View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8913_low_1 (Length: 698)

Name: NF8913_low_1
Description: NF8913
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8913_low_1
NF8913_low_1
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (15-684)||(30464337-30465022)
chr5 (341-684)||(12800667-12801009)
chr5 (342-684)||(21841740-21842082)
chr5 (341-684)||(2180514-2180853)
chr5 (341-684)||(12737844-12738186)
chr5 (362-688)||(32134897-32135223)
chr5 (362-684)||(8540410-8540732)
chr5 (341-684)||(2853310-2853653)
chr5 (341-684)||(28821119-28821476)
chr5 (341-672)||(42472525-42472855)
chr5 (497-684)||(7268584-7268771)
chr5 (151-344)||(2181078-2181271)
chr5 (533-684)||(24540425-24540576)
chr5 (15-260)||(34328264-34328526)
chr5 (15-257)||(32134630-32134889)
chr5 (15-344)||(21842309-21842653)
chr5 (151-344)||(42472107-42472300)
chr5 (151-327)||(40781553-40781729)
chr5 (151-344)||(17575243-17575435)
chr5 (151-344)||(17577274-17577466)
chr5 (381-598)||(41494524-41494741)
chr5 (15-344)||(7268804-7269150)
chr5 (171-344)||(17575963-17576135)
chr5 (151-327)||(29620726-29620902)
chr5 (15-143)||(12801092-12801220)
chr5 (15-143)||(12738269-12738397)
chr5 (15-246)||(18623839-18624087)
chr5 (15-246)||(8540751-8541000)
chr5 (463-583)||(40781430-40781550)
chr5 (15-283)||(41494228-41494510)
chr5 (458-583)||(29620899-29621024)
chr5 (15-116)||(2181289-2181390)
chr5 (220-344)||(28036067-28036191)
chr5 (15-74)||(24540190-24540249)
chr5 (15-74)||(17575530-17575589)
chr5 (301-344)||(18624089-18624132)
chr5 (15-74)||(27077124-27077183)
chr5 (341-382)||(18624357-18624398)
chr5 (151-195)||(12738200-12738244)
chr5 (151-195)||(12801023-12801067)
chr5 (167-311)||(18727107-18727251)
chr5 (168-311)||(35291588-35291729)
chr5 (15-74)||(40781814-40781873)
chr5 (341-378)||(17575700-17575737)
chr5 (341-378)||(17577011-17577048)
chr5 (309-344)||(28821701-28821736)
chr5 (167-246)||(32089389-32089468)
chr5 (309-344)||(34328230-34328265)
chr5 (15-53)||(28821748-28821786)
chr5 (199-239)||(40329989-40330029)
[»] chr1 (61 HSPs)
chr1 (15-684)||(31237213-31237891)
chr1 (341-684)||(6817758-6818101)
chr1 (341-684)||(27088026-27088368)
chr1 (341-684)||(46582630-46582973)
chr1 (362-684)||(3012516-3012838)
chr1 (341-684)||(26224587-26224938)
chr1 (341-684)||(50555145-50555488)
chr1 (362-684)||(51895228-51895550)
chr1 (341-633)||(37345126-37345418)
chr1 (341-633)||(45045545-45045837)
chr1 (341-684)||(15105185-15105528)
chr1 (341-633)||(25277409-25277709)
chr1 (341-684)||(33600186-33600536)
chr1 (405-684)||(2870338-2870617)
chr1 (361-684)||(52642698-52643019)
chr1 (15-344)||(50554574-50554920)
chr1 (497-684)||(34777335-34777522)
chr1 (15-344)||(6817273-6817618)
chr1 (497-684)||(4855164-4855351)
chr1 (15-341)||(52642298-52642641)
chr1 (482-672)||(8168514-8168704)
chr1 (15-260)||(37087570-37087832)
chr1 (15-258)||(3012249-3012509)
chr1 (15-246)||(51894961-51895209)
chr1 (151-344)||(33599767-33599960)
chr1 (151-344)||(34777116-34777309)
chr1 (151-327)||(1443523-1443699)
chr1 (151-327)||(9120627-9120803)
chr1 (151-344)||(26224169-26224362)
chr1 (151-327)||(47012027-47012203)
chr1 (151-344)||(27088593-27088786)
chr1 (15-247)||(15105797-15106046)
chr1 (151-344)||(4854945-4855138)
chr1 (15-147)||(45045305-45045436)
chr1 (15-147)||(2870640-2870771)
chr1 (463-583)||(9120806-9120926)
chr1 (463-583)||(1443400-1443520)
chr1 (33-147)||(25277187-25277300)
chr1 (463-583)||(47012206-47012326)
chr1 (33-147)||(37345527-37345640)
chr1 (167-344)||(42558489-42558666)
chr1 (297-344)||(15105753-15105800)
chr1 (15-74)||(34776963-34777022)
chr1 (15-65)||(33599612-33599662)
chr1 (15-147)||(46582378-46582511)
chr1 (15-74)||(4854791-4854850)
chr1 (15-74)||(8169170-8169229)
chr1 (15-74)||(26224015-26224074)
chr1 (21-74)||(27088881-27088934)
chr1 (15-74)||(1443784-1443843)
chr1 (15-74)||(8168369-8168428)
chr1 (15-74)||(20944692-20944751)
chr1 (15-74)||(47011883-47011942)
chr1 (168-246)||(18183149-18183227)
chr1 (167-311)||(46637308-46637452)
chr1 (309-344)||(37087536-37087571)
chr1 (41-74)||(27952168-27952201)
chr1 (530-614)||(3370338-3370422)
chr1 (652-684)||(25277706-25277738)
chr1 (652-684)||(37345097-37345129)
chr1 (652-684)||(45045834-45045866)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (341-684)||(22154639-22154982)
chr7 (341-684)||(22210554-22210897)
chr7 (344-684)||(6604264-6604604)
chr7 (341-684)||(23905294-23905637)
chr7 (341-684)||(27665088-27665431)
chr7 (341-684)||(38473166-38473508)
chr7 (341-684)||(39858285-39858627)
chr7 (341-684)||(35692393-35692735)
chr7 (341-684)||(45360076-45360418)
chr7 (341-684)||(29995558-29995901)
chr7 (362-684)||(37114591-37114913)
chr7 (341-684)||(46438552-46438895)
chr7 (341-684)||(34776004-34776346)
chr7 (341-684)||(24227463-24227806)
chr7 (395-684)||(13168822-13169111)
chr7 (15-344)||(6604747-6605092)
chr7 (15-344)||(22155207-22155554)
chr7 (15-344)||(22211122-22211469)
chr7 (15-341)||(38549915-38550259)
chr7 (414-679)||(38550385-38550650)
chr7 (15-344)||(34775435-34775780)
chr7 (15-344)||(45360643-45360989)
chr7 (19-344)||(47384682-47385024)
chr7 (15-344)||(48850941-48851288)
chr7 (341-684)||(47385249-47385595)
chr7 (415-684)||(37792150-37792419)
chr7 (15-253)||(24226948-24227197)
chr7 (425-684)||(48851450-48851708)
chr7 (16-344)||(35691822-35692167)
chr7 (482-672)||(35402544-35402733)
chr7 (15-260)||(38472645-38472908)
chr7 (15-260)||(46438029-46438292)
chr7 (151-327)||(20479044-20479220)
chr7 (16-258)||(37114325-37114584)
chr7 (151-344)||(77364-77557)
chr7 (490-592)||(69032-69134)
chr7 (15-147)||(23904991-23905123)
chr7 (463-583)||(20478921-20479041)
chr7 (15-143)||(39858073-39858202)
chr7 (15-195)||(13169162-13169362)
chr7 (588-658)||(66845-66915)
chr7 (341-415)||(69132-69206)
chr7 (199-324)||(48311269-48311395)
chr7 (167-311)||(11683970-11684114)
chr7 (341-426)||(48310945-48311030)
chr7 (207-311)||(34692157-34692261)
chr7 (15-74)||(29995305-29995364)
chr7 (521-634)||(48310752-48310867)
chr7 (15-68)||(13036183-13036236)
chr7 (15-147)||(27664836-27664969)
chr7 (15-74)||(35402398-35402457)
chr7 (167-246)||(38614305-38614384)
chr7 (262-344)||(7403221-7403303)
chr7 (638-684)||(30939748-30939794)
chr7 (15-147)||(77578-77710)
chr7 (530-614)||(13035621-13035705)
chr7 (151-195)||(39858227-39858271)
chr7 (15-74)||(35403221-35403280)
chr7 (15-74)||(37792037-37792096)
chr7 (15-73)||(48311414-48311472)
chr7 (167-311)||(46995204-46995348)
chr7 (309-344)||(38472907-38472942)
chr7 (309-344)||(46438291-46438326)
chr7 (361-407)||(38550316-38550362)
chr7 (41-74)||(8421806-8421839)
chr7 (202-283)||(23954735-23954816)
chr7 (307-344)||(24227201-24227238)
chr7 (41-74)||(35342816-35342849)
chr7 (362-434)||(7402879-7402951)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (341-684)||(35402710-35403053)
chr4 (341-683)||(43520178-43520520)
chr4 (341-684)||(11254972-11255315)
chr4 (341-684)||(49523871-49524214)
chr4 (341-684)||(41760769-41761112)
chr4 (341-684)||(42981359-42981702)
chr4 (341-684)||(51012666-51013009)
chr4 (341-684)||(2692328-2692671)
chr4 (361-684)||(48645809-48646130)
chr4 (361-684)||(54386880-54387203)
chr4 (341-672)||(834097-834427)
chr4 (341-672)||(5438536-5438862)
chr4 (15-344)||(35402142-35402488)
chr4 (482-684)||(41782261-41782463)
chr4 (15-325)||(54387270-54387597)
chr4 (482-672)||(319845-320035)
chr4 (482-672)||(4172685-4172875)
chr4 (482-672)||(33265336-33265526)
chr4 (15-344)||(2691758-2692103)
chr4 (482-658)||(43507993-43508169)
chr4 (18-260)||(11254455-11254714)
chr4 (151-344)||(833781-833974)
chr4 (410-634)||(11640839-11641068)
chr4 (151-344)||(5438985-5439178)
chr4 (15-260)||(41760121-41760383)
chr4 (15-344)||(51013234-51013581)
chr4 (531-684)||(11602416-11602569)
chr4 (545-684)||(52867414-52867542)
chr4 (151-344)||(11641396-11641592)
chr4 (174-316)||(48645578-48645720)
chr4 (42-260)||(42981936-42982172)
chr4 (15-144)||(49524326-49524454)
chr4 (166-344)||(28101121-28101299)
chr4 (341-418)||(11641094-11641171)
chr4 (15-147)||(43520639-43520772)
chr4 (15-74)||(33264811-33264870)
chr4 (266-344)||(4614840-4614918)
chr4 (199-344)||(27385820-27385965)
chr4 (212-344)||(10544363-10544495)
chr4 (15-74)||(319700-319759)
chr4 (15-74)||(4173342-4173401)
chr4 (15-74)||(11641647-11641706)
chr4 (15-74)||(33265612-33265671)
chr4 (15-65)||(320511-320561)
chr4 (15-65)||(43507595-43507645)
chr4 (15-74)||(4172540-4172599)
chr4 (15-74)||(20820363-20820422)
chr4 (15-74)||(43508255-43508314)
chr4 (309-344)||(41760382-41760417)
chr4 (167-244)||(4519939-4520016)
chr4 (15-56)||(11641743-11641784)
chr4 (41-74)||(44793324-44793357)
chr4 (41-74)||(47942414-47942447)
chr4 (530-614)||(7150221-7150305)
chr4 (15-63)||(26397594-26397642)
chr4 (15-55)||(28100937-28100977)
[»] scaffold0564 (2 HSPs)
scaffold0564 (341-684)||(9008-9351)
scaffold0564 (15-144)||(9463-9593)
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (341-684)||(27691905-27692248)
chr8 (341-684)||(40338723-40339065)
chr8 (341-684)||(41041627-41041969)
chr8 (362-684)||(42942533-42942855)
chr8 (341-684)||(33707852-33708195)
chr8 (341-628)||(5037231-5037518)
chr8 (362-684)||(22272998-22273328)
chr8 (341-672)||(29237945-29238276)
chr8 (341-672)||(15307044-15307374)
chr8 (341-672)||(15487413-15487743)
chr8 (361-673)||(26239504-26239816)
chr8 (341-672)||(27405185-27405515)
chr8 (361-684)||(7744193-7744516)
chr8 (361-673)||(41824733-41825045)
chr8 (497-684)||(8609005-8609192)
chr8 (497-684)||(13107571-13107758)
chr8 (497-684)||(38547966-38548153)
chr8 (341-684)||(13485179-13485493)
chr8 (416-684)||(9672292-9672562)
chr8 (15-341)||(41824334-41824676)
chr8 (15-341)||(26239102-26239447)
chr8 (497-684)||(13283135-13283317)
chr8 (15-246)||(22273347-22273595)
chr8 (482-672)||(35510167-35510357)
chr8 (482-672)||(33761642-33761832)
chr8 (483-672)||(600809-600998)
chr8 (15-260)||(41041106-41041368)
chr8 (341-623)||(3152573-3152863)
chr8 (151-344)||(13283343-13283536)
chr8 (151-344)||(15307599-15307792)
chr8 (151-344)||(15487968-15488161)
chr8 (151-344)||(27404768-27404961)
chr8 (15-344)||(8608632-8608979)
chr8 (15-344)||(13107198-13107545)
chr8 (15-260)||(40338207-40338456)
chr8 (151-344)||(38548179-38548372)
chr8 (15-246)||(42942874-42943121)
chr8 (151-344)||(29238501-29238694)
chr8 (203-341)||(7743998-7744136)
chr8 (15-147)||(5037627-5037759)
chr8 (160-345)||(11719983-11720168)
chr8 (15-147)||(13484904-13485040)
chr8 (352-619)||(11720429-11720697)
chr8 (15-70)||(3152358-3152413)
chr8 (15-147)||(27692367-27692500)
chr8 (15-147)||(33707600-33707733)
chr8 (16-144)||(29693894-29694022)
chr8 (214-283)||(25705685-25705754)
chr8 (214-310)||(25370912-25371008)
chr8 (18-74)||(38548467-38548523)
chr8 (15-74)||(15562781-15562840)
chr8 (15-74)||(33761497-33761556)
chr8 (15-74)||(33762319-33762378)
chr8 (15-74)||(35509642-35509701)
chr8 (15-64)||(11719820-11719869)
chr8 (640-684)||(5037198-5037242)
chr8 (15-74)||(13283631-13283690)
chr8 (151-202)||(13485061-13485112)
chr8 (15-74)||(29238789-29238848)
chr8 (153-210)||(29693813-29693870)
chr8 (18-74)||(17807389-17807445)
chr8 (199-251)||(25371582-25371634)
chr8 (15-74)||(15684118-15684177)
chr8 (309-344)||(41041367-41041402)
chr8 (362-479)||(24285717-24285834)
chr8 (199-239)||(33369337-33369377)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (341-684)||(16763704-16764047)
chr2 (341-684)||(19907322-19907664)
chr2 (341-684)||(14388136-14388487)
chr2 (341-684)||(6798264-6798607)
chr2 (341-673)||(2767683-2768015)
chr2 (341-684)||(17696965-17697308)
chr2 (341-684)||(39455918-39456260)
chr2 (362-689)||(40560978-40561305)
chr2 (341-672)||(6784330-6784662)
chr2 (341-672)||(24206573-24206914)
chr2 (15-344)||(39663537-39663882)
chr2 (512-684)||(39663994-39664166)
chr2 (341-510)||(34401225-34401394)
chr2 (341-493)||(44708864-44709015)
chr2 (172-341)||(19581735-19581904)
chr2 (546-684)||(44709004-44709142)
chr2 (17-260)||(42517953-42518213)
chr2 (15-260)||(34400702-34400966)
chr2 (151-344)||(6783912-6784105)
chr2 (15-253)||(6798873-6799128)
chr2 (151-327)||(37021511-37021687)
chr2 (151-344)||(24206157-24206348)
chr2 (33-253)||(2768281-2768518)
chr2 (15-147)||(39456369-39456501)
chr2 (151-260)||(17697567-17697676)
chr2 (249-344)||(44708544-44708639)
chr2 (590-684)||(42518524-42518618)
chr2 (15-143)||(19907110-19907239)
chr2 (463-583)||(37021388-37021508)
chr2 (151-258)||(40561312-40561419)
chr2 (361-439)||(19581960-19582038)
chr2 (243-333)||(31471007-31471097)
chr2 (341-396)||(42518470-42518525)
chr2 (16-147)||(31474647-31474778)
chr2 (15-74)||(16764214-16764273)
chr2 (15-74)||(14387777-14387836)
chr2 (15-74)||(40561514-40561573)
chr2 (575-620)||(37646238-37646283)
chr2 (151-195)||(19907264-19907308)
chr2 (15-74)||(2577083-2577142)
chr2 (84-147)||(17697697-17697760)
chr2 (29-74)||(161722-161767)
chr2 (362-495)||(20941639-20941772)
chr2 (530-614)||(161216-161300)
chr2 (309-344)||(2768240-2768275)
chr2 (309-344)||(17697533-17697568)
chr2 (15-74)||(26581370-26581429)
chr2 (41-74)||(15373555-15373588)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (341-684)||(7372025-7372367)
chr6 (345-684)||(20524126-20524465)
chr6 (341-684)||(32438122-32438465)
chr6 (341-665)||(18644031-18644363)
chr6 (341-633)||(32517661-32517953)
chr6 (361-684)||(7050498-7050821)
chr6 (345-684)||(11355948-11356286)
chr6 (361-684)||(10569141-10569462)
chr6 (15-344)||(11356502-11356848)
chr6 (15-341)||(6902269-6902612)
chr6 (29-344)||(33267431-33267765)
chr6 (15-260)||(20524768-20525030)
chr6 (84-344)||(9399425-9399702)
chr6 (15-344)||(32437555-32437899)
chr6 (361-574)||(6901999-6902212)
chr6 (341-583)||(33267919-33268155)
chr6 (172-341)||(7050878-7051047)
chr6 (172-341)||(10569519-10569687)
chr6 (151-327)||(32454836-32455012)
chr6 (568-684)||(6900225-6900341)
chr6 (15-260)||(7371526-7371767)
chr6 (15-150)||(33277174-33277309)
chr6 (33-147)||(32518062-32518175)
chr6 (463-573)||(32455015-32455125)
chr6 (151-222)||(18644650-18644721)
chr6 (341-406)||(9399135-9399200)
chr6 (15-147)||(13611074-13611207)
chr6 (15-74)||(14338045-14338104)
chr6 (297-344)||(17935909-17935956)
chr6 (309-344)||(20524734-20524769)
chr6 (15-49)||(9399715-9399749)
chr6 (652-684)||(32517632-32517664)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (341-684)||(27898157-27898499)
chr3 (341-684)||(30599250-30599592)
chr3 (341-684)||(44794958-44795301)
chr3 (341-684)||(2660973-2661316)
chr3 (341-684)||(17516069-17516411)
chr3 (341-684)||(44275260-44275601)
chr3 (341-684)||(2377755-2378091)
chr3 (341-684)||(46198479-46198821)
chr3 (341-684)||(43765880-43766223)
chr3 (362-684)||(23292232-23292554)
chr3 (341-684)||(21349453-21349796)
chr3 (341-684)||(2225206-2225555)
chr3 (341-684)||(46113226-46113569)
chr3 (341-684)||(54899172-54899543)
chr3 (341-684)||(610353-610696)
chr3 (361-684)||(48829886-48830209)
chr3 (423-684)||(35904849-35905113)
chr3 (361-684)||(51685350-51685673)
chr3 (397-684)||(42280246-42280534)
chr3 (497-684)||(41978487-41978674)
chr3 (15-340)||(27897586-27897928)
chr3 (15-341)||(51685730-51686073)
chr3 (341-562)||(53188742-53188963)
chr3 (15-341)||(42281852-42282195)
chr3 (497-684)||(7884091-7884278)
chr3 (15-308)||(2378326-2378636)
chr3 (482-684)||(38192456-38192657)
chr3 (485-672)||(46609724-46609911)
chr3 (482-672)||(53093196-53093386)
chr3 (482-672)||(46309762-46309952)
chr3 (16-344)||(24845924-24846268)
chr3 (151-344)||(35904373-35904566)
chr3 (15-260)||(30598731-30598992)
chr3 (15-260)||(21350055-21350317)
chr3 (15-260)||(43766482-43766744)
chr3 (151-344)||(53188324-53188517)
chr3 (15-344)||(7883722-7884066)
chr3 (151-344)||(41978700-41978893)
chr3 (558-684)||(53190118-53190247)
chr3 (172-321)||(48829679-48829828)
chr3 (15-246)||(23291963-23292213)
chr3 (151-260)||(44274892-44275001)
chr3 (423-634)||(24845670-24845884)
chr3 (15-122)||(17516561-17516668)
chr3 (341-400)||(35904791-35904850)
chr3 (167-311)||(1847067-1847211)
chr3 (168-260)||(46199080-46199172)
chr3 (168-311)||(35862085-35862228)
chr3 (15-118)||(44268375-44268476)
chr3 (262-344)||(32843067-32843149)
chr3 (15-68)||(46113731-46113784)
chr3 (167-311)||(2975967-2976111)
chr3 (167-311)||(33112384-33112528)
chr3 (15-147)||(44795420-44795553)
chr3 (15-74)||(610851-610910)
chr3 (15-74)||(2661510-2661569)
chr3 (15-74)||(53188170-53188229)
chr3 (15-64)||(35904218-35904267)
chr3 (293-341)||(13466515-13466563)
chr3 (164-344)||(22218712-22218892)
chr3 (15-74)||(23876035-23876094)
chr3 (15-74)||(38192311-38192370)
chr3 (15-74)||(38193112-38193171)
chr3 (15-74)||(41978988-41979047)
chr3 (15-74)||(46309235-46309294)
chr3 (15-74)||(46310038-46310097)
chr3 (15-74)||(46609577-46609636)
chr3 (15-74)||(53093051-53093110)
chr3 (15-74)||(53093875-53093934)
chr3 (349-487)||(13466115-13466253)
chr3 (15-74)||(54899710-54899769)
chr3 (24-74)||(3150674-3150724)
chr3 (309-344)||(21350021-21350056)
chr3 (167-246)||(45897583-45897662)
chr3 (530-614)||(35862691-35862775)
chr3 (309-345)||(43766447-43766483)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (341-684)||(107628-107970)
scaffold0004 (15-344)||(107059-107404)
[»] scaffold0345 (2 HSPs)
scaffold0345 (345-684)||(301-647)
scaffold0345 (15-344)||(863-1209)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (441-684)||(4043-4286)
scaffold0058 (441-684)||(5215-5458)
scaffold0058 (15-74)||(6839-6898)
[»] scaffold0920 (3 HSPs)
scaffold0920 (341-536)||(1560-1752)
scaffold0920 (15-56)||(1134-1175)
scaffold0920 (15-52)||(1212-1249)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 684
Target Start/End: Original strand, 30464337 - 30465022
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| | |||||       | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30464337 aatttcttccatgacttgatgtcaatgttcttccc-aattaaataaacttaacaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaaccaatggtcat 30464435  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||                 |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30464436 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtagtgggcgtatgggcaaaaaaaactacaatagtcagtcttcatcttcaagctctatgtacaatgataa 30464535  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |  |||||||||    
T  30464536 ggtgagagagcttcaatgttgctgacctagaatttgtgttgtaagagaagccaacactgtcaataaccaaggaaggcctttctatatcttccctctgcca 30464635  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtatt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30464636 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtaaatggtttgtttaagatattcataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtatt 30464735  T
Q  398 gtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatat 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30464736 gtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatat 30464835  T
Q  498 gcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacattt 597  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30464836 gcatatccatcatatcgatcctaaaattagtgataataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatatattt 30464935  T
Q  598 gctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30464936 gctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgactataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 30465022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 12801009 - 12800667
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  12801009 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 12800911  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  12800910 gaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcatcaaattagtgaaaataccacc 12800811  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  12800810 aaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttaattataa 12800711  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12800710 aaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttgatgt 12800667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 342 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 21842082 - 21841740
Alignment:
Q  342 taagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  21842082 taagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgttattgtattgtggcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatg 21841983  T
Q  442 aatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcg 541  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21841982 aatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatca 21841883  T
Q  542 aataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaa 641  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21841882 aataggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgattcttagtgcatacatttgctgaagaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaa 21841783  T
Q  642 aagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21841782 aagacacacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 21841740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 2180853 - 2180514
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  2180853 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagtt--ttaaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 2180757  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2180756 gaatgaatcaaacccttgtgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 2180657  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2180656 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataa 2180557  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2180556 aaagacagac-tttgcataccatcataaatcatatctttgatgt 2180514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 12738186 - 12737844
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |     
T  12738186 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcgat 12738088  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  12738087 gaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcatcaaattagtgaaaataccacc 12737988  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  12737987 aaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttaattataa 12737888  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12737887 aaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttgatgt 12737844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 362 - 688
Target Start/End: Original strand, 32134897 - 32135223
Alignment:
Q  362 tttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgt 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||    
T  32134897 tttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtcgatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgt 32134996  T
Q  462 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttca 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32134997 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 32135096  T
Q  562 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatacc 661  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  32135097 caacggagatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataac 32135196  T
Q  662 atcataagtcatatatttgatgtccat 688  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  32135197 atcctaagtcatatatttgatgtccat 32135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 362 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 8540732 - 8540410
Alignment:
Q  362 tttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgt 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| || |||    
T  8540732 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaaatccatgtaatgttgtaatgaaaataggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgt 8540633  T
Q  462 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttca 561  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8540632 caaaaaatttcaatcaaattgatccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttca 8540533  T
Q  562 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatacc 661  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  8540532 caacagatatcattgtgatccttggtgcataaatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcatacc 8540433  T
Q  662 atcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8540432 atcataagtcatatatttgatgt 8540410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 2853310 - 2853653
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||     
T  2853310 ttaagatattgatatgaatattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtaatgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaatagattgtcaat 2853409  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  2853410 gaatgaaccaaacctttatgtcaaaatatttcaatgaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatc 2853509  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  2853510 aaataggtctttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgattataa 2853609  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2853610 aaagacagacattttcatattatcataagtcatatatttgatgt 2853653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 28821476 - 28821119
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  28821476 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatctaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 28821377  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtc--------------aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaatta 526  Q
    |||||||||||||  |||| |               ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28821376 gaatgaatcaaacatttatatatatataaaaaataaaaaaaaaatcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaatta 28821277  T
Q  527 gtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaga 626  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28821276 gtgaaaataacatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatctttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaa 28821177  T
Q  627 cactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    || ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28821176 cattttgattataaaaagacagatatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 28821119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 341 - 672
Target Start/End: Original strand, 42472525 - 42472855
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  42472525 ttaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaaaaggttgtcaat 42472624  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | ||||    
T  42472625 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatc 42472724  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  42472725 aaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgattataa 42472823  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  42472824 aaagacaaacatttgcattatatcataagtca 42472855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 497 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 7268771 - 7268584
Alignment:
Q  497 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 596  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7268771 tgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataacatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 7268672  T
Q  597 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7268671 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttacataccatcataagtcatatatttgatgt 7268584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2181271 - 2181078
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2181271 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagatctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagcca 2181172  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  2181171 acactgtcaataacgcaggaaggcctttctatgcctgccctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtccgaatggtttatttaa 2181078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 533 - 684
Target Start/End: Original strand, 24540425 - 24540576
Alignment:
Q  533 ataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacttt 632  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24540425 ataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacttt 24540524  T
Q  633 gactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24540525 gattataaaaagacatacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 24540576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34328526 - 34328264
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  34328526 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 34328427  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |    
T  34328426 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtggtgggcgtatggacaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctttgtgtacaatgatga 34328327  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 260  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34328326 ggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 34328264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Original strand, 32134630 - 32134889
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  32134630 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 32134729  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||                 |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  32134730 tgttgaagattcggtgttcataaatgatgggtggtgggcgtatggccaaaaacaactacaatagtcggtcttcatcttcaagctctacgtacaatgatga 32134829  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgt 257  Q
     |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32134830 ggtgagagagcttcaacaatggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgt 32134889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21842653 - 21842309
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaa-tggtca 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||       | || ||||| ||||||| ||| ||| |||||     
T  21842653 aatttcttccacgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattctaaattcataaatcaagtggtct 21842554  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg-----atg---------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaag 199  Q
       ||| ||||||||||||||||| |||||||||     |||         |||| |||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  21842553 gccttgtagattcggtgttcagaattgatgggtgcgcgaatgggcaaaaacaacttcaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatg 21842454  T
Q  200 tgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaa 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||  ||    
T  21842453 tgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaatagctaacactgtcaataacccaggaaggtctttctatgcttgccctctgcataa 21842354  T
Q  300 ggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  21842353 gatttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 21842309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Original strand, 42472107 - 42472300
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  42472107 aactacaacaaccgttattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaa 42472206  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  42472207 acactgtcaataacccaggaaggcttttctatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 42472300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 151 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 40781729 - 40781553
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  40781729 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaa 40781630  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgt 327  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40781629 acattgtcaataacccaggaagacctttctatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgt 40781553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17575435 - 17575243
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  17575435 aactacaacaatcggtatttatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttccatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaa 17575336  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  17575335 acactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctctgcataagg-ttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgatttgtttaa 17575243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17577466 - 17577274
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  17577466 aactacaacaatcggtatttatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttccatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaa 17577367  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  17577366 acactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctctgcataagg-ttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgatttgtttaa 17577274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 381 - 598
Target Start/End: Original strand, 41494524 - 41494741
Alignment:
Q  381 taaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaat 480  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| || | ||||||  |||| |||||||    
T  41494524 taaaatgttattgtattgtgccaagtctgtgtaatgtagtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaattcaacccttttatcaaaatctttccatcaaat 41494623  T
Q  481 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 580  Q
    ||||||||  ||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  41494624 tggtccttctattgtatgtctatccatcatattgatccccaaatttgtgaaaataccatcaaataattccttgaattttcacaacatatatcactgtaat 41494723  T
Q  581 ccttggtgcatacatttg 598  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  41494724 ccttagtgcatatatttg 41494741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7269150 - 7268804
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaa-tggtca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||       | || ||||| ||||||| ||| ||| |||||     
T  7269150 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtct 7269051  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgata 196  Q
       ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||                 ||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  7269050 gccttgtagattcggtgttcagaattgatgggtggtgcgcgaatgggcaaaaacaactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatg 7268951  T
Q  197 aagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcc 296  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |   |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |  |||||||     
T  7268950 atgtgagagagcttcaatgttgatgtcctataatttg-gttgtaagaacaacaaacactgtcaataacctaggaaggcccttctatgcttgccctctgct 7268852  T
Q  297 aaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  7268851 taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 7268804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 171 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17576135 - 17575963
Alignment:
Q  171 atcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccagga 270  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  17576135 atcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttccatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccagga 17576036  T
Q  271 aggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||  |  |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  17576035 aggcctttctatgcttgccctctgcataagg-ttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgatttgtttaa 17575963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 151 - 327
Target Start/End: Original strand, 29620726 - 29620902
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  29620726 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagtttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaa 29620825  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgt 327  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  29620826 acactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctctgcataagttttgtttaacaaaggttatttgatgt 29620902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12801220 - 12801092
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12801220 aatttcttacatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaaccagtggtcat 12801121  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatg 143  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12801120 tgttgaatattcggtgttcaaaaatgatg 12801092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12738397 - 12738269
