View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8909_low_6 (Length: 568)

Name: NF8909_low_6
Description: NF8909
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8909_low_6
NF8909_low_6
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (14-554)||(15739819-15740359)
chr4 (13-554)||(19754860-19755405)
chr4 (13-554)||(19784401-19784946)
chr4 (13-554)||(23642593-23643134)
chr4 (13-554)||(47685897-47686438)
chr4 (25-554)||(13270893-13271422)
chr4 (13-554)||(47418402-47418942)
chr4 (22-554)||(7403518-7404051)
chr4 (269-554)||(1828542-1828827)
chr4 (13-384)||(159863-160234)
chr4 (21-335)||(20788501-20788815)
chr4 (20-523)||(12697417-12697920)
chr4 (19-172)||(17402070-17402223)
chr4 (20-370)||(4548405-4548755)
chr4 (72-397)||(8360756-8361081)
chr4 (13-78)||(43019538-43019603)
chr4 (41-121)||(11587633-11587713)
chr4 (13-88)||(8890620-8890695)
chr4 (24-111)||(23163076-23163163)
chr4 (13-99)||(16427146-16427232)
chr4 (21-255)||(46145280-46145514)
chr4 (20-121)||(2822472-2822573)
chr4 (21-114)||(19740482-19740575)
chr4 (20-120)||(48311694-48311794)
chr4 (20-120)||(54483595-54483695)
chr4 (420-523)||(55725719-55725822)
chr4 (462-523)||(45472742-45472803)
chr4 (21-121)||(5790523-5790623)
chr4 (19-115)||(55726034-55726130)
chr4 (297-408)||(20002599-20002710)
chr4 (462-523)||(8361146-8361207)
chr4 (467-523)||(20002776-20002832)
chr4 (21-121)||(36223524-36223624)
[»] chr3 (30 HSPs)
chr3 (13-554)||(34332817-34333358)
chr3 (13-554)||(2363874-2364415)
chr3 (21-554)||(19920231-19920764)
chr3 (13-554)||(7312374-7312914)
chr3 (20-554)||(40930530-40931064)
chr3 (13-554)||(10323573-10324114)
chr3 (24-510)||(7031926-7032412)
chr3 (21-254)||(50651650-50651883)
chr3 (13-99)||(10312975-10313061)
chr3 (72-397)||(36801234-36801559)
chr3 (14-523)||(26771022-26771528)
chr3 (21-255)||(963464-963698)
chr3 (21-255)||(3140457-3140691)
chr3 (20-514)||(7031059-7031553)
chr3 (13-99)||(15827308-15827394)
chr3 (20-523)||(11203423-11203926)
chr3 (20-523)||(29523778-29524281)
chr3 (20-115)||(48570480-48570575)
chr3 (28-114)||(15312194-15312280)
chr3 (20-370)||(33496151-33496501)
chr3 (242-372)||(35214555-35214685)
chr3 (13-67)||(926718-926772)
chr3 (14-115)||(11310640-11310741)
chr3 (223-523)||(12342259-12342558)
chr3 (20-184)||(30695715-30695879)
chr3 (458-522)||(33496589-33496653)
chr3 (14-121)||(19890276-19890383)
chr3 (19-186)||(53184907-53185074)
chr3 (20-116)||(12342667-12342763)
chr3 (467-523)||(35214404-35214460)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (14-554)||(13395986-13396526)
chr8 (12-550)||(32266160-32266698)
chr8 (14-554)||(41665371-41665911)
chr8 (13-554)||(7923983-7924524)
chr8 (13-554)||(8299400-8299941)
chr8 (14-554)||(171701-172241)
chr8 (19-554)||(9922204-9922739)
chr8 (13-384)||(20496681-20497052)
chr8 (13-341)||(32567480-32567807)
chr8 (14-370)||(5181267-5181624)
chr8 (339-523)||(13200046-13200230)
chr8 (24-119)||(34137400-34137495)
chr8 (20-523)||(37433736-37434239)
chr8 (14-478)||(2529484-2529948)
chr8 (273-523)||(20824153-20824403)
chr8 (273-523)||(2170197-2170449)
chr8 (20-121)||(25089990-25090092)
chr8 (273-523)||(43270307-43270557)
chr8 (308-508)||(34137011-34137211)
chr8 (20-103)||(29733403-29733486)
chr8 (20-370)||(17699086-17699436)
chr8 (21-114)||(12257893-12257986)
chr8 (21-114)||(12265285-12265378)
chr8 (14-115)||(13199721-13199822)
chr8 (462-523)||(17699528-17699589)
chr8 (20-121)||(20823900-20824001)
chr8 (20-120)||(13879923-13880023)
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (13-554)||(11277254-11277796)
chr7 (12-554)||(37919140-37919682)
chr7 (25-554)||(47876592-47877121)
chr7 (13-554)||(29967572-29968113)
chr7 (13-554)||(4938130-4938671)
chr7 (27-554)||(235439-235968)
chr7 (19-554)||(17720247-17720773)
chr7 (13-440)||(31177421-31177848)
chr7 (13-139)||(38890137-38890263)
chr7 (22-523)||(37254364-37254865)
chr7 (338-523)||(25619381-25619566)
chr7 (21-114)||(48394509-48394602)
chr7 (273-358)||(18530367-18530452)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (13-554)||(51052077-51052618)
chr1 (13-554)||(11909107-11909648)
chr1 (13-554)||(35540646-35541187)
chr1 (13-554)||(6050199-6050741)
chr1 (14-357)||(6259415-6259758)
chr1 (14-351)||(4841997-4842339)
chr1 (13-280)||(26059488-26059755)
chr1 (14-241)||(12813519-12813746)
chr1 (14-275)||(13351912-13352173)
chr1 (20-370)||(43387971-43388321)
chr1 (308-522)||(47623111-47623323)
chr1 (13-104)||(24547518-24547609)
chr1 (24-121)||(47623500-47623597)
chr1 (297-523)||(37191243-37191469)
chr1 (21-254)||(2490817-2491050)
chr1 (20-379)||(16917986-16918345)
chr1 (28-114)||(6478131-6478217)
chr1 (462-523)||(16917842-16917903)
chr1 (467-523)||(43388418-43388474)
chr1 (14-121)||(37192362-37192469)
chr1 (14-88)||(37297967-37298041)
chr1 (462-514)||(22191823-22191875)
chr1 (69-121)||(28351379-28351431)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (13-553)||(23237980-23238521)
chr5 (13-554)||(12824796-12825337)
chr5 (13-554)||(30732316-30732857)
chr5 (13-538)||(8227623-8228148)
chr5 (13-554)||(42513317-42513858)
chr5 (14-554)||(27117163-27117703)
chr5 (19-554)||(35983793-35984327)
chr5 (13-450)||(12820055-12820492)
chr5 (19-554)||(28535677-28536212)
chr5 (14-554)||(42927729-42928269)
chr5 (14-523)||(19255155-19255665)
chr5 (19-384)||(3418386-3418751)
chr5 (13-320)||(25824608-25824915)
chr5 (19-171)||(31641360-31641512)
chr5 (21-253)||(32228409-32228641)
chr5 (417-554)||(31641513-31641649)
chr5 (20-523)||(25857457-25857960)
chr5 (21-252)||(33169263-33169494)
chr5 (20-523)||(8300215-8300718)
chr5 (14-377)||(18359270-18359632)
chr5 (20-523)||(27766647-27767149)
chr5 (308-523)||(33385407-33385622)
chr5 (21-114)||(26072498-26072591)
chr5 (49-114)||(27166394-27166459)
chr5 (462-522)||(10776810-10776870)
chr5 (20-120)||(27795087-27795187)
chr5 (25-121)||(29142409-29142505)
chr5 (315-397)||(10776663-10776745)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (13-554)||(105845-106386)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (42-554)||(4551795-4552307)
chr2 (41-523)||(41206631-41207123)
chr2 (14-523)||(15917251-15917761)
chr2 (14-523)||(17764995-17765504)
chr2 (14-523)||(12645134-12645643)
chr2 (306-521)||(28252610-28252825)
chr2 (20-115)||(40176274-40176369)
chr2 (24-121)||(28252329-28252426)
chr2 (20-115)||(33516225-33516320)
chr2 (273-379)||(11000127-11000233)
chr2 (20-121)||(44022966-44023067)
chr2 (19-114)||(44472961-44473056)
chr2 (21-118)||(15391748-15391845)
chr2 (13-55)||(40914380-40914422)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (14-531)||(12733723-12734240)
chr6 (21-554)||(24767426-24767959)
chr6 (14-387)||(21167823-21168196)
chr6 (21-554)||(18651236-18651769)
chr6 (265-554)||(2553486-2553775)
chr6 (19-358)||(5734439-5734778)
chr6 (11-180)||(18789255-18789424)
chr6 (412-554)||(21168194-21168337)
chr6 (24-521)||(14373026-14373523)
chr6 (14-523)||(15958846-15959356)
chr6 (20-523)||(17579114-17579616)
chr6 (20-523)||(17606367-17606870)
chr6 (21-255)||(13937305-13937539)
chr6 (273-523)||(20883066-20883316)
chr6 (273-523)||(17573688-17573938)
chr6 (20-523)||(21630140-21630645)
chr6 (26-121)||(32536505-32536600)
chr6 (14-116)||(11462013-11462115)
chr6 (20-211)||(10929649-10929840)
chr6 (308-523)||(10577282-10577497)
chr6 (273-379)||(11462270-11462375)
chr6 (49-121)||(20883465-20883537)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (14-554)||(11207-11747)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (226-554)||(3062-3390)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (11-180)||(5788-5957)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (42-114)||(6451-6523)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 554
Target Start/End: Original strand, 15739819 - 15740359
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  15739819 acataaaagcgggctcgaccaccactgttgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttagccaccacaaagaagttgatttcactttatctagc 15739918  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  15739919 atttgtggcaaagtactttgtctatttctaaaaagccgattattcatttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagacc 15740018  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15740019 gtctccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 15740118  T
Q  314 tggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaa 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15740119 tggccataaggcaccaaaagttagacaagacaaaaacaaatgattaacatctttaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaa 15740218  T
Q  414 atgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatta 513  Q
    ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15740219 atgccacggcttgtcaaattattttttgtaggtaaccgatctcgcaaaagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatta 15740318  T
Q  514 agtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15740319 actccatattatggtgtaactggggctgctcctatgatgtc 15740359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Original strand, 19754860 - 19755405
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19754860 gacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtacaaaaactaaatacagcattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctaa 19754959  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  19754960 catttgtggcagagtaccttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttc-ttccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 19755058  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccc--taccactcctagccatgctcgcac 310  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  19755059 cgtcgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaacaatgatctgaagttgattgagattcgacccctataccactcctagccatgcccgcac 19755158  T
Q  311 caatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacagg- 409  Q
    || || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||     
T  19755159 cattgaccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgctcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggt 19755258  T
Q  410 --taaaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgcc 507  Q
      ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19755259 aataaaatgtcacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcc 19755358  T
Q  508 aaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    ||||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||    
T  19755359 aaattaactccatatgatgatgaaattggggctgctcttgtgatgtc 19755405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 19784946 - 19784401
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19784946 gacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtacaaaaactaaatacagcattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctaa 19784847  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  19784846 catttgtggcagagtaccttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttc-ttccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 19784748  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccc--taccactcctagccatgctcgcac 310  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  19784747 cgtcgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaacaatgatctgaagttgattgagattcgacccctataccactcctagccatgcccgcac 19784648  T
Q  311 caatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacagg- 409  Q
    || || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||     
T  19784647 cattgaccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgctcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggt 19784548  T
Q  410 --taaaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgcc 507  Q
      ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19784547 aataaaatgtcacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgcc 19784448  T
Q  508 aaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    ||||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||    
T  19784447 aaattaactccatatgatgatgaaattggggctgctcttgtgatgtc 19784401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 23643134 - 23642593
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  23643134 gacataaaagagggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctag 23643035  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  23643034 caattgaggcacggtactttatctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 23642935  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagcc-atgctcgcacc 311  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  23642934 cgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcacc 23642836  T
Q  312 aatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggta 411  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| || |||||| ||| ||||| ||    
T  23642835 atcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagata 23642736  T
Q  412 aaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaat 511  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23642735 gaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaat 23642636  T
Q  512 taagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23642635 taagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 23642593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 47686438 - 47685897
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  47686438 gacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttgtctag 47686339  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    || ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || ||||||    
T  47686338 catttgtggcaaagtacttagtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacactgaaacacaaagcaaccaaatcaagtgaaagaaagac 47686239  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacca 312  Q
    |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||||    
T  47686238 cgtcaccctcttgaacaacctgcataattaataaattgcaccaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactcctaaccaatcccgcacca 47686139  T
Q  313 atggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaa 412  Q
      |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| |||    
T  47686138 tcggccataatgcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaacgagaaacatcttcgacattcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagataa 47686039  T
Q  413 aatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatt 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47686038 aatgccacggtttgccaaattatgttttgtaggtaaccgatctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaatt 47685939  T
Q  513 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47685938 aagtccagattatggtgtaacttgggctgctcttgtgatgtc 47685897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 25 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 13271422 - 13270893
Alignment:
Q  25 ggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtggcac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  13271422 ggctcgaccaccactgatgagtgccaaaaataaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctagcaattgtgtcac 13271323  T
Q  125 tgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccctctc 224  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||    
T  13271322 tttactttttctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctc 13271223  T
Q  225 aaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagcc-atgctcgcaccaatggccataag 323  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||     
T  13271222 gaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcaccatcggccataat 13271124  T
Q  324 gcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacgat 423  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| || |||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  13271123 gcaccaaaagttgcacaagacaaaaataaattagtaacatcttcgacaatcccacatccagtaactcataaccgctcctccacagatagaatgccacgat 13271024  T
Q  424 ttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 523  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  || | || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13271023 ttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacatt 13270924  T
Q  524 atggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13270923 atggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 13270893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Original strand, 47418402 - 47418942
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |     
T  47418402 gacataaaagtgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttagccaccacaacgaagttaacttcactttatcgag 47418501  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  47418502 caattgaggcactgtactttgactatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaccaccgtgacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 47418601  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagcc-atgctcgcacc 311  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |  |||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || |||| ||||||    
T  47418602 cgtcgccctctcgaacaacctgcatattgtataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacaccta-cactcctaaccaatgc-cgcacc 47418699  T
Q  312 aatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggta 411  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || | ||| || |||||| ||| | ||| ||    
T  47418700 atcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatcctgcaacgcataaccgctcctccccagata 47418799  T
Q  412 aaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaat 511  Q
     |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  47418800 gaatgccacgagttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaat 47418899  T
Q  512 taagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47418900 taagtccatactatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 47418942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 22 - 554
Target Start/End: Original strand, 7403518 - 7404051
Alignment:
Q  22 gcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa-caattgtg 120  Q
    |||||||||||||||| | |||| |  |||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  || |||||    
T  7403518 gcgggctcgaccaccaattatgaatatcaaagctaaatacaacattgcgagtttttaaccaccacaaagaatatgatttcactttatctaggcatttgtg 7403617  T
Q  121 gcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccc 220  Q
    |||  |  ||||||||||||| ||||| | | ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||    
T  7403618 gcaaagagctttgtctatttctaaaaatcttgtcattccgttcaatcgacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaaaaaagaacgtcgccc 7403717  T
Q  221 tctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccat 320  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  7403718 tctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactccgagccatgcccacaccaatggccat 7403817  T
Q  321 aaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccac 420  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  7403818 aaggcactaaaagttggacaagacaaaaacaaatgattgacatcttcaacgttcccgcatccagagacacacaaccgcgcctccaaacgtaaaatgccac 7403917  T
Q  421 gatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccat 520  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||  || | ||  |||| ||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||| | |||    
T  7403918 ggtttgccaaattcttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagagactttgaaatgaacttgtttatgccaaattaacttcat 7404017  T
Q  521 attatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7404018 attttgatgtaactggggctgctcctgtgatgtc 7404051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 269 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 1828827 - 1828542
Alignment:
Q  269 tgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1828827 tgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggtcataaagcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgatcaacatcttca 1828728  T
Q  369 acattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctcc 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1828727 acattcccacacccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattagtttttgtaggtaacctatctcgcaatagtctcc 1828628  T
Q  469 aagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1828627 aagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatgatgtaactggggctgctcctgtgatgtc 1828542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 160234 - 159863
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  160234 gacataaaagagggctcgaccaccactgatgtttgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctag 160135  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||    
T  160134 taattgtggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcatttcattccacaacaccgaaacacaaaacaaccaaatcaagtggaagaaagac 160035  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagcc-atgctcgcacc 311  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || |||| ||||||    
T  160034 cgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccacttctaaccaatgc-cgcacc 159936  T
Q  312 aatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccag 384  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  159935 atcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccag 159863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20788815 - 20788501
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttct-agcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||| || ||||    
T  20788815 agcgggttcgaccaccaattctgagtaccaaagctaaacacaacatttatgagcttttaaccaccacaaagaagatgatataaccttatctagcatttgt 20788716  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    ||||  |  ||||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| |||  ||    
T  20788715 ggcaaagagctttgtctatttctaaaaatcatgtcattccgttcattccacaacaccgaaacacaaagtaaccaaatcaagtg-aaaaaagatcgttgcc 20788617  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20788616 ctctcgaacaacctacataattaataaattgcaacaaatgatctgaagttgattgagagtcgaccccgaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 20788517  T
Q  320 taaggcaccaaaagtt 335  Q
    |||||| | |||||||    
T  20788516 taaggcgctaaaagtt 20788501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 523
Target Start/End: Original strand, 12697417 - 12697920
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  12697417 aagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttgctagctttcaaccaccacaaggtatttgattttactttatctaacaatagt 12697516  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    || |  | |||||| | |||  |||| | ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||||| ||| || || ||  | | |     
T  12697517 ggtatagaactttgacgattctgaaataacctatcattccgttctttccataaaaccgagacacattgaaaccaaatcaaatgaaataatgattgacgcg 12697616  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
     | |||||| |||||| || | ||||||||||| ||  ||||  ||  | |  ||||||||||||||| | || || ||||| || |||||||| |||||    
T  12697617 atttcaaaccacctgcatattcaataaattgcacaaagtgatcggagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggcca 12697716  T
Q  320 taaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgcca 419  Q
    ||| ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || |  ||||| |||||    | ||||| || ||| |||    
T  12697717 taatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagctataatccca 12697816  T
Q  420 cgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtcca 519  Q
    || |   |||||||   ||| |||||||| |  || | ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  12697817 cgttccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaatttca 12697916  T
Q  520 tatt 523  Q
    ||||    
T  12697917 tatt 12697920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17402223 - 17402070
Alignment:
