View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8912A_low_334 (Length: 230)

Name: NF8912A_low_334
Description: NF8912A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8912A_low_334
NF8912A_low_334
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (25-230)||(29888752-29888957)
chr5 (22-230)||(23892493-23892701)
chr5 (1-227)||(23717634-23717860)
chr5 (1-227)||(24687803-24688029)
chr5 (1-224)||(22998760-22998983)
chr5 (1-227)||(23752096-23752322)
chr5 (8-227)||(11549644-11549863)
chr5 (1-227)||(18500376-18500602)
chr5 (4-230)||(22888757-22888983)
chr5 (1-227)||(6874595-6874821)
chr5 (1-227)||(30934923-30935149)
chr5 (1-227)||(33777777-33778003)
chr5 (1-227)||(43078542-43078768)
chr5 (4-227)||(33877537-33877760)
chr5 (1-227)||(24681730-24681956)
chr5 (1-227)||(24724257-24724483)
chr5 (1-227)||(24970308-24970534)
chr5 (4-230)||(25199316-25199542)
chr5 (1-227)||(2511341-2511567)
chr5 (1-227)||(3789831-3790057)
chr5 (1-227)||(12132445-12132671)
chr5 (1-227)||(13324475-13324701)
chr5 (1-227)||(33516646-33516872)
chr5 (1-227)||(37358289-37358515)
chr5 (3-227)||(41674999-41675223)
chr5 (1-191)||(5638236-5638426)
chr5 (1-227)||(9317741-9317967)
chr5 (1-195)||(15658406-15658600)
chr5 (1-227)||(28649525-28649751)
chr5 (1-227)||(30152308-30152534)
chr5 (1-227)||(30168759-30168985)
chr5 (1-227)||(31431730-31431956)
chr5 (1-227)||(40473195-40473421)
chr5 (37-230)||(13184330-13184523)
chr5 (1-227)||(18375058-18375284)
chr5 (1-227)||(30029705-30029931)
chr5 (1-227)||(31826053-31826279)
chr5 (1-227)||(34616808-34617034)
chr5 (1-227)||(37755270-37755496)
chr5 (5-230)||(11326081-11326306)
chr5 (5-228)||(13440144-13440367)
chr5 (1-227)||(37671129-37671355)
chr5 (1-227)||(37770633-37770859)
chr5 (1-227)||(15758503-15758729)
chr5 (1-227)||(26480682-26480907)
chr5 (1-230)||(32599118-32599347)
chr5 (1-227)||(8665121-8665347)
chr5 (1-227)||(28959432-28959658)
chr5 (5-227)||(9548193-9548415)
chr5 (94-227)||(29966805-29966938)
chr5 (97-227)||(33292815-33292945)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (4-230)||(16449636-16449862)
chr7 (1-227)||(10916503-10916729)
chr7 (4-227)||(39210661-39210884)
chr7 (1-227)||(2154855-2155081)
chr7 (4-227)||(26484976-26485199)
chr7 (4-227)||(26682638-26682861)
chr7 (25-227)||(2775641-2775843)
chr7 (5-227)||(4200829-4201051)
chr7 (1-227)||(11424412-11424637)
chr7 (4-230)||(16041602-16041828)
chr7 (1-227)||(16503015-16503241)
chr7 (1-227)||(16518051-16518277)
chr7 (25-227)||(2108664-2108866)
chr7 (1-227)||(3445588-3445814)
chr7 (1-227)||(5128274-5128500)
chr7 (1-227)||(26435539-26435765)
chr7 (1-227)||(26537505-26537731)
chr7 (1-227)||(31125202-31125428)
chr7 (1-227)||(5146975-5147201)
chr7 (1-227)||(31564025-31564251)
chr7 (1-230)||(16736095-16736324)
chr7 (1-230)||(16751149-16751378)
chr7 (1-230)||(17523811-17524040)
chr7 (1-230)||(17529175-17529404)
chr7 (1-195)||(24592176-24592370)
chr7 (1-227)||(26274729-26274955)
chr7 (5-230)||(31088103-31088328)
chr7 (5-230)||(45733739-45733964)
chr7 (1-227)||(9618933-9619159)
chr7 (1-191)||(26319504-26319694)
chr7 (1-227)||(26669549-26669775)
chr7 (1-227)||(4144758-4144984)
chr7 (1-227)||(45387625-45387851)
chr7 (1-160)||(26513130-26513289)
chr7 (48-227)||(11441854-11442033)
chr7 (97-227)||(18541081-18541211)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-227)||(16283730-16283956)
chr8 (1-227)||(16277835-16278061)
chr8 (4-227)||(18710867-18711090)
chr8 (1-227)||(2136967-2137193)
chr8 (5-230)||(19658752-19658977)
chr8 (1-227)||(14557905-14558131)
chr8 (5-227)||(19688379-19688601)
chr8 (5-227)||(19286743-19286965)
chr8 (1-227)||(19674722-19674948)
chr8 (1-227)||(27608613-27608839)
chr8 (1-227)||(29829603-29829829)
chr8 (1-227)||(19208068-19208294)
chr8 (1-227)||(28361663-28361889)
chr8 (4-230)||(44563378-44563603)
chr8 (5-230)||(33244943-33245168)
chr8 (1-195)||(3329215-3329409)
chr8 (1-227)||(31489458-31489684)
chr8 (1-191)||(33259040-33259230)
chr8 (1-227)||(9354904-9355130)
chr8 (1-227)||(12092432-12092658)
chr8 (1-227)||(31354805-31355031)
chr8 (4-230)||(22080589-22080815)
chr8 (89-227)||(189375-189513)
chr8 (1-119)||(18791096-18791214)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (4-230)||(16207783-16208009)
chr1 (4-227)||(28152142-28152365)
chr1 (4-230)||(20340087-20340313)
chr1 (4-230)||(20461358-20461584)
chr1 (3-227)||(41793059-41793283)
chr1 (1-227)||(28585261-28585487)
chr1 (1-191)||(10962986-10963176)
chr1 (1-227)||(51638498-51638724)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (1-230)||(27290062-27290291)
chr6 (1-227)||(26918658-26918884)
chr6 (1-227)||(13298643-13298869)
chr6 (1-227)||(22934572-22934798)
chr6 (1-227)||(23857017-23857243)
chr6 (1-227)||(29549753-29549979)
chr6 (1-227)||(26989279-26989506)
chr6 (25-227)||(14143001-14143203)
chr6 (1-227)||(15424009-15424235)
chr6 (1-227)||(24304310-24304536)
chr6 (25-227)||(26788222-26788424)
chr6 (25-227)||(27196595-27196797)
chr6 (25-227)||(27252443-27252645)
chr6 (4-230)||(22456638-22456855)
chr6 (1-227)||(34463038-34463264)
chr6 (4-227)||(13521768-13521991)
chr6 (1-227)||(24863995-24864221)
chr6 (1-227)||(27044666-27044892)
chr6 (1-227)||(4545467-4545693)
chr6 (1-227)||(4723826-4724052)
chr6 (1-227)||(16674417-16674643)
chr6 (1-227)||(27485407-27485633)
chr6 (1-227)||(30557708-30557934)
chr6 (1-227)||(4758042-4758268)
chr6 (1-227)||(16750132-16750358)
chr6 (1-227)||(28207732-28207958)
chr6 (1-227)||(29573291-29573517)
chr6 (5-230)||(28162932-28163157)
chr6 (1-227)||(4525564-4525790)
chr6 (1-191)||(16943719-16943909)
chr6 (1-227)||(26116102-26116328)
chr6 (1-227)||(27272272-27272498)
chr6 (1-227)||(29501693-29501919)
chr6 (5-230)||(8892007-8892232)
chr6 (5-230)||(8903242-8903467)
chr6 (4-191)||(3696395-3696582)
chr6 (1-227)||(4773284-4773510)
chr6 (1-227)||(27008005-27008231)
chr6 (1-180)||(27019461-27019640)
chr6 (1-227)||(27359684-27359910)
chr6 (1-227)||(27450027-27450253)
chr6 (5-227)||(33373952-33374174)
chr6 (25-221)||(17092156-17092352)
chr6 (1-227)||(26777302-26777533)
chr6 (1-224)||(27629392-27629615)
chr6 (124-227)||(17025555-17025658)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (25-230)||(21702926-21703131)
chr2 (1-227)||(28882491-28882717)
chr2 (1-227)||(27434182-27434408)
chr2 (1-227)||(12655819-12656045)
chr2 (1-227)||(9349720-9349946)
chr2 (1-227)||(20838195-20838421)
chr2 (4-227)||(22925769-22925992)
chr2 (1-227)||(23128304-23128530)
chr2 (5-230)||(34303045-34303270)
chr2 (1-227)||(27777499-27777725)
chr2 (1-227)||(27817257-27817483)
chr2 (1-227)||(32050075-32050301)
chr2 (1-227)||(12587087-12587313)
chr2 (1-227)||(12716340-12716566)
chr2 (1-227)||(13936282-13936508)
chr2 (1-227)||(27803984-27804210)
chr2 (1-227)||(39051560-39051786)
chr2 (5-230)||(27118962-27119187)
chr2 (1-227)||(16829076-16829302)
chr2 (1-227)||(16892179-16892405)
chr2 (1-227)||(19416237-19416463)
chr2 (4-230)||(19456162-19456388)
chr2 (1-227)||(37375438-37375664)
chr2 (1-227)||(11634924-11635150)
chr2 (1-227)||(11641113-11641339)
chr2 (1-227)||(37685647-37685873)
chr2 (1-227)||(37700912-37701138)
chr2 (1-227)||(37925770-37925996)
chr2 (5-230)||(3784928-3785153)
chr2 (5-230)||(31891070-31891295)
chr2 (5-230)||(34157284-34157509)
chr2 (4-230)||(16163873-16164102)
chr2 (1-227)||(260491-260717)
chr2 (1-227)||(34286631-34286857)
chr2 (1-227)||(34291691-34291917)
chr2 (1-227)||(34861957-34862183)
chr2 (1-227)||(39890351-39890577)
chr2 (1-227)||(40233788-40234014)
chr2 (1-227)||(21676920-21677146)
chr2 (1-227)||(31876558-31876784)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-227)||(46734-46960)
scaffold0089 (5-227)||(39822-40044)
scaffold0089 (1-227)||(30044-30270)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-227)||(14665314-14665540)
chr4 (1-227)||(24592063-24592289)
chr4 (1-227)||(17014296-17014522)
chr4 (1-227)||(14763053-14763279)
chr4 (25-230)||(15228163-15228368)
chr4 (1-227)||(6570149-6570375)
chr4 (1-227)||(18800362-18800588)
chr4 (1-227)||(36344264-36344490)
chr4 (5-227)||(54833683-54833905)
chr4 (4-230)||(1900550-1900776)
chr4 (4-230)||(15284680-15284906)
chr4 (1-227)||(21969997-21970223)
chr4 (1-227)||(30754050-30754276)
chr4 (1-227)||(31126267-31126493)
chr4 (1-227)||(33673547-33673773)
chr4 (1-227)||(39850934-39851160)
chr4 (1-227)||(40105387-40105613)
chr4 (1-227)||(27163066-27163292)
chr4 (1-228)||(5006168-5006395)
chr4 (1-227)||(14098837-14099063)
chr4 (5-230)||(24460358-24460583)
chr4 (4-228)||(15391090-15391314)
chr4 (27-230)||(14235300-14235503)
chr4 (27-227)||(24112958-24113158)
chr4 (97-227)||(34188805-34188935)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (1-227)||(6192558-6192784)
chr3 (1-227)||(15740884-15741110)
chr3 (1-227)||(18051504-18051730)
chr3 (4-230)||(18530627-18530853)
chr3 (1-227)||(7073454-7073680)
chr3 (1-227)||(8296214-8296440)
chr3 (4-227)||(31033910-31034133)
chr3 (4-227)||(32292994-32293217)
chr3 (1-227)||(4796443-4796669)
chr3 (1-227)||(8301057-8301283)
chr3 (1-227)||(28021517-28021743)
chr3 (25-230)||(16626320-16626525)
chr3 (1-227)||(4721873-4722099)
chr3 (1-227)||(15892496-15892722)
chr3 (1-227)||(18242981-18243207)
chr3 (1-227)||(18276842-18277068)
chr3 (1-227)||(18307444-18307670)
chr3 (1-227)||(48466169-48466395)
chr3 (5-230)||(5652626-5652851)
chr3 (1-227)||(18292143-18292369)
chr3 (1-227)||(18330911-18331137)
chr3 (1-227)||(20576637-20576863)
chr3 (1-227)||(21674935-21675161)
chr3 (1-227)||(29148545-29148771)
chr3 (1-227)||(51782265-51782491)
chr3 (1-227)||(24328401-24328627)
chr3 (1-227)||(35881008-35881234)
chr3 (1-227)||(36996867-36997093)
chr3 (1-227)||(11110139-11110365)
chr3 (1-227)||(22387368-22387594)
chr3 (1-227)||(4417161-4417387)
chr3 (1-227)||(5013954-5014180)
chr3 (1-227)||(5596147-5596373)
chr3 (1-227)||(5609112-5609338)
chr3 (1-227)||(8211980-8212206)
chr3 (1-227)||(28115744-28115970)
chr3 (1-195)||(29664760-29664954)
chr3 (5-230)||(5713466-5713691)
chr3 (5-230)||(5724376-5724601)
chr3 (5-230)||(5767767-5767992)
chr3 (5-230)||(17993578-17993803)
chr3 (1-227)||(6542252-6542478)
chr3 (1-227)||(28339544-28339770)
chr3 (1-191)||(47023731-47023921)
chr3 (1-227)||(4346477-4346703)
chr3 (1-227)||(5467227-5467453)
chr3 (1-227)||(10396375-10396601)
chr3 (5-230)||(4626183-4626408)
chr3 (4-227)||(31964266-31964489)
chr3 (1-191)||(18225469-18225659)
chr3 (1-227)||(22870646-22870872)
chr3 (1-227)||(22885705-22885931)
chr3 (1-227)||(7996804-7997030)
chr3 (1-227)||(10643312-10643538)
chr3 (1-227)||(17984746-17984972)
chr3 (68-230)||(5756940-5757101)
chr3 (120-227)||(51797355-51797462)
chr3 (130-227)||(50133990-50134087)
chr3 (142-227)||(20066285-20066370)
chr3 (142-227)||(32439396-32439481)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-227)||(30733-30960)
scaffold0124 (166-230)||(20665-20729)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (1-227)||(6295-6521)
scaffold0415 (166-230)||(1832-1896)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (4-230)||(2410-2636)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-227)||(27573-27800)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-227)||(9847-10073)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-227)||(8230-8456)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-191)||(6988-7178)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-227)||(8815-9041)
scaffold0159 (1-227)||(20296-20523)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-195)||(14679-14873)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (25-230)||(21839-22044)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (4-230)||(370-596)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-191)||(25950-26140)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (18-182)||(46561-46729)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (124-227)||(1-104)
[»] scaffold2173 (2 HSPs)
scaffold2173 (148-224)||(373-449)
scaffold2173 (1-41)||(552-592)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 29888752 - 29888957
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctt 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29888752 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcacggttaaacagagaagctt 29888851  T
Q  125 tgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatg 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  29888852 tgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctcaatcatgttcacagcagcgtg 29888951  T
Q  225 attcgg 230  Q
    ||||||    
T  29888952 attcgg 29888957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23892701 - 23892493
Alignment:
Q  22 tcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaag 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892701 tcattcatcaagctttggatgtcattttgaacgaagtagcaccccaaaggattacgaaggcatcctgggcagttggcatgatcatggttaaacagagaag 23892602  T
Q  122 ctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagc 221  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23892601 ctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagc 23892502  T
Q  222 atgattcgg 230  Q
    |||||||||    
T  23892501 atgattcgg 23892493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 23717634 - 23717860
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  23717634 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 23717733  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23717734 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 23717833  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  23717834 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 23717860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 24687803 - 24688029
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||  ||||||    
T  24687803 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacatggcat 24687902  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24687903 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24688002  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  24688003 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 24688029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 22998760 - 22998983
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  22998760 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 22998859  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22998860 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 22998959  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatg 224  Q
     || ||||| |||||||| |||||    
T  22998960 ttcgatcatatttacagcggcatg 22998983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 23752096 - 23752322
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  || |||| |||||||    
T  23752096 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcat 23752195  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23752196 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 23752295  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  23752296 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 23752322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11549863 - 11549644
Alignment:
Q  8 cagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatg 107  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || | || ||||||||||||||    
T  11549863 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 11549764  T
Q  108 gttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 207  Q
    | | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||    
T  11549763 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatc 11549664  T
Q  208 atgtttacagcagcatgatt 227  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  11549663 atatttacagcggcatgatt 11549644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 18500376 - 18500602
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || | || |||||||    
T  18500376 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 18500475  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||| | ||    
T  18500476 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacacac 18500575  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  18500576 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 18500602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22888983 - 22888757
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  22888983 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtaacaacccaaaggattacggaagcattctgggcaactagcatgat 22888884  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||| ||| | || |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22888883 catggtcaaacaaagaggtttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctaggagcttcctcatatacctc 22888784  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22888783 aatcatgtttacagcagcgtgattcgg 22888757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6874821 - 6874595
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  6874821 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 6874722  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  6874721 gatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 6874622  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  6874621 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 6874595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30935149 - 30934923
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  30935149 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 30935050  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  30935049 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 30934950  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||    
T  30934949 ttcgatcatatatacagcggcatgatt 30934923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33778003 - 33777777
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  33778003 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 33777904  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33777903 gatcatggctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 33777804  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||  ||||||||    
T  33777803 ttcgatcatattcacagtggcatgatt 33777777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43078768 - 43078542
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  43078768 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 43078669  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  43078668 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 43078569  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  43078568 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 43078542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33877760 - 33877537
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||  || || ||| ||||||||||||| |    
T  33877760 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggt 33877661  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33877660 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 33877561  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  33877560 aatcatgttcacagcagcgtgatt 33877537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24681956 - 24681730
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  24681956 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 24681857  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24681856 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24681757  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  24681756 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 24681730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24724483 - 24724257
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  24724483 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 24724384  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24724383 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24724284  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  24724283 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 24724257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24970534 - 24970308
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  24970534 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 24970435  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  24970434 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacgtac 24970335  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     |  ||||| |||||||||||||||||    
T  24970334 tttgatcatatttacagcagcatgatt 24970308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25199542 - 25199316
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  25199542 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcatcttgaacgacgtagcaccccgaaggattacagaagcattctgggcaactggcatgat 25199443  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||| | | |||| |||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25199442 catggtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggggctttctcatatacctc 25199343  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25199342 aatcatgtttacagcagcgtgattcgg 25199316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2511567 - 2511341
