| ||| | |||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12019 aacagtttagtgacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgttgagaattaatagtgatttcttgaatagtatccgaga 11920  T
Q  255 agcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagattt 354  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| || | ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  11919 agcgcaacaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgctggtaatgaaacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgagattc 11820  T
Q  355 agagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaa 454  Q
    | ||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  11819 ataggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgatcttagaagaaagtcataagagtagcttaagtattcatccaggagctacaaaaa 11720  T
Q  455 tgtatcatgatttgaagaagctgttttg 482  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11719 tgtatcatgatttgaagaagttgttttg 11692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 519 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 11691 - 11550
Alignment:
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  11691 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtatcggagtggaaatgggataacatt 11592  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11591 tctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 11550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 70 - 643
Target Start/End: Original strand, 39694 - 40267
Alignment:
Q  70 ggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggact 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| ||  ||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  39694 ggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcatgaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaggagtttgagttgcttgaacaatttagagact 39793  T
Q  170 tgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttga 269  Q
    ||||||| || |||||  ||||  |||| ||| || ||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  39794 tgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtatgaagttgggtatgttgaagatcaacaatgagttcttgaacagtatcaaagaagcacaaaaagttga 39893  T
Q  270 tgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgt 369  Q
    | |||||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  | |||||||    
T  39894 tattaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggcgtgttgagatttcgaggaagaatttgt 39993  T
Q  370 attcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttga 469  Q
    |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||| |  || | ||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  39994 attccttataatgatgaattgaaaaagttgattttagaagatattcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatttatcatgacttga 40093  T
Q  470 agaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||  ||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||    
T  40094 agaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaaacttgc 40193  T
Q  570 agggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttac 643  Q
     |||||||  ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||||||    
T  40194 tgggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtaacaagtttac 40267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 457 - 643
Target Start/End: Original strand, 28090 - 28276
Alignment:
Q  457 tatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaac 556  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  28090 tatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaac 28189  T
Q  557 atcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttac 643  Q
    ||||||| | ||| |||||||  ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||||||    
T  28190 atcagaaacttgctgggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtaacaagtttac 28276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 72 - 667
Target Start/End: Original strand, 95 - 681
Alignment:
Q  72 taaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttg 171  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||||  | |  ||||||    
T  95 taaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacatgtttgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgaacaactcaaagacttg 194  T
Q  172 agtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatg 271  Q
    ||||| || |||||  || || ||||         |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||    
T  195 agtcttgtttgtgagctgccacctca---------gttgggtatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtattagagaagcccagaatgttgatg 285  T
Q  272 ttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtat 371  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||  || |||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| || ||||  | |||||| ||    
T  286 tcaagtgtgtggatttaatggttactagtaatgaaactgaagatcgtgacttcaaggttgacgattagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcat 385  T
Q  372 tcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaag 471  Q
    |||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || | ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||    
T  386 tcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttcgaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatttaggagctacaaagatgtattatgacctgaag 485  T
Q  472 aagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcag 571  Q
    |   ||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  486 agattgttttggtggtctgggttgaaacatgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcag 585  T
Q  572 ggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  586 ggttgttgacaccgttagatgtgccagagtgaaagtgggatagcatttccatggattttgtgacgagtttactgaatactccgagagggcatgatg 681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 28653 - 28176
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  28653 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcag 28554  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||||||| |||| || |  || |||||||| |   | ||||| ||||| ||  ||||||| || |||||||| || |||||| || || |||| |||||     
T  28553 gaagacactgcatatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctagagtagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtgta 28454  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||| || |||||     
T  28453 cagttggggatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtcaagcttgttgatttgatggttgctggtaatg 28354  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| || |||||||||   || ||||||||||| ||  |||  | |||||||||| || | ||||| || ||||| |||||||||||    
T  28353 gcactgaggatagtgactttaaggttgattttcagggtgtgttgaggttcggaggaagaatttgtatttctaataatgatgatttgaaaaagttgatttt 28254  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttg 482  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28253 agaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggatctacgaaaatgtatcatgatttcaagaagctgttttg 28176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 34906 - 34429
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  34906 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcag 34807  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||||||| |||| || |  || |||||||| |   | ||||| ||||| ||  ||||||| || |||||||| || |||||| || || |||| |||||     
T  34806 gaagacactgcatatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctagagtagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtgta 34707  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||| || |||||     
T  34706 cagttggggatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtcaagcttgttgatttgatggttgctggtaatg 34607  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| || |||||||||   || ||||||||||| ||  |||  | |||||||||| || | ||||| || ||||| |||||||||||    
T  34606 gcactgaggatagtgactttaaggttgattttcagggtgtgttgaggttcggaggaagaatttgtatttctaataatgatgatttgaaaaagttgatttt 34507  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttg 482  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34506 agaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggatctacgaaaatgtatcatgatttcaagaagctgttttg 34429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 187 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 4045 - 3565
Alignment:
Q  187 atgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatt 286  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4045 atgtcacctcagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagcgatttcttgaatagtatccgagaagcgcagcaagtggatgtcaagtttgttgatt 3946  T
Q  287 taatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaaga 386  Q
    | |||||| || ||||| || | ||  | ||||| |||||||||||||  || ||||||||||| || ||||  | |||||| ||||| || ||||| ||    
T  3945 tgatggttgctggtaatgaaactgaagagagtgacttcaaggttgatgttcagggtgtgttgaggttcagagggagaatttgcattccagataatgatga 3846  T
Q  387 attgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctgg 486  Q
     ||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  3845 gttgaaaaagtttattctggaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtgg 3746  T
Q  487 tccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgt 586  Q
    || || ||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  3745 tctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagactaaggttgagcatcagaagcctgtagggttgttgacaccgt 3646  T
Q  587 tggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  3645 tagatgtgccggagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaacactcccagagggcgtgatg 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 7776 - 7172
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||    
T  7776 aaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaa 7677  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      ||||| || ||||| |||||||| || || |||||  | |||||||||||||||||  |||||||| || | |  |||||||||||  ||| ||| ||    
T  7676 aagagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatccgaaagtgtgaagctagaaatgctgaagattgataatgaatt 7577  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||| | ||| |||||  ||   ||||||||||||||||| ||  |||||  |||  ||||  |  |  | ||||| || ||  | |||||     
T  7576 tctgaaaagtattaaagaggcacagaaaaccgatgttaagtttgtggacttgttggttgttagagatcagactaaagacagtgattttaaaatcgatgat 7477  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    ||||||||  | || ||| |||     ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |  ||||  || |||||||||||||    
T  7476 caaggtgtactaaggtttcgaggtcggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagatccatagaagtaacttgagtattc 7377  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    ||  ||||||||| || |||||||||||| | |||| | ||||||| |||||||  ||||| || ||||| || || ||||||||| | ||||||| |||    
T  7376 atctgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaggttgttttggtggtccgaattgaaacgtgacgttgcacaatttgtgtattcttgtttgatttg 7277  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  ||     | |||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| |||||    
T  7276 tcagaagtcgaaggttgagcatcaaaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 7177  T
Q  637 agttt 641  Q
    |||||    
T  7176 agttt 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 388 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 917 - 639
Alignment:
Q  388 ttgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggt 487  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  917 ttgaaaaagttagttttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggt 818  T
Q  488 ccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgtt 587  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  817 ccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgtcaccgtt 718  T
Q  588 ggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  717 ggatgtgccgaagtggaagtgggataacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagagggcatgat 639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 278 - 667
Target Start/End: Original strand, 22519 - 22908
Alignment:
Q  278 ttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctga 377  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||| || | ||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  |  ||||||||||||||    
T  22519 ttgttgatttgatggttgctagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgtattcctga 22618  T
Q  378 caatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctg 477  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22619 taatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaaactagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctg 22718  T
Q  478 ttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgt 577  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  22719 ttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagactgctgggttgt 22818  T
Q  578 ctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  22819 tgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttctatggattttgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatgatg 22908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 278 - 667
Target Start/End: Original strand, 14340 - 14729
Alignment:
Q  278 ttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctga 377  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||| || | ||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  |  ||||||||||||||    
T  14340 ttgttgatttgatggttgctagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgtattcctga 14439  T
Q  378 caatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctg 477  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14440 taatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaaactagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctg 14539  T
Q  478 ttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgt 577  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||  || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14540 ttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttactaagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagactgcagggttgt 14639  T
Q  578 ctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  14640 tgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttctatggattttgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatgatg 14729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 14175 - 14336
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| ||||||||  || | || || |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  14175 aggcagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccag-taaagacaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 14273  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttga 172  Q
    | ||||| ||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  14274 cgttgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagagacttga 14336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 22354 - 22515
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| ||||||||  || | || || |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  22354 aggcagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccag-taaagacaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 22452  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttga 172  Q
    | ||||| ||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  22453 cgttgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagagacttga 22515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 161 - 630
Target Start/End: Original strand, 20467 - 20936
Alignment:
Q  161 ttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 260  Q
    |||| ||||||||||| || || ||| || || |||| ||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20467 ttagagacttgagtcttgtctgcgaattgacacctcagagtgtacagttagggatgctgaagtttaacagtgatttcttgaatagtatccgggaagcaca 20566  T
Q  261 acaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagac 360  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| || ||| |    |  || ||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||      
T  20567 gcaagtggatgtcaagtttgtcgatttgatggttgctggtagtggcactcaggatagtgactttaaggttgatgatcatggtgtgttgagattcagagga 20666  T
Q  361 aaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatc 460  Q
    | |||||| ||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  20667 agaatttgcattcctgatgatgatgatttgaaaaagttgattttagaaaaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatctatc 20766  T
Q  461 atgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatca 560  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20767 ttgatttgaagaagcttttttggtggtctgggttgaagcgtgatgttgctcagtttgtctatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatca 20866  T
Q  561 gaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20867 gaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaaatgggacagcatttctatggatttt 20936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Original strand, 27713 - 27761
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27713 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 27761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 488
Target Start/End: Original strand, 2360 - 2838
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  2360 aggcagagaagatggctagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtgaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 2459  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||| ||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  | ||| || | ||||| |||||    
T  2460 cgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttctcaccttagagtgtacagtt 2559  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| |||||| || ||||| || |     
T  2560 gggtatgttgaagattaattgtaatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaactggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaact 2659  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||  |||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  2660 gaagatagtgacttcaaggttgatgatgagggtgtgttgaggttcggagaaagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaatttgattttagagg 2759  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtc 488  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  2760 aaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtc 2838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 438
Target Start/End: Original strand, 1729 - 2157
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1729 aggcagaggagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagcaaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaga 1828  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | |||||||||||  |  ||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  || || |||| |||||  ||||    
T  1829 cgttgcacatgtctactatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtaaagtt 1928  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| || |||||||| || |     
T  1929 ggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaacaatatcagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgttgatttgatgattgctagtaatgaaact 2028  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  ||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||  |||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||      
T  2029 gaagatagtgacttcaaggttaatgatcagggtgtgttgaggttccgaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaga 2128  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcat 438  Q
    ||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  2129 aaagtcacaagagtagcttaagtattcat 2157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 409 - 3
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||    
T  409 aggcagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatatggttgcagatgctttgagcaggaaga 310  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||  ||||| ||| |||| || |||||||| || || |||||  ||||| |||| ||||| |||||    
T  309 cgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgtgttgcttgaatagttcagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagtt 210  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |     
T  209 gggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaact 110  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  |  |||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||  | |||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||    
T  109 gaagagggtgatttcaaggttgatgatcagggggtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataacgatgagttgaaaaagttgattttagaag 10  T
Q  410 aaagtca 416  Q
    |||||||    
T  9 aaagtca 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 6563 - 6972
Alignment:
Q  13 cagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 112  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  6563 cagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcggatgctttgagtaggaagacgt 6662  T
Q  113 tgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttggg 212  Q
    | |||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||  ||||  | || ||||||||||||||    
T  6663 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtcttgtttgtgagttgtcgccccagagtgtgcagttggg 6762  T
Q  213 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggag 312  Q
    |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||     
T  6763 tatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtcaagcttgtggatttaagggttaatagtaatcaaactgaa 6862  T
Q  313 aatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaa 412  Q
     ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||| || ||||||| ||||||||||||| ||  |||| | | |||||||||||||||    