Q  19 aaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattg 118  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||   || ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  17402223 aaagcgggctcgaccaccaattatgagtaccaaagtgaactacaacattactagcctttaactaccacaaagaagatgattttactttatctaacatatg 17402124  T
Q  119 tggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaa 172  Q
    ||| |  |  |||| ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17402123 tggtaaagagctttttctgtttctaaatagcctatcattccgttcattccacaa 17402070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4548755 - 4548405
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || || ||||| |||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  4548755 aagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttgctggctttcaaccaccacaagatatttgattttactttatctaacaatagt 4548656  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    || |  | |||||| | |||  |||| | ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||||| ||| || || || || | |     
T  4548655 ggtatagaactttgacgattctgaaataacctatcattccgttctttccataaaaccgagacacattgaaaccaaatcaaatgaaataatgatcgacgcg 4548556  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
     | |||||| |||||| || | ||||||||||| || ||||| |||  | |  ||||||||||||||| | || || ||||| || | |||||  |||||    
T  4548555 atttcaaaccacctgcatattcaataaattgcacaaaatgatctgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccacaccagaggcca 4548456  T
Q  320 taaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 370  Q
     || ||||||||| ||   ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4548455 caatgcaccaaaaattgggcaagacaaaaataaatgattcacatcttcaac 4548405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 397
Target Start/End: Original strand, 8360756 - 8361081
Alignment:
Q  72 gcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccaca 171  Q
    ||||| |||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||| |||| |  | |||||| | |||  |||| | ||||||||||| ||| ||||| |    
T  8360756 gctttcaaccaccataaggtatttgattttactttatctaacaatagtggtatagaactttgacgattctgaaataacctatcattccgttctttccata 8360855  T
Q  172 acaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttga 271  Q
    | ||||| |||||  | |||||||||| ||| || |  || || | |  | |||||| |||||| || | ||||||||| | || ||||| |||  | |     
T  8360856 aaaccgagacacactgaaaccaaatcaaatgaaatagggatcgacgcgatttcaaaccacctgcatattcaataaattgaacaaaatgatctgagatagc 8360955  T
Q  272 ttgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaaca 371  Q
     |||||||| |||||| | || || ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  8360956 atgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacc 8361055  T
Q  372 ttcccacacccagaaacacacaaccg 397  Q
    | |||||| || || ||||| |||||    
T  8361056 tgcccacatcccgatacacaaaaccg 8361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 43019538 - 43019603
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagctttta 78  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  43019538 gacataaaagcggactcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaatattactagccttta 43019603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 11587713 - 11587633
Alignment:
Q  41 atgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtgg 121  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  11587713 atgagtaccaaagctaaaaacaacattactagcttttaaccaccacaaagaagatgattttactttgtctaacatttgtgg 11587633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Original strand, 8890620 - 8890695
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaa 88  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  8890620 gacatgaaagcaggctcgaccaccaattatgagtaccaaaactaaatacagcattacaagcttttaaccaccacaa 8890695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 23163163 - 23163076
Alignment:
Q  24 gggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatcta 111  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  23163163 gggctcgaccaccaattatgagtaccatagctaaaaacaacattactagcttttaaccaccacaaagaagatgattttactttgtcta 23163076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 99
Target Start/End: Original strand, 16427146 - 16427232
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatt 99  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || |  |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16427146 gacatgaaagcgggttcgaccaccaatgatgagtaccaaaactaaatacatctttacatgcttttaatcaccacaaagaagttgatt 16427232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 255
Target Start/End: Original strand, 46145280 - 46145514
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtg 120  Q
    |||||| |||||||||| | |||| | ||||||||||| || ||||| ||| |||| | ||| || || |||  |||||| |||||||||||||| || |    
T  46145280 agcgggttcgaccaccaattatgaataccaaaactaaaaactacattactaactttcatccatcataaggaacatgattttactttatctaacaaatgcg 46145379  T
Q  121 gcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccc 220  Q
    | |  |  || ||| ||||||  ||||  ||||||||||  ||||||||||| | | ||||||| |  | |||||| |||||||||||||| || |   |    
T  46145380 gtaaagagctgtgtttatttcagaaaactctatcattccgctcattccacaatatccaaacacacataagccaaattagatggaaaaaagaacgccgtgc 46145479  T
Q  221 tctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaa 255  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  46145480 tctcataccacctgcataattaataaattgcaaaa 46145514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 2822573 - 2822472
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||| |||||| |||| |  ||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  2822573 aagcgggctcgaccatcaactatgagtaccaaaagtaaagaacacattactagctttcaaccaccacagagaatttgatttcactttatctaacaactgt 2822474  T
Q  120 gg 121  Q
    ||    
T  2822473 gg 2822472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 19740575 - 19740482
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaaca 114  Q
    |||||| || ||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  19740575 agcgggttcaaccaccaattatgagtaccaaaagtaaaaacaacattactagctttcagccaccacaaggaatatgattttactttatctaaca 19740482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Original strand, 48311694 - 48311794
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| | ||| ||||  | | ||||||| |||||||||||||| |||    
T  48311694 aagcgggctcgaccaccaattatgagtaccaaaagtaaagaccacattactagctttcagccatcacagagtatttgattttactttatctaacaactgt 48311793  T
Q  120 g 120  Q
    |    
T  48311794 g 48311794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 54483695 - 54483595
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||| |||||  |||| || ||||| |||||||| | ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| |||    
T  54483695 aagcggggtcgaccaccaattatgagtaccaaatgtaaagaccacattactagctttcagccaccacaaggtatttgattttactttatctaacaactgt 54483596  T
Q  120 g 120  Q
    |    
T  54483595 g 54483595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 55725822 - 55725719
Alignment:
Q  420 cgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtcca 519  Q
    |||| |||||||||   |||||||||||| |  || | |||||| | |||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  55725822 cgatctgccaaattgtattttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttttagaggaacttgtttatgccaaattaactcca 55725723  T
Q  520 tatt 523  Q
    ||||    
T  55725722 tatt 55725719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 462 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 45472803 - 45472742
Alignment:
Q  462 agtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 523  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45472803 agtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 45472742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 5790623 - 5790523
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtg 120  Q
    |||||| ||||||||||   |||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||   ||||| |||| |||||||| |||||    
T  5790623 agcgggttcgaccaccaactatgaataccgaagctaaacacaacattactagctttcaaccaccacaacgaataggatttaacttgatctaacagttgtg 5790524  T
Q  121 g 121  Q
    |    
T  5790523 g 5790523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 55726130 - 55726034
Alignment:
Q  19 aaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaa 115  Q
    ||||||||||||||||||| | |||  | |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | |   ||||| ||||||||||||||    
T  55726130 aaagcgggctcgaccaccaattatgtataccaaaattaaagaccacattactagctttcaaccaccacaaggtatgagattttactttatctaacaa 55726034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 408
Target Start/End: Original strand, 20002599 - 20002710
Alignment:
Q  297 agccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaacc 396  Q
    |||||||| |||||||  ||||| || ||||| |||  |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||||    
T  20002599 agccatgcccgcaccataggccacaatgcaccgaaaaatggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaacc 20002698  T
Q  397 gcgccttcacag 408  Q
    | |||| |||||    
T  20002699 gagcctccacag 20002710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 523
Target Start/End: Original strand, 8361146 - 8361207
Alignment:
Q  462 agtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 523  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8361146 agtcgccaaacaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 8361207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 467 - 523
Target Start/End: Original strand, 20002776 - 20002832
Alignment:
Q  467 ccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 523  Q
    |||||||| |||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20002776 ccaagcaatgatagaaacttttaaaagaacctgtttatgccaaattaactccatatt 20002832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 36223624 - 36223524
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtg 120  Q
    |||||| |||||||||| |  ||| | ||||||||||| || ||||| |||||||| | | | ||||| |||  |||||| |||||||||||||| ||||    
T  36223624 agcgggttcgaccaccagttgtgaataccaaaactaaaaactacattactagctttcagctatcacaaggaatatgattttactttatctaacaaatgtg 36223525  T
Q  121 g 121  Q
    |    
T  36223524 g 36223524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 34333358 - 34332817
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  34333358 gacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgttagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctag 34333259  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    || ||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  34333258 catttgtggcaaaatactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 34333159  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacca 312  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34333158 cgtcgccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatttgaagttgattgagagtcgacccctaccactcctagccatgcccgcacca 34333059  T
Q  313 atggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaa 412  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  34333058 ttggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaa 34332959  T
Q  413 aatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatt 512  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34332958 aatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaatcgatctctcagaagttgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatt 34332859  T
Q  513 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34332858 aactccatattatgatgtaactggggctgctcctgtgatgtc 34332817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Original strand, 2363874 - 2364415
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  2363874 gacataaaagagggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctag 2363973  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  2363974 caattgaggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaatcaaatcaagtggaagaaagac 2364073  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagcc-atgctcgcacc 311  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  2364074 cgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcacc 2364172  T
Q  312 aatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggta 411  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| || |||||| ||| ||||| ||    
T  2364173 atcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagata 2364272  T
Q  412 aaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaat 511  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2364273 gaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaat 2364372  T
Q  512 taagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2364373 taagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 2364415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 19920764 - 19920231
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19920764 agcgggctcgaccaccactgatgggtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgcagttgatttcactttatctaacaattgtg 19920665  T
Q  121 gcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccc 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  19920664 gcactgtactttggctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgagacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccc 19920565  T
Q  221 tctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccat 320  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||  || ||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||| |||  | |||||||  ||||||    
T  19920564 tctcgaacaacctgcataattgataaattgctcaaaatgatctgaagatgatcgagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggccat 19920465  T
Q  321 aaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccac 420  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| || |||||| |    
T  19920464 aatgcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgagaagcatcttcgacattcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgcctc 19920365  T
Q  421 gatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccat 520  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||  || | ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19920364 gatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccat 19920265  T
Q  521 attatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    || ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19920264 atgatggtgtaactggggcttctcctgtgatgtc 19920231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Original strand, 7312374 - 7312914
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7312374 gacataaaagcgggctcgaccaccactgacgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctag 7312473  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || |||||     
T  7312474 caattgtggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacactgaaacacaaagcaaccaaatcaagtgcaagaaagat 7312573  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacca 312  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  || ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||  | ||||||     
T  7312574 cgtcgccctctcgaacaacctgcataataaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcacc- 7312672  T
Q  313 atggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaa 412  Q
    || | | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||| |||||  |     
T  7312673 atcggcttaatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacaaagccgctcctccacagacag 7312772  T
Q  413 aatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatt 512  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7312773 aatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggtacctgtttatgccaaatt 7312872  T
Q  513 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7312873 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 7312914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 20 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 40931064 - 40930530
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  40931064 aagcgggctcgaccaccactgttgagtaccgaaactaaaaacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttgt 40930965  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    ||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| ||    
T  40930964 ggcaaagaactttgtctatttctaaaaatcctatcatttcgttcattccacaacactgaaacacaaagcagccaaatcaaatgaaagaaagaacgtcacc 40930865  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  40930864 ctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatccgaagttgattgagagtcgacccctaccactccaagccatgcccgcaccattggcca 40930765  T
Q  320 taaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgcca 419  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  40930764 taaggcactaaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattgacatcttcgacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaaggcca 40930665  T
Q  420 cgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtcca 519  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||  || | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  40930664 cggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatccctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaactaactcca 40930565  T
Q  520 tattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    | || || || ||||| || ||||| |||||||||    
T  40930564 tgttttgatgcaactgaggttgctcctgtgatgtc 40930530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 10324114 - 10323573
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||| | ||||||||||| |     
T  10324114 gacataaaagtgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagccttgagccaccacaacgaagttaacttcactttatcgag 10324015  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  10324014 caattgaggcactgtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaccaccgtgacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 10323915  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagcc-atgctcgcacc 311  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |  |||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  10323914 cgtcgccctctcgaacaacctgcatattgtataaattgcacaaagtgatcagaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcacc 10323816  T
Q  312 aatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggta 411  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| || |||||| | | | ||| ||    
T  10323815 atcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcatccccagata 10323716  T
Q  412 aaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaat 511  Q
     |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10323715 gaatgccacgagttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaat 10323616  T
Q  512 taagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10323615 taagtccatactatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 10323573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 510
Target Start/End: Original strand, 7031926 - 7032412
Alignment:
Q  24 gggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtggca 123  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |  |||||   |||||| ||||||||||| |||| |||| | || ||||||| ||  || ||||    
T  7031926 gggctcgaccaccaattctgagtaccaaagctaaacattacattatgagctttcaaccaccacaaagaagatgatataaccttatctagcatatgaggca 7032025  T
Q  124 ctgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccctct 223  Q
      |  ||||||| ||| | ||||| | |  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| || | ||||||    
T  7032026 aagagctttgtcgattactaaaaatcttggcattccgctcattccacaacacagaaacacaaagtaaccaaatcaagtgaaaaaaagatcgccgccctct 7032125  T
Q  224 caaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataag 323  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||||| | || ||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||   | ||||||     
T  7032126 cgagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaa 7032225  T
Q  324 gcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacgat 423  Q
    || |  |||||    ||   ||| ||||||||| |||||||||| ||   ||| || || || |||||| ||||||| | || ||||||||  |||| ||    
T  7032226 gcgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggccccgcaacctgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacaat 7032325  T
Q  424 ttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaa 510  Q
    | |||| |||  |||||||||||||||  || | ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  7032326 tcgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaattttgagaggaacctgtttgtgccaaa 7032412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 50651883 - 50651650
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtg 120  Q
    |||||| |||||||||| |  ||| | ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  50651883 agcgggttcgaccaccaattgtgaataccaaaactaaaaactacattactagctttcaaccaccacaaggaataagattttactttacctaacaaatgtg 50651784  T
Q  121 gcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccc 220  Q
    | |  | ||| ||  |||| |  ||||  ||||||||||  ||||||||||| | | ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||   |    
T  50651783 gtaaagaactatgattattactgaaaacgctatcattccgctcattccacaatatccaaacacacagcagccaaattagatgaaaaaaagaccgtcgtgc 50651684  T
Q  221 tctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaa 254  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  50651683 tctcaaaccacctgcataattaataaactgcaaa 50651650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 99
Target Start/End: Original strand, 10312975 - 10313061
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatt 99  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10312975 gacatgaaagcgggttcgaccaccaatgatgagtaccaaaactaaatacaacgttacacgcttttaaccaccacaaagaagttgatt 10313061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 36801559 - 36801234
Alignment:
Q  72 gcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccaca 171  Q
    ||||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||  |||| |  | |||||| | |||  |||| | ||||||||||| ||| ||||| |    
T  36801559 gctttcaaccaccacaaggtatttgattttactttatctaacaagagtggtatagaactttgacgattctgaaataacctatcattccgttctttccata 36801460  T
Q  172 acaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttga 271  Q
    | ||||| |||||  | |||||||||| ||| || || || || | |  | |||| | |||||| || | ||||||||||| || ||||| |||  | |     
T  36801459 aaaccgagacacactgtaaccaaatcaaatgaaataaggatcgacgcgatttcaagccacctgcatattcaataaattgcacaaaatgatctgagatagc 36801360  T
Q  272 ttgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaaca 371  Q
     |||||||| |||||| | || || ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  36801359 atgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgatttacatcttcaacc 36801260  T
Q  372 ttcccacacccagaaacacacaaccg 397  Q
    | |||||| || || ||||| |||||    
T  36801259 tgcccacatcccgatacacaaaaccg 36801234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 26771528 - 26771022
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| |||| |||||||||||||| | ||||||  |||||||||| |||||||| |||| | |||   ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  26771528 acataaaagtgggctcgaccaccaattatgagtatcaaaactaaaaacaacattactagttgtta---accacaaagaagatgattttactttgtctaac 26771432  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    | ||| || |  |   | |  || |||| |||||  ||||||||||  |||||||| |  ||| |||||||  | | |||||||| |||||||||| | |    
T  26771431 atttgaggtaaagagttcttcctgtttctaaaaattctatcattccgatcattccataggacccaaacacactgaagccaaatcaaatggaaaaaaaatc 26771332  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 313  Q
     || |  | | || ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |  ||| |    |||| ||| |||||| | || || | ||| || | ||||||    
T  26771331 ttcgcgattttaagcaacctgcgtaatgaataaattgcaaaaaattgtccgaaatatgctgaggatcaaccccttcaaccccaaaccaagccctcaccaa 26771232  T
Q  314 tggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaa 413  Q
    |||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||| ||||| |||||||| || | |||||| ||||  ||||||||| || ||| || ||| |      