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12738397 aatttcttacatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaaccagtggtcat 12738298  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatg 143  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  12738297 tgttgaatattcggtgttaaaaaatgatg 12738269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 246
Target Start/End: Original strand, 18623839 - 18624087
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||  ||||||||||| ||  ||||||    
T  18623839 aatttcttacatgaattgatgccaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaatttgaaattcaaaaatcagcggtcat 18623938  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||  ||                 |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |    
T  18623939 tgttgaagatttgttgtttagaaatgatgggtagtgggcgtatgggcaaaaacaactacaatagtcggtcttcatcttcaagccctatgtataatgaaga 18624038  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaa 246  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18624039 tgtgagagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaagaaaa 18624087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8541000 - 8540751
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggtt---caattcaaaattcaaaaaccaatggt 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||         ||   |||||| ||||||||||| || ||||    
T  8541000 aatttcttccatgaaatgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggt 8540901  T
Q  112 cattgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||                 ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8540900 cattgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggcggtgggcgtatgggcaaaaacaactacaacagttagtcttcatcttcaagctttatgtacaatga 8540801  T
Q  195 taaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaa 246  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||    
T  8540800 tgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcatagaa--tgtgttgtacgaaaa 8540751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 463 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 40781550 - 40781430
Alignment:
Q  463 aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcac 562  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||     
T  40781550 aaaaaaattcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcat 40781451  T
Q  563 aacagatatcactgtgatcct 583  Q
    |||||| |||| |||||||||    
T  40781450 aacagagatcaatgtgatcct 40781430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 41494228 - 41494510
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |         |||||||  |||| |||||| || |||| ||    
T  41494228 aatttcttccatgaattgatgacaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctgattttttttattcaattagaaatccaaaaatcagtggttat 41494327  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatgaac-----------------tacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    |||||||||||   |||| |||||||||||||| || ||                 ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | |    
T  41494328 tgttgaagatttaatgtttagaaatgatgggtggtggacgtatgggtaaaaacagctacaacagtgggtcttcatcttcaagttctatgtacaatggtga 41494427  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatg 283  Q
     ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |   ||||||||||||||    
T  41494428 tgtgagagtgcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaaaccaacactgtcaataactc---aaggcctttctatg 41494510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 458 - 583
Target Start/End: Original strand, 29620899 - 29621024
Alignment:
Q  458 atgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaatt 557  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29620899 atgtcaaaaaaaatcaatcacattggtccttgaattacaatcatatccatcattttgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaatt 29620998  T
Q  558 ttcacaacagatatcactgtgatcct 583  Q
     ||| |||||| |||| |||||||||    
T  29620999 atcataacagagatcaatgtgatcct 29621024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 2181390 - 2181289
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2181390 aatttcttacatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattcaaaaaccagtggtcat 2181291  T
Q  115 tg 116  Q
    ||    
T  2181290 tg 2181289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 344
Target Start/End: Original strand, 28036067 - 28036191
Alignment:
Q  220 tgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggtta 319  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | | | || || | || ||||||||| ||||  |  | | ||  |||||||||||||||||||||||    
T  28036067 tgtcctagaatttgtgttgtaaaaaaagtcaatactctaaaaaatcgagaaaggcctttatatgattgtcatttgttaaaggtttgtttaacaatggtta 28036166  T
Q  320 tgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||||||||  |||||||||||||||    
T  28036167 tgtgatgtcggaatggtttgtttaa 28036191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 24540190 - 24540249
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24540190 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 24540249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 17575589 - 17575530
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  17575589 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaatttagaaccctaa 17575530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 344
Target Start/End: Original strand, 18624089 - 18624132
Alignment:
Q  301 gtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18624089 gtttatttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 18624132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 27077183 - 27077124
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27077183 aatttcttccattaattgatgacaacgttcttccccaattcaaaaaacttcaaaacctaa 27077124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 382
Target Start/End: Original strand, 18624357 - 18624398
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgttta 382  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18624357 ttaagatattgataggagtaatttgtttgattgagttgttta 18624398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12738244 - 12738200
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgat 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12738244 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctatatgtacaatgat 12738200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12801067 - 12801023
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgat 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12801067 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctatatgtacaatgat 12801023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Original strand, 18727107 - 18727251
Alignment:
Q  167 cttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataaccc 266  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |   ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  ||| | |   || || ||    
T  18727107 cttcatcttcaagctccaagtttaatggtgttgtgagagtgcttgaatgttggtgtcctacaatttgtgttgttagaaaatccaatacttcaaaaaatcc 18727206  T
Q  267 aggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaac 311  Q
    ||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||| |||||||    
T  18727207 aggaaggccgttctatgcttgccctctgccaaaggttggtttaac 18727251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 311
Target Start/End: Original strand, 35291588 - 35291729
Alignment:
Q  168 ttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataaccca 267  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| | ||| || | ||||    
T  35291588 ttcatcttcaagctccaagtttaatggtgatgtgatagtgcttgaatgttggtgtcctagaatttgtgtcgttagaaaa-tcaatactgtaaaaatccca 35291686  T
Q  268 ggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaac 311  Q
     ||||||| |||||||  |  ||||| |||||||||||||||||    
T  35291687 tgaaggccattctatgcttgccctct-ccaaaggtttgtttaac 35291729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 40781873 - 40781814
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40781873 aatttcttccataaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 40781814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17575737 - 17575700
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17575737 ttaagatattgataggagtattttgtttgactgagttg 17575700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17577048 - 17577011
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17577048 ttaagatattgataggagtattttgtttgactgagttg 17577011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28821736 - 28821701
Alignment:
Q  309 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28821736 aacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaa 28821701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32089468 - 32089389
Alignment:
Q  167 cttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaa 246  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |   ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  32089468 cttcatcttcaagctccaagtttaatggtgttgtgagagtgcttgaatgttggtgtcctacaatttgtgttgttagaaaa 32089389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34328265 - 34328230
Alignment:
Q  309 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34328265 aacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaa 34328230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 28821786 - 28821748
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaat 53  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28821786 aatttcttccattaattgatgtcaatcttcttccccaat 28821748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40330029 - 40329989
Alignment:
Q  199 gtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgt 239  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40330029 gtgagagtgcttgaatgttggtgtcctagaatttgtgttgt 40329989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 684
Target Start/End: Original strand, 31237213 - 31237891
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31237213 aatttcttccattaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaaccaatggtcat 31237312  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31237313 tgttgaagattcggtgttcaaaaatgatgggtagtgggcgtatggacaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgataa 31237412  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  31237413 ggtgagagagcttcaatgttgctgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaagactgtcaataatccaggaaggcctttctatgtctgccctctgcca 31237512  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtatt 397  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31237513 aaggtttgtttaacaatggctatgtgatgtgtaaatggtttgtttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtatt 31237612  T
Q  398 gtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatat 497  Q
    || |||||||||||||        ||||||||||||| |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31237613 gtaccaagtccatgta--------atgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttctatcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatat 31237704  T
Q  498 gcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacattt 597  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31237705 gcatatccattatatcgatcctcaaattagtgataataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacattt 31237804  T
Q  598 gctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31237805 gctgaacaaagtaaaaagtaaaagacattcactttgactataaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 31237891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 6817758 - 6818101
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  6817758 ttaagatattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtacatataatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 6817857  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6817858 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 6817957  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6817958 aaataggtccttggtttttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtgaaagacagacactttgattataa 6818057  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6818058 aaagacagacatgtgcataccatcataagtcatatatttgatgt 6818101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 27088368 - 27088026
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27088368 ttaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 27088269  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27088268 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaa--ttcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 27088171  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactat-a 639  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27088170 aaataggtccttgacttttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 27088071  T
Q  640 aaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27088070 aaaagacacatatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 27088026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 46582630 - 46582973
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  46582630 ttaagatattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtattgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 46582729  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  46582730 gaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatc 46582829  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  46582830 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataa 46582929  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46582930 aaagactgatattttcataccatcataagtaatatatttgatgt 46582973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 362 - 684
Target Start/End: Original strand, 3012516 - 3012838
Alignment:
Q  362 tttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgt 461  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| || |||    
T  3012516 tttgtttgattgagttatttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtgatgaaaataggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgt 3012615  T
Q  462 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttca 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3012616 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatattgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttggattttca 3012715  T
Q  562 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatacc 661  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3012716 caacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcatacc 3012815  T
Q  662 atcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3012816 atcataagtcatatatttgatgt 3012838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 26224587 - 26224938
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgta--------atgttgtaatgaaaagagg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||||||| ||||||||||    
T  26224587 ttaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgttgtactgaaaagagg 26224686  T
Q  433 ttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaa 532  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26224687 ttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaa 26224786  T
Q  533 ataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacttt 632  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224787 agaccatcaaataggtccttgaattttcacaacaaatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacttt 26224886  T
Q  633 gactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26224887 gattataaaaagacacacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 26224938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 50555145 - 50555488
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  50555145 ttaagatattgataggagtattttgtttgatggagttgtttaaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 50555243  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50555244 gaatgaatcaaatcattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatc 50555343  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagt-aaaaagtaaaagacagacactttgactata 639  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  50555344 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttactgaacaaggtaaaaaactaaaagacagacactttgattata 50555443  T
Q  640 aaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  50555444 aaaagacagacatttgcatgccatcataaatcatatatttgatgt 50555488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 362 - 684
Target Start/End: Original strand, 51895228 - 51895550
Alignment:
Q  362 tttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgt 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  51895228 tttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattatgtcatgtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgt 51895327  T
Q  462 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttca 561  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  51895328 caaaaaaattcaatcaaattggcccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttca 51895427  T
Q  562 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatacc 661  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  51895428 caacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaatacactttgattataaaaagacagacatttgcatacc 51895527  T
Q  662 atcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  51895528 atcataagtcatatattttatgt 51895550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 341 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 37345418 - 37345126
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  37345418 ttaagatattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 37345319  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37345318 gactgaaccaaacccttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcataccgatcctcaaattagtgaaaataccatc 37345219  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 633  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37345218 aaatagttccttgaattttcacaacagacatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 37345126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 341 - 633
Target Start/End: Original strand, 45045545 - 45045837
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  45045545 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaagttgtcaat 45045644  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45045645 gaatgaaccaaacccttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcttcaaattagtgaaaatatcatc 45045744  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 633  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45045745 aaataggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 45045837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 15105528 - 15105185
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15105528 ttaagatattgataggagtaatttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 15105429  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||||| |||| || ||| || |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15105428 gaatgaatccaaccattctgttaagaaatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatc 15105329  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||    
T  15105328 aaataagtccttgaattttcacaacataaatcattgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgcaa 15105229  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15105228 aaagacagacattcgcataccatcatgagtcatatatttgatgt 15105185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 341 - 633
Target Start/End: Original strand, 25277409 - 25277709
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgta--------atgttgtaatgaaaagagg 432  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||||    
T  25277409 ttaagatattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagagg 25277508  T
Q  433 ttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaa 532  Q
    || |||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277509 ttgtcaatgactgaaccaaacccttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaa 25277608  T
Q  533 ataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacttt 632  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  25277609 ataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagacatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacatttt 25277708  T
Q  633 g 633  Q
    |    
T  25277709 g 25277709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 33600186 - 33600536
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaa--------tgaaaagagg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  33600186 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaaagttgtaatgaaaagagg 33600285  T
Q  433 ttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaa 531  Q
    || |||| ||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33600286 ttgtcaatgaatgaatcaa-cctttctgtcaaaaaaaattcaatcaaatcggtccttgaattatatgcatatccatcctttcgatcctcaaattagtgaa 33600384  T
Q  532 aataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactt 631  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  33600385 aatactatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatcaatgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacaatt 33600484  T
Q  632 tgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||    
T  33600485 tgattgtaaaaagacagacatttgcattatatcataagtca-atatttgatgt 33600536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 405 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 2870617 - 2870338
Alignment:
Q  405 gtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatc 504  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2870617 gtccatgtaatgttgtaacgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatc 2870518  T
Q  505 catcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870517 catcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 2870418  T
Q  605 aaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870417 aaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 2870338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 361 - 684
Target Start/End: Original strand, 52642698 - 52643019
Alignment:
Q  361 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatg 460  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||| || ||    
T  52642698 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgcattgtgccaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgccaatgaatgaatttaacccttctg 52642797  T
Q  461 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  52642798 tcaaaaaatttcaatcaaattggtctttctattgcatgtctatccatcatatcgatccctaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttc 52642897  T
Q  561 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatac 660  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||    
T  52642898 acaacatatatcactgtgatccttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagac--acactttgattgtaaaaagacgaatatttgcaaac 52642995  T
Q  661 catcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||| || ||||||    
T  52642996 catcataagtcatacatctgatgt 52643019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Original strand, 50554574 - 50554920
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         |||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  50554574 aatttcttacatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaatttgaaattcaaaaactagtggtcat 50554673  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  50554674 tgttgaagattcggtgttcataaatgattagtggtgggcgtatgggcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatgt 50554773  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  50554774 ggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacactgtcaataacccaagaagacctttctatgtctgccctctgcca 50554873  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50554874 aaggtttgtttaacaatagttatgtgatgtgcgaatggtttgtttaa 50554920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 497 - 684
Target Start/End: Original strand, 34777335 - 34777522
Alignment:
Q  497 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 596  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34777335 tgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcataacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 34777434  T
Q  597 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34777435 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 34777522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Original strand, 6817273 - 6817618
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||       | |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  6817273 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaagacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 6817372  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||                 |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||| | |    
T  6817373 tgttgaagattcggtgtatagaaatgatgggtggtgggcgtatgggcaaaaataactacaatagtcggtcttcatctttaagctctatctacaatg-tga 6817471  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  6817472 ggtgtgagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgtctgccctctgcca 6817571  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6817572 aatgtttgtttaacaatgattatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 6817618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 497 - 684
Target Start/End: Original strand, 4855164 - 4855351
Alignment:
Q  497 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 596  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4855164 tgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtaatccttggtgcatacatt 4855263  T
Q  597 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4855264 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacaatttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 4855351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 341
Target Start/End: Original strand, 52642298 - 52642641
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||       | |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  52642298 aatttcttccatgaattgatgcaaaagttcttcctcaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 52642397  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||                 | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  52642398 tgttgaagatttgatgtttagaaatgatgggtggtgggcgtatgggcaaaaacagctacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatga 52642497  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  52642498 tgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttatgttgtaaaaaaagccaacaccgtcaataacccaggaaggcctttctatgtctgccctctgcca 52642597  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52642598 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtcaatggtttgtt 52642641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 482 - 672
Target Start/End: Original strand, 8168514 - 8168704
Alignment:
Q  482 ggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 581  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  8168514 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtcattgaattatcataacagatatcaatgtgatc 8168613  T
Q  582 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  8168614 ctttgtgcatacatttgctaaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 8168704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37087832 - 37087570
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||| ||||||||||| || ||| |||    
T  37087832 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttgttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtgggcat 37087733  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  37087732 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtggtgggcgtatgggcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctgtgtacaatgatga 37087633  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 260  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  37087632 ggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtattgtaagaaaagccaacactgtcaa 37087570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Original strand, 3012249 - 3012509
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       | || ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  3012249 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgatttaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 3012348  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg--------atg---------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||        |||         |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  3012349 tgttgaagactcggtgttcaaaaatgatgggtgttaggcgtatgggaaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacagtgatga 3012448  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtc 258  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3012449 ggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaaaccaacattgtc 3012509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 246
Target Start/End: Original strand, 51894961 - 51895209
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||       | |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  51894961 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcagaaaacttaaaaccctaacttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 51895060  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |    
T  51895061 tgttgaagattcggtgtttagaaatgatgggtggtggacgtatgggcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctatatatacaatgatga 51895160  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaa 246  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51895161 ggttagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaa 51895209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Original strand, 33599767 - 33599960
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  33599767 aactacaacaaccggtcttcatcttcaaactctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagcaa 33599866  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  33599867 acactatcaataacccaggaaggtctttctatgtttgccctcagcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 33599960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Original strand, 34777116 - 34777309
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  34777116 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaa 34777215  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  34777216 acactatcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 34777309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 151 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1443699 - 1443523
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  1443699 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaa 1443600  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgt 327  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1443599 acactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgt 1443523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 151 - 327
Target Start/End: Original strand, 9120627 - 9120803
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  9120627 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaa 9120726  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgt 327  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9120727 acactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgt 9120803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Original strand, 26224169 - 26224362
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |    
T  26224169 aactacaacaaccgatattcatcttcgagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaaacaa 26224268  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  26224269 acaatgtcaataacccaggaagacctttctatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 26224362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 151 - 327
Target Start/End: Original strand, 47012027 - 47012203
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  |    
T  47012027 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaaattgtgttgtaagaagagcaa 47012126  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgt 327  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47012127 acactgtcaataacccaggaagacctttctatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgt 47012203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27088786 - 27088593
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |   |    
T  27088786 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgttcaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtgagaacaacaa 27088687  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  27088686 acaccgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatagttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 27088593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15106046 - 15105797
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  15106046 aatttcttacatgaattgatgccaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 15105947  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatgaac-----------------tacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||                 ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |    
T  15105946 tgttgaagatttggtgtttagaaatgatggatggtggacgtatgggcaaaaacagctacaacagtcggtcttcatcttcaagccctatgtacaatgaaga 15105847  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaag 247  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15105846 tgtgagagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaagaaaag 15105797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Original strand, 4854945 - 4855138
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |   |    
T  4854945 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgttgtaagaataccaa 4855044  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||    
T  4855045 acactgtcaataacccagtaatacctttctatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatatatgaatgttttgtttaa 4855138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Original strand, 45045305 - 45045436
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         || ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  45045305 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttt-atttaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 45045403  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45045404 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 45045436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2870771 - 2870640
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||         |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  2870771 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaa-cttaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattcaaaaataagtggtcat 2870673  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870672 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 2870640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 463 - 583
Target Start/End: Original strand, 9120806 - 9120926
Alignment:
Q  463 aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcac 562  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||     
T  9120806 aaaaaaattcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcat 9120905  T
Q  563 aacagatatcactgtgatcct 583  Q
    |||||| |||| |||||||||    
T  9120906 aacagagatcaatgtgatcct 9120926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 463 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 1443520 - 1443400
Alignment:
Q  463 aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcac 562  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||     
T  1443520 aaaaaaattcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcat 1443421  T
Q  563 aacagatatcactgtgatcct 583  Q
    |||||| |||| ||| |||||    
T  1443420 aacagagatcaatgtaatcct 1443400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 147
Target Start/End: Original strand, 25277187 - 25277300
Alignment:
Q  33 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcattgttgaagattcggtgtt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||       | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25277187 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaattgttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcggtgtt 25277285  T
Q  133 cagaaatgatgggtg 147  Q
    |||||||||||||||    
