View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8912A_low_210 (Length: 258)

Name: NF8912A_low_210
Description: NF8912A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8912A_low_210
NF8912A_low_210
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (1-258)||(24567536-24567793)
chr2 (1-255)||(22280423-22280677)
chr2 (1-255)||(25130927-25131181)
chr2 (18-253)||(22739527-22739762)
chr2 (1-210)||(12638818-12639027)
chr2 (1-210)||(24829105-24829313)
chr2 (101-238)||(25878531-25878668)
chr2 (106-210)||(12644485-12644589)
chr2 (100-209)||(34821567-34821675)
chr2 (108-240)||(27541911-27542048)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (1-255)||(20650129-20650383)
chr8 (1-255)||(21194326-21194580)
chr8 (1-255)||(16414844-16415093)
chr8 (1-255)||(23902915-23903169)
chr8 (7-238)||(24931619-24931846)
chr8 (1-255)||(21848111-21848365)
chr8 (74-255)||(22437116-22437297)
chr8 (1-234)||(23154838-23155070)
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (1-253)||(6150425-6150677)
chr3 (1-255)||(30149673-30149927)
chr3 (1-255)||(15948041-15948294)
chr3 (1-255)||(8271969-8272223)
chr3 (1-246)||(13964931-13965176)
chr3 (50-240)||(15612467-15612657)
chr3 (1-255)||(17200951-17201205)
chr3 (1-210)||(12795883-12796092)
chr3 (1-238)||(30140122-30140359)
chr3 (1-210)||(16258789-16258998)
chr3 (1-210)||(18915373-18915582)
chr3 (159-255)||(22150307-22150403)
chr3 (108-171)||(29680858-29680922)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (1-255)||(5638-5892)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (1-255)||(12959-13213)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (1-255)||(2438-2692)
[»] scaffold0021 (6 HSPs)
scaffold0021 (1-255)||(90218-90472)
scaffold0021 (1-255)||(7873-8127)
scaffold0021 (9-188)||(21255-21434)
scaffold0021 (9-188)||(30831-31010)
scaffold0021 (207-255)||(21209-21257)
scaffold0021 (207-255)||(30785-30833)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-255)||(26493-26746)
scaffold0008 (1-255)||(131823-132077)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (1-255)||(20527755-20528009)
chr1 (1-255)||(20828795-20829049)
chr1 (1-255)||(20927756-20928010)
chr1 (1-255)||(22133155-22133409)
chr1 (1-255)||(41215259-41215513)
chr1 (75-238)||(20171938-20172101)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-255)||(23679-23933)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (1-255)||(4236-4490)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (1-255)||(26112-26366)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (1-255)||(34801-35055)
[»] chr7 (7 HSPs)
chr7 (1-255)||(27105114-27105368)
chr7 (1-255)||(27172957-27173211)
chr7 (1-255)||(7826576-7826830)
chr7 (1-253)||(4442603-4442855)
chr7 (13-255)||(13458723-13458963)
chr7 (141-240)||(11284626-11284725)
chr7 (1-207)||(17926295-17926501)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (1-255)||(16100566-16100820)
chr6 (1-255)||(16379849-16380103)
chr6 (1-255)||(18401196-18401450)
chr6 (1-255)||(1646290-1646544)
chr6 (1-240)||(16234910-16235148)
chr6 (1-255)||(16647445-16647699)
chr6 (6-240)||(23025252-23025486)
chr6 (135-240)||(18578106-18578211)
chr6 (135-238)||(19985697-19985800)
chr6 (126-210)||(18836178-18836262)
chr6 (98-182)||(14131087-14131171)
chr6 (178-253)||(14133824-14133899)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (1-255)||(21934701-21934955)
chr5 (1-255)||(23508285-23508539)
chr5 (1-255)||(24583811-24584065)
chr5 (1-210)||(23505176-23505383)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-255)||(1286-1540)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (1-255)||(73931-74184)
scaffold0011 (1-255)||(78312-78565)
scaffold0011 (93-255)||(175847-176009)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-255)||(5140-5394)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (1-255)||(24894-25148)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (1-255)||(14999333-14999587)
chr4 (1-255)||(15290489-15290743)
chr4 (1-240)||(9292853-9293092)
chr4 (1-240)||(15139016-15139254)
chr4 (1-255)||(12340198-12340452)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-240)||(17697-17935)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (1-255)||(15626-15880)
scaffold0162 (1-210)||(10553-10762)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-238)||(3199-3436)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (7-255)||(955-1203)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (6-255)||(7196-7444)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-255)||(929-1181)
[»] scaffold1486 (1 HSPs)
scaffold1486 (1-233)||(223-455)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (1-233)||(53967-54199)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-236)||(46436-46670)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-238)||(93791-94028)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (1-255)||(6338-6593)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-219)||(8196-8414)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (8-210)||(795-997)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (12-210)||(1-198)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (1-210)||(10757-10967)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (1-210)||(51557-51766)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (1-192)||(202-393)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (53-255)||(2342-2543)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (27-210)||(3331-3514)
scaffold0409 (27-210)||(11586-11769)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (135-240)||(2328-2433)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (135-240)||(24914-25019)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (89-239)||(3303-3453)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (184-255)||(2313-2384)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (147-255)||(21060-21168)
[»] scaffold0878 (1 HSPs)
scaffold0878 (1-120)||(4712-4831)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (200-257)||(77345-77402)
scaffold0058 (90-166)||(77229-77305)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24567793 - 24567536
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  24567793 tcatgaacacacaagcttcaccgtctaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttcgaaaaagttacact 24567694  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  24567693 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttccatggaagacacacaagatccaactca 24567594  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcatcg 258  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24567593 aaatcaacagtaccaaaatcaacaggacacttagcacacataaaagaagttgtcatcg 24567536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 22280423 - 22280677
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| || |  ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||    
T  22280423 tcataaacacacaagcttcaccgtctaaagatctcttcacttgttccgcggtcaagaacttcatatctaactcttctaccggcttagaaaaagttacact 22280522  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  22280523 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 22280622  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22280623 aaatcaacattacctaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 22280677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 25130927 - 25131181
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || | ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25130927 tcataaacacacaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcccacctaactcatctaccggcttcgaaaacgttatact 25131026  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  25131027 cttggttaaacaattaatgctaaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactca 25131126  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  25131127 aaatcaatattaccaaaattaacagggcacttagcacacactaaggaagtagtca 25131181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22739762 - 22739527
Alignment:
Q  18 tcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatactcttagtcaaacaattaa 117  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || | ||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22739762 tcaccgtccaaagacttcttcacttgctctgcggtctagaacttcctatctaactcttccaccggcttcgaaaaagttacactcttagtcaaacaattaa 22739663  T
Q  118 tgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatcaacattaccaaa 217  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  22739662 tgctaaccccaaaaattaataaccattccatgccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattacaaaa 22739563  T
Q  218 attaacaggacacttagcacacataaaagaagtagt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22739562 attaacaggacacttagcacacataaaagaagtagt 22739527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12639027 - 12638818
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |  |||| || | |||    
