View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8912A_low_84 (Length: 349)

Name: NF8912A_low_84
Description: NF8912A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8912A_low_84
NF8912A_low_84
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (1-337)||(16041143-16041479)
chr7 (1-337)||(16449985-16450321)
chr7 (10-337)||(31088451-31088778)
chr7 (10-337)||(45733289-45733616)
chr7 (1-309)||(16503395-16503706)
chr7 (1-309)||(16518431-16518742)
chr7 (1-309)||(10916883-10917191)
chr7 (166-337)||(2108992-2109163)
chr7 (166-337)||(26484679-26484850)
chr7 (1-330)||(5127809-5128141)
chr7 (166-337)||(39211010-39211181)
chr7 (166-337)||(2775344-2775515)
chr7 (55-309)||(11424791-11425048)
chr7 (1-329)||(5159339-5159667)
chr7 (166-329)||(18540784-18540947)
chr7 (1-309)||(2154390-2154701)
chr7 (2-330)||(5147334-5147665)
chr7 (1-330)||(26435074-26435406)
chr7 (1-330)||(16736454-16736786)
chr7 (1-330)||(16751508-16751840)
chr7 (1-330)||(17529534-17529866)
chr7 (1-309)||(4145138-4145449)
chr7 (1-330)||(17523349-17523681)
chr7 (1-309)||(26319884-26320195)
chr7 (1-309)||(45387160-45387471)
chr7 (1-309)||(26275109-26275420)
chr7 (1-309)||(9618468-9618779)
chr7 (1-309)||(26669929-26670240)
chr7 (1-309)||(24592556-24592867)
chr7 (190-309)||(3445315-3445434)
chr7 (188-309)||(31564405-31564526)
chr7 (1-309)||(26537885-26538199)
chr7 (166-309)||(31124905-31125048)
chr7 (199-309)||(11441590-11441700)
chr7 (1-186)||(26485885-26486070)
chr7 (1-131)||(11441377-11441507)
chr7 (1-131)||(31124728-31124858)
chr7 (1-131)||(31564595-31564725)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (1-337)||(22888298-22888634)
chr5 (1-337)||(25198857-25199193)
chr5 (10-337)||(13184646-13184973)
chr5 (10-337)||(33877084-33877411)
chr5 (10-337)||(13440492-13440819)
chr5 (10-337)||(11325631-11325958)
chr5 (1-337)||(23892031-23892370)
chr5 (154-337)||(29889080-29889263)
chr5 (28-309)||(24969876-24970154)
chr5 (1-309)||(30934461-30934769)
chr5 (1-330)||(23752455-23752787)
chr5 (1-330)||(33777312-33777644)
chr5 (1-309)||(23718014-23718325)
chr5 (1-309)||(24688183-24688494)
chr5 (1-309)||(11549179-11549490)
chr5 (1-330)||(22999119-22999451)
chr5 (1-329)||(33292353-33292681)
chr5 (1-330)||(32599477-32599806)
chr5 (55-309)||(34616400-34616654)
chr5 (1-309)||(8665501-8665812)
chr5 (55-330)||(9548548-9548826)
chr5 (1-309)||(15758883-15759194)
chr5 (1-309)||(18375438-18375749)
chr5 (2-309)||(30168295-30168605)
chr5 (1-330)||(15658765-15659097)
chr5 (1-309)||(12131980-12132291)
chr5 (1-309)||(26480217-26480528)
chr5 (1-309)||(33516181-33516492)
chr5 (1-330)||(6874127-6874462)
chr5 (166-309)||(2511044-2511187)
chr5 (56-330)||(41674589-41674866)
chr5 (1-309)||(5637735-5638046)
chr5 (1-309)||(9317276-9317587)
chr5 (1-330)||(37671488-37671829)
chr5 (1-309)||(29967092-29967403)
chr5 (1-309)||(30151843-30152154)
chr5 (1-309)||(31431253-31431576)
chr5 (188-330)||(28649250-28649392)
chr5 (1-309)||(30029240-30029551)
chr5 (1-330)||(43078074-43078409)
chr5 (166-309)||(28959812-28959955)
chr5 (190-309)||(31826433-31826552)
chr5 (166-309)||(37358669-37358812)
chr5 (1-131)||(3789351-3789481)
chr5 (188-330)||(37770992-37771134)
chr5 (188-330)||(18500735-18500877)
chr5 (188-309)||(3789556-3789677)
chr5 (188-309)||(37754995-37755116)
chr5 (1-131)||(37358862-37358992)
chr5 (55-131)||(18500955-18501031)
chr5 (1-131)||(13325051-13325181)
chr5 (1-131)||(31826626-31826756)
chr5 (188-329)||(13324835-13324976)
chr5 (1-125)||(24681262-24681386)
chr5 (1-125)||(24723789-24723913)
chr5 (55-131)||(28649105-28649181)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (1-337)||(15227704-15228040)
chr4 (1-337)||(1900091-1900427)
chr4 (1-337)||(15285029-15285365)
chr4 (10-337)||(24460706-24461033)
chr4 (7-337)||(14235626-14235959)
chr4 (10-337)||(15391439-15391763)
chr4 (1-309)||(24592443-24592751)
chr4 (1-330)||(17013831-17014163)
chr4 (1-309)||(14664849-14665160)
chr4 (1-330)||(14763412-14763744)
chr4 (4-329)||(34189069-34189394)
chr4 (1-329)||(24112496-24112824)
chr4 (1-330)||(36344623-36344952)
chr4 (1-330)||(6569684-6570016)
chr4 (1-309)||(14098372-14098683)
chr4 (1-309)||(31126647-31126958)
chr4 (1-330)||(54833221-54833550)
chr4 (1-309)||(27163446-27163757)
chr4 (1-330)||(5005701-5006036)
chr4 (188-309)||(18800742-18800863)
chr4 (1-309)||(40105767-40106078)
chr4 (190-309)||(30753777-30753896)
chr4 (1-111)||(19373092-19373202)
chr4 (55-224)||(21969586-21969758)
chr4 (190-330)||(33673906-33674046)
chr4 (1-131)||(18800932-18801062)
chr4 (1-131)||(30753573-30753703)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (1-337)||(21703254-21703590)
chr2 (10-337)||(27118512-27118839)
chr2 (10-337)||(34303393-34303720)
chr2 (1-337)||(19456511-19456847)
chr2 (10-337)||(34156835-34157162)
chr2 (10-337)||(3784478-3784805)
chr2 (10-337)||(16163423-16163750)
chr2 (10-309)||(31891446-31891745)
chr2 (1-337)||(27434534-27434873)
chr2 (1-337)||(27392805-27393120)
chr2 (1-309)||(23128684-23128995)
chr2 (1-309)||(12655354-12655665)
chr2 (1-309)||(28882026-28882337)
chr2 (1-309)||(20837730-20838041)
chr2 (1-330)||(34279261-34279593)
chr2 (1-309)||(21677300-21677611)
chr2 (1-330)||(11635283-11635618)
chr2 (1-330)||(34286166-34286498)
chr2 (1-330)||(34291226-34291558)
chr2 (1-330)||(11641472-11641807)
chr2 (1-287)||(13936684-13936973)
chr2 (1-309)||(37925305-37925616)
chr2 (4-330)||(22926125-22926454)
chr2 (1-309)||(31876093-31876404)
chr2 (1-309)||(37686027-37686338)
chr2 (1-309)||(37701292-37701603)
chr2 (1-330)||(37374973-37375305)
chr2 (1-309)||(16829456-16829767)
chr2 (1-309)||(16891714-16892025)
chr2 (1-309)||(34861492-34861803)
chr2 (55-309)||(32049664-32049921)
chr2 (190-337)||(40233515-40233662)
chr2 (1-309)||(19416617-19416928)
chr2 (55-186)||(261009-261140)
chr2 (166-309)||(39890054-39890197)
chr2 (1-131)||(40233311-40233441)
chr2 (199-330)||(260850-260981)
chr2 (1-131)||(39889874-39890004)
chr2 (166-287)||(12716742-12716863)
chr2 (1-125)||(12716910-12717034)
chr2 (1-125)||(39052133-39052257)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (10-337)||(2759-3086)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (10-337)||(20340436-20340763)
chr1 (1-337)||(16208132-16208465)
chr1 (2-330)||(20460924-20461228)
chr1 (166-337)||(28151845-28152016)
chr1 (1-330)||(41793416-41793748)
chr1 (1-309)||(28584796-28585107)
chr1 (1-309)||(10962485-10962796)
chr1 (1-330)||(51638033-51638365)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (1-337)||(16626648-16626984)
chr3 (10-337)||(17993926-17994253)
chr3 (10-337)||(4625733-4626060)
chr3 (7-337)||(18530180-18530504)
chr3 (10-337)||(5652176-5652503)
chr3 (1-309)||(15892876-15893187)
chr3 (1-309)||(8301437-8301745)
chr3 (10-309)||(5713013-5713315)
chr3 (10-309)||(5723923-5724225)
chr3 (10-309)||(5757252-5757554)
chr3 (10-309)||(5768143-5768445)
chr3 (166-337)||(32292697-32292868)
chr3 (1-309)||(18051039-18051350)
chr3 (1-330)||(22387727-22388056)
chr3 (1-309)||(8295752-8296060)
chr3 (166-337)||(31034259-31034430)
chr3 (1-309)||(4796823-4797134)
chr3 (1-309)||(35880543-35880854)
chr3 (1-309)||(18330451-18330757)
chr3 (2-330)||(29148904-29149235)
chr3 (1-329)||(4892990-4893318)
chr3 (1-330)||(4721408-4721740)
chr3 (1-330)||(6192093-6192425)
chr3 (1-330)||(18277201-18277533)
chr3 (1-330)||(18292502-18292834)
chr3 (1-330)||(18307803-18308135)
chr3 (1-329)||(32438934-32439262)
chr3 (1-330)||(8211518-8211847)
chr3 (1-309)||(17985126-17985437)
chr3 (1-330)||(10395913-10396242)
chr3 (1-287)||(20065823-20066109)
chr3 (1-309)||(15741264-15741563)
chr3 (55-330)||(4346836-4347111)
chr3 (1-330)||(7072989-7073321)
chr3 (1-309)||(5466762-5467073)
chr3 (1-330)||(28116103-28116438)
chr3 (55-309)||(7996393-7996650)
chr3 (55-309)||(10642901-10643158)
chr3 (55-330)||(28021109-28021384)
chr3 (1-309)||(18224968-18225279)
chr3 (4-330)||(21674473-21674802)
chr3 (4-330)||(31964622-31964951)
chr3 (55-309)||(47023284-47023541)
chr3 (4-330)||(50134220-50134549)
chr3 (55-330)||(5609471-5609749)
chr3 (4-330)||(28339082-28339411)
chr3 (1-309)||(5596527-5596847)
chr3 (188-309)||(6542632-6542753)
chr3 (166-330)||(4416864-4417028)
chr3 (190-309)||(36997247-36997366)
chr3 (1-309)||(5013489-5013800)
chr3 (1-131)||(29665336-29665466)
chr3 (1-309)||(24327936-24328247)
chr3 (190-330)||(11110498-11110638)
chr3 (166-309)||(18242684-18242827)
chr3 (190-330)||(48465896-48466036)
chr3 (187-330)||(22871005-22871148)
chr3 (187-330)||(22886064-22886207)
chr3 (250-309)||(51782052-51782111)
chr3 (55-131)||(11110712-11110788)
chr3 (250-301)||(51797141-51797192)
chr3 (1-131)||(6542825-6542955)
chr3 (1-131)||(22871225-22871355)
chr3 (1-131)||(22886284-22886414)
chr3 (1-131)||(36997440-36997570)
chr3 (1-131)||(48465692-48465822)
chr3 (1-186)||(18242504-18242689)
chr3 (166-287)||(20577039-20577160)
[»] chr6 (59 HSPs)
chr6 (10-337)||(13522117-13522444)
chr6 (10-337)||(33374300-33374627)
chr6 (10-337)||(8892354-8892681)
chr6 (10-337)||(8903589-8903916)
chr6 (10-337)||(28162482-28162809)
chr6 (13-337)||(22477317-22477644)
chr6 (142-337)||(22456978-22457176)
chr6 (52-335)||(20160568-20160851)
chr6 (52-335)||(22171980-22172263)
chr6 (154-337)||(27290414-27290597)
chr6 (1-337)||(22934924-22935260)
chr6 (1-337)||(23857369-23857705)
chr6 (166-337)||(14143329-14143500)
chr6 (166-337)||(26787925-26788096)
chr6 (166-337)||(27196298-27196469)
chr6 (166-337)||(27252771-27252942)
chr6 (4-309)||(24304690-24304998)
chr6 (1-309)||(13299023-13299334)
chr6 (1-309)||(15424389-15424700)
chr6 (1-330)||(29549291-29549620)
chr6 (1-309)||(26988814-26989125)
chr6 (1-309)||(26999886-27000197)
chr6 (1-330)||(26918193-26918525)
chr6 (1-309)||(24863530-24863841)
chr6 (1-330)||(16749667-16749999)
chr6 (1-309)||(4525102-4525410)
chr6 (1-330)||(27044203-27044532)
chr6 (91-337)||(27272624-27272876)
chr6 (1-309)||(29572826-29573137)
chr6 (1-309)||(30558088-30558399)
chr6 (1-309)||(29501219-29501539)
chr6 (55-186)||(27629907-27630038)
chr6 (188-309)||(4773009-4773130)
chr6 (190-309)||(3696086-3696205)
chr6 (4-309)||(4757577-4757888)
chr6 (166-309)||(26777687-26777830)
chr6 (199-309)||(4545847-4545957)
chr6 (199-309)||(4724206-4724316)
chr6 (199-309)||(28207468-28207578)
chr6 (1-309)||(16944099-16944410)
chr6 (190-330)||(16674144-16674284)
chr6 (166-309)||(27485110-27485253)
chr6 (188-330)||(27007730-27007872)
chr6 (166-309)||(27360064-27360207)
chr6 (166-309)||(27450407-27450550)
chr6 (1-131)||(4546037-4546167)
chr6 (1-131)||(4724396-4724526)
chr6 (1-131)||(28207255-28207385)
chr6 (188-309)||(26116482-26116603)
chr6 (1-186)||(27484930-27485115)
chr6 (190-330)||(34463397-34463537)
chr6 (188-287)||(17025280-17025379)
chr6 (1-131)||(3695876-3696006)
chr6 (1-131)||(4772810-4772940)
chr6 (1-131)||(17025075-17025205)
chr6 (1-131)||(27007525-27007655)
chr6 (1-131)||(27360263-27360393)
chr6 (1-131)||(27450606-27450736)
chr6 (55-131)||(26777880-26777956)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (10-337)||(9354450-9354777)
chr8 (10-337)||(19659099-19659426)
chr8 (10-337)||(44562929-44563256)
chr8 (1-337)||(16283265-16283604)
chr8 (1-337)||(22080938-22081271)
chr8 (1-309)||(2137347-2137658)
chr8 (1-309)||(16277370-16277681)
chr8 (1-309)||(27608993-27609304)
chr8 (166-337)||(33244649-33244820)
chr8 (4-309)||(14557446-14557751)
chr8 (1-309)||(19687914-19688225)
chr8 (1-330)||(18710402-18710734)
chr8 (1-330)||(31354340-31354672)
chr8 (1-330)||(19286281-19286610)
chr8 (1-309)||(31489838-31490149)
chr8 (1-330)||(19674254-19674589)
chr8 (1-309)||(19208448-19208759)
chr8 (1-309)||(28362043-28362354)
chr8 (188-309)||(3329595-3329716)
chr8 (1-309)||(33258539-33258850)
chr8 (188-309)||(12092812-12092933)
chr8 (1-131)||(3329788-3329918)
chr8 (1-131)||(29829129-29829259)
chr8 (188-310)||(29829328-29829450)
chr8 (1-131)||(19518412-19518542)
chr8 (2-131)||(12093002-12093131)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-337)||(20228-20543)
scaffold0124 (1-309)||(30269-30579)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (154-337)||(129-312)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-337)||(21383-21716)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-309)||(29579-29890)
scaffold0089 (1-309)||(40198-40509)
scaffold0089 (55-309)||(47114-47371)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-309)||(27108-27419)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-309)||(258-570)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (252-337)||(2018-2103)
scaffold0415 (250-330)||(6080-6160)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-309)||(15059-15370)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-309)||(7368-7679)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (4-309)||(9195-9503)
scaffold0159 (4-309)||(19834-20142)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-302)||(26338-26642)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (158-330)||(9542-9714)
scaffold0336 (1-165)||(8048-8212)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (199-309)||(7966-8076)
scaffold0038 (1-131)||(7753-7883)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 16041143 - 16041479
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  16041143 gttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgt 16041242  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041243 catcgggtcaacctcaggtacccgttaattccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 16041342  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16041343 ccctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcct 16041442  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16041443 cccaggttccgttctgacctaaagtgtgatttccatc 16041479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16450321 - 16449985
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16450321 gttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtacgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattttatcatcagtatcctttgc 16450222  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16450221 catcgggtcaacctcaggtacccattaatgccgtcgttcagcaagtgcaacaacagccaccagctcaacagcaacagcagcaacaagctagacctacctt 16450122  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16450121 tcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatcctttgcct 16450022  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16450021 cccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatc 16449985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31088778 - 31088451
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31088778 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 31088679  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31088678 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 31088579  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  31088578 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 31088479  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  31088478 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 31088451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Original strand, 45733289 - 45733616
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45733289 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 45733388  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45733389 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 45733488  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  45733489 accaatgttatatgctgaattactcttaactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 45733588  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  45733589 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 45733616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16503706 - 16503395
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16503706 gttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgc 16503607  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| || ||| |||||||||  || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  16503606 caccgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 16503507  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16503506 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 16503407  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  16503406 cctccaaggttc 16503395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16518742 - 16518431
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16518742 gttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgc 16518643  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| || ||| |||||||||  || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  16518642 caccgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 16518543  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16518542 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 16518443  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  16518442 cctccaaggttc 16518431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10917191 - 10916883
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | ||| |||  ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||    
T  10917191 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgccttcgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtatcctctgc 10917092  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  10917091 caccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttt 10916992  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10916991 ccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcct 10916892  T
Q  301 cccaggttc 309  Q
    || ||||||    
T  10916891 ccaaggttc 10916883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2109163 - 2108992
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2109163 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 2109064  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  2109063 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 2108992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Original strand, 26484679 - 26484850
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484679 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 26484778  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  26484779 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 26484850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 5127809 - 5128141
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||    
T  5127809 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtatcctctgc 5127908  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  5127909 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 5128008  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5128009 ttttcctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggtaagcccccacctaatccgttg 5128108  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  5128109 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 5128141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 39211181 - 39211010
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39211181 caacaacgaccgcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 39211082  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
     ||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  39211081 tcagacaggggaagcttccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 39211010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Original strand, 2775344 - 2775515
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    ||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775344 caacaacgacagtagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagtagctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 2775443  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  2775444 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 2775515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 11425048 - 11424791
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 154  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||    
T  11425048 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 11424949  T
Q  155 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 251  Q
    ||   ||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  11424948 agttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatag 11424849  T
Q  252 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11424848 agggcattgcacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 11424791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 5159339 - 5159667
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  5159339 gttgctcctatcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 5159438  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || ||    
T  5159439 caccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttt 5159538  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || |||    
T  5159539 tcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacct 5159638  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtga 329  Q
    || |||||||  ||||| || ||||||||    
T  5159639 ccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 5159667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 166 - 329
Target Start/End: Original strand, 18540784 - 18540947
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18540784 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacttttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 18540883  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 329  Q
     ||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || ||||||||    
T  18540884 tcagacaggggaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 18540947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 2154390 - 2154701
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  2154390 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 2154489  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||  | | ||| || ||  ||||||||   |  |||||||   |||||||  |||| |||||||||| |||    
T  2154490 caccgggtcaacctcaagtatccgttaatgcaattgctcaacagataaaacaacagttgctggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacatac 2154589  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2154590 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 2154689  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  2154690 cctccaaggttc 2154701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5147665 - 5147334
Alignment:
Q  2 ttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgcc 101  Q
    |||||||||||||||| |||||  | |||||||  || || |||  ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||    
T  5147665 ttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgcc 5147566  T
Q  102 atcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacc 198  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   ||  ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||     
T  5147565 accgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccgattcaacaacaacaacaaaatcaacaagctagacctact 5147466  T
Q  199 tttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 298  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  5147465 tttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 5147366  T
Q  299 ctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    |||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  5147365 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 5147334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 26435074 - 26435406
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| |||    
T  26435074 gttgctcctatcagtgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgc 26435173  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||||| ||    
T  26435174 caccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccaac 26435273  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  26435274 ttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 26435373  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  26435374 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 26435406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16736786 - 16736454
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |  ||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  16736786 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgtctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgc 16736687  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  16736686 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 16736587  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||     
T  16736586 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgtta 16736487  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  16736486 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 16736454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16751840 - 16751508
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |  ||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  16751840 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgtctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgc 16751741  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  16751740 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 16751641  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||     
T  16751640 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgtta 16751541  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  16751540 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 16751508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17529866 - 17529534
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |  ||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  17529866 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgtctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgc 17529767  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  17529766 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 17529667  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||     
T  17529666 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgtta 17529567  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  17529566 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 17529534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4145449 - 4145138
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  4145449 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 4145350  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| || |  || |||||||||||||| |   |||| |||||||| |||||    
T  4145349 caccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 4145250  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  4145249 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 4145150  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  4145149 cctccaaggttc 4145138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 17523349 - 17523681
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |  ||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  17523349 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgtctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgc 17523448  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| |||||    
T  17523449 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 17523548  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||     
