View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8912A_low_108 (Length: 317)

Name: NF8912A_low_108
Description: NF8912A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8912A_low_108
NF8912A_low_108
[»] chr2 (145 HSPs)
chr2 (13-288)||(43947466-43947740)
chr2 (13-288)||(39828094-39828370)
chr2 (107-294)||(21115444-21115631)
chr2 (107-276)||(18547176-18547346)
chr2 (129-287)||(21237481-21237640)
chr2 (107-291)||(34136645-34136831)
chr2 (83-285)||(23004497-23004701)
chr2 (83-254)||(26392167-26392335)
chr2 (107-289)||(23790981-23791163)
chr2 (107-289)||(25108625-25108807)
chr2 (107-289)||(24688520-24688702)
chr2 (107-289)||(22413368-22413549)
chr2 (107-277)||(18787134-18787302)
chr2 (32-139)||(18547065-18547171)
chr2 (24-233)||(22252600-22252800)
chr2 (83-237)||(24835036-24835187)
chr2 (107-289)||(20520386-20520567)
chr2 (107-262)||(17306315-17306470)
chr2 (177-289)||(24697827-24697940)
chr2 (107-208)||(23712255-23712356)
chr2 (107-262)||(28653571-28653726)
chr2 (107-277)||(7964-8132)
chr2 (107-207)||(23287154-23287254)
chr2 (21-139)||(34136836-34136952)
chr2 (107-208)||(6725814-6725915)
chr2 (203-288)||(23285528-23285615)
chr2 (86-235)||(5985035-5985183)
chr2 (105-277)||(6725702-6725879)
chr2 (107-209)||(23135407-23135510)
chr2 (105-277)||(23712291-23712468)
chr2 (107-209)||(24367591-24367693)
chr2 (107-209)||(24898438-24898541)
chr2 (107-209)||(24900921-24901024)
chr2 (107-209)||(24903398-24903501)
chr2 (107-209)||(24905875-24905978)
chr2 (107-209)||(24908350-24908453)
chr2 (107-209)||(26505196-26505299)
chr2 (107-209)||(26507674-26507777)
chr2 (107-209)||(39682130-39682233)
chr2 (107-208)||(18808761-18808863)
chr2 (107-208)||(28576917-28577019)
chr2 (107-208)||(32039740-32039842)
chr2 (107-208)||(21155302-21155403)
chr2 (107-208)||(24643193-24643294)
chr2 (107-206)||(571217-571317)
chr2 (107-206)||(23709774-23709874)
chr2 (143-254)||(24529852-24529963)
chr2 (140-247)||(25044898-25045004)
chr2 (145-247)||(356895-356996)
chr2 (140-234)||(24515043-24515136)
chr2 (83-163)||(24697775-24697856)
chr2 (143-277)||(24367481-24367614)
chr2 (107-225)||(10822850-10822967)
chr2 (145-262)||(22689522-22689638)
chr2 (107-208)||(24529772-24529874)
chr2 (113-237)||(24815703-24815824)
chr2 (107-208)||(45030096-45030198)
chr2 (84-225)||(1384735-1384876)
chr2 (142-233)||(19202295-19202384)
chr2 (142-233)||(24435925-24436014)
chr2 (83-232)||(25140843-25140992)
chr2 (142-247)||(9974782-9974886)
chr2 (142-232)||(18391368-18391456)
chr2 (142-247)||(24883319-24883423)
chr2 (142-247)||(26896167-26896271)
chr2 (83-204)||(36839140-36839260)
chr2 (107-235)||(14693131-14693257)
chr2 (142-235)||(21367723-21367814)
chr2 (140-263)||(18389350-18389472)
chr2 (83-139)||(21115636-21115692)
chr2 (145-235)||(5032458-5032546)
chr2 (83-207)||(17306451-17306573)
chr2 (142-232)||(21316804-21316892)
chr2 (142-232)||(21336794-21336882)
chr2 (142-277)||(24643271-24643405)
chr2 (107-225)||(25175623-25175740)
chr2 (186-235)||(25085320-25085368)
chr2 (183-235)||(24782036-24782087)
chr2 (151-225)||(38383-38458)
chr2 (83-126)||(3538817-3538860)
chr2 (193-277)||(21177718-21177802)
chr2 (151-225)||(21900721-21900796)
chr2 (193-247)||(22500740-22500794)
chr2 (193-247)||(22508674-22508728)
chr2 (151-225)||(23060292-23060367)
chr2 (151-225)||(23072217-23072292)
chr2 (151-225)||(23654654-23654729)
chr2 (189-277)||(23713200-23713288)
chr2 (83-205)||(28653468-28653588)
chr2 (154-232)||(3538671-3538747)
chr2 (186-232)||(22258844-22258889)
chr2 (151-225)||(22336905-22336979)
chr2 (196-253)||(34402859-34402916)
chr2 (188-233)||(7672583-7672627)
chr2 (151-232)||(10743996-10744074)
chr2 (136-207)||(18391282-18391350)
chr2 (83-126)||(6576218-6576261)
chr2 (83-122)||(21316760-21316799)
chr2 (83-126)||(22689685-22689728)
chr2 (83-126)||(22694281-22694324)
chr2 (167-225)||(22731516-22731575)
chr2 (151-225)||(23103662-23103737)
chr2 (140-207)||(24515150-24515216)
chr2 (83-122)||(25587691-25587730)
chr2 (208-254)||(28576851-28576897)
chr2 (208-254)||(45030218-45030264)
chr2 (208-253)||(571150-571195)
chr2 (179-225)||(7679391-7679437)
chr2 (208-253)||(18808696-18808741)
chr2 (84-168)||(19357955-19358040)
chr2 (84-122)||(21336663-21336701)
chr2 (208-253)||(23135344-23135389)
chr2 (208-253)||(23709896-23709941)
chr2 (183-233)||(23969774-23969823)
chr2 (208-253)||(24898559-24898604)
chr2 (208-253)||(24905996-24906041)
chr2 (208-253)||(24908471-24908516)
chr2 (208-253)||(26505133-26505178)
chr2 (208-253)||(26507611-26507656)
chr2 (208-253)||(32039862-32039907)
chr2 (84-126)||(44071544-44071586)
chr2 (186-235)||(10897763-10897811)
chr2 (84-125)||(18391268-18391309)
chr2 (188-233)||(20913147-20913191)
chr2 (21-62)||(21073601-21073642)
chr2 (83-139)||(22413306-22413363)
chr2 (83-139)||(23207172-23207229)
chr2 (107-164)||(23713081-23713137)
chr2 (209-253)||(24901043-24901087)
chr2 (209-253)||(24903520-24903564)
chr2 (184-225)||(25587823-25587863)
chr2 (83-123)||(5032328-5032368)
chr2 (107-139)||(7679471-7679503)
chr2 (82-126)||(19202142-19202186)
chr2 (23-67)||(21914751-21914795)
chr2 (107-139)||(22134405-22134437)
chr2 (193-225)||(23076270-23076302)
chr2 (83-139)||(23287259-23287315)
chr2 (193-225)||(23657616-23657648)
chr2 (84-139)||(24688459-24688515)
chr2 (136-207)||(24865739-24865808)
chr2 (109-177)||(28405797-28405865)
chr2 (107-139)||(28405872-28405904)
chr2 (23-63)||(34492371-34492411)
chr2 (188-232)||(44071437-44071480)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (13-288)||(38252-38527)
scaffold0011 (107-203)||(125525-125621)
scaffold0011 (23-161)||(125642-125776)
scaffold0011 (142-232)||(39799-39887)
scaffold0011 (84-207)||(39865-39990)
scaffold0011 (151-225)||(168245-168320)
[»] chr1 (133 HSPs)
chr1 (13-276)||(47190359-47190621)
chr1 (107-294)||(21534100-21534287)
chr1 (107-288)||(52954556-52954729)
chr1 (83-289)||(50686355-50686564)
chr1 (107-289)||(50622176-50622358)
chr1 (107-291)||(21043511-21043697)
chr1 (107-289)||(50614348-50614530)
chr1 (167-291)||(22118518-22118643)
chr1 (23-277)||(23967475-23967724)
chr1 (107-291)||(14800233-14800419)
chr1 (107-291)||(14809107-14809293)
chr1 (107-289)||(26064646-26064828)
chr1 (107-208)||(431577-431678)
chr1 (107-208)||(48520124-48520225)
chr1 (107-204)||(20316250-20316347)
chr1 (83-263)||(51475892-51476071)
chr1 (107-277)||(16368516-16368684)
chr1 (142-277)||(20316134-20316269)
chr1 (160-276)||(16380926-16381041)
chr1 (107-208)||(22123310-22123411)
chr1 (107-274)||(41050267-41050432)
chr1 (107-277)||(16758374-16758540)
chr1 (107-207)||(29297957-29298057)
chr1 (83-207)||(4596811-4596934)
chr1 (107-235)||(19675608-19675735)
chr1 (107-208)||(27161705-27161806)
chr1 (107-235)||(42911906-42912033)
chr1 (107-206)||(21475329-21475429)
chr1 (107-277)||(21896487-21896655)
chr1 (142-277)||(48520012-48520147)
chr1 (24-139)||(22124181-22124294)
chr1 (107-247)||(16059384-16059524)
chr1 (107-225)||(21753820-21753937)
chr1 (107-208)||(23593977-23594079)
chr1 (194-274)||(20957912-20957993)
chr1 (83-237)||(8276948-8277101)
chr1 (107-206)||(21923533-21923633)
chr1 (107-206)||(31612132-31612232)
chr1 (105-277)||(29297844-29298021)
chr1 (107-225)||(20248054-20248170)
chr1 (107-225)||(22922100-22922217)
chr1 (107-225)||(33680779-33680896)
chr1 (107-260)||(42696599-42696753)
chr1 (107-262)||(22349475-22349629)
chr1 (183-262)||(35982141-35982220)
chr1 (140-235)||(20241684-20241778)
chr1 (25-139)||(20958004-20958116)
chr1 (107-235)||(4596915-4597042)
chr1 (83-207)||(20241792-20241915)
chr1 (142-235)||(20587600-20587691)
chr1 (142-235)||(20592138-20592229)
chr1 (107-163)||(13988730-13988786)
chr1 (107-262)||(45754334-45754489)
chr1 (188-262)||(1642361-1642435)
chr1 (83-225)||(44891536-44891677)
chr1 (142-277)||(431466-431600)
chr1 (154-232)||(17904123-17904199)
chr1 (142-266)||(22123388-22123510)
chr1 (107-221)||(22237403-22237516)
chr1 (142-277)||(27161783-27161918)
chr1 (107-225)||(52928202-52928319)
chr1 (83-207)||(16059280-16059403)
chr1 (178-289)||(35261337-35261447)
chr1 (83-207)||(42912014-42912136)
chr1 (188-235)||(14238637-14238683)
chr1 (21-208)||(14800360-14800541)
chr1 (21-208)||(14809234-14809415)
chr1 (120-235)||(19762194-19762306)
chr1 (21-139)||(21043390-21043506)
chr1 (145-247)||(38888167-38888268)
chr1 (142-247)||(20634665-20634769)
chr1 (26-139)||(48520230-48520339)
chr1 (238-287)||(20957880-20957929)
chr1 (153-225)||(34509560-34509633)
chr1 (143-277)||(40388900-40389034)
chr1 (188-247)||(7053147-7053206)
chr1 (107-163)||(22124119-22124175)
chr1 (84-168)||(24720763-24720850)
chr1 (145-233)||(35088347-35088433)
chr1 (183-235)||(43542726-43542777)
chr1 (183-235)||(46383017-46383068)
chr1 (151-225)||(20134961-20135036)
chr1 (151-225)||(27250996-27251071)
chr1 (151-225)||(38801655-38801730)
chr1 (142-233)||(48300735-48300824)
chr1 (84-126)||(14793392-14793434)
chr1 (83-207)||(19675716-19675837)
chr1 (145-235)||(38057707-38057795)
chr1 (145-235)||(41227787-41227875)
chr1 (84-204)||(45754433-45754550)
chr1 (83-139)||(16368454-16368511)
chr1 (83-139)||(26064833-26064890)
chr1 (107-164)||(35261309-35261366)
chr1 (84-168)||(42696730-42696814)
chr1 (151-247)||(43696969-43697064)
chr1 (184-232)||(7322047-7322094)
chr1 (142-226)||(13528849-13528931)
chr1 (151-235)||(20636513-20636595)
chr1 (23-67)||(29764517-29764561)
chr1 (23-67)||(48520352-48520396)
chr1 (184-232)||(51323257-51323304)
chr1 (83-139)||(52954495-52954551)
chr1 (151-230)||(21240300-21240377)
chr1 (166-277)||(21840374-21840486)
chr1 (83-126)||(41227698-41227741)
chr1 (28-67)||(48603283-48603322)
chr1 (167-225)||(50210500-50210559)
chr1 (208-253)||(13988663-13988708)
chr1 (84-126)||(18120610-18120652)
chr1 (83-121)||(21240190-21240228)
chr1 (208-253)||(21475451-21475496)
chr1 (85-139)||(21534041-21534095)
chr1 (143-225)||(21706962-21707044)
chr1 (143-225)||(21711504-21711586)
chr1 (143-208)||(21711564-21711630)
chr1 (208-253)||(21923655-21923700)
chr1 (208-253)||(23594099-23594144)
chr1 (143-208)||(40389012-40389078)
chr1 (184-225)||(22825920-22825960)
chr1 (183-247)||(28194911-28194975)
chr1 (21-62)||(28312485-28312526)
chr1 (83-139)||(35261247-35261304)
chr1 (208-252)||(41372860-41372904)
chr1 (136-207)||(13301800-13301868)
chr1 (184-232)||(18120457-18120504)
chr1 (83-123)||(20587738-20587778)
chr1 (83-123)||(20592276-20592316)
chr1 (107-139)||(21896450-21896482)
chr1 (107-139)||(22237521-22237553)
chr1 (136-207)||(24720777-24720846)
chr1 (107-139)||(33680901-33680933)
chr1 (86-126)||(39060181-39060221)
chr1 (183-235)||(41306049-41306100)
[»] chr7 (196 HSPs)
chr7 (13-288)||(9033447-9033723)
chr7 (83-294)||(11772460-11772671)
chr7 (108-294)||(11525796-11525982)
chr7 (83-294)||(11769083-11769294)
chr7 (83-276)||(17017624-17017818)
chr7 (83-274)||(16091520-16091711)
chr7 (85-289)||(48990926-48991130)
chr7 (107-288)||(38519080-38519263)
chr7 (83-276)||(18203571-18203765)
chr7 (83-265)||(9177835-9178017)
chr7 (107-288)||(16995930-16996113)
chr7 (83-289)||(20220356-20220564)
chr7 (107-276)||(42461669-42461840)
chr7 (107-289)||(15008730-15008912)
chr7 (166-268)||(131106-131208)
chr7 (107-276)||(14044468-14044637)
chr7 (107-276)||(14354498-14354667)
chr7 (83-287)||(1868163-1868368)
chr7 (107-277)||(44116258-44116428)
chr7 (178-289)||(14323117-14323229)
chr7 (107-277)||(12256052-12256220)
chr7 (108-277)||(2282482-2282649)
chr7 (83-235)||(20585291-20585442)
chr7 (111-277)||(18456615-18456781)
chr7 (107-289)||(12901028-12901210)
chr7 (83-262)||(17071245-17071424)
chr7 (11-139)||(38519268-38519394)
chr7 (107-253)||(11393529-11393684)
chr7 (21-139)||(130926-131042)
chr7 (23-208)||(32300939-32301118)
chr7 (140-247)||(14161973-14162080)
chr7 (21-139)||(16996118-16996234)
chr7 (107-208)||(18427350-18427452)
chr7 (142-235)||(14183715-14183807)
chr7 (107-209)||(14949364-14949467)
chr7 (107-209)||(16409876-16409979)
chr7 (107-209)||(24702055-24702158)
chr7 (107-209)||(24704505-24704608)
chr7 (107-209)||(27216677-27216780)
chr7 (105-235)||(44373843-44373971)
chr7 (105-235)||(44382708-44382836)
chr7 (107-208)||(11972314-11972416)
chr7 (107-208)||(16232338-16232440)
chr7 (143-260)||(17130800-17130916)
chr7 (107-208)||(20110373-20110475)
chr7 (107-208)||(21189837-21189939)
chr7 (107-208)||(32125309-32125411)
chr7 (107-208)||(41522735-41522837)
chr7 (107-208)||(41525197-41525299)
chr7 (108-225)||(67513-67629)
chr7 (107-277)||(47831522-47831691)
chr7 (107-206)||(15376955-15377055)
chr7 (83-235)||(3286873-3287023)
chr7 (107-209)||(20385365-20385468)
chr7 (21-139)||(11525673-11525789)
chr7 (83-235)||(13699711-13699862)
chr7 (140-234)||(15281165-15281257)
chr7 (107-225)||(16056101-16056218)
chr7 (107-225)||(22072766-22072883)
chr7 (142-247)||(36686291-36686396)
chr7 (21-139)||(42461845-42461961)
chr7 (107-208)||(48273209-48273311)
chr7 (107-207)||(456140-456241)
chr7 (151-235)||(16461403-16461488)
chr7 (151-235)||(16579344-16579429)
chr7 (143-277)||(17062155-17062289)
chr7 (83-207)||(19282055-19282178)
chr7 (183-262)||(9390158-9390237)
chr7 (107-230)||(19281952-19282074)
chr7 (142-233)||(61510-61599)
chr7 (83-235)||(43277776-43277926)
chr7 (107-225)||(18005418-18005535)
chr7 (107-225)||(44013951-44014068)
chr7 (142-247)||(48811694-48811798)
chr7 (83-207)||(12466226-12466349)
chr7 (151-277)||(14257988-14258114)
chr7 (151-277)||(20110261-20110387)
chr7 (142-235)||(32300870-32300962)
chr7 (143-224)||(48273150-48273231)
chr7 (154-233)||(4070630-4070707)
chr7 (142-233)||(8852256-8852345)
chr7 (183-234)||(12466409-12466460)
chr7 (140-235)||(14220142-14220235)
chr7 (111-209)||(15082128-15082226)
chr7 (145-247)||(18875943-18876045)
chr7 (83-263)||(47094005-47094178)
chr7 (178-277)||(15082237-15082336)
chr7 (107-225)||(16219949-16220065)
chr7 (145-235)||(20619113-20619201)
chr7 (143-225)||(29329199-29329281)
chr7 (107-235)||(10660275-10660401)
chr7 (82-235)||(12371172-12371327)
chr7 (151-235)||(16586234-16586318)
chr7 (128-208)||(29329140-29329221)
chr7 (142-235)||(33000864-33000955)
chr7 (105-232)||(8136111-8136235)
chr7 (151-235)||(11066296-11066378)
chr7 (188-247)||(30821952-30822011)
chr7 (140-247)||(36705723-36705829)
chr7 (188-235)||(37785459-37785505)
chr7 (143-232)||(9744114-9744200)
chr7 (83-204)||(14161836-14161956)
chr7 (107-208)||(18640090-18640192)
chr7 (183-235)||(8468101-8468152)
chr7 (107-163)||(14323201-14323257)
chr7 (84-168)||(48213885-48213972)
chr7 (111-225)||(811368-811482)
chr7 (151-225)||(3564569-3564644)
chr7 (188-235)||(11053552-11053598)
chr7 (151-225)||(11996295-11996370)
chr7 (166-277)||(13869090-13869202)
chr7 (167-225)||(16402719-16402778)
chr7 (83-126)||(19558265-19558308)
chr7 (142-232)||(19558366-19558455)
chr7 (151-225)||(28505552-28505627)
chr7 (166-277)||(38898683-38898795)
chr7 (151-225)||(40443232-40443307)
chr7 (193-235)||(12128280-12128321)
chr7 (145-235)||(13150672-13150760)
chr7 (84-126)||(24270776-24270818)
chr7 (84-126)||(25941394-25941436)
chr7 (142-277)||(38227211-38227345)
chr7 (83-139)||(14044642-14044699)
chr7 (83-139)||(14354672-14354729)
chr7 (83-139)||(15008668-15008725)
chr7 (84-125)||(15576925-15576966)
chr7 (197-234)||(16585244-16585281)
chr7 (142-231)||(18075576-18075662)
chr7 (154-235)||(32434734-32434813)
chr7 (188-233)||(38479895-38479939)
chr7 (151-235)||(6170533-6170615)
chr7 (82-126)||(8852168-8852212)
chr7 (136-207)||(11053642-11053711)
chr7 (188-232)||(13133599-13133642)
chr7 (183-235)||(14270496-14270547)
chr7 (82-126)||(15096640-15096684)
chr7 (193-225)||(15144341-15144373)
chr7 (27-67)||(15719826-15719866)
chr7 (23-209)||(16461065-16461252)
chr7 (183-235)||(17232237-17232288)
chr7 (83-168)||(44373946-44374032)
chr7 (83-168)||(44382811-44382897)
chr7 (151-225)||(10588815-10588890)
chr7 (136-207)||(12128183-12128253)
chr7 (83-126)||(13150540-13150583)
chr7 (151-225)||(15755219-15755294)
chr7 (208-254)||(18423442-18423488)
chr7 (208-254)||(18640024-18640070)
chr7 (83-126)||(20619290-20619333)
chr7 (193-232)||(22001350-22001388)
chr7 (84-204)||(33000936-33001054)
chr7 (83-126)||(46387066-46387109)
chr7 (208-253)||(456075-456120)
chr7 (84-126)||(8136045-8136087)
chr7 (193-254)||(10064127-10064188)
chr7 (84-126)||(11053683-11053725)
chr7 (208-253)||(11972249-11972294)
chr7 (84-168)||(14220005-14220090)
chr7 (208-253)||(14949485-14949530)
chr7 (186-232)||(15105215-15105260)
chr7 (186-235)||(15120423-15120470)
chr7 (208-253)||(15377077-15377122)
chr7 (208-253)||(16232273-16232318)
chr7 (208-253)||(16409813-16409858)
chr7 (83-125)||(18075532-18075574)
chr7 (208-253)||(20385486-20385531)
chr7 (208-253)||(21189959-21190004)
chr7 (208-253)||(24701992-24702037)
chr7 (208-253)||(24704442-24704487)
chr7 (144-209)||(26356238-26356304)
chr7 (208-253)||(26356322-26356367)
chr7 (144-209)||(26358690-26358756)
chr7 (208-253)||(26358774-26358819)
chr7 (208-253)||(27216614-27216659)
chr7 (208-253)||(32125244-32125289)
chr7 (178-208)||(38227322-38227352)
chr7 (208-253)||(41522670-41522715)
chr7 (208-253)||(41525132-41525177)
chr7 (145-235)||(45848048-45848136)
chr7 (183-233)||(46387170-46387219)
chr7 (83-139)||(14323262-14323319)
chr7 (142-235)||(20253697-20253788)
chr7 (153-225)||(26211774-26211846)
chr7 (27-67)||(1490304-1490344)
chr7 (107-139)||(2280316-2280348)
chr7 (84-163)||(9744092-9744175)
chr7 (23-67)||(11392118-11392162)
chr7 (83-123)||(18875876-18875916)
chr7 (142-206)||(20619183-20619246)
chr7 (193-225)||(28505650-28505682)
chr7 (23-67)||(32301128-32301172)
chr7 (193-225)||(34200562-34200594)
chr7 (183-235)||(37727999-37728050)
chr7 (107-139)||(44014073-44014105)
chr7 (136-207)||(48213899-48213968)
chr7 (188-232)||(48809592-48809635)
[»] scaffold0001 (7 HSPs)
scaffold0001 (13-291)||(497168-497446)
scaffold0001 (107-225)||(160457-160574)
scaffold0001 (112-261)||(446224-446371)
scaffold0001 (194-235)||(31737-31777)
scaffold0001 (194-235)||(37044-37084)
scaffold0001 (151-233)||(76581-76661)
scaffold0001 (142-207)||(76648-76712)
[»] chr6 (142 HSPs)
chr6 (107-294)||(16492852-16493039)
chr6 (107-290)||(18896539-18896722)
chr6 (107-291)||(19362133-19362317)
chr6 (107-286)||(33442758-33442938)
chr6 (107-274)||(35007873-35008040)
chr6 (21-235)||(18452982-18453194)
chr6 (107-275)||(22117651-22117819)
chr6 (107-275)||(20223667-20223835)
chr6 (111-274)||(23076454-23076618)
chr6 (107-291)||(17229886-17230069)
chr6 (23-203)||(17743032-17743208)
chr6 (107-285)||(23528333-23528510)
chr6 (107-288)||(20136380-20136559)
chr6 (107-288)||(22196310-22196489)
chr6 (13-139)||(19362322-19362447)
chr6 (13-137)||(18896414-18896532)
chr6 (25-206)||(27573214-27573391)
chr6 (107-255)||(15705797-15705945)
chr6 (112-289)||(18177907-18178084)
chr6 (142-277)||(17742915-17743050)
chr6 (107-277)||(20108857-20109025)
chr6 (27-262)||(18260117-18260348)
chr6 (107-260)||(22212529-22212680)
chr6 (107-235)||(23538314-23538439)
chr6 (107-289)||(19668080-19668261)
chr6 (107-207)||(1595369-1595469)
chr6 (143-234)||(20078437-20078527)
chr6 (117-277)||(9100813-9100971)
chr6 (83-209)||(17105522-17105645)
chr6 (107-225)||(22080959-22081076)
chr6 (107-225)||(25644111-25644228)
chr6 (107-235)||(7825501-7825628)
chr6 (107-235)||(17105419-17105543)
chr6 (107-235)||(19656484-19656609)
chr6 (105-277)||(1595256-1595433)
chr6 (107-209)||(12742134-12742237)
chr6 (23-209)||(19656248-19656427)
chr6 (107-209)||(26924882-26924985)
chr6 (107-209)||(33861611-33861714)
chr6 (107-208)||(18334834-18334936)
chr6 (107-208)||(19004864-19004966)
chr6 (107-225)||(19651967-19652084)
chr6 (107-208)||(24422365-24422467)
chr6 (86-231)||(27126446-27126590)
chr6 (107-208)||(33864096-33864198)
chr6 (140-260)||(23083374-23083493)
chr6 (178-254)||(25714187-25714263)
chr6 (107-206)||(19859161-19859261)
chr6 (84-232)||(23492259-23492407)
chr6 (84-232)||(23497857-23498005)
chr6 (143-254)||(25688312-25688423)
chr6 (107-208)||(8054847-8054949)
chr6 (113-236)||(16245100-16245219)
chr6 (83-209)||(23538496-23538619)
chr6 (23-139)||(15705679-15705792)
chr6 (107-208)||(20557135-20557236)
chr6 (178-254)||(25656523-25656599)
chr6 (107-209)||(1541153-1541256)
chr6 (107-291)||(13019196-13019379)
chr6 (21-139)||(20078279-20078396)
chr6 (107-208)||(2291422-2291524)
chr6 (193-277)||(19773989-19774072)
chr6 (84-229)||(31735872-31736015)
chr6 (145-261)||(22376952-22377067)
chr6 (108-225)||(27333357-27333473)
chr6 (108-225)||(27394097-27394213)
chr6 (193-235)||(22805519-22805561)
chr6 (107-277)||(23019124-23019293)
chr6 (83-139)||(16493044-16493100)
chr6 (145-233)||(20411837-20411923)
chr6 (83-139)||(23076627-23076683)
chr6 (83-139)||(33442943-33442999)
chr6 (151-225)||(11185291-11185366)
chr6 (142-225)||(20557213-20557296)
chr6 (141-232)||(22556094-22556183)
chr6 (107-209)||(23538418-23538517)
chr6 (183-247)||(25957083-25957147)
chr6 (145-247)||(19830007-19830107)
chr6 (83-139)||(20223840-20223896)
chr6 (188-247)||(20734531-20734591)
chr6 (83-139)||(22117824-22117880)
chr6 (83-139)||(35008045-35008101)
chr6 (151-225)||(20638551-20638626)
chr6 (151-225)||(35245363-35245438)
chr6 (183-233)||(18319505-18319554)
chr6 (83-125)||(23500700-23500742)
chr6 (84-126)||(25920703-25920745)
chr6 (193-235)||(27329002-27329043)
chr6 (193-235)||(27389742-27389783)
chr6 (84-126)||(28947501-28947543)
chr6 (151-225)||(29060320-29060394)
chr6 (112-262)||(15895666-15895813)
chr6 (84-168)||(15895795-15895879)
chr6 (142-235)||(23017246-23017337)
chr6 (23-67)||(15174334-15174378)
chr6 (151-222)||(17288062-17288134)
chr6 (23-67)||(17743218-17743262)
chr6 (23-67)||(18913785-18913829)
chr6 (23-67)||(18937043-18937087)
chr6 (136-207)||(23500659-23500727)
chr6 (193-225)||(25629662-25629694)
chr6 (184-232)||(28947394-28947441)
chr6 (151-225)||(1561081-1561156)
chr6 (151-225)||(16920898-16920973)
chr6 (83-122)||(17319074-17319113)
chr6 (83-126)||(18708505-18708548)
chr6 (208-254)||(19859283-19859329)
chr6 (83-126)||(20136578-20136621)
chr6 (83-126)||(22196248-22196291)
chr6 (167-225)||(22780509-22780568)
chr6 (167-225)||(28496754-28496813)
chr6 (167-225)||(29809165-29809224)
chr6 (142-233)||(31733620-31733709)
chr6 (196-277)||(34963111-34963191)
chr6 (208-253)||(1541274-1541319)
chr6 (208-253)||(2291544-2291589)
chr6 (208-253)||(8054782-8054827)
chr6 (208-253)||(12742071-12742116)
chr6 (143-225)||(16448809-16448891)
chr6 (83-168)||(17229824-17229909)
chr6 (208-253)||(18334956-18335001)
chr6 (208-253)||(19004799-19004844)
chr6 (86-207)||(22556160-22556282)
chr6 (208-253)||(22782025-22782070)
chr6 (151-225)||(22831287-22831356)
chr6 (208-253)||(24422300-24422345)
chr6 (208-253)||(25591120-25591165)
chr6 (208-253)||(26925003-26925048)
chr6 (208-253)||(33861548-33861593)
chr6 (208-253)||(33864031-33864076)
chr6 (184-225)||(19234283-19234323)
chr6 (82-123)||(23017093-23017134)
chr6 (143-208)||(25714276-25714341)
chr6 (151-247)||(27850772-27850867)
chr6 (184-225)||(30674493-30674533)
chr6 (197-233)||(17319215-17319250)
chr6 (193-225)||(19303805-19303837)
chr6 (193-225)||(20076483-20076515)
chr6 (193-225)||(20593598-20593630)
chr6 (107-139)||(22080922-22080954)
chr6 (83-162)||(22212466-22212546)
chr6 (23-67)||(27573158-27573202)
[»] chr5 (134 HSPs)
chr5 (107-294)||(21809809-21809996)
chr5 (107-294)||(21732158-21732345)
chr5 (107-288)||(26740875-26741057)
chr5 (107-255)||(25578261-25578409)
chr5 (107-288)||(23469511-23469694)
chr5 (107-288)||(22178451-22178633)
chr5 (107-247)||(16227232-16227372)
chr5 (107-232)||(25574695-25574820)
chr5 (107-232)||(25575888-25576013)
chr5 (145-289)||(15796130-15796273)
chr5 (177-288)||(26733089-26733201)
chr5 (186-288)||(21330534-21330636)
chr5 (107-274)||(20027172-20027337)
chr5 (107-230)||(23202759-23202883)
chr5 (107-277)||(27989160-27989328)
chr5 (107-225)||(10775919-10776036)
chr5 (105-254)||(2154892-2155046)
chr5 (188-289)||(25743471-25743574)
chr5 (166-247)||(16227522-16227604)
chr5 (107-208)||(2154856-2154957)
chr5 (107-208)||(22412005-22412106)
chr5 (107-209)||(29345797-29345900)
chr5 (107-209)||(29348270-29348373)
chr5 (107-209)||(42245607-42245710)
chr5 (107-208)||(265010-265112)
chr5 (107-225)||(22959762-22959879)
chr5 (143-277)||(11581522-11581656)
chr5 (107-208)||(29329753-29329854)
chr5 (107-234)||(10952881-10953006)
chr5 (107-206)||(20908832-20908932)
chr5 (142-247)||(21555421-21555525)
chr5 (107-209)||(29350743-29350846)
chr5 (107-208)||(11581442-11581544)
chr5 (146-277)||(20918271-20918402)
chr5 (107-225)||(21329728-21329845)
chr5 (107-225)||(21565314-21565431)
chr5 (85-208)||(23202699-23202818)
chr5 (21-208)||(23469635-23469815)
chr5 (105-225)||(21502387-21502506)
chr5 (143-262)||(25250951-25251069)
chr5 (143-262)||(25314736-25314854)
chr5 (107-207)||(32027213-32027313)
chr5 (71-126)||(21330500-21330555)
chr5 (143-225)||(14047880-14047962)
chr5 (142-277)||(29329641-29329776)
chr5 (107-208)||(20918189-20918290)
chr5 (84-207)||(25742803-25742923)
chr5 (107-219)||(22143826-22143937)
chr5 (107-163)||(39245000-39245056)
chr5 (107-218)||(19668675-19668785)
chr5 (142-225)||(22411946-22412028)
chr5 (142-277)||(32027100-32027235)
chr5 (188-247)||(12122583-12122643)
chr5 (83-139)||(21731628-21731684)
chr5 (83-139)||(21809748-21809804)
chr5 (151-226)||(25431173-25431249)
chr5 (107-163)||(26733062-26733118)
chr5 (107-209)||(10733182-10733285)
chr5 (151-225)||(13095274-13095349)
chr5 (142-233)||(20470183-20470272)
chr5 (184-235)||(26761332-26761382)
chr5 (188-234)||(21406772-21406817)
chr5 (143-225)||(24066949-24067031)
chr5 (156-233)||(13536459-13536534)
chr5 (183-247)||(31454785-31454849)
chr5 (136-207)||(20470097-20470165)
chr5 (188-247)||(21558130-21558190)
chr5 (83-139)||(26740814-26740870)
chr5 (151-225)||(8287111-8287186)
chr5 (151-225)||(13025090-13025165)
chr5 (151-225)||(19661102-19661177)
chr5 (140-235)||(20565322-20565415)
chr5 (151-225)||(24493348-24493423)
chr5 (167-225)||(24529000-24529059)
chr5 (84-126)||(8504700-8504742)
chr5 (84-126)||(14026867-14026909)
chr5 (143-225)||(18319272-18319354)
chr5 (107-177)||(26012269-26012339)
chr5 (83-209)||(27989098-27989219)
chr5 (154-247)||(36509873-36509965)
chr5 (196-253)||(39363152-39363209)
chr5 (143-207)||(6551486-6551548)
chr5 (85-126)||(16605390-16605431)
chr5 (193-234)||(17874936-17874976)
chr5 (183-247)||(21742003-21742067)
chr5 (237-274)||(22142523-22142560)
chr5 (193-225)||(1096248-1096280)
chr5 (193-225)||(9077734-9077766)
chr5 (184-232)||(20198817-20198864)
chr5 (154-225)||(21729335-21729407)
chr5 (154-225)||(21808659-21808731)
chr5 (23-67)||(22107670-22107714)
chr5 (83-139)||(25575827-25575883)
chr5 (83-139)||(25578200-25578256)
chr5 (86-126)||(29914344-29914384)
chr5 (142-233)||(19920587-19920676)
chr5 (151-225)||(21293237-21293312)
chr5 (166-277)||(38619218-38619330)
chr5 (208-254)||(39244888-39244934)
chr5 (208-253)||(265132-265177)
chr5 (208-253)||(10733303-10733348)
chr5 (143-208)||(14047940-14048006)
chr5 (84-126)||(20198711-20198753)
chr5 (208-253)||(20908765-20908810)
chr5 (154-232)||(21619101-21619177)
chr5 (83-125)||(25743632-25743674)
chr5 (84-122)||(26761487-26761525)
chr5 (208-253)||(29345734-29345779)
chr5 (208-253)||(29348207-29348252)
chr5 (208-253)||(29350680-29350725)
chr5 (142-247)||(31455398-31455502)
chr5 (143-208)||(36155021-36155087)
chr5 (208-253)||(42245728-42245773)
chr5 (183-247)||(5889621-5889685)
chr5 (184-225)||(16605475-16605515)
chr5 (26-67)||(17010854-17010895)
chr5 (84-125)||(20470083-20470124)
chr5 (184-225)||(22110681-22110721)
chr5 (83-139)||(22178389-22178446)
chr5 (210-262)||(25742726-25742779)
chr5 (140-181)||(25742786-25742827)
chr5 (136-169)||(25743626-25743659)
chr5 (184-225)||(26748941-26748981)
chr5 (107-139)||(20027135-20027167)
chr5 (166-225)||(23064307-23064367)
chr5 (136-207)||(25250863-25250932)
chr5 (136-207)||(25314648-25314717)
chr5 (83-139)||(25574634-25574690)
chr5 (83-135)||(26733001-26733053)
chr5 (23-67)||(29447844-29447888)
chr5 (183-235)||(29915478-29915529)
chr5 (208-253)||(31144025-31144072)
chr5 (177-209)||(39244997-39245029)
chr5 (193-233)||(40725599-40725639)
[»] chr3 (197 HSPs)
chr3 (95-290)||(32404369-32404564)
chr3 (107-288)||(15245726-15245908)
chr3 (107-288)||(15264847-15265029)
chr3 (83-276)||(13919087-13919281)
chr3 (107-291)||(315826-316011)
chr3 (107-254)||(15206678-15206826)
chr3 (23-208)||(43889916-43890098)
chr3 (83-266)||(12377690-12377873)
chr3 (13-137)||(23318814-23318937)
chr3 (13-139)||(15206831-15206956)
chr3 (13-139)||(15245913-15246038)
chr3 (177-288)||(9577414-9577526)
chr3 (83-288)||(37427455-37427658)
chr3 (23-208)||(18700607-18700788)
chr3 (115-235)||(10562544-10562664)
chr3 (107-289)||(43925668-43925849)
chr3 (107-230)||(23318944-23319067)
chr3 (107-277)||(38962134-38962303)
chr3 (13-139)||(15265034-15265159)
chr3 (107-254)||(21618220-21618368)
chr3 (24-163)||(9577497-9577634)
chr3 (107-277)||(24153407-24153577)
chr3 (111-204)||(323851-323944)
chr3 (107-274)||(606556-606721)
chr3 (115-274)||(22110591-22110748)
chr3 (107-208)||(29172826-29172927)
chr3 (83-235)||(44269465-44269615)
chr3 (107-277)||(17661106-17661274)
chr3 (143-254)||(36166326-36166437)
chr3 (84-234)||(20417025-20417172)
chr3 (107-208)||(16283053-16283154)
chr3 (107-208)||(17446896-17446997)
chr3 (107-277)||(52523960-52524129)
chr3 (83-247)||(14153421-14153584)
chr3 (140-235)||(2842555-2842649)
chr3 (107-209)||(10247965-10248068)
chr3 (107-209)||(16454523-16454626)
chr3 (107-209)||(28848853-28848956)
chr3 (107-229)||(35065650-35065771)
chr3 (140-235)||(35353426-35353520)
chr3 (107-277)||(42386140-42386309)
chr3 (83-262)||(46751826-46752004)
chr3 (107-225)||(1644904-1645021)
chr3 (107-208)||(13152033-13152135)
chr3 (107-208)||(13154498-13154600)
chr3 (107-208)||(15977330-15977432)
chr3 (107-208)||(34159144-34159246)
chr3 (107-208)||(36166415-36166517)
chr3 (107-208)||(45607149-45607251)
chr3 (107-208)||(8898913-8899014)
chr3 (107-208)||(9707849-9707950)
chr3 (107-235)||(14441165-14441290)
chr3 (107-206)||(17462998-17463098)
chr3 (107-206)||(55500762-55500862)
chr3 (105-277)||(16283089-16283266)
chr3 (105-277)||(17446932-17447109)
chr3 (109-208)||(41123709-41123808)
chr3 (107-208)||(6469372-6469474)
chr3 (142-277)||(8898801-8898936)
chr3 (107-225)||(12174481-12174598)
chr3 (83-234)||(50349054-50349203)
chr3 (23-139)||(323953-324065)
chr3 (140-233)||(16049753-16049844)
chr3 (83-207)||(35065546-35065669)
chr3 (83-206)||(2842418-2842540)
chr3 (111-276)||(14234200-14234364)
chr3 (153-233)||(16059136-16059214)
chr3 (142-253)||(29172904-29173015)
chr3 (83-247)||(37037750-37037913)
chr3 (145-247)||(14642606-14642707)
chr3 (140-262)||(42327371-42327492)
chr3 (84-204)||(19569277-19569394)
chr3 (107-225)||(32307451-32307568)
chr3 (142-247)||(41173410-41173514)
chr3 (183-259)||(1465872-1465948)
chr3 (190-262)||(8492584-8492656)
chr3 (151-235)||(10542917-10543002)
chr3 (140-233)||(16044277-16044368)
chr3 (142-235)||(18700765-18700857)
chr3 (142-235)||(43890075-43890167)
chr3 (178-260)||(37251427-37251508)
chr3 (107-206)||(45578080-45578180)
chr3 (140-235)||(12506730-12506823)
chr3 (142-233)||(40806868-40806957)
chr3 (142-235)||(5214788-5214879)
chr3 (151-232)||(11191862-11191941)
chr3 (142-235)||(14507774-14507865)
chr3 (112-234)||(15565431-15565547)
chr3 (142-235)||(19569375-19569466)
chr3 (188-247)||(12269179-12269239)
chr3 (188-247)||(15017551-15017610)
chr3 (145-233)||(17538002-17538088)
chr3 (142-225)||(41123651-41123732)
chr3 (145-247)||(6158292-6158393)
chr3 (140-235)||(11886847-11886940)
chr3 (142-233)||(15932545-15932634)
chr3 (142-233)||(17520061-17520150)
chr3 (142-233)||(17534858-17534947)
chr3 (154-225)||(25476653-25476724)
chr3 (142-233)||(30175605-30175694)
chr3 (151-225)||(40213986-40214061)
chr3 (142-233)||(40811683-40811772)
chr3 (188-231)||(42353620-42353663)
chr3 (142-247)||(17043953-17044057)
chr3 (151-225)||(17207051-17207123)
chr3 (145-231)||(19884555-19884640)
chr3 (145-235)||(22307696-22307784)
chr3 (83-204)||(35353537-35353657)
chr3 (145-235)||(45531678-45531766)
chr3 (186-235)||(53646972-53647020)
chr3 (83-139)||(316016-316072)
chr3 (188-277)||(10901479-10901568)
chr3 (23-67)||(12469741-12469785)
chr3 (142-233)||(5206694-5206783)
chr3 (188-262)||(9644329-9644403)
chr3 (107-233)||(11258297-11258421)
chr3 (151-225)||(13210595-13210670)
chr3 (189-263)||(16728166-16728240)
chr3 (151-225)||(17487636-17487711)
chr3 (151-225)||(17499118-17499193)
chr3 (151-225)||(23083627-23083702)
chr3 (84-126)||(6155695-6155737)
chr3 (84-126)||(11192008-11192050)
chr3 (83-204)||(11258405-11258525)
chr3 (151-277)||(14670586-14670713)
chr3 (151-277)||(14682108-14682235)
chr3 (138-207)||(16059243-16059310)
chr3 (151-225)||(18438314-18438388)
chr3 (21-99)||(32403068-32403145)
chr3 (196-253)||(55476259-55476316)
chr3 (85-126)||(14519412-14519453)
chr3 (188-233)||(15448082-15448126)
chr3 (188-225)||(16097139-16097176)
chr3 (188-233)||(31415067-31415111)
chr3 (83-139)||(43925854-43925911)
chr3 (153-232)||(6145934-6146010)
chr3 (184-232)||(11562450-11562497)
chr3 (140-224)||(12512871-12512953)
chr3 (23-67)||(16796334-16796378)
chr3 (184-232)||(17259292-17259339)
chr3 (23-67)||(35961767-35961811)
chr3 (84-227)||(54331374-54331519)
chr3 (83-126)||(5214923-5214966)
chr3 (166-277)||(8499262-8499374)
chr3 (151-225)||(12398988-12399063)
chr3 (142-233)||(13031816-13031905)
chr3 (83-126)||(14507909-14507952)
chr3 (208-254)||(15977264-15977310)
chr3 (83-126)||(17519909-17519952)
chr3 (83-126)||(17534771-17534814)
chr3 (142-225)||(17548606-17548687)
chr3 (188-235)||(17669148-17669194)
chr3 (83-126)||(22307587-22307630)
chr3 (167-225)||(26683134-26683193)
chr3 (208-254)||(28848974-28849020)
chr3 (83-126)||(40807001-40807044)
chr3 (83-126)||(40811816-40811859)
chr3 (151-225)||(43840712-43840787)
chr3 (208-254)||(45578202-45578248)
chr3 (83-126)||(45804362-45804405)
chr3 (84-126)||(1208937-1208979)
chr3 (208-253)||(9707970-9708015)
chr3 (208-253)||(10248086-10248131)
chr3 (208-253)||(13152155-13152200)
chr3 (208-253)||(13154620-13154665)
chr3 (138-207)||(16044384-16044451)
chr3 (107-177)||(16103601-16103671)
chr3 (208-253)||(16454644-16454689)
chr3 (84-126)||(17044101-17044143)
chr3 (208-253)||(17462931-17462976)
chr3 (208-253)||(34159079-34159124)
chr3 (208-253)||(45607271-45607316)
chr3 (208-253)||(55500696-55500741)
chr3 (188-221)||(15467654-15467687)
chr3 (83-139)||(22110521-22110578)
chr3 (184-225)||(24545558-24545598)
chr3 (84-121)||(24545691-24545728)
chr3 (188-233)||(31225039-31225083)
chr3 (107-209)||(42386250-42386346)
chr3 (184-225)||(50756455-50756495)
chr3 (23-67)||(324075-324119)
chr3 (107-139)||(9512816-9512848)
chr3 (107-139)||(9520791-9520823)
chr3 (23-67)||(10542503-10542547)
chr3 (193-225)||(11425024-11425056)
chr3 (107-139)||(12174444-12174476)
chr3 (193-225)||(13442097-13442129)
chr3 (193-225)||(14972638-14972670)
chr3 (166-225)||(15412225-15412285)
chr3 (107-139)||(15470818-15470850)
chr3 (107-139)||(16103676-16103708)
chr3 (83-126)||(17207191-17207235)
chr3 (142-206)||(24545616-24545679)
chr3 (107-163)||(37251399-37251455)
chr3 (193-233)||(37642571-37642611)
chr3 (23-67)||(43889862-43889906)
chr3 (107-139)||(49668269-49668301)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (107-294)||(19877-20064)
scaffold0106 (13-125)||(19746-19858)
scaffold0106 (107-225)||(15437-15555)
[»] chr8 (172 HSPs)
chr8 (110-290)||(16799192-16799372)
chr8 (115-288)||(20502339-20502513)
chr8 (107-288)||(22995551-22995733)
chr8 (107-288)||(28397258-28397440)
chr8 (107-290)||(22963642-22963826)
chr8 (107-290)||(37515233-37515417)
chr8 (107-291)||(22525264-22525449)
chr8 (107-288)||(22253395-22253576)
chr8 (21-247)||(5083262-5083486)
chr8 (107-289)||(24352729-24352912)
chr8 (140-288)||(22983993-22984142)
chr8 (83-286)||(40493180-40493384)
chr8 (107-288)||(22381962-22382145)
chr8 (107-274)||(22419642-22419808)
chr8 (142-293)||(23667629-23667779)
chr8 (107-276)||(2419100-2419270)
chr8 (107-276)||(17439736-17439906)
chr8 (13-139)||(28397445-28397570)
chr8 (108-255)||(17086382-17086529)
chr8 (167-288)||(35027106-35027226)
chr8 (108-289)||(19155118-19155300)
chr8 (13-139)||(22995738-22995863)
chr8 (107-254)||(26219489-26219636)
chr8 (111-254)||(20533643-20533787)
chr8 (32-139)||(37515422-37515528)
chr8 (13-139)||(16799381-16799506)
chr8 (83-233)||(23944158-23944307)
chr8 (107-263)||(5760255-5760409)
chr8 (142-277)||(18833155-18833289)
chr8 (23-208)||(18833266-18833447)
chr8 (107-204)||(41598011-41598108)
chr8 (107-277)||(983637-983805)
chr8 (107-262)||(19929840-19929994)
chr8 (107-208)||(45290938-45291039)
chr8 (136-236)||(6102726-6102824)
chr8 (84-233)||(17907927-17908076)
chr8 (107-208)||(19896084-19896185)
chr8 (23-209)||(5760388-5760566)
chr8 (107-209)||(4542615-4542718)
chr8 (107-209)||(5853534-5853637)
chr8 (107-209)||(14823591-14823694)
chr8 (105-235)||(20179548-20179676)
chr8 (21-139)||(22253273-22253390)
chr8 (107-208)||(1484220-1484322)
chr8 (107-225)||(6520136-6520253)
chr8 (142-277)||(15203551-15203686)
chr8 (107-208)||(20403045-20403147)
chr8 (107-225)||(20498335-20498452)
chr8 (107-225)||(26355893-26356010)
chr8 (107-225)||(38855448-38855566)
chr8 (107-208)||(15203473-15203574)
chr8 (142-276)||(41597896-41598030)
chr8 (143-254)||(26225570-26225681)
chr8 (146-247)||(29763869-29763969)
chr8 (111-208)||(22001572-22001670)
chr8 (107-235)||(25849459-25849585)
chr8 (107-235)||(17217489-17217617)
chr8 (144-262)||(9063-9180)
chr8 (105-277)||(19895972-19896149)
chr8 (141-235)||(19698971-19699063)
chr8 (107-233)||(23888630-23888756)
chr8 (143-225)||(45291017-45291099)
chr8 (107-235)||(22259382-22259508)
chr8 (83-203)||(42818864-42818983)
chr8 (107-163)||(20046437-20046493)
chr8 (143-235)||(23947182-23947272)
chr8 (84-207)||(36405975-36406099)
chr8 (140-231)||(22584787-22584876)
chr8 (140-235)||(23418251-23418344)
chr8 (140-235)||(42819001-42819095)
chr8 (145-262)||(13665522-13665638)
chr8 (145-262)||(13724797-13724913)
chr8 (107-225)||(21673478-21673594)
chr8 (143-232)||(20084608-20084695)
chr8 (107-235)||(39695634-39695760)
chr8 (150-225)||(21389717-21389793)
chr8 (150-225)||(21779043-21779119)
chr8 (21-125)||(22381840-22381942)
chr8 (83-163)||(22963580-22963660)
chr8 (188-247)||(41681761-41681820)
chr8 (84-206)||(18819845-18819970)
chr8 (83-207)||(19699040-19699160)
chr8 (151-225)||(21249163-21249238)
chr8 (151-225)||(21255001-21255076)
chr8 (140-235)||(22244307-22244400)
chr8 (188-235)||(23669325-23669371)
chr8 (142-233)||(24713093-24713182)
chr8 (105-232)||(36728343-36728470)
chr8 (107-208)||(26225490-26225592)
chr8 (83-163)||(19929778-19929858)
chr8 (186-235)||(22207085-22207133)
chr8 (108-225)||(23761077-23761193)
chr8 (107-258)||(42266613-42266763)
chr8 (183-235)||(1323539-1323590)
chr8 (83-139)||(17086320-17086376)
chr8 (188-247)||(18302951-18303010)
chr8 (83-139)||(20502270-20502326)
chr8 (83-139)||(20533578-20533634)
chr8 (188-247)||(21580315-21580375)
chr8 (84-168)||(22473551-22473638)
chr8 (84-207)||(23888697-23888819)
chr8 (151-225)||(5866542-5866617)
chr8 (151-225)||(18818675-18818750)
chr8 (151-225)||(18879495-18879570)
chr8 (151-225)||(20535988-20536063)
chr8 (190-225)||(21673421-21673456)
chr8 (145-208)||(23667756-23667819)
chr8 (165-232)||(31723825-31723890)
chr8 (196-253)||(4483049-4483106)
chr8 (84-126)||(22318883-22318925)
chr8 (107-232)||(22318992-22319114)
chr8 (183-247)||(20983087-20983151)
chr8 (83-139)||(24352917-24352974)
chr8 (188-232)||(2717867-2717910)
chr8 (193-225)||(16092605-16092637)
chr8 (193-233)||(19127863-19127902)
chr8 (83-139)||(19155056-19155112)
chr8 (83-168)||(20179487-20179573)
chr8 (150-225)||(21396247-21396323)
chr8 (184-232)||(21513202-21513249)
chr8 (150-225)||(21790740-21790816)
chr8 (83-139)||(22419581-22419637)
chr8 (83-139)||(22525454-22525510)
chr8 (193-225)||(22874849-22874881)
chr8 (23-67)||(23478209-23478253)
chr8 (193-233)||(33587132-33587171)
chr8 (84-168)||(36733581-36733668)
chr8 (183-235)||(38550453-38550504)
chr8 (84-168)||(45471426-45471512)
chr8 (136-207)||(45471440-45471508)
chr8 (188-232)||(45471569-45471612)
chr8 (166-277)||(14409750-14409862)
chr8 (196-277)||(16413692-16413772)
chr8 (83-126)||(19128015-19128058)
chr8 (208-254)||(20046515-20046561)
chr8 (83-168)||(39695571-39695657)
chr8 (193-247)||(39833581-39833635)
chr8 (142-233)||(39937101-39937190)
chr8 (151-225)||(45131264-45131339)
chr8 (208-253)||(1484155-1484200)
chr8 (208-253)||(4542736-4542781)
chr8 (208-253)||(5853655-5853700)
chr8 (208-253)||(14823528-14823573)
chr8 (84-126)||(17979457-17979499)
chr8 (84-126)||(20025250-20025292)
chr8 (208-253)||(20402980-20403025)
chr8 (84-126)||(21513355-21513397)
chr8 (208-253)||(22001507-22001552)
chr8 (183-237)||(27472750-27472803)
chr8 (186-232)||(38988218-38988263)
chr8 (186-232)||(39019315-39019360)
chr8 (84-207)||(4381735-4381860)
chr8 (151-225)||(17140692-17140768)
chr8 (184-225)||(22343995-22344035)
chr8 (184-225)||(22355655-22355695)
chr8 (184-225)||(22482784-22482824)
chr8 (84-125)||(22584693-22584734)
chr8 (107-139)||(6759149-6759181)
chr8 (183-235)||(13428504-13428555)
chr8 (136-207)||(17217598-17217667)
chr8 (184-232)||(17979605-17979652)
chr8 (107-139)||(20498457-20498489)
chr8 (107-139)||(21673599-21673631)
chr8 (136-207)||(22473555-22473624)
chr8 (136-168)||(22584707-22584739)
chr8 (193-225)||(22626517-22626549)
chr8 (107-139)||(22874955-22874987)
chr8 (107-139)||(23761039-23761071)
chr8 (237-277)||(32121517-32121557)
chr8 (23-67)||(37515546-37515590)
chr8 (83-123)||(38988406-38988446)
chr8 (83-123)||(39019503-39019543)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (13-291)||(57567-57838)
[»] scaffold0347 (2 HSPs)
scaffold0347 (107-288)||(8598-8780)
scaffold0347 (13-139)||(8785-8910)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (107-288)||(17212-17394)
scaffold0293 (32-139)||(17399-17504)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (83-274)||(106043-106235)
scaffold0006 (107-161)||(96842-96896)
scaffold0006 (83-139)||(96901-96957)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (117-288)||(4837-5008)
[»] scaffold0914 (2 HSPs)
scaffold0914 (107-276)||(1421-1591)
scaffold0914 (24-139)||(1596-1710)
[»] scaffold0046 (5 HSPs)
scaffold0046 (107-291)||(17147-17331)
scaffold0046 (107-291)||(26296-26480)
scaffold0046 (13-137)||(17017-17140)
scaffold0046 (32-139)||(26148-26254)
scaffold0046 (107-139)||(26259-26291)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (107-288)||(1602-1785)
scaffold0396 (23-139)||(1790-1904)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (83-249)||(206693-206860)
[»] chr4 (141 HSPs)
chr4 (107-273)||(15791408-15791575)
chr4 (134-277)||(13592404-13592547)
chr4 (107-275)||(14853103-14853272)
chr4 (107-274)||(17333001-17333168)
chr4 (107-235)||(37018448-37018576)
chr4 (13-160)||(15791648-15791794)
chr4 (107-289)||(53082384-53082566)
chr4 (107-288)||(26045523-26045703)
chr4 (107-288)||(26050704-26050884)
chr4 (107-262)||(14825204-14825360)
chr4 (83-288)||(46640624-46640831)
chr4 (107-288)||(16042724-16042904)
chr4 (107-254)||(15355568-15355715)
chr4 (177-276)||(32307212-32307311)
chr4 (20-136)||(13592211-13592326)
chr4 (110-277)||(12288445-12288610)
chr4 (107-208)||(13592334-13592435)
chr4 (107-233)||(40906676-40906801)
chr4 (84-263)||(19734214-19734393)
chr4 (107-277)||(43198783-43198952)
chr4 (107-277)||(14082-14250)
chr4 (107-277)||(52243427-52243596)
chr4 (83-247)||(9637750-9637913)
chr4 (72-139)||(15791580-15791647)
chr4 (21-139)||(26045402-26045518)
chr4 (21-139)||(26050583-26050699)
chr4 (107-233)||(53631609-53631731)
chr4 (107-208)||(52312329-52312430)
chr4 (139-235)||(16997382-16997477)
chr4 (140-246)||(15608186-15608291)
chr4 (107-209)||(44615105-44615208)
chr4 (107-208)||(1837751-1837853)
chr4 (107-208)||(18239661-18239763)
chr4 (107-225)||(39706525-39706642)
chr4 (107-208)||(50222581-50222683)
chr4 (145-261)||(27995643-27995758)
chr4 (107-206)||(7641424-7641524)
chr4 (107-206)||(15118594-15118694)
chr4 (107-206)||(29267440-29267540)
chr4 (107-209)||(18215517-18215620)
chr4 (111-208)||(8575069-8575167)
chr4 (188-261)||(19736373-19736446)
chr4 (83-262)||(40229361-40229540)
chr4 (83-183)||(16997513-16997613)
chr4 (142-235)||(35812528-35812620)
chr4 (143-277)||(44102001-44102135)
chr4 (83-202)||(11424922-11425040)
chr4 (140-247)||(13036855-13036961)
chr4 (107-235)||(21061430-21061558)
chr4 (83-159)||(32307161-32307237)
chr4 (143-235)||(32467272-32467362)
chr4 (185-235)||(14548567-14548617)
chr4 (107-225)||(14927969-14928086)
chr4 (107-208)||(44773329-44773431)
chr4 (107-208)||(54798953-54799055)
chr4 (142-235)||(15042219-15042311)
chr4 (183-259)||(15098932-15099008)
chr4 (142-235)||(15112113-15112205)
chr4 (107-261)||(15364801-15364953)
chr4 (83-207)||(42874762-42874885)
chr4 (141-260)||(20401-20519)
chr4 (107-222)||(14157624-14157738)
chr4 (145-247)||(19435818-19435919)
chr4 (105-266)||(52312229-52312394)
chr4 (83-207)||(25090616-25090739)
chr4 (140-247)||(33244278-33244388)
chr4 (143-254)||(54799033-54799143)
chr4 (188-235)||(3484892-3484938)
chr4 (107-222)||(14164329-14164443)
chr4 (145-247)||(16296394-16296495)
chr4 (83-126)||(55582287-55582330)
chr4 (178-277)||(12582-12681)
chr4 (143-225)||(14280111-14280193)
chr4 (143-225)||(18215597-18215678)
chr4 (116-209)||(37018555-37018647)
chr4 (83-168)||(50160020-50160105)
chr4 (143-277)||(20149575-20149709)
chr4 (107-235)||(25090509-25090635)
chr4 (107-235)||(42874654-42874781)
chr4 (183-235)||(361863-361914)
chr4 (184-232)||(14629671-14629718)
chr4 (83-139)||(14853042-14853098)
chr4 (183-235)||(19857190-19857241)
chr4 (188-247)||(46642492-46642552)
chr4 (140-247)||(51992416-51992522)
chr4 (151-225)||(7798554-7798629)
chr4 (151-225)||(7893482-7893557)
chr4 (83-126)||(16027040-16027083)
chr4 (151-225)||(16377787-16377862)
chr4 (151-225)||(17046265-17046340)
chr4 (151-225)||(22636215-22636290)
chr4 (107-235)||(50159919-50160043)
chr4 (84-126)||(12622442-12622484)
chr4 (83-137)||(17333175-17333229)
chr4 (185-231)||(33185868-33185913)
chr4 (84-126)||(46740139-46740181)
chr4 (145-234)||(10357575-10357662)
chr4 (188-225)||(12773862-12773899)
chr4 (84-232)||(26444775-26444921)
chr4 (23-67)||(13592161-13592205)
chr4 (193-225)||(14038482-14038514)
chr4 (83-139)||(14825365-14825421)
chr4 (21-168)||(15364930-15365074)
chr4 (23-67)||(17048370-17048414)
chr4 (184-232)||(26922828-26922875)
chr4 (23-67)||(40619666-40619710)
chr4 (83-126)||(10357444-10357487)
chr4 (183-234)||(13844212-13844262)
chr4 (151-225)||(14053569-14053644)
chr4 (84-126)||(35659732-35659775)
chr4 (151-225)||(44052608-44052683)
chr4 (83-168)||(20569-20654)
chr4 (208-253)||(1837873-1837918)
chr4 (208-253)||(12033503-12033548)
chr4 (151-225)||(12902537-12902611)
chr4 (143-208)||(14280171-14280237)
chr4 (208-253)||(14718330-14718375)
chr4 (208-253)||(15118716-15118761)
chr4 (208-253)||(18239783-18239828)
chr4 (84-126)||(19566950-19566992)
chr4 (83-168)||(19738108-19738192)
chr4 (83-168)||(40906778-40906864)
chr4 (208-253)||(50222703-50222748)
chr4 (140-233)||(11424812-11424903)
chr4 (188-225)||(52873566-52873603)
chr4 (184-225)||(55582203-55582243)
chr4 (82-126)||(2425562-2425606)
chr4 (184-232)||(2425712-2425759)
chr4 (107-139)||(14038546-14038578)
chr4 (107-163)||(14157720-14157776)
chr4 (107-163)||(14164425-14164481)
chr4 (86-126)||(14629735-14629775)
chr4 (107-139)||(14927932-14927964)
chr4 (83-123)||(15042132-15042172)
chr4 (83-123)||(15112252-15112292)
chr4 (32-68)||(15497281-15497317)
chr4 (145-233)||(19609153-19609238)
chr4 (193-233)||(22353578-22353618)
chr4 (83-126)||(33244142-33244186)
chr4 (107-139)||(39706488-39706520)
chr4 (107-139)||(43198746-43198778)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (107-289)||(4925-5107)
scaffold0081 (82-139)||(4863-4920)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (108-288)||(332026-332208)
scaffold0004 (85-231)||(109119-109265)
scaffold0004 (83-139)||(332214-332270)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (83-286)||(129138-129343)
scaffold0022 (107-289)||(44311-44492)
scaffold0022 (107-289)||(78032-78212)
scaffold0022 (180-254)||(116190-116264)
scaffold0022 (83-139)||(78217-78274)
[»] scaffold0010 (7 HSPs)
scaffold0010 (109-288)||(355-536)
scaffold0010 (107-288)||(6723-6906)
scaffold0010 (107-274)||(117857-118022)
scaffold0010 (21-206)||(481-659)
scaffold0010 (107-221)||(129682-129795)
scaffold0010 (140-235)||(127474-127567)
scaffold0010 (83-163)||(117795-117875)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (107-289)||(2384-2567)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (85-247)||(142369-142531)
scaffold0020 (107-219)||(16013-16124)
[»] scaffold0107 (5 HSPs)
scaffold0107 (107-247)||(10365-10506)
scaffold0107 (107-268)||(35909-36071)
scaffold0107 (85-247)||(10597-10758)
scaffold0107 (21-208)||(36012-36192)
scaffold0107 (185-247)||(16499-16561)
[»] scaffold0077 (4 HSPs)
scaffold0077 (142-275)||(55990-56124)
scaffold0077 (107-207)||(55912-56012)
scaffold0077 (145-235)||(13983-14071)
scaffold0077 (83-139)||(55851-55907)
[»] scaffold0047 (3 HSPs)
scaffold0047 (107-262)||(22014-22170)
scaffold0047 (142-235)||(77956-78047)
scaffold0047 (83-139)||(22175-22231)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (107-262)||(14349-14505)
scaffold0005 (184-232)||(187665-187712)
scaffold0005 (83-139)||(14288-14344)
scaffold0005 (86-126)||(187608-187648)
[»] scaffold0282 (3 HSPs)
scaffold0282 (107-288)||(18398-18581)
scaffold0282 (107-288)||(11901-12084)
scaffold0282 (21-122)||(18276-18375)
[»] scaffold0170 (3 HSPs)
scaffold0170 (109-247)||(2706-2845)
scaffold0170 (24-139)||(2852-2965)
scaffold0170 (145-247)||(2419-2520)
[»] scaffold0453 (1 HSPs)
scaffold0453 (153-289)||(2113-2250)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (83-229)||(2468-2614)
scaffold0357 (107-277)||(16294-16462)
[»] scaffold1539 (2 HSPs)
scaffold1539 (108-233)||(703-828)
scaffold1539 (24-139)||(834-947)
[»] scaffold0485 (2 HSPs)
scaffold0485 (152-288)||(9880-10017)
scaffold0485 (22-139)||(10059-10174)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (83-235)||(19107-19258)
[»] scaffold0292 (4 HSPs)
scaffold0292 (107-235)||(4510-4637)
scaffold0292 (95-139)||(4642-4686)
scaffold0292 (151-225)||(3250-3325)
scaffold0292 (168-225)||(10287-10345)
[»] scaffold0420 (4 HSPs)
scaffold0420 (107-276)||(13913-14082)
scaffold0420 (107-288)||(6459-6640)
scaffold0420 (83-139)||(13851-13908)
scaffold0420 (83-139)||(6397-6454)
[»] scaffold0040 (8 HSPs)
scaffold0040 (107-289)||(10845-11027)
scaffold0040 (107-289)||(103862-104043)
scaffold0040 (146-260)||(21975-22088)
scaffold0040 (116-235)||(102175-102293)
scaffold0040 (83-207)||(102062-102185)
scaffold0040 (87-139)||(11033-11086)
scaffold0040 (89-139)||(22133-22184)
scaffold0040 (83-139)||(103800-103857)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (87-273)||(38155-38341)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (107-277)||(27943-28111)
[»] scaffold0054 (3 HSPs)
scaffold0054 (107-276)||(76060-76227)
scaffold0054 (142-232)||(66124-66212)
scaffold0054 (84-207)||(65943-66066)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (107-277)||(136615-136783)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (107-222)||(12360-12475)
scaffold0383 (218-289)||(3282-3353)
[»] scaffold0452 (2 HSPs)
scaffold0452 (107-235)||(13774-13901)
scaffold0452 (82-164)||(13712-13793)
[»] scaffold0278 (5 HSPs)
scaffold0278 (188-289)||(10785-10886)
scaffold0278 (151-235)||(7332-7415)
scaffold0278 (188-225)||(5417-5454)
scaffold0278 (83-126)||(7565-7608)
scaffold0278 (107-139)||(5538-5570)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (107-235)||(1603-1727)
[»] scaffold0853 (1 HSPs)
scaffold0853 (145-262)||(2933-3050)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (107-268)||(24837-24998)
scaffold0123 (83-139)||(25003-25060)
scaffold0123 (184-225)||(15795-15835)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (83-262)||(56650-56827)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (83-235)||(10772-10923)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (146-277)||(708-840)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (107-277)||(8304-8472)
scaffold0218 (145-247)||(9137-9238)
[»] scaffold0075 (4 HSPs)
scaffold0075 (107-277)||(53780-53948)
scaffold0075 (146-277)||(52248-52379)
scaffold0075 (141-260)||(60100-60218)
scaffold0075 (83-168)||(60268-60353)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (107-253)||(158693-158840)
scaffold0003 (142-235)||(95201-95292)
scaffold0003 (83-122)||(95340-95379)
scaffold0003 (193-225)||(340254-340286)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (107-289)||(260-441)
[»] scaffold0111 (4 HSPs)
scaffold0111 (107-235)||(19871-19998)
scaffold0111 (83-207)||(19767-19890)
scaffold0111 (142-233)||(7186-7275)
scaffold0111 (142-233)||(14305-14394)
[»] scaffold0379 (5 HSPs)
scaffold0379 (83-262)||(14791-14967)
scaffold0379 (107-262)||(4807-4959)
scaffold0379 (83-168)||(4745-4830)
scaffold0379 (184-225)||(9490-9530)
scaffold0379 (184-225)||(16682-16722)
[»] scaffold0034 (5 HSPs)
scaffold0034 (107-225)||(32306-32423)
scaffold0034 (151-235)||(116685-116770)
scaffold0034 (193-235)||(56577-56618)
scaffold0034 (27-125)||(117089-117183)
scaffold0034 (23-66)||(117198-117241)
[»] scaffold0697 (2 HSPs)
scaffold0697 (107-208)||(6421-6522)
scaffold0697 (142-266)||(6321-6444)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (107-208)||(9567-9668)
scaffold0145 (208-253)||(9502-9547)
scaffold0145 (193-225)||(38584-38616)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (107-235)||(63311-63438)
scaffold0032 (83-139)||(63133-63189)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (107-206)||(13212-13312)
scaffold0444 (208-253)||(13145-13190)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (108-277)||(12290-12457)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (107-209)||(40217-40320)
scaffold0044 (208-253)||(40154-40199)
[»] scaffold0028 (12 HSPs)
scaffold0028 (107-209)||(136497-136600)
scaffold0028 (107-209)||(138966-139069)
scaffold0028 (107-209)||(141435-141538)
scaffold0028 (107-209)||(143904-144007)
scaffold0028 (107-209)||(134028-134131)
scaffold0028 (107-177)||(132517-132586)
scaffold0028 (208-253)||(133965-134010)
scaffold0028 (208-253)||(136434-136479)
scaffold0028 (208-253)||(138903-138948)
scaffold0028 (208-253)||(141372-141417)
scaffold0028 (208-253)||(143841-143886)
scaffold0028 (188-232)||(4130-4173)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (107-225)||(6591-6708)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (107-225)||(8291-8408)
scaffold0507 (152-247)||(3025-3119)
[»] scaffold0254 (2 HSPs)
scaffold0254 (107-208)||(20565-20667)
scaffold0254 (208-253)||(20500-20545)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (107-225)||(22901-23018)
scaffold0037 (83-125)||(113612-113654)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (107-208)||(94229-94331)
scaffold0023 (107-208)||(44273-44374)
scaffold0023 (107-225)||(100123-100240)
scaffold0023 (142-277)||(44161-44296)
scaffold0023 (107-225)||(101311-101427)
scaffold0023 (188-225)||(40405-40442)
scaffold0023 (151-225)||(119654-119729)
scaffold0023 (208-253)||(94164-94209)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (107-208)||(30156-30258)
scaffold0013 (143-266)||(30056-30178)
[»] scaffold1695 (1 HSPs)
scaffold1695 (83-232)||(325-474)
[»] scaffold0530 (2 HSPs)
scaffold0530 (107-277)||(1270-1439)
scaffold0530 (107-139)||(1233-1265)
[»] scaffold0394 (2 HSPs)
scaffold0394 (107-204)||(11886-11983)
scaffold0394 (178-277)||(11770-11869)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (112-274)||(2034-2194)
scaffold0737 (151-235)||(6788-6870)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (142-222)||(14365-14445)
scaffold0447 (218-289)||(418-489)
[»] scaffold0230 (3 HSPs)
scaffold0230 (107-206)||(13767-13867)
scaffold0230 (183-233)||(23845-23894)
scaffold0230 (183-233)||(20915-20964)
[»] scaffold0042 (4 HSPs)
scaffold0042 (143-262)||(28155-28273)
scaffold0042 (140-262)||(47579-47700)
scaffold0042 (83-168)||(28288-28374)
scaffold0042 (167-225)||(24404-24463)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (107-237)||(802-930)
[»] scaffold0134 (3 HSPs)
scaffold0134 (107-209)||(37638-37741)
scaffold0134 (185-247)||(10317-10379)
scaffold0134 (208-253)||(37575-37620)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (188-277)||(20116-20204)
[»] scaffold0074 (4 HSPs)
scaffold0074 (21-139)||(8056-8173)
scaffold0074 (83-207)||(535-658)
scaffold0074 (142-235)||(7924-8016)
scaffold0074 (140-247)||(415-521)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (107-225)||(806-923)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (107-235)||(15222-15347)
scaffold0359 (23-168)||(15324-15465)
[»] scaffold0328 (2 HSPs)
scaffold0328 (140-261)||(19699-19819)
scaffold0328 (86-207)||(19603-19723)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (107-262)||(24045-24197)
scaffold0151 (27-168)||(24174-24313)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (107-225)||(24115-24232)
scaffold0100 (184-225)||(10312-10352)
[»] scaffold1662 (2 HSPs)
scaffold1662 (107-235)||(491-617)
scaffold1662 (83-207)||(387-510)
[»] scaffold0500 (2 HSPs)
scaffold0500 (108-235)||(7317-7441)
scaffold0500 (23-126)||(7461-7560)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (140-247)||(7990-8096)
[»] scaffold0445 (2 HSPs)
scaffold0445 (140-232)||(2989-3079)
scaffold0445 (83-207)||(2890-3013)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (145-236)||(13173-13261)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (140-247)||(25871-25977)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (107-222)||(861-975)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (140-246)||(1101-1204)
scaffold0439 (140-246)||(8961-9064)
[»] scaffold0108 (5 HSPs)
scaffold0108 (105-232)||(7936-8063)
scaffold0108 (188-247)||(5268-5327)
scaffold0108 (21-139)||(3152-3269)
scaffold0108 (84-126)||(7876-7918)
scaffold0108 (143-206)||(5425-5487)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (145-247)||(39010-39111)
scaffold0098 (21-168)||(39125-39270)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (140-235)||(397401-397494)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (154-263)||(7186-7294)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (107-225)||(12534-12651)
scaffold0476 (107-139)||(12656-12688)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (107-225)||(1744-1861)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (107-225)||(12711-12828)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (107-225)||(46023-46140)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (107-208)||(44906-45008)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (145-235)||(19513-19601)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (113-237)||(7677-7798)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (142-235)||(124-215)
[»] scaffold0207 (4 HSPs)
scaffold0207 (185-234)||(15479-15528)
scaffold0207 (107-225)||(2875-2991)
scaffold0207 (85-126)||(15460-15501)
scaffold0207 (107-139)||(2838-2870)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (107-277)||(10283-10452)
[»] scaffold1223 (1 HSPs)
scaffold1223 (84-232)||(140-288)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (183-235)||(8272-8324)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (140-247)||(1049-1155)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (151-225)||(1728-1803)
[»] scaffold0220 (4 HSPs)
scaffold0220 (140-235)||(17315-17408)
scaffold0220 (188-247)||(3352-3411)
scaffold0220 (153-247)||(15617-15710)
scaffold0220 (143-207)||(15773-15836)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (107-222)||(29000-29114)
scaffold0211 (107-139)||(28963-28995)
[»] scaffold0064 (4 HSPs)
scaffold0064 (142-233)||(57672-57761)
scaffold0064 (151-225)||(46773-46848)
scaffold0064 (82-126)||(57805-57849)
scaffold0064 (244-288)||(63155-63199)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (140-235)||(78441-78534)
scaffold0036 (83-126)||(78314-78357)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (21-139)||(221315-221432)
scaffold0012 (107-288)||(225197-225376)
[»] scaffold0621 (3 HSPs)
scaffold0621 (107-225)||(6305-6422)
scaffold0621 (107-289)||(8175-8356)
scaffold0621 (188-225)||(1888-1925)
[»] scaffold0601 (2 HSPs)
scaffold0601 (183-233)||(7973-8023)
scaffold0601 (107-208)||(7854-7956)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (188-237)||(15230-15278)
scaffold0338 (84-207)||(11766-11886)
[»] scaffold0142 (2 HSPs)
scaffold0142 (151-266)||(16496-16610)
scaffold0142 (143-208)||(16639-16705)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (151-232)||(65927-66006)
scaffold0056 (151-225)||(17487-17562)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (140-263)||(1240-1362)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (188-263)||(20528-20603)
[»] scaffold0371 (3 HSPs)
scaffold0371 (142-233)||(2755-2844)
scaffold0371 (186-235)||(11398-11446)
scaffold0371 (184-232)||(14497-14544)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (151-225)||(8795-8870)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (110-225)||(19034-19148)
[»] scaffold0083 (4 HSPs)
scaffold0083 (152-235)||(11773-11854)
scaffold0083 (188-235)||(7903-7949)
scaffold0083 (86-168)||(896-979)
scaffold0083 (86-168)||(6200-6283)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (152-235)||(106173-106254)
[»] scaffold1792 (1 HSPs)
scaffold1792 (183-233)||(6-55)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (193-235)||(145680-145722)
scaffold0026 (193-225)||(25719-25751)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (107-225)||(14931-15048)
scaffold0008 (107-209)||(14893-14990)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (188-233)||(1271-1315)
[»] scaffold0065 (2 HSPs)
scaffold0065 (145-261)||(54751-54866)
scaffold0065 (83-233)||(53592-53741)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (84-161)||(61760-61840)
scaffold0063 (188-232)||(73024-73067)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (83-139)||(927-983)
[»] scaffold1815 (1 HSPs)
scaffold1815 (188-247)||(917-976)
[»] scaffold1186 (2 HSPs)
scaffold1186 (184-232)||(556-603)
scaffold1186 (86-126)||(620-660)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (183-235)||(2653-2704)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (183-235)||(44246-44297)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (151-225)||(10692-10767)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (151-225)||(4491-4566)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (151-225)||(16059-16134)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (151-225)||(20448-20523)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (151-225)||(11711-11786)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (151-225)||(53-128)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (151-225)||(31938-32013)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (151-225)||(10078-10153)
[»] scaffold0520 (1 HSPs)
scaffold0520 (84-126)||(378-420)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (145-235)||(13553-13641)
[»] scaffold0375 (3 HSPs)
scaffold0375 (145-235)||(9438-9526)
scaffold0375 (142-207)||(9393-9457)
scaffold0375 (83-123)||(9306-9346)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (84-126)||(20978-21020)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (142-232)||(18893-18981)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (136-225)||(18075-18161)
scaffold0213 (84-163)||(18093-18175)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (151-225)||(37128-37202)
[»] scaffold0112 (2 HSPs)
scaffold0112 (84-126)||(1892-1934)
scaffold0112 (184-225)||(1696-1736)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (143-225)||(1519-1601)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (151-225)||(77610-77684)
[»] scaffold1256 (1 HSPs)
scaffold1256 (136-225)||(359-446)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (84-125)||(3793-3834)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (83-136)||(2581-2634)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (140-260)||(3185-3304)
[»] scaffold0113 (3 HSPs)
scaffold0113 (151-232)||(34191-34270)
scaffold0113 (151-225)||(31846-31921)
scaffold0113 (188-232)||(34092-34135)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (188-233)||(14063-14107)
[»] scaffold0645 (1 HSPs)
scaffold0645 (184-232)||(198-245)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (183-235)||(9931-9982)
[»] scaffold0462 (3 HSPs)
scaffold0462 (23-67)||(10350-10394)
scaffold0462 (186-234)||(317-364)
scaffold0462 (186-234)||(5823-5870)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (193-225)||(3635-3667)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (193-225)||(21868-21900)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (193-225)||(27658-27690)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (23-67)||(21022-21066)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (83-123)||(49083-49123)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (167-225)||(5412-5471)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (190-221)||(3453-3484)
[»] scaffold0505 (2 HSPs)
scaffold0505 (83-126)||(3730-3773)
scaffold0505 (84-126)||(1719-1761)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (166-277)||(10380-10492)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (151-225)||(13274-13349)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (154-225)||(5102-5173)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (166-277)||(8849-8961)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (151-225)||(12992-13067)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (142-225)||(692-773)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (151-221)||(15732-15803)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (188-235)||(10997-11043)
[»] scaffold0333 (3 HSPs)
scaffold0333 (107-225)||(6379-6496)
scaffold0333 (107-139)||(6501-6533)
scaffold0333 (107-139)||(13881-13913)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (84-126)||(7439-7481)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (107-177)||(31919-31989)
scaffold0150 (107-139)||(31994-32026)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (152-225)||(10095-10169)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (186-232)||(55912-55957)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (84-126)||(25656-25698)
[»] scaffold0217 (2 HSPs)
scaffold0217 (196-225)||(16908-16937)
scaffold0217 (107-139)||(16799-16831)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (186-231)||(285-329)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (184-225)||(14962-15002)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (107-139)||(22-54)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (184-232)||(2910-2957)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (193-225)||(6390-6422)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (193-225)||(4964-4996)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (107-139)||(2999-3031)
scaffold0628 (107-139)||(3301-3333)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (193-225)||(15937-15969)
scaffold0120 (193-225)||(17634-17666)
scaffold0120 (193-225)||(33262-33294)
scaffold0120 (193-225)||(45711-45743)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (23-67)||(70700-70744)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 145)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 43947466 - 43947740
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43947466 agatgaaagatgtcgtccaaa-gtattggagtcataagttgatgatgttgtctaa-gttgtacaagtttattgagtccatgcatactcattaaagttggg 43947563  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattg 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43947564 ggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattg 43947663  T
Q  213 gtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  43947664 gtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 43947740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 39828094 - 39828370
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  39828094 agatgaaagatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa-gttgtacaatttgattgagtctatgcatactcattaaagtttgg 39828192  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattg 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39828193 ggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgagagtatatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattg 39828292  T
Q  213 gtaccacatgcatgattaaga-agataagttgcatagtc-aagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  39828293 gtaccacatgcatgattaagagaattaagttgcatagtcaaagtcagagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 39828370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 107 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21115631 - 21115444
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21115631 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattcagttgagggcttgatgcactgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 21115532  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgttacat 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21115531 ggactggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagttgttacat 21115444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 107 - 276
Target Start/End: Original strand, 18547176 - 18547346
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||   |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18547176 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagtgcttgatgccccgagagtgttttaatgctcaaatacgttgagggcttgatgccct 18547275  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18547276 ggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgttgagtcaa 18547346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 129 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21237640 - 21237481
Alignment:
Q  129 gcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgat 228  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21237640 gcctttgctcaattaagttgagggcttgacgccctcagagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggaatggtaccacatgcatgat 21237541  T
Q  229 taagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagtt 287  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21237540 taagaggattaagttgcatagttaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagtt 21237481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34136831 - 34136645
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||| | || ||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  34136831 gttgggggcttgatgccctgtgagcttttgctcaaataagttaagggattgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgcca 34136732  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgtta 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34136731 tggattggtaccacatgcatgattaagaagaataagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttgtta 34136645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 23004701 - 23004497
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||     
T  23004701 ttgagtccatgcatactccttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatactt 23004602  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcg 280  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |    
T  23004601 aaacacgttgagggcttgatgccctggattggtaccatatgcatggttaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagttgcattgtcgagtcaagttg 23004502  T
Q  281 ttaag 285  Q
    |||||    
T  23004501 ttaag 23004497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26392335 - 26392167
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26392335 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctca 26392236  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    | |||||| ||||||||||||||||||    
T  26392235 attacgttgagggtttgatgccctggattggtaccatatgca----ttagaagattaagttgcatagtcaagt 26392167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23791163 - 23790981
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  23791163 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgagggctttatgccctgcaagtatattaatacttaa-tacgttgagggcttgatgccct 23791065  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23791064 agattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagttgt 23790981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25108807 - 25108625
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  25108807 gttgggggcttgatgcccttgagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaa-tacgttgagggcttgatgccct 25108709  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  25108708 ggaataataccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagttgt 25108625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Original strand, 24688520 - 24688702
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||||    
T  24688520 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-taatacgttgaaggcttaatgccct 24688618  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  24688619 ggattggtaccacatgcatgaataagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagttgcattgtcgtgtcaagttgttaagttgt 24688702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Original strand, 22413368 - 22413549
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  22413368 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaa-tacgttgagggcttgatgccct 22413466  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa-tcgttaagttgt 289  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22413467 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaaagttgttaagttgt 22413549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 18787134 - 18787302
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  18787134 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 18787232  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18787233 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 18787302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 139
Target Start/End: Original strand, 18547065 - 18547171
Alignment:
Q  32 aaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcc 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18547065 aaagtattggagtcctaagttgatgatgttctctaa-gttgtataagttgattgagtccatgcatactcattaaagttgggggcttgataccctggagcc 18547163  T
Q  132 tttgctca 139  Q
    ||||||||    
T  18547164 tttgctca 18547171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Original strand, 22252600 - 22252800
Alignment:
Q  24 gtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgcc 123  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  22252600 gtcgttccaaagtgttggagtcctaagttgttgatgttgtccaa-gttgtacacgttg-tggagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatacc 22252697  T
Q  124 ctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 223  Q
    ||| ||||||||||||   | ||||  |||||||||||||  |||  |     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22252698 ctggagcctttgctca-acacgttgggggcttgatgccct-ggagcct----ttgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg-ttggtagcacatgc 22252790  T
Q  224 atgattaaga 233  Q
    ||||||||||    
T  22252791 atgattaaga 22252800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 237
Target Start/End: Original strand, 24835036 - 24835187
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| || |||||||||| ||| | |||| ||||||    
T  24835036 ttgagtccatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggtttgatgccctgtgactgtatttatgctc 24835134  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat 237  Q
       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24835135 --ttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagat 24835187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Original strand, 20520386 - 20520567
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||   | ||||| ||||| |||||||   ||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||    
T  20520386 gttgggggcttgatgccctagagcctttgctcacc-acgttgagggcttcatgccctggaagtatattaatacttaac-acgttgagggcttgatgccct 20520483  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| | | ||||||||||    
T  20520484 ggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagtaacattgtagagtcgagttgttaagttgt 20520567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17306470 - 17306315
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||  |||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  17306470 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggtttgatgccctgggagtgtatttatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccc 17306373  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  17306372 tggattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 17306315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 289
Target Start/End: Original strand, 24697827 - 24697940
Alignment:
Q  177 tgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtca 275  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  24697827 tgctcaattaagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgaataagaggtctaagttgcataatcaagttgaagttgcattgtcgtgtca 24697926  T
Q  276 aatcgttaagttgt 289  Q
    | | ||||||||||    
T  24697927 agttgttaagttgt 24697940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 23712255 - 23712356