T  6863 gatagtgatttcaaggttgatgaacacggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtgttcctgacaatgatgagatgaaaaggctgattttagaagaaa 6962  T
Q  413 gtcataagag 422  Q
    |||| |||||    
T  6963 gtcacaagag 6972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 598 - 630
Target Start/End: Original strand, 887 - 919
Alignment:
Q  598 gagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  887 gagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 471
Target Start/End: Original strand, 422 - 887
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  422 acatgaggcagaggagatgcttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtag 521  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| || ||||||||||| ||  ||||||| |  || ||||| ||| | || |||||||| |||||||| || || |||||| || || |||| |||||     
T  522 gaaaacgttgcacatgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgta 621  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||| || |||||     
T  622 cagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgggaagcacaacaagtggatgtcaagctggttgatttgatggttgctggtaatg 721  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
       | ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||  | ||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||    
T  722 gcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcaaggtgtattgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatg-agagttgaaaaagttgatttt 820  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaag 471  Q
    ||| |||||||| || || | ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  821 agaggaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaag 887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 492 - 667
Target Start/End: Original strand, 881 - 1056
Alignment:
Q  492 tttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggat 591  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  881 tttgaagcatgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggat 980  T
Q  592 gtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  981 gtgccggagtggaagtgggacctaatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 1056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 13456 - 12930
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||||| |||||    
T  13456 tatgattttgagttgagctatcatccgggtcaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcataagtctgccatgatggtaaaggagt 13357  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    | || || || |||||||| || || |||||  | |||||||||||||||||| | |||||| || | || |||||||||||  ||| ||| ||  ||||    
T  13356 tcgagttacttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaa 13257  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggt 342  Q
     ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | ||  | ||||| || ||| | ||||| ||||||    
T  13256 gagtattaaagaagcacagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaagatcgatgatcaaggt 13157  T
Q  343 gtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgg 442  Q
    |||||||||||| |||  |  ||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  13156 gtgttgagatttcgaggtaggatttgtattccagacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcaccctg 13057  T
Q  443 gagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaa 542  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||| | ||| ||  |||| || || || || || || |||||| | ||||| | |||||||||    
T  13056 gagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggttgtctggactgaaacgagatgttgcacagttcgtgtattcttgtttaatttgtcagaa 12957  T
Q  543 gtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  12956 gtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 12930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 7418 - 6895
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  ||||    
T  7418 tatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaatgagt 7319  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    | || ||||| |||||||| || || |||||| | || ||||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||||  ||| ||| ||  ||||    
T  7318 tcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttctgaa 7219  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggt 342  Q
     ||||| | |||||||||  |||| |||||||||||||| || ||  ||||| ||||| ||||  | ||  | ||||| || ||  | ||||| |||| |    
T  7218 gagtattaaagaagcacagaaagtcgatgttaagtttgttgacttgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaagct 7119  T
Q  343 gtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgg 442  Q
    ||||| || |||||||  |  ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||| | |    
T  7118 gtgttaaggtttagaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccag 7019  T
Q  443 gagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaa 542  Q
    ||||||| || ||||| || ||| |    ||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  7018 gagctacgaagatgtaccacgatct---aaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgatgttgcacagtttgtgtatacttgtttgatttgtcagaa 6922  T
Q  543 gtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
     || ||||||||  ||||||| |||||    
T  6921 atcgaaggttgagtatcagaaacctgc 6895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 164; Significance: 3e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 142 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 27560 - 27037
Alignment:
Q  142 tttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttga 241  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||    
T  27560 tttgaattgttggaacagtttagagacctgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggggatgctgaagattgatagtaatttcttga 27461  T
Q  242 atagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaagg 341  Q
    | |||||| ||||||| ||  || | ||| | || ||||| ||||| |||  || | ||| | |  | ||| ||||||| || ||||||||||| || ||    
T  27460 acagtatccgagaagctcagaaaatagatttgaaatttgttgatttgatgactattggtagtgacactgaggatagtgactttaaggttgatgatcaggg 27361  T
Q  342 tgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcg 441  Q
    |||| |||| || | ||  | | |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |  |||||||||||  ||    
T  27360 tgtgctgaggttcaaaggaagagtttgtattcctgatcatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccg 27261  T
Q  442 ggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaga 541  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |  | || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27260 ggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagatatgttgctcattttgtttatgcttgtttgatttgtcaga 27161  T
Q  542 agtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||    
T  27160 agtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtttgatgtaccgtagtggaagtgggacagtatctctatggatttcgtgacgagttt 27061  T
Q  642 acaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||  ||||||||||||||||||||    
T  27060 accgaacactccgagagggcatga 27037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 37 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 16281 - 15677
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  16281 aaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggtta 16182  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
     |||||||||  |||| ||||||||||| || |||||| | || || ||  ||||| |||| |||||  || |||| |||||||||||  ||||||| ||    
T  16181 aggagtttgagctgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtaaagctgggaatgctgaagattgatagtgaatt 16082  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      | || |||||    ||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||  ||||  ||||||| ||||| || |||||     
T  16081 tctaaagagtattcatgaagcgcagaaagaggatgttaagtttgtggacttgttggttgcaagtaatcagacggaagatagtgacttcaaagtcgatgat 15982  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| | || ||  |||||||  ||||| | ||||| ||||| |  || | |||||||||||    
T  15981 cagggtgtgttgagatttcgagatataatttgtattcctgacgacgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattc 15882  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||||   ||||||| |||    
T  15881 atccgggagctactaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgagacgtggcacagtttgtgtattactgtttgatttg 15782  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    ||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||   ||||| || ||||| ||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  15781 tcagaagtcaaaagttcagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccatagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacg 15682  T
Q  637 agttt 641  Q
    |||||    
T  15681 agttt 15677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 641
Target Start/End: Original strand, 112396 - 112993
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||    
T  112396 tatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttaagtaggaagacattgcatatgtcgaccatgatggtaaaagagt 112495  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    | || ||| | ||||||||||| || |||||| | || ||||||||||||||| | |||||| || | || |||||||||||  ||||||| ||  ||||    
T  112496 tcgagttgttggaacagtttagagatttgagtttagtctgtgaaatgtcatctaagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaa 112595  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggt 342  Q
     ||||| | |||||||||  | || |||||||||||||| || ||  | | | ||||||||||  | ||  || |||| || ||  | ||||| | ||||    
T  112596 aagtattaaagaagcacagaaggtcgatgttaagtttgtagacttgttagctgctagtaatcatactgaagatggtgattttaaaatcgatgatcgaggt 112695  T
Q  343 gtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgg 442  Q
    |||||||||||  |||  | |||||||||||| ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||| |||    
T  112696 gtgttgagattccgaggtagaatttgtattccagacgatgaggagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgg 112795  T
Q  443 gagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaa 542  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | ||||| | |||||||||    
T  112796 gagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcttgtttaatttgtcagaa 112895  T
Q  543 gtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||     | | || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  112896 gtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtatctttagatgtgccaga-tggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagttt 112993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 55 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 5417 - 4831
Alignment:
Q  55 ttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcg 154  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  5417 ttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttacatatgtccgctatgatggtaagagagtttgagttgcttg 5318  T
Q  155 aacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagaga 254  Q
    ||||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| |||| |||||| || || | ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  5317 aacagtttagggatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgagaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaaaga 5218  T
Q  255 agcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagattt 354  Q
    ||| ||  || |||||||||||||||| || ||  ||||| | ||||||||  | ||  ||||||| || ||||| ||||| || || |||||| | |||    
T  5217 agcgcagaaaattgatgttaagtttgtagacttgttggttgcaagtaatcagactgaagatagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcgtttt 5118  T
Q  355 agagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaa 454  Q
     ||| || |||||||||||| ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||| || | |||||||| |||| |||||||||| || |    
T  5117 cgaggcagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtaatcatccgggagctacgaaga 5018  T
Q  455 tgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttga 554  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||  | || || || || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||    
T  5017 tgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaatgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagttga 4918  T
Q  555 acatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
     |||||||| |||||||| |||   ||||| ||  |||| |  |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  4917 gcatcagaaacctgcaggtttgatgacacctttatatgttctagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagttt 4831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 89 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16632 - 16449
Alignment:
Q  89 cagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaat 188  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  16632 cagatgccttgagtagaaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggaattggaattgctcgaacagtttagagacttgagtctcgtgtgtgaatt 16533  T
Q  189 gtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16532 gtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtctcagagaagcacaacaagttgatgt 16449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 427 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 7198 - 6959
Alignment:
Q  427 ttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcat 526  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||   || |||||||  ||||| |||||||    
T  7198 ttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtatatgcat 7099  T
Q  527 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7098 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggaaagttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 6999  T
Q  627 ttttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    |||| |||| |||||||  || |||||||| |||||||||    
T  6998 ttttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgat 6959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Original strand, 10759 - 10864
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  10759 acatgaggcagcggagatggcttgagttcttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttaagcag 10858  T
Q  105 gaagac 110  Q
    ||||||    
T  10859 gaagac 10864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 148; Significance: 9e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 10388 - 9770
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||    
T  10388 tggctcgaattgttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttacatatgt 10289  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    | ||  ||||||| | |||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||| | || |||||  ||||| |||| |||||| || | || ||||| ||    
T  10288 ctgctatgatggttaaggagttcgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgtgaggtgtcacctcagagtgtgaagctagggatgctaaa 10189  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    ||||||||| || ||  |||| | ||| | | |||| ||  |||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||  |  |  ||| |||     
T  10188 gatcaatagcgagtttctgaaaa-tattatataagcgcagaaagttgatgttaagtttgtgtacttgttggttgctagtaatcagacaaaagataatgac 10090  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| |||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  |    
T  10089 tttaaggtcgatgaccaaggtgtgttgagattctgaggaagaatttgtattcatgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaa 9990  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgta 521  Q
    | | |||||| |||||| | |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  |||| || || || ||  | ||||||||    
T  9989 gtagcttgagcattcatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctggactgaaacgtgatgtggcatagtttgtgta 9890  T
Q  522 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttct 621  Q
    | | ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||   |||||||| |||||||| |||||||| | |||||| || ||     
T  9889 ttcttgtttgatttgtcagaagtcaaaggttgagcatcaaaaacctgcagggttgatgacaccgttagatgtgccagagtggaaataggatagtatatcc 9790  T
Q  622 atggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  9789 atggattttgtgacgagttt 9770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 148; Significance: 9e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 5290 - 4671
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  5290 tggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgt 5191  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    |  |  |||||||||   ||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| | || || ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||    
T  5190 ccactatgatggtaaaaaagtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaa 5091  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    |||  ||||||| ||  |||| ||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  |||||||     
T  5090 gattgatagtgaatttctgaaaagtattaaagaagcgcagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgac 4991  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    || ||  | ||||| ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||||| ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  |    
T  4990 tttaaaatcgatgatcaaggagtgttgagattccgagccagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaa 4891  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgta 521  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| || || || ||  | ||||||||    
T  4890 gtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtcgtctgggttgaaacgtgatgtggcatagtttgtgta 4791  T
Q  522 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttct 621  Q
    | | ||||||| |||||||||||| || || || |||||||| |||  |||||||   ||||| ||  |||| || |||||||| | | ||||||| ||     
T  4790 ttcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagtggagcatcagaaacctatagggttgatgacacctttatatgtaccagagtggaaatagaatagcatatcc 4691  T
Q  622 atggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  4690 atggattttgtgacgagttt 4671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 12420 - 11801
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  12420 tggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgt 12321  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    |  |  |||||||||   ||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| | || || ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||    
T  12320 ccactatgatggtaaaaaagtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaa 12221  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    |||  ||||||| ||  |||| ||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  |||||||     
T  12220 gattgatagtgaatttctgaaaagtattaaagaagcgcagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgac 12121  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    || ||  | ||||| ||||| |||||||||||  ||| || |||||||||||| ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  |    
T  12120 tttaaaatcgatgatcaaggagtgttgagattccgagccagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaa 12021  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgta 521  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| || || || ||  | ||||||||    
T  12020 gtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtcgtctgggttgaaacgtgatgtggcatagtttgtgta 11921  T
Q  522 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttct 621  Q
    | | ||||||| |||||||||||| || || || |||||||| |||  |||||||   ||||| ||  |||| || |||||||| | | ||||||| ||     
T  11920 ttcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagtggagcatcagaaacctatagggttgatgacacctttatatgtaccagagtggaaatagaatagcatatcc 11821  T
Q  622 atggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  11820 atggattttgtgacgagttt 11801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 638
Target Start/End: Original strand, 218319 - 218920
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |  |||||||||    
T  218319 aaagattatgattttgggttgaactataatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgatggtaa 218418  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      |||||||| ||||| || |||||||| || |||||| | || |  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||| ||    
T  218419 aagagtttgagttgcttgagcagtttagagatttgagtttagtctacgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtgaatt 218518  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||  || ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | ||  | | ||| || ||  |  ||||     
T  218519 cttgaacaatatcaaagaagcgcagaaaattgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacaatgattttaaaatcaatgat 218618  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || ||  ||||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||    
T  218619 cagggattgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgataatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 218718  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || |||||| || | ||||||| |||    
T  218719 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgaattcctgtttgatttg 218818  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||| || ||| | || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  218819 tcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacaccattagatataccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacg 218918  T
Q  637 ag 638  Q
    ||    
T  218919 ag 218920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 331 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 230153 - 229915
Alignment:
Q  331 gatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 430  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||| |||||| ||| |||| ||  |||||||| ||||| | |||||||||||||  || | |||||    