T  12639027 tcatgaacacacaagcttcaccatctaaagatctcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggtttacaaaaagtcacact 12638928  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| |    
T  12638927 cctagtcaaacaattaatggtaaccccaaaagctaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaaaatccaactca 12638828  T
Q  201 aaatcaacat 210  Q
    ||||||||||    
T  12638827 aaatcaacat 12638818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24829313 - 24829105
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||    
T  24829313 tcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaacgttacact 24829214  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||| ||| |    
T  24829213 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacattcatatgcttcaacggaagaca-aaaagatccaactca 24829115  T
Q  201 aaatcaacat 210  Q
    ||||||||||    
T  24829114 aaatcaacat 24829105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 101 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25878668 - 25878531
Alignment:
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  25878668 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagttaacaaccaattcataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactca 25878569  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25878568 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttaacaca 25878531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12644589 - 12644485
Alignment:
Q  106 tcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatc 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| ||||||    
T  12644589 tcaaacaattaatggtaaccccaaaagccaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaaaatccaactcaaaatc 12644490  T
Q  206 aacat 210  Q
    |||||    
T  12644489 aacat 12644485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 209
Target Start/End: Original strand, 34821567 - 34821675
Alignment:
Q  100 tcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgacta 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||     
T  34821567 tcttagtcaaacaattaatggtaaccccaaaagccaacaaccaatccatacc-aaaatcgcatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactc 34821665  T
Q  200 aaaatcaaca 209  Q
    ||||||||||    
T  34821666 aaaatcaaca 34821675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Original strand, 27541911 - 27542048
Alignment:
Q  108 aaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaat-----cacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaa 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||| || |||||     |||||||||||||| ||| || |  || || | |||| |   |||    
T  27541911 aaacaattaatgttaaccccaaaagacaacatccaattcattccgaaaattaaatcacatccatatgctccaaaggtatgcaaaccaaatccaatgcaaa 27542010  T
Q  203 atcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacaca 240  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27542011 atccacattaccaaaattaacatgacacttaacacaca 27542048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20650383 - 20650129
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| || | |||    
T  20650383 tcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcgtctaccggcttcgaaaaagtcacact 20650284  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  20650283 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagttaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactca 20650184  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20650183 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttatcacacataaaagaagtagtca 20650129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21194580 - 21194326
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| | ||||| |||| |||    
T  21194580 tcatgaacacacaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaatttttctaccggctttgaaaaagttacact 21194481  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  21194480 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaaaataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactca 21194381  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21194380 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 21194326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 16414844 - 16415093
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |   || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||    
T  16414844 tcatgaacacacaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccacgttcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagttacact 16414943  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || |  |||||||||| ||| |    
T  16414944 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttc-----aaaaatcacaagatccaactca 16415038  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16415039 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 16415093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 23902915 - 23903169
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23902915 tcatgaacacacaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaactttccacctaactcatctaccggcttcgaaaatgttatact 23903014  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||| || || || ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  23903015 cttggttaagcagttaatgctaacaccaaaagacaacatccaatccatacaaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactca 23903114  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  23903115 aaatcaacatttccaaaattaacaggacacttagcacacactaaggaagtagtca 23903169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24931846 - 24931619
Alignment:
Q  7 acacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatactcttagt 106  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| || || |  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||    
T  24931846 acacacaagcttcaccatctagagatttctttacttgctccgcgatcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacactcttagt 24931747  T
Q  107 caaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    | ||||||||| ||| |||||||    
T  24931746 caaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacgga----aaacaagatccaactcaaaatca 24931651  T
Q  207 acattaccaaaattaacaggacacttagcaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24931650 acattaccaaaattaacaggacacttagcaca 24931619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21848365 - 21848111
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||    ||| |||| ||||| ||| |||||| |||||||||  | ||||| || | |||    
T  21848365 tcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcgttcaaaaacttcctatctaacttttctaccggtttagaaaaagtcacact 21848266  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  21848265 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaataacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 21848166  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21848165 aaatcaacatcaacaaaattaacaggacacttagcacacataaacgaagtagtca 21848111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 255
Target Start/End: Original strand, 22437116 - 22437297
Alignment:
Q  74 ttctaccggcatcgaaaatgttatactcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttc 173  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  22437116 ttctaccggcttcgaaaatgttacacttttggtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacattcaatccatacaaaaaatcacatccatatgattc 22437215  T
Q  174 aatggaagacacacaagatccgactaaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22437216 aatggaagacacacaagatctaactcaaaatcaacattaccaaaattaacatgacacttagcacacactaaagaagtagtca 22437297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23155070 - 23154838
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||||| || |  ||||||||||||||  ||  ||||||||||||| || ||||||| |||| |||    
T  23155070 tcataaacacacaagtttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcttacttaactcttctaccagcttcgaaaacgttacact 23154971  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||| |    
T  23154970 cttagtcaaacagttaatgctaaccccaaaagacaacaaccaatccat-cccaaaatcacatccatatgcttcaacggaagatacacaagatcaaactca 23154872  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23154871 aaatcaacattaccataattaacatgacacttag 23154838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6150677 - 6150425
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || | | || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| || | |||    
T  6150677 tcatgaacatacaagcttcaccatctaaagacttcttcacctgctctacgatcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttcgaaaaagtcacact 6150578  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  6150577 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 6150478  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6150477 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagt 6150425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 30149673 - 30149927
