View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8929_high_3 (Length: 423)

Name: NF8929_high_3
Description: NF8929
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8929_high_3
NF8929_high_3
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-405)||(19716502-19716906)
chr2 (2-408)||(23274144-23274550)
chr2 (1-301)||(19721065-19721365)
chr2 (1-406)||(23097503-23097908)
chr2 (2-409)||(20848139-20848546)
chr2 (1-405)||(12576907-12577311)
chr2 (173-406)||(23113276-23113508)
chr2 (227-399)||(11351422-11351594)
chr2 (227-402)||(22733485-22733660)
chr2 (227-402)||(23074420-23074595)
chr2 (185-399)||(21322935-21323149)
chr2 (227-399)||(9338142-9338314)
chr2 (227-399)||(9486776-9486948)
chr2 (227-399)||(16983800-16983972)
chr2 (227-399)||(17001560-17001732)
chr2 (227-399)||(22742677-22742849)
chr2 (227-399)||(23064973-23065145)
chr2 (257-402)||(23105469-23105614)
chr2 (251-408)||(24817575-24817732)
chr2 (227-399)||(22323053-22323225)
chr2 (227-399)||(24705193-24705365)
chr2 (227-399)||(24712594-24712766)
chr2 (227-399)||(44383281-44383453)
chr2 (230-399)||(27220576-27220745)
chr2 (246-399)||(27373829-27373982)
chr2 (214-399)||(45673710-45673895)
chr2 (227-399)||(10871410-10871582)
chr2 (227-399)||(24678047-24678219)
chr2 (246-399)||(23029191-23029344)
chr2 (227-304)||(30208631-30208708)
chr2 (227-399)||(24264930-24265102)
chr2 (227-399)||(24657369-24657541)
chr2 (227-399)||(24874461-24874633)
chr2 (174-304)||(19817502-19817632)
chr2 (246-399)||(21142771-21142924)
chr2 (227-399)||(23204874-23205046)
chr2 (225-293)||(22739363-22739431)
chr2 (224-293)||(22280771-22280840)
chr2 (227-294)||(23676583-23676650)
chr2 (2-108)||(28350726-28350832)
chr2 (248-293)||(25131275-25131320)
chr2 (338-399)||(41606209-41606269)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (1-408)||(22071-22478)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-408)||(8563-8970)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (2-408)||(14377007-14377413)
chr6 (1-406)||(18797476-18797881)
chr6 (2-408)||(19437786-19438192)
chr6 (2-408)||(24515505-24515911)
chr6 (5-408)||(19455807-19456210)
chr6 (5-402)||(10465942-10466339)
chr6 (1-406)||(21567081-21567486)
chr6 (5-389)||(19465971-19466355)
chr6 (2-409)||(24367183-24367590)
chr6 (1-406)||(34642676-34643081)
chr6 (4-408)||(15462120-15462524)
chr6 (5-406)||(21474386-21474787)
chr6 (64-406)||(25770630-25770972)
chr6 (183-406)||(19486566-19486789)
chr6 (227-402)||(23081213-23081388)
chr6 (278-402)||(20010821-20010945)
chr6 (227-402)||(18405260-18405435)
chr6 (185-393)||(5836502-5836710)
chr6 (230-406)||(18182686-18182862)
chr6 (227-410)||(30678340-30678523)
chr6 (214-399)||(22436662-22436847)
chr6 (227-399)||(29589755-29589927)
chr6 (227-399)||(2872118-2872290)
chr6 (227-399)||(16574683-16574855)
chr6 (227-399)||(16620525-16620697)
chr6 (227-399)||(16924956-16925128)
chr6 (181-399)||(23085095-23085313)
chr6 (227-399)||(28312423-28312595)
chr6 (227-399)||(24293098-24293270)
chr6 (227-399)||(27559285-27559457)
chr6 (253-399)||(19867480-19867626)
chr6 (227-399)||(28260513-28260685)
chr6 (227-399)||(28285231-28285403)
chr6 (227-399)||(28339262-28339434)
chr6 (230-399)||(27190229-27190398)
chr6 (230-399)||(27258842-27259011)
chr6 (227-399)||(25115345-25115517)
chr6 (227-294)||(22829702-22829769)
chr6 (248-293)||(16379710-16379755)
chr6 (248-293)||(16647306-16647351)
chr6 (2-110)||(16813722-16813830)
chr6 (248-293)||(16100914-16100959)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (1-408)||(8410-8817)
scaffold0235 (1-408)||(18624-19031)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-405)||(53371-53775)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (3-408)||(804-1209)
[»] chr4 (45 HSPs)
chr4 (1-408)||(16150556-16150963)
chr4 (1-408)||(16154702-16155109)
chr4 (5-406)||(20892953-20893354)
chr4 (2-409)||(44658812-44659219)
chr4 (2-409)||(11204178-11204585)
chr4 (1-405)||(51603737-51604141)
chr4 (2-409)||(3261740-3262147)
chr4 (1-401)||(53750415-53750815)
chr4 (5-408)||(14993316-14993719)
chr4 (2-409)||(29450483-29450890)
chr4 (4-406)||(27903307-27903709)
chr4 (2-368)||(15266736-15267102)
chr4 (5-402)||(15073285-15073682)
chr4 (2-315)||(7357280-7357593)
chr4 (232-402)||(14697027-14697197)
chr4 (185-402)||(14162396-14162613)
chr4 (175-402)||(15894-16121)
chr4 (317-408)||(15354301-15354392)
chr4 (5-140)||(18259629-18259764)
chr4 (227-399)||(17092060-17092232)
chr4 (227-399)||(8050534-8050706)
chr4 (227-399)||(12479529-12479701)
chr4 (227-399)||(14300890-14301062)
chr4 (227-399)||(14683496-14683668)
chr4 (227-399)||(16233903-16234075)
chr4 (227-399)||(19635065-19635237)
chr4 (227-399)||(23958676-23958848)
chr4 (227-396)||(8389344-8389513)
chr4 (227-399)||(16350465-16350637)
chr4 (227-399)||(19775704-19775876)
chr4 (227-399)||(27714265-27714437)
chr4 (253-399)||(15144829-15144975)
chr4 (209-271)||(15354229-15354291)
chr4 (246-399)||(18224376-18224529)
chr4 (227-399)||(40475969-40476141)
chr4 (227-393)||(13513285-13513451)
chr4 (227-328)||(16219188-16219289)
chr4 (227-328)||(16222508-16222609)
chr4 (338-399)||(16250872-16250933)
chr4 (364-408)||(15258847-15258891)
chr4 (248-293)||(14999681-14999726)
chr4 (230-294)||(18604733-18604797)
chr4 (350-399)||(14188435-14188484)
chr4 (248-293)||(15290350-15290395)
chr4 (257-293)||(18546820-18546856)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (1-404)||(164349-164752)
scaffold0023 (185-402)||(47115-47331)
scaffold0023 (253-399)||(30774-30920)
scaffold0023 (338-402)||(152036-152100)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (4-402)||(438-836)
scaffold0222 (2-408)||(20763-21169)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-408)||(98531-98938)
scaffold0020 (5-406)||(175939-176339)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (1-408)||(325656-326063)
scaffold0004 (192-411)||(200607-200826)
scaffold0004 (1-118)||(319482-319599)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (5-406)||(22027672-22028073)
chr8 (1-410)||(22053847-22054256)
chr8 (5-405)||(31413924-31414324)
chr8 (2-409)||(16268613-16269020)
chr8 (7-410)||(29300820-29301223)
chr8 (2-409)||(28983896-28984303)
chr8 (35-406)||(19985168-19985539)
chr8 (35-406)||(21928416-21928787)
chr8 (35-406)||(22373857-22374228)
chr8 (131-409)||(28989115-28989393)
chr8 (173-406)||(20391074-20391307)
chr8 (265-409)||(27357521-27357665)
chr8 (227-402)||(22421506-22421681)
chr8 (249-402)||(22523538-22523691)
chr8 (230-398)||(22375071-22375239)
chr8 (214-399)||(19980962-19981147)
chr8 (227-402)||(21253937-21254112)
chr8 (227-402)||(21391475-21391650)
chr8 (227-402)||(21780801-21780976)
chr8 (253-399)||(21164178-21164324)
chr8 (257-402)||(21785999-21786144)
chr8 (227-399)||(17671636-17671808)
chr8 (175-402)||(22990037-22990264)
chr8 (227-399)||(19115395-19115567)
chr8 (227-399)||(20015877-20016049)
chr8 (227-399)||(32603140-32603312)
chr8 (181-402)||(22245583-22245804)
chr8 (181-402)||(22246001-22246222)
chr8 (227-399)||(18859572-18859744)
chr8 (227-399)||(22031098-22031270)
chr8 (227-399)||(22117789-22117961)
chr8 (227-399)||(22126573-22126745)
chr8 (227-399)||(22042822-22042994)
chr8 (227-399)||(30310758-30310930)
chr8 (227-384)||(19481686-19481843)
chr8 (227-399)||(15536378-15536550)
chr8 (227-399)||(22129231-22129403)
chr8 (248-293)||(20649990-20650035)
chr8 (248-293)||(21847972-21848017)
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (1-406)||(14283306-14283711)
chr7 (3-408)||(13676361-13676766)
chr7 (5-405)||(16947408-16947808)
chr7 (1-406)||(11385361-11385766)
chr7 (2-409)||(13965601-13966008)
chr7 (2-408)||(15099536-15099942)
chr7 (36-405)||(13024258-13024626)
chr7 (5-402)||(12459544-12459941)
chr7 (5-410)||(21755320-21755725)
chr7 (2-409)||(26091731-26092138)
chr7 (82-406)||(14140591-14140915)
chr7 (2-409)||(40924750-40925157)
chr7 (5-408)||(12798437-12798840)
chr7 (2-409)||(49155210-49155617)
chr7 (1-405)||(18050885-18051289)
chr7 (2-409)||(26115523-26115930)
chr7 (2-406)||(19149923-19150327)
chr7 (2-406)||(20749322-20749726)
chr7 (2-406)||(14261179-14261583)
chr7 (174-406)||(15343343-15343575)
chr7 (2-406)||(12203733-12204137)
chr7 (1-253)||(12712595-12712847)
chr7 (229-399)||(15146105-15146275)
chr7 (227-399)||(14957472-14957644)
chr7 (227-399)||(44788531-44788703)
chr7 (227-399)||(8710523-8710695)
chr7 (227-399)||(11550282-11550454)
chr7 (175-402)||(14042610-14042837)
chr7 (227-399)||(14335314-14335486)
chr7 (175-402)||(14352640-14352867)
chr7 (227-399)||(9591282-9591454)
chr7 (227-399)||(11234393-11234565)
chr7 (227-399)||(13688959-13689131)
chr7 (227-399)||(18587351-18587523)
chr7 (174-397)||(15627444-15627667)
chr7 (227-402)||(18180658-18180833)
chr7 (1-105)||(14144874-14144978)
chr7 (227-399)||(15158237-15158409)
chr7 (227-399)||(17703635-17703807)
chr7 (338-399)||(8200966-8201027)
chr7 (227-399)||(12690420-12690591)
chr7 (345-399)||(10873608-10873662)
chr7 (248-293)||(4442951-4442996)
chr7 (248-293)||(7826924-7826969)
chr7 (248-293)||(13459057-13459102)
chr7 (227-304)||(16726621-16726698)
chr7 (248-293)||(27104975-27105020)
chr7 (248-293)||(27173305-27173350)
chr7 (248-293)||(14207343-14207388)
chr7 (248-293)||(14216033-14216078)
chr7 (257-293)||(38356-38392)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (1-406)||(64550-64955)
scaffold0067 (1-406)||(49128-49533)
scaffold0067 (1-406)||(58162-58567)
scaffold0067 (2-408)||(29573-29979)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (2-408)||(9721-10127)
scaffold0243 (227-402)||(24119-24294)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (1-408)||(53996-54403)
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (1-408)||(31941452-31941859)
chr3 (2-408)||(31692359-31692765)
chr3 (1-406)||(16831701-16832106)
chr3 (5-408)||(12357704-12358107)
chr3 (1-408)||(18131520-18131926)
chr3 (5-406)||(16326886-16327287)
chr3 (1-406)||(17188925-17189330)
chr3 (5-407)||(12180894-12181296)
chr3 (10-403)||(11949107-11949500)
chr3 (1-406)||(24189855-24190260)
chr3 (5-408)||(17494195-17494598)
chr3 (5-406)||(11958358-11958759)
chr3 (1-405)||(8744563-8744967)
chr3 (2-409)||(47126492-47126899)
chr3 (2-406)||(10408519-10408923)
chr3 (1-405)||(13944576-13944980)
chr3 (2-408)||(28756868-28757274)
chr3 (2-406)||(14290706-14291110)
chr3 (5-408)||(16825456-16825861)
chr3 (8-408)||(10417225-10417625)
chr3 (157-380)||(13317863-13318086)
chr3 (193-405)||(16378299-16378511)
chr3 (214-406)||(12509869-12510061)
chr3 (173-406)||(12857841-12858073)
chr3 (248-408)||(12272887-12273047)
chr3 (8-406)||(15230154-15230552)
chr3 (8-406)||(15236022-15236420)
chr3 (2-299)||(35982839-35983136)
chr3 (1-177)||(16384545-16384721)
chr3 (311-408)||(14575535-14575632)
chr3 (227-402)||(12843513-12843688)
chr3 (227-402)||(15262175-15262350)
chr3 (227-399)||(15345655-15345827)
chr3 (227-399)||(16638321-16638493)
chr3 (227-399)||(43165223-43165395)
chr3 (227-399)||(48427995-48428167)
chr3 (174-399)||(15013115-15013340)
chr3 (227-399)||(10008148-10008320)
chr3 (227-399)||(10908758-10908930)
chr3 (227-399)||(12889257-12889429)
chr3 (227-399)||(13255238-13255410)
chr3 (246-406)||(15065612-15065772)
chr3 (227-399)||(15358631-15358803)
chr3 (227-399)||(15713466-15713638)
chr3 (227-399)||(24185738-24185910)
chr3 (227-399)||(3688491-3688663)
chr3 (227-399)||(15586802-15586974)
chr3 (227-397)||(14578818-14578988)
chr3 (246-399)||(14873997-14874150)
chr3 (227-399)||(15399927-15400099)
chr3 (227-399)||(16754111-16754283)
chr3 (227-399)||(20059464-20059636)
chr3 (227-399)||(6603283-6603455)
chr3 (227-399)||(16694712-16694884)
chr3 (227-399)||(16804357-16804529)
chr3 (227-399)||(26790823-26790995)
chr3 (227-399)||(53382428-53382600)
chr3 (246-399)||(5422359-5422512)
chr3 (5-126)||(13317746-13317867)
chr3 (319-402)||(17492396-17492479)
chr3 (227-288)||(11861033-11861094)
chr3 (1-129)||(12501751-12501879)
chr3 (248-293)||(8271830-8271875)
chr3 (248-293)||(13964786-13964831)
chr3 (227-304)||(23079427-23079504)
chr3 (248-293)||(30150021-30150066)
chr3 (248-293)||(15944026-15944071)
chr3 (248-293)||(22150168-22150213)
chr3 (2-110)||(2037086-2037194)
chr3 (2-110)||(2040827-2040935)
chr3 (2-66)||(11861234-11861298)
chr3 (2-110)||(14039593-14039701)
chr3 (1-33)||(23414974-23415006)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (5-408)||(5161-5564)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (1-408)||(6987-7394)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (1-406)||(203332-203737)
scaffold0003 (227-399)||(424266-424438)
scaffold0003 (82-161)||(424504-424583)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (5-405)||(23078036-23078436)
chr5 (2-409)||(22505512-22505919)
chr5 (5-408)||(23563299-23563702)
chr5 (2-409)||(20345115-20345522)
chr5 (2-409)||(25850905-25851312)
chr5 (2-409)||(14884119-14884526)
chr5 (1-405)||(17266461-17266865)
chr5 (8-399)||(20824296-20824687)
chr5 (146-408)||(28892214-28892476)
chr5 (146-402)||(20778753-20779009)
chr5 (8-402)||(22464790-22465184)
chr5 (173-406)||(21983476-21983709)
chr5 (173-406)||(21561324-21561557)
chr5 (174-399)||(21631699-21631924)
chr5 (227-402)||(25429279-25429454)
chr5 (227-402)||(26736080-26736255)
chr5 (185-402)||(23474053-23474270)
chr5 (227-399)||(16359363-16359535)
chr5 (227-399)||(21882635-21882807)
chr5 (227-399)||(29473426-29473598)
chr5 (227-399)||(34569355-34569527)
chr5 (227-399)||(40711641-40711813)
chr5 (227-399)||(14997092-14997264)
chr5 (227-399)||(18781975-18782147)
chr5 (227-399)||(22330240-22330412)
chr5 (227-399)||(27521267-27521439)
chr5 (227-399)||(37288849-37289021)
chr5 (227-399)||(41773703-41773875)
chr5 (227-399)||(19772821-19772993)
chr5 (227-399)||(27613217-27613389)
chr5 (227-399)||(27682753-27682925)
chr5 (227-328)||(21332339-21332440)
chr5 (227-395)||(22350784-22350952)
chr5 (227-399)||(23460832-23461004)
chr5 (227-399)||(27665843-27666015)
chr5 (246-399)||(20803458-20803611)
chr5 (227-399)||(22137529-22137701)
chr5 (214-304)||(21410090-21410180)
chr5 (338-399)||(21342878-21342939)
chr5 (227-359)||(23525952-23526084)
chr5 (248-293)||(23508633-23508678)
chr5 (248-293)||(24584159-24584204)
chr5 (8-69)||(28892076-28892137)
chr5 (2-110)||(16258164-16258272)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (5-405)||(24096636-24097036)
chr1 (1-408)||(20832917-20833324)
chr1 (5-405)||(19857243-19857643)
chr1 (5-409)||(52988706-52989110)
chr1 (2-401)||(20074727-20075126)
chr1 (5-408)||(22015766-22016169)
chr1 (2-406)||(21739054-21739458)
chr1 (2-409)||(48425838-48426245)
chr1 (2-409)||(38909844-38910251)
chr1 (2-409)||(31537015-31537422)
chr1 (2-409)||(37680014-37680421)
chr1 (2-409)||(20297346-20297755)
chr1 (2-406)||(21742570-21742974)
chr1 (173-408)||(18710351-18710586)
chr1 (8-402)||(20853784-20854178)
chr1 (5-266)||(21961135-21961396)
chr1 (227-406)||(16379031-16379210)
chr1 (227-402)||(21751988-21752163)
chr1 (227-399)||(22496499-22496671)
chr1 (336-409)||(12200483-12200556)
chr1 (227-399)||(16347838-16348010)
chr1 (227-399)||(20081619-20081791)
chr1 (227-399)||(24785100-24785272)
chr1 (227-399)||(51330735-51330907)
chr1 (246-399)||(33388291-33388444)
chr1 (227-399)||(17042258-17042430)
chr1 (227-399)||(21833246-21833418)
chr1 (227-399)||(21842156-21842328)
chr1 (227-399)||(19109312-19109484)
chr1 (227-384)||(41350911-41351068)
chr1 (232-288)||(21045372-21045428)
chr1 (227-375)||(21228799-21228947)
chr1 (248-293)||(20828656-20828701)
chr1 (248-293)||(20928104-20928149)
chr1 (227-304)||(22401631-22401708)
chr1 (227-282)||(22435976-22436031)
chr1 (248-293)||(20528103-20528148)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-406)||(263177-263582)
[»] scaffold0010 (5 HSPs)
scaffold0010 (2-409)||(39282-39689)
scaffold0010 (282-408)||(44656-44782)
scaffold0010 (191-402)||(4870-5081)
scaffold0010 (227-399)||(14382-14554)
scaffold0010 (8-165)||(180794-180951)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (2-409)||(514302-514709)
scaffold0001 (185-402)||(495975-496192)
scaffold0001 (251-408)||(441602-441759)
scaffold0001 (97-149)||(441860-441912)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (36-405)||(5128-5497)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (1-406)||(9735-10139)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (2-408)||(1901-2307)
scaffold0034 (4-406)||(70323-70725)
scaffold0034 (1-141)||(11854-11994)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-402)||(40013-40414)
scaffold0114 (227-402)||(17523-17698)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (1-406)||(65246-65651)
scaffold0053 (2-231)||(62721-62950)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (1-406)||(493-898)
scaffold0476 (227-399)||(10744-10916)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (3-402)||(4799-5198)
scaffold0348 (1-402)||(17432-17833)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-408)||(36888-37295)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (5-408)||(5754-6157)
scaffold0035 (227-397)||(41282-41452)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (5-408)||(1263-1666)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (5-408)||(7693-8096)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (5-409)||(409-813)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (35-405)||(251574-251941)
scaffold0009 (227-294)||(230026-230093)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (5-408)||(835-1238)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (1-402)||(6205-6606)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (5-404)||(767-1166)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (2-409)||(29882-30289)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (5-406)||(10928-11329)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (5-408)||(50054-50457)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (5-406)||(30278-30679)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (3-406)||(12678-13081)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (2-409)||(41683-42090)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (2-408)||(34286-34692)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-411)||(115508-115918)
scaffold0029 (8-408)||(93849-94249)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (2-365)||(8970-9333)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (5-406)||(67060-67461)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (5-406)||(63471-63872)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (5-408)||(5130-5533)
[»] scaffold0011 (7 HSPs)
scaffold0011 (149-408)||(151516-151775)
scaffold0011 (227-402)||(23707-23882)
scaffold0011 (9-123)||(153726-153840)
scaffold0011 (248-297)||(73792-73841)
scaffold0011 (248-297)||(78173-78222)
scaffold0011 (248-300)||(175708-175760)
scaffold0011 (248-293)||(182054-182099)
[»] scaffold1530 (2 HSPs)
scaffold1530 (152-408)||(532-788)
scaffold1530 (3-62)||(799-858)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (2-408)||(42647-43053)
scaffold0102 (214-399)||(50506-50691)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (35-399)||(4286-4650)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (35-406)||(11911-12282)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (1-330)||(1796-2125)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (155-409)||(11757-12011)
scaffold0443 (2-122)||(12032-12152)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (8-406)||(43374-43772)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (2-386)||(70079-70463)
scaffold0046 (239-406)||(60690-60857)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (8-406)||(29478-29876)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (2-406)||(5553-5957)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (179-408)||(9353-9582)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (2-406)||(1672-2075)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (199-406)||(1-208)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (173-406)||(1392-1625)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (173-406)||(28405-28638)
[»] scaffold0167 (2 HSPs)
scaffold0167 (224-408)||(1069-1253)
scaffold0167 (1-220)||(5190-5409)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (200-408)||(15072-15280)
scaffold0074 (1-150)||(15279-15428)
scaffold0074 (230-399)||(6071-6240)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (110-346)||(19026-19262)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (2-278)||(1556-1832)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (214-408)||(20689-20883)
scaffold0261 (214-408)||(12509-12703)
scaffold0261 (1-141)||(12360-12500)
scaffold0261 (1-141)||(20540-20680)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (5-273)||(1439-1707)
[»] scaffold0523 (3 HSPs)
scaffold0523 (230-406)||(2822-2998)
scaffold0523 (3-278)||(11693-11968)
scaffold0523 (2-235)||(5562-5795)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (220-406)||(1-187)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (173-406)||(11781-12012)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (5-301)||(824-1125)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (214-406)||(4250-4442)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (240-408)||(110559-110727)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (2-292)||(51716-52006)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (2-270)||(752-1020)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (3-234)||(2754-2985)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (173-406)||(4012-4242)
scaffold0130 (246-399)||(7972-8125)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (262-406)||(49086-49230)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (1-204)||(232-435)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (262-406)||(21802-21946)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (174-408)||(5037-5271)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (227-402)||(4389-4564)
scaffold0621 (227-373)||(1-147)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (175-402)||(55592-55819)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (227-402)||(2437-2612)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (227-402)||(8365-8540)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (175-402)||(14388-14615)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (227-402)||(13653-13828)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (175-402)||(216542-216769)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (185-397)||(15111-15323)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (227-399)||(36456-36628)
scaffold0079 (2-149)||(36706-36853)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (230-402)||(17833-18005)
scaffold0040 (227-402)||(111081-111256)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (214-402)||(23459-23647)
scaffold0018 (251-408)||(9549-9706)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (227-402)||(6828-7003)
scaffold0270 (227-402)||(13958-14133)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (214-397)||(1959-2142)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (227-402)||(40681-40856)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (248-402)||(14039-14193)
scaffold0120 (227-328)||(11293-11394)
scaffold0120 (248-293)||(25242-25287)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (309-406)||(26063-26160)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (227-399)||(10332-10504)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (185-402)||(15377-15582)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (227-402)||(552-727)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (227-402)||(1944-2119)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (185-384)||(3524-3723)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (227-402)||(57788-57963)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (333-406)||(3450-3523)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (227-395)||(14873-15041)
[»] scaffold0181 (2 HSPs)
scaffold0181 (227-399)||(29102-29274)
scaffold0181 (1-149)||(28876-29024)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (227-399)||(22205-22377)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (227-399)||(7194-7366)
[»] scaffold0017 (5 HSPs)
scaffold0017 (227-399)||(17240-17412)
scaffold0017 (1-101)||(4401-4501)
scaffold0017 (253-399)||(195038-195184)
scaffold0017 (230-399)||(24264-24433)
scaffold0017 (2-135)||(17015-17148)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (230-402)||(104182-104354)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (246-397)||(942-1093)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (227-402)||(11054-11229)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (227-402)||(7913-8088)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (227-402)||(8178-8353)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (174-408)||(26301-26535)
scaffold0042 (253-399)||(37020-37166)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (125-273)||(1364-1512)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (227-399)||(41590-41762)
scaffold0022 (227-399)||(75310-75482)
scaffold0022 (253-399)||(34915-35061)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (253-396)||(1-144)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (2-233)||(16761-16992)
scaffold0266 (248-289)||(7057-7098)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (228-399)||(31841-32012)
scaffold0080 (227-402)||(54592-54767)
scaffold0080 (228-399)||(37307-37478)
scaffold0080 (227-399)||(10412-10584)
scaffold0080 (227-399)||(13067-13239)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (174-284)||(16730-16840)
scaffold0100 (281-410)||(21413-21542)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (249-402)||(4538-4691)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (227-402)||(8905-9077)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (257-402)||(24916-25061)
scaffold0218 (248-293)||(1147-1192)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (229-402)||(17892-18065)
scaffold0028 (227-402)||(11424-11599)
scaffold0028 (227-303)||(55058-55134)
scaffold0028 (365-402)||(53682-53719)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (227-399)||(10326-10498)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (227-399)||(3382-3554)
scaffold0044 (227-399)||(17118-17290)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (309-383)||(1185-1259)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (185-399)||(18608-18822)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (227-399)||(1206-1378)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (227-399)||(13298-13470)
scaffold0109 (227-399)||(41113-41285)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (227-399)||(943-1115)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (227-399)||(8216-8388)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (227-395)||(21566-21734)
scaffold0081 (227-395)||(36990-37158)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (181-307)||(11078-11204)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (1-75)||(490-564)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (230-399)||(99-268)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (230-395)||(11533-11698)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (247-399)||(674-826)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (227-304)||(15753-15830)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (227-303)||(48719-48795)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (227-297)||(2924-2994)
[»] scaffold1914 (1 HSPs)
scaffold1914 (1-66)||(1178-1243)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (342-399)||(12621-12678)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (224-293)||(13502-13571)
scaffold0467 (248-293)||(816-861)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (338-402)||(3556-3620)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (248-293)||(5499-5544)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (248-293)||(26460-26505)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (248-293)||(35149-35194)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (248-293)||(24027-24072)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (248-293)||(8221-8266)
scaffold0021 (248-293)||(90566-90611)
scaffold0021 (248-293)||(21071-21116)