T  17523549 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgtta 17523648  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  17523649 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 17523681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26320195 - 26319884
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  26320195 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 26320096  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| |||||||| | || |||||||||||||| |   |||| |||||||| |||||    
T  26320095 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagacgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 26319996  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  26319995 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 26319896  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  26319895 cctccaaggttc 26319884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 45387160 - 45387471
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| |||    
T  45387160 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgc 45387259  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| |||||    
T  45387260 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 45387359  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  45387360 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 45387459  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  45387460 cctccaaggttc 45387471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26275420 - 26275109
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  26275420 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 26275321  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  26275320 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 26275221  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  26275220 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 26275121  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  26275120 cctccaaggttc 26275109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 9618468 - 9618779
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  9618468 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 9618567  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| |||||    
T  9618568 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 9618667  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  9618668 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 9618767  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  9618768 cctccaaggttc 9618779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26670240 - 26669929
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  26670240 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 26670141  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaac---aacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || ||||||||||   ||||  |||| |||||||| |||||    
T  26670140 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 26670041  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  26670040 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 26669941  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    || || ||||||    
T  26669940 cccccaaggttc 26669929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24592867 - 24592556
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  24592867 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 24592768  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| ||||| || || ||    
T  24592767 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaac 24592668  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
    ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  24592667 cttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 24592568  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  24592567 cctccaaggttc 24592556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 309
Target Start/End: Original strand, 3445315 - 3445434
Alignment:
Q  190 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 289  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  3445315 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 3445414  T
Q  290 atccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  3445415 atccgttgcctccaaggttc 3445434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31564526 - 31564405
Alignment:
Q  188 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  31564526 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 31564427  T
Q  288 taatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  31564426 tgatccgttgcctccaaggttc 31564405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26538199 - 26537885
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||  |||    
T  26538199 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgc 26538100  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaa------cagcatcaacaagctagacc 194  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || ||||||||||||      ||||| ||| |  | |||||    
T  26538099 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacagcagcagcaatataccagacc 26538000  T
Q  195 tacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccg 294  Q
     || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| ||  | || |||||||||||||| |||||| |||||    
T  26537999 aacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtgcgactagacagggcaagccaccacctgatccg 26537900  T
Q  295 ttgcctcccaggttc 309  Q
    |||||||| ||||||    
T  26537899 ttgcctccaaggttc 26537885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 309
Target Start/End: Original strand, 31124905 - 31125048
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  31124905 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaa 31125004  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31125005 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 31125048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 309
Target Start/End: Original strand, 11441590 - 11441700
Alignment:
Q  199 tttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 298  Q
    |||||||  |||||||||||||| || ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11441590 tttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgc 11441689  T
Q  299 ctcccaggttc 309  Q
    |||| ||||||    
T  11441690 ctccaaggttc 11441700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26486070 - 26485885
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||  |||    
T  26486070 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgc 26485971  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaa 186  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||    
T  26485970 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaacaacaa 26485885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 11441377 - 11441507
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| ||   ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| |||    
T  11441377 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgc 11441476  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  11441477 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 11441507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 31124728 - 31124858
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  31124728 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 31124827  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
     | |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  31124828 aaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 31124858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31564725 - 31564595
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  31564725 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 31564626  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  31564625 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 31564595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 22888298 - 22888634
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22888298 gttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgc 22888397  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888398 catcgggtcaacctcaggtaaccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 22888497  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22888498 ccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctatttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcct 22888597  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22888598 cccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 22888634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 25198857 - 25199193
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||| |||||| | ||  | ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25198857 gttgctcctattaatgcttcccaattgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgc 25198956  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25198957 catcgggtcaacctcaggtactcgttaacgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 25199056  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25199057 ttctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacct 25199156  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  25199157 cccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatc 25199193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13184973 - 13184646
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13184973 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 13184874  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13184873 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 13184774  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  13184773 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 13184674  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13184673 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 13184646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Original strand, 33877084 - 33877411
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33877084 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 33877183  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33877184 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 33877283  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  33877284 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 33877383  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33877384 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 33877411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13440819 - 13440492
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13440819 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 13440720  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13440719 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 13440620  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  13440619 accaatgttatatgctaaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 13440520  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13440519 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 13440492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Original strand, 11325631 - 11325958
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  11325631 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccattgggac 11325730  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11325731 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 11325830  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  11325831 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 11325930  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  11325931 cgttcggacctcaaatgtgatttccatc 11325958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 23892031 - 23892370
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  | ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23892031 gttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaacattctatcatcagtatcctttgc 23892130  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23892131 catcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctac 23892230  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23892231 ctttcctccgataccaatcatgtatgccgagttgcttccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttg 23892330  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||||||||  || |||||||| |||||| ||||||    
T  23892331 cctcccaggttccggtccgacctcaaatgtgatttccatc 23892370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 29889263 - 29889080
Alignment:
Q  154 cagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagag 253  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  29889263 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgctgagctactcccaactctacttctcagag 29889164  T
Q  254 ggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  29889163 ggcactgcaccaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatc 29889080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 309
Target Start/End: Original strand, 24969876 - 24970154
Alignment:
Q  28 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 127  Q
    ||||||| |||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24969876 cctccgtcgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtta 24969975  T
Q  128 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccga 227  Q
    ||||  | | ||| || ||| |||||||||  || ||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  24969976 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaaca---tcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctga 24970072  T
Q  228 gttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24970073 gttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 24970154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 30934461 - 30934769
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  30934461 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 30934560  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  30934561 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttt 30934660  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
     |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  30934661 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcct 30934760  T
Q  301 cccaggttc 309  Q
    |||||||||    
T  30934761 cccaggttc 30934769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23752787 - 23752455
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  23752787 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 23752688  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  23752687 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 23752588  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23752587 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 23752488  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   || |||||||| ||||||    
T  23752487 cctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 23752455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 33777312 - 33777644
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  33777312 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 33777411  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  33777412 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 33777511  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  33777512 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 33777611  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   || |||||||| ||||||    
T  33777612 cctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 33777644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23718325 - 23718014
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  23718325 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 23718226  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  23718225 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 23718126  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23718125 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 23718026  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  23718025 cctccaaggttc 23718014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24688494 - 24688183
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| |||    
T  24688494 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctgc 24688395  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||| |  | | ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  24688394 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatacaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 24688295  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| || |||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24688294 tttccctccgataccgatattgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 24688195  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||||||||||    
T  24688194 cctcccaggttc 24688183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 11549179 - 11549490
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||    
T  11549179 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattcacagcatcctttctttccaccattttatcatcagtaccctctgc 11549278  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  11549279 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 11549378  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11549379 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 11549478  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  11549479 cctccaaggttc 11549490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22999451 - 22999119
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  22999451 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 22999352  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  22999351 cgccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 22999252  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22999251 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 22999152  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   || || ||||||||||||    
T  22999151 cctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgat 22999119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 33292353 - 33292681
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  33292353 gttgctcctatcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 33292452  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || ||    
T  33292453 caccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcaacaatatgctagaccaacttt 33292552  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || |||    
T  33292553 tcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacct 33292652  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtga 329  Q
    || |||||||  ||||| || ||||||||    
T  33292653 ccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 33292681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32599806 - 32599477
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  32599806 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 32599707  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||||||  | ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || ||    
T  32599706 cacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcagcaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttt 32599607  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  32599606 tcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcct 32599507  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    || ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  32599506 ccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 32599477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 309
Target Start/End: Original strand, 34616400 - 34616654
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 154  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| | ||  |||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| |    
T  34616400 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggctaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatc 34616499  T
Q  155 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 254  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |  |||||    
T  34616500 aaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagg 34616599  T
Q  255 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
     || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  34616600 acattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 34616654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8665812 - 8665501
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||||||   ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||     
T  8665812 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgt 8665713  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  8665712 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 8665613  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8665612 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttg 8665513  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  8665512 cctccaaggttc 8665501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9548826 - 9548548
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 154  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||    
T  9548826 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 9548727  T
Q  155 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 251  Q
    ||   ||  ||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||| |||| |  ||    
T  9548726 agatgccgattcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaag 9548627  T
Q  252 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||    
T  9548626 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgat 9548548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15759194 - 15758883
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  15759194 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 15759095  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  15759094 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 15758995  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15758994 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttg 15758895  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  15758894 cctccaaggttc 15758883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18375749 - 18375438
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  18375749 gttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 18375650  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  18375649 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 18375550  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  18375549 ttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 18375450  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  18375449 cctccaaggttc 18375438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 309
Target Start/End: Original strand, 30168295 - 30168605
Alignment:
Q  2 ttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgcc 101  Q
    ||||||| |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  30168295 ttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 30168394  T
Q  102 atcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacc 198  Q
    | ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| |||||     
T  30168395 accgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctact 30168494  T
Q  199 tttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 298  Q
    || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30168495 ttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgc 30168594  T
Q  299 ctcccaggttc 309  Q
    |||| ||||||    
T  30168595 ctccaaggttc 30168605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15659097 - 15658765
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | |||||||  || || |||| ||  || ||||||||||| |||||||| || || || ||||| || ||| |||    
T  15659097 gttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatatccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccgttttaccatcagtaccctctgc 15658998  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  15658997 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 15658898  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  15658897 tttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 15658798  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  15658797 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 15658765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 12131980 - 12132291
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  12131980 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 12132079  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| |||||||| | || |||||||||||||| |   |||| |||||||| |||||    
T  12132080 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagacgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 12132179  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  12132180 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 12132279  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  12132280 cctccaaggttc 12132291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 26480217 - 26480528
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  26480217 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 26480316  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| |||||    
T  26480317 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 26480416  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26480417 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttg 26480516  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  26480517 cctccaaggttc 26480528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 33516181 - 33516492
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  33516181 gttgctcccatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 33516280  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||| |||||    
T  33516281 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 33516380  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||  |||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  33516381 ttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttg 33516480  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  33516481 cctccaaggttc 33516492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 6874127 - 6874462
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  6874127 gttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 6874226  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc------atcaacaagctagacc 194  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |      |||| |||||||| ||    
T  6874227 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcc 6874326  T
Q  195 tacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccg 294  Q
    ||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6874327 tactttccctccgataccgatgttatatgctgagctgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccg 6874426  T
Q  295 ttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    |||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  6874427 ttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 6874462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 309