T  26771231 tggccataaggcactaaaaattgggcaagacaaaaacaagtgattcacatcttccacgtgcccacaaccagtgacacacaactgcacctccaaaggaatg 26771132  T
Q  414 atgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatta 513  Q
    || ||||| |||||||||||   ||| |||||||| |  || | ||| || | ||||| ||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  26771131 ataccacggtttgccaaatttgctttcgtaggtaaacgatccctcaaaagccgccaagtaagaatagagactttaagaggagcctgtttatgccacatta 26771032  T
Q  514 agtccatatt 523  Q
    | ||||||||    
T  26771031 actccatatt 26771022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 963698 - 963464
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtg 120  Q
    |||||| |||||||||| | |||| | ||||||||||| || ||||| |||||||| | ||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| || |    
T  963698 agcgggttcgaccaccaattatgaataccaaaactaaaaactacattactagctttcatccaccacaaggaacatgattttactttatctaacaaatgcg 963599  T
Q  121 gcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccc 220  Q
    | |  |  || | | ||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||| | | ||||||| || | |||||| ||||||||||| || || |   |    
T  963598 gtaaagagctatatttattttggaaaactctatcattccgctcattccacaatatccaaacacacagaagccaaattagatggaaaaaggaacgccgtgc 963499  T
Q  221 tctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaa 255  Q
    ||||| || |||| | |||||||||||||||||||    
T  963498 tctcataccacctacataattaataaattgcaaaa 963464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 255
Target Start/End: Original strand, 3140457 - 3140691
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtg 120  Q
    |||||| |||||||||| | |||| | ||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||| ||||  ||  |||||| |||||||||||||| || |    
T  3140457 agcgggttcgaccaccaattatgaataccaaaactaaaaactacattactagctttcagtcacgacaagaaacatgattttactttatctaacaaatgcg 3140556  T
Q  121 gcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccc 220  Q
    | |  |  |||| | ||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||| | | ||||||| || | |||||| || ||||||||||| |||    |    
T  3140557 gtaaagagctttatttatttcggaaaactctatcattccgctcattccacaatatccaaacacacagaagccaaattagttggaaaaaagaacgttgtgc 3140656  T
Q  221 tctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaa 255  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  3140657 tctcaaatcacctgcataattaataaattgcaaaa 3140691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 7031553 - 7031059
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||| | | ||||||| |||||||||| || | ||    
T  7031553 aagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaaaactatgttactagctttcaaccaccacaaggtatttgattttactttatctagcagtagt 7031454  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    || |  | ||| || | |||  |||| | ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||||| ||| || || || || | |     
T  7031453 ggtatagaactatgacgattctgaaataacctatcattccgttctttccataaaaccgagacacattgaaaccaaatcaaatgaaataatgatcgacgcg 7031354  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
     | |||| | |||||| || | ||||||||||| ||  |||| |||  | |  ||||||||||||||| | || || ||||| || |||||||  |||||    
T  7031353 atttcaagccacctgcatattcaataaattgcacaaagtgatctgacatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccagaggcca 7031254  T
Q  320 taaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgcca 419  Q
     || |||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || |  ||||| |||||    | ||||| |||||| ||     
T  7031253 caaagcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacagctaaaatccct 7031154  T
Q  420 cgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaa 514  Q
    ||     ||||||||  ||| |||||||| |  || | ||| || | ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7031153 cgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagacgccaagcaaggatagaaagttttaaaggaacctgtttatgccaaattaa 7031059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 99
Target Start/End: Original strand, 15827308 - 15827394
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatt 99  Q
    ||||| |||||||| |||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15827308 gacatgaaagcgggttcgatcatcaatgatgagtaccaaaactaaatacagcattgcaagcttttaaccaccacaaagaagttgatt 15827394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 523
Target Start/End: Original strand, 11203423 - 11203926
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  11203423 aagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttactagctttcaaccaccacaaggtatttgattttactttatctaacaatagt 11203522  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    || |  | ||||||   |||  |||| |  |||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||||| ||| || || || || | |     
T  11203523 ggtatagaactttgatgattctgaaataatctatcattccgttctttccataaaaccgagacacattgaaaccaaatcaaatgaaataatgatcgacgcg 11203622  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
     | |||||| |||||| || | ||||||||||| ||  |||| |||  | |  | |||||| |||||  | || || ||||| || |||||||| |||||    
T  11203623 atttcaaaccacctgcatattcaataaattgcacaaagtgatctgagatggtattagaatcaaccccgtcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggcca 11203722  T
Q  320 taaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgcca 419  Q
     || | ||||||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || |  ||||| |||||    | ||||| || ||| |||    
T  11203723 caatgaaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagctataatccca 11203822  T
Q  420 cgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtcca 519  Q
    || |   |||||||   ||| |||||||| |  || | ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11203823 cgttccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaagtatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactcca 11203922  T
Q  520 tatt 523  Q
    ||||    
T  11203923 tatt 11203926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 29524281 - 29523778
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  29524281 aagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttgctagctttcaaccaccacaaggtatttgattttactttatctaacaatagt 29524182  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    || |    ||||||   |||  |||| | ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||||| ||| || || || || | |     
T  29524181 ggtatataactttgatgattctgaaataacctatcattccgttctttccataaaaccgagacacattgaaaccaaatcaaatgaaataatgatcgacacg 29524082  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
     | |||||| |||||| || | ||||||||||| || ||||| |||  |    ||||||||||||||| | || || ||||| || | |||||| |||||    
T  29524081 atttcaaaccacctgcatattcaataaattgcacaaaatgatctgagatattatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccacaccaaaggcca 29523982  T
Q  320 taaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgcca 419  Q
     || ||||||||| ||  ||||||||| || |||||||| ||||||| ||| | ||  || || |  ||||| |||||    | ||||| || ||| |||    
T  29523981 caatgcaccaaaaattggacaagacaagaataaatgattcacatctttaacctgcctgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagctataatccca 29523882  T
Q  420 cgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtcca 519  Q
    ||     |||||||   ||| |||||||| |  || | ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29523881 cgtgccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactcca 29523782  T
Q  520 tatt 523  Q
    ||||    
T  29523781 tatt 29523778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 48570575 - 48570480
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaa 115  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| || |||||  ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  48570575 aagcgggctcgaccaccaattatgagtaccaaaaataaagaccacattattagctttcaaccaccacagggaatttgattttactttatctaacaa 48570480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 114
Target Start/End: Original strand, 15312194 - 15312280
Alignment:
Q  28 tcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaaca 114  Q
    ||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| | |||||||||||    
T  15312194 tcgaccaccaaagatgagtaccgaaactaaatacaacattactagctttcaaccaccacaaggaatatgattttagtttatctaaca 15312280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Original strand, 33496151 - 33496501
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||| ||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || ||| |||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33496151 aagcgggttcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttactaactttcaaccaccacaaggtatttgattttactttatctaacaatagt 33496250  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    || |  | |||||| | |||  |||| | ||||||||||  ||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||||| ||| || || || || | |     
T  33496251 ggtatagaactttgacgattctgaaataacctatcattctgttctttccataaaaccgagacacactgaaaccaaatcaaatgaaataaggatcgacgcg 33496350  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
     | |||||  |||||| || | ||||||||||| || ||||  |||  | |  |||||||| |||||| | || || ||||| || |||||||| |||||    
T  33496351 atttcaaatcacctgcatattcaataaattgcacaaaatgagctgagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggcca 33496450  T
Q  320 taaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 370  Q
     || ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33496451 caatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaac 33496501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 35214685 - 35214555
Alignment:
Q  242 aataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttacacaa 341  Q
    ||||||||||| || |||||||||  | |  |||||||| |||||| | || || |||||||| |||||||  ||||| || ||||||||| ||  ||||    
T  35214685 aataaattgcacaaaatgatatgagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccatgcccgcaccataggccacaatgcaccaaaaattggacaa 35214586  T
Q  342 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaacat 372  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35214585 gacaagaacaaatgattcacatcttcaacat 35214555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Original strand, 926718 - 926772
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatt 67  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  926718 gacatgaaagcgggctcgaccaccaatgatgagtaccataactaaatacaacatt 926772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11310741 - 11310640
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||| | ||| || |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | |   ||||| ||||||||||||    
T  11310741 acatgaaagcgggttcgaccaccaattatgtgtaccaaaattaaagaccacattgctagctttcaaccaccacaaggtatgagattttactttatctaac 11310642  T
Q  114 aa 115  Q
    ||    
T  11310641 aa 11310640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 12342558 - 12342259
Alignment:
Q  223 tcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataa 322  Q
    |||||| |||||| || | ||||||||||| || ||||| |||  | |  |||||||||||| || | || || ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  12342558 tcaaaccacctgcatattcaataaattgcacaaaatgatctgagatagtatgagaatcgacctcttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggccacaa 12342459  T
Q  323 ggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacga 422  Q
     ||||||||| ||  |||||| || || |||||||| ||||||||||| | ||| || || |  ||||| |||||    | ||||| || ||| |||||     
T  12342458 tgcaccaaaaattggacaagagaagaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagctataatcccacgt 12342359  T
Q  423 tttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatat 522  Q
    |   |||||||   ||| |||||||| |  || | ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12342358 tccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaactttta-aagaacctgtttatgccaaattaactccatat 12342260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30695879 - 30695715
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || || ||||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  30695879 aagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttgctggctttcaaccaccacaaggtatttgattttactttatctaacaatagt 30695780  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacaca 184  Q
    || |  | |||||| | |||  |||| | ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||    
T  30695779 ggtatagaactttgacgattctgaaataacctatcattccgttctttccataaaaccgagacaca 30695715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 458 - 522
Target Start/End: Original strand, 33496589 - 33496653
Alignment:
Q  458 caatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatat 522  Q
    ||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33496589 caacagtcgccaagcaatgatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatat 33496653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Original strand, 19890276 - 19890383
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||   || || |||| | |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |    |||||| ||||||||||||    
T  19890276 acataaaagcgggctcgaccaccacatgtgtgtaccaacattaaagactacattactagctttcaaccaccacaaggtgtgtgattttactttatctaac 19890375  T
Q  114 aattgtgg 121  Q
    ||| ||||    
T  19890376 aatagtgg 19890383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 53185074 - 53184907
Alignment:
Q  19 aaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattg 118  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| |||||| |||| || |||   ||| |||| ||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||||| |    
T  53185074 aaagcgggctcgaccatcaattatgagtaccaaaattaaagactacacaactaactttcaaccaccacaaggtatgtgattttactttatctaacaatag 53184975  T
Q  119 tggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaa 186  Q
    ||| |  | |||||| | ||| ||||| | | | ||||||| ||| ||||| || ||| |||||||||    
T  53184974 tggtatagaactttgacaattccgaaataacatgtcattccgttctttccataaaacccaaacacaaa 53184907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 12342763 - 12342667
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaat 116  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || |||||||| |||||| |||| | | ||||||| |||||||||||||||    
T  12342763 aagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttgctagctttcaaccactacaaggtatttgattttactttatctaacaat 12342667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 467 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 35214460 - 35214404
Alignment:
Q  467 ccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 523  Q
    |||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35214460 ccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccagattaactccatatt 35214404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 554
Target Start/End: Original strand, 13395986 - 13396526
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13395986 acataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacagcattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctaac 13396085  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13396086 atttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaataccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagacc 13396185  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 313  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13396186 gtcgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcagacaatgatctgaagttgattgagattcgacccctaccactcctagccatgcccgcaccat 13396285  T
Q  314 tggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaa 413  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13396286 tggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaa 13396385  T
Q  414 atgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatta 513  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13396386 atgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacttgtttatgccaaatta 13396485  T
Q  514 agtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    | ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13396486 actccatatgatgatgtaattggggctgctcctgtgatgtc 13396526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 550
Target Start/End: Original strand, 32266160 - 32266698
Alignment:
Q  12 ggacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatcta 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  32266160 ggacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacatttctagtctttaaccaccacagagaagttgatttcacattatcta 32266259  T
Q  112 acaattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaaga 211  Q
     || ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  32266260 gcatttgtggcaaagtactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacacccaaacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaaga 32266359  T
Q  212 ccgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacc 311  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  32266360 ccgacgccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcacc 32266459  T
Q  312 aatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggta 411  Q
    | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  32266460 attggccacaatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggta 32266559  T
Q  412 aaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaat 511  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32266560 aaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaat 32266659  T
Q  512 taagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtga 550  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32266660 taactccaaattatggtgtaactgtggttgctcttgtga 32266698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 41665911 - 41665371
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  41665911 acataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctaaa 41665812  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |    
T  41665811 atttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagatc 41665712  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 313  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  41665711 gtcgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcagacaatgatctgaagttgattgagattcaacccctaccactcctagccatgcccgcaccat 41665612  T
Q  314 tggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaa 413  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  41665611 tggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaa 41665512  T
Q  414 atgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatta 513  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||   ||||  |  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41665511 atgtcatggtttgccaaattattttttgtaggtaactgatctcttaggaatcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatta 41665412  T
Q  514 agtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    | ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41665411 actccatatgatgatgtaattggggctgctcctgtgatgtc 41665371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Original strand, 7923983 - 7924524
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  7923983 gacataaaagagggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctag 7924082  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  7924083 caattgaggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 7924182  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagcc-atgctcgcacc 311  Q
    |||  ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  7924183 cgttgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcacc 7924281  T
Q  312 aatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggta 411  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| || |||||| ||| ||||| ||    
T  7924282 atcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagata 7924381  T
Q  412 aaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaat 511  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7924382 gaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaat 7924481  T
Q  512 taagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7924482 taagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 7924524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Original strand, 8299400 - 8299941
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  8299400 gacataaaagagggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttagccaccacaacgaagttaatttcactttatctag 8299499  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  8299500 caattgaggcacagtactatgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacagcaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 8299599  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagcc-atgctcgcacc 311  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  8299600 cgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcacc 8299698  T
Q  312 aatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggta 411  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| || ||| ||| ||||| ||    
T  8299699 atcggccataatgcaccaaaagttgcacaggacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacacataatcgctcctccacagata 8299798  T
Q  412 aaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaat 511  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8299799 gaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaat 8299898  T
Q  512 taagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  8299899 taagtccaaattatggtgtaattggggctactcctgtgatgtc 8299941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 14 - 554
Target Start/End: Original strand, 171701 - 172241
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  171701 acataaaagcgggcttgaccaccactgttgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccatcacaaagaagttgatttcactttatctagc 171800  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    ||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  171801 aatagtggcaaagtactctgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagacc 171900  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 313  Q
    ||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||||     
T  171901 gtcgccctctcgaacaaccggcataattaataaattgcacaaaattatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactcctaaccaatcccgcaccat 172000  T
Q  314 tggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaa 413  Q
     |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| || || || |    
T  172001 cggccataatgcgtcaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacattaccacagccagaaacacataaccgctcctccatagataga 172100  T
Q  414 atgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatta 513  Q
    ||| |||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  172101 atgtcacggtttaccaaattaagttttgtgggtaaccggtccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatta 172200  T
Q  514 agtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  172201 agtccattttatggtgtaactggttctgctcctgtgatgtc 172241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 19 - 554
Target Start/End: Original strand, 9922204 - 9922739
Alignment:
Q  19 aaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  9922204 aaagcgggctcgaccaccactggtgagtaccaaaactaaaaacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttg 9922303  T
Q  119 tggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctc 218  Q
    |||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| || || || |||| |    
T  9922304 tggcaaagaactttgtctatttctaaaaagcctttcattccgttcattccacaacaccgaaacaacaagcagccaaatcaaatgaaagaaggaacgtcgc 9922403  T
Q  219 cctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcc 318  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9922404 cctctcgaacatcctgcataattaataaattgcactaaatgatctgaagttgattgagagtcaacccctaccactccaagccatgctcgcaccaatggcc 9922503  T
Q  319 ataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgcc 418  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  9922504 ataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattgacatcttctacattcccacaaccagaaacacacatccgcgcctccagaggtaaaatgcc 9922603  T