T  230153 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaatttatattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttga 230054  T
Q  431 gtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgttt 530  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | |||||    
T  230053 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttggtttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcttgttt 229954  T
Q  531 gacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |  |||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||    
T  229953 ggtttgtcagaagtcgaaaattgagcatcagaaacctgc 229915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 145; Significance: 6e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15543 - 15287
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  15543 aggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatctgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 15444  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
      ||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||| ||||| |||||    
T  15443 ggttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagtt 15344  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagt 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343 gggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagt 15287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 626
Target Start/End: Original strand, 9308 - 9352
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9308 accgttgtttgtgccagaatggaagtgggatagcatttctatgga 9352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Original strand, 16879 - 17402
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||  | || ||||| ||  ||||||| |    
T  16879 aaagattatgattttgagttgaattatcaaccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatggtca 16978  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
     ||| ||||| || || ||||||||||| || |||||  | || |||||| ||||| |||| |||||| |||| || |||||||||||  ||| ||| ||    
T  16979 aggaatttgagttacttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgataatgaatt 17078  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
    |||||| | ||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | ||  ||| ||| ||||||||||||||     
T  17079 cttgaacaatattaaagaagcgcaaaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagataatgacttcaaggttgatgat 17178  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || |  |||||| ||||  ||| || ||||||||||| |||  |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  17179 caggaggtgttgcgattctgaggcagaatttgtattcttgaagatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcacaaaagtaacttgagtattc 17278  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | ||||||| |||    
T  17279 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttg 17378  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatca 560  Q
    ||||||||| || ||||| |||||    
T  17379 tcagaagtcaaaagttgagcatca 17402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 138; Significance: 9e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 347
Target Start/End: Original strand, 5959 - 6303
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgta--gttgcagatgcgttgagt 102  Q
    |||| |||||||| || ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  5959 acatgaggcagagaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtacggttgcagatgctttgagt 6058  T
Q  103 aggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtg 202  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||| ||||    
T  6059 aggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagttggagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtg 6158  T
Q  203 tgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaa 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||  || | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6159 tgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatcaaggaaacacagaaaatcgatgccaagtttgtggatttaatggttactagtaa 6258  T
Q  303 tcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgtt 347  Q
    |||| | ||  || |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6259 tcaaactgaagatggtgacttcaaagttgatgatcaaggtgtgtt 6303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 430 - 666
Target Start/End: Original strand, 6331 - 6567
Alignment:
Q  430 agtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtt 529  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||| || || || || || ||| | || |||||||    
T  6331 agtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgcacaatttctataggcatgtt 6430  T
Q  530 tgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattt 629  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  6431 tgacttgtcagaagtctaagattgaacatgagaagcctgcaggattgttgacaccgttagattttccagagtggaagtgggacagcatctccatggattt 6530  T
Q  630 tatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  6531 tgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgat 6567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 138; Significance: 9e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 8361 - 7720
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  8361 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 8262  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||||||||    
T  8261 tgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 8162  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||  | |||    
T  8161 gaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcacagagagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagt 8062  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||  | ||||||||| |  |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  8061 gattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcata 7962  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||||||  |||||||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  7961 gaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatttatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 7862  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatt 618  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||     
T  7861 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaagcctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtata 7762  T
Q  619 tctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagaggg 660  Q
    || ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  7761 tccatggattttgtgacgagttttccaaatactcctagaggg 7720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 138; Significance: 9e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 41126 - 40781
Alignment:
Q  13 cagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 112  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  41126 cagagaagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggttttgattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 41027  T
Q  113 tgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttggg 212  Q
    |||||||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  41026 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 40927  T
Q  213 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggag 312  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||  ||| || | ||     
T  40926 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacatcaagtggatatcaagtttgttgatttgatggttactaacaatgaaactgaa 40827  T
Q  313 aatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagag 358  Q
     || |||| |||||||||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  40826 gatggtgacttcaaggttgattatcagggtgtgttgagattcagag 40781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 403 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 40776 - 40512
Alignment:
Q  403 ttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcg 502  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| || ||||| || |    
T  40776 ttagaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgagagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaatttttttggtggtctgggttgaaacgtg 40677  T
Q  503 acgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtg 602  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||    
T  40676 atgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaaaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtg 40577  T
Q  603 gaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  40576 gaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatg 40512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 4)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 409 - 667
Target Start/End: Original strand, 6510 - 6769
Alignment:
Q  409 gaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcg 508  Q
    |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || |    
T  6510 gaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttg 6609  T
Q  509 ctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtg 608  Q
    |||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6610 ctcaatttttcaatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcaccagaagcctgcaaggttgttgacaccattagatgtgccggagtggaagtg 6709  T
Q  609 ggatagcatttctatgga-ttttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6710 ggacagcatttccatggatttttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 6769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 409 - 667
Target Start/End: Original strand, 10941 - 11200
Alignment:
Q  409 gaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcg 508  Q
    |||||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || |    
T  10941 gaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttg 11040  T
Q  509 ctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtg 608  Q
    |||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11041 ctcaatttttcaatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcaccagaagcctgcaaggttgttgacaccattagatgtgccggagtggaagtg 11140  T
Q  609 ggatagcatttctatgga-ttttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11141 ggacagcatttccatggatttttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatg 11200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 6264 - 6498
Alignment:
Q  69 gggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggac 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  6264 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagac 6363  T
Q  169 ttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttg 268  Q
    |||||||| || |||||  ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6364 ttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagttg 6463  T
Q  269 atgttaagtttgtggatttaatggttactagtaat 303  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||| || |||||    
T  6464 atgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaat 6498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 69 - 303
Target Start/End: Original strand, 10695 - 10929
Alignment:
Q  69 gggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggac 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  10695 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagac 10794  T
Q  169 ttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttg 268  Q
    |||||||| || |||||  ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10795 ttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagttg 10894  T
Q  269 atgttaagtttgtggatttaatggttactagtaat 303  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||| || |||||    
T  10895 atgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaat 10929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Original strand, 969 - 1501
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||| ||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  969 aaagactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatcttgtagcagatgccttgaataggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaa 1068  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||| |  | || ||  |||||||||| |||||| || | || |||||||||||  ||||||| ||    
T  1069 aagagttcgaattgttcgaacagtttagagatttgagtttattctgagagttgtcatctcagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgaatt 1168  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  | ||||| || ||  | |||||     
T  1169 tctgaaaagtattaaagaagcacagaaagttgatgttaagtttgtagactttttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgat 1268  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    |||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||| |||| ||  |||||||  |||| || ||||| ||||||| ||| | |||||||||||    
T  1269 caaggtgtgttgagattccgaggtagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgatatttgaagagagtcataggagtagcttgagtattc 1368  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || || ||||||||| |||| ||| ||||||| || || || ||||| || || || || || ||||||||| | ||||||| |||    
T  1369 atccgggagctacgaagatatatcatgatctgaaaaagttgttttggtgatctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcttgtttgatttg 1468  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  1469 tcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 1501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 2312 - 1708
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| |    
T  2312 aaagattatgatttcgggctgaattatcatccaggtaaagctaatgttcttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatggtta 2213  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
       |||| ||  ||| |||||||||||  ||| ||||| | || |||||| ||||| |||| |||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||    
T  2212 aaaagttggagctgcacgaacagtttattgacctgagttttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtcaagttgggaatgttgaagattaatagtgaatt 2113  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
     ||||| ||||| | |||||||||  ||   ||| | |||||||| |||||| || ||  | | |||||  | ||| ||||||| || || ||||||||     
T  2112 tttgaacagtattaaagaagcacagaaaacggatctaaagtttgtagatttattgattggtggaaatcagactgaggatagtgactttaaagttgatgat 2013  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || || |||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| ||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| |  || | |||||||||||    
T  2012 cagggagtgttgcgatttcgaggcagaatttgtattcttgacaatgatgagataaagaagatgattctcgaagagagtcacagaagtagcttgagtattc 1913  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| || || ||  | || ||||||||| ||||||||| |||    
T  1912 atccgggagctataaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctaggttgaaacgtgatgtgacacagtttgtgtattcatgtttgatttg 1813  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||  || ||||| |||||||| || |  ||||||||| |||||    
T  1812 tcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgctgggttgttgacaccgttagatgtgctagaatggaaatgggatagtatatacatggattttgtgacg 1713  T
Q  637 agttt 641  Q
    |||||    
T  1712 agttt 1708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 107
Target Start/End: Original strand, 8567 - 8631
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaa 107  Q
    ||||||||||  ||||  || ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  8567 tatgattttgagttgagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagtaggaa 8631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 437 - 4
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||    
T  437 acatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggtagcagatgcgttgagcag 338  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |  || || || ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||  || || |||| |||||     
T  337 gaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaagaattcgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtt 238  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    ||||| || ||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||| || |||||     
T  237 cagtttgggatgttgaaaattaatagtgatttcctgaatagtatccgagaagcacagcaagtagatgttaagtttgttgatttgattgttgctggtaatg 138  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
         ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  137 ttattgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgatttt 38  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattcat 438  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  37 agaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcat 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 350
Target Start/End: Original strand, 3142 - 3487
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  3142 acatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcag 3241  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || |  |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||| ||||||    
T  3242 gaagacgttgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtg 3341  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||  || | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3342 caattgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatcaaggaagcgcagaaaatggatgtcaagtttgtggatttgatggttgctagtaatc 3441  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgag 350  Q
    || | ||  ||  |||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  3442 aaactgaagatgttgacatcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 3487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 350
Target Start/End: Original strand, 30155 - 30500
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  30155 acatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcag 30254  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || |  |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||| ||||||    
T  30255 gaagacgttgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtg 30354  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||  || | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30355 caattgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatcaaggaagcgcagaaaatggatgtcaagtttgtggatttgatggttgctagtaatc 30454  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgag 350  Q
    || | ||  ||  |||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  30455 aaactgaagatgttgacatcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 30500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 102637 - 102105
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||    
T  102637 aaagattatgattttggtttgaactatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgcattgagtaggaagactttgcatatgcccgccatgatggtaa 102538  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      ||||| || ||||| ||||||||||  || |||||  | || |||||| |||||||||| |||||| || | |  |||||||||||  ||||||| ||    
T  102537 aagagttcgagttgcttgaacagtttatagatttgagcttagtctgtgaattgtcatctcagagtgtgaagctagaaatgctgaagattgatagtgaatt 102438  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||  |||||  ||||||| |  | || |||||||| || ||  | |||||     
T  102437 tctgaaaagtattaaagaagcgcagaaagtcgatgttaagtttgtagatttgttggttgatagtaatgagactgaaaatagtgattttaaaatcgatgac 102338  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    |||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||| |    
T  102337 caaggtgtgttgagattccgaggtagaatttgtattcctgacgatgaggagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatcc 102238  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |  || ||  | || ||||||||| | | ||||| |||    
T  102237 atccgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacatgatgtgtcacagtttgtgtattcctatttgatttg 102138  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  102137 tcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 102105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 7445 - 6814
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  7445 aggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagtaaga 7346  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| |||||  |  ||||||| || ||||| || || || || |||||||| ||  ||||  | || |||||   |||| |||| ||| || |  |    
T  7345 cattgcatatgtcctctatgatggttagagagttcgagttacttgatcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtctgaaact 7246  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||| || ||  ||||| |||| |||||| |     
T  7245 gggaatgctgaagattgatagtgaatttttgaaaagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagcaatcaaact 7146  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  || |||| || || || ||||| |  ||||||||||||||  |||    |||||||||||||||  |||||||  |||||||  ||||| | ||||    
T  7145 gaagatggtgattttaaagtcgatgaccttggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaag 7046  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| | |||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  7045 agagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctatgaagatgtatcatgatctaaagaagatattttggtggtctggattgaaacgcgacgttgc 6946  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgg 609  Q
     || ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||     | | || |||||||| |||||||| |||    
T  6945 acagtttgtgtattcttgtttgatttgtcataagtcgaaggttgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgg 6846  T
Q  610 gatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  6845 gatagtatatccatggattttgtgacgagttt 6814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 128 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 17993 - 17457
Alignment:
Q  128 tgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaa 227  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| | || ||  || ||||| |||| |||||| || | || ||||| |||||  |    