Target Start/End: Original strand, 2511044 - 2511187
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  2511044 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 2511143  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2511144 ctagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttc 2511187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 330
Target Start/End: Original strand, 41674589 - 41674866
Alignment:
Q  56 ctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaaca 155  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||  | |  || || ||| |||||||    
T  41674589 ctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtccacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaaca 41674688  T
Q  156 gccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcaga 252  Q
    |   || |||||||   |||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||| |||| |  |||    
T  41674689 gttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaaga 41674788  T
Q  253 gggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  41674789 gggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgat 41674866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 5637735 - 5638046
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  5637735 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 5637834  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| |||||    
T  5637835 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 5637934  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  5637935 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 5638034  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  5638035 cctccaaggttc 5638046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 9317276 - 9317587
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  9317276 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 9317375  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| |||||    
T  9317376 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 9317475  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  9317476 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 9317575  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  9317576 cctccaaggttc 9317587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37671829 - 37671488
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  37671829 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 37671730  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaaca--------ag----c 188  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| || |||||        ||    |    
T  37671729 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacagcagcagcagtatac 37671630  T
Q  189 tagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacct 288  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  37671629 tagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggcaagccaccacct 37671530  T
Q  289 aatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
     ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  37671529 gatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 37671488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29967403 - 29967092
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  29967403 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 29967304  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| ||||| || || ||    
T  29967303 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaac 29967204  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  29967203 cttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 29967104  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  29967103 cctccaaggttc 29967092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 30151843 - 30152154
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  30151843 gttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 30151942  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| |||||    
T  30151943 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 30152042  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  30152043 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 30152142  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  30152143 cctccaaggttc 30152154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 31431253 - 31431576
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| |||    
T  31431253 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgc 31431352  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaag------------- 187  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| || ||||||                  
T  31431353 caccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaacagcagcagcagta 31431452  T
Q  188 --ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctcca 285  Q
      |||| || || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||    
T  31431453 tactaggccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccacca 31431552  T
Q  286 cctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||    
T  31431553 cctgatccgttgcctccaaggttc 31431576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 330
Target Start/End: Original strand, 28649250 - 28649392
Alignment:
Q  188 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  28649250 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 28649349  T
Q  288 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  28649350 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 28649392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 30029240 - 30029551
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  30029240 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 30029339  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| ||||| || || ||    
T  30029340 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaac 30029439  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  30029440 cttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 30029539  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  30029540 cctccaaggttc 30029551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 43078074 - 43078409
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | ||||||| |||||| ||   ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| |||    
T  43078074 gttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgc 43078173  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaaca------gcatcaacaagctagacc 194  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || ||||||||||||||      ||| ||| |  | |||||    
T  43078174 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacagcagcagcaatataccagacc 43078273  T
Q  195 tacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccg 294  Q
     || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| |||||    
T  43078274 aacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggtaagcccccacctgatccg 43078373  T
Q  295 ttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    |||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  43078374 ttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 43078409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28959955 - 28959812
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    ||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  28959955 caacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 28959856  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28959855 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 28959812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31826552 - 31826433
Alignment:
Q  190 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 289  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  31826552 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 31826453  T
Q  290 atccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  31826452 atccgttgcctccaaggttc 31826433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37358812 - 37358669
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  37358812 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 37358713  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37358712 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 37358669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 3789351 - 3789481
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  3789351 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 3789450  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || |||||||| ||||| |||||    
T  3789451 caccgggccagcctcaggtgcccgtcaatgc 3789481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37771134 - 37770992
Alignment:
Q  188 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || || || |||||||||||||| |||||    
T  37771134 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 37771035  T
Q  288 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  37771034 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 37770992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18500877 - 18500735
Alignment:
Q  188 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  18500877 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18500778  T
Q  288 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  18500777 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 18500735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 309
Target Start/End: Original strand, 3789556 - 3789677
Alignment:
Q  188 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  3789556 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3789655  T
Q  288 taatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  3789656 tgatccgttgcctccaaggttc 3789677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 309
Target Start/End: Original strand, 37754995 - 37755116
Alignment:
Q  188 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || || || ||||| |||||||| |||||    
T  37754995 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacaaggcaagccaccacc 37755094  T
Q  288 taatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  37755095 tgatccgttgcctccaaggttc 37755116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37358992 - 37358862
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  37358992 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 37358893  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  37358892 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 37358862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18501031 - 18500955
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  18501031 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 18500955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13325181 - 13325051
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  13325181 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 13325082  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  13325081 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 13325051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31826756 - 31826626
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  31826756 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 31826657  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  31826656 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 31826626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13324976 - 13324835
Alignment:
Q  188 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  13324976 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 13324877  T
Q  288 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 329  Q
      | || || ||||| |||||||  ||||| ||||| |||||    
T  13324876 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtga 13324835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 24681262 - 24681386
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||    
T  24681262 gttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgc 24681361  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgt 125  Q
    || |||| || ||||| || |||||    
T  24681362 caccgggccagcctcaagtgcccgt 24681386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 24723789 - 24723913
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||    
T  24723789 gttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgc 24723888  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgt 125  Q
    || |||| || ||||| || |||||    
T  24723889 caccgggccagcctcaagtgcccgt 24723913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 131
Target Start/End: Original strand, 28649105 - 28649181
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  28649105 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 28649181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 15227704 - 15228040
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227704 gttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 15227803  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15227804 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgctgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctt 15227903  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  15227904 tcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgtacaaccagacagggtaagcctccacctgatccattgcct 15228003  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15228004 cccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 15228040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 1900091 - 1900427
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1900091 gttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgc 1900190  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1900191 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacatcaacaagctagacctacctt 1900290  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |    
T  1900291 tcctccgataccaatgctgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacatggtaagcctccacctgatccgttgctt 1900390  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1900391 ctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatc 1900427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15285365 - 15285029
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  15285365 gttgcccctattaatgctgcccagttacctccattgtacccatatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctac 15285266  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15285265 catcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccaactcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctt 15285166  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    ||||| |||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15285165 tcctccgataccaatgctatatttcgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcct 15285066  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  15285065 cccaggttccggtctgacctcaagtgtgatttccatc 15285029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24461033 - 24460706
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24461033 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtc 24460934  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24460933 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 24460834  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  24460833 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 24460734  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24460733 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 24460706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14235959 - 14235626
Alignment:
Q  7 cctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgg 106  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |  ||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  14235959 cctattaatgctgctcagttacctctgccgtaccagtatatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcatcagtaccctctaccatcgg 14235860  T
Q  107 gtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaac---agcatcaacaagctagacctacctttcc 203  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14235859 gtcacccataggtacccgttaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgccggctcagcaacaacagcagcaacaacaagctagacctacctttcc 14235760  T
Q  204 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14235759 tctgataccaatgttgtatgccgagctgctcccgactctgcttcttaaagggcactgtacaaccagacagggcaagcctccacctaaccctttgcctccc 14235660  T
Q  304 aggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||    
T  14235659 aggttccatttcgacctcaaatgtgatttccatc 14235626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15391763 - 15391439
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat---cgg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||   |||||   |||    
T  15391763 atcaatgttgctcagctacctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgg 15391667  T
Q  107 gtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctct 206  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| | | |||||||||||| |||||||| |  | |   ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||     
T  15391666 gtcaacctcaggtacccatcaatgccattgctcagcaaatgcagcaacagccgctggct---caacaacagcagcaacaaaccagacctacctttcctcc 15391570  T
Q  207 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 306  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15391569 gataccaatgctgtacgccgagttgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcaggggaagcctccacctaacccgttgcctcccagg 15391470  T
Q  307 ttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15391469 ttccgttctgacctcaagtgcgatttccatc 15391439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24592751 - 24592443
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  24592751 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 24592652  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  24592651 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttt 24592552  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24592551 ccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcct 24592452  T
Q  301 cccaggttc 309  Q
    || ||||||    
T  24592451 ccaaggttc 24592443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 17013831 - 17014163
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | ||||| |  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  17013831 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccttcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 17013930  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  17013931 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 17014030  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17014031 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccaaagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 17014130  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||||||||||   || |||||||| ||||||    
T  17014131 cctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 17014163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 14664849 - 14665160
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | |||||||  ||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  14664849 gttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcaccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 14664948  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  14664949 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 14665048  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14665049 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 14665148  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  14665149 cctccaaggttc 14665160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14763744 - 14763412
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  14763744 gttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 14763645  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || |  || |||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  14763644 caccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 14763545  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14763544 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttg 14763445  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  14763444 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 14763412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34189394 - 34189069
Alignment:
Q  4 gctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||     
T  34189394 gctcctatcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccac 34189295  T
Q  104 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 203  Q
    |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||    
T  34189294 cgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcc 34189195  T
Q  204 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 303  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || |||||     
T  34189194 tcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctcca 34189095  T
Q  304 aggttccattctgacctcaagtgtga 329  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||    
T  34189094 aggttccgctctgatcttaagtgtga 34189069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 24112496 - 24112824
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  24112496 gttgctcctgtcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 24112595  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || ||    
T  24112596 caccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttt 24112695  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || |||    
T  24112696 tcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacct 24112795  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtga 329  Q
    || |||||||  ||||| || ||||||||    
T  24112796 ccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 24112824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 36344952 - 36344623
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| | ||| || |||||||| ||||||||||    
T  36344952 gttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcctaccgttttatcatcagtatcctttgc 36344853  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| |  ||||||| || ||    
T  36344852 caccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttt 36344753  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    |||||  ||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  36344752 tcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcct 36344653  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    || ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  36344652 ccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 36344623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 6569684 - 6570016
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| |||    
T  6569684 gttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgc 6569783  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  | |  || || ||| ||||||||   ||||||||||| ||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  6569784 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccagttcaacagcaacaacaaaatcagcaagctagacctac 6569883  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  6569884 tttccctccgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 6569983  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  6569984 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 6570016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 14098372 - 14098683
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  14098372 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 14098471  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  14098472 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 14098571  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14098572 ttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttg 14098671  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  14098672 cctccaaggttc 14098683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31126958 - 31126647
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  31126958 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 31126859  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  31126858 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 31126759  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  31126758 ttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgacccgttg 31126659  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  31126658 cctccaaggttc 31126647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 54833221 - 54833550
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |    
T  54833221 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttac 54833320  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| | | ||| ||  | ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| |  ||||||| || ||    
T  54833321 caccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccattgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttt 54833420  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    |||||  ||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  54833421 tcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgttgcct 54833520  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    || ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  54833521 ccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 54833550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27163757 - 27163446
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| |||    
T  27163757 gttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgc 27163658  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||| |||||    
T  27163657 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 27163558  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  27163557 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 27163458  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  27163457 cctccaaggttc 27163446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 5005701 - 5006036
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| |||    
T  5005701 gttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgc 5005800  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac------aacaacagcatcaacaagctagacc 194  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||      |||||||  |||| |||||||| ||    
T  5005801 caccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcc 5005900  T
Q  195 tacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccg 294  Q
    ||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||    
T  5005901 tactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaaggcaagcccccacctgatccg 5006000  T
Q  295 ttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    |||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  5006001 ttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 5006036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18800863 - 18800742
Alignment:
Q  188 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  18800863 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18800764  T
Q  288 taatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  18800763 tgatccgttgcctccaaggttc 18800742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 40106078 - 40105767