Q  419 acgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtcc 518  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||||  || | ||  ||||  || ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  9922604 acggtttgccaaattatcttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgtcatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaactcc 9922703  T
Q  519 atattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |  || || ||||| || |||||||| |||||||||    
T  9922704 aagttttgatgtaagtgaggctgctcctgtgatgtc 9922739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 384
Target Start/End: Original strand, 20496681 - 20497052
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  20496681 gacataaaagagggctcgaccaccactgatgtgtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctag 20496780  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  20496781 taattgaggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacagcaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 20496880  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagcc-atgctcgcacc 311  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  20496881 cgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcacc 20496979  T
Q  312 aatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccag 384  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  20496980 atcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccag 20497052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32567807 - 32567480
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  32567807 gacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtatcaaaactaaatacaacattgctagcttt-aaccaccacaaagaagttgatttcacattatctag 32567709  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    || ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||    
T  32567708 catttgtggcaaagtactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacacccaaacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagac 32567609  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacca 312  Q
    || | ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  32567608 cgacgccctcttgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctggcacca 32567509  T
Q  313 atggccataaggcaccaaaagttacacaa 341  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32567508 ttggccataatgcactaaaagttacacaa 32567480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 370
Target Start/End: Original strand, 5181267 - 5181624
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| ||||||||  |||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||    
T  5181267 acatgaaagcgggtacgaccaccaagtatgagtactaaagctaaatacaacattactaacttttaaccaccacaaataagatgattttactttatctaac 5181366  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    |  ||||| |  | ||||| |||||||| ||| | | ||||||| | ||| |||||||| ||| |||||||  | | ||||||||  |  ||||| || |    
T  5181367 atatgtggtaaagaactttctctatttctaaatatcatatcatttcgttcgttccacaaaacctaaacacattgaagccaaatcaagtaaaaaaaggatc 5181466  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaatt-gcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacca 312  Q
    ||| |  |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||   |||||    
T  5181467 gtcgcgatctcgagcaacctgcgtaattaataaatttgcaaaaaatggtttgtagttgtctgagagtcgacccctaccacaccgagccatgcctacacca 5181566  T
Q  313 atggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 370  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  5181567 atggccacaaggcaccaaaagttgggcaagacaaaaacatatgattctcatcttcaac 5181624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 339 - 523
Target Start/End: Original strand, 13200046 - 13200230
Alignment:
Q  339 caagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacgatttgccaaattaattt 438  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||| ||| |  || | |||||||||   ||    
T  13200046 caagacaaaaacatatgagtcacatcttcaacatgcccacacccagtaacacaaaaccgagcctccataggtagaattctgcgctctgccaaattgtatt 13200145  T
Q  439 ttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 523  Q
    |||||||||| |  || | ||||||   |||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13200146 ttgtaggtaaacgatccctcaatagctgccaagcaaggattgaaacttttagaggaacctgtttatgccaaactaactccatatt 13200230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 34137495 - 34137400
Alignment:
Q  24 gggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  34137495 gggctcgaccaccaattatgagtaccaaagctaaaaacaacattactagcttttaaccaccacaatgaagatgattttactttgtctaacatttgt 34137400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 523
Target Start/End: Original strand, 37433736 - 37434239
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || || ||||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  37433736 aagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttgctggctttcaaccaccacaaggtatttgattttactttatctaacaatagt 37433835  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    || |  | |||||| | |||  |||| | ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||| | ||| || || || || | |     
T  37433836 ggtatagaactttgacgattctgaaataacctatcattccgttctttccataaaaccgagacacattgaaaccaaattaaatgaaataaggatcgacgcg 37433935  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
     | |||||| ||| || || | ||||||||||| || ||||| |||  | |  ||||||||||||||| | || |  ||||| || |||||||| |||||    
T  37433936 atttcaaaccacccgcatattcaataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatcgaccccttcgacacaaagccaagcccgcaccaaaggcca 37434035  T
Q  320 taaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgcca 419  Q
     || ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || |  ||||| |||||    | ||||| || ||| |||    
T  37434036 caatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagatataatccca 37434135  T
Q  420 cgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtcca 519  Q
    || |   |||||||   ||| |||||||| |  || | ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37434136 cgttccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaagaatagagacttttaaaggaacatgtttatgccaaattaactcca 37434235  T
Q  520 tatt 523  Q
    ||||    
T  37434236 tatt 37434239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 478
Target Start/End: Original strand, 2529484 - 2529948
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | |   ||||| ||||||||||||    
T  2529484 acatgaaagcgggctcgaccaccaatcatgtgtaccaaaattaaaaaccacattactagctttcaaccaccacaaggtatgagattttactttatctaac 2529583  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    ||  ||||||  | |||||| |  |||| ||| | ||| ||||||| ||||||||| || ||| |||| ||  ||| |||||||| ||| || || || |    
T  2529584 aaaagtggcatagaactttgacgttttctaaataacctgtcattccgttcattccataaaacccaaacgcactgcagccaaatcaaatgaaataaggatc 2529683  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 313  Q
    | |    | |||| |  ||||| || | ||||||||||| || ||||| |||| | |   ||||||| || ||| | || || ||||| || |||||||     
T  2529684 gacgggatttcaagcctcctgcatattcaataaattgcataaaatgatctgaaatagcaagagaatctactccttcgacaccaagccaagcccgcaccat 2529783  T
Q  314 tggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaa 413  Q
     ||||| || |  || ||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||| || | ||| |    
T  2529784 aggccacaatgtgccgaaaattgggcaagacaaaaacaaatgagtcacatcttcaacatgcccacaccctgtaacacaaaaccgagcctccaaaagtaga 2529883  T
Q  414 atgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggat 478  Q
    || ||||||| | |||||||   |||||||||||| |  || | |||||| | ||||||||||||    
T  2529884 attccacgatctaccaaattgtattttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggat 2529948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 523
Target Start/End: Original strand, 20824153 - 20824403
Alignment:
Q  273 tgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacat 372  Q
    ||||||||||||||| | || || ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  20824153 tgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccagaggccacaaagcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacct 20824252  T
Q  373 tcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagc 472  Q
     |||||| || |  ||||| |||||    | ||||| || ||| || ||     ||||||||  ||| |||||||| |  || | ||| |||| ||||||    
T  20824253 gcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacagctataatccctcgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagc 20824352  T
Q  473 aaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 523  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20824353 aaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 20824403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 523
Target Start/End: Original strand, 2170197 - 2170449
Alignment:
Q  273 tgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacat 372  Q
    |||||||| |||||| | || || ||||| || |||||||  ||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  2170197 tgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacct 2170296  T
Q  373 tcccacacccagaaacacacaaccgcgcctt--cacaggtaaaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaa 470  Q
     ||||||||| |  ||||| |||  ||  ||  ||||| || ||| ||||| | | |||||||   ||| |||||||| |  || | |||  ||| ||||    
T  2170297 gcccacaccccgttacacaaaacaccgattttccacagatagaatcccacgttctaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacggtcgccaa 2170396  T
Q  471 gcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 523  Q
    ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2170397 gcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccagattaactccatatt 2170449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 121
Target Start/End: Original strand, 25089990 - 25090092
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgcc-aaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattg 118  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||| || ||||| |||||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  25089990 aagcgggctcgaccaccaattatgagtacccaaaagtaaagaccacattactagctttcagccaccacaaggaatttgattttactttatctaacaactg 25090089  T
Q  119 tgg 121  Q
    |||    
T  25090090 tgg 25090092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 273 - 523
Target Start/End: Original strand, 43270307 - 43270557
Alignment:
Q  273 tgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacat 372  Q
    |||||||| |||||| | || || ||||| || |||||||  | ||| || ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  43270307 tgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccatagaccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacct 43270406  T
Q  373 tcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagc 472  Q
     |||||| || |  ||||| ||||| || | ||||| || |||  |||| | | |||||||  |||| ||||| || |  ||   ||| |||| |||||     
T  43270407 gcccacaacccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatctcacgttctaccaaatttgttttagtaggcaaacgatccttcaacagtcgccaagt 43270506  T
Q  473 aaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 523  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  43270507 aaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccagatgaactccatatt 43270557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 34137211 - 34137011
Alignment:
Q  308 caccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcaca 407  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||| |||| || |||   |||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||    
T  34137211 caccaatggccacaaggcaccaaaatttgggcaagacaaaaacaagtgattcacattttgaacgcacccacaaccagtagcacacaaccgcccctccaca 34137112  T
Q  408 ggtaaaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgcc 507  Q
    || |  || || || |||||||||||   ||| |||||||| |  ||   ||  || | ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  34137111 ggaatgataccgcggtttgccaaattttctttcgtaggtaaacgatccatcataagccgccaagcaagaatagagactttgagaggtacctgtttatgcc 34137012  T
Q  508 a 508  Q
    |    
T  34137011 a 34137011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 29733486 - 29733403
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcac 103  Q
    |||||| |||||||||||   |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29733486 aagcggtctcgaccaccaactatgagtaccaaaagtaaagaccacattactagctttcaaccaccacaaagaatttgatttcac 29733403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Original strand, 17699086 - 17699436
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || || | ||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  17699086 aagcgggctcgaccaccaactatgcgtaccaaaaataaagactatgttactggttttcaaccaccacaaggtatttgattttactttatctaacaatagt 17699185  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    || |    ||||||   |||  |||| | | ||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||||| ||| || || || || | |     
T  17699186 ggtataaaactttgatgattctgaaataacatatcattccgttctttccataaaaccgagacacactgaaaccaaatcaaatgaaataaggatcggcgca 17699285  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
     | |||| | |||||| || | ||||||||||| || ||||| |||  | |  |||||||| |||||| | || || ||||| || |||||||| || ||    
T  17699286 atttcaagccacctgcatattcaataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggtca 17699385  T
Q  320 taaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 370  Q
     || ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17699386 caatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaac 17699436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 12257986 - 12257893
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaaca 114  Q
    |||||| |||||||||| | |||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||    
T  12257986 agcgggttcgaccaccagttatgagtaccaaaactagaaacaacgttactagctttcaaccaccacatgtaatatgattttactttatctaaca 12257893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 12265378 - 12265285
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaaca 114  Q
    |||||| |||||||||| | |||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||    
T  12265378 agcgggttcgaccaccagttatgagtaccaaaactagaaacaacgttactagctttcaaccaccacatgtaatatgattttactttatctaaca 12265285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Original strand, 13199721 - 13199822
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| || ||||| ||||||||  |||||||||| | |   ||||| ||||||||||||    
T  13199721 acataaaagcgggctcgaccaccaattatgtgtaccaaaattaaagaccacattactagctttcgaccaccacaaggtatgagattttactttatctaac 13199820  T
Q  114 aa 115  Q
    ||    
T  13199821 aa 13199822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 462 - 523
Target Start/End: Original strand, 17699528 - 17699589
Alignment:
Q  462 agtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 523  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17699528 agtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 17699589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 121
Target Start/End: Original strand, 20823900 - 20824001
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||| | | ||||||| |||||||||| |||| ||    
T  20823900 aagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttactagctttcaaccaccacaaggtatttgattttactttatctagcaatagt 20823999  T
Q  120 gg 121  Q
    ||    
T  20824000 gg 20824001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 13880023 - 13879923
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||| |||||  |||| || ||||| | |||||| | ||||||||  | | ||||||| |||||||||||||| |||    
T  13880023 aagcggactcgaccaccaattatgagtaccaaatgtaaagaccacattacgagctttcagccaccacagggtatttgattttactttatctaacaactgt 13879924  T
Q  120 g 120  Q
    |    
T  13879923 g 13879923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 11277796 - 11277254
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagtt-gatttcactttatcta 111  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11277796 gacataaaagtgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccacaaagaagtttgatttcactttatcta 11277697  T
Q  112 acaattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaaga 211  Q
      | ||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  11277696 gtatttgtggcaaaatactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccaaaacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaaga 11277597  T
Q  212 ccgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacc 311  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  11277596 ccgacgccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcacc 11277497  T
Q  312 aatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggta 411  Q
    | ||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11277496 attggccataatgcactaaaatttacacaagactaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggta 11277397  T
Q  412 aaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaat 511  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  |||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11277396 aaatgccacggtttgccaaattatttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaat 11277297  T
Q  512 taagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11277296 taactccatattatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 11277254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 554
Target Start/End: Original strand, 37919140 - 37919682
Alignment:
Q  12 ggacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatcta 111  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37919140 ggacataaaagcgggttcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatcta 37919239  T
Q  112 acaattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaaga 211  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||    
T  37919240 acatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcctatcatccatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaatcaagtggaagaaaga 37919339  T
Q  212 ccgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacc 311  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37919340 ccgtcatcttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgacccctaccactcctagccatgcccgcacc 37919439  T
Q  312 aatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggta 411  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||    
T  37919440 attggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaataaatgattaacatcttcaacgttcccacaactagaaacacacaaccgcgcctccaaaggta 37919539  T
Q  412 aaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaat 511  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  37919540 aaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttataccaaat 37919639  T
Q  512 taagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    ||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37919640 taacttcatatgatgatgtaattggggctgctcctgtgatgtc 37919682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 554
Target Start/End: Original strand, 47876592 - 47877121
Alignment:
Q  25 ggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtggcac 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||     
T  47876592 ggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttttctagcatttgtggcaa 47876691  T
Q  125 tgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccctctc 224  Q
     | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||    
T  47876692 agaactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccatcgccctctc 47876791  T
Q  225 aaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataagg 324  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||| |    
T  47876792 gaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaataatctgaagttgattaagagtcgacccctaccactcctagccatgcccgcatcaattgtcataatg 47876891  T
Q  325 caccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacgatt 424  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  47876892 cactaaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccgcatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtt 47876991  T
Q  425 tgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatta 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   |||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  47876992 tgccaaattattttttgtaggtaactgatctctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccctattt 47877091  T
Q  525 tggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  47877092 tgatgtaactggggctgctcctgtgatgtc 47877121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Original strand, 29967572 - 29968113
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||     
T  29967572 gacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaaaacaacattactagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatctag 29967671  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    || ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||    
T  29967672 catttgtggcagcgtactttgtctatttctaaaaatcctatcattccgttcattccacagcacccagacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagac 29967771  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacca 312  Q
    || |  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  29967772 cgacgtcctctcgaacaacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctaaggttgaatgagaatctactcccaccactcctagccatgctcgcacca 29967871  T
Q  313 atggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaa 412  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29967872 ttggccataaagcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaa 29967971  T
Q  413 aatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatt 512  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||  |||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29967972 aatgccatggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtcctcaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatt 29968071  T
Q  513 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29968072 aactccatactatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 29968113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 4938671 - 4938130
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |     
T  4938671 gacataaaagtgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttagccaccacaacgaagttaacttcactttatcgag 4938572  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  4938571 caattgaggcactgtactttgactatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaccaccgtgacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 4938472  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagcc-atgctcgcacc 311  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |  |||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  4938471 cgtcgccctctcgaacaacctgcatattgtataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcacc 4938373  T
Q  312 aatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggta 411  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| || |||||| ||| ||||| ||    
T  4938372 atcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagata 4938273  T
Q  412 aaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaat 511  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4938272 gaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaat 4938173  T
Q  512 taagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4938172 taagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 4938130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 235968 - 235439
Alignment:
Q  27 ctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtggcactg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  235968 ctcgaccaccactgttgagtaccaaaactaaatacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaag 235869  T
Q  127 tactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccctctcaa 226  Q
      ||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| ||||||| |    