T  17993 tgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtatgc-aattgtcacctcatagtgtgaagctaggaatgctaaagattga 17895  T
Q  228 tagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaag 327  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||  || ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | ||  ||| ||| || ||     
T  17894 tagtgaattcttgaacagtatcaaagaagcgcagaaaattgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagataatgattttaaa 17795  T
Q  328 gttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaact 427  Q
     | ||||| || || |||||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||    
T  17794 atcgatgatcagggagtgttgagattctgaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagct 17695  T
Q  428 tgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatg 527  Q
    | ||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  | |||||  |||| || || || ||||||||| | ||    
T  17694 taagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctaggttgaaatgcgatgtggcacagtttgtgtattcctg 17595  T
Q  528 tttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggat 627  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  17594 tttgatttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgttccagagtggaaatgggatagcatatccatggat 17495  T
Q  628 tttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||| |||| ||||    
T  17494 tttgtgacgagtttgccgaacactccgaaagggaatga 17457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Original strand, 7989 - 8521
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||| ||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  7989 aaagactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaacattgcatatgtcggccatgatggtaa 8088  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| || ||| | ||||||||||| || |||||| | || |||||| |||||||||| |||||| || | |  |||||||||||  ||||||| ||    
T  8089 gagagttcgagttgtttgaacagtttagagatttgagtttagtatgtgaattgtcatctcagagtgtgaagctagaaatgctgaagattgatagtgaatt 8188  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||  | ||  ||||| ||||||||||  | ||  | ||||| || ||  | |||||     
T  8189 tctgaaaagtattaaagaagcacagaaagttgatgttaagtttgtatacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgagtttaaaatcgatgat 8288  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    |||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| |||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| | |||||  ||   ||| ||||| |    
T  8289 caaggtgtgttgagattccgaggtagaatttgtattcatgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagaatcatagaagtggcttaagtatcc 8388  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || || |||||| ||||||||| |||    
T  8389 atccgggagctacgcagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagttcgtgtattcatgtttgatttg 8488  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    | ||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  8489 ttagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 8521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 641
Target Start/End: Original strand, 38722 - 39326
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  38722 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgtgtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggtta 38821  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||||  | ||||||||   |||| |||| |||||| |  |||| || ||||||||  ||||||| ||    
T  38822 gagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtgtgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaattctgaagattgatagtgaatt 38921  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      | || ||||| | ||| |||||  |||||||||| || ||| | || ||  ||||| ||||||||||  | ||  || |||| || ||| |||||||     
T  38922 tctaaaaagtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaattttttagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaagcttgatgac 39021  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || ||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| | ||||| | |||||  || | |||||||||||    
T  39022 catggtgtgttgagattccgagatcgaatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagactcatagaagtagcttgagtattc 39121  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | || || ||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||| | |||||   |||    
T  39122 acccgggagctacaaagatgtatcatgatctgaagaaaattttatggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacaatttgtgtattcctgtttagtttg 39221  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| || || || |||     | | || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| |||||    
T  39222 tcagaagtcgaagattgaacatcagaaacccgctggtttgatggtatccttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 39321  T
Q  637 agttt 641  Q
    |||||    
T  39322 agttt 39326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 66827 - 66286
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |    
T  66827 agatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaagaagacattgcata 66728  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| || |||||||| || ||||| || || ||  ||||||| || || |||||| | || ||||||  |||| || | || ||| || |||| |||||    
T  66727 tgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacttaaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcaccttagagagtgaagctgggaatgct 66628  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| |||||||||   | ||  |  ||    
T  66627 gaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcggactgaagacggt 66528  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || || |||||||| || ||||||||||||||  |||     ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||    
T  66527 gactttaaagttgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcata 66428  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  66427 gaagtagcttgagtatccatctgggagctacgaaaatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgt 66328  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatca 560  Q
    |||  | |||||   |||||||||||| ||| |||| |||||    
T  66327 gtactcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatca 66286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 363 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 34266 - 34015
Alignment:
Q  363 aatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcat 462  Q
    |||||| ||||||||||| || ||  | || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||     
T  34266 aatttgcattcctgacaacgatgagataaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcac 34167  T
Q  463 gatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaga 562  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34166 gatttgaaaaagcttttttggtggtctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttttttatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcaga 34067  T
Q  563 agcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatag 614  Q
    | |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34066 atcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatag 34015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 630
Target Start/End: Original strand, 18120 - 18707
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  |    
T  18120 gattgtgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaag 18219  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| | || || ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||||| |||||  ||||||| |||||    
T  18220 agtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtgaattctt 18319  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||||||||||| | |||| ||  || ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | ||  || |||| || ||  | ||||| ||     
T  18320 gaatagtatcacaaaagcgcagaaaattgatgttaagtttgtggacttgttggtttctagtaatcagactgaagattgtgattttaaaatcgatgatcag 18419  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    || |||||| | ||| ||  || |||||||||||||||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||      
T  18420 ggagtgttgcgttttcgattcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacc 18519  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtc-cggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtc 538  Q
     ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||     |||| || || || ||||||||| | ||||||| |||||    
T  18520 tgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtcttggttt----tgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtc 18615  T
Q  539 agaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
      ||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||   ||||| || ||| | |  ||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  18616 caaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcagcgttgatgacacctttagatatactagagtgaaaatgggatagcatatccatggatttt 18707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 64 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 50809 - 50304
Alignment:
Q  64 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagttta 163  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |    
T  50809 catccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcacatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagttca 50710  T
Q  164 gggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcacaac 262  Q
      || |||||  | || ||||| ||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||| | |||||| |||     
T  50709 aagatttgagcttagtttgtgagatgtcatctaagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaagagtattaaagaagcgcaaa 50611  T
Q  263 aagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaa 362  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||  | ||  | ||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |     
T  50610 aagttgatgttaagtttgtagacttgttggttactagtaatcagactgaagacagtgattttaaaattgatgatcaaggtgtattgaggtttcgaggtag 50511  T
Q  363 aatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcat 462  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||    
T  50510 aatttgtattccagaagatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccat 50411  T
Q  463 gatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaga 562  Q
    ||| | |||||| | ||||||||||| || ||||| || || || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  50410 gatctaaagaagttattttgctggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgcgtattcttgtttgatttgccagaagtcgaaagttgagcatcaga 50311  T
Q  563 agcctgc 569  Q
    | |||||    
T  50310 aacctgc 50304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 20006 - 19474
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  20006 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 19907  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||||  | || |||||   || | |||| | |||| |  |||| |||||||||||  ||||||| ||    
T  19906 gagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggttacctcagaatgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatt 19807  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||   |||| ||||||||||  | ||  || |||| || ||||| |||||     
T  19806 tctgaagagtatcaaagaagcacagaaagttgatgttaagtttgtagacttgtcggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgac 19707  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || ||||||||||||||  |||    |||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | | | |||||||    
T  19706 catggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcctaagtattc 19607  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    |  ||| |||||| || |||||||||||| |||||||  | || || |||||  | ||||| ||| | ||  | || ||||||||| | ||||||  |||    
T  19606 acccggcagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaaatattctggtggtctagattgaaacgcaatgtgacacagtttgtgtattcctgtttggtttg 19507  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  19506 tcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgc 19474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 35430 - 34898
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  35430 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 35331  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||||  | || |||||   || | |||| | |||| |  |||| |||||||||||  ||||||| ||    
T  35330 gagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggttacctcagaatgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatt 35231  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||   |||| ||||||||||  | ||  || |||| || ||||| |||||     
T  35230 tctgaagagtatcaaagaagcacagaaagttgatgttaagtttgtagacttgtcggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgac 35131  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || ||||||||||||||  |||    |||||||||||||||  |||||||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | | | |||||||    
T  35130 catggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcctaagtattc 35031  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    |  ||| |||||| || |||||||||||| |||||||  | || || |||||  | ||||| ||| | ||  | || ||||||||| | ||||||  |||    
T  35030 acccggcagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaaatattctggtggtctagattgaaacgcaatgtgacacagtttgtgtattcctgtttggtttg 34931  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  34930 tcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgc 34898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 7450 - 6849
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  |    
T  7450 gattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaag 7351  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    |||| || ||||| ||| |||| || || |||||  | |||||| ||||||||||| |||||||| || | || |||||||||||  ||| ||| ||  |    
T  7350 agttcgagttgcttgaatagttcagagatttgagcttagtgtgttaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttct 7251  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||  |||| ||||  |  |  | ||||| || ||  | ||| | |||    
T  7250 gaaaagtattaaagaggcacaaaaagttgatgttaagtttgtggacttgttagttgttagtgatcagactaaagacagtgattttaaaatcgataatcaa 7151  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    |||||  |||| ||| |||     ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| || ||||  || |||||||||||||||     
T  7150 ggtgtactgaggttttgaggtcggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatc 7051  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||| || || ||||||||| | || |||| ||||||    
T  7050 cgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaagttgttttggtggtccggattgaaatgcgacgttgcacagtttgtgtattcttgcttgatttgtca 6951  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  ||     | |||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||    
T  6950 gaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgcctgagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagt 6851  T
Q  640 tt 641  Q
    ||    
T  6850 tt 6849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 306
Target Start/End: Original strand, 3538 - 3780
Alignment:
Q  64 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagttta 163  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  3538 catccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagtttgaattgttagaacagttca 3637  T
Q  164 gggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtg-atttcttgaatagtatcagagaagcacaac 262  Q
    | || |||||| | || ||||||||||||||| | |||||| || | || |||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||| | |||||| ||      
T  3638 gagatttgagtttggtatgtgaaatgtcatctaagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtgtatttc-tgaaaagtattaaagaagcgcaga 3736  T
Q  263 aagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaa 306  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  ||||| | |||||||||    
T  3737 aagttgatgttaagtttgttgacttcttggttgcaagtaatcaa 3780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 17058 - 16527
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17058 aaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaa 16959  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtg-att 235  Q
      |||||||||||  | ||||||||||| || |||||  | || || |||||||||||| | |||||| |  | || |||||||||||  |||||| |||    
T  16958 aagagtttgaattattggaacagtttagagatttgaggttagtttgcgaaatgtcatctaagagtgtgaacctaggaatgctgaagattgatagtgtatt 16859  T
Q  236 tcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatga 335  Q
    ||| ||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  ||||||| || ||  | |||||    
T  16858 tct-gaaaagtattaaagaagcacagaaagttgatgttaaggttgtagacttgttggttgctagtaatcagacagaagatagtgattttaaaatcgatga 16760  T
Q  336 gcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtatt 435  Q
     |||||||| ||||| ||| |||  | |||||| ||||| ||| |||  ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||    
T  16759 tcaaggtgtcttgaggtttcgaggtagaatttgcattccagacgatg-tgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatt 16661  T
Q  436 cattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgactt 535  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||| | || ||| | ||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | ||||||| ||    
T  16660 catccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaagttattttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcttgtttgattt 16561  T
Q  536 gtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  16560 gtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgc 16527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 544
Target Start/End: Original strand, 25873 - 26353
Alignment:
Q  64 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagttta 163  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| || ||| | ||||||||||    
T  25873 catccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagttcgagttgttggaacagttta 25972  T
Q  164 gggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaaca 263  Q
    | || |||||| | || ||||||||||||||| | |||||| || | || ||| |||||||  ||||||| ||  | |  ||||| | |||||||||  |    
T  25973 gagatttgagtttagtctgtgaaatgtcatctaagagtgtgaagctaggaatgttgaagattgatagtgagtttctaagaagtattaaagaagcacagaa 26072  T
Q  264 agttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaa 363  Q
    |||||||||||||||||| || ||  | ||| ||||||||||  | ||  | ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||| |||  | |    
T  26073 agttgatgttaagtttgtagacttgttagttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggtaga 26172  T
Q  364 atttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatg 463  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  |  | ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  26173 atttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaaatagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 26272  T
Q  464 atttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagt 544  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||| ||| | ||||||| |||||||||||    
T  26273 atttgaaaaagttattttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtatattcttgtttgatttgtcagaagt 26353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 641
Target Start/End: Original strand, 31655 - 32259
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||| | || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||    
T  31655 aaagattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaa 31754  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||| | || ||  |  |||||||| |||||||| || |||| ||||| |||||  ||| ||| ||    
T  31755 aagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcaagttgtcatcttaaagtgtgaagctgggaatgctaaagattgataatgaatt 31854  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||| | |||||| ||  |||||||||| |||||||| || ||  | ||| ||||||||||  | ||  ||||||| || ||  | |||||     
T  31855 tctgaaaagtattaaagaagcgcagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttagttgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgat 31954  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    |||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || ||||||||||| |    
T  31955 caaggtgtgttgagattccgaggtagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtatcc 32054  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | | ||| | |||    
T  32055 atccgggagctacgaagatgtatcatgatgtgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctatttaatttg 32154  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    | ||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||     | | || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  32155 tgagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtatctttagatgtaccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacg 32254  T
Q  637 agttt 641  Q
    |||||    
T  32255 agttt 32259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Original strand, 12397 - 12614
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||  | || || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12397 acatgaggcagaggagatggttagaactgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtag 12496  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||||||  |||| ||||| || |  ||||| |  || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| || || |||| ||| |     
T  12497 gaagacgctgcatatgtctgcttgaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtatt 12596  T
Q  205 cagttgggtatgctgaag 222  Q
    |||||||| |||||||||    
T  12597 cagttggggatgctgaag 12614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 641
Target Start/End: Original strand, 115807 - 116411
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||  | || ||||| ||  ||||| | |    