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  30149673 tcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 30149772  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  30149773 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 30149872  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30149873 aaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 30149927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15948294 - 15948041
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||  |  || ||||||||||||||||| | |||||  ||| |||    
T  15948294 tcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaatctcttatctaactcttctaccggcttagaaaactttacact 15948195  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| |    
T  15948194 cttagtcaa-caattaatgctaactccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttaaacggaagacaaacaagatccaactca 15948096  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15948095 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 15948041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8272223 - 8271969
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  | ||||| || | |||    
T  8272223 tcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggtttagaaaaagtcacact 8272124  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  8272123 cctagtcaaacaattaatgcgaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 8272024  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8272023 aaatcaacatcaccaaaattaacaggacatttagcacacataaaagaagtagtca 8271969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13965176 - 13964931
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||     ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  13965176 tcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccacggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 13965077  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  13965076 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 13964977  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaag 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964976 aaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaag 13964931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 50 - 240
Target Start/End: Original strand, 15612467 - 15612657
Alignment:
Q  50 ggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatactcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccata 149  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15612467 ggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacactcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccata 15612566  T
Q  150 ccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacaca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15612567 ccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacaca 15612657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 17200951 - 17201205
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||  | ||||||  || |||    
T  17200951 tcatgaacacacaagcctcaccgttcaaagacttcttcacttgctacgcggtcaagaacttcctacttaactcgtctaccggttttgaaaatactacact 17201050  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  17201051 cttagttaaccaattaatgctaaccccaaaagatatcaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactca 17201150  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17201151 aaatcaacattacctaaattaacaggacaattagcacacacaaaagaagtagtca 17201205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 12795883 - 12796092
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||| |||| |||    
T  12795883 tcataaacactcaagcttcaccatctaaagatctcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaacggcttagaaaaagttacact 12795982  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  12795983 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 12796082  T
Q  201 aaatcaacat 210  Q
    ||||||||||    
T  12796083 aaatcaacat 12796092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 30140122 - 30140359
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  30140122 tcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 30140221  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  30140222 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaataacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 30140321  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcaca 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30140322 aaatcaacatcaccaaaattaacagaacacttaacaca 30140359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 16258789 - 16258998
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || |  |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| || | |||    
T  16258789 tcatgaacacacaagcttcgccatctaaagatctcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatccaactcttctaccggcttcgaaaaagtcacact 16258888  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  16258889 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaataacatccatattcttcaacggaagacacacaagatccaactca 16258988  T
Q  201 aaatcaacat 210  Q
    ||||||||||    
T  16258989 aaatcaacat 16258998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 18915373 - 18915582
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||| |||| |||    
T  18915373 tcatgaacacacaagcttcaccatctaaagatctcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccgacttagaaaacgttacact 18915472  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| |    
T  18915473 cttagtaaaacaattaatgataacaccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagccaaacaagatccaactca 18915572  T
Q  201 aaatcaacat 210  Q
    || |||||||    
T  18915573 aagtcaacat 18915582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22150403 - 22150307
Alignment:
Q  159 acatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22150403 acatccatatgcttcaacggaagacaaacaagacccaactcaaaattaacataaccaaaattaacaagacacttagcacacataaaagaagtagtca 22150307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 29680922 - 29680858
Alignment:
Q  108 aaacaattaatgctaacccc-aaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgct 171  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29680922 aaacaattaatattaacccccaaaagataacatctaatccattccaaaaatcacatccatatgct 29680858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5892 - 5638
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||    
T  5892 tcatgaacacacaagcttcaccgtctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaactttctatctaactcttctaccggcttagaaaaagttacact 5793  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  | | |    
T  5792 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacagaagacaaacaagatcaaattca 5693  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5692 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 5638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13213 - 12959
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  13213 tcataaacacataagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 13114  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  13113 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaattcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 13014  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13013 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 12959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 2438 - 2692
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  2438 tcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaactttctatctaactcttctaccggcttcgaaaaagttacact 2537  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  ||| |    
T  2538 cttagtgaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgctttaacggaaaacacacaagatctaactca 2637  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2638 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcgcacataaaagaagtagtca 2692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 6)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 90218 - 90472
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || |  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||| |||| |||    
T  90218 tcatgaacacacaagcttcaccatctagagatttctttacttgctccgcgatcaagaacttcctatctaactcttctatcggcttagaaaaagttacact 90317  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  90318 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatacgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 90417  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90418 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 90472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 7873 - 8127
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  7873 tcatgaacacacaagcttcgccgtccaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttcgaaaatgttacact 7972  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |    
T  7973 tctggtcaaacaattaatgctaaccccaaaagagaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatacaactta 8072  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8073 aaatcaacatcaccaaaattgacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 8127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21434 - 21255