T  25277286 cagaaatgatgggtg 25277300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 463 - 583
Target Start/End: Original strand, 47012206 - 47012326
Alignment:
Q  463 aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcac 562  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||     
T  47012206 aaaaaaattcaatcacattggtccttgaattataatcatatcaatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcat 47012305  T
Q  563 aacagatatcactgtgatcct 583  Q
    |||||| |||| |||||||||    
T  47012306 aacagagatcaatgtgatcct 47012326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 37345640 - 37345527
Alignment:
Q  33 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcattgttgaagattcggtgtt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||       | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37345640 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaattgttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcggtgtt 37345542  T
Q  133 cagaaatgatgggtg 147  Q
    || ||||||||||||    
T  37345541 cataaatgatgggtg 37345527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 344
Target Start/End: Original strand, 42558489 - 42558666
Alignment:
Q  167 cttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataaccc 266  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | | ||||||| |||| ||||||| ||||| | |||||||| || |||||||  ||| | | |||| ||||     
T  42558489 cttcatcttcaagctccatgtttaatggtgatgtgagagtgcttgaatgttggtgtccgataatttgtggtgcaagaaaatccaatactatcaaaaaccg 42558588  T
Q  267 aggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    || ||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||    
T  42558589 agaaaggcctttctatgcttgccctttgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtcagagtggttggtttaa 42558666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15105800 - 15105753
Alignment:
Q  297 aaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15105800 aaaggtttatttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 15105753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 34776963 - 34777022
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  34776963 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 34777022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 33599612 - 33599662
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaactta 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33599612 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaactta 33599662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Original strand, 46582378 - 46582511
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaa-tggtca 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||       | || ||||| ||||||| ||| ||| |||||     
T  46582378 aatttcttccatgaattgttgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtct 46582477  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 147  Q
       ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  46582478 accttgtagattcggtgttcagaattgatgggtg 46582511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 4854791 - 4854850
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4854791 aatttctttcatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 4854850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 8169229 - 8169170
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8169229 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 8169170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 26224015 - 26224074
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26224015 aatttcttccatgaattgatatcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 26224074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 27088934 - 27088881
Alignment:
Q  21 ttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27088934 ttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 27088881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 1443843 - 1443784
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1443843 aatttcttccataaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 1443784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 8168369 - 8168428
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8168369 aattttttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 8168428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 20944751 - 20944692
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  20944751 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaacaaacttagaaccctaa 20944692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 47011883 - 47011942
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  47011883 aatttcttccataaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 47011942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 246
Target Start/End: Original strand, 18183149 - 18183227
Alignment:
Q  168 ttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaa 246  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  18183149 ttcatcttcaagctccaagtttaatggtgatgtgagaaagcttgaatgttggtgtcctagaatttgtgtcgttagaaaa 18183227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Original strand, 46637308 - 46637452
Alignment:
Q  167 cttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataaccc 266  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |   ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  ||| | |   || |||||    
T  46637308 cttcatcttcaagctccaagtttaatggtgttgtgagagtgcttgaatgttggtgtcctacaatttgtgttgttagaaaatccaatacttcaaaaaaccc 46637407  T
Q  267 aggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaac 311  Q
    ||||||| | |||||||  |  ||||||||||| ||| |||||||    
T  46637408 aggaaggtcattctatgcttgccctctgccaaatgttggtttaac 46637452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37087571 - 37087536
Alignment:
Q  309 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37087571 aacaatggttatgtgatgtgtgaatgctttgtttaa 37087536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 27952201 - 27952168
Alignment:
Q  41 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27952201 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaa 27952168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 530 - 614
Target Start/End: Original strand, 3370338 - 3370422
Alignment:
Q  530 aaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 614  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||    
T  3370338 aaaataccatcaaataagtctttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcatatatgtgcataataaagtaaaaa 3370422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 652 - 684
Target Start/End: Original strand, 25277706 - 25277738
Alignment:
Q  652 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277706 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 25277738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 652 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 37345129 - 37345097
Alignment:
Q  652 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37345129 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 37345097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 652 - 684
Target Start/End: Original strand, 45045834 - 45045866
Alignment:
Q  652 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45045834 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 45045866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 22154982 - 22154639
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  22154982 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgaattgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 22154883  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22154882 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 22154783  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22154782 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccatggtgcatatatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagactctttgattataa 22154683  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22154682 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 22154639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 22210897 - 22210554
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  22210897 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgaattgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 22210798  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22210797 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 22210698  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22210697 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccatggtgcatatatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagactctttgattataa 22210598  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22210597 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 22210554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 344 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 6604604 - 6604264
Alignment:
Q  344 agatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaa 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  6604604 agatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaa 6604505  T
Q  444 tgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaa 543  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6604504 tgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaa 6604405  T
Q  544 taggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaa 643  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6604404 taggtccttgacttttcacaacatatatcactgtgatcattggtgcatacatttactgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaa 6604305  T
Q  644 gacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6604304 gacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 6604264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 23905294 - 23905637
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  23905294 ttaagatattgataggagtattttgtttgattcagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 23905393  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23905394 gaatgaatcaaacccttctgtcaaaaaatttaaatcaaattggtcattgaattatatgcatatcaatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 23905493  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  23905494 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaaaacactttgattataa 23905593  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23905594 aaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 23905637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 27665088 - 27665431
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27665088 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 27665187  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||| |||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27665188 gaatgaaccaaacctttctgtcaaaatattttaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatc 27665287  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27665288 aaatatgtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 27665387  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665388 aaaggcagacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 27665431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 38473166 - 38473508
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  38473166 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattttgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 38473265  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473266 gaatgaatcaaacctttttgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatactcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 38473365  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  38473366 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaa-acatacactttgattataa 38473464  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473465 aaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 38473508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 39858285 - 39858627
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  39858285 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 39858383  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  39858384 gaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaatgagtgaaaataccatg 39858483  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  39858484 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataa 39858583  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  39858584 aaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttgatgt 39858627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 35692393 - 35692735
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  35692393 ttaagatattgataaaagtattttgtttgattgtgttgtttaaa-tgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 35692491  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35692492 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 35692591  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  35692592 aaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatatatttgccgaacgaagtaaaaagcaaaagacagacactttgattataa 35692691  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35692692 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 35692735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 45360418 - 45360076
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  45360418 ttaagatattgataggagtattttgttggattgagttgtttaaaatgctaatg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 45360320  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45360319 gaatgaatcaaacccttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctaaaattagtgaaaataccatc 45360220  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  45360219 aaataggtctttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagataaacactttgattataa 45360120  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45360119 aaagacagacatttgcataccatcataaatcatatatttgatgt 45360076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 29995558 - 29995901
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  29995558 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtctatgtaatgttgtaatgaacagaggttttcaat 29995657  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||| |||||  || |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  29995658 gaatgaaccaaacatttctgtcaaaatatttcaatcaaattgatccttaaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatg 29995757  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29995758 aaataggtccttgaattttcacaacaaatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 29995857  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29995858 aaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 29995901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 362 - 684
Target Start/End: Original strand, 37114591 - 37114913
Alignment:
Q  362 tttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgt 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||    
T  37114591 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtattgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaatctttttgt 37114690  T
Q  462 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttca 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37114691 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 37114790  T
Q  562 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatacc 661  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  37114791 caacagatatcattgtaatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaatacactttgattataaaaagacagacatttgcatacc 37114890  T
Q  662 atcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37114891 atcataagtcatatatttgatgt 37114913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 46438552 - 46438895
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  46438552 ttaagatattgatatgagtattttgtttggttgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtactgaaaagaggttgtcaac 46438651  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46438652 gaatgaatcaaacctatatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaataagtgaaaataccatc 46438751  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||     
T  46438752 aaataggtcattgaattttcacaacagatatcactttgatccttggtggatacatttgctgaatagagtaaaaagtagaagacaaacactttgattatag 46438851  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46438852 aaagacggacatttgcataccatcataagtcatatatttaatgt 46438895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 34776004 - 34776346
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  34776004 ttaagatattgataggtgtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattg-attgtcccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 34776102  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||  || |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34776103 gaatgaatcaaactcttctgtcaaatttttttaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 34776202  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||    
T  34776203 aaatagatctttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaactaaaagacagacactcagattataa 34776302  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34776303 aaagacaaacatttgcataccatcataaatcatatatttgatgt 34776346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 24227463 - 24227806
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  24227463 ttaagatattgataggagtattttgtttcattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgcaatgaaaagaggttgtcaat 24227562  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24227563 gaatgaatcaaaccttgttgtcaaaaaatttcaatcaaatatgtccttaaattatatacacatccatcatatcaatcctcaaattagtgaaaataccatc 24227662  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24227663 aaataggacatttaattttcacaacagatatcactgtgatcattggtacatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattacaa 24227762  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24227763 aaagacagacatttgtataccatcataaatcatatatttgatgt 24227806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 395 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 13169111 - 13168822
Alignment:
Q  395 attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaatta 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13169111 attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaatta 13169012  T
Q  495 tatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcataca 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13169011 tatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaacataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcaatgtgatccttggtgcataca 13168912  T
Q  595 tttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  13168911 ttcgctgaacaaaataaaaactaaaagacagacactttgattataaaaatacagacatttgcatatcattataaatcatatatttgatgt 13168822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6605092 - 6604747
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6605092 aatttcttccatgaattgatgtcaatgtttttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaaccagtggtcat 6604993  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  6604992 tgttgaagattcggtgttcggaaatgatgggtggtgggtgtatgggcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatg-tga 6604894  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||    
T  6604893 ggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttatgttgtaagaaaagtcaactatgtcaataacccaggaaggcctttctatgcctgccctctgcca 6604794  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6604793 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatagtttgtttaa 6604747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22155554 - 22155207
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnngg-ttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        | |||||||||||||||||||| || | ||||    
T  22155554 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaactttttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtagtca 22155455  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgata 196  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  22155454 tcgttgaagattcggtgttcaaaaatgatgggtggtggacgtctgggcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatg 22155355  T
Q  197 aagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcc 296  Q
    | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  22155354 aggtgagataacttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacctaggaaggcctttctatgtctgtcctctgcc 22155255  T
Q  297 aaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22155254 aaagttttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 22155207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22211469 - 22211122
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnngg-ttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        | |||||||||||||||||||| || | ||||    
T  22211469 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaactttttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtagtca 22211370  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgata 196  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  22211369 tcgttgaagattcggtgttcaaaaatgatgggtggtggacgtctgggcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatg 22211270  T
Q  197 aagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcc 296  Q
    | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  22211269 aggtgagataacttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacctaggaaggcctttctatgtctgtcctctgcc 22211170  T
Q  297 aaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22211169 aaagttttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 22211122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 341
Target Start/End: Original strand, 38549915 - 38550259
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38549915 aatttcttccatgaattgataccaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaattttttttattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcat 38550014  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg------------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgata 196  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||                  | ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  38550015 tattgaagatttggtgttcagaaatgatgggtggtgggcgtatggggcaaaaacagctataacagtcggtctttatcttcaagctctatgtacaatgatg 38550114  T
Q  197 aagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcc 296  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||    
T  38550115 atgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgtttgcccactgcc 38550214  T
Q  297 aaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtt 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38550215 aaatgtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtt 38550259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 414 - 679
Target Start/End: Original strand, 38550385 - 38550650
Alignment:
Q  414 atgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatc 513  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||  |||||||||||||    
T  38550385 atgttgtaatgaaaagaggttgtcaataaatgaatttaacccttatgtaaaaaaaattcaatcaaattagtccttctattgtatgtctatccatcatatc 38550484  T
Q  514 gatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaa 613  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38550485 gatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaatttttacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaaataaaa 38550584  T
Q  614 agtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatattt 679  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38550585 agtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacattt 38550650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Original strand, 34775435 - 34775780
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||          |||||||  ||||| |||||||| |||||||    
T  34775435 aatttcttacatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcagaaaacttaaaaccctatttttttta-ttcaatttgaaattaaaaaaccagtggtcat 34775533  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||                 |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  34775534 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgagtggtggaagtatgggaaaaaacaactacaacagtaggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatga 34775633  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| |||    
T  34775634 ggtgagagagcttcaatgttggtggcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacagtgtcaataatccaggaaggcctttctatgcataccctctacca 34775733  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34775734 aaggtttgtttaacaatggttatatgatgtgcgaatggtttgtttaa 34775780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 45360989 - 45360643
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  45360989 aatttcttacaagaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaatttaaaattcaaaaatcagtggtcat 45360890  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||                 |||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  45360889 tgttgaagattcagtgttcataaatgatgagtggtggacgtatgggcaaaaacaactacaatagtaggtcctcatcttcaagctctatgtacaatgatga 45360790  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||| |||    
T  45360789 ggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacactgtcaataacccaagaaggcctttctatgtctgccctcttcca 45360690  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  45360689 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgcgaatggtctgtttaa 45360643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 47384682 - 47385024
Alignment:
Q  19 tcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcattgtt 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||         |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  47384682 tcttccatgaattgatgtcaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgtt 47384781  T
Q  119 gaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatgaac-----------------tacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtg 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||                 |||||||| | ||||||||||||||||||  ||| ||||||| | |||    
T  47384782 gaagatttggtgttcagaaatgatgggtggtggacgtatgggaaaaaacagctacaacagacagtcttcatcttcaagctctctgttcaatgatgatgtg 47384881  T
Q  202 agagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaagg 301  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||     
T  47384882 agagagattcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaaaccaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtttgccctcttccaaagt 47384981  T
Q  302 tttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47384982 tttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 47385024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Original strand, 48850941 - 48851288
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnngg-ttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtca 113  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||        | |||||||| ||||||||||| || || |||    
T  48850941 aatttcttccattaattgatgccaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtgatca 48851040  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatgaac-----------------tacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgata 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||                 ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  48851041 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtggtggacgtatgggcaaaaacagctacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgcacaatgatg 48851140  T
Q  197 aagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcc 296  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  48851141 atgtgagagagcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacctaggaaggcctttctatgcttgccctctgcc 48851240  T
Q  297 aaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48851241 aaatgtttggttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 48851288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 47385249 - 47385595
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgta--------atgttgtaatgaaaagagg 432  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||  ||||        ||||||||||||| || ||    
T  47385249 ttaagatattgataggagtgatttgtttgattgagttgtttagaattttattttattgtgccaagtctgtgtaatgctgtaatgttgtaatgaacagtgg 47385348  T
Q  433 ttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaa 532  Q
    || |||| ||||||||  |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47385349 ttgtcaatgaatgaattcaacctttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattatatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaa 47385448  T
Q  533 ataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacttt 632  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47385449 ttaccatcaaataagtccttgaattttcacaacatacatca-tgtgatc----atgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacatt 47385543  T
Q  633 gactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    || | |||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  47385544 gattgtaaaaagacagacatttacataccatcataactgatacatttgatgt 47385595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 415 - 684
Target Start/End: Original strand, 37792150 - 37792419
Alignment:
Q  415 tgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcg 514  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  |||  |||||||||||| |    
T  37792150 tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaattcaacccttctgtcaaaatatttccatcaaattggtccttctattgcatgtctatccatcatattg 37792249  T
Q  515 atcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 614  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  37792250 atccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaccatatatcactgtgatcattggtgcatacatttgttgtacaaagtaaaaa 37792349  T
Q  615 gtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| || | ||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  37792350 gtaaaagtcaaagactttgattgtaaaaagacagacatttgcttaccatcatatgtcatacatttgatgt 37792419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Original strand, 24226948 - 24227197
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||       | |||||||| |||||| |||| || |||||||    
T  24226948 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaagaccctaatttttttgattcaattcgaaattcgaaaatcagtggtcat 24227047  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||    
T  24227048 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggaggtgtgtgtatggacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatgagatgag 24227147  T
Q  204 agagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaaca 253  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24227148 agagcttcaatgttagtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaaca 24227197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 425 - 684
Target Start/End: Original strand, 48851450 - 48851708
Alignment:
Q  425 aaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaat 524  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  |||| || ||||||||  |||| ||||||||||||| |  ||| ||||  || ||||||||| |||||  ||||    
T  48851450 aaaagaggttgtcaatgaatgaattcaaccattctgtcaaaatctttccatcaaattggtccctctattgtatgtctacccatcatattgatcca-aaat 48851548  T
Q  525 tagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 624  Q
    ||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48851549 tagtgaaaatctcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggggcatacatttgctgaccaaagtaaaaagtaaaagaca 48851648  T
Q  625 gacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  48851649 gacactttgattgtaaaaagacatacatttgcataccatcagaagttatacatttgatgt 48851708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 35691822 - 35692167
Alignment:
Q  16 atttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcatt 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||       | || ||| | ||||||||||| || |||||       
T  35691822 atttcttccatgaatcgatgtcaaagttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaatccgaaattcaaaaatcagtggtctac 35691921  T
Q  116 gttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaa 198  Q
     ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||                 ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |     
T  35691922 cttgtagattcggtgttcataattgatgggtggtgggcatatgggcaaaaacaactacaacagccggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatgat 35692021  T
Q  199 gtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaa 298  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |  |||||||  |    
T  35692022 gtgagaaagcttcaatgttggtgtccaagaatttgcgttgtaagaaaagcaaacactgtcaataacctaggaaggcctttctattcctgccctctgcata 35692121  T
Q  299 aggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35692122 aggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatgttttctttaa 35692167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 482 - 672
Target Start/End: Original strand, 35402544 - 35402733
Alignment:
Q  482 ggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 581  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  35402544 ggtccttgaattatattca-atccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 35402642  T
Q  582 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  35402643 ctttgagcatatatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagataaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 35402733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Original strand, 38472645 - 38472908
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnngg-ttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||          |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  38472645 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtca 38472744  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgata 196  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  38472745 ttgttgaagattcggtgttcacaaatgatgggtggtgggcgtatggacaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaattatg 38472844  T
Q  197 aagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 260  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  38472845 agatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 38472908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Original strand, 46438029 - 46438292
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttcccc-aattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtca 113  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||       | |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  46438029 aatttcttccataaactgatgtcaatgttcttcccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaatttgaaattcaaaaatcaatggtca 46438128  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgata 196  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||                 |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  46438129 ttgttgaagattcggtgttcataaatgatgggtggtgggcgtatgggcaaaaagaactacaacagtcgctcttcatcttcaagctctatgtacaatgatg 46438228  T
Q  197 aagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 260  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  46438229 aggtgagagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaaaaaaagccaacactgtcaa 46438292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 151 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20479220 - 20479044
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  20479220 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaa 20479121  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgt 327  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20479120 acactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgt 20479044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 258
Target Start/End: Original strand, 37114325 - 37114584
Alignment:
Q  16 atttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcatt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||       | |||||||  ||||| ||||| || ||||||||    
T  37114325 atttcttccataaattgatgtcaatgttcttccccaatttaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaatttgaaattgaaaaatcagtggtcatt 37114424  T
Q  116 gttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||                 |||||||| |||  |||||||||||||| ||| |||||||||||| |     