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712255 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccct 23712354  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  23712355 gg 23712356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 262
Target Start/End: Original strand, 28653571 - 28653726
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  28653571 gttgagggcttgatgccccgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccc 28653668  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  28653669 tggattggtacaacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 28653726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 7964 - 8132
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||| |||||||| || ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |  || ||||||||||| |||||||    
T  7964 gttgggggtttgatgccttggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgcccttgaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttaatgccct 8062  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8063 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcgagttgaagtcgcattgtcgagtcaaa 8132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23287254 - 23287154
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23287254 gttgggggcttgatgccctagagctttagctcaattaagttgagggcttgatgcactgggagtatattaatgctcaaataagttgagggtttgatgccct 23287155  T
Q  207 g 207  Q
    |    
T  23287154 g 23287154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 34136952 - 34136836
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  34136952 gatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaa-gttgtacacgttg-ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgat 34136855  T
Q  121 gccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  34136854 gccctggagccttcgctca 34136836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6725915 - 6725814
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6725915 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgagagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgtcct 6725816  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  6725815 gg 6725814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 203 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23285615 - 23285528
Alignment:
Q  203 ccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat--aagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  23285615 ccctggattggtaccgcatgcatgatttagaagatttaagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcaagtcaagtcgttaagttg 23285528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5985183 - 5985035
Alignment:
Q  86 agtccatgtatactcat-taaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaa 183  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||| || ||||||| || |||||||| | || || |     
T  5985183 agtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgattccctgtgagcctttgctc-tttacgttgagggtttgatgcgctgtgagtataattatact-at 5985086  T
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5985085 atatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 5985035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6725879 - 6725702
Alignment:
Q  105 aagttgggggcttgatgccctga-agccttt----gctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttg 199  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||    |||||  |||||||| ||||||||| |||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  6725879 aagttgagggcttgatgccctgagagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgtcctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttg 6725780  T
Q  200 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  6725779 atgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 6725702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23135510 - 23135407
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23135510 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 23135411  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  23135410 tgga 23135407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 277
Target Start/End: Original strand, 23712291 - 23712468
Alignment:
Q  105 aagttgggggcttgatgccctga-agccttt----gctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttg 199  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||    |||||  |||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  23712291 aagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttg 23712390  T
Q  200 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  23712391 atgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 23712468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24367693 - 24367591
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24367693 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccct-ggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 24367595  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  24367594 tgga 24367591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 24898438 - 24898541
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24898438 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 24898537  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  24898538 tgga 24898541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 24900921 - 24901024
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24900921 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 24901020  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  24901021 tgga 24901024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 24903398 - 24903501
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24903398 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 24903497  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  24903498 tgga 24903501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 24905875 - 24905978
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24905875 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 24905974  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  24905975 tgga 24905978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 24908350 - 24908453
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24908350 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 24908449  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  24908450 tgga 24908453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26505299 - 26505196
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26505299 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 26505200  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  26505199 tgga 26505196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26507777 - 26507674
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26507777 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 26507678  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  26507677 tgga 26507674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39682233 - 39682130
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39682233 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcccttggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 39682134  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  39682133 tgga 39682130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18808863 - 18808761
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18808863 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 18808764  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  18808763 tgg 18808761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28577019 - 28576917
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28577019 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 28576920  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  28576919 tgg 28576917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 32039740 - 32039842
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32039740 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 32039839  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  32039840 tgg 32039842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 21155302 - 21155403
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  |||  | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155302 gttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccttgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccct 21155401  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  21155402 gg 21155403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 24643193 - 24643294
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643193 gttggaggcttgatgccctagagcctttgctcaattaagttgaaggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccct 24643292  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  24643293 gg 24643294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 571317 - 571217
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  571317 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 571218  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  571217 t 571217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Original strand, 23709774 - 23709874
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23709774 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 23709873  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  23709874 t 23709874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 254
Target Start/End: Original strand, 24529852 - 24529963
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagt 241  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24529852 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttggtggcttgatgccatggattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagt 24529950  T
Q  242 tgcatagtcaagt 254  Q
    |||||||||||||    
T  24529951 tgcatagtcaagt 24529963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25045004 - 25044898
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-a 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || ||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  25045004 tttaagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagctga 25044907  T
Q  239 agttgcata 247  Q
    |||||||||    
T  25044906 agttgcata 25044898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 356996 - 356895
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  356996 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttg 356899  T
Q  244 cata 247  Q
    ||||    
T  356898 cata 356895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24515136 - 24515043
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaa 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24515136 tttaagttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctcaa-tatgttgggggcttgatgtcctagattggtaccacatgcatgactaagaa 24515043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 163
Target Start/End: Original strand, 24697775 - 24697856
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccct 163  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24697775 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 24697856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24367614 - 24367481
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag--ataag 240  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||   ||||    
T  24367614 aagttgagggcttgatgccctg-gagcctatttacgctaaaacacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat-at--agaaggtctaag 24367519  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24367518 ttgcatagtcaagtcggagtcgcatttgtcgagtcaaa 24367481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 10822850 - 10822967
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||| || |||||| |||||||  ||||||||||| ||  | || |||||||| ||||||| ||    
T  10822850 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagtcgagggcttggtgccctagaagtatattaatact-tattacgttgagggtttgatgctct 10822948  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10822949 ggattggtaccacatgcat 10822967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22689638 - 22689522
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  22689638 gttgagggcttgattccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgtatgattaagaagttgaagttg 22689541  T
Q  244 catagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  22689540 catagtcaagttgaagtcg 22689522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 24529772 - 24529874
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||| |   ||  |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24529772 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggtttgatgccttgcaagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 24529871  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  24529872 tgg 24529874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 237
Target Start/End: Original strand, 24815703 - 24815824
Alignment:
Q  113 ggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggatt 211  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||||||  ||  |||||||||||||| |||||| ||    
T  24815703 ggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggctcgatgccctattggtgtatttatgctcttat--gttgagggcttgataccctgg-tt 24815798  T
Q  212 ggtaccacatgcatgattaagaagat 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24815799 ggtaccacatgcatgattaagaagat 24815824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 45030096 - 45030198
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||   | || | |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  45030096 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggatcctttttacgctcaaataaagttgagagcttgatgccc 45030195  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  45030196 tgg 45030198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 225
Target Start/End: Original strand, 1384735 - 1384876
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  |||||| | |||||||  ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  1384735 tgagtccatgcatactcattaaacttaagggcttgatgccctgtgagcctatttgctc-tataagttgcgggcttgatgtcctgtgagtatatttatgct 1384833  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    | | || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1384834 cca-tacgttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcat 1384876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 19202295 - 19202384
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19202295 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 19202384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24436014 - 24435925
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24436014 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 24435925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25140992 - 25140843
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctc-atttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatg 178  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||  |||||| ||||  ||||  || |||||||| | |||||||||| |||    
T  25140992 ttgagtccatccatactcattaaagttgagggcttgatgcgctgtgagcctatttgctctattt--gttgggggattgatgccttgtgagtatatttatg 25140895  T
Q  179 ctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    ||| | || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25140894 ctcta-tatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 25140843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9974886 - 9974782
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aag 240  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  9974886 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaag 9974789  T
Q  241 ttgcata 247  Q
    |||||||    
T  9974788 ttgcata 9974782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 232
Target Start/End: Original strand, 18391368 - 18391456
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18391368 taagttgggggcttgatgccctgtgagtatatttatgctc-tatatgttgggggcttgttgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 18391456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24883423 - 24883319
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aag 240  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||  |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24883423 taagttgagggcttgatgcactgtgagcctatttacactcaa-tacgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaag 24883326  T
Q  241 ttgcata 247  Q
    |||||||    
T  24883325 ttgcata 24883319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26896271 - 26896167
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aag 240  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||  || | | |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26896271 taagttgaggacttgatgccctgtgagcctagttacgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaag 26896174  T
Q  241 ttgcata 247  Q
    |||||||    
T  26896173 ttgcata 26896167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36839260 - 36839140
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||| |||| ||||||    
T  36839260 ttgagtccatgcatactcatttatgttgagagcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccttgagagtgtatttatgctc 36839162  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgcc 204  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  36839161 -aatacgttgagggcttgatgcc 36839140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14693257 - 14693131
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||  ||||||| | || || | ||| |||||||| |||||||||    
T  14693257 gttgggggcttgatgccttgtgagcttttgctc-tttatgttgagggcttgatgccctgcgagtataattatact-atatatgttgagggtttgatgccc 14693160  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14693159 tgt-ttggtaccacatgcatgattaagaag 14693131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21367814 - 21367723
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||  ||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21367814 taagttgagggcttgatgccctatgagcctatttatgctc-tatacgttgtggggttgatgccctgg-ttggtaccacatgcataattaagaag 21367723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 263
Target Start/End: Original strand, 18389350 - 18389472
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-a 238  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||| | || |||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |      
T  18389350 tttaagttgggggcttgatgccctgtgagtataattatactctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaggaagttgt 18389447  T
Q  239 agttgcatagtcaagtcgaagtcgc 263  Q
    ||||||||  || ||||||||||||    
T  18389448 agttgcattatcgagtcgaagtcgc 18389472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 21115692 - 21115636
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21115692 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 21115636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 235
Target Start/End: Original strand, 5032458 - 5032546
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5032458 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgataccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 5032546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17306573 - 17306451
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | | ||  ||||||||||| ||  ||| ||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  17306573 ttgagtccatgcatactcatttacgctgaaggcttgatgccttgtgagcttttgct--tttaagttgagggattgatgccctaggagtgtatttatgctc 17306476  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
     |||| ||||||||||||||||||||    
T  17306475 -aatacgttgagggcttgatgccctg 17306451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 232
Target Start/End: Original strand, 21316804 - 21316892
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21316804 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttatgctc-tatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccagatgcatgattaag 21316892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 232
Target Start/End: Original strand, 21336794 - 21336882
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||  |||| |||||| | || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21336794 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttatgctcta-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 21336882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Original strand, 24643271 - 24643405
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataag 240  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  |||| |  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  ||||    
T  24643271 taagttgagggcttgatgccctgggagcctatttac-ctcaaatacgttggggccttaatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaag 24643367  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  24643368 ttgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 24643405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25175740 - 25175623
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||  || | ||| ||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||  | || |||||| |||||||||  |    
T  25175740 gttgggggcttgatgccctggagatttaggtcaattatgttgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-tattacgttgagagcttgatgcaat 25175642  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25175641 ggattggtaccacatgcat 25175623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25085368 - 25085320
Alignment:
Q  186 aagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25085368 aagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 25085320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Original strand, 24782036 - 24782087
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24782036 aatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 24782087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 38383 - 38458
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38383 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 38458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3538860 - 3538817
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3538860 ttgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 3538817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 277
Target Start/End: Original strand, 21177718 - 21177802
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  21177718 gggcttgatgccctagattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 21177802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 21900721 - 21900796
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21900721 ggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 21900796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22500794 - 22500740
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22500794 gggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 22500740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22508728 - 22508674
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22508728 gggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 22508674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23060367 - 23060292
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23060367 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 23060292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 23072217 - 23072292
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23072217 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 23072292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 23654654 - 23654729
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23654654 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 23654729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 277
Target Start/End: Original strand, 23713200 - 23713288
Alignment:
Q  189 ttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgc-attgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||    
T  23713200 ttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcgagttggagtcgcaattgtcgagtcaaa 23713288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 205
Target Start/End: Original strand, 28653468 - 28653588
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| || ||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| || ||||||| ||  |||| |||| ||||||    
T  28653468 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagg-cttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgatggtttgatgctctgggagtgtatttatgctc 28653565  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    || || ||||||||||||||||||    
T  28653566 aa-tacgttgagggcttgatgccc 28653588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3538747 - 3538671
Alignment:
Q  154 ttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3538747 ttgatgctctgtgagtatatttatgct-atatatgttgggggcttgatgccctgg-ttgataccacatgcatgattaag 3538671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22258889 - 22258844
Alignment:
Q  186 aagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22258889 aagttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgattaag 22258844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22336979 - 22336905
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| |||||    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336979 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 22336905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 253
Target Start/End: Original strand, 34402859 - 34402916
Alignment:
Q  196 cttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34402859 cttgatgccccgtattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 34402916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Original strand, 7672583 - 7672627
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7672583 gttgagggcttgatgccctgg-ttgataccacatgcatgattaaga 7672627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 10743996 - 10744074
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10743996 ggcttgaagccctgtgagtatatttatgctcta-tatgttgggggcttgatgcc-tgg-ttggtaccacatgcatgattaag 10744074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Original strand, 18391282 - 18391350
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  18391282 ctcatttaagttgagggcttgatgccctatgagcctatt--tgctc-tataagttgagggcttgatgtcctg 18391350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 6576261 - 6576218
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  6576261 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 6576218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 21316760 - 21316799
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21316760 ttgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgc 21316799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22689728 - 22689685
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22689728 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 22689685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22694324 - 22694281
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22694324 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 22694281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Original strand, 22731516 - 22731575
Alignment:
Q  167 agtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22731516 agtatattaatactcaaataacgatgggggcttgataccctgtattggtaccacatgcat 22731575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 23103662 - 23103737
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23103662 ggcttgatgccctgaaagtatattactactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 23103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24515216 - 24515150
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  24515216 tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctc-aatacattgagggcttgatgccctg 24515150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 25587691 - 25587730
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25587691 ttgagtccatgcataatcattaaagttgggggcttgatgc 25587730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28576897 - 28576851
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28576897 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaagt 28576851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 254
Target Start/End: Original strand, 45030218 - 45030264
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  45030218 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaagt 45030264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 571195 - 571150
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  571195 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 571150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7679437 - 7679391
Alignment:
Q  179 ctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7679437 ctcaattatgttgggggctttatgccctggattggtaccacatgcat 7679391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18808741 - 18808696
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18808741 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 18808696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19358040 - 19357955
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcatt-aaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  19358040 tgagtccatgcatactcattcaaagttgagggtttgatgccctgtgagcttttgctc-tttacgttgagggcttgatgccctgtgag 19357955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 122
Target Start/End: Original strand, 21336663 - 21336701
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21336663 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgc 21336701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23135389 - 23135344
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23135389 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 23135344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 23709896 - 23709941
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23709896 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 23709941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Original strand, 23969774 - 23969823
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23969774 aatacgttggggacttgatgccctg-attggtaccacatgcatgattaaga 23969823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 24898559 - 24898604
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24898559 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 24898604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 24905996 - 24906041
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24905996 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 24906041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 24908471 - 24908516
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24908471 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 24908516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26505178 - 26505133
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26505178 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 26505133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26507656 - 26507611
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26507656 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 26507611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 32039862 - 32039907
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32039862 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 32039907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 44071586 - 44071544
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44071586 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgccctg 44071544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Original strand, 10897763 - 10897811
Alignment:
Q  186 aagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10897763 aagttgagggcttgatgttcagg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 10897811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Original strand, 18391268 - 18391309
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccct 125  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18391268 tgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccct 18391309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Original strand, 20913147 - 20913191
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  20913147 gttgagggcttgatgccctgg-ttgataccacatacatgattaaga 20913191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 62
Target Start/End: Original strand, 21073601 - 21073642
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttg 62  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21073601 gatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttg 21073642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 22413306 - 22413363
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22413306 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctggagccttcgctca 22413363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 23207229 - 23207172
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23207229 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctggaccctttgctca 23207172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 164
Target Start/End: Original strand, 23713081 - 23713137
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgcccta 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||    
T  23713081 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca-ctacgttgggggcttgatgcccta 23713137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 253
Target Start/End: Original strand, 24901043 - 24901087
Alignment:
Q  209 attggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24901043 attggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 24901087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 253
Target Start/End: Original strand, 24903520 - 24903564
Alignment:
Q  209 attggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24903520 attggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 24903564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Original strand, 25587823 - 25587863
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25587823 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 25587863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 123
Target Start/End: Original strand, 5032328 - 5032368
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgcc 123  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5032328 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgcc 5032368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7679503 - 7679471
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7679503 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 7679471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 19202142 - 19202186
Alignment:
Q  82 attgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19202142 attgagttcatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccctg 19202186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 21914795 - 21914751
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  21914795 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgctaatgttgtctaa 21914751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 22134405 - 22134437
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22134405 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 22134437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23076302 - 23076270
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23076302 gggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 23076270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 23287315 - 23287259
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||| |||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23287315 ttgagttcatgcatacttattcatgtcgggggcttgatgccctggagcctttgctca 23287259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23657648 - 23657616
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23657648 gggcttgataccctggattggtaccacatgcat 23657616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 139
Target Start/End: Original strand, 24688459 - 24688515
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24688459 tgagtccatgcatactcattcattgttgggagcttgatgccctggagcctttgctca 24688515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Original strand, 24865739 - 24865808
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  24865739 ctcatgtaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgct--tataagttgagggcttgatgccctg 24865808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28405865 - 28405797
Alignment:
Q  109 tgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaat 177  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   |||||||||||    
T  28405865 tgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaat 28405797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 28405904 - 28405872
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28405904 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 28405872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 63
Target Start/End: Original strand, 34492371 - 34492411
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgt 63  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34492371 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgt 34492411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44071480 - 44071437
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  44071480 gttgggggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 44071437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 38252 - 38527
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38252 agatgaaagatgttgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa-gttgtacaagttgattgagtccatgcatactcattaaagttggg 38350  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattg 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38351 ggcttgatgccctggagcctatgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatatttatgctcaattaagttgagggcttgatgccctggattg 38450  T
Q  213 gtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  38451 gtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 38527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 125621 - 125525
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  125621 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 125525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 125776 - 125642
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  125776 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaaagttgta--agttg-ttgagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgc 125680  T
Q  123 cctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgcc 161  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  125679 cctggagcctttgctca-ataagttgagggcttgatgcc 125642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39887 - 39799
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  39887 taagttgggggcttgatgccctgtgagtatatttatgctc-tatacgttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcatgtttaag 39799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39990 - 39865
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcat-taaagttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgc 179  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||   |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  | |    
T  39990 tgagtccatgcatattcatctaaagttgagggcttgatgccctatgagcctatttgctctattaagttgacggcttgatgccctgtgagcctatt--ttc 39893  T
Q  180 tcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||    
T  39892 tctactaagttgggggcttgatgccctg 39865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 168245 - 168320
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  168245 ggcttgatgccctggaagtattttaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 168320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 133)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 47190621 - 47190359
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  47190621 agatgaaagatgttgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttatctaa-gatgtacaagttgattgagtccatgcattatcattaaagttggg 47190523  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattg 212  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47190522 ggcttgatgacctggagcctttgctaaattaagttgagagattgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattg 47190423  T
Q  213 gtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47190422 gtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaa 47190359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 107 - 294
Target Start/End: Original strand, 21534100 - 21534287
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21534100 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaatatgttgagggcttgatgccct 21534199  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgttacat 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21534200 ggattggtaccacattcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttgttacat 21534287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Original strand, 52954556 - 52954729
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |        ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52954556 gttggaggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagg--------ccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 52954647  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  52954648 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 52954729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 50686564 - 50686355
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||     
T  50686564 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgcccttgagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatactt 50686465  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa-tc 279  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  50686464 aaacacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatacatgattaagaggtctaggttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaaagtt 50686365  T
Q  280 gttaagttgt 289  Q
    ||||||||||    
T  50686364 gttaagttgt 50686355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Original strand, 50622176 - 50622358
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  50622176 gttgggggcttgatgccatggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaa-tacgttgagggcttgatgccct 50622274  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  50622275 ggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagttgt 50622358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Original strand, 21043511 - 21043697
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||  |  |||||||  |||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21043511 gttgggggcttgatgccctgtgagcttttgcaaaaataagttgggggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccc 21043610  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgtta 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21043611 tggattggtaccacatgcatgattaagaagataaagttgcatagtcaagtttaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttgtta 21043697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Original strand, 50614348 - 50614530
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  50614348 gttgggggcttgatgccatggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaa-tacgttgagggcttgatgccct 50614446  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  50614447 ggactggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagttgt 50614530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 167 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22118643 - 22118518
Alignment:
Q  167 agtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcat 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22118643 agtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgcccttgattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagtcgcat 22118544  T
Q  266 tgtcgagtcaaatcgttaagttgtta 291  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||    
T  22118543 tgtcgagtcaagttgataagttgtta 22118518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23967724 - 23967475
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| || | ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23967724 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaa-gttgta--agttg-ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgc 23967629  T
Q  123 cctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatg 222  Q
    |||| ||| ||||||||   | ||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||| ||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23967628 cctggagcttttgctcaac-acgttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaa-taccttgggagcttgatgccctgtattggtaccacatg 23967531  T
Q  223 catgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23967530 catgattaagaagataaagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgccgagtcaaa 23967475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14800419 - 14800233
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||| || ||||||||||  || | |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14800419 gttgggggcttgatgccctgtgagcttttgctcaaataagttgagggtttgatgccctgggaatgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgtcc 14800320  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgtta 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  14800319 tggattggtatcacatgcatgattaagaagacaaagttgcatagtcaagtcaaagttgcattgtcgagtcaagttgataagttgtta 14800233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14809293 - 14809107
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||| || ||||||||||  || | |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14809293 gttgggggcttgatgccctgtgagcttttgctcaaataagttgagggtttgatgccctgggaatgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgtcc 14809194  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgtta 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  14809193 tggattggtatcacatgcatgattaagaagacaaagttgcatagtcaagtcaaagttgcattgtcgagtcaagttgataagttgtta 14809107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26064828 - 26064646
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||    
T  26064828 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaac-acgttgagggcttgatgccct 26064730  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| | | ||||||||||    
T  26064729 ggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagtttcattgttgagtcgagttgttaagttgt 26064646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 431678 - 431577
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  431678 gttggaggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 431579  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  431578 gg 431577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48520225 - 48520124
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48520225 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgctct 48520126  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  48520125 gg 48520124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20316347 - 20316250
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgcc 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20316347 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgctctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgcc 20316250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 51476071 - 51475892
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || |||    
T  51476071 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactc 51475973  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgc 263  Q
       || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  51475972 -tttatgttgagggcttgatgccttgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcatcgtcgagtcgaagtcgc 51475892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 16368516 - 16368684
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   |||||||| || |  || ||  || |||||||||||||||    
T  16368516 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgcccttgaagtatatttatacgtaa-tacattaagggcttgatgccct 16368614  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368615 ggattggtaccacatgcata--taagaggtttaagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 16368684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20316269 - 20316134
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aag 240  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||  |||| | |||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20316269 taagttgagggcttgatgccttgggagcctatttacgctcaa-tacgttgggggtttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataaag 20316171  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20316170 ttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgtgtcaaa 20316134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16381041 - 16380926
Alignment:
Q  160 ccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagata-agttgcatagtcaagtcgaa 258  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  16381041 ccctgtgagtatattaatactcttat--gttgagggattgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagatgatagagttgcatagtcaagtcaaa 16380944  T
Q  259 gtcgcattgtcgagtcaa 276  Q
    || |||||||||||||||    
T  16380943 gttgcattgtcgagtcaa 16380926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 22123310 - 22123411
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123310 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataagttgagggcttgatgccct 22123409  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  22123410 gg 22123411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 41050267 - 41050432
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |    
T  41050267 gttgagggcttgatgccctagagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaa-tacgttgagggcttgatgcctt 41050365  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtc 274  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41050366 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagttgcattgtcgagtc 41050432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16758540 - 16758374
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||    || |||||||| ||||||||||    
T  16758540 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatact----tacgttgagggtttgatgccct 16758445  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16758444 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcgcatttgtcgagtcaaa 16758374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29298057 - 29297957
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298057 gttgggggcttgatgccctggagcctttgttcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 29297958  T
Q  207 g 207  Q
    |    
T  29297957 g 29297957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Original strand, 4596811 - 4596934
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  4596811 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctaggagtgtatttatgctc 4596909  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
     |||| ||||||||||||||||||||    
T  4596910 -aatacgttgagggcttgatgccctg 4596934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19675735 - 19675608
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||  |||| |||| |||||||| || |||| ||||||||||||     
T  19675735 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggtttgatgccctgggagtgtatttatgctcaa-tatgttgggggcttgatgcct 19675638  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19675637 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 19675608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 27161705 - 27161806
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27161705 gttgggggctggatgccctgtagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataagttgagggtttgatgccct 27161804  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  27161805 gg 27161806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42912033 - 42911906
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  42912033 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaa-tatgttgggggtttgatgccc 42911936  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42911935 tagattggtaccacatgcatgattaagaag 42911906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Original strand, 21475329 - 21475429
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21475329 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctaggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 21475428  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  21475429 t 21475429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 21896487 - 21896655
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || ||| |||||||||||||||    
T  21896487 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgggggcttgatgccctcgaagtatattaatacttat-tacgttcagggcttgatgccct 21896585  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||||||    ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  21896586 ggattggtaccacatgca--cataagaggtttaagttgcatagtcgagttggagtcgcattgtcgagtcaaa 21896655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 48520147 - 48520012
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aag 240  Q
    |||||||| |||||||||| ||  |||| |||| | |||||| || ||||  || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48520147 taagttgagggcttgatgctctgggagtctatttacgctcaa-tacgttggaggtttaatgctctggattggtaccacatgcatgattaagaagataaag 48520049  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  48520048 ttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtttagtcaaa 48520012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22124294 - 22124181
Alignment:
Q  24 gtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgcc 123  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||| | || ||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22124294 gtcgttccaaagtgttggagtcataagttgttgatgttggctaa-gttgcacacgttg-ttgagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgcc 22124197  T
Q  124 ctgaagcctttgctca 139  Q
    ||| ||||||||||||    
T  22124196 ctggagcctttgctca 22124181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 247
Target Start/End: Original strand, 16059384 - 16059524
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||||  ||||||| || |||| |||||||||||||    
T  16059384 gttgagggcttgatgtcctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgagagtgtatttttgctcaa-tatgttgggggcttgatgccc 16059481  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16059482 tgaattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 16059524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21753937 - 21753820
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||   ||||||||||| ||  | || |||||||| ||||||||||    
T  21753937 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgggggcttgatgccctggaagtatattaatact-tattacgttgaggggttgatgccct 21753839  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21753838 ggattggtaccacatgcat 21753820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 23593977 - 23594079
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23593977 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 23594076  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  23594077 tgg 23594079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20957993 - 20957912
Alignment:
Q  194 ggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  20957993 ggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagaataagttgcagagtcacgtcgaagttgcatagtcaagtc 20957912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 237
Target Start/End: Original strand, 8276948 - 8277101
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcatta-aagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    ||||||||| | |||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||| |||| |||||    
T  8276948 ttgagtccacgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttacgttgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgct 8277046  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat 237  Q
    |   || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8277047 ctt-tatgttgagggcttgatgtcctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagat 8277101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Original strand, 21923533 - 21923633
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21923533 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 21923632  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  21923633 t 21923633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31612232 - 31612132
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||  |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31612232 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcacttaagttgagggtttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 31612133  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  31612132 t 31612132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29298021 - 29297844
Alignment:
Q  105 aagttgggggcttgatgccctga-agccttt----gctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttg 199  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||    |||||  |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||||||  ||| |||||||    
T  29298021 aagttgagggcttgatgccctgggagcctttttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaaatacattgggggcttg 29297922  T
Q  200 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  29297921 atgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttacatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 29297844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20248170 - 20248054
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  20248170 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgg-ggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 20248073  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20248072 ggattggtaccacatgcat 20248054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 22922100 - 22922217
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  22922100 gttgggggcttgatgccctggagctttaactcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 22922198  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22922199 ggattggtaccacatgcat 22922217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33680896 - 33680779
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||| ||||||||||||||    
T  33680896 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgggggcttgatgccct 33680798  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33680797 ggattggtaccacatgcat 33680779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 42696753 - 42696599
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 203  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||| ||||||||| | | |||||||| | || ||| |  | ||||||||||||||||    
T  42696753 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctc-tttaagttgagggcttgatgtcgtgtgagtataattatactctac-atgttgagggcttgatgc 42696656  T
Q  204 cctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagt 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  42696655 cctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatagtcgagtcgaagt 42696599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22349629 - 22349475
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  | |||||||| | || ||| | || ||||||||||||||||||    
T  22349629 gttgagggcttgaagccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgctttgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgccc 22349532  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  22349531 tgg-ttggtaccaaatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtcgaagtcg 22349475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 262
Target Start/End: Original strand, 35982141 - 35982220
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  35982141 aatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatagtcaagttgaagtcg 35982220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20241778 - 20241684
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||| | |||||||||||  |||| |||| |||||||| || |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20241778 tttaagttgaggacttgatgccctgggagtgtatttatgctcaa-tatgttagggacttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 20241684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20958116 - 20958004
Alignment:
Q  25 tcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccc 124  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | |||||| |||| | |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20958116 tcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaa-gttgtacatgttg-tggagtccatgcgtactcattcatgttgggggcttgatgccc 20958019  T
Q  125 tgaagcctttgctca 139  Q
    |  ||||||||||||    
T  20958018 tcgagcctttgctca 20958004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Original strand, 4596915 - 4597042
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  |  |||| || | ||||| || || |||| |||||||||||||    
T  4596915 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgctttgggagtgtacttatgcttaa-tatgttgggggcttgatgccc 4597012  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4597013 tggattgataccacatgcatgattaagaag 4597042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20241915 - 20241792
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  20241915 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttactc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctc 20241817  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||    
T  20241816 -aatacgttgagggcttgatgtcctg 20241792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20587691 - 20587600
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20587691 taagttaagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 20587600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20592229 - 20592138
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20592229 taagttaagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 20592138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13988786 - 13988730
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccct 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13988786 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 13988730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 45754489 - 45754334
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 203  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||| | || ||| | || ||||||| ||||| ||    
T  45754489 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctc-tttaagttgagggcttgatgccatgtgagtataattatactcta-tatgttgagg-cttgacgc 45754393  T
Q  204 cctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  45754392 cctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtcgaagtcg 45754334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1642435 - 1642361
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||||    
T  1642435 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 1642361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44891677 - 44891536
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcc--tttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgc 179  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||  |||||||  ||||||||| || |||||||||| ||||  ||||  |||    
T  44891677 ttgagtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatt--tgc 44891580  T
Q  180 tcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44891579 tc-tatacgttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 44891536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 431600 - 431466
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataag 240  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  ||||    
T  431600 taagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaag 431504  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  431503 ttgcatagtcgagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 431466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Original strand, 17904123 - 17904199
Alignment:
Q  154 ttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17904123 ttgatgccctgtgagtatatttatgctcta-tatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 17904199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 266
Target Start/End: Original strand, 22123388 - 22123510
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataag 240  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||| |  ||||    
T  22123388 taagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttg-tgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaag 22123484  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgcatt 266  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  22123485 ttgcatagtcaagttggagtcgcatt 22123510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22237516 - 22237403
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  22237516 gttggggtcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttac-tacgttgagggcttgatgccct 22237418  T
Q  207 ggattggtaccacat 221  Q
    ||||| |||||||||    
T  22237417 ggatttgtaccacat 22237403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Original strand, 27161783 - 27161918
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga-agataag 240  Q
    |||||||| || ||||||||||  |||  |||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  ||||    
T  27161783 taagttgagggtttgatgccctgggagcctatttacgctgaaatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagagatctaag 27161880  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  27161881 ttgcataatcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 27161918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 52928202 - 52928319
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  52928202 gttggtggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgcccttgaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 52928300  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
     |||||||| |||||||||    
T  52928301 agattggtatcacatgcat 52928319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Original strand, 16059280 - 16059403
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||| ||||||| ||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  16059280 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggcatgatgccatgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctc 16059378  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||    
T  16059379 -aatacgttgagggcttgatgtcctg 16059403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 289
Target Start/End: Original strand, 35261337 - 35261447
Alignment:
Q  178 gctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaa 276  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||  |||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  35261337 gctcaactaagttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcgaagtcaaattgaagtcgcatcgtcgagtcaa 35261434  T
Q  277 atcgttaagttgt 289  Q
       ||||||||||    
T  35261435 gatgttaagttgt 35261447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42912136 - 42912014
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    |||||||||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||     
T  42912136 ttgagtccatgcgtactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctca-ttaagttgagggcttgatgccct-ggagtttatttatgct- 42912040  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
     |||| ||||||||||||||||||||    
T  42912039 taatacgttgagggcttgatgccctg 42912014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 14238637 - 14238683
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14238637 gttgagggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgattaagaag 14238683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14800541 - 14800360
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||| |||||  | || ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  14800541 gatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtc-caagttgtacacgttg-ttgagctcgtgcatactcatttaagttgagggtttgat 14800444  T
Q  121 gccct-gaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    ||||| | || |||||||||   | ||||  ||||||||||||| ||||     |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14800443 gccctgggagtctttgctca-acacgttgggggcttgatgccctgtgag----cttttgctcaaataagttgagggtttgatgccctgg 14800360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14809415 - 14809234
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||| |||||  | || ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  14809415 gatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtc-caagttgtacacgttg-ttgagctcgtgcatactcatttaagttgagggtttgat 14809318  T
Q  121 gccct-gaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    ||||| | || |||||||||   | ||||  ||||||||||||| ||||     |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14809317 gccctgggagtctttgctca-acacgttgggggcttgatgccctgtgag----cttttgctcaaataagttgagggtttgatgccctgg 14809234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Original strand, 19762194 - 19762306
Alignment:
Q  120 tgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccac 219  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||| |||||||| | || ||| | || |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19762194 tgccctggagcttttgctc-tttacgttgggggcttgatgccctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggctcgatgccctgg-ttggtaccac 19762290  T
Q  220 atgcatgattaagaag 235  Q
    ||| ||||||||||||    
T  19762291 atggatgattaagaag 19762306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Original strand, 21043390 - 21043506
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||  ||||| |||    
T  21043390 gatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtc-caagttgtacacgttg-ttgagtccatggatacttatt-aagttaagggctagat 21043486  T
Q  121 gccct-gaagcctttgctca 139  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  21043487 gccctaggagcctttgctca 21043506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 247
Target Start/End: Original strand, 38888167 - 38888268
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||||   || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  38888167 gttgagggcttgatgccttgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgacgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttg 38888264  T
Q  244 cata 247  Q
    ||||    
T  38888265 cata 38888268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 247
Target Start/End: Original strand, 20634665 - 20634769
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aag 240  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  20634665 taagttgagggcttgatgtcctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggctttatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaag 20634762  T
Q  241 ttgcata 247  Q
    |||||||    
T  20634763 ttgcata 20634769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 48520339 - 48520230
Alignment:
Q  26 cgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccct 125  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| || | ||||  ||||| ||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  48520339 cgttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaa-gttgta--agttg-ttgagtccatgcatgctcatttaagttgagggcttgatgccct 48520244  T
Q  126 gaagcctttgctca 139  Q
    | || |||||||||    
T  48520243 ggagtctttgctca 48520230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20957929 - 20957880
Alignment:
Q  238 aagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagtt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  20957929 aagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagtt 20957880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34509633 - 34509560
Alignment:
Q  153 cttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509633 cttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 34509560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 40389034 - 40388900
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagt 241  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||| | || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||    
T  40389034 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctctactacgttgggggcttgatgtcctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagt 40388937  T
Q  242 tgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  40388936 tgcatagtcaagttagagtcgcatttgtcgagtcaaa 40388900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Original strand, 7053147 - 7053206
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7053147 gttgagggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 7053206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22124175 - 22124119
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccct 163  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  22124175 gttgggggcttgatgccgtggagcctttgctcaattaagttgagggcttgacgccct 22124119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 168
Target Start/End: Original strand, 24720763 - 24720850
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcc--tttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24720763 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagggcttgatgccctgtgag 24720850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35088433 - 35088347
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35088433 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgacgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 35088347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43542777 - 43542726
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43542777 aatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 43542726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Original strand, 46383017 - 46383068
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46383017 aatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 46383068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20135036 - 20134961
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  | || || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20135036 ggcttgatgccctgtaagtatattaatactcaaatagcgatggggacttgatgccctgtattggtaccacatgcat 20134961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 27250996 - 27251071
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27250996 ggcttgatgtcctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 27251071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 38801655 - 38801730
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38801655 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 38801730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 48300824 - 48300735
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| || |||||||| | ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48300824 taagttgagggtttgatgccatgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 48300735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 14793392 - 14793434
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14793392 tgagtccatgcatactcattaaagttgggggcttgatgacctg 14793434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19675837 - 19675716
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||  |||||| |  ||||||    
T  19675837 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggtttgattccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggtttgatgccctgagagtattt--atgctc 19675741  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    || || ||||||||||||||||||||    
T  19675740 aa-tacgttgagggcttgatgccctg 19675716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 235
Target Start/End: Original strand, 38057707 - 38057795
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || |||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38057707 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagagtttgatgccctgg-ttggtactacatgcatgattaagaag 38057795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 235
Target Start/End: Original strand, 41227787 - 41227875
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  41227787 gttgagggcttgatgccatgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctag-ttggtaccacatgcatgattaagaag 41227875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 45754550 - 45754433
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||   ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||  |||||     
T  45754550 tgagtccatgcatactcataaaagttgagggcttgatgtcctatgagcctttgctc-tttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctc- 45754455  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgcc 204  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  45754454 tttaagttgagggcttgatgcc 45754433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 16368454 - 16368511
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16368454 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 16368511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 26064890 - 26064833
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26064890 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 26064833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 164
Target Start/End: Original strand, 35261309 - 35261366
