View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8921_low_35 (Length: 499)

Name: NF8921_low_35
Description: NF8921
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8921_low_35
NF8921_low_35
[»] chr6 (72 HSPs)
chr6 (22-485)||(26802201-26802667)
chr6 (22-485)||(28780902-28781364)
chr6 (22-485)||(28786041-28786503)
chr6 (22-463)||(28792184-28792624)
chr6 (22-484)||(27724807-27725267)
chr6 (22-485)||(27718341-27718803)
chr6 (22-465)||(27610964-27611406)
chr6 (30-474)||(27698464-27698906)
chr6 (22-485)||(27604667-27605135)
chr6 (59-485)||(26655752-26656177)
chr6 (59-485)||(26761723-26762148)
chr6 (22-411)||(27592982-27593371)
chr6 (22-411)||(27678782-27679171)
chr6 (132-485)||(27228997-27229347)
chr6 (22-385)||(26884025-26884390)
chr6 (59-392)||(26646334-26646667)
chr6 (59-392)||(26752302-26752635)
chr6 (22-411)||(27677576-27677965)
chr6 (22-365)||(27531159-27531502)
chr6 (22-411)||(27706364-27706753)
chr6 (22-411)||(31284124-31284513)
chr6 (59-425)||(27338064-27338430)
chr6 (59-425)||(27398804-27399170)
chr6 (26-353)||(25481636-25481963)
chr6 (59-417)||(26622806-26623164)
chr6 (59-417)||(26728784-26729142)
chr6 (62-485)||(26823609-26824025)
chr6 (22-409)||(26861454-26861838)
chr6 (59-353)||(25579613-25579907)
chr6 (59-353)||(26142759-26143053)
chr6 (59-353)||(25538434-25538728)
chr6 (59-353)||(26055820-26056114)
chr6 (59-353)||(26075790-26076084)
chr6 (22-480)||(27427568-27428020)
chr6 (59-353)||(26048739-26049033)
chr6 (59-353)||(26069908-26070202)
chr6 (123-370)||(28234441-28234688)
chr6 (112-382)||(28226815-28227085)
chr6 (112-385)||(28325343-28325616)
chr6 (126-243)||(25506975-25507092)
chr6 (123-391)||(28185222-28185490)
chr6 (57-349)||(28242702-28242994)
chr6 (112-391)||(28180970-28181249)
chr6 (62-415)||(28139373-28139726)
chr6 (98-273)||(28149912-28150086)
chr6 (112-352)||(26848555-26848795)
chr6 (117-393)||(28098426-28098702)
chr6 (112-383)||(26341986-26342257)
chr6 (132-370)||(26893543-26893781)
chr6 (112-385)||(28297765-28298038)
chr6 (112-385)||(28514035-28514308)
chr6 (123-387)||(26936954-26937218)
chr6 (192-316)||(29825958-29826082)
chr6 (198-352)||(26635585-26635739)
chr6 (198-352)||(26741551-26741705)
chr6 (188-352)||(25071554-25071718)
chr6 (188-328)||(26949580-26949720)
chr6 (224-352)||(27214312-27214440)
chr6 (224-352)||(27234788-27234916)
chr6 (222-307)||(26617266-26617351)
chr6 (222-307)||(26723194-26723279)
chr6 (222-343)||(26959069-26959190)
chr6 (215-352)||(27665272-27665409)
chr6 (200-303)||(26811453-26811556)
chr6 (93-247)||(2184288-2184442)
chr6 (453-485)||(27338450-27338482)
chr6 (453-485)||(27399190-27399222)
chr6 (200-284)||(28491660-28491744)
chr6 (200-284)||(29804070-29804154)
chr6 (94-265)||(2184880-2185051)
chr6 (198-277)||(29467797-29467876)
chr6 (198-328)||(26974971-26975101)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (22-485)||(13594-14056)
scaffold0277 (22-485)||(4633-5100)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (22-485)||(7295-7750)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (22-484)||(3383-3844)
scaffold0349 (22-474)||(14318-14767)
scaffold0349 (320-485)||(8061-8225)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (144-485)||(1-334)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (59-483)||(18699386-18699807)
chr4 (61-485)||(18731492-18731913)
chr4 (59-485)||(18655463-18655886)
chr4 (59-485)||(18679553-18679976)
chr4 (61-417)||(18724073-18724429)
chr4 (22-480)||(18073535-18073987)
chr4 (249-480)||(17989226-17989454)
chr4 (51-343)||(5090945-5091237)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (41-431)||(28164331-28164720)
chr1 (25-385)||(28127631-28127992)
chr1 (59-411)||(268343-268695)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (59-411)||(29273769-29274121)
chr8 (216-371)||(31903727-31903882)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (22-480)||(59343-59795)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (112-370)||(34602-34860)
scaffold0038 (112-382)||(27313-27583)
scaffold0038 (112-385)||(116658-116931)
scaffold0038 (57-349)||(42864-43156)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (112-385)||(58334-58607)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (112-373)||(3279562-3279823)
chr2 (188-409)||(17993812-17994033)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (198-314)||(16688944-16689060)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 428; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 26802667 - 26802201
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802667 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaataggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 26802568  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802567 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 26802468  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802467 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 26802368  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgag 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802367 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgag 26802268  T
Q  422 aaattggatg---nnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    ||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802267 aaattggatgaaaaaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 26802201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28781364 - 28780902
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    |||||||||||||   || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28781364 atgcttcaccataaggacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaat 28781265  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28781264 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgat 28781165  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  28781164 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggc 28781065  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||| |||    
T  28781064 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgataattgagag 28780965  T
Q  422 aaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    ||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28780964 aaattggatg-aaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgtttttgtggtctgtg 28780902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28786503 - 28786041
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28786503 atgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatcgacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaat 28786404  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28786403 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgat 28786304  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |    
T  28786303 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggc 28786204  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgag 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||| |||    
T  28786203 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagag 28786104  T
Q  422 aaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    ||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28786103 aaattggatg-aaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgtttttgtggtctgtg 28786041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 22 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 28792624 - 28792184
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28792624 atgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatcgacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaat 28792525  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28792524 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgat 28792425  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |    
T  28792424 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggc 28792325  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgag 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||| |||    
T  28792324 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagag 28792225  T
Q  422 aaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaat 463  Q
    ||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||    
T  28792224 aaattggatg-aaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 28792184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 22 - 484
Target Start/End: Original strand, 27724807 - 27725267
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    ||||||||||||| |||| | | ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27724807 atgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaat 27724906  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27724907 tatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaataggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgat 27725006  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  27725007 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgcc 27725106  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgag 421  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||    
T  27725107 gagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgacaattgagag 27725206  T
Q  422 aaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgt 484  Q
    |||| |||||       |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27725207 aaataggatg-aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatg-gtaaatttttgtggtctgt 27725267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Original strand, 27718341 - 27718803
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    ||||||||||||| |||| | | ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27718341 atgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaat 27718440  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27718441 tatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgat 27718540  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||    
T  27718541 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaactgtgcc 27718640  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgag 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||    
T  27718641 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagag 27718740  T
Q  422 aaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    |||| |||||       ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  27718741 aaataggatg-aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtgaatttttgtgttctgtg 27718803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 22 - 465
Target Start/End: Original strand, 27610964 - 27611406
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    ||||||||||||| |||| | | ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27610964 atgcttcaccataactacctttctgatgtcgcactttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaat 27611063  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27611064 tatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgat 27611163  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |    
T  27611164 ggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggc 27611263  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgag 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   | ||||||||||||||||||| |||    
T  27611264 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaagaagaggaagctaattgcatagccatgaaaattgagag 27611363  T
Q  422 aaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaatga 465  Q
    ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  27611364 aaattggatg-aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatga 27611406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Original strand, 27698464 - 27698906