Alignment:
Q  9 acacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatactcttagtca 108  Q
    |||||||| ||||  || ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21434 acacaagcctcactgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacctaactcttttaccggcttcgaaaatgttatactcttggtca 21335  T
Q  109 aacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacaca 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21334 aacaattaatgctaaccccaaaagataacatccaatcgataccaaaaatcacatctatatgcttcaacggaagacacaca 21255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31010 - 30831
Alignment:
Q  9 acacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatactcttagtca 108  Q
    |||||||| ||||  || ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31010 acacaagcctcactgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacctaactcttttaccggcttcgaaaatgttatactcttggtca 30911  T
Q  109 aacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacaca 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30910 aacaattaatgctaaccccaaaagataacatccaatcgataccaaaaatcacatctatatgcttcaacggaagacacaca 30831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21257 - 21209
Alignment:
Q  207 acattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21257 acattaccaaaattaataggacacttagcacacactaaagaagtagtca 21209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30833 - 30785
Alignment:
Q  207 acattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30833 acattaccaaaattaataggacacttagcacacactaaagaagtagtca 30785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 26493 - 26746
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |   ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||    
T  26493 tcatgaacacacaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccacggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagttacact 26592  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||      
T  26593 cttagtcaaacaattactgctaaccccaaaagctaacaaccaatctataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaact-c 26691  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26692 aaattaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 26746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 132077 - 131823
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  132077 tcataaacacacaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 131978  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  131977 cctagtcaaacaatttattctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactta 131878  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  131877 aaattaacattaccaaaattaataggacatttagcacacataaaagaagtagtca 131823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 20527755 - 20528009
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  20527755 tcataaacacagaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgcttcgcggtcaagaacttcccatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 20527854  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| |    
T  20527855 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccatatcaaaaatcacatccatatgctttaacggaagacaaacaagatccaactca 20527954  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20527955 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 20528009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20829049 - 20828795
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  20829049 tcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 20828950  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  20828949 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 20828850  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20828849 aaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 20828795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 20927756 - 20928010
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||| | |||    
T  20927756 tcataaacacacaagctttaccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggtttagaaaatgtcacact 20927855  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |    
T  20927856 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaacaatccataccaaaaatcacatctatatgcttcaacggaagacaaacaagatctaactca 20927955  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20927956 aaatcaacattaccaaaattaacaggacatttagcacacataaaagaagtagtca 20928010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22133409 - 22133155
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || |   ||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  22133409 tcataaacacacaagctccaccgtccaaagacttcttcacttgctccacggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggcttcgaaaacgttacact 22133310  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  22133309 cttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactca 22133210  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22133209 aaatcaacattaccaaaattaataggacacttagcgcacacaaaacaagtagtca 22133155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41215513 - 41215259
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || | ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41215513 tcataaacacacaagcctcaccgtccaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcccacctaactcatctaccggcttcgaaaatgttatact 41215414  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||| ||| |    
T  41215413 attcgttaaacaattaatgctaaccccaaaagataacatccaatcaataccaaaaatcacatccatatgctaaaacggaagacaaacaagatccaactca 41215314  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||    
T  41215313 aaattaatgttaccaaaattaacatgacacttagcacacactaaggaagtagtca 41215259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 20171938 - 20172101
Alignment:
Q  75 tctaccggcatcgaaaatgttatactcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttca 174  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||  ||| | |||||   ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||| |  ||    
T  20171938 tctactggcttcgagaatgttatacttttggtcaaaaaattaatgtcaacactaaaagacgacatccagtccttaccgaaaatcacatccatattcacca 20172037  T
Q  175 atggaagacacacaagatccgactaaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcaca 238  Q
    | || |  || ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20172038 acggcaagcaaacaagatccaactcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcaca 20172101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 23679 - 23933
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  23679 tcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgcttcgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 23778  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  23779 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 23878  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23879 aaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 23933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4490 - 4236
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||    
T  4490 tcataaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgttcagcggtcatgaacttcctatctaactcctctaccggcttagaaaaagttacact 4391  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  4390 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactca 4291  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4290 aagtcaacattaccaaaattaacagggcatttagcacacataaaagaagtagtca 4236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 26112 - 26366
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  26112 tcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 26211  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  26212 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 26311  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26312 aaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 26366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 34801 - 35055
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| | | ||||| || | |||    
T  34801 tcataaacacacaagcttcaccatccaatgatttcttcacttgctccgcggtcaagaatttcctatctaactcttctaccgacttagaaaaagtcacact 34900  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  34901 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 35000  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35001 aaatcaacattaccaaaattaacaggacatttagcacacataaaagaagtagtca 35055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27105368 - 27105114
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  27105368 tcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 27105269  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  27105268 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 27105169  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105168 aaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 27105114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 27172957 - 27173211
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||| || | |||    