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  40106078 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 40105979  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| |||| |||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  40105978 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacagcagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 40105879  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40105878 tttccctccgataccgatgttatatgctgaacttcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttg 40105779  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  40105778 cctccaaggttc 40105767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 309
Target Start/End: Original strand, 30753777 - 30753896
Alignment:
Q  190 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 289  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  30753777 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 30753876  T
Q  290 atccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  30753877 atccgttgcctccaaggttc 30753896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 19373092 - 19373202
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  19373092 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 19373191  T
Q  101 catcgggtcaa 111  Q
    || ||||||||    
T  19373192 caccgggtcaa 19373202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 224
Target Start/End: Original strand, 21969586 - 21969758
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 154  Q
    ||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||    
T  21969586 tctcagcatcctttcttcccgccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 21969685  T
Q  155 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgc 224  Q
    ||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  21969686 agttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgc 21969758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33674046 - 33673906
Alignment:
Q  190 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 289  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  33674046 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 33673947  T
Q  290 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  33673946 acccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 33673906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18801062 - 18800932
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||    
T  18801062 gttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgc 18800963  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  18800962 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 18800932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 30753573 - 30753703
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| |||    
T  30753573 gttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgc 30753672  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    |  ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  30753673 cgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 30753703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21703590 - 21703254
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||  || ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21703590 gttgcccctattaatgctgcctagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgc 21703491  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703490 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 21703391  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21703390 ccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacaggacaagcctccacctgatccgttgcct 21703291  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21703290 cccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 21703254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Original strand, 27118512 - 27118839
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27118512 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgcatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 27118611  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  27118612 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctaccttccctccgat 27118711  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  27118712 accgatgttgtatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgtcgcctcccaagttc 27118811  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27118812 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 27118839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 34303720 - 34303393
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34303720 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 34303621  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303620 aacctcaggtacccgttaatgtcgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 34303521  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  34303520 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgtcgcctcccaagttc 34303421  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34303420 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 34303393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19456847 - 19456511
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  19456847 gttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgcaatactttcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctac 19456748  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19456747 catcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgccatcgtttagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctt 19456648  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19456647 tcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcatagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcct 19456548  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19456547 cccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 19456511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Original strand, 34156835 - 34157162
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34156835 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 34156934  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34156935 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 34157034  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  34157035 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 34157134  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34157135 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 34157162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Original strand, 3784478 - 3784805
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3784478 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 3784577  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3784578 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagtagcaacaggctagacctacctttcctctgat 3784677  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  3784678 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 3784777  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3784778 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 3784805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Original strand, 16163423 - 16163750
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16163423 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtc 16163522  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16163523 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 16163622  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  16163623 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 16163722  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16163723 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 16163750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31891745 - 31891446
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  31891745 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggac 31891646  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891645 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 31891546  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31891545 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttc 31891446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27434873 - 27434534
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  | ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27434873 gttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtaccctttgc 27434774  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  27434773 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 27434674  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||| || |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27434673 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccggctttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 27434574  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    ||||||| ||||   || |||||||| |||||| ||||||    
T  27434573 cctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatc 27434534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 27392805 - 27393120
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||||   ||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    |    
T  27392805 gttgcccccatcgatgctgctcagctacctccaccgtaccagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccac 27392904  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||                     |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  27392905 cgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaa---------------------caacagcaacaacaaaccagacctacctt 27392983  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27392984 tcctccgataccaatgatgtatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggcaagcctccacctaacccgttgcct 27393083  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27393084 cccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatc 27393120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23128995 - 23128684
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  23128995 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 23128896  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  23128895 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 23128796  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23128795 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 23128696  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  23128695 cctccaaggttc 23128684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 12655354 - 12655665
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||  |||    
T  12655354 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgc 12655453  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  12655454 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 12655553  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12655554 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 12655653  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  12655654 cctccaaggttc 12655665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 28882026 - 28882337
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  28882026 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 28882125  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  28882126 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 28882225  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28882226 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 28882325  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||||||||||    
T  28882326 cctcccaggttc 28882337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 20837730 - 20838041
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | | |||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||  |||    
T  20837730 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcatccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgc 20837829  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  20837830 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 20837929  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  20837930 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatctgttg 20838029  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||||||||||    
T  20838030 cctcccaggttc 20838041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 34279261 - 34279593
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| |||    
T  34279261 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgc 34279360  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  34279361 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 34279460  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  34279461 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 34279560  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  34279561 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 34279593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21677611 - 21677300
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||||||   ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  21677611 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 21677512  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  21677511 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 21677412  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21677411 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttg 21677312  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  21677311 cctccaaggttc 21677300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11635618 - 11635283
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| |||    
T  11635618 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgc 11635519  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaa------caagctagacc 194  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| || |||      |||||||||||    
T  11635518 caccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacc 11635419  T
Q  195 tacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccg 294  Q
    ||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  11635418 tactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccg 11635319  T
Q  295 ttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    |||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  11635318 ttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 11635283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 34286166 - 34286498
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| |||    
T  34286166 gttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattcccagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgc 34286265  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||  |||||||| ||||| || | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  34286266 caccgggtcaacctccagtacccgtcaatgcagttgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 34286365  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  34286366 tttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 34286465  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  34286466 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 34286498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 34291226 - 34291558
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| |||    
T  34291226 gttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattcccagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgc 34291325  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||  |||||||| ||||| || | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  34291326 caccgggtcaacctccagtacccgtcaatgcagttgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 34291425  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  34291426 tttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 34291525  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  34291526 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 34291558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11641807 - 11641472
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| |||    
T  11641807 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgc 11641708  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaa------caagctagacc 194  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| || |||      |||||||||||    
T  11641707 caccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacc 11641608  T
Q  195 tacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccg 294  Q
    ||| || |||| |||||  ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  11641607 tactttccctccgatacagatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccg 11641508  T
Q  295 ttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    |||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  11641507 ttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 11641472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13936973 - 13936684
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| |||    
T  13936973 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgc 13936874  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| |||||||||  || |||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||    
T  13936873 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaacagcaaagtcagcaagccagacctac 13936774  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  13936773 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 13936684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 37925305 - 37925616
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  37925305 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 37925404  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| |||||    
T  37925405 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 37925504  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||||||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  37925505 tttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacccgacccgttg 37925604  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  37925605 cctccaaggttc 37925616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22926454 - 22926125
Alignment:
Q  4 gctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 103  Q
    |||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||      
T  22926454 gctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgc 22926355  T
Q  104 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctt 200  Q
    |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| ||    
T  22926354 cgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttt 22926255  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
     |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22926254 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcct 22926155  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    || ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  22926154 ccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 22926125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 31876093 - 31876404
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  31876093 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 31876192  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  31876193 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 31876292  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||  |||||||||||||| || ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  31876293 ttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 31876392  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  31876393 cctccaaggttc 31876404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37686338 - 37686027
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  37686338 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 37686239  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  37686238 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 37686139  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  37686138 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 37686039  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  37686038 cctccaaggttc 37686027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37701603 - 37701292
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  37701603 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 37701504  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  37701503 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 37701404  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  37701403 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 37701304  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  37701303 cctccaaggttc 37701292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 37374973 - 37375305
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || |||||||    
T  37374973 gttgctcctatcaacgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccgccgttttatcatcagtaccctttgc 37375072  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaag---ctagacctac 197  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||| | ||| ||| ||  | ||||| || || || |||||||| || ||||| || |||    ||||||| ||    
T  37375073 caccgggccaacctcaggttcctgtcaatgtcatcgctcaacaggtacaacatcaaccgcccgttcaacagcagcagcagcagcaatatactagaccaac 37375172  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||  ||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  37375173 ttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 37375272  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  37375273 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 37375305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16829767 - 16829456
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||| ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  16829767 gttgctcccatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 16829668  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  16829667 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 16829568  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||  |||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16829567 ttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttg 16829468  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  16829467 cctccaaggttc 16829456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 16891714 - 16892025
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||| ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  16891714 gttgctcccatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 16891813  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  16891814 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 16891913  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||  |||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16891914 ttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttg 16892013  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  16892014 cctccaaggttc 16892025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 34861492 - 34861803
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  34861492 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 34861591  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| |||||    
T  34861592 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 34861691  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  34861692 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 34861791  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  34861792 cctccaaggttc 34861803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 309
Target Start/End: Original strand, 32049664 - 32049921
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 154  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||    
T  32049664 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 32049763  T
Q  155 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 251  Q
    ||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  32049764 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 32049863  T
Q  252 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    |||||| || ||||| |||||||| || || |||||  | ||||||||||| ||||||    
T  32049864 agggcattgtacaactagacagggtaaacccccaccggacccgttgcctccaaggttc 32049921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 337
Target Start/End: Original strand, 40233515 - 40233662
Alignment:
Q  190 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 289  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||     
T  40233515 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 40233614  T
Q  290 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  40233615 atccgttgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 40233662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19416928 - 19416617
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  19416928 gttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 19416829  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| ||||| || || ||    
T  19416828 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaac 19416729  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || ||||  ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  19416728 tttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 19416629  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  19416628 cctccaaggttc 19416617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 261140 - 261009
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 154  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  261140 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 261041  T
Q  155 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaa 186  Q
    ||   ||||||||||||||||| || ||||||    
T  261040 agttgccagttcaacaacaacaacaacaacaa 261009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 309
Target Start/End: Original strand, 39890054 - 39890197
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    ||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||  |||| |  ||||| || || ||||    
T  39890054 caacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaa 39890153  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  39890154 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 39890197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 40233311 - 40233441
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||  |||    
T  40233311 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgc 40233410  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  40233411 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 40233441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 199 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 260981 - 260850
Alignment:
Q  199 tttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 298  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||| |||||    
T  260981 tttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatctgttgc 260882  T