T  115807 aaagattatgattttggattgaattatcatccaggtaaggctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgatca 115906  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      ||| | ||  |||||||||||||||| ||| ||||| | || |||||| ||||| |||| |||||| |||| || ||||||| |||  ||||||| ||    
T  115907 aagagctggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgatgattgatagtgaatt 116006  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      ||| | |||| | ||| |  ||  |||||||||| |||||||| |||| | |  ||  | | |||||  | ||  ||||||| || ||||| |||||     
T  116007 tatgattggtattaaagaggtgcataaagttgatgtaaagtttgtagattcatttattggtggaaatcagactgaagatagtgactttaaggtcgatgat 116106  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || || |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| ||||| |  || | |||||||||||    
T  116107 cagggagtgttgcgatttcgaggcagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattc 116206  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| ||||||||| ||     
T  116207 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcgcagtttgtgtattcatgtttgatttc 116306  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| |||||  |||||   ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| |||||    
T  116307 tcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgctaggttgatgacacctttagaagtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 116406  T
Q  637 agttt 641  Q
    |||||    
T  116407 agttt 116411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 440 - 667
Target Start/End: Original strand, 17842 - 18069
Alignment:
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  17842 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagatgttgttttggtggtctgggttaaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtta 17941  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||    
T  17942 gaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcaggattgttgacaccgttagatgtggcagagtgaaagtgggacagcatttccatggatttcgtaacgagt 18041  T
Q  640 ttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18042 ttaccgaacactccgagagggcatgatg 18069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 113; Significance: 7e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 640
Target Start/End: Original strand, 85424 - 86023
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||| || |    
T  85424 gattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttattgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggttagag 85523  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||  | || |||||| | || || ||| ||||||||||   ||| || ||    
T  85524 agtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgcagagtgtgaaattaggaatgttgaagatcaacgatgaattttt 85623  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
     || | ||||| |||||| ||    || ||||| ||||| || |||||||| |||   |  ||||   | ||  ||||||| || || ||| |||| |||    
T  85624 taacactatcaaagaagctcagatggtagatgtgaagttggtagatttaatagttgggaagaatcggactgaagatagtgattttaaagtttatgatcaa 85723  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    || | |||| | | | |  | | |||||||||||||||  ||  |||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||     
T  85724 ggagcgttgcggtctcggaatagaatttgtattcctgatgatacagaaatgaaaaagatgattttggaagaaagtcacataagcaatttgagtatttatc 85823  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| || || || || |||||| |||| ||||| | ||||||    
T  85824 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaag-ttatttggtggtccgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgcatgcgtgtttaatttgtca 85922  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagt 639  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || ||||| ||  |||||||||||||||  || || ||||||||| ||||||||    
T  85923 gaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgctgggttgttgacacctttagatgttccaaagtggaagtgggataatatatccatggattttgtgacgagt 86022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 263 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 4318 - 3940
Alignment:
Q  263 aagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaa 362  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | ||| ||||||| || |  |||||||| ||||||||| |||||||| ||| |      
T  4318 aagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaggatagtgactttagagttgatgaccaaggtgtgctgagatttcgaggccg 4219  T
Q  363 aatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcat 462  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||  | |||||| ||||||| ||||| |||||||  || | |||||||||||||| |||| |||| || ||||||||     
T  4218 aatttgtattcatgacgatgatgagattaagaagatgattttggaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatttgggatctaccaagatgtatcac 4119  T
Q  463 gatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaga 562  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||| | ||| ||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||    
T  4118 gatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacaatttatttattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcaga 4019  T
Q  563 agcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    | ||||||||| ||   ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  4018 aacctgcagggctgatgacacctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagttt 3940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4534 - 4380
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||| || || |    
T  4534 agatggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcaaacggttaaagctaatgttgttgcggataccttaagtaggaagactttacata 4435  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgag 173  Q
    |||| ||  ||||||| | ||||||||| || || ||||| |||||||| |||||    
T  4434 tgtctgctatgatggttaaggagtttgagtttcttgaacaatttagggatttgag 4380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 569
Target Start/End: Original strand, 7236 - 7765
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||  |||| ||  |||||||||  |    
T  7236 gattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttgcatttgtctgctatgatggtaaaag 7335  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    |||| || ||||| |||||||| || || |||||| | |||||||||||||||| | |||||||| || | || |||||||||||   || ||| ||  |    
T  7336 agttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtgtgtgaaatgtcatttgaaagtgtgtagctaggaatgctgaagattggtaatgaatttct 7435  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| ||||| | ||| |||||  |||  |||||||||||||| || ||  |||||  |||  ||||  | ||  | ||||| || ||  | ||||| |||    
T  7436 gaaaagtattaaagaggcacataaagccgatgttaagtttgtagacttgttggttgttagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaa 7535  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    |||||  |||| ||| |||  |  ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| || ||||  || |||||||||||||||     
T  7536 ggtgtactgaggtttcgaggtaggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatc 7635  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtca 539  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||| | ||||||| |||| |    
T  7636 cgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtta 7735  T
Q  540 gaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7736 gaagtcgaaggttgaacatcagaaacctgc 7765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 2646 - 2137
Alignment:
Q  64 catccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagttta 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||| |||||| || ||||| ||| |||| |    
T  2646 catccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaatagttca 2547  T
Q  164 gggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaaca 263  Q
    | || |||||| | || ||||||||||||||| |||||||| || | || || ||||||||  ||| ||| ||  |||| ||||| | |||||| ||| |    
T  2546 gagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaattctgaagattgataatgaatttctgaagagtattaaagaagcgcaaaa 2447  T
Q  264 agttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaa 363  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||  | ||  ||||||| || ||  | ||||| |||||||||||||| ||| |||  |      
T  2446 agttgatgttaagtttgtgtacttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtagg 2347  T
Q  364 atttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata---ag-agcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtat 459  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||| | |||||||   || || ||||||||||||||| |||||||| | || |||||     
T  2346 atttgtcttccagacgatgacgagatgaagaaaatgattcttgaatagagtcatatatagaagtaacttgagtattcatccgggagctccgaagatgtag 2247  T
Q  460 catgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatc 559  Q
    |||||| | |||||| ||||||| ||||| || |||||  ||||||| || || ||||||||| | ||||| | |||||||||||| |||| ||| | ||    
T  2246 catgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaatgcgacgttgcacagtttgtgtattcttgttttatttgtcagaagtcgaaggatgagcgtc 2147  T
Q  560 agaagcctgc 569  Q
    |||| |||||    
T  2146 agaaacctgc 2137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 3
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||| |||||    
T  164 tatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagt 65  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    | || ||||| ||| |||| || || |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  64 tcgagttgcttgaatagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtg 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 641
Target Start/End: Original strand, 4557 - 5097
Alignment:
Q  100 agtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaa 199  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||| || ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| | || || ||| ||||  | || |    
T  4557 agtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggttagagagttggagttgcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgcgaagtgtcgccgcaga 4656  T
Q  200 gtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactag 299  Q
    ||||| | || || ||||||||| || | ||||| || ||||||||||||| |||||| ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||   |     
T  4657 gtgtgaaattaggaatgctgaaggtccacagtgaatttttgaatagtatcaaagaagctcagaaggcagatgtgaagttggtagatttaatggttgggaa 4756  T
Q  300 taatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttg 399  Q
     |||||  | ||  ||||||| || || |||||||| ||||| |||||| | ||| |  |   ||||||||||||||| |||  |||| |||| ||| ||    
T  4757 caatcagactgaagatagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaattgaatttgtattcctgataatacagaaatgaaaaagatg 4856  T
Q  400 attttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagc 499  Q
    ||| | ||||||||||| |  || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||    
T  4857 attctggaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcacgatttgaagaagttattttggtggtccgggttaaagc 4956  T
Q  500 gcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccgga 599  Q
    | || || || || ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||  || | |||||||  ||||| || ||| | || ||    
T  4957 gagatgttgcacaatttgtgtatgcatgtttaatttgtcagaagtcgaaggttgaacatcacaaaacttctgggttgttgacacctttagatattccaga 5056  T
Q  600 gtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  5057 gtggaagtgggatagtatatc-atggattttgtgacgagttt 5097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 8770 - 8166
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  8770 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 8671  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||| | || || |||  |||| || | |||||| |  ||||||||||||||||  |||||||  |    
T  8670 gagagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcaccttagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaaat 8571  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| |||||||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||  | ||| | ||  |||   | ||  | | ||| || ||  | |||||     
T  8570 tctgaaaagtatcaaggaagcgcagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttagttgcaagagatcggactgaagacaatgattttaaaatcgatgat 8471  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    |||||||||||||||||  |||  | |||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| | ||| | |||||||||||    
T  8470 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtattc 8371  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || ||||||||| | ||| |   |||    
T  8370 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtctagtttg 8271  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    ||||||||| || || || |||||||| ||||| ||  ||     ||| || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||| |||||    
T  8270 tcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacg 8171  T
Q  637 agttt 641  Q
    |||||    
T  8170 agttt 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 569
Target Start/End: Original strand, 79381 - 79928
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  79381 tggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagaaagacattgcatatgt 79480  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    | ||| ||||||| || ||||| || || || || |||||||| ||  ||||  | || |||||   |||| |||| |||||| |  | || ||| ||||    
T  79481 ccgccatgatggttagagagttcgagttacttgagcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactaggaatgttgaa 79580  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaa 321  Q
    |||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||  ||||||||||  | ||  |  |||||    
T  79581 gattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtcaagtttgtagacttattggtagctagtaatcagactgaagaaggtgaa 79680  T
Q  322 ttcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 421  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||  |||||||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  |    
T  79681 tttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattacgagatcaaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaa 79780  T
Q  422 gcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgta 521  Q
    | | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| || ||||| || || || || || ||||||||    
T  79781 gtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgagatgtggcacagtttgtgta 79880  T
Q  522 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |   |||||   |||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  79881 tttgtgtttattttgtcataagtcgaagatcgaacatcagaaacctgc 79928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 522
Target Start/End: Original strand, 4258 - 4740
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| || |    
T  4258 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgaatatgtccgctttgatggttagag 4357  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    |||| || |||||  |||||||||| ||  ||||  | || |||||   |||| |||| |||||| || |||| |||||||||||  ||||||| ||  |    
T  4358 agttcgagttgcttaaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtgaatttct 4457  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
     || ||||||| |||||||||  |||||||||| |||||| | || ||  ||||| ||||||||||  | ||  || |||| || ||||||||||| ||     
T  4458 aaagagtatcaaagaagcacagaaagttgatgtcaagtttttagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggttgatgaccat 4557  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    ||||||||||||||  |||    |||||| ||||||||| |||||||  ||||||   ||||| | |||||  ||||||  || | ||||||||||||      
T  4558 ggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgcattcctgacgatgaagagatgaagataatgattcttgaagagggtcatagaagtagcttgagtattcacc 4657  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtat 522  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||    
T  4658 cgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattttggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtat 4740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 2297 - 1780
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||  ||||  || ||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2297 aaagattatgattttgagttgagctatcatctaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaa 2198  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      |||||||||||| | |||| ||| || ||  ||||| | || |||||| |||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||  ||| ||| ||    
T  2197 aagagtttgaattgttggaacggttgagagatatgagtttagtatgtgaattgtcatctcagagtgtgaaactaggtatgctgaagattgataatgaatt 2098  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||  | ||| ||||||||||  | ||  | | ||| || ||  | |||||     
T  2097 tctgaaaagtattaaagaagcgcagaaagttgatgttaagtttgtagacttggtagttgctagtaatcagactgaagacaatgattttaaaatcgatgat 1998  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    ||||||||||| |||||  |||  | |||||||||||  ||| |||| ||  |||||||| ||||| |  |||| |||||||  || | |||||||||||    
T  1997 caaggtgtgttcagattccgaggtagaatttgtattctagacgatgaggagatgaagaagatgattctcaaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 1898  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||  | ||||| || || || || || ||||||||| |  |||||| |||    
T  1897 atccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaaaaagttattttggtgatctaggttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattctggtttgatttg 1798  T
Q  537 tcagaagtctaaggttga 554  Q
    ||||||||| || |||||    
T  1797 tcagaagtcgaaagttga 1780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 1745 - 1693
Alignment:
Q  589 gatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  1745 gatgtgccagagtggaagtgggatagtatatccatggattttgtgacgagttt 1693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 13872 - 13340
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||    
T  13872 aaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgtcgcagatgccttaagcaggaaaactttgcatatgtccgccatgatggtaa 13773  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| | || || ||| ||||| |||| |||||| || | || ||||| |||||| ||||||| ||    
T  13772 aagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctaggaatgctaaagatcgatagtgaatt 13673  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatca-agcggagaatagtgaattcaaggttgatga 335  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||  || || |||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||| |  |||| |  |||| || || || |||||    
T  13672 cttgaacagtatcaaagaagcgcagaaaattaatgttaagtttgtggacttgttggatgctagtaatcagactggag-acggtgactttaaagtcgatga 13574  T
Q  336 gcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtatt 435  Q
     || || |||||||||||  |||     ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||    
T  13573 ccacggcgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatt 13474  T
Q  436 cattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgactt 535  Q
    ||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | || || ||||| ||||||||  | || || || || ||||||||| | |||||   ||    
T  13473 catccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaatgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagttt 13374  T
Q  536 gtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  13373 gtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgc 13340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 68 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 6594 - 6093
Alignment:
Q  68 cgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttaggga 167  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||  ||||||||| |||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  6594 cgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagttcagaga 6495  T
Q  168 cttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagtt 267  Q
     |||||| | || ||||||||||||||| |||||||| || | || ||||||| |||  ||| ||| || ||||| ||||| | |||||||||  |||||    
T  6494 tttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaggattgataatgaatttttgaagagtattaaagaagcacagaaagtt 6395  T
Q  268 gatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaattt 367  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  | ||||| || ||  | |||||  ||||||||||||  ||| |||  |  ||||    
T  6394 gatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgataaaggtgtgttgaagtttcgaggtaggattt 6295  T
Q  368 gtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgattt 467  Q
    | ||||  |||||||| ||  |||||||  ||||| | |||||||||||||  || | ||||||||| |||  ||||||||  || ||||| || ||| |    
T  6294 gcattctagacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatctgggagctatgaagatgtaccacgatct 6195  T
Q  468 gaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcct 567  Q
     |||||| ||||||  |||||  | ||||| ||||| || || || ||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  6194 aaagaagttgttttagtggtctagattgaaacgcgatgttgcacaatttgtgtattcttgtttgacttgttagaagtcgaaggttgagcatcagaaacct 6095  T
Q  568 gc 569  Q
    ||    
T  6094 gc 6093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 398 - 1
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  398 acatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcag 299  T
Q  105 gaagacattgcacat----gtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaag 200  Q
    ||| |||||||| ||    ||| || |||||||| | ||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||    
T  298 gaaaacattgcatatatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgctataacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagag 199  T
Q  201 tgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagt 300  Q
    | | |||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||| ||| | |||||||| ||||| |||  | |  ||    