Alignment:
Q  30 ccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaa 129  Q
    ||||| |||| | ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |    
T  27698464 ccataactacctttatgatgtctcacattagttggttccacaccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaattatgtgga 27698563  T
Q  130 caagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgat 229  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27698564 caagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttgagagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgat 27698663  T
Q  230 ttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtca 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  27698664 ttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtca 27698763  T
Q  330 gtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaattgga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  27698764 gtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaatagga 27698863  T
Q  430 tgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttt 474  Q
    ||       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27698864 tg--aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttt 27698906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Original strand, 27604667 - 27605135
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    |||||| ||| || |||| | ||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  27604667 atgcttgaccgtaactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaat 27604766  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||| |    
T  27604767 gatgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaagaggcatatttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgct 27604866  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27604867 ggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttcatcaatgaaggtatgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatc 27604966  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaa------gaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaat 415  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||      ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  27604967 gagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaaatgaagaggatgaggatgaggaaggtaattgcatagccatgagaat 27605066  T
Q  416 tgtgagaaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    || |||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605067 tgagagaaattggatg-aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 27605135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 59 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 26656177 - 26655752
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||     
T  26656177 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 26656078  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26656077 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 26655978  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 358  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26655977 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggta 26655878  T
Q  359 agtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaata 458  Q
      | || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||||| ||||||       ||||||| ||||||||||||    
T  26655877 tttaaacccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaaatggatg-aaaaaagagtttgggaatgcagaata 26655779  T
Q  459 tgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26655778 tgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 26655752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 59 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 26762148 - 26761723
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||     
T  26762148 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 26762049  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26762048 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 26761949  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 358  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26761948 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggta 26761849  T
Q  359 agtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaata 458  Q
      | || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||||| ||||||       ||||||| ||||||||||||    
T  26761848 tttaaacccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaaatggatg-aaaaaagagtttgggaatgcagaata 26761750  T
Q  459 tgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26761749 tgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 26761723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 411
Target Start/End: Original strand, 27592982 - 27593371
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27592982 atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacagggcgaccctttgtcttgtagcaatgaat 27593081  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
     |||||  ||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  27593082 gatgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgat 27593181  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27593182 ggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtacc 27593281  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatga 411  Q
    |||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  || |  |||| |||| ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||    
T  27593282 gagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtaatcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatga 27593371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27679171 - 27678782
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    ||||||||||||| |||| | || |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27679171 atgcttcaccataactacctttacgatgtcgcacaacagtaggttccacaccaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaat 27679072  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  27679071 gatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgat 27678972  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  27678971 ggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattcccggtgaaaccgtacc 27678872  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatga 411  Q
    |||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  || |  |||| |||| ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||    
T  27678871 gagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatga 27678782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 132 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 27229347 - 27228997
Alignment:
Q  132 agttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgattt 231  Q
    ||||||| ||| ||||||   ||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27229347 agttcgttcaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgattt 27229248  T
Q  232 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagt 331  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27229247 cgtctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgagtgtcagt 27229148  T
Q  332 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaattggatg 431  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  27229147 gcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccaaaggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgtatagccatgagacttgagagaaattggatg 27229048  T
Q  432 nnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
           |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27229047 ---aaaagagttttagaatgcagaatatgaatgagtatgtttttgtggtatgtg 27228997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 26884390 - 26884025
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  26884390 atgcttcaccataactacctgtatgatgtcgcacatcagtaggatccacaccaacaaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaat 26884291  T
Q  122 aa--tgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtg 219  Q
     |  |||| |||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884290 gacatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtg 26884191  T
Q  220 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgta 319  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||| ||    
T  26884190 atggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccata 26884091  T
Q  320 ccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagagga 385  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26884090 ccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 26884025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 59 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26646667 - 26646334
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26646667 agtaggatccacgccatagaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagag 26646568  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||    
T  26646567 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcat 26646468  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 358  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||  ||||||| || |||||    
T  26646467 caatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggta 26646368  T
Q  359 agtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaa 392  Q
     |||||||| || |||| | ||||||| ||||||    
T  26646367 ggtgaatccgtaggaaattaaagaggaagaggaa 26646334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 59 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26752635 - 26752302
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26752635 agtaggatccacgccatagaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagag 26752536  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||    
T  26752535 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcat 26752436  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 358  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||  ||||||| || |||||    
T  26752435 caatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggta 26752336  T
Q  359 agtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaa 392  Q
     |||||||| || |||| | ||||||| ||||||    
T  26752335 ggtgaatccgtaggaaattaaagaggaagaggaa 26752302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 411
Target Start/End: Original strand, 27677576 - 27677965
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    ||||||||||||| |||| | | ||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27677576 atgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacaatagtaggttccacagcaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaat 27677675  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  27677676 gatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacagcaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgat 27677775  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27677776 ggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtacc 27677875  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatga 411  Q
    |||||||| | || || ||| ||||||| ||||||||  || |  |||| |||| ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||    
T  27677876 gagtgtcacttcctctgaaattgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatga 27677965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 365
Target Start/End: Original strand, 27531159 - 27531502
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| || || | ||||||||| |  ||||||||| |    
T  27531159 atgcttcaccatatctacctgtgtgatgtcgcacatcagtaggatccacaccaataaaaacaggcaaaacaagacaaccctttgtatcgtagcaatgagt 27531258  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||   |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||    