T  235868 agctttgtctatttctaaaaatcatatcatttcgttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaacgtcgccctctcga 235769  T
Q  227 acaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggca 326  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  235768 acaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaatttgattgagagtcgacccctaccactccgagccatgcccgcaccattggccataaggca 235669  T
Q  327 ccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacgatttg 426  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  235668 ctaaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttctcgcaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttg 235569  T
Q  427 ccaaat--taatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatta 524  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||  || | ||  |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  235568 ccaaatgattttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagagactttgagatgaacctgtttatgccaaattaactccatattt 235469  T
Q  525 tggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  235468 tgatgtaactggggctgctcctgtgatgtc 235439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 554
Target Start/End: Original strand, 17720247 - 17720773
Alignment:
Q  19 aaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  17720247 aaagcgggctcgaccaccactggtgagtaccaaaactaaaaacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttg 17720346  T
Q  119 tggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctc 218  Q
    |||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||         |||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| || || || | || |    
T  17720347 tggcaaagaactttgtctatttctaaaaagcctatcat---------tccacaacaccgaaacaacaagcagccaaatcaaatgaaagaaggaacatcgc 17720437  T
Q  219 cctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcc 318  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17720438 cctctcgaacatcctgcataattaataaattgcactaaatgatctgaagttgattgagagtcaacccctaccactccaagccatgcttgcaccaatggcc 17720537  T
Q  319 ataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgcc 418  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  17720538 ataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcttcattcccacaactagaaacacacatccgcgcctccagaggtaaaatgcc 17720637  T
Q  419 acgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtcc 518  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||||  || | ||  |||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  17720638 acggtttgccaaattatcttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaactcc 17720737  T
Q  519 atattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |  || || ||||| || |||||||| |||||||||    
T  17720738 aagttttgatgtaagtgaggctgctcctgtgatgtc 17720773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31177848 - 31177421
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  31177848 gacataaaagtgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactaacctttagccaccacaacgaagttaacttcactttatctag 31177749  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  31177748 caattgaggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 31177649  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagcc-atgctcgcacc 311  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  31177648 cgtcgcccactcgaacaacctgcataatgtataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcacc 31177550  T
Q  312 aatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggta 411  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||| ||||  ||    
T  31177549 atcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacacataaccgctcctccacatata 31177450  T
Q  412 aaatgccacgatttgccaaattaattttt 440  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31177449 gaatgccacgatttgtcaaattaagtttt 31177421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 38890263 - 38890137
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  38890263 gacataaaagcgggctcaaccaccactgatgagtgccaaaattaaatacaacattactaacctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctag 38890164  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatt 139  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||    
T  38890163 caattgtggcaaagtactttgtctatt 38890137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 523
Target Start/End: Original strand, 37254364 - 37254865
Alignment:
Q  22 gcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtgg 121  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37254364 gcgggctcgaccaccaattatgtgtaccaaaattaaagactacattactagctttcaaccaccacaaggtatgtgattttactttatctaacaattgtgg 37254463  T
Q  122 cactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccct 221  Q
     |  | |||||| |  || ||||| | |||  |||||| ||||||||| || ||| |||||||  | | |||||| | ||| || ||||| || |    |    
T  37254464 tatagaactttgacagttccgaaataacctgccattccattcattccataaaacccaaacacactgaagccaaataaaatgaaataaagatcgacgggat 37254563  T
Q  222 ctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccata 321  Q
      ||| | |||||| || | ||||||||||| || ||||| |||  | |  |||||||  |||||| | || || |||||||| |||||||  ||||| |    
T  37254564 tccaagccacctgcatattcaataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatttaccccttcgacaccaagccatgcccgcaccataggccaca 37254663  T
Q  322 aggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacg 421  Q
    | ||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  |||||  | |  ||||| ||||| | || ||||| || ||||||||     
T  37254664 atgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaaaatgtccacattccgtgacacaaaaccgagtctccacagatataatgccaca 37254763  T
Q  422 atttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccata 521  Q
    || |||||| ||   ||| |||||||| |  || | ||| |  | |||||||||||| || | ||| | || ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  37254764 atctgccaagttggatttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggattgaaacttttaaagtaacctgtttatgccagattaactccata 37254863  T
Q  522 tt 523  Q
    ||    
T  37254864 tt 37254865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 523
Target Start/End: Original strand, 25619381 - 25619566
Alignment:
Q  338 acaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacgatttgccaaattaatt 437  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| || |  ||||| || ||  ||| ||||| |  ||||||||||| |||||| ||   |    
T  25619381 acaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcctgtgacacaaaatcggtcctccacagatgcaatgccacgatctgccaagttggat 25619480  T
Q  438 tttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 523  Q
    || |||||||| |  || | ||| |  | ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25619481 ttagtaggtaatcgttccctcaacaaccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccatattaactccatatt 25619566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 114
Target Start/End: Original strand, 48394509 - 48394602
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaaca 114  Q
    |||||| |||||||||| | |||||| || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| | |||||||||||    
T  48394509 agcgggttcgaccaccaattatgagtaccgaaattaaagacaacattactagctttcaaccaccacaaggaatatgattttattttatctaaca 48394602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 358
Target Start/End: Original strand, 18530367 - 18530452
Alignment:
Q  273 tgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgatt 358  Q
    |||||||| |||||| | || || ||||| || |||||||  ||||| || ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  18530367 tgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgatt 18530452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Original strand, 51052077 - 51052618
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51052077 gacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagtctttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctag 51052176  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  51052177 caattgtggcacaatactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 51052276  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacca 312  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||  | |||||||    
T  51052277 cgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcacca 51052376  T
Q  313 atggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaa 412  Q
      |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| ||     
T  51052377 tcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatag 51052476  T
Q  413 aatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatt 512  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51052477 aatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatt 51052576  T
Q  513 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51052577 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 51052618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 11909648 - 11909107
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11909648 gacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctag 11909549  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  11909548 caattgtggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 11909449  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacca 312  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||  |  ||||||    
T  11909448 cgtcaccctctcaaacaacctgcataataaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcctgcacca 11909349  T
Q  313 atggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaa 412  Q
      |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||| ||||| ||     
T  11909348 tcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacatagccgctcctccacagatag 11909249  T
Q  413 aatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatt 512  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | ||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11909248 aatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaatgatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatt 11909149  T
Q  513 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11909148 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 11909107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Original strand, 35540646 - 35541187
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  35540646 gacataaaagagggctcgaccaccactgatgtgtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctag 35540745  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  35540746 taattgaggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacagcaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 35540845  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagcc-atgctcgcacc 311  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  35540846 cgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcacc 35540944  T
Q  312 aatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggta 411  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| || || ||  ||| ||||| ||    
T  35540945 atcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataatcgttcctccacagata 35541044  T
Q  412 aaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaat 511  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||  || | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  35541045 gaatgccacgatttgccaaattatgttttgtgggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaat 35541144  T
Q  512 taagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35541145 taagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 35541187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Original strand, 6050199 - 6050741
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  6050199 gacataaaagagggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctag 6050298  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
     ||||  |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  6050299 aaatttaggcacaatactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 6050398  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgat-atgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagcc-atgctcgcac 310  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| |||||    
T  6050399 cgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatcttgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcac 6050497  T
Q  311 caatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggt 410  Q
    ||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| || |||||| ||| ||||| |    
T  6050498 catcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcagaaccgctcctccacagat 6050597  T
Q  411 aaaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaa 510  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || | || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6050598 agaatgccacaatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaa 6050697  T
Q  511 ttaagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6050698 ttaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 6050741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 14 - 357
Target Start/End: Original strand, 6259415 - 6259758
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  6259415 acataaaagcgggctcgaccaccagtgttgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttagccaccacaaagaagttgatttcactttatctagc 6259514  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6259515 atttgtggcaaagtactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaaatggaaaaaagacc 6259614  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 313  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6259615 gtctccctctcgaacaacctacgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 6259714  T
Q  314 tggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgat 357  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6259715 tggccataaagcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgat 6259758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 351
Target Start/End: Original strand, 4841997 - 4842339
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4841997 acataaaagcgggctcgaccaccactgatgaataccaaaactaaatacaggattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctaac 4842096  T
Q  114 aattgtggcactg-----tactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaa 208  Q
    | |||| |||  |     ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  4842097 atttgtcgcaaggaggagtactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaa 4842196  T
Q  209 agaccgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgc 308  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4842197 agaccgtcgccttctcaaacaacctgcgtaatgaataaattgctgacaatgatctgaagttgattgagattcgacccctaccactcctagccatgcccgc 4842296  T
Q  309 accaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaaca 351  Q
    ||||  |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  4842297 accataggccataatgcattaaaagttacacaagacaaaaaca 4842339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Original strand, 26059488 - 26059755
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  26059488 gacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctag 26059587  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  26059588 catttgtggcaaagtacattgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 26059687  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatc 280  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26059688 cgtcaccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagaatc 26059755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12813746 - 12813519
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12813746 acataaaagcgggctcgaccaccactgatgaatactaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctaac 12813647  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  12813646 atttgtggcagagtactttgtctatttctaaaattcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagacc 12813547  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaatt 241  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||    
T  12813546 gtcgccttctcaaacaacctgcgtaatt 12813519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 13351912 - 13352173
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||  | |||| ||||| |||| |    
T  13351912 acatgaaagcgggctcaaccaccaattatgagtaccaaagctaaatacaacattacgagcttttaaccaccacaaagaaaattatttaactttgtctagc 13352011  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    | ||||||||  |  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | || ||||||| || |||||||||||||||||||| |  || ||||| || |    
T  13352012 atttgtggcaaagagctttgtctatttctaaaaatcctatcattccatacactccacaaaactgaaacacaaagcaaccaaataaagtgaaaaaatgaac 13352111  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattga 275  Q
    ||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  13352112 gtcgctctctcgaacaacctgcataattaataaattacaaaaaatgatctgaagttgattga 13352173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Original strand, 43387971 - 43388321
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || ||| |||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  43387971 aagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttgctaactttcaaccaccacaaggtatttgattttactttatctaacaatagt 43388070  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    || |  | |||||| | |||  |||| | ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||||| ||| || || || || | |     
T  43388071 ggtatagaactttgacgattctgaaataacctatcattccattctttccataaaaccgagacacattgaaaccaaatcaaatgaaataatgatcgacgcg 43388170  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
     | |||||| |||||| || | ||||||||||| ||  ||||||||  | |  ||||||||||||||| | || || ||||| || |||||||| |||||    
T  43388171 atttcaaaccacctgcatattcaataaattgcacaaagtgatatgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggcca 43388270  T
Q  320 taaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 370  Q
     || ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43388271 caatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaac 43388321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 308 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 47623323 - 47623111
Alignment:
Q  308 caccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcaca 407  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  |   ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||| ||| || |    
T  47623323 caccaaagaccataaggcaccaaaaaatgggcaagacagaaacaagtgattcacatcttcatcatgcccacaaccagaaacaca--accgcccctccata 47623226  T
Q  408 ggtaaaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgcc 507  Q
    || | |||| |||| |||||||||||    || |||||||| | ||| | ||| || | ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  47623225 ggaataatgtcacggtttgccaaatttcccttcgtaggtaagcggtccctcaaaagccgccaagcaagaatagatactttgagaggtacctgtttatgcc 47623126  T
Q  508 aaattaagtccatat 522  Q
    ||||||| |||||||    
T  47623125 aaattaattccatat 47623111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 24547609 - 24547518
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcact 104  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24547609 gacatgaaagcaggctcgaccaccaattatgagtaccaaaactaaatacagcattacaagcttttaaccactacaaagaagttgatttcact 24547518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 47623597 - 47623500
Alignment:
Q  24 gggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtgg 121  Q
    |||||||||||||| | ||||||  || | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  47623597 gggctcgaccaccaattatgagtatcatagctaaaaacaacattactagcttttaaccaccacaaagaagatgattttactttgtctaacatttgtgg 47623500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 37191469 - 37191243
Alignment:
Q  297 agccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaacc 396  Q
    |||||| | |||||||  |||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| || |  ||||| || |    
T  37191469 agccattcccgcaccataggccataatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaatc 37191370  T
Q  397 gcgccttcacaggtaaaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaac 496  Q
    |  ||| ||||| |  ||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||| |  |||| ||| || | ||||||||||||| | | ||| | | ||||    
T  37191369 gatcctccacagatgtaatgccacgatctgccaagttggatttagtaggtaatcgatctctcaacagccgccaagcaaggatataaacttttaaatgaac 37191270  T
Q  497 ctgtttatgccaaattaagtccatatt 523  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  37191269 cagtttatgccagattaactccatatt 37191243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Original strand, 2490817 - 2491050
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtg 120  Q
    |||||| |||||||||| |  ||| | ||||||| ||| || ||||| ||| |||| | ||||||||  |||   ||||| |||||||||||||| ||||    
T  2490817 agcgggttcgaccaccaattgtgaataccaaaacgaaaaactacattactaactttcagccaccacagggaataagattttactttatctaacaaatgtg 2490916  T
Q  121 gcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccc 220  Q
    | |  | ||| ||  |||| |  ||||  ||||||||||  ||||||||||| | | ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||   |    
T  2490917 gtaaagaactatgattattactgaaaacgctatcattccgctcattccacaatatccaaacacacagcagccaaattagatggaaaaaagatcgtcgtgc 2491016  T
Q  221 tctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaa 254  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  2491017 tctcgaaccacctgcataattaataaactgcaaa 2491050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16918345 - 16917986
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||||| ||||||| |  || |||||||| ||||||||||| | | ||||||| |||||||||| |||| ||    
T  16918345 aagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaatactatgttactagctttcaaccaccacaaggtatttgattttactttatctagcaatagt 16918246  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    |  |  | ||| || | |||  |||| | ||||||||||| ||| ||||| || | ||| |||||  | |||||||||| ||| || || ||  | | |     
T  16918245 gatatagaactatgacgattctgaaataacctatcattccgttctttccataaaatcgagacacattgaaaccaaatcaaatgaaataatgattgacacg 16918146  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
     | |||| | |||||| || | ||||||||||| ||  |||| |||  | |  ||||||||||||||| | || || ||||| || |||||||  |||||    
T  16918145 atgtcaagccacctgcatattcaataaattgcacaaagtgatctgacatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccagaggcca 16918046  T
Q  320 taaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccaca 379  Q
     || |||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  16918045 caaagcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccaca 16917986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 114
Target Start/End: Original strand, 6478131 - 6478217
Alignment:
Q  28 tcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaaca 114  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  6478131 tcgaccaccaattatgagtatcaaaactaaaaacaacattattagcttttagccaccacaaggaatatgattttactttatctaaca 6478217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 462 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 16917903 - 16917842
Alignment:
Q  462 agtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 523  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16917903 agtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 16917842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 467 - 523
Target Start/End: Original strand, 43388418 - 43388474
Alignment:
Q  467 ccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 523  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43388418 ccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 43388474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 37192469 - 37192362
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||   || || |||| | |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||    