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgcccta 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  35261309 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgcccta 35261366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 42696814 - 42696730
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  42696814 tgagtccatgcatactcatatatgttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctc-tttacgttgagggcttgatgccctgtgag 42696730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43697064 - 43696969
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||||||||| |||||||| |||| | |||||| || |||| ||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  43697064 ggcttgatgctctatgagtctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgataccttgg-ttagtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 43696969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Original strand, 7322047 - 7322094
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7322047 ataagttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgtttaag 7322094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 226
Target Start/End: Original strand, 13528849 - 13528931
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatg 226  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||| | |||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13528849 taagttgagggcttgatgccctgtgattctatttacgctc-aatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtgccacatgcatg 13528931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20636595 - 20636513
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||| || ||||  |||| |||||||| || |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20636595 ggcttgatgctctgtgagcctatttatgctcaa-tacgttgggggcttgatgtccttg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 20636513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Original strand, 29764517 - 29764561
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29764517 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 29764561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 48520396 - 48520352
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  48520396 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 48520352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 51323304 - 51323257
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  51323304 ataagttgggggcttgatgccttg-attggtaccacatgcatgattaag 51323257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 52954495 - 52954551
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  52954495 ttgagtccatgcatactcattcatgttggaggcttgatgccttggagcctttgctca 52954551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 230
Target Start/End: Original strand, 21240300 - 21240377
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatta 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  21240300 ggcttgatgccctgtgagtatatttatgctc-tatatgttggggacttgatgtcgtgg-ttggtaccacatgcatgatta 21240377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21840486 - 21840374
Alignment:
Q  166 gagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgc 263  Q
    |||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  21840486 gagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcgagttggagtcgc 21840389  T
Q  264 a-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    | |||||||||||||    
T  21840388 atttgtcgagtcaaa 21840374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 41227698 - 41227741
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  41227698 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 41227741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 48603322 - 48603283
Alignment:
Q  28 ttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  48603322 ttcaaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 48603283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Original strand, 50210500 - 50210559
Alignment:
Q  167 agtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||  | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210500 agtatattaatactcaaatagcgatgggggtttgatgccctggattggtaccacatgcat 50210559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13988708 - 13988663
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13988708 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 13988663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 18120652 - 18120610
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18120652 tgagtccttgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 18120610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 121
Target Start/End: Original strand, 21240190 - 21240228
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatg 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21240190 ttgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatg 21240228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 21475451 - 21475496
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21475451 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 21475496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 139
Target Start/End: Original strand, 21534041 - 21534095
Alignment:
Q  85 gagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21534041 gagttcatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctagagcctttgctca 21534095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21707044 - 21706962
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||| |||||||||||||  | |  |||| | ||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21707044 aagttgagggcttgatgccctgggtgcctatttacgcttaaatacgttgggggcttgatgcgttggattggtaccacatgcat 21706962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21711586 - 21711504
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||| |||||||||||||  | |  |||| | ||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21711586 aagttgagggcttgatgccctgggtgcctatttacgcttaaatacgttgggggcttgatgcgttggattggtaccacatgcat 21711504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21711630 - 21711564
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21711630 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgg 21711564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 21923655 - 21923700
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21923655 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 21923700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 23594099 - 23594144
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23594099 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 23594144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40389078 - 40389012
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40389078 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgg 40389012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Original strand, 22825920 - 22825960
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22825920 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 22825960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Original strand, 28194911 - 28194975
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||| |||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28194911 aatacgttgggggcttgatgtccttg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 28194975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 28312526 - 28312485
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttg 62  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28312526 gatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttg 28312485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 35261247 - 35261304
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  35261247 ttgagtccatgcatactcattcattgttggaggcttgatgccctggagcctttgctca 35261304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41372904 - 41372860
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41372904 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaa 41372860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13301868 - 13301800
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||  |||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  13301868 ctcatttaagttgagggtttgatgccctatgagcctatt--tgctc-tataagttgggggcttgatgccctg 13301800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18120504 - 18120457
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18120504 ataagttgggggcttgttgccctg-attggtaccacatgcatgtttaag 18120457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20587778 - 20587738
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgcc 123  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20587778 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgcc 20587738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20592316 - 20592276
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgcc 123  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20592316 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgcc 20592276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 21896450 - 21896482
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21896450 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 21896482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22237553 - 22237521
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22237553 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 22237521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Original strand, 24720777 - 24720846
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| ||||  ||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24720777 ctcattaaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatt--tgctctattaagttgagggcttgatgccctg 24720846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 33680933 - 33680901
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33680933 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 33680901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 39060221 - 39060181
Alignment:
Q  86 agtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  39060221 agtcaatgtataatcattaaagttgagggcttgatgccctg 39060181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Original strand, 41306049 - 41306100
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41306049 aatatgttgggggcttgatgccttgg-ttggtaccacaagcatgattaagaag 41306100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 196)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 9033447 - 9033723
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgat-gatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgg 111  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9033447 agatgaaagatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgtttgatgttgtctaa-gttgtacaagttgattgagtccatgcatactcattaaagttgg 9033545  T
Q  112 gggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggatt 211  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9033546 gggcttgatgctctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgtcctgggattatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggatt 9033645  T
Q  212 ggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  9033646 ggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcgagtcgaagtcacattgtcgagtcaagttgttaagttg 9033723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 83 - 294
Target Start/End: Original strand, 11772460 - 11772671
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||  || |||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11772460 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggatctagatgccttggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctaggagtatattaatgctca 11772559  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgtt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  11772560 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagaaaagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgtt 11772659  T
Q  283 aagttgttacat 294  Q
    ||||||||||||    
T  11772660 aagttgttacat 11772671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 294
Target Start/End: Original strand, 11525796 - 11525982
Alignment:
Q  108 ttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11525796 ttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 11525895  T
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgttacat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  11525896 gattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagtggttacat 11525982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 83 - 294
Target Start/End: Original strand, 11769083 - 11769294
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11769083 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttaagggcttgatgccctgggagtatattaatgctca 11769182  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgtt 282  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  11769183 aataagttgaggacttgatgtcgtggattgataccacatgcatgattaagaagaaaagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgtt 11769282  T
Q  283 aagttgttacat 294  Q
    ||||||||||||    
T  11769283 aagttgttacat 11769294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 83 - 276
Target Start/End: Original strand, 17017624 - 17017818
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |    
T  17017624 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatactta 17017723  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaa 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17017724 aatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaa 17017818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 83 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16091711 - 16091520
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |    
T  16091711 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatactta 16091612  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtc 274  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16091611 aatacattgagggcttgatgccctgtattgctaccacatgcatgattaagaagttaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcaagtc 16091520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 48991130 - 48990926
Alignment:
Q  85 gagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaa 184  Q
    ||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||| || |||    
T  48991130 gagtccatgcatactcgttcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgtcctggaagtatattaatacttaaa 48991031  T
Q  185 taagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaa 284  Q
    ||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| | |||||    
T  48991030 tacattgaaggattgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagttaagttgcatagtcgagtcgaggttgcattgtcgagtcaagttgttaa 48990931  T
Q  285 gttgt 289  Q
    |||||    
T  48990930 gttgt 48990926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 38519263 - 38519080
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38519263 gttgggggcttgatgccttgtgagcttttgctcaaataagttgagggcttgataccctgggagtgtatttatgctcaaataagttaggggcttgatgccc 38519164  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  38519163 tggattggtaccacatgcatgattaagaagaataagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 38519080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 83 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18203765 - 18203571
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |    
T  18203765 ttgagtccacgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctgaaacctttgctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatactta 18203666  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaa 276  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18203665 aatacgttgaggacttgatgccttggattggtaccacatgaatggttaagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaa 18203571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 265
Target Start/End: Original strand, 9177835 - 9178017
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||| | || |    
T  9177835 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattagtactta 9177934  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcat 265  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9177935 aatacgttgagggcttgatgccctggatttgtaccacatgcat-attaagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcgcat 9178017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16996113 - 16995930
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgat-gccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16996113 gttgggggcttgaacgccctggagcctttgctcaattaagttgagagtttgatgccctgggagtatatttatgctcaaataagtttagggtttgatgccc 16996014  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||    
T  16996013 tggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcatgtcgaagtcacattgtcaagtcaagttgttaagttg 16995930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 20220356 - 20220564
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||| ||     
T  20220356 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgacctggagcttttgctcaattaagttgagggcttgatgccttggaagtatattaatactt 20220455  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcg 280  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | |    
T  20220456 aaacacattgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcataatcaagttgaagtcgcattgtcgagtcgagttg 20220555  T
Q  281 ttaagttgt 289  Q
    |||||||||    
T  20220556 ttaagttgt 20220564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 42461840 - 42461669
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  42461840 gttgggggtttgatgctctgtgagcttttgctcaaataagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagatgggggcttgatgccc 42461741  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaa 276  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42461740 tagattggtaccacatgcatgattaagaagataaagttgcatagtcaagtcgaagtttcattgtcgagtcaa 42461669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Original strand, 15008730 - 15008912
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  15008730 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaa-tacgttgagggcttgatgccct 15008828  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaaga-agataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||    
T  15008829 ggattggtaccacatgcatgaataagagatctaagttgcatagtcaagttgaagttgcattgtcgagtcgagttgttaagttgt 15008912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 268
Target Start/End: Original strand, 131106 - 131208
Alignment:
Q  166 gagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcat 265  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  131106 gagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagttgcat 131205  T
Q  266 tgt 268  Q
    |||    
T  131206 tgt 131208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14044637 - 14044468
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| |||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |    
T  14044637 gttgagggcttgatgccatggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaa-tacgttgagggcttgatgcctt 14044539  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14044538 ggattggtaccacatgcatgattaagaggtgtaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaa 14044468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14354667 - 14354498
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| |||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |    
T  14354667 gttgagggcttgatgccatggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaa-tacgttgagggcttgatgcctt 14354569  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14354568 ggattggtaccacatgcatgattaagaggtgtaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaa 14354498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 287
Target Start/End: Original strand, 1868163 - 1868368
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||     
T  1868163 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctagagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatactt 1868262  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcg 280  Q
    || || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | | |    
T  1868263 aa-tatgttgagggcttaatgccctagattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaaattgaagtcacattgtcgagtcgagttg 1868361  T
Q  281 ttaagtt 287  Q
    |||||||    
T  1868362 ttaagtt 1868368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44116428 - 44116258
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  44116428 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccct 44116329  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  44116328 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 44116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 178 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14323229 - 14323117
Alignment:
Q  178 gctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaa 276  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14323229 gctcaattaagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtgtaagttgcatagtcaagttgatgtcgcattgtcgagtcaa 14323130  T
Q  277 atcgttaagttgt 289  Q
     | ||||||||||    
T  14323129 gttgttaagttgt 14323117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 12256052 - 12256220
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||    
T  12256052 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctagaagtatattaatact-tattacgttgagggcttgatgccct 12256150  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  12256151 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcgagttggagtcgcattgtcgagtcaaa 12256220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 2282482 - 2282649
Alignment:
Q  108 ttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  2282482 ttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccctg 2282580  T
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2282581 gattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcgagttgaagtcgcattgtcgagtcaaa 2282649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20585442 - 20585291
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  20585442 ttgagtccatgcatactcatttacgttgatggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctc 20585344  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    || || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20585343 aa-tatgttgggggcttgatgccctgaattggtaccacatgcatgattaagaag 20585291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 277
Target Start/End: Original strand, 18456615 - 18456781
Alignment:
Q  111 ggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggat 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  18456615 ggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgaggccttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggagcttgatgccctggat 18456714  T
Q  211 tggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||| || ||  |  |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  18456715 tggtaccacatgcat-ataaaagatctaagttgcatagtcgagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 18456781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12901210 - 12901028
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| ||||||||||| |   ||||||||||| || || || |||||||||| ||||||||    
T  12901210 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccttggaagtatattaatacttaa-tacgttgagggctcgatgccct 12901112  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgc-atagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa-tcgttaagttgt 289  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| || |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12901111 ggattggtaccacatgcat--ataagaggattaagttgcaatagtcaagttgaggtcgcattgtcgagtcaaagttgttaagttgt 12901028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 262
Target Start/End: Original strand, 17071245 - 17071424
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcatta-aagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    |||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17071245 ttgagtacatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgct-atttaagttaagggcttgatgccctatgagtgtatttatgct 17071343  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    |   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||    
T  17071344 ctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttgcattgtcgagttgaagtcg 17071424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 38519394 - 38519268
Alignment:
Q  11 tgagatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttg 110  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | | |||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38519394 tgagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaa-gttatacacgttg-ttgagtccatgcatactcatttaagttg 38519297  T
Q  111 ggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38519296 agggcttgatgccctgaagcctttgctca 38519268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 253
Target Start/End: Original strand, 11393529 - 11393684
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11393529 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 11393628  T
Q  206 tg--------gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    ||        |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11393629 tggagcctaagattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 11393684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Original strand, 130926 - 131042
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  130926 gatgtcgttccaaagtgttggagtcctaagttgttgatgttgtccaa-gttgtacacgctg-ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgat 131023  T
Q  121 gccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||    
T  131024 gccctgaagcctttgctca 131042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32301118 - 32300939
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  | ||||  ||||| ||||||| ||| ||| | ||| |||||| |||||||||||    
T  32301118 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccag-gttgta--agttg-ttgagtctatgcatatttatttaagttgagggcttgatgc 32301023  T
Q  123 cctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    |||| ||||||||||||   | ||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32301022 cctggagcctttgctcaac-acgttgg-ggcttgatgccctgggagtatattaatgctcagataagttgagggcttgatgccctgg 32300939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 247
Target Start/End: Original strand, 14161973 - 14162080
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-a 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||   |||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14161973 tttaagttgagggcttgatgccccgggagtgtatttatgctcaa-tatgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagttga 14162071  T
Q  239 agttgcata 247  Q
    |||||||||    
T  14162072 agttgcata 14162080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16996234 - 16996118
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | || ||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16996234 gatgtcgttccaaagtgttggagtcctaagttgttgatgttgtccaa-gttgcacacgttg-ttaagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgat 16996137  T
Q  121 gccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  16996136 gccctggagcctttgctca 16996118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18427452 - 18427350
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18427452 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 18427353  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  18427352 tgg 18427350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Original strand, 14183715 - 14183807
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14183715 taagttgagggcttgataccctgtgagtctatttatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 14183807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 14949364 - 14949467
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14949364 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 14949463  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  14949464 tgga 14949467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16409979 - 16409876
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16409979 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 16409880  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  16409879 tgga 16409876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24702158 - 24702055
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24702158 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 24702059  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  24702058 tgga 24702055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24704608 - 24704505
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24704608 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 24704509  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  24704508 tgga 24704505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27216780 - 27216677
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27216780 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 27216681  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  27216680 tgga 27216677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44373971 - 44373843
Alignment:
Q  105 aagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||    
T  44373971 aagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgtccttggagtgtatttatgctcaa-tacgttgggggcttgatgc 44373874  T
Q  204 cctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44373873 cctg-attggtaccacatgcatgattaagaag 44373843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44382836 - 44382708
Alignment:
Q  105 aagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||    
T  44382836 aagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgtccttggagtgtatttatgctcaa-tacgttgggggcttgatgc 44382739  T
Q  204 cctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44382738 cctg-attggtaccacatgcatgattaagaag 44382708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11972416 - 11972314
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11972416 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 11972317  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  11972316 tgg 11972314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16232440 - 16232338
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16232440 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttaggctcaaataaagttgagggcttgatgccc 16232341  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  16232340 tgg 16232338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 260
Target Start/End: Original strand, 17130800 - 17130916
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagt 241  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| | || ||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  17130800 aagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagt 17130897  T
Q  242 tgcatagtcaagtcgaagt 260  Q
    ||||| ||| |||||||||    
T  17130898 tgcattgtcgagtcgaagt 17130916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20110475 - 20110373
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20110475 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagtttagggcttgatgccc 20110376  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  20110375 tgg 20110373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 21189837 - 21189939
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21189837 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 21189936  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  21189937 tgg 21189939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32125411 - 32125309
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32125411 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 32125312  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  32125311 tgg 32125309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41522837 - 41522735
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41522837 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 41522738  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  41522737 tgg 41522735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41525299 - 41525197
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41525299 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 41525200  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  41525199 tgg 41525197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 67629 - 67513
Alignment:
Q  108 ttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||||| || |  ||  |||||||||||||||||||    
T  67629 ttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctagaagtatattaatacttat-tacattgagggcttgatgccctg 67531  T
Q  208 gattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||||||    
T  67530 gattggtaccacatgcat 67513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 47831691 - 47831522
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||| ||||  ||||||||||| | | ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  47831691 gttgggggcttgatgctctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccttttaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 47831593  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  47831592 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcgagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 47831522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Original strand, 15376955 - 15377055
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15376955 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 15377054  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  15377055 t 15377055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3287023 - 3286873
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcatta-aagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||  ||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  3287023 ttgagtcaatgtatactcatttgaagttgatggcttgatgctctgtgagcttttgctc--ttacgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgct 3286926  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3286925 ctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 3286873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 20385365 - 20385468
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| |||||||||||||||||||     
T  20385365 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgcct 20385464  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  20385465 tgga 20385468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Original strand, 11525673 - 11525789
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||    
T  11525673 gatgttgttccaaagtgctggagtcctaagttgttgatgttgtccaa-gttgtacatgttg-ttgagtccatgcatactcattcaagttgggcccttgat 11525770  T
Q  121 gccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  11525771 gccctggagcctttgctca 11525789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 235
Target Start/End: Original strand, 13699711 - 13699862
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcatta-aagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | || ||    
T  13699711 ttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagctttttctc-tttaagttgagggcttgatgtcctgtgagtataattatact 13699809  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    | | || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13699810 cta-tatgttgagggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcataattaagaag 13699862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15281257 - 15281165
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaa 234  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15281257 tttaagttgagggcttaatgccctgtgagtatatttaagctcta-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaa 15281165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16056218 - 16056101
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||  ||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  16056218 gttgggggcttgatgccctagagctttagctcgattatgttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 16056120  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16056119 ggattggtaccacatgcat 16056101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22072883 - 22072766
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||| ||||    
T  22072883 gttgggggcttgatgccctggagctttaactcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgattccct 22072785  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22072784 ggattggtaccacatgcat 22072766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 247
Target Start/End: Original strand, 36686291 - 36686396
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aag 240  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  36686291 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctggatttgtaccacatgcatgattaagaagttgaag 36686389  T
Q  241 ttgcata 247  Q
    |||||||    
T  36686390 ttgcata 36686396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 42461961 - 42461845
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| || || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42461961 gatgtcgttccaatgtattggagtcttaagttgttgatgttatccaa-gttgtacacgttg-ttgagtccatgtatactcatttaagttgagggcttgat 42461864  T
Q  121 gccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||  | ||||||||||||    
T  42461863 gcctgggagcctttgctca 42461845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48273311 - 48273209
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48273311 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggtttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 48273212  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  48273211 tgg 48273209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 456241 - 456140
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||   | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  456241 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggatcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 456142  T
Q  206 tg 207  Q
    ||    
T  456141 tg 456140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 235
Target Start/End: Original strand, 16461403 - 16461488
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16461403 ggcttgatgccctgaaagtatattagtactcaaatagcgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 16461488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16579429 - 16579344
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579429 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 16579344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 277
Target Start/End: Original strand, 17062155 - 17062289
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagt 241  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||    
T  17062155 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgatcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagt 17062252  T
Q  242 tgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  17062253 tgcatagtcaagtcggattcgcatttgtcgagtcaaa 17062289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19282178 - 19282055
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||| |||| ||||||    
T  19282178 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgcctttggagtgtatttatgctc 19282080  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
     |||| ||||||||||||||||||||    
T  19282079 -aatacgttgagggcttgatgccctg 19282055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 262
Target Start/End: Original strand, 9390158 - 9390237
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  9390158 aatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatagtcaagttgaagtcg 9390237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19282074 - 19281952
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  19282074 gttgagggcttgatgccctgtgagattttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctggaagtgtatttatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccc 19281977  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgatta 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  19281976 tggattggtactacatgcatgatta 19281952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 61510 - 61599
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  61510 taagttgagggcttgatgccctatgagcatatttacgctc-aatacgttgggggcttgatgcactgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 61599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 235
Target Start/End: Original strand, 43277776 - 43277926
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcatta-aagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  43277776 ttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc--ttatgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgct 43277873  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  43277874 c-tttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcattataaagaag 43277926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18005535 - 18005418
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||| ||    
T  18005535 gttgggggcttgatgccctagagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgctct 18005437  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18005436 ggattggtaccacatgcat 18005418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44014068 - 44013951
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| ||    || |||||||||||||||||||    
T  44014068 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttgt-tacgttgagggcttgatgccct 44013970  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
     ||||||||||||||||||    
T  44013969 agattggtaccacatgcat 44013951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48811798 - 48811694
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aag 240  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||  |||| | |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  48811798 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaag 48811701  T
Q  241 ttgcata 247  Q
    |||||||    
T  48811700 ttgcata 48811694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Original strand, 12466226 - 12466349
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||||||||  ||  |||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  12466226 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggtttgatgccctgtgagtttttgttc-tttaagttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctc 12466324  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
     |||| ||||||||||||||||||||    
T  12466325 -aatacgttgagggcttgatgccctg 12466349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14258114 - 14257988
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatag 248  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||    
T  14258114 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaattatcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcata--taagaggtctaagttgcatag 14258017  T
Q  249 tcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14258016 tcaagtcgaagttgcattgccgagtcaaa 14257988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20110387 - 20110261
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagt 249  Q
    |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||    
T  20110387 ggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagt 20110290  T
Q  250 caagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    | ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  20110289 cgagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 20110261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32300962 - 32300870
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32300962 taagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgattccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 32300870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48273231 - 48273150
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgca 224  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48273231 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgca 48273150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4070707 - 4070630
Alignment:
Q  154 ttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4070707 ttgatgccctgtgagtatatttatgctcta-tagattgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 4070630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 8852256 - 8852345
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8852256 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 8852345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 234
Target Start/End: Original strand, 12466409 - 12466460
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaa 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12466409 aatatgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgcatgattaagaa 12466460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Original strand, 14220142 - 14220235
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14220142 tttatgttgagggcttgatgccatgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 14220235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 209
Target Start/End: Original strand, 15082128 - 15082226
Alignment:
Q  111 ggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccctgga 209  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15082128 ggggcttgatgccctggagcatttgctcacttaagttgagggcttgatgccct-ggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccttgga 15082226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 247
Target Start/End: Original strand, 18875943 - 18876045
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  |||| | | |||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18875943 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacggtcaa-tacgttgggggtttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttg 18876041  T
Q  244 cata 247  Q
    ||||    
T  18876042 cata 18876045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 47094178 - 47094005
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||||  ||| ||||| |||||||||| || ||||  | |    ||||    
T  47094178 ttgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccatgcgagcttttgctc--ttacgttgagggcttgatgctctgtgagctttt----gctc 47094085  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgc 263  Q
      ||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||    
T  47094084 ttat--gttgaggacttaatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcaagtcgaagtcgc 47094005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 277
Target Start/End: Original strand, 15082237 - 15082336
Alignment:
Q  178 gctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtca 275  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15082237 gctcaaacacgttgagggcttgatgtcctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatactcaagtcggagtcgcacttgtcgagtca 15082334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 16219949 - 16220065
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| | | || |||||  |||||||| |||||||||||||   |||||| |||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  16219949 gttgggggcttgatgccctggatctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatactaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 16220047  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    || ||||||||||||||||    
T  16220048 gg-ttggtaccacatgcat 16220065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20619201 - 20619113
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||| || |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20619201 gttgagggcttgatgccctatgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 20619113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 225
Target Start/End: Original strand, 29329199 - 29329281
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329199 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacattgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 29329281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Original strand, 10660275 - 10660401
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||  | |||||||| | || ||| | || ||||||||||||||||||    
T  10660275 gttgagggcttgacgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggtcttgatgctttgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgccc 10660372  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10660373 tgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 10660401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12371327 - 12371172
Alignment:
Q  82 attgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agccttt----gctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaa 176  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| |    ||||| | | ||||| ||||||||||||| ||||  |||| |    
T  12371327 attgagtccatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaat-acgttgagggcttgatgccctgtgagcctattta 12371229  T
Q  177 tgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12371228 tgctc-aatacgttgggggcttgatgccttgg-ttggtacgacatggatgattaagaag 12371172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 235
Target Start/End: Original strand, 16586234 - 16586318
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16586234 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgcc-tggattggtaccacatgcatgattaagaag 16586318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 208
Target Start/End: Original strand, 29329140 - 29329221
Alignment:
Q  128 agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29329140 agcctttgctcacttaagttgagggcttgatgctctaggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgg 29329221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33000955 - 33000864
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| |  | ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33000955 taagttgagggcttgatgccttgtgagtataattgtactcta-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 33000864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 8136111 - 8136235
Alignment:
Q  105 aagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||  ||||| ||||| | || |||| |||||||||||    
T  8136111 aagttgagggcttgatgccctgagagcctatgctc-tataagttgggggcttgatgccctgtgagcctatta-tgctcta-tacgttgggggcttgatgc 8136207  T
Q  204 cctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8136208 cctg-attggtaccacatgcatgtttaag 8136235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11066378 - 11066296
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11066378 ggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 11066296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Original strand, 30821952 - 30822011
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  30821952 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 30822011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 247
Target Start/End: Original strand, 36705723 - 36705829
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-a 238  Q
    |||||||||| || ||||||| || |||||||| | || ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  36705723 tttaagttgagggtttgatgctctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgccctg-attggtaccacaagcatgattaagaagttga 36705820  T
Q  239 agttgcata 247  Q
    |||||||||    
T  36705821 agttgcata 36705829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 37785459 - 37785505
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37785459 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 37785505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 232
Target Start/End: Original strand, 9744114 - 9744200
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||  ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9744114 aagttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctctattaagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgagtaag 9744200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Original strand, 14161836 - 14161956
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |  ||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  14161836 ttgagtccatgcataatcatttacattgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctc 14161934  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgcc 204  Q
     | || |||||||||||||||||    
T  14161935 -agtacgttgagggcttgatgcc 14161956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18640192 - 18640090
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||| |  |||  | || | |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18640192 gttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaattaagttgagggtttgatgccgtgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggtttgatgccc 18640093  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  18640092 tgg 18640090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8468152 - 8468101
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8468152 aatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 8468101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14323257 - 14323201
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccct 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14323257 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccct 14323201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 168
Target Start/End: Original strand, 48213885 - 48213972
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcc--tttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  48213885 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctattaaattgagggcttgatgccctgtgag 48213972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 225
Target Start/End: Original strand, 811368 - 811482
Alignment:
Q  111 ggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgga- 209  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||| | | ||||  |||||||||||||   ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||     
T  811368 ggggcttgatgccctggagctttagctcaatcatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatact-tattacgttgagggcttgatgccttggat 811466  T
Q  210 ttggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  811467 ttggtaccacatgcat 811482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 3564569 - 3564644
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3564569 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 3564644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11053598 - 11053552
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11053598 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccgcatgcatgattaagaag 11053552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 11996295 - 11996370
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11996295 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 11996370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13869202 - 13869090
Alignment:
Q  166 gagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgc 263  Q
    |||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13869202 gagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcgagttgaagtcgc 13869105  T
Q  264 a-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    | |||||||||||||    
T  13869104 atttgtcgagtcaaa 13869090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Original strand, 16402719 - 16402778
Alignment:
Q  167 agtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16402719 agtatattaatactcaaataacgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 16402778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 19558265 - 19558308
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19558265 ttgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 19558308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 232
Target Start/End: Original strand, 19558366 - 19558455
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagtt-gagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19558366 taagttgggggcttgatgccttgtgagtatatttatgctc-tatatgttggggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 19558455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 28505552 - 28505627
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28505552 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 28505627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 277
Target Start/End: Original strand, 38898683 - 38898795
Alignment:
Q  166 gagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgc 263  Q
    |||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||    
T  38898683 gagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgcat--ataagaagtctaagttgcatagtcaagttggagttgc 38898780  T
Q  264 a-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    | |||||||||||||    
T  38898781 atttgtcgagtcaaa 38898795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40443307 - 40443232
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40443307 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 40443232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 235
Target Start/End: Original strand, 12128280 - 12128321
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12128280 gggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 12128321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 235
Target Start/End: Original strand, 13150672 - 13150760
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || ||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13150672 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttggaggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 13150760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 24270776 - 24270818
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24270776 tgagtccatgcataatcattaaagttgggggcttgatgccctg 24270818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 25941436 - 25941394
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25941436 tgagtccatgcataatcattaaagttgggggcttgatgccctg 25941394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 38227345 - 38227211
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataag 240  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||   ||||| |  ||||    
T  38227345 taagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctggattggtaaaaaatgcat--ataagaggtctaag 38227249  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  38227248 ttgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 38227211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14044699 - 14044642
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14044699 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 14044642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14354729 - 14354672
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14354729 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 14354672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 15008668 - 15008725
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15008668 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctgaagcctttactca 15008725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Original strand, 15576925 - 15576966
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccct 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15576925 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccct 15576966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16585281 - 16585244
Alignment:
Q  197 ttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaa 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16585281 ttgatgccctagattggtaccacatgcatgattaagaa 16585244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 231
Target Start/End: Original strand, 18075576 - 18075662
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaa 231  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18075576 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttg-gggcttgatgccctag-ttggtaccacatgcatgattaa 18075662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 235
Target Start/End: Original strand, 32434734 - 32434813
Alignment:
Q  154 ttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| | |||| ||||| | |||||| || |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32434734 ttgatgccatgtgagcatatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgcactgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 32434813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38479939 - 38479895
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38479939 gttgagggcttgatgtcctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 38479895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 235
Target Start/End: Original strand, 6170533 - 6170615
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||| |||||||  |||| | |||||| || |||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6170533 ggcttgatgctctatgagcctatttacgctcaa-tacgttggggacttgatgtcctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 6170615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 8852168 - 8852212
Alignment:
Q  82 attgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8852168 attgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 8852212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11053711 - 11053642
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||  ||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  11053711 ctcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctctactacgttgagggcttgatgccctg 11053642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 232
Target Start/End: Original strand, 13133599 - 13133642
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13133599 gttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgattaag 13133642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Original strand, 14270496 - 14270547
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14270496 aatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcttgattaagaag 14270547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 15096640 - 15096684
Alignment:
Q  82 attgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15096640 attgagtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgccctg 15096684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Original strand, 15144341 - 15144373
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144341 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 15144373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 15719866 - 15719826
Alignment:
Q  27 gttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15719866 gttccaaagtattggagtcctaagttgttgatgttgtctaa 15719826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 16461065 - 16461252
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcatt--aaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||  |||||| |||| |||||| ||   ||||  |  |||||||| |||||    
T  16461065 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtctaaagttgt--aagttg-ttgaatccatgcattagcatttcattgttgggggattgat 16461161  T
Q  121 gccctgaagcctttgctcattta-agttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctgga 209  Q
    |||||| ||| || ||||| |||  | ||  |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  16461162 gccctggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgga 16461252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17232288 - 17232237
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17232288 aatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatggatgattaagaag 17232237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44374032 - 44373946
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccct--gaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  44374032 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgcccttgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgtgag 44373946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44382897 - 44382811
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccct--gaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  44382897 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgcccttgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgtgag 44382811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10588890 - 10588815
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10588890 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccatgtattggtaccacatgcat 10588815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Original strand, 12128183 - 12128253
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12128183 ctcatttaagttgagggtttgatgccctttgagcctatttacgctc-aatacgttgagggcttgatgccctg 12128253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 13150540 - 13150583
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13150540 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 13150583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 15755219 - 15755294
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttga-gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15755219 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgagaagggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 15755294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18423488 - 18423442
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18423488 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaagt 18423442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18640070 - 18640024
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18640070 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaagt 18640024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20619333 - 20619290
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20619333 ttgagtccatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccctg 20619290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 232
Target Start/End: Original strand, 22001350 - 22001388
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22001350 gggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgattaag 22001388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33001054 - 33000936
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcat-taaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||  || | ||||| ||||||||||||| ||||  ||||  |||||    
T  33001054 tgagtccatgcatactcatataaagttgagggcttaatgccctgtgagcctttgcttctt-acgttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctc 33000958  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgcc 204  Q
      |||||||||||||||||||||    
T  33000957 -tataagttgagggcttgatgcc 33000936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 46387066 - 46387109
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  46387066 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 46387109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 456120 - 456075
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  456120 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 456075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 8136045 - 8136087
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8136045 tgagtctatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 8136087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 254
Target Start/End: Original strand, 10064127 - 10064188
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  10064127 gggcttgatgctccgtattggtaccacatgcatgatt-agaggattaagttgcatagtcaagt 10064188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11053725 - 11053683
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  11053725 tgagtccatgaatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 11053683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11972294 - 11972249
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11972294 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 11972249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 168
Target Start/End: Original strand, 14220005 - 14220090
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcatt-aaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  14220005 tgagtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgatgctctgtgagcctttgctc-tatacgttgagggcttgatgccctgtgag 14220090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 14949485 - 14949530
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14949485 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 14949530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 232
Target Start/End: Original strand, 15105215 - 15105260
Alignment:
Q  186 aagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15105215 aagttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgtttaag 15105260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Original strand, 15120423 - 15120470
Alignment:
Q  186 aagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  15120423 aagttgggggcttgatgccctg--ttggtatcacatgcatgattaagaag 15120470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 15377077 - 15377122
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15377077 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 15377122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16232318 - 16232273
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16232318 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 16232273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16409858 - 16409813
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16409858 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 16409813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 125
Target Start/End: Original strand, 18075532 - 18075574
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccct 125  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18075532 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccct 18075574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 20385486 - 20385531
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20385486 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 20385531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 21189959 - 21190004
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21189959 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 21190004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24702037 - 24701992
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24702037 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 24701992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24704487 - 24704442
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24704487 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 24704442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Original strand, 26356238 - 26356304
Alignment:
Q  144 agttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctgga 209  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||  | || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26356238 agttgagggcttgatgccctgtgagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgga 26356304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 26356322 - 26356367
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26356322 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 26356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Original strand, 26358690 - 26358756
Alignment:
Q  144 agttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctgga 209  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||  | || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26358690 agttgagggcttgatgccctgtgagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgga 26358756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 26358774 - 26358819
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26358774 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 26358819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27216659 - 27216614
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27216659 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 27216614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32125289 - 32125244
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32125289 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 32125244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38227352 - 38227322
Alignment:
Q  178 gctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227352 gctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 38227322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41522715 - 41522670
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  41522715 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 41522670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41525177 - 41525132
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  41525177 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 41525132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 235
Target Start/End: Original strand, 45848048 - 45848136
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||| |||||||||| || ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  45848048 gttgagggcttgatgctctgtgagcctatttacgctcaa-tatgttgggggcttgacgccctgg-ttggtaccacatgtatgattaagaag 45848136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Original strand, 46387170 - 46387219
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  46387170 aatatgttgggggcttgatgccctag-ttggtaccacatgcatgattaaga 46387219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14323319 - 14323262
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14323319 ttgagtccatgcatactcattcattgttggggggttgatgccctggagcctttgctca 14323262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Original strand, 20253697 - 20253788
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| || ||||||| || ||||  |||| |||||| | || |||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20253697 taagttgagggtttgatgcactgtgagcctatttatgctcta-tacgttggggacttgatgccctg-atttgtaccacatgcatgattaagaag 20253788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26211846 - 26211774
Alignment:
Q  153 cttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26211846 cttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatg-gggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 26211774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 67
Target Start/End: Original strand, 1490304 - 1490344
Alignment:
Q  27 gttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1490304 gttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 1490344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 2280316 - 2280348
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2280316 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 2280348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 163
Target Start/End: Original strand, 9744092 - 9744175
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcat-taaagttgggggcttgatgccctg-aagcc--tttgctcatttaagttgacggcttgatgccct 163  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  9744092 tgagtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgggggcttgatgccct 9744175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Original strand, 11392118 - 11392162
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  11392118 tgtcgttccaaagtattggagccttaagttgttgatgttgtctaa 11392162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 123
Target Start/End: Original strand, 18875876 - 18875916
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgcc 123  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18875876 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgcc 18875916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20619246 - 20619183
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||||||||||||||||||    
T  20619246 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgagggcttgatgccct 20619183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Original strand, 28505650 - 28505682
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28505650 gggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 28505682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 32301172 - 32301128
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  32301172 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtctaa 32301128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34200594 - 34200562
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34200594 gggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 34200562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Original strand, 37727999 - 37728050
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  37727999 aatacgttgggggcttgatgccatgg-ttgataccacatgcatgattaagaag 37728050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 44014105 - 44014073
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44014105 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 44014073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Original strand, 48213899 - 48213968
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||  ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  48213899 ctcattaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctctattaaattgagggcttgatgccctg 48213968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 232
Target Start/End: Original strand, 48809592 - 48809635