T  27531259 gatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttttcagaaaatacgggaataaaaatcctagatttttcaatggcattttttagtgat 27531358  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |    
T  27531359 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatagattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggc 27531458  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaat 365  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27531459 gagtgtccgcgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaat 27531502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 411
Target Start/End: Original strand, 27706364 - 27706753
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    ||||||||||||| |||| | || |||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27706364 atgcttcaccataactacctttacgatgtcgcacaatagtaggttctacaccaaataaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaat 27706463  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  27706464 gatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgat 27706563  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27706564 ggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaaaagccttgtagagattgcctgtgaaaccgtacc 27706663  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatga 411  Q
    ||||||||   || || ||||||||||| ||||||||  || |  |||| |||| ||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||    
T  27706664 gagtgtcacctcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagagaaaggtgattgcatagccatga 27706753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31284513 - 31284124
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    ||||||| ||||| |||| | ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||  | |||||    
T  31284513 atgcttctccataactacctctatgatgtcgcacatgagaaggatccacgccaaagaaaacgggcaaaacgaggcgaccattttgcttatacaagtgaat 31284414  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||    |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  31284413 gatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaagaggcatagttggcagaaaacacggggataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgat 31284314  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  31284313 ggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccatacc 31284214  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatga 411  Q
    |||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  31284213 gagtgtcacttcccctgaaactaaggaatacttggtatttgaatacataggaaattgaagaggaagaggaagatgattgcatagccatga 31284124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 59 - 425
Target Start/End: Original strand, 27338064 - 27338430
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    | |||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||||     
T  27338064 agtaggatccgcaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagat 27338163  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    ||||||||   |||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27338164 gcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcat 27338263  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 358  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  27338264 caatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggta 27338363  T
Q  359 agtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaat 425  Q
      |||| ||| | |||| ||||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27338364 tttgaacccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccatgagaattgagagaaat 27338430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 59 - 425
Target Start/End: Original strand, 27398804 - 27399170
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    | |||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||||     
T  27398804 agtaggatccgcaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagat 27398903  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    ||||||||   |||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27398904 gcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcat 27399003  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 358  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  27399004 caatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggta 27399103  T
Q  359 agtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaat 425  Q
      |||| ||| | |||| ||||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27399104 tttgaacccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccatgagaattgagagaaat 27399170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25481963 - 25481636
Alignment:
Q  26 ttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatg 125  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||| || || || | || || ||||||||| ||||| ||||| |||    
T  25481963 ttcaccataactacatgtatgacgtcgaacatcagtaggatccacaccatagaaaacgggtaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatg 25481864  T
Q  126 tgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtg 225  Q
    || |||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||  |||||| |  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25481863 tggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatacaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtg 25481764  T
Q  226 tgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||  ||  |||||    
T  25481763 tgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagt 25481664  T
Q  326 gtcagtgcccctaaaactgaggaacact 353  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  25481663 gtcactgcccctgaaattgaggaacact 25481636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 59 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 26623164 - 26622806
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||   ||| |     
T  26623164 agtaggatccacgccatagaagacgggcaaaacgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatat 26623065  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||   ||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||   ||||    
T  26623064 gcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcat 26622965  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  26622964 caatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggta 26622865  T
Q  359 agtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattg 417  Q
      |||||  ||| |||| ||||||||| ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  26622864 tttgaattgataggaaattgaagaggaagaggatggtgattgcatagccatgataattg 26622806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 59 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 26729142 - 26728784
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||   ||| |     
T  26729142 agtaggatccacgccatagaagacgggcaaaacgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatat 26729043  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||   ||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||   ||||    
T  26729042 gcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcat 26728943  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  26728942 caatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggta 26728843  T
Q  359 agtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattg 417  Q
      |||||  ||| |||| ||||||||| ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  26728842 tttgaattgataggaaattgaagaggaagaggatggtgattgcatagccatgataattg 26728784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 62 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 26824025 - 26823609
Alignment:
Q  62 aggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggca 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  26824025 aggatccacaccatagaaaacaggcaaaacgaggcgccccttttccttgtagacgcgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggca 26823926  T
Q  162 tagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaa 261  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||| |||   |||||||    
T  26823925 tagttggcagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattattgagtgattgttcgattttatcccctctttgaagttcacgatcatcaa 26823826  T
Q  262 tgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagt 361  Q
      ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  |    
T  26823825 aaaaggtgtggattcccttgtctgtaagagccttgtagagattgccggtaaattcataccgagtgtcagcgcctctaaaactgagaaacacttggtattt 26823726  T
Q  362 gaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatga 461  Q
    |||  |||| |||| ||||      |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||    
T  26823725 gaaatcatatgaaactgaa------gaggaagttgactgcatagccatgagaattgagagaaattggacg-aagaaagagtttgagaatgcagaatatga 26823633  T
Q  462 atgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    ||||||| |||  |||||| ||||    
T  26823632 atgagtatgttactgtggtgtgtg 26823609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26861838 - 26861454
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  |||   ||| | |||    
T  26861838 atgcttcaccataaatacctctatgatgtcgcacattagtaggatccatgccatagaaaacaggcaaaacgacgcgacccttttcctt---gcagttaat 26861742  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
     || || |||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  26861741 gatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttggcagaaaacacaggaatgaaaattctagactcttcaatggcattgtcgagtgat 26861642  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
      | |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  26861641 cttttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattaccggtaaaaccatacc 26861542  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccat 409  Q
    |||||||| | || || ||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||  |||||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  26861541 gagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacctggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 26861454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25579907 - 25579613
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||| |||||| || ||||||| ||||| || | || || ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||     
T  25579907 agtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 25579808  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25579807 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattatcat 25579708  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 353  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||  ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  25579707 caaagaaggtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaagtgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacact 25579613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26143053 - 26142759
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||| |||||| || ||||||| || || || | || || ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||     
T  26143053 agtaggttccacatcatagaaaacgggaaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 26142954  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26142953 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcat 26142854  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 353  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||   ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26142853 caatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaatttgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26142759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25538728 - 25538434