scaffold0021 (248-293)||(30647-30692)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (248-300)||(3556-3608)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (248-293)||(2635-2680)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (248-293)||(4097-4142)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (248-293)||(5000-5045)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (246-287)||(171188-171229)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (2-66)||(23872-23936)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 19716502 - 19716906
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  19716502 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtagtgat 19716601  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19716602 gttgtttgttataactgcaacaaagagggccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 19716701  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19716702 cgcagactactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 19716801  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19716802 tgctattgaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatttgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 19716901  T
Q  401 gtttg 405  Q
    |||||    
T  19716902 gtttg 19716906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23274550 - 23274144
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||  |||||| ||||| || ||      
T  23274550 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggacacacattagctgattgtaagcggggagaca 23274451  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||     
T  23274450 tagtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgcacacaaccgaagaaggttaggactggtggtaaagtgtttgctctgactggtat 23274351  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23274350 gcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctactcattgtttcatt 23274251  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23274250 gctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 23274151  T
Q  402 tttgtct 408  Q
    |||||||    
T  23274150 tttgtct 23274144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 19721065 - 19721365
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  19721065 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtagtgat 19721164  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19721165 gttgtttgttataactgcaacaaagagggccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 19721264  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19721265 cgcagactactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 19721364  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  19721365 t 19721365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 23097503 - 23097908
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |   | | |||||| | ||||||    
T  23097503 cgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatcagaagaagtgcttcaagtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgat 23097602  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23097603 gttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgcactcagccaaagaagattagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggta 23097702  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23097703 cgcagactactaatgaggacaggcttataagaggtacttgattctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 23097802  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  ||||||| | |||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23097803 tgctttagaatgtgcatttaagttgggtctggttgtaactgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 23097902  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  23097903 gtttgt 23097908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 20848546 - 20848139
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  20848546 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 20848447  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| ||  || | |||||||||  |||||  ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  20848446 ttgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtac 20848347  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20848346 gcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttatt 20848247  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20848246 gctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 20848147  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  20848146 tttgtctg 20848139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 12577311 - 12576907
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||  |||   ||||||||||| ||||||    
T  12577311 cgagaaaggtcacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgat 12577212  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||| | || ||||| || |||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  12577211 gttgtatgctataattgtaatgaagagggtcacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggta 12577112  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    | |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12577111 cacagactgctaatgaggaccgcctcatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 12577012  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  ||||||| |||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  12577011 tgctttagaatgtgcctataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaatgactacttctctg 12576912  T
Q  401 gtttg 405  Q
    |||||    
T  12576911 gtttg 12576907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 173 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23113508 - 23113276
Alignment:
Q  173 ggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 272  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||| |   || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23113508 ggtggaaaggtgtttgcattgactggaacacaggcagttattgaggac-gacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 23113410  T
Q  273 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 372  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| | || | ||||| ||||| |||||| | ||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23113409 ttgatactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataaattgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactcc 23113310  T
Q  373 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23113309 aactaagggttcagtaactacttctctcgtttgt 23113276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 11351422 - 11351594
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  11351422 atcagaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 11351521  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11351522 gtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 11351594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 22733485 - 22733660
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  22733485 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcgttgatttattgcttttgattgtgctactaagttgg 22733584  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  22733585 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgt 22733660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 23074595 - 23074420
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  23074595 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgg 23074496  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23074495 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 23074420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 185 - 399
Target Start/End: Original strand, 21322935 - 21323149
Alignment:
Q  185 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 284  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    | |||||| || || ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21322935 tttgcattgaccggtactcagaccgagaatgaggatcgcctaatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtg 21323034  T
Q  285 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 384  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21323035 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 21323134  T
Q  385 agtaactacttctct 399  Q
     || |||||||||||    
T  21323135 ggtgactacttctct 21323149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9338314 - 9338142
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  9338314 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 9338215  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9338214 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 9338142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9486948 - 9486776
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  9486948 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 9486849  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9486848 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 9486776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16983972 - 16983800
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16983972 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16983873  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16983872 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16983800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 17001732 - 17001560
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  17001732 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17001633  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17001632 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 17001560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 22742677 - 22742849
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  22742677 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattggtactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 22742776  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22742777 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23065145 - 23064973
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  23065145 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgg 23065046  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23065045 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 257 - 402
Target Start/End: Original strand, 23105469 - 23105614
Alignment:
Q  257 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 356  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  23105469 cctttagttgctattattgttactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 23105568  T
Q  357 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23105569 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 23105614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 251 - 408
Target Start/End: Original strand, 24817575 - 24817732
Alignment:
Q  251 agtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaag 350  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||| |     | ||  ||||||| |    
T  24817575 agtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatg 24817674  T
Q  351 gagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  24817675 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtct 24817732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 22323053 - 22323225
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  22323053 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22323152  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22323153 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22323225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 24705193 - 24705365
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  24705193 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 24705292  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24705293 gtcttgatttgtctgatatgaatgcagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtaactacttctct 24705365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24712766 - 24712594
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  24712766 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 24712667  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24712666 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 24712594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 44383281 - 44383453
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  44383281 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgttttgg 44383380  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  44383381 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 44383453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 230 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27220745 - 27220576
Alignment:
Q  230 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 329  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||||     
T  27220745 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 27220646  T
Q  330 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27220645 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27220576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27373982 - 27373829
Alignment:
Q  246 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 345  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  27373982 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27373883  T
Q  346 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27373882 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27373829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 399
Target Start/End: Original strand, 45673710 - 45673895
Alignment:
Q  214 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 313  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||| |  | |||    
T  45673710 tgaggatcgattgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggagctacgcattgttttattgctttcgattgt 45673809  T
Q  314 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    | || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  45673810 gattctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 45673895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10871582 - 10871410
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  10871582 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 10871483  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  10871482 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 10871410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24678219 - 24678047
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  24678219 atcagaggtacttgctatatgaataatactcctttagttgctattaatgatactggtgctaggcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 24678120  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  24678119 gtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggtgactacttctct 24678047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 399
Target Start/End: Original strand, 23029191 - 23029344
Alignment:
Q  246 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 345  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  23029191 ttaataatactcccttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 23029290  T
Q  346 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    ||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23029291 gaatggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggtgactacttctct 23029344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 304
Target Start/End: Original strand, 30208631 - 30208708
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30208631 atcaaaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattgct 30208708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24265102 - 24264930
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  24265102 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 24265003  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||  ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  24265002 gtcttgatttgtctgatatgagtggatagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 24264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 24657369 - 24657541
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  24657369 atcagaggtacttgctatattaataatactccattagttgctattattgatacagctgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 24657468  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
     | | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24657469 atcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 24657541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 24874461 - 24874633
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  24874461 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 24874560  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  24874561 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttcggtgactacttctct 24874633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19817632 - 19817502
Alignment:
Q  174 gtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 273  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||  | | |||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||     
T  19817632 gtgggaatgtgtttgctttagctggtactcagacatcgaatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactactac 19817533  T
Q  274 agatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  19817532 agatactggtgctacacattgctttattgct 19817502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 399
Target Start/End: Original strand, 21142771 - 21142924
Alignment:
Q  246 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 345  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  21142771 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatat 21142870  T
Q  346 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  21142871 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctct 21142924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23205046 - 23204874
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||  |  ||||| |  | |||| || |   ||||    
T  23205046 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgcatttttgctttccattgtgtttctgctttgg 23204947  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23204946 gtcttgatgtgtctgatatgaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctct 23204874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 293
Target Start/End: Original strand, 22739363 - 22739431
Alignment:
Q  225 ttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22739363 ttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 22739431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22280840 - 22280771
Alignment:
Q  224 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  22280840 cttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcatt 22280771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 227 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23676650 - 23676583
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 294  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  23676650 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattg 23676583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 28350832 - 28350726
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |   |||||||| || |||||| | |||||  ||||||| || ||  ||  ||| |||||||||||||||     
T  28350832 gagaaaggccacaagagtaatgtttgcaatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgata 28350733  T
Q  102 ttgtttg 108  Q
    |||||||    
T  28350732 ttgtttg 28350726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25131320 - 25131275
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25131320 aatagtactcatttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 25131275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 399
Target Start/End: Original strand, 41606209 - 41606269
Alignment:
Q  338 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  41606209 tctgatatgaatggagagatggt-gtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 41606269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22478 - 22071
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22478 cgagaaaggccacaagagtaatgtttttactaaggatgagaagaaatgcttcaagtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgat 22379  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  22378 gttgtttgctataactgcaatgaagagggccatatcagttctcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccgttggtatagtgtttgcattgactggta 22279  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22278 ctcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattggtattatagatactggtgttactcattgtttcat 22179  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22178 tgctattgaatgtgcatatatgttgggtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactttagctaagtgttcagtaactacttctctt 22079  T
Q  401 gtttgtct 408  Q
    ||||||||    
T  22078 gtttgtct 22071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 8970 - 8563
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  8970 cgagaatggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgac 8871  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
     ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8870 attgtttgctacaactgcaacgaagaaggccatatcagttcgcagtgcactcaaccgaagaaggttagtaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 8771  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8770 cgcatactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 8671  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8670 tgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtatctgatataaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 8571  T
Q  401 gtttgtct 408  Q
    ||||||||    
T  8570 gtttgtct 8563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Original strand, 14377007 - 14377413
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  | |||| |||||||||||||    
T  14377007 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctaattgtaagcgtggtgatg 14377106  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14377107 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccacatcagttcgcaatgtacacagccgaagaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgcattgactggtac 14377206  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14377207 gcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcatt 14377306  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  14377307 gctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcaaagggtttagtagctacttctcttg 14377406  T
Q  402 tttgtct 408  Q
    |||||||    
T  14377407 tttgtct 14377413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 18797881 - 18797476
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  18797881 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgcactaaagatgagcagaaatgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgac 18797782  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797781 gttgtttgctataactgcaatgatgaaggccatatcagttcacagtgcactcaaccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 18797682  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797681 cgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 18797582  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18797581 tgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctctt 18797482  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  18797481 gtttgt 18797476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19438192 - 19437786
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  19438192 gagaaaggccacttgagtaatgtttgtactaaagatgagaataagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatg 19438093  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||  |||| || ||||||||  ||||||||||    
T  19438092 ttgtatgttataactgcaacgaagagcgccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttaggactagtggtaaggtgtttgctctgactggtac 19437993  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| || |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19437992 gcaaaccactagtaaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 19437893  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19437892 gctattgaatgtgcttataagttgagtctagttgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 19437793  T
Q  402 tttgtct 408  Q
    |||||||    
T  19437792 tttgtct 19437786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Original strand, 24515505 - 24515911
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||| | || ||||    
T  24515505 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaagacacacactagctgattggaagaggggagatg 24515604  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || || ||||||| || |||||| |||||||| || |||||| |  ||||||||||    
T  24515605 ttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcacatcagttcgcagtgtacgcaaccgaggacggttaggaccggtggtaacgtgttttctctgactggtac 24515704  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24515705 gcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcatt 24515804  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  24515805 gttattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagttaagtgttcattaactacttctcttg 24515904  T
Q  402 tttgtct 408  Q
    |||||||    
T  24515905 tttgtct 24515911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19456210 - 19455807
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| ||  |||    
T  19456210 aaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtggtgtcagaaaggacacacactagatgattgtaagcgtggagacattg 19456111  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||| ||||||||||| || || || ||||| |||||  | || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  19456110 tttgctataactgcaacgaggaaggtcatattagttcgtagtgtactcaaccaaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgca 19456011  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
     || |||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456010 aaccactattgaggattttcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 19455911  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19455910 attgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggtgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 19455811  T
Q  405 gtct 408  Q
    ||||    
T  19455810 gtct 19455807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 5 - 402
Target Start/End: Original strand, 10465942 - 10466339
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||  ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  ||| || |||||||| ||  |||    
T  10465942 aaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaaatgttttaggtgtggtcagaagggacacaccctagctgaatgtaagcgtggggacattg 10466041  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  10466042 tctgctataactgcaatgaagaaggtcatattagttcacagtgtactcagccgaagaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgtattgatcggtacgca 10466141  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10466142 gactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgttgctactcattgttttattgct 10466241  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10466242 attgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 10466339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 21567081 - 21567486
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |   | | |||||| | ||||||    
T  21567081 cgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgat 21567180  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||||||||| ||  || | |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21567181 gttgtttgttataattgtgataaggagggccacatcagttcccagtgcactcagccaaagaagattagaaccggtggaaaagtgtttgctttgactggta 21567280  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21567281 cgcagactactaataaggacatgcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttattcaattgctattatagacactggtactactcattgtttcat 21567380  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  ||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21567381 tgctttagaatgtgcatattagttgggtttgattgtaactgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 21567480  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  21567481 gtttgt 21567486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 19466355 - 19465971
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| ||  |||    
T  19466355 aaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtggtgtcagaaaggacacacactagatgattgtaagcgtggagacattg 19466256  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||| ||||||||||| || || || ||||| |||||  | || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  19466255 tttgctataactgcaacgaggaaggtcatattagttcgtagtgtactcaaccaaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgca 19466156  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