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48809592 gttgggggcttgatgctctg-attggtaccacatgcatgattaag 48809635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 7)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 497446 - 497168
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  497446 agatgaaagatgtcgttctaaagtattgaagtcttaagttgttgatgttgtctaa-gttgtacaagttgattgagtccatgcatactcattaaagttggg 497348  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattg 212  Q
    ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  497347 ggcttgatgccttggagcctttgcttaattaagttgggggcttgatgccgtgggagtatatttatgttcaattaagttgagggattgatgcccttgattg 497248  T
Q  213 gtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgtta 291  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  497247 gtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttgtta 497168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 160574 - 160457
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||   ||||||||||| ||  | || |||||||| ||||||||||    
T  160574 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgggggcttgatgccctggaagtatattaatact-tattacgttgagggtttgatgccct 160476  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  160475 ggattggtaccacatgcat 160457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 446371 - 446224
Alignment:
Q  112 gggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggat 210  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||   || | |||||| |||||||||||| |    
T  446371 gggcttgatgccctgtgagcttttgctc--ttatgttgagggcttgatgccatatgagtgtacttatgctctt-tatgatgagggtttgatgccctgg-t 446276  T
Q  211 tggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  446275 tggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttgcatagtcgagttgaagtc 446224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31777 - 31737
Alignment:
Q  194 ggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31777 ggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 31737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37084 - 37044
Alignment:
Q  194 ggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37084 ggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 37044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 76661 - 76581
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| ||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  76661 ggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-taaattgggggcttgatgccgtgg-ttggtaccacattcatgattaaga 76581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 76712 - 76648
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  76712 taagttgagggcttgatgccctgtgagcatatttacgctc-aatatgttgtgggcttgatgccctg 76648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 142)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 107 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16493039 - 16492852
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16493039 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 16492940  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgttacat 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  16492939 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtctagttgttaagttgttacat 16492852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 107 - 290
Target Start/End: Original strand, 18896539 - 18896722
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18896539 gttgggggcttgatgccctggagcttttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgtaagtatattaatgctcaaatacgttgagggcttgatgctct 18896638  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgtt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  18896639 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgtgtcaagttgttaagttgtt 18896722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19362317 - 19362133
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19362317 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggattgatgccctaggagtatattaatgctcaattacgttgagggcttgatgccct 19362218  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgtta 291  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||||    
T  19362217 ggattggtaccacatgcatgaataagatgataagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgttgagtcaagttgtcaagttgtta 19362133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 107 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 33442938 - 33442758
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |||||  |||||||||||||| |||    
T  33442938 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaatacattgagggcttgatgtcct 33442839  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatga-ttaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagt 286  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33442838 ggattggtaccacatgcatgatttaagaagataagttgcatagtcgagtcgaagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagt 33442758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35008040 - 35007873
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  35008040 gttgggggcttgatgccctggagccttcgctccattaagttgagggcttgatgccctagaagtatattaatgcttaaatacgttgagggcttgatgctct 35007941  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35007940 ggattggtaccacatgcatgattaagaagttaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtctagtc 35007873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18453194 - 18452982
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | |||||| |||| | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  18453194 gatgtcgtttcaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaa-gttgtacacgttg-tggagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgat 18453097  T
Q  121 gccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccaca 220  Q
    |||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18453096 gccctggagcttttgctcaaataagttgaaggcttgatgccctgggagcgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccaca 18452997  T
Q  221 tgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||||    
T  18452996 tgcatgattaagaag 18452982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 107 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22117819 - 22117651
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  22117819 gttggtggcttgatgctctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaatacgttgagggcttgatgccct 22117720  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtca 275  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22117719 ggattggtacgacatgcatgattaagaagttaagttgcatagtcaagtcgaggttgcattgtcgagtca 22117651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20223835 - 20223667
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||    
T  20223835 gttggaggcttgatgctctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaacacgttgagggcttgatgccct 20223736  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtca 275  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20223735 ggattggtacgacatgcatgattaagaagttaagttgcatagtcaagtcgaggttgcattgtcgagtca 20223667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 111 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23076618 - 23076454
Alignment:
Q  111 ggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggat 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23076618 ggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaatacgttgagagcttgatgccctggat 23076519  T
Q  211 tggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtc 274  Q
    || || ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23076518 tgatatcacatacatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtc 23076454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Original strand, 17229886 - 17230069
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| || |||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||| ||    
T  17229886 gttgagggcttgatgccctgtgagctttagctc-tttatgttgagggcttgaagccctatgagtatatttatgctcttat--gttgagggcttgatgtcc 17229982  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgtta 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  17229983 tggattggtaccacatgcatgattaagaagataaagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgataagttgtta 17230069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17743208 - 17743032
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| || | ||||  ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  17743208 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaa-gttgta--agttg-ttgagtccatgcatacccatttaagttgagggcttgatgc 17743113  T
Q  123 cctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 203  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17743112 cctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccccgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 17743032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 285
Target Start/End: Original strand, 23528333 - 23528510
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  23528333 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaggttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctcttat--gttgagggcttgatgccc 23528429  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagata-agttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  23528430 tggattggtaccacatgcatgattaagtagatagagtttcacagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaag 23528510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20136559 - 20136380
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  20136559 gttgagggcttgatgccctgtgagattttgctc-tttatgttgagggcttgatgccctgtgagggtatttatgctcttat--gttgagggcttgatgccc 20136463  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  20136462 tgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagatgaagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 20136380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Original strand, 22196310 - 22196489
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  22196310 gttgagggcttgatgccctgtgagattttgctc-tttatgttgagggcttgatgccctgtgagggtatttatgctcttat--gttgagggcttgatgccc 22196406  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  22196407 tgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagatgaagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 22196489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19362447 - 19362322
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19362447 agatgaatgatgtcgttccaaagcattggaatcctaagttgatgatgatgtctaa-gttgtataagttgattgagtccatgcatactcattaaagttggg 19362349  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||    
T  19362348 ggctttatgccctggagtctttgctca 19362322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 137
Target Start/End: Original strand, 18896414 - 18896532
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||     || |    
T  18896414 agatgaatgatgtcgttccaaaatattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa-gttgtacaagttgattgagtccatgcatactcatt-----tgtg 18896507  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgct 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18896508 ggcttgatgccctgaagcctttgct 18896532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 206
Target Start/End: Original strand, 27573214 - 27573391
Alignment:
Q  25 tcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccc 124  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27573214 tcgttccaaagtattggagtcttaagatgtcgatgttgtccaa-gatgta--agttg-ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccc 27573309  T
Q  125 tgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    || ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  ||| |||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27573310 tggagcctttgctcaaataagttgagggcttgatgccctagaagtctatttacgctcaaagaagttgagggtttgatgccct 27573391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 255
Target Start/End: Original strand, 15705797 - 15705945
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15705797 gttgagggattgatgccctggagcctttgctcaat-aagttgagggcttgttgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccct 15705895  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtc 255  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  15705896 ggattgttaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcaagtc 15705945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 289
Target Start/End: Original strand, 18177907 - 18178084
Alignment:
Q  112 gggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggat 210  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18177907 gggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttacgttgagggcttgatgccttgtgagtatatttatgctcttat--gttgagggcttgattccctggat 18178003  T
Q  211 tggtaccacatgcatga-ttaagaagata-agttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| || | ||||||||||    
T  18178004 tggtaccacatgcatgatttaagaagatagagttgcatagtcaagttgaagttgcatagtcgagtgaagttgttaagttgt 18178084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17743050 - 17742915
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aag 240  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||  |||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17743050 taagttgagggcttgatgctctaggagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataaag 17742952  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  17742951 ttgcatagtcaagtcgaagttgcattaccgagtcaaa 17742915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20109025 - 20108857
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||| |||||| |   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  20109025 gttgggggcttgatgccctgtagctttagctcaactaagttgagggctcgatgccttggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 20108927  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20108926 ggattggtaccacatgcat--ttaagaggtttaagttgcatagtcgagttgaagtcgcattgtcgagtcaaa 20108857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Original strand, 18260117 - 18260348
Alignment:
Q  27 gttcaaaagtattggagtccta--agttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccc 124  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18260117 gttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaa-gttgtacacgttg-ttgagtccatgcatactcattaa-gttgagggcttgatgccc 18260213  T
Q  125 tga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 223  Q
    ||  ||| |||||||  ||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||  | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18260214 tgtgagcttttgctc--ttacgttgagggcttgacgccctgtgagtgtatttatgct--attatgttgagggcttgatgccctcg-ttggtaccacatgc 18260308  T
Q  224 atgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    ||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||    
T  18260309 atgattaagaagatgtagtttcattgtcaagttgaagtcg 18260348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 260
Target Start/End: Original strand, 22212529 - 22212680
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||   ||||||||||||||||||  |    
T  22212529 gttgagggcttgatgccccgtgagcctttgctc-tttgagttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctc--ttaagttgagggcttgatgttc 22212625  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagt 260  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22212626 tgg-ttggtaccacatgcatgactaagaagttgaagttgcatagtcaagtcgaagt 22212680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23538439 - 23538314
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23538439 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaat-attttgagggcttgatgccctg-gagtgtatttatgctcaa-tatgttgagggcttgatgccct 23538343  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23538342 ggattggtaccacatgcatgattaagaag 23538314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19668261 - 19668080
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||    
T  19668261 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-ttatacgttgagggcttgatgccct 19668163  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa-tcgttaagttgt 289  Q
     |||||||||||||| |||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19668162 agattggtaccacatccat--ataagaggtttaagttgcatagtcgagttggagtcgcattgtcgagtcaaagttgttaagttgt 19668080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1595469 - 1595369
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595469 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccct 1595370  T
Q  207 g 207  Q
    |    
T  1595369 g 1595369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 234
Target Start/End: Original strand, 20078437 - 20078527
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaa 234  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20078437 aagttgagggcttgatgccctaggagtgtatttatgctcaaataagttg-gggcttgatgtcctagattggtaccacatgcatgattaagaa 20078527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 277
Target Start/End: Original strand, 9100813 - 9100971
Alignment:
Q  117 tgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtac 216  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||||||  ||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  9100813 tgatgccctgaagctttagctcaactaagttgagtgcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgataccttggattggtac 9100911  T
Q  217 cacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9100912 cacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaaa 9100971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17105645 - 17105522
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||     
T  17105645 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctggagcctttgctca-ataagttgagggcttgatgccct-ggagtgtatttatgctc- 17105549  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctgga 209  Q
    || | ||||||||||||||||||||||    
T  17105548 aacacgttgagggcttgatgccctgga 17105522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 22080959 - 22081076
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  22080959 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctagaagtatattaatact-aattacgttgagggcttgatgccct 22081057  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    | |||||||||||||||||    
T  22081058 gaattggtaccacatgcat 22081076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25644228 - 25644111
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||| |||||||||    
T  25644228 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctagaagtatattaatact-tattacgttgagggcatgatgccct 25644130  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25644129 ggattggtaccacatgcat 25644111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7825628 - 7825501
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  7825628 gttgagggcttgatgtcctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccc 7825531  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7825530 tggattgataccacatgcatgattaagaag 7825501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17105543 - 17105419
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17105543 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaat-attttgagggcttgatgccctg-gagtgtatttatgctcaa-tatgttgagggcttgatgccct 17105447  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17105446 gg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 17105419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Original strand, 19656484 - 19656609
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  19656484 gttgagggcttgatgttctggagcctttgctcaat-aagttgagggcttgatgccctg-gagtgtatttatgctcaa-tacgttgggggcttgatgccct 19656580  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19656581 ggattgataccacatgcatgattaagaag 19656609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1595433 - 1595256
Alignment:
Q  105 aagttgggggcttgatgccctga-agccttt----gctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttg 199  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||    |||||  |||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  1595433 aagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccctgagagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttg 1595334  T
Q  200 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  1595333 atgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 1595256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12742237 - 12742134
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12742237 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 12742138  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  12742137 tgga 12742134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 19656248 - 19656427
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19656248 tgtcattccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaa-gttgta--agttg-ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgc 19656343  T
Q  123 cctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgga 209  Q
    |||| || |||||||||  |||||||| ||||||||| |||  |||| |||| |||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  19656344 cctggagactttgctca-ataagttgagggcttgatg-ccttggagtgtatttatgctc-aacacgttgagggcttgatgtcctgga 19656427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 26924882 - 26924985
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26924882 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 26924981  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  26924982 tgga 26924985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33861714 - 33861611
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33861714 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 33861615  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  33861614 tgga 33861611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 18334834 - 18334936
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18334834 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 18334933  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  18334934 tgg 18334936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19004966 - 19004864
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19004966 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 19004867  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  19004866 tgg 19004864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19652084 - 19651967
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  19652084 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttac-tacgttgagggcttgatgccct 19651986  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19651985 ggattggtaccacatgcat 19651967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24422467 - 24422365
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24422467 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 24422368  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  24422367 tgg 24422365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Original strand, 27126446 - 27126590
Alignment:
Q  86 agtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaa 184  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||| | |||||||||||||   ||| |||| ||||||||     
T  27126446 agtccatgcatactcatttgagttgagggcttgatgccctgtgagctttttctc-tttaagttcagggcttgatgccctggaagtgtatttatgctcaa- 27126543  T
Q  185 taagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaa 231  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27126544 tatgttgggggcttgatgccctggattcgtaccacatgcatgattaa 27126590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33864198 - 33864096
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33864198 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 33864099  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  33864098 tgg 33864096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Original strand, 23083374 - 23083493
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-a 238  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  23083374 tttatgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagatgt 23083471  T
Q  239 agttgcatagtcaagtcgaagt 260  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  23083472 agttgcatagtcgagttgaagt 23083493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25714263 - 25714187
Alignment:
Q  178 gctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25714263 gctcaaatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaagt 25714187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Original strand, 19859161 - 19859261
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19859161 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 19859260  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  19859261 t 19859261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 232
Target Start/End: Original strand, 23492259 - 23492407
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||  || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23492259 tgagttcatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgaacctatttactc-tttaagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgct 23492357  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |  ||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23492358 c-tatacgtcgggggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 23492407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 232
Target Start/End: Original strand, 23497857 - 23498005
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||  || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23497857 tgagttcatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgaacctatttactc-tttaagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgct 23497955  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |  ||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23497956 c-tatacgtcgggggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 23498005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25688423 - 25688312
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagt 241  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25688423 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttaatgccctggattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagt 25688325  T
Q  242 tgcatagtcaagt 254  Q
     ||||||||||||    
T  25688324 ggcatagtcaagt 25688312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8054949 - 8054847
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8054949 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccttgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 8054850  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  8054849 tgg 8054847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16245219 - 16245100
Alignment:
Q  113 ggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggatt 211  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  16245219 ggcttgatgccctgtgagcttttgctc--ttatgttgagggcttgatgccctatgagtgtattaatgatcttat--gttgagggcttgacgccctgg-tt 16245125  T
Q  212 ggtaccacatgcatgattaagaaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16245124 ggtaccacatgcatgattaagaaga 16245100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23538619 - 23538496
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||     
T  23538619 ttgagtccatgcatactcatataagttgagggcttgatgcactggagcctttgctca-ataagttgagggcttgatgccct-ggagtgtatttatgctc- 23538523  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctgga 209  Q
    || | ||||||||||||||||||||||    
T  23538522 aacacgttgagggcttgatgccctgga 23538496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 139
Target Start/End: Original strand, 15705679 - 15705792
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||     
T  15705679 tgtcgttccaaagtattggagtcttaaattgtcgatgttgtccaaagttgta--agttg-ttgagtccatgcataatcatttaagttgggggcttgatga 15705775  T
Q  123 cctgaagcctttgctca 139  Q
    |||| ||||||||||||    
T  15705776 cctggagcctttgctca 15705792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 20557135 - 20557236
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| |||||||||| | || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20557135 gttgtgggcttgatgtcgtggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataagttaagggcttgatgccct 20557234  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  20557235 gg 20557236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25656599 - 25656523
Alignment:
Q  178 gctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25656599 gctcaaatacgttgggggcttgattccctggattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaagt 25656523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 1541153 - 1541256
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1541153 gttgggggcttgatgccttggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcccagggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 1541252  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  1541253 tgga 1541256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13019379 - 13019196
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||   ||||||||||| |   ||||||||||| || || ||  ||||||||||| || | |    
T  13019379 gttgggggcttgatgccctagagctttagctcaattaagttaggggcttgatgccttggaagtatattaatacttaa-tacattgagggcttgttgtctt 13019281  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtca-aatcgttaagttgtta 291  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||    
T  13019280 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcaagtcagagttgttaagttgtta 13019196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Original strand, 20078279 - 20078396
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| | |||||||    
T  20078279 gatgtcgttccaaagtactggagtcttaagttgttgatgttgtct-aagttgtccaagttg-ttgagtctatgcatactcatttaagttgagagcttgat 20078376  T
Q  121 gccctga-agcctttgctca 139  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  20078377 gtcctgagagcctttgctca 20078396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 2291422 - 2291524
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2291422 gttgggggcttgatgccctggagccttttctcaattaagttgaggtcttgatgccctgagagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 2291521  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  2291522 tgg 2291524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 277
Target Start/End: Original strand, 19773989 - 19774072
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19773989 gggcttgatgccctgtattggtaccacatgcata--taagaggtctaagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaa 19774072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 229
Target Start/End: Original strand, 31735872 - 31736015
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||  |||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||| || |  ||||  ||||    
T  31735872 tgagtccatgcatactcatttaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgtgcgcctatt--tgct 31735968  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 229  Q
    |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31735969 ctt-taagttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 31736015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 261
Target Start/End: Original strand, 22376952 - 22377067
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22376952 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggattgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttg 22377049  T
Q  244 catagtcaagtcgaagtc 261  Q
    ||| ||| ||| ||||||    
T  22377050 cattgtcgagttgaagtc 22377067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 225
Target Start/End: Original strand, 27333357 - 27333473
Alignment:
Q  108 ttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||| ||   ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  27333357 ttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgctctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccctg 27333455  T
Q  208 gattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  27333456 gattgataccacatgcat 27333473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 225
Target Start/End: Original strand, 27394097 - 27394213
Alignment:
Q  108 ttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||| ||   ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  27394097 ttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgctctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccctg 27394195  T
Q  208 gattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  27394196 gattgataccacatgcat 27394213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22805561 - 22805519
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22805561 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 22805519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23019293 - 23019124
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |||||  |||||| | |||||||||||||   ||| ||||||| || |  || |||||||||||| ||||||    
T  23019293 gttgggggcttgattccctggagctttagctcaactaagtttagggcttgatgccctggaagtttattaatacttat-tacgttgagggcttggtgccct 23019195  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  23019194 ggattagtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcgagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 23019124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16493100 - 16493044
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16493100 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 16493044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 233
Target Start/End: Original strand, 20411837 - 20411923
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20411837 gttgagggcttgatgtcctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 20411923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 23076683 - 23076627
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23076683 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 23076627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 33442999 - 33442943
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33442999 ttgagtccatgcatactcatttatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 33442943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11185366 - 11185291
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11185366 ggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaataacgatgggggctttatgccctgtattggtaccacatgcat 11185291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 225
Target Start/End: Original strand, 20557213 - 20557296
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||| | |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20557213 taagttaagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccatatgcat 20557296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22556183 - 22556094
Alignment:
Q  141 ttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||  |||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22556183 ttaagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgttc-tatatattgggggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 22556094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23538517 - 23538418
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||  |||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||||    
T  23538517 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctca-ataatttgagggcttgatgccct-ggagtgtatttatgctc-aacacgttgagggcttgatgccct 23538421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Original strand, 25957083 - 25957147
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  25957083 aatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 25957147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 247
Target Start/End: Original strand, 19830007 - 19830107
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| |||||||||| || ||| | |||| ||||||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19830007 gttgagggcttgatgctctgtgaatgtatttatgctcttata--ttgagggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttg 19830103  T
Q  244 cata 247  Q
    ||||    
T  19830104 cata 19830107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20223896 - 20223840
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20223896 ttgagtccatgcatactcattcatgtttggggcttgatgccctggagcctttgctca 20223840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Original strand, 20734531 - 20734591
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  20734531 gttgagggtttgatgccctggattagtaccacatgcatgattatgaagttgaagttgcata 20734591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22117880 - 22117824
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22117880 ttgagtccatgcatactcattcatgtttggggcttgatgccctggagcctttgctca 22117824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 35008101 - 35008045
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35008101 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatggcctggagcctttgctca 35008045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 20638551 - 20638626
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20638551 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 20638626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 35245438 - 35245363
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35245438 ggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 35245363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18319554 - 18319505
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18319554 aatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacattcatgattaaga 18319505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23500742 - 23500700
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccct 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23500742 ttgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccct 23500700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 25920745 - 25920703
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25920745 tgagtccatgcataatcattaaagttgggggcttgatgccctg 25920703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 235
Target Start/End: Original strand, 27329002 - 27329043
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27329002 gggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 27329043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 235
Target Start/End: Original strand, 27389742 - 27389783
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27389742 gggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 27389783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 28947543 - 28947501
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28947543 tgagtccatgcatactcattaaagttgggggtttgatgccctg 28947501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29060394 - 29060320
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| |||||    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060394 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 29060320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15895813 - 15895666
Alignment:
Q  112 gggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggat 210  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||  ||| ||||| || |||||||||| ||||| |||| ||||||   || |||||||| |||||||||||| |    
T  15895813 gggcttgatgccctgtgagcttttgctc--ttatgttgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggtttgatgccctgg-t 15895718  T
Q  211 tggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||    
T  15895717 tggtaccacatgtatga-taagaagatgtagttgcattgtcgagttgaagtcg 15895666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15895879 - 15895795
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  15895879 tgagtccatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccccgtgagcctttgctc-cttaatttgagggcttgatgccctgtgag 15895795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Original strand, 23017246 - 23017337
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23017246 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgtccttg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 23017337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Original strand, 15174334 - 15174378
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15174334 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 15174378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 222
Target Start/End: Original strand, 17288062 - 17288134
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatg 222  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17288062 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatg 17288134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 17743262 - 17743218
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17743262 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 17743218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 18913829 - 18913785
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18913829 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 18913785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 18937087 - 18937043
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18937087 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 18937043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23500727 - 23500659
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23500727 ctcattaaagttgagggcttgatgccctatgagcctatt--tgctc-tataagttgagggcttgatgccctg 23500659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Original strand, 25629662 - 25629694
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629662 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 25629694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28947441 - 28947394
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28947441 ataagttgggggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 28947394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1561156 - 1561081
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttga-gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1561156 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgagaagggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 1561081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 16920898 - 16920973
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16920898 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggtcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 16920973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 17319074 - 17319113
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  17319074 ttgagtccatgtatactcatttaagttgagggcttgatgc 17319113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 18708548 - 18708505
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18708548 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 18708505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 254
Target Start/End: Original strand, 19859283 - 19859329
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19859283 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaagt 19859329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20136621 - 20136578
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20136621 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 20136578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 22196248 - 22196291
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22196248 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 22196291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Original strand, 22780509 - 22780568
Alignment:
Q  167 agtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22780509 agtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 22780568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Original strand, 28496754 - 28496813
Alignment:
Q  167 agtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28496754 agtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 28496813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Original strand, 29809165 - 29809224
Alignment:
Q  167 agtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29809165 agtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 29809224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31733709 - 31733620
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| || |||||||| | ||||  |||| | |||||| || |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31733709 taagttgagggattgatgccatgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 31733620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34963191 - 34963111
Alignment:
Q  196 cttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34963191 cttgatgccccgtattggtaccacatgcata--taagaggtctaagttgcatagtcgagttgaagttgcattgtcgagtcaaa 34963111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 1541274 - 1541319
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1541274 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 1541319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 2291544 - 2291589
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  2291544 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 2291589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8054827 - 8054782
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8054827 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 8054782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12742116 - 12742071
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12742116 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 12742071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 225
Target Start/End: Original strand, 16448809 - 16448891
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |  |||  |||| | |||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16448809 aagttgagggcttgatgccttgggagcctatttacgctctactacgttgggggcttgatgccctggattggtaccatatgcat 16448891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 168
Target Start/End: Original strand, 17229824 - 17229909
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| |||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  17229824 ttgagtccatccatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgct-atatacgttgagggcttgatgccctgtgag 17229909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 18334956 - 18335001
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18334956 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 18335001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19004844 - 19004799
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19004844 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 19004799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22556282 - 22556160
Alignment:
Q  86 agtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcc--tttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||  |||||||  |||||||||   ||||||||| | ||||  ||||  | |||     
T  22556282 agtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagaacttgatgccttgtgagcctatt--tactct 22556185  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  22556184 attaagttgagggcttgatgccctg 22556160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22782070 - 22782025
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22782070 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 22782025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22831356 - 22831287
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| |||||||     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22831356 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaat-----gggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 22831287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24422345 - 24422300
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24422345 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 24422300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 25591120 - 25591165
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25591120 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 25591165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 26925003 - 26925048
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26925003 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 26925048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 33861593 - 33861548
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  33861593 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 33861548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 33864076 - 33864031
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  33864076 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 33864031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19234323 - 19234283
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19234323 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 19234283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Original strand, 23017093 - 23017134
Alignment:
Q  82 attgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgcc 123  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23017093 attgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgcc 23017134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25714341 - 25714276
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25714341 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataagttgagggtttgatgctctgg 25714276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27850867 - 27850772
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||||||||| |||||||  |||| | |||||| || |||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  27850867 ggcttgatgctctatgagcctatttacgctcaa-tatgttgggtacttgatgccctgg-ttggtaccacatgcataattaagaagttgaagttgcata 27850772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Original strand, 30674493 - 30674533
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30674493 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 30674533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Original strand, 17319215 - 17319250
Alignment:
Q  197 ttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17319215 ttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 17319250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Original strand, 19303805 - 19303837
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19303805 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 19303837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20076515 - 20076483
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20076515 gggcttgatgccctcgattggtaccacatgcat 20076483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20593630 - 20593598
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20593630 gggcttgatgccctggtttggtaccacatgcat 20593598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 22080922 - 22080954
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22080922 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 22080954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 162
Target Start/End: Original strand, 22212466 - 22212546
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccc 162  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||    
T  22212466 ttgagtccacgcatactcatttaagttgagggcttgatgccatgtgagcctttactcaaatacgttgagggcttgatgccc 22212546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Original strand, 27573158 - 27573202
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27573158 tgtcgttccaaagtatttgagtcttaagttgttgatgttgtctaa 27573202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 134)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 107 - 294
Target Start/End: Original strand, 21809809 - 21809996
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21809809 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccca 21809908  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgttacat 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21809909 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttgttacat 21809996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 107 - 294
Target Start/End: Original strand, 21732158 - 21732345
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21732158 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccca 21732257  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgttacat 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  21732258 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtccagttgttaagttgttacat 21732345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Original strand, 26740875 - 26741057
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  26740875 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaatacgttgagggcttgatgccct 26740974  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  26740975 ggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttggatagtcaagtcgaagtcgcattgttgagtcaagttgttaagttg 26741057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 107 - 255
Target Start/End: Original strand, 25578261 - 25578409
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25578261 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctaggagtgtatttatgctcaaataagttgagggcttgatgcctt 25578360  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25578361 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcattgtcgagtc 25578409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23469694 - 23469511
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23469694 gttgggggcttgatgccctgtgagcttttgctcaaataagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagaagagggcttgatgccc 23469595  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  23469594 tggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcgagtcgaggttgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 23469511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Original strand, 22178451 - 22178633
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || ||| | |||||||||||| ||||||    
T  22178451 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaacacgttgagggcttgctgccct 22178550  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | | |||||||||    
T  22178551 ggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagttgcattgtcaagtcgagttgttaagttg 22178633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16227372 - 16227232
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16227372 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaaataagttgagggcttgatgtcctgggagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 16227273  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16227272 gg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 16227232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 232
Target Start/End: Original strand, 25574695 - 25574820
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25574695 gttgggggcttgatgtcttggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 25574794  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25574795 ggattggtaccacatgcatgattaag 25574820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 232
Target Start/End: Original strand, 25575888 - 25576013
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25575888 gttgggggcttgatgtcttggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagtttagggcttgatgccct 25575987  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25575988 ggattggtaccacatgcatgattaag 25576013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15796273 - 15796130
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagata-agttg 243  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15796273 gttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatactcttat--gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagatagagttg 15796176  T
Q  244 catagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  15796175 catagtcaagttgaagttgcattgtcaagtcaagttgttaagttgt 15796130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 288
Target Start/End: Original strand, 26733089 - 26733201
Alignment:
Q  177 tgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtca 275  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26733089 tgctcaattaagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattatgaggattaagttgcatagtcaagttggagtcgcattgtcgagtca 26733188  T
Q  276 aatcgttaagttg 288  Q
    | | |||||||||    
T  26733189 agttgttaagttg 26733201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 186 - 288
Target Start/End: Original strand, 21330534 - 21330636
Alignment:
Q  186 aagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaag 285  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  21330534 aagttgggggcttaatgccctggattggtaccacatgcatgtttaagatgataagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaag 21330633  T
Q  286 ttg 288  Q
    |||    
T  21330634 ttg 21330636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 20027172 - 20027337
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  20027172 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 20027270  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtc 274  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20027271 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtc 20027337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 230
Target Start/End: Original strand, 23202759 - 23202883
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  23202759 gttgggggcttgatgccctgtgagcttttgctcaaataagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgatggcttgatgtcc 23202858  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgatta 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23202859 tggattggtaccacatgcatgatta 23202883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 27989160 - 27989328
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || || || ||| |||||||||||||||    
T  27989160 gttgagggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaa-tacgttaagggcttgatgccct 27989258  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27989259 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgttgagtcaaa 27989328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 10775919 - 10776036
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10775919 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccct-ggagcctatttacgctcaaacacgttgagggcttgatgccct 10776017  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10776018 ggattggtaccacatgcat 10776036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 254
Target Start/End: Original strand, 2154892 - 2155046
Alignment:
Q  105 aagttgggggcttgatgccctga-agccttt----gctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttg 199  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||    |||||  |||||||| |||||||||||||  |||  |||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  2154892 aagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccctgggagcctatttatgctcaaatacgttgggggcttg 2154991  T
Q  200 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2154992 atgccctggattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaagt 2155046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25743574 - 25743471
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatga-ttaagaagata-agttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaag 285  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| | ||||||    
T  25743574 gttgagggcttaatgccctggattggtaccacatgcatgatttaagaagatagagttgcatagtcaagttgaagttgcatagtcgagtcaagttgttaag 25743475  T
Q  286 ttgt 289  Q
    ||||    
T  25743474 ttgt 25743471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 166 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16227604 - 16227522
Alignment:
Q  166 gagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcata 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16227604 gagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcata 16227522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 2154856 - 2154957
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154856 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccct 2154955  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  2154956 gg 2154957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22412106 - 22412005
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22412106 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctaaaataagttgagggcttgatgccct 22412007  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  22412006 gg 22412005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29345900 - 29345797
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29345900 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 29345801  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  29345800 tgga 29345797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29348373 - 29348270
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29348373 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 29348274  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  29348273 tgga 29348270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 42245607 - 42245710
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42245607 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 42245706  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  42245707 tgga 42245710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 265010 - 265112
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  265010 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 265109  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  265110 tgg 265112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 22959762 - 22959879
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  22959762 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 22959860  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22959861 ggattggtaccacatgcat 22959879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 277
Target Start/End: Original strand, 11581522 - 11581656
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagt 241  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||    
T  11581522 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagt 11581619  T
Q  242 tgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  11581620 tgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 11581656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29329854 - 29329753
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||  | || | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29329854 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagagcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggtttgatgccct 29329755  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  29329754 gg 29329753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10953006 - 10952881
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| ||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || ||| | || ||||||||||||||||||    
T  10953006 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgccc 10952909  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaa 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10952908 tgg-ttggtaccacatgcatgattaagaa 10952881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20908932 - 20908832
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20908932 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 20908833  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  20908832 t 20908832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 247
Target Start/End: Original strand, 21555421 - 21555525
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aag 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||| | ||| |  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21555421 taagttgacggcttgatgccctgtgagcttatttacgctta--tacgttgagggcttgatgccctcgattggtaccacatgcatgattaagaagttgaag 21555518  T
Q  241 ttgcata 247  Q
    |||||||    
T  21555519 ttgcata 21555525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29350846 - 29350743
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29350846 gttgggggcttgatgcccaggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 29350747  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  29350746 tgga 29350743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 11581442 - 11581544
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||  |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11581442 gttgggggcttgatgcccttgagcctttgctcacttaagttgagggcttcatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 11581541  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  11581542 tgg 11581544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 277
Target Start/End: Original strand, 20918271 - 20918402
Alignment:
Q  146 ttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgc 244  Q
    |||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||    
T  20918271 ttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgc 20918368  T
Q  245 atagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  20918369 atagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 20918402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 21329728 - 21329845
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  21329728 gttgggggcttgataccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctcgaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 21329826  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21329827 ggattggtaccacatgcat 21329845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21565431 - 21565314
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  21565431 gttgggggcttggtgccctggagctttagctcaattacgttgggggcttgatgccctagaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 21565333  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  21565332 ggattggtaccacaagcat 21565314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 208
Target Start/End: Original strand, 23202699 - 23202818
Alignment:
Q  85 gagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaa 184  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||  ||||||||||||| ||||     |  ||||||||    
T  23202699 gagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaaacacgttgggggcttgatgccctgtgag----cttttgctcaaa 23202794  T
Q  185 taagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23202795 taagttgagggcttgatgccctgg 23202818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23469815 - 23469635
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |  ||| |||| | | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  23469815 gatgtcgttccaaagtgttggagtcttaagttgttgatgttgtctaa-gtttcacacgttgttag-gtccatgcatactcatataagttgggggcttgat 23469718  T
Q  121 gccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    |||||  ||||||||||||   | ||||  ||||||||||||| ||||     |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23469717 gccctagagcctttgctca-acatgttgggggcttgatgccctgtgag----cttttgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 23469635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 225
Target Start/End: Original strand, 21502387 - 21502506
Alignment:
Q  105 aagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| ||  | || || ||||| ||||||||    
T  21502387 aagttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatact-tattacgtagagggattgatgcc 21502485  T
Q  205 ctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21502486 ctggattggtaccacatgcat 21502506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Original strand, 25250951 - 25251069
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagt 241  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||| | || ||| | || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  25250951 aagttgagggtttgatgccctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgataccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagt 25251048  T
Q  242 tgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  25251049 tgcattgtcgagtcgaagtcg 25251069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Original strand, 25314736 - 25314854
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagt 241  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||| | || ||| | || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  25314736 aagttgagggtttgatgccctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgataccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagt 25314833  T
Q  242 tgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  25314834 tgcattgtcgagtcgaagtcg 25314854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32027313 - 32027213
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||  |||  | || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32027313 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggtttgatgcactgagagcctttttacgctcaaataagttgagggcttaatgccct 32027214  T
Q  207 g 207  Q
    |    
T  32027213 g 32027213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 126
Target Start/End: Original strand, 21330500 - 21330555
Alignment:
Q  71 tgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21330500 tgtacaagttgattgagtccatgcatactcattaaagttgggggcttaatgccctg 21330555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14047962 - 14047880
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14047962 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 14047880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29329776 - 29329641
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataag 240  Q
    |||||||| || ||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| |  ||||    
T  29329776 taagttgagggtttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtatcacatgcat--ataagaggtctaag 29329679  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  29329678 ttgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 29329641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 20918189 - 20918290
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  ||   | || | ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20918189 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgtcctgagaacctttttacgctcaaaaaaattgagggcttgatgccct 20918288  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  20918289 gg 20918290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25742923 - 25742803
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||  |||||     
T  25742923 tgagtccatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccctgtgagccattgctc-tttacgttgagggcttgatgccctatgagcctatt--tgctc- 25742828  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  25742827 tttaagttgagggcttgatgccctg 25742803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22143937 - 22143826
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||  | || |||||||| ||||||||||    
T  22143937 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-tattacgttgagggtttgatgccct 22143839  T
Q  207 ggattggtaccac 219  Q
     ||||||||||||    
T  22143838 agattggtaccac 22143826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39245056 - 39245000
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccct 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39245056 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 39245000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19668785 - 19668675
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  19668785 gttgggggcttgatgtcctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 19668687  T
Q  207 ggattggtacca 218  Q
    ||||||||||||    
T  19668686 ggattggtacca 19668675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22412028 - 22411946
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412028 taagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttg-gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 22411946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32027235 - 32027100
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataag 240  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| |  || |    
T  32027235 taagttgagggcttaatgccctgagagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctagattggtaccacatgcat--ataagaggtctagg 32027138  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  32027137 ttgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 32027100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Original strand, 12122583 - 12122643
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12122583 gttgagggcttgatgcactggattgataccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 12122643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 21731628 - 21731684
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21731628 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 21731684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 21809748 - 21809804
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21809748 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 21809804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25431249 - 25431173
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatg 226  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25431249 ggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatg 25431173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 163
Target Start/End: Original strand, 26733062 - 26733118
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccct 163  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26733062 gttgggggtttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 26733118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 10733182 - 10733285
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| ||| |||| ||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10733182 gttgggggcttgatgcccttgagcttttgctcaattaagttgagggcatgataccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 10733281  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  10733282 tgga 10733285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13095349 - 13095274
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13095349 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgagggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 13095274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 20470183 - 20470272
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||  |||||| | || |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  20470183 taagttgggggcttgatgccctgtgagtatatctatgctcta-tatgttgagggcttgatgctcttg-ttggtaccacatgcatgattaaga 20470272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26761382 - 26761332
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26761382 ataagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 26761332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 234
Target Start/End: Original strand, 21406772 - 21406817
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaa 234  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21406772 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaa 21406817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24067031 - 24066949
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24067031 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctctactacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 24066949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 13536459 - 13536534
Alignment:
Q  156 gatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| ||||  |||| |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13536459 gatgccctgtgagcctatttatgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 13536534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31454849 - 31454785
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31454849 aatacgttgagggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 31454785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Original strand, 20470097 - 20470165
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  20470097 ctcatttaagttgagggcttgatgccctatgagtctatt--tgctc-tataagttgagggcttgataccctg 20470165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Original strand, 21558130 - 21558190
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21558130 gttgggggcttgatgcactagattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 21558190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 26740814 - 26740870
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26740814 ttgagtccatgcataatcattcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 26740870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 8287111 - 8287186
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8287111 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 8287186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13025165 - 13025090
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13025165 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgagagcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 13025090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 19661102 - 19661177
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19661102 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 19661177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20565415 - 20565322