T  37192469 acataaaagcgggctcgaccaccacatgtgtgtaccaacattaaagactacattactagctttcaaccaccacaaggtatgtgattttactttatctaac 37192370  T
Q  114 aattgtgg 121  Q
    ||| ||||    
T  37192369 aatagtgg 37192362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 37298041 - 37297967
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaa 88  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37298041 acataaaagcgggctcgaccaccaattatgtgtaccaaaattaaagactacattactagctttcaaccaccacaa 37297967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 462 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 22191875 - 22191823
Alignment:
Q  462 agtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaa 514  Q
    |||||||||||||| ||||| |  || | ||||||||||||||||||||||||    
T  22191875 agtctccaagcaagaatagaaaccttcaaaggaacctgtttatgccaaattaa 22191823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 121
Target Start/End: Original strand, 28351379 - 28351431
Alignment:
Q  69 ctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtgg 121  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||    
T  28351379 ctagctttcaaccaccacaatgaatatgattttactttatctaacaaatgtgg 28351431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 553
Target Start/End: Original strand, 23237980 - 23238521
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  23237980 gacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaaaacaacattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcacattatctag 23238079  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    ||  |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||    
T  23238080 catctgtggcaaagtactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccaaaacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagac 23238179  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgac-ccctaccactcctagccatgctcgcacc 311  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23238180 cgacgccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatcagacgttgaatgagaatcgactccccaccactcctagccatgctcgcacc 23238279  T
Q  312 aatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggta 411  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||    
T  23238280 attggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaagcta 23238379  T
Q  412 aaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaat 511  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23238380 aaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagaaactttgagaggaacctatttatgccaaat 23238479  T
Q  512 taagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgt 553  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23238480 taactccatattatggtgtaactggggttgctcctgtgatgt 23238521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Original strand, 12824796 - 12825337
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12824796 gacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctag 12824895  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  12824896 caattgtggtacaatactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccggaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 12824995  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacca 312  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||  | |||||||    
T  12824996 cgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcacca 12825095  T
Q  313 atggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaa 412  Q
      |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| ||     
T  12825096 tcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatag 12825195  T
Q  413 aatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatt 512  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | ||  |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12825196 aatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatacatactttgagaggaacttgtttatgccaaatt 12825295  T
Q  513 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12825296 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 12825337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 30732857 - 30732316
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30732857 gacataaaagcaggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagtctttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctag 30732758  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  30732757 caattgtggcacaatactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 30732658  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacca 312  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||  | |||||||    
T  30732657 cgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcacca 30732558  T
Q  313 atggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaa 412  Q
      ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| ||     
T  30732557 tcggctataatgcaccaaaagttgtacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatag 30732458  T
Q  413 aatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatt 512  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | ||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30732457 aatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaagatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatt 30732358  T
Q  513 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30732357 aagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 30732316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 538
Target Start/End: Original strand, 8227623 - 8228148
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |     
T  8227623 gacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccacaaagaggttgatttcacattatcaag 8227722  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    || || |||||  ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||    
T  8227723 catttatggcaacgtactttgtttatttctaaaaatcatatcattcctttcattccacatcacccaaacacaaagcaaccaaattaagtggaagaaagac 8227822  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacca 312  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8227823 cgacgccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaggttgaatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcacca 8227922  T
Q  313 atggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaa 412  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8227923 ttggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttctcacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaa 8228022  T
Q  413 aatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatt 512  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8228023 aatgtcacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaatt 8228122  T
Q  513 aagtccatattatggtgtaactgggg 538  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  8228123 aactccatattatggtgtaactgggg 8228148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Original strand, 42513317 - 42513858
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  42513317 gacataaaagagggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctag 42513416  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  42513417 caattgaggcacaatactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 42513516  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagcc-atgctcgcacc 311  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  42513517 cgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcacc 42513615  T
Q  312 aatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggta 411  Q
    |  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| || |||||| ||| ||||| ||    
T  42513616 atcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaaaaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagata 42513715  T
Q  412 aaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaat 511  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  42513716 gaatgtcacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaat 42513815  T
Q  512 taagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42513816 taagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 42513858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 14 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 27117703 - 27117163
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  27117703 acataaaagcaggctcgaccaccactgttgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagc 27117604  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  27117603 aattgtggcaaagtactctgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagacc 27117504  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 313  Q
    ||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | | |||||     
T  27117503 gtcgccctctcgaacaaccgacataattaataaattgcacaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactcctaaccaatcccacaccat 27117404  T
Q  314 tggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaa 413  Q
     |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| || || || |    
T  27117403 cggccataatgctccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacattcccacagccagaaacacataaccgctcctccatagataga 27117304  T
Q  414 atgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatta 513  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27117303 atgccacggtttaccaaattaagttttgtgggtaaccggtccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatta 27117204  T
Q  514 agtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  27117203 agtccatattatggtgtaactggatctgctcctgtgatgtc 27117163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 19 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 35984327 - 35983793
Alignment:
Q  19 aaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  35984327 aaagtgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaaaacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttg 35984228  T
Q  119 tggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctc 218  Q
    |||||  | |||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |    
T  35984227 tggcaaagaactttgtctatttctaaaat-cctatcattccgttcattccacaacaccgaaacacaaagcagccaaatcaaatgaaagaaagaacgtcgc 35984129  T
Q  219 cctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcc 318  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||    
T  35984128 cctctcgaacaacctgcataattaataaattgcataaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactccaagtcatgcccgcaccattggcc 35984029  T
Q  319 ataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgcc 418  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  35984028 ataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattgacaacttctacattcccacaaccaaaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgtc 35983929  T
Q  419 acgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtcc 518  Q
    | | |||||||||||| |||||||||||||||  |  | ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  35983928 atggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgattcctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtgtaagccaaattaactcc 35983829  T
Q  519 atattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    || || || |||||||| |||||||| |||||||||    
T  35983828 atgttttgatgtaactgaggctgctcctgtgatgtc 35983793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12820492 - 12820055
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12820492 gacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattaccagcctttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctag 12820393  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12820392 caattgtggcacaatactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaaatggaagaaagac 12820293  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacca 312  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||  | |||||||    
T  12820292 cgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcacca 12820193  T
Q  313 atggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaa 412  Q
      |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| ||     
T  12820192 tcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagagacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatag 12820093  T
Q  413 aatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12820092 aatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaacc 12820055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 28536212 - 28535677
Alignment:
Q  19 aaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||    
T  28536212 aaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaaaacaacattacaagcctttaaccaccacaaagacgttgatttcactttatctagcatttg 28536113  T
Q  119 tggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctc 218  Q
    |||||  | |||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| ||| || || || |||| |    
T  28536112 tggcaaagaacttcgtctatttctaaaaatcctatcatttcgttcattccacaacaccgaaacaacaagtagccaaatcaaatgaaagaaggaacgtcgc 28536013  T
Q  219 cctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcc 318  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  28536012 cctctcgaacaaccagcataattaataaattgcacaaaatgatctgaagttgattgagagtcaacccctaccactccaagccatgcccgcaccattggcc 28535913  T
Q  319 ataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgcc 418  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  28535912 ataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgatcgacatcttctacattcccacaaccagaaacacacatctgcgcctccaaaggtaaaatgcc 28535813  T
Q  419 acgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtcc 518  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||  || | ||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  28535812 acggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaactcc 28535713  T
Q  519 atattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    || || || |||||||| |||||||| |||||||||    
T  28535712 atgttttgatgtaactgaggctgctcctgtgatgtc 28535677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 554
Target Start/End: Original strand, 42927729 - 42928269
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| |||| |||||||||||||| | ||||||  |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |    
T  42927729 acataaaagtgggctcgaccaccaattatgagtatcaaagctaaatacaacattacgagcttttaaccaccacaaagaagatgatttaactttatctagc 42927828  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    | ||||||||  |  ||||||| ||||| || ||   | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |    
T  42927829 atttgtggcaaagagctttgtcaatttctaagaatattgtcattccgttcattccacaaaaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaaaaatgaac 42927928  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 313  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42927929 gtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactccgagccatgcccgcaccaa 42928028  T
Q  314 tggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaa 413  Q
    ||| |||||||||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||    
T  42928029 tggtcataaggcactaaaagttggacatgacaagaacaaatgattgacatcttcaacgttcccgcatccagagacacacaaccgcacctccaagggtaaa 42928128  T
Q  414 atgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatta 513  Q
    |||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||  || | ||  || | |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42928129 atgccacagtttgtcaaattattttttgtagttaaccgatccctcagaagccgccaaacaaggatagagactttgagaggaacctgtttataccaaatta 42928228  T
Q  514 agtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    | ||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||    
T  42928229 actccatatttggatgtaactggggctgttcctgcgatgtc 42928269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 19255665 - 19255155
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  19255665 acatgaaagcgggctcgaccaccaaatatgagtaccaaaactaaatacaacattatgaggttttaaccaccacaaagaagatgatttgactttatctaac 19255566  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    |  |||||||  |  |||| |||||||| |||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |    
T  19255565 atatgtggcaaagagctttttctatttctaaaaatattgtcattccgttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaaaaatgatc 19255466  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 313  Q
    ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19255465 gtcgcaatctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgtttgagaatcgacccctaccactccgagccatgcccgcaccaa 19255366  T
Q  314 tggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgc-cttcacaggtaa 412  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||  |||||||||||||| || ||  || |     
T  19255365 tgtccataaggcaccaaaagttggacaagacaagaacaaatgattgacatcttcaacgtgcccgcatccagtgacacacaaccgcgcgctccaagggaat 19255266  T
Q  413 aatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatt 512  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  || | ||  |  | ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  19255265 aatgccacaatttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaaaccgccaagcaaggatagatactttgagagaaatctgtttatgccaaatt 19255166  T
Q  513 aagtccatatt 523  Q
    || ||||||||    
T  19255165 aactccatatt 19255155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 384
Target Start/End: Original strand, 3418386 - 3418751
Alignment:
Q  19 aaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattg 118  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  3418386 aaagagggctcgatcaccactgatgtgtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctagtaattg 3418485  T
Q  119 tggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctc 218  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  3418486 aggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacagcaccgaaacacaaagcaaccaaatcaaatggaagaaagaccgtcgc 3418585  T
Q  219 cctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagcc-atgctcgcaccaatggc 317  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| |||||||  |||    
T  3418586 cctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcaccatcggc 3418684  T
Q  318 cataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccag 384  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  3418685 cataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccag 3418751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 320
Target Start/End: Original strand, 25824608 - 25824915
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  25824608 gacatgaaagcgggctcgaccaccaccgatgagtaccaaaactaaatacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctag 25824707  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    || ||| ||||  | || ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||     
T  25824708 catttgaggcaaagaacattgtctatttctaaaaatcctatcattctgttcattccacaacaccgaaacacaaagcagccaaatcaaatgaaagaaagaa 25824807  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacca 312  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25824808 cgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactccaagccatgcccgcacca 25824907  T
Q  313 atggccat 320  Q
     |||||||    
T  25824908 ttggccat 25824915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 171
Target Start/End: Original strand, 31641360 - 31641512
Alignment:
Q  19 aaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  31641360 aaagcgggctcgaccaccactggtgagtaccaaaactaaatacaacattacaagcctttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctagcatttg 31641459  T
Q  119 tggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccaca 171  Q
    |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31641460 tggcaaagaactttgtctatttctaaaaatcctatcattccgttcattccaca 31641512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 32228409 - 32228641
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtg 120  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||  || |    
T  32228409 agcgggttcgatcaccaattatgagtaccaaaactaaaaacaacattactagctttcaaccaccacaaaaaatatgattttactttatctaacatatgcg 32228508  T
Q  121 gcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccc 220  Q
    | |  |  |||||| ||||||  ||||   |||||||||  ||| ||||||| | | ||||||| || | |||||| ||||||||||| || |||| | |    
T  32228509 gtagagagctttgtttatttctgaaaactttatcattccgctcagtccacaaaatccaaacacacaggagccaaattagatggaaaaaggaacgtcgcgc 32228608  T
Q  221 tctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaa 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32228609 tctcaaacaacctgcataattaataaattgcaa 32228641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 417 - 554
Target Start/End: Original strand, 31641513 - 31641649
Alignment:
Q  417 ccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagt 516  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || | || ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31641513 ccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagtagtctccatgcaaggatagaaacttt-agaggaacctgtgtatgccaaattaact 31641611  T
Q  517 ccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| |||||||||    
T  31641612 ccatgttttgatgtaagtgaggctgctcctgtgatgtc 31641649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 25857960 - 25857457
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || ||||| || ||||||||||| | | |||| || |||||||||| |||| ||    
T  25857960 aagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttactagcgttcaaccaccacaaggtatttgagtttactttatctagcaatagt 25857861  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    || |  | ||| || | |||  |||| | ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||||| ||| || || || || | |     
T  25857860 ggtatagaactgtgacgattctgaaataacctatcattccgttctttccataaaaccgagacacattgaaaccaaatcaaatgaaataatgatcgacgcg 25857761  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
     | |||| | |||||| || | ||||||||||| ||  |||| |||  | |  ||||||||||||||| | || || ||||| || |||||||  |||||    
T  25857760 atttcaagccacctgcatattcaataaattgcacaaagtgatctgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccagaggcca 25857661  T
Q  320 taaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgcca 419  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || |  ||||| || ||    | ||||| || ||| ||     
T  25857660 caaggcaccaaaagtcaaacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaatcggttttccacagctataatccct 25857561  T
Q  420 cgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtcca 519  Q
    ||     ||||||||  ||| |||||||| |  || | ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25857560 cgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactcca 25857461  T
Q  520 tatt 523  Q
    ||||    
T  25857460 tatt 25857457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 252
Target Start/End: Original strand, 33169263 - 33169494
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtg 120  Q
    |||||| |||||||||| | || | | ||||||||||| || ||||| |||||||| | ||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| || |    
T  33169263 agcgggttcgaccaccaattataaataccaaaactaaaaactacattactagctttcatccaccacaaggaacatgattttactttatctaacaaatgcg 33169362  T
Q  121 gcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccc 220  Q
    | |  |  || | | ||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||| | | ||||||| || | |||||| ||||||||||| || || |   |    
T  33169363 gtaaagagctatatttatttcggaaaactctatcattccgctcattccacaatatccaaacacacagaagccaaattagatggaaaaaggaacgccgtgc 33169462  T
Q  221 tctcaaacaacctgcgtaattaataaattgca 252  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  33169463 tctcataccacctgcataattaataaattgca 33169494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 8300718 - 8300215
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||| | | ||||||| |||||||||| |||| ||    
T  8300718 aagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttactagctttcaaccaccacaaggtatttgattttactttatctagcaatagt 8300619  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    || |  | ||| || | |||  |||| | ||||||||||| ||| ||||| || | ||| |||||  | |||||||||| ||| || || || || |       
T  8300618 ggtatagaactgtgacgattatgaaataacctatcattccgttctttccataaaatcgagacacattgaaaccaaatcaaatgaaataatgatcgacgtg 8300519  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
     | |||| | |||||| || | ||||||||||| ||  |||| |||  | |  ||||||||||||||| | || || ||||| || |||| ||  |||||    
T  8300518 atttcaagccacctgcatattcaataaattgcacaaagtgatctgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcatcagaggcca 8300419  T
Q  320 taaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgcca 419  Q
     ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || |  ||||| |||||    | ||||| || ||| ||     
T  8300418 caaggcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacagctataatccct 8300319  T
Q  420 cgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtcca 519  Q
    ||     ||||||||  ||| |||||||| |  || | ||| |||| |||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8300318 cgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactcca 8300219  T
Q  520 tatt 523  Q
    ||||    
T  8300218 tatt 8300215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18359632 - 18359270
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| ||||||| ||||| || || | ||| || |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||    
T  18359632 acataaaagcggactcgatcatcaattatgtgtaccaaaattaaagactacattactagctttcaaccaccacaaagtatgtgattttactttatctaac 18359533  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    ||| |||| |  | |||||| |  || ||||| | ||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||||  | | |||||||| ||| || ||||| |    
T  18359532 aatagtggtatagaactttgacggttccgaaataacctgtcattccgttcattccataaaacccaaacacactgaagccaaatcaaatgaaagaaagatc 18359433  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 313  Q
    | |    | |||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||  | |  |||||||| | |||| | || || |||||||| ||| |||     
T  18359432 gacgagatttcaagccacctgcgtatttaataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatcta-cccttcgacaccaagccatgcccgccccat 18359334  T
Q  314 tggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattccca 377  Q
     ||||| || ||||| ||| |   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  18359333 aggccacaatgcaccgaaaatcggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgccca 18359270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 523
Target Start/End: Original strand, 27766647 - 27767149
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||  || |||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  27766647 aagcgggctcgaccaccaactatctgtaccaaaaataaagactatgttgctagctttcaaccaccacaaggtattcgattttactttatctaacaatagt 27766746  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    |  |  | |||||| | |||  |||| | ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||||| ||| || || || || | |     
T  27766747 gatatagaactttgacgattctgaaataacctatcattccgttctttccataaaaccgatacacattgaaaccaaatcaaatgaaataatgatcgacgcg 27766846  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
     | |||||  |||||| || | ||||||||||| |  ||||| |||| | |  ||||||||||||||| | || || ||||| ||  |||| || |||||    
T  27766847 atttcaaaacacctgcatattcaataaattgcacacaatgatctgaaatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcctgcacaaa-ggcca 27766945  T
Q  320 taaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgcca 419  Q
     || ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || |  ||||| |||||    | ||||  || ||| |||    
T  27766946 caaagcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacatatataatccca 27767045  T
Q  420 cgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtcca 519  Q
    || |   |||||||   |||||||||||| |  || | ||| |||| ||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27767046 cgttccaccaaatttgattttgtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactcca 27767145  T
Q  520 tatt 523  Q
    ||||    
T  27767146 tatt 27767149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 33385622 - 33385407
Alignment:
Q  308 caccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcaca 407  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || || ||||| |||||    | ||||    
T  33385622 caccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgatacacaaaaccgattttccaca 33385523  T
Q  408 ggtaaaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgcc 507  Q
    | || ||| |||||     |||||||   ||| |||||||| |  || | ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||    
T  33385522 gatataattccacgtgccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgcc 33385423  T
Q  508 aaattaagtccatatt 523  Q
    ||||||| ||||||||    
T  33385422 aaattaactccatatt 33385407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 114
Target Start/End: Original strand, 26072498 - 26072591
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaaca 114  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||  | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||    
T  26072498 agcgggttcgaccaccaattatgagtatcgaaactaaagacaacattactagctttcaaccaccacaaggaataagattttactttatctaaca 26072591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 27166459 - 27166394
Alignment:
Q  49 caaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaaca 114  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  27166459 caaaactaaagataacattactagctttcaaccaccacaaagaatatgattttactttatctaaca 27166394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 462 - 522
Target Start/End: Original strand, 10776810 - 10776870
Alignment:
Q  462 agtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatat 522  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10776810 agtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatat 10776870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Original strand, 27795087 - 27795187
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||  |||| || ||||| | |||||| | ||||||||  | | ||||||| |||||||||||||| |||    
T  27795087 aagcgggctcgaccaccaattatgagtaccaaatgtaaagaccacattacgagctttcagccaccacagggtatttgattttactttatctaacaactgt 27795186  T
Q  120 g 120  Q
    |    
T  27795187 g 27795187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Original strand, 29142409 - 29142505
Alignment:
Q  25 ggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtgg 121  Q
    |||||||||| || | | |||| ||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  29142409 ggctcgaccatcaattaagagtaccagagctaaaaacaacattattagcttttaaccaccacaaagatgatgattttactttgtctaacatttgtgg 29142505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 397
Target Start/End: Original strand, 10776663 - 10776745
Alignment:
Q  315 ggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccg 397  Q
    ||||| || ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || || ||||| |||||    
T  10776663 ggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacttgcccacatcccgatacacaaaaccg 10776745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 106386 - 105845
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaa 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  106386 gacataaaagagggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttaatttcactttatctag 106287  T
Q  113 caattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagac 212  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  106286 caattgaggcacaatactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagac 106187  T
Q  213 cgtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagcc-atgctcgcacc 311  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  106186 cgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgc-cgcacc 106088  T
Q  312 aatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggta 411  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| || |||||| ||| ||||| ||    
T  106087 atcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagata 105988  T
Q  412 aaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaat 511  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  105987 gaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaat 105888  T
Q  512 taagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  105887 taagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 105845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 42 - 554
Target Start/End: Original strand, 4551795 - 4552307
Alignment:
Q  42 tgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtggcactgtactttgtctatttc 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4551795 tgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctagtaattgtggcacagtactttgtctatttc 4551894  T
Q  142 gaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccctctcaaacaacctgcgtaatt 241  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  4551895 taaaaagcctatcatttctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatt 4551994  T
Q  242 aataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttacacaa 341  Q
    ||||||||||  || ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||  | |||||||  || ||||| |||||||||||| |||||    
T  4551995 aataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggtcataatgcaccaaaagttgcacaa 4552094  T
Q  342 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacgatttgccaaattaatttttg 441  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4552095 gacaaaaacaaatgagaaacattttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttg 4552194  T
Q  442 taggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctg 541  Q
    |||||||||  || | ||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552195 taggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttaagaggaacctatttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctg 4552294  T
Q  542 ctcttgtgatgtc 554  Q
    ||| |||||||||    
T  4552295 ctcctgtgatgtc 4552307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 41 - 523
Target Start/End: Original strand, 41206631 - 41207123
Alignment:
Q  41 atgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtggcactgtactttgtctattt 140  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||  ||||| |  |  ||||||||||||    
T  41206631 atgagtaccaaagctaaatacaacattacgagattttaaccaccataaagaagatgatttgactttatctaacatgtgtggtaaagagctttgtctattt 41206730  T
Q  141 cgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtc----tccc------tctcaaacaa 230  Q
    | ||||| | | ||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| || ||||    || |      |||| |||||    
T  41206731 ctaaaaatcatttcatttcgttcattcctcaaaaccgaaacacaaagcaatcaaatcaagtggaaaaatgatcgtcgcaatctcgaacaatctcgaacaa 41206830  T
Q  231 cctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaa 330  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  41206831 cttgcgtagttaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgtctgagagtcaacccctaccactccgagccatgcccgcatcaatggccataaggcaccaa 41206930  T
Q  331 aagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacgatttgccaa 430  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||  |||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||    
T  41206931 aagttggacaagacaagaacaaatgattgacatcttcaacgtgcccgcatccagtgacacacaaccgcgcctccaagggaataatgccacgatttgccaa 41207030  T
Q  431 attaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 523  Q
    |||| |||||||||||||||  || | ||  || | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41207031 attattttttgtaggtaaccgatccctcagaagccgccaagcaaggatagagactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 41207123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 523
Target Start/End: Original strand, 15917251 - 15917761
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  15917251 acataaaagcgggctcgaccaccaattatgagtaccaaaactaaagacaacattactagctttcaaccaccacaaagaatatgattttactttatctaac 15917350  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    |  ||||| |  |  ||||||||||| | ||| || || ||||||| |||||||||||| ||| |||||||  | |  |||| ||  ||||||||||| |    
T  15917351 atatgtggtatagagctttgtctattcctaaatagtctgtcattccgttcattccacaaaacccaaacacattgaagtcaaaccaagtggaaaaaagatc 15917450  T
Q  214 gtctccctct-caaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcacca 312  Q
    ||| |  | | | | | |||||| |||| |||||||||||||| ||| | |||| | |  |||||| |||||||||| || |  ||||||||  ||||||    
T  15917451 gtcgcgattttcgagccacctgcataatgaataaattgcaaaaaatggtctgaaatagcctgagaaccgacccctacaacactgagccatgcctgcacca 15917550  T
Q  313 atggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaa 412  Q
    ||||||| || || |||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||| | | || ||| |     
T  15917551 atggccacaacgcgccaaaagttggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacaaccagtgacacacaaccgcacttccaaaggaat 15917650  T
Q  413 aatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatt 512  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || | ||  |||| ||||||||||||| | | ||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  15917651 aataccacgatttgccaaattaacttttgtaggtaaacgatccctcagcagtccccaagcaaggatacagactttcagaggaacctatttatgcgaaatt 15917750  T
Q  513 aagtccatatt 523  Q
    || || |||||    
T  15917751 aactcaatatt 15917761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 17765504 - 17764995
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| |||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  17765504 acataaaagtgggctcgaccaccaactatgagtaccaaaactaaaaacaacattactagcttttaacccccacaaagaagatgattttactttgtctaac 17765405  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    |||||||| |  |  || ||  | |||| |||||  ||| ||||||  |||||||| || ||| |||||||  | | |||||||| ||| |||||||| |    
T  17765404 aattgtggtaaagagctctgcatgtttctaaaaattctaacattccgatcattccataagacccaaacacactgaagccaaatcaaatgaaaaaaagatc 17765305  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 313  Q
     ||    | |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||| |   ||||| ||| |||||| | || |   | ||  | | ||||||    
T  17765304 ttcgtgatttcaagcaacctgcgtaatgaataagttgcaaaaaatggtctgaaatatgttgaggatcaaccccttcaacccaatgtcaatccctcaccaa 17765205  T
Q  314 tggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaa 413  Q
    || |||||||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||| ||||  |||||||||||||||| || ||| |      
T  17765204 tgaccataaggcaccaaaaattgggcaagacaaaaacaagtgattcacatcttccacgtgaccacaaccagtgacacacaaccgcgcctccaaaggaatg 17765105  T
Q  414 atgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatta 513  Q
    || ||||| |||||||||||   ||| ||||||||    || | |||||| | ||||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  17765104 ataccacggtttgccaaatttgctttcgtaggtaaatgatccctcaatagccgccaagcaagaatagagactttaagaggagcctgtttatgccatatta 17765005  T
Q  514 agtccatatt 523  Q
    | ||||||||    
T  17765004 actccatatt 17764995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 523
Target Start/End: Original strand, 12645134 - 12645643
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||| | |   ||||| ||||||||||||    
T  12645134 acatgaaaacgggctcgaccaccaattatgtgtaccaaaattaaagaccacattactagcttttaaccaccacaaggtatgagattttactttatctaac 12645233  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    ||  ||||||  | |||||| |  |||| ||| | ||||||||| | ||||||||| || ||| |||||||  ||| |||||||| ||| || || || |    
T  12645234 aaaagtggcatagaactttgacggtttctaaataacctatcatttcgttcattccataaaacccaaacacactgcagccaaatcaaatgaaataaggatc 12645333  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 313  Q
    | |  | | |||| |  | ||| || | ||||||||||  || ||||| |||| | |   ||||||| |||||| | || || ||||| || |||||||     
T  12645334 gacggcgtttcaagcctcatgcatattcaataaattgcgtaaaatgatctgaaatagcaagagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccat 12645433  T
Q  314 tggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaa 413  Q
     ||||| || || |||||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||| || ||||| |    
T  12645434 aggccacaatgcgccaaaaattgggcaagacaaaaacaaatgagtcacatcttcaacatgcccacaccctgtaacacaaaaccgagcctccaaaggtaga 12645533  T
Q  414 atgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatta 513  Q
    || |  |||| || ||||||   |||||||||||| |  || | |||||| | |||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12645534 attctgcgatctgtcaaattgtattttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttttagagaaacctgtttatgccaaatta 12645633  T
Q  514 agtccatatt 523  Q
    | ||||||||    
T  12645634 actccatatt 12645643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 306 - 521
Target Start/End: Original strand, 28252610 - 28252825
Alignment:
Q  306 cgcaccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttca 405  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| || |||||||| |||||| ||| ||    
T  28252610 cgcaccaaagaccataaggcaccaaaaaatggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcatcatgaccacaaccggaaacacataaccgcccctcca 28252709  T
Q  406 caggtaaaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatg 505  Q
     | | | ||||||| | |||||||||||    || |||||||| |  || | ||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  28252710 tatgaataatgccatggtttgccaaatttcccttcgtaggtaagcgatccctcaaaagccgccaagcaagaatagatacttttagaggtacctgtttatg 28252809  T
Q  506 ccaaattaagtccata 521  Q
    ||||||||| ||||||    
T  28252810 ccaaattaattccata 28252825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 115
Target Start/End: Original strand, 40176274 - 40176369
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaa 115  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40176274 aagcgggctcgaccaccaattatgagttccaaaagtaaagaccacattactagctttcaaccaccacatggaatttgattttactttatctaacaa 40176369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 121
Target Start/End: Original strand, 28252329 - 28252426
Alignment:
Q  24 gggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtgg 121  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  28252329 gggctcgaccaccaattatgagtaccatagctaaaaacaatattactagcttttaaccaccacaaagaagatgattttactttgtctaacatttgtgg 28252426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 33516320 - 33516225
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaa 115  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| || || || |||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33516320 aagcgggctcgaccaccaattatgagtaccaaaagtaaagaccacgttactagctttcaaccaccacatggaatttgattttactttatctaacaa 33516225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 273 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 11000233 - 11000127
Alignment:
Q  273 tgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacat 372  Q
    |||||||| |||||| | || || |||||||| |||||||  ||||| || ||||||||| ||  |||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  11000233 tgagaatctaccccttcgacaccaagccatgcccgcaccataggccacaatgcaccaaaaattggacaagataagaacaaatgattcacatcttcaacat 11000134  T
Q  373 tcccaca 379  Q
     ||||||    
T  11000133 gcccaca 11000127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 121
Target Start/End: Original strand, 44022966 - 44023067
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    |||||||||| || |||| | |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||  | | ||||||| |||||||||||||| |||    
T  44022966 aagcgggctcaactaccaattatgagtaccaaaagtaaagaccacattactagctttcaaccaccacagggtatttgattttactttatctaacaactgt 44023065  T
Q  120 gg 121  Q
    ||    
T  44023066 gg 44023067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Original strand, 44472961 - 44473056
Alignment:
Q  19 aaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaaca 114  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||   | ||||  ||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  44472961 aaagagggctcgaccaccacgaatgagtaccaaaactaaaggtagcattattagctttcaaccaccacaaagaatatgattttactttatctaaca 44473056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 118
Target Start/End: Original strand, 15391748 - 15391845
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattg 118  Q
    |||||| |||||||||| | |||||| || ||||||||  || | || |||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||    
T  15391748 agcgggttcgaccaccaattatgagtaccgaaactaaagtcagctttactagctttcaaccaccacaaggaataagatttaactttatctaacaattg 15391845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 40914422 - 40914380
Alignment:
Q  13 gacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaact 55  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40914422 gacataaaagcaggcccgaccaccactgatgagtgccaaaact 40914380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 14 - 531
Target Start/End: Original strand, 12733723 - 12734240
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  12733723 acataaaagcgggctcgaccaccgctgttgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagc 12733822  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  12733823 aattgtggcaacgtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagacc 12733922  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 313  Q
    ||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |  ||||||     
T  12733923 gtcgccctctcgaacaaccggcataattaataaattgcacaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactcctaaccaatcctgcaccat 12734022  T
Q  314 tggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaa 413  Q
     |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| || || || |    
T  12734023 cggccataatgctccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacattcccacatctagaaacacataaccgctcctccagagataga 12734122  T
Q  414 atgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatta 513  Q
    ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||  || | ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12734123 atgccacgggttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatta 12734222  T
Q  514 agtccatattatggtgta 531  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  12734223 aatccatattatgatgta 12734240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 24767959 - 24767426
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtg 120  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  24767959 agcggactcgaccaccaattatgaatacccaaactaaatacagcattacaagcttttaaccaccacaaagaagatgatttcactttatctagcatttgtg 24767860  T
Q  121 gcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccc 220  Q
    |||  |  ||||||||||||| |||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||    
T  24767859 gcaaagagctttgtctatttctaaaaattatgtcattacgttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaaaaaagaatgtcgccc 24767760  T
Q  221 tctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccat 320  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  24767759 tctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactccgagccatgcccgcaccaatggtcat 24767660  T
Q  321 aaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccac 420  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24767659 aaggcactaaaagttggacaagacaaaaacaaattattaacatcttcaacgttcccgcaaccaaaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccac 24767560  T
Q  421 gatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccat 520  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  || |  |  ||||  |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24767559 gatttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctaagaagtcgtcaagcaaggatagagactttgataggaacctgtttatgcaaaattaactccat 24767460  T
Q  521 attatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    ||| || ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24767459 attttgatgtaactagggctgctcctgtgatgtc 24767426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 14 - 387
Target Start/End: Original strand, 21167823 - 21168196
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  21167823 acataaaagcgggctcgaccaccactgttgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttagccaccacaaagaagttggtttcactttatctagc 21167922  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    | ||||||||  |||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  21167923 atttgtggcaaagtactttgtctattcctaaaaatcctatcattcttttcattctacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagacc 21168022  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  21168023 gtctccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagaatcgacccccaccactcctagccatgctcgcatcaa 21168122  T
Q  314 tggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaa 387  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21168123 tggccataaagcaccaaaagttacacaagacaaaaacatatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaa 21168196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 18651769 - 18651236
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtg 120  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||| || |||||    
T  18651769 agcgggttcgaccaccaattctgagtaccaaaactaaacacaacattatgagcttttaaccaccacaaagaagatgatataaccttatctagcatttgtg 18651670  T
Q  121 gcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccc 220  Q
    |||  |  ||||||||||||| |||||   | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| |||| |||    
T  18651669 gcaaagagctttgtctatttctaaaaattttgtcattccgttcattccacaacactgaaacacaaagtaaccaaatcaagtgaaaaaaagatcgtcgccc 18651570  T
Q  221 tctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccat 320  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18651569 tctcgaacaacctgcataattaataaattgcaacaaatgatctgaagttgattgagagtcgaccccgaccactcctagccatgctcgcaccaatggcaat 18651470  T
Q  321 aaggcaccaaaagttacacaagacaaa-aacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgcca 419  Q
    ||||| | |||||||  || | ||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||| | || ||||||||| |||    
T  18651469 aaggcgctaaaagttggac-acacaaagaacaagtgattgacatcttcaacggtcccgcatccagagacacacaaccgcgcatccaaaggtaaaatccca 18651371  T
Q  420 cgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtcca 519  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||||  || | ||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18651370 cggttttccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagagactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactcca 18651271  T
Q  520 tattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||| || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  18651270 tattttgatctaactggggctgctcctgtgatgtc 18651236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 265 - 554
Target Start/End: Original strand, 2553486 - 2553775
Alignment:
Q  265 aagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatc 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2553486 aagttgattgagaatcgacccctatcactcctagccatgcccgcaccattggtcataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatc 2553585  T
Q  365 ttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagt 464  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||  ||| |||    
T  2553586 ttcaacgttcccacatccagaaacacacaactgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctttcaaaagt 2553685  T
Q  465 ctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2553686 cgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 2553775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 5734778 - 5734439
Alignment:
Q  19 aaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattg 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  5734778 aaagcggactcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctagcatttg 5734679  T
Q  119 tggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctc 218  Q
    |||||  | |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| ||| || || || |||  |    
T  5734678 tggcaaagaactttgtctatttctaaaaatcttatcattccgttcattccacaccaccgaaacaacaagtaaccaaatcaaatgaaagaaggaacgttgc 5734579  T
Q  219 cctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcc 318  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  5734578 cctctcgaacaacctgcataattaataaattgcacaaaatgatctgaagttgattgagagtcaacccttaccactccaagccatgctcgcaccaatgatc 5734479  T
Q  319 ataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgatt 358  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5734478 ataaagcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgatt 5734439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18789424 - 18789255
Alignment:
Q  11 tggacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatct 110  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18789424 tggacataaaagcgggcttgaccaccagtgatgagtaccaaaactaaatacagcattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatct 18789325  T
Q  111 aacaattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaa 180  Q
    | || ||||||||   || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18789324 agcatttgtggcaaattagtttttctatttctaaaaatcttatcattcctttcattccacaacaccgaaa 18789255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 412 - 554
Target Start/End: Original strand, 21168194 - 21168337
Alignment:
Q  412 aaatgccacgatttgccaaattaatttt-tgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaa 510  Q
    |||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |  ||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  21168194 aaatgccacggtttgccaatttttttttttgtaggtaatcgatcttgcaaaagtctccaagctaggatagatactttgagaggaacctatttatgccaaa 21168293  T
Q  511 ttaagtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21168294 ttaactccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 21168337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 14373523 - 14373026
Alignment:
Q  24 gggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtggca 123  Q
    |||||||||||||| | |||| | ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| |||||  |    
T  14373523 gggctcgaccaccaattatgaataccatagctaaaaacaacattactagcttttaaccaccacaaagaagatgattttactttgtctaacatttgtgata 14373424  T
Q  124 ctgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccctct 223  Q
      | ||| ||  | |||| |||||   |||||||||  |||||||| || ||| ||| |||  | | |||||||| |||||| || || || |    | |    
T  14373423 aagaactctgcatgtttctaaaaactatatcattccgctcattccataaaacccaaaaacactgaagccaaatcaaatggaagaatgatcgacgtgattt 14373324  T
Q  224 caaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataag 323  Q
    ||||| ||| || || | |||||||||||||| |||||  |   | || |||||||| || ||||| || || ||||   | |||||||| | |||||||    
T  14373323 caaactaccagcatactgaataaattgcaaaaaatgattcgtcatagactgagaatcaacgcctacaacccccagccgctcccgcaccaaagaccataag 14373224  T
Q  324 gcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacgat 423  Q
    |||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | || ||||||||||||||| ||| || ||  | ||||||||| |    
T  14373223 gcaccaaaaaatggacaagacaaaaacaaatgatttacatcttcatcatgcccataaccggaaacacacaaccgcccctccatagaaataatgccacggt 14373124  T
Q  424 ttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccata 521  Q
    ||||||||||   ||| |||||||| | ||  | ||| ||   ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14373123 ttgccaaatttcctttcgtaggtaagccgttcctcaaaagctgccaagcaagaatagatacttttagaggtacctgtttatgccaaattaaatccata 14373026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 15959356 - 15958846
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  15959356 acataaaagtgggctcgaccaccaattatgagtaccaaaactaaaaacaacattactaacttttaaccaccacaaagaagatgattttactttgtctaac 15959257  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    | |||||| |  | ||| ||  | |||| |||||  ||||||||||  |||||||| |   || ||  |||    | |||||||| |||||||||||| |    
T  15959256 atttgtggtaaagaactctgcttgtttctaaaaattctatcattccgatcattccataggtcccaattacacttaagccaaatcaaatggaaaaaagatc 15959157  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatg-ctcgcacca 312  Q
     || |  | |||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||| | |||| |    |||| ||  |||||| | || || ||||| | ||| |||||    
T  15959156 ttcgcgatttcaagcaacctgcgtaatgaacaaattgcgaaaaatggtctgaaatatgctgaggatgaaccccttcaaccccaagccaagcctctcacca 15959057  T
Q  313 atggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaa 412  Q
    |||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| ||||| |||||||| || | ||||||  |||  ||||||||| || ||| || ||| |     
T  15959056 atggccataaggcaccaaaaattgggcaagataaaaacaagtgattcacatcttccacgtgcccacaatcagtgacacacaactgcacctccaaaggaat 15958957  T
Q  413 aatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatt 512  Q
     || ||| | |||||||||||   ||| ||||||||    || | ||| || | ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15958956 gataccatggtttgccaaatttgctttcgtaggtaaatgatccctcaaaagccgccaagcaagaatagagactttaagaggaacctgtttatgccatatt 15958857  T
Q  513 aagtccatatt 523  Q
    || | ||||||    
T  15958856 aacttcatatt 15958846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 17579616 - 17579114
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || |||||||| |||||| |||||| | ||||||| |||||||||| |||| ||    
T  17579616 aagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttactagctttcaaccac-acaacgtatttgattttactttatctagcaatagt 17579518  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    || |  | ||| || | |||  |||| | ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||    |||||||||| ||| || || || || | |     
T  17579517 ggtatagaactgtgacgattctgaaataacctatcattccgttctttccataaaaccgagacacattaaaaccaaatcaaatgaaataatgatcgacgcg 17579418  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
     | |||| | |||||| || | ||||||||||| ||  |||| |||  | |  ||||||||||||||| | || || ||||| || |||||||  |||||    
T  17579417 atttcaagccacctgcatattcaataaattgcacaaagtgatctgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccagaggcca 17579318  T
Q  320 taaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgcca 419  Q
     ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || |  ||||| |||||    | ||||| || ||| ||     
T  17579317 caaggcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacagctataatccct 17579218  T
Q  420 cgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtcca 519  Q
    ||     ||||||||  ||| |||||||| |  || | ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17579217 cgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactcca 17579118  T
Q  520 tatt 523  Q
    ||||    
T  17579117 tatt 17579114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 17606870 - 17606367
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  17606870 aagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttgctagctttcaaccaccacaaggtatttgattttactttatctaacaatagt 17606771  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    || |  | |||||| | |||  |||| | ||||||||||  ||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||||| ||| || || || || | |     
T  17606770 ggtatagaactttgacgattctgaaataacctatcattctgttctttccataaaaccgagacacattgaaaccaaatcaaatgaaataatgatcgacgcg 17606671  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
     | |||||| |||||| || | ||||||||||| ||  |||| |||  | |  ||||||||||||||| | || || ||||| || |||||||| | |||    
T  17606670 atttcaaaccacctgcatattcaataaattgcacaaagtgatctgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccaaagacca 17606571  T
Q  320 taaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgcca 419  Q
     || ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||  | || |  ||||| || ||    | ||||| || ||| |||    
T  17606570 caatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgtatcccgttacacaaaatcgattttccacagctataattcca 17606471  T
Q  420 cgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtcca 519  Q
    || |   |||||||   ||| ||||||||    || | ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17606470 cgttccaccaaatttgatttagtaggtaaatgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactcca 17606371  T
Q  520 tatt 523  Q
    ||||    
T  17606370 tatt 17606367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 255
Target Start/End: Original strand, 13937305 - 13937539
Alignment:
Q  21 agcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtg 120  Q
    |||||| |||||||||| | |||| | ||||||||||| || ||||| |||||||| | ||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| ||      
T  13937305 agcgggttcgaccaccaattatgaataccaaaactaaaaactacattactagctttcatccaccacaaggaacatgattttactttatctaacaaatgca 13937404  T
Q  121 gcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctccc 220  Q
    | |  |  || | | ||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||| | | ||||||| |  | |||||| |||||||||||||| ||||   |    
T  13937405 gtaaagagctatatttattttggaaaactctatcattccgctcattccacaatatccaaacacacaaaagccaaattagatggaaaaaagaacgtcgtgc 13937504  T
Q  221 tctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaa 255  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  13937505 tctcataccacctgcataattaataaattgcaaaa 13937539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 273 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 20883316 - 20883066
Alignment:
Q  273 tgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacat 372  Q
    |||||||| |||||| | || || |||||||  |||||||  ||||| || ||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  20883316 tgagaatctaccccttcgacaccaagccatgtccgcaccataggccacaatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcatatcttcaacat 20883217  T
Q  373 tcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagc 472  Q
     |||||| || |  ||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||| | |||| ||   ||| |||||||| |  || | ||| || | ||||||    
T  20883216 gcccacatcccgtgacacaaaaccgagcctccacagatataatgccacgatctaccaagttcgatttagtaggtaaacaatccctcaacagccgccaagc 20883117  T
Q  473 aaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 523  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  20883116 aaggatagaaacttttaaaggaacctatttatgccagattaactccatatt 20883066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 17573938 - 17573688
Alignment:
Q  273 tgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacat 372  Q
    ||||||||||||||| | || || ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  17573938 tgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccagaggccacaaggcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacct 17573839  T
Q  373 tcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagc 472  Q
     |||||| || |  ||||| |||||    | ||||| || ||| || ||     ||||||||  ||| |||||||| |  || | ||| |||| ||||||    
T  17573838 gcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacagctataatccctcgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagc 17573739  T
Q  473 aaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 523  Q
    |||||||||   ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17573738 aaggatagaatcttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 17573688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 21630645 - 21630140
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || |||||||| ||| ||||||| | | ||||||| |||||||||| |||| ||    
T  21630645 aagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttgctagctttcaacaaccacaatgtatttgattttactttatctagcaatagt 21630546  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagaccgtctcc 219  Q
    |  |  | |||||| | |||   ||| | ||||||||||  ||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||||| ||| || || || || | |     
T  21630545 gatatagaactttgacaattctaaaataacctatcattctgttctttccataaaaccgatacacattgaaaccaaatcaaatgaaataatgatcgacgcg 21630446  T
Q  220 ctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggcca 319  Q
     | |||||  |||||| || | ||||||||||| |  ||||| |||| | |  ||||||||||||||| | || || ||||| || |||||||| |||||    
T  21630445 atttcaaaacacctgcatattcaataaattgcacacaatgatctgaaatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggcca 21630346  T
Q  320 taaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgcca 419  Q
     || ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || |  ||||| |||||    | ||||| || ||| |||    
T  21630345 caaagcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagatataatccca 21630246  T
Q  420 cgatttgccaaattaat--ttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtc 517  Q
    || |   |||||||  |  |||||||||||| |  || | |||||||| |||| |||||||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  21630245 cgttccaccaaatttttgattttgtaggtaaacgatccctcaatagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctggttatgccaaattaactc 21630146  T
Q  518 catatt 523  Q
    ||||||    
T  21630145 catatt 21630140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 121
Target Start/End: Original strand, 32536505 - 32536600
Alignment:
Q  26 gctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtgg 121  Q
    |||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  32536505 gctcgaccaccaattattagtaccaaaactaaaaacaacattaatagcttttaaccaccaaaaagaagatgattttactttgtctaacatttgtgg 32536600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 116
Target Start/End: Original strand, 11462013 - 11462115
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | |  |||||| |||||||| |||    
T  11462013 acataaaagcgggctcgaccaccaattatgtgtaccaaaattaaagactacattactagctttcaaccaccacaaggtatgtgattttactttatccaac 11462112  T
Q  114 aat 116  Q
    |||    
T  11462113 aat 11462115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10929840 - 10929649
Alignment:
Q  20 aagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgt 119  Q
    |||| |||||||||||||   ||| || |||||| |||| || |  || |||||||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10929840 aagcaggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttgctagctttcaaccaccacaaggtatttgattttactttatctaacaatagt 10929741  T
Q  120 ggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaaga 211  Q
    || |  | |||||| | |||  |||| | ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||||| ||| || |||||    
T  10929740 ggtatagaactttgacgattctgaaataacctatcattccgttctttccataaaaccgagacacattgaaaccaaatcaaatgaaataaaga 10929649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 10577497 - 10577282
Alignment:
Q  308 caccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcaca 407  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || |  ||||| |||||    | ||||    
T  10577497 caccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccaca 10577398  T
Q  408 ggtaaaatgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgcc 507  Q
    | || ||| ||||| |   |||||||   ||| |||||||| |  || | ||| |||| ||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||    
T  10577397 gttataatcccacgttccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgcc 10577298  T
Q  508 aaattaagtccatatt 523  Q
    ||||||| || |||||    
T  10577297 aaattaactctatatt 10577282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 379
Target Start/End: Original strand, 11462270 - 11462375
Alignment:
Q  273 tgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacat 372  Q
    |||||||| |||||| | || || |||||||| |||||||  ||| | || ||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11462270 tgagaatctaccccttcgacaccaagccatgcccgcaccataggc-acaatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacat 11462368  T
Q  373 tcccaca 379  Q
     ||||||    
T  11462369 gcccaca 11462375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 20883537 - 20883465
Alignment:
Q  49 caaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaacaattgtgg 121  Q
    ||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20883537 caaaattaaagactacattactagctttcaaccaccacaaggtatgtgattttactttatctaacaatagtgg 20883465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 14 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 11747 - 11207
Alignment:
Q  14 acatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaac 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  11747 acataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgacaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatctaga 11648  T
Q  114 aattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagcaaccaaatcagatggaaaaaagacc 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||  ||||| |||||||    
T  11647 aattgtggcaaagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcttttcattccacagcatcgaaacacaaagcagtcaaatcaagtggaagaaagacc 11548  T
Q  214 gtctccctctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaa 313  Q
    | | ||||||| ||||||| || |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||||     
T  11547 gccgccctctcgaacaaccggcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactcctaaccaatcccgcaccat 11448  T
Q  314 tggccataaggcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaa 413  Q
     |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| || |    
T  11447 cggccataatgctccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgaaaaacattttcgacattcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagataga 11348  T
Q  414 atgccacgatttgccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaatta 513  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || |  |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11347 atgccacggtttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctgagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaatta 11248  T
Q  514 agtccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  11247 agtccagattatggtgtagctgggtctgctcctgtgatgtc 11207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 226 - 554
Target Start/End: Original strand, 3062 - 3390
Alignment:
Q  226 aacaacctgcgtaattaataaattgcaaaagatgatatgaagttgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggc 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | || ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  3062 aacaacctgcgtaattgataaattgcaaaaaatgatctgagatagaatgagagtcgactcccaccactcctaaccatgctcgcaccattggccataatgc 3161  T
Q  326 accaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgccttcacaggtaaaatgccacgattt 425  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||    
T  3162 actaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccatggttt 3261  T
Q  426 gccaaattaatttttgtaggtaacctgtctcgcaatagtctccaagcaaggatagatattttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattat 525  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3262 gccaaattgcttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagaaactttaagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattat 3361  T
Q  526 ggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 554  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  3362 ggtgtaactagggttgctcctgtgatgtc 3390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5957 - 5788
Alignment:
Q  11 tggacatcaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatct 110  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5957 tggacataaaagcgggcttgaccaccagtgatgagtaccaaaactaaatacagcattgctagcctttaaccaccacaaagaagttgatttcactttatct 5858  T
Q  111 aacaattgtggcactgtactttgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaa 180  Q
    | || ||||||||   || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5857 agcatttgtggcaaattagtttatctatttctaaaaatcttatcattcctttcattccacaacaccgaaa 5788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 6523 - 6451
Alignment:
Q  42 tgagtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgaagttgatttcactttatctaaca 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||    
T  6523 tgagtaccaaaactaaatacaacattactagctttcaaccaccacaatgaataagattttactttatctaaca 6451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University