     || |||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19466155 aaccactattgaggattttcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 19466056  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaa 389  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19466055 attgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaa 19465971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 24367590 - 24367183
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| |||||||| || ||      
T  24367590 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcggggggaca 24367491  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| || ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||| || ||||||||||   |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24367490 ttgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttcacagtgccctgaaccgaagaaaactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtac 24367391  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  24367390 gcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctactcattgttttatt 24367291  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||   | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24367290 gctattgaatgtgcatatcagttgggtccggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctcttg 24367191  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  24367190 tttgtctg 24367183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 34642676 - 34643081
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||    ||  |||||| || |||||||||    
T  34642676 cgagaagggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgtaaacgtggtgat 34642775  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
     |||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34642776 attgtatgctacaactgcaatggggagggtcatatcagttctcagtgcactcaaccgaagaaggttaggaccggtgggaaagtgtttgccttggctggta 34642875  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||| ||  | | ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34642876 cgcaaaccgcgaatgaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaatcgctattatagacactggtgctacacattgtttcat 34642975  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  | |||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34642976 tgctttagagtgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctctt 34643075  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  34643076 gtttgt 34643081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15462524 - 15462120
Alignment:
Q  4 gaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgtt 103  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||     |   ||| |||||||| || ||| |     
T  15462524 gaaaggccacaagagtaatgtctgcaccagagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaaaggtcatgtgttggctgagtgcaagcggggagatatc 15462425  T
Q  104 gtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgc 203  Q
    || |||||||||||   ||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15462424 gtgtgttataactgtggtgaggagggccacattagttcgcagtgcacgcaacctaagaaggtcagaactggaggaaaagtatttgccttgactggtacgc 15462325  T
Q  204 agactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 303  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15462324 agactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgc 15462225  T
Q  304 tattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 403  Q
    | |  ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  15462224 tttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtg 15462125  T
Q  404 tgtct 408  Q
    |||||    
T  15462124 tgtct 15462120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21474787 - 21474386
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||      ||||||||||| || ||| | |||||  |||||||||||||  |   ||| ||||||||||||||| |||    
T  21474787 aaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgtttccgatgtgggaagaaaggacacacattggctgagtgcaagcgtggtgatattg 21474688  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    | || || || ||  |||||||||| ||||| ||||| || ||||   |||| ||||||| |   || ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  21474687 tgtgctacaattgtgatgaagagggtcatattagttctcagtgcaggaaacctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgca 21474588  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  21474587 aacttctaatgaggaccgacttatcagaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttgattgtt 21474488  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
     || | ||||| |||||||||||| | ||| | |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21474487 gttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatagaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcatgttt 21474388  T
Q  405 gt 406  Q
    ||    
T  21474387 gt 21474386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 25770972 - 25770630
Alignment:
Q  64 gaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaag 163  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| || || || ||  ||||||| || ||||| || || || ||||   |||| ||||||    
T  25770972 gaaaggacacacattatctgattgcaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctctcagtgcaggaaacctaagaag 25770873  T
Q  164 gttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaa 263  Q
    | |   || ||||| || |||||| | |||||| ||| ||| |||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25770872 gctctgacaggtggcaaggtgtttcctttgactagtaagcaaactgttaataaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaa 25770773  T
Q  264 ttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgt 363  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25770772 ttgctattatagatattggtgctattcattgtttcattgttgttgattgtgcttataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgt 25770673  T
Q  364 tgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25770672 tgaatctccagcaaagggttcaatcactacttctcttgtttgt 25770630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 183 - 406
Target Start/End: Original strand, 19486566 - 19486789
Alignment:
Q  183 tgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgg 282  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19486566 tgtttgcattgactggtacgcaaacatttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattattgatactgg 19486665  T
Q  283 tgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggt 382  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||  | ||   |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19486666 tgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggtcatgtcaagtatgagtagagaaatggttgttgaaactccagctaagggt 19486765  T
Q  383 tcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  19486766 ttagtaactacttctcttgtttgt 19486789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 23081388 - 23081213
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  23081388 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 23081289  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    |||| | | | ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23081288 gttttgctatgtcaaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgt 23081213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 278 - 402
Target Start/End: Original strand, 20010821 - 20010945
Alignment:
Q  278 actggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcta 377  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20010821 actggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcttataagttgggcctaatcgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagcca 20010920  T
Q  378 agggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20010921 agggttcagtaactacttctcttgt 20010945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 18405260 - 18405435
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  18405260 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctatgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 18405359  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18405360 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 18405435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 185 - 393
Target Start/End: Original strand, 5836502 - 5836710
Alignment:
Q  185 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 284  Q
    ||||| ||||||||||| |||||   || |||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  5836502 tttgctttgactggtactcagacatataatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtg 5836601  T
Q  285 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 384  Q
    |||| |||||||| |||||| || | ||||||||||  |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5836602 ctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttatactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 5836701  T
Q  385 agtaactac 393  Q
     ||||||||    
T  5836702 ggtaactac 5836710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 230 - 406
Target Start/End: Original strand, 18182686 - 18182862
Alignment:
Q  230 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 329  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||   | ||||||||| | ||||||| ||||||||||     
T  18182686 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacacatttccttattgctattgattgtgcttctaagttgggtc 18182785  T
Q  330 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    | | | | ||  ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18182786 ttgctatgtcaaatatgaatggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgt 18182862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 410
Target Start/End: Original strand, 30678340 - 30678523
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| | |||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  30678340 atcagaggtacatgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatatttgtgctacgcgttgttttattgctactgattgtgcttctaagttgg 30678439  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctga 410  Q
    || | ||| | ||   |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||    
T  30678440 gtcttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggttactacttctctagtgtgtctga 30678523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 214 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22436847 - 22436662
Alignment:
Q  214 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 313  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |  | |||    
T  22436847 tgaggaccgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgt 22436748  T
Q  314 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    |||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22436747 gcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22436662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 29589755 - 29589927
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  29589755 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 29589854  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29589855 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 29589927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 2872118 - 2872290
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  2872118 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 2872217  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2872218 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 2872290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16574855 - 16574683
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16574855 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16574756  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16574755 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16574683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 16620525 - 16620697
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16620525 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16620624  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16620625 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16620697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 16924956 - 16925128
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  16924956 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16925055  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  16925056 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactacttctct 16925128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 399
Target Start/End: Original strand, 23085095 - 23085313
Alignment:
Q  181 agtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatact 280  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||    | |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| |||||||||||||| || ||||||| || |||    
T  23085095 agtgtttgctttgactagtatgcagacagagaatgaggaccgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagtttctattattgaaact 23085194  T
Q  281 ggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 380  Q
    |||||||| |||||||| |||| | || | | ||||| |||||||||| |   | | ||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23085195 ggtgctacacattgttttattgttgttgattatgcttctaagttgggtcttactatgtcaagtatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagg 23085294  T
Q  381 gttcagtaactacttctct 399  Q
    |||| || |||||||||||    
T  23085295 gttcggtgactacttctct 23085313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28312595 - 28312423
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  28312595 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcaattgtgtttctgctttgg 28312496  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28312495 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28312423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 24293098 - 24293270
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  24293098 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcacggttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 24293197  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24293198 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 24293270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 27559285 - 27559457
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  27559285 atcagaggtacttgttatattaataatactccatttgttgctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27559384  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27559385 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27559457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 19867626 - 19867480
Alignment:
Q  253 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 352  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||  | ||| | ||| ||||||| | |    
T  19867626 tactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggccttgttatgtcttatatgaatgaa 19867527  T
Q  353 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19867526 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 19867480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 28260513 - 28260685
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  28260513 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28260612  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28260613 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28260685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28285403 - 28285231
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  28285403 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28285304  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28285303 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28285231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 28339262 - 28339434
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  28339262 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28339361  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28339362 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28339434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27190398 - 27190229
Alignment:
Q  230 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 329  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||||     
T  27190398 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27190299  T
Q  330 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    | |   | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27190298 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27190229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 399
Target Start/End: Original strand, 27258842 - 27259011
Alignment:
Q  230 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 329  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||||     
T  27258842 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27258941  T
Q  330 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    | |   | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27258942 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27259011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 25115517 - 25115345
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| |||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   | ||    
T  25115517 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtactacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcttcgg 25115418  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25115417 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 25115345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 294
Target Start/End: Original strand, 22829702 - 22829769
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 294  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22829702 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 22829769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 16379710 - 16379755
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16379710 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 16379755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 16647306 - 16647351
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16647306 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 16647351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 16813830 - 16813722
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| |||||| | |||||  ||||| | |||||  ||  ||| |||||||||||||||     
T  16813830 gagaaaggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaatggcacacaatagctgaatgcaagcgtggtgata 16813731  T
Q  102 ttgtttgtt 110  Q
    |||||||||    
T  16813730 ttgtttgtt 16813722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16100959 - 16100914
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  16100959 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcatt 16100914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 8410 - 8817
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  8410 cgagaatggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgac 8509  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8510 gttgtttgttataactgcaatgaatagggccatatcagttcgcagtgcaatcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 8609  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  8610 cgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcat 8709  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710 tgctatcgaatgtgcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 8809  T
Q  401 gtttgtct 408  Q
    || |||||    
T  8810 gtgtgtct 8817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 18624 - 19031
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  18624 cgagaatggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgac 18723  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18724 gttgtttgttataactgcaatgaatagggccatatcagttcgcagtgcaatcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 18823  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  18824 cgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcat 18923  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18924 tgctatcgaatgtgcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 19023  T
Q  401 gtttgtct 408  Q
    || |||||    
T  19024 gtgtgtct 19031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 53371 - 53775
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  53371 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgattcaggtgtggtcaaaaaggacacatcctagttgattgcaagcgtggtgac 53470  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53471 gtggtatgttataactgtaatgaagagggccatatcagttcacaatgcacatagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtatttgcattgactggta 53570  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  53571 cgcagactactaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctactcattgtttcaa 53670  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    ||||||  || |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53671 tgctatagaaagtgcatataagttaggtttaattgtatctgaaatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctt 53770  T
Q  401 gtttg 405  Q
    |||||    
T  53771 gtttg 53775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 3 - 408
Target Start/End: Original strand, 804 - 1209
Alignment:
Q  3 agaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgt 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |    
T  804 agaaaggccataagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatat 903  T
Q  103 tgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  904 tgtttgttataactgcaatgaagagggtcatatcagttcacagtgtacgcaaccgaggaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtatg 1003  T
Q  203 cagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 302  Q
    || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1004 caaaccactagtgaggatcgaattatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattg 1103  T
Q  303 ctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1104 ctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatatgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 1203  T
Q  403 ttgtct 408  Q
     |||||    
T  1204 gtgtct 1209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 45)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16150963 - 16150556
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16150963 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggtgat 16150864  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| || || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16150863 gttgtttgctataactgtgatgaagaggggcatattagctcgcaatgcaagaaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 16150764  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    || |||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16150763 cgtagaccactagtgaggatcgacttatcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 16150664  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16150663 tgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 16150564  T
Q  401 gtttgtct 408  Q
    || |||||    
T  16150563 gtgtgtct 16150556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16155109 - 16154702
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16155109 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggtgat 16155010  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| || || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16155009 gttgtttgctataactgtgatgaagaggggcatattagctcgcaatgcaagaaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 16154910  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    || |||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16154909 cgtagaccactagtgaggatcgacttatcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 16154810  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16154809 tgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 16154710  T
Q  401 gtttgtct 408  Q
    || |||||    
T  16154709 gtgtgtct 16154702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20893354 - 20892953
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  ||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||  ||| ||||||||||| ||| |||    
T  20893354 aaaggcaacaagagcaatgtttgtggtagagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacaatttagctgaatgcaagcgtggggatattg 20893255  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    | |  || ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  20893254 tctactacaactgcaatgaagaggggcatatcagttcgcagtgtactgagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgca 20893155  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20893154 gactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 20893055  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
     |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20893054 ttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 20892955  T
Q  405 gt 406  Q
    ||    
T  20892954 gt 20892953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Original strand, 44658812 - 44659219
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| |||     
T  44658812 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggata 44658911  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| || ||||||| |||  | ||||| |||||||| ||  || |||||||||||  |||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  44658912 ttgtctgttacaattgcaatggagaatgtcatattagttcacagtgtcctgaaccgaagaagactagaactggtggaaaggtgtttgctttgaatggtac 44659011  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44659012 gcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttatt 44659111  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44659112 gctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 44659211  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  44659212 tttgtctg 44659219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Original strand, 11204178 - 11204585
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||  | | ||||||||||| |||     
T  11204178 gagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgatagaaaatgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagcttaatgcaagcgtggggata 11204277  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| || || || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||  || | ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11204278 ttgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaaaaaggctagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtac 11204377  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11204378 gcanactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 11204477  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11204478 gctattgaatgtgcctataagttaggtttggatgtatctggtatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 11204577  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  11204578 tttgtctg 11204585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 51603737 - 51604141
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||  |||   ||||||||||| ||||||    
T  51603737 cgagaaaggtcacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgat 51603836  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||| | || ||||| || |||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  51603837 gttgtgtgctataattgtaatgaagagggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggta 51603936  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    | |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51603937 cacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 51604036  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  |||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51604037 tgctttagaatgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctt 51604136  T
Q  401 gtttg 405  Q
    |||||    
T  51604137 gtttg 51604141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Original strand, 3261740 - 3262147
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  3261740 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 3261839  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| ||  || | |||||||||  |||||  ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  3261840 ttgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtac 3261939  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3261940 gcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 3262039  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3262040 gctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 3262139  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  3262140 tttgtctg 3262147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Original strand, 53750415 - 53750815
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||  |||   ||||||||||| ||||||    