Q  299 ctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    |||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  260881 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 260850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 39889874 - 39890004
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  39889874 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 39889973  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    ||  ||| || ||||| || ||||| |||||    
T  39889974 cacagggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 39890004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12716863 - 12716742
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    |||||||||||||| ||| |  | ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  12716863 caacaacaacagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 12716764  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  12716763 ctaggcagggcaagcctccacc 12716742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12717034 - 12716910
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||    
T  12717034 gttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgc 12716935  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgt 125  Q
    || |||| || ||||| || |||||    
T  12716934 caccgggccagcctcaagtgcccgt 12716910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 39052257 - 39052133
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||  |||    
T  39052257 gttgctcctaccaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgc 39052158  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgt 125  Q
    || ||||||||||||| || |||||    
T  39052157 caccgggtcaacctcaagtgcccgt 39052133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3086 - 2759
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3086 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 2987  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  2986 aacctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgat 2887  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  2886 accaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttc 2787  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2786 cgttctgacctcaagtgtgatttccatc 2759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20340763 - 20340436
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20340763 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 20340664  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  20340663 aacctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgat 20340564  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  20340563 accaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttc 20340464  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20340463 cgttctgacctcaagtgtgatttccatc 20340436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16208465 - 16208132
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||  ||| | |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    |    
T  16208465 gttgcccctattaatgctgcccagttacctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccac 16208366  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  16208365 catcgggtcagcctcaggtacccattaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaaca---tcaacaagctagacctacctt 16208269  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  16208268 tcctccgataccaatgttgtataccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggaaaacctccacctgatccgttgcct 16208169  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16208168 cccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 16208132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 20460924 - 20461228
Alignment:
Q  2 ttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgcc 101  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  20460924 ttgcccctattaatgctgcccagttacctccgccgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcaatatcctctacc 20461023  T
Q  102 atcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                     |||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  20461024 atcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccatcgttcagcaaatg---------------------caacaacagca---acaagctagacctaccttt 20461099  T
Q  202 cctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctc 301  Q
    |||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20461100 cctccgatactaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctc 20461199  T
Q  302 ccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20461200 ccaggttccgttctgacctcaagtgtgat 20461228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Original strand, 28151845 - 28152016
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28151845 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 28151944  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  28151945 tcagacaggggaagcctccacctgatctgttacctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 28152016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 41793748 - 41793416
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| |||    
T  41793748 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgc 41793649  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||  || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  41793648 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctccacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 41793549  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41793548 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttg 41793449  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  41793448 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 41793416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 28584796 - 28585107
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  |||||||||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  28584796 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccgtatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 28584895  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| |||||    
T  28584896 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 28584995  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  28584996 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 28585095  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  28585096 cctccaaggttc 28585107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 10962485 - 10962796
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  10962485 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 10962584  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  10962585 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 10962684  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| | || |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  10962685 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttgctccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 10962784  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  10962785 cctccaaggttc 10962796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 51638033 - 51638365
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  51638033 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 51638132  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || | || || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||  ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| |||||    
T  51638133 cacccggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagataaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 51638232  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||  |||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || || || ||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  51638233 tttcccttcgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgacccgttg 51638332  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  51638333 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 51638365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16626984 - 16626648
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |    
T  16626984 gttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgcacaatactctcagcatcccttctttccaccgttctatcatcagtatcctctac 16626885  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16626884 catcgggtcaacctccggtacccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctt 16626785  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    ||||| |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16626784 tcctccgataccaatgatatatgtcgagttactccctactctacttcttagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcct 16626685  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16626684 cccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 16626648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17994253 - 17993926
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17994253 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 17994154  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17994153 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 17994054  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  17994053 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 17993954  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  17993953 cgttcggacctcaaatgtgatttccatc 17993926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Original strand, 4625733 - 4626060
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4625733 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtatcctttgccatcgggtc 4625832  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4625833 aacctcaggtacccgttaatgtcgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 4625932  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  4625933 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 4626032  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4626033 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 4626060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 7 - 337
Target Start/End: Original strand, 18530180 - 18530504
Alignment:
Q  7 cctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgg 106  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  18530180 cctattaatgctgcccagttacctccatcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgg 18530279  T
Q  107 gtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctct 206  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  18530280 gtcaacctcaagtgcccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaaca------gcagcaacaagctagacctacctttcctcc 18530373  T
Q  207 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18530374 gataccaatgttgtatgctgagttactcctgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccagg 18530473  T
Q  307 ttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18530474 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 18530504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Original strand, 5652176 - 5652503
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  5652176 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcgtttgcaatcgggtc 5652275  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5652276 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 5652375  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| ||||    
T  5652376 accaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagccttcacctgacccgtcgcctcccaagttc 5652475  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5652476 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 5652503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15893187 - 15892876
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  15893187 gttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgcccttctatcatcagtaccctttgc 15893088  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagtt---caacaacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15893087 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctac 15892988  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  15892987 tttccctccgataccaatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcctttg 15892888  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||||||||||    
T  15892887 cctcccaggttc 15892876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8301745 - 8301437
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | ||||||| |||| | |||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  8301745 gttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcgtactcatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgc 8301646  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  8301645 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttt 8301546  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8301545 ccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcct 8301446  T
Q  301 cccaggttc 309  Q
    || ||||||    
T  8301445 ccaaggttc 8301437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 309
Target Start/End: Original strand, 5713013 - 5713315
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  5713013 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtc 5713112  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctct 206  Q
    ||||||| || ||||| |||||  |||  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||| |||||||| || ||||     
T  5713113 aacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctcc 5713212  T
Q  207 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 306  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  5713213 gataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaagg 5713312  T
Q  307 ttc 309  Q
    |||    
T  5713313 ttc 5713315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 309
Target Start/End: Original strand, 5723923 - 5724225
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  5723923 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtc 5724022  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctct 206  Q
    ||||||| || ||||| |||||  |||  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||| |||||||| || ||||     
T  5724023 aacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctcc 5724122  T
Q  207 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 306  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  5724123 gataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaagg 5724222  T
Q  307 ttc 309  Q
    |||    
T  5724223 ttc 5724225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5757554 - 5757252
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  5757554 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtc 5757455  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctct 206  Q
    ||||||| || ||||| |||||  |||  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||| |||||||| || ||||     
T  5757454 aacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctcc 5757355  T
Q  207 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 306  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  5757354 gataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaagg 5757255  T
Q  307 ttc 309  Q
    |||    
T  5757254 ttc 5757252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5768445 - 5768143
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  5768445 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtc 5768346  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctct 206  Q
    ||||||| || ||||| |||||  |||  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||| |||||||| || ||||     
T  5768345 aacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctcc 5768246  T
Q  207 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 306  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  5768245 gataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaagg 5768146  T
Q  307 ttc 309  Q
    |||    
T  5768145 ttc 5768143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Original strand, 32292697 - 32292868
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292697 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 32292796  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
     ||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  32292797 tcagacaggggaagtctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 32292868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 18051039 - 18051350
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| |||    
T  18051039 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctgc 18051138  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  18051139 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 18051238  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  18051239 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgctg 18051338  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||||||||||    
T  18051339 cctcccaggttc 18051350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22388056 - 22387727
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| | || |||||||| || |||||||    
T  22388056 gttgctcctatcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccatactctcagcatccgttcttcccatcgttttatcatcagtaccctttgc 22387957  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || ||    
T  22387956 caccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcaacaatatgctagaccgacttt 22387857  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22387856 tcctcctataccaatgttgtatgcagagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcct 22387757  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    || ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  22387756 ccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 22387727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 8295752 - 8296060
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||     
T  8295752 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgt 8295851  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  8295852 caccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccaattcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttt 8295951  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  8295952 ccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccacagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccctacctgatctgttgcct 8296051  T
Q  301 cccaggttc 309  Q
    |||||||||    
T  8296052 cccaggttc 8296060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31034430 - 31034259
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034430 caacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 31034331  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  31034330 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 31034259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4797134 - 4796823
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  4797134 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 4797035  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  4797034 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 4796935  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4796934 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 4796835  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  4796834 cctccaaggttc 4796823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 35880543 - 35880854
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  35880543 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 35880642  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  35880643 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 35880742  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  35880743 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccaaacagggcaagcccccacctgatccgctg 35880842  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  35880843 cctccaaggttc 35880854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 18330451 - 18330757
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||     ||| |||    
T  18330451 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccaccattttatcatc-----cctctgc 18330545  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  18330546 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 18330645  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18330646 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgaccttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 18330745  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  18330746 cctccaaggttc 18330757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 29149235 - 29148904
Alignment:
Q  2 ttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgcc 101  Q
    |||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  29149235 ttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 29149136  T
Q  102 atcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacc 198  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||     
T  29149135 accgggtcaacctcaagtgcccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctact 29149036  T
Q  199 tttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 298  Q
    || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  29149035 ttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgc 29148936  T
Q  299 ctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    |||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  29148935 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 29148904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 4892990 - 4893318
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  4892990 gttgctcctatcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 4893089  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || ||    
T  4893090 caccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttt 4893189  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||  | || || |||    
T  4893190 tcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaaacctccaccggaccctttacct 4893289  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtga 329  Q
    || |||||||| ||||| || ||||||||    
T  4893290 ccaaggttccactctgatcttaagtgtga 4893318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 4721408 - 4721740
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  4721408 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcttttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 4721507  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||  | | ||| || ||  ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  4721508 caccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagataaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 4721607  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  4721608 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgctg 4721707  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   || |||||||| ||||||    
T  4721708 cctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 4721740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 6192093 - 6192425
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||| | ||||| |||||| | || ||| |||    
T  6192093 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttcttttcgccattttatcattagtaccctctgc 6192192  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  6192193 caccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 6192292  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  6192293 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatctgctg 6192392  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   || |||||||| ||||||    
T  6192393 cctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 6192425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18277533 - 18277201
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  18277533 gttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 18277434  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || |  || |||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  18277433 caccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 18277334  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  18277333 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttg 18277234  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  18277233 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 18277201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18292834 - 18292502
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  18292834 gttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 18292735  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || |  || |||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  18292734 caccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 18292635  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  18292634 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttg 18292535  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  18292534 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 18292502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18308135 - 18307803
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  18308135 gttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 18308036  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || |  || |||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  18308035 caccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 18307936  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  18307935 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttg 18307836  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  18307835 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 18307803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 32438934 - 32439262
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  32438934 gttgctcctgtcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 32439033  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || ||    
T  32439034 caccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttt 32439133  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || |||    
T  32439134 tcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacct 32439233  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtga 329  Q
    || |||||||  ||||| || ||||||||    
T  32439234 ccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 32439262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 8211518 - 8211847
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  8211518 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 8211617  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| |  ||||||  || ||    
T  8211618 caccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagactaacttt 8211717  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || || || ||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  8211718 tcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcct 8211817  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    || ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  8211818 ccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 8211847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17985437 - 17985126