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||| |||||| || ||||||| ||||| || | || || ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||   |||||     
T  25538728 agtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatctggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 25538629  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25538628 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaattctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcat 25538529  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 353  Q
    | ||||| |||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||   ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25538528 ctatgaaagtactaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaatttgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 25538434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26056114 - 26055820
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||| |||||| || ||||||| ||||| || | || || |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||     
T  26056114 agtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 26056015  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26056014 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcat 26055915  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 353  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||  ||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26055914 caatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaaatgaggaacact 26055820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26076084 - 26075790
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||| |||||| || ||||||| ||||| || | || || |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||     
T  26076084 agtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 26075985  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26075984 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcat 26075885  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 353  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||  ||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26075884 caatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 26075790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 480
Target Start/End: Original strand, 27427568 - 27428020
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||||| |||||    
T  27427568 atgctttaccatacctacctgtatgatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaat 27427667  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
     ||||| ||||||  |||||| ||| ||   ||||| |||||||||  |||||| |  ||||| ||||| || |||||||||||     ||||      |    
T  27427668 gatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaataa---tgat------t 27427758  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatc------aatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaac 315  Q
    ||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||      |  ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  27427759 ggtgtgactttgtctcttctttgaagatcactgtcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaac 27427858  T
Q  316 cgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaat 415  Q
    ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||||  || ||||  | ||||| ||||||| |||    
T  27427859 cgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaat 27427958  T
Q  416 tgtgagaaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggt 480  Q
    || |||||||  ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27427959 tgagagaaataagatg---agaagagtttgagaatgcagaatatgaatgaggatgtttttgtggt 27428020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26049033 - 26048739
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||| |||||| || | ||||| ||||| || | || || ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||     
T  26049033 agtaggttccacatcataaaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 26048934  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26048933 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatggccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcat 26048834  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 353  Q
    ||||||| |||   |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||  ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26048833 caatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26048739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26070202 - 26069908
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||| |||||| || | ||||| ||||| || | || || ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||     
T  26070202 agtaggttccacatcataaaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 26070103  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26070102 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatggccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcat 26070003  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 353  Q
    ||||||| |||   |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||  ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26070002 caatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26069908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28234688 - 28234441
Alignment:
Q  123 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 222  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  28234688 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatg 28234589  T
Q  223 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccg 322  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  | ||||||||  | |||||||| || ||    
T  28234588 gtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccatagcg 28234489  T
Q  323 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccata 370  Q
    ||||||| | || |||||||| |||||||| |  || |||||||||||    
T  28234488 agtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccata 28234441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 112 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28227085 - 28226815
Alignment:
Q  112 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctt 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28227085 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgacctt 28226986  T
Q  212 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgta 311  Q
    ||  ||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||  | ||||||| ||| || || |||||||| | |  |||| |  |||||||||| || |||    
T  28226985 gaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagta 28226886  T
Q  312 aaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaaga 382  Q
    ||||| || ||||||||| | || |||||||| |||||||| |  || |||||||||||||| || |||||    
T  28226885 aaaccataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataagagaaggaaga 28226815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 112 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28325616 - 28325343
Alignment:
Q  112 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctt 211  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    ||||| ||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28325616 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28325517  T
Q  212 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgta 311  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||   |  |||| | ||||||||||| || |||    
T  28325516 gaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagta 28325417  T
Q  312 aaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagagga 385  Q
    ||||| || ||||||||| | || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28325416 aaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaagagga 28325343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 243
Target Start/End: Original strand, 25506975 - 25507092
Alignment:
Q  126 tgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtg 225  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||    
T  25506975 tgaacaagttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtg 25507074  T
Q  226 tgatttcatctcctcttt 243  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25507075 tgatttcatctcctcttt 25507092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28185490 - 28185222
Alignment:
Q  123 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 222  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  28185490 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatg 28185391  T
Q  223 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccg 322  Q
     ||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | | |||||| || |||||||  || ||    
T  28185390 atgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagtaaaacgataacg 28185291  T
Q  323 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgagga 391  Q
    ||||||| | || ||||| || |||||||| |  || ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  28185290 agtgtcactacctctaaagctaaggaacacgtcataggtgaatccataggagaaggaagaggatgagga 28185222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 28242994 - 28242702
Alignment:
Q  57 ttagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaag 156  Q
    |||| ||| |||||| || ||||||  ||||| || ||||| || ||| ||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||    
T  28242994 ttagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactaggcgtccatttttcttgcagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaag 28242895  T
Q  157 aggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtc 256  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||| | |||| ||  ||||    
T  28242894 aagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtc 28242795  T
Q  257 atcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaa 349  Q
    ||||||||||||  | |||||||| | |  |||| | ||||||||||| || |||||||| || ||||||||| | || |||||||| |||||    
T  28242794 atcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 28242702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28181249 - 28180970
Alignment:
Q  112 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctt 211  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28181249 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28181150  T
Q  212 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgta 311  Q
    ||  ||||||| ||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | | |||||| || |||    
T  28181149 gaaaagtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagta 28181050  T
Q  312 aaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgagga 391  Q
    ||||| || |||||||||   || ||||| || |||||| | |  || ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  28181049 aaaccataacgagtgtcaccacctctaaagctaaggaacgcgtcataggtgaatccataggagaaggaagaggatgagga 28180970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 28139726 - 28139373
Alignment:
Q  62 aggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggca 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |  |  |||||||| ||  |||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  28139726 aggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccaaacatccctttgtgttgaagcagtcaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaacgaagaagaggca 28139627  T
Q  162 tagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaa 261  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || | |||||| ||||  ||||| || |||| |||||| ||  | |||||||    
T  28139626 tagttgatggaaaacacagggatgaaaatcctagattcttcaatggcttttacgagtgacggtgatatttcgtcacctccttgaagctccctatcatcaa 28139527  T
Q  262 tgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagt 361  Q