T  53750415 cgagaaaggtcacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgat 53750514  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||| | || ||||| || |||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  53750515 gttgtatgctataattgtaatgaagagggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggta 53750614  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    | |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53750615 cacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 53750714  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  |||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53750715 tgctttagaatgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctt 53750814  T
Q  401 g 401  Q
    |    
T  53750815 g 53750815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Original strand, 14993316 - 14993719
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||      ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  14993316 aaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgtgagaagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgcaagcatggggatgttg 14993415  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||| || ||||||||||| || || ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||| |||||||||    
T  14993416 tttgctacaactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgaatggtacgca 14993515  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
     ||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  14993516 aacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctcttcattatttcattgct 14993615  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
     || | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14993616 gttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgttt 14993715  T
Q  405 gtct 408  Q
    ||||    
T  14993716 gtct 14993719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Original strand, 29450483 - 29450890
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||      ||||| | ||| || ||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  29450483 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaggagatgataggaagtgtttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 29450582  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||  || || || ||||||||||| ||  || | |||||||||  |||||  || || || |||||||| |||||||||||    
T  29450583 ttgtctgttacaactgcaatggggaaggtcacatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtac 29450682  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29450683 gcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 29450782  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29450783 gctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 29450882  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  29450883 tttgtctg 29450890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27903709 - 27903307
Alignment:
Q  4 gaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgtt 103  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     |   ||| ||||||||||| ||| ||    
T  27903709 gaaaggccacaagagtaatgtctgcaccaaagatgagaagaagtgtttcagatgtggtcagaaaggtcatgtgttggctgaatgcaagcgtggagatatt 27903610  T
Q  104 gtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgc 203  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  27903609 gtttgttataactgtaatgaggagggcaacattagttcacagtgcacgcaacctaagaaggtcagaacttgaggaaaagtatttgctttgactggtacgc 27903510  T
Q  204 agactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 303  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27903509 agactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacatgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgc 27903410  T
Q  304 tattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 403  Q
    | |  ||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27903409 tttagaatgtgcatataagttgggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtt 27903310  T
Q  404 tgt 406  Q
    |||    
T  27903309 tgt 27903307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15267102 - 15266736
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||   |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||| ||      
T  15267102 gagaagggccataagagtaatgtttgtgacagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgtaagcatggagaca 15267003  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||  ||||    
T  15267002 ttgtttgctataactgcaacgaagaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccgaagaaggttaggaccggtggcaaggtgtttgctttaaccagtac 15266903  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| || |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15266902 gcaaacaactagtgaagacagacttatcagaggtagttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtactactcattgtttcatt 15266803  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 368  Q
    | | || | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15266802 gatgttgattgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 15266736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 15073682 - 15073285
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||      ||||||||||| || || ||||||||  |||||||||||||  ||  ||||||||||| | |||||||||    
T  15073682 aaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagctgattgcaagctttgtgatgttg 15073583  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| || ||||| || ||||| ||||   | || ||||||| |   || ||||| || |||||| | ||||||||||| ||    
T  15073582 tttgctataattgtgatgaagaaggtcatataagctcacagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgttttctttgactggtacaca 15073483  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
     |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073482 aactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 15073383  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
     || | |||||  ||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073382 gttgattgtgcacataagttggctctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 15073285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7357593 - 7357280
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  7357593 gagaaaggccacaagagcaatgtttatggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacaatttagctgaatgcaagcgtggagaca 7357494  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| || || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||  || | |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7357493 ttgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactagtgggaaggtgtttgcattgactggtac 7357394  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7357393 acagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 7357294  T
Q  302 gctattaaatgtgc 315  Q
    |||||| |||||||    
T  7357293 gctattgaatgtgc 7357280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 232 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 14697197 - 14697027
Alignment:
Q  232 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggttta 331  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| |     
T  14697197 aggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtctt 14697098  T
Q  332 gttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14697097 gctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 14697027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 185 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 14162613 - 14162396
Alignment:
Q  185 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 284  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||   |  ||||| || || |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  14162613 tttgcattgacgggtacccagactgagaacgaggatcgcctgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataccggtg 14162514  T
Q  285 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 384  Q
    |||| ||| |||| |||||| || | ||||||| |||||||| | | | | | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14162513 ctacgcatagttttattgctcttgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 14162414  T
Q  385 agtaactacttctcttgt 402  Q
     |||||||||||||||||    
T  14162413 ggtaactacttctcttgt 14162396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 175 - 402
Target Start/End: Original strand, 15894 - 16121
Alignment:
Q  175 tgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattata 274  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||   |  ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||     
T  15894 tgggagagtttttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattatt 15993  T
Q  275 gatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccag 374  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| |   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  15994 gatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccag 16093  T
Q  375 ctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||    
T  16094 ctaagggttcggtgactacttctcttgt 16121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 317 - 408
Target Start/End: Original strand, 15354301 - 15354392
Alignment:
Q  317 tataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354301 tataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctcttgtttgtct 15354392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18259764 - 18259629
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| ||  |||    
T  18259764 aaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgtaagcgtggggacattg 18259665  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagtt 140  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  18259664 tttgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagtt 18259629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 17092060 - 17092232
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  17092060 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgg 17092159  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17092160 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 17092232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 8050534 - 8050706
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  8050534 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 8050633  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8050634 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 8050706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12479701 - 12479529
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  12479701 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 12479602  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12479601 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 12479529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 14300890 - 14301062
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  14300890 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14300989  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14300990 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14301062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14683668 - 14683496
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  14683668 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14683569  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14683568 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14683496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 16233903 - 16234075
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16233903 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16234002  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16234003 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16234075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 19635237 - 19635065
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  19635237 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19635138  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19635137 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 19635065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23958848 - 23958676
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  23958848 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 23958749  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23958748 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23958676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8389513 - 8389344
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  8389513 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 8389414  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttc 396  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8389413 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 8389344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 16350465 - 16350637
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  16350465 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctatgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16350564  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16350565 gtcttgatttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16350637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 19775704 - 19775876
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  19775704 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19775803  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  19775804 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 19775876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27714437 - 27714265
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  27714437 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27714338  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  27714337 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 27714265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 399
Target Start/End: Original strand, 15144829 - 15144975
Alignment:
Q  253 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 352  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| | |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  15144829 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 15144928  T
Q  353 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  15144929 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctct 15144975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 271
Target Start/End: Original strand, 15354229 - 15354291
Alignment:
Q  209 actactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatt 271  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15354229 actagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatatt 15354291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 399
Target Start/End: Original strand, 18224376 - 18224529
Alignment:
Q  246 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 345  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  18224376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18224475  T
Q  346 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18224476 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 18224529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 40476141 - 40475969
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  40476141 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 40476042  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  40476041 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 40475969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13513451 - 13513285
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   | ||    
T  13513451 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgg 13513352  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactac 393  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  13513351 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 13513285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16219289 - 16219188
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16219289 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16219190  T
Q  327 gt 328  Q
    ||    
T  16219189 gt 16219188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16222609 - 16222508
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16222609 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16222510  T
Q  327 gt 328  Q
    ||    
T  16222509 gt 16222508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 399
Target Start/End: Original strand, 16250872 - 16250933
Alignment:
Q  338 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16250872 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16250933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15258891 - 15258847
Alignment:
Q  364 tgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15258891 tgaaactccagctaagagttcagtaactacttctcttgtttgtct 15258847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14999726 - 14999681
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14999726 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 14999681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 294
Target Start/End: Original strand, 18604733 - 18604797
Alignment:
Q  230 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 294  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18604733 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 18604797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14188484 - 14188435
Alignment:
Q  350 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14188484 ggagagatggttgtcgaaactccagctaaaggttcggttactacttctct 14188435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 15290350 - 15290395
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  15290350 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcatt 15290395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 257 - 293
Target Start/End: Original strand, 18546820 - 18546856
Alignment:
Q  257 cctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18546820 cctttaattgctattatagatactggagctacgcatt 18546856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 164349 - 164752
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||    
T  164349 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgttctaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagttgattgcaagcgtggtaat 164448  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  164449 gttgtttgttataactgcaatgaagaaggccatatcagttcgcattatactcagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgaccggta 164548  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  164549 cgtagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 164648  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  164649 tgccattgaatgtgcttataagttgggtctggttatatctgataagaaaggggaaatggttgttgaaactccagcaaatggttcaataactacttctctt 164748  T
Q  401 gttt 404  Q
    ||||    
T  164749 gttt 164752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 402
Target Start/End: Original strand, 47115 - 47331
Alignment:
Q  185 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   |  ||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  47115 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgctttatcagaggtacttgttattttaatagtacacctttagttactattattgattctggtg 47214  T
Q  285 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 384  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| |   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  47215 ctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaa-ggttc 47313  T
Q  385 agtaactacttctcttgt 402  Q
     || ||||||||||||||    
T  47314 ggtgactacttctcttgt 47331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 253 - 399
Target Start/End: Original strand, 30774 - 30920
Alignment:
Q  253 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 352  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| |   |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  30774 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatgga 30873  T
Q  353 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  30874 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 30920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 338 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 152100 - 152036
Alignment:
Q  338 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  152100 tctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 152036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 4 - 402
Target Start/End: Original strand, 438 - 836
Alignment:
Q  4 gaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgtt 103  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  438 gaaaggccacaagagtgatgtttgtaccaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacagcctagctgattgcaagcgtggtgatgtt 537  T
Q  104 gtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgc 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  538 gtttgctataactgcaatgaagagggccatatcagttcacagtgcacacagccgaagaaggttagaaccgatgggaaagtgtttgcattgactggtacac 637  T
Q  204 agactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  638 agactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctacacaatgtttaattgc 737  T
Q  304 tattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    |||  ||||||| |||||| ||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  738 tatagaatgtgcatataagatgggtataaaaatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21169 - 20763
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||||| ||||| || ||      
T  21169 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaaggtgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggacacacattagttgattgtaagcggggagaca 21070  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |  |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  21069 taatttgctataactgcaatgaggagggccgtatcagttcacagtgtacacaaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtac 20970  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20969 gcaaaccactattgaggatctacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcatt 20870  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20869 gctattgaatgtgcttataagttgggtctggtcgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 20770  T
Q  402 tttgtct 408  Q
    |||||||    
T  20769 tttgtct 20763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 98531 - 98938
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  98531 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgat 98630  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||||||  |||||||||    
T  98631 gttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggta 98730  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    | || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98731 cacaaaccactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 98830  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98831 tactattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctaatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 98930  T
Q  401 gtttgtct 408  Q
    || |||||    
T  98931 gtgtgtct 98938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 176339 - 175939
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||      ||||||||||| || || ||||||||  |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  176339 aaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtggtgatgttg 176240  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| || ||||| || || || ||||   | |   |||||| |   || ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  176239 tttgctataattgtgatgaagaaggtcatattagctcgcagtgcaggaagctttagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgca 176140  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
     |||  || | | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  176139 aactgttaataaagaccgacttatcagaggtacttatttcttta-tagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 176041  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
     || | ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  176040 gttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgttt 175941  T
Q  405 gt 406  Q
    ||    
T  175940 gt 175939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 326063 - 325656
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||  | |||| ||||| || |||    
T  326063 cgagaaagaccacaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcaagtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagat 325964  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  325963 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacagtgcacacaaccaaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggta 325864  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  325863 cgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatattactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 325764  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  325763 tgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 325664  T
Q  401 gtttgtct 408  Q
    ||||||||    
T  325663 gtttgtct 325656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 192 - 411
Target Start/End: Original strand, 200607 - 200826
Alignment:
Q  192 tgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactca 291  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  200607 tgactggtacgcagacggttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactagtgctacaca 200706  T
Q  292 ttgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaact 391  Q
    ||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  200707 ttgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaact 200806  T
Q  392 acttctcttgtttgtctgat 411  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  200807 acttctctcgtttgtttgat 200826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 319599 - 319482
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  | |||| ||||| || |||    
T  319599 cgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagat 319500  T
Q  101 gttgtttgttataactgc 118  Q
    ||||||||||||||||||    
T  319499 gttgtttgttataactgc 319482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 5 - 406
Target Start/End: Original strand, 22027672 - 22028073
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||  |||||| ||| | || || ||||    
T  22027672 aaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacacattagctgattgtaagaggggagacgttg 22027771  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22027772 tttgctataactacaatgaagagggccatatcagttctcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgcattgaccggtacgca 22027871  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22027872 gactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 22027971  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22027972 attgaatgtgcatataagttgggtttggttttatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgttt 22028071  T
Q  405 gt 406  Q
    ||    
T  22028072 gt 22028073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 22054256 - 22053847
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||    ||   ||||||||||||||||||    
T  22054256 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaagtgcttcagatgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaagcgtggtgat 22054157  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22054156 gttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagccgaagaaggatagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggta 22054057  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22054056 cgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 22053957  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  || |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22053956 tgctttagaaagtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 22053857  T
Q  401 gtttgtctga 410  Q
    ||||||||||    
T  22053856 gtttgtctga 22053847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 405
Target Start/End: Original strand, 31413924 - 31414324
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||  ||  ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||| ||  |||    
T  31413924 aaaggccataagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgttttaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattg 31414023  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31414024 tttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcacagtgtactcagtcgaagaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtatgca 31414123  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31414124 gactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgct 31414223  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    | | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31414224 aatgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagttt 31414323  T