T  27172957 tcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccgacttagaaaaagtcacact 27173056  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  27173057 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 27173156  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27173157 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 27173211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 7826576 - 7826830
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||| || | |||    
T  7826576 tcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccgacttagaaaaagtcacact 7826675  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  7826676 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 7826775  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7826776 aaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 7826830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 4442603 - 4442855
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||| || |  ||| |||||||||| | | |||| || |||||| || ||||||||||||||||    
T  4442603 tcataaacacacaagcctcatcgtccaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcccacctaagtcatctaccagcttcgaaaatgttatact 4442702  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |    
T  4442703 cttggtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatacaactca 4442802  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagt 253  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||  || ||||||||    
T  4442803 aaatcaatgttaccaaaattagcatgacacctagcacacactaaggaagtagt 4442855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 13458723 - 13458963
Alignment:
Q  13 aagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatactcttagtcaaaca 112  Q
    |||||||| | || ||||| |||||||| || |  || ||||| ||||| | | ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||| || |||||    
T  13458723 aagcttcatcgtccaaagacttcttcacttgctccgcagtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaaca 13458822  T
Q  113 attaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatcaacatta 212  Q
     ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  13458823 gttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatggttcaacggcatacacacaaaatccaactcaaaatcaacatta 13458922  T
Q  213 ccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  13458923 ccaaaattaacaggacacttagcacac--taaagaagtagtca 13458963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 240
Target Start/End: Original strand, 11284626 - 11284725
Alignment:
Q  141 caatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacaca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11284626 caatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaaaatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacaca 11284725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 17926295 - 17926501
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| |||||||||| |||||| || || || |||||||| || |  |||||||||||||| |   ||| |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  17926295 tcataaacacacaagtttcaccgtccaaggacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttccctcctacctcagctaccggcttcgaaaatgttatact 17926394  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||  | ||||||||||||||||| |||||||  ||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |    
T  17926395 cttgattaaacaattaatgctaacaccaaaagacaacattcaatccataccagagatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaggatccaactca 17926494  T
Q  201 aaatcaa 207  Q
    |||||||    
T  17926495 aaatcaa 17926501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 16100566 - 16100820
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||    
T  16100566 tcatgaacacccaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaggaacttcatatctaactcttctaccggcttagaaaaagttacact 16100665  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
T  16100666 cttagtcaaacaattaatggtaaccctaaaagctaacaactaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacgcaagatccaactca 16100765  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16100766 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 16100820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16380103 - 16379849
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  16380103 tcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 16380004  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  16380003 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 16379904  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16379903 aaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 16379849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 18401196 - 18401450
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||| |||| |||    
T  18401196 tcatgaacacacaagcttcatcatccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggctaagaaaaagttacact 18401295  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |    
T  18401296 cttagtcaaacaattaatgataacccaaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagagacacaagatccaactca 18401395  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18401396 aaatcaacattaccgaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 18401450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1646544 - 1646290
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| | ||||| || | |||    
T  1646544 tcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaattcttctaccggcttagaaaaagtcacact 1646445  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |    
T  1646444 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagaaaaacaagatccaactca 1646345  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646344 aaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 1646290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 16234910 - 16235148
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  16234910 tcataaacacacaagcttcgccatctaaagatctcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 16235009  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  16235010 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccaaaacaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacaaacaagatccaactca 16235109  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacaca 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16235110 aaatcaacattacc-aaattaacaggacacttagcacaca 16235148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16647699 - 16647445
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||    |||||||| |||||  || ||||||||||||||||  | ||||| || | |||    
T  16647699 tcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcggtcaaaaacttcatatctaactcttctaccggtttagaaaaagtcacact 16647600  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  16647599 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 16647500  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16647499 aaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 16647445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23025486 - 23025252
Alignment:
Q  6 aacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatactcttag 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| |||||||| || || |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  23025486 aacacacaagcctctccgtccaaagacttcttcacttgcttcgcggtcaagaactttccacctaactcatctaccggcttcgaaaatgttacactcttgg 23025387  T
Q  106 tcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatc 205  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  23025386 ttaaacaattaatgctaaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacgcacaagatccaactcaaaatc 23025287  T
Q  206 aacattaccaaaattaacaggacacttagcacaca 240  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23025286 aatgttaccaaaattaacaagacacttagcacaca 23025252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 135 - 240
Target Start/End: Original strand, 18578106 - 18578211
Alignment:
Q  135 aacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18578106 aacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaagacacttag 18578205  T
Q  235 cacaca 240  Q
    ||||||    
T  18578206 cacaca 18578211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19985800 - 19985697
Alignment:
Q  135 aacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttag 234  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19985800 aacaaccaattcatacaaaaaatcacatctatatgcttcaacggaagacaaacaggatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttaa 19985701  T
Q  235 caca 238  Q
    ||||    
T  19985700 caca 19985697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18836262 - 18836178
Alignment:
Q  126 ccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatcaacat 210  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  18836262 ccaaaagacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacagacaagatccaactcaaaatcaacat 18836178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 182
