View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8912A_low_284 (Length: 241)

Name: NF8912A_low_284
Description: NF8912A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8912A_low_284
NF8912A_low_284
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (8-241)||(15462084-15462317)
chr6 (11-235)||(14377219-14377443)
chr6 (11-241)||(18797438-18797668)
chr6 (8-232)||(10466148-10466372)
chr6 (11-241)||(24515717-24515947)
chr6 (21-241)||(19455771-19455991)
chr6 (13-241)||(19437750-19437978)
chr6 (21-240)||(21567304-21567523)
chr6 (9-241)||(34642887-34643119)
chr6 (9-241)||(19486595-19486827)
chr6 (21-186)||(19465971-19466136)
chr6 (9-241)||(21474348-21474580)
chr6 (74-231)||(20010820-20010977)
chr6 (13-241)||(25770592-25770820)
chr6 (9-240)||(24367149-24367380)
chr6 (29-241)||(23085146-23085358)
chr6 (9-228)||(23081184-23081403)
chr6 (29-241)||(18182688-18182900)
chr6 (9-241)||(30678325-30678557)
chr6 (9-241)||(5836529-5836761)
chr6 (24-241)||(18405260-18405477)
chr6 (24-241)||(16924956-16925173)
chr6 (9-241)||(29589740-29589972)
chr6 (9-230)||(16574649-16574870)
chr6 (9-230)||(16620510-16620731)
chr6 (139-241)||(27559400-27559502)
chr6 (43-230)||(2872137-2872324)
chr6 (53-241)||(22436617-22436805)
chr6 (139-241)||(28260628-28260730)
chr6 (139-241)||(28285186-28285288)
chr6 (139-241)||(28339377-28339479)
chr6 (139-230)||(24293213-24293304)
chr6 (24-230)||(19867446-19867652)
chr6 (139-241)||(25115300-25115402)
chr6 (139-241)||(28312378-28312480)
chr6 (139-241)||(27190184-27190286)
chr6 (139-241)||(27258954-27259056)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (8-238)||(20824254-20824484)
chr5 (9-241)||(20778711-20778943)
chr5 (9-241)||(28892280-28892512)
chr5 (12-241)||(22464748-22464977)
chr5 (9-241)||(17266672-17266904)
chr5 (9-240)||(23078243-23078474)
chr5 (9-241)||(23563506-23563738)
chr5 (9-241)||(21561363-21561595)
chr5 (9-241)||(21983515-21983747)
chr5 (8-196)||(22505522-22505710)
chr5 (9-240)||(14884329-14884560)
chr5 (8-240)||(20345081-20345313)
chr5 (8-240)||(25850871-25851103)
chr5 (29-201)||(21631757-21631929)
chr5 (9-241)||(23474011-23474243)
chr5 (54-241)||(25429237-25429424)
chr5 (9-241)||(21882590-21882822)
chr5 (9-241)||(18781930-18782162)
chr5 (24-241)||(26736080-26736297)
chr5 (9-241)||(16359318-16359550)
chr5 (43-230)||(29473445-29473632)
chr5 (9-241)||(34569310-34569542)
chr5 (9-241)||(40711596-40711828)
chr5 (138-241)||(21336761-21336864)
chr5 (9-241)||(27521222-27521454)
chr5 (9-241)||(27613172-27613404)
chr5 (9-241)||(41773658-41773890)
chr5 (43-230)||(14997111-14997298)
chr5 (43-230)||(22330259-22330446)
chr5 (43-230)||(37288868-37289055)
chr5 (43-230)||(19772787-19772974)
chr5 (43-230)||(27682772-27682959)
chr5 (9-100)||(21410091-21410182)
chr5 (43-241)||(22350735-22350933)
chr5 (43-241)||(27665862-27666060)
chr5 (139-241)||(21342882-21342984)
chr5 (139-241)||(22137484-22137586)
chr5 (152-240)||(20311667-20311755)
chr5 (139-241)||(20803413-20803515)
chr5 (9-125)||(21332324-21332440)
chr5 (9-196)||(23460832-23461019)
chr5 (9-125)||(23525983-23526099)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (8-241)||(27903269-27903502)
chr4 (8-240)||(20892916-20893148)
chr4 (11-234)||(16150527-16150750)
chr4 (11-234)||(16154673-16154896)
chr4 (9-241)||(51603948-51604180)
chr4 (9-240)||(44659022-44659253)
chr4 (9-240)||(3261950-3262181)
chr4 (9-240)||(29450693-29450924)
chr4 (9-196)||(53750626-53750813)
chr4 (9-241)||(15073243-15073475)
chr4 (9-230)||(14993523-14993744)
chr4 (8-240)||(11204387-11204619)
chr4 (19-165)||(15266736-15266882)
chr4 (108-235)||(15354295-15354422)
chr4 (9-241)||(14696985-14697217)
chr4 (24-228)||(15946-16150)
chr4 (12-225)||(14162370-14162583)
chr4 (8-100)||(7357292-7357384)
chr4 (161-240)||(15258812-15258891)
chr4 (9-241)||(12479484-12479716)
chr4 (9-241)||(17092045-17092277)
chr4 (43-241)||(16233922-16234120)
chr4 (43-241)||(18224376-18224574)
chr4 (9-230)||(27714231-27714452)
chr4 (9-241)||(8389296-8389528)
chr4 (10-241)||(14683451-14683682)
chr4 (9-241)||(15144788-15145020)
chr4 (43-230)||(23958642-23958829)
chr4 (43-241)||(19635020-19635218)
chr4 (139-241)||(16250876-16250978)
chr4 (9-230)||(16350450-16350671)
chr4 (11-68)||(15354234-15354291)
chr4 (43-230)||(8050553-8050740)
chr4 (43-230)||(14300909-14301096)
chr4 (174-241)||(16219114-16219181)
chr4 (174-241)||(16222434-16222501)
chr4 (43-241)||(40475924-40476122)
chr4 (43-230)||(19775723-19775910)
chr4 (135-241)||(14188390-14188496)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (9-241)||(94053-94285)
scaffold0029 (9-241)||(115475-115707)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (8-238)||(10417428-10417658)
chr3 (8-240)||(11958564-11958796)
chr3 (9-241)||(16831912-16832144)
chr3 (11-241)||(12357913-12358143)
chr3 (8-238)||(16327092-16327322)
chr3 (11-241)||(31692571-31692801)
chr3 (9-241)||(16378318-16378550)
chr3 (11-235)||(18131733-18131956)
chr3 (11-241)||(12180857-12181087)
chr3 (9-241)||(8744774-8745006)
chr3 (9-241)||(14290916-14291148)
chr3 (9-241)||(13944537-13944769)
chr3 (21-241)||(17188887-17189107)
chr3 (21-241)||(24189817-24190037)
chr3 (11-241)||(31941416-31941646)
chr3 (21-241)||(17494159-17494380)
chr3 (9-240)||(28756833-28757064)
chr3 (9-177)||(13317918-13318086)
chr3 (9-241)||(15230116-15230348)
chr3 (9-241)||(15235984-15236216)
chr3 (9-240)||(10408482-10408713)
chr3 (9-241)||(16825663-16825897)
chr3 (11-192)||(11949311-11949492)
chr3 (8-240)||(12509866-12510098)
chr3 (12-240)||(47126458-47126686)
chr3 (45-241)||(12272851-12273047)
chr3 (9-241)||(12857880-12858111)
chr3 (108-241)||(14575499-14575632)
chr3 (24-241)||(15262133-15262350)
chr3 (9-241)||(12843498-12843730)
chr3 (138-241)||(14578932-14579035)
chr3 (9-96)||(35982839-35982926)
chr3 (9-241)||(12889212-12889444)
chr3 (9-241)||(13255193-13255425)
chr3 (9-241)||(15065574-15065806)
chr3 (9-241)||(43165178-43165410)
chr3 (9-241)||(48427950-48428182)
chr3 (43-241)||(15358586-15358784)
chr3 (9-230)||(10008114-10008335)
chr3 (9-230)||(10908724-10908945)
chr3 (139-241)||(20059579-20059681)
chr3 (9-205)||(14873963-14874159)
chr3 (9-234)||(15013153-15013378)
chr3 (9-230)||(15345640-15345861)
chr3 (9-241)||(15586787-15587019)
chr3 (43-230)||(15713485-15713672)
chr3 (9-241)||(16638276-16638508)
chr3 (10-241)||(24185693-24185924)
chr3 (24-241)||(5422340-5422557)
chr3 (139-241)||(17492354-17492456)
chr3 (9-241)||(3688446-3688678)
chr3 (43-241)||(15399946-15400144)
chr3 (139-241)||(6603238-6603340)
chr3 (139-241)||(16694667-16694769)
chr3 (139-241)||(16754226-16754328)
chr3 (139-241)||(53382543-53382645)
chr3 (139-230)||(26790938-26791029)
chr3 (139-241)||(16804472-16804574)
chr3 (205-241)||(13318082-13318118)
chr3 (9-85)||(11861033-11861109)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (8-241)||(70285-70518)
scaffold0034 (21-241)||(2123-2343)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (12-241)||(20853991-20854220)
chr1 (11-241)||(18710315-18710545)
chr1 (9-241)||(21742780-21743012)
chr1 (9-241)||(22015973-22016205)
chr1 (11-241)||(19857204-19857434)
chr1 (11-241)||(20833130-20833360)
chr1 (9-241)||(21739264-21739496)
chr1 (9-240)||(24096843-24097074)
chr1 (9-240)||(48425804-48426035)
chr1 (8-240)||(52988672-52988904)
chr1 (9-240)||(38910054-38910285)
chr1 (8-196)||(20074936-20075124)
chr1 (8-240)||(20297312-20297544)
chr1 (9-240)||(31537225-31537456)
chr1 (9-240)||(37679980-37680211)
chr1 (24-241)||(16378993-16379210)
chr1 (133-240)||(12200449-12200556)
chr1 (9-241)||(24785085-24785317)
chr1 (53-230)||(22496528-22496705)
chr1 (9-241)||(16347823-16348055)
chr1 (53-241)||(20081648-20081836)
chr1 (9-241)||(51330720-51330952)
chr1 (11-241)||(17042245-17042475)
chr1 (43-230)||(19109278-19109465)
chr1 (8-63)||(21961135-21961190)
chr1 (43-230)||(33388291-33388478)
chr1 (24-196)||(21751991-21752163)
chr1 (9-230)||(21833212-21833433)
chr1 (139-241)||(21842111-21842213)
chr1 (9-86)||(21045352-21045429)
chr1 (139-241)||(41351026-41351128)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (9-240)||(5008-5239)
scaffold0348 (9-240)||(17643-17874)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (9-241)||(49339-49571)
scaffold0067 (9-241)||(58373-58605)
scaffold0067 (9-241)||(64761-64993)
scaffold0067 (9-241)||(29537-29769)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (8-240)||(39972-40204)
scaffold0114 (9-241)||(17508-17739)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (9-240)||(29301025-29301256)
chr8 (9-241)||(22027879-22028111)
chr8 (9-240)||(22053814-22054045)
chr8 (9-240)||(31414131-31414362)
chr8 (13-241)||(19985130-19985358)
chr8 (9-241)||(21928378-21928610)
chr8 (9-241)||(22373819-22374051)
chr8 (8-238)||(16268822-16269052)
chr8 (9-241)||(20391036-20391268)
chr8 (9-240)||(28983862-28984093)
chr8 (9-240)||(28989081-28989312)
chr8 (62-240)||(27357487-27357665)
chr8 (29-241)||(22375073-22375284)
chr8 (24-241)||(22421506-22421723)
chr8 (9-241)||(19980917-19981149)
chr8 (54-230)||(22523507-22523683)
chr8 (54-241)||(21253895-21254082)
chr8 (54-241)||(21391505-21391692)
chr8 (54-241)||(21780831-21781018)
chr8 (54-241)||(21785999-21786186)
chr8 (9-241)||(22989995-22990227)
chr8 (9-241)||(19115350-19115582)
chr8 (9-241)||(20015862-20016094)
chr8 (9-241)||(17671621-17671853)
chr8 (139-230)||(21164267-21164358)
chr8 (138-241)||(22245743-22245846)
chr8 (138-241)||(22246161-22246264)
chr8 (43-241)||(32603095-32603293)
chr8 (9-241)||(30310743-30310975)
chr8 (43-241)||(18859527-18859725)
chr8 (139-241)||(15536333-15536435)
chr8 (9-230)||(22031064-22031285)
chr8 (9-230)||(22126558-22126779)
chr8 (43-230)||(22117808-22117995)
chr8 (147-241)||(22042777-22042871)
chr8 (139-241)||(22129346-22129448)
chr8 (139-241)||(19481801-19481903)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (11-241)||(8527-8757)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (11-235)||(5370-5594)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (11-235)||(6957-7181)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (9-241)||(15036-15268)
scaffold0074 (9-241)||(6026-6258)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (11-241)||(1015-1245)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (11-241)||(13676325-13676555)
chr7 (9-241)||(14140553-14140785)
chr7 (21-241)||(15343305-15343525)
chr7 (9-239)||(13024221-13024450)
chr7 (9-241)||(11385572-11385804)
chr7 (21-241)||(14283529-14283749)
chr7 (9-241)||(15099746-15099978)
chr7 (9-240)||(16947615-16947846)
chr7 (9-241)||(12798644-12798876)
chr7 (9-241)||(18051096-18051328)
chr7 (9-240)||(12459503-12459734)
chr7 (9-241)||(12203943-12204175)
chr7 (9-241)||(19149885-19150117)
chr7 (9-241)||(20749284-20749516)
chr7 (9-240)||(26091941-26092172)
chr7 (9-235)||(14261389-14261615)
chr7 (9-240)||(49155176-49155407)
chr7 (8-240)||(13965810-13966042)
chr7 (9-240)||(26115733-26115964)
chr7 (8-238)||(21755289-21755519)
chr7 (9-196)||(40924960-40925147)
chr7 (9-241)||(44788516-44788748)
chr7 (9-241)||(14335269-14335501)
chr7 (10-241)||(11550268-11550499)
chr7 (43-241)||(14957427-14957625)
chr7 (9-230)||(8710489-8710710)
chr7 (9-241)||(17703620-17703852)
chr7 (43-230)||(13688925-13689112)
chr7 (133-241)||(18180616-18180724)
chr7 (139-241)||(8200921-8201023)
chr7 (139-241)||(9591237-9591339)
chr7 (9-230)||(18587336-18587557)
chr7 (43-230)||(11234412-11234599)
chr7 (142-241)||(10873563-10873662)
chr7 (54-196)||(15146133-15146275)
chr7 (148-241)||(12690375-12690468)
chr7 (29-241)||(15627397-15627609)
chr7 (24-228)||(14042581-14042785)
chr7 (24-228)||(14352611-14352815)
chr7 (43-230)||(15158256-15158443)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (8-241)||(65456-65689)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (21-241)||(9957-10177)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (29-241)||(263139-263351)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (11-241)||(9933-10163)
scaffold0243 (24-228)||(24119-24323)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (11-241)||(8623-8853)
scaffold0235 (11-241)||(18837-19067)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (11-241)||(98744-98974)
scaffold0020 (18-241)||(175901-176123)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (11-241)||(325620-325850)
scaffold0004 (9-241)||(200627-200859)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (11-241)||(23274108-23274338)
chr2 (11-241)||(19716715-19716945)
chr2 (9-241)||(12576868-12577100)
chr2 (9-240)||(20848105-20848336)
chr2 (29-240)||(23097734-23097945)
chr2 (18-241)||(23113238-23113461)
chr2 (48-241)||(24817575-24817768)
chr2 (11-98)||(19721278-19721365)
chr2 (9-240)||(30208616-30208847)
chr2 (54-228)||(22733515-22733689)
chr2 (139-241)||(23105554-23105656)
chr2 (9-241)||(17001515-17001747)
chr2 (56-228)||(23074391-23074563)
chr2 (9-241)||(45673708-45673940)
chr2 (9-230)||(21322962-21323183)
chr2 (9-241)||(22323038-22323270)
chr2 (9-241)||(24705178-24705410)
chr2 (9-241)||(24712549-24712781)
chr2 (9-241)||(44383266-44383498)
chr2 (9-241)||(9338097-9338329)
chr2 (9-241)||(9486731-9486963)
chr2 (9-241)||(11351407-11351639)
chr2 (9-241)||(16983755-16983987)
chr2 (43-241)||(27220531-27220729)
chr2 (139-241)||(24657484-24657586)
chr2 (43-230)||(27373795-27373982)
chr2 (9-230)||(10871376-10871597)
chr2 (139-241)||(24678002-24678104)
chr2 (53-196)||(22742706-22742849)
chr2 (43-230)||(23029191-23029378)
chr2 (139-241)||(21142867-21142969)
chr2 (139-241)||(24874576-24874678)
chr2 (56-196)||(23064973-23065113)
chr2 (9-100)||(19817503-19817594)
chr2 (189-241)||(23279291-23279343)
chr2 (139-196)||(23204874-23204931)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (29-241)||(203294-203506)
scaffold0003 (139-196)||(424266-424323)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (13-241)||(496-724)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (21-241)||(716-936)
scaffold0476 (24-241)||(10699-10916)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (11-241)||(20727-20957)
scaffold0222 (9-241)||(646-878)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (9-241)||(12640-12872)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (9-241)||(42611-42843)
scaffold0102 (9-241)||(50504-50736)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (11-235)||(53966-54190)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (8-240)||(67266-67498)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (11-241)||(1472-1702)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (11-241)||(7657-7887)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (9-241)||(14-246)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (11-235)||(9388-9612)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (21-241)||(1033-1253)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (9-241)||(22035-22267)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (9-241)||(63678-63910)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (9-240)||(5304-5535)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (9-240)||(30485-30716)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (19-241)||(36852-37074)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (9-241)||(974-1206)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (9-241)||(20687-20919)
scaffold0261 (9-241)||(12507-12739)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (9-241)||(50018-50250)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (9-240)||(251536-251767)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (29-235)||(151486-151692)
scaffold0011 (24-241)||(23707-23924)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (9-241)||(1431-1663)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (9-241)||(28444-28676)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (9-233)||(11881-12105)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (9-241)||(53582-53814)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (9-241)||(1042-1274)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (9-196)||(6416-6603)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (9-240)||(11723-11954)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (9-232)||(10899-11122)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (11-232)||(164562-164783)
scaffold0023 (12-241)||(47145-47373)
scaffold0023 (139-241)||(151994-152096)
scaffold0023 (53-205)||(30777-30929)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (11-240)||(39494-39723)
scaffold0010 (79-241)||(44656-44818)
scaffold0010 (9-230)||(4839-5060)
scaffold0010 (140-241)||(14337-14438)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (9-241)||(29440-29672)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (21-241)||(5718-5938)
scaffold0035 (9-100)||(41267-41358)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (8-240)||(514511-514743)
scaffold0001 (48-239)||(441568-441759)
scaffold0001 (9-239)||(495935-496165)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (36-241)||(60652-60857)
scaffold0046 (9-183)||(70079-70253)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (9-241)||(5094-5326)
[»] scaffold0523 (2 HSPs)
scaffold0523 (29-241)||(2784-2996)
scaffold0523 (11-70)||(11904-11963)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (18-205)||(2-189)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (8-240)||(375-607)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (9-233)||(43578-43802)
scaffold0104 (154-241)||(25129-25216)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (8-240)||(29848-30080)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (102-241)||(26025-26164)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (9-241)||(11743-11973)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (9-241)||(1634-1866)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (9-241)||(4248-4480)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (9-241)||(5515-5747)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (9-205)||(4463-4659)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (9-241)||(34250-34482)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (37-241)||(110523-110727)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (9-235)||(4051-4274)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (9-196)||(41693-41880)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (59-241)||(21764-21946)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (59-241)||(49086-49268)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (11-162)||(9182-9333)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (21-134)||(2019-2132)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (29-241)||(17791-18003)
scaffold0040 (9-241)||(111066-111298)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (9-241)||(15138-15370)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (9-241)||(23457-23689)
scaffold0018 (48-241)||(9549-9742)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (21-137)||(19140-19256)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (9-240)||(1913-2144)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (9-239)||(13638-13868)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (123-241)||(3443-3561)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (104-241)||(1132-1261)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (29-241)||(5001-5213)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (9-241)||(14425-14657)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (53-241)||(6786-6974)
scaffold0270 (53-241)||(13916-14104)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (139-241)||(8863-8965)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (31-241)||(1902-2112)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (24-241)||(36411-36628)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (24-241)||(4347-4564)
scaffold0621 (24-170)||(1-147)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (24-241)||(57788-58005)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (9-241)||(2422-2654)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (24-228)||(55644-55848)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (9-241)||(15335-15555)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (9-239)||(216579-216809)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (9-241)||(17225-17457)
scaffold0017 (139-240)||(24220-24321)
scaffold0017 (53-229)||(195041-195217)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (9-241)||(26265-26497)
scaffold0042 (53-230)||(37023-37200)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (54-241)||(11084-11271)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (54-241)||(54550-54737)
scaffold0080 (139-241)||(31796-31898)
scaffold0080 (139-241)||(10527-10629)
scaffold0080 (139-241)||(37262-37364)
scaffold0080 (139-205)||(13182-13248)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (43-228)||(8336-8521)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (9-241)||(29087-29319)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (9-241)||(10317-10549)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (54-241)||(582-769)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (24-207)||(40681-40864)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (138-241)||(104140-104243)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (8-70)||(1765-1827)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (139-241)||(18563-18665)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (139-241)||(8136-8238)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (9-70)||(1646-1707)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (24-241)||(41545-41762)
scaffold0022 (24-241)||(75265-75482)
scaffold0022 (9-241)||(34874-35106)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (24-228)||(7913-8117)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (9-241)||(22160-22392)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (9-85)||(51720-51796)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (19-98)||(1046-1125)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (139-241)||(25001-25103)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (8-67)||(961-1020)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (43-241)||(10281-10479)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (45-208)||(14030-14193)
scaffold0120 (24-125)||(11293-11394)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (150-241)||(21485-21576)
scaffold0100 (24-81)||(16783-16840)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (139-241)||(1321-1423)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (43-241)||(895-1093)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (12-70)||(1364-1422)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (139-241)||(12576-12678)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (139-241)||(3514-3616)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (139-241)||(8171-8273)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (139-241)||(41068-41170)
scaffold0109 (9-205)||(13283-13479)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (139-241)||(11382-11484)
scaffold0028 (139-241)||(17850-17952)
scaffold0028 (162-241)||(53640-53719)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (135-228)||(4509-4602)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (9-205)||(7185-7381)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (43-230)||(3348-3535)
scaffold0044 (9-241)||(17073-17305)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (54-192)||(14873-15011)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (53-193)||(1-141)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (139-196)||(769-826)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (9-205)||(928-1124)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (142-230)||(21528-21616)
scaffold0081 (142-230)||(36952-37040)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (152-240)||(83823-83911)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15462317 - 15462084
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15462317 caatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaa 15462218  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  15462217 tgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaa 15462118  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15462117 ggtgtccgttatctatgtttggtagagattttga 15462084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 14377219 - 14377443
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  14377219 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgt 14377318  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| || ||| ||||||    
T  14377319 gcttataagttgggtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcaaagggtttagtagctacttctcttgtttgtctaaggt 14377418  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagaga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14377419 gtctgttgtctatgtttggtagaga 14377443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18797668 - 18797438
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  18797668 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgt 18797569  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  18797568 gcatataagttgggtttgattgtatctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggt 18797469  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||   | |||||||||||||| ||||||||    
T  18797468 ttcctatatctatgtttggtagggattttga 18797438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 232
Target Start/End: Original strand, 10466148 - 10466372
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||| |||||  | |||    
T  10466148 caatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgttgctactcattgttttattgctattgaa 10466247  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10466248 tgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaa 10466347  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtag 232  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  10466348 ggtgtctgttatctatgtttggtag 10466372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 24515717 - 24515947
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||||    
T  24515717 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgt 24515816  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||    
T  24515817 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagttaagtgttcattaactacttctcttgtttgtctaaggt 24515916  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24515917 gtccgttgtctatgtttggtagagactttga 24515947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19455991 - 19455771
Alignment:
Q  21 cttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagt 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||| |||||||    
T  19455991 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagt 19455892  T
Q  121 tgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtc 220  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  ||||||    
T  19455891 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggtgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgttcgttgtc 19455792  T
Q  221 tatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  19455791 tatgtttggtagagactttga 19455771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19437978 - 19437750
Alignment:
Q  13 aggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgc 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||    
T  19437978 aggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgc 19437879  T
Q  113 atataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgt 212  Q
     ||||||||| || |  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||    
T  19437878 ttataagttgagtctagttgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgt 19437779  T
Q  213 ctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    | ||||| |||||||| |||||| |||||    
T  19437778 ccgttgtttatgtttgttagagactttga 19437750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 21567304 - 21567523
Alignment:
Q  21 cttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagt 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21567304 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttattcaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgctttagaatgtgcatattagt 21567403  T
Q  121 tgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtc 220  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||   | ||    
T  21567404 tgggtttgattgtaactgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatc 21567503  T
Q  221 tatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21567504 tatgtttggtagagattttg 21567523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 34642887 - 34643119
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34642887 aatgaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaatcgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagt 34642986  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  34642987 gtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgag 34643086  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||   | |||||||||||||| ||||||||    
T  34643087 atgtcctatatctatgtttggtagggattttga 34643119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 19486595 - 19486827
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  | || |    
T  19486595 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgatt 19486694  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || |  | || | |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||    
T  19486695 gtgcatataagttgggtctggtcatgtcaagtatgagtagagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgag 19486794  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19486795 ttgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 19486827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19466136 - 19465971
Alignment:
Q  21 cttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagt 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||| |||||||    
T  19466136 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagt 19466037  T
Q  121 tgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaa 186  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19466036 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaa 19465971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21474580 - 21474348
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||   | || |    
T  21474580 aatgaggaccgacttatcagaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttgattgttgttgatt 21474481  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || || | ||| |||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||    
T  21474480 gtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatagaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcatgtttgtttgag 21474381  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  21474380 ttgtccattgtctatgtttggtagagactttga 21474348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Original strand, 20010820 - 20010977
Alignment:
Q  74 cactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcc 173  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20010820 cactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcttataagttgggcctaatcgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagcc 20010919  T
Q  174 aagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggta 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20010920 aagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatttttggta 20010977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25770820 - 25770592
Alignment:
Q  13 aggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgc 112  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||   | || |||||    
T  25770820 aggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctattcattgtttcattgttgttgattgtgc 25770721  T
Q  113 atataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgt 212  Q
     |||||||||||| || || | ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||    
T  25770720 ttataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaatctccagcaaagggttcaatcactacttctcttgtttgtttgagttgt 25770621  T
Q  213 ctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  25770620 ccattgtctatgtttggtagagactttga 25770592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24367380 - 24367149
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||    
T  24367380 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 24367281  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||||||| ||||||||  |  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||| |  |    
T  24367280 gtgcatatcagttgggtccggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 24367181  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||| ||||||||||||||||    
T  24367180 gtgtcctatatctatctttggtagagattttg 24367149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 241
Target Start/End: Original strand, 23085146 - 23085358
Alignment:
Q  29 aggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttg 128  Q
    |||||| ||||  ||| |||||| ||||||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||   | || | ||| | |||||||||| |     
T  23085146 aggtacatgttattttgatagtactcctttagtttctattattgaaactggtgctacacattgttttattgttgttgattatgcttctaagttgggtctt 23085245  T
Q  129 attgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttg 228  Q
    | | | || | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  23085246 actatgtcaagtatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttg 23085345  T
Q  229 gtagagattttga 241  Q
    |||||||||||||    
T  23085346 gtagagattttga 23085358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23081403 - 23081184
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||  | || |    
T  23081403 aatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgatt 23081304  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | ||||||||||||   | | || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23081303 gtgcttctaagttgggttttgctatgtcaaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaag 23081204  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttg 228  Q