Q  405 g 405  Q
    |    
T  31414324 g 31414324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Original strand, 16268613 - 16269020
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || | ||||  ||| ||||||||||| |||     
T  16268613 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcatagcctagctgaatgcaagcgtggggata 16268712  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| || || || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||  || | |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16268713 ttgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtac 16268812  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16268813 gcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 16268912  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16268913 gctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 16269012  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
     |||||||    
T  16269013 cttgtctg 16269020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 410
Target Start/End: Original strand, 29300820 - 29301223
Alignment:
Q  7 aggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgtt 106  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||  ||||| | ||| || || ||||||||||||| ||||||||| |||  ||| || |||||||| ||  ||||     
T  29300820 aggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgaaaggaagtgttttaggtgtggtcagagaggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtc 29300919  T
Q  107 tgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcaga 206  Q
    |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29300920 tactataactgcaatgaagaaggtcatatcagttctcagtgtactcagccgaagaaggctaggatcggtgggaaagtgttttcattgacgggtacgcaga 29301019  T
Q  207 ctactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctat 306  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29301020 ctacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgcttt 29301119  T
Q  307 taaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
      ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29301120 agaatgtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 29301219  T
Q  407 ctga 410  Q
    ||||    
T  29301220 ctga 29301223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 28984303 - 28983896
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  28984303 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 28984204  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| ||  || | |||||||||  |||||  ||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  28984203 ttgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtac 28984104  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28984103 acagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttatt 28984004  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28984003 gctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 28983904  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  28983903 tttgtctg 28983896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19985539 - 19985168
Alignment:
Q  35 gatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccata 134  Q
    ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||| |||||||  ||  |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||    
T  19985539 gatgagaagaagtatttcagatgtggacagaaatgacacacattagctgattgcaagagtggggatgttgtttgctataattgtgatgaagaggggcata 19985440  T
Q  135 tcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagagg 234  Q
    | || ||||| ||||   | || ||||||||| | || ||||| || || |||||||||||| |||||||||||   | | |||||||||||||||||||    
T  19985439 ttagctcacagtgcaagaagcctaagaaggttcggacaggtggcaaggtatttgcattgactagtacgcagactgtgaataaggaccgacttatcagagg 19985340  T
Q  235 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||||| |||    
T  19985339 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtttggtt 19985240  T
Q  335 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19985239 atatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 19985168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21928787 - 21928416
Alignment:
Q  35 gatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccata 134  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| ||||    
T  21928787 gatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacactttgggtgattgcaagcgtggtgatgtcgtttgctataattgtgatgaagaggggcata 21928688  T
Q  135 tcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagagg 234  Q
    | || ||||||||||   | || ||||||||| | || ||||| || |||||||| |||||| ||| ||| |||   | ||| |||||||||||||||||    
T  21928687 ttagctcacaatgcaagaagcccaagaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactagtaagcaaactgtgaatgaagaccgacttatcagagg 21928588  T
Q  235 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| | |||    
T  21928587 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggtt 21928488  T
Q  335 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21928487 atatctgatatgaatggcgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 21928416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 35 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22374228 - 22373857
Alignment:
Q  35 gatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccata 134  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||  |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||    
T  22374228 gatgaaaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtggtgatattgtttgctataattgtgatgaagaaggtcata 22374129  T
Q  135 tcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagagg 234  Q
    | || || || ||||   | || ||||||| |  ||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||    
T  22374128 ttagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacccaaactgttaatgaggaccgacttatcagagg 22374029  T
Q  235 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||||| |||||||||||| |||||    
T  22374028 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatagtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctagtt 22373929  T
Q  335 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22373928 atatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 22373857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 28989393 - 28989115
Alignment:
Q  131 catatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatca 230  Q
    |||||||||||||| ||  || | |||||||||  |||||  ||||| || ||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28989393 catatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatca 28989294  T
Q  231 gaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggttt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28989293 gaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggttt 28989194  T
Q  331 agttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 409  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28989193 ggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 28989115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 173 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20391307 - 20391074
Alignment:
Q  173 ggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 272  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20391307 ggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctatta 20391208  T
Q  273 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 372  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||| | ||| | ||   ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  20391207 ttgatactggtgctacacattgattcattgctgttaattgtgaatataagttgggtctggttatgtcaagtattagtggagaaatggttgttgaaactcc 20391108  T
Q  373 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20391107 agctaagggttcagtaactacttctctcgtttgt 20391074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 265 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 27357665 - 27357521
Alignment:
Q  265 tgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgtt 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27357665 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 27357566  T
Q  365 gaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27357565 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 27357521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 22421506 - 22421681
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22421506 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 22421605  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22421606 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 22421681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 249 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22523691 - 22523538
Alignment:
Q  249 atagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaa 348  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | | | | ||  |||||||    
T  22523691 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaa 22523592  T
Q  349 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22523591 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 22523538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 230 - 398
Target Start/End: Original strand, 22375071 - 22375239
Alignment:
Q  230 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 329  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||     
T  22375071 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgatattgattgtgcttctaagttgggtc 22375170  T
Q  330 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctc 398  Q
    | | | | ||  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  22375171 ttgctatgtcgaatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc 22375239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 214 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 19981147 - 19980962
Alignment:
Q  214 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 313  Q
    |||||| || || ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||    
T  19981147 tgaggatcggctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgt 19981048  T
Q  314 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    |||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19981047 gcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 19980962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21254112 - 21253937
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||  | | ||||||  ||||||||    
T  21254112 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattattttattgcttatgattgtgctactaagttgg 21254013  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21254012 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 21253937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 21391475 - 21391650
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||  | | ||||||  ||||||||    
T  21391475 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgg 21391574  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  21391575 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgt 21391650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 21780801 - 21780976
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||  | | ||||||  ||||||||    
T  21780801 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgg 21780900  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  21780901 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgt 21780976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 253 - 399
Target Start/End: Original strand, 21164178 - 21164324
Alignment:
Q  253 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 352  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| | || ||||||| |   |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  21164178 tactcctttagttgctattattgatactgatgctacgcattgttttattgctttcaattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatgga 21164277  T
Q  353 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21164278 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 21164324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 257 - 402
Target Start/End: Original strand, 21785999 - 21786144
Alignment:
Q  257 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 356  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  21785999 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21786098  T
Q  357 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  21786099 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgt 21786144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 17671636 - 17671808
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  17671636 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17671735  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17671736 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 17671808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22990264 - 22990037
Alignment:
Q  175 tgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattata 274  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    | |||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| | ||||| |||||| ||||||||||     
T  22990264 tgggagagtttttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgacagtacacctttagttgctattatt 22990165  T
Q  275 gatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccag 374  Q
    |||||| ||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||| | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  22990164 gatactagtgctaaacattgttttattgctattgattgtgcttcaaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccag 22990065  T
Q  375 ctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||    
T  22990064 cgaagggttcggtgactacttctcttgt 22990037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 19115567 - 19115395
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  19115567 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19115468  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19115467 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 19115395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 20015877 - 20016049
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  20015877 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 20015976  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20015977 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 20016049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 32603312 - 32603140
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  32603312 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 32603213  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32603212 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 32603140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 402
Target Start/End: Original strand, 22245583 - 22245804
Alignment:
Q  181 agtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatact 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||    | |||||| ||  | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||| |    
T  22245583 agtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatatt 22245682  T
Q  281 ggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 380  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  22245683 agtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagg 22245782  T
Q  381 gttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  22245783 gttcggtgactacttctcttgt 22245804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 402
Target Start/End: Original strand, 22246001 - 22246222
Alignment:
Q  181 agtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatact 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||    | |||||| ||  | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||| |    
T  22246001 agtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatatt 22246100  T
Q  281 ggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 380  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  22246101 agtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagg 22246200  T
Q  381 gttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  22246201 gttcggtgactacttctcttgt 22246222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18859744 - 18859572
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  18859744 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18859645  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18859644 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 18859572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22031270 - 22031098
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  22031270 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22031171  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  22031170 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctct 22031098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 22117789 - 22117961
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  |  ||| || |   ||||    
T  22117789 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatcgtgtttctgctttgg 22117888  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22117889 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22117961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 22126573 - 22126745
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  22126573 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22126672  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  22126673 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgattacttctct 22126745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22042994 - 22042822
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| || || | |||| || |   ||||    
T  22042994 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatttcttttgattgtgtttctgctttgg 22042895  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22042894 gtcttgatttttctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 30310758 - 30310930
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  30310758 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 30310857  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  30310858 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactacttctct 30310930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 384
Target Start/End: Original strand, 19481686 - 19481843
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  19481686 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19481785  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 384  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19481786 gtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 19481843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15536550 - 15536378
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | | || || |   ||||    
T  15536550 atcagaggtacttgctatattaatgatactccgttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattatgtttctgccttgg 15536451  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15536450 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 15536378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 22129231 - 22129403
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  22129231 atcagaggtacttgctagattaataatactgctttagttgctattattgatactggtgttacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22129330  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22129331 gtcttgatttgtctgatatgaatggacagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22129403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 20649990 - 20650035
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20649990 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20650035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 21847972 - 21848017
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21847972 aatagtactcttttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 21848017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 14283306 - 14283711
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  14283306 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacacattagctgattgcaagcgtggtgat 14283405  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14283406 gttgtatgttataactgcaacgaagagggtcatatcagcacacagtgcccacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactggta 14283505  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14283506 cgcagactactaatgaggactgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttcattgctattatagacattggtgctactcattgtttcat 14283605  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14283606 tgctattgaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctctt 14283705  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  14283706 gtttgt 14283711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 3 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13676766 - 13676361
Alignment:
Q  3 agaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||  ||  |||||| ||||| || ||  |    
T  13676766 agaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtacttcaggtgtggacagaagggacacacattagctgattgtaagcggggagacat 13676667  T
Q  103 tgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacg 202  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  13676666 agtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgtgcacaaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacg 13676567  T
Q  203 cagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 302  Q
    || || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13676566 caaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattg 13676467  T
Q  303 ctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13676466 ctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 13676367  T
Q  403 ttgtct 408  Q
    ||||||    
T  13676366 ttgtct 13676361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 405
Target Start/End: Original strand, 16947408 - 16947808
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||| ||  |||    
T  16947408 aaaggccacaagagtaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgtgttaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggagacattg 16947507  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16947508 tttgctacaactgcaacgaagagggtcatatcagttcacagtgtattcagctgaagaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgaatggtacgca 16947607  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16947608 gactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 16947707  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16947708 attgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagttt 16947807  T
Q  405 g 405  Q
    |    
T  16947808 g 16947808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 11385361 - 11385766
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |   | | |||||| | ||||||    
T  11385361 cgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgat 11385460  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11385461 gttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgcactcaaccaaagaagattagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggta 11385560  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11385561 cgcagactactaatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgatgctactcattgtttcat 11385660  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  ||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11385661 tgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatttgatatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctctt 11385760  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  11385761 gtttgt 11385766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Original strand, 13965601 - 13966008
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||  ||| ||||||||||| |||     
T  13965601 gagaaagaccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgatagaaaatgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagctgaatgcaagcgtggggata 13965700  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| || || || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||  || | |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13965701 ttgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtgtttgcattgactggtac 13965800  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13965801 gcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 13965900  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13965901 gctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttg 13966000  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  13966001 tttgtctg 13966008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Original strand, 15099536 - 15099942
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||| ||      
T  15099536 gagaaaggccacaagagtaacgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacactctagatgattgtaagcgtggggaca 15099635  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    | |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||     
T  15099636 tcgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagccgaagaaggttaggacaggtggtaaggtgtttgctttaactggtat 15099735  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||   || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15099736 gcagacagttaatgaggaccgacttatcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcatt 15099835  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    ||| || | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15099836 gctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 15099935  T
Q  402 tttgtct 408  Q
    |||||||    
T  15099936 tttgtct 15099942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 36 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 13024626 - 13024258
Alignment:
Q  36 atgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccatat 135  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||| ||||| || |||||    
T  13024626 atgagaggaaatgtttcaggtgtggttagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaacgaagaaggtcatat 13024527  T
Q  136 cagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggt 235  Q
    |||||| || || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13024526 cagttctcagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggt 13024427  T
Q  236 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttg 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| | ||    
T  13024426 acttgtttctttaatag-actcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttggatg 13024328  T
Q  336 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13024327 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttg 13024258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 12459941 - 12459544
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||  ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  ||| || |||||||| ||  |||    
T  12459941 aaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaaatgttttaggtgtggtcagaagggacacaccctagctgaatgtaagcgtggggacattg 12459842  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  12459841 tctgctataactgcaatgaagaaggtcatattagttcacagtgtactcagccgaagaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgaattgaaaggtacgca 12459742  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  12459741 gactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactaattgttttattgct 12459642  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12459641 attgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 12459544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21755725 - 21755320
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| || |||||  ||  ||| || |||||||| ||| |||    
T  21755725 aaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgtttcaggtgtggtcagaagggtcacactttagctgaatgtaagcgtggggatattg 21755626  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    | || || |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||  || | ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  21755625 tctgctacaactgcaatggagagggtcatattagctcacagtgtcctgagccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgca 21755526  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  21755525 gactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgct 21755426  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21755425 attgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatggaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgttt 21755326  T
Q  405 gtctga 410  Q