Target Start/End: Original strand, 14131087 - 14131171
Alignment:
Q  98 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaaga 182  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14131087 actcttggtcaaacaattaatacaaactccaaaagataacatccaatccataccaaagatcacatccatatgtttcaatggaaga 14131171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 253
Target Start/End: Original strand, 14133824 - 14133899
Alignment:
Q  178 gaagacacacaagatccgactaaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagt 253  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  14133824 gaagacacacaagatccagctcaaaatcaaccttaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaggaagtagt 14133899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21934955 - 21934701
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  21934955 tcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 21934856  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  21934855 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 21934756  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21934755 aaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 21934701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 23508285 - 23508539
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  23508285 tcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 23508384  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |    
T  23508385 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatctaactca 23508484  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23508485 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttaacacacataaaagaagtagtca 23508539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 24583811 - 24584065
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||    ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||  | ||||| || | |||    
T  24583811 tcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcggttaaaaacttcctatctaactcttctaccggtttagaaaaagtcacact 24583910  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  24583911 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 24584010  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24584011 aaatcaatatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 24584065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 23505176 - 23505383
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||||||| || | |||    
T  23505176 tcatgaacacacaagcttcgccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatccaactcttctaccgacttcgaaaa-gtcacact 23505274  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| |    
T  23505275 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaatcaatccata-caaaaatcacatccatatgcttcaacagaagacaaacaagatccaactca 23505373  T
Q  201 aaatcaacat 210  Q
    ||||||||||    
T  23505374 aaatcaacat 23505383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1540 - 1286
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||| | | ||| || | |||    
T  1540 tcataaacacacaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaaccgttctatcggcttaggaaaagtcacact 1441  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| |    
T  1440 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacagaagacaaacaagatccaactca 1341  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1340 aaatcaacattaccaaaattaataggacacttagcacacataaaagaagtagtca 1286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 74184 - 73931
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||| ||||||| |||| |||    
T  74184 tcataaacacacaagct-caccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaattctgataccggcttcgaaaaagttacact 74086  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |    
T  74085 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacagccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatcgaactca 73986  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73985 aaatcaacattaacaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 73931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 78565 - 78312
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||| ||||||| |||| |||    
T  78565 tcataaacacacaagct-caccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaattctgataccggcttcgaaaaagttacact 78467  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |    
T  78466 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacagccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatcgaactca 78367  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78366 aaatcaacattaacaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 78312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 176009 - 175847
Alignment:
Q  93 gttatactcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagat 192  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||     
T  176009 gttatactcttggttaaacaattaatgctaacactaaaagacaacatccagtccataccaaaaatcacatccatgtgctttaacggaagaaacacaagaa 175910  T
Q  193 ccgactaaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    || ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | || ||||||||||    
T  175909 ccaactcaaaatcaacattaccaaagttaacgggacacttagaacacctcaaggaagtagtca 175847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5394 - 5140
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  5394 tcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 5295  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  |    
T  5294 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaacaca 5195  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5194 aaatcaacatcaccaaaattaacagaacacttagcacacataaaagaagtagtca 5140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 24894 - 25148
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| |||| |||    
T  24894 tcatgaacacactagcttcgccatccaaggacttcttcacttgctttgcagtcaagaacttcctatctaactcttcaaccggctttgaaaaagttacact 24993  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |    
T  24994 cttcgtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgctttaacggaagacacacaagatccaactca 25093  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25094 aaatcaacattaccaaaattaataggacatttagcacccataaaagaagtagtca 25148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 14999333 - 14999587
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||| ||||||| |  || ||||| ||||||||||| |  |||| |||| |||    
T  14999333 tcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggccaagaacctcttatctaacccttctaccggcttacaaaacgttacact 14999432  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  14999433 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaataacaaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 14999532  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999533 aaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 14999587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15290743 - 15290489
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||| ||    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  | ||||| || | |||    
T  15290743 tcataaacacacaagtctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggtttagaaaaagtcacact 15290644  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  15290643 cctagtcaaacaattaacgctaaccccaaaagcgaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 15290544  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290543 aaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 15290489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 9292853 - 9293092
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||| | |||||||| || |  | |||||||||||| ||| | |||||| ||||| || ||| ||| || | |||    
T  9292853 tcatgaacacacaagtttcaccgtccaaaaacttcttcacttgctccgtggtcaagaacttcctatccaactctcctaccagcttcggaaaagtcacact 9292952  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |    
T  9292953 cttagtcaaacaattaatgctaacctcaaaagctaacaatcaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaactca 9293052  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacaca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9293053 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacaca 9293092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15139254 - 15139016
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |  | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||   ||||| || | |||    
T  15139254 tcataaacacacaagcttcaccatctaaagacttctttacttgctccgtggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggctaagaaaaagtcacact 15139155  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  15139154 cctagtcaaacaattaatgctaactccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaattacatccataagcttcaacggaagaca-acaagatccaactca 15139056  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacaca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15139055 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacaca 15139016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12340452 - 12340198