T  37114425 gttgaagattcggtgttcagaaatgatggatggtgggcatatgggcaaaaacaactacaatagtgagtcttcatcttcaaactctatgtacaatgatgag 37114524  T
Q  199 gtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtc 258  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37114525 gtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaaaccaacattgtc 37114584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 77557 - 77364
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  77557 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaa 77458  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |   || |||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  77457 acactgtcaataacccaggaaggcttttctatgcttgcactatgcataaggtttgtttaacaatggttatttaatgtatgaatgttttgtttaa 77364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 490 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 69134 - 69032
Alignment:
Q  490 aattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgc 589  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  69134 aattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatccttggtgc 69035  T
Q  590 ata 592  Q
    |||    
T  69034 ata 69032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Original strand, 23904991 - 23905123
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  23904991 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatattttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 23905090  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 147  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23905091 tgttaaagattaggtgttcaaaaatgatgggtg 23905123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 463 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 20479041 - 20478921
Alignment:
Q  463 aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcac 562  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||     
T  20479041 aaaaaaattcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcat 20478942  T
Q  563 aacagatatcactgtgatcct 583  Q
    |||||| |||| |||||||||    
T  20478941 aacagagatcaatgtgatcct 20478921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Original strand, 39858073 - 39858202
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa-nnnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtca 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||        | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39858073 aatttcttacatgaattgatgtcaatgttcttcaccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttgattcaattcgaaattcaaaaaccagtggtca 39858172  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatg 143  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39858173 ttgttgaatattcggtgttcagaaatgatg 39858202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13169362 - 13169162
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa---nnnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggt 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||          | |||||||| |||||||||||| | ||||    
T  13169362 aatttcttacatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttttgattcaattcgaaattcaaaaactagtggt 13169263  T
Q  112 cattgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatga 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13169262 cattgttgaatattcggtgttcagaaatgatgagtggtgggcgtatgggcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatga 13169163  T
Q  195 t 195  Q
    |    
T  13169162 t 13169162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 588 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 66915 - 66845
Alignment:
Q  588 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcat 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  66915 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagaaaggcatttgcat 66845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 341 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 69206 - 69132
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaat 415  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  69206 ttaagatattaatatgagtattttgtttgattgagttgttttaaatactattgtactgtgccaagtccatgtaat 69132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 48311395 - 48311269
Alignment:
Q  199 gtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggc-ctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||  |  |||||| ||    
T  48311395 gtgagagtgcttgaatgttggtgtaatagattttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacccaggaagactttttctatgcttgccctctgtca 48311296  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtga 324  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  48311295 aagttttgttcaacaatggttatgtga 48311269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11684114 - 11683970
Alignment:
Q  167 cttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataaccc 266  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||| | | |||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | | | || || ||    
T  11684114 cttcatctttaagctccatgtttaatggtgatgtgagagtacttgaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaaaccaatactcttaaaaatcc 11684015  T
Q  267 aggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaac 311  Q
    | ||||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  11684014 aagaaggtctttctatgcttgccctctgccaaaggtttgtttaac 11683970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 48311030 - 48310945
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaa 426  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| || ||||||  |||||||||||||||||    
T  48311030 ttaagatattgacatgagtaatttgtttgattgaattgtttaaaatgctattatattatgtcaagtctgtgtaatgttgtaatgaa 48310945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34692261 - 34692157
Alignment:
Q  207 gcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgt 306  Q
    |||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  34692261 gcttgaatgttggtgtggtagaatttgtgctgtaagaaaagccaacactctcaaaaacccagaaaggtctttctatgcttgccctctgccaaaggtttgt 34692162  T
Q  307 ttaac 311  Q
    |||||    
T  34692161 ttaac 34692157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 29995305 - 29995364
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  29995305 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 29995364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 521 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 48310867 - 48310752
Alignment:
Q  521 aaattagtgaaaa-taccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta-aaaagtaa 618  Q
    ||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||  ||    
T  48310867 aaattagtgaaaaatatcatcaaataagtcattgaattatcacaacatatatcaatatgatctttgctacatatatttgctgaacaaagtagaaaataaa 48310768  T
Q  619 aagacagacactttga 634  Q
    ||||||||||||||||    
T  48310767 aagacagacactttga 48310752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 13036236 - 13036183
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaa 68  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13036236 aatttcttccattaattgatgacaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaa 13036183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Original strand, 27664836 - 27664969
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaa-tggtca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || |||||       | || ||||| ||||||| ||| ||| |||||     
T  27664836 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattccaaattcataaatcaagtggtct 27664935  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 147  Q
       ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27664936 gccttgtagattcggtgttcagaattgatgggtg 27664969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 35402398 - 35402457
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35402398 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 35402457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38614384 - 38614305
Alignment:
Q  167 cttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaa 246  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| | | ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38614384 cttcatcttcaagctccaagtctaatggtgatgtgagagtgcttaaatgttggtgtcctagaatttgtgttgttagaaaa 38614305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7403303 - 7403221
Alignment:
Q  262 aacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||  |||||||||||||||    
T  7403303 aacccaggaagacctttctatggttgccctctgccaaaggtttgtttaaccataattgtgtgatgtccgaatggtttgtttaa 7403221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 638 - 684
Target Start/End: Original strand, 30939748 - 30939794
Alignment:
Q  638 taaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30939748 taaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 30939794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 77710 - 77578
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaa-tggtca 113  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||       | || ||||||||||||| ||| ||| |||||     
T  77710 aatttcttccataaattgatgcaaat-ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcaaaattcataaatcaagtggtct 77612  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 147  Q
       ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  77611 gccttgtagattcggtgttcagaattgatgggtg 77578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 13035705 - 13035621
Alignment:
Q  530 aaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 614  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  13035705 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcatatatgtgcaaaacaaagtaaaaa 13035621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 195
Target Start/End: Original strand, 39858227 - 39858271
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgat 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39858227 aacttcaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgat 39858271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 35403280 - 35403221
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35403280 aatttctttcatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttataaccctaa 35403221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 37792037 - 37792096
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||| |||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37792037 aatttcttccctgaacttatggcaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaa 37792096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 48311472 - 48311414
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatccta 73  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  48311472 aatttctttcattaattgatgacaaagttcttccccaattcaaaaaatttaaaaaccta 48311414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Original strand, 46995204 - 46995348
Alignment:
Q  167 cttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataaccc 266  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |   ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  ||| | |   || |||||    
T  46995204 cttcatcttcaagctccaagtttaatggtgttgtgagagtgcttgaatgttggtgtcctacaatttgtgttgttagaaaatccaatacttcaaaaaaccc 46995303  T
Q  267 aggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaac 311  Q
    | ||||||| |||||||  |  | ||||||||||||| |||||||    
T  46995304 atgaaggccattctatgcttgccatctgccaaaggttggtttaac 46995348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 344
Target Start/End: Original strand, 38472907 - 38472942
Alignment:
Q  309 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38472907 aacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaa 38472942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 344
Target Start/End: Original strand, 46438291 - 46438326
Alignment:
Q  309 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46438291 aacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaa 46438326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 361 - 407
Target Start/End: Original strand, 38550316 - 38550362
Alignment:
Q  361 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtc 407  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  38550316 ttttgtgttattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgcaaagtc 38550362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 74
Target Start/End: Original strand, 8421806 - 8421839
Alignment:
Q  41 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8421806 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaa 8421839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23954816 - 23954735
Alignment:
Q  202 agagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatg 283  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |   || |||||||||||||| |||||||    
T  23954816 agagtgcttgaatgttggtgtcctagaatttgtgttgttagaaaatccaatacttcaaaaaacccaggaaggccattctatg 23954735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 344
Target Start/End: Original strand, 24227201 - 24227238
Alignment:
Q  307 ttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24227201 ttaacaatgattatgtgatgtgtgaatgatttgtttaa 24227238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 74
Target Start/End: Original strand, 35342816 - 35342849
Alignment:
Q  41 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35342816 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaa 35342849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 7402951 - 7402879
Alignment:
Q  362 tttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggtt 434  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||| || |||||||| | | ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  7402951 tttgtttgtttgggttgtttaacatgctactgtattgtactatgtgtgtgtaatgttgtaatgaaaagaggtt 7402879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 35402710 - 35403053
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  35402710 ttaagatattgataggagtattttttttgattgagttgtttaaaatgctattgtactgtgccaagtccgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 35402809  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35402810 gaatgaatcaaacccttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggttcttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatc 35402909  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  35402910 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaacgacagacactttgattataa 35403009  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35403010 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 35403053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 341 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 43520520 - 43520178
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  43520520 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 43520421  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43520420 gaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatc 43520321  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43520320 aaatagatccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 43520221  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatg 683  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43520220 aaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatg 43520178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 11254972 - 11255315
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  11254972 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattatattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 11255071  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11255072 gaatgaatcaaacctttatgtcaaaaaatttcaatcaaattgatcgttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 11255171  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11255172 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcattagtgcatacatttgctgagcaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 11255271  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11255272 aaagacagatatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 11255315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 49524214 - 49523871
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  49524214 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatattattgtattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 49524115  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49524114 gaatgaatcaaacccttctgtcaaaatatttcaatcaaattggtcattgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 49524015  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49524014 aaataggtccttgaattttcacaacaaatataactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 49523915  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49523914 aaacacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 49523871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 41760769 - 41761112
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  41760769 ttaagatattgatatgagtattttgtttgattgagttgttgaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 41760868  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41760869 gaatgaatcaaacctttctggcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 41760968  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41760969 aaataggtccttgaattttcataccagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataa 41761068  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41761069 aaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 41761112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 42981702 - 42981359
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |     
T  42981702 ttaagatattgataggagtattttgtttcattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagttcatgtattgttgtaatgaaaagaggttgtcgat 42981603  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42981602 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatctatcatatcgatccttaaattagtgaaaataccatc 42981503  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42981502 aaataggtccttgaattttcacaacaggtatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 42981403  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42981402 aaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 42981359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 51013009 - 51012666
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  51013009 ttaagatattgataggagtattttgtttgactgggttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 51012910  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  51012909 gaatgaatcaaacctttctatcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcaatcctcaaattagtgaaaataccatc 51012810  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51012809 aaataggtccttaaattttcacaacagatattactgcgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 51012710  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51012709 aaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 51012666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 2692328 - 2692671
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2692328 ttaagatattgataggagtaatttgtttgattaagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctctgtaatgttgtaattaaaagaggttgtcaac 2692427  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||||  || | || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2692428 gaatgaattcaatccttctgtcaaaaaatttccatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaatatcatc 2692527  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  2692528 aaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggttcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattgtaa 2692627  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2692628 aaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgt 2692671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 361 - 684
Target Start/End: Original strand, 48645809 - 48646130
Alignment:
Q  361 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||| || ||    
T  48645809 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaataaatgaatttaacccttctg 48645908  T
Q  461 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  48645909 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttc 48646008  T
Q  561 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatac 660  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||  | ||||||||||||    
T  48646009 acaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaataaagtaaaaagtaaaagacaaatactttgattgtaaaaag--agacatttgcatac 48646106  T
Q  661 catcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  48646107 catcataagtcatatatttgatgt 48646130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 361 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 54387203 - 54386880
Alignment:
Q  361 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatg 460  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| || ||    
T  54387203 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctg 54387104  T
Q  461 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  54387103 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttcgattgtatgtctctccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttc 54387004  T
Q  561 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatac 660  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  54387003 acaacatatatcactgcaattcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatac 54386904  T
Q  661 catcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  54386903 catcataagtcatacatttgatgt 54386880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 341 - 672
Target Start/End: Original strand, 834097 - 834427
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  834097 ttaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaaaaggttgtcaat 834196  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | ||||    
T  834197 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatc 834296  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  834297 aaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgaatataa 834395  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||||||    
T  834396 aaagacaaacattttcattatatcataagtca 834427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 341 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 5438862 - 5438536
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  5438862 ttaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaaaaggttgtcaat 5438763  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | ||||    
T  5438762 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatc 5438663  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||    |||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  5438662 aaa----tccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgaatataa 5438568  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||||||    
T  5438567 aaagacaaacattttcattatatcataagtca 5438536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Original strand, 35402142 - 35402488
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||       | |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  35402142 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattaaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 35402241  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||                 ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  35402242 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtggtggacgtatgggcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagttctatgtacaatgatga 35402341  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||  |  |||||||||    
T  35402342 ggtgaaagagcttcgatgttggtgtccaagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacactatcaataacctaggaagacctttctatgcctgccctctgcca 35402441  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35402442 aaggtttgtttaacaatggtcatgtgatgtgtcaatggtttgtttaa 35402488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 482 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 41782463 - 41782261
Alignment:
Q  482 ggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41782463 ggtccttgaattatatgcatatccatcatatcaatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaattggtccttgatttttcacaacagatatcaccgtgatc 41782364  T
Q  582 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttga 681  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  41782363 cttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatatgcacactatcataagtcatatatttga 41782264  T
Q  682 tgt 684  Q
    |||    
T  41782263 tgt 41782261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 54387597 - 54387270
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||         |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  54387597 aatttcttccatgaattgatgccaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattatttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 54387498  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |    
T  54387497 tgttgaagatttggtgttcagaaatgatgggtggtgggcgtatgggcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtataataatga 54387398  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||    
T  54387397 tgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacccaggaagacctttctatgtctgccctatgcca 54387298  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgat 325  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||    
T  54387297 aatgtttgtttaacgatggttatgtgat 54387270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 482 - 672
Target Start/End: Original strand, 319845 - 320035
Alignment:
Q  482 ggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 581  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  319845 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 319944  T
Q  582 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  319945 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 320035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 482 - 672
Target Start/End: Original strand, 4172685 - 4172875
Alignment:
Q  482 ggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 581  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  4172685 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 4172784  T
Q  582 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  4172785 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 4172875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 482 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 33265526 - 33265336
Alignment:
Q  482 ggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 581  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  33265526 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 33265427  T
Q  582 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  33265426 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 33265336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Original strand, 2691758 - 2692103
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||| | |||||| || |||| ||    
T  2691758 aatttcttccattaattgatgacaaaattcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaattcaaagtccaaaaatcactggtaat 2691857  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||                 |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  | |    
T  2691858 tgttgaagatttggtgttcagaaatgatgggtggtgggcgtatgggcaaaaataactacaacagtccatcttcatcttcaagctctatgtacaatcgtga 2691957  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  2691958 tgtgagat-gcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaagccaacattgttaataatccaggaaggcctttttatgtcttccctctgcca 2692056  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2692057 aaggtttgtttaacaatgattatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 2692103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 482 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 43508169 - 43507993
Alignment:
Q  482 ggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 581  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||    
T  43508169 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaagataccatcaaattggtccttgaattatcataacaaatatcaatgtgatc 43508070  T
Q  582 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcat 658  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43508069 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 43507993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 11254455 - 11254714
Alignment:
Q  18 ttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcattgt 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||       | |||||||| |||||||||||  | ||||||||||    
T  11254455 ttcttccattaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaactcaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaattagtggtcattgt 11254554  T
Q  118 tgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagt 200  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||                 ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||    
T  11254555 tgaagattcagtgttcaaaaatgatgggtggtgggcgtatgggcagaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaggctctatgtacaatgatgaggt 11254654  T
Q  201 gagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11254655 gagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 11254714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Original strand, 833781 - 833974
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  833781 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaa 833880  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  833881 acactgtcaataacccaggaaggcttttctatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 833974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 410 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 11641068 - 11640839
Alignment:
Q  410 tgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatca 509  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||  |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||    
T  11641068 tgtaatgttgtaaagaaaagatgttgtcaatgaatgaattcaaccattctgtcaaaatatttccatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatca 11640969  T
Q  510 tatc-----gatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 604  Q
    ||||     ||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11640968 tatcatatcgatctccaaattagtgaaaatacaatcaaataagtcgttcaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctgaac 11640869  T
Q  605 aaagtaaaaagtaaaagacagacactttga 634  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11640868 aaagtaaaaagtaaaaaacatacactttga 11640839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5439178 - 5438985
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  5439178 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaa 5439079  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  |||||||||    
T  5439078 acactgtcaataacccaggaaggcttttctatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtataaatattttgtttaa 5438985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Original strand, 41760121 - 41760383
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||         |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  41760121 aatttcttccatgaattgttgtcaatgttcttccccaattcaaaaaaattaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 41760220  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |                  ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  41760221 tgttgaagattcgatgttcagaaatgatgggaggtagacgtataggaaaaaacaactacagcagtcggtcttcatcttcaacctctatgtacaatgatga 41760320  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 260  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  41760321 ggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaatccaacactgtcaa 41760383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 51013581 - 51013234
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaa-tggtca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||       | || ||||| ||||||| ||| ||| |||||     
T  51013581 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtct 51013482  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgata 196  Q
       ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||                 ||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  51013481 accttgtagattcggtgttcagaattgatgggtggtgcgcgaatgggcaaaaacaactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatg 51013382  T
Q  197 aagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcc 296  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||  |||||||||||||   |  |||||||     
T  51013381 atgtaagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccataaaggcctttctatacttgccctctgca 51013282  T
Q  297 aaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||    
T  51013281 taaggtttgtttaacaatgattatttgatgtatgaatgttttgtttaa 51013234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 531 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 11602569 - 11602416
Alignment:
Q  531 aaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacact 630  Q
    |||||| ||| |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11602569 aaatacaatcaaataagtcgttcaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacatacact 11602470  T
Q  631 ttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  11602469 ttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcacacatttgatgt 11602416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 545 - 684
Target Start/End: Original strand, 52867414 - 52867542
Alignment:
Q  545 aggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaag 644  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           |    
T  52867414 aggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtagaagacagacacttt-----------g 52867502  T
Q  645 acaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52867503 acaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 52867542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11641592 - 11641396
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatg---ataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaag 247  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||   || | |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11641592 aactacgacagtcagtcttcttcttcaagctctatgtacaatggtgatcatgtgagagtacttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaag 11641493  T
Q  248 tcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
     ||||| | ||||||| ||| |||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11641492 ccaacactatcaataatccaagaagacctttctatgtcttccctctgtcaaaggtttatttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttttttaa 11641396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 174 - 316
Target Start/End: Original strand, 48645578 - 48645720
Alignment:
Q  174 ttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaagg 273  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  48645578 ttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgccaataacccaggaagg 48645677  T
Q  274 cctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatgg 316  Q
     |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48645678 tctttctatgtctgccctctgccaaaagtttgtttaacaatgg 48645720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 42982172 - 42981936
Alignment:
Q  42 ttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnngg-ttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcattgttgaagattcggtgttcagaaatg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||          |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42982172 ttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtagtcattgttgaagattcggtgttcagaaatg 42982073  T
Q  141 atgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtc 223  Q
    | ||||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  42982072 acgggtggtgggcgtatgagcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtc 42981973  T
Q  224 ctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 260  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  42981972 ctagaatttgttttgtaaggaaagccaacactgtcaa 42981936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 49524454 - 49524326