    ||||||    
T  21755325 gtctga 21755320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Original strand, 26091731 - 26092138
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  26091731 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 26091830  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| ||  || | |||||||||  |||||  ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  26091831 ttgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtac 26091930  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26091931 gcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 26092030  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26092031 gctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 26092130  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  26092131 tttgtctg 26092138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 82 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 14140915 - 14140591
Alignment:
Q  82 tgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaa 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||     
T  14140915 tgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataattgtaacgaagagggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagaactggtgggaag 14140816  T
Q  182 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 281  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14140815 gtatttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaaagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 14140716  T
Q  282 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 381  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14140715 gtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgagtgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 14140616  T
Q  382 ttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14140615 ttcagtaactacttctcttgtttgt 14140591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Original strand, 40924750 - 40925157
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  40924750 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 40924849  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| ||  || | |||||||||  |||||  || || || |||||||| |||||||||||    
T  40924850 ttgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtac 40924949  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  40924950 gcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 40925049  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40925050 gctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 40925149  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  40925150 tttgtctg 40925157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Original strand, 12798437 - 12798840
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||  ||||||| ||||||    
T  12798437 aaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtgagcgtggggatgtt 12798535  T
Q  104 gtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgc 203  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| || || || || || ||||||| ||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  12798536 gtttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacacagcctaagaaggctaggacaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgc 12798635  T
Q  204 agactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 303  Q
    | ||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12798636 aaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgt 12798735  T
Q  304 tattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 403  Q
    | || | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12798736 tgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctcttatt 12798835  T
Q  404 tgtct 408  Q
    |||||    
T  12798836 tgtct 12798840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 49155617 - 49155210
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || || |   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  49155617 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcatagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 49155518  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| ||  || | |||||||||  |||||  ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  49155517 ttgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtac 49155418  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  49155417 gcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 49155318  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49155317 gctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 49155218  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  49155217 tttgtctg 49155210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 18050885 - 18051289
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||  |||   ||||||||||| ||||||    
T  18050885 cgagaaaggtcacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgat 18050984  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||| | || ||||| || |||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  18050985 gttgtatgttataattgtaatgaagagggtcacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggta 18051084  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    | |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18051085 cacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 18051184  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  || |||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  18051185 tgctttagaaagtgcatataggttgggtttgattgtgtctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctg 18051284  T
Q  401 gtttg 405  Q
    |||||    
T  18051285 gtttg 18051289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Original strand, 26115523 - 26115930
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  26115523 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 26115622  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| || ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||  || |||||||||||  |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  26115623 ttgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagtacacagtgtcctgaaccgaagaagactagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtac 26115722  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  26115723 gcacactcctaatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttatt 26115822  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26115823 gctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 26115922  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  26115923 tttgtctg 26115930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19150327 - 19149923
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  |   ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||| |||     
T  19150327 gagaaaggccacaacagtaatgtgtgtgatcgagatcagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggagata 19150228  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||||| ||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  19150227 ttgtttgctacaactgtaatgaagaaggacatattagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggctaggataggtggtaaagtatttgcgttgactggtac 19150128  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19150127 gcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcatt 19150028  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    | | || | ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19150027 gttgttgattgtgcatataagttaggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 19149928  T
Q  402 tttgt 406  Q
    |||||    
T  19149927 tttgt 19149923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20749726 - 20749322
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  |   ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||| |||     
T  20749726 gagaaaggccacaacagtaatgtgtgtgatcgagatcagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggagata 20749627  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||||| ||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  20749626 ttgtttgctacaactgtaatgaagaaggacatattagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggctaggataggtggtaaagtatttgcgttgactggtac 20749527  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20749526 gcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcatt 20749427  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    | | || | ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20749426 gttgttgattgtgcatataagttaggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 20749327  T
Q  402 tttgt 406  Q
    |||||    
T  20749326 tttgt 20749322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 406
Target Start/End: Original strand, 14261179 - 14261583
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  |   ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||  |   ||||||||||||||| |||     
T  14261179 gagaaaggccacaagagtaatgtgcgtcatcgagatgagaagaagtactttaggtgtagtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggata 14261278  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || |  |  || || ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  14261279 ttgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtttatgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtac 14261378  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14261379 gcaaactatgaatgaggaccgacttatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 14261478  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    | | || | || || |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14261479 gttgttgattgagcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttg 14261578  T
Q  402 tttgt 406  Q
    |||||    
T  14261579 tttgt 14261583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 174 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15343575 - 15343343
Alignment:
Q  174 gtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 273  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343575 gtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 15343476  T
Q  274 agatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 373  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343475 agacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 15343376  T
Q  374 gctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15343375 gctaagggtaaagtaactacttctcttgtttgt 15343343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 406
Target Start/End: Original strand, 12203733 - 12204137
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||| || |||||| | |||||  ||||||| || ||  ||  ||| |||||||||| ||||     
T  12203733 gagaagggccacaagagtaatgtttgtaatggtgatgagaaaaagtgcttctgatgtgggaagaaagggcatacgatagctgaatgcaagcgtgatgata 12203832  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    ||||||| |  || ||  ||||||| || ||| | || || |||||||   | || ||||||| |   || ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  12203833 ttgtttgcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaagcctaagaaggctcagacaggtggaaaggtgtttgcattgaccggtac 12203932  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
      ||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12203933 atagacggttaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcatt 12204032  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    | | || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12204033 gttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactctagctaagggttcaataactacttctcttg 12204132  T
Q  402 tttgt 406  Q
    |||||    
T  12204133 tttgt 12204137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 12712595 - 12712847
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||    ||  ||||||||| |||||||||    
T  12712595 cgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgcaaacgtggtgat 12712694  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
     |||| || |||||||||||||  ||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| | ||||    
T  12712695 attgtatgctataactgcaatggggagggtcatatcaattctcagtgcactcaacggaagaaggttaggaccagcgggaaagtgtttgccttggcgggta 12712794  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 253  Q
    |||| || || | | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12712795 cgcaaaccacaaatcaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 12712847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 229 - 399
Target Start/End: Original strand, 15146105 - 15146275
Alignment:
Q  229 cagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggt 328  Q
    ||||||||| ||||   ||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||    
T  15146105 cagaggtacatgttatattaatagaacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggt 15146204  T
Q  329 ttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
     | | | | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15146205 cttgctttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 15146275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14957644 - 14957472
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  14957644 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14957545  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14957544 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 14957472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 44788531 - 44788703
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  44788531 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 44788630  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  44788631 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 44788703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8710695 - 8710523
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  8710695 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 8710596  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8710595 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 8710523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 11550282 - 11550454
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| || | ||||  | |   ||||    
T  11550282 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcttttgattgtgtatctgccttgg 11550381  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11550382 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 11550454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 14042837 - 14042610
Alignment:
Q  175 tgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgactt-atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 273  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    | |||||| | |||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||| ||||||    
T  14042837 tgggagagtttttgcattgactggtactcagaccgagagtgaggatc-acttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattat 14042739  T
Q  274 agatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 373  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| | | | | ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||| |    
T  14042738 tgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaa 14042639  T
Q  374 gctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  14042638 gctaagggttttgtgactacttctcttgt 14042610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14335486 - 14335314
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  14335486 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14335387  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14335386 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14335314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 14352867 - 14352640
Alignment:
Q  175 tgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgactt-atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 273  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    | |||||| | |||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||| ||||||    
T  14352867 tgggagagtttttgcattgactggtactcagaccgagagtgaggatc-acttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattat 14352769  T
Q  274 agatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 373  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| | | | | ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||| |    
T  14352768 tgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaa 14352669  T
Q  374 gctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  14352668 gctaagggttttgtgactacttctcttgt 14352640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9591454 - 9591282
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   | ||    
T  9591454 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgg 9591355  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9591354 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 9591282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 11234393 - 11234565
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  11234393 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 11234492  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11234493 gtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 11234565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 13689131 - 13688959
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||  | |   ||||    
T  13689131 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtgtctgctttgg 13689032  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13689031 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 13688959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 18587351 - 18587523
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  18587351 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18587450  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18587451 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 18587523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 15627667 - 15627444
Alignment:
Q  174 gtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 273  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    | |||||||||  | || | |||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15627667 gtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgattataggtacatgcttctttgatagtactcctttaattactattat 15627568  T
Q  274 agatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 373  Q
     |||||||||| ||| |||||||| |||||  || | ||||||  || ||||||| | | | | ||   |||||| |  ||||||||| | |||||||||    
T  15627567 tgatactggtgatacgcattgttttattgccgttgattgtgctcctatgttgggtcttgatatgtcgagtatgaatgaggaaatggttttcgaaactcca 15627468  T
Q  374 gctaagggttcagtaactacttct 397  Q
    ||||||||||| || |||||||||    
T  15627467 gctaagggttcggtgactacttct 15627444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 18180833 - 18180658
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  18180833 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18180734  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | |   ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18180733 gtcttgagttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 18180658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 14144978 - 14144874
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||    ||  |||||||||||||||||||    
T  14144978 cgagaaaggccacaagagtaacgtttgtaccaaggaggagaagaagtgcttcaggtgtggtcaaaagggtcacgtgttagctgattgcaagcgtggtgat 14144879  T
Q  101 gttgt 105  Q
    |||||    
T  14144878 gttgt 14144874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 15158237 - 15158409
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  15158237 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15158336  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  15158337 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 15158409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 17703635 - 17703807
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  17703635 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17703734  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  17703735 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctct 17703807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8201027 - 8200966
Alignment:
Q  338 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8201027 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 8200966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12690591 - 12690420
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  12690591 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattatt-atactagtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 12690493  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12690492 gtcttgatttgtctgatatgagttgagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 12690420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10873662 - 10873608
Alignment:
Q  345 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10873662 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10873608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4442996 - 4442951
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4442996 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 4442951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7826969 - 7826924
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7826969 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 7826924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13459102 - 13459057
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13459102 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13459057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 304
Target Start/End: Original strand, 16726621 - 16726698
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  16726621 atcagaggtacttgatatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgct 16726698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 27104975 - 27105020
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27104975 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 27105020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27173350 - 27173305
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27173350 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 27173305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14207388 - 14207343
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  14207388 aatagtactcctttaattgcaattattaatactggcgctactcatt 14207343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14216078 - 14216033
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  14216078 aatagtactcctttaattgcaattattaatactggcgctactcatt 14216033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 257 - 293
Target Start/End: Original strand, 38356 - 38392
Alignment:
Q  257 cctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38356 cctttaattgctattatagatactggagctacgcatt 38392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 64550 - 64955
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  64550 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgat 64649  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    || ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  64650 gtagtttgctataattgtgatgaagagggccatattagttcacagtgcacacaaccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggta 64749  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  64750 cgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 64849  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  ||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  64850 tgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctctt 64949  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  64950 gtttgt 64955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 49128 - 49533
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  49128 cgagaagggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgat 49227  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    || ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  49228 gtagtttgctataattgtgatgaagagggccatattagttcacagtgcacacaaccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggta 49327  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  49328 cgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcat 49427  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  ||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49428 tgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctt 49527  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  49528 gtttgt 49533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 58162 - 58567
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  58162 cgagaagggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgat 58261  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    || ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  58262 gtagtttgctataattgtgatgaagagggccatattagttcacagtgcacacaaccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggta 58361  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  58362 cgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcat 58461  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  ||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  58462 tgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctt 58561  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  58562 gtttgt 58567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 29979 - 29573
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||| ||| |||| ||      
T  29979 gagaaaggccacaagagtaacgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcaaaagggacacactctagctgattgtaagtgtggggaca 29880  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    | ||||||||||  |||||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  29879 tcgtttgttatatttgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaaccgaagaaggttaggacaggtggtaaggtgtttgctttgactggtac 29780  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  29779 gcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcaatgtttgatt 29680  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    ||| || | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29679 gctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 29580  T
Q  402 tttgtct 408  Q
    |||||||    
T  29579 tttgtct 29573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Original strand, 9721 - 10127
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||    
T  9721 gagaagggccacaagagtaatgtctgtgataaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgtaagcggggagatg 9820  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  9821 ttgtttgctataactgcaatgaggagggccatataagttcacaatgtacgcaaccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtac 9920  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9921 gcaaaccactagtgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcatt 10020  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10021 gctattgaatttgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctag 10120  T
Q  402 tttgtct 408  Q
    |||||||    
T  10121 tttgtct 10127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 24119 - 24294
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  |||||| |    
T  24119 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttag 24218  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24219 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 24294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 54403 - 53996
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  54403 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagcttattgcaagcgtggtgat 54304  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  54303 gttgtttgttataactgcaatgaagagggtcatatcagctcacggtgcacacaaccgaaaaaggttaggaccagtggtaaagtgtttgctttcactggta 54204  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  54203 cgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcat 54104  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54103 tgctattgaatgtgcttataagttgtgtctggttgtatctgatatgaatgtagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctctt 54004  T
Q  401 gtttgtct 408  Q
    || |||||    
T  54003 gtgtgtct 53996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 31941859 - 31941452
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||||||||||||    