    | || || ||||||||   ||||  |||||| ||||||||||| || || |||||| | ||||||||| |||| || || ||||| || || | ||| ||    
T  28139526 taaaagtgtggattccacagtcacgaagagctttgtagagatttccagtgaaaccgaaacgagtgtcactgcctctgaagctgagaaagacatcgtatgt 28139427  T
Q  362 gaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaat 415  Q
    ||| ||||| || || ||||  || || ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  28139426 gaagccataggagaaagaagtagaagaagaaggtggttgcaaagccatgaaaat 28139373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28150086 - 28149912
Alignment:
Q  98 accctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagat 197  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||| | |||||||||||| || |  ||||| ||||| || ||     
T  28150086 accctttgccttgaagcagtgaataatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgatagagaagattggaatgaaaatcctggac 28149987  T
Q  198 tcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatgga 273  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| || ||| ||  | |||||||||||||| ||||    
T  28149986 tcttcaatggccttga-gagtgatggtgtgatttcgtcccctcgttaaagctccgtatcatcaatgaaggtgtgga 28149912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26848795 - 26848555
Alignment:
Q  112 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctt 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    |||| |||||||||   ||| || ||| ||||  |||| || || |||||||||  |||    
T  26848795 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagttctcagagaatacaagaatggaaatcctcgagtcttcaatgttctt 26848696  T
Q  212 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgta 311  Q
    || ||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||||||| || ||     
T  26848695 gaggagcgaaggtgtgatctcatcaccactctgaagatccttgtcatcaatgaaggttcggattccattgtcagaaagagctttatagagattaccagtg 26848596  T
Q  312 aaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 352  Q
    |||| | | | |||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  26848595 aaactgaatctagtgtcggtgcccctgaaactaatgaacac 26848555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 393
Target Start/End: Original strand, 28098426 - 28098702
Alignment:
Q  117 tgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatga 216  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    ||||| ||||||||  |||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||  |    
T  28098426 tgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaagaccggaattaaaatcctggactcttcgatggccttgacaa 28098525  T
Q  217 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaacc 316  Q
    | ||| ||||||||  ||| |||   |||||||| || |  |||||||||||  ||| |||   ||||  |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  28098526 gggattgtgtgattctatcaccttcatgaagatctttatggtcaatgaaggtgcggactcctccgtcacaaagagctttgtagagatttccagtaaaacc 28098625  T
Q  317 gtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaag 393  Q
     ||||||||||| |||||||||||| | || ||||| |  || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  28098626 ataccgagtgtcggtgcccctaaaattaagaaacacgtcataggtgaatccataagagaatgaagagaaagaggaag 28098702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 383
Target Start/End: Original strand, 26341986 - 26342257
Alignment:
Q  112 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctt 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    ||||| ||||||||||| || || |  ||||| ||||| || || ||||||||||| ||    
T  26341986 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattgagaaaattggaatgaaaatcctggactcttcaatggcttt 26342085  T
Q  212 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgta 311  Q
    ||  |||||| |||||||||  || ||||  ||||| ||  | ||||||||||||||  ||| |||   ||||   |||||  | |||| |||||| |||    
T  26342086 gacaagtgattgtgtgattttgtcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtgcggactccaccgtcacatagagctctatagatattgccagta 26342185  T
Q  312 aaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagag 383  Q
    ||||| || |||||| || ||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||| || |||||||||    
T  26342186 aaaccatagcgagtgccaatgcccctaaaattgaggaacacatcatatgtgaatccatatgagaatgaagag 26342257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 370
Target Start/End: Original strand, 26893543 - 26893781
Alignment:
Q  132 agttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgattt 231  Q
    ||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |  || |||||  | ||  |||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  26893543 agttcttccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaggactggaatgtatatcatagactcttcaattgccttgataagtgatggtgagattt 26893642  T
Q  232 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagt 331  Q
    | || ||||| ||||| ||  | |||||||||||||| || |||||  | |||  |||||| || || ||||  |||||||||||  | ||||||||||     
T  26893643 cgtcacctctatgaagctctgtatcatcaatgaaggtgtgaattccactatcacaaagagctttataaagatgacccgtaaaaccaaaacgagtgtcaga 26893742  T
Q  332 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccata 370  Q
    ||| |||||| ||||||| || | ||| |||||||||||    
T  26893743 gcctctaaaattgaggaagacatcgtaggtgaatccata 26893781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 385
Target Start/End: Original strand, 28297765 - 28298038
Alignment:
Q  112 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctt 211  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||||  |||    
T  28297765 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgctt 28297864  T
Q  212 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgta 311  Q
    ||  ||||||||||| ||||| || |||| || ||| ||  ||||||||||||||||  | ||||||||   |  |||| | |||| |||||| ||  ||    
T  28297865 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcctacaaagatctttgtggagatttccaata 28297964  T
Q  312 aaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagagga 385  Q
    |||| ||| || |||||| | || |||||||| ||||| || |  | |||||||||||| || || ||||||||    
T  28297965 aaactgtagcgtgtgtcactacctctaaaacttaggaaaacgtcatgagtgaatccataggagaaggaagagga 28298038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28514308 - 28514035
Alignment:
Q  112 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctt 211  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||||  |||    
T  28514308 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgctt 28514209  T
Q  212 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgta 311  Q
    ||  ||||||||||| ||||| || |||| || ||| ||  ||||||||||||||||  | ||||||||   |  |||| | |||| |||||| ||  ||    
T  28514208 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcctacaaagatctttgtggagatttccaata 28514109  T
Q  312 aaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagagga 385  Q
    |||| ||| || |||||| | || |||||||| ||||| || |  | |||||||||||| || || ||||||||    
T  28514108 aaactgtagcgtgtgtcactacctctaaaacttaggaaaacgtcatgagtgaatccataggagaaggaagagga 28514035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26937218 - 26936954
Alignment:
Q  123 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 222  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||| || ||||| ||   ||| |  || |||||||| |||||||  |||||||    
T  26937218 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaatacaggtatggcaatcccggaatcttcaattgccttgacaagtgatg 26937119  T
Q  223 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccg 322  Q
    |||||||||| |||||||  || || || |||||||||||||||||  | |||||    |||  |||||| ||||| ||||  ||  |||||  | | ||    
T  26937118 gtgtgatttcttctcctccatggagctccttgtcatcaatgaaggtgcgaattccacaatcacaaagagctttgtaaagatgaccaataaaatggaagcg 26937019  T
Q  323 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatg 387  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  26937018 agtgtcggtgcctctgaaactgaggaacacgtcataggtgaatccataagagaaggaagatgatg 26936954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29826082 - 29825958
Alignment:
Q  192 ctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagag 291  Q
    |||||||||| ||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||  ||||||| | ||||    
T  29826082 ctagattcttgaattgccttcacaagtgagggtgtgatttcgtcccctctttgaagctctttgtcatcaatgaaggtgcgaattttcttgtcagttagag 29825983  T
Q  292 ccttgtagagattgcccgtaaaacc 316  Q
    | |||||||||||||| ||||||||    
T  29825982 ctttgtagagattgccggtaaaacc 29825958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26635739 - 26635585
Alignment:
Q  198 tcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgt 297  Q
    |||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||  |||||| || |    
T  26635739 tcttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttat 26635640  T
Q  298 agagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 352  Q
    |||| || || || |||||| |  ||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  26635639 agaggttaccggtgaaaccgaattgagtgtcggtgcccctgaaactaatgaacac 26635585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26741705 - 26741551
Alignment:
Q  198 tcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgt 297  Q
    |||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||  |||||| || |    
T  26741705 tcttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttat 26741606  T
Q  298 agagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 352  Q
    |||| || || || |||||| |  ||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  26741605 agaggttaccggtgaaaccgaattgagtgtcggtgcccctgaaactaatgaacac 26741551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 25071718 - 25071554
Alignment:
Q  188 aattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaata 287  Q
    |||||| || |||||||||  ||||  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |    
T  25071718 aattctcgaatcttcaatgctcttgcggagcgaaggtgtgatttcgtcacctctcttaagctctttgtcatcaataaaggtgtggattcctttgtcagaa 25071619  T
Q  288 agagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 352  Q
    ||||| || || ||||| || ||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  25071618 agagctttataaagattaccggtaaaaccgaatcgagtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 25071554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26949720 - 26949580
Alignment:
Q  188 aattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaata 287  Q
    |||||| |||||||||||   ||||| |||||| ||||||||||| || ||| | ||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||       
T  26949720 aattctcgattcttcaattctcttgaggagtgaaggtgtgatttcgtcacctttctgaagctccttatcatcaatgaaggttcggattcccttgtcagag 26949621  T
Q  288 agagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtc 328  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||| | ||||||||    
T  26949620 agagctttatagagattaccggtgaaaccgaatcgagtgtc 26949580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27214440 - 27214312
Alignment:
Q  224 tgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccga 323  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||||||| || || |||||||  |||    
T  27214440 tgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcga 27214341  T
Q  324 gtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 352  Q
    ||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  27214340 gtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27214312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 352
Target Start/End: Original strand, 27234788 - 27234916
Alignment:
Q  224 tgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccga 323  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||||||| || || |||||||  |||    
T  27234788 tgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcga 27234887  T