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  49524454 aatttcttacatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-gtggtcat 49524356  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49524355 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgg 49524326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 344
Target Start/End: Original strand, 28101121 - 28101299
Alignment:
Q  166 tcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacc 265  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| | | ||||| | |||| ||| ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||  | | |||| || |    
T  28101121 tcttcatcttcaagctctatgtataatggtgatgtgagggtgcttgaatattggtgtcccagaatttgtgatgtaaaaaaagccactactatcaaaaatc 28101220  T
Q  266 caggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||||||||  ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||  || ||||||||  |||||||||||||||    
T  28101221 caggaaggtatttctatgtttgccctctgccaaaagtttgtttaaccattattgtgtgatgtcagaatggtttgtttaa 28101299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 11641171 - 11641094
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgtt 418  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||||||    
T  11641171 ttaagatgttgataggagtaatttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgaaaagtctgtgtaatgtt 11641094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 43520772 - 43520639
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaa-tggtca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||       | || ||||| ||||||| ||| ||| |||||     
T  43520772 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtct 43520673  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 147  Q
       ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  43520672 gccttgtagattcggtgttcagaattgatgggtg 43520639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 33264811 - 33264870
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33264811 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaa 33264870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4614918 - 4614840
Alignment:
Q  266 caggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4614918 caggaaggcctttctatgctttccctttgccaaaggtttgtttaaaaagggttatgtgatgtcagaatggtttgtttaa 4614840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27385965 - 27385820
Alignment:
Q  199 gtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaa 298  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||||| | ||||| || | ||||||||| ||| | |||||| |||| | ||||| |||||||||| |  |||||  |||    
T  27385965 gtgagagtacttgaatgttggtgtcccataatttatgctctaagaaaagccaataatgtcaaaaacctaagaaggtctttctatgtttgccctctatcaa 27385866  T
Q  299 aggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  27385865 aggtttgtttaataatggttatgtggtgtcataatggtttgtttaa 27385820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10544495 - 10544363
Alignment:
Q  212 aatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaac 311  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| | | |||| || ||||||||| |||||||||  || | | |||||||  ||| ||||||    
T  10544495 aatgttggtgtcccataatttgtgtggtaagaaaagtcaatactctcaaaaatccaggaaggtctttctatgcttaccatttgccaaatatttatttaac 10544396  T
Q  312 aatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||| |||||   ||| ||||||||||    
T  10544395 aatggttatgagatgtcataatagtttgtttaa 10544363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 319700 - 319759
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  319700 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 319759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 4173401 - 4173342
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4173401 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 4173342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11641706 - 11641647
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11641706 aatttcttcgatgaattgatgacaaagtttttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaa 11641647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 33265671 - 33265612
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  33265671 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 33265612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 320561 - 320511
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaactta 65  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  320561 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaactta 320511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 43507595 - 43507645
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaactta 65  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43507595 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaactta 43507645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 4172540 - 4172599
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4172540 aatttcttccatgaattgatgtaatatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 4172599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 20820363 - 20820422
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20820363 aatttcttccactaattgatgacaaagttcttctccaattcaaaaaacttaaaaacctaa 20820422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 43508314 - 43508255
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  43508314 aatttattccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 43508255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 344
Target Start/End: Original strand, 41760382 - 41760417
Alignment:
Q  309 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41760382 aacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaa 41760417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4520016 - 4519939
Alignment:
Q  167 cttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaa 244  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| | | || | || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4520016 cttcatcttcaagctccaagtttaatggtgatgtcaaagtgcttgaatgttggtgtcctagaatttgtgttgttagaa 4519939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 11641784 - 11641743
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattca 56  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11641784 aatttcttccatggattgatgacaaagttcttccccaattca 11641743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 74
Target Start/End: Original strand, 44793324 - 44793357
Alignment:
Q  41 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44793324 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaa 44793357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 47942447 - 47942414
Alignment:
Q  41 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47942447 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaa 47942414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 530 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 7150305 - 7150221
Alignment:
Q  530 aaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 614  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||| |   ||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||    
T  7150305 aaaataccatcaaataagtcctttaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggcgcatatatgtgtagaacaaagtaaaaa 7150221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26397642 - 26397594
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaact 63  Q
    |||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26397642 aatttcttctgttaattgatgacaatgttcttccccaattccaaaaact 26397594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Original strand, 28100937 - 28100977
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattc 55  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28100937 aatttcttccattaattgatgacaacgttcttccccaattc 28100977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 9351 - 9008
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  9351 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 9252  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9251 gaatgaatcaaacccttatgtcaaaaaaattcaatcaaattagtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 9152  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9151 aaataggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgatccttggtgcatacatctgccgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 9052  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9051 aaagacagacatttgcatactatcataagtcatatatttgatgt 9008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9593 - 9463
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa-nnnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||        | |||||||  ||||||||||| || ||||||    
T  9593 aatttcttccatgaattgatgtcaatgtttttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttgattcaattataaattcaaaaatcagtggtca 9494  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgg 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9493 ttgttaaagattcggtgttcagaaatgatgg 9463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 27692248 - 27691905
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27692248 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgttaaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 27692149  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27692148 gaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatc 27692049  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27692048 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataa 27691949  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27691948 aaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 27691905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 40338723 - 40339065
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  40338723 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtcc-tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 40338821  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40338822 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcgtatcgatcctcaaattagtgaaaatacaatc 40338921  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40338922 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttgttgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 40339021  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40339022 aaagacatacatttgcataccatcataactcatatatttgatgt 40339065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 41041627 - 41041969
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  41041627 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattttgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 41041726  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41041727 gaatgaatcaaacatttctgtccaaaaatt-caatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 41041825  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41041826 aaataggtccttgaattttcacaacagataccattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 41041925  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41041926 aaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatctgatgt 41041969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 362 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 42942855 - 42942533
Alignment:
Q  362 tttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgt 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||    
T  42942855 tttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgt 42942756  T
Q  462 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttca 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42942755 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattattgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 42942656  T
Q  562 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatacc 661  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  42942655 caacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattatcaaaagacagacatttgcatacc 42942556  T
Q  662 atcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  42942555 atcataagtcatatatttgatgt 42942533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 33707852 - 33708195
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  33707852 ttaagatattgatagaagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtctatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 33707951  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33707952 gaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattggtcattgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatc 33708051  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33708052 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgttccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataa 33708151  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33708152 aaagacagacattttcatatcatcataagtcatatatttgatgt 33708195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 341 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 5037518 - 5037231
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  5037518 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 5037419  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5037418 gaatgaatcaaacccttatgtcaaagaaattcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatc 5037319  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagaca 628  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5037318 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagacagaca 5037231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 362 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 22273328 - 22272998
Alignment:
Q  362 tttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatg--------aaaagaggttttcaacgaatgaatcaaac 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  22273328 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaataaatgaatcaaac 22273229  T
Q  454 cgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttg 553  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22273228 ctttctatcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcgtatcgatcatcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttg 22273129  T
Q  554 aattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatt 653  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  || |    
T  22273128 aattttcacaacagatatcattgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaagagacaggcaat 22273029  T
Q  654 tgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273028 tgcataccatcataagtcatatatttgatgt 22272998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 341 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 29238276 - 29237945
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  29238276 ttaagttattgataggagtattttgtttggttgagttatttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 29238177  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29238176 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccgtcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 29238077  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29238076 aaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcatttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataa 29237977  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  29237976 aaagacaaacatttgcattatatcataagtca 29237945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 341 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 15307374 - 15307044
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15307374 ttaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 15307275  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15307274 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaccatc 15307175  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||| || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15307174 aaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcatttgtacatatatttgctgaacaaagt-aaaagtaaaagacaaacactttgattataa 15307076  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  15307075 aaagacaaacatttgcattatatcataagtca 15307044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 341 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 15487743 - 15487413
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15487743 ttaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 15487644  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15487643 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaccatc 15487544  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||| || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15487543 aaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcatttgtacatatatttgctgaacaaagt-aaaagtaaaagacaaacactttgattataa 15487445  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  15487444 aaagacaaacatttgcattatatcataagtca 15487413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 361 - 673
Target Start/End: Original strand, 26239504 - 26239816
Alignment:
Q  361 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatg 460  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| || ||    
T  26239504 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtatcaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctg 26239603  T
Q  461 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttc 560  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  26239604 tcaaaaaatttcaatccaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcattgaattttc 26239703  T
Q  561 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatac 660  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  26239704 acaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctcaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagaaagacatttgcatac 26239803  T
Q  661 catcataagtcat 673  Q
    |||||||||||||    
T  26239804 catcataagtcat 26239816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 341 - 672
Target Start/End: Original strand, 27405185 - 27405515
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  27405185 ttaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaaaaggttgtcaat 27405284  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | ||||    
T  27405285 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatc 27405384  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  27405385 aaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgattataa 27405483  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  27405484 aaagacaaacatttgcattatatcataagtca 27405515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 361 - 684
Target Start/End: Original strand, 7744193 - 7744516
Alignment:
Q  361 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatg 460  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  |||| || ||    
T  7744193 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctgtataatgttgtaatgaaaagaggctgtcaatgaatgaatttaacccttctg 7744292  T
Q  461 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttc 560  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  7744293 tcaaaaaatttcaatcaaattggttcttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaacaccatcaaataagtccttgaattttc 7744392  T
Q  561 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatac 660  Q
    ||| || || ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  7744393 acatcatatttcacttttattcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatac 7744492  T
Q  661 catcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  7744493 catcataagtcatacatttgatgt 7744516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 361 - 673
Target Start/End: Original strand, 41824733 - 41825045
Alignment:
Q  361 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatg 460  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||| || ||    
T  41824733 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagcctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgccaatgaatgaatttaacccttctg 41824832  T
Q  461 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttc 560  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  41824833 tcaaaaaaattcaatcaaattggtcattctattgtatgtctatccatcatattgatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttc 41824932  T
Q  561 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatac 660  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||    
T  41824933 acaacatatatcaccgtgatgcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatatacactgtgattgtaaaaagccagacatttgcatac 41825032  T
Q  661 catcataagtcat 673  Q
    |||||||| ||||    
T  41825033 catcataaatcat 41825045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 497 - 684
Target Start/End: Original strand, 8609005 - 8609192
Alignment:
Q  497 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 596  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8609005 tgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 8609104  T
Q  597 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8609105 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatctatttgatgt 8609192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 497 - 684
Target Start/End: Original strand, 13107571 - 13107758
Alignment:
Q  497 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 596  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13107571 tgcatatccatcatttcgattctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 13107670  T
Q  597 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13107671 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcctaccatcataagtcatatatttgatgt 13107758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 497 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 38548153 - 38547966
Alignment:
Q  497 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 596  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38548153 tgcatatccatcattttgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 38548054  T
Q  597 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38548053 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 38547966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 13485179 - 13485493
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  13485179 ttaagatattgatatgagtattttattcgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtaccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 13485278  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||                    ||||    
T  13485279 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaa----aatcaaattggtccttgaattatgtacatatccatcatatcgat--------------------catc 13485354  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  13485355 aaataggtccttcaattttcacaacagatatcactgtgatccttgaggcatacatttgctg----aagtaaaaagtagaagacaaacactttgattataa 13485450  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13485451 aaa-acagacatttgcataccatcataaatcatatatttgatgt 13485493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 416 - 684
Target Start/End: Original strand, 9672292 - 9672562
Alignment:
Q  416 gttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcga 515  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||| ||||||    
T  9672292 gttgtaatgaaaagatgttgtcaatgaatgaatccaacccttctgtcgaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcgtatcga 9672391  T
Q  516 tcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaag 615  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9672392 tccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaactaaaaag 9672491  T
Q  616 taaaagacagacactttgactataaaaagacaaacat---ttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||   ||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  9672492 taaaagacagacactttgattgtaaaaagacagacatttgttgcatatcatcataaat-atatatttgatgt 9672562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 341
Target Start/End: Original strand, 41824334 - 41824676
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  41824334 aatttcttccatgaattgatgtcaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatgagtggtcat 41824433  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatgaac-----------------tacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    | ||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| |                 |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  41824434 tattgaagatttgatgttcataaatgatgggtggtgagcatatgggcaaaaacagctacagcagtcggtcttcatcttcaagctctatctacaatgatga 41824533  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||    
T  41824534 tgtgagagagtttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgttgtaagaaaagt-aacactgtcaataacccaggaaggcctttctatatctgccctctgcca 41824632  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtt 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41824633 aaggtttgtataacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtt 41824676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 341
Target Start/End: Original strand, 26239102 - 26239447
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggt--tcaattcaaaattcaaaaaccaatggtc 112  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||         |  ||||||||||||| |||||  | |||||    
T  26239102 aatttcttccatgaattgacgccaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttttattcaattcaaaattaaaaaattagtggtc 26239201  T
Q  113 attgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgat 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||                 | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26239202 attgttgaagatttggtgttcagaaatgatgggtggtgggcgtatgggcaaaaacagctacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgat 26239301  T
Q  196 aaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgc 295  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| |  ||||| |    
T  26239302 gatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgtagtaagaaaagccaacactgtcaataacacagaaaggcatttctatgtctgccctctac 26239401  T
Q  296 caaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtt 341  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26239402 caaatgtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtt 26239447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 497 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 13283317 - 13283135
Alignment:
Q  497 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 596  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13283317 tgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatacgatcaaataggtccttgaattttcaca-----tatcactgtgatccttggtgcatacatt 13283223  T
Q  597 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13283222 tgctcaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 13283135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22273595 - 22273347
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       | |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  22273595 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaagaaacttaaaatcctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 22273496  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22273495 tgttgaagattcggtgttcagaaatggtgggtggtgggcggatgggcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatga 22273396  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaa 246  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22273395 ggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaa 22273347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 482 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 35510357 - 35510167
Alignment:
Q  482 ggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 581  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||    
T  35510357 ggtccttaaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtggtc 35510258  T
Q  582 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  35510257 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 35510167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 482 - 672
Target Start/End: Original strand, 33761642 - 33761832
Alignment:
Q  482 ggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 581  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  33761642 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtcattgaattatcataacagatatcaatgtgatc 33761741  T
Q  582 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||||||    
T  33761742 ctttgtgcatacatttgctaaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaggacaaacatttgcattatatcataagtca 33761832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 483 - 672
Target Start/End: Original strand, 600809 - 600998
Alignment:
Q  483 gtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 582  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||||    
T  600809 gtccttgaattatattcatatccgtcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcc 600908  T
Q  583 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  600909 tttgtgcatacatttgctgaataaagtaaaaagtaaaagagaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 600998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Original strand, 41041106 - 41041368
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||         |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  41041106 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaataacttaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 41041205  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  41041206 tgttgaagattcgttgttcagaaatgacgggtggtgggcgtatgggcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctttatgtacaatgatga 41041305  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 260  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41041306 ggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 41041368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 341 - 623
Target Start/End: Original strand, 3152573 - 3152863
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaat--------gaaaagagg 432  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| |||||   ||||||||||||||        ||||||| |    
T  3152573 ttaaaatattgataggagtaatttgtttgattaagtcgtttaaaatgttattttattgtgtcaagtgtgtgtaatgttgtaatgttataatgaaaagaag 3152672  T
Q  433 ttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaa 532  Q
    || |||| ||||||||  |||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||  ||||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  3152673 ttgtcaatgaatgaattcaacccttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggttcttctattgtatgtctatccatcacattcatccccaaattagtgaaa 3152772  T
Q  533 ataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagac 623  Q
     ||||||| |||  || ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3152773 ttaccatcaaatcagttcttgaattttcacaacataaatcaatgtgatccttggtgcatacatctactgaacaaagtaaaaagtaaaagac 3152863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13283536 - 13283343
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   |    
T  13283536 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacaacaa 13283437  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  13283436 acactgtcaataacccaggaaggtctttctatgtttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 13283343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15307792 - 15307599
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |    
T  15307792 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttatgttgtaagaagagcaa 15307693  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  15307692 acactgtcaataacccaggaaggcttttctatgtttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 15307599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15488161 - 15487968
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |    
T  15488161 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttatgttgtaagaagagcaa 15488062  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  15488061 acactgtcaataacccaggaaggcttttctatgtttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 15487968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Original strand, 27404768 - 27404961
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  27404768 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaa 27404867  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  27404868 acactgtcaataacccaggaaggcttttctatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 27404961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Original strand, 8608632 - 8608979
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaa-tggtca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||       | || ||||| ||||||| ||| ||| |||||     
T  8608632 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtct 8608731  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgata 196  Q
       ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||                 ||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  8608732 gcattgtagattcggtgttcagaattgatgggtggtgcgcgaatgggcaaaaacaactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatg 8608831  T
Q  197 aagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcc 296  Q
    | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||     
T  8608832 atgtgagagagcttcagcgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacaacaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctctgca 8608931  T
Q  297 aaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  8608932 taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 8608979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Original strand, 13107198 - 13107545
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaa-tggtca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| |       | || ||||| ||||||| ||| ||| |||||     
T  13107198 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctgatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtct 13107297  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgata 196  Q
       ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||                 ||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  13107298 gccttgtagattcggtgttcagaattgatgggtggtgtgcgaatgggcaaaaacaactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatg 13107397  T
Q  197 aagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcc 296  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  | | |||     
T  13107398 atgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccttttgca 13107497  T
Q  297 aaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  13107498 taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 13107545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Original strand, 40338207 - 40338456
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||       | || ||||| |||||||||||      |||||    
T  40338207 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaatttaaaaccctaatttttttgatttaattcgaaattcaaaaa------gtcat 40338300  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgag 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||           ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||    
T  40338301 tgttgaagatttggtgttcagaa-tgatgggtggtgggcgtatggacaactacaacagtcagtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatgagctgag 40338399  T
Q  204 agagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 260  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40338400 agagtttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 40338456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 38548372 - 38548179
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  38548372 aactacaacaactggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaatagcaa 38548273  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||  |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  38548272 acactgtcaataatccaggaagacctttctatgcttgccctctacataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 38548179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42943121 - 42942874
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||         |||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  42943121 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttctccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcgt 42943022  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgg--gtg-----atg---------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaa 198  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||     |||         |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |     