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||| |||| ||||||   || ||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20565415 tttaagttgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttaagggcttcatgccctag-ttggtaccacatgcatgattaagaag 20565322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24493423 - 24493348
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24493423 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 24493348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24529059 - 24529000
Alignment:
Q  167 agtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529059 agtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 24529000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 8504700 - 8504742
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8504700 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 8504742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 14026867 - 14026909
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14026867 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 14026909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 225
Target Start/End: Original strand, 18319272 - 18319354
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||| | ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319272 aagttgagggcttgatgccctgagagcctatttacgctctactacattgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 18319354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 177
Target Start/End: Original strand, 26012269 - 26012339
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaat 177  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  26012269 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaat 26012339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 27989098 - 27989219
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||||    | |  || | ||||    
T  27989098 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca-ccacgttgagggcttgatgccct----ggagcttta-gctc 27989191  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctgga 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  27989192 aactaagttgagggcttgatgccctgga 27989219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 247
Target Start/End: Original strand, 36509873 - 36509965
Alignment:
Q  154 ttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||   || |||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36509873 ttgatgccctatgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggtttgatgtcttgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 36509965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39363209 - 39363152
Alignment:
Q  196 cttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39363209 cttgatgccccgtattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 39363152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 207
Target Start/End: Original strand, 6551486 - 6551548
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6551486 aagttgagggcttgatgccctatgagcctatt--tgctctattaagttgagggcttgatgccctg 6551548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 16605390 - 16605431
Alignment:
Q  85 gagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16605390 gagtccatgcataatcattaaagttgggggcttgatgccctg 16605431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17874976 - 17874936
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaa 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17874976 gggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgattaagaa 17874936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Original strand, 21742003 - 21742067
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21742003 aatacgttgagggcttgatgtccttg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 21742067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22142560 - 22142523
Alignment:
Q  237 taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtc 274  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22142560 taagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtc 22142523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1096280 - 1096248
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096280 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 1096248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9077766 - 9077734
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9077766 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 9077734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Original strand, 20198817 - 20198864
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20198817 ataagttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgtttaag 20198864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 225
Target Start/End: Original strand, 21729335 - 21729407
Alignment:
Q  154 ttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21729335 ttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 21729407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 225
Target Start/End: Original strand, 21808659 - 21808731
Alignment:
Q  154 ttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21808659 ttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 21808731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Original strand, 22107670 - 22107714
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22107670 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 22107714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 25575827 - 25575883
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  25575827 ttgagtccatgcatactcattcaaattgggggcttgatgccctagatcctttgctca 25575883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 25578200 - 25578256
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  25578200 ttgagtccatgcatactcattcacgttgggggcttgatgccctagatcctttgctca 25578256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 29914384 - 29914344
Alignment:
Q  86 agtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29914384 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 29914344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19920676 - 19920587
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| || |||||||| | ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19920676 taagttgagggtttgatgccatgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtactacatgcatgattaaga 19920587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 21293237 - 21293312
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21293237 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggacttgatgccctgtattggtaccacatgcat 21293312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 38619330 - 38619218
Alignment:
Q  166 gagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgc 263  Q
    |||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  38619330 gagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcgagttggagtcgc 38619233  T
Q  264 a-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    | |||||||||||||    
T  38619232 atttgtcgagtcaaa 38619218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39244934 - 39244888
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  39244934 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaagt 39244888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 265132 - 265177
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  265132 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 265177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 10733303 - 10733348
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10733303 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 10733348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14048006 - 14047940
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14048006 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgg 14047940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 20198711 - 20198753
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20198711 tgagtccttgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 20198753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20908810 - 20908765
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20908810 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 20908765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Original strand, 21619101 - 21619177
Alignment:
Q  154 ttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||| | || |||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  21619101 ttgatgccctgtgagtatatttatactcta-tatgttgggggcttgatgcccagg-ttggtaccacacgcatgattaag 21619177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25743674 - 25743632
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccct 125  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25743674 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccct 25743632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 26761525 - 26761487
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26761525 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgc 26761487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29345779 - 29345734
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  29345779 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 29345734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29348252 - 29348207
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  29348252 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 29348207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29350725 - 29350680
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  29350725 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 29350680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31455502 - 31455398
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aag 240  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| ||||  |||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | |||    
T  31455502 taagatgagggcttgatgtcctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgagggtttgatgccctggtttgtt-ccacatgcatgattaagaagttgaag 31455405  T
Q  241 ttgcata 247  Q
    |||||||    
T  31455404 ttgcata 31455398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Original strand, 36155021 - 36155087
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36155021 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgg 36155087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 42245728 - 42245773
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  42245728 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 42245773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Original strand, 5889621 - 5889685
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||| |||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5889621 aatacgttgggggcttgatgtccttg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 5889685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Original strand, 16605475 - 16605515
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16605475 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 16605515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 17010895 - 17010854
Alignment:
Q  26 cgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17010895 cgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 17010854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Original strand, 20470083 - 20470124
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccct 125  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20470083 tgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccct 20470124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22110721 - 22110681
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22110721 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 22110681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 22178389 - 22178446
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22178389 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgctca 22178446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25742779 - 25742726
Alignment:
Q  210 ttggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||    
T  25742779 ttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttgcattgtcgagttgaagtcg 25742726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 25742827 - 25742786
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25742827 tttaagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctc 25742786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25743659 - 25743626
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagt 169  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25743659 ctcatttaagttgagggcttgatgccctatgagt 25743626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26748981 - 26748941
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26748981 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 26748941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 20027135 - 20027167
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20027135 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 20027167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23064367 - 23064307
Alignment:
Q  166 gagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23064367 gagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgcat 23064307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Original strand, 25250863 - 25250932
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25250863 ctcatataagttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tactctaatacgttgagggcttgatgccctg 25250932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Original strand, 25314648 - 25314717
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25314648 ctcatataagttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tactctaatacgttgagggcttgatgccctg 25314717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 25574634 - 25574690
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  25574634 ttgaatccatgcatactcattcaaattgggggcttgatgccctagaacctttgctca 25574690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 135
Target Start/End: Original strand, 26733001 - 26733053
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttg 135  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  26733001 ttgagtccatgcatactcattcatgttgcgggcttgatcccctgtagcctttg 26733053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 29447888 - 29447844
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29447888 tgtctttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 29447844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Original strand, 29915478 - 29915529
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29915478 aataagttcggggcttgatgtcctag-ttggtaccacatgcatgattaagaag 29915529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31144072 - 31144025
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgatt--aagaagataagttgcatagtcaag 253  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  31144072 gattggtaccacatgcatgattagaagattataagttgcatagtcaag 31144025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39245029 - 39244997
Alignment:
Q  177 tgctcaaataagttgagggcttgatgccctgga 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39245029 tgctcaattaagttgagggcttgatgccctgga 39244997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40725639 - 40725599
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  40725639 gggcttgatgctccgtattggtaccacatgcatgattaaga 40725599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 197)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 95 - 290
Target Start/End: Original strand, 32404369 - 32404564
Alignment:
Q  95 atactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32404369 atactcattaaagttgggggcttgatgtcctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgctctgggagtatattaatgctcaaataagtttagg 32404468  T
Q  195 gcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgtt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32404469 gcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttgtt 32404564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15245908 - 15245726
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15245908 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 15245809  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  15245808 ggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 15245726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15265029 - 15264847
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15265029 gttgggggcttgatgccctggagccattgctcaattaagttgagggcttgatgccctaagagtatattaatgctcaaataagttgagggattgatgccct 15264930  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  15264929 ggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 15264847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 83 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13919281 - 13919087
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13919281 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagccttttctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctca 13919182  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaa 276  Q
    ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13919181 aatacattgagggcttaatgccttggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaa 13919087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 316011 - 315826
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  316011 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccttggaagtatattaatactcaaataagttgagggcttgatgccct 315912  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgtta 291  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  315911 ggattagtaccacatgcatgattaagaggtgtaggttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcgagttcttaagttgtta 315826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15206826 - 15206678
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15206826 gttgggggcttgatgctctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 15206727  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  15206726 ggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagt 15206678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Original strand, 43889916 - 43890098
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||  ||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43889916 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaaagttgta--agttg-ttgagaccatacatactcatttaagttgggggcttgatgc 43890012  T
Q  123 cctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43890013 cctgaagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccttgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 43890098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12377873 - 12377690
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  12377873 ttgagtctatgcatacttattcatgttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctataagtatattaatactta 12377774  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcatt 266  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12377773 aa-acgttcagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcgcatt 12377690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 137
Target Start/End: Original strand, 23318814 - 23318937
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23318814 agatgaatgatgtcgttccaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtct-aagatgtttaagttgattgagtccatgcatactcattaaagttggg 23318912  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgct 137  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||    
T  23318913 ggcttgatgtcctggagcctttgct 23318937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15206956 - 15206831
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15206956 agatgaaagttgtcgttccaaagtattggagtcctaagttgatgattttgtctaa-gttgtacaagttgattgagtccatgcatactcattaaagttggg 15206858  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15206857 ggcttgatgccctggagcctttgctca 15206831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15246038 - 15245913
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15246038 agatgaaagttgtcgttccaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa-gttgtacaagttgattgagtccatgcatacttattaaagttggg 15245940  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15245939 ggcttgatgccctggagcctttgctca 15245913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 177 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9577526 - 9577414
Alignment:
Q  177 tgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9577526 tgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagtcacattgtcgagtca 9577427  T
Q  276 aatcgttaagttg 288  Q
    | | |||||||||    
T  9577426 agttgttaagttg 9577414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37427658 - 37427455
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| | || |||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  37427658 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagtttagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctc 37427560  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataa-gttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcg 280  Q
      ||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |    
T  37427559 ttat--gttgagggcttgatgccctggct-ggtaccacatgcatgattaagaagatgatgttgcatagtcaagttgaagttgcattgtcgagtcaagttg 37427463  T
Q  281 ttaagttg 288  Q
    ||||||||    
T  37427462 ttaagttg 37427455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Original strand, 18700607 - 18700788
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||  ||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18700607 tgtcgttccaaagtattggaatcttaagttgtcgatgttgtccaaagttgta--agttg-ttgagttcatgcatactcatttaagttgggggcttgatgc 18700703  T
Q  123 cctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    |||| ||||||||||||   |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18700704 cctggagcctttgctca-acacattgagggcttgatgccctaggagtatattaatgctcaaataagttgaggtcttgatgccctgg 18700788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10562664 - 10562544
Alignment:
Q  115 cttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggt 214  Q
    |||||||| |||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10562664 cttgatgctctggtgcctttactcaattaagttgagggcttgatgccttgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggt 10562565  T
Q  215 accacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10562564 accacatgcatgattaagaag 10562544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 43925849 - 43925668
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||  |||||||||||||   ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |    
T  43925849 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttaa-tacgttgagggcttgatgcc-t 43925752  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  43925751 ggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttacatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagttgt 43925668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 230
Target Start/End: Original strand, 23318944 - 23319067
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  23318944 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaatacgttgagggcttgatgccct 23319043  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgatta 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  23319044 ggattgataccacatgcatgatta 23319067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 38962134 - 38962303
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38962134 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccct-ggagcctatttacgctcaaacacgttgagggcttgatgccct 38962232  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag--ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  38962233 ggattggtaccacatgcat-at--agaaggtctaagttgcatagtcaagtcggagtcgcatttgtcgagtcaaa 38962303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15265159 - 15265034
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  15265159 agatgaaagttgtcattccaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa-gttgtacaagttgattgagttcatgcatactcatttaagttggg 15265061  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15265060 ggcttgataccctggagcctttgctca 15265034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21618368 - 21618220
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaa-gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21618368 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccc 21618269  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21618268 tggattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaagt 21618220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9577634 - 9577497
Alignment:
Q  24 gtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgcc 123  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9577634 gtcgttccaaagtgttggagtcttaagttgttgatgttgtctaa-gttgtacacattg-ttgagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgcc 9577537  T
Q  124 ctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccct 163  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  9577536 ctgaagcctttgctcaaataagttgagggcttgatgccct 9577497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 24153407 - 24153577
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24153407 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccct 24153506  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    | |||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  24153507 gcattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcgagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 24153577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 323944 - 323851
Alignment:
Q  111 ggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgcc 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  323944 ggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggctggatgcc 323851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 606556 - 606721
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| |   ||||  || || ||||||||||||    
T  606556 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctagaaatatattaatac-ataatacattaagagcttgatgccct 606654  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtc 274  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  606655 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcaagtcgaggtcgcattgtcgagtc 606721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 274
Target Start/End: Original strand, 22110591 - 22110748
Alignment:
Q  115 cttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggt 214  Q
    |||||||||||| ||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| || || || ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22110591 cttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctagaaatatattaatacttaa-tacgttgaggtcttgatgctctggattggt 22110689  T
Q  215 accacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtc 274  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22110690 accacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtc 22110748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 29172826 - 29172927
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172826 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacactcaaataagttgagggcttgatgccct 29172925  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  29172926 gg 29172927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44269615 - 44269465
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  44269615 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggctttatgccatgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctc 44269517  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    || || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44269516 aa-tatgttg-gggcttgatgcccttgattggtaccacatgcatgattaagaag 44269465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 17661106 - 17661274
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||  | || |||||||| ||||||||||    
T  17661106 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-tattacgttgagggtttgatgccct 17661204  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  17661205 ggattgttaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcgagttggagtcgcattgtcgagtcaaa 17661274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 36166437 - 36166326
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagt 241  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  36166437 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagt 36166339  T
Q  242 tgcatagtcaagt 254  Q
    |||||||||||||    
T  36166338 tgcatagtcaagt 36166326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20417172 - 20417025
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || |||     
T  20417172 tgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttg-tgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactct 20417075  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaa 234  Q
    | || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20417074 a-tatgttgagggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaa 20417025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 16283053 - 16283154
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16283053 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgttgccct 16283152  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  16283153 gg 16283154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 17446896 - 17446997
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17446896 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcccttggagcctttttacgctcaaataagttgagggattgatgccct 17446995  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  17446996 gg 17446997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 52523960 - 52524129
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  52523960 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 52524058  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  52524059 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcgagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 52524129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 247
Target Start/End: Original strand, 14153421 - 14153584
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcatta-aagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  14153421 ttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc--ttatgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgct 14153518  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14153519 ctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 14153584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Original strand, 2842555 - 2842649
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2842555 tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccatggattggtaccacatgcatgattaagaag 2842649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 10247965 - 10248068
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10247965 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 10248064  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  10248065 tgga 10248068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 16454523 - 16454626
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16454523 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 16454622  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  16454623 tgga 16454626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 28848853 - 28848956
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28848853 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 28848952  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  28848953 tgga 28848956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 35065650 - 35065771
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  35065650 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccc 35065747  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgatt 229  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  35065748 tagattggtaccacatgcatgatt 35065771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35353520 - 35353426
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35353520 tttaagttgacggcttgatgccctgggagtgtatgtatgctcaa-tatgttgggggcttgatgctctggattggtaccacatgcatgattaagaag 35353426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 42386309 - 42386140
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  42386309 gttgagggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 42386211  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||| |||||| || ||     || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42386210 ggattggtaccatatgcat-ataaaaggtttaggttgcatagtcaagttgaagtcgcatttgtcgagtcaaa 42386140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 46752004 - 46751826
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcatta-aagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  46752004 ttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc--ttacgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgct 46751907  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    |   || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||    
T  46751906 ctt-tatgttgagggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttgcattgtcgagttgaagtcg 46751826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 1644904 - 1645021
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||   ||||||||||| ||  | || |||||||| ||||||||||    
T  1644904 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgggggcttgatgccctggaagtatattaatact-tattacgttgagggattgatgccct 1645002  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1645003 ggattggtaccacatgcat 1645021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 13152033 - 13152135
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13152033 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 13152132  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  13152133 tgg 13152135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 13154498 - 13154600
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13154498 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 13154597  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  13154598 tgg 13154600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15977432 - 15977330
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15977432 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 15977333  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  15977332 tgg 15977330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34159246 - 34159144
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34159246 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 34159147  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  34159146 tgg 34159144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36166517 - 36166415
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36166517 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 36166418  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  36166417 tgg 36166415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 45607149 - 45607251
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45607149 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 45607248  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  45607249 tgg 45607251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8899014 - 8898913
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  |||  | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899014 gttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgctctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccct 8898915  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  8898914 gg 8898913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 9707849 - 9707950
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9707849 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaataaagttgagggcttgatgccct 9707948  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  9707949 gg 9707950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14441290 - 14441165
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| || ||||||||||   ||| |||| |||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  14441290 gttgagggcttgatgcgctggagcctttgctcaat-aagttgagggtttgatgccctga-agtgtatttatgctcaa-tacgttgggggcttgatgccct 14441194  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14441193 ggattggtaccacatgtatgattaagaag 14441165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17463098 - 17462998
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17463098 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 17462999  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  17462998 t 17462998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 55500862 - 55500762
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55500862 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 55500763  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  55500762 t 55500762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 277
Target Start/End: Original strand, 16283089 - 16283266
Alignment:
Q  105 aagttgggggcttgatgccctga-agccttt----gctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttg 199  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||    |||||  |||||||| |||||| ||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  16283089 aagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgttgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttg 16283188  T
Q  200 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  16283189 atgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 16283266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 277
Target Start/End: Original strand, 17446932 - 17447109
Alignment:
Q  105 aagttgggggcttgatgccct-gaagccttt----gctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttg 199  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||    |||||  |||||||| || ||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  17446932 aagttgagggcttgatgcccttggagcctttttacgctcaaataagttgagggattgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttg 17447031  T
Q  200 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  17447032 atgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 17447109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41123808 - 41123709
Alignment:
Q  109 tgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||  | || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123808 tggggccttaatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgctctaggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 41123709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 6469372 - 6469474
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6469372 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgtcc 6469471  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  6469472 tgg 6469474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8898936 - 8898801
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataag 240  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  ||||    
T  8898936 taagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaag 8898839  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||    
T  8898838 ttgcatagtcaagttggagttgcatttgtcgagtcaaa 8898801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 12174481 - 12174598
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |   |||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  12174481 gttgggggcttgatgccctgaagctttagctcaaataagttaagaacttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 12174579  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12174580 ggattggtaccacatgcat 12174598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 234
Target Start/End: Original strand, 50349054 - 50349203
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcatta-aagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    ||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  50349054 ttgagtccatgcatattcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc--ttacgttgagggctagatgccctatgagtgtatttatgct 50349151  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaa 234  Q
    |   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50349152 ctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaa 50349203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 324065 - 323953
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| || | ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  324065 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaa-gttg--caagttg-ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgc 323970  T
Q  123 cctgaagcctttgctca 139  Q
    |||| ||||||||||||    
T  323969 cctggagcctttgctca 323953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16049844 - 16049753
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16049844 tttacgttgagggcttgatgccctgtgagtatatttattct-atatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 16049753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Original strand, 35065546 - 35065669
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  35065546 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggcctgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctc 35065644  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
     |||| ||||||||||||||||||||    
T  35065645 -aatacgttgagggcttgatgccctg 35065669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 206
Target Start/End: Original strand, 2842418 - 2842540
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccct-gaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  2842418 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctatgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctc 2842516  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||    
T  2842517 -aatatgttgagggcttgatgccct 2842540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14234364 - 14234200
Alignment:
Q  111 ggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggat 210  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||| ||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||    
T  14234364 ggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgctctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccctggat 14234266  T
Q  211 tggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaa 276  Q
    |||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  14234265 tggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcgagttggagtcgcatttgtcgagtcaa 14234200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16059214 - 16059136
Alignment:
Q  153 cttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16059214 cttgatgccctgtgagtatatttatgctcta-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 16059136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 253
Target Start/End: Original strand, 29172904 - 29173015
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taag 240  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  |||| | | ||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29172904 taagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgttcaaacacgttgggggcttgatgccctagattggtaccacatgcatgatt-agaagattaag 29173002  T
Q  241 ttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||    
T  29173003 ttgcatagtcaag 29173015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37037913 - 37037750
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcatta-aagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    ||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  37037913 ttgagtccatgcataatcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc--ttatgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgct 37037816  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |   || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37037815 ctt-tatgttgagggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 37037750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 247
Target Start/End: Original strand, 14642606 - 14642707
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14642606 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttg 14642703  T
Q  244 cata 247  Q
    ||||    
T  14642704 cata 14642707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 262
Target Start/End: Original strand, 42327371 - 42327492
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-a 238  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||| | || ||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  42327371 tttaagttgagggcttgatgctctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgctctg-attggtaccacatacatgattaagaagttga 42327468  T
Q  239 agttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    |||||||| ||| |||||||||||    
T  42327469 agttgcattgtcgagtcgaagtcg 42327492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Original strand, 19569277 - 19569394
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||  |||||     
T  19569277 tgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctc-tttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctc- 19569372  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgcc 204  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  19569373 tataagttgagggcttgatgcc 19569394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32307568 - 32307451
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  || ||||  |||||||||| |||  ||||||||||| || |  || |||||||||||||||| ||    
T  32307568 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactatgttgggggcttgatgcactagaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgctct 32307470  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32307469 ggattggtaccacatgcat 32307451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 247
Target Start/End: Original strand, 41173410 - 41173514
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aag 240  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  41173410 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaag 41173507  T
Q  241 ttgcata 247  Q
    |||||||    
T  41173508 ttgcata 41173514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 1465872 - 1465948
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaag 259  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  1465872 aataagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgaataagaagttgaagttgcatagtcaagttgaag 1465948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 262
Target Start/End: Original strand, 8492584 - 8492656
Alignment:
Q  190 tgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  8492584 tgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtcgaagtcg 8492656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 235
Target Start/End: Original strand, 10542917 - 10543002
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10542917 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgattaagaag 10543002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16044368 - 16044277
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| || | || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16044368 tttacgttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgttcta-tatgttgagggcttgatgtcctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 16044277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Original strand, 18700765 - 18700857
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| | |||||||||||  |||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18700765 taagttgaggtcttgatgccctgggagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 18700857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Original strand, 43890075 - 43890167
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43890075 taagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgaattggtaccacatgcatgattaagaag 43890167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 260
Target Start/End: Original strand, 37251427 - 37251508
Alignment:
Q  178 gctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagt 260  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  37251427 gctcaactaagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgtatagtcaagtcgaagt 37251508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Original strand, 45578080 - 45578180
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45578080 gttgggggcttgatgccctggagtctttgcttaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 45578179  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  45578180 t 45578180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Original strand, 12506730 - 12506823
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||||||| | || ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12506730 tttaagttgagaccttcatgccctatgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 12506823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40806957 - 40806868
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40806957 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 40806868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5214879 - 5214788
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | | |||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5214879 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgttcaa-tatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 5214788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11191941 - 11191862
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11191941 ggcttgatgccctgtgagtatatttatgctc-tatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtactacatgcatgattaag 11191862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14507865 - 14507774
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14507865 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccccgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 14507774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15565547 - 15565431
Alignment:
Q  112 gggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggatt 211  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||   | ||| | ||||||||||||| ||    |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  15565547 gggcttgatgccctggagcttttgctcaac-acgttaagggcttgatgccctgtg----tatttatgctcaa-tatgttgagggcttgatgccatggatt 15565454  T
Q  212 ggtaccacatgcatgattaagaa 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  15565453 ggtgccacatgcatgattaagaa 15565431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Original strand, 19569375 - 19569466
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||| | || ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19569375 taagttgagggcttgatgccatgtgagtataattatactcta-taagttgagggcttgatgctctgg-ttggtgccacatgcatgattaagaag 19569466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12269239 - 12269179
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12269239 gttgggggcttcatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 12269179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15017610 - 15017551
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15017610 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 15017551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17538088 - 17538002
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17538088 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 17538002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41123732 - 41123651
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123732 taagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttg--ggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 41123651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6158393 - 6158292
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  6158393 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttaagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaaaagttgaagttg 6158296  T
Q  244 cata 247  Q
    ||||    
T  6158295 cata 6158292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Original strand, 11886847 - 11886940
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||| ||||||||||  | ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11886847 tttaagttgagggcttgatgctatgtgagcctatttacgctcaa-tatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 11886940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 15932545 - 15932634
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15932545 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 15932634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 17520061 - 17520150
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17520061 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 17520150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 17534858 - 17534947
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17534858 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 17534947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 225
Target Start/End: Original strand, 25476653 - 25476724
Alignment:
Q  154 ttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476653 ttgatgccctgtaagtatattaatactcaatagcgatgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 25476724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 30175605 - 30175694
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30175605 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 30175694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 40213986 - 40214061
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213986 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgtgggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 40214061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40811772 - 40811683
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40811772 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 40811683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 42353620 - 42353663
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaa 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42353620 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaa 42353663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17044057 - 17043953
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aag 240  Q
    |||||||| || ||||| |||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17044057 taagttgagggtttgattccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaag 17043960  T
Q  241 ttgcata 247  Q
    |||||||    
T  17043959 ttgcata 17043953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17207123 - 17207051
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17207123 ggcttgatgccctgtgagtatatttatgctc-tatacgttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 17207051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 231
Target Start/End: Original strand, 19884555 - 19884640
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaa 231  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19884555 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgcctttgattggtaccacatgcatgattaa 19884640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 235
Target Start/End: Original strand, 22307696 - 22307784
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  ||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22307696 gttgagggcttgatgccctgtgaacatatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttgataccacatgcatgattaagaag 22307784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35353657 - 35353537
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    |||| |||||| ||||||||| | ||||  | ||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  35353657 ttgattccatgcatactcatttacgttgatgacttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctaggagtgtatttatgctc 35353559  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgcc 204  Q
     |||| ||||||| |||||||||    
T  35353558 -aatacgttgaggacttgatgcc 35353537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 235
Target Start/End: Original strand, 45531678 - 45531766
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||||   || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45531678 gttgagggcttgatgccttgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgacgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 45531766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Original strand, 53646972 - 53647020
Alignment:
Q  186 aagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53646972 aagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 53647020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 316072 - 316016
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  316072 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcttttgctca 316016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 277
Target Start/End: Original strand, 10901479 - 10901568
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  10901479 gttgtgggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcgagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 10901568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 12469785 - 12469741
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12469785 tgtcgttcaaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 12469741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 5206694 - 5206783
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||  |||| | |||||| || | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5206694 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgatgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 5206783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9644403 - 9644329
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||||    
T  9644403 gttgagggcttgatgctctgt-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgattcgaagtcg 9644329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11258421 - 11258297
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| |  |||| |||| |||||||| || |||| ||| ||||||||     
T  11258421 gttgagggcttgatgccatgtgagcttttgctc-tttaagtttagggcttgatgccatgggagtgtatttatgctcaa-tatgttgggggtttgatgcca 11258324  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11258323 tgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 11258297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 13210595 - 13210670
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13210595 ggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 13210670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16728240 - 16728166
Alignment:
Q  189 ttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgc 263  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||  |||||||||||    
T  16728240 ttgagggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgggtcgaagtcgc 16728166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17487711 - 17487636
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17487711 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagtgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 17487636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17499193 - 17499118
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17499193 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagtgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 17499118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 23083627 - 23083702
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23083627 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagtgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 23083702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 6155737 - 6155695
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6155737 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 6155695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11192050 - 11192008
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11192050 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 11192008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11258525 - 11258405
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||| |||  | | ||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||| |||| ||||||    
T  11258525 ttgagtccatgcatactcatttacgttgaaggcttgatgctctgtgaacttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccatgagagtgtatttatgctc 11258427  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgcc 204  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  11258426 -aatacgttgagggcttgatgcc 11258405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14670713 - 14670586
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatag 248  Q
    |||||||||||||   || |||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||    
T  14670713 ggcttgatgccctggaagcatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatag 14670616  T
Q  249 tcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    || ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  14670615 tcgagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 14670586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14682235 - 14682108
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatag 248  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||    
T  14682235 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctatattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatag 14682138  T
Q  249 tcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    || ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  14682137 tcgagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 14682108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16059310 - 16059243
Alignment:
Q  138 catttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16059310 catttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctctactaagttgagggcttgatgccctg 16059243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18438388 - 18438314
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| |||||    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438388 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 18438314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Original strand, 32403068 - 32403145
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatact 99  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  32403068 gatgtcgttccaaagtgttggattcttaagttgttgatgttgtct-aagttgttcaagttgactgagtccatgcatact 32403145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 55476316 - 55476259
Alignment:
Q  196 cttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  55476316 cttgatgccccgtattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 55476259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14519453 - 14519412
Alignment:
Q  85 gagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14519453 gagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 14519412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Original strand, 15448082 - 15448126
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15448082 gttgagggcttgatgccctag-ttggtaccacatgcatgattaaga 15448126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16097176 - 16097139
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16097176 gttgagggcttcatgccctggattggtaccacatgcat 16097139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31415111 - 31415067
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  31415111 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgtatgattaaga 31415067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 43925911 - 43925854
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43925911 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctgaagcctttactca 43925854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6146010 - 6145934
Alignment:
Q  153 cttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  6146010 cttgatgccctttgagtatatttatgctcta--aagttgggggcttgatcccct-aattggtaccacatgcatgtttaag 6145934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11562497 - 11562450
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11562497 ataagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgaataag 11562450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 224
Target Start/End: Original strand, 12512871 - 12512953
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgca 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | || |||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12512871 tttaagttgagggcttgatgccctgtgattataattatactc-tatatgttgagggcttgatgccct-gtttggtaccacatgca 12512953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 16796378 - 16796334
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16796378 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 16796334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Original strand, 17259292 - 17259339
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17259292 ataagttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgactaag 17259339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Original strand, 35961767 - 35961811
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35961767 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 35961811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 227
Target Start/End: Original strand, 54331374 - 54331519
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcat-taaagttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgc 179  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||  |||||   |||||| |  ||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  54331374 tgagtccatgcatactcatctaaacttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctatattaagtagggggcttgatgccctgtgagtataattatgc 54331473  T
Q  180 tcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatga 227  Q
    ||  ||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  54331474 tc-tatatgttgggggattgatgccctgg-ttggtaccagatgcatga 54331519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 5214966 - 5214923
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  5214966 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 5214923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8499374 - 8499262
Alignment:
Q  166 gagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgc 263  Q
    |||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  8499374 gagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcgagttggagtcgc 8499277  T
Q  264 a-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    | |||||||||||||    
T  8499276 atttgtcgagtcaaa 8499262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12399063 - 12398988
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagt-tgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12399063 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcaatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 12398988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 13031816 - 13031905
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13031816 taagttaagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccttgg-ttggttccacatgcatgattaaga 13031905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14507952 - 14507909
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14507952 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 14507909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15977310 - 15977264
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15977310 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaagt 15977264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 17519909 - 17519952
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17519909 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 17519952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 17534771 - 17534814
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17534771 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 17534814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 225
Target Start/End: Original strand, 17548606 - 17548687
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17548606 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctc-aatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtgccacatgcat 17548687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17669194 - 17669148
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17669194 gttgggggcttgatgccctgg-ttggcaccacatgcatgattaagaag 17669148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 22307587 - 22307630
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22307587 ttgagtccatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccctg 22307630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26683193 - 26683134
Alignment:
Q  167 agtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26683193 agtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 26683134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 254
Target Start/End: Original strand, 28848974 - 28849020
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28848974 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaagt 28849020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 40807044 - 40807001
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40807044 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 40807001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 40811859 - 40811816
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40811859 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 40811816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43840787 - 43840712
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43840787 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggtttgatgccctgtattggtaccacatgcat 43840712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 254
Target Start/End: Original strand, 45578202 - 45578248
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  45578202 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaagt 45578248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 45804362 - 45804405
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45804362 ttgagtccatgcataatcattaaagttgggggcttaatgccctg 45804405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 1208937 - 1208979
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1208937 tgagtccatgcataatcattaaagctgggggcttgatgccctg 1208979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 9707970 - 9708015
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9707970 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 9708015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 10248086 - 10248131
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10248086 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 10248131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 13152155 - 13152200
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13152155 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 13152200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 13154620 - 13154665
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13154620 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 13154665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16044451 - 16044384
Alignment:
Q  138 catttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  16044451 catttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctctactaagttgaggggttgatgccctg 16044384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16103671 - 16103601
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaat 177  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   |||||||||||    
T  16103671 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaat 16103601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 16454644 - 16454689
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16454644 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 16454689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 17044143 - 17044101
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17044143 tgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 17044101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17462976 - 17462931
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17462976 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 17462931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34159124 - 34159079
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34159124 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 34159079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 45607271 - 45607316
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  45607271 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 45607316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 55500741 - 55500696
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  55500741 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 55500696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15467687 - 15467654
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacat 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15467687 gttgagggtttgatgccctggattggtaccacat 15467654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 22110521 - 22110578
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22110521 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctggagcctttcctca 22110578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24545598 - 24545558
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24545598 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 24545558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 24545728 - 24545691
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatg 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24545728 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatg 24545691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Original strand, 31225039 - 31225083
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  31225039 gttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatacatgattaaga 31225083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42386346 - 42386250
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||||    | |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42386346 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca-ccacgttgagggcttgatgccct----ggagcttta-gctcaactaagttgagggcttgatgccct 42386253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Original strand, 50756455 - 50756495
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50756455 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 50756495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 324119 - 324075
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  324119 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtctaa 324075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 9512848 - 9512816
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9512848 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 9512816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 9520823 - 9520791
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9520823 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 9520791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Original strand, 10542503 - 10542547
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  10542503 tgtcgttccaaagtactggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 10542547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Original strand, 11425024 - 11425056
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11425024 gggcttgatgctctggattggtaccacatgcat 11425056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 12174444 - 12174476
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12174444 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 12174476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13442129 - 13442097
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13442129 gggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 13442097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14972670 - 14972638
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14972670 gggcttgatgccctcgattggtaccacatgcat 14972638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15412285 - 15412225
Alignment:
Q  166 gagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15412285 gagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgcat 15412225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15470850 - 15470818
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15470850 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 15470818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16103708 - 16103676
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16103708 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 16103676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 17207235 - 17207191
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcat-taaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17207235 ttgagtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgatgccctg 17207191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24545679 - 24545616