Q  324 gtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 352  Q
    ||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  27234888 gtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27234916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26617351 - 26617266
Alignment:
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcc 307  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| || |||||||||||    
T  26617351 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagattgcc 26617266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26723279 - 26723194
Alignment:
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcc 307  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| || |||||||||||    
T  26723279 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagattgcc 26723194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26959190 - 26959069
Alignment:
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||  |||||| || ||||| || || || |||| | | |    
T  26959190 ggtgtgatttcatccccttttttaagctctttgtcatcaatgaaggtgtcgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtgaaactgaatc 26959091  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaact 343  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  26959090 gagtgtcggtgcccctgaaact 26959069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 352
Target Start/End: Original strand, 27665272 - 27665409
Alignment:
Q  215 gagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaa 314  Q
    |||||| ||||||||||| || ||  || |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||| || || || |||    
T  27665272 gagtgaaggtgtgatttcgtcaccagttggaagctccttgtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaaagagccttatagaggttaccggtgaaa 27665371  T
Q  315 ccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 352  Q
    ||  | |||||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  27665372 ccaaatcgagtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27665409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26811556 - 26811453
Alignment:
Q  200 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtag 299  Q
    |||||||  ||||| ||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||    
T  26811556 ttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatag 26811457  T
Q  300 agat 303  Q
    ||||    
T  26811456 agat 26811453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2184442 - 2184288
Alignment:
Q  93 aggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattc 192  Q
    ||||| ||||||| |||  || || |||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||  | || || ||||| || |||||||    
T  2184442 aggcgtccctttgacttggagtaacgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagttctttgagaaaacagggatgaaaattc 2184343  T
Q  193 tagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaag 247  Q
    | || ||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| | |||| ||||||    
T  2184342 tggactcttcaatggctttcataagtgatgctgttatttcaccccctcgttgaag 2184288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 485
Target Start/End: Original strand, 27338450 - 27338482
Alignment:
Q  453 agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27338450 agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 27338482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 485
Target Start/End: Original strand, 27399190 - 27399222
Alignment:
Q  453 agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27399190 agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 27399222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 284
Target Start/End: Original strand, 28491660 - 28491744
Alignment:
Q  200 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 284  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || | ||| || ||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  28491660 ttcaatggctttgatgagtgatggtgtgatttcttcacctttttgaagctcctcgtcgtccatgaaagtacggactcctttgtca 28491744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 284
Target Start/End: Original strand, 29804070 - 29804154
Alignment:
Q  200 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 284  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || | ||| || ||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  29804070 ttcaatggctttgatgagtgatggtgtgatttcttcacctttttgaagctcctcgtcgtccatgaaagtacggactcctttgtca 29804154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2185051 - 2184880
Alignment:
Q  94 ggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattct 193  Q
    |||| ||||||| |||  ||||| |||| || || |||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||   | || || ||||| || ||||||||    
T  2185051 ggcgtccctttgacttggagcaacgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtcctttgagaaaacagggatgaaaattct 2184952  T
Q  194 agattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 265  Q
     |||||||||||||| || |  || |||||||| |||||| | |||| |||||| || | |||||| |||||    
T  2184951 ggattcttcaatggctttcacaagcgatggtgttatttcaccccctcgttgaagctcttcgtcatccatgaa 2184880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29467876 - 29467797
Alignment:
Q  198 tcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcc 277  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || |  ||||| |||||||| || |||||    
T  29467876 tcttcaatagctttgatgagtgatggtgtgatttcttcgcctttttgaagttcttcatcatccatgaaggtgtgaattcc 29467797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26975101 - 26974971
Alignment:
Q  198 tcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgt 297  Q
    |||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| || ||| ||| ||| || ||||||||||||||| | | |||||| ||||||  |||||| || |    
T  26975101 tcttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcgtccccttttttaagctccttgtcatcaatgaagatgttgattcctttgtcagaaagagctttat 26975002  T
Q  298 agagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtc 328  Q
    |||| || || || |||||| | ||||||||    
T  26975001 agaggttaccggtgaaaccgaatcgagtgtc 26974971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Original strand, 13594 - 14056
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13594 atgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaat 13693  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13694 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgat 13793  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  13794 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggc 13893  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||| |||    
T  13894 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgataattgagag 13993  T
Q  422 aaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    ||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13994 aaattggatg-aaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgtttttgtggtctgtg 14056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Original strand, 4633 - 5100
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    ||||||||||||| |||| | |  |||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4633 atgcttcaccataactacctttcagatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaat 4732  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||    
T  4733 tatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaaaggcatagaagatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgcggagggat 4832  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |    
T  4833 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggc 4932  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgag 421  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||| |||    
T  4933 gagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagag 5032  T
Q  422 aaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatg-----aatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    ||||||||||       |||||||||||| |||||||||     ||||| |||||||||||||||||||    
T  5033 aaattggatg-aaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatttaatgaataagtttttgtggtctgtg 5100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 7750 - 7295
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  7750 atgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttctgtcttgtagcaatgaat 7651  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7650 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgat 7551  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  7550 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggc 7451  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgag 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||| |||    
T  7450 gagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgagaattgagag 7351  T
Q  422 aaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    ||||| ||||       |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7350 aaattagatg-aaaaaagagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 22 - 484
Target Start/End: Original strand, 3383 - 3844
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    ||||||||||||| |||| | || |||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3383 atgcttcaccataactacctttacgatgtcgcacaatagtaggttccacaccaaataaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaat 3482  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatag-ttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtga 220  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3483 gatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtga 3582  T
Q  221 tggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtac 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  3583 tggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgc 3682  T
Q  321 cgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtga 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| ||    
T  3683 cgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgacaattgaga 3782  T
Q  421 gaaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgt 484  Q
    ||||| |||||       |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3783 gaaataggatg-aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatg-gtaaatttttgtggtctgt 3844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 22 - 474
Target Start/End: Original strand, 14318 - 14767
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    ||||||||||||| |||| | | ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14318 atgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaat 14417  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14418 tatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaa-aggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgat 14516  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  14517 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgcc 14616  T
Q  322 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||    
T  14617 gagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagag 14716  T
Q  422 aaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttt 474  Q
    |||| |||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14717 aaataggatg--aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttt 14767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 320 - 485
Target Start/End: Original strand, 8061 - 8225
Alignment:
Q  320 ccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtg 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |    
T  8061 ccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgag 8160  T
Q  420 agaaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    |||||| |||||       ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  8161 agaaataggatg-aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtgaatttttgtgttctgtg 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 144 - 485