T  42943021 tgttaaagattcagtgttcaaaaatgatggtggtgggcgtatgtgcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaataatgag 42942922  T
Q  199 gtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  42942921 gtgagagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaagaaaa 42942874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29238694 - 29238501
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||  |    
T  29238694 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatatgtgttgcaagaagagcaa 29238595  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| | | | |||||||||||||| ||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  29238594 acactcttagtaacccaggaaggcttttctatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 29238501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Original strand, 7743998 - 7744136
Alignment:
Q  203 gagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggt 302  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  7743998 gagagcttcattgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaaaagccaacattttcaataacccatgaatgtctttctatgtctgccctctgccaaatgt 7744097  T
Q  303 ttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtt 341  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  7744098 ttgtttaacaatgattatgtgatgtgtgaatgatttgtt 7744136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5037759 - 5037627
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||         |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  5037759 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttcctcaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 5037660  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 147  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5037659 tgttaaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 5037627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 345
Target Start/End: Original strand, 11719983 - 11720168
Alignment:
Q  160 agtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtca 259  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||   |||| | | |||||||  ||| ||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| | | |    
T  11719983 agtctgtcttcatcttcaagctctatgcttaatggtgatgtgagagtacttgaatgttggtgtcccataatttgtgctgtaagaaaagccaacactttaa 11720082  T
Q  260 ataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaag 345  Q
    | ||||| ||||||  ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11720083 aaaacccgggaaggtttttctatgtctgccctctgccaaagttttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaag 11720168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Original strand, 13484904 - 13485040
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa----nnnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatgg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||             |||||||  ||||||||||| || |||    
T  13484904 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttttttaattcaatttgaaattcaaaaatcagtgg 13485003  T
Q  111 tcattgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13485004 tcattgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 13485040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 352 - 619
Target Start/End: Original strand, 11720429 - 11720697
Alignment:
Q  352 ataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaa 451  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| || |||||||||| || ||  |||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||  |    
T  11720429 ataggagtaatttgtttgtttaagttgtttaacatgctactgtattgtgctaattctgtgtaatattgtaatgaaaagaggttgaaaatgaatgaatgca 11720528  T
Q  452 accgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtg-aaaataccatcgaataggtcc 550  Q
    ||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| | ||  |||  |||| |||||| |  | ||||||| |||||| |||| |||| ||||    
T  11720529 accattttgtcaaaatctttccatcaaattggtccttaaattgtttgtctatatatcaaatcgattcctacattagtgaaaaatatcatcaaataagtcc 11720628  T
Q  551 ttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 619  Q
    ||||| |||   || | ||  || |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  11720629 ttgaagtttttaaaaatatgacaatgtgatccttggtgcatatatgtgttgaacaaagtaaaaagtaaa 11720697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 70
Target Start/End: Original strand, 3152358 - 3152413
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatc 70  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3152358 aatttcttccatgaattgatgccaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaatc 3152413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27692500 - 27692367
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaa-tggtca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||       | || ||||| ||||||| ||| ||| |||||     
T  27692500 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtct 27692401  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 147  Q
       ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27692400 gccttgtagattcggtgttcagaattgatgggtg 27692367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Original strand, 33707600 - 33707733
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaa-tggtca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||       | || ||||| ||||||| ||| ||| |||||     
T  33707600 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtct 33707699  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 147  Q
       ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33707700 gccttgtagattcggtgttcagaattgatgggtg 33707733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29694022 - 29693894
Alignment:
Q  16 atttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcatt 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||       | ||||||||||||| |||||| || | || |||    
T  29694022 atttcttccatgaattgatgacaaagttcttctccaatttaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcaaaatccaaaaatcattagttatt 29693923  T
Q  116 gttgaagattcggtgttcagaaatgatgg 144  Q
     || ||| ||  |||||||||||||||||    
T  29693922 attcaagctttcgtgttcagaaatgatgg 29693894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 283
Target Start/End: Original strand, 25705685 - 25705754
Alignment:
Q  214 tgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatg 283  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25705685 tgttggtgtcctagattttgtgttgtaagaaaagccaatactgtgaaaaacccaggaaggcctttctatg 25705754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 25370912 - 25371008
Alignment:
Q  214 tgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaa 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||| ||||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||| |||||    
T  25370912 tgttggtgttctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaatacagtgaaaaactcaggaaggcctttctatgcttgccctatgccaaaggtttttttaa 25371008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 38548523 - 38548467
Alignment:
Q  18 ttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  38548523 ttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 38548467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 15562781 - 15562840
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15562781 aatttcttccattaattgatgacacagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaacctaa 15562840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 33761497 - 33761556
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  33761497 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 33761556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 33762378 - 33762319
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  33762378 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 33762319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 35509642 - 35509701
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35509642 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 35509701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 11719820 - 11719869
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaactt 64  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11719820 aatttcttccattaattgatgacaacgttcttccccaattcaaaaaactt 11719869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 640 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 5037242 - 5037198
Alignment:
Q  640 aaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5037242 aaaagacagacatttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 5037198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 13283690 - 13283631
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||| || |||||    
T  13283690 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccgcagttcaaaaaacttagaaccctaa 13283631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 202
Target Start/End: Original strand, 13485061 - 13485112
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtga 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  13485061 aactacaacagtcagtcttcatcttcaagctctacgtacaatgataaggtga 13485112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 29238848 - 29238789
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  29238848 aatttcttccatgaattcatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 29238789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29693870 - 29693813
Alignment:
Q  153 ctacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagctt 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||| ||||    
T  29693870 ctacaacagtcagtcttcatcttcaagctctatgtacaatggtgatgtgagagtgctt 29693813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Original strand, 17807389 - 17807445
Alignment:
Q  18 ttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17807389 ttcttccattaattgatgacaacattcttccccaattcaaaaaacttcaaaacctaa 17807445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25371634 - 25371582
Alignment:
Q  199 gtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaa 251  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25371634 gtgagagtgcttgaatattggtgtcctagaatttgtgttgtaagataagtcaa 25371582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 15684118 - 15684177
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  15684118 aatttcttccattaattgatgacaacgttcttccccaattctaaaaatttcaaaacctaa 15684177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 344
Target Start/End: Original strand, 41041367 - 41041402
Alignment:
Q  309 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41041367 aacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaa 41041402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 24285834 - 24285717
Alignment:
Q  362 tttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgt 461  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| | | ||   |||| |||||||||||||||| |||    | ||||||||  |||| ||||||    
T  24285834 tttgcttgtttgagttgtttaacatgctattgtattgtactaggtatgtgtattgttgtaatgaaaagatgttgaagatgaatgaatgcaacctttatgt 24285735  T
Q  462 caaaaaatttcaatcaaa 479  Q
    ||||| ||||| ||||||    
T  24285734 caaaatatttccatcaaa 24285717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 239
Target Start/End: Original strand, 33369337 - 33369377
Alignment:
Q  199 gtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgt 239  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33369337 gtgagagcgcttgaatgttggtgtcctagaatttgtgttgt 33369377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 16764047 - 16763704
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  16764047 ttaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 16763948  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16763947 gaatgaatcaaacctttatgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 16763848  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16763847 aaataggtcattgaatttacacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacagagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataa 16763748  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16763747 aaagacacacatttgcatactatcataagtcatatatttgatgt 16763704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 19907322 - 19907664
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19907322 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttatcaat 19907420  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  19907421 gaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaatgagtgaaaataccatg 19907520  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19907521 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataa 19907620  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19907621 aaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttgatgt 19907664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 14388136 - 14388487
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgta--------atgttgtaatgaaaagagg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||    
T  14388136 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagagg 14388235  T
Q  433 ttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaa 532  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388236 ttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgtaaaaaaacttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaa 14388335  T
Q  533 ataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacttt 632  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14388336 atactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacacttt 14388435  T
Q  633 gactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388436 gattataaaaaaacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 14388487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 6798607 - 6798264
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  6798607 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 6798508  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6798507 gaatgagtcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattgtatacatattcatcaaatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 6798408  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6798407 aaatatgtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgatgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 6798308  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6798307 aaagacagacatttgcatatcatcataagttatatatttgatgt 6798264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 341 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 2768015 - 2767683
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  2768015 ttaagatattgataggagtattttgtttgattaagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaaacccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 2767916  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2767915 gaatgaataaaacctttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaatttagtgaaaataccatc 2767816  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  2767815 aaattggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgatccttggtgcatacattttctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaactctttgattataa 2767716  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcat 673  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2767715 aaagacagacatttgcataccatcataagtcat 2767683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 17697308 - 17696965
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17697308 ttaagatattgatatgagtattttgtttgattgaattgtttaaaatgctattgtattatgccaagtccatgtaatgttgttatgaaaagaggttgtcaac 17697209  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17697208 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaactggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctaaaattggtgaaaataccatc 17697109  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17697108 aaataggtccttgaattttcacaacatacatcactatgatccttggtggatacatttgttgaacaaagtaaaaagtagaagacagacactttgattataa 17697009  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17697008 aaagacagatatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 17696965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 39456260 - 39455918
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  39456260 ttaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 39456161  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  39456160 gaatgaatcaaacccttttgtcaaaaaaattcaatcaaattggtcattgaattatatgcatattcatcatattgattctcaaatgagtgaaaatatcatc 39456061  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  39456060 aaataggtccttaaattttcacaacagatatcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaga-actttgattataa 39455962  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39455961 aaagacagacatttgtataccatcataagtcatatacttgatgt 39455918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 362 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 40561305 - 40560978
Alignment:
Q  362 tttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgt 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||    
T  40561305 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagatgttgtcaatgaatgaatcaaacctttttgt 40561206  T
Q  462 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttca 561  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40561205 taaaaaatttcaattaaattggtccttaaattatatgcacatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 40561106  T
Q  562 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatacc 661  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  40561105 caacagatatcaatgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagccatacactttgattataaaaagacagacatttgcatatc 40561006  T
Q  662 atcataagtcatatatttgatgtccatc 689  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40561005 atcataaatcatatatttgatgttcatc 40560978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 341 - 672
Target Start/End: Original strand, 6784330 - 6784662
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  6784330 ttaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 6784429  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagt-gaaaataccat 539  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||  |||| | |||    
T  6784430 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatctttaaattagtaaaaaaaaacat 6784529  T
Q  540 cgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactata 639  Q
    | ||| |||||||||||| ||| |||||| |||| |  ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6784530 caaattggtccttgaattatcataacagaaatcaattggatcctttggacatacatttgctgaacaaagtcaaaagtaaaagacaaacactttgattata 6784629  T
Q  640 aaaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  6784630 aaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 6784662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 341 - 672
Target Start/End: Original strand, 24206573 - 24206914
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgta--------atgttgtaatgaaaagagg 432  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||        |||||||||||||||||||    
T  24206573 ttaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgttctaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagagg 24206672  T
Q  433 ttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagt--ga 530  Q
    || |||| |||||||||||||| || |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||   |    
T  24206673 ttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaa 24206772  T
Q  531 aaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacact 630  Q
    ||| | |||| ||| |||||||||||| | | |||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  24206773 aaaaatcatcaaattggtccttgaattattataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacaat 24206872  T
Q  631 ttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  24206873 ttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 24206914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Original strand, 39663537 - 39663882
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||          |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39663537 aatttcttacatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctatttttttta-ttcaattcgaaattcaaaaaccagtggtcat 39663635  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||                 ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  39663636 tgttgaaaattcggtgctcagaaatgatgagtggtgggcgtatgggcaaaaacaactacaacagtcagtcttcatcttcaagctctatgtacaacgatga 39663735  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  39663736 ggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacaccgtcaataatctaggaaggcctttctatgtctgccctctgcca 39663835  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39663836 aaagtttgtttaacaatggttatgtgatgtgcgaatggtttgtttaa 39663882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 512 - 684
Target Start/End: Original strand, 39663994 - 39664166
Alignment:
Q  512 tcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39663994 tcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 39664093  T
Q  612 aaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39664094 aaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatctgcataccatcataaatcatatatttgatgt 39664166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 341 - 510
Target Start/End: Original strand, 34401225 - 34401394
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  34401225 ttaagatattgataggattattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgcattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 34401324  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcat 510  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34401325 gaatgaatcaaacctttttgttaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcat 34401394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 341 - 493
Target Start/End: Original strand, 44708864 - 44709015
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  44708864 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgcgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 44708963  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaatt 493  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44708964 gaatgaatcaaacccttatgt-aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaatt 44709015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 341
Target Start/End: Original strand, 19581735 - 19581904
Alignment:
Q  172 tcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaa 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19581735 tcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggcgtcctagaatttgtattgtaagaaaagccaacactgtcaataacccaggaa 19581834  T
Q  272 ggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtt 341  Q
    | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19581835 gacctttctatgtcttccctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgcgatgtgtgaatggtttgtt 19581904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 546 - 684
Target Start/End: Original strand, 44709004 - 44709142
Alignment:
Q  546 ggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaaga 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||      
T  44709004 ggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtcaaagacagacactttgattataaaaatg 44709103  T
Q  646 caaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44709104 cagacatttgcataccatcataagacatatatttgatgt 44709142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 42517953 - 42518213
Alignment:
Q  17 tttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcattg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  42517953 tttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattg 42518052  T
Q  117 ttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaag 199  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||                 ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  42518053 ttgaagatttggtgttcaaaaatgatgggtggtgggcatatgggcaaaaacaactacaacagtcggccttcatcttcaagctctatgtacaatgatgagg 42518152  T
Q  200 tgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 260  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  42518153 tgagagagctttaatgttggtgtcctaaaatttttgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 42518213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Original strand, 34400702 - 34400966
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnngg-ttcaattcaaaattcaaaaac-caatggtc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       || |||||||| ||||| |||||  || |||||    
T  34400702 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttggattcaattcgaaattaaaaaaatcagtggtc 34400801  T
Q  113 attgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatga-----------------actacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgat 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||                 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34400802 attgttgaagattcagtgttcagaaatgatgggtggtgagcgtataggcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgat 34400901  T
Q  196 aaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 260  Q
     | |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  34400902 gaggtgagagagcttcaatgttggtgtcttagaattcgtgttttaagaaaagccaacactgtcaa 34400966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Original strand, 6783912 - 6784105
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  6783912 aactacaacaacaggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaa 6784011  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  6784012 acactgtcaataactcaggaaggcttttctatgtttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 6784105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6799128 - 6798873
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||       | |||||||| ||||||||||| || || ||||    
T  6799128 aatttgttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccttaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtgatcat 6799029  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||                 || |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |    
T  6799028 tgttgaagattcagtgttcagaaatgatgggtggtgggcgtatgggcaaaaacaattacaacagtcggtcttcatctttaagctctgtgtacaatgatga 6798929  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaaca 253  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6798928 ggtgagagagcttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgttgtaagaaaagacaaca 6798873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 151 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 37021687 - 37021511
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  37021687 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgggagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaa 37021588  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgt 327  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37021587 acactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgt 37021511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Original strand, 24206157 - 24206348
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  24206157 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttg--gtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaa 24206254  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| |||||||   |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  24206255 acactgtcaataactcaggaaggcttttctatacttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttatttaa 24206348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2768518 - 2768281
Alignment:
Q  33 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcattgttgaagattcggtgtt 132  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||       | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  2768518 atgtcaatgttcttccccaatttaaataatttaaagccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcagtgtt 2768419  T
Q  133 cagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatg 215  Q
    ||||||||||| ||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2768418 cagaaatgatgagtggtggacgtatgggcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatg 2768319  T
Q  216 ttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaaca 253  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2768318 ttggtgtcctagaatttgtgttgtaaaaaaagccaaca 2768281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 39456501 - 39456369
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |       | |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  39456501 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctgatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 39456402  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 147  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39456401 tgttgaagattcgatgttcagaaatgatgggtg 39456369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 151 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17697676 - 17697567
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17697676 aactacaacagtcgatcttcatcttcaagctctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtcagaaaagcca 17697577  T
Q  251 acattgtcaa 260  Q
    ||| ||||||    
T  17697576 acactgtcaa 17697567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 249 - 344
Target Start/End: Original strand, 44708544 - 44708639
Alignment:
Q  249 caacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44708544 caacattgtcaataatccaggaaggcatttctatgtctaccctctgtcaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 44708639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 590 - 684
Target Start/End: Original strand, 42518524 - 42518618
Alignment:
Q  590 atacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42518524 atacatttgctgaacaaagtaaaaaataaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 42518618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Original strand, 19907110 - 19907239
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa-nnnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtca 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||        | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19907110 aatttcttacatgaattgatgtcaatgttcttcaccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttgattcaattcgaaattcaaaaaccagtggtca 19907209  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatg 143  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19907210 ttgttgaatattcggtgttcagaaatgatg 19907239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 463 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 37021508 - 37021388
Alignment:
Q  463 aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcac 562  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| |||     
T  37021508 aaaaaaattcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcattttgatcctcaaattaatgaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcat 37021409  T
Q  563 aacagatatcactgtgatcct 583  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  37021408 aacagatatcaatgtgatcct 37021388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 151 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40561419 - 40561312
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  40561419 aactacaacaatcggtattcatcttcgagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaagaaaaacca 40561320  T
Q  251 acattgtc 258  Q
    ||||||||    
T  40561319 acattgtc 40561312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 439
Target Start/End: Original strand, 19581960 - 19582038
Alignment:
Q  361 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaa 439  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19581960 ttttgtttgattgaattgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtctctgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaa 19582038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31471097 - 31471007
Alignment:
Q  243 aaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaat 333  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31471097 aaaagccaacactatcaataacacaggaatgcctttctatgtctgccctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtttgaat 31471007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 341 - 396
Target Start/End: Original strand, 42518470 - 42518525
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42518470 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtat 42518525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31474778 - 31474647
Alignment:
Q  16 atttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcatt 115  Q
    ||||||||||||||||  || ||| | |||| ||||||||||||||| ||||| |||||       |||||||||| |||| |||||| || |||| |||    
T  31474778 atttcttccatgaattagtgacaaagatctttcccaattcaaaaaacctaaaaccctaatttttttggttcaattcgaaatccaaaaatcagtggttatt 31474679  T
Q  116 gttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 147  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  31474678 gttcaagctttggtgttcagaaatgatgggtg 31474647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16764273 - 16764214
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16764273 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 16764214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 14387777 - 14387836
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14387777 aatttcttccaataattgatgtcaattttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 14387836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 40561573 - 40561514
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40561573 aatttcttccataaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 40561514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 37646283 - 37646238
Alignment:
Q  575 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 620  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37646283 tgtgatctttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 37646238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 195
Target Start/End: Original strand, 19907264 - 19907308
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgat 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19907264 aacttcaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgat 19907308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 2577142 - 2577083
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2577142 aatttcttccataaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 2577083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17697760 - 17697697
Alignment:
Q  84 ttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcattgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 147  Q
    |||||||  |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17697760 ttcaatttgaaattcaaaaattagtggtcattgttcaagattcggtgttcataaatgatgggtg 17697697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 161767 - 161722
Alignment:
Q  29 attgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  161767 attgatgacaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaacctaa 161722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 20941772 - 20941639
Alignment:
Q  362 tttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgt 461  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||   ||||| |||||||||||||||||||    | ||||||||  |||| || |||    
T  20941772 tttgcttgtttgagttgtttaacatgttactgtattgtgctaggtgtgtgtaacgttgtaatgaaaagaggttgaagatgaatgaatgcaacctttctgt 20941673  T
Q  462 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattat 495  Q
    | ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  20941672 cgaaatatttccatcaaattagtcctttaattat 20941639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 530 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 161300 - 161216
Alignment:
Q  530 aaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 614  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |   ||||||| |||  ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  161300 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacagatgtcaacgtgatccttggtgcatatatgtgcataacaaagtaaaaa 161216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2768275 - 2768240