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| | |||| | |||||||| || |  |||||||||||||| | | ||| ||| || |  ||| | || |||||||||||    
T  12340452 tcatgaacacactaacttcaccgttaaaataattcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacctacctcctccaatggcttagataatgttatact 12340353  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||| || || ||||| ||| |||| |||||||  |||| | | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  12340352 cttggttaagcaattgatgttaacaccaaaagacaacatctagtccataccaaaaatcacgtccatgtgcttcaacggaagacacacaagatccaactca 12340253  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    || |||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  12340252 aagtcaacattaccagagttaacatgacacttagcgcacaccaaggaagtagtca 12340198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17935 - 17697
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | | ||||||| |||||  || ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  17935 tcataaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctctacggtcaaaaacttcttatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 17836  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  17835 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagattcaact-a 17737  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacaca 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17736 aaatcaacattaccgaaattaacaggacacttagcacaca 17697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 15626 - 15880
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| || |  |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||    
T  15626 tcatgaacacaaaagcttcaccatctagagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacctcttatctaactcttctaccggcttagaaaaagttacact 15725  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| |    
T  15726 cttagtcaaacaattaatgctagccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaactcacatccatatgcttcaacggaaggcaaacaagatccaactca 15825  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15826 aaatcagcattaccaaaattaacaggacatttagcacacataaaagaagtagtca 15880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10762 - 10553
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| || |  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  10762 tcataaacacacaagcttcaccgtctaaaaatttcttcacttgttccgcgttcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 10663  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  10662 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaatcaatccataccaaaaattacatccatattcttcaacggaagacatacaagatccaactca 10563  T
Q  201 aaatcaacat 210  Q
    ||||||||||    
T  10562 aaatcaacat 10553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 3199 - 3436
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  3199 tcatgaacacacaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggttaagaacttcctatctagctcttctaccggcttcgaaaacgttaaact 3298  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  3299 cttggtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacattcatatgcttcaatggaagacacacaagatccaactca 3398  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3399 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttaccaca 3436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1203 - 955
Alignment:
Q  7 acacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatactcttagt 106  Q
    |||||||||||||||| || | ||| |||||||| || |  |||||||||||| |  || ||||||||| ||||||| | ||||| |||| |||||||||    
T  1203 acacacaagcttcaccttctagagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacctcttatctaactcttttaccggcttagaaaacgttacactcttagt 1104  T
Q  107 caaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatca 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  1103 caaacaattaatgctaaccccagaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatca 1004  T
Q  207 acattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1003 gtattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7444 - 7196
Alignment:
Q  6 aacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatactcttag 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| | || | |||| |||    
T  7444 aacacacaagcttcaccatctaaagatttctccacttgcttcgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaataagtcacactcctag 7345  T
Q  106 tcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatc 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  7344 tcaaacaattaatactaaccccaaaagccaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatc 7245  T
Q  206 aacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7244 aacatcaccaaaattaactggacatttagcacacat-aaagaagtagtca 7196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 929 - 1181
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |  |||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| | ||||  || | |||    
T  929 tcataaacacacaagcttctccgtccaatgatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaattcttctatcggcttagaaa--gtcacact 1026  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |    
T  1027 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagagaaacaagatccaactca 1126  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1127 aaatcaacatcaccaaaattaacaagacacttagcacacataaaagaagtagtca 1181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1486 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1486
Description:

Target: scaffold1486; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 223 - 455
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||| |||||||||| |||  ||||||||||| |||| | ||||| || | |||    
T  223 tcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcctatataactcttctatcggcttagaaaaagtcacact 322  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  323 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaacctaacgaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactta 422  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacactta 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  423 aaatcaacattatcaaaattaacaggacactta 455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 54199 - 53967
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||| |||||||||| |||  ||||||||||| |||| | ||||| || | |||    
T  54199 tcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcctatataactcttctatcggcttagaaaaagtcacact 54100  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  54099 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaaactaacgaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactta 54000  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacactta 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53999 aaatcaacattatcaaaattaacaggacactta 53967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 46670 - 46436
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||    
T  46670 tcatgaacacacaagcttcgccatctgaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagttacact 46571  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  46570 cttattcaaaaaattaatgctaaccccaaaagctaacaactaatccatacc-aaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 46472  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagca 236  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  46471 aaatcaacattaccgaaatttacaggacacttagca 46436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 94028 - 93791
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || |   ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  94028 tcatgaacacacaagctttgccatctaaagacttcttcacttgctccacggtcaagaacttcctatccaactcttctaccggctttgaaaaagtcacact 93929  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||      
T  93928 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagttaacaatcaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcc 93829  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcaca 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  93828 aaatcaacattaccgaaattaacaggacacttaacaca 93791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6593 - 6338
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || |  |||||||||||||| | | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  6593 tcatgaacacacaagcttcaccgtctaaagacttattcacttgctccgcggtcaagaacttcccacctaactcatctaccgacttcgaaaatgttatact 6494  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |    
T  6493 cttggttaaacagttaatgctaacaccaaaagacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaacacacacaagatccaactca 6394  T
Q  201 aaatcaacattacc-aaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  6393 aaatcaacattaccaaaaattaacagggcacttagcacacactaaggaagtagtca 6338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8414 - 8196
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  8414 tcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 8315  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |    