Target Start/End: Original strand, 1 - 334
Alignment:
Q  144 caaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctcttt 243  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 caaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttt 100  T
Q  244 gaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaact 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  101 gaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaact 200  T
Q  344 gaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaattggatgnnnnnnngagtt 443  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||       |||||    
T  201 aaggaacacttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaattagatg-aaaaaagagtt 299  T
Q  444 tgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  300 tg-------agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 59 - 483
Target Start/End: Original strand, 18699386 - 18699807
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  18699386 agtaggatctacgccatagaaaacaggcaaaacgagacgaccttttgtcttgtagcagtgaatgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagag 18699485  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| || ||||| || |||  |||||    
T  18699486 gcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtcat 18699585  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18699586 caatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcagtgcccctgaagctgaggaacacttggta 18699685  T
Q  359 agtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaata 458  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||| | ||||       ||||||||||||||||||||    
T  18699686 agtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaactagatg-aaaaaagagtttgagaatgcagaata 18699784  T
Q  459 tgaatgagtaagtttttgtggtctg 483  Q
    |||  |  |||||||||||||||||    
T  18699785 tga--ggttaagtttttgtggtctg 18699807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 61 - 485
Target Start/End: Original strand, 18731492 - 18731913
Alignment:
Q  61 taggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggc 160  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  18731492 taggatccacgccatagaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggc 18731591  T
Q  161 atagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  |||||||    
T  18731592 atagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatca 18731691  T
Q  261 atgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaag 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18731692 atgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctctgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaag 18731791  T
Q  361 tgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatg 460  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  18731792 tgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgaaaatcgagagaaactggatg-aaaaaagagtttgagaatgcagaatatg 18731890  T
Q  461 aatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    |  |  |||||||||||||| ||||    
T  18731891 a--gtttaagtttttgtggtatgtg 18731913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 59 - 485
Target Start/End: Original strand, 18655463 - 18655886
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  18655463 agtaggatccacgccatagaaaacaggaaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgcggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagag 18655562  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||| || ||||| || |||  |||||    
T  18655563 gcatagttgatagaaaacacaggaataaagatcctagactcttgaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcagctcacggtcat 18655662  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  18655663 caatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatgcccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggta 18655762  T
Q  359 agtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaata 458  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||       ||||||||||||||||||||    
T  18655763 agtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcctagccatgaaaattgagagaaactggatg-aaaaaagagtttgagaatgcagaata 18655861  T
Q  459 tgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    |||  |  |||||||||||||| ||||    
T  18655862 tga--gtttaagtttttgtggtatgtg 18655886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 59 - 485
Target Start/End: Original strand, 18679553 - 18679976
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  18679553 agtaggatccacgacatagaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagag 18679652  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  |||||    
T  18679653 gcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcat 18679752  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 358  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  18679753 caatgaaggtgtggattcctttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggta 18679852  T
Q  359 agtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaata 458  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||       ||||||||||||||||||||    
T  18679853 agtgaatcgataggaaaatgaagagaatgaggaaggtgattgcatagccatgaaaatagagagaaactggatg-aaaaaagagtttgagaatgcagaata 18679951  T
Q  459 tgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 485  Q
    |||  |  |||||||||||||| ||||    
T  18679952 tga--gtttaagtttttgtggtatgtg 18679976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 61 - 417
Target Start/End: Original strand, 18724073 - 18724429
Alignment:
Q  61 taggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggc 160  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||| ||| ||||||   ||||||||    
T  18724073 taggatccacgccatagaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgttcaaacaaaatgaagaagaggc 18724172  T
Q  161 atagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  |||||||    
T  18724173 atagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatca 18724272  T
Q  261 atgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaag 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18724273 atgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaag 18724372  T
Q  361 tgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattg 417  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  18724373 tgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgagaattg 18724429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18073987 - 18073535
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||||| |||||    
T  18073987 atgctttaccatacctacctgtatgatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaat 18073888  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
     ||||| ||||||  |||||| ||| ||   ||||| |||||||||  |||||| |  ||||| ||||| || |||||||||||     ||||      |    
T  18073887 gatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaataa---tgat------t 18073797  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatc------aatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaac 315  Q
    ||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||      |  ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  18073796 ggtgtgactttgtctcttctttgaagatcactgtcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaac 18073697  T
Q  316 cgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaat 415  Q
    ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||||  || ||||  | ||||| ||||||| |||    
T  18073696 cgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaat 18073597  T
Q  416 tgtgagaaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggt 480  Q
    || |||||||  ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18073596 tgagagaaataagatg---agaagagtttgagaatgcagaatatgaatgaggatgtttttgtggt 18073535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 249 - 480
Target Start/End: Original strand, 17989226 - 17989454
Alignment:
Q  249 tcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgagga 348  Q
    |||| |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| || || ||||||    
T  17989226 tcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgagga 17989325  T
Q  349 acacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaattggatgnnnnnnngagtttgaga 448  Q
    |||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||||  || ||||  | ||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||       ||||||||||    
T  17989326 acacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg---agaagagtttgaga 17989422  T
Q  449 atgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggt 480  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17989423 atgcagaatatgaatgaggatgtttttgtggt 17989454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 343
Target Start/End: Original strand, 5090945 - 5091237
Alignment:
Q  51 cgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaatt 150  Q
    ||||||| || ||| ||||||||| |||||| |||||| || |||| ||| |||  |||  |||| |||||||| || |||||||| || || |||||      
T  5090945 cgcacatgagaaggttccacaccatagaaaataggcaaaaccaggcaaccattttccttggagcagtgaataatatggacaagttcatctaaacaaaacg 5091044  T
Q  151 ttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatc 250  Q
      ||||| ||||||| | |||| || ||   ||| | |||  ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||  |||||||  ||||| ||    
T  5091045 aagaagaagcatagtggttagagaaaacgataatgacaatcttagattcttgaatggccttgagaagtgacggtgttatttggtctcctcgctgaagctc 5091144  T
Q  251 attgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaact 343  Q
      |||||||||||||||| || ||||||||| ||   ||||| |  |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  5091145 tctgtcatcaatgaaggtgtgaattcccttgacacgtagagcttcatagagatttccagtaaaaccgtaacgagtgtcggtgcctctaaaact 5091237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 41 - 431
Target Start/End: Original strand, 28164331 - 28164720
Alignment:
Q  41 tgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtcc 140  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  28164331 tgtatgatgtcgcacatcagtaggatccacgccaa-gaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtcc 28164429  T
Q  141 aagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctc 240  Q
    || ||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  28164430 aaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagataacacaggaataaaaattcaagatttttcaatggccttgatgaatgacggtgtgatttcttctcctc 28164529  T
Q  241 tttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaa 340  Q
    | | |||||||   ||||||||||| || || |||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  28164530 tctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaattcccttgtcgtcaagggccttatagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctaaa 28164629  T
Q  341 actgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaattggatg 431  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||  | |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  28164630 actgaggaacacttggtatgtgaatccataggaaattgaagaggaagaggaatgcgatcgtatagccatgagaattgacagaaattggatg 28164720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 385
Target Start/End: Original strand, 28127631 - 28127992
Alignment:
Q  25 cttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataat 124  Q
    |||||||||| || | ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  28127631 cttcaccataactccctgtatgatatcgcacatcagtaggatccacgccaaagaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgat 28127730  T
Q  125 gtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggt 224  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||    