Alignment:
Q  309 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2768275 aacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaa 2768240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17697568 - 17697533
Alignment:
Q  309 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17697568 aacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaa 17697533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 26581370 - 26581429
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26581370 aatttcttccattaattgatgacaacgctgttccccaattcaaaaaacttcaaaacctaa 26581429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15373588 - 15373555
Alignment:
Q  41 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15373588 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaa 15373555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 7372025 - 7372367
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  7372025 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatggtattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 7372124  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372125 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatatcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 7372224  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7372225 aaataggtccttgaattttcacaatcga-atcactgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 7372323  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372324 aaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 7372367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 345 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 20524465 - 20524126
Alignment:
Q  345 gatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaat 444  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20524465 gatattgatatgagtattttgttttattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaat 20524366  T
Q  445 gaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaat 544  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20524365 gaatcaaacctttatgtaaaaaaaattcaatcaaattggtccttgaattatatatgtatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaat 20524266  T
Q  545 aggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaag 644  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20524265 aggtccttgaattttcacaacagatatcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaag 20524166  T
Q  645 acaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524165 acagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 20524126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 32438122 - 32438465
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  32438122 ttaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgctattgcattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagagattgtcaat 32438221  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32438222 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcatattggtcctttaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 32438321  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32438322 aaataggtccttgaattttcacaatagatatcactatgatccttggtccatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 32438421  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32438422 aaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 32438465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 341 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 18644363 - 18644031
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatg--------aaaagagg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||        |||||||     
T  18644363 ttaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtctgtgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaga 18644264  T
Q  433 ttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaa 532  Q
    || |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  18644263 ttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccattatttcgatcatcaaattagtgaaa 18644164  T
Q  533 ataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacttt 632  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644163 ataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacttt 18644064  T
Q  633 gactataaaaagacaaacatttgcataccatca 665  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18644063 gattataaaaagacacacatttgcataccatca 18644031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 341 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 32517953 - 32517661
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  32517953 ttaagatattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 32517854  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32517853 gactgaaccaaacccttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcataccgatcctcaaattagtgaaaataccatc 32517754  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 633  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32517753 aaatagttccttgaattttcacaacagacatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 32517661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 361 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 7050821 - 7050498
Alignment:
Q  361 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||  |||| || ||    
T  7050821 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatggatgaatttaacccttttg 7050722  T
Q  461 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttc 560  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  7050721 tcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcattgaattttc 7050622  T
Q  561 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatac 660  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  7050621 acaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatac 7050522  T
Q  661 catcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7050521 catcataagtcatatatttgatgt 7050498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 345 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 11356286 - 11355948
Alignment:
Q  345 gatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatg--------aaaagaggtttt 436  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||  |    
T  11356286 gatattgatagaagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattctattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggtggt 11356187  T
Q  437 caacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatac 536  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||    
T  11356186 caatgaatgaatcaaacccttatgtcaaaaagtttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatc---------gatcctcaaattagtaaaaatac 11356096  T
Q  537 catcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgact 636  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  11356095 catcaaacaggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgatt 11355996  T
Q  637 ataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11355995 ataaaaagacagacatttgcataccatcattagtcatatatttgatgt 11355948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 361 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 10569462 - 10569141
Alignment:
Q  361 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| || |     
T  10569462 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttcta 10569363  T
Q  461 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttc 560  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||     
T  10569362 tcaaaaaatttcaatcaaattgatccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaatttt- 10569264  T
Q  561 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatac 660  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||     
T  10569263 -caacatatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaaaacagacactttgattgtaaaaagatagacatttgcatat 10569165  T
Q  661 catcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10569164 catcataagtcatatatttgatgt 10569141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11356848 - 11356502
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||       | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11356848 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaatttaagaccctaatttttttgattcaattcaaaattcaaaaaccagtggtcat 11356749  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||                 |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  11356748 tgttgaagattcggtgttcagaaatgaagggcggtgggcgtatgggcaaaaacaactacaacagtcggtgttcatcttcaagctctatgtacaatgatga 11356649  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  11356648 ggtgagagagcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactatcaataacccaagaaagcctttctatgtctgccctctgcca 11356549  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11356548 aaggtttgtttaacaaaggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 11356502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6902612 - 6902269
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||         |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  6902612 aatttcttccatgaattgatgccaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattaaaaaatcagtggtcat 6902513  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  6902512 tgttgaagatttggtgttcataaatgatgggtggtgggcgtatgggcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatga 6902413  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  6902412 tgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgtagtaagaaaagccaacactgtcaataacccaggaaggtctttctatgtctgccctctgcca 6902313  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtt 341  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6902312 aatgtttgtttaacattggttatgtgatgtgtgaatggtttgtt 6902269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 33267431 - 33267765
Alignment:
Q  29 attgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcattgttgaagattcgg 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||       | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  33267431 attgatgtcaaagttcttccccaatt---aaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcaatggtcattgttgaagatttgg 33267527  T
Q  129 tgttcagaaatgatgggtgatg------------------aactacaacagtcggtcttcatctt----caagctccatgtacaatgataaagtgagaga 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||                  | ||||||||||||||||| |||||    ||||||| |||| ||||||| | ||||||||    
T  33267528 tgttcagaaatgatgggtggtgggcgtatgggcaaaaaccagctacaacagtcggtcttaatctttcttcaagctctatgtgcaatgatgatgtgagaga 33267627  T
Q  207 gcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgt 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |   || || |||||||||||    
T  33267628 gcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacctaggaaggtctttttatgcttgctctatgtcaaaggtttgt 33267727  T
Q  307 ttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33267728 ttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 33267765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20525030 - 20524768
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  20525030 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 20524931  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  20524930 tgttgaagattcagtgttcagaaatgatgggtggtgggtgtatgggcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatga 20524831  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 260  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20524830 ggttagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaaggcaacactgtcaa 20524768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 84 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9399702 - 9399425
Alignment:
Q  84 ttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcattgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggt 166  Q
    |||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||                 |||||||  |||||||    
T  9399702 ttcaatttgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagatttggtgttcagaaatgatgggtggtggacgtatgggaaaaaacaactacagtagtcggt 9399603  T
Q  167 cttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataaccc 266  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||    
T  9399602 cttcatcttcaagctctctgttcaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgccaataatcc 9399503  T
Q  267 aggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9399502 aggaaggcctttctatgcttgccctttgccaaagatttgtttaacaatggttatgtaatgtgtgaatggtttgtttaa 9399425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Original strand, 32437555 - 32437899
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaa-tggtca 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||       | || ||||| ||||||| ||| ||| |||||     
T  32437555 aatttctttcatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtct 32437654  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg-----atg---------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaag 199  Q
       ||| ||||||||||||||||| |||||||||     |||         ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  32437655 gccttgtagattcggtgttcagaattgatgggtgcgcgaatgggcaaaaacaactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatg 32437754  T
Q  200 tgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaa 299  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||  ||    
T  32437755 tgagaaagcttcaatgttgttgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctctgcataa 32437854  T
Q  300 ggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  32437855 ggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 32437899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 361 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 6902212 - 6901999
Alignment:
Q  361 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatg 460  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| || ||    
T  6902212 ttttgtgtgattgagttgtttaaaaagttattgtattgtgtcaagtctgcgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctg 6902113  T
Q  461 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttc 560  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  6902112 tcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcaatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttc 6902013  T
Q  561 acaacagatatcac 574  Q
    |||||| |||||||    
T  6902012 acaacatatatcac 6901999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 341 - 583
Target Start/End: Original strand, 33267919 - 33268155
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtc-catgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaa 439  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33267919 ttaagatattgataggagtaatttgtttgaatgagctgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaa 33268018  T
Q  440 cgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccat 539  Q
     ||||||||  |||| || | |||||||||||||||  |||||||||        ||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  33268019 tgaatgaattcaacccttctctcaaaaaatttcaattgaattggtcc-------gtatgtctatccatcatatcgatccctaaattattgaaaataccat 33268111  T
Q  540 cgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 583  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33268112 caaataagtccttgaattttcacaacatatatcaatgtgatcct 33268155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 172 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7051047 - 7050878
Alignment:
Q  172 tcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaa 271  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  7051047 tcttcaagctctatgtaaaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaatagcccaggaa 7050948  T
Q  272 ggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtt 341  Q
    ||||||||||||| |   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7050947 ggcctttctatgtctgctctttgccataggtttgtttaacaatggttatgcgatgtgtgaatggtttgtt 7050878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 172 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10569687 - 10569519
Alignment:
Q  172 tcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaa 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  10569687 tcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagcgagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactatcaataacccaggaa 10569588  T
Q  272 ggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtt 341  Q
     ||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10569587 agcc-ttctatgtctgccatctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgcgatgtgtgaatggtttgtt 10569519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 151 - 327
Target Start/End: Original strand, 32454836 - 32455012
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  32454836 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaa 32454935  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgt 327  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32454936 acaccgtcaataacccaggaagacctttttatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgt 32455012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 568 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 6900341 - 6900225
Alignment:
Q  568 atatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcata 667  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  6900341 atatcactgtgatccttggttcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaggacagacatttgcataccattata 6900242  T
Q  668 agtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| |||||||||    
T  6900241 agtcatacatttgatgt 6900225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Original strand, 7371526 - 7371767
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||                     |||||||| || |||||||    
T  7371526 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaa---------------------ttcaaaaatcagtggtcat 7371604  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |                  | |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  7371605 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtggtaggcgtgtgggcaaaaatacctacaatagtcggttttcatcttcaagctatatgtacaatgatga 7371704  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 260  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7371705 ggtgagagagcttcaatgctggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 7371767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Original strand, 33277174 - 33277309
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||  ||||||||||| || |||||||    
T  33277174 aatttcttccatgaattgatattaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaatttgaaattcaaaaatcagtggtcat 33277273  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg 150  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33277274 tgttgaagatttggtgttcataaatgatgggtgatg 33277309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32518175 - 32518062
Alignment:
Q  33 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcattgttgaagattcggtgtt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||       | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  32518175 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaattgttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcggtgtt 32518077  T
Q  133 cagaaatgatgggtg 147  Q
    || ||||||||||||    
T  32518076 cataaatgatgggtg 32518062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 463 - 573
Target Start/End: Original strand, 32455015 - 32455125
Alignment:
Q  463 aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcac 562  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||     
T  32455015 aaaaaaattcaattacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcat 32455114  T
Q  563 aacagatatca 573  Q
    |||||| ||||    
T  32455115 aacagagatca 32455125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18644721 - 18644650
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgt 222  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  18644721 aactacaacaattggtattcatcttcaagctccatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgatgatgt 18644650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 9399200 - 9399135
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagt 406  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  9399200 ttaagatattgataggagtgatttgtttgtttgagttgtttagaatgttattttattgtgccaagt 9399135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Original strand, 13611074 - 13611207
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaa-tggtca 113  Q
    |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||       | || ||||| ||||||| ||| ||| |||||     
T  13611074 aatttcctccatgaatttatgtcgaagttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtct 13611173  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 147  Q
       ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13611174 gccttgtagattcggtgttcagaattgatgggtg 13611207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 14338045 - 14338104
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  14338045 aatttcttccattaattgatgacaaagttcatccccatttctaaaaacttaaaaacctaa 14338104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17935956 - 17935909
Alignment:
Q  297 aaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||    
T  17935956 aaaggtttgtttaacaatggtaatgtgatgtcaaaatggtttgtttaa 17935909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20524769 - 20524734
Alignment:
Q  309 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20524769 aacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaa 20524734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 9399749 - 9399715
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccc 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9399749 aatttcttccatgaattgatgtcaaagttcttccc 9399715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 652 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 32517664 - 32517632
Alignment:
Q  652 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32517664 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 32517632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 27898157 - 27898499
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27898157 ttaatatattgataggagtattttgtttgattaagttgtttaaaatgctattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 27898255  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27898256 gaatgaatcaaacccttttgtcaaaaaaattcaatcaagttggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 27898355  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  27898356 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccctggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataa 27898455  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27898456 aaagacagacatttgcataccatcataaatcatatatttgatgt 27898499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 30599250 - 30599592
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  30599250 ttaagatattgatatgagtattttgtttcattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 30599349  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30599350 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaa-atttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatattgatcctcaaattagtgaaaataccatc 30599448  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30599449 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgcagaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataa 30599548  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30599549 aaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 30599592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 44795301 - 44794958
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  44795301 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaataatattgtattatgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcgat 44795202  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44795201 gaatgaaccaaaccattatgtcaaaatatttcaatcaaattggttcttgaattatatccatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatc 44795102  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44795101 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 44795002  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44795001 aaagacggacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 44794958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 2661316 - 2660973
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  2661316 ttaagatattgataggggtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccatgtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 2661217  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||| |||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  2661216 gaatgaaccaaacctttctgtcaaaatattttaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattggtttaaataccatc 2661117  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2661116 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 2661017  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2661016 aaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 2660973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 17516411 - 17516069
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  17516411 ttaagatattgatagaagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaattccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 17516312  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17516311 gaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatat-catatccatcatatcgatactcaaattagtaaaaataccatc 17516213  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17516212 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgcttaacaaagtaaaaagtaaaagacagatactttgattataa 17516113  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17516112 aaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 17516069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 44275260 - 44275601
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  44275260 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatggtattgtattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 44275359  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44275360 gaatgaatcaaacctttctg--aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatacacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 44275457  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  44275458 aaataggttcttgaattttcacaatagatatcattgtgatccttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaattaaaagacaaacactttgattataa 44275557  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44275558 aaagacagtcatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 44275601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 2378091 - 2377755
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        
T  2378091 ttaagatattgataggagtatttt-tttgattgagttgtttaaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgt---- 2377998  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377997 -aatgaatcaaacccttatgttaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcataacgatcctcaaattagtgaaaataccatc 2377899  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  2377898 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacaaacactttgattataa 2377799  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2377798 aaagacaaatatttgcatatcatcataaatcatatatttgatgt 2377755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 46198821 - 46198479
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  46198821 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattatattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 46198722  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46198721 gaatgaatcaaacatttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatctatcatatcgatcctcaaattagtaaaaataccatc 46198622  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46198621 aaataggtcc-tggatttttacaacagatatcattgtgatctttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 46198523  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46198522 aaaaacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 46198479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 43766223 - 43765880
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||     
T  43766223 ttaatatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattttattgtgtcaagttcatgtaacattgtaatgaaaagaggttgtcaat 43766124  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  43766123 gaatgaatcaaacctttctatcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcatcaaattagtgaaaatactatc 43766024  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43766023 aaatatgtccttgaattttcacaacagatatcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataa 43765924  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43765923 aaagacagacatttgcataccatcataaatcatatatttgatgt 43765880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 362 - 684
Target Start/End: Original strand, 23292232 - 23292554
Alignment:
Q  362 tttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgt 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  || |||    
T  23292232 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgacaagtccatataatgttgtaatgaaaataggttgtcaatgaatgaatcaaacttttctgt 23292331  T
Q  462 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttca 561  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23292332 caaaaaatttcaatcaaattgatccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttca 23292431  T
Q  562 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatacc 661  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23292432 caacagatatcattgtgatccttggtgcataaatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcatacc 23292531  T
Q  662 atcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23292532 atcataagtcatatatttgatgt 23292554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 21349796 - 21349453
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  21349796 ttaagacattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattctattgcgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 21349697  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21349696 gaatgaatcaaacctttctgtaaaaaaaaatcaatcaaattggtcattgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 21349597  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21349596 aaataggtccttgaattttcacaacaattatcactgtggtccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataa 21349497  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21349496 aaagatagacatttgcatactatcataagtcatatatttgatgt 21349453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 2225206 - 2225555
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgta--------atgttgtaatgaaaagagg 432  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||    
T  2225206 ttaatatattgataggagtattttgcttgactgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagagg 2225305  T
Q  433 ttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaa 532  Q
    || |||| |||||||||||||  || |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2225306 ttgtcaatgaatgaatcaaacatttctgtcaaaaaaattcattcgcattggtccttgaattatatacatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaa 2225405  T
Q  533 ataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacttt 632  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2225406 ataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacttt 2225505  T
Q  633 gactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2225506 gattataaaaagacacacatttgcataccatc--aagtcatatatttgatgt 2225555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 46113569 - 46113226
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  46113569 ttaagatattgataggagtaatttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaag 46113470  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  46113469 gaatgaatccaacccttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtttatccatcacatcaatccctaaattagtgaagataccatc 46113370  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     || | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  46113369 aaacaagtccttgaattttcacaacataaatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaa 46113270  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  46113269 aaagacagacatttgcatatcatcataagtcatacatttgatgt 46113226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 54899543 - 54899172
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatg--------aaaagagg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||    
T  54899543 ttaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagagg 54899444  T
Q  433 ttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaa 532  Q
    || |||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54899443 ttgtcaatgaatgaatcaaacctttccgtcaaaaaaattcaatcacatcggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaa 54899344  T
Q  533 ataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa------------ 620  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  54899343 ataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaaagtaaa 54899244  T
Q  621 --------gacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
            |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54899243 aagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatactatcataagtcatatatttgatgt 54899172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 610696 - 610353
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  610696 ttaagatattgataggagtaatttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtatgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 610597  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||||  |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  610596 gaatgaattcaacccttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcgcatcgatccccaaattagtgaaaataccatc 610497  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  610496 aaataagtccttgaattttcacaacataaatcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattgtaa 610397  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  610396 aaaagcagacatttgcatataatcataagtcatacatttgatgt 610353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 361 - 684
Target Start/End: Original strand, 48829886 - 48830209
Alignment:
Q  361 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  |||| |||||    
T  48829886 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagtggttgtcaatgaatgaatttaacccttatg 48829985  T
Q  461 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttc 560  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  48829986 tcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatctccaaattagtgaaaataccatcaaacaagtccttgaattttc 48830085  T
Q  561 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatac 660  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||| |||     
T  48830086 acaacatatatcactgtgatccttagtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatatactttgattgtaaaaagacagacatttgtatat 48830185  T
Q  661 catcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  48830186 catcataagtcatatatttgatgt 48830209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 423 - 684
Target Start/End: Original strand, 35904849 - 35905113
Alignment:
Q  423 tgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaa 522  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35904849 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaa 35904948  T
Q  523 attagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 622  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35904949 attagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 35905048  T
Q  623 cagacactttgactataaaaagacaaacatt---tgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35905049 cagacactttgattataaaaagacacacatttgatgaataccatcataagtcatatatttgatgt 35905113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 361 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 51685673 - 51685350
Alignment:
Q  361 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatg 460  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| || ||    
T  51685673 ttttgtgtgattgagttgtttgaaatgttattgtattgtgtcaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacctttctg 51685574  T