T  31941859 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagctgactgcaagcgtggtgat 31941760  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || || || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  31941759 gttgtttgttataattgcaatgaggagggccatatcagttcatagtgtacgcagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgactggta 31941660  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31941659 cgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactcattttttcat 31941560  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31941559 tgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtctagtaactacttctctt 31941460  T
Q  401 gtttgtct 408  Q
    || |||||    
T  31941459 gtgtgtct 31941452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Original strand, 31692359 - 31692765
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||| |||  ||| |||||| |||||||||    
T  31692359 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggttagaagggacacactctagctgactgcaagagtggtgatg 31692458  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  31692459 ttgtttgttataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgtacgcagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtac 31692558  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31692559 gcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcatt 31692658  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31692659 gctattgaatgtgcttataagtcgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctcttg 31692758  T
Q  402 tttgtct 408  Q
    | |||||    
T  31692759 tgtgtct 31692765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 16831701 - 16832106
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    ||   || |||||||||||||||    
T  16831701 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacgtgttagcggactgcaagcgtggtgat 16831800  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  16831801 gttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggta 16831900  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16831901 cgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 16832000  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  || |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16832001 tgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 16832100  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  16832101 gtttgt 16832106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Original strand, 12357704 - 12358107
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||| || || ||||    
T  12357704 aaaggccacaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcggggagacgttg 12357803  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  12357804 tttgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgca 12357903  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
     || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12357904 aaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgct 12358003  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12358004 attgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 12358103  T
Q  405 gtct 408  Q
    ||||    
T  12358104 gtct 12358107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 18131520 - 18131926
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||  | |||| |||||||| |||    
T  18131520 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacgcattagctaattgtaagcgtggggat 18131619  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    || || || |||||||||||||| ||  | ||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  18131620 gtagtgtgctataactgcaatgaggaaagtcatattagttcgcagtgtactcaactgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttactctgactggta 18131719  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18131720 cgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagac-ctggtgctactcattgtttcat 18131818  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18131819 tgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 18131918  T
Q  401 gtttgtct 408  Q
    ||||||||    
T  18131919 gtttgtct 18131926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 406
Target Start/End: Original strand, 16326886 - 16327287
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||  ||| || |||||||| ||  |||    
T  16326886 aaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgagaggaaatgtttcaggtgtggtcagaagggacacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattg 16326985  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    | || || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16326986 tctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcgcagtgtactaagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgca 16327085  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327086 gactaccaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 16327185  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
     |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327186 ttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgttt 16327285  T
Q  405 gt 406  Q
    ||    
T  16327286 gt 16327287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 17189330 - 17188925
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |   | | |||||| | ||||||    
T  17189330 cgagaaaggccacaaaagtaacgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacgttggctaactgcaagtggggtgat 17189231  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17189230 gttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgtactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagtgtttgcgttgactggta 17189131  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17189130 cgcaaactactaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacgggtgctactcattgtttcat 17189031  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  17189030 tgctttagaatgtgcatataaattgggtttgattgtatctgatatggagggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctc 17188931  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  17188930 gtttgt 17188925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12181296 - 12180894
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||| || |||  ||  ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||| |||| ||| ||  |||    
T  12181296 aaaggccacaagagtaaagtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcagttgtggtcggaaaggacacacactagctgattgtaagcttggggacattg 12181197  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||||||||| |||||  | || || |||||||||||  | || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  12181196 tttgttataattgcaacaaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtacgta 12181097  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
     || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12181096 aaccactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgct 12180997  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12180996 attgaatgtgcttataagttgggtctgtttgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgacactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 12180897  T
Q  405 gtc 407  Q
    |||    
T  12180896 gtc 12180894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 10 - 403
Target Start/End: Original strand, 11949107 - 11949500
Alignment:
Q  10 ccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgtttgt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   ||  |||||| ||||| || |||||||||||     
T  11949107 ccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcagatgtggtcagaaaggacacatattagctgattgtaagcggggagatgttgtttgc 11949206  T
Q  110 tataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagacta 209  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||  || || ||  |  ||||||||||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |    
T  11949207 tataactgcaatgaggaaggtcacatcagtttgcagtgtacgtagacgaagaaggttaggatcggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaacca 11949306  T
Q  210 ctactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaa 309  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11949307 ctagtgaggatcaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattga 11949406  T
Q  310 atgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 403  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11949407 atgtggttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtt 11949500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 24190260 - 24189855
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |   | | |||||| | ||||||    
T  24190260 cgagaaaggccacaaaagtaacgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacgttggctaactgcaagtggggtgat 24190161  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24190160 gttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgtactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagagtttgcgttgactggta 24190061  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24190060 cgcagactactaacgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 24189961  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  24189960 tgctttagaatgtgcatataaattgggtttgattgtatctgatatgaagggagagatggttgttgagactccagctaagggttcagtgactacttttctc 24189861  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  24189860 gtttgt 24189855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17494598 - 17494195
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| || ||| |||| ||  |||    
T  17494598 aaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgct-caggtgtggtcagaaaggacacacactagctgactgtaagtgtggagacattg 17494500  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  17494499 tttgctataactgcaacgaggaaggtcatattagttcgcagtgtactcaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgca 17494400  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
     || | || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17494399 aaccattagtgaggacatgcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgct 17494300  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg-aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 403  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17494299 attgaatgtgcttataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtt 17494200  T
Q  404 tgtct 408  Q
    |||||    
T  17494199 tgtct 17494195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 406
Target Start/End: Original strand, 11958358 - 11958759
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    ||||||||||| || |||| ||||  ||  ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || |||  ||| || |||||||  ||  |||    
T  11958358 aaaggccacaaaagcaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacatacactagctgaatgtaagcgtgaggacattg 11958457  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    | || || |||||||| |||||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11958458 tctgctacaactgcaacgaagaaagtcatatcagttcatagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 11958557  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11958558 gactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgct 11958657  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
     |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11958658 ttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 11958757  T
Q  405 gt 406  Q
    ||    
T  11958758 gt 11958759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 8744563 - 8744967
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||  |||   ||||||||||| ||||||    
T  8744563 cgagaaaggtcacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgat 8744662  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  8744663 gttgtatgctataattgtaatgaagagggccacatcagtactcagtgcacacaaccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggta 8744762  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    | |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8744763 cacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 8744862  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  || |||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8744863 tgctttagaaagtgcatataggttgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctt 8744962  T
Q  401 gtttg 405  Q
    |||||    
T  8744963 gtttg 8744967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 47126899 - 47126492
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  47126899 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 47126800  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| ||  || | |||||||||  |||||  ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  47126799 ttgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggtaaggtgtttgctttgactggtac 47126700  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  47126699 gcagactcctaacgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 47126600  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47126599 gctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 47126500  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  47126499 tttgtctg 47126492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10408923 - 10408519
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  10408923 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 10408824  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| ||  || | |||||||||  |||||  ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  10408823 ttgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtac 10408724  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10408723 gcagactcctaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 10408624  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10408623 gctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 10408524  T
Q  402 tttgt 406  Q
    |||||    
T  10408523 tttgt 10408519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 13944980 - 13944576
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||  |||   ||||||||||| ||||||    
T  13944980 cgagaaaggtcacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgat 13944881  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||| | || ||||| || |||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  13944880 gttgtatgctataattgtaatgaagagggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggta 13944781  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    | |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13944780 cacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 13944681  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  |||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13944680 tgctttagaatgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatggaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcta 13944581  T
Q  401 gtttg 405  Q
    |||||    
T  13944580 gtttg 13944576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 28757274 - 28756868
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  28757274 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 28757175  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| || ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||  || | |||||||||  |||||  || || || |||||||| |||||||||||    
T  28757174 ttgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtac 28757075  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28757074 gcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 28756975  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28756974 gctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 28756875  T
Q  402 tttgtct 408  Q
    |||||||    
T  28756874 tttgtct 28756868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 406
Target Start/End: Original strand, 14290706 - 14291110
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |   ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||  |||||| |||||||| ||||    
T  14290706 gagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgattgagatgagaagaagtgctttaggtgtggacagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatg 14290805  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    || |||| ||||| ||  |||||||||| ||||| || || || ||||   | || ||||||||| | || ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  14290806 ttatttgctataattgtgatgaagagggacatattagctcgcagtgcaagaagcctaagaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtac 14290905  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| ||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14290906 gcaaaccgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcatt 14291005  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    ||| || | ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291006 gctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 14291105  T
Q  402 tttgt 406  Q
    |||||    
T  14291106 tttgt 14291110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Original strand, 16825456 - 16825861
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||  ||  |||||| |||||||| ||  |||    
T  16825456 aaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgtgatgagaagaagtgcttcaggtgtggtaaaaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggacattg 16825555  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||| || |||| |||||| || || ||||||||||  || || || || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  16825556 tttgctacaacttcaatgaggaaggtcatatcagtttgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgca 16825655  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaata--gtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 302  Q
     ||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16825656 aacggtgaatgaggactgacttatcagaggtacttgtttctttaatatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattg 16825755  T
Q  303 ctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || || | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825756 ctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 16825855  T
Q  403 ttgtct 408  Q
    ||||||    
T  16825856 ttgtct 16825861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 408
Target Start/End: Original strand, 10417225 - 10417625
Alignment:
Q  8 ggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgttt 107  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||     |    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  10417225 ggccacaagagtaatgcttgcactcaagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaaaggtcatgtgttggcggattgcaagcgtggagatattgttt 10417324  T
Q  108 gttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagac 207  Q
    ||| ||||||   ||| ||||| || || ||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10417325 gttttaactgtggtgatgagggtcacattagttcgcagtgcccgcaacctaagaaggtcagaactggaggaaaagtatttgctttgactggtacgcagac 10417424  T
Q  208 tactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctatt 307  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |     
T  10417425 taccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctacacattgtttcattgcttta 10417524  T
Q  308 aaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtc 407  Q
     | ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  10417525 gagtgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctctggtgtgtc 10417624  T
Q  408 t 408  Q
    |    
T  10417625 t 10417625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 157 - 380
Target Start/End: Original strand, 13317863 - 13318086
Alignment:
Q  157 gaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtact 256  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317863 gaagaaggtcagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtact 13317962  T
Q  257 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 356  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13317963 cctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcttgattgtatctgatatgaaaggagaaa 13318062  T
Q  357 tggttgttgaaactccagctaagg 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13318063 tggttgttgaaactccagctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 193 - 405
Target Start/End: Original strand, 16378299 - 16378511
Alignment:
Q  193 gactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcat 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16378299 gactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattgctatcatagacactggtgctactcat 16378398  T
Q  293 tgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaacta 392  Q
    |||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16378399 tgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaacta 16378498  T
Q  393 cttctcttgtttg 405  Q
    |||||||||||||    
T  16378499 cttctcttgtttg 16378511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 214 - 406
Target Start/End: Original strand, 12509869 - 12510061
Alignment:
Q  214 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12509869 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgt 12509968  T
Q  314 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  12509969 gcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttgt 12510061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 173 - 406
Target Start/End: Original strand, 12857841 - 12858073
Alignment:
Q  173 ggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 272  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12857841 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggac-gacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 12857939  T
Q  273 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 372  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |    ||||| |||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12857940 tagatactggtgctagttattgtttcattgctgtggtttgtgcatataagttggttctggttatatctgatatgaatggagaaacggttgttgaaactcc 12858039  T
Q  373 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12858040 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 12858073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 248 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 12273047 - 12272887
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatga 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12273047 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgactatgcatttaagttgggtctggttgtatctgatatga 12272948  T
Q  348 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12272947 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 12272887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15230552 - 15230154
Alignment:
Q  8 ggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgttt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||||| || || ||| | |||||  ||||||| || ||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15230552 ggccacaagagtaatgtttgtaatggtgatgagaaaaagtgtttctgatgtgggaagaaagggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgttt 15230453  T
Q  108 gttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagac 207  Q
    | |  || ||  ||||||| || ||| | || || |||||||   | || ||||||| |   || ||||| || |||||||||||||| ||||| | |||    
T  15230452 gcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaagcctaagaaggatcagacaggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacggac 15230353  T
Q  208 tactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctatt 307  Q
       || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15230352 ggttaatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgtt 15230253  T
Q  308 aaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
     | | ||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15230252 gattttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgt 15230154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15236420 - 15236022
Alignment:
Q  8 ggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgttt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||||| || || ||| | |||||  ||||||| || ||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15236420 ggccacaagagtaatgtttgtaatggtgatgagaaaaagtgtttctgatgtgggaagaaagggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgttt 15236321  T
Q  108 gttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagac 207  Q
    | |  || ||  ||||||| || ||| | || || |||||||   | || ||||||| |   || ||||| || |||||||||||||| ||||| | |||    
T  15236320 gcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaagcctaagaaggatcagacaggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacggac 15236221  T
Q  208 tactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctatt 307  Q
       || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15236220 ggttaatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgtt 15236121  T
Q  308 aaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
     | | ||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15236120 gattttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgt 15236022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 35983136 - 35982839
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  || |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  |   ||||||||||||||| |||    
T  35983136 gagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgaccgag-atgagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggat 35983038  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
     ||||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||| ||    
T  35983037 attgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcattgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactgtta 35982938  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttca 299  Q
    |||| ||    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35982937 cgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagagatacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtactactcattgtttca 35982839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 16384545 - 16384721
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   |   |||||||||||||||||||    
T  16384545 cgagaaagtccacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacatgttggctgattgcaagcgtggtgat 16384644  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgg 177  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  16384645 gttgtatgctataattgtaatgaagagggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagaactggtgg 16384721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 311 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 14575632 - 14575535
Alignment:
Q  311 tgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14575632 tgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 14575535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 12843513 - 12843688
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  12843513 atcagaggtacttgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 12843612  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
     | | | | | ||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12843613 atcttgctatgtcaaatatgaatggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagtgactacttctcttgt 12843688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 15262350 - 15262175
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  15262350 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 15262251  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  15262250 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaatggttcggtgactacttctcttgt 15262175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 15345655 - 15345827
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  15345655 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15345754  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15345755 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 15345827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16638493 - 16638321
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| || | |||| || |   ||||    
T  16638493 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgtgtttctgctttgg 16638394  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16638393 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16638321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 43165395 - 43165223
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  43165395 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 43165296  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  43165295 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 43165223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 48428167 - 48427995
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  48428167 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 48428068  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  48428067 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 48427995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 399