     ||||  |||||||||||||    
T  23081203 atgtcctttgtctatgtttg 23081184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 241
Target Start/End: Original strand, 18182688 - 18182900
Alignment:
Q  29 aggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttg 128  Q
    |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||   | |||||  | || ||||| | |||||||||| |     
T  18182688 aggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacacatttccttattgctattgattgtgcttctaagttgggtctt 18182787  T
Q  129 attgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttg 228  Q
      | | || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||| |||    
T  18182788 gctatgtcaaatatgaatggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcatttgtctatgcttg 18182887  T
Q  229 gtagagattttga 241  Q
    || ||||||||||    
T  18182888 gtcgagattttga 18182900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 30678325 - 30678557
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||| |||||    || |    
T  30678325 aatgaggatcggttgatcagaggtacatgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatatttgtgctacgcgttgttttattgctactgatt 30678424  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | |||||||||| |  || | ||   |||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||| | |     
T  30678425 gtgcttctaagttgggtcttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggttactacttctctagtgtgtctgaa 30678524  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||  |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  30678525 gtgttcgttgtcgatgtttggtcgagactttga 30678557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 5836529 - 5836761
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || | ||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  5836529 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgatt 5836628  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||| ||||  |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |    
T  5836629 gtgcttatactttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactaccactctagtatgtttga 5836727  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
      ||||  || |||||||||||| | ||||||||    
T  5836728 aatgtcctttttctatgtttggtcgtgattttga 5836761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Original strand, 18405260 - 18405477
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||  ||||||  ||||||||| || ||||||||||  | |||||| ||||| || || |||||   ||||||||    
T  18405260 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctatgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 18405359  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    || |   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||    
T  18405360 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcccttgtctat 18405459  T
Q  224 gtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| | | ||||||||    
T  18405460 gtttgattgtgattttga 18405477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Original strand, 16924956 - 16925173
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| || || ||||  | ||  ||||    
T  16924956 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16925055  T
Q  124 gt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtcta 222  Q
    || |||||| | ||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||  || ||||    
T  16925056 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttttcta 16925154  T
Q  223 tgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  16925155 tgtttggtcgtgattttga 16925173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 29589740 - 29589972
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  29589740 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 29589839  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  29589840 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 29589939  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  29589940 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 29589972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16574870 - 16574649
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  16574870 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 16574771  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  16574770 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 16574672  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
      ||||  |||||||||||||||    
T  16574671 aatgtcctttgtctatgtttggt 16574649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 16620510 - 16620731
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  16620510 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 16620609  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  16620610 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 16620708  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
      ||||  |||||||||||||||    
T  16620709 aatgtcctttgtctatgtttggt 16620731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 27559400 - 27559502
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  27559400 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 27559499  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  27559500 tga 27559502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 2872137 - 2872324
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  2872137 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 2872235  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  2872236 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 2872324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22436805 - 22436617
Alignment:
Q  53 tcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaa 152  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| ||||||| | |||||| ||||| || || ||||| | ||  |||||| |  || | ||| ||||||| |||||     
T  22436805 tcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagag 22436706  T
Q  153 atggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  |||   ||||||||||||||| | ||||||||    
T  22436705 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgttctttgtctatgtttggtcgtgattttga 22436617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 28260628 - 28260730
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  28260628 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 28260727  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  28260728 tga 28260730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28285288 - 28285186
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  28285288 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 28285189  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  28285188 tga 28285186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 28339377 - 28339479
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  28339377 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 28339476  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  28339477 tga 28339479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 230
Target Start/End: Original strand, 24293213 - 24293304
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  24293213 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 24293304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19867652 - 19867446
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| || ||||||| || ||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||| | ||  ||||    
T  19867652 atcaaaggtacatgttatattgataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgg 19867553  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    |  |  || | ||| ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||    
T  19867552 gccttgttatgtcttatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 19867453  T
Q  224 gtttggt 230  Q
    |||||||    
T  19867452 gtttggt 19867446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25115402 - 25115300
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  25115402 atatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 25115303  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  25115302 tga 25115300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28312480 - 28312378
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  28312480 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 28312381  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  28312380 tga 28312378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27190286 - 27190184
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||| |||||| | |||||    
T  27190286 atatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattt 27190187  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  27190186 tga 27190184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 27258954 - 27259056
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||| |||||| | |||||    
T  27258954 atatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattt 27259053  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  27259054 tga 27259056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20824484 - 20824254
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  20824484 caatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagag 20824385  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20824384 tgtgcatataagttgggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtttaa 20824285  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20824284 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagattt 20824254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20778943 - 20778711
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20778943 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 20778844  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20778843 gtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaag 20778744  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20778743 gtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 20778711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 28892280 - 28892512
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  28892280 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatggtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaat 28892379  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28892380 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaag 28892479  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28892480 gtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 28892512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22464977 - 22464748
Alignment:
Q  12 gaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  22464977 gaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtg 22464878  T
Q  112 catataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtg 211  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22464877 catataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtg 22464778  T
Q  212 tctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22464777 tccgttgtctatgtttggtagagattttga 22464748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 17266672 - 17266904
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||     
T  17266672 aatgaggaccgtctcatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 17266771  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  17266772 gtgcatataggttgggtttgtttgtgtctaacatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 17266871  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  17266872 gtgtccaatttctatgtttggtagagattttga 17266904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 23078243 - 23078474
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | ||||    
T  23078243 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgcaattgaat 23078342  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  23078343 gtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgag 23078442  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  23078443 atgtccattgtctatgtttggtagagactttg 23078474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 23563506 - 23563738
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||  | ||||    
T  23563506 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatattatagaaactggtgctactcaatgtttaattgctattgaat 23563605  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  23563606 gtgcatataagttgggtatggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 23563705  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23563706 gtgtacgttgtctatgtttggtagagactttga 23563738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 21561363 - 21561595
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  | || |    
T  21561363 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgatt 21561462  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||| ||| || || | || | |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  21561463 gtgcatataagttaggtatggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgag 21561562  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21561563 ttgtccattgtctatgtttggtagagattttga 21561595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 21983515 - 21983747
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  | || |    
T  21983515 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattactattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgatt 21983614  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || || | || | |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  21983615 gtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgag 21983714  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  21983715 ttgtccattgtttatgtttggtagagattttga 21983747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22505710 - 22505522
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | |||    
T  22505710 caatgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaa 22505611  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 196  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22505610 tgtgcttataagttgggtttggatgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctct 22505522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 14884329 - 14884560
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||    
T  14884329 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 14884428  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  |    
T  14884429 gtgcatataagttgggtttagatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 14884528  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  14884529 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 14884560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20345313 - 20345081
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | |||    
T  20345313 caatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaa 20345214  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || ||| |      
T  20345213 tgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctgg 20345114  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||||||   | ||| ||||||||||||||||||    
T  20345113 ggtgtcctatatctttgtttggtagagattttg 20345081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25851103 - 25850871
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | |||    
T  25851103 caatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaa 25851004  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||| |      
T  25851003 tgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaaggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgc 25850904  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  25850903 ggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 25850871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 201
Target Start/End: Original strand, 21631757 - 21631929
Alignment:
Q  29 aggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttg 128  Q
    |||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||| |||||  | || ||||| | |||||||||| |     
T  21631757 aggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctgttgattgtgcttctaagttgggtctt 21631856  T
Q  129 attgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgt 201  Q
     || | || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  21631857 gttatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgt 21631929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23474243 - 23474011
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||| | || | |||||| ||||  ||| || |||  |||||| |||||||||| || || |||||||||| |||||| |||||  | || |    
T  23474243 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgattgtacacctttagttgctattattgataccggtgctacacattgttttattgctattgatt 23474144  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    || | | |||||||||| ||  | |  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| || |||    
T  23474143 gtacttctaagttgggtctggctatgacgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtattaaag 23474044  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23474043 atgtcctttgtctatgtttggtcgagattttga 23474011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25429424 - 25429237
Alignment:
Q  54 cctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaa 153  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || | |||   |||||||||| |  || | | | ||||||| ||||| |    
T  25429424 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattttgctactaagttgggtcttgttatgtttgatatgaatggagaga 25429325  T
Q  154 tggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | | ||||||||    
T  25429324 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtctatgtttgatcgtgattttga 25429237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21882822 - 21882590
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| ||| |||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  21882822 aatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttggtattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 21882723  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | ||  |||||| |   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  21882722 gtgcttctactttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgag 21882623  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  21882622 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 21882590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18782162 - 18781930
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| || || |    
T  18782162 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 18782063  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||      
T  18782062 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactacttctctcgtatgtttgc 18781964  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    | ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  18781963 gatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 18781930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Original strand, 26736080 - 26736297
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |  | || ||||| | || |||||    
T  26736080 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgcttctatgttgg 26736179  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    || |   | | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||  || ||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||    
T  26736180 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggtttggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcctttgtctat 26736279  T
Q  224 gtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| | | ||||||||    
T  26736280 gtttgatcgtgattttga 26736297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16359550 - 16359318
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  16359550 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 16359451  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  16359450 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 16359351  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  16359350 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 16359318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 29473445 - 29473632
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  29473445 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 29473543  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  29473544 tgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 29473632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34569542 - 34569310
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  34569542 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 34569443  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  34569442 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 34569343  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  34569342 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 34569310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40711828 - 40711596
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  40711828 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatcttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 40711729  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  40711728 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 40711629  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  40711628 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 40711596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 241
Target Start/End: Original strand, 21336761 - 21336864
Alignment:
Q  138 aatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagatt 237  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||  || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  21336761 aatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggtttggtgactacttctcgtgtgtgtttaagatgtcttttgtctatgtttggtcgcgatt 21336860  T
Q  238 ttga 241  Q
    ||||    
T  21336861 ttga 21336864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27521454 - 27521222
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  27521454 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 27521355  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  27521354 gtgtttctgctttgggtcttggtt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 27521256  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
      ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  27521255 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 27521222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27613404 - 27613172
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  27613404 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 27613305  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  27613304 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 27613206  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
      ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  27613205 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 27613172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41773890 - 41773658
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  41773890 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 41773791  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  41773790 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 41773692  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
      |||   ||||||||||||||| | ||||||||    
T  41773691 aatgtactttgtctatgtttggtcgcgattttga 41773658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 14997111 - 14997298
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  14997111 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 14997209  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  14997210 tgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 14997298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 22330259 - 22330446
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  22330259 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 22330357  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  22330358 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 22330446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 37288868 - 37289055
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  37288868 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttt-tctgata 37288966  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||| ||||||||    
T  37288967 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctttgtttggt 37289055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19772974 - 19772787
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  19772974 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 19772876  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  19772875 tgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 19772787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 27682772 - 27682959
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | | | |||    
T  27682772 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtttgata 27682870  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  27682871 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 27682959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 21410182 - 21410091
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgc 100  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  21410182 aatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactatcatagatactggtgctacatattgttttattgc 21410091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22350933 - 22350735
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||| ||||||| | ||| || ||||| || || ||||  | ||  |||||| |||||| | ||| |||    
T  22350933 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 22350835  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  22350834 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgattttga 22350735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Original strand, 27665862 - 27666060
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  27665862 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 27665960  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  27665961 tgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 27666060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 21342882 - 21342984
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||  | ||||  ||||||||||||| | | |||||    
T  21342882 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 21342981  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  21342982 tga 21342984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22137586 - 22137484
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||| |||||||||| | |||||    
T  22137586 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgattt 22137487  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  22137486 tga 22137484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20311755 - 20311667
Alignment:
Q  152 aatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||||||||| ||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||| || || | |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  20311755 aatggttgtcgaaaccccaactaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttg 20311667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20803515 - 20803413
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  20803515 atatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 20803416  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  20803415 tga 20803413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 125
Target Start/End: Original strand, 21332324 - 21332440
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||  | || |    
T  21332324 aatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgatt 21332423  T
Q  109 gtgcatataagttgggt 125  Q
    |||| | ||||||||||    
T  21332424 gtgcttctaagttgggt 21332440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23461019 - 23460832
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || | ||||||||| | |  ||| ||||| || || |    
T  23461019 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctgtattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacccatgtttttattgctttcgatt 23460920  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 196  Q
    |||| | ||  |||||| |||||| | ||| ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  23460919 gtgcttctactttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23460832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23526099 - 23525983
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || |||||||| |||| |||||| ||||| || || |    
T  23526099 aatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcaacacattgttttattgctttcgatt 23526000  T
Q  109 gtgcatataagttgggt 125  Q
    |||| | || |||||||    
T  23525999 gtgcttctacgttgggt 23525983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27903502 - 27903269
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27903502 caatgaggatcgacttatcagaggtacatgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaa 27903403  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27903402 tgtgcatataagttgggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaa 27903303  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27903302 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 27903269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20893148 - 20892916
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20893148 caatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaa 20893049  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||      
T  20893048 agtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgg 20892949  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||| ||   | ||||||||||||||||||||||    
T  20892948 ggtatcctatatctatgtttggtagagattttg 20892916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16150750 - 16150527
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  16150750 tgaggatcgacttatcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 16150651  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16150650 gcatataagttgggtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggt 16150551  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagag 234  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  16150550 gtccgttgtctatgtttggtagag 16150527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16154896 - 16154673
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  16154896 tgaggatcgacttatcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 16154797  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16154796 gcatataagttgggtttggttgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggt 16154697  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagag 234  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  16154696 gtccgttgtctatgtttggtagag 16154673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 51603948 - 51604180
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  51603948 aatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaat 51604047  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  51604048 gtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 51604147  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  51604148 gtgtccaatttctatgtttggtagagattttga 51604180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 44659022 - 44659253
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||    
T  44659022 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 44659121  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  |    
T  44659122 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 44659221  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  44659222 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 44659253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 3261950 - 3262181
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||    
T  3261950 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 3262049  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  |    
T  3262050 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 3262149  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  3262150 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 3262181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 29450693 - 29450924
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||    
T  29450693 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 29450792  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  |    
T  29450793 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 29450892  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  29450893 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 29450924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Original strand, 53750626 - 53750813
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  53750626 aatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaat 53750725  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 196  Q
    |||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  53750726 gtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 53750813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15073475 - 15073243
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | || |    
T  15073475 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 15073376  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||| ||||||||| | || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  15073375 gtgcacataagttggctctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtcagtttgag 15073276  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  15073275 ttgtcctttgtctatgtttggtagagactttga 15073243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 14993523 - 14993744
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||   | || |||||||||  | || |    
T  14993523 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctcttcattatttcattgctgttgatt 14993622  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||    
T  14993623 gtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtctaag 14993722  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  14993723 ttgtccgttgtctatgtttggt 14993744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Original strand, 11204387 - 11204619
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | |||    
T  11204387 caatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaa 11204486  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    ||||| |||||||| ||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |      
T  11204487 tgtgcctataagttaggtttggatgtatctggtatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgg 11204586  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  11204587 ggtgtcctaaatctatgtttggtagagattttg 11204619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15266882 - 15266736
Alignment:
Q  19 gacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataa 118  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||   | || ||||| |||||    
T  15266882 gacttatcagaggtagttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgatgttgattgtgcttataa 15266783  T
Q  119 gttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 165  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15266782 gttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 15266736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 235
Target Start/End: Original strand, 15354295 - 15354422
Alignment:
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  15354295 tgtgtatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaa 15354394  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagaga 235  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15354395 gatgtctgttgtctatgtttggtagaga 15354422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14697217 - 14696985
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | || | |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||  | || |    
T  14697217 aatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgatt 14697118  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | |||||||||| |   | | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  14697117 gtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaag 14697018  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14697017 atgtcccttgtctatgtttggtcgagattttga 14696985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 15946 - 16150
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||| | || ||| |||||  | || |||||   ||||||||    
T  15946 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgg 16045  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  16046 gtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 16145  T
Q  224 gtttg 228  Q
    |||||    
T  16146 gtttg 16150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14162583 - 14162370
Alignment:
Q  12 gaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtg 111  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || || |||||||| | | |||| |||||  | || ||||    
T  14162583 gaggatcgcctgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataccggtgctacgcatagttttattgctcttgattgtg 14162484  T
Q  112 catataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtg 211  Q
    | | |||||||| | |   | | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14162483 cttctaagttggatcttgctatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctcttgtgtgtttaaggtg 14162384  T
Q  212 tctgttgtctatgt 225  Q
    ||  ||||||||||    
T  14162383 tcctttgtctatgt 14162370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 7357384 - 7357292
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||    
T  7357384 caatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgc 7357292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15258891 - 15258812
Alignment:
Q  161 tgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15258891 tgaaactccagctaagagttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 15258812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12479716 - 12479484
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  12479716 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 12479617  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  12479616 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 12479518  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
      ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  12479517 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 12479484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 17092045 - 17092277
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  17092045 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 17092144  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  17092145 gtgtttctgccttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 17092244  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  17092245 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 17092277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Original strand, 16233922 - 16234120
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  16233922 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 16234020  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  16234021 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 16234120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Original strand, 18224376 - 18224574
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  18224376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 18224474  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||  | ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  18224475 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 18224574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27714452 - 27714231
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  27714452 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 27714353  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  27714352 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 27714254  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
      ||||| |||||||||||||||    
T  27714253 aatgtcttttgtctatgtttggt 27714231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8389528 - 8389296
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  8389528 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 8389429  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |    
T  8389428 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttcactcgtatgtttga 8389330  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
      ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  8389329 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 8389296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14683682 - 14683451
Alignment:
Q  10 atgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatg 109  Q
    ||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| || || ||    
T  14683682 atgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattg 14683583  T
Q  110 tgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||  |    
T  14683582 tgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcg 14683484  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  14683483 ttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 14683451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 15144788 - 15145020
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| ||||   || ||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||  | |||||| ||||  || || |    
T  15144788 aatgaggatcgcttgatcaaaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgatt 15144887  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | ||  |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |     
T  15144888 gtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaa 15144987  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  15144988 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 15145020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23958829 - 23958642
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  23958829 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 23958731  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  23958730 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 23958642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19635218 - 19635020
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  19635218 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 19635120  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  19635119 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgttcggtcgtgattttga 19635020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 16250876 - 16250978
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||  | ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  16250876 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 16250975  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  16250976 tga 16250978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 16350450 - 16350671
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||| ||||||  | |||||| ||||| || || |    
T  16350450 aatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctatgcattgttttattgctttcgatt 16350549  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | ||  |||||| |||||| | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  16350550 gtgtttctactttgggtcttgatt-tgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 16350648  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    | ||||  |||||||||| ||||    
T  16350649 gatgtcctttgtctatgtctggt 16350671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Original strand, 15354234 - 15354291
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctatt 68  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15354234 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatatt 15354291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 8050553 - 8050740
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  8050553 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 8050651  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  | ||  |||||||||||||||    
T  8050652 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggt 8050740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 14300909 - 14301096
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  14300909 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 14301007  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||| ||||||    
T  14301008 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggt 14301096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16219181 - 16219114
Alignment:
Q  174 aagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  16219181 aagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 16219114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16222501 - 16222434
Alignment:
Q  174 aagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  16222501 aagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 16222434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40476122 - 40475924
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  40476122 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 40476024  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  40476023 tgaatggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 40475924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 19775723 - 19775910
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  19775723 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 19775821  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||  | ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  19775822 tgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 19775910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14188496 - 14188390
Alignment:
Q  135 tctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagag 234  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||  |||||| |||||| | | |    
T  14188496 tctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaaggttcggttactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctttgtttgatcgtg 14188397  T
Q  235 attttga 241  Q
    |||||||    
T  14188396 attttga 14188390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 94053 - 94285
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  94053 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaat 94152  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  94153 gtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaag 94252  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  94253 gtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 94285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 115707 - 115475
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  115707 aatgaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgctttagagt 115608  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |     
T  115607 gtgcatataaactaggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgat 115508  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||   | |||||||||||||| ||||||||    
T  115507 atgtcctatatctatgtttggtagggattttga 115475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 238
Target Start/End: Original strand, 10417428 - 10417658
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||     
T  10417428 caatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctacacattgtttcattgctttagag 10417527  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  10417528 tgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctctggtgtgtctaa 10417627  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10417628 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagattt 10417658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Original strand, 11958564 - 11958796
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  11958564 caatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaa 11958663  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  11958664 agtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttga 11958763  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  11958764 ggtgtcctatatctatgtttggtagagactttg 11958796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 16831912 - 16832144
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||     
T  16831912 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 16832011  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  16832012 gtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 16832111  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  16832112 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 16832144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 12357913 - 12358143
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  12357913 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 12358012  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  12358013 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 12358112  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12358113 gtccgttgtctatgtttggtagagactttga 12358143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 238
Target Start/End: Original strand, 16327092 - 16327322
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  16327092 caatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaa 16327191  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||      
T  16327192 agtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgg 16327291  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  16327292 ggtgtcctatatctatgtttggtagagattt 16327322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 31692571 - 31692801
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  31692571 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 31692670  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || ||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31692671 gcttataagtcgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggt 31692770  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  31692771 gtccgttgtctatgtttggtagagactttga 31692801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 16378318 - 16378550
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||     
T  16378318 aatgaggaccgtcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattgctatcatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 16378417  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  16378418 gtgcatataagttgggtttgattgtatctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgag 16378517  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  16378518 gtgtccaatatctatgtttggtagagattttga 16378550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 18131733 - 18131956
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  18131733 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagac-ctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 18131831  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  18131832 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 18131931  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagaga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18131932 gtctgttgtctatgtttggtagaga 18131956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12181087 - 12180857
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  12181087 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 12180988  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |    
T  12180987 gcttataagttgggtctgtttgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgacactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtccaagat 12180888  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12180887 gtccgttgtctatgtttggtagagactttga 12180857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 8744774 - 8745006
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||     
T  8744774 aatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 8744873  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  8744874 gtgcatataggttgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 8744973  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  8744974 gtgtccaatttctatgtttggtagagattttga 8745006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 14290916 - 14291148
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  | || |    
T  14290916 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctgttgatt 14291015  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  14291016 gtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 14291115  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14291116 ttgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 14291148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13944769 - 13944537
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  13944769 aatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaat 13944670  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||    
T  13944669 gtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatggaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctagtttgcttgag 13944570  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  13944569 gtgtccaatttctatgtttggtagagattttga 13944537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17189107 - 17188887
Alignment:
Q  21 cttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagt 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17189107 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacgggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaat 17189008  T
Q  121 tgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtc 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||   | ||    
T  17189007 tgggtttgattgtatctgatatggagggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtttgtttgaggtgtcctatatc 17188908  T
Q  221 tatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17188907 tatgtttggtagagattttga 17188887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24190037 - 24189817
Alignment:
Q  21 cttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagt 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24190037 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaat 24189938  T
Q  121 tgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtc 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||   | ||    
T  24189937 tgggtttgattgtatctgatatgaagggagagatggttgttgagactccagctaagggttcagtgactacttttctcgtttgtttgaggtgtcctatatc 24189838  T
Q  221 tatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24189837 tatgtttggtagagattttga 24189817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31941646 - 31941416
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || |||||||||  | ||||||    
T  31941646 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactcattttttcattgctattgaatgt 31941547  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31941546 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtctagtaactacttctcttgtgtgtctaaggt 31941447  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    | | ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31941446 gcccgttgtctatgtttggcagagactttga 31941416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17494380 - 17494159
Alignment:
Q  21 cttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagt 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||| ||||| |    
T  17494380 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataaat 17494281  T
Q  121 tgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttg-aaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgt 219  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| |||| |||| |||||    
T  17494280 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtttgtctaagatgtccgttgt 17494181  T
Q  220 ctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  17494180 ctatgtttggtagagactttga 17494159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28757064 - 28756833
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||    
T  28757064 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 28756965  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| || |    
T  28756964 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctacg 28756865  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  28756864 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 28756833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 177
Target Start/End: Original strand, 13317918 - 13318086
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  13317918 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaat 13318017  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagg 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13318018 gtgcatataagttgggcttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15230348 - 15230116
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |    
T  15230348 aatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgatt 15230249  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
     |||||||||||||||| || || | || | |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||    
T  15230248 ttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgag 15230149  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  15230148 ttgtccattgtctatgttttgtagagattttga 15230116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15236216 - 15235984
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |    
T  15236216 aatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgatt 15236117  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
     |||||||||||||||| || || | || | |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||    
T  15236116 ttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgag 15236017  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  15236016 ttgtccattgtctatgttttgtagagattttga 15235984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10408713 - 10408482
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||    
T  10408713 aatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 10408614  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  |    
T  10408613 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtgtgcg 10408514  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  10408513 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 10408482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 16825663 - 16825897
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaata--gtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttaga 106  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||  | ||    
T  16825663 aatgaggactgacttatcagaggtacttgtttctttaatatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctgttga 16825762  T
Q  107 atgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgttta 206  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  16825763 ttgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtcta 16825862  T
Q  207 aggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    || |||| |||||||||  |||||||||| |||||    
T  16825863 agttgtccgttgtctataattggtagagactttga 16825897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 11949311 - 11949492
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  11949311 tgaggatcaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 11949410  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactactt 192  Q
    |  |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11949411 ggttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 11949492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Original strand, 12509866 - 12510098
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | |||    
T  12509866 caatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaa 12509965  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||      
T  12509966 tgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttgtttgg 12510065  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  12510066 ggtgtcttatatctatgtttggtagagattttg 12510098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 47126686 - 47126458
Alignment:
Q  12 gaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtg 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | |||||||    
T  47126686 gaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtg 47126587  T
Q  112 catataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtg 211  Q
    | |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  ||||    
T  47126586 cttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtg 47126487  T
Q  212 tctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||    
T  47126486 tcctatatctatgtttggtagagattttg 47126458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12273047 - 12272851
Alignment:
Q  45 aatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatga 144  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||   | || | ||||| |||||||||| || |||||||| ||||||    
T  12273047 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgactatgcatttaagttgggtctggttgtatctgatatga 12272948  T
Q  145 aaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  12272947 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttga 12272851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 12857880 - 12858111
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||  | |  |    
T  12857880 aatgagga-cgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctagttattgtttcattgctgtggttt 12857978  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||| | || || ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  12857979 gtgcatataagttggttctggttatatctgatatgaatggagaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 12858078  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  12858079 ttgtccattgtctatgtttggtagtgactttga 12858111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14575632 - 14575499
Alignment:
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  14575632 tgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaa 14575533  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14575532 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 14575499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15262350 - 15262133
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||  | || ||||| | ||||||||    
T  15262350 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 15262251  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    || |   | | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  15262250 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaatggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 15262151  T
Q  224 gtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  15262150 gtttggtcgagattttga 15262133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 12843498 - 12843730
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | || |    
T  12843498 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgatt 12843597  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | |||||||| | |   | | || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12843598 gtgcttctaagttggatcttgctatgtcaaatatgaatggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaag 12843697  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  |||| |||||||| | | ||||||||    
T  12843698 atgtcctttgtttatgtttgatcgtgattttga 12843730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 241
Target Start/End: Original strand, 14578932 - 14579035
Alignment:
Q  138 aatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagatt 237  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||||||||| | | ||||    
T  14578932 aatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtaactacttctatagtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgatt 14579031  T
Q  238 ttga 241  Q
    ||||    
T  14579032 ttga 14579035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 35982926 - 35982839
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttca 96  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||    
T  35982926 aatgaggaccgacttatcagagatacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtactactcattgtttca 35982839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12889444 - 12889212
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  12889444 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 12889345  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  12889344 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 12889246  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
      ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  12889245 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 12889212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13255425 - 13255193
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  13255425 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 13255326  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  13255325 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 13255227  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
      ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  13255226 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 13255193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15065806 - 15065574
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| || || |||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  15065806 aatgaggatcgcttgatcaaaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 15065707  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  15065706 gtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtttgtttgaa 15065607  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  15065606 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 15065574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43165410 - 43165178
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  43165410 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 43165311  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  43165310 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 43165211  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  43165210 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 43165178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48428182 - 48427950
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  48428182 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 48428083  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  48428082 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 48427983  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  48427982 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 48427950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15358784 - 15358586
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  15358784 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 15358686  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  15358685 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 15358586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10008335 - 10008114
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  10008335 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 10008236  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  10008235 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 10008137  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
      ||||  |||||||||||||||    
T  10008136 aatgtcctttgtctatgtttggt 10008114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10908945 - 10908724
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  10908945 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 10908846  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  10908845 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 10908747  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
      ||||  |||||||||||||||    
T  10908746 aatgtcctttgtctatgtttggt 10908724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 20059579 - 20059681
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  20059579 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 20059678  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  20059679 tga 20059681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 14873963 - 14874159
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||   |||||| || ||||||| |||||||||| || | |||||| |||| |||||| ||||| || || |    
T  14873963 aatgaggatcgcttgatcataggtacatgttatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcaacacattgttttattgctttcgatt 14874062  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgttt 205  Q
    |||| | ||  |||||| |||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  14874063 gtgcttctactttgggtcttgata-tgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 14874159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 15013153 - 15013378
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||| || ||| ||||     || |    
T  15013153 aatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagcactcctttaattactattatagatactagtgttacacatttttttattgttgctgatt 15013252  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||   |||||||||| |  || | ||   |||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |     
T  15013253 gtgctactaagttgggtcttgttatgtcgtctatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaa 15013352  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagag 234  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||    
T  15013353 gtgtcctttgtcgatgtttggtagag 15013378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 15345640 - 15345861
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  15345640 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 15345739  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  15345740 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 15345839  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
     ||||  |||||||||||||||    
T  15345840 atgtcctttgtctatgtttggt 15345861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 15586787 - 15587019
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  15586787 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 15586886  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  15586887 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 15586985  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
      ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  15586986 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 15587019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 15713485 - 15713672
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  15713485 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 15713583  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  15713584 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 15713672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16638508 - 16638276
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| || || |    
T  16638508 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgatt 16638409  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  16638408 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 16638309  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  16638308 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 16638276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24185924 - 24185693
Alignment:
Q  10 atgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatg 109  Q
    ||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| || || ||    
T  24185924 atgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattg 24185825  T
Q  110 tgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||  | ||  |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| || |||||  |    
T  24185824 tgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgcg 24185726  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  24185725 ttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 24185693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Original strand, 5422340 - 5422557
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||||||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || || |  | |   ||||    
T  5422340 atcaaaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgcgtttctgctttgg 5422439  T
Q  124 gt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtcta 222  Q
    || |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||| |||||||    
T  5422440 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtcta 5422538  T
Q  223 tgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  5422539 tgtttggtcgtgattttga 5422557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17492456 - 17492354
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| |||||||| | | |||||    
T  17492456 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtttatgtttgatcgtgattt 17492357  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  17492356 tga 17492354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3688678 - 3688446
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| |  || |    
T  3688678 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttccgatt 3688579  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  3688578 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 3688479  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  3688478 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 3688446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Original strand, 15399946 - 15400144
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||  |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  15399946 ttaataatactcctttggttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 15400044  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  15400045 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 15400144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6603340 - 6603238
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  6603340 atatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 6603241  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  6603240 tga 6603238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16694769 - 16694667
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||  | ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  16694769 atatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 16694670  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  16694669 tga 16694667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 16754226 - 16754328
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||   |||||||||||||| | |||||    
T  16754226 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctctgtctatgtttggtcgtgattt 16754325  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  16754326 tga 16754328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 53382543 - 53382645
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  53382543 atatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 53382642  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  53382643 tga 53382645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 230
Target Start/End: Original strand, 26790938 - 26791029
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  26790938 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 26791029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 16804472 - 16804574
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| || || ||  | |||||  |||||||||||||| | |||||    
T  16804472 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgcttgcgatgtcttctgtctatgtttggtcgtgattt 16804571  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  16804572 tga 16804574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 13318082 - 13318118
Alignment:
Q  205 taaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13318082 taaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 13318118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 11861109 - 11861033
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctac 85  Q
    |||||||||||  | |||| |||||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  11861109 aatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 11861033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 70518 - 70285
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||    
T  70518 caatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttctttgctttagaa 70419  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  70418 tgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaa 70319  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  70318 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 70285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 2123 - 2343
Alignment:
Q  21 cttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagt 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | |||||| | |||||||    
T  2123 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgttcttataagt 2222  T
Q  121 tgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtc 220  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  ||||||    
T  2223 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggggatatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgttcgttgtc 2322  T
Q  221 tatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  2323 tatgtttggtagagactttga 2343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 20853991 - 20854220
Alignment:
Q  12 gaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  20853991 gaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtg 20854090  T
Q  112 catataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtg 211  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20854091 catataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtg 20854190  T
Q  212 tctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20854191 tccgttgtctatgtttggtagagattttga 20854220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18710545 - 18710315
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  18710545 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataaacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 18710446  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || ||||||||| || || |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  18710445 gcttataagttgcgtctggttgtatctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 18710346  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18710345 gtccgttgtctatgtttggtagagactttga 18710315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 21742780 - 21743012
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   | || |    
T  21742780 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttgttgatt 21742879  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  21742880 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaactacgtctcttgtttgtttgag 21742979  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21742980 ttgtctgttgtctatgtttggtagagactttga 21743012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 22015973 - 22016205
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||   | || |    
T  22015973 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgatgttgatt 22016072  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  22016073 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 22016172  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22016173 gtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 22016205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19857434 - 19857204
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||   | ||||||    
T  19857434 tgaggatcgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgt 19857335  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||    
T  19857334 gcttataagttgggtatggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcctaaggt 19857235  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19857234 gtccgttgtctatgtttggtagagactttga 19857204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 20833130 - 20833360
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||||    
T  20833130 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatattattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgt 20833229  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
     | |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||    
T  20833230 tcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagataagggttcattaactacttctcttgtttgtctaaggt 20833329  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20833330 gtccgttgtctatgtttggtagagactttga 20833360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 21739264 - 21739496
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | || |    
T  21739264 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 21739363  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||    
T  21739364 gtgcatataagttgggtcttgttttatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtttgtttgag 21739463  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  21739464 ttgtccattgtctatgtttggtagagactttga 21739496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 24096843 - 24097074
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||  | ||||    
T  24096843 aatgaggactgacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaat 24096942  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || || ||    
T  24096943 gtgcttataagttgggtttggatgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgcttgag 24097042  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  24097043 atgtccattgtctatgtttggtagagactttg 24097074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48426035 - 48425804
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||    
T  48426035 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 48425936  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  |    
T  48425935 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 48425836  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  48425835 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 48425804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 52988904 - 52988672
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | |||    
T  52988904 caatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaa 52988805  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |      
T  52988804 tgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgc 52988705  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  52988704 ggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 52988672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 38910054 - 38910285
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||    
T  38910054 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 38910153  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  |    
T  38910154 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 38910253  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  38910254 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 38910285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 196
Target Start/End: Original strand, 20074936 - 20075124
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | |||    
T  20074936 caatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaa 20075035  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 196  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20075036 tgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 20075124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20297544 - 20297312
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | |||    
T  20297544 caatgaggaccgacttatcagaggtactggtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaa 20297445  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |      
T  20297444 tgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgg 20297345  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||||||   | | ||||||||||||||||||||    
T  20297344 ggtgtcctatatttatgtttggtagagattttg 20297312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 31537225 - 31537456
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||    
T  31537225 aatgaagaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 31537324  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  |    
T  31537325 gtgcatataagttgggtttggatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 31537424  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  31537425 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 31537456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37680211 - 37679980
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  | |||||| |||||  | ||||    
T  37680211 aatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctattcattgttttattgctattgaat 37680112  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  |    
T  37680111 gtgcatataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 37680012  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  37680011 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 37679980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16379210 - 16378993
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||| |||||  | || ||||| | ||||||||    
T  16379210 atcagaggtacatgttactttgatggtactcctttaattgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16379111  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    ||     | | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||    
T  16379110 gtcatgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcctttgtctat 16379011  T
Q  224 gtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||| | ||||||||    
T  16379010 gtttggtcgtgattttga 16378993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12200556 - 12200449
Alignment:
Q  133 tatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtag 232  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  ||||||   | ||||||||||||||    
T  12200556 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtag 12200457  T
Q  233 agattttg 240  Q
    ||||||||    
T  12200456 agattttg 12200449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 24785085 - 24785317
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||| ||||||||| |||||| ||||| || || |    
T  24785085 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgctacacattgttttattgctttcgatt 24785184  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | |   |||||| |  || ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  24785185 gtgcttctgctttgggtcttgttttatctgatatgaatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 24785284  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  24785285 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 24785317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 230
Target Start/End: Original strand, 22496528 - 22496705
Alignment:
Q  53 tcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaa 152  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||| | ||  |||||| |  || | ||| ||||||| |||||     
T  22496528 tcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctacattgggtcttgttatgtctgatatgaatggagag 22496627  T
Q  153 atggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  22496628 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 22496705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 16347823 - 16348055
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  16347823 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 16347922  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  16347923 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 16348022  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  16348023 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 16348055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 241
Target Start/End: Original strand, 20081648 - 20081836
Alignment:
Q  53 tcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaa 152  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||| |||| | |||||| ||||| || || ||||| | ||  |||||| |  || | ||| ||||||| |||||     
T  20081648 tcctttagttgctattattgatactggtactacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagag 20081747  T
Q  153 atggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  20081748 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 20081836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 51330720 - 51330952
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  51330720 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 51330819  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  51330820 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 51330919  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  51330920 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 51330952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 17042245 - 17042475
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    |||||||||  | |||| |||||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||| || || |||    
T  17042245 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgt 17042344  T
Q  111 gcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaagg 209  Q
    |  | |   |||||  |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||  |     
T  17042345 gtttctgctttgggccttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcga 17042443  T
Q  210 tgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  17042444 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 17042475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19109465 - 19109278
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||| |  || ||||| | |   ||| || |||||| | ||| |||    
T  19109465 ttaataatactcctttagttgctattattgacactggtgctatgcattgttttattgcctatgattgtgcttctgctttgagtcttgatt-tgtctgata 19109367  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  19109366 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 19109278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 21961190 - 21961135
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattg 63  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21961190 caatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 21961135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 33388291 - 33388478
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatat 142  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |  || | ||| ||||    
T  33388291 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 33388390  T
Q  143 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  33388391 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 33388478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21752163 - 21751991
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || | ||||||||| | |||||| |||||  | || |||||   ||||||||    
T  21752163 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 21752064  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 196  Q
    || |   | | ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  21752063 gtcttgctatgtctaatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21751991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21833433 - 21833212
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| || || || || |    
T  21833433 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatggctttcgatt 21833334  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  21833333 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtctgtttga 21833235  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
      ||||  || ||||||||||||    
T  21833234 aatgtcctttatctatgtttggt 21833212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21842213 - 21842111
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  21842213 atatgaatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcatttgtctatgtttggtcgtgattt 21842114  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  21842113 tga 21842111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 21045352 - 21045429
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctaca 86  Q
    |||||||||||  | || | |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21045352 aatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctaca 21045429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 41351026 - 41351128
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||   ||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||| || | |||||    
T  41351026 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattt 41351125  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  41351126 tga 41351128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 5008 - 5239
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  5008 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatactactcctttaattgatattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaaa 5107  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  5108 gtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctctttaag 5207  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5208 gtgtccgttgtctatgtttggtagagattttg 5239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 17643 - 17874
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||||     
T  17643 aatgaggatcgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacattggtgctacttattgtttcattgctttagaaa 17742  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17743 gtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaag 17842  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    | ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17843 gagtcagttgactatgtttggtagagattttg 17874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 49339 - 49571
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  49339 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaat 49438  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  49439 gtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaag 49538  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49539 gtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 49571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 58373 - 58605
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  58373 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaat 58472  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  58473 gtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaag 58572  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  58573 gtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 58605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 64761 - 64993
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  64761 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaat 64860  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  64861 gtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaag 64960  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  64961 gtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 64993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29769 - 29537
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||  | || |    
T  29769 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcaatgtttgattgctgttgatt 29670  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  29669 gtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 29570  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  29569 gtgtccattgtctatgtttggtagagactttga 29537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40204 - 39972
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||||    
T  40204 caatgaggaccgtcttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacaggtgctactcattgttttattgctttagaa 40105  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  40104 agtgcatataagttggggttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctcttgtctgtttaa 40005  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40004 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttg 39972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 17508 - 17739
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||||||||   |||||| ||  |||||| |||||||||| || || |||||||| | |||||||||| | |  || |    
T  17508 aatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatacacctttagttgctattattgatacaggtgctacgcattgtttcatttcttatgatt 17607  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||   |||||||||| | ||  |  || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  17608 gtgctactaagttgggtcttatcatgcctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgctgactacttctcttgtgtgtttaag 17707  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||| | | ||||||||    
T  17708 atgtc-cttgtctatgtttgatcgtgattttga 17739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 29301025 - 29301256
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  29301025 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaat 29301124  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | ||    
T  29301125 gtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgag 29301224  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29301225 ttgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 29301256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 22027879 - 22028111
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | ||||    
T  22027879 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaat 22027978  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  22027979 gtgcatataagttgggtttggttttatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttaag 22028078  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22028079 gtgtccattgtctatgtttggtagagattttga 22028111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22054045 - 22053814
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||     
T  22054045 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 22053946  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | ||    
T  22053945 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgag 22053846  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||     ||||||||||||||||| ||||    
T  22053845 gtgtcctacatctatgtttggtagagactttg 22053814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 31414131 - 31414362
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||    ||||    
T  31414131 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctaatgaat 31414230  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  31414231 gtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgag 31414330  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  31414331 atgtccattgtctatgtttggtagagactttg 31414362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19985358 - 19985130
Alignment:
Q  13 aggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgc 112  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||   | || |||||    
T  19985358 aggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgc 19985259  T
Q  113 atataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgt 212  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||    
T  19985258 atataagttgggtttggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgt 19985159  T
Q  213 ctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  19985158 ccattgtctatgtttggtagagactttga 19985130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21928610 - 21928378
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | || |    
T  21928610 aatgaagaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 21928511  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  21928510 gtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaatggcgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 21928411  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     |||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21928410 ctgtgcgttgtctatgtttggtagagactttga 21928378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22374051 - 22373819
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||   | || |    
T  22374051 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatagtttcattgatgttgatt 22373952  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  22373951 gtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 22373852  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||| |||||| |||||    
T  22373851 ttgtccattgtctatgtttgatagagactttga 22373819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 238
Target Start/End: Original strand, 16268822 - 16269052
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | |||    
T  16268822 caatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaa 16268921  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| |      
T  16268922 tgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgcttgtctgg 16269021  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  16269022 ggtgtcctatatctatgtttggtagagattt 16269052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20391268 - 20391036
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgc-gttagaa 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| |||| |     
T  20391268 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattattgatactggtgctacacattgattcattgctgtta-at 20391170  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||| ||||||||||||| || || | || | ||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  20391169 tgtgaatataagttgggtctggttatgtcaagtattagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttga 20391070  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391069 gttgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 20391036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28984093 - 28983862
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| |||||  | ||||    
T  28984093 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaat 28983994  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  |    
T  28983993 gtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 28983894  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  28983893 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 28983862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28989312 - 28989081
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| |||||  | ||||    
T  28989312 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaat 28989213  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  |    
T  28989212 gtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 28989113  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  28989112 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 28989081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27357665 - 27357487
Alignment:
Q  62 tgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgtt 161  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | |||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27357665 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 27357566  T
Q  162 gaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  ||||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  27357565 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 27357487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 241
Target Start/End: Original strand, 22375073 - 22375284
Alignment:
Q  29 aggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttg 128  Q
    |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||   | || ||||| | |||||||||| |     
T  22375073 aggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgatattgattgtgcttctaagttgggtctt 22375172  T
Q  129 attgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttg 228  Q
      | | || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  22375173 gctatgtcgaatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcc-gtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 22375271  T
Q  229 gtagagattttga 241  Q
    |||||||||||||    
T  22375272 gtagagattttga 22375284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Original strand, 22421506 - 22421723
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||  ||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||  | || ||||| | ||||||||    
T  22421506 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 22421605  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    || |   | | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||    
T  22421606 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctat 22421705  T
Q  224 gtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| | | ||||||||    
T  22421706 gtttgatcgtgattttga 22421723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19981149 - 19980917
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||   || ||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  19981149 aatgaggatcggctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 19981050  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | ||  |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  19981049 gtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 19980950  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  19980949 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 19980917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22523683 - 22523507
Alignment:
Q  54 cctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaa 153  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||  | || ||||| | |||||||||| |   | | || |||||||| ||||| |    
T  22523683 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagaga 22523584  T
Q  154 tggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||   || ||||||||||||    
T  22523583 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttttctatgtttggt 22523507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21254082 - 21253895
Alignment:
Q  54 cctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaa 153  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| | || ||| ||||| |  || |||||   |||||||||| |  |  | ||| ||||||| |||||||    
T  21254082 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattattttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21253983  T
Q  154 tggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | | ||||||||    
T  21253982 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttga 21253895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 241
Target Start/End: Original strand, 21391505 - 21391692
Alignment:
Q  54 cctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaa 153  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||| | |  || |||||   |||||||||| |  |  | ||| ||||||| |||||||    
T  21391505 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21391604  T
Q  154 tggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | | ||||||||    
T  21391605 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttga 21391692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 241
Target Start/End: Original strand, 21780831 - 21781018
Alignment:
Q  54 cctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaa 153  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||| | |  || |||||   |||||||||| |  |  | ||| ||||||| |||||||    
T  21780831 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21780930  T
Q  154 tggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | | ||||||||    
T  21780931 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttga 21781018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 241
Target Start/End: Original strand, 21785999 - 21786186
Alignment:
Q  54 cctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaa 153  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||| | |  || |||||   |||||||||| |  |  | ||| ||||||| |||||||    
T  21785999 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21786098  T
Q  154 tggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | | ||||||||    
T  21786099 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttga 21786186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22990227 - 22989995
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||  ||| | ||||  |||||| |||||||||| || ||| |||||| || |||||| |||||  | || |    
T  22990227 aatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgacagtacacctttagttgctattattgatactagtgctaaacattgttttattgctattgatt 22990128  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |  ||||||||| |   | | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  22990127 gtgcttcaaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaag 22990028  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  22990027 atgtcccttgtctatgtttggtcgtgattttga 22989995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19115582 - 19115350
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  19115582 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 19115483  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  19115482 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttga 19115384  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
      ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  19115383 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 19115350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 20015862 - 20016094
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  20015862 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 20015961  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  20015962 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 20016060  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
      ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  20016061 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 20016094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 17671621 - 17671853
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  17671621 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 17671720  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  17671721 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 17671820  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  17671821 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 17671853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 230
Target Start/End: Original strand, 21164267 - 21164358
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||  |||||||||||||||    
T  21164267 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggt 21164358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 241
Target Start/End: Original strand, 22245743 - 22245846
Alignment:
Q  138 aatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagatt 237  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  22245743 aatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagatt 22245842  T
Q  238 ttga 241  Q
    ||||    
T  22245843 ttga 22245846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 241
Target Start/End: Original strand, 22246161 - 22246264
Alignment:
Q  138 aatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagatt 237  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  22246161 aatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagatt 22246260  T
Q  238 ttga 241  Q
    ||||    
T  22246261 ttga 22246264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32603293 - 32603095
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  32603293 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 32603195  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||  | ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  32603194 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggttgtgattttga 32603095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 30310743 - 30310975
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||| || || |    
T  30310743 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgatt 30310842  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||      
T  30310843 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgc 30310941  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    | ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  30310942 gatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 30310975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18859725 - 18859527
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  18859725 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 18859627  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  18859626 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 18859527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15536435 - 15536333
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||| | ||||  |||||||| |||||| | |||||    
T  15536435 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttacgttgtcctttgtctatatttggtcgtgattt 15536336  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  15536335 tga 15536333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22031285 - 22031064
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| || || |    
T  22031285 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 22031186  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||| || |||||      
T  22031185 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgc 22031087  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    | ||||  |||||||||||||||    
T  22031086 gatgtcctttgtctatgtttggt 22031064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 22126558 - 22126779
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  22126558 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 22126657  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||| || ||||| |    
T  22126658 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgattacttctctcgtatgtttga 22126756  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
      ||||  |||||||||||||||    
T  22126757 aatgtcctttgtctatgtttggt 22126779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 22117808 - 22117995
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || ||  |||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  22117808 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatcgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 22117906  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  22117907 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 22117995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22042871 - 22042777
Alignment:
Q  147 ggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||  | ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  22042871 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 22042777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 22129346 - 22129448
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||  | ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  22129346 atatgaatggacagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 22129445  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  22129446 tga 22129448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 19481801 - 19481903
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||   ||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||| || | |||||    
T  19481801 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattt 19481900  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  19481901 tga 19481903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8757 - 8527
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  8757 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 8658  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  8657 gcatataagttgggtttggttgtatctgatataaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 8558  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8557 gtccattgtctatgtttggtagagattttga 8527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 5370 - 5594
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  5370 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 5469  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  5470 gcttataagttgggtctggttgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 5569  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagaga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5570 gtctgttgtctatgtttggtagaga 5594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7181 - 6957
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  7181 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 7082  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7081 gcttataagttgggtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggt 6982  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagaga 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  6981 gtccgttgtctatgtttggtagaga 6957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15268 - 15036
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | ||||    
T  15268 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcttttatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaat 15169  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  15168 gtgcatataagttgggtttgattgtatttgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctctagtttgtctaag 15069  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  15068 gtgtccattgtctatgtttcgtagagattttga 15036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6258 - 6026
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | || | |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||| | |||||| | |||  |  | |    
T  6258 aatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactgatgctacgcattgttttaatgctatttatt 6159  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | |||||||||| | | | | || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  6158 gtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaaaggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaag 6059  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  6058 atgtcctttgtcaatgtttggtcgagatgttga 6026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 1015 - 1245
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  1015 tgaggatcgaattatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 1114  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || |||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1115 gcttataagttgggtctggttgtatatgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggt 1214  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1215 gtccgttgtctatgtttggtagagactttga 1245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13676555 - 13676325
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  13676555 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 13676456  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  13676455 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 13676356  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13676355 gtccgttgtctatgtttggtagagactttga 13676325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14140785 - 14140553
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||     
T  14140785 aatgaggaaagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 14140686  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  14140685 gtgcatataagttgggtttgagtgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 14140586  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  14140585 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 14140553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15343525 - 15343305
Alignment:
Q  21 cttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagt 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15343525 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagt 15343426  T
Q  121 tgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtc 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| || ||||| |||||||   | ||    
T  15343425 tgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtaaagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatc 15343326  T
Q  221 tatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15343325 tatgtttggtagagattttga 15343305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13024450 - 13024221
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||     
T  13024450 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag-actcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 13024352  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  13024351 gtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgag 13024252  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagatttt 239  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13024251 gtgtccgttgtctatgtttggtagggatttt 13024221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 11385572 - 11385804
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||    
T  11385572 aatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgatgctactcattgtttcattgctttagaat 11385671  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  11385672 gtgcatataagttgggtctgattgtatttgatatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctcttgtttgtttgag 11385771  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  11385772 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 11385804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 14283529 - 14283749
Alignment:
Q  21 cttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagt 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  14283529 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttcattgctattatagacattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagt 14283628  T
Q  121 tgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtc 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||   | ||    
T  14283629 tgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatc 14283728  T
Q  221 tatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14283729 tatgtttggtagagattttga 14283749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 15099746 - 15099978
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||  | || |    
T  15099746 aatgaggaccgacttatcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgctgttgatt 15099845  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  15099846 gtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 15099945  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15099946 gtgtctgttgtctatgtttggtagagactttga 15099978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 16947615 - 16947846
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | ||||    
T  16947615 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaat 16947714  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  16947715 gtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgag 16947814  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  16947815 atgtccattgtctatgtttggtagagactttg 16947846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 12798644 - 12798876
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||   | || |    
T  12798644 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgatt 12798743  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  12798744 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctcttatttgtctaag 12798843  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12798844 ttgtctgttgtctatgtttggtagagactttga 12798876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 18051096 - 18051328
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||     
T  18051096 aatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 18051195  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  18051196 gtgcatataggttgggtttgattgtgtctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctggtttgcttgag 18051295  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  18051296 gtgtccaatttctatgtttggtagagattttga 18051328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12459734 - 12459503
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||| |||||  | ||||    
T  12459734 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactaattgttttattgctattgaat 12459635  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12459634 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaag 12459535  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12459534 gtgtccgttatctatgtttggtagagactttg 12459503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 12203943 - 12204175
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | || |    
T  12203943 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgttgttgatt 12204042  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || || | || | |||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||    
T  12204043 gtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactctagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgag 12204142  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12204143 ttgtccattgtctatgtttggtagagattttga 12204175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19150117 - 19149885
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||   | || |    
T  19150117 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgatt 19150018  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  19150017 gtgcatataagttaggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 19149918  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  19149917 ttgtccattgtctatgtttggtagagactttga 19149885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20749516 - 20749284
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||   | || |    
T  20749516 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgatt 20749417  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  20749416 gtgcatataagttaggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 20749317  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  20749316 ttgtccattgtctatgtttggtagagactttga 20749284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 26091941 - 26092172
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||    
T  26091941 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 26092040  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  |    
T  26092041 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 26092140  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  26092141 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 26092172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 14261389 - 14261615
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||   | || |    
T  14261389 aatgaggaccgacttatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgatt 14261488  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||    
T  14261489 gagcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgag 14261588  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagaga 235  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||    
T  14261589 ttgtccattgtctatgtttggtagaga 14261615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49155407 - 49155176
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||    
T  49155407 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 49155308  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  |    
T  49155307 gtgcatataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 49155208  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  49155207 gtgtcccatatctatgtttggtagagattttg 49155176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Original strand, 13965810 - 13966042
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | |||    
T  13965810 caatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaa 13965909  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || ||| |      
T  13965910 tgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctgg 13966009  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  13966010 ggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 13966042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 26115733 - 26115964
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||| |||||  | ||||    
T  26115733 aatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaat 26115832  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  |    
T  26115833 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 26115932  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  26115933 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 26115964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21755519 - 21755289
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||| |||||  | |||    
T  21755519 caatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaa 21755420  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| | |    
T  21755419 tgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatggaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctga 21755320  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  21755319 ggtgtcctatatctatgtttggtagagattt 21755289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Original strand, 40924960 - 40925147
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||    
T  40924960 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 40925059  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 196  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40925060 gtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 40925147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 44788516 - 44788748
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  44788516 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 44788615  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  44788616 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 44788714  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
      ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  44788715 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 44788748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14335501 - 14335269
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  14335501 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 14335402  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  14335401 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 14335303  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
      ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  14335302 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 14335269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Original strand, 11550268 - 11550499
Alignment:
Q  10 atgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatg 109  Q
    ||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| || || ||    
T  11550268 atgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcttttgattg 11550367  T
Q  110 tgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    || || |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||  |    
T  11550368 tgtatctgccttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcg 11550466  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  11550467 ttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 11550499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14957625 - 14957427
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  14957625 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 14957527  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||  | ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  14957526 tgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 14957427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8710710 - 8710489
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  8710710 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 8710611  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  8710610 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 8710512  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
      ||||  |||||||||||||||    
T  8710511 aatgtcctttgtctatgtttggt 8710489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 17703620 - 17703852
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||| ||||||||| ||| || ||||| || || |    
T  17703620 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgctttcgatt 17703719  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||| || |||||      
T  17703720 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgc 17703818  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    | ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  17703819 gatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 17703852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13689112 - 13688925
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  13689112 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtgtctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 13689014  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  13689013 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 13688925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18180724 - 18180616
Alignment:
Q  133 tatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtag 232  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| |    
T  18180724 tatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcg 18180625  T
Q  233 agattttga 241  Q
     ||||||||    
T  18180624 tgattttga 18180616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8201023 - 8200921
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  8201023 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 8200924  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  8200923 tga 8200921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9591339 - 9591237
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||  || |||||||||||| | |||||    
T  9591339 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattt 9591240  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  9591239 tga 9591237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 18587336 - 18587557
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| ||| |||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  18587336 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 18587435  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  18587436 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 18587534  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
      ||||  |||||||||||||||    
T  18587535 aatgtcctttgtctatgtttggt 18587557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 11234412 - 11234599
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||  | ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  11234412 ttaataatactcctttagttgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttt-tctgata 11234510  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  11234511 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 11234599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10873662 - 10873563
Alignment:
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  10873662 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 10873563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 196
Target Start/End: Original strand, 15146133 - 15146275
Alignment:
Q  54 cctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaa 152  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | || ||||| | |||||||||| ||| || | ||  ||||||| |||||     
T  15146133 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttgctt-tgtcggatatgaatggagag 15146231  T
Q  153 atggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 196  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  15146232 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 15146275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12690468 - 12690375
Alignment:
Q  148 gagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||  | ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  12690468 gagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 12690375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15627609 - 15627397
Alignment:
Q  29 aggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-tt 127  Q
    |||||| || |||||| |||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| ||| | |||||| |||||  | || |||||   || ||||||| ||    
T  15627609 aggtacatgcttctttgatagtactcctttaattactattattgatactggtgatacgcattgttttattgccgttgattgtgctcctatgttgggtctt 15627510  T
Q  128 gattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgttt 227  Q
    |||  | || | |||||| |  ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||   ||| | ||||||    
T  15627509 gata-tgtcgagtatgaatgaggaaatggttttcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtctaaggtgttctttgccgatgttt 15627411  T
Q  228 ggtagagattttga 241  Q
    ||| |||| |||||    
T  15627410 ggtcgagactttga 15627397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14042785 - 14042581
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||| ||||  ||| ||||||  |||||| ||| |||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | || |||||   ||||||||    
T  14042785 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14042686  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    || |   | | || ||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||  || ||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||    
T  14042685 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctat 14042586  T
Q  224 gtttg 228  Q
    |||||    
T  14042585 gtttg 14042581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14352815 - 14352611
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||| ||||  ||| ||||||  |||||| ||| |||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | || |||||   ||||||||    
T  14352815 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14352716  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    || |   | | || ||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||  || ||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||    
T  14352715 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctat 14352616  T
Q  224 gtttg 228  Q
    |||||    
T  14352615 gtttg 14352611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 15158256 - 15158443
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  15158256 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 15158354  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  15158355 tgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 15158443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 241
Target Start/End: Original strand, 65456 - 65689
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    |||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  65456 caatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttccttgctttagaa 65555  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  65556 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaa 65655  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||   | || ||||||||||||||||||||    
T  65656 ggtgtcctatatccatgtttggtagagattttga 65689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 9957 - 10177
Alignment:
Q  21 cttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagt 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9957 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagt 10056  T
Q  121 tgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtc 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||   | ||    
T  10057 tgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatc 10156  T
Q  221 tatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10157 tatgtttggtagagattttga 10177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 263351 - 263139
Alignment:
Q  29 aggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  263351 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttg 263252  T
Q  129 attgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttg 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||   | ||||||||||    
T  263251 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 263152  T
Q  229 gtagagattttga 241  Q
    |||||||||||||    
T  263151 gtagagattttga 263139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 9933 - 10163
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||| |    
T  9933 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaattt 10032  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  10033 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgtctaagat 10132  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10133 gtccgttgtctatgtttagtagagactttga 10163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 24119 - 24323
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||| ||||||| | |||||| |||||  | || |||||   |||||| |    
T  24119 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttag 24218  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    || |   | | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||| || ||||  ||||||||    
T  24219 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgcgtttgagatgtcctttgtctat 24318  T
Q  224 gtttg 228  Q
    |||||    
T  24319 gtttg 24323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 8623 - 8853
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||  | ||||||    
T  8623 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgt 8722  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8723 gcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggt 8822  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8823 gtccgttgtctatgtttggtagagactttga 8853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 18837 - 19067
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||  | ||||||    
T  18837 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgt 18936  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18937 gcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggt 19036  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19037 gtccgttgtctatgtttggtagagactttga 19067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 98744 - 98974
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |  | ||||||    
T  98744 tgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattactattgaatgt 98843  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  98844 gcttataagttgggtctggttgtatctaatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggt 98943  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  98944 gttcgttgtctatgtttggtagagactttga 98974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 176123 - 175901
Alignment:
Q  18 cgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatata 117  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | || ||||||||||    
T  176123 cgacttatcagaggtacttatttcttta-tagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatata 176025  T
Q  118 agttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgtt 217  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||  ||    
T  176024 agttgggtctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtttgagttgtccatt 175925  T
Q  218 gtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  175924 gtctatgtttggtagagattttga 175901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 325850 - 325620
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  325850 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatattactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 325751  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |    
T  325750 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagat 325651  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  325650 gtctgttgtctatgtttggtagagactttga 325620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 200627 - 200859
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||   | || |    
T  200627 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactagtgctacacattgtttcattgttgttgatt 200726  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || || | || | |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |     
T  200727 gtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgat 200826  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  200827 ttgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 200859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23274338 - 23274108
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  23274338 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 23274239  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  23274238 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 23274139  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23274138 gtccgttgtctatgtttggtagagactttga 23274108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 19716715 - 19716945
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  19716715 tgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 19716814  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |    
T  19716815 gcttataagttgggtttagttgtatctgatttgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgagat 19716914  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  19716915 gtccattgtctatgtttggtagagactttga 19716945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12577100 - 12576868
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  12577100 aatgaggaccgcctcatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaat 12577001  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || || || ||    
T  12577000 gtgcctataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaatgactacttctctggtttgcttgag 12576901  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  12576900 gtgtccaatttctatgtttggtagagattttga 12576868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20848336 - 20848105
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||    
T  20848336 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 20848237  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  |    
T  20848236 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 20848137  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  20848136 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 20848105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 23097734 - 23097945
Alignment:
Q  29 aggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttg 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  23097734 aggtacttgattctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatttaagttgggtctg 23097833  T
Q  129 attgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttg 228  Q
     ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||   | ||||||||||    
T  23097834 gttgtaactgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 23097933  T
Q  229 gtagagattttg 240  Q
    ||||||||||||    
T  23097934 gtagagattttg 23097945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23113461 - 23113238
Alignment:
Q  18 cgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||   | || ||||||||||    
T  23113461 cgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatata 23113362  T
Q  118 agttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgtt 217  Q
    | |||||| || || | || | |||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||  ||    
T  23113361 aattgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccatt 23113262  T
Q  218 gtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23113261 gtctatgtttggtagagattttga 23113238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 24817575 - 24817768
Alignment:
Q  48 agtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaag 147  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | || ||||| | |||||||||| | |   | || |||||||| |    
T  24817575 agtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatg 24817674  T
Q  148 gagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  24817675 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttga 24817768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 19721278 - 19721365
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcatt 98  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  19721278 tgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 19721365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 30208616 - 30208847
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    || |    
T  30208616 aatgaggatcatctgatcaaaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattgctgctgatt 30208715  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  |  || |||||| |  || | ||   ||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||| || ||||||||| ||||     
T  30208716 gtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcgtctatgaaaggggaaatggttgtcgaaaccccggcaaagggttcggtgactaattttctagtgtgcttaaa 30208815  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  30208816 gtgtcctttgtcgatgtttgatagagattttg 30208847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 228
Target Start/End: Original strand, 22733515 - 22733689
Alignment:
Q  54 cctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaa 153  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||   |||||||||| |  |  | ||| ||||||| |||||||    
T  22733515 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcgttgatttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 22733614  T
Q  154 tggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttg 228  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  22733615 tggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtataagatgtcccttgtctatgtttg 22733689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 23105554 - 23105656
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | | |||||    
T  23105554 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 23105653  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  23105654 tga 23105656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17001747 - 17001515
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  17001747 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 17001648  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  17001647 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 17001549  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
      ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  17001548 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 17001515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23074563 - 23074391
Alignment:
Q  56 tttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatg 155  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |||||   |||||||||| |   | | ||| ||||||| ||||| |||    
T  23074563 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatg 23074464  T
Q  156 gttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttg 228  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  23074463 gttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 23074391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 45673708 - 45673940
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || | ||| ||||| | |||||| ||||| || || |    
T  45673708 aatgaggatcgattgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggagctacgcattgttttattgctttcgatt 45673807  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  45673808 gtgattctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgag 45673907  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  45673908 atgtcttttgtctatgtttggtcgtgattttga 45673940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 21322962 - 21323183
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||   || ||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  21322962 aatgaggatcgcctaatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 21323061  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | ||  |||||| |  || | ||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  21323062 gtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 21323161  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
     ||||  |||||||||||||||    
T  21323162 atgtcctttgtctatgtttggt 21323183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 22323038 - 22323270
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  22323038 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 22323137  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  22323138 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 22323236  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
      ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  22323237 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 22323270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 24705178 - 24705410
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||||||||   |||||| || ||||||| ||| |||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  24705178 aatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 24705277  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | ||  |||||| |||||| | ||| ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||| |    
T  24705278 gtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatgcagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtaactacttctctcgtatgtttga 24705376  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    | || |  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  24705377 gatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttga 24705410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24712781 - 24712549
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  24712781 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 24712682  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  24712681 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 24712583  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
      ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  24712582 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 24712549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 44383266 - 44383498
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  44383266 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 44383365  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  44383366 gtgtttctgttttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 44383464  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
      ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  44383465 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 44383498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9338329 - 9338097
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  9338329 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 9338230  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  9338229 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 9338130  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  9338129 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 9338097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9486963 - 9486731
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  9486963 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 9486864  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  9486863 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 9486764  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  9486763 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 9486731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 11351407 - 11351639
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || || |||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  11351407 aatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 11351506  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | ||  |||||| |   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  11351507 gtgcttctactttgggtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 11351606  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  11351607 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 11351639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16983987 - 16983755
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  16983987 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 16983888  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  16983887 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 16983788  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  16983787 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 16983755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27220729 - 27220531
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  27220729 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 27220631  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  27220630 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 27220531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 24657484 - 24657586
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  24657484 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 24657583  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  24657584 tga 24657586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27373982 - 27373795
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  27373982 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 27373884  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  27373883 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 27373795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10871597 - 10871376
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  10871597 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 10871498  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  10871497 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 10871399  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
      ||||  |||||||||||||||    
T  10871398 aatgtcgtttgtctatgtttggt 10871376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24678104 - 24678002
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  24678104 atatgaatggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 24678005  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  24678004 tga 24678002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 196
Target Start/End: Original strand, 22742706 - 22742849
Alignment:
Q  53 tcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaa 152  Q
    ||||||| |||||||||| |  ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||| | ||  |||||| |  || | ||| ||||||| |||||     
T  22742706 tcctttagttgctattattggtactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagag 22742805  T
Q  153 atggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 196  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  22742806 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 23029191 - 23029378
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatat 142  Q
    |||||| || ||| ||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||| | |   |||||| |  || | ||| ||||    
T  23029191 ttaataatactcccttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 23029290  T
Q  143 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    ||| ||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||  |||||||||||||||    
T  23029291 gaatggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggt 23029378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 21142867 - 21142969
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  21142867 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 21142966  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  21142967 tga 21142969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 24874576 - 24874678
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  24874576 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttcggtgactacttctctcgtatgtttcaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 24874675  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  24874676 tga 24874678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23065113 - 23064973
Alignment:
Q  56 tttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatg 155  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |||||   |||||||||| |   | | ||| ||||||| ||||| |||    
T  23065113 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatg 23065014  T
Q  156 gttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 196  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  23065013 gttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 19817594 - 19817503
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgc 100  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||| || |||||    
T  19817594 aatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactactacagatactggtgctacacattgctttattgc 19817503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23279343 - 23279291
Alignment:
Q  189 acttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23279343 acttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 23279291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23204931 - 23204874
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 196  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  23204931 atatgaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctct 23204874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 203506 - 203294
Alignment:
Q  29 aggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  203506 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttg 203407  T
Q  129 attgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttg 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||   | ||||||||||    
T  203406 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 203307  T
Q  229 gtagagattttga 241  Q
    |||||||||||||    
T  203306 gtagagattttga 203294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 424323 - 424266
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 196  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  424323 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 724 - 496
Alignment:
Q  13 aggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgc 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||    
T  724 aggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgc 625  T
Q  113 atataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgt 212  Q
     |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  624 ttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccatctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgt 525  T
Q  213 ctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  524 ccgttgtctatgtttggtagagactttga 496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 716 - 936
Alignment:
Q  21 cttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagt 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  716 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagt 815  T
Q  121 tgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtc 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||   | ||    
T  816 tgggtttgattgtatctgatatgaaaggagagatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttcccttgtttgtttgaggtgtcctctatc 915  T
Q  221 tatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  916 tatgtttggtagggattttga 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10916 - 10699
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || | ||||||||| | |||||| ||||   | || |||||   ||||||||    
T  10916 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgg 10817  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    || |   | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||  ||||||||    
T  10816 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtccattgtctat 10717  T
Q  224 gtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||| | ||||||||    
T  10716 gtttggtcgtgattttga 10699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20957 - 20727
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  20957 tgaggatctacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 20858  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || |||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |    
T  20857 gcttataagttgggtctggtcgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagtt 20758  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20757 gtccgttgtctatgtttggtagagactttga 20727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 646 - 878
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||  ||||||    
T  646 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctacacaatgtttaattgctatagaat 745  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||| ||||| | |   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  746 gtgcatataagatgggtataaaaatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaa 845  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  846 atgtccgttgtctatgtttagtagagactttga 878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12872 - 12640
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | || |    
T  12872 aatgaggaccaacttatcaggggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 12773  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12772 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaag 12673  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  12672 ttgtccattgtctatgtttggtagagactttga 12640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42843 - 42611
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||   | || |    
T  42843 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttatttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgtagttgatt 42744  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||    
T  42743 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaag 42644  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  42643 gtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 42611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 50504 - 50736
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||   || ||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  50504 aatgaggatcgcctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 50603  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | ||  |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||| |     
T  50604 gtgcttctaccttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcatatgtttgaa 50703  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  50704 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 50736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54190 - 53966
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  54190 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgt 54091  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || ||||||||| || || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  54090 gcttataagttgtgtctggttgtatctgatatgaatgtagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtgtgtctaaggt 53991  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagaga 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  53990 gtccgttgtctatgtttggtagaga 53966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Original strand, 67266 - 67498
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||    
T  67266 caatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgccttagaa 67365  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||      
T  67366 agtgcatataagttgggtttgattgtatccgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgg 67465  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  67466 ggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 67498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 1472 - 1702
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | || |||    
T  1472 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgt 1571  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||    
T  1572 gcatataagttgggtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggt 1671  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1672 gtccgttgtctatgtttggtagagactttga 1702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7887 - 7657
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | || |||    
T  7887 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgt 7788  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||    
T  7787 gcatataagttgggtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggt 7688  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7687 gtccgttgtctatgtttggtagagactttga 7657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 14 - 246
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||  | || |    
T  14 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatacgggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 113  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  114 gtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtataag 213  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     |||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  214 atgtacgttgtctatgtttggtagagactttga 246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 9388 - 9612
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  9388 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcattaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 9487  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
     | |||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  9488 acttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaacgggaaatagttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 9587  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagaga 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  9588 gtccgttgtctatgtttggtagaga 9612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1253 - 1033
Alignment:
Q  21 cttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagt 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||| |||||||    
T  1253 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagt 1154  T
Q  121 tgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtc 220  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  1153 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtc 1054  T
Q  221 tatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  1053 tatgtttggtagagactttga 1033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22267 - 22035
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||  | ||||    
T  22267 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattggtattatagatactggtgttactcattgtttcattgctattgaat 22168  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  22167 gtgcatatatgttgggtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactttagctaagtgttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 22068  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22067 gtgtccattgtctatgtttggtagagattttga 22035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 63678 - 63910
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||   | || |    
T  63678 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtgttactcattgtttcattgttgttgatt 63777  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  63778 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 63877  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  63878 ttgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 63910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 5304 - 5535
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | ||||    
T  5304 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaat 5403  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  5404 gtgcttataagttgggtatggatgtatctgatatgaaaagagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgag 5503  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  5504 gtgtccattgtttatgtttggtagagattttg 5535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 30485 - 30716
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||   | ||||    
T  30485 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaaaagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgatattgaat 30584  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  30585 gtgcatataagttgggtttggttgtatctgatatgaaaggggtaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 30684  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30685 ttgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 30716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37074 - 36852
Alignment:
Q  19 gacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||   | || |||||||| ||    
T  37074 gacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatacaa 36975  T
Q  119 gttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttg 218  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  36974 gttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttg 36875  T
Q  219 tctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  36874 tctatgtttggtagagactttga 36852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 974 - 1206
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||  | || |    
T  974 aatgaggacagacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcccttaattgctattatagacactagtgctactcattgttttattgctattgatt 1073  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | | ||||    
T  1074 gtgcatataagttgggtctggctgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttttctaag 1173  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1174 atgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 1206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 20687 - 20919
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | || |    
T  20687 aatgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 20786  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  20787 gtgcatataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 20886  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20887 gtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 20919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 12507 - 12739
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | || |    
T  12507 aatgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 12606  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||||||||| |||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  12607 gtgcatataaattggatctggttgtatcaaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 12706  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12707 gtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 12739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 50250 - 50018
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | || |    
T  50250 aatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 50151  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  50150 gtgcatataagttggggctagttgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 50051  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  50050 ttgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 50018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 251767 - 251536
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||  | ||||    
T  251767 aatgaggaccggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaat 251668  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  251667 gtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgag 251568  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  251567 atgtccattgtctatgtttggtagagactttg 251536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 151692 - 151486
Alignment:
Q  29 aggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttg 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||    
T  151692 aggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttg 151593  T
Q  129 attgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttg 228  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  151592 gttgtatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttg 151493  T
Q  229 gtagaga 235  Q
    |||||||    
T  151492 gtagaga 151486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Original strand, 23707 - 23924
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||  | || ||||| | ||||||||    
T  23707 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 23806  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    || |   | | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||    
T  23807 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttgtctat 23906  T
Q  224 gtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  23907 gtttggtcgagattttga 23924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 1431 - 1663
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgc-gttagaa 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |     
T  1431 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgtta-at 1529  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |    
T  1530 tgtgcatataagttgggtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttga 1629  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  1630 gttgtccattgtctatgtttggtagagactttga 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 28444 - 28676
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgc-gttagaa 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |     
T  28444 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgtta-at 28542  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |    
T  28543 tgtgcatataagttgggtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttga 28642  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  28643 gttgtccattgtctatgtttggtagagactttga 28676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12105 - 11881
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||  | || |    
T  12105 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggcgctactcattgtttcattgctgttgatt 12006  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || || | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  12005 gtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 11906  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtaga 233  Q
     |||| |||||||||||||||||||    
T  11905 ttgtccgttgtctatgtttggtaga 11881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 53582 - 53814
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||  |||||     
T  53582 aatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctactcattgtttcaatgctatagaaa 53681  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  53682 gtgcatataagttaggtttaattgtatctgaaatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 53781  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  53782 atgtccattgtctatgtttggtagagactttga 53814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 1042 - 1274
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||   | || |    
T  1042 aatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagctactggtgctactcattatttcattgttgttgatt 1141  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  1142 gtgcgcataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 1241  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1242 atgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 1274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Original strand, 6416 - 6603
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||     
T  6416 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctataatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 6515  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  6516 gtgcttataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctct 6603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11954 - 11723
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||    
T  11954 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 11855  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  |    
T  11854 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 11755  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  11754 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 11723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11122 - 10899
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||   ||||||     
T  11122 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatttttttagaaa 11023  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  11022 gtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatacttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggg 10923  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtag 232  Q
    |||||   | ||||||||||||||    
T  10922 gtgtcctatatctatgtttggtag 10899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 164562 - 164783
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  164562 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgccattgaatgt 164661  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    || |||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || | | ||||||    
T  164662 gcttataagttgggtctggttatatctgataagaaaggggaaatggttgttgaaactccagcaaatggttcaataactacttctcttgtttatctaaggt 164761  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtag 232  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  164762 gtctattgtctatgtttggtag 164783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 47145 - 47373
Alignment:
Q  12 gaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtg 111  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||||| ||  |||||||||||| |||||| |||||  | || ||||    
T  47145 gaggatcgctttatcagaggtacttgttattttaatagtacacctttagttactattattgattctggtgctacacattgttttattgctattgattgtg 47244  T
Q  112 catataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtg 211  Q
    |   |||||||||| |   | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  47245 ctactaagttgggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagg-ttcggtgactacttctcttgtgtgtttaaggtg 47343  T
Q  212 tctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||||||||||| | | ||||||||    
T  47344 tcttttgtctatgtttgatcgtgattttga 47373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 152096 - 151994
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | | |||||    
T  152096 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 151997  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  151996 tga 151994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 205
Target Start/End: Original strand, 30777 - 30929
Alignment:
Q  53 tcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaa 152  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||| | |   |||||| |  || | ||| ||||||| |||||     
T  30777 tcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagag 30876  T
Q  153 atggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgttt 205  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  30877 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 30929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 39494 - 39723
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||||    
T  39494 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgt 39593  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggt 210  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  |||    
T  39594 gcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggt 39693  T
Q  211 gtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||   | ||||||||||||||||||||||    
T  39694 gtcctatatctatgtttggtagagattttg 39723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Original strand, 44656 - 44818
Alignment:
Q  79 gtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaaggg 178  Q
    ||||||| | ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  44656 gtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaaggg 44755  T
Q  179 ttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44756 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 44818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5060 - 4839
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||| | || | |||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |  | || |    
T  5060 aatgaggatcgattaattagaggtacatgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgatt 4961  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | ||||||||||||  || | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  4960 gtgcttctaagttgggttttgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtgtgtttaac 4861  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
     ||||  |||||| ||||||||    
T  4860 atgtcctttgtctttgtttggt 4839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14438 - 14337
Alignment:
Q  140 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagatttt 239  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | |||  | ||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  14438 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttt 14339  T
Q  240 ga 241  Q
    ||    
T  14338 ga 14337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29672 - 29440
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||  | || |    
T  29672 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgcagttgatt 29573  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || || | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||    
T  29572 gtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcacttgtttgtttgag 29473  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  29472 ttgtccattgtctatgtttggtagagactttga 29440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5938 - 5718
Alignment:
Q  21 cttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagt 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||  |  |||||||||||||||    
T  5938 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattatagatactagtgctactcattgtttcattgctatttaatgtgcatataagt 5839  T
Q  121 tgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtc 220  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||||||    
T  5838 tgggtctggttgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtc 5739  T
Q  221 tatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  5738 tatgtttggtagagactttga 5718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 100
Target Start/End: Original strand, 41267 - 41358
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgc 100  Q
    ||||||||||  || |||| |||||| |||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  41267 aatgaggatcatctgatcagaggtacatgttacattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattgc 41358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Original strand, 514511 - 514743
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | |||    
T  514511 caatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaa 514610  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |      
T  514611 tgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgg 514710  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  514711 ggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 514743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 441759 - 441568
Alignment:
Q  48 agtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaag 147  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||   |||||| |||||  | || ||||| | ||| |||||| | | | | || |||||||| |    
T  441759 agtactcctttagttgctattattgatactggtgctacggattgttttattgctcttgattgtgcttctaaattgggtcttactatgtcaaatatgaatg 441660  T
Q  148 gagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagatttt 239  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  441659 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagatttt 441568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 496165 - 495935
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||| ||||||||| |||||| |||||  | || |    
T  496165 aatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtagacctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgctattgatt 496066  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| |  ||||||||| |   | | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||||    
T  496065 gtgcttcgaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtttttaag 495966  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagatttt 239  Q
     |||   ||||||||||||||| ||||||||    
T  495965 atgttctttgtctatgtttggtcgagatttt 495935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 36 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 60857 - 60652
Alignment:
Q  36 tgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtat 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | || |||||||||||||||||| |  || |||    
T  60857 tgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatat 60758  T
Q  136 ctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagaga 235  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  60757 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 60658  T
Q  236 ttttga 241  Q
     |||||    
T  60657 ctttga 60652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 70253 - 70079
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | || |    
T  70253 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 70154  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcag 183  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  70153 gtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 70079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5326 - 5094
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | || |    
T  5326 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 5227  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| || ||| ||||    
T  5226 gtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctgaggtttcagtaactatttctcttgtttgtctaag 5127  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     |||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  5126 ttgtccgttgtcaatgtttggtagagactttga 5094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2996 - 2784
Alignment:
Q  29 aggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||||||||||||||||| ||    
T  2996 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggggctactcattgtttcattgttgttgcttgtgcatataagttgggtctg 2897  T
Q  129 attgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttg 228  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||  |||||||||||||    
T  2896 gttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttg 2797  T
Q  229 gtagagattttga 241  Q
    ||||||| |||||    
T  2796 gtagagactttga 2784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 70
Target Start/End: Original strand, 11904 - 11963
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattat 70  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11904 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 11963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 205
Target Start/End: Original strand, 2 - 189
Alignment:
Q  18 cgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatata 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2 cgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctattcattgtttcattgctttagaaagtgcatata 101  T
Q  118 agttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgttt 205  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  102 agttgagtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgttt 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 607 - 375
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  | |||||| |||||  | |||    
T  607 caatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctagtcattgttttattgctattgaa 508  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |      
T  507 tgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgg 408  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  407 ggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 43578 - 43802
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||   | || |    
T  43578 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgatt 43677  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || || | ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||    
T  43678 gtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgag 43777  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtaga 233  Q
     ||||  ||||||||||||||||||    
T  43778 ttgtccattgtctatgtttggtaga 43802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25216 - 25129
Alignment:
Q  154 tggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| | || ||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25216 tggttgtcgaaactcgagctaagggttcgataactacttctttggtttgtttgagttgtccgttgtctatgtatggtagagattttga 25129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30080 - 29848
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | |||    
T  30080 caatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaa 29981  T
Q  108 tgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| || ||| |      
T  29980 tgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaagaaccacttctcttgtttgtctgg 29881  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  29880 ggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 29848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 102 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26164 - 26025
Alignment:
Q  102 ttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26164 ttagaatgtgcatataagttgggcctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagttt 26065  T
Q  202 gtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26064 gtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 26025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11973 - 11743
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  | || |    
T  11973 aatgaggaccgacttattagagatacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaccatggtgctacacattgtttcattgctattgatt 11874  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||   |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||    
T  11873 gtgcatataagttgggtctgattg--tcaggtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgag 11776  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11775 ttgtcctttgtctatgtttggtagagattttga 11743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1866 - 1634
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||   | || |    
T  1866 aatgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgatt 1767  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || || | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||    
T  1766 gtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttcttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttctttgtttgag 1667  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     | ||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  1666 ttttccactgtctatgtttggtagagactttga 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 4248 - 4480
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||  | || |    
T  4248 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 4347  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| |  || | || | |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| ||    
T  4348 gtgcatataagttgggtctacttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgtttgag 4447  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  4448 ttgtcctttgtctatgtttggtagagactttga 4480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5747 - 5515
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||   | |  |    
T  5747 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgttt 5648  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
     |||||||||||||||| || || | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||| |     
T  5647 atgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttatttgtttgac 5548  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5547 ttgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 5515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 4463 - 4659
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | || |    
T  4463 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 4562  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgttt 205  Q
    |||||||||||||||||  | || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4563 gtgcatataagttgggtcgggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtatgttt 4659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34482 - 34250
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | ||||    
T  34482 aatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgaat 34383  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
     || |||||||||||||  | |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||| ||||    
T  34382 atgtatataagttgggtccggttgtatctgatatgaaagtggaaatggttgttgaaattccagctaagggttcagtagctatttctcttgtttgtctaag 34283  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34282 gtgtccgttgtctatgtttggtaaagactttga 34250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 110727 - 110523
Alignment:
Q  37 gtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatc 136  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||   | || |||||||||||||||||| || |||| ||    
T  110727 gtttctttaatagtactcctttaattgctgttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtgtc 110628  T
Q  137 taatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagat 236  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  110627 tgatatgaaaggagaaatggttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagac 110528  T
Q  237 tttga 241  Q
    |||||    
T  110527 tttga 110523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 4051 - 4274
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  | || |    
T  4051 aatgaggaccgacttataagaggtacttgtttctttaatagtactc---taattgctattattgacactggtgctacactttgtttcattgctgttgatt 4147  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||||||||||||||| || || | || | |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  4148 gtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttatcttgtttgtttaag 4247  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagaga 235  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||    
T  4248 atgtcaattgtctatgtttggtagaga 4274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 41880 - 41693
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||    
T  41880 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 41781  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 196  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41780 gtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 41693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21946 - 21764
Alignment:
Q  59 aattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggtt 158  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  21946 aattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataaattgggtttgattatatctgatatgaaaggagaaatggtc 21847  T
Q  159 gttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||   | |||||||| ||||| ||||||||    
T  21846 gttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgttcggtagggattttga 21764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 241
Target Start/End: Original strand, 49086 - 49268
Alignment:
Q  59 aattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggtt 158  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||   | || |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49086 aattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 49185  T
Q  159 gttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49186 gttgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttga 49268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 162
Target Start/End: Original strand, 9182 - 9333
Alignment:
Q  11 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||    
T  9182 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 9281  T
Q  111 gcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttg 162  Q
    || ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9282 gcttataagttgggtcaggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttg 9333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Original strand, 2019 - 2132
Alignment:
Q  21 cttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagt 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2019 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataagt 2118  T
Q  121 tgggtttgattgta 134  Q
    ||||||||||||||    
T  2119 tgggtttgattgta 2132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18003 - 17791
Alignment:
Q  29 aggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttg 128  Q
    |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||  | || ||||| | |||||||||| |     
T  18003 aggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctgttgattgtgcgtctaagttgggtctt 17904  T
Q  129 attgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttg 228  Q
    | | | || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  17903 actatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 17804  T
Q  229 gtagagattttga 241  Q
    || |||| |||||    
T  17803 gtcgagactttga 17791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 111066 - 111298
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||  ||||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | || |    
T  111066 aatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttattttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgatt 111165  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||   |||||||||| |   | | || |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||   | ||||||||||| |||||||||||    
T  111166 gtgctactaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtttgttgactacttctcttgtgtgtttaag 111265  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     || |  |||| |||||||| | | ||||||||    
T  111266 atgccctttgtttatgtttgatcgtgattttga 111298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 15138 - 15370
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||| | || | |||||| ||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||||||| | |||||| |||||  | || |    
T  15138 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagttgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctcttgatt 15237  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | |||||||||| | | | | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  15238 gtgcttctaagttgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtttaag 15337  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     | ||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  15338 atatcctttatctatgtttggtagatattttga 15370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 23457 - 23689
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||| | |||| |||||| ||||  ||| |||||| ||||||| |||||||||| || | | ||||||| | |||||| |||||  | ||      
T  23457 aatgaggatcgattaatcagaggtacgtgttattttgatagtactcctttagttgctattattgataatagtgctacgcattgttttattgctcttgata 23556  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | |||||||||| |   | | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||    
T  23557 gtgcttctaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggcgactacttctcttgtgtgtttaag 23656  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  23657 atgtcatttatctatgtttggtagagattttga 23689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 9549 - 9742
Alignment:
Q  48 agtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaag 147  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | || ||||| | |||||||||| | |   | || |||||||| |    
T  9549 agtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatg 9648  T
Q  148 gagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  9649 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttga 9742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 19140 - 19256
Alignment:
Q  21 cttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagt 120  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||| |||||||    
T  19140 cttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagt 19239  T
Q  121 tgggtttgattgtatct 137  Q
    |||||||| ||||||||    
T  19240 tgggtttggttgtatct 19256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2144 - 1913
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||     || |    
T  2144 aatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctacgcattgttttattgttgctgatt 2045  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||   |||||||||| | ||| | ||  ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||| || || |     
T  2044 gtgctactaagttgggtcttattatgtcatatatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctttagtatgcttgaa 1945  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  1944 gtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttg 1913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 239
Target Start/End: Original strand, 13638 - 13868
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || | || |||||||| |||||  |||||  | || |    
T  13638 aatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattgatgctacacattgttctattgctattgatt 13737  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | |||||||||| |   | | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  13738 gtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagagttcggtgactacttctcttgtgtgattaag 13837  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagatttt 239  Q
     ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  13838 atgtccattgtctatgtttggtcgagatttt 13868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Original strand, 3443 - 3561
Alignment:
Q  123 ggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtcta 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||   | ||||    
T  3443 ggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatcta 3542  T
Q  223 tgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  3543 tgtttggtagggattttga 3561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1261 - 1132
Alignment:
Q  104 agaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||| || |||    
T  1261 agaatgtgcatataagttgggtctggttgtatccgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggt--------tacttctcttgtttgt 1170  T
Q  204 ttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1169 ctaagatgtctgttgtctatgtttggtagagactttga 1132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5213 - 5001
Alignment:
Q  29 aggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttg 128  Q
    |||||| |||| |||| |||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||   | || ||||| | |||||||||| |     
T  5213 aggtacatgttactttgatagtactcttttaattgctattattgatactggtgctacgcattgttttattggtgttgattgtgcttctaagttgggtctt 5114  T
Q  129 attgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttg 228  Q
     || | |  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  5113 gttatgttaaatatgaatggagatatggtcgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaaggtgtcctttgtcgatgtttg 5014  T
Q  229 gtagagattttga 241  Q
    || |||| |||||    
T  5013 gtcgagactttga 5001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 14425 - 14657
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| |||| |||| ||| || ||||||||| ||| |||| || ||||||||||||| |||||| ||| |  | || |    
T  14425 aatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatattactcctttaatagcttttattgatactggtgctacacattgttttatttctattgatt 14524  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||   |||||||||| |   | | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||||    
T  14525 gtgctcctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtatttaag 14624  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14625 atgtcctttgtctatgtttggtcgagattttga 14657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6974 - 6786
Alignment:
Q  53 tcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaa 152  Q
    |||||||| || |||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | || ||||| | |||||||||| |   | | || |||||||| ||||||    
T  6974 tcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaa 6875  T
Q  153 atggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6874 atggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttga 6786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14104 - 13916
Alignment:
Q  53 tcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaa 152  Q
    |||||||| || |||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | || ||||| | |||||||||| |   | | || |||||||| ||||||    
T  14104 tcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaa 14005  T
Q  153 atggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14004 atggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttga 13916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8965 - 8863
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | | |||||    
T  8965 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtgattt 8866  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  8865 tga 8863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2112 - 1902
Alignment:
Q  31 gtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgat 130  Q
    |||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||| | || ||| ||||| || || |||||   |||||||||| |       
T  2112 gtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtctttc 2013  T
Q  131 tgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |    
T  2012 tatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgat 1913  T
Q  231 agagattttga 241  Q
     | ||||||||    
T  1912 cgtgattttga 1902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36628 - 36411
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || ||||  | ||  ||||    
T  36628 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttcattgctttcgattgtgtttctactttgg 36529  T
Q  124 gt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtcta 222  Q
    || |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||  |||||||    
T  36528 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtcta 36430  T
Q  223 tgtttggtagagattttga 241  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  36429 tgtttggtcgtgattttga 36411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4564 - 4347
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | || |||||   ||||||||    
T  4564 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 4465  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    || |   | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  4464 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 4365  T
Q  224 gtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| | | ||||||||    
T  4364 gtttgatcgtgattttga 4347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 1
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||  | || |||||   ||||||||    
T  147 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 48  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 170  Q
    || |   | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  47 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Original strand, 57788 - 58005
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||   | || ||||| | |||||| |    
T  57788 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgttattgattgtgcttctaagttag 57887  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    || |   | | || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  57888 gtcttgctatgtcgaatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 57987  T
Q  224 gtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  57988 gtttggtcgagattttga 58005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 2422 - 2654
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| ||  |||||| |||||||||| || ||||||||||| | || ||| ||||| |  ||||    
T  2422 aatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattcttttattgcttatgaat 2521  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    ||||   |||||||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  2522 gtgctactaagttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaag 2621  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||| | | ||||||||    
T  2622 atgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttga 2654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 55644 - 55848
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||| | || ||| |||||  | || |||||   ||||||||    
T  55644 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgg 55743  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  55744 gtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtcctttgtctat 55843  T
Q  224 gtttg 228  Q
    |||||    
T  55844 gtttg 55848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15555 - 15335
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||| | |||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||| |||||  | || |    
T  15555 aatgaggatcgattgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgatt 15456  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | |||||||            || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15455 gtgcttctaagttg------------tcaaatatgaaaggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaag 15368  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  15367 atgtcctttgtctacgattggtcgagattttga 15335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 239
Target Start/End: Original strand, 216579 - 216809
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||| | | |||| |||||| |||| |||| |||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||   | || |    
T  216579 aatgaggatcaattgatcagaggtacatgttactttgatagtactactttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgttattgatt 216678  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    || | |  ||||| ||| |   | | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||    
T  216679 gtacttcaaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtagaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttcag 216778  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagatttt 239  Q
     ||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  216779 atgtcctttgtctatgattggtcgagatttt 216809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 17225 - 17457
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||| || || |    
T  17225 aatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgatt 17324  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | ||  |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  17325 gtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 17423  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    | ||||  || |||||||||||| | ||||||||    
T  17424 gatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttga 17457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24321 - 24220
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||  | | |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  24321 atatgaatggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggttcagtgactacttctctagtatgcctgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattt 24222  T
Q  239 tg 240  Q
    ||    
T  24221 tg 24220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 229
Target Start/End: Original strand, 195041 - 195217
Alignment:
Q  53 tcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaa 152  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||| | ||  |||||| |  || | ||| ||||||  |||||     
T  195041 tcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagag 195140  T
Q  153 atggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttgg 229  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||    
T  195141 atagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttgg 195217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26497 - 26265
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||| | || | |||||  ||||  ||| |||||| || |||| |||||||||| || | ||||||||| |  ||||| ||||   | || |    
T  26497 aatgaggatcgattgattagaggtaaatgttattttgatagtactcttttagttgctattattgatattggtgctacgcaatgttttattgttgttgatt 26398  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | |||||||||| | | | | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  26397 gtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaag 26298  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  || |||||||||||| |||| |||||    
T  26297 atgtcctttatctatgtttggtcgagactttga 26265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 230
Target Start/End: Original strand, 37023 - 37200
Alignment:
Q  53 tcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggaga 151  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||    
T  37023 tcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tatctgatatgaatggaga 37121  T
Q  152 aatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  37122 gatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgatatgtcctttgtctatgtttggt 37200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 241
Target Start/End: Original strand, 11084 - 11271
Alignment:
Q  54 cctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaa 153  Q
    |||||| || ||||||| || ||| ||||||||| |||||| ||||| |  || |||||   |||||||||| |  |  | ||| ||||||| |||||||    
T  11084 cctttagtttctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 11183  T
Q  154 tggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | | ||||||||    
T  11184 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttga 11271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 54737 - 54550
Alignment:
Q  54 cctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaa 153  Q
    |||||| |||||||||| || | ||||||||| | |||||| ||||| |  || |||||   |||||||||| |  |  | ||||||||||| |||||||    
T  54737 cctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttttcatgtctaatatgaatggagaaa 54638  T
Q  154 tggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||||| | | ||||||||    
T  54637 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttttctatgtttgatcgtgattttga 54550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31898 - 31796
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  31898 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 31799  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  31798 tga 31796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 10527 - 10629
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||  ||  ||||||||||| | |||||    
T  10527 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttaactatgtttggtcgtgattt 10626  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  10627 tga 10629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37364 - 37262
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||  | ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  37364 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctctcttatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 37265  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  37264 tga 37262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 205
Target Start/End: Original strand, 13182 - 13248
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgttt 205  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  13182 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 13248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8521 - 8336
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatat 142  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| |  || |||||   |||||||||| |  |  | ||| ||||    
T  8521 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatat 8422  T
Q  143 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttg 228  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||    
T  8421 gaatggagaaatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcctttgtctatgtttg 8336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 29087 - 29319
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||| | | |||| |||||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||| || | ||||||||| | ||| || ||||| || || |    
T  29087 aatgaggatcaattgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgctacgcattgatttattgctttcgatt 29186  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | ||  |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  29187 gtgtttctactttgggtcttgatt-tatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 29285  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    | ||||  || |||||||||||| | ||||||||    
T  29286 gatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttga 29319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 10317 - 10549
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||| || |||||||| || | |||||| ||||| || || |    
T  10317 aatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgccacgcattgttttattgctttcgatt 10416  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | ||  |||||| |   | | |||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |     
T  10417 gtgcttctactttgggtctacatatgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaa 10516  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  10517 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 10549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 241
Target Start/End: Original strand, 582 - 769
Alignment:
Q  54 cctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaa 153  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| |  || |||||   ||| |||||| |  |  | ||| ||||||| |||||||    
T  582 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaaattgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 681  T
Q  154 tggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | | ||||||||    
T  682 tggttgtcgaaactccagctaagggttctgtgactacttcacttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttga 769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 207
Target Start/End: Original strand, 40681 - 40864
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| ||||||||| |  ||| ||||||  |||||| |||| ||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |||||   ||||||||    
T  40681 atcagaggtacttgctattttgatagtacacctttagttgccattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 40780  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    || |  || | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  40781 gtcttgttatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaa 40864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 104243 - 104140
Alignment:
Q  138 aatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagatt 237  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | | ||||    
T  104243 aatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgatt 104144  T
Q  238 ttga 241  Q
    ||||    
T  104143 ttga 104140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 70
Target Start/End: Original strand, 1765 - 1827
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattat 70  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1765 caatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 1827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18665 - 18563
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | | |||||    
T  18665 atatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtgattt 18566  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  18565 tga 18563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8238 - 8136
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | | |||||    
T  8238 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 8139  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  8138 tga 8136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 70
Target Start/End: Original strand, 1646 - 1707
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattat 70  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1646 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 1707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41762 - 41545
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||  | || |||||   ||||||||    
T  41762 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 41663  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    || |   | | |  ||||||||  |||| ||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  41662 gtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 41563  T
Q  224 gtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| | | ||||||||    
T  41562 gtttgatcgtgattttga 41545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 75482 - 75265
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||  | || |||||   ||||||||    
T  75482 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 75383  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    || |   | | |  ||||||||  |||| ||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  75382 gtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 75283  T
Q  224 gtttggtagagattttga 241  Q
    ||||| | | ||||||||    
T  75282 gtttgatcgtgattttga 75265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 34874 - 35106
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| ||||   || ||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||  | |||||| ||||  || || |    
T  34874 aatgaggatcgcttgatcaaaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgatt 34973  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||| | ||  |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |     
T  34974 gtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaa 35073  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  35074 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 35106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 7913 - 8117
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| || |||||  | || |||||   |||| |||    
T  7913 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctattgattgtgctactaaggtgg 8012  T
Q  124 gtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctat 223  Q
    || |   | | |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  8013 gtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 8112  T
Q  224 gtttg 228  Q
    |||||    
T  8113 gtttg 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22392 - 22160
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  22392 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 22293  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  22292 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 22193  T
Q  209 gtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
     ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  22192 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 22160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 51796 - 51720
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctac 85  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  51796 aatgaggactgacttatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactcgtgctac 51720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Original strand, 1046 - 1125
Alignment:
Q  19 gacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcatt 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  1046 gacttatcagaggtacttgtttctttaataatacgcctttaattgctattatagacactagtgttactcattgtttcatt 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 25001 - 25103
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||||| | | |||||    
T  25001 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattt 25100  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  25101 tga 25103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Original strand, 961 - 1020
Alignment:
Q  8 caatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctat 67  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  961 caatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10479 - 10281
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  10479 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgata 10381  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  10380 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 10281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14193 - 14030
Alignment:
Q  45 aatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatga 144  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| || | ||||||||| | |||||| ||||| || || |||||   |||||||||| |   | | ||| ||||||    
T  14193 aatagtacacctttagttgctattattgatagtggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatga 14094  T
Q  145 aaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaag 208  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  14093 atggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaag 14030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11394 - 11293
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgg 123  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |||||   ||||||||    
T  11394 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 11295  T
Q  124 gt 125  Q
    ||    
T  11294 gt 11293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Original strand, 21485 - 21576
Alignment:
Q  150 gaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||| ||| || ||||||||| |||| |||||    
T  21485 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctgaagtgtccgttctcgatgtttggtcgagactttga 21576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 81
Target Start/End: Original strand, 16783 - 16840
Alignment:
Q  24 atcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtg 81  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  16783 atcagaggtacatgtttctttaattgtactcctttaattgctattattgatactggtg 16840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Original strand, 1321 - 1423
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  1321 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 1420  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  1421 tga 1423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1093 - 895
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatat 142  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |  || | ||| ||||    
T  1093 ttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttcttttttgggtcttgttttgtctgatat 994  T
Q  143 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| | || || |||| |||||  ||||||||||||| | | ||||||||    
T  993 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctgtcgtatgcttaaagtgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttga 895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 1422 - 1364
Alignment:
Q  12 gaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattat 70  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1422 gaggatcgacttatcagaggtacttgtttcttgaatagtactcctttaatagctattat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12576
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 12579  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  12578 tga 12576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3616 - 3514
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | | |||||    
T  3616 atatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 3517  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  3516 tga 3514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8273 - 8171
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||    |||| |||||||||||||||| | |||||    
T  8273 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcattgtccgttgtctatgtttggtcgtgattt 8174  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  8173 tga 8171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41170 - 41068
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  41170 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 41071  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  41070 tga 41068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 13283 - 13479
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| || || |    
T  13283 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 13382  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgttt 205  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  13383 gtgtttctggtttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 13479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11484 - 11382
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  11484 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 11385  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  11384 tga 11382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17952 - 17850
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattt 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  17952 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 17853  T
Q  239 tga 241  Q
    |||    
T  17852 tga 17850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 53719 - 53640
Alignment:
Q  162 gaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  53719 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 53640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4602 - 4509
Alignment:
Q  135 tctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttg 228  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  4602 tctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgtgtgtttaagaagtcctttgtctatgtttg 4509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7381 - 7185
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  7381 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 7282  T
Q  109 gtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgttt 205  Q
    |||  | |   |||||| |  || | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  7281 gtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 7185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3535 - 3348
Alignment:
Q  43 ttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaata 141  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||  | |   |||||| |||||| | ||| |||    
T  3535 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatt-tgtctgata 3437  T
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  3436 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 3348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17305 - 17073
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| |||||||||||   ||||||  | ||||||| || ||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  17305 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataaaactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 17206  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaa 207  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| || |||||||    
T  17205 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttaa 17107  T
Q  208 ggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 241  Q
    | || |  || ||||||||| || | ||||||||    
T  17106 gatgccctttatctatgtttagtcgtgattttga 17073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15011 - 14873
Alignment:
Q  54 cctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaaa 153  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| |  || |||||   |||||||||| |  |  | ||| ||||||| |||||||    
T  15011 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 14912  T
Q  154 tggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactactt 192  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  14911 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 141 - 1
Alignment:
Q  53 tcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctaatatgaaaggagaa 152  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || | ||| | ||  |||||| |  || | ||| ||||||| |||||     
T  141 tcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattatgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagag 42  T
Q  153 atggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttc 193  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  41 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 196
Target Start/End: Original strand, 769 - 826
Alignment:
Q  139 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 196  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  769 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctct 826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 928 - 1124
Alignment:
Q  9 aatgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctacacgttgtttcattgcgttagaat 108  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| || || |    
T  928 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 1027  T
Q  109 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgttt 205  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  1028 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgacatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21616 - 21528
Alignment:
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||| |  | ||  |||||||||||||||    
T  21616 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggt 21528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37040 - 36952
Alignment:
Q  142 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggt 230  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||| |  | ||  |||||||||||||||    
T  37040 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggt 36952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 240
Target Start/End: Original strand, 83823 - 83911
Alignment:
Q  152 aatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtgtgtttaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagattttg 240  Q
    ||||||| | ||||| || || |||| ||| || |||||||||||||| || || | |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  83823 aatggttatcgaaaccccggctaaggattcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttg 83911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University