Q  461 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  51685573 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatcgatcatatcaatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttc 51685474  T
Q  561 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcatac 660  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||    
T  51685473 acaacatatatcactgtgatcgttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacggacatttgcaaac 51685374  T
Q  661 catcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  51685373 catcataagtcatacatttgatgt 51685350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 397 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 42280534 - 42280246
Alignment:
Q  397 tgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattata 496  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  42280534 tgtgccaagtttgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttctattgta 42280435  T
Q  497 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 596  Q
    ||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42280434 tgtctatccatcatatcaatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggtgcatacatt 42280335  T
Q  597 tgctgaacaaagta-aaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42280334 tgctgaacaaagtaaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgt 42280246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 497 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 41978674 - 41978487
Alignment:
Q  497 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 596  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41978674 tgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 41978575  T
Q  597 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41978574 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 41978487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Original strand, 27897586 - 27897928
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||       | |||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  27897586 aatttcttacatgaattgatgtcaatgttcttccccaattaaaaaaacttaaaaccataatttttttgattcaattcgaaattcaaaaactagtggtcat 27897685  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||                 ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27897686 tgttgaagattcggtgtttagaaatgatgagtggtgggcgtatgggcaaaaacaactacaacagccggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatga 27897785  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||    
T  27897786 ggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcctgccctctgcca 27897885  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgt 340  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27897886 aaggtttgtttagcaatggttatgtgatgtgcgaatggtttgt 27897928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 51686073 - 51685730
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||| ||||||||||| || || ||||    
T  51686073 aatttcttccatgaattgatgccaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtgatcat 51685974  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
     |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||                 | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  51685973 cgttgaagatttgatgttcataaatgatgggtggtgggcgtatgggcaaaaacagctacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatga 51685874  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  51685873 tgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataatccaggaaggcctttctatgtctgccctctgcca 51685774  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51685773 aaggtttgtttaacaatggttatgtgacgtgtgaatggtttgtt 51685730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 341 - 562
Target Start/End: Original strand, 53188742 - 53188963
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  53188742 ttaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaataggttgtcaat 53188841  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  53188842 gaatgaatgaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatgtcatc 53188941  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcac 562  Q
     |||||||| ||||||||||||    
T  53188942 aaataggtcattgaattttcac 53188963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42282195 - 42281852
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||         |||||||| ||||||||||| ||  ||||||    
T  42282195 aatttcttccatgaattgatgccaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagcggtcat 42282096  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  42282095 tgttgaagatttggtgttcagaaatgataggtggtgggcgtatgggcaaagacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatga 42281996  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42281995 tgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgccaataacccaagaaggcctttctatgtctgacctctgcca 42281896  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtt 341  Q
    || ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  42281895 aatgtttgtttaacgatgattatttgatgtgcgaatggtttgtt 42281852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 497 - 684
Target Start/End: Original strand, 7884091 - 7884278
Alignment:
Q  497 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 596  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7884091 tgcatatccatcatttcaatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 7884190  T
Q  597 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7884191 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaagacacacatttgcctaccatcataagtcatatatttaatgt 7884278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2378636 - 2378326
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||       | |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2378636 aatttcttacatgaattgatgtcaatgttcttccctaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaaccagtggtcat 2378537  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |    
T  2378536 tgttgaagattcggtggtcagaaatgatgagtggtgggcgtttgggcaaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtaaaataatga 2378437  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||||    
T  2378436 ggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacccaggaaggcctttatatgcctgccctctgcca 2378337  T
Q  298 aaggtttgttt 308  Q
    ||| |||||||    
T  2378336 aagatttgttt 2378326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 482 - 684
Target Start/End: Original strand, 38192456 - 38192657
Alignment:
Q  482 ggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 581  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  38192456 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 38192555  T
Q  582 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttga 681  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||    
T  38192556 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcgttatatcataagtca-atatttga 38192654  T
Q  682 tgt 684  Q
    |||    
T  38192655 tgt 38192657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 485 - 672
Target Start/End: Original strand, 46609724 - 46609911
Alignment:
Q  485 ccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcctt 584  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  46609724 ccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcctt 46609823  T
Q  585 ggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  46609824 tgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 46609911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 482 - 672
Target Start/End: Original strand, 53093196 - 53093386
Alignment:
Q  482 ggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 581  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  53093196 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 53093295  T
Q  582 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  53093296 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaatactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 53093386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 482 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 46309952 - 46309762
Alignment:
Q  482 ggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 581  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  46309952 ggtccatgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 46309853  T
Q  582 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtca 672  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  46309852 atttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 46309762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24846268 - 24845924
Alignment:
Q  16 atttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcatt 115  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||       | |||||||| |||| |||||| || |||| |||    
T  24846268 atttcttctatgaattgatgacaaagttcttccccaattcaaaaaatttaaaatcctaatttttttgattcaattcgaaatccaaaaatcagtggttatt 24846169  T
Q  116 gttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatgaac-----------------tacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaa 198  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||||||| || ||                 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |     
T  24846168 gttcaagctttggtgttcagaaatgatgggtggtggacgtatgggcaaaaacagctacaatagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatggtgat 24846069  T
Q  199 gtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaa 298  Q
     |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||| |   |||||||||    
T  24846068 atgagagtgcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcgataacacatgaatgcctttctatgtct-gtctctgccaa 24845970  T
Q  299 aggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24845969 atgtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 24845924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Original strand, 35904373 - 35904566
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  35904373 aactacaacaatcggtattcatcttcaagctccatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaa 35904472  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  35904473 acactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 35904566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Original strand, 30598731 - 30598992
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  30598731 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 30598830  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  30598831 tattgaagattcggtgttcagaaatgatgggtggtgggcgtatgagctaaaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatga 30598930  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 260  Q
     |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  30598931 ggtgagaga-cttcaatgttggtgacctagaatttgtgttgtaagaaaagctaacactgtcaa 30598992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21350317 - 21350055
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  21350317 aatttcttccatgaattgatgtcaatgtacttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 21350218  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||                 |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21350217 cgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtggtgggcgtatgggcaaaaacaactacaacactcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgataa 21350118  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 260  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||  ||||| ||||||    
T  21350117 ggtgagagagcttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgtactaagaaaaaccaacactgtcaa 21350055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43766744 - 43766482
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       | |||| ||| ||||||||||| || |||||||    
T  43766744 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcagttcgaaattcaaaaatcagtggtcat 43766645  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  43766644 tgttgaagattcaatgtttagaaatgatgggtgatgggcgtatgggcataaacaactacaacagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgatga 43766545  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 260  Q
     ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  43766544 ggtgagagaagttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgttgtaagaaaaggcaacactgtcaa 43766482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Original strand, 53188324 - 53188517
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  53188324 aactacaacaatcggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaa 53188423  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  53188424 acactgtcaataacccaggaaggccttttaatgtttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 53188517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Original strand, 7883722 - 7884066
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaa-tggtca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||       | || ||||| ||||||| ||| ||| |||||     
T  7883722 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtct 7883821  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg-----atg---------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaag 199  Q
       ||| ||||||||||||||||| |||||||||     |||         ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| | | |    
T  7883822 gccttgtagattcggtgttcagaattgatgggtgcgcgaatgggcaaaaacaactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgttgatg 7883921  T
Q  200 tgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaa 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| |||||||| |||||||||  |  |||||||  ||    
T  7883922 tgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgcaagaaaagcaaacactgtcaataactcaggaaggtctttctatgcttgccctctgcataa 7884021  T
Q  300 ggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  7884022 ggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 7884066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41978893 - 41978700
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  41978893 aactacaacaaccggtattcatcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaatagcaa 41978794  T
Q  251 acattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  41978793 acactgtcaataacccaggaatacctttctatgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 41978700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 558 - 684
Target Start/End: Original strand, 53190118 - 53190247
Alignment:
Q  558 ttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta---aaaagtaaaagacagacactttgactataaaaagacaaacattt 654  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  53190118 ttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaattattaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacatattt 53190217  T
Q  655 gcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53190218 gcataccatcataagtcatatatttgatgt 53190247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 172 - 321
Target Start/End: Original strand, 48829679 - 48829828
Alignment:
Q  172 tcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaa 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  48829679 tcttcaagctctatgtacaatgatgatgtgaaagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacccaagaa 48829778  T
Q  272 ggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatg 321  Q
    ||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48829779 ggcctttctatatctgccctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatg 48829828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 246
Target Start/End: Original strand, 23291963 - 23292213
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggt--tcaattcaaaattcaaaaaccaatggtc 112  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||         |  ||||||| ||||||||||| || |||||    
T  23291963 aatttcttccatgaattaacgtcaatgttcttccccaattcaaaagacttaaaaccctaattttttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtc 23292062  T
Q  113 attgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgat 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||                 |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23292063 attgttgaagattcggtgttcagaaatgataggtggtgggcgtatgggcaaaaacaactccatcagtcggtcttcatcttcaagctctatgtacaatgat 23292162  T
Q  196 aaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaa 246  Q
     | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23292163 gaggtgagaaagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaa 23292213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 151 - 260
Target Start/End: Original strand, 44274892 - 44275001
Alignment:
Q  151 aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtca 250  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44274892 aactacaacagtcgatcttcatcttcaatctctatgtacaatgatgaggtgagaaagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagcca 44274991  T
Q  251 acattgtcaa 260  Q
    ||| ||||||    
T  44274992 acactgtcaa 44275001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 423 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 24845884 - 24845670
Alignment:
Q  423 tgaaaagaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaa 522  Q
    |||||||||||| | || ||||||||  |||| || | ||||||  |||| |||||||||||||||  ||| | ||  ||| ||||| |||| |||  ||    
T  24845884 tgaaaagaggttgtaaatgaatgaattcaacccttctatcaaaatctttccatcaaattggtccttctattgtttgtctatgcatcaaatcgttccctaa 24845785  T
Q  523 attagtgaaaa-taccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagt--aaa 619  Q
    |||||| |||| ||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24845784 attagttaaaaataccatcaaataagtctttgaattatcacaacatatatcaatgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaa 24845685  T
Q  620 agacagacactttga 634  Q
    ||||| |||||||||    
T  24845684 agacatacactttga 24845670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17516668 - 17516561
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||       | |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  17516668 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccctaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 17516569  T
Q  115 tgttgaag 122  Q
    ||||||||    
T  17516568 tgttgaag 17516561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 341 - 400
Target Start/End: Original strand, 35904791 - 35904850
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35904791 ttaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgttattgtattgtg 35904850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1847211 - 1847067
Alignment:
Q  167 cttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataaccc 266  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  ||| | |   || ||| |    
T  1847211 cttcatcttcaagctccaagtttaatggtgatgtgagagagcttgaatgttggtgtcctataatttgtgttgttagaaaatccaatactaataaaaactc 1847112  T
Q  267 aggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaac 311  Q
     |||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  1847111 gggaaggccattctatgtttgccctctgccaaaggtttgtttaac 1847067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 46199172 - 46199080
Alignment:
Q  168 ttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 260  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  46199172 ttcatcttcaagctctatatacaatgatgaggtaagagagcttcaatgttggtgccctataatttgtattgtaagaaaagccaacactgtcaa 46199080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 311
Target Start/End: Original strand, 35862085 - 35862228
Alignment:
Q  168 ttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataaccca 267  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||| | || | ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||| ||    
T  35862085 ttcatcttcaagctctatgtttaatggtgatgtgagagtgtttgagtgttggtgtcccataatttgtgttttaagaaaagtcaatactgtcaaaaactca 35862184  T
Q  268 ggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaac 311  Q
    ||||||||||||||||  |  |||  ||||||||||||||||||    
T  35862185 ggaaggcctttctatgcttgccctaagccaaaggtttgtttaac 35862228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 44268375 - 44268476
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  |       | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44268375 aatttcttccatgaattaatgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttaaa--ccctatttttttgattcaattcaaaattcaaaaaccagtggtcat 44268472  T
Q  115 tgtt 118  Q
    ||||    
T  44268473 tgtt 44268476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 344
Target Start/End: Original strand, 32843067 - 32843149
Alignment:
Q  262 aacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||    
T  32843067 aacccaggaaggcctttctatgtttgccctttgctaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtcaaaatggtatgtttaa 32843149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 46113784 - 46113731
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaa 68  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46113784 aatttcttccatgaattgatgccaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaa 46113731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Original strand, 2975967 - 2976111
Alignment:
Q  167 cttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataaccc 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||  |||| | | ||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||  | |||||    
T  2975967 cttcatcttcaagttccaagtttaatggtgatgtgagattgcttgaatgttgttgtcctagaatttgtgttgttagaaaagccaatactgtacaaaaccc 2976066  T
Q  267 aggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaac 311  Q
    ||||||| | |||||||  |  ||||||||||| |||||||||||    
T  2976067 aggaaggtcattctatgcttgccctctgccaaatgtttgtttaac 2976111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Original strand, 33112384 - 33112528
Alignment:
Q  167 cttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataaccc 266  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||| | | ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| || |  |     
T  33112384 cttcatcttcaaactccaagtttaatggtgatgtgagagtgcttgaatgttggtgtcctagaatttgtgttgttagaaaatccaatattgtaaaaattct 33112483  T
Q  267 aggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaac 311  Q
    | ||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  33112484 atgaaggccattctatgcttgccctctgccaaaggtttgtttaac 33112528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 44795553 - 44795420
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaa-tggtca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||       | || ||||||||||||| ||| ||| |||||     
T  44795553 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttataaccctaatttttttgattaaattcaaaattcataaatcaagtggtct 44795454  T
Q  114 ttgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtg 147  Q
       ||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  44795453 gccttgtagattcggtgttcaaaattgatgggtg 44795420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 610910 - 610851
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  610910 aatttctttcatgaattgatgccaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaa 610851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 2661569 - 2661510
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2661569 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 2661510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 53188170 - 53188229
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  53188170 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 53188229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 35904218 - 35904267
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35904218 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaactt 35904267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 293 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13466563 - 13466515
Alignment:
Q  293 tgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtt 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13466563 tgccaaaggtttatttaacaatggttatgtgatgtgggaatggtttgtt 13466515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 344
Target Start/End: Original strand, 22218712 - 22218892
Alignment:
Q  164 ggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataa 263  Q
    |||||||||||||||| || ||||  |||| | | |||||||  ||| ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||  ||||| | |||| ||    
T  22218712 ggtcttcatcttcaagttctatgtctaatggtgatgtgagagtacttgaatgttggtgtcctataatatgcgttgtaagaaaatgcaacactatcaaaaa 22218811  T
Q  264 cccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||| ||| | ||||||||   |  | ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||   ||||||||||||||    
T  22218812 cccaagaatgtctttctattcttgccatctgccaaaggtttgtttaaccattattgtgtgatgtcataatggtttgtttaa 22218892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 23876035 - 23876094
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23876035 aatttcttccattaattgatgacaatcttcttccccaattcaaaaaacttcaaaacctaa 23876094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 38192311 - 38192370
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  38192311 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 38192370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 38193171 - 38193112
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  38193171 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 38193112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 41979047 - 41978988
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41979047 aatttctttcatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 41978988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 46309235 - 46309294
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  46309235 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 46309294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 46310097 - 46310038
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  46310097 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 46310038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 46609577 - 46609636
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  46609577 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 46609636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 53093051 - 53093110
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  53093051 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 53093110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 53093934 - 53093875
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  53093934 aatttcttccatgaattgatgtaaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 53093875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 13466253 - 13466115
Alignment:
Q  349 ttgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaacgaatgaat 448  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| || |||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||    
T  13466253 ttgataggtgtaatttgtttgattggattgtttaacatgctactgtattatgctaagtttgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgaaaatgaatgaat 13466154  T
Q  449 caaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtcct 487  Q
      |||  || ||||||||  |||| | ||||||||||||    
T  13466153 gcaactcttctgtcaaaatctttccaacaaattggtcct 13466115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 54899769 - 54899710
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  54899769 aatttctttcatgaattgatgtcaaatttcttccccaattaaaaaaacttagaaccctaa 54899710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 3150674 - 3150724
Alignment:
Q  24 catgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3150674 catgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 3150724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21350056 - 21350021
Alignment:
Q  309 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21350056 aacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaa 21350021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 246
Target Start/End: Original strand, 45897583 - 45897662
Alignment:
Q  167 cttcatcttcaagctccatgtacaatgataaagtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaa 246  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |   ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  45897583 cttcatcttcaagctccaagtttaatggtgttgtgagagtgcttgaatgttggtgtcctacaatttgtgttgttagaaaa 45897662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 530 - 614
Target Start/End: Original strand, 35862691 - 35862775
Alignment:
Q  530 aaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 614  Q
    ||||||| |||  ||| ||||||||||| |   ||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  35862691 aaaatacaatcagataagtccttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttgttgcatatatgtgcagaacaaagtaaaaa 35862775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43766483 - 43766447
Alignment:
Q  309 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaag 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43766483 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaag 43766447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 341 - 684
Target Start/End: Original strand, 107628 - 107970
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaac 440  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| ||||     
T  107628 ttaagatattgataggagtaatttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtttgtgtaatgtagtaatgaaaaaaggttgtcaat 107727  T
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  107728 gaatgaatcaaccc-ttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtcattctattgtatgtctatccatcatatcgatccctaaattagtgaaaataccatc 107826  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     |||| |||||| ||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  107827 aaataagtccttaaattttcacaatataaatcactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataa 107926  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  107927 aaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgt 107970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Original strand, 107059 - 107404
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||         ||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  107059 aatttcttccatgaattgatgtcaa-gttcttccccaattcaaaaaacttaaaactctaattttttttattccattcgaaattcaaaaatcagtggtcat 107157  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg--------------aac---tacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||              |||   ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  107158 tgttgaacatttggtgtttagaaatgatgggtggtgggcgtacgtgcaaaaacagttacaacagtcgatcttcatcttcaaactcaatgtacaatgatga 107257  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||    
T  107258 tgtgagagagcttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgttgtaagaaaattcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgcatgccctctgcca 107357  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107358 aaggtttgtttaacagtggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 107404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 345 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 647 - 301
Alignment:
Q  345 gatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatg----------------aaaa 428  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||                ||||    
T  647 gatattgatagaagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattctattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaa 548  T
Q  429 gaggttttcaacgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagt 528  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  547 gaggtggtcaatgaatgaatcaaacccttatgtcaaaaagtttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatc---------gatcctcaaattagt 457  T
Q  529 gaaaataccatcgaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagaca 628  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  456 aaaaataccatcaaacaggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgccgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaaca 357  T
Q  629 ctttgactataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  356 ctttgattataaaaagacagacatttgcataccatcaggagtcatatatttgatgt 301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1209 - 863
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaannnnnnnggttcaattcaaaattcaaaaaccaatggtcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||       | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1209 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaatttaagaccctaatttttttgattcaattcaaaattcaaaaaccagtggtcat 1110  T
Q  115 tgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgatg-----------------aactacaacagtcggtcttcatcttcaagctccatgtacaatgataa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||                 |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  1109 tgttgaagattcggtgttcagaaatgaagggcggtgggcgtatgggcaaaaacaactacaacagtcggtgttcatcttcaagctctatgtacaatgatga 1010  T
Q  198 agtgagagagcttcaatgttgatgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtgtaacctctgcca 297  Q
     |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  1009 ggtgagagagcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactatcaataacccaagaaagcctttctatgtctgccctctgcca 910  T
Q  298 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 344  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  909 aaggtttgtttaacaaaggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaa 863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 441 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 4286 - 4043
Alignment:
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  4286 gaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatc 4187  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  4186 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattatca 4087  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4086 aaagacagacatttttataccatcataagtcatatatttgatgt 4043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 441 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 5458 - 5215
Alignment:
Q  441 gaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 540  Q
    ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  5458 gaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatc 5359  T
Q  541 gaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgactataa 640  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  5358 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattatca 5259  T
Q  641 aaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 684  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5258 aaagacagacatttttataccatcataagtcatatatttgatgt 5215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 6898 - 6839
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  6898 aatttcttccatgaattgatgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaa 6839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 341 - 536
Target Start/End: Original strand, 1560 - 1752
Alignment:
Q  341 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatg-aaaagaggttttcaa 439  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||      
T  1560 ttaagatgttgataggagtaatttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattatgccaagtctatgtaatgttgtaatgaaaaagatgttgtc-- 1657  T
Q  440 cgaatgaatcaaaccgttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatac 536  Q
      |||||||  |||| || | |||||| ||||| |||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1658 --aatgaattcaaccattctatcaaaatatttccatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatctccaaattagtgaaaatac 1752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 56
Target Start/End: Original strand, 1134 - 1175
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaattca 56  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1134 aatttcttccatgaattgatgacaaagttcttccccaattca 1175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 52
Target Start/End: Original strand, 1212 - 1249
Alignment:
Q  15 aatttcttccatgaattgatgtcaatgttcttccccaa 52  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1212 aatttcttccatgaattgatgacaaagttcttccccaa 1249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University