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  24545679 taagttaagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctc-tatatgttgggggcttgatgccct 24545616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 163
Target Start/End: Original strand, 37251399 - 37251455
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccct 163  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  37251399 gttgagggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccct 37251455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 233
Target Start/End: Original strand, 37642571 - 37642611
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  37642571 gggcttgatgctccgtattggtaccacatgcatgattaaga 37642611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Original strand, 43889862 - 43889906
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  43889862 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttatctaa 43889906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 49668269 - 49668301
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49668269 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 49668301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 107 - 294
Target Start/End: Original strand, 19877 - 20064
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19877 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcatttaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatactcaaataagttgagggctagatgccct 19976  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgttacat 294  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  19977 ggattggtaccacatgcatgactaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgggtcaagttgttaagttgttacat 20064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Original strand, 19746 - 19858
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19746 agatgaatgatgtcgttccaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagttgtacaagttgattgagtcaatgcatactcattaaagttggg 19845  T
Q  113 ggcttgatgccct 125  Q
    |||||||||||||    
T  19846 ggcttgatgccct 19858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 15437 - 15555
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15437 gttgggggcttgatgccctggagcctttgcttacttaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccct 15536  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15537 ggattggtaccacatgcat 15555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 172)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16799372 - 16799192
Alignment:
Q  110 gggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgga 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16799372 gggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgctctgggagtatattaatgctcaattacgttgagggcttgatgccctgga 16799273  T
Q  210 ttggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgtt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16799272 ttggtaccacatgcatgattaagatgataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagttgtt 16799192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 115 - 288
Target Start/End: Original strand, 20502339 - 20502513
Alignment:
Q  115 cttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggt 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20502339 cttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggt 20502438  T
Q  215 accacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20502439 accacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 20502513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22995733 - 22995551
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22995733 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 22995634  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22995633 ggattggtaccaaatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtagaagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 22995551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28397440 - 28397258
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28397440 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatcctcaaataagttgagggcttgatgccct 28397341  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28397340 ggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 28397258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 107 - 290
Target Start/End: Original strand, 22963642 - 22963826
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22963642 gttgggggcttgatgccctggagccttcgctcaattaagttgagggcttgatgccctaggagtatattaattctcaaataagttgagggtttgatgcctt 22963741  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgtt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  22963742 ggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaagttgataagttgtt 22963826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 107 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37515417 - 37515233
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37515417 gttgggggcttgatgctctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctaggagtatattaatgctcaaatacgttgggggcttgatgccct 37515318  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgtt 290  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  37515317 ggactggtaccacatgcatgatttagaagattaagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcaagtcgagtcgttaagttgtt 37515233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22525449 - 22525264
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  22525449 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaatacgttgagggcttgatgccct 22525350  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgtta 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||    
T  22525349 ggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagtcgaagtcgcatggtcgagtcaagttgtcaagttgtta 22525264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Original strand, 22253395 - 22253576
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22253395 gttgggggcttgatgccctggagcctttactcaat-aagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccct 22253493  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  22253494 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataaagttgcatagtcaagttgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 22253576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 247
Target Start/End: Original strand, 5083262 - 5083486
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||  ||| | ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  5083262 gatgtcgttccaaagtgttggagtcctaagttgttgatgttgtccaa-gttgtacactttg-tggagtccatgcatattcatttaagttaggggcttgat 5083359  T
Q  121 gccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccaca 220  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5083360 gccctggagcctttgctcaaataagttgagggtttgatgccctgggagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccaca 5083458  T
Q  221 tgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5083459 tgcatgattaagaagttgaagttgcata 5083486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24352912 - 24352729
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  24352912 gttgggggcttgatgccttggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaatacgttgagggcttgatgccct 24352813  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24352812 ggattggtaccacatgcatgaataagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagttgt 24352729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 140 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22984142 - 22983993
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-ta 238  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  22984142 tttaagttgaggccttgatgccctaggagtatattaatgctcaaataagttaagggcttgatgccctggattggtaccatatgcatgattaagaggatta 22984043  T
Q  239 agttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22984042 agttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 22983993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 286
Target Start/End: Original strand, 40493180 - 40493384
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |    
T  40493180 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaactaagttgagggcttgatgcccttgaagtatattaatactta 40493279  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgt 281  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||    
T  40493280 aatacgttgagggcttgatgccctggattggtatcacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagttgcattgtcaagtcaagttgt 40493379  T
Q  282 taagt 286  Q
    |||||    
T  40493380 taagt 40493384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Original strand, 22381962 - 22382145
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||  ||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22381962 gttgggggcttgatgccctgtgagcttttgctcaaataagttgggggcttgatgccatgcgagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccc 22382061  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22382062 tggattggtaacacatgcatgattaagaagataaagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaattgttaagttg 22382145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 22419642 - 22419808
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  22419642 gttgggggtttgatgccctggagcctttgctcaattatgttgagggcttaatgccctggaagtatattaatacttaaatacgttgagggcttgatgccct 22419741  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtc 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22419742 ggattggtaccacatgcat-attaagaagataagttgcatagtcaagttgaagttgcattgtcgagtc 22419808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 142 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23667779 - 23667629
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataagt 241  Q
    |||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23667779 taagttgagggtttgatgcactgggagtatattaatgctcaaataagttgagggtttgatgcc-tggattggtaccacatgcatgattaagaagataagt 23667681  T
Q  242 tgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgttaca 293  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23667680 tgcatagtcaaatcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttgttaca 23667629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 107 - 276
Target Start/End: Original strand, 2419100 - 2419270
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  2419100 gttgggggcttgatgccctggagcttctgctcaattaagttgaggggttgatgccctgggagtatattaatgctcaattacgttgagggcttgatgctct 2419199  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  2419200 ggattggtaccacatgcatgaataagaggtataagttgcatagtcaagttgaagttgcattgtcgagtcaa 2419270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 107 - 276
Target Start/End: Original strand, 17439736 - 17439906
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||    
T  17439736 gttgggggcttgatgacctggagcctttgctcaattaagttgagggcttaatgccctggaagtatattaatacttaaatacgttgagggcttgatgtcct 17439835  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17439836 ggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaa 17439906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 28397570 - 28397445
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28397570 agatgaaagatgtcgttccaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa-gttgtacaagttgattgagtccatgcatactcattaaagttggg 28397472  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28397471 ggcttgatgccctgaagcctttgctca 28397445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 255
Target Start/End: Original strand, 17086382 - 17086529
Alignment:
Q  108 ttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17086382 ttgggggtttgatgtcctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgctcttggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 17086481  T
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtc 255  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  17086482 aaatggtaccacatgcatgattaagaagttaagttgcattgtcgagtc 17086529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 167 - 288
Target Start/End: Original strand, 35027106 - 35027226
Alignment:
Q  167 agtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcatt 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35027106 agtatattaatgctcaaataatttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagttgataagttgcatagtcaagtcg-agttgcatt 35027204  T
Q  267 gtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  35027205 gtcgagtcaagttgttaagttg 35027226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 289
Target Start/End: Original strand, 19155118 - 19155300
Alignment:
Q  108 ttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatga-gtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| | || |||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  19155118 ttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccc-aggatgtatattaatacttaaacactttgagggcttgatgccct 19155216  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| | || ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  19155217 ggattggtaccacatgcatgattaagaagttaaattgcatagtcgagtcaaggttgcatttgtcgagtcaagttgttaagttgt 19155300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22995863 - 22995738
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22995863 agatgaaagatgttgttccaaattgttggagtcctaagttgataatgttgtctaa-gttgtacaagttgattgagtccatgcatactcattaaagttggg 22995765  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||| || |||||||||    
T  22995764 ggcttgatgccctggagtctttgctca 22995738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26219636 - 26219489
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||   ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26219636 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcccatttacactcaaatacgttgagggcttgatgccct 26219537  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  26219536 gaattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcattgtcaagt 26219489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 254
Target Start/End: Original strand, 20533643 - 20533787
Alignment:
Q  111 ggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggat 210  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || | ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  20533643 ggggtttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttatatacgttgggggcttgatgtcctggat 20533742  T
Q  211 tggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagt 254  Q
    || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  20533743 tgataccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagt 20533787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 37515528 - 37515422
Alignment:
Q  32 aaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcc 131  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37515528 aaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa-gttgttcgagttgattgagtccatgcatactcattaaagttgggggcttgatgccctggagcc 37515430  T
Q  132 tttgctca 139  Q
    ||||||||    
T  37515429 tttgctca 37515422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16799506 - 16799381
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16799506 agatgaatgatgttgttccaaagtatttgagtcttaagttgttgatgttgtctaa-gttgtttaagttgattgagtccatgcatactcattaaagtaggg 16799408  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16799407 ggcttaatgccctggagcctttgctca 16799381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 233
Target Start/End: Original strand, 23944158 - 23944307
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |    
T  23944158 ttgagtccatgtatacgcattcatgttgggggcttgatgcccttgagcctttgctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatactta 23944257  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||  ||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23944258 aatactttggggacttgatgcccttg-ttggtaccacatgcatgattaaga 23944307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5760409 - 5760255
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||| || |||| ||| || |||||||    
T  5760409 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaat-aagttgagggcttgatgcccta-gagtgtatttatgctcaa-tacgttggggggttaatgccct 5760313  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  5760312 ggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcgc 5760255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18833289 - 18833155
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aag 240  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18833289 taagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaa-tatgttgggggcttgatgcc-tggattggtaccacatgcatgattaagaagataaag 18833192  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  18833191 ttgcatagtcaagtcgaagttgcattgccaagtcaaa 18833155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18833447 - 18833266
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||| || | ||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18833447 tgtcgttccgaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaa-gttgta--agttg-ttgagtctatgcatactcatttaagttaagggcttgatgc 18833352  T
Q  123 cctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    | || |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||   ||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18833351 catggagcctttgctcaattaagttgagggctggatgccctggtagcctatttacgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 18833266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41598108 - 41598011
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgcc 204  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598108 gttgggggcttgatgccctggagtctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttatgctcaaataagttgagggcttgatgcc 41598011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 983637 - 983805
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||  |||||||| ||||||||||| |   ||||||||||| || |  || ||||||||||||||| |||    
T  983637 gttgggggcttgatgccctggagctttaactcaactaagttgagggcttgatgccatggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgtcct 983735  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  983736 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcgagttgaagtcgcattgtcgagtcaaa 983805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 262
Target Start/End: Original strand, 19929840 - 19929994
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||||||| | |||||||| || |||||||||| ||||| |||| ||||||  ||  |||||||| |||||||||    
T  19929840 gttgggggattgatgccctggcagcttttgctc-tataagttgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctcttat--gttgaggggttgatgccc 19929936  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  19929937 tggattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 19929994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 45290938 - 45291039
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45290938 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccct-ggagtctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 45291036  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  45291037 tgg 45291039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Original strand, 6102726 - 6102824
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| ||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6102726 ctcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttatgcttatat--gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 6102823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 233
Target Start/End: Original strand, 17907927 - 17908076
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  |||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  17907927 tgagtccatgcatgctcattaaagttgagagcttgatgccctgtgagcctatttgctt-tttaagttgagggcttgatgccctgtgaatatatttatgct 17908025  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |  ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17908026 c-tatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 17908076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19896185 - 19896084
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19896185 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagtgcttgatgccct 19896086  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  19896085 gg 19896084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5760566 - 5760388
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5760566 tgtcattccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaa-gttgta--agttg-ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgc 5760471  T
Q  123 cctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgga 209  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||    |||| |||  |||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  5760470 cctggagcctttgctca-ataagttgagggcttgatgcc--tggagtgtatatatgctc-aacacgttgagggcttgatgccctgga 5760388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 4542615 - 4542718
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4542615 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 4542714  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  4542715 tgga 4542718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 5853534 - 5853637
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5853534 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 5853633  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  5853634 tgga 5853637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14823694 - 14823591
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14823694 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcccttggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 14823595  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  14823594 tgga 14823591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 235
Target Start/End: Original strand, 20179548 - 20179676
Alignment:
Q  105 aagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||    
T  20179548 aagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgtccttggagtgtatttatgctcaa-tacgttgggggcttgatgc 20179645  T
Q  204 cctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20179646 cctg-attggtaccacatgcatgattaagaag 20179676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Original strand, 22253273 - 22253390
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22253273 gatgtcgttccaaagtattggagtcttaagatgttgatgttgtccaa-gttgtacacgttg-ttgagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgat 22253370  T
Q  121 gccct-gaagcctttgctca 139  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  22253371 gccctgggagcctttgctca 22253390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1484322 - 1484220
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1484322 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 1484223  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  1484222 tgg 1484220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6520253 - 6520136
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  6520253 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgaaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 6520155  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6520154 ggattggtaccacatgcat 6520136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Original strand, 15203551 - 15203686
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataag 240  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  ||||    
T  15203551 taagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaag 15203648  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  15203649 ttgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 15203686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20403147 - 20403045
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20403147 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 20403048  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  20403047 tgg 20403045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20498452 - 20498335
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| || ||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  20498452 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggtttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 20498354  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20498353 ggattggtaccacatgcat 20498335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 26355893 - 26356010
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  26355893 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 26355991  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26355992 ggattggtaccacatgcat 26356010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 38855448 - 38855566
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  38855448 gttgggggcttgatgcactggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttaattacgttgagggcttgatgccct 38855547  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  38855548 ggattagtaccacatgcat 38855566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 15203473 - 15203574
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  |||  | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203473 gttgggggcttgatgcccaggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccttgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccct 15203572  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  15203573 gg 15203574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 41598030 - 41597896
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataag 240  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||  |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  ||||    
T  41598030 taagttgagggcttgatgccatgggagcctatttatgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaag 41597933  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaa 276  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  41597932 ttgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaa 41597896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 254
Target Start/End: Original strand, 26225570 - 26225681
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagt 241  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26225570 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctgaattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagt 26225668  T
Q  242 tgcatagtcaagt 254  Q
    ||||| |||||||    
T  26225669 tgcattgtcaagt 26225681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 247
Target Start/End: Original strand, 29763869 - 29763969
Alignment:
Q  146 ttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgc 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||| | ||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29763869 ttgagggcttgatgccctatgagcctatttacgctta--tacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgc 29763966  T
Q  245 ata 247  Q
    |||    
T  29763967 ata 29763969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22001670 - 22001572
Alignment:
Q  111 ggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22001670 ggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgg 22001572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Original strand, 25849459 - 25849585
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| ||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || ||| | || |||||||| |||||||||    
T  25849459 gttgagggtttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggtttgatgccc 25849556  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25849557 tgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 25849585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17217617 - 17217489
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 203  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||  |    
T  17217617 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctc-tatatgttgagggcttgacac 17217520  T
Q  204 cctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17217519 cctgg-ttggtaccacatgcgtgattaagaag 17217489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9180 - 9063
Alignment:
Q  144 agttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagtt 242  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| | || ||| | || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  9180 agttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgccctg-attagtaccacatgcatgattaagaagttgcagtt 9083  T
Q  243 gcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  9082 gcattgtcaagttgaagtcg 9063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19896149 - 19895972
Alignment:
Q  105 aagttgggggcttgatgccctga-agccttt----gctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttg 199  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||    |||||  ||||||||  ||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| | || |||||||    
T  19896149 aagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagtgcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacggtgggggcttg 19896050  T
Q  200 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  19896049 atgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 19895972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19699063 - 19698971
Alignment:
Q  141 ttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || ||  | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19699063 ttaagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatacttta-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 19698971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23888756 - 23888630
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 203  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||   || |||||||||||    
T  23888756 gttgggggcttgatgccctgtgagcctatttgctc-ttaaagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctcta-tattatgggggcttgatgc 23888659  T
Q  204 cctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23888658 cctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 23888630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 225
Target Start/End: Original strand, 45291017 - 45291099
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45291017 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 45291099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Original strand, 22259382 - 22259508
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| ||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || ||||| ||||||||||||    
T  22259382 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctc-tttatgttgaaggcttgatgccc 22259479  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22259480 tag-ttggtaccacatgcatgattaagaag 22259508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 203
Target Start/End: Original strand, 42818864 - 42818983
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  42818864 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggattgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgagagtgtatttatgctc 42818962  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgc 203  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  42818963 -aatacgttgagggcttgatgc 42818983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 163
Target Start/End: Original strand, 20046437 - 20046493
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccct 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20046437 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 20046493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23947272 - 23947182
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23947272 aagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatact-ttatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgtatgattaagaag 23947182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Original strand, 36405975 - 36406099
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcc--tttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||  ||||  ||||    
T  36405975 tgagtccatgcatactaattaaagttgggggcttgatgccctgtgagcctatttgctctcttaagttgatggcttgatgccttgtgagcctatt--tgct 36406072  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    | | ||||||||||| |||||||||||    
T  36406073 ctattaagttgagggtttgatgccctg 36406099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 231
Target Start/End: Original strand, 22584787 - 22584876
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaa 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || |||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22584787 tttaagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactc-tatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcataattaa 22584876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23418344 - 23418251
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||| | || ||| | || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23418344 tttaagttgaggtcttgatgccctgtgagtataattatactcta-tatgttgatggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgattaagaag 23418251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Original strand, 42819001 - 42819095
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| | || || |||||||  |||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42819001 tttaagtttagggttttatgccctgggagtgtatttatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccatggattggtaccacatgcatgattaagaag 42819095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 262
Target Start/End: Original strand, 13665522 - 13665638
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||| |  || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13665522 gttgagggcttgatgccctgtgagtgcatttatgct-atttatgttgagggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttg 13665619  T
Q  244 catagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    ||| ||| ||| |||||||    
T  13665620 cattgtcgagttgaagtcg 13665638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 262
Target Start/End: Original strand, 13724797 - 13724913
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||| |  || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13724797 gttgagggcttgatgccctgtgagtgcatttatgct-atttatgttgagggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttg 13724894  T
Q  244 catagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    ||| ||| ||| |||||||    
T  13724895 cattgtcgagttgaagtcg 13724913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21673594 - 21673478
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  21673594 gttgtgggcttgatgccctagagctttagctcaattatgttgg-ggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 21673497  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21673496 ggattggtaccacatgcat 21673478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 232
Target Start/End: Original strand, 20084608 - 20084695
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20084608 aagttgagggcttgatgctctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 20084695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Original strand, 39695634 - 39695760
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| | || ||| | || |||||||||||||||| |    
T  39695634 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggctcgatgccctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgctc 39695731  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  39695732 tgg-ttggcactacatgcatgattaagaag 39695760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 225
Target Start/End: Original strand, 21389717 - 21389793
Alignment:
Q  150 cggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21389717 cggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 21389793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 225
Target Start/End: Original strand, 21779043 - 21779119
Alignment:
Q  150 cggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21779043 cggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 21779119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 125
Target Start/End: Original strand, 22381840 - 22381942
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||  |||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||    
T  22381840 gatgtcgtcccaaagtattggagtcttaagttcttgatgttgtccaa-gttgtacacgttg-ttgagtccatccatactcatttaagttgagggcttgat 22381937  T
Q  121 gccct 125  Q
    |||||    
T  22381938 gccct 22381942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 163
Target Start/End: Original strand, 22963580 - 22963660
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccct 163  Q
    ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||  |||||||||||||    
T  22963580 ttgagtccaagaatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcatacacgttgggggcttgatgccct 22963660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Original strand, 41681761 - 41681820
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41681761 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 41681820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 206
Target Start/End: Original strand, 18819845 - 18819970
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcat-taaagttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgc 179  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||  ||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| || |    
T  18819845 tgagtccatgcatactcatctaaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgggggcttgatgccctgtgaatatatttatac 18819944  T
Q  180 tcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    || | ||||||||||||||||||||||    
T  18819945 tcta-taagttgagggcttgatgccct 18819970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19699160 - 19699040
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||  ||||  |||||    
T  19699160 ttgagtccatgcatactcatataagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctc-tttacgttgagggtttgatgccctgtgagcctatt--tgctc 19699064  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
       |||||||||||||||||||||||    
T  19699063 --ttaagttgagggcttgatgccctg 19699040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21249238 - 21249163
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21249238 ggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 21249163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21255076 - 21255001
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21255076 ggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 21255001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22244400 - 22244307
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||| | || |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22244400 tttaagttgaatgtttgatgccctgtgagtatatttatgctcta-tatgttgggggtttgatgccctag-ttggtaccacatgcatgattaagaag 22244307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23669371 - 23669325
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23669371 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 23669325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24713182 - 24713093
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24713182 taagttgagggcttgataccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 24713093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 36728343 - 36728470
Alignment:
Q  105 aagttgggggcttgatgccctg-aagcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgat 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| | || ||||  ||||||||||| | |||||||||| || ||| | || ||||||||||||||    
T  36728343 aagttgggggcttgatgccctgtaagtctatttgctc-tatacgttggaggcttgatgccatgtgagtatatttatactcta-tatgttgagggcttgat 36728440  T
Q  202 gccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36728441 gctctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 36728470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 26225490 - 26225592
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||   ||  | || |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26225490 gttgggggcttgatgccctggagcctttgcttaattaagttaagggcttgatgccctggtagcctttttaccctcaaataaagttgagggcttgatgccc 26225589  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  26225590 tgg 26225592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 163
Target Start/End: Original strand, 19929778 - 19929858
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccct 163  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||    
T  19929778 ttgagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctgtgagcctttgctc-tttacgttgggggattgatgccct 19929858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22207133 - 22207085
Alignment:
Q  186 aagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22207133 aagttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgattaagaag 22207085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 225
Target Start/End: Original strand, 23761077 - 23761193
Alignment:
Q  108 ttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| ||  | ||  || ||||||||||||| |     
T  23761077 ttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatact-tattacatttagggcttgatgccata 23761175  T
Q  208 gattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23761176 gattggtaccacatgcat 23761193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 258
Target Start/End: Original strand, 42266613 - 42266763
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| | ||||| |||| || |||||||| | || ||| | || |||||||||||||||| |    
T  42266613 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagtttagggctttatgctctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgctc 42266710  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaa 258  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||    
T  42266711 tgt-ttggtaccatatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtcgaa 42266763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Original strand, 1323539 - 1323590
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1323539 aatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 1323590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 17086320 - 17086376
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17086320 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctagagcctttgctca 17086376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Original strand, 18302951 - 18303010
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18302951 gttgagggctcgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 18303010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 20502270 - 20502326
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20502270 ttgagtccatgcatactcatccatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 20502326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 20533578 - 20533634
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20533578 ttgagtccatgaatattcattcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 20533634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Original strand, 21580315 - 21580375
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21580315 gttgagggcttgatgcccttggttggtatcacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 21580375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22473638 - 22473551
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcc--tttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22473638 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagggcttgatgccctgtgag 22473551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23888819 - 23888697
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcc--tttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||  ||||  ||||    
T  23888819 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctc-tttacgttgggggcttgatgccctgtgagcctatt--tgct 23888723  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||    
T  23888722 ctta-aagttgagggcttgatgccctg 23888697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 5866542 - 5866617
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5866542 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 5866617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 18818675 - 18818750
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18818675 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagtgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 18818750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 18879495 - 18879570
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18879495 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 18879570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20536063 - 20535988
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20536063 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 20535988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21673456 - 21673421
Alignment:
Q  190 tgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673456 tgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 21673421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23667819 - 23667756
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    ||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23667819 gttgagggtttgatgcactgggagtatattaatgctcaaataagttgagggtttgatgcactgg 23667756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Original strand, 31723825 - 31723890
Alignment:
Q  165 tgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31723825 tgagtatatttatgctcta-tatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 31723890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4483106 - 4483049
Alignment:
Q  196 cttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4483106 cttgatgccccgtattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 4483049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 22318883 - 22318925
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22318883 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 22318925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 232
Target Start/End: Original strand, 22318992 - 22319114
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||  ||||||||||||| ||||  |||| ||||||  | |||||| |||||||||||||    
T  22318992 gttgggggcttgatgccctgagagcctatgctc-tataaattgggggcttgatgccctgtgagcctatt-atgctc-tacaagttgggggcttgatgccc 22319088  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||    
T  22319089 t-gattggtaccacattcatgtttaag 22319114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Original strand, 20983087 - 20983151
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20983087 aatatgttgggggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 20983151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24352974 - 24352917
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24352974 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 24352917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 232
Target Start/End: Original strand, 2717867 - 2717910
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2717867 gttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 2717910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Original strand, 16092605 - 16092637
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092605 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 16092637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19127902 - 19127863
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19127902 gggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 19127863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 19155056 - 19155112
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  19155056 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgtcctagagcctttgctca 19155112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 168
Target Start/End: Original strand, 20179487 - 20179573
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccct--gaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20179487 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgcccttgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgtgag 20179573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 225
Target Start/End: Original strand, 21396247 - 21396323
Alignment:
Q  150 cggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  | || |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  21396247 cggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttaatgccctgtattggcaccacatgcat 21396323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21513249 - 21513202
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21513249 ataagttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgtttaag 21513202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 225
Target Start/End: Original strand, 21790740 - 21790816
Alignment:
Q  150 cggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  | || |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  21790740 cggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttaatgccctgtattggcaccacatgcat 21790816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 22419581 - 22419637
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22419581 ttgagtccatgcatacacattcatgttgggggcttgatgccctagagcctttgctca 22419637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22525510 - 22525454
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22525510 ttgagttcatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctagagcctttgctca 22525454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22874881 - 22874849
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22874881 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 22874849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23478253 - 23478209
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23478253 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 23478209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 233
Target Start/End: Original strand, 33587132 - 33587171
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33587132 gggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgattaaga 33587171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 168
Target Start/End: Original strand, 36733581 - 36733668
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcc--tttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||  |||||||  ||||||||| || |||||||||| ||||    
T  36733581 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgttctgtaagcctatttgctctattaagttgagggattgatgccctgtgag 36733668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Original strand, 38550453 - 38550504
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38550453 aatatgttgggggcttgatgccctgg-ttgataccacatgcatgattaagaag 38550504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 168
Target Start/End: Original strand, 45471426 - 45471512
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcc--tttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  45471426 tgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctc-tataagttgagggcttgatgccctgtgag 45471512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Original strand, 45471440 - 45471508
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45471440 ctcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctc-tataagttgagggcttgatgccctg 45471508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 232
Target Start/End: Original strand, 45471569 - 45471612
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45471569 gttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgattaag 45471612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 277
Target Start/End: Original strand, 14409750 - 14409862
Alignment:
Q  166 gagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgc 263  Q
    |||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  14409750 gagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcgagttggagtcgc 14409847  T
Q  264 a-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    | |||||||||||||    
T  14409848 atttgtcgagtcaaa 14409862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 277
Target Start/End: Original strand, 16413692 - 16413772
Alignment:
Q  196 cttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16413692 cttgatgccccgtattggtaccacatgcata--taagaggtctaagttgcatagtcgagttgaagttgcattgtcgagtcaaa 16413772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19128058 - 19128015
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19128058 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 19128015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 254
Target Start/End: Original strand, 20046515 - 20046561
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20046515 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaagt 20046561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 168
Target Start/End: Original strand, 39695571 - 39695657
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcatta-aagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  39695571 ttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttacgttgagggcttgatgccctgtgag 39695657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39833635 - 39833581
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39833635 gggcttgatgtcctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 39833581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 39937101 - 39937190
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||| |||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  39937101 taagttgagggcttgatgccctgcgagcctatttacgctc-aatacgttgggggcttgatgccctgg-ttgataccatatgcatgattaaga 39937190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 45131264 - 45131339
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45131264 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctctattggtaccacatgcat 45131339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1484200 - 1484155
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1484200 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 1484155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 4542736 - 4542781
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4542736 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 4542781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 5853655 - 5853700
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5853655 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 5853700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14823573 - 14823528
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14823573 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 14823528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 17979457 - 17979499
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17979457 tgagtccttgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 17979499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 20025250 - 20025292
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20025250 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgccctg 20025292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20403025 - 20402980
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20403025 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 20402980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21513397 - 21513355
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21513397 tgagtccttgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 21513355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22001552 - 22001507
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22001552 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 22001507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 237
Target Start/End: Original strand, 27472750 - 27472803
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat 237  Q
    |||| |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472750 aatatgttgggggcttgatgctctag-ttggtaccacatgcatgattaagaagat 27472803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38988263 - 38988218
Alignment:
Q  186 aagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38988263 aagttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgtttaag 38988218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39019360 - 39019315
Alignment:
Q  186 aagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  39019360 aagttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgtttaag 39019315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Original strand, 4381735 - 4381860
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcatt-aaagttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgc 179  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||  |||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||  |||  ||||    
T  4381735 tgagtccatccatactcatttaaagttaagggcttgatgccttgtgagcctatttgctctattaagttgagggcttgatgccctgtgagcctat--atgc 4381832  T
Q  180 tcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||    
T  4381833 tctattaagttgggggcttgatgccctg 4381860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17140768 - 17140692
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagt--tgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||  ||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17140768 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 17140692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22344035 - 22343995
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22344035 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 22343995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22355695 - 22355655
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22355695 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 22355655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22482824 - 22482784
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22482824 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 22482784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Original strand, 22584693 - 22584734
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccct 125  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22584693 tgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccct 22584734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 6759181 - 6759149
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6759181 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 6759149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Original strand, 13428504 - 13428555
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13428504 aatatgttgggggcttgatgcactgg-ttggtaccatatgcatgattaagaag 13428555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17217667 - 17217598
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |  ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17217667 ctcatataagttgagggcttgatgccctgtgagcctattta--ctctaatacgttgagggcttgatgccctg 17217598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Original strand, 17979605 - 17979652
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17979605 ataagttgggggcttgatgacctg-attggtaccacatgcatgtttaag 17979652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20498489 - 20498457
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20498489 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 20498457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 21673631 - 21673599
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21673631 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 21673599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22473624 - 22473555
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| ||||  ||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22473624 ctcattaaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatt--tgctctattaagttgagggcttgatgccctg 22473555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 168
Target Start/End: Original strand, 22584707 - 22584739
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22584707 ctcatttaagttgagggcttgatgccctatgag 22584739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22626549 - 22626517
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22626549 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 22626517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22874987 - 22874955
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22874987 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 22874955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 23761039 - 23761071
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23761039 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 23761071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32121557 - 32121517
Alignment:
Q  237 taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32121557 taagttgcatagtcgagttgaagttgcattgtcgagtcaaa 32121517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 37515590 - 37515546
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  37515590 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtctaa 37515546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 38988446 - 38988406
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgcc 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  38988446 ttgagtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgcc 38988406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 39019543 - 39019503
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgcc 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  39019543 ttgagtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgcc 39019503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 57838 - 57567
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  57838 agatgaatgatgtcgttccaaagcattggagtcctaagttgatgatgatgtctaa-gttgtataagttgattgagtccatgcatactcattaaagttggg 57740  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattg 212  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||   | ||||  |||||||||||||  |||  |     ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  57739 ggcttaatgccctggagcctttgctca-acacgttgggggcttgatgccct-ggagcct----ttgctcagttaagttgagggcttgatgccctagattg 57646  T
Q  213 gtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgtta 291  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||    
T  57645 gtaccacatgcatgaataagatgataagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgtcaagttgtta 57567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 8780 - 8598
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8780 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgtgggcttgatgccatgggagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 8681  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  8680 ggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagtcgttaagttg 8598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 8910 - 8785
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8910 agatgaaggatgtcgttccaaagtattggagtcataagttgttgatgttgtctaa-gttgtacaagttgattgattccatgcatactcattaaagttggg 8812  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  8811 ggtttgatgccctgaagcctttgctca 8785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17394 - 17212
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17394 gttgggggcttgatgccctgaagcctttggtcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtgaatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccct 17295  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  17294 ggattggtaccacatgcatgattaagaagaataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcaagtcaagttgttaagttg 17212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 17504 - 17399
Alignment:
Q  32 aaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcc 131  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||| || | || ||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  17504 aaagtattggagtcctaagttgttaacgttgtccaa-gttgcacacgttg-ttgagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctagagcc 17407  T
Q  132 tttgctca 139  Q
    ||||||||    
T  17406 tttgctca 17399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 83 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 106235 - 106043
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||| ||||    
T  106235 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccttggaagtatattaatactca 106136  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtc 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  106135 aatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtc 106043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 96896 - 96842
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgcc 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  96896 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 96842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 96957 - 96901
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  96957 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctagagcctttgctca 96901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Original strand, 4837 - 5008
Alignment:
Q  117 tgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtac 216  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4837 tgatgccctagagcctttgctcaattaagttgagggtttgatgccctggaagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgggttggtac 4936  T
Q  217 cacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  4937 cacatgcatgattaagaagataagttgcgtagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 5008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 107 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1591 - 1421
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1591 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgcctt 1492  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  1491 ggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcacattgtcgaatcaa 1421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 1710 - 1596
Alignment:
Q  24 gtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgcc 123  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1710 gtcgttccaaagtattagagtcctaagttgatgatgttgtctaa-gttgtataagttgattgagtccatgcatactcattaaagttgggggcttgatgcc 1612  T
Q  124 ctgaagcctttgctca 139  Q
    ||| || |||||||||    
T  1611 ctggagtctttgctca 1596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 5)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Original strand, 17147 - 17331
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  17147 gttgggggcttgacgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaatacgttgggggattgatgccct 17246  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgtta 291  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||    
T  17247 ggattggaaccacatgcatgaagaagatgataagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgtcaagttgtta 17331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Original strand, 26296 - 26480
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26296 gttgggggcttgacgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaattctcaaatacgttgggggcttgatgccct 26395  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgtta 291  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | || |||||||||    
T  26396 ggattggaaccacatgcatgaataagatgataagttgcatagtcaagtcgaagttgcactgtcgagtcaagttgtcaagttgtta 26480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 137
Target Start/End: Original strand, 17017 - 17140
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17017 agatgaaagatgtcgttccaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa-gttgtacaagttgattgagtccatgcatactcattaaagttggg 17115  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgct 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  17116 ggcttgatgccctggagcctttgct 17140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 139
Target Start/End: Original strand, 26148 - 26254
Alignment:
Q  32 aaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcc 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  26148 aaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa-gttgtatatgttgattgagtccatgcatactcattaaagttgggggcttgatgccctggagtc 26246  T
Q  132 tttgctca 139  Q
    ||||||||    
T  26247 tttgctca 26254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 26259 - 26291
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26259 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 26291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1785 - 1602
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1785 gttgggggcttgataccctgtgagcttttgctcaaataagttgggggcttgatgccctaggagtgtatttatgctcaaataagttgcgggcttgatgccc 1686  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  1685 tggattggtaccacatgcatgattaagaagataaagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 1602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 1904 - 1790
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  1904 tgtcgtcccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtc-caagttgtacacgttg-ttgagtccatgcatactcatt-aagttgagggattgatgc 1808  T
Q  123 cct-gaagcctttgctca 139  Q
    | | | ||||||||||||    
T  1807 cttgggagcctttgctca 1790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 83 - 249
Target Start/End: Original strand, 206693 - 206860
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  206693 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgagagtatattaatgctca 206792  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatga-ttaagaagataagttgcatagt 249  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  206793 actacgttgagggcttgatgccctggatttgtaccacgtgcatgatttaagaagataagttgcatagt 206860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 141)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 107 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15791575 - 15791408
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15791575 gttgggggcttgatgctctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccat 15791476  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagt 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  15791475 ggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtttaagttgcatagtcgagt 15791408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 277
Target Start/End: Original strand, 13592404 - 13592547
Alignment:
Q  134 tgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13592404 tgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatactcaaatacgttgagggcttgatgccctggattggtatcacatgcatgattaaga 13592503  T
Q  234 agataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13592504 tgataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgttgagtcaaa 13592547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 107 - 275
Target Start/End: Original strand, 14853103 - 14853272
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14853103 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 14853202  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtca 275  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  14853203 agattggtacctcatacatgattaagaggtttaagttacatagtcaagttgaagttgcactgtcgagtca 14853272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17333168 - 17333001
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  17333168 gttgggggtttgataccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgattccctggaagtatattaatacttaaatacgttgagggcttgatgccct 17333069  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtc 274  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17333068 agattggtaccacatgcatgattaagaagttaagtttcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtc 17333001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37018576 - 37018448
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37018576 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgaaggcttgatgccctgagagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 37018477  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37018476 ggattggtaacacatgcatgattaagaag 37018448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15791794 - 15791648
Alignment:
Q  13 agatgaatgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttggg 112  Q
    ||||||| ||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15791794 agatgaaagatgttgtttcaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa-gatgtacaagttgattgagtccatgcatactcattaaagttggg 15791696  T
Q  113 ggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgc 160  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15791695 ggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgc 15791648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Original strand, 53082384 - 53082566
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||    
T  53082384 gttgggggcttgatgccctgaagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-taatacgttgagggcttgatgctct 53082482  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  53082483 ggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttggagtcgcattgtcgagtcaagctgttaagttgt 53082566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Original strand, 26045523 - 26045703
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26045523 gttgggggcttgatgacctgtgagcttttgctcaaataagttgagggcttgatgccatgagagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccc 26045622  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||||||||    
T  26045623 tggattggtaccacatgcatgattaagaagaataagttgcatagtcaagtcga---tgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 26045703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Original strand, 26050704 - 26050884
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26050704 gttgggggcttgatgtcctgtgagcttttgctcaaataagttgagggcttgatgccatgagagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccc 26050803  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||||||||    
T  26050804 tggattggtaccacatgcatgattaagaagaataagttgcatagtcaagtcga---tgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 26050884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14825360 - 14825204
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14825360 gttgggggcttgatgtcctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaataagttgagggcttgatgccct 14825261  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||||||| |||||||    
T  14825260 gcattggtaccacatgcatgattaataggtgtaggttgcatagtcaagttgaagtcg 14825204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 288
Target Start/End: Original strand, 46640624 - 46640831
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||     
T  46640624 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgtaagtatattaatactt 46640723  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaa-gtcgcattgtcgagtcaaatc 279  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |     
T  46640724 aa-tacgttgagggcttgatgccctggattggtaccatatgcatgattaagaggtctaagttgcatggtcaagttgaatgtcgcattgtcgagtcaagtg 46640822  T
Q  280 gttaagttg 288  Q
    |||||||||    
T  46640823 gttaagttg 46640831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16042904 - 16042724
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  | |  ||||||| |||||||||    
T  16042904 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttatgttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctcttaca--ttgagggtttgatgccc 16042808  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagata-agttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  16042807 tggattggtaccacatgcgtgattaagaagatagagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 16042724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Original strand, 15355568 - 15355715
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15355568 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatatgttgggggcttgatgccct 15355667  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15355668 agattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaagt 15355715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 276
Target Start/End: Original strand, 32307212 - 32307311
Alignment:
Q  177 tgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaa 276  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  32307212 tgctcaactaagttgagggcttgatgtcctggattggtaccacatgcatgattaagaagagaagttgcatagtcaagttgaagttgcattgtcgagtcaa 32307311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 136
Target Start/End: Original strand, 13592211 - 13592326
Alignment:
Q  20 tgatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttga 119  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13592211 tgatgttgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagta-gttcaagttgattgagtccatgcatactcattaaagttgggggcttga 13592309  T
Q  120 tgccctgaagcctttgc 136  Q
    ||||||| |||||||||    
T  13592310 tgccctggagcctttgc 13592326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 12288445 - 12288610
Alignment:
Q  110 gggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgga 209  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||    
T  12288445 gggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccctgga 12288543  T
Q  210 ttggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12288544 ttggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcgagttgaagtcgcattgtcgagtcaaa 12288610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 13592334 - 13592435