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  17985437 gttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 17985338  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  17985337 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 17985238  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17985237 ttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttg 17985138  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  17985137 cctccaaggttc 17985126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 10395913 - 10396242
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  10395913 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattcccagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctttgc 10396012  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  |   |||||||   ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  10396013 caccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggt---acaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 10396109  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  10396110 tttccctccgatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 10396209  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  10396210 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 10396242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 20065823 - 20066109
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  20065823 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctttgc 20065922  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| |  ||||||| || ||    
T  20065923 caccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttt 20066022  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  20066023 tcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 20066109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15741563 - 15741264
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  15741563 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 15741464  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||  |||            |||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  15741463 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagttgc------------cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 15741376  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  15741375 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgattcgttg 15741276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4347111 - 4346836
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 154  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| |    
T  4347111 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatc 4347012  T
Q  155 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 254  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||    
T  4347011 aaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagagg 4346912  T
Q  255 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
     |||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  4346911 acactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 4346836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 7072989 - 7073321
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| |||    
T  7072989 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgc 7073088  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  7073089 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 7073188  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||| || ||| ||||||||    
T  7073189 ttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacaaggtaagcccccgcctgatccgttg 7073288  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  7073289 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 7073321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 5466762 - 5467073
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  5466762 gttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccattttatcatcagtaccctttgc 5466861  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaa---gctagacctac 197  Q
    || | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||  || || ||||||||||| || ||||| || |||   | |||||| ||    
T  5466862 cacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacgtcaaccgccagttcaacagcagcagcagcagcaatatgatagaccaac 5466961  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5466962 ttttcctcttatacctatgttgtatgcagaactccttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttg 5467061  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  5467062 cctccaaggttc 5467073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28116438 - 28116103
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| |||    
T  28116438 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgc 28116339  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaa------caagctagacc 194  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| || |||      |||||||||||    
T  28116338 caccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacc 28116239  T
Q  195 tacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccg 294  Q
    ||| || |||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | |||||    
T  28116238 tactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacttgatccg 28116139  T
Q  295 ttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    |||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  28116138 ttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 28116103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 309
Target Start/End: Original strand, 7996393 - 7996650
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 154  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||    
T  7996393 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 7996492  T
Q  155 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 251  Q
    ||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  7996493 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 7996592  T
Q  252 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7996593 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 7996650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 309
Target Start/End: Original strand, 10642901 - 10643158
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 154  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||    
T  10642901 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 10643000  T
Q  155 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 251  Q
    ||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  10643001 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 10643100  T
Q  252 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10643101 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 10643158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 330
Target Start/End: Original strand, 28021109 - 28021384
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 154  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| |    
T  28021109 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatc 28021208  T
Q  155 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 254  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||    
T  28021209 aaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactatactccagagagg 28021308  T
Q  255 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  28021309 gcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 28021384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 18224968 - 18225279
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  18224968 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 18225067  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  ||||||||||||| |||||    
T  18225068 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcaacaagctaggcctac 18225167  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  18225168 cttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 18225267  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  18225268 cctccaaggttc 18225279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Original strand, 21674473 - 21674802
Alignment:
Q  4 gctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 103  Q
    |||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||  |||||     
T  21674473 gctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatccgttctttccgccattttaccatcagtaccccctgccac 21674572  T
Q  104 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    ||||||||||||| || ||| | || ||  | |  || || ||| ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||||| || ||    
T  21674573 cgggtcaacctcaagtgcccatcaacgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttt 21674672  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21674673 tcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcct 21674772  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    || ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  21674773 ccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 21674802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31964951 - 31964622
Alignment:
Q  4 gctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 103  Q
    |||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||      
T  31964951 gctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgc 31964852  T
Q  104 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctt 200  Q
    |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| ||    
T  31964851 cgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttt 31964752  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
     |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31964751 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcct 31964652  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    || ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  31964651 ccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 31964622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 309
Target Start/End: Original strand, 47023284 - 47023541
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 154  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  47023284 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaggtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 47023383  T
Q  155 agccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 251  Q
    ||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  47023384 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 47023483  T
Q  252 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47023484 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 47023541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 50134549 - 50134220
Alignment:
Q  4 gctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 103  Q
    |||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||      
T  50134549 gctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgc 50134450  T
Q  104 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctt 200  Q
    |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| ||    
T  50134449 cgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttt 50134350  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
     |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  50134349 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcct 50134250  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    || ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  50134249 ccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 50134220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5609749 - 5609471
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 154  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  5609749 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 5609650  T
Q  155 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 251  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  5609649 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 5609550  T
Q  252 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  5609549 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 5609471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Original strand, 28339082 - 28339411
Alignment:
Q  4 gctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 103  Q
    |||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||      
T  28339082 gctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgc 28339181  T
Q  104 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| ||||| ||    
T  28339182 cgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttt 28339281  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
     |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28339282 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcct 28339381  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    || ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  28339382 ccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 28339411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5596847 - 5596527
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  5596847 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 5596748  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaaca--ag----------c 188  Q
    || | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||||||    ||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||  ||          |    
T  5596747 cacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcagcaggcacaacaccaaccgccaattcaacaacaacaacaacaacagcagcagcagtatac 5596648  T
Q  189 tagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacct 288  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5596647 tagaccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacct 5596548  T
Q  289 aatccgttgcctcccaggttc 309  Q
     ||||||||||||| ||||||    
T  5596547 gatccgttgcctccaaggttc 5596527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6542753 - 6542632
Alignment:
Q  188 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6542753 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggcaagccaccacc 6542654  T
Q  288 taatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  6542653 tgatccgttgcctccaaggttc 6542632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 330
Target Start/End: Original strand, 4416864 - 4417028
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  4416864 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 4416963  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  4416964 ctagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 4417028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 36997366 - 36997247
Alignment:
Q  190 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 289  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  36997366 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 36997267  T
Q  290 atccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  36997266 atccgttgcctccaaggttc 36997247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 5013489 - 5013800
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  5013489 gttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 5013588  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| ||||| || || ||    
T  5013589 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaac 5013688  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||  |||||||||||||| || ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  5013689 ttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 5013788  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  5013789 cctccaaggttc 5013800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 29665466 - 29665336
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| ||   ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  29665466 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 29665367  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  29665366 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 29665336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 24327936 - 24328247
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  24327936 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 24328035  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| ||||| || || ||    
T  24328036 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaac 24328135  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
    ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  24328136 cttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 24328235  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  24328236 cctccaaggttc 24328247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11110638 - 11110498
Alignment:
Q  190 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 289  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  11110638 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcctccacctg 11110539  T
Q  290 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  11110538 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 11110498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 309
Target Start/End: Original strand, 18242684 - 18242827
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  18242684 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaa 18242783  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18242784 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 18242827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 330
Target Start/End: Original strand, 48465896 - 48466036
Alignment:
Q  190 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 289  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||     
T  48465896 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccaaagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 48465995  T
Q  290 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  48465996 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 48466036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22871148 - 22871005
Alignment:
Q  187 gctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 286  Q
    |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || || || ||||| ||||| ||||    
T  22871148 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22871049  T
Q  287 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  22871048 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 22871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22886207 - 22886064
Alignment:
Q  187 gctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 286  Q
    |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || || || ||||| ||||| ||||    
T  22886207 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22886108  T
Q  287 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  22886107 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 22886064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 309
Target Start/End: Original strand, 51782052 - 51782111
Alignment:
Q  250 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  51782052 agagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 51782111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11110788 - 11110712
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  11110788 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 11110712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 301
Target Start/End: Original strand, 51797141 - 51797192
Alignment:
Q  250 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctc 301  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  51797141 agagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctc 51797192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6542955 - 6542825
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  6542955 gttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 6542856  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  6542855 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 6542825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22871355 - 22871225
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  22871355 gttgcacctatcaatgcagctcagatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 22871256  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || | || || ||||| || ||||| |||||    
T  22871255 caccaggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 22871225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22886414 - 22886284
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  22886414 gttgcacctatcaatgcagctcagatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 22886315  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || | || || ||||| || ||||| |||||    
T  22886314 caccaggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 22886284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 36997570 - 36997440
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| ||   ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| |||    
T  36997570 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgc 36997471  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || | || ||||||||||| ||||| |||||    
T  36997470 cacccggccaacctcaggtgcccgtcaatgc 36997440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 48465692 - 48465822
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||   ||    
T  48465692 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccccgc 48465791  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  48465792 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 48465822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 18242504 - 18242689
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  ||||||    
T  18242504 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtactctttgc 18242603  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaa 186  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  ||||| ||| ||||||||   || |||||||||||||| || ||||||    
T  18242604 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccagcagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 18242689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20577160 - 20577039
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  20577160 caacaacagcagcatcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 20577061  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  20577060 ctaggcagggcaagcctccacc 20577039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13522444 - 13522117
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13522444 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 13522345  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13522344 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 13522245  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  13522244 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 13522145  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13522144 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 13522117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33374627 - 33374300
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33374627 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 33374528  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33374527 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 33374428  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  33374427 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 33374328  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33374327 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 33374300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8892681 - 8892354
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8892681 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtattctttgccatcgggtc 8892582  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8892581 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 8892482  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  8892481 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 8892382  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8892381 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 8892354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8903916 - 8903589
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8903916 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatctcttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtc 8903817  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8903816 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 8903717  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  8903716 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 8903617  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8903616 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 8903589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Original strand, 28162482 - 28162809
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  28162482 atcaatgctgctcagctacctccatcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggac 28162581  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162582 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 28162681  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| ||||    
T  28162682 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacttgatccatcgcctcccaagttc 28162781  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28162782 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 28162809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22477644 - 22477317
Alignment:
Q  13 aatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 112  Q
    |||||||| ||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22477644 aatgctgcccaattacctctgtcgtacccgtatgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattctatcattagtatcctttgccatcgggtcaac 22477545  T
Q  113 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaac---agcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22477544 ctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacaaatgcaacaacagtcaccggttcaacaacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgat 22477445  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22477444 accaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcatatggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttc 22477345  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||||    
T  22477344 cgttctaacctcaagtgtgatttccatc 22477317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 142 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22457176 - 22456978
Alignment:
Q  142 caaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaac---agcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccga 238  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22457176 caaatgcaacaacagtcaccggttcaacaacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccga 22457077  T
Q  239 ctctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  22457076 ctctacttctcataaggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatc 22456978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 52 - 335
Target Start/End: Original strand, 20160568 - 20160851
Alignment:
Q  52 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaac 151  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  || |    
T  20160568 tactctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagc 20160667  T