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  2511567 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 2511468  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  2511467 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 2511368  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  2511367 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 2511341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3790057 - 3789831
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  3790057 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 3789958  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  3789957 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcactagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 3789858  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  3789857 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 3789831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12132671 - 12132445
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  || | || |||||||    
T  12132671 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggcat 12132572  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  12132571 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 12132472  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  12132471 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 12132445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 13324475 - 13324701
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  13324475 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 13324574  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  13324575 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 13324674  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  13324675 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 13324701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33516872 - 33516646
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  33516872 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 33516773  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  33516772 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 33516673  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  33516672 ctcgatcatattcacagcggcatgatt 33516646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 37358289 - 37358515
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  37358289 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaatctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 37358388  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  37358389 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 37358488  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  37358489 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 37358515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41675223 - 41674999
Alignment:
Q  3 actgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatga 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  || | || |||||||||    
T  41675223 actgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatga 41675124  T
Q  103 tcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacct 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||    
T  41675123 tcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatct 41675024  T
Q  203 caatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||||| || || |||||||||||    
T  41675023 caatcatattcacggcagcatgatt 41674999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5638426 - 5638236
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  5638426 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 5638327  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttc 191  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  5638326 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 5638236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9317967 - 9317741
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  9317967 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 9317868  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  9317867 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 9317768  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  9317767 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 9317741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 15658406 - 15658600
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||  || | || |||||||    
T  15658406 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 15658505  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctca 195  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15658506 gatcatggctgaacagagaagcttcgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 15658600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28649751 - 28649525
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  28649751 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacggtatagcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 28649652  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  28649651 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 28649552  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  28649551 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 28649525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30152534 - 30152308
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  |  | || |||||||    
T  30152534 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 30152435  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  30152434 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 30152335  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  30152334 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 30152308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30168985 - 30168759
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || || ||||    
T  30168985 tcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtcttgaacagcataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttagcat 30168886  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  30168885 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcttcacatac 30168786  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  30168785 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 30168759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31431956 - 31431730
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || |||||||    
T  31431956 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 31431857  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | || || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  31431856 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 31431757  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  31431756 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 31431730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 40473195 - 40473421
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||  || | || |||||||    
T  40473195 tcactgacagtcagaagattatcattcgtcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggcat 40473294  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  40473295 ggtcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 40473394  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  40473395 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 40473421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 230
Target Start/End: Original strand, 13184330 - 13184523
Alignment:
Q  37 tggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgc 136  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||     
T  13184330 tggatgtcattctgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 13184429  T
Q  137 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13184430 tgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcgg 13184523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 18375058 - 18375284
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  |  | || |||||||    
T  18375058 tcactgacagtcagaaagttatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 18375157  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  18375158 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18375257  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||    
T  18375258 ttcaatcatattcacagcggcatgatt 18375284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30029931 - 30029705
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  30029931 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcgtggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 30029832  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  30029831 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 30029732  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  30029731 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 30029705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 31826053 - 31826279
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  31826053 tcactgacagtcagaaaattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcttggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 31826152  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  31826153 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaaaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 31826252  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  31826253 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 31826279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34617034 - 34616808
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| ||||||| || |||  || | || |||||||    
T  34617034 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcat 34616935  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | ||    
T  34616934 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 34616835  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  34616834 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 34616808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37755496 - 37755270
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  37755496 tcactgacagtcagaagattagcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcaccctagacacttggcat 37755397  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  37755396 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 37755297  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  37755296 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 37755270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11326306 - 11326081
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||   | ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11326306 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 11326207  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  11326206 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 11326107  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  11326106 atcatgtttacagcaacgtgattcgg 11326081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 13440144 - 13440367
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||  || ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13440144 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 13440243  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||| | |||| ||||| || | ||||||| || ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13440244 atggtcaaacagaaaggcttggcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 13440343  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattc 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  13440344 atcatgtttacagcagcgtgattc 13440367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 37671129 - 37671355
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||  || | || |||||||    
T  37671129 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 37671228  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||| |   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  37671229 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggcgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 37671328  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  37671329 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 37671355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 37770633 - 37770859
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  37770633 tcactgacagtcagaagattagcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 37770732  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||    
T  37770733 gatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctagaagcttcctcacacac 37770832  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  37770833 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 37770859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 15758503 - 15758729
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| ||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  15758503 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 15758602  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  15758603 gctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 15758702  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  15758703 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 15758729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26480907 - 26480682
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |   |  |  | || |||||||    
T  26480907 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagatatcccagacacttggcat 26480808  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  26480807 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccaga-gagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 26480709  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  26480708 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 26480682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 32599118 - 32599347
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || |||||||    
T  32599118 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 32599217  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| ||||||  ||| || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| | ||    
T  32599218 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggggcttcctcacacac 32599317  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
     || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  32599318 ttcgatcatattcacagcggcatgattcgg 32599347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 8665121 - 8665347
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  8665121 tcactgacggtcagaagattatcattcatcaagctttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 8665220  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | ||    
T  8665221 gctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 8665320  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  8665321 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 8665347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 28959432 - 28959658
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||||||||| ||  | |||  || | || |||||||    
T  28959432 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 28959531  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| ||||||  ||| || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||  |||||| | ||    
T  28959532 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagtctcctcacacac 28959631  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  28959632 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 28959658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Original strand, 9548193 - 9548415
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||  || ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||| |||    
T  9548193 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcataatc 9548292  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || | ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || ||     
T  9548293 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcg 9548392  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  9548393 atcatattcacagcggcatgatt 9548415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 227
Target Start/End: Original strand, 29966805 - 29966938
Alignment:
Q  94 ttggcatgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 193  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  29966805 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 29966904  T
Q  194 catatacctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    || | || || ||||| || ||||| ||||||||    
T  29966905 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatt 29966938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33292945 - 33292815
Alignment:
Q  97 gcatgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 196  Q
    ||||||||||| | |||||   |||||| ||| | |||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || |||     
T  33292945 gcatgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcac 33292846  T
Q  197 atacctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||| ||||||||| || || ||| |||||||    
T  33292845 atatctcaatcatattcacggcatcatgatt 33292815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 16449636 - 16449862
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| |  ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16449636 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggcatgat 16449735  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16449736 catggtcaaacagagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacgtccagtctgggagcttcctcatatacctc 16449835  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16449836 aatcatgttcacagcagcgtgattcgg 16449862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 10916503 - 10916729
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  10916503 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 10916602  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  10916603 gatcatggctaaacagagaagctttacacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 10916702  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  10916703 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 10916729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Original strand, 39210661 - 39210884
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  39210661 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacacagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 39210760  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39210761 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 39210860  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  39210861 aatcatgttcacagcagcgtgatt 39210884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2155081 - 2154855
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  2155081 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 2154982  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2154981 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 2154882  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  2154881 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 2154855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26485199 - 26484976
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  26485199 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26485100  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26485099 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 26485000  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  26484999 aatcatgttcacagcagcgtgatt 26484976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Original strand, 26682638 - 26682861
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  26682638 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26682737  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26682738 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 26682837  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  26682838 aatcatgttcacagcagcgtgatt 26682861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2775843 - 2775641
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||   || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2775843 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattatagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 2775744  T
Q  125 tgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatg 224  Q
     ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  2775743 ggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 2775644  T
Q  225 att 227  Q
    |||    
T  2775643 att 2775641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4201051 - 4200829
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||  || ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  || || ||| ||||||||||||||||    
T  4201051 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatc 4200952  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4200951 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctca 4200852  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    |||||||| |||||||| |||||    
T  4200851 atcatgttcacagcagcgtgatt 4200829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 11424412 - 11424637
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  11424412 tcactaacagtcaaaa-attatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 11424510  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  11424511 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 11424610  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  11424611 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 11424637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16041828 - 16041602
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  16041828 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaagattacggaagcattctgggcaattggtatgat 16041729  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    | || ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16041728 cgtgattaaacagagaggcttgacatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcgtatacctc 16041629  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16041628 aatcatgttcacagcagcgtgattcgg 16041602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 16503015 - 16503241
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  16503015 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 16503114  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16503115 gatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatac 16503214  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  16503215 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 16503241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 16518051 - 16518277
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  16518051 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 16518150  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16518151 gatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatac 16518250  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  16518251 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 16518277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Original strand, 2108664 - 2108866
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctt 124  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2108664 ttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 2108763  T
Q  125 tgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatg 224  Q
     |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  2108764 ggcataatttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtccagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 2108863  T
Q  225 att 227  Q
    |||    
T  2108864 att 2108866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3445814 - 3445588
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  3445814 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 3445715  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  3445714 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 3445615  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||||||||||||    
T  3445614 ttcgatcatattcacagcagcatgatt 3445588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5128500 - 5128274
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  5128500 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 5128401  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5128400 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttatggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 5128301  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  5128300 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 5128274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26435765 - 26435539
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| | |||  || | || | |||||    
T  26435765 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacactcggcat 26435666  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  26435665 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 26435566  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  26435565 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 26435539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 26537505 - 26537731
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||  || | || |||||||    
T  26537505 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcat 26537604  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  26537605 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 26537704  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  26537705 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 26537731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31125428 - 31125202
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  || | || |||||||    
T  31125428 tcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcat 31125329  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  31125328 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 31125229  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  31125228 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 31125202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 5146975 - 5147201
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  5146975 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 5147074  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||  | ||    
T  5147075 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacac 5147174  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  5147175 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 5147201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 31564025 - 31564251
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  31564025 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 31564124  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  31564125 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 31564224  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  31564225 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 31564251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16736095 - 16736324
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  16736095 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 16736194  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  16736195 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 16736294  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
     || ||||| || || || |||||||||||    
T  16736295 ttcgatcatattcacggcggcatgattcgg 16736324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16751149 - 16751378
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  16751149 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 16751248  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  16751249 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 16751348  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
     || ||||| || || || |||||||||||    
T  16751349 ttcgatcatattcacggcggcatgattcgg 16751378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17524040 - 17523811
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  17524040 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 17523941  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  17523940 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 17523841  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
     || ||||| || || || |||||||||||    
T  17523840 ttcgatcatattcacggcggcatgattcgg 17523811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 17529175 - 17529404
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  17529175 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 17529274  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  17529275 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 17529374  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
     || ||||| || || || |||||||||||    
T  17529375 ttcgatcatattcacggcggcatgattcgg 17529404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 24592176 - 24592370
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  24592176 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 24592275  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctca 195  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24592276 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 24592370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 26274729 - 26274955
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  26274729 tcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 26274828  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  26274829 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 26274928  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  26274929 ctcgatcatattcacagcggcatgatt 26274955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 31088103 - 31088328
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||  || ||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31088103 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccgaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 31088202  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31088203 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 31088302  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31088303 atcatgtttacagcagcgtgattcgg 31088328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 45733964 - 45733739
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||   | ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  45733964 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 45733865  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  45733864 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 45733765  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45733764 atcatgtttacagcagcgtgattcgg 45733739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9619159 - 9618933
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  9619159 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 9619060  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  9619059 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 9618960  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  9618959 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 9618933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 26319504 - 26319694
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  26319504 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagtcacttggcat 26319603  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttc 191  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  26319604 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 26319694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 26669549 - 26669775
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  26669549 tcactgacagtcaggagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 26669648  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  26669649 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 26669748  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  26669749 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 26669775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 4144758 - 4144984
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||  | |||  || | || |||||||    
T  4144758 tcactgacagtcagaagattatcattcattaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 4144857  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  4144858 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 4144957  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  4144958 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 4144984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45387851 - 45387625
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  45387851 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 45387752  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||| | ||    
T  45387751 gatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacac 45387652  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  45387651 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 45387625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26513289 - 26513130
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  26513289 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccagaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 26513190  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttg 160  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||    
T  26513189 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttg 26513130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11442033 - 11441854
Alignment:
Q  48 ttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggt 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || ||     
T  11442033 ttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggc 11441934  T
Q  148 accagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  11441933 accagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatt 11441854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18541211 - 18541081
Alignment:
Q  97 gcatgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 196  Q
    ||||||||||| | |||||   |||||| ||| | |||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || |||     
T  18541211 gcatgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcac 18541112  T
Q  197 atacctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  18541111 atatctcaatcatattcacggcagcatgatt 18541081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16283956 - 16283730
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||| ||    
T  16283956 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaaatggtat 16283857  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  16283856 gatcatggctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacattacggacaacaagtctaggagcttcctcacatac 16283757  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16283756 ttcaatcatgttcacagcggcatgatt 16283730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16278061 - 16277835
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  16278061 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaactcaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 16277962  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16277961 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 16277862  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||    
T  16277861 ttcgatcatatttacggcggcatgatt 16277835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18711090 - 18710867
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  18711090 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 18710991  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18710990 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 18710891  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  18710890 aatcatgttcacagcagcgtgatt 18710867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 2136967 - 2137193
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  2136967 tcactaacagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 2137066  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| || |    
T  2137067 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctttctcacatgc 2137166  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  2137167 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 2137193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 19658752 - 19658977
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19658752 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattttgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 19658851  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19658852 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgggtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctca 19658951  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19658952 atcatgtttacagcagcgtgattcgg 19658977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14558131 - 14557905
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  14558131 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 14558032  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14558031 gatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 14557932  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||  |||||||| ||||||||    
T  14557931 ttcgatcacatttacagcggcatgatt 14557905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19688601 - 19688379
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||    
T  19688601 tgacattcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttggacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatc 19688502  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||     
T  19688501 atggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcg 19688402  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||||    
T  19688401 atcatatttacagcggcatgatt 19688379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19286965 - 19286743
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  || | || |||||||||||    
T  19286965 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttggcatgatc 19286866  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || ||     
T  19286865 atggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcg 19286766  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  19286765 atcatattcacagcggcatgatt 19286743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19674948 - 19674722
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  19674948 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 19674849  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  19674848 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 19674749  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  19674748 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 19674722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 27608613 - 27608839
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  27608613 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 27608712  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | || || ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  27608713 gatcatggctgaatagggaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 27608812  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  27608813 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 27608839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29829829 - 29829603
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  29829829 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 29829730  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  29829729 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 29829630  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  29829629 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 29829603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 19208068 - 19208294
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  19208068 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 19208167  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  19208168 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 19208267  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  19208268 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 19208294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 28361663 - 28361889
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  28361663 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 28361762  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  28361763 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 28361862  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  28361863 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 28361889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44563603 - 44563378
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  44563603 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 44563504  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  44563503 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctc 44563404  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  44563403 aatcatg-ttacagcagcgtgattcgg 44563378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33245168 - 33244943
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33245168 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 33245069  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||  ||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||  || ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33245068 atggtcaaacagagaggcttggcataatttgatgtgtagtggcaccataggagttgcaacgttacaaacgtccggtctgagagcttcctcatatacctca 33244969  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||||| || |||||    
T  33244968 atcatgtttacagcagcgtggttcgg 33244943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 3329215 - 3329409
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  3329215 tcactgacagtcaggaagttatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 3329314  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctca 195  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3329315 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 3329409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 31489458 - 31489684
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||  |  | |||  || | || |||||||    
T  31489458 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcccagaggcatcctagacacttggcat 31489557  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  31489558 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 31489657  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  31489658 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 31489684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33259230 - 33259040
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  33259230 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 33259131  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttc 191  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  33259130 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 33259040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9355130 - 9354904
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| ||||||| || |||  || | || |||||||    
T  9355130 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcat 9355031  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | ||    
T  9355030 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 9354931  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  9354930 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 9354904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 12092432 - 12092658
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||  || | || ||| |||    
T  12092432 tcactgacggtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcat 12092531  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | || || || |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  12092532 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtgacaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 12092631  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  12092632 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 12092658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31355031 - 31354805
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  31355031 tcactgacagtcaggagattatcatccatcaggctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 31354932  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  31354931 gctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctgggagcttcctcacacac 31354832  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  31354831 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 31354805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 22080589 - 22080815
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||| |||||||  ||| || ||||||| ||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||| |||||||| |   ||| ||||| |||||||||||||    
T  22080589 ctgatagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctggacaattggcatgat 22080688  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| |||||  || |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||    |||    
T  22080689 catggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacgaacgtcaagactgggaacttcttcatgagtctc 22080788  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||    
T  22080789 gatcatgttcacagcagcgtgattcgg 22080815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 189513 - 189375
Alignment:
Q  89 ggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagc 188  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  189513 ggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagc 189414  T
Q  189 ttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||||| |||| || ||||| || ||||  ||||||||    
T  189413 ttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatt 189375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18791214 - 18791096
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  18791214 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgagcagtgtagcaacccaaaggattacgaatgcatcctaggcacttggcat 18791115  T
Q  101 gatcatggttaaacagaga 119  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  18791114 gatcatggctgaacagaga 18791096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 16207783 - 16208009
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  16207783 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctttggatgtcattttgaacgacatagcaccccaaaggattacggaagcattctgggcaactggcatgat 16207882  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16207883 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggagctttctcatatacctc 16207982  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16207983 aatcatgtttacagcagcgtgattcgg 16208009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28152365 - 28152142
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  28152365 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 28152266  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28152265 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctc 28152166  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  28152165 aatcatgttcacagcagcgtgatt 28152142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 20340087 - 20340313
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |  || |||||||||||||||  || || ||||| ||| |||||||||    
T  20340087 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgat 20340186  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340187 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 20340286  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20340287 aatcatgttcacagcagcgtgattcgg 20340313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20461584 - 20461358
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  20461584 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacgaaagcattctggacaactggcatgat 20461485  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||| ||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20461484 catggtcaaacaaagaggcttgacatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcaagtctgcgagcttgctcatatacctc 20461385  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  20461384 aatcatgttcacaacagcgtgattcgg 20461358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 227
Target Start/End: Original strand, 41793059 - 41793283
Alignment:
Q  3 actgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||||    
T  41793059 actgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatga 41793158  T
Q  103 tcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacct 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || |    
T  41793159 tcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacactt 41793258  T
Q  203 caatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    | ||||| || ||||| ||||||||    
T  41793259 cgatcatattcacagcggcatgatt 41793283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28585487 - 28585261
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  28585487 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 28585388  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  28585387 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 28585288  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  28585287 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 28585261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10963176 - 10962986
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| ||||||| || |||  ||   || |||||||    
T  10963176 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctaaacacttggcat 10963077  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttc 191  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  10963076 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 10962986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 51638724 - 51638498
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||  | |||  || | || |||||||    
T  51638724 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 51638625  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | |||| | ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  51638624 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 51638525  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  51638524 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 51638498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27290062 - 27290291
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  27290062 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 27290161  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27290162 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcatatac 27290261  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27290262 ctcaatcatatttacagtagcatgattcgg 27290291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26918884 - 26918658
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  26918884 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgttatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 26918785  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26918784 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 26918685  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  26918684 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 26918658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 13298643 - 13298869
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||  || |||| |||||||    
T  13298643 tcactgacagtcaaataattgtcattcatcaagctctggatgtcattttgaacagtataccaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcat 13298742  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13298743 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 13298842  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  13298843 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 13298869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 22934572 - 22934798
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  22934572 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 22934671  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22934672 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 22934771  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  22934772 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 22934798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 23857017 - 23857243
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  23857017 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 23857116  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23857117 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 23857216  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  23857217 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 23857243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29549979 - 29549753
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  29549979 tcactgacagtcagaaaattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 29549880  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||    
T  29549879 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtccaggagcttcctcacacac 29549780  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || |||||||| ||||| ||||||||    
T  29549779 ttcgatcatgttcacagcggcatgatt 29549753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26989506 - 26989279
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagatta-tcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 99  Q
    ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  26989506 tcactaacagtcaaaaaattaatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 26989407  T
Q  100 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatata 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26989406 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 26989307  T
Q  200 cctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||    
T  26989306 cttcgatcatatttacagcggcatgatt 26989279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Original strand, 14143001 - 14143203
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctt 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14143001 ttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 14143100  T
Q  125 tgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatg 224  Q
     ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  14143101 ggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 14143200  T
Q  225 att 227  Q
    |||    
T  14143201 att 14143203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 15424009 - 15424235
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| | |||||    
T  15424009 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcactcggcat 15424108  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15424109 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 15424208  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  15424209 tttgatcatatttacagcggcatgatt 15424235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 24304310 - 24304536
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  24304310 tcactaacagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 24304409  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24304410 ggtcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24304509  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  24304510 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 24304536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26788424 - 26788222
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctt 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26788424 ttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 26788325  T
Q  125 tgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatg 224  Q
     ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  26788324 ggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 26788225  T
Q  225 att 227  Q
    |||    
T  26788224 att 26788222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27196797 - 27196595
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctt 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27196797 ttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 27196698  T
Q  125 tgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatg 224  Q
     ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  27196697 ggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 27196598  T
Q  225 att 227  Q
    |||    
T  27196597 att 27196595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Original strand, 27252443 - 27252645
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctt 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27252443 ttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 27252542  T
Q  125 tgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatg 224  Q
     ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  27252543 ggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 27252642  T
Q  225 att 227  Q
    |||    
T  27252643 att 27252645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 22456638 - 22456855
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| |  ||| || |||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22456638 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaatctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattctggacaattggcatgat 22456737  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456738 catggtcaaacaaagaagctttgcatagcttgatgtg---------cagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 22456828  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  22456829 aatcacgttcacagcagcgtgattcgg 22456855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 34463038 - 34463264
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  34463038 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 34463137  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  34463138 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 34463237  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  34463238 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 34463264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Original strand, 13521768 - 13521991
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||  || || ||| ||||||||||||| |    
T  13521768 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggt 13521867  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13521868 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 13521967  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  13521968 aatcatgttcacagcagcgtgatt 13521991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24864221 - 24863995
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  24864221 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggacgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 24864122  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||||||| | |||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24864121 gatcatggctgaacagagaggatttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24864022  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  24864021 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 24863995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27044892 - 27044666
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  || | || |||||||    
T  27044892 tcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacacttggcat 27044793  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  27044792 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27044693  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  27044692 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 27044666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 4545467 - 4545693
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || |||||||    
T  4545467 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 4545566  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  4545567 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4545666  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  4545667 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 4545693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 4723826 - 4724052
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||  || | |||  || | || |||||||    
T  4723826 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcagcccaaaggatctcggaggcatcctagacacttggcat 4723925  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  4723926 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4724025  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  4724026 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 4724052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16674643 - 16674417
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  16674643 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 16674544  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  16674543 gatcatggctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 16674444  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  16674443 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 16674417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27485633 - 27485407
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  27485633 tcactaacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 27485534  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  27485533 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 27485434  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  27485433 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 27485407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 30557708 - 30557934
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  30557708 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 30557807  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  30557808 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 30557907  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  30557908 ctcgatcatattcacagcggcatgatt 30557934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4758268 - 4758042
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  4758268 tcactgacagtccgaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 4758169  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  4758168 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4758069  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  4758068 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 4758042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16750358 - 16750132
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  || | || |||||||    
T  16750358 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 16750259  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||| || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16750258 gatcatggctgaacagagaagctttgcaccgcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcgggcatcaagtctaggagcttcctcacatac 16750159  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  16750158 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 16750132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28207958 - 28207732
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||  || | || ||| |||    
T  28207958 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcat 28207859  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  28207858 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 28207759  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  28207758 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 28207732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29573517 - 29573291
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  29573517 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 29573418  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  29573417 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 29573318  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  29573317 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 29573291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28163157 - 28162932
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||  || ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28163157 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaccgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 28163058  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  28163057 atggtcaaacagagaggcttggcataacccgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 28162958  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28162957 atcatgtttacagcagcgtgattcgg 28162932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4525790 - 4525564
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  4525790 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 4525691  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  4525690 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4525591  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  4525590 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 4525564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 16943719 - 16943909
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  16943719 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 16943818  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttc 191  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  16943819 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 16943909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 26116102 - 26116328
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  26116102 tcactgacagtcagaagattatcgttcatcgaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 26116201  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  26116202 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 26116301  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  26116302 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 26116328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 27272272 - 27272498
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| | |||  || |||| |||||||    
T  27272272 tcactaacagtcaaaaacttatcattcatcaagctctggatgtcatcttgaacaataaagcaacccaaaggattacggaggcatcctaggcacttggcat 27272371  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | |||| | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  27272372 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttacaacgttacggacatcaagtctaggagctacctcacatac 27272471  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||||||||||||    
T  27272472 ttcgatcatattcacagcagcatgatt 27272498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29501919 - 29501693
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || |||||||    
T  29501919 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 29501820  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  29501819 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 29501720  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  29501719 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 29501693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 8892007 - 8892232
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||   | ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8892007 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 8892106  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  8892107 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 8892206  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8892207 atcatgtttacagcagcgtgattcgg 8892232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 8903242 - 8903467
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||   | ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8903242 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 8903341  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  8903342 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 8903441  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8903442 atcatgtttacagcagcgtgattcgg 8903467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3696582 - 3696395
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||  || | || ||||||||||    
T  3696582 ctgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcatgat 3696483  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttc 191  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  3696482 cgtggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttc 3696395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4773510 - 4773284
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || |||||||    
T  4773510 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 4773411  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| ||||||  ||| || || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  4773410 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4773311  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  4773310 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 4773284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27008231 - 27008005
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || |||||||    
T  27008231 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 27008132  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | | ||    
T  27008131 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacac 27008032  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  27008031 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 27008005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27019640 - 27019461
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||  || |||| |||||||    
T  27019640 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaactcaaagcattacgaaggcatcctaggcacttggcat 27019541  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagt 180  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  27019540 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaggggagttgcgacgttacggacatcaagt 27019461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 27359684 - 27359910
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || |||||||    
T  27359684 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 27359783  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | || || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  27359784 gatcatggctgaacagagaggctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27359883  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  27359884 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 27359910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 27450027 - 27450253
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || |||||||    
T  27450027 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 27450126  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | || || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  27450127 gatcatggctgaacagagaggctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27450226  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  27450227 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 27450253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Original strand, 33373952 - 33374174
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||  || ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33373952 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 33374051  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
     |||| ||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  33374052 gtggtcaaacagagaggcttggcataacccgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 33374151  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    |||||||| |||||||| |||||    
T  33374152 atcatgttcacagcagcgtgatt 33374174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 221
Target Start/End: Original strand, 17092156 - 17092352
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctt 124  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||| | | ||||||| ||  ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  17092156 ttcatcaagccctggatgtcattttgaacaatgtagcaacccaaaggatcacggaagtattatgggcaactgctatgatcatggtcaaacaaagaggctt 17092255  T
Q  125 tgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagc 221  Q
      ||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  17092256 gacatagcttgatgtttagaggcaccagaggagttgcaacactgcggacatcaagtttggtagcttcctcacatacctcagtcatgttcacagcagc 17092352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 26777302 - 26777533
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || | || |||||||    
T  26777302 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 26777401  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagct-----tgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctca 195  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| ||||     ||| | | || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||    
T  26777402 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagagcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggattttcctca 26777501  T
Q  196 tatacctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     | || || ||||| || ||||| ||||||||    
T  26777502 cacacttcgatcatattcacagcggcatgatt 26777533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 27629392 - 27629615
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||| |   ||||||||| |||||| |   ||| || | |||| || |||    
T  27629392 tcactaacagtcagatgattatcattcatcaagctctggatatcctcttgcacaacgcggcaacccaagggattaagggcgcactcggagcaactgtcat 27629491  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||| || ||    || || || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||  |    
T  27629492 gatcatgtttaaacaaagaagcctggcaaagtttaacatgcaggggcaccaaaggagtcgcaacattacggacatctagtttgggcgcttcttcatacgc 27629591  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatg 224  Q
     |||||||||||||| ||||||||    
T  27629592 ttcaatcatgtttactgcagcatg 27629615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17025658 - 17025555
Alignment:
Q  124 ttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcat 223  Q
    ||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| ||||    
T  17025658 ttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcat 17025559  T
Q  224 gatt 227  Q
    ||||    
T  17025558 gatt 17025555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 21702926 - 21703131
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  21702926 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggtatgatcgtggttaaacagagaggctt 21703025  T
Q  125 tgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatg 224  Q
     |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21703026 ggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtg 21703125  T
Q  225 attcgg 230  Q
    ||||||    
T  21703126 attcgg 21703131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28882717 - 28882491
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  28882717 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 28882618  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28882617 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 28882518  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  28882517 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 28882491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 27434182 - 27434408
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  27434182 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 27434281  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  27434282 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 27434381  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  27434382 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 27434408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12656045 - 12655819
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  || |||| |||||||    
T  12656045 tcactcacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggtatcctaggcacttggcat 12655946  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12655945 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 12655846  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||    
T  12655845 ttcgatcatatttacggcggcatgatt 12655819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 9349720 - 9349946
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||| || ||| | |||  || | || |||||||    
T  9349720 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttggcat 9349819  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  9349820 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggggttgtaacattacggacgtcaagaccgggagcttcctcatatac 9349919  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||    
T  9349920 ctcaatcatgttcacagcagcgtgatt 9349946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20838421 - 20838195
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  20838421 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 20838322  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20838321 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 20838222  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||  |||||||| ||||||||    
T  20838221 ttcgatcaaatttacagcggcatgatt 20838195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Original strand, 22925769 - 22925992
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  22925769 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaagaattacagaatcattcttggcaattggcatgat 22925868  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22925869 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 22925968  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  22925969 aatcatgttcacagcagcgtgatt 22925992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 23128304 - 23128530
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  23128304 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatatcatcttgaatagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 23128403  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||  | |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23128404 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaagcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 23128503  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  23128504 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 23128530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 34303045 - 34303270
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || || |||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| |   ||| | ||||||||||||||||||    
T  34303045 tgacagtcagataattgtcgttgatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattttgggcaattggcatgatc 34303144  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    || || |||||  || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303145 attgtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 34303244  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||    
T  34303245 atcatgtttatagcagcatgtttcgg 34303270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27777725 - 27777499
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  27777725 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 27777626  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  27777625 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27777526  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  27777525 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 27777499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27817483 - 27817257
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  27817483 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 27817384  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  27817383 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27817284  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  27817283 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 27817257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32050301 - 32050075
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  32050301 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 32050202  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | ||    
T  32050201 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 32050102  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||    
T  32050101 ttcaatcatattcacagcggcatgatt 32050075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12587313 - 12587087
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  12587313 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 12587214  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  12587213 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 12587114  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  12587113 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 12587087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 12716340 - 12716566
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  12716340 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 12716439  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12716440 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 12716539  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  12716540 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 12716566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 13936282 - 13936508
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  || | |||  || | || |||||||    
T  13936282 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcgcggaggcatcctagacatttggcat 13936381  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  13936382 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 13936481  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  13936482 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 13936508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27804210 - 27803984
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  27804210 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 27804111  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || ||| |||||||||| |||||||||||| | ||    
T  27804110 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggtcatcaagtctaggagcttcctcacacac 27804011  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  27804010 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 27803984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 39051560 - 39051786
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  39051560 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgttgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 39051659  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  39051660 gatcatggctgatcagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 39051759  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  39051760 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 39051786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27119187 - 27118962
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27119187 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 27119088  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27119087 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacaaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctca 27118988  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||    
T  27118987 atcatgtttacaacagcgtgattcgg 27118962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 16829076 - 16829302
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  16829076 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 16829175  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  16829176 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 16829275  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  16829276 ctcgatcatattcacagcggcatgatt 16829302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16892405 - 16892179
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  16892405 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 16892306  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  16892305 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 16892206  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  16892205 ctcgatcatattcacagcggcatgatt 16892179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 19416237 - 19416463
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  19416237 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 19416336  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  19416337 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 19416436  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  19416437 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 19416463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 19456162 - 19456388
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| |  ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||    
T  19456162 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaaactctggatatcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattccgggcaactggcatgat 19456261  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19456262 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcactagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctc 19456361  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  19456362 aatcatgttcacaacagcgtgattcgg 19456388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37375664 - 37375438
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || | || |||||||    
T  37375664 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 37375565  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| || | ||    
T  37375564 gttcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttccccacacac 37375465  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  37375464 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 37375438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 11634924 - 11635150
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  |  | || |||||||    
T  11634924 tcaccgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 11635023  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||  | ||    
T  11635024 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacac 11635123  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  11635124 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 11635150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 11641113 - 11641339
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  |  | || |||||||    
T  11641113 tcaccgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 11641212  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||  | ||    
T  11641213 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacac 11641312  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  11641313 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 11641339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 37685647 - 37685873
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  37685647 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 37685746  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  37685747 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 37685846  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  37685847 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 37685873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 37700912 - 37701138
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  37700912 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 37701011  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  37701012 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 37701111  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  37701112 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 37701138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37925996 - 37925770
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  37925996 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 37925897  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  37925896 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 37925797  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  37925796 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 37925770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3785153 - 3784928
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||   | ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3785153 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 3785054  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  3785053 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 3784954  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3784953 atcatgtttacagcagcgtgattcgg 3784928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 31891070 - 31891295
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||  || ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31891070 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 31891169  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || | ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31891170 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtggtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 31891269  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31891270 atcatgtttacagcagcgtgattcgg 31891295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34157509 - 34157284
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||   | ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34157509 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 34157410  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  34157409 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 34157310  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34157309 atcatgtttacagcagcgtgattcgg 34157284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16164102 - 16163873
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  16164102 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacataatcattcttggcaattggcatgat 16164003  T
Q  104 catggttaaacaga---gaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||| |||||||   || |||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||||||||||||||||||    
T  16164002 catggtcaaacagagaggaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatac 16163903  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16163902 ctcaatcatgtttacagcagcgtgattcgg 16163873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 260491 - 260717
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  260491 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 260590  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||||| ||| |||||||  | ||    
T  260591 gatcgtggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcgcacac 260690  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  260691 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 260717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34286857 - 34286631
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| | |||  || | || |||||||    
T  34286857 tcactgacagtcagaaaattatcgttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcat 34286758  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| |||     
T  34286757 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 34286658  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||    
T  34286657 ctcgatcatattcacggcagcatgatt 34286631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34291917 - 34291691
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| | |||  || | || |||||||    
T  34291917 tcactgacagtcagaaaattatcgttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcat 34291818  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| |||     
T  34291817 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 34291718  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||    
T  34291717 ctcgatcatattcacggcagcatgatt 34291691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34862183 - 34861957
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  34862183 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 34862084  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||| | ||    
T  34862083 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatctagtctcggagcttcttcacacac 34861984  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  34861983 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 34861957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39890577 - 39890351
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  39890577 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagccttggatgtcgtcttgaacaacatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 39890478  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  39890477 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 39890378  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  39890377 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 39890351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40234014 - 40233788
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||| | |||  |  | || |||||||    
T  40234014 tcactgacagttagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcccagacacttggcat 40233915  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  40233914 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 40233815  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  40233814 ttcgatcattttcacagcggcatgatt 40233788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 21676920 - 21677146
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  21676920 tcactgacggtcagaagattatcattcatcaagctttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 21677019  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | ||    
T  21677020 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 21677119  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  21677120 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 21677146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31876784 - 31876558
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||| | ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  31876784 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagggtcacggagacatcccagacacttggcat 31876685  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  31876684 gatcatgattgaacagagaaactttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 31876585  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  31876584 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 31876558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 46734 - 46960
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  46734 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagccttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 46833  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  46834 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 46933  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  46934 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 46960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Original strand, 39822 - 40044
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||    
T  39822 tgacagtcaaaaaattatcattcgtcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatc 39921  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||     
T  39922 atggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcg 40021  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||||    
T  40022 atcatatttacagcggcatgatt 40044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30270 - 30044
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||| |||  || |||| ||||| |    
T  30270 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattccgaaggcatcctaggcacttggcgt 30171  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  30170 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaagagcttcctcacatac 30071  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||  ||||||||    
T  30070 ttcgatcatatttacagtggcatgatt 30044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14665540 - 14665314
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  14665540 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 14665441  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14665440 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 14665341  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  14665340 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 14665314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 24592063 - 24592289
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||  || |||| |||||||    
T  24592063 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcat 24592162  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24592163 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24592262  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  24592263 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 24592289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17014522 - 17014296
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  17014522 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 17014423  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17014422 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 17014323  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  17014322 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 17014296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 14763053 - 14763279
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  || | || |||||||    
T  14763053 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcat 14763152  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  14763153 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 14763252  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  14763253 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 14763279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15228368 - 15228163
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| | | |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  15228368 ttcatcaagctctggatgtcatttcgaacaacgtggcaacctaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 15228269  T
Q  125 tgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatg 224  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  15228268 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacatcaagtctgggagctatctcatataccccaatcatgttcacagcagcgtg 15228169  T
Q  225 attcgg 230  Q
    ||||||    
T  15228168 attcgg 15228163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6570375 - 6570149
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| | |||  || | || |||||||    
T  6570375 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcat 6570276  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
     ||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  6570275 aatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 6570176  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  6570175 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 6570149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 18800362 - 18800588
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  18800362 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 18800461  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  18800462 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18800561  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  18800562 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 18800588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 36344264 - 36344490
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || | || |||||||    
T  36344264 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 36344363  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  36344364 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 36344463  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  36344464 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 36344490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 54833905 - 54833683
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  || | || |||||||||||    
T  54833905 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttggcatgatc 54833806  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || ||     
T  54833805 atggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcg 54833706  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  54833705 atcatattcacagcggcatgatt 54833683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1900776 - 1900550
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| |  ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||| | || || ||||||||| ||||||| |    
T  1900776 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatttcattttgaacaacgtagcaacccaaagtattatggaatcattctgggcaactggcatggt 1900677  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1900676 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttatgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctc 1900577  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1900576 aatcatgtttacagcagcgtgattcgg 1900550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 15284680 - 15284906
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| |  ||| || |||||||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||    
T  15284680 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaaactctagatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcatttcgggcaactggcatgat 15284779  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15284780 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctc 15284879  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||    
T  15284880 aatcatgttcacagcaacgtgattcgg 15284906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21970223 - 21969997
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  21970223 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 21970124  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | |     
T  21970123 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacat 21970024  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||    
T  21970023 ttcaatcatattcacagcggcatgatt 21969997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30754276 - 30754050
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  30754276 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 30754177  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  30754176 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 30754077  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  30754076 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 30754050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 31126267 - 31126493
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  31126267 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 31126366  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  31126367 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 31126466  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  31126467 ctcgatcatattcacagcggcatgatt 31126493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 33673547 - 33673773
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  33673547 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 33673646  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | ||    
T  33673647 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 33673746  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  33673747 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 33673773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39851160 - 39850934
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| || |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  39851160 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 39851061  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  39851060 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 39850961  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  39850960 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 39850934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 40105387 - 40105613
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  40105387 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 40105486  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  40105487 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 40105586  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  40105587 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 40105613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 27163066 - 27163292
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  |  | || |||||||    
T  27163066 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 27163165  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  27163166 gatcatgattgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggtaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27163265  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  27163266 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 27163292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5006395 - 5006168
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||| | |||  |  | || |||||||    
T  5006395 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaatccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 5006296  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  5006295 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttaatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 5006196  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgattc 228  Q
     || ||||| || ||||| |||||||||    
T  5006195 ttcgatcatattcacagcggcatgattc 5006168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14099063 - 14098837
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  14099063 tcactgacagtcagaaggttatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 14098964  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  14098963 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 14098864  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  14098863 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 14098837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 24460358 - 24460583
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||   | ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24460358 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 24460457  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  24460458 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 24460557  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24460558 atcatgtttacagcagcgtgattcgg 24460583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Original strand, 15391090 - 15391314
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    ||||||||||||  ||| || ||||||| ||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||| |||||||| |   ||| |||||||||||||||||||    
T  15391090 ctgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgat 15391189  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
     ||||| |||||  || |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||    |||    
T  15391190 tatggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggatgtcaagactgggaacttcttcatgactctc 15391289  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgattc 228  Q
     |||||||| |||||||| ||||||    
T  15391290 gatcatgttcacagcagcgtgattc 15391314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 230
Target Start/End: Original strand, 14235300 - 14235503
Alignment:
Q  27 catcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctttg 126  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||| | | ||| || || |||  |||||| ||||||| |||||  ||||||| |    
T  14235300 catcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcagcctaaaggattatggaggcattccggacaaacggcatggtcatggtcaaacaaggaagcttgg 14235399  T
Q  127 catagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatgat 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||| |||||||| ||||    
T  14235400 catagcttgatgtgtagtggtaccagaggagtcgcaacgttacgaacgtcaagactgggagcttcttcataggtctcaatcatgttcacagcagcgtgat 14235499  T
Q  227 tcgg 230  Q
    ||||    
T  14235500 tcgg 14235503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24113158 - 24112958
Alignment:
Q  27 catcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctttg 126  Q
    ||||||||| ||||  || ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||  | || ||| |||| || ||||||||||| | |||||   |||||| |    
T  24113158 catcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcacttagcatgatcatgttcaaacaataaagcttgg 24113059  T
Q  127 catagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatgat 226  Q
    || | |||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  24113058 cacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgat 24112959  T
Q  227 t 227  Q
    |    
T  24112958 t 24112958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 227
Target Start/End: Original strand, 34188805 - 34188935
Alignment:
Q  97 gcatgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 196  Q
    ||||||||||| | |||||   |||||| ||| | |||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || |||     
T  34188805 gcatgatcatgttcaaacaacaaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcac 34188904  T
Q  197 atacctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  34188905 atatctcaatcatattcacggcagcatgatt 34188935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6192784 - 6192558
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  6192784 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 6192685  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6192684 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 6192585  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  6192584 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 6192558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 15740884 - 15741110
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  15740884 tcactaacagtcaaaaaattatcatccatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 15740983  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15740984 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 15741083  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  15741084 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 15741110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18051730 - 18051504
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||  || |||||||| |||    
T  18051730 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaattgacat 18051631  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  18051630 gatcatggctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagctttctcacatac 18051531  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18051530 ttcaatcatgttcacagcggcatgatt 18051504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18530853 - 18530627
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| |  ||| || ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18530853 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagccctggatgtcattttgaacaacatagcaacccaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgat 18530754  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||| | | |||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18530753 catggtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacgaacattaagtctgggagctccctcatatacctc 18530654  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18530653 aatcatgttcacagcagcgtgattcgg 18530627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7073680 - 7073454
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  7073680 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaagggttacgaaggcattctaggcacttggcat 7073581  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  7073580 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 7073481  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || |||||||| ||||| ||||||||    
T  7073480 ttcgatcatgttcacagcggcatgatt 7073454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8296440 - 8296214
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  8296440 tcactgacagtcaaaaaatcatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 8296341  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8296340 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 8296241  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  8296240 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 8296214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Original strand, 31033910 - 31034133
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  31033910 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 31034009  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31034010 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 31034109  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  31034110 aatcatgttcacagcagcgtgatt 31034133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32293217 - 32292994
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||    
T  32293217 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 32293118  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32293117 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 32293018  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  32293017 aatcatgttcacagcagcgtgatt 32292994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 4796443 - 4796669
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  4796443 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 4796542  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4796543 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 4796642  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  4796643 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 4796669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 8301057 - 8301283
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  8301057 tcaccgacaatcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 8301156  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  8301157 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 8301256  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  8301257 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 8301283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28021743 - 28021517
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  || | || |||||||    
T  28021743 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 28021644  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28021643 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 28021544  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  28021543 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 28021517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 16626320 - 16626525
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  16626320 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattatggaagcattccgggcaactggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 16626419  T
Q  125 tgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatg 224  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  16626420 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagtgtg 16626519  T
Q  225 attcgg 230  Q
    ||||||    
T  16626520 attcgg 16626525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4722099 - 4721873
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  4722099 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 4722000  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  4721999 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcgagtctaggagcttcctcacatac 4721900  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||| | ||||||||    
T  4721899 ttcgatcatattcacaacggcatgatt 4721873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 15892496 - 15892722
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || |||  || |||| |||||||    
T  15892496 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacaaaggcatcctaggcacttggcat 15892595  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15892596 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 15892695  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  15892696 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 15892722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18243207 - 18242981
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || | || |||||||    
T  18243207 tcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 18243108  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  18243107 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18243008  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  18243007 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 18242981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 18276842 - 18277068
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  || | || |||||||    
T  18276842 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcat 18276941  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  18276942 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18277041  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  18277042 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 18277068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 18307444 - 18307670
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  || | || |||||||    
T  18307444 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcat 18307543  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  18307544 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18307643  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  18307644 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 18307670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48466395 - 48466169
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| | |||  || | || |||||||    
T  48466395 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcat 48466296  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  48466295 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 48466196  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  48466195 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 48466169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5652851 - 5652626
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5652851 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5652752  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5652751 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcacatacctca 5652652  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  5652651 atcatgttcacagcagcatgattcgg 5652626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 18292143 - 18292369
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  || | || |||||||    
T  18292143 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcat 18292242  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  18292243 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18292342  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  18292343 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 18292369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18331137 - 18330911
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  18331137 tcactaacagtcaaaaaattttcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacctaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 18331038  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18331037 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 18330938  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  18330937 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 18330911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 20576637 - 20576863
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  20576637 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 20576736  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  20576737 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 20576836  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  20576837 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 20576863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21675161 - 21674935
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  21675161 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 21675062  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  21675061 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 21674962  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  21674961 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 21674935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 29148545 - 29148771
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  || | || |||||||    
T  29148545 tcactgacagtcaaagaattgtcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 29148644  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29148645 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 29148744  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||    
T  29148745 ttcgatcatatttacagcggcatgatt 29148771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 51782491 - 51782265
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  51782491 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 51782392  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  51782391 gatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 51782292  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  51782291 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 51782265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24328627 - 24328401
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  24328627 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 24328528  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  24328527 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 24328428  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  24328427 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 24328401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35881234 - 35881008
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||    
T  35881234 tcactaacagtcaaaaaaatttcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 35881135  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  35881134 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 35881035  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  35881034 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 35881008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 36996867 - 36997093
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  36996867 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 36996966  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  36996967 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 36997066  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  36997067 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 36997093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 11110139 - 11110365
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  11110139 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 11110238  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  11110239 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtcttggagcttcctcacacac 11110338  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||    
T  11110339 ttcaatcatattcacagcggcatgatt 11110365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 22387368 - 22387594
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  || | || |||||||    
T  22387368 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaagaattacgaaggcatcctagacacttggcat 22387467  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||   | |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22387468 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgttgtgtataagcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 22387567  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  22387568 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 22387594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4417387 - 4417161
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  |  | || |||||||    
T  4417387 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagttttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatccgagacacttggcat 4417288  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  4417287 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4417188  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  4417187 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 4417161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5014180 - 5013954
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  5014180 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 5014081  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  5014080 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 5013981  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  5013980 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 5013954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 5596147 - 5596373
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||  | |||  || | || |||||||    
T  5596147 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 5596246  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  ||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  5596247 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 5596346  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  5596347 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 5596373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 5609112 - 5609338
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  5609112 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 5609211  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  5609212 gatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 5609311  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  5609312 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 5609338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8212206 - 8211980
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  8212206 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacatcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 8212107  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  8212106 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 8212007  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  8212006 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 8211980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 28115744 - 28115970
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||  |  | || |||||||    
T  28115744 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 28115843  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||  | ||    
T  28115844 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacac 28115943  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  28115944 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 28115970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 29664760 - 29664954
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  29664760 tcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 29664859  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctca 195  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  29664860 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 29664954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5713691 - 5713466
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||   | ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5713691 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5713592  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5713591 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5713492  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5713491 atcatgtttacagcagcgtgattcgg 5713466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5724601 - 5724376
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||   | ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5724601 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5724502  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5724501 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5724402  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5724401 atcatgtttacagcagcgtgattcgg 5724376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 5767767 - 5767992
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||   | ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5767767 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5767866  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5767867 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5767966  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5767967 atcatgtttacagcagcgtgattcgg 5767992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 17993578 - 17993803
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||   | ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||| |||  || | || |||||||||||    
T  17993578 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatc 17993677  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  17993678 atggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 17993777  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17993778 atcatgtttacagcagcgtgattcgg 17993803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 6542252 - 6542478
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  6542252 tcactgacggtcaggaaattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 6542351  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | | ||    
T  6542352 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacac 6542451  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  6542452 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 6542478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28339770 - 28339544
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  28339770 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 28339671  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  28339670 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 28339571  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  28339570 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 28339544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47023921 - 47023731
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  47023921 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 47023822  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttc 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  47023821 gatcatgattaaacagagaagctttgcgcagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 47023731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 4346477 - 4346703
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| ||||||| || |||  || | || |||||||    
T  4346477 tcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcat 4346576  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  4346577 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4346676  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  4346677 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 4346703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5467453 - 5467227
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  5467453 tcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 5467354  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  5467353 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 5467254  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  5467253 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 5467227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10396601 - 10396375
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  10396601 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 10396502  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |  |||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  10396501 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgatgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 10396402  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  10396401 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 10396375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4626408 - 4626183
Alignment:
Q  5 tgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 104  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||   | ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4626408 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 4626309  T
Q  105 atggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  4626308 atggtcaaacagagaggctcggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagctttctcatatacctca 4626209  T
Q  205 atcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4626208 atcatgtttacagcagcgtgattcgg 4626183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Original strand, 31964266 - 31964489
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||| |    
T  31964266 ctgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgct 31964365  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || ||    
T  31964366 catggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttc 31964465  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     ||||| || ||||| ||||||||    
T  31964466 gatcatattcacagcggcatgatt 31964489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18225659 - 18225469
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  18225659 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacggtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 18225560  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttc 191  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  18225559 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttc 18225469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 22870646 - 22870872
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| ||||||| || |||  || | || |||||||    
T  22870646 tcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcat 22870745  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | ||    
T  22870746 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 22870845  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  22870846 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 22870872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 22885705 - 22885931
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| ||||||| || |||  || | || |||||||    
T  22885705 tcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcat 22885804  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | ||    
T  22885805 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 22885904  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  22885905 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 22885931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7997030 - 7996804
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  7997030 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 7996931  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||| | ||    
T  7996930 gatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacac 7996831  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  7996830 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 7996804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10643538 - 10643312
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  10643538 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 10643439  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||| | ||    
T  10643438 gatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacac 10643339  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  10643338 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 10643312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 17984746 - 17984972
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||| ||||||||||| |||  || | || |||||||    
T  17984746 tcactgacggtcagaagatcatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacaatatggcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 17984845  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||  | |||||||||||||| || |||||| | || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  17984846 gatcatgactgaacagagaagctttacacagcttgatatgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcttcacacac 17984945  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  17984946 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 17984972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Original strand, 5756940 - 5757101
Alignment:
Q  68 aaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacatt 167  Q
    |||||||| | ||||| |||||  || ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5756940 aaggattatggaagcattctggcaaactggcatgatcatg-tcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgtt 5757038  T
Q  168 acggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||  || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5757039 acaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcgg 5757101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 51797462 - 51797355
Alignment:
Q  120 agctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagca 219  Q
    ||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| || |||||     
T  51797462 agctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcg 51797363  T
Q  220 gcatgatt 227  Q
    ||||||||    
T  51797362 gcatgatt 51797355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Original strand, 50133990 - 50134087
Alignment:
Q  130 agcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    |||||| |||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| ||||||||    
T  50133990 agcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatt 50134087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20066370 - 20066285
Alignment:
Q  142 agtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||| | || ||| ||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  20066370 agtggtaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcacgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatt 20066285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32439481 - 32439396
Alignment:
Q  142 agtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  32439481 agtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatt 32439396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30960 - 30733
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaaga-ttatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 99  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  30960 tcactgacagtcaaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 30861  T
Q  100 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatata 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  30860 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 30761  T
Q  200 cctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||    
T  30760 cttcgatcatatttacagcggcatgatt 30733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20729 - 20665
Alignment:
Q  166 ttacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20729 ttacgaacatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcgg 20665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6521 - 6295
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || | || |||||||    
T  6521 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 6422  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||| | ||    
T  6421 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacacac 6322  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  6321 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 6295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 230
Target Start/End: Original strand, 1832 - 1896
Alignment:
Q  166 ttacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1832 ttacgaacatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcgg 1896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 2410 - 2636
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |  || |||||||||||||||  || || ||||| ||| |||||||||    
T  2410 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgat 2509  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 2609  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2610 aatcatgttcacagcagcgtgattcgg 2636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27800 - 27573
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagatta-tcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 99  Q
    ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||    
T  27800 tcactaacagtcaaaaaattaatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 27701  T
Q  100 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatata 199  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  27700 tgatcatggctaaatagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacata 27601  T
Q  200 cctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||    
T  27600 cttcgatcatatttacagcggcatgatt 27573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10073 - 9847
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  10073 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 9974  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||||| | |||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  9973 gatcatggctgaacagaaaggctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 9874  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  9873 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 9847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8456 - 8230
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||  || | || ||| |||    
T  8456 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcat 8357  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  8356 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 8257  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  8256 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 8230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 6988 - 7178
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  6988 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 7087  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttc 191  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  7088 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 7178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 8815 - 9041
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || |||||||    
T  8815 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 8914  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  8915 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 9014  T
Q  201 ctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||    
T  9015 ttcgatcatattcacagcggcatgatt 9041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20523 - 20296
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaa-gattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggca 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||  || | || ||||||    
T  20523 tcactgacagtcagaaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggca 20424  T
Q  100 tgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatata 199  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| | |    
T  20423 tgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacaca 20324  T
Q  200 cctcaatcatgtttacagcagcatgatt 227  Q
    | || ||||| || ||||| ||||||||    
T  20323 cttcgatcatattcacagcggcatgatt 20296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 14679 - 14873
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||  |  | || |||||||    
T  14679 tcactgacagtcagaaagttatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 14778  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctca 195  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14779 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 14873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22044 - 21839
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcatggttaaacagagaagctt 124  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||    
T  22044 ttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacaaggaggctt 21945  T
Q  125 tgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatg 224  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||  |||||   ||| |||||||| |||||||| ||    
T  21944 ggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagaccgggaactttttcataagtctcgatcatgttcacagcagcgtg 21845  T
Q  225 attcgg 230  Q
    ||||||    
T  21844 attcgg 21839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 370 - 596
Alignment:
Q  4 ctgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat 103  Q
    |||||||| |||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | || |||||| |||||||| |   ||| | |||||||||||||||||    
T  370 ctgacagtaagataattgtcattcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtaacaaccccaaggattatggcggcattatgggcaattggcatgat 469  T
Q  104 catggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||| |||||  ||  ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||   |||    
T  470 catggtcaaacaaggagacttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagactgggaacttcttcataagtctc 569  T
Q  204 aatcatgtttacagcagcatgattcgg 230  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||    
T  570 gatcatgttcacagcagcgtgattcgg 596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 25950 - 26140
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||  | |||  || | || |||||||    
T  25950 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 26049  T
Q  101 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttc 191  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | |||| | ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  26050 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 26140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Original strand, 46561 - 46729
Alignment:
Q  18 attatcattcatcaagcttt-ggatgtcatt-ttgaacagcatagcaacccaaa-ggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgat-catggttaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||  || |||| |||||||||| ||||| | ||    
T  46561 attatcattcatcaagcttttggatgtcaatcttgaacagtaaagcaacccaaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgattcatggctgaa 46660  T
Q  114 cagagaagctttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtct 182  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  46661 cagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtct 46729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 227
Target Start/End: Original strand, 1 - 104
Alignment:
Q  124 ttgcatagcttgctgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcat 223  Q
    ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||    
T  1 ttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcat 100  T
Q  224 gatt 227  Q
    ||||    
T  101 gatt 104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 449 - 373
Alignment:
Q  148 accagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcatg 224  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  449 accaaaggagtcgcaacattacggacatctagtttgggtgcttcttcatacgcttcaatcatgtttactgcagcatg 373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 592 - 552
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggat 41  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  592 tcactaacagtcagatgattatcattcatcaagctctggat 552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University