T  198 tatacagttggggatgctgaagatttattgtgatttcttgaacagtatccgagaagctcagaaagtggatttgaagtttgttgatttgatgacttcaggt 99  T
Q  301 aatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagtt 398  Q
    ||| |  | ||| ||||||| || | ||||||||| || |||||| |||| || ||||  | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  98 aatgacactgaggatagtgactttatggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagtt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 3594 - 3066
Alignment:
Q  41 attatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggga 140  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |  ||    
T  3594 attatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttacagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaaga 3495  T
Q  141 gtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttg 240  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| || |||||  | || |||||  |||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||  ||||| | ||  ||    
T  3494 gttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagttgtcatctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtaaatttctg 3395  T
Q  241 aatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaag 340  Q
    || | |||||  ||||||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| | ||||||||  | ||  || |||| || ||||| ||||| || |    
T  3394 aaaactatcaaggaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgccagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatg 3295  T
Q  341 gtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattc 440  Q
    |||||||||||||  |||    |||||||||||||||  |||||||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||       
T  3294 gtgtgttgagattccgaggtttaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacct 3195  T
Q  441 gggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcag 540  Q
    ||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||||  |||||||    
T  3194 gggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcag 3095  T
Q  541 aagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  3094 aagtcgacgattgaacatcagaaacctgc 3066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 641
Target Start/End: Original strand, 6793 - 7397
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| ||  ||||| | |    
T  6793 aaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcattaagtaggaagactctacatatgtccgctatgatgatca 6892  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      ||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||  | || || ||| ||||| || | |||||| |||| || ||| |||||||   |||||| ||    
T  6893 aagagttggagctgcttgaacagtttagagacttgagcttagtctgcgaagtgtcaccttagagtgtgaagttaggaatgatgaagattgttagtgaatt 6992  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||  | ||  ||| ||| || ||||| |||||     
T  6993 cttgaacagtattaaagaagcgcagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcagactgaagataatgactttaaggtcgatgat 7092  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || || |||||| | ||| |||  | ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||| | ||||| ||||| |  || | ||||||||| |    
T  7093 cagggagtgttgcgtttttgaggtagaatttgtattccttacgatgatgaaatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatcc 7192  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||  | ||||| || || || ||  | ||||| ||| ||||||||  |||    
T  7193 atccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatgttttggtggtctcggttgaaacgtgatgtggcatagtttgtatattcatgtttggtttg 7292  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacg 636  Q
    ||||||||| || || || |||||||| ||||  ||||||     | | || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||     
T  7293 tcagaagtcaaaagtggagcatcagaaacctgttgggttgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgaca 7392  T
Q  637 agttt 641  Q
    |||||    
T  7393 agttt 7397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 503
Target Start/End: Original strand, 14116 - 14579
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| ||  |||||||||  |    
T  14116 gattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccatgcatatgtctgctatgatggtaaaag 14215  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttctt 239  Q
    |||| || ||||| |||||||| || || |||||  | |||||||||||||||| | || ||||| || | || |||||||||||  ||| ||| ||  |    
T  14216 agttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatatgaacgtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgagtttct 14315  T
Q  240 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaa 339  Q
    ||| ||||| | ||| |||||  ||| |||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||| | ||  | | |||||| ||  | ||||| |||    
T  14316 gaaaagtattaaagaggcacagaaagctgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcaaactgaagacaatgaatttaaaatcgatgatcaa 14415  T
Q  340 ggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatt 439  Q
    |||||| |||| ||| |||     ||||||||||||||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| || ||||  || |||||||||||||||     
T  14416 ggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatc 14515  T
Q  440 cgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcga 503  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  14516 cgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcga 14579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 139 - 639
Target Start/End: Original strand, 19006 - 19506
Alignment:
Q  139 gagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttct 238  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || || |||||  | |||||||||||||||| | || ||||| || | || |||||||||||  ||| ||| ||      
T  19006 gagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatatgaacgtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgagtttc 19105  T
Q  239 tgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagca 338  Q
    |||| ||||| | ||| |||||  ||| |||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||| | ||  | | |||||| ||  | ||||| ||    
T  19106 tgaaaagtattaaagaggcacagaaagctgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcaaactgaagacaatgaatttaaaatcgatgatca 19205  T
Q  339 aggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcat 438  Q
    ||||||| |||| ||| |||     ||||||||||||||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| || ||||  || |||||||||||||||    
T  19206 aggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcat 19305  T
Q  439 tcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtc 538  Q
     |||||||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||||||||| ||||||| ||| |    
T  19306 ccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacggtttgtgtatgcttgtttgatttgcc 19405  T
Q  539 agaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgag 638  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |   |||    | |||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||||||| |||||||    
T  19406 agaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctgatatgttggtatcgttagatgttccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgag 19505  T
Q  639 t 639  Q
    |    
T  19506 t 19506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 131477 - 130979
Alignment:
Q  70 ggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggact 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||  ||||| || ||||| |||||||| || || |    
T  131477 ggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatt 131378  T
Q  170 tgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttga 269  Q
    ||||  | | |||||| ||||| ||| |||||||| || | || |||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||||| | ||| |||||  ||| |||    
T  131377 tgagcttagggtgtgagatgtcgtctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaattc-tgaaaagtattaaagaggcacagaaagctga 131279  T
Q  270 tgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgt 369  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||  | ||  | ||||| || ||  | ||||| ||||||||  |||| ||| |||     ||||||    
T  131278 tgttaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtactgaggtttcgaggtcggatttgt 131179  T
Q  370 attcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttga 469  Q
    ||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| || ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||| | |    
T  131178 attcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagcaacttgagtattcatccgggagctacgaagaggtatcatgatctaa 131079  T
Q  470 agaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||| | |||||||| |||||    
T  131078 agaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgacgttgcaaagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgatggttaagcatcagaaacctgc 130979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 641
Target Start/End: Original strand, 3358 - 3963
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    |||||||| |||||| | || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||  |  ||||||| |    
T  3358 aaagattacgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtcttctatgatggtta 3457  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| | || || ||| | |||||  | |||||| || |||| ||||| |||||  ||| | | ||    
T  3458 aagagttttaattgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattttcatcatagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgataataaatt 3557  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaa-gcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatga 335  Q
    | | || ||||| | |||| ||| |  ||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||| ||||||  | ||   |||||| || ||  | ||||     
T  3558 cctaaaaagtattaaagaaagcatagaaagttgatgttaagtttgtagacttggtggttgctaataatcagactgaaggtagtgattttaaaatcgatgc 3657  T
Q  336 gcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtatt 435  Q
     ||||||| |||||||||  |||  | ||||||||||||||||  ||| ||  |||| ||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||    
T  3658 tcaaggtgcgttgagattccgaggtagaatttgtattcctgacggtgatgagatgaaaaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatt 3757  T
Q  436 cattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgactt 535  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | ||||| | ||    
T  3758 catctgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcctgtttaattt 3857  T
Q  536 gtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgac 635  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||||  ||| ||     | | || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  3858 gtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgttgggatgatggtatctttagatgttccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgac 3957  T
Q  636 gagttt 641  Q
    ||||||    
T  3958 gagttt 3963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 60159 - 59529
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| || ||||  |   |||||||    
T  60159 taaaggattatgatttcggattgaattaccatccgggtaagggtaatgttgttgcagatgctttaaataggaaaacattacatatgtttgatatgatggt 60060  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgat 234  Q
     |  ||||| || ||||| ||||| || |  || |||||| | || |||||| ||||  |  | |||||| | || || |||||||||||||| | |||     
T  60059 ta--gagttggagttgcttgaacaattcaaagatttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgtagagtgtgaaattaggaatgctgaagatcaacaatgaa 59962  T
Q  235 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatg 334  Q
    ||  |||||||||||| | |||  ||  |||  ||||| ||||| || || |||||||||   |  |||||  |  |  ||||||| || || |||||||    
T  59961 tttctgaatagtatcaaataagatcagaaagaagatgtgaagttagtagacttaatggttgggaacaatcagactaaagatagtgattttaaagttgatg 59862  T
Q  335 agcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtat 434  Q
    | ||||| |||||| | ||| |  | | |||||||||||||||  ||  |||| |||||||| ||||| | ||||||||||| |  || || ||||||||    
T  59861 atcaaggagtgttgcggtttcggaatagaatttgtattcctgatgatacagaaatgaagaagatgattatggaagaaagtcacagaagtaatttgagtat 59762  T
Q  435 tcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgact 534  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||  | || || || |||| |||||| ||||| | |    
T  59761 tcatccgggagctacaaaaatgtatcaagattttaagaagttattttggtggtccgggttgaagcgacatgtggcacaatttgggtatgcgtgtttaatt 59662  T
Q  535 tgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatga 634  Q
    ||||||||||  || | |||||| ||||| ||| | |||||||  ||||| || ||| | |  ||||||||||||||||| || || ||||||||| |||    
T  59661 tgtcagaagttaaaagatgaacaccagaaacctactgggttgttgacacctttagatattcgagagtggaagtgggatagtatatccatggattttgtga 59562  T
Q  635 cgagtttacaaaacactccgagagggcatgatg 667  Q
    ||| ||| | ||| ||||| | ||| |||||||    
T  59561 cgattttgccaaatactccaaaaggacatgatg 59529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 164
Target Start/End: Original strand, 28273 - 28397
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaggg 139  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||| || |    
T  28273 gattatgactttggtttcaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattccttgagttggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagag 28372  T
Q  140 agtttgaattgctcgaacagtttag 164  Q
    ||||  | || || |||||||||||    
T  28373 agttctagtttcttgaacagtttag 28397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 641
Target Start/End: Original strand, 28601 - 28878
Alignment:
Q  364 atttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatg 463  Q
    |||||||||||| || ||| ||| ||||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||    
T  28601 atttgtattccttacgatgtagagttgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatg 28700  T
Q  464 atttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    ||   |||||| | || |  | ||| |  ||||| || || || || || ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28701 atccaaagaagattttatagttgtctgtattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaa 28800  T
Q  564 gcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
     || || ||  ||     | | || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  28801 acccgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagttt 28878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 626
Target Start/End: Original strand, 55347 - 55391
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  55347 accgttgtttgtgccagaatggaagtgggatagcatttctatgga 55391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Original strand, 177149 - 177432
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| || || ||||    
T  177149 tggcttgagttgttgaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgtcgttgcagaagctttaagcaggaagacgttacatatgt 177248  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    | ||  ||||||| |  || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  177249 ctgctatgatggttaaagaattagaattgctagaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaa 177348  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatca 305  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||    
T  177349 gatcaatagtgaattcttgaacagtattaaagaagcataaaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatca 177432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 426 - 665
Target Start/End: Original strand, 25010 - 25249
Alignment:
Q  426 cttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgca 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| ||    
T  25010 cttgagtattcattagggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattca 25109  T
Q  526 tgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgg 625  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  | || ||||    
T  25110 tgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgttgggttgttgacaccgttagatgtgccgtagtggaaatgggatagtgtatccatgg 25209  T
Q  626 attttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatga 665  Q
    ||||| | |||||||| |  || ||||| |||||||||||    
T  25210 attttgtcacgagtttgccgaatactccaagagggcatga 25249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Original strand, 23087 - 23307
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |  || || |||||  |  ||||||| |    
T  23087 aaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaattttacatatgtctcctatgatggtta 23186  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||| | || |||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||    
T  23187 aagagttggagctgctcgaatagtttagacacttgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtgaatt 23286  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagc 257  Q
     || |||||||| | ||||||    
T  23287 ttttaatagtattaaagaagc 23307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 96595 - 96345
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  96595 aggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaaga 96496  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    || |||| ||||| ||  ||||| |||  || ||||| || || ||||||||||| ||| ||||| | || |||||  |||| |||||||  || |||||    
T  96495 cactgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgattttctggaacagtttagagacatgagtttggtttgtgagttgtcgtctcaaatcgtacagtt 96396  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 260  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  96395 ggggatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagcaca 96345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8825 - 8364
Alignment:
Q  13 cagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 112  Q
    ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8825 cagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 8726  T
Q  113 tgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttggg 212  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| || ||||| || || || |||||||| || ||  ||||| | || || |||  |||| |||| |||||| |  ||||    
T  8725 tgcatatgtccgctatgatggtgagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactggg 8626  T
Q  213 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggag 312  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||  |||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||  | ||     
T  8625 tatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatcaaggaagcaaagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaa 8526  T
Q  313 aatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaa 412  Q
     | | ||| || ||  | ||||  |||||||||||||||||   ||  | |||||||||||| ||||||| |||  | | |||| ||||| | ||||| |    
T  8525 gacaatgattttaaaatcgatggtcaaggtgtgttgagattccaaggaagaatttgtattccagacaatggagagattacgaagatgattcttgaagaga 8426  T
Q  413 gtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaag 474  Q
    ||||||  || ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  8425 gtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaag 8364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 49476 - 49319
Alignment:
Q  148 ttgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagta 247  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||  | |||||||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||||  ||| ||| ||  |||| ||||    
T  49476 ttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgagtttctgaaaagta 49377  T
Q  248 tcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatca 305  Q
    | | ||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||    
T  49376 ttaaagaggcacaaaaagctgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagtgatca 49319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 88 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 1049 - 574
Alignment:
Q  88 gcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaa 187  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||| |||||| || ||||| |||||||| || || |||||| | || || || |    
T  1049 gcagatgctttaagtaggaagaccttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagttaagagatttgagtttagtctgcgaga 950  T
Q  188 tgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggattt 287  Q
    |||||||| |||||||| || | || || |  |||||  ||| ||| ||  |||| ||||| | ||| |||||  || |||||||||||||||| || ||    
T  949 tgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatccaaaagattgataatgaatttctgaaaagtattaaagaggcacataaaattgatgttaagtttgtagagtt 850  T
Q  288 aatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaa 387  Q
      ||||  ||||||||||  | ||| ||||||| || ||  | ||||| |||| ||||||||| ||| |||  |  |||| |||||| ||| | || ||     
T  849 gttggtggctagtaatcagactgaggatagtgattttaaaatcgatgatcaagctgtgttgaggtttcgaggtaggatttctattccagacgacgatgag 750  T
Q  388 ttgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggt 487  Q
     |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || ||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  749 atgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgattattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggt 650  T
Q  488 ccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    | || ||||| | ||| || || || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  649 ctggattgaaacacgatgttgcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaa 574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 28369 - 27937
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||  ||||| ||||| ||    
T  28369 acatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaggccaatgtggttgttgatgcattgagcag 28270  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| |||||||| ||||| || || ||||| |  || ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||| |     
T  28269 gaaaacattgcatatgtctgctttaatggtgaaagaatttgaattgttagaaaagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtata 28170  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatc 304  Q