Q  152 aacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||    
T  20160668 aacagccaccagctcaacaacaacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacag 20160767  T
Q  252 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtcca 335  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||    
T  20160768 agggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttcca 20160851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 52 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22172263 - 22171980
Alignment:
Q  52 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaac 151  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  || |    
T  22172263 tactctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagc 22172164  T
Q  152 aacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||    
T  22172163 aacagccaccagctcaacaacaacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacag 22172064  T
Q  252 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtcca 335  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||    
T  22172063 agggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttcca 22171980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27290597 - 27290414
Alignment:
Q  154 cagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagag 253  Q
    |||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27290597 cagccaccggctcaacaacgacagcagcaataagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgagttgctcccgactctacttctcagag 27290498  T
Q  254 ggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27290497 ggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 27290414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22935260 - 22934924
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22935260 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgc 22935161  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||||   || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  22935160 caccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttt 22935061  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
     |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22935060 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcct 22934961  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||||   || |||||||| |||||| ||||||    
T  22934960 cccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatc 22934924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23857705 - 23857369
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23857705 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgc 23857606  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||||   || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  23857605 caccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttt 23857506  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
     |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23857505 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcct 23857406  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||||   || |||||||| |||||| ||||||    
T  23857405 cccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatc 23857369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14143500 - 14143329
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14143500 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaa 14143401  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  14143400 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 14143329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Original strand, 26787925 - 26788096
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26787925 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaa 26788024  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  26788025 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 26788096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Original strand, 27196298 - 27196469
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27196298 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaa 27196397  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  27196398 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 27196469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27252942 - 27252771
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27252942 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaa 27252843  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  27252842 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 27252771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24304998 - 24304690
Alignment:
Q  4 gctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||     
T  24304998 gctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccac 24304899  T
Q  104 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| ||    
T  24304898 cgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagtttccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttt 24304799  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
     |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24304798 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcct 24304699  T
Q  301 cccaggttc 309  Q
    || ||||||    
T  24304698 ccaaggttc 24304690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13299334 - 13299023
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  13299334 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 13299235  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  13299234 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 13299135  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13299134 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 13299035  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  13299034 cctccaaggttc 13299023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15424700 - 15424389
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  15424700 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 15424601  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   |||||| |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  15424600 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttgaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 15424501  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15424500 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttg 15424401  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  15424400 cctccaaggttc 15424389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 29549291 - 29549620
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  29549291 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 29549390  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| || ||    
T  29549391 caccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacaacagcagcagcaatacgctagaccaacttt 29549490  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  29549491 tcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcct 29549590  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    || ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  29549591 ccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 29549620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 26988814 - 26989125
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  26988814 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 26988913  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaa---caacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||   |||||  |||| ||||||||||||||    
T  26988914 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacatcaacaaaatcagcaagctagacctac 26989013  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26989014 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 26989113  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  26989114 cctccaaggttc 26989125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 26999886 - 27000197
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  26999886 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 26999985  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  26999986 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 27000085  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27000086 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 27000185  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  27000186 cctccaaggttc 27000197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 26918193 - 26918525
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  26918193 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 26918292  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||  | | ||| || | | ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  26918293 caccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagacgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 26918392  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26918393 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 26918492  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  26918493 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 26918525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 24863530 - 24863841
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| | |    
T  24863530 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctac 24863629  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || || ||||||| || ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  24863630 caccgagtcaaccccaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 24863729  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24863730 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 24863829  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  24863830 cctccaaggttc 24863841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 16749667 - 16749999
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||| || |||||  |  ||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  16749667 gttgctcctatcaacgcagctcaaatgtctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 16749766  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  16749767 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 16749866  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16749867 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttg 16749966  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  16749967 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 16749999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 4525102 - 4525410
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  4525102 gttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtatcctttgc 4525201  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||  |  ||||||| || ||    
T  4525202 caccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcagtatactagaccaacttt 4525301  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4525302 tcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgcacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcct 4525401  T
Q  301 cccaggttc 309  Q
    || ||||||    
T  4525402 ccaaggttc 4525410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 27044203 - 27044532
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  27044203 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 27044302  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| |  ||||||| || ||    
T  27044303 caccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttt 27044402  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    |||||  ||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  27044403 tcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgacccgttgcct 27044502  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    || ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  27044503 ccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 27044532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27272876 - 27272624
Alignment:
Q  91 tatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttca------acaacaacagcatcaac 184  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||||| || |||||  | || ||||| | || |||||| |||||||||||      |||||||||| |||| |    
T  27272876 tatcctttgccatcaggaccacctcaagtacctgtgaatgctattgtgcagcagaagccacaacaaccaccagttcagcaacaacaacaacagaatcagc 27272777  T
Q  185 aagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctcc 284  Q
    |||  |||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  27272776 aagtcagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactctactccagagagggcattgtacaaccagacagggtaagccccc 27272677  T
Q  285 acctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||| |||||| |||||||||||||   || |||||||| |||||| ||||||    
T  27272676 acctgatccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatc 27272624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 29572826 - 29573137
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  29572826 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 29572925  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| ||||||||||| ||    
T  29572926 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccaac 29573025  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  29573026 ttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttg 29573125  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  29573126 cctccaaggttc 29573137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30558399 - 30558088
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  30558399 gttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 30558300  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||| |||||    
T  30558299 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 30558200  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||  |||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  30558199 ttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttg 30558100  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  30558099 cctccaaggttc 30558088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 29501219 - 29501539
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  29501219 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 29501318  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaaca--ag----------c 188  Q
    || | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||||||    ||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||  ||          |    
T  29501319 cacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcagcaggcacaacatcaaccgccaattcaacaacaacaacaacaacagcagcagcagtatac 29501418  T
Q  189 tagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacct 288  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29501419 tagaccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacct 29501518  T
Q  289 aatccgttgcctcccaggttc 309  Q
     ||||||||||||| ||||||    
T  29501519 gatccgttgcctccaaggttc 29501539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27630038 - 27629907
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 154  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || || || | || |||||    
T  27630038 tctcagcatccattcttcccaccgttttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcaacagaagccacaac 27629939  T
Q  155 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaa 186  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  27629938 aaccaccagttcagcaacaacaacagcaacaa 27629907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 309
Target Start/End: Original strand, 4773009 - 4773130
Alignment:
Q  188 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  4773009 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 4773108  T
Q  288 taatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  4773109 tgatccgttgcctccaaggttc 4773130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 309
Target Start/End: Original strand, 3696086 - 3696205
Alignment:
Q  190 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 289  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||     
T  3696086 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctg 3696185  T
Q  290 atccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  3696186 atccgttgcctccaaggttc 3696205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 309
Target Start/End: Original strand, 4757577 - 4757888
Alignment:
Q  4 gctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 103  Q
    |||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||     
T  4757577 gctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccac 4757676  T
Q  104 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaaca--ag----ctagacctac 197  Q
    |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| || || ||  ||    ||||||| ||    
T  4757677 cgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacagcagcagcagtatactagaccaac 4757776  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  4757777 ttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 4757876  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  4757877 cctccaaggttc 4757888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26777830 - 26777687
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    ||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  26777830 caacagcagcagcagcaatatgctagaccaaccttccctcctataccgatgttgtatgccgaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 26777731  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26777730 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 26777687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4545957 - 4545847
Alignment:
Q  199 tttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 298  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  4545957 tttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 4545858  T
Q  299 ctcccaggttc 309  Q
    |||| ||||||    
T  4545857 ctccaaggttc 4545847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4724316 - 4724206
Alignment:
Q  199 tttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 298  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  4724316 tttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgc 4724217  T
Q  299 ctcccaggttc 309  Q
    |||| ||||||    
T  4724216 ctccaaggttc 4724206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 309
Target Start/End: Original strand, 28207468 - 28207578
Alignment:
Q  199 tttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 298  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  28207468 tttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgc 28207567  T
Q  299 ctcccaggttc 309  Q
    |||| ||||||    
T  28207568 ctccaaggttc 28207578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16944410 - 16944099
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  16944410 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 16944311  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||| ||||| ||   ||| ||||| || || ||    
T  16944310 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacagcaacaacaaaatcagcaagccaggccaac 16944211  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
    ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  16944210 cttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 16944111  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  16944110 cctccaaggttc 16944099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 330
Target Start/End: Original strand, 16674144 - 16674284
Alignment:
Q  190 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 289  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||     
T  16674144 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 16674243  T
Q  290 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  16674244 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 16674284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 309
Target Start/End: Original strand, 27485110 - 27485253
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  27485110 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaa 27485209  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27485210 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 27485253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 330
Target Start/End: Original strand, 27007730 - 27007872
Alignment:
Q  188 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  27007730 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 27007829  T
Q  288 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  27007830 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 27007872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27360207 - 27360064
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  27360207 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaa 27360108  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27360107 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 27360064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27450550 - 27450407
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  27450550 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaa 27450451  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27450450 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 27450407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4546167 - 4546037
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  4546167 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 4546068  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  4546067 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 4546037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4724526 - 4724396
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  4724526 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 4724427  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  4724426 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 4724396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 28207255 - 28207385
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  28207255 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 28207354  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  28207355 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 28207385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26116603 - 26116482
Alignment:
Q  188 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||  | || |||||| |||| |  ||||| || || || || |||||||||||||| |||||    
T  26116603 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccgactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 26116504  T
Q  288 taatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  26116503 tgatccgttgcctccaaggttc 26116482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 27484930 - 27485115
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  27484930 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 27485029  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaa 186  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  ||||| ||| ||||||||   || |||||||||||||| || ||||||    
T  27485030 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccagcagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 27485115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 34463537 - 34463397
Alignment:
Q  190 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 289  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||     
T  34463537 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacaaggaaagcccccacctg 34463438  T
Q  290 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  34463437 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 34463397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 287
Target Start/End: Original strand, 17025280 - 17025379
Alignment:
Q  188 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  17025280 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 17025379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 3695876 - 3696006
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| ||   ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||  |||    
T  3695876 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccccctgc 3695975  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  3695976 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 3696006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 4772810 - 4772940
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  4772810 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 4772909  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  4772910 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 4772940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 17025075 - 17025205
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  17025075 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 17025174  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  17025175 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 17025205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 27007525 - 27007655
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||  |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  27007525 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacctatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 27007624  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  27007625 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 27007655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27360393 - 27360263
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  27360393 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 27360294  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  27360293 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 27360263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27450736 - 27450606
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  27450736 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 27450637  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  27450636 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 27450606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26777956 - 26777880
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  26777956 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 26777880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Original strand, 9354450 - 9354777
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9354450 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 9354549  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9354550 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 9354649  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  9354650 accaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 9354749  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9354750 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 9354777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19659426 - 19659099
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19659426 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtc 19659327  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19659326 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacaacctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 19659227  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||    