Target Start/End: Original strand, 15013115 - 15013340
Alignment:
Q  174 gtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 273  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||  | | |||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15013115 gtgggaaggtgtttgctttagctggtactcagacagcgaatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagcactcctttaattactattat 15013214  T
Q  274 agatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 373  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||| |||| |  | | ||||||  |||||||||| | ||| | ||   |||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  15013215 agatactagtgttacacatttttttattgttgctgattgtgctactaagttgggtcttgttatgtcgtctatgaatggggaaatggttgtcgaaacccca 15013314  T
Q  374 gctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    ||||||||||| || |||||||||||    
T  15013315 gctaagggttcggtgactacttctct 15013340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10008320 - 10008148
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  10008320 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 10008221  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10008220 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10008148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10908930 - 10908758
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  10908930 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 10908831  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10908830 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10908758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12889429 - 12889257
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  12889429 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 12889330  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12889329 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 12889257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 13255410 - 13255238
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  13255410 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 13255311  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13255310 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 13255238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 246 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15065772 - 15065612
Alignment:
Q  246 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 345  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  15065772 ttaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatat 15065673  T
Q  346 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  15065672 gaatggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtttgt 15065612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15358803 - 15358631
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  15358803 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15358704  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15358703 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 15358631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 15713466 - 15713638
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  15713466 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15713565  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15713566 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 15713638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24185910 - 24185738
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  24185910 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 24185811  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  24185810 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtttggtgactacttctct 24185738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3688663 - 3688491
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    | |||| || |   ||||    
T  3688663 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttccgattgtgtttctgctttgg 3688564  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  3688563 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 3688491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 15586802 - 15586974
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  15586802 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15586901  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  15586902 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 15586974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 397
Target Start/End: Original strand, 14578818 - 14578988
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||| ||| |||||  || ||| ||| |||||| || ||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  14578818 atcagagctacatgttttattgataatacacctttagttactattattgatcctagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 14578917  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 397  Q
    || |     | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14578918 gtcttcccatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 14578988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 399
Target Start/End: Original strand, 14873997 - 14874150
Alignment:
Q  246 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 345  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | | | | ||| ||||    
T  14873997 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatatgtctaatat 14874096  T
Q  346 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14874097 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14874150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 15399927 - 15400099
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  15399927 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttggttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15400026  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  15400027 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttcggtgactacttctct 15400099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 16754111 - 16754283
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16754111 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16754210  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16754211 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16754283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 20059464 - 20059636
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  20059464 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 20059563  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20059564 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 20059636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6603455 - 6603283
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  6603455 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacccattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 6603356  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6603355 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 6603283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16694884 - 16694712
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |  |||||    
T  16694884 atcagaggtacttgctatattaataatactcccttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcgttgg 16694785  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16694784 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctct 16694712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 16804357 - 16804529
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||| |||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16804357 atcagatgtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16804456  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  16804457 gtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctct 16804529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 26790823 - 26790995
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |  | |||| ||     ||||    
T  26790823 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgttttcgattgtgtttccgctttgg 26790922  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  26790923 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 26790995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 53382428 - 53382600
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  53382428 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 53382527  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  53382528 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 53382600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 399
Target Start/End: Original strand, 5422359 - 5422512
Alignment:
Q  246 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 345  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | || | || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  5422359 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 5422458  T
Q  346 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  5422459 gaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctct 5422512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 13317746 - 13317867
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     ||   |||||||||||||| ||||| |    
T  13317746 aaaggccacaaaagtaatgtttgcaccaaagatgagaagaagtgtttcagatgtggtcaaaaaggtcatgttttagcggattgcaagcgtggggatgtgg 13317845  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaaga 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  13317846 tttgttataactgtaatgaaga 13317867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 17492479 - 17492396
Alignment:
Q  319 taagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    |||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||    
T  17492479 taagttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgt 17492396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11861094 - 11861033
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctac 288  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11861094 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 11861033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 12501879 - 12501751
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |  |||||||| ||| |||||||  |||| || |||||  ||  ||||||||||| |||||||    
T  12501879 cgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaggaggtaaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtcacacattagctgattgcaagcatggtgat 12501780  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagaggg 129  Q
     |||| ||||  || ||||| ||||||||    
T  12501779 attgtgtgtttcaattgcaaggaagaggg 12501751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 8271830 - 8271875
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8271830 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 8271875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 13964786 - 13964831
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13964786 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13964831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 304
Target Start/End: Original strand, 23079427 - 23079504
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||    
T  23079427 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgcaacacattgttttattgct 23079504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 30150066 - 30150021
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30150066 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 30150021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 15944026 - 15944071
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  15944026 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcatt 15944071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 22150168 - 22150213
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  22150168 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcatt 22150213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 110
Target Start/End: Original strand, 2037086 - 2037194
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |   || |||||||| |||||| | |||||  ||||||| || ||  ||  ||| |||||||||||||||     
T  2037086 gagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgata 2037185  T
Q  102 ttgtttgtt 110  Q
    |||||||||    
T  2037186 ttgtttgtt 2037194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 110
Target Start/End: Original strand, 2040827 - 2040935
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |   || |||||||| |||||| | |||||  ||||||| || ||  ||  ||| |||||||||||||||     
T  2040827 gagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgata 2040926  T
Q  102 ttgtttgtt 110  Q
    |||||||||    
T  2040927 ttgtttgtt 2040935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 11861298 - 11861234
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaa 66  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  11861298 gagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaggaggtgaagaaatgtttctggtgtggtaagaa 11861234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14039701 - 14039593
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |   || |||||||| |||||| | |||||  ||||||| || ||  ||  ||| |||||||||||||||     
T  14039701 gagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgata 14039602  T
Q  102 ttgtttgtt 110  Q
    |||||||||    
T  14039601 ttgtttgtt 14039593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 23414974 - 23415006
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23414974 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctaa 23415006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Original strand, 5161 - 5564
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||  |||||| |||||  | |||||||    
T  5161 aaaggccacaagagtaatgtctgtgataaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacactttagctgattgtaagcggagagatgttg 5260  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  5261 tttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcatagtgtacataaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgca 5360  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5361 aaccactactgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgct 5460  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5461 attgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 5560  T
Q  405 gtct 408  Q
    ||||    
T  5561 gtct 5564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 7394 - 6987
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  7394 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgat 7295  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| || || |||||||   | || |||||| |||| |||||||| |||||||||||  | ||||| |    
T  7294 gttgtttgttataactatgatgaagaggggcatattagctcgcaatgcaagaagcccaagaagattaggaccggtggtaaagtgtttgctctaactggca 7195  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7194 cgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 7095  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7094 tgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 6995  T
Q  401 gtttgtct 408  Q
    || |||||    
T  6994 gtgtgtct 6987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 203737 - 203332
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    ||   |||||||||  |||||||    
T  203737 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaaggatggtgat 203638  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  203637 gttgtatgttataactgtaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagtcgaagaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgactggta 203538  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  203537 cgcagactactaatgaggacaggcttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 203438  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  203437 tgctttagaaagtgcttataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 203338  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  203337 gtttgt 203332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 424438 - 424266
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||     | |||| || |   |||     
T  424438 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcctacgattgtgtttctgctttga 424339  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  424338 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 424583 - 424504
Alignment:
Q  82 tgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaaga 161  Q
    ||||||||||||||  ||  |||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||    
T  424583 tgattgcaagcgtgaggacattgtgtgttttaactgcaatgaagagggtcacatcagttcacagtgtactcagcctaaga 424504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 405
Target Start/End: Original strand, 23078036 - 23078436
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    ||||||||||| || |||| ||||  ||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||| ||  |||    
T  23078036 aaaggccacaaaagcaatgcttgtggtagagatgagaggaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattg 23078135  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||| || |||||||| ||||| || |||||||||||| | || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23078136 tttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcatagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactagtacgca 23078235  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23078236 gactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgca 23078335  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23078336 attgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagttt 23078435  T
Q  405 g 405  Q
    |    
T  23078436 g 23078436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 22505919 - 22505512
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||| || |||| ||| |||||||||||||||||||  ||||| | | ||  ||| || |||||||| ||      
T  22505919 gagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagacgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagatgggacatagcttagctgaatgtaagcgtggggaca 22505820  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| || || |||||||||| |||||| || ||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  22505819 ttgtctgctacaactgcaatggagagggtcacatcagttcacagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtac 22505720  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22505719 gcagactaccaatgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 22505620  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22505619 gctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttg 22505520  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  22505519 tttgtctg 22505512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Original strand, 23563299 - 23563702
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| || ||| |||| ||   ||    
T  23563299 aaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgactgtaagggtggagacaatg 23563398  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  23563399 tttgttataactgcaatgaggaaggtcatattagttcgcagtgtacgcagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgca 23563498  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
     || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23563499 aacaactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatattatagaaactggtgctactcaatgtttaattgct 23563598  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23563599 attgaatgtgcatataagttgggtatggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 23563698  T
Q  405 gtct 408  Q
    ||||    
T  23563699 gtct 23563702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 20345522 - 20345115
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| ||||||||||| ||      
T  20345522 gagaaagcccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagttgaatgcaagcgtggggaca 20345423  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| || || ||||||||||  || || ||||| |||||||| ||  || | |||||||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  20345422 ttgtctgctacaactgcaatggggaaggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttaactggtac 20345323  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20345322 gcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 20345223  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20345222 gctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttg 20345123  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  20345122 tttgtctg 20345115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 25851312 - 25850905
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||  ||| | ||||||||| ||      
T  25851312 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagctgaatacaagcgtggagaca 25851213  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| || || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||  || | |||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  25851212 ttgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttgactggtac 25851113  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  25851112 gcagactaccaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 25851013  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25851012 gctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaaggttcagtaaccacttctcttg 25850913  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  25850912 tttgtctg 25850905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Original strand, 14884119 - 14884526
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   |   ||| ||||||||||| ||      
T  14884119 gagaaaggccacaagagtaatgtctgtgggagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttggctgaatgcaagcgtggggaca 14884218  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||  || || ||||| |||||||| ||  || | |||| ||||  |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14884219 ttgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaggaagactagaattggtgggaaagtgtttgctttgactggtac 14884318  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14884319 gcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 14884418  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14884419 gctattgaatgtgcatataagttgggtttagatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 14884518  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  14884519 tttgtctg 14884526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 17266461 - 17266865
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  |||   ||||||||||| ||||||    
T  17266461 cgagaaaggtcacaagagtaacgtttgtaccgaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgat 17266560  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||| | || ||||| || |||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  17266561 gttgtatgctataattgtaatgaagagggtcacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggta 17266660  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |  ||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17266661 cctagactgctaatgaggaccgtctcatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 17266760  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  || |||| |||| |||||||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17266761 tgctttagaaagtgcatataggttgggtttgtttgtgtctaacatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctt 17266860  T
Q  401 gtttg 405  Q
    |||||    
T  17266861 gtttg 17266865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 20824687 - 20824296
Alignment:
Q  8 ggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgttt 107  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||     |  | || ||||||||||| ||| ||||||    
T  20824687 ggccacaagagtaatgcttgcactcaagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaaaggtcatgtgttggtggactgcaagcgtggagatattgttt 20824588  T
Q  108 gttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagac 207  Q
    ||| ||||||   ||| || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20824587 gttttaactgtggtgatgaaggtcacattagttcgcagtgcacgcaacctaagaaggtcaggactggaggaaaagtatttgctttgactggtacgcagac 20824488  T
Q  208 tactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctatt 307  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  20824487 taccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgcttta 20824388  T
Q  308 aaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
     | ||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20824387 gagtgtgcatataagttgggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 20824296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 146 - 408
Target Start/End: Original strand, 28892214 - 28892476
Alignment:
Q  146 tgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttct 245  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28892214 tgcactcaacctaagaaggtcagaaccggaggaaaagtattcgctttgactggtactcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttct 28892313  T
Q  246 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  28892314 ttaatggtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatat 28892413  T
Q  346 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28892414 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtct 28892476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 146 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20779009 - 20778753
Alignment:
Q  146 tgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttct 245  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || || || || || ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20779009 tgcactcaacctaagaaggtcagaaccggaggaaaggtattcgctttgactggtaatcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttct 20778910  T
Q  246 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||    
T  20778909 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatat 20778810  T
Q  346 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20778809 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgt 20778753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22465184 - 22464790
Alignment:
Q  8 ggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgttt 107  Q
    |||||||||||||||| ||| |   | |||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |   |   ||| ||||||||||| ||| | ||||    
T  22465184 ggccacaagagtaatgcttgcatccaagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaagggtcatatgttggctgaatgcaagcgtggagatatcgttt 22465085  T
Q  108 gttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagac 207  Q
    ||| ||| ||    || |||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||| ||||  || ||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  22465084 gttttaattgtggcgatgagggccacattagctcgcagtgcacgcaacctaagaaggtcagaattggagggaaggttttcgctttgactggtacccagac 22464985  T
Q  208 tactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctatt 307  Q
    ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  22464984 taccaacgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgcttta 22464885  T
Q  308 aaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
     ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22464884 gaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgt 22464790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 173 - 406
Target Start/End: Original strand, 21983476 - 21983709
Alignment:
Q  173 ggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 272  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21983476 ggtggaaaggtgtttgcattgactgttacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattactatta 21983575  T
Q  273 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 372  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21983576 ttgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactcc 21983675  T
Q  373 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21983676 agctaagggttcagtaactacttctctcgtttgt 21983709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 173 - 406
Target Start/End: Original strand, 21561324 - 21561557
Alignment:
Q  173 ggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 272  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21561324 ggtggaaaggtgtttgcattgactggtatgcaaacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctatta 21561423  T
Q  273 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 372  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||| | ||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21561424 ttgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttaggtatggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactcc 21561523  T
Q