T  28127731 gtgcacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggtagaaaatacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctttaaaagtgacggt 28127830  T
Q  225 gtgatttcat-ctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccga 323  Q
    |||||||  | ||||||| | ||||| |   ||||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| || |||||||  |||    
T  28127831 gtgatttttttctcctctctcaagattacaatcatcaatgaatgtgtggattcccttgtcataaagggccttgtagagatggccagtgaaaccgtcacga 28127930  T
Q  324 gtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagagga 385  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  28127931 gtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtatgtgaatccataggaaattgaagagga 28127992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 59 - 411
Target Start/End: Original strand, 268343 - 268695
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||||||||| ||| |||| || ||||| | ||| ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  268343 agtaggatccacgccatagaagacgggcaaaatgagacgaccctttttcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagag 268442  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||   ||||    
T  268443 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcat 268542  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| |  |||||||||  ||| || ||  ||||||| || |||||    
T  268543 caatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccctcacgagtgtcaccgcctctgaagttgaggaagacctggta 268642  T
Q  359 agtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatga 411  Q
     |  |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  268643 ggcaaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatga 268695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 59 - 411
Target Start/End: Original strand, 29273769 - 29274121
Alignment:
Q  59 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 158  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  29273769 agtaggatccacgccatagaagacaggcaaaatgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagag 29273868  T
Q  159 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   ||||    
T  29273869 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagactcttcaatgacattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcat 29273968  T
Q  259 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||  ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  29273969 caatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagtcttgtagagatggccaataaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggta 29274068  T
Q  359 agtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatga 411  Q
    |||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  29274069 agtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatga 29274121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31903882 - 31903727
Alignment:
Q  216 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaac 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| || |||||||    
T  31903882 agtgatggtgtgatttcatgtcctctttgaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataaagagctttgtagagatttccagtaaaac 31903783  T
Q  316 cgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataa 371  Q
    | || ||||||||   ||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  31903782 catagcgagtgtctaagcctctaaagctgaggaacacatcgtaggtgaatccataa 31903727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 59795 - 59343
Alignment:
Q  22 atgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaat 121  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||||| |||||    
T  59795 atgctttaccatacctacctgtatgatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaat 59696  T
Q  122 aatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgat 221  Q
     ||||| ||||||  |||||| ||| ||   ||||| |||||||||  |||||| |  ||||| ||||| || |||||||||||     ||||      |    
T  59695 gatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaataa---tgat------t 59605  T
Q  222 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatc------aatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaac 315  Q
    ||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||      |  ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  59604 ggtgtgactttgtctcttctttgaagatcactgtcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaac 59505  T
Q  316 cgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaat 415  Q
    ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||||  || ||||  | ||||| ||||||| |||    
T  59504 cgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaat 59405  T
Q  416 tgtgagaaattggatgnnnnnnngagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggt 480  Q
    || |||||||  ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  59404 tgagagaaataagatg---agaagagtttgagaatgcagaatatgaatgaggatgtttttgtggt 59343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 112 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 34860 - 34602
Alignment:
Q  112 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctt 211  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34860 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 34761  T
Q  212 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgta 311  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  | ||||||||  | |||    
T  34760 gaaaagtgatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggta 34661  T
Q  312 aaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccata 370  Q
    ||||| || ||||||||| | || |||||||| |||||||| |  || |||||||||||    
T  34660 aaaccatagcgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccata 34602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 112 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27583 - 27313
Alignment:
Q  112 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctt 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27583 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgacctt 27484  T
Q  212 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgta 311  Q
    ||  ||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||  | ||||||| ||| || || |||||||| | |  |||| |  |||||||||| || |||    
T  27483 gaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagta 27384  T
Q  312 aaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaaga 382  Q
    ||||| || ||||||||| | || |||||||| |||||||| |  || |||||||||||||| || |||||    
T  27383 aaaccataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataagagaaggaaga 27313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 112 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 116931 - 116658
Alignment:
Q  112 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctt 211  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    ||||| ||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  116931 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 116832  T
Q  212 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgta 311  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||   |  |||| | ||||||||||| || |||    
T  116831 gaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagta 116732  T
Q  312 aaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagagga 385  Q
    ||||| || ||||||||| | || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  116731 aaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaagagga 116658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 43156 - 42864
Alignment:
Q  57 ttagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaag 156  Q
    |||| ||| |||||| || ||||||  ||||| || ||||| || ||| ||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||    
T  43156 ttagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactaggcgtccatttttcttgcagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaag 43057  T
Q  157 aggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtc 256  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||| | |||| ||  ||||    
T  43056 aagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtc 42957  T
Q  257 atcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaa 349  Q
    ||||||||||||  | |||||||| | |  |||| | ||||||||||| || |||||||| || ||||||||| | || |||||||| |||||    
T  42956 atcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 42864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 112 - 385
Target Start/End: Original strand, 58334 - 58607
Alignment:
Q  112 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctt 211  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||   ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  58334 agcagtgaatgatgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggcctt 58433  T
Q  212 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgta 311  Q
    ||  ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  |||||||||| || |||    
T  58434 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctgtagagatttccagta 58533  T
Q  312 aaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagagga 385  Q
    ||||| || |||||||||   || ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||    
T  58534 aaaccatagcgagtgtcacaacctctaaagctaaggaacacgtgataggtgaatccataggagaaggaagagga 58607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3279823 - 3279562
Alignment:
Q  112 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctt 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||  | || ||||| ||||||||    
T  3279823 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggcctt 3279724  T
Q  212 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgta 311  Q
    ||  |||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||  | ||||||||||||||   || |||   |||| | | |||  | |||||||| || |||    
T  3279723 gacaagtgattgtgtgatttcatcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtgcagaatccaccgtcacttaaagctctatagagatttccagta 3279624  T
Q  312 aaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataaga 373  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| || |  || ||||||||||||||    
T  3279623 aaaccatagcgagtgtcagtgcccctaaaactcaagaatacgtcataggtgaatccataaga 3279562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 409
Target Start/End: Original strand, 17993812 - 17994033
Alignment:
Q  188 aattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaata 287  Q
    |||||| || |||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||  | ||||||||||||  |    
T  17993812 aattcttgagtcttcaatgctcttgaggagcgacggtgtgatttcatcacctctctgaagctctttgtcatcgatgaaggttcgaattcccttgtcagaa 17993911  T
Q  288 agagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatg 387  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||| || || ||||| ||||| | |||||| | | |  |||| |||||||| || || || || |    
T  17993912 agagctttatagagattaccggtgaaaccatatcgagtatcggtacccctgaaactaatgaacacatcgaagctgaaaccataagataaggaggaagagg 17994011  T
Q  388 aggaaggagactgcatagccat 409  Q
    ||||||| || |||||||||||    
T  17994012 aggaaggtgattgcatagccat 17994033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16689060 - 16688944
Alignment:
Q  198 tcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgt 297  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || |||||||||||||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||    
T  16689060 tcttcaattgccttgataagtgatggtgtgattttgtcacctctctgaagttccttgtcatcaatgaagacacggattcccttgtcacatagagctttgt 16688961  T
Q  298 agagattgcccgtaaaa 314  Q
    | ||||| || ||||||    
T  16688960 acagattaccagtaaaa 16688944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University