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13592334 gttgggggcttgatgccctggagcctttactcaattaagttgaggtcttgatgccctgggagtatattaatgctcaattaagttgagggcttgatgccct 13592433  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  13592434 gg 13592435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40906801 - 40906676
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40906801 gttgggggcttgatgccctgtgagctttttctc-tttaagttgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctcaa-taagttgagggcttgacgccc 40906704  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40906703 tggattggtaccacatgcatgattaaga 40906676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19734393 - 19734214
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcatta-aagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  19734393 tgagtccatgcatactcattggaagttgagggcttgatgctctgtgagcctttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctc 19734295  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgc 263  Q
       || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  19734294 tt-tatgttgagggcttgatgccctag-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgc 19734214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 43198783 - 43198952
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||    
T  43198783 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgaggacttgatgccctagaagtatattaatact-tattacgttgagggcttgatgccct 43198881  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||   || || |  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  43198882 ggattggtaccacatgcat--atatgaggtctaagttgcatagtcgagttgaagtcgcatttgtcgagtcaaa 43198952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 14082 - 14250
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||   ||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  14082 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaaccaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 14180  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    | |||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14181 gaattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcgagttgaagtcgcattgtcgagtcaaa 14250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 52243427 - 52243596
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||  ||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  52243427 gttgggggcttgatgccctgaagctttagctcaactaagttgagtgcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 52243525  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  52243526 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcgagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 52243596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9637913 - 9637750
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcatt-aaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  9637913 ttgagtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc--ttatgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgct 9637816  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9637815 ctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 9637750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15791647 - 15791580
Alignment:
Q  72 gtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15791647 gtacaagttgattgagtccatgcatactcattaaagttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 15791580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Original strand, 26045402 - 26045518
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  26045402 gatgtcgttccaaagtgttggagtcctaagttgttgatgttgtccaa-gttgtacacgtt-actgagtccatgtatactcatttaagttagggacttgat 26045499  T
Q  121 gccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  26045500 gccctggagcctttgctca 26045518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Original strand, 26050583 - 26050699
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  26050583 gatgtcgttccaaagtgttggagtcctaagttgttgatgttgtccaa-gttgtacacgtt-actgagtccatgtatactcatttaagttagggacttgat 26050680  T
Q  121 gccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  26050681 gccctggagcctttgctca 26050699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Original strand, 53631609 - 53631731
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  53631609 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctca-ataagttgagggcttgatgccct-ggagtgtatttatgctc-aatacgttgggggcttgatgccct 53631705  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  53631706 gg-ttggtaccacatgcatgattaaga 53631731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 52312430 - 52312329
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52312430 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgctct 52312331  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  52312330 gg 52312329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16997477 - 16997382
Alignment:
Q  139 atttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16997477 atttaagttgagggcttgatgccctagaagtgtatttatgctcaa-tatgttaggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 16997382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15608291 - 15608186
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-a 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || ||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15608291 tttaagttgatggcttgatgccctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagatga 15608194  T
Q  239 agttgcat 246  Q
    ||||||||    
T  15608193 agttgcat 15608186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44615208 - 44615105
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44615208 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 44615109  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  44615108 tgga 44615105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 1837751 - 1837853
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1837751 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 1837850  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  1837851 tgg 1837853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 18239661 - 18239763
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18239661 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 18239760  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  18239761 tgg 18239763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 39706525 - 39706642
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  39706525 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattacgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 39706623  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39706624 ggattggtaccacatgcat 39706642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 50222581 - 50222683
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50222581 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 50222680  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  50222681 tgg 50222683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27995758 - 27995643
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  27995758 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaaaatgtagttg 27995661  T
Q  244 catagtcaagtcgaagtc 261  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  27995660 catagtcaagttgaagtc 27995643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Original strand, 7641424 - 7641524
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7641424 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 7641523  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  7641524 t 7641524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Original strand, 15118594 - 15118694
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15118594 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 15118693  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  15118694 t 15118694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29267540 - 29267440
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29267540 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 29267441  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  29267440 t 29267440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 18215517 - 18215620
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18215517 gttgggggcttgatgccttggagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttaccctcaaataaagttgagggcttgatgccc 18215616  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  18215617 tgga 18215620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 208
Target Start/End: Original strand, 8575069 - 8575167
Alignment:
Q  111 ggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  | || | |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8575069 ggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctttgagcctttttacgctcaaataaagttgagggtttgatgccctgg 8575167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19736446 - 19736373
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  19736446 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttgcatagtcaagttgaagtc 19736373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 40229540 - 40229361
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcatta-aagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| | || ||    
T  40229540 ttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttactc-tttaagttgagggcttgatgctctgtgagtataattatact 40229442  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    | | || |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  40229441 cta-tatgttgagggcttgatgctctg-attggtaccaaatgcataattaagaagttgaagttgcattgtcgagtagaagtcg 40229361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16997613 - 16997513
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16997613 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctc 16997515  T
Q  182 aa 183  Q
    ||    
T  16997514 aa 16997513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Original strand, 35812528 - 35812620
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35812528 taagttgagggcttgatgccatgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 35812620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44102135 - 44102001
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagt 241  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  || ||    
T  44102135 aagttgagggcttgatgccctgagagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaggt 44102038  T
Q  242 tgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  44102037 tgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 44102001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11425040 - 11424922
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  11425040 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctc 11424942  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatg 202  Q
     |||| |||||||||||||||    
T  11424941 -aatacgttgagggcttgatg 11424922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 247
Target Start/End: Original strand, 13036855 - 13036961
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-a 238  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  13036855 tttatgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttga 13036952  T
Q  239 agttgcata 247  Q
    |||||||||    
T  13036953 agttgcata 13036961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21061558 - 21061430
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 203  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||| || ||||||| ||||| ||||||| |||||| | || |||| |||||||||||    
T  21061558 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctc-tttaagttgagggtttgatgctctatgtgtatatttatgctcta-tatgttgggggcttgatgc 21061461  T
Q  204 cctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21061460 cctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 21061430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 159
Target Start/End: Original strand, 32307161 - 32307237
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatg 159  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  32307161 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaactaagttgagggcttgatg 32307237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 235
Target Start/End: Original strand, 32467272 - 32467362
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| | || ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32467272 aagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 32467362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14548617 - 14548567
Alignment:
Q  185 taagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14548617 taagttgagggcttgatgccctggatgggtaccacatgcatgattaagaag 14548567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 14927969 - 14928086
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||| ||| || |  || |||||||| ||||||||||    
T  14927969 gttgggggcttgatgccctagagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgaaagtatatcaatacttat-tacgttgagggtttgatgccct 14928067  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14928068 ggattggtaccacatgcat 14928086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 44773329 - 44773431
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44773329 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttaatgccattggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 44773428  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  44773429 tgg 44773431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 54798953 - 54799055
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  54798953 gttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggtttgatgccc 54799052  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  54799053 tgg 54799055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Original strand, 15042219 - 15042311
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15042219 taagttgagggattgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tatgttgggggcttcatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 15042311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15099008 - 15098932
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaag 259  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  15099008 aatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatagtcaagttgaag 15098932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15112205 - 15112113
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15112205 taagttgagggattgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tatgttgggggctttatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 15112113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15364953 - 15364801
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || | | ||||||||||||||    
T  15364953 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc--ttatgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgataagggcttgatgccc 15364857  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtc 261  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  15364856 tag-ttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttgcatagtcgagttgaagtc 15364801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42874885 - 42874762
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||| |||| ||||||    
T  42874885 ttgagtccatggatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgacagtgtatttatgctc 42874787  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
     |||| |||||||||||||| |||||    
T  42874786 -aatacgttgagggcttgataccctg 42874762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20519 - 20401
Alignment:
Q  141 ttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aa 239  Q
    ||||||||| |||||||||||   |||||||| | || ||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  20519 ttaagttgagggcttgatgccacgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaa 20422  T
Q  240 gttgcatagtcaagtcgaagt 260  Q
    ||||||| ||| ||| |||||    
T  20421 gttgcattgtcgagtagaagt 20401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14157738 - 14157624
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||  | || |||| |||||||||||||     
T  14157738 gttgagggcttgatgccctggagctttagctcacctaagttgagggcttgatgccctagaagtatattaatact-tattacgttgggggcttgatgcccc 14157640  T
Q  207 ggattggtaccacatg 222  Q
    |||||| |||||||||    
T  14157639 ggattgataccacatg 14157624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 247
Target Start/End: Original strand, 19435818 - 19435919
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19435818 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttaatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttg 19435915  T
Q  244 cata 247  Q
    ||||    
T  19435916 cata 19435919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 52312394 - 52312229
Alignment:
Q  105 aagttgggggcttgatgccctga-agccttt----gctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttg 199  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||    |||||  |||||||| |||||||||| ||  |||  |||| | ||||||||| |||| || ||||    
T  52312394 aagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgctctgggagcctatttacgctcaaatacgttggggacttg 52312295  T
Q  200 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcatt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  52312294 atgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcaagttggagtcgcatt 52312229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25090739 - 25090616
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  25090739 ttgagtccatgcatactcatttactttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctt-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctc 25090641  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
     |||| |||||||||||||| |||||    
T  25090640 -aatacgttgagggcttgattccctg 25090616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 247
Target Start/End: Original strand, 33244278 - 33244388
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg---attggtaccacatgcatgattaagaaga 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||     
T  33244278 tttatgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggtttgatgccctggttaattggtaccacatgcatgattaagaagt 33244376  T
Q  237 t-aagttgcata 247  Q
    | ||||||||||    
T  33244377 tgaagttgcata 33244388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 254
Target Start/End: Original strand, 54799033 - 54799143
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagt 241  Q
    ||||||| || ||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| | ||||||    
T  54799033 aagttgagggtttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctgcattggtaccacatgcat--ataagaggtataagt 54799130  T
Q  242 tgcatagtcaagt 254  Q
    |||||||||||||    
T  54799131 tgcatagtcaagt 54799143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3484938 - 3484892
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3484938 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 3484892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14164443 - 14164329
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | || |||| |||||||||||||     
T  14164443 gttgagggcttgatgccctggagctttagctcacctaagttgagggcttgatgtcctagaagtatattaatact-tattacgttgggggcttgatgcccc 14164345  T
Q  207 ggattggtaccacatg 222  Q
    |||||| |||||||||    
T  14164344 ggattgataccacatg 14164329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16296495 - 16296394
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  16296495 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgacgccctgg-ttggtacaacatgcatgattaagaagttgaagttg 16296398  T
Q  244 cata 247  Q
    ||||    
T  16296397 cata 16296394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 55582330 - 55582287
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55582330 ttgagtccatgcatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 55582287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 277
Target Start/End: Original strand, 12582 - 12681
Alignment:
Q  178 gctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtca 275  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  12582 gctcaaatacgttgggggcttgattccttggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtca 12679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14280193 - 14280111
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280193 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctctactacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 14280111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 225
Target Start/End: Original strand, 18215597 - 18215678
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215597 aagttgagggcttgatgccctg-gagcctatttacgctcaaatacgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 18215678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37018647 - 37018555
Alignment:
Q  116 ttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgga 209  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  37018647 ttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgccctgga 37018555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 50160105 - 50160020
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  50160105 ttgagtccatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctc-tttgcgttgagggcttgatgccctgtgag 50160020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20149709 - 20149575
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagt 241  Q
    ||||||| | |||||||||||  |||  |||| | |||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||    
T  20149709 aagttgaggacttgatgccctgggagcctatttacgctctactacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagt 20149612  T
Q  242 tgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  20149611 tgcatagtcaagttagagtcgcatttgtcgagtcaaa 20149575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25090635 - 25090509
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||| || ||||| ||||  |||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  25090635 gttgagggcttgattccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggg-ttgatcccctgggagtgtatttatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccc 25090539  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  25090538 ttgattgataccacatgcataattaagaag 25090509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42874781 - 42874654
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||  |||| |||| |||||| | ||  ||| ||| |||||| |     
T  42874781 gttgagggcttgataccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggtttgatgccctgggagtgtatttatgctcga-tatattgggggattgatgtca 42874684  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42874683 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 42874654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 361914 - 361863
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  361914 aatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 361863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14629718 - 14629671
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14629718 ataagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 14629671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 14853042 - 14853098
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14853042 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcttttgctca 14853098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19857241 - 19857190
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19857241 aatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 19857190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 46642552 - 46642492
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  46642552 gttgggggcttgatgtcatggattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 46642492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 51992522 - 51992416
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-a 238  Q
    |||||||||| || ||||||| || |||||||| | || ||| | || ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  51992522 tttaagttgagggtttgatgctctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgccctgt-ttggtatcacatgcatgattaagaagttga 51992425  T
Q  239 agttgcata 247  Q
    |||||||||    
T  51992424 agttgcata 51992416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7798629 - 7798554
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7798629 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 7798554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7893557 - 7893482
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7893557 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 7893482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 16027040 - 16027083
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16027040 ttgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 16027083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 16377787 - 16377862
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16377787 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 16377862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17046340 - 17046265
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17046340 ggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 17046265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22636290 - 22636215
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22636290 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 22636215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 50160043 - 50159919
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||||||  ||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||| ||||||   |  |||||||||||||| |||    
T  50160043 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc--ttatgttgagggcttgatcccctgtgagtgtatttatgctcttgt--gttgagggcttgataccc 50159948  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  50159947 tgg-ttggcaccacatgcatgattaagaag 50159919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12622484 - 12622442
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12622484 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 12622442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17333229 - 17333175
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgct 137  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17333229 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccttggagcctttgct 17333175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33185913 - 33185868
Alignment:
Q  185 taagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  33185913 taagttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcattattaa 33185868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 46740181 - 46740139
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46740181 tgagtccatgcatactctttaaagttgggggcttgatgccctg 46740139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 234
Target Start/End: Original strand, 10357575 - 10357662
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaa 234  Q
    ||||| || |||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10357575 gttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccatatgcatgattaagaa 10357662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12773899 - 12773862
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12773899 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 12773862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26444921 - 26444775
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  || ||  |||||| | || ||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  26444921 tgagtccatgcatactcattaa-gttgagggcttgatgccctgtgagtctatttgctc-tatatgttgggggcttgatgccctgtgagtatatttatgtt 26444824  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
      | || |||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  26444823 tta-tatgttgggggcttgatgccctggtt--gtaccacatgcatgattaag 26444775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Original strand, 13592161 - 13592205
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13592161 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 13592205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14038514 - 14038482
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14038514 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 14038482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14825421 - 14825365
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  14825421 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctagagcttttgctca 14825365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15365074 - 15364930
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtccta--agttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttg 118  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| || | ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||    
T  15365074 gatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaa-gttgta--agttg-ttgagtccatgcatactcattga-gttgagggcttg 15364980  T
Q  119 atgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  15364979 atgccctgtgagcctttgctc-cttacgttgagggcttgatgccctgtgag 15364930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Original strand, 17048370 - 17048414
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17048370 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 17048414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Original strand, 26922828 - 26922875
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26922828 ataagttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgtttaag 26922875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 40619710 - 40619666
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40619710 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 40619666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 10357444 - 10357487
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10357444 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 10357487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13844262 - 13844212
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaa 234  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13844262 aatacgttgggggcttgatgccctggtttg-taccacatgcatgattaagaa 13844212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 14053569 - 14053644
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| || |||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14053569 ggcttgatgccctggaagtatattaatactaaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 14053644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 35659775 - 35659732
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcat-taaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35659775 tgagtccatgcatactcatctaaagttgggggcttgatgccctg 35659732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44052683 - 44052608
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  44052683 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatatcgatgggggcttgatgtcctgtattggtaccacatgcat 44052608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20654 - 20569
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||||    
T  20654 ttgagtccatgcatactcatataagttgagggcttgatgccatgtgagcctttgctc-tttacgttgaggacttgatgccctgtgag 20569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 1837873 - 1837918
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1837873 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 1837918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 12033503 - 12033548
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12033503 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 12033548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12902611 - 12902537
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||      ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12902611 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgaaggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 12902537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14280237 - 14280171
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14280237 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgg 14280171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 14718330 - 14718375
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14718330 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 14718375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 15118716 - 15118761
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15118716 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 15118761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 18239783 - 18239828
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18239783 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 18239828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 19566950 - 19566992
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19566950 tgagtccttgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 19566992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19738192 - 19738108
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  19738192 ttgagtccatgcatactcattga-gttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctc-cttacgttgagggcttgatgccctgtgag 19738108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40906864 - 40906778
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||   | ||||  ||||||||||||| ||||    
T  40906864 ttgagttcatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctcaaacacgttgggggcttgatgccctgtgag 40906778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 50222703 - 50222748
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  50222703 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 50222748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11424903 - 11424812
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||||| || ||||| || |  |||| |||| |||||||| || |||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11424903 tttaagttgagggtttgataccttgggagtgtatttatgctcaa-tacgttgggggcttgatgctctgg-ttggtaccgcatgcatgattaaga 11424812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 225
Target Start/End: Original strand, 52873566 - 52873603
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52873566 gttgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 52873603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 55582243 - 55582203
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55582243 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 55582203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 2425562 - 2425606
Alignment:
Q  82 attgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2425562 attgagtcattgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 2425606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Original strand, 2425712 - 2425759
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2425712 ataagttaggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgtttaag 2425759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14038578 - 14038546
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14038578 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 14038546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14157776 - 14157720
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccct 163  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||||    
T  14157776 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaaccacgttgagggcttgatgccct 14157720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14164481 - 14164425
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccct 163  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||||    
T  14164481 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaaccacgttgagggcttgatgccct 14164425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14629775 - 14629735
Alignment:
Q  86 agtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14629775 agtccatgcacactcattatagttgggggcttgatgccctg 14629735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 14927932 - 14927964
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14927932 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 14927964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 123
Target Start/End: Original strand, 15042132 - 15042172
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgcc 123  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15042132 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgcc 15042172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15112292 - 15112252
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgcc 123  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15112292 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgcc 15112252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 68
Target Start/End: Original strand, 15497281 - 15497317
Alignment:
Q  32 aaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaa 68  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15497281 aaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaaa 15497317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19609238 - 19609153
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| |||| | |||||| || ||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19609238 gttgagggcttgatgctctgtgagtttatttacgctcaa-tacgttggaggcttgatgcc-tgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 19609153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22353618 - 22353578
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  22353618 gggcttgatgctccgtattggtaccacatgcatgattaaga 22353578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 33244142 - 33244186
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcatt-aaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33244142 ttgagtccatgcatactcattcaaagttgagggcttgatgccctg 33244186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 39706488 - 39706520
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39706488 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 39706520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 43198746 - 43198778
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43198746 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 43198778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Original strand, 4925 - 5107
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  4925 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaatacgttgagggcttgatgccct 5024  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| || || ||| | ||||||||||    
T  5025 ggattggtaccacatgcatgattaagaagttaagttgcatagtcgagtcgaggttgcattttcaagacaagttgttaagttgt 5107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 139
Target Start/End: Original strand, 4863 - 4920
Alignment:
Q  82 attgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4863 attgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctagagcctttgctca 4920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 108 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 332208 - 332026
Alignment:
Q  108 ttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  332208 ttgggggcttgatgccctggagacttagctcaattaagttcagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaattagttgagggcttgatgccctg 332109  T
Q  208 gattggtaccacatgcatga-ttaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  332108 gattggtaccacatgcatgatttaagaggtttaggttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 332026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 109265 - 109119
Alignment:
Q  85 gagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||  |||||| | ||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||| |     
T  109265 gagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctc-tataagtagggggcttgatgccctgtgagtatatttatgatt 109167  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaa 231  Q
     | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  109166 ta-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaa 109119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 332270 - 332214
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  332270 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccttagagcctttgctca 332214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 286
Target Start/End: Original strand, 129138 - 129343
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||| ||     
T  129138 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccatggagcctttgctcaattaagatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactt 129237  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcg 280  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |    
T  129238 aaatacgttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgcatgaataagaggtataagttgcatagtcaagttgaagttgcattgtcgagtcaagttg 129337  T
Q  281 ttaagt 286  Q
    ||||||    
T  129338 ttaagt 129343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 44492 - 44311
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||    
T  44492 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgtaagtatattaatact-taatacgttgagagcttgatgccct 44394  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa-tcgttaagttgt 289  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44393 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaagttgttaagttgt 44311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 78212 - 78032
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||  || || || |||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||    
T  78212 gttgggggcttgatgcctaga-gctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgtaagtatattaatacttaa-tacgttgagagcttgatgccct 78115  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa-tcgttaagttgt 289  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  78114 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaagttgttaagttgt 78032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 116264 - 116190
Alignment:
Q  180 tcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagt 254  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  116264 tcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaagt 116190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 78274 - 78217
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  78274 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 78217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 7)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 109 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 536 - 355
Alignment:
Q  109 tgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  536 tgggggcttgatgccctgtgagattttgctcaaataagttgagggcttgatgccctaggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctg 437  T
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||    
T  436 gattggtaccacatgcatgattaagaagaataagttgcatagtaaagtcgaagttgcattgtcaagtcaagttgttaagttg 355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6906 - 6723
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| | |||||||||||||  | || |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6906 gttgggggcttgatgccctgtgagattttgctcaaataagttaagggcttgatgccctgggtgtgtatttatgctcaaatatgttgggggcttgatgccc 6807  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||    
T  6806 tggattggtaccacatgcatgattaagaagaataagttgcatagtcaagtcgaaattgcattgtcaagtcaagttgttaagttg 6723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 117857 - 118022
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||    
T  117857 gttgagggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgataccctagaagtatattaatacttaac-acgttgagggcttgatgccct 117955  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtc 274  Q
     ||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  117956 agattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtc 118022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 659 - 481
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||||| || | ||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  659 gatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttattgttgtccaa-gttgtgcacgttg-ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgat 562  T
Q  121 gccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||| |||||||||| |   | | ||  ||||||||||||| ||||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  561 gccctggagcctttgctta-acacgctgggggcttgatgccctgtgag---att-ttgctcaaataagttgagggcttgatgccct 481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 129795 - 129682
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  129795 gttggggtcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttac-tacgttgagggcttgatgccct 129697  T
Q  207 ggattggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||||    
T  129696 ggattggtaccacat 129682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Original strand, 127474 - 127567
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| ||  ||| |||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  127474 tttaagttgagggcttgatgccctgcgagtatatttatgatc-tatatgttgggggtttgatgctctgg-ttggtatcacatgcatgattaagaag 127567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 163
Target Start/End: Original strand, 117795 - 117875
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccct 163  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||  || ||||| |||||||||||||    
T  117795 ttgaggccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgctca-atacgttgagggcttgatgccct 117875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2567 - 2384
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  2567 gttgggggcttgatgccccggagcctttgctcaattaagttaagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaatacgttgagggcttgatgccct 2468  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| | ||||||||||    
T  2467 ggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagtttcattgtcgagtcaagttgttaagttgt 2384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 142531 - 142369
Alignment:
Q  85 gagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaa 184  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  142531 gagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaaataagttgagggcttgatgccttgggagtatatttatgctcaaa 142432  T
Q  185 taagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  142431 taagttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 142369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Original strand, 16013 - 16124
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  || ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  16013 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 16111  T
Q  207 ggattggtaccac 219  Q
     ||||||||||||    
T  16112 agattggtaccac 16124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 5)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 107 - 247
Target Start/End: Original strand, 10365 - 10506
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10365 gttgggggcttgatgctctggagccttttctcaaataagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 10464  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10465 ggattggtaccacatgcatgattaagaggatcaagttgcata 10506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36071 - 35909
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||  |||||||| |||||||| ||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36071 gttgagggcttgatgccctgtgagctttttctcaaataagttgagggcttgattccctgggagtgtatttatgctcaaacaagttgagggcttgatgccc 35972  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35971 tggattggtaccacatgcatgattaagaagataggttgcatagtcaagtcgaagttgcattgt 35909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 247
Target Start/End: Original strand, 10597 - 10758
Alignment:
Q  85 gagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaa 184  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||   | ||||  |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  10597 gagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccttggagcctttgctcaac-acgttgggggctggatgccctaggagtatatttatgctcaaa 10695  T
Q  185 taagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10696 taagttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 10758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36192 - 36012
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  36192 gatgtctttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaa-gttgtacacgttg-ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgat 36095  T
Q  121 gccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    |||||  ||||||||||||   | ||||| ||||||||||||| ||||  | ||    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36094 gcccttgagcctttgctca-acacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttt----ctcaaataagttgagggcttgattccctgg 36012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 247
Target Start/End: Original strand, 16499 - 16561
Alignment:
Q  185 taagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16499 taagttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 16561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 275
Target Start/End: Original strand, 55990 - 56124
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataag 240  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  55990 taagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaag 56089  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtca 275  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  56090 ttgcatagtcaaatcgaagttgcaatgtcgagtca 56124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 207
Target Start/End: Original strand, 55912 - 56012
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55912 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 56011  T
Q  207 g 207  Q
    |    
T  56012 g 56012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14071 - 13983
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  14071 gttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctc-tttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcattataaagaag 13983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 55851 - 55907
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55851 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 55907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22170 - 22014
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22170 gttgggggcttgatgtcctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaataagttgagggcttgatgccct 22071  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||||||| |||||||    
T  22070 gcattggtaccacatgcatgattaataggtgtaggttgcatagtcaagttgaagtcg 22014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 78047 - 77956
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  78047 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctg-attggtactacatgcatgattaagaag 77956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22231 - 22175
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  22231 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctagagcttttgctca 22175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 262
Target Start/End: Original strand, 14349 - 14505
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14349 gttgggggcttgatgtcctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaataagttgagggcttgatgccct 14448  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||||||| |||||||    
T  14449 gcattggtaccacatgcatgattaataggtgtaggttgcatagtcaagttgaagtcg 14505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Original strand, 187665 - 187712
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  187665 ataagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 187712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 14288 - 14344
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  14288 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctagagcttttgctca 14344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 126
Target Start/End: Original strand, 187608 - 187648
Alignment:
Q  86 agtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  187608 agtccatgcacactcattatagttgggggcttgatgccctg 187648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Original strand, 18398 - 18581
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||  |||||| | |||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18398 gttgggggcttgatgccatgtgagcttttgcgcaaataagttaagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgataccc 18497  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  18498 tggattggtaccacgtgcatgattaagaagataaagttgcatagttaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 18581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Original strand, 11901 - 12084
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||  |||||||| || |||||||| |  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  11901 gttgggggcttgatgccatgtgagcttttgcgcaaataagttgaggggttgatgccttgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgataccc 12000  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  12001 tagattggtaccacgtgcatgattaagaagataaagttgcatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 12084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Original strand, 18276 - 18375
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  18276 gatgtcgtcccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtc-caagttgtacacgttg-ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgat 18373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2845 - 2706
Alignment:
Q  109 tgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2845 tgggggcttgatgccctggagcctttgctcaaataagttgagggcttgatgcccttggagtatatttatgctcaaataagttaagggcttgatgccctgg 2746  T
Q  209 attggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcata 247  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2745 attggtcccacatgcatgattaagaggattaagttgcata 2706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 2965 - 2852
Alignment:
Q  24 gtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgcc 123  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  2965 gtcgttccaaagtgttggagtcctaagttgttgatgttgtccaa-gttgtacacgttg-tggagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatacc 2868  T
Q  124 ctgaagcctttgctca 139  Q
    ||| ||||||||||||    
T  2867 ctggagcctttgctca 2852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2520 - 2419
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| || |||||||||| ||||| |||| ||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  2520 gttgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaaaagttgaagttg 2423  T
Q  244 cata 247  Q
    ||||    
T  2422 cata 2419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2250 - 2113
Alignment:
Q  153 cttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtca 251  Q
    ||||||||| |  ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2250 cttgatgccatgggagtatatttatactcaaataagttcagggcttgatgccctggattgctaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtca 2151  T
Q  252 agtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2150 agtcgaagtcgcattgtcgagtcaagttgttaagttgt 2113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2614 - 2468
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || |    
T  2614 ttgagtccatgcatactcattcatgttggggacttgatgctctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctagaagtatattaatactta 2515  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 229  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2514 aacatgttgaggacttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 2468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 16294 - 16462
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||    
T  16294 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-tattacgttgagggcttgatgccct 16392  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
     ||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  16393 agattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcgtagtcaagttaaagtcgcattgtcaagtcaaa 16462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 828 - 703
Alignment:
Q  108 ttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828 ttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaaataagttgagggattgatgctctgggagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 729  T
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  728 gattgataccacatgcatgattaaga 703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 947 - 834
Alignment:
Q  24 gtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgcc 123  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  947 gtcgttccaaagtgttggagtcctaagttgttgatgttgtccaa-gttgtacacgttg-tggagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgcc 850  T
Q  124 ctgaagcctttgctca 139  Q
    ||| ||||||||||||    
T  849 ctggagcctttgctca 834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10017 - 9880
Alignment:
Q  152 gcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtc 250  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10017 gcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgagggcttgatgcctttgattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtc 9918  T
Q  251 aagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  9917 aagtcgaggttgcattgtcgagtcaagttgttaagttg 9880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 10174 - 10059
Alignment:
Q  22 atgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatg 121  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| | || ||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10174 atgtcgttccaaagtgttggagtcttaagttgttgaagttgtctaa-gttgcacacgttg-ttgagtccatacatactcatttaagttgggggtttgatg 10077  T
Q  122 ccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  10076 ccctggagcctttgctca 10059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 235
Target Start/End: Original strand, 19107 - 19258
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || | |||| ||||||    
T  19107 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctaggattgtatttatgctc 19205  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19206 aa-tatgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 19258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4637 - 4510
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4637 gttgggggcttgatgccctggagcctttactcaat-aagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccct 4539  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4538 ggattggtaccacatgcatgattaagaag 4510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 4686 - 4642
Alignment:
Q  95 atactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4686 atactcatttaagttggggacttgatgccctggagcctttgctca 4642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3325 - 3250
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||    |||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3325 ggcttgatgccctggacgtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 3250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10345 - 10287
Alignment:
Q  168 gtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10345 gtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 10287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 276
Target Start/End: Original strand, 13913 - 14082
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||    
T  13913 gttgggggcttgatgctctggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccatagaaatatattaatacttaac-acgttgagggcttgatgccct 14011  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14012 ggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgttgagtcaa 14082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Original strand, 6459 - 6640
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||    
T  6459 gttgggggcttgatgctctggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccgtggaagtatattaatacttaac-acgttgagggcttgatgccct 6557  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| | |||||||||    
T  6558 ggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagttgcattgtcaagacaagttgttaagttg 6640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 13851 - 13908
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13851 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 13908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 6397 - 6454
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6397 ttgagtccatgcatacacattcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 6454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 8)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11027 - 10845
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||  |||| |||||||||||||    
T  11027 gttggggacttgatgccctgtgagcttttgctc-tttatcttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctcttat--gttgggggcttgatgccc 10931  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa-tcgttaagttgt 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  10930 tggattggtaccacatgcatgattaagaagatgaagttgcatagtcaagttgaagttgcatagtcgagtcaaagttgttaagttgt 10845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Original strand, 103862 - 104043
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  103862 gttgggggcttgatgccctagagctttagctcaattatgttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaa-tacgttgagggcttgatgccct 103960  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa-tcgttaagttgt 289  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  103961 ggattggtaccacatgcat--ataagaggattaagttgcatagtcaagttgaggtcgcattgtcgagccaaagttgttaagttgt 104043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22088 - 21975
Alignment:
Q  146 ttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgc 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22088 ttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctcttat--gttgggggcttgatgccctggattggtacaacatgcatgattaagaagatgaagttgc 21991  T
Q  245 atagtcaagtcgaagt 260  Q
    |||||| |||||||||    
T  21990 atagtcgagtcgaagt 21975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 102175 - 102293
Alignment:
Q  116 ttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggt 214  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||  |||| |||| || ||||| || |||| |||||||||||||||| |||||    
T  102175 ttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctgggagtgtatttatactcaa-tatgttgggggcttgatgccctggcttggt 102272  T
Q  215 accacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  102273 accacatgcatgattcagaag 102293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Original strand, 102062 - 102185
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||| ||    
T  102062 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatggtc 102160  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
     |||| ||||| || |||||||||||    
T  102161 -aatacgttgaaggtttgatgccctg 102185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 11086 - 11033
Alignment:
Q  87 gtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctca 139  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11086 gtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctgtcagcctttgctca 11033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22184 - 22133
Alignment:
Q  89 ccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctca 139  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22184 ccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctgtgagcctttgctca 22133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 103800 - 103857
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  103800 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccatggagcctttgctca 103857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 38341 - 38155
Alignment:
Q  87 gtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat 185  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || || |    
T  38341 gtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaat-acgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttaa-t 38244  T
Q  186 aagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagt 273  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  38243 acgttgagggcttgatgccctggactggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagacgcattgtcgagt 38155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 27943 - 28111
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  27943 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 28041  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28042 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtcaaa 28111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 276
Target Start/End: Original strand, 76060 - 76227
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||| ||||||||  ||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  76060 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttatgttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctcttat--gttgagggcttgatgccc 76156  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaa 276  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  76157 tgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagatgaagttttatagtcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaa 76227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 232
Target Start/End: Original strand, 66124 - 66212
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  66124 taagttgggggcttgatgccctgtgagtatatttatgctc-tatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 66212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Original strand, 65943 - 66066
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcc--tttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||  |||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||  ||||    
T  65943 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgctctgtgagcctatttgctctattaagttgaggccttgatgccctctgagcttatt--tgct 66040  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  66041 c-tatacgttgagggcttgatgccctg 66066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 136615 - 136783
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  136615 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-taatacgttgagggcctgatgccct 136713  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  136714 ggattggtaccacatgcat--ataagaggattaagttgcatagtcaagttgaggtcgcattgtcgagtcaaa 136783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12475 - 12360
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12475 gttgggggcttgatgctctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatacgttgacggcttgatgccct 12376  T
Q  207 ggattggtaccacatg 222  Q
    ||||||||||||||||    
T  12375 ggattggtaccacatg 12360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 289
Target Start/End: Original strand, 3282 - 3353
Alignment:
Q  218 acatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  3282 acatgcatgattaagaagttaagttgcatagtcaagttgaggttgcattgtcaagtcaagttgttaagttgt 3353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Original strand, 13774 - 13901
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||| | ||||| | ||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13774 gttgagggcttgatgccctagagcctttgctcaat-aagttaagggcctgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccct 13872  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13873 ggattggtaccacatgcatgattaagaag 13901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 164
Target Start/End: Original strand, 13712 - 13793
Alignment:
Q  82 attgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgcccta 164  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||   | ||||| ||||||||||||||    
T  13712 attgagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctagagcctttactca-acacgttgagggcttgatgcccta 13793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 5)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 188 - 289
Target Start/End: Original strand, 10785 - 10886
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagtt 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| || | ||||||||    
T  10785 gttgagggcttgatgtcctggattggtaccacatgcatgattaagaagttaagttgcatagtcaagtctaggttgcattgtcgagtaaagttgttaagtt 10884  T
Q  288 gt 289  Q
    ||    
T  10885 gt 10886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7415 - 7332
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||   |||| |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7415 ggcttgatgccctggaagtaaattaatact-aaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 7332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5454 - 5417
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5454 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 5417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 7608 - 7565
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7608 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctg 7565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 5570 - 5538
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5570 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 5538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Original strand, 1603 - 1727
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1603 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaat-aagttgagggcttgatgccctg-gagtgtatttatgctcaa-taagttgagggcttgatgccct 1699  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1700 gg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 1727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0853 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0853
Description:

Target: scaffold0853; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 262
Target Start/End: Original strand, 2933 - 3050
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2933 gttgagggcttgatgccctatgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgcccttgattggtaccacatgcatgattaagaagataaagttg 3031  T
Q  244 catagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  3032 catagtcaagtcaaagtcg 3050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24998 - 24837
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||  || | |||||| |||||||||  |    
T  24998 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctagaagtatattaatact-taacacgttgagagcttgatgcttt 24900  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  24899 ggattggtaccacatgcatgaataagaggtctaagttgcatagtcgagttgaagttgcattgt 24837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 25060 - 25003
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaa-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25060 ttgagtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 25003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15835 - 15795
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15835 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 15795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 56827 - 56650
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  56827 ttgagtccatgcagactcattcatgttgggggcttgttgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctc 56729  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
       || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  56728 --ttatgttgggggcttgatgccctgga-tggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 56650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10923 - 10772
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||| ||    
T  10923 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgttc 10825  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    || || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10824 aa-tatgttggggggttgatcccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 277
Target Start/End: Original strand, 708 - 840
Alignment:
Q  146 ttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaa-gaagat-aagttg 243  Q
    |||| |||||||||||||  |||  |||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  708 ttgagggcttgatgccctgggagcctatttatgctcaa-tatgttgcgggcttgatgccctggattggtaccacttgcatgattaaggaagataaagttg 806  T
Q  244 catagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  807 catagtcaagtcgaagttgcattgccgagtcaaa 840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 8304 - 8472
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  8304 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 8402  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
     ||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8403 agattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagttgcattgtcgagtcaaa 8472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 247
Target Start/End: Original strand, 9137 - 9238
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9137 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgctgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttg 9234  T
Q  244 cata 247  Q
    ||||    
T  9235 cata 9238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 53780 - 53948
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||   ||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  53780 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaaccaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 53878  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    | |||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  53879 gaattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcgagttgaagtcgcattgtcgagtcaaa 53948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 277
Target Start/End: Original strand, 52248 - 52379
Alignment:
Q  146 ttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgc 244  Q
    |||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||    
T  52248 ttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgc 52345  T
Q  245 atagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  52346 atagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 52379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 60218 - 60100
Alignment:
Q  141 ttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aa 239  Q
    ||||||||| |||||||||||   |||||||| | || ||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  60218 ttaagttgagggcttgatgccacgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaa 60121  T
Q  240 gttgcatagtcaagtcgaagt 260  Q
    ||||||| ||| ||| |||||    
T  60120 gttgcattgtcgagtagaagt 60100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 60353 - 60268
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||||    
T  60353 ttgagtccatgcatactcatataagttgagggcttgatgccatgtgagcctttgctc-tttacgttgaggacttgatgccctgtgag 60268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 253
Target Start/End: Original strand, 158693 - 158840
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  |||  |||| | |||||||  | |||| || ||||||||||    
T  158693 gttgggggcttgatgccttggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccttgggagcctatttacgctcaaaacacgttggggtcttgatgccc 158792  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  158793 tggattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 158840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 95292 - 95201
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  95292 taagttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 95201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 95379 - 95340
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  95379 ttgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgc 95340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Original strand, 340254 - 340286
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  340254 gggcttgatgccctcgattggtaccacatgcat 340286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 441 - 260
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| || | |||  |||||||| |||||||| ||||   ||||||||||| || || ||  |||||||||||| |||||    
T  441 gttgggggcttggtgccctggagctttagatcaactaagttgagggcttgattccctggaagtatattaatacttaa-taccttgagggcttgaagccct 343  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa-tcgttaagttgt 289  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  342 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcatgtcgaagtcgcattgtcgagtcaaagttgttaagttgt 260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Original strand, 19871 - 19998
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  19871 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccc 19968  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19969 tggattggtaccacatgcatcattaagaag 19998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Original strand, 19767 - 19890
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| || ||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  19767 ttgagtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggtttgataccctaggagtgtatttatgctc 19865  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
     |||| ||||||||||||||||||||    
T  19866 -aatacgttgagggcttgatgccctg 19890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7275 - 7186
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7275 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgtgggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 7186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14394 - 14305