    |||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||| | | |||| ||||||| ||  | || ||| | || || || ||||| |||  |||| ||| |     
T  28169 cagttggggatgctgaaaattgatagtaatttcttggacaatatccgagaagctcagaaggtagatttgaaattggttgatttgatgactactggtagtg 28070  T
Q  305 aagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttt 404  Q
    | || ||||| ||||| |||||| |||||||  | |||||  ||||||| ||||  | | |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |    
T  28069 acgctgagaacagtgatttcaagattgatgattagggtgtactgagattcagaggaagagtttgtattcctgacaacgatgaattgaggaagttgattct 27970  T
Q  405 agaagaaagtcataagagcaacttgagtattca 437  Q
     ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  27969 tgaagagagtcacaagagtagattgagtattca 27937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 1963 - 1548
Alignment:
Q  154 gaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagag 253  Q
    ||||| ||||| || |||||| | || ||||| ||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||    
T  1963 gaacattttagagatttgagtttggtatgtgagatgtcatctgatagtgtgaagttaggaatgttgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaag 1864  T
Q  254 aagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatt 353  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | ||  | ||||| || ||  | || || |||||||||||||||||    
T  1863 aagcacagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacgatcaaggtgtgttgagatt 1764  T
Q  354 tagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaa 453  Q
    |||||  |  ||||||||||  ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| ||||||   || |  |||||||||||| |||||||||| ||     
T  1763 tagaggaaggatttgtattctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcattgaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaag 1664  T
Q  454 atgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttg 553  Q
    ||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||| || |||||||| || || || |  ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  1663 atgcaccatgatttgaagatgttgttttgatggtctggattgaagcgtgatgttgcacggtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttg 1564  T
Q  554 aacatcagaagcctgc 569  Q
    | |||||||| |||||    
T  1563 agcatcagaaacctgc 1548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Original strand, 15369 - 15652
Alignment:
Q  22 tggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 121  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  15369 tggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccatgtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgt 15468  T
Q  122 cggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaa 221  Q
    |  |  |||||||||  |||||||| || || |||| |||||| || |||||| | || || ||  ||||  |||| |||||| ||||||| ||||| |     
T  15469 ccactatgatggtaaaagagtttgagttacttgaacggtttagagatttgagtttagtttgcgatttgtcccctcagagtgtgaagttgggaatgctaag 15568  T
Q  222 gatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatca 305  Q
    |||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||  || ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||    
T  15569 gattgatagtgaattcttgaacagtatcaaagaagcgcataaaattgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatca 15652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 641
Target Start/End: Original strand, 15742 - 15922
Alignment:
Q  454 atgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttg 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |  || || || || ||||||||| | ||||||| |||||| ||||       ||    
T  15742 atgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacatgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcaaaagt-------tg 15834  T
Q  554 aacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    | |||||||| ||||||| | ||   ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  15835 agcatcagaaacctgcagcgatgatgacacctttagatgtaccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagttt 15922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 224
Target Start/End: Original strand, 7561 - 7742
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||    
T  7561 tatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagt 7660  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagat 224  Q
    | || ||||| |||||||| || || |||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||| || |||||||||||    
T  7661 tcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtatgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagttagggatgctgaagat 7742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 263 - 641
Target Start/End: Original strand, 11325 - 11703
Alignment:
Q  263 aagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaa 362  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||   | ||  ||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||  |     
T  11325 aagtagatgttaagtttgtggatttgttggttgctagtaatccgactgaagatagtgacttcaaagtcgatgatcaaggagtgttgagattctgaggtag 11424  T
Q  363 aatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcat 462  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||  |||||||| ||| | |  |||| ||||| |  || | ||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  11425 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcat 11524  T
Q  463 gatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaga 562  Q
     ||||||||| | ||||||| |||||  | |||||  |  | || || || ||||||||| | ||||||  |||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  11525 tatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagtaatgtggcacaatttgtgtattcctgtttgctttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcaga 11624  T
Q  563 agcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    | ||||||||||||   ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  11625 aacctgcagggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaaatgggatagaatatccatggattttgtgacgagttt 11703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 263 - 641
Target Start/End: Original strand, 17517 - 17895
Alignment:
Q  263 aagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaa 362  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||   | ||  ||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||  |     
T  17517 aagtagatgttaagtttgtggatttgttggttgctagtaatccgactgaagatagtgacttcaaagtcgatgatcaaggagtgttgagattctgaggtag 17616  T
Q  363 aatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcat 462  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||  |||||||| ||| | |  |||| ||||| |  || | ||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  17617 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcat 17716  T
Q  463 gatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaga 562  Q
     ||||||||| | ||||||| |||||  | |||||  |  | || || || ||||||||| | ||||||  |||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  17717 tatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagtaatgtggcacaatttgtgtattcctgtttgctttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcaga 17816  T
Q  563 agcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    | ||||||||||||   ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  17817 aacctgcagggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaaatgggatagaatatccatggattttgtgacgagttt 17895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 641
Target Start/End: Original strand, 13983 - 14585
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||  | || ||||| ||  ||||| | |    
T  13983 aaagattatggttttgggttgaattatcatcctagtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgatca 14082  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtga-tt 235  Q
      ||||| ||  |||||||||||||||  ||| ||||| | || |||||  ||||| |  | |||||| |||| || |||| ||||||  ||||||| ||    
T  14083 aagagttggagctgctcgaacagtttaaagacctgagtttagtttgtgagttgtcaccatagagtgtgaagttaggaatgcagaagattgatagtgaatt 14182  T
Q  236 tcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatga 335  Q
    |||| ||| |||| | |||||| ||  |||| ||||| |||||||| |||||| | |||    | |||||  | ||  ||||||| || ||||| |||||    
T  14183 tctt-aat-gtattaaagaagcgcagaaagtcgatgtaaagtttgtagatttatttgttggggg-aatcagactgaagatagtgactttaaggtcgatga 14279  T
Q  336 gcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtatt 435  Q
     || || |||||| | ||| ||| || |||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| ||||| |  || | ||||||||||    
T  14280 tcagggagtgttgcggtttcgaggcagaatttgtattcctgactatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatt 14379  T
Q  436 cattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgactt 535  Q
    |||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |  || ||  | || ||||||||| ||||||||| ||    
T  14380 catcagggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacatgatgtgacacagtttgtgtattcatgtttgattt 14479  T
Q  536 gtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttatgac 635  Q
    || ||||||| || |||||  ||||||| ||||  ||||||   ||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||    
T  14480 gttagaagtcaaaagttgagtatcagaaacctgttgggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaaatgagatagtatatccatggaatttgtgac 14579  T
Q  636 gagttt 641  Q
    ||||||    
T  14580 gagttt 14585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 563
Target Start/End: Original strand, 3289 - 3833
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  3289 agatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgagcaggaagacattgcata 3388  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| || |||||||| || ||||| || || |  |||||||| || || |||||| |||| ||||||   ||| || | |  ||| |  |||| |||||    
T  3389 tgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacctgaacagttcagagaattgagtttcgtttgtgaatgatcaccttagaaagtgaaactgggaatgct 3488  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||    ||  |  ||    
T  3489 gaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagaatgaagacggt 3588  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||||||  |||     ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||    
T  3589 gaatttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcata 3688  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | |||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  3689 gaagtagcttgagtattcatctgggtgctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 3788  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    |||| | ||||||  |||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  3789 gtattcctgtttggtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaa 3833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Original strand, 29473 - 29717
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  29473 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtta 29572  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||  | || |||||   ||||||||| |||||| |  |||  |||||||||||  ||||||| ||    
T  29573 aagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcatctcagagtgtgaaactggaaatgctgaagattgatagtgaatt 29672  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgt 281  Q
     ||||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  29673 tttgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtcaagtttgt 29717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 10018 - 9474
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  10018 agatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgagcaggaagacattgcata 9919  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| || |||||||| || ||||| || || |  |||||||| || || |||||| |||| ||||||   ||| || | |  ||| |  |||| |||||    
T  9918 tgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacctgaacagttcagagaattgagtttcgtttgtgaatgatcaccttagaaagtgaaactgggaatgct 9819  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||    ||  |  ||    
T  9818 gaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagaatgaagacggt 9719  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||||||  |||     ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||    
T  9718 gaatttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcata 9619  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | |||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  9618 gaagtagcttgagtattcatctgggtgctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgt 9519  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    |||| | ||||||  |||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  9518 gtattcctgtttggtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaa 9474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 563
Target Start/End: Original strand, 32448 - 33001
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  32448 aggcagtgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaaga 32547  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||| |||||  | |||||||| |  ||||| || || |  ||||| || || || |||||| | || ||||||  |||| |||| |  ||| |  |    
T  32548 cgttgcatatgtccactttgatggtcaaagagttcgagttaccggaacaattcagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaact 32647  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||| | || ||  ||||| ||||||||||  |     
T  32648 gggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtcaagtttctagacttgttggttgctagtaatcagact 32747  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  |  |||| || || || || || || ||||||||||||||  |||     ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | || |    
T  32748 gaagacggtgactttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgagg 32847  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || ||    
T  32848 agagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggc 32947  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
     || ||||||||| | ||||||  |||||||| ||| ||| |||| ||||||||    
T  32948 acagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaggtcaaagattgagcatcagaa 33001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 26378 - 25846
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  26378 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 26279  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| || || ||  | |||||||| ||  ||||| | || |||||   |||| |||| | |||| |  |||| |||||||||||  ||||||| ||    
T  26278 gagagttcgagttactttatcagtttagagatatgagttttgtttgtgattggtcacctcagattgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatt 26179  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||| ||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||  ||||| ||| ||||||  | ||  || |||| || ||||| |||||     
T  26178 tctgaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgttaagtttgtatacttgttggttgctattaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgac 26079  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || | |||||| |||||  |||   | ||||| |||||| ||  ||||||  |||||||  | ||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||    
T  26078 catgatgtgttaagattccgaggtcagatttgaattcctaacggtgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 25979  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || |||||||||| || |||||||||||| |||||| | | || || ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | | |||   |||    
T  25978 atccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagatgattttctggtggtctggattgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctatttagtttg 25879  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  25878 tcacaagtcgaagattgaacatcagaaacctgc 25846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 569
Target Start/End: Original strand, 62933 - 63465
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  62933 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtta 63032  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      | ||| || ||||| ||||||||||| || |||||  | || |||||    |||| ||| |||||  |  |||| |||||||||||  ||||||| ||    
T  63033 aagtgttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtgctcatatcagagtgtaaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatt 63132  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      || | |||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  |  |||| || || || ||  |     
T  63133 tctgcaaagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagaaggtgactttaaagtcgaaaaa 63232  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    |||||||||||||||||  |||    |||||| ||||||||| |||||||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||||    
T  63233 caaggtgtgttgagattacgaggtcgaatttgaattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 63332  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    |  |||||||||| || |||||||| ||| | |||||| | || || ||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||| | |||| |  |||    
T  63333 acccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcgcagtttgtgtattcctgttaggtttg 63432  T
Q  537 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  63433 tcagaagtcgaagattgaacataagaaacctgc 63465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 109061 - 108857
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||    
T  109061 aggcagagaagatggcttgagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaaga 108962  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    | ||||||||||| ||  |||||||||  || ||||| || || ||  ||||||| ||||||||||| || |||||  ||||| |||| || || |||||    
T  108961 cgttgcacatgtctgctatgatggtaaatgattttgagtttctagattagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagcgtacagtt 108862  T
Q  210 gggta 214  Q
    |||||    
T  108861 gggta 108857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 1704 - 1934
Alignment:
Q  5 acatcaggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtag 104  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  1704 acatgaggcagaggagatggttatagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcag 1803  T
Q  105 gaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtg 204  Q
    ||| |||||||| ||||| || || ||| |||  || || |||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||| |     
T  1804 gaaaacattgcatatgtctgctttaatgataaaagaattcgaattgttagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtata 1903  T
Q  205 cagttgggtatgctgaagatcaatagtgatt 235  Q
     ||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  1904 tagttggggatgctgaagattgatagtgatt 1934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 545
Target Start/End: Original strand, 18969 - 19477
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |||||||  |    
T  18969 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaatacattgcatatgtccactttgatgggta 19068  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
    | ||||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||  | || |||||   |||| |||| |||||| |  |||| || ||||||||  ||||||| ||    
T  19069 gagagttcgaattccttgaacggtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatactgaagattgatagtgaatt 19168  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
     ||||| ||||| |  || |||||| ||||||||||  ||||||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  || |||| || || ||||||||     
T  19169 tttgaagagtattaatgaggcacaaaaagttgatgtccagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagttgatgac 19268  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || |||| |||||| ||  |||     ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||| | |||||||  || | |||||||||||    
T  19269 catggtgcgttgaggttccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaatagagtcatataagtagcttgagtattc 19368  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttg 536  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| | || || ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | |||||   |||    
T  19369 atccgggagctacaaagatgtatcatggtttaaagaagatcttctggtggtctggattgaaacgtgatgtagcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 19468  T
Q  537 tcagaagtc 545  Q
    |||||||||    
T  19469 tcagaagtc 19477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 57439 - 56895
Alignment:
Q  19 agatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcaca 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  57439 agatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgctttgagcaggaagacattgcata 57340  T
Q  119 tgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgct 218  Q
    |||| || || ||||| || ||||| || || || |||||||| || || |||||| | || ||||||  |||| |||| |  ||| |  |||| |||||    
T  57339 tgtccgcttttatggtcagagagttcgagtttcttgaacagttcagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgct 57240  T
Q  219 gaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagt 318  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| ||||| | ||| ||| |  |||||||||| |||||||| |||||  ||||| ||||||||||  | ||  |  ||    
T  57239 gaagattgatagtgaatttatgaagagtattaaagaggcaaagaaagttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagacggt 57140  T
Q  319 gaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata 418  Q
    || || || || || || || ||||||||||||||  |||     ||||  ||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||    
T  57139 gactttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttacattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcata 57040  T
Q  419 agagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgt 518  Q
      || | ||||||||| ||  |||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || || || || || |||||    
T  57039 gaagtagcttgagtatccacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacaatttgt 56940  T
Q  519 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    |||| | |||||   |||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  56939 gtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaaattgagcatcagaa 56895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 563
Target Start/End: Original strand, 196353 - 196906
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||    
T  196353 aggcagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcggacgccttgagtaggaaga 196452  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||  ||||| | || |||||   |||| |||| |||||| |  |    
T  196453 cattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttgcttgaacaatttagagatatgagtttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaact 196552  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcg 309  Q
    ||| ||| |||||||   |||||| ||  |||| ||||| | ||  | |||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||  |     
T  196553 gggaatgttgaagattggtagtgaatttctgaaaagtattaaaggggtacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagact 196652  T
Q  310 gagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaag 409  Q
    ||  || |||| || || |||||||| ||  |||||||||||||  |||     ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | || |    
T  196653 gaagatggtgactttaaagttgatgaccatcgtgtgttgagattccgaggtcgtatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgagg 196752  T
Q  410 aaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgc 509  Q
    | || ||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| || ||||| || || || ||    
T  196753 agagccatagaagtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttatggtggtctggattgaaacgagatgtggc 196852  T
Q  510 tcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
      | ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  196853 atagtttgtgtattcttgtttggtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaa 196906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24871 - 24555
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| |    
T  24871 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaagactctacatatgtccgctttgatggtta 24772  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||  | || |||||   ||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||  ||||||| ||    
T  24771 aagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcatctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatt 24672  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      | || |||||||  ||||||||| |||||||||  |||| ||| || ||  ||||| ||||||||||  | ||  || |||| || ||||| |||||     
T  24671 tctaaaaagtatcaaggaagcacaaaaagttgatggcaagtgtgtagacttgctggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgac 24572  T
Q  337 caaggtgtgttgagatt 353  Q
    || ||||||||||||||    
T  24571 catggtgtgttgagatt 24555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 24497 - 24370
Alignment:
Q  442 ggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaga 541  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||| | || || |||||    ||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  24497 ggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagatattctggtggtctaaattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcaga 24398  T
Q  542 agtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    |||| | | ||||||||||||| |||||    
T  24397 agtcgatgattgaacatcagaaacctgc 24370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1822 - 1626
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  1822 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggtta 1723  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtga 233  Q
    | |||||||| || || |||||||| || || |||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| |  |||| |||||||||||  |||||||    
T  1722 gagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtga 1626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15562 - 15366
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  15562 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggtta 15463  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtga 233  Q
    | |||||||| || || |||||||| || || |||||| | || ||||||  |||| |||| |||||| |  |||| |||||||||||  |||||||    
T  15462 gagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtga 15366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2834 - 2572
Alignment:
Q  43 tatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagt 142  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||||| |||||    
T  2834 tatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagttaatgttgttgcggatgctttgagtaggaagactttacatatgtctgctatgatggtaaaggagt 2735  T
Q  143 ttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaa 242  Q
    | || || || |||||||| |  || |||||| | || ||||||||||||||| | |||||| || | || |||||||||||  ||| ||| || |||||    
T  2734 tcgagttacttgaacagttcaaagatttgagtttagtatgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaatttttgaa 2635  T
Q  243 tagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatca 305  Q
     ||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||    
T  2634 gagtattatagatgcacagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatca 2572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 430 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 2478 - 2339
Alignment:
Q  430 agtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtt 529  Q
    |||||| || |||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| || || || || || || || || ||||||||| | ||||    
T  2478 agtattgatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaactattttggtggtctggattaaaacgggatgtggcacagtttgtgtattcttgtt 2379  T
Q  530 tgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  2378 tgatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgc 2339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 61; Significance: 8e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 517 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 12418 - 12294
Alignment:
Q  517 gtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtctacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagca 616  Q
    |||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  12418 gtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcaaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgatgacaccgttagatgtaccagagtggaaatgggatagca 12319  T
Q  617 tttctatggattttatgacgagttt 641  Q
    | || ||||||||| ||||||||||    
T  12318 tatccatggattttgtgacgagttt 12294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 39810 - 39539
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaaga 109  Q
    |||||| | |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||    
T  39810 aggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgctttgagcagtaaga 39711  T
Q  110 cattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagtt 209  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| || |||||| | || || |||||||| || || |||||| | || ||||||  |||| |||| |  ||| |  |    
T  39710 cattgcatatgtccgctttgatggtcagagagtttaagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaact 39611  T
Q  210 gggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgt 281  Q
    ||| |||||||||||  ||| ||| ||  |||| ||||| | ||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  39610 gggaatgctgaagattgataatgaatttctgaagagtattaaagaggcacagaaagttgatgtcaagtttgt 39539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 161
Target Start/End: Original strand, 38848 - 38974
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| | ||||| ||  |||||||    
T  38848 taaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttggatatgtctgctatgatggt 38947  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtt 161  Q
    || |||||| || ||||| ||||||||    
T  38948 aaaggagttcgagttgcttgaacagtt 38974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 449
Target Start/End: Original strand, 39132 - 39217
Alignment:
Q  364 atttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctac 449  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39132 atttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtaacttgagtattcatccgggagctac 39217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39963 - 39774
Alignment:
Q  35 taaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggt 134  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||| |||||||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  39963 taaaagattatgattttgagttgagctatcatccggttaaagctaatgttgttgcagacactctgagtgggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 39864  T
Q  135 aagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagat 224  Q
    || |||||| || ||||| |||||||| || || |||||  | || | ||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||||    
T  39863 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtttttgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagat 39774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 480
Target Start/End: Original strand, 9918 - 10361
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaa 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  || |||||||| ||  | || ||||| ||  ||||| | |    
T  9918 aaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtatagccaatgttgttgcagatgaattaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgatca 10017  T
Q  137 gggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaaatgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgattt 236  Q
      || || ||  |||| ||||||||| | || |||||| | || |||||| ||||| |  | |||||| |||| || |||||||||||  ||||||| ||    
T  10018 aagaattggagctgcttgaacagttttgagatttgagtttagtctgtgaagtgtcaccctagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtgaatt 10117  T
Q  237 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgaattcaaggttgatgag 336  Q
      |||||||||| | |||||| ||| |||  ||||| |||||||| |||||| |  ||  | | || ||  | ||  ||||||| || ||||| || ||     
T  10118 tctgaatagtattaaagaagcgcaaaaagcggatgtaaagtttgtagatttatttattggtggaaaccagactgaagatagtgactttaaggtcgacgat 10217  T
Q  337 caaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattc 436  Q
    || || |||||| ||||  ||  || |||||||||||||||| | || ||  |||||||  ||||| | ||||| ||||| |  || | ||||||||| |    
T  10218 cagggagtgttgcgattccgaagcagaatttgtattcctgacgacgatgacatgaagaaaatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatac 10317  T
Q  437 attcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttt 480  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10318 atccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttt 10361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 116
Target Start/End: Original strand, 12894 - 12973
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgca 116  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12894 aaagaatatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 12973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 364 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 3451 - 3246
Alignment:
Q  364 atttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatg 463  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |    
T  3451 atttgtattccagacgatgaggagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccacg 3352  T
Q  464 atttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    || | |||||| |||| || ||||| || ||||| || || || || || ||||||||| | ||||||| ||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  3351 atctaaagaagttgttctggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaattgaaggttgagcatcagaa 3252  T
Q  564 gcctgc 569  Q
     |||||    
T  3251 acctgc 3246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 569
Target Start/End: Original strand, 1 - 128
Alignment:
Q  442 ggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaga 541  Q
    |||||||| || |||||||||||| | |||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||| | | ||||| ||||||||    
T  1 ggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtattcttatttgatttgtcaga 100  T
Q  542 agtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
    | || |||||||| |||||||| |||||    
T  101 aatcgaaggttgagcatcagaaacctgc 128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 607 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 49606 - 49547
Alignment:
Q  607 tgggatagcatttctatggattttatgacgagtttacaaaacactccgagagggcatgat 666  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49606 tgggatagcatttctatggattttgtggcgagtttaccaaacactccgagagggcatgat 49547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 77 - 19
Alignment:
Q  10 aggcagaggagatggctcgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatcc 68  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  77 aggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcc 19  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0719 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0719
Description:

Target: scaffold0719; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 522
Target Start/End: Original strand, 8 - 321
Alignment:
Q  209 tgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagc 308  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| || |||| |||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||  |||| ||    
T  8 tgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagcacatagagttgatgtaaagtttgtggatttgctggttgccagagatcaggc 107  T
Q  309 ggagaatagtgaattcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagagacaaaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaa 408  Q
     ||  |  |||| || ||  | |||||  |||| |||||||||||  |||  | |||||||||||| ||||| |||||  | |||||| ||||| | |||    
T  108 tgaagacggtgattttaaaatcgatgatgaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacaacgaagagattaagaagatgattcttgaa 207  T
Q  409 gaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcg 508  Q
    || |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| || || || |    
T  208 gagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtgg 307  T
Q  509 ctcattttgtgtat 522  Q
    | || |||||||||    
T  308 cacagtttgtgtat 321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 563
Target Start/End: Original strand, 3043 - 3242
Alignment:
Q  364 atttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatg 463  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  3043 atttgtattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatg 3142  T
Q  464 atttgaagaagctgttttgctggtccggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    || |||||||  | || || ||||| || | ||| ||||| || || || ||||||| | | ||||||  |||||||||||| |||  ||||| ||||||    
T  3143 atctgaagaaaattttctggtggtctggatcgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtgttcttgtttggtttgtcagaagtcgaagactgaacgtcagaa 3242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 116
Target Start/End: Original strand, 23975 - 24054
Alignment:
Q  37 aaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgca 116  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23975 aaagattatgactttaggttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagacattgca 24054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 389 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 22919 - 22739
Alignment:
Q  389 tgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttgctggtc 488  Q
    |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||    
T  22919 tgaagaaaatgattcttgaagagagtcatataagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaaaattttttggtggtc 22820  T
Q  489 cggtttgaagcgcgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgc 569  Q
     |||||||| || || || || || ||||| ||| | |||||   |||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  22819 tggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtatattcctgtttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacctgc 22739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 1477 - 1358
Alignment:
Q  378 caatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctg 477  Q
    |||||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| |     
T  1477 caatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagatt 1378  T
Q  478 ttttgctggtccggtttgaa 497  Q
    || || ||||| ||||||||    
T  1377 ttctggtggtctggtttgaa 1358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Original strand, 3322 - 3370
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3322 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 3370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 24253 - 24205
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24253 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 24205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 626
Target Start/End: Original strand, 3391 - 3435
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3391 accgttgtttgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 3435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 44397 - 44349
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44397 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 44349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 15515 - 15471
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15515 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggataacatttctatgga 15471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 398 - 343
Alignment:
Q  40 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgc 95  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  398 gattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttgttgcagatgc 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10659 - 10561
Alignment:
Q  76 gctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagt 174  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||||| | || |||||| | |||||||||    
T  10659 gctaatgttgttgccgatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagttttgagacttgagt 10561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 592 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 4007 - 3969
Alignment:
Q  592 gtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4007 gtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 3969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 473
Target Start/End: Original strand, 51 - 161
Alignment:
Q  363 aatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcattcgggagctacaaaaatgtatcat 462  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||  | ||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||||  |||||||||| || |||| ||||    
T  51 aatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtttcat 150  T
Q  463 gatttgaagaa 473  Q
    ||| |||||||    
T  151 gatctgaagaa 161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8630 - 8532
Alignment:
Q  76 gctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagt 174  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||||| | || |||||| | |||||||||    
T  8630 gctaatgttgttgccgatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagttttgagacttgagt 8532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 582 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 45356 - 45312
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45356 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 45312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 582 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 47013 - 46969
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47013 accgttgtttgtgcctgagtggaagtgggatagcatttctatgga 46969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 582 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 460
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttt 630  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  508 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagtatttctatggatttt 460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25327 - 25229
Alignment:
Q  76 gctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttgagt 174  Q
    |||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |  |||||||||||| | || |||||| | |||||||||    
T  25327 gctaatgtcgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaatgagtttgaattgattgagcagtttcgagacttgagt 25229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 514 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 24807 - 24758
Alignment:
Q  514 tttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaa 563  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24807 tttgtgtatgcttgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaa 24758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 6018 - 5990
Alignment:
Q  598 gagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6018 gagtggaagtgggatagcatttctatgga 5990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 18906 - 18862
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18906 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagtatttctatgga 18862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 13767 - 13723
Alignment:
Q  582 accgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 626  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13767 accgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagtatttctatgga 13723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University