T  8314 cctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaataaaatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactca 8215  T
Q  201 aaatcaacattaccaaaat 219  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  8214 aaatcaacatcaccaaaat 8196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Original strand, 795 - 997
Alignment:
Q  8 cacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatactcttagtc 107  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||    
T  795 cacacaagcttcaacgtctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccagcttcgaaaaagttacactcttagtc 894  T
Q  108 aaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatcaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  895 aaacaattaatgctaaccccaaaagataacaactaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaa 994  T
Q  208 cat 210  Q
    |||    
T  995 cat 997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 210
Target Start/End: Original strand, 1 - 198
Alignment:
Q  12 caagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatactcttagtcaaac 111  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| || | | ||||||||||||    
T  1 caagcttcaccatctaaagatctcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttcgaaaaagtaacaatcttagtcaaac 100  T
Q  112 aattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatcaacat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||    
T  101 aattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaataacatccatatgcttcaacggaagacaaacaa-atccaactcaaaatcaacat 198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10967 - 10757
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||    
T  10967 tcatgaacacacaagcttcgccatctaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacctcttatctaactcttctaccggcttagaaaacgttacact 10868  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgact-a 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||      
T  10867 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagttaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgctttaacggaagacaaacaagatccaactcc 10768  T
Q  200 aaaatcaacat 210  Q
    |||||||||||    
T  10767 aaaatcaacat 10757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 51557 - 51766
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||| |||| |||    
T  51557 tcatgaacacacaagcttcgccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctacccaactcttctaccggcttagaaaaagttacact 51656  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | | |    
T  51657 cttagtcaaacaattaatgctaaccacaaaagctaacaaccaatccatgccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagataaacaagatccaattca 51756  T
Q  201 aaatcaacat 210  Q
    ||||||||||    
T  51757 aaatcaacat 51766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 393 - 202
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |  ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  393 tcataaacacacaagcttctccgtctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcttacttaactcttctaccggcttcgaaaatgttacact 294  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagat 192  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  293 cttaatcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagat 202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 255
Target Start/End: Original strand, 2342 - 2543
Alignment:
Q  53 caagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatactcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccatacca 152  Q
    ||||||||| | | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||||    
T  2342 caagaacttcccacctaactcatctaccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccagaagacaacatccaatccatacca 2441  T
Q  153 aaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtag 252  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||    
T  2442 aaaatcacacccatatgctttaa-cgaagacacacaagatccaactcaaaatcaaaattaccaaaattaataggacacttagcacacactaaggaagtag 2540  T
Q  253 tca 255  Q
    |||    
T  2541 tca 2543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3514 - 3331
Alignment:
Q  27 aaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatactcttagtcaaacaattaatgctaaccc 126  Q
    ||||| |||||||| || |  ||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3514 aaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcttacttaactcttctaccggcttcgaaaacattacactcttagtcaaacaattaatgataaccc 3415  T
Q  127 caaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatcaacat 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  3414 caaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatctatatgcttcaaccgaagacacaaaagatccaactcaaaatcaacat 3331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11769 - 11586
Alignment:
Q  27 aaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatactcttagtcaaacaattaatgctaaccc 126  Q
    ||||| |||||||| || |  ||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11769 aaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcttacttaactcttctaccggcttcgaaaacattacactcttagtcaaacaattaatgataaccc 11670  T
Q  127 caaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatcaacat 210  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  11669 caaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatctatatgcttcaaccgaagacacaaaagatccaactcaaaatcaacat 11586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 135 - 240
Target Start/End: Original strand, 2328 - 2433
Alignment:
Q  135 aacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2328 aacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaagacacttag 2427  T
Q  235 cacaca 240  Q
    ||||||    
T  2428 cacaca 2433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 135 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25019 - 24914
Alignment:
Q  135 aacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25019 aacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacgggagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttag 24920  T
Q  235 cacaca 240  Q
    ||||||    
T  24919 cacaca 24914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 239
Target Start/End: Original strand, 3303 - 3453
Alignment:
Q  89 aaatgttatactcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacaca 188  Q
    |||| |||||||||| || || || ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  3303 aaatattatactcttggttaagcagttaatgctaacaccaaaagacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatgtgcttcaacgaaagacacaca 3402  T
Q  189 agatccgactaaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacac 239  Q
    |||||| |||  ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  3403 agatccaactctaaatcaacactaccaaaacgaacaagacacttagcacac 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2384 - 2313
Alignment:
Q  184 acacaagatccgactaaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtca 255  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2384 acacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaagacacttagcacacacaaaagaagtagtca 2313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21168 - 21060
Alignment:
Q  147 ataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagatccgactaaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaag 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | ||| |||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||||  |||| |    
T  21168 ataccgaaaatcacatccatatgcttcaacagaagacaaacaagatacaactcaaaatcgacgctaccaaaactaacgggacacttagcacaactaaagg 21069  T
Q  247 aagtagtca 255  Q
    |||||||||    
T  21068 aagtagtca 21060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0878 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0878
Description:

Target: scaffold0878; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4831
Alignment:
Q  1 tcatgaacacacaagcttcaccatcaaaagatttcttcacgtgatttgcggtcaagaacttgctaactaactcttctaccggcatcgaaaatgttatact 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |  |  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||    
T  4712 tcataaacacacaagcttcaccgtctaatgatttcttcacttactccgcgatcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacact 4811  T
Q  101 cttagtcaaacaattaatgc 120  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  4812 cctagtcaaacaattaatgc 4831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 257
Target Start/End: Original strand, 77345 - 77402
Alignment:
Q  200 aaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcatc 257  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  77345 aaaatcaacgttaccaaaattaacaggaaacttagcacaaactaaggaagtagtcatc 77402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 166
Target Start/End: Original strand, 77229 - 77305
Alignment:
Q  90 aatgttatactcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccat 166  Q
    |||||||||||||| || ||| | |||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  77229 aatgttatactcttggttaaatagttaatgttaactccaaaggataacatccaatccataccgaaaataacatccat 77305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University