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14394 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgtgggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 14305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 5)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 262
Target Start/End: Original strand, 14791 - 14967
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||  ||| |||||||  ||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||||    
T  14791 ttgagaccatgcatactcattcaagttgagtgcttgatgccctgtgagcgtttgctc--ttatgttgagggcttgaggccctaagagtgtatttatgctc 14888  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
      ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||    
T  14889 ttat--gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttgcattgtcgagtggaagtcg 14967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 262
Target Start/End: Original strand, 4807 - 4959
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||  |||||||||||||||| |    
T  4807 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc--ttatgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctcttat--gttgagggcttgatgcac 4902  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||    
T  4903 tag-ttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttgcattgtcgagtggaagtcg 4959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 168
Target Start/End: Original strand, 4745 - 4830
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  4745 ttgagtccatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctca-ttgcgttgagggcttgatgccctgtgag 4830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9530 - 9490
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9530 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 9490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16722 - 16682
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16722 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 16682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 5)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32423 - 32306
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  32423 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 32325  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32324 ggattggtaccacatgcat 32306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 116770 - 116685
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  116770 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatgattaagaag 116685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 56618 - 56577
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  56618 gggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 56577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 117183 - 117089
Alignment:
Q  27 gttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccct 125  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| || | ||||   |||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  117183 gttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaa-gttgtat--gttg-ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccct 117089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 117241 - 117198
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtcta 66  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  117241 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtcta 117198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6522 - 6421
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6522 gttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaattaagttgaaggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccct 6423  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  6422 gg 6421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6444 - 6321
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataag 240  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  ||||    
T  6444 taagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctgaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaag 6347  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgcatt 266  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  6346 ttgcatagtcaagttggagtcgcatt 6321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9668 - 9567
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9668 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagtgagggcttgatgccct 9569  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  9568 gg 9567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9547 - 9502
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9547 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 9502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38616 - 38584
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38616 gggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 38584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Original strand, 63311 - 63438
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagccttt-gctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  63311 gttgagggcttgatgccctgtgaccttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaa-tatgttgagggcttgatgccc 63408  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  63409 tggattggtacgacatgtatgattaagaag 63438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 63133 - 63189
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  63133 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccttggagcctttgctca 63189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13312 - 13212
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13312 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctaggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 13213  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  13212 t 13212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13190 - 13145
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13190 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 13145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12457 - 12290
Alignment:
Q  108 ttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||||||||||||||||||  ||| || ||  | ||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |  ||  |||||||||||||||||||    
T  12457 ttgggggcttgatgccctagagctttagcctaattatgttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacattgagggcttgatgccctg 12359  T
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  12358 gattggtaccacatgcat--ataagaggattaagttgcatagtcaagttgaggtcacattgtcgagtcaaa 12290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40320 - 40217
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40320 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 40221  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  40220 tgga 40217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40199 - 40154
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40199 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 40154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 12)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 136600 - 136497
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  136600 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgagagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 136501  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  136500 tgga 136497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 139069 - 138966
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  139069 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgagagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 138970  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  138969 tgga 138966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 141538 - 141435
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  141538 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgagagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 141439  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  141438 tgga 141435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 144007 - 143904
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  144007 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgagagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 143908  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  143907 tgga 143904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 134131 - 134028
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  134131 gttgggggcttgatgccgtggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgcttaaataaagttgagggcttgatgccc 134032  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  134031 tgga 134028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 132586 - 132517
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaat 177  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  132586 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca-ccacgttgggggcttgatgccctagaagtatattaat 132517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 134010 - 133965
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  134010 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 133965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 136479 - 136434
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  136479 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 136434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 138948 - 138903
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  138948 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 138903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 141417 - 141372
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  141417 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 141372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 143886 - 143841
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  143886 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 143841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 232
Target Start/End: Original strand, 4130 - 4173
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4130 gttgggggcttgatgccctg-attagtaccacatgcatgattaag 4173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6708 - 6591
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  6708 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 6610  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6609 ggattggtaccacatgcat 6591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 8291 - 8408
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||  | || |||||| ||||||||||||    
T  8291 gttgggggcttgatgccctagagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-tattacgttgagagcttgatgccct 8389  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8390 ggattggtaccacatgcat 8408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 247
Target Start/End: Original strand, 3025 - 3119
Alignment:
Q  152 gcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3025 gcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 3119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20667 - 20565
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20667 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 20568  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  20567 tgg 20565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20545 - 20500
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20545 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 20500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 22901 - 23018
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  22901 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 22999  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23000 ggattggtaccacatgcat 23018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 125
Target Start/End: Original strand, 113612 - 113654
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccct 125  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  113612 ttgagtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccct 113654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 94331 - 94229
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  94331 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 94232  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  94231 tgg 94229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44374 - 44273
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||  |||  | || | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44374 gttggggacttgatgccctggagcctttgctcaattaagttaagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgaggccttgatgccct 44275  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  44274 gg 44273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 100240 - 100123
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| ||  | || ||||||||| ||||||| |    
T  100240 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatact-tattacgttgagggcctgatgcctt 100142  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  100141 ggattggtaccacatgcat 100123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44296 - 44161
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataag 240  Q
    |||||||| | |||||||||||  |||  |||| |  |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| |  ||||    
T  44296 taagttgaggccttgatgccctgggagcctatttacactcaaatacgttgggggcttgatgccctagattggtaccacatgcat--ataagaggtctaag 44199  T
Q  241 ttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  44198 ttgcatagtcaagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 44161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 101427 - 101311
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||   | ||||  |||||||||||||    |||||||||| || |  ||  ||||||||||||||||||    
T  101427 gttgggggcttgatgccctggagcccttgctcacc-acgttgggggcttgatgccctgaaggtatattaatacttat-tacattgagggcttgatgccct 101330  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
     ||||||||||||||||||    
T  101329 agattggtaccacatgcat 101311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 225
Target Start/End: Original strand, 40405 - 40442
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40405 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 40442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 119729 - 119654
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagt-tgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  119729 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcaatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 119654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 94209 - 94164
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  94209 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 94164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 30258 - 30156
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30258 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 30159  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  30158 tgg 30156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30178 - 30056
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagt 241  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||    
T  30178 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaacacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagt 30081  T
Q  242 tgcatagtcaagtcgaagtcgcatt 266  Q
    ||||||||||||| | |||||||||    
T  30080 tgcatagtcaagttggagtcgcatt 30056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1695 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1695
Description:

Target: scaffold1695; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 474 - 325
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgc 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||  |||||| | |||||||  ||||||||||||| |||||||||| || |    
T  474 ttgagtccatgcatactcattaaagttaggggtttgatgccctgtgagcctatttgctc-tataagttgggggcttgatgccctgtgagtatatttatac 376  T
Q  180 tcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    || | || |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  375 tcta-tatgttgggggcttgatgccctag-ttggtaccacatgcatgattaag 325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 1270 - 1439
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||  || | ||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  1270 gttgggggcttgatgccctggagatttagatcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttaa-tacgttgagggcttgatgccct 1368  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  1369 ggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcgagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 1233 - 1265
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1233 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 1265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11983 - 11886
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgcc 204  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  11983 gttggtggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgattccctgggagtctatttacgctcaaataagttgagggcttgttgcc 11886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11869 - 11770
Alignment:
Q  178 gctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtca 275  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||    
T  11869 gctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcgagttggagtcgcatttgtcgagtca 11772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 274
Target Start/End: Original strand, 2034 - 2194
Alignment:
Q  112 gggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggatt 211  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||    
T  2034 gggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccctggatt 2132  T
Q  212 ggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtc 274  Q
     |||||||||||||   ||||| |  |||||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2133 tgtaccacatgcat--ataagaggtttaagtaacacagtcaagttgaagtcgcattgtcgagtc 2194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 235
Target Start/End: Original strand, 6788 - 6870
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6788 ggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 6870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14445 - 14365
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14445 taagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatacgttgacggcttgatgccctggattggtaccacatg 14365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 289
Target Start/End: Original strand, 418 - 489
Alignment:
Q  218 acatgcatgattaagaagataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttgt 289  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  418 acatgcatgattaagaagttaagttgcatagtcaagttgaggttgcattgtcaagtcaagttgttaagttgt 489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13867 - 13767
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13867 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccc 13768  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  13767 t 13767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Original strand, 23845 - 23894
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23845 aatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 23894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Original strand, 20915 - 20964
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20915 aatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacattcatgattaaga 20964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28273 - 28155
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagt 241  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||| || ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  28273 aagttgagggtttgatgccctataagtatatttatactcta-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttttagt 28176  T
Q  242 tgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    ||||| ||||||| |||||||    
T  28175 tgcattgtcaagttgaagtcg 28155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 262
Target Start/End: Original strand, 47579 - 47700
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-a 238  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||| | || ||| | || |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  47579 tttaagttgagggcttgatgctctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggtttgatgctctgt-ttggtaccacatgcatgattaagaagttga 47676  T
Q  239 agttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||    
T  47677 agtttcattgtcgagtcgaagtcg 47700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28374 - 28288
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcatt-aaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| ||||    
T  28374 ttgagtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctc-tttacattgagggcttgatgccctgtgag 28288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Original strand, 24404 - 24463
Alignment:
Q  167 agtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24404 agtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 24463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 930 - 802
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||| ||  || |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||| | ||||||   || ||||||||||||||||||    
T  930 gttgagggcttgatgccttgtgagtctttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgtaagtatacttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccc 833  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat 237  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  832 tgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagat 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37741 - 37638
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  | || | |||||||| |||||||||||||||||||     
T  37741 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgcct 37642  T
Q  206 tgga 209  Q
    ||||    
T  37641 tgga 37638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 247
Target Start/End: Original strand, 10317 - 10379
Alignment:
Q  185 taagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10317 taagttgagggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 10379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 37620 - 37575
Alignment:
Q  208 gattggtaccacatgcatgattaagaaga-taagttgcatagtcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37620 gattggtaccacatgcatgatt-agaagattaagttgcatagtcaag 37575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 277
Target Start/End: Original strand, 20116 - 20204
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20116 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcataatcaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaa 20204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 8173 - 8056
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  8173 gatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaaa-ttgtacacgttg-ttgagtctatgcatactcatttaagttgagggcttgat 8076  T
Q  121 gccct-gaagcctttgctca 139  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  8075 gccctgggagcctttgctca 8056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 658 - 535
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  658 ttgagtccatgcatactcatttacgttgaaggcttgatgccctatgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctc 560  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
     |||| ||||||||||||||||||||    
T  559 -aatacgttgagggcttgatgccctg 535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8016 - 7924
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| ||||||||||  |  ||||  ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8016 taagttgagggcttgatgcaattggagtgcatttatgcttaaataagttg-ggccttgatgccctggattggtactacatgcatgattaagaag 7924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 521 - 415
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-a 238  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||| | || ||| | || |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  521 tttaagttgagggcttgatgctctgtgagtataattatactcta-tatgttgtgggcttgatgctctgt-ttggtaccacatgcatgactaagaagttga 424  T
Q  239 agttgcata 247  Q
    |||||||||    
T  423 agttgcata 415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 923 - 806
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||| ||||||||||||    
T  923 gttgggggcttgatgcccttgagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagagcttgatgccct 825  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  824 ggattggtaccacatgcat 806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15347 - 15222
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||  |||| |||||||||||||    
T  15347 gttggaggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tctaagttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctcttat--gttgggggcttgatgccc 15251  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15250 tggat-ggtaccacatgcatgattaagaag 15222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15465 - 15324
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||| || | ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  15465 tgtcgttccaaagtattggattcttaagttgttgatgttgtccaa-gttgta--agttg-ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttcatgc 15370  T
Q  123 cctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    ||||  ||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  15369 cctgtgagcttttgctc-tttacgttggaggcttgatgccctgtgag 15324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 261
Target Start/End: Original strand, 19699 - 19819
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-a 238  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |      
T  19699 tttatgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgt 19796  T
Q  239 agttgcatagtcaagtcgaagtc 261  Q
    |||||||| ||| ||||||||||    
T  19797 agttgcattgtcgagtcgaagtc 19819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 207
Target Start/End: Original strand, 19603 - 19723
Alignment:
Q  86 agtccatgtatactcatta-aagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaa 183  Q
    |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||      
T  19603 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc--ttacgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctc-t 19699  T
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
     || ||||||||||||||||||||    
T  19700 ttatgttgagggcttgatgccctg 19723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24197 - 24045
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||| | || |||| |||||| ||||||    
T  24197 gttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctcctt-aagttgagggcctgatgccct--gagtatatttatgctcta-tatgttgggggcttcatgccc 24102  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 262  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  24101 tgg-ttggtaccacatgcatgatcaagaagttgaagttgcattgtcgagtcgaagtcg 24045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24313 - 24174
Alignment:
Q  27 gttcaaaagtattggagtccta--agttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccc 124  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| | ||||  ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24313 gttctaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtctaa-gttgta--agttgct-gagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccc 24218  T
Q  125 tg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  24217 tgtgagcctttgctc-tttacgttgagggcttgatgccctgtgag 24174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 24115 - 24232
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||| |  || ||  ||||||||||||||||||    
T  24115 gttgggggcttgatgccttggagctttagctcaattacgttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacataa-tacattgagggcttgatgccct 24213  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24214 ggattggtaccacatgcat 24232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Original strand, 10312 - 10352
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10312 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 10352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Original strand, 491 - 617
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||| |||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||| || |||| ||| ||||| |||    
T  491 gttgagggcttgatgccctgtgagattttgctc-tttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaa-tatgttg-gggtttgattccc 587  T
Q  206 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  588 tggattggtaccacatgcatgattaagaag 617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Original strand, 387 - 510
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctc 181  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||  |||  |||| ||||||    
T  387 ttgagtccattcatactcatttacgttgagggcttggtgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggcttgatgtcctgggagcttatttatgctc 485  T
Q  182 aaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    || || ||||||||||||||||||||    
T  486 aa-tacgttgagggcttgatgccctg 510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7441 - 7317
Alignment:
Q  108 ttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || |||| ||||||||||||||    
T  7441 ttgggggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgggggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctc--ttatgttgggggcttgatgccct 7345  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  7344 gga-tggtaccacatggatgattaagaag 7317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 7560 - 7461
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgc 122  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||| || | ||||  | ||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7560 tgtcgttccaaagtattggattcttaagttgttgatgttgtccaa-gttgta--atttg-ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgc 7465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8096 - 7990
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-a 238  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||| |||| |||||| | || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  8096 tttaagttgatggcttgatgctctgtgagtgtatttatgctcta-tatgttgagggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttga 7999  T
Q  239 agttgcata 247  Q
    |||||||||    
T  7998 agttgcata 7990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Original strand, 2989 - 3079
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2989 tttaagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctc-tatacgttgggggcttgatgcactgg-ttggtaccacatgcatgattaag 3079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Original strand, 2890 - 3013
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcc--tttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||  ||||  |||    
T  2890 ttgagtccatgtatactcattaaagttgagggcttgatgccatgtgagcctatttgctc-tttaagttgagggcttgatgccatgtgagcctatt--tgc 2986  T
Q  180 tcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||    
T  2987 tc-tttaagttgagggcttgatgccctg 3013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 236
Target Start/End: Original strand, 13173 - 13261
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaaga 236  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13173 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctcttat--gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaaga 13261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 247
Target Start/End: Original strand, 25871 - 25977
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-a 238  Q
    |||||||||| | |||||||||||  |||| |||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  25871 tttaagttgaggtcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgattaagaagttga 25968  T
Q  239 agttgcata 247  Q
    |||||||||    
T  25969 agttgcata 25977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 975 - 861
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   ||||||| ||| ||  | || |||||||||||||||||||    
T  975 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatatcaatact-tattacgttgagggcttgatgccct 877  T
Q  207 ggattggtaccacatg 222  Q
    | ||||||||||||||    
T  876 gaattggtaccacatg 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1204 - 1101
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataa 239  Q
    |||| ||||| || |||||||||| ||||| |||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  1204 tttatgttgagggattgatgccctgtgagtgtatttatgctct--taagttgagggcttgatgcgctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagtgaa 1108  T
Q  240 gttgcat 246  Q
    |||||||    
T  1107 gttgcat 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9064 - 8961
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataa 239  Q
    |||| ||||| || |||||||||| ||||| |||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9064 tttatgttgagggattgatgccctgtgagtgtatttatgctct--taagttgagggcttgatgcgctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagtgaa 8968  T
Q  240 gttgcat 246  Q
    |||||||    
T  8967 gttgcat 8961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 5)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 7936 - 8063
Alignment:
Q  105 aagttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| | ||||||   || |||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||    
T  7936 aagttgggggcttgatgccctgtgagcctatttgctc-tataagtttggggtttgatgccctttgagtatatttatgctcta-tatgttgagggcttgat 8033  T
Q  202 gccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8034 gccctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 8063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5327 - 5268
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5327 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 5268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 3269 - 3152
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || | |||||| |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  3269 gatgtcgtcccaaagtattggagtcttaagttgttgattttgtccaa-gttgtacacgttg-ttgagtccaagcatactcatttaagttgacggcttgat 3172  T
Q  121 gccct-gaagcctttgctca 139  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  3171 gccctgggagcctttgctca 3152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 7876 - 7918
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7876 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 7918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5487 - 5425
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||   || |||||||||||||||||||    
T  5487 aagttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctc-tttatgttgagggcttgatgccct 5425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39111 - 39010
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39111 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttg 39014  T
Q  244 cata 247  Q
    ||||    
T  39013 cata 39010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39270 - 39125
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtccta--agttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcatt-aaagttgggggctt 117  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| || | ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  39270 gatgttgttctaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaa-gttgta--agttg-ttgagtccatgcatactcatttaaagttgagggctt 39175  T
Q  118 gatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    |||||| ||  ||| |||||||  ||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  39174 gatgccatgtgagcttttgctc--ttacgttgagggcttgatgctctatgag 39125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 397494 - 397401
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || ||| | || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  397494 tttaagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 397401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7294 - 7186
Alignment:
Q  154 ttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaa 252  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |    
T  7294 ttgatgccctctgagtgtatttatgctcgt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgcagttgcattgtcga 7197  T
Q  253 gtcgaagtcgc 263  Q
    |||||||||||    
T  7196 gtcgaagtcgc 7186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12651 - 12534
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  ||  ||||||||||||||||||    
T  12651 gttgggggcttgatgccctggagctttatctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacattgagggcttgatgccct 12553  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12552 ggattggtaccacatgcat 12534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12688 - 12656
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12688 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 12656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1861 - 1744
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||| |||||||||||||   | ||||||||| ||  | || |||||| |||||||||| |    
T  1861 gttgggggtttgatgccctgaagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaaatatattaatact-tattacgttgagagcttgatgcctt 1763  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1762 ggattggtaccacatgcat 1744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12828 - 12711
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  12828 gttgcgggcttgatgccctagagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 12730  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12729 ggattggtaccacatgcat 12711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 46023 - 46140
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| ||  | || ||| |||||||||||||||    
T  46023 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatact-tactatgttaagggcttgatgccct 46121  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
     ||||||||||||||||||    
T  46122 agattggtaccacatgcat 46140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 44906 - 45008
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaat-aagttgagggcttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||  | || | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  44906 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttaatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgtgggcttgatgccc 45005  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  45006 tgg 45008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 235
Target Start/End: Original strand, 19513 - 19601
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19513 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 19601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 237
Target Start/End: Original strand, 7677 - 7798
Alignment:
Q  113 ggcttgatgccctga-agcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggatt 211  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||||||  ||  |||||||||||||| |||||| ||    
T  7677 ggcttgatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgagggctcgatgccctattggtgtatttatgctcttat--gttgagggcttgataccctgg-tt 7772  T
Q  212 ggtaccacatgcatgattaagaagat 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7773 ggtaccacatgcatgattaagaagat 7798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 215 - 124
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||  |||| | |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  215 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Original strand, 15479 - 15528
Alignment:
Q  185 taagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaa 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15479 taagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgactaagaa 15528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 2875 - 2991
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  2875 gttgggggcttgatgccctcgagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctga-agtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 2972  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  2973 ggattgctaccacatgcat 2991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 15460 - 15501
Alignment:
Q  85 gagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15460 gagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 15501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 2838 - 2870
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2838 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 2870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10452 - 10283
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||   |||||||||||   ||||||||||| || |  ||  |||||| |||||||||||    
T  10452 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagtacttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacattgaggtcttgatgccct 10354  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaa 277  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  10353 agattggtaccacatgcatg--taagaggcttaagttgcatagtcgagttggagtcgcatttgtcgagtcaaa 10283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1223 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1223
Description:

Target: scaffold1223; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 232
Target Start/End: Original strand, 140 - 288
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctga-agcct--ttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||  |||||| | || ||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  140 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgcactgtgagcctatttgctc-tatatgttgggggcttgatgccctgtgggtatatttatgct 238  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    | | || |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  239 cta-tatgttgggggcttgatgccctgg-tcggtaccacatgcatgattaag 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8324 - 8272
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8324 aatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 8272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 247
Target Start/End: Original strand, 1049 - 1155
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-a 238  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| | || ||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  1049 tttaagttgagggtttgatgccctgcgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttga 1146  T
Q  239 agttgcata 247  Q
    |||||||||    
T  1147 agttgcata 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1803 - 1728
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1803 ggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaataacgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 1728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17408 - 17315
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||| | || ||| | || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17408 tttaagttgagggcttgatgctctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttgataccacatgcatgattaagaag 17315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3411 - 3352
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3411 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 3352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15710 - 15617
Alignment:
Q  153 cttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||   || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15710 cttgatgcactatgagtgtatttatgctctt-tatgttgagtgcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 15617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15836 - 15773
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||   || |||||||||||| |||||||    
T  15836 aagttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctc-tttatgttgagggcttgttgccctg 15773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Original strand, 29000 - 29114
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  29000 gttggaggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttac-tacgttgagggcttgatgccct 29098  T
Q  207 ggattggtaccacatg 222  Q
     |||||||||||||||    
T  29099 agattggtaccacatg 29114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 28963 - 28995
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28963 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 28995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 57761 - 57672
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  57761 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 57672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 46848 - 46773
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46848 ggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 46773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 57849 - 57805
Alignment:
Q  82 attgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  57849 attgagtccatgcatactcatttaagttaagggcttgatgccctg 57805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 63199 - 63155
Alignment:
Q  244 catagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||    
T  63199 catagtcaagtcgaagttacattgtcgagtcaagttgttaagttg 63155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Original strand, 78441 - 78534
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  78441 tttatgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgattaagaag 78534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 78314 - 78357
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  78314 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 78357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Original strand, 221315 - 221432
Alignment:
Q  21 gatgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaaagatgtacaagttgattgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgat 120  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||||  |||||||||| || |||||| |||||| |||||||||    
T  221315 gatgtcgttccaaagtattggaggcttaagttgttgatgttgt-tcaagttgtacacgttg-ctgagtccatgcatgctcatttaagttgagggcttgat 221412  T
Q  121 gccct-gaagcctttgctca 139  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  221413 gccctgggagcctttgctca 221432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 225376 - 225197
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||  |||||||| ||||   ||||||||||| ||  | || |||||||| ||| ||||||    
T  225376 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca-ccacgttgggggcttgataccctggaagtatattaatact-tattacgttgagggattggtgccct 225279  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgca-ttgtcgagtcaaatcgttaagttg 288  Q
    |||||||||||| ||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  225278 ggattggtaccatatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcgagttggagtcgcatttgtcgagtcaagttgttaagttg 225197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6422 - 6305
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    ||||||||||||||||  || ||| || ||||| ||| ||||  ||||||||||| |   ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||    
T  6422 gttgggggcttgatgcattggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccttggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccct 6324  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6323 ggattggtaccacatgcat 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8356 - 8175
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| || ||| |  |||||||| |||||||||||||   |||||| |||| || |  || ||||||||||| ||||| |    
T  8356 gttgggggcttgatgctctggagctttagcttaactaagttgagggcttgatgccctggaagtataataatacttat-tacgttgagggcttcatgccat 8258  T
Q  207 ggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaa-tcgttaagttgt 289  Q
    | |||||||||||| ||||   ||||| | | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8257 gcattggtaccacaagcata--taagaggtttaagttgcatagtcgagttggagtcgcattgtcgagtcaaagttgttaagttgt 8175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1925 - 1888
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1925 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 1888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Original strand, 7973 - 8023
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7973 aatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 8023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 7854 - 7956
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgaggg-cttgatgccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||| ||| | |  || |||||||| | | ||||||||||||||  |||||||||    
T  7854 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaatttagttgagggcttcatgtcttgggaatatattaaagttgaaataagttgagggttttgatgccc 7953  T
Q  206 tgg 208  Q
    |||    
T  7954 tgg 7956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 237
Target Start/End: Original strand, 15230 - 15278
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15230 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagat 15278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Original strand, 11766 - 11886
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctca 182  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||  | ||      
T  11766 tgagtccatacatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagtctttgctc-cttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgttct-- 11862  T
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  11863 -ttaagttgagggcttgatgccctg 11886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16610 - 16496
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagt 249  Q
    |||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||    
T  16610 ggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggataggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagt 16513  T
Q  250 caagtcgaagtcgcatt 266  Q
    ||||| | |||||||||    
T  16512 caagttggagtcgcatt 16496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16705 - 16639
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctgg 208  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16705 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgg 16639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 66006 - 65927
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  66006 ggcttgatgccctgtgagtatatttatgctc-tatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcataattaag 65927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 17487 - 17562
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 17562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1362 - 1240
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-a 238  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |      
T  1362 tttatgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatcccctgg-ttggtaccacatacatgattaagaagttgt 1265  T
Q  239 agttgcatagtcaagtcgaagtcgc 263  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||    
T  1264 agttgcattgttgagtcgaagtcgc 1240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20603 - 20528
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagata-agttgcatagtcaagtcgaagtcgc 263  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || ||||||||||||    
T  20603 gttgagggcttgatgccttg-attggtaccacatgcatgattaagaagttatagttgcattatcgagtcgaagtcgc 20528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2844 - 2755
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2844 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tatgttgggggcttgatgccctgg-ttggttccacatgcatgattaaga 2755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Original strand, 11398 - 11446
Alignment:
Q  186 aagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11398 aagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 11446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14544 - 14497
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14544 ataagttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgattaag 14497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 8795 - 8870
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8795 ggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 8870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19148 - 19034
Alignment:
Q  110 gggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgga 209  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||  |||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  || |||||| ||||||||| |||||    
T  19148 gggggcttgatgccctggagctttagctcaattatattgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagagcttgatgctctgga 19050  T
Q  210 ttggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  19049 ttggtaccacatgcat 19034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 235
Target Start/End: Original strand, 11773 - 11854
Alignment:
Q  152 gcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||||||||||| |||||||| | || ||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11773 gcttgatgccctgtgagtataattatactcta-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcgtgattaagaag 11854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7949 - 7903
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7949 gttgagggcttgatgccctag-ttggtaccacatgcatgattaagaag 7903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 168
Target Start/End: Original strand, 896 - 979
Alignment:
Q  86 agtccatgtatactcat-taaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  896 agtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgatgccttgtgagcctttgctc-tttacgttgagggcttgatgccctgtgag 979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 168
Target Start/End: Original strand, 6200 - 6283
Alignment:
Q  86 agtccatgtatactcat-taaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgag 168  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  6200 agtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgatgccttgtgagcctttgctc-tttacgttgagggcttgatgccctgtgag 6283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 106254 - 106173
Alignment:
Q  152 gcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||| |||||||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  106254 gcttgatgctctatgagcctatttacgctcaa-tatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 106173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 55 - 6
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55 aatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 145722 - 145680
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  145722 gggcttgatgccctggattggtaccacatacatgattaagaag 145680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25751 - 25719
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25751 gggcttgatgccctagattggtaccacatgcat 25719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 14931 - 15048
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||  || |||||  || ||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |  ||  |||||||||||||||| |    
T  14931 gttgggggcttgatgccctggagatttagctcaaatatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttat-tacattgagggcttgatgcctt 15029  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15030 ggattggtaccacatgcat 15048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 14893 - 14990
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||  |||||||||||||    | | ||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14893 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaaccacgttgggggcttgatgccct----ggagattta-gctcaaatatgttgggggcttgatgccct 14987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1315 - 1271
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1315 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaaga 1271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 54866 - 54751
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttg 243  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||  |||||    
T  54866 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcaatgttaagaagatgtagttg 54769  T
Q  244 catagtcaagtcgaagtc 261  Q
    ||| ||| ||| ||||||    
T  54768 cattgtcgagttgaagtc 54751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 233
Target Start/End: Original strand, 53592 - 53741
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcatta-aagttgggggcttgatgccctgaa-gcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgct 180  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||||||||   || ||||||| |||| ||||| || |||||||||| |||||||| | || ||    
T  53592 ttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggtttgatgccctgtgtgcttttgctc-tttatgttgagggtttgatgccctgtgagtataattatact 53690  T
Q  181 caaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    | | ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  53691 cta-tatattgagtgcttgatgccctgg-ttggtaccatatgcatgattaaga 53741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 61840 - 61760
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcc--tttgctcatttaagttgacggcttgatgcc 161  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  61840 tgagtccatgcatactcactaaagttgggggcttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagggcttgatgcc 61760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 73067 - 73024
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  73067 gttgggggattgatgccctg-attggtaccacatgcatgattaag 73024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 927 - 983
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  927 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctcgagcctttgctca 983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1815 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1815
Description:

Target: scaffold1815; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 976 - 917
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcata 247  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  976 gttgagggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcata 917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 603 - 556
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  603 ataagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaag 556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 660 - 620
Alignment:
Q  86 agtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  660 agtccatgcacactcattatagttgggggcttgatgccctg 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2704 - 2653
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2704 aatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 2653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Original strand, 44246 - 44297
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44246 aatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 44297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 10692 - 10767
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10692 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 10767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4566 - 4491
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4566 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaataccgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 4491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16134 - 16059
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16134 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 16059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20523 - 20448
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20523 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggcttgatgccctgtattggtatcacatgcat 20448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 11711 - 11786
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11711 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 11786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 128 - 53
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  128 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32013 - 31938
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32013 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 31938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10153 - 10078
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10153 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctagattggtaccacatgcat 10078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 378 - 420
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  378 tgagtccatgcataatcattaaagttgggggcttgatgccctg 420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13641 - 13553
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  | || | |||||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13641 gttgagggcttgatgccctgtgagcctttttacgctcaa-tacgttgggggcttgattccctgg-ttggtaccacatgcatgattaagaag 13553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 235
Target Start/End: Original strand, 9438 - 9526
Alignment:
Q  145 gttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||  |||| | |||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9438 gttgagggcttgatgccctgtaagcctatttacgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctag-ttggtaccacatgcatgattaagaag 9526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 207
Target Start/End: Original strand, 9393 - 9457
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 207  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  9393 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctg 9457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 123
Target Start/End: Original strand, 9306 - 9346
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgcc 123  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9306 ttgagtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgcc 9346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 20978 - 21020
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20978 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 21020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 232
Target Start/End: Original strand, 18893 - 18981
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||| || ||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  18893 taagttgggggcttgatgccctgtgagtatatttatgctc-tatatgttggggacttgatgtcccgg-ttggtaccacatgcatgattaag 18981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18161 - 18075
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| ||||  ||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18161 ctcattaaacttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctctattaagttgagggattgatgccct-gattggtaccacatgcat 18075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18175 - 18093
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-aagcc--tttgctcatttaagttgacggcttgatgccct 163  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||  |||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  18175 tgagtccatgcatactcattaaacttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagggattgatgccct 18093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37202 - 37128
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| |||||    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37202 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 37128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1934 - 1892
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1934 tgagtccatgcataatcattaaagttgggggcttgatgccctg 1892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1736 - 1696
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1736 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 1696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 225
Target Start/End: Original strand, 1519 - 1601
Alignment:
Q  143 aagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||  |||| | |||| | || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1519 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctctactacgttgggggcttgatgccctgaattggtaccacatgcat 1601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 77610 - 77684
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| |||||    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77610 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 77684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1256 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1256
Description:

Target: scaffold1256; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 225
Target Start/End: Original strand, 359 - 446
Alignment:
Q  136 ctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||| | || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  359 ctcattaaaattgagggcttggtgccctgtgagtatatttatgctcta-tacgttaggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcat 446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3834 - 3793
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccct 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3834 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccct 3793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Original strand, 2581 - 2634
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctgaagcctttgc 136  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2581 ttgagtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctggagcatttgc 2634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3304 - 3185
Alignment:
Q  140 tttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-a 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||  || | ||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  3304 tttaagttgagggcttgatgccctgcgagtataattatattcta-tatattgagggcttgatgcccaag-ttggtaccacatgcatgattaagaagttga 3207  T
Q  239 agttgcatagtcaagtcgaagt 260  Q
    |||| ||| ||| |||||||||    
T  3206 agttacattgtcgagtcgaagt 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34270 - 34191
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  34270 ggcttgataccctgtgagtatatttatgctcta-tatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtactacattcatgattaag 34191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31921 - 31846
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31921 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggtttgatgccctgtattggtaccacatgcat 31846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34135 - 34092
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  34135 gttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatacatgattaag 34092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14107 - 14063
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 233  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14107 gttgagggcttgatgccctag-ttggtaccacatgcatgattaaga 14063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0645 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0645
Description:

Target: scaffold0645; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Original strand, 198 - 245
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  198 ataagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgaataag 245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Original strand, 9931 - 9982
Alignment:
Q  183 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9931 aatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacttgcatgattaagaag 9982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 10394 - 10350
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  10394 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 10350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 364 - 317
Alignment:
Q  186 aagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaa 234  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  364 aagttgggggcttgatgccctgg-tttgtaccgcatgcatgattaagaa 317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5870 - 5823
Alignment:
Q  186 aagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaa 234  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  5870 aagttgggggcttgatgccctgg-tttgtaccgcatgcatgattaagaa 5823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Original strand, 3635 - 3667
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3635 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 3667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21900 - 21868
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21900 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 21868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27690 - 27658
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27690 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 27658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 21066 - 21022
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21066 tgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 21022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 49123 - 49083
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgcc 123  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49123 ttgagtccatgcataatcattaaagttgggggcttgatgcc 49083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Original strand, 5412 - 5471
Alignment:
Q  167 agtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5412 agtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 5471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 221
Target Start/End: Original strand, 3453 - 3484
Alignment:
Q  190 tgagggcttgatgccctggattggtaccacat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3453 tgagggcttgatgccctggattggtaccacat 3484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3773 - 3730
Alignment:
Q  83 ttgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3773 ttgagtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgccctg 3730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1761 - 1719
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1761 tgagtccatgcatactcattaaagttgaggacttgatgccctg 1719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10492 - 10380
Alignment:
Q  166 gagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgc 263  Q
    |||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  10492 gagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcgagttggagtcgc 10395  T
Q  264 a-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    | |||||||||||||    
T  10394 atttgtcgagtcaaa 10380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13349 - 13274
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13349 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccatatgcat 13274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 225
Target Start/End: Original strand, 5102 - 5173
Alignment:
Q  154 ttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||    | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5102 ttgatgccctggaagtatattaatgctcaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 5173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8961 - 8849
Alignment:
Q  166 gagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag-ataagttgcatagtcaagtcgaagtcgc 263  Q
    |||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  8961 gagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcatagtcgagttggagtcgc 8864  T
Q  264 a-ttgtcgagtcaaa 277  Q
    | |||||||||||||    
T  8863 atttgtcgagtcaaa 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13067 - 12992
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13067 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggacttgatgccctgtattggtaccacatgcat 12992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 225
Target Start/End: Original strand, 692 - 773
Alignment:
Q  142 taagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  692 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttatgctc-aatacgttgggggcttgatgccttgg-ttggtgccacatgcat 773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 221
Target Start/End: Original strand, 15732 - 15803
Alignment:
Q  151 ggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacat 221  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15732 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacat 15803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 10997 - 11043
Alignment:
Q  188 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 235  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10997 gttgagggcttgacgccctgg-ttggtaccacatgtatgattaagaag 11043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6496 - 6379
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |||||  || || |  |||||||| ||||   ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||| |    
T  6496 gttgggggcttgattccctggagctttagctcaactatgtcgggggcttgataccctggaagtatattaatacttat-tacgttgagggcttgatgccgt 6398  T
Q  207 ggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  6397 ggattggtagcacatgcat 6379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 6533 - 6501
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6533 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 6501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 13913 - 13881
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13913 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 13881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 7439 - 7481
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7439 tgagtccttgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctg 7481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31989 - 31919
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcatttaagttgacggcttgatgccctatgagtatattaat 177  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||   |||||||||||    
T  31989 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctggaagtatattaat 31919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 32026 - 31994
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32026 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 31994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10169 - 10095
Alignment:
Q  152 gcttgatgccctatgagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10169 gcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctatattggtaccacatgcat 10095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 55957 - 55912
Alignment:
Q  186 aagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  55957 aagttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgtttaag 55912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 25698 - 25656
Alignment:
Q  84 tgagtccatgtatactcattaaagttgggggcttgatgccctg 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25698 tgagtccatgcatactcattaaagttgagggcttcatgccctg 25656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 225
Target Start/End: Original strand, 16908 - 16937
Alignment:
Q  196 cttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16908 cttgatgccctggattggtaccacatgcat 16937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 16799 - 16831
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16799 gttggaggcttgatgccctgaagcctttgctca 16831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 231
Target Start/End: Original strand, 285 - 329
Alignment:
Q  186 aagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  285 aagttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgtttaa 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15002 - 14962
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15002 ataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 14962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 54 - 22
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 22  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2957 - 2910
Alignment:
Q  184 ataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 232  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  2957 ataagttgggggcttgatgccct-gattgttaccacatgcatgtttaag 2910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Original strand, 6390 - 6422
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6390 gggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 6422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Original strand, 4964 - 4996
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4964 gggctttatgccctggattggtaccacatgcat 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 2999 - 3031
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2999 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 3031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 139
Target Start/End: Original strand, 3301 - 3333
Alignment:
Q  107 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctca 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3301 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 3333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15969 - 15937
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15969 gggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 15937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Original strand, 17634 - 17666
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17634 gggcttgattccctggattggtaccacatgcat 17666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Original strand, 33262 - 33294
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33262 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 33294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 45743 - 45711
Alignment:
Q  193 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45743 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 45711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Original strand, 70700 - 70744
Alignment:
Q  23 tgtcgttcaaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaa 67  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  70700 tgtctttcaaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaa 70744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University