T  19659226 accaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccacctgacccgtcgcctcccaagttc 19659127  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19659126 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 19659099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Original strand, 44562929 - 44563256
Alignment:
Q  10 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  44562929 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggac 44563028  T
Q  110 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563029 aacctcaggtacccgttaatgccgccgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 44563128  T
Q  210 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  44563129 accaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttc 44563228  T
Q  310 cattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44563229 cgttcggacctcaagtgtgatttccatc 44563256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 16283265 - 16283604
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  | ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  16283265 gttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcattagtatcctttgc 16283364  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagtt---caacaacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16283365 caccaggtcaacctcaggtacccattaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctac 16283464  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16283465 cttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccttagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 16283564  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    ||||||||||||   || |||||||| |||||| ||||||    
T  16283565 cctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatc 16283604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22081271 - 22080938
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| | |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||   ||    
T  22081271 gttgcccccatcaatgctgctcagctacctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gc 22081175  T
Q  101 catcg---ggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    |||||   |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||    | |||||| || |||||   |||| | ||||||||    
T  22081174 catcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcagcaacagccgttggctcaacagcagcagca---acaaaccagacctac 22081078  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22081077 ctttcctccgataccaatgctgtacgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggaaagcctccacctaacccgttg 22080978  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22080977 cctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatc 22080938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 2137658 - 2137347
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| || ||| |||    
T  2137658 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgtcattttatcatcagtaccctctgc 2137559  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  2137558 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 2137459  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2137458 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 2137359  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  2137358 cctccaaggttc 2137347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 16277370 - 16277681
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  16277370 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 16277469  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  16277470 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 16277569  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16277570 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 16277669  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||||||||||    
T  16277670 cctcccaggttc 16277681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27609304 - 27608993
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| |   || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  27609304 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgtcgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 27609205  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  27609204 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 27609105  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27609104 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 27609005  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  27609004 cctccaaggttc 27608993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Original strand, 33244649 - 33244820
Alignment:
Q  166 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 265  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33244649 caacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgttgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaa 33244748  T
Q  266 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33244749 ccagacagggcaagcctccacctgacccgtcgcctcctaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 33244820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 309
Target Start/End: Original strand, 14557446 - 14557751
Alignment:
Q  4 gctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 103  Q
    |||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||     
T  14557446 gctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccac 14557545  T
Q  104 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||    
T  14557546 cgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccc 14557645  T
Q  204 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 303  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||     
T  14557646 tccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagccctcgcctgatccgttgcctcca 14557745  T
Q  304 aggttc 309  Q
    ||||||    
T  14557746 aggttc 14557751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 19687914 - 19688225
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | |||||||  ||||| |||||||  || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||| |||    
T  19687914 gttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattcccagcatcctttctttccgccattctatcaccagtaccctctgc 19688013  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||||    | |||||||   |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  19688014 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgtcggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 19688113  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19688114 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 19688213  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  19688214 cctccaaggttc 19688225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 18710402 - 18710734
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  18710402 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 18710501  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaa---gctagacctac 197  Q
    || |||| ||||||||||| ||||| ||||| || | ||| || ||| ||||||||   || ||||||||||| ||||| || |||   |||||||| ||    
T  18710502 caccgggccaacctcaggttcccgtcaatgcagttgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacagcagcagcagcaatatgctagaccaac 18710601  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| |||||  ||||| ||||| ||    
T  18710602 ttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccctcacctgatccgctg 18710701  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||||||||||    
T  18710702 cctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgat 18710734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 31354340 - 31354672
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  31354340 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 31354439  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| || |  || |||||||||||||| |   |||| |||||||| |||||    
T  31354440 caccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 31354539  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||||||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  31354540 tttccctccgataccgatgttatatgccgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatcctttg 31354639  T
Q  298 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  31354640 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 31354672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 19286281 - 19286610
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |    
T  19286281 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttac 19286380  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||| | | ||| ||  | ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| |  ||||||| || ||    
T  19286381 caccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccattgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttt 19286480  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    |||||  ||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  19286481 tcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgttgcct 19286580  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    || ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  19286581 ccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 19286610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31490149 - 31489838
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  31490149 gttgcccctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 31490050  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| |||| |||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  31490049 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacagcagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 31489950  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31489949 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttg 31489850  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  31489849 cctccaaggttc 31489838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 19674254 - 19674589
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  19674254 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgc 19674353  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac------aacaacagcatcaacaagctagacc 194  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||      |||||||  |||| |||||||| ||    
T  19674354 caccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcc 19674453  T
Q  195 tacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccg 294  Q
    ||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||| |||||    
T  19674454 tactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaaacccccacctgatccg 19674553  T
Q  295 ttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    |||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  19674554 ttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 19674589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19208759 - 19208448
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  19208759 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 19208660  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  19208659 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 19208560  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19208559 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttg 19208460  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  19208459 cctccaaggttc 19208448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28362354 - 28362043
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  28362354 gttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 28362255  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  28362254 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 28362155  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  28362154 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 28362055  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  28362054 cctccaaggttc 28362043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3329716 - 3329595
Alignment:
Q  188 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  3329716 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3329617  T
Q  288 taatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  3329616 tgatccgttgcctccaaggttc 3329595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 33258539 - 33258850
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  33258539 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 33258638  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| ||||| || || ||    
T  33258639 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaac 33258738  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
    ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  33258739 cttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 33258838  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  33258839 cctccaaggttc 33258850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12092933 - 12092812
Alignment:
Q  188 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  12092933 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 12092834  T
Q  288 taatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  12092833 tgatccgttgcctccaaggttc 12092812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3329918 - 3329788
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  3329918 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 3329819  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  3329818 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 3329788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 29829129 - 29829259
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  29829129 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 29829228  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  29829229 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 29829259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 310
Target Start/End: Original strand, 29829328 - 29829450
Alignment:
Q  188 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 287  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||||||||| || ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||    
T  29829328 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactttactccagagagggcattgtaccaccagacagggtaagcccccacc 29829427  T
Q  288 taatccgttgcctcccaggttcc 310  Q
    | ||||||||||||| |||||||    
T  29829428 tgatccgttgcctccaaggttcc 29829450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19518542 - 19518412
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||    
T  19518542 gttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgc 19518443  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  19518442 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 19518412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12093131 - 12093002
Alignment:
Q  2 ttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgcc 101  Q
    |||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  12093131 ttgctcctatcaatgcagctcaagtgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 12093032  T
Q  102 atcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    |  ||| || ||||| || ||||| |||||    
T  12093031 acagggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 12093002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 20228 - 20543
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20228 gttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccatcattctatcatcagtatcctttgc 20327  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20328 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaa---------------------caacagcagcaacaagctagacctacctt 20406  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20407 tcccccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcct 20506  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20507 cccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 20543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 30269 - 30579
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  30269 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 30368  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||     
T  30369 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccta- 30467  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||  |||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  30468 ctttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttg 30567  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  30568 cctccaaggttc 30579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 312 - 129
Alignment:
Q  154 cagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagag 253  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  312 cagccaccagctcaacagcaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagag 213  T
Q  254 ggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  212 ggcactgctcaaccagacatggcaagcctccacctgatccgttgccttccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 21383 - 21716
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    |    
T  21383 gttgcccccatcaatgcttctcagctacctccgccgtaccagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccac 21482  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||  |  | | |||| ||   ||| |||||| | |||||||||||    
T  21483 cgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagctgctggcttaacagca---gcaacaacaaaccagacctacctt 21579  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21580 tcctccgataccaatgctatatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaaggacactgcacaaccaggcagggcaagcctccacctaacctgttgcct 21679  T
Q  301 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21680 cccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatc 21716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 29579 - 29890
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  | ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  29579 gttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccatcgtacccgtatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgc 29678  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagtt---caacaacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29679 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatagctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctac 29778  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29779 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 29878  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  29879 cctccaaggttc 29890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 40509 - 40198
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | ||||||  |||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||    
T  40509 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgccgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttctgccattctatcatcagtaccctttgc 40410  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  40409 caccgggtcaacctcaggtacccgtaaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 40310  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40309 tttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 40210  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    || |||||||||    
T  40209 ccccccaggttc 40198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 47371 - 47114
Alignment:
Q  55 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 154  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||    
T  47371 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 47272  T
Q  155 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 251  Q
    ||   ||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||    
T  47271 agttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatag 47172  T
Q  252 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 309  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47171 aggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 47114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 27108 - 27419
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| | |    
T  27108 gttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctac 27207  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  27208 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 27307  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27308 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttg 27407  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  27408 cctccaaggttc 27419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 570 - 258
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||    
T  570 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgc 471  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  470 caccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 371  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgc-cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgtt 296  Q
     || |||| |||||| ||||| |||||   |||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  370 tttccctccgataccgatgttatatgctttagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccaccggatccgtt 271  T
Q  297 gcctcccaggttc 309  Q
    |||||||| ||||    
T  270 gcctcccaagttc 258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 252 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 2018
Alignment:
Q  252 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2103 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 2018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 330
Target Start/End: Original strand, 6080 - 6160
Alignment:
Q  250 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  6080 agagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 6160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15370 - 15059
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  15370 gttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 15271  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  15270 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctac 15171  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  15170 ttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 15071  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  15070 cctccaaggttc 15059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 7679 - 7368
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  7679 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 7580  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| |||||||| | || |||||||||||||| |   |||| |||||||| |||||    
T  7579 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagacgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 7480  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  7479 tttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 7380  T
Q  298 cctcccaggttc 309  Q
    ||||| ||||||    
T  7379 cctccaaggttc 7368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9503 - 9195
Alignment:
Q  4 gctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 103  Q
    |||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||      
T  9503 gctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgc 9404  T
Q  104 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctt 200  Q
    |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| ||    
T  9403 cgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttt 9304  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
     |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  9303 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcct 9204  T
Q  301 cccaggttc 309  Q
    || ||||||    
T  9203 ccaaggttc 9195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 309
Target Start/End: Original strand, 19834 - 20142
Alignment:
Q  4 gctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 103  Q
    |||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||      
T  19834 gctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgc 19933  T
Q  104 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctt 200  Q
    |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| ||||| ||    
T  19934 cgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttt 20033  T
Q  201 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 300  Q
     |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20034 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcct 20133  T
Q  301 cccaggttc 309  Q
    || ||||||    
T  20134 ccaaggttc 20142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26642 - 26338
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||    
T  26642 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtacccgttgc 26543  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctac 197  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || | | ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||    
T  26542 cgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagaggaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctac 26443  T
Q  198 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 297  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  26442 ttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttg 26343  T
Q  298 cctcc 302  Q
    |||||    
T  26342 cctcc 26338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 330
Target Start/End: Original strand, 9542 - 9714
Alignment:
Q  158 caccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggca 257  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||||||    
T  9542 caccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggca 9641  T
Q  258 ctgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 330  Q
     || || || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  9642 ttgtacgactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgat 9714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 8048 - 8212
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  8048 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtatcctttgc 8147  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagtt 165  Q
    || | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| ||||| ||||||    
T  8148 caccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcagccgccagtt 8212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 309
Target Start/End: Original strand, 7966 - 8076
Alignment:
Q  199 tttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 298  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  7966 tttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgc 8065  T
Q  299 ctcccaggttc 309  Q
    |||| ||||||    
T  8066 ctccaaggttc 8076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 7753 - 7883
Alignment:
Q  1 gttgctcctatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  7753 gttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgc 7852  T
Q  101 catcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 131  Q
    || |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  7853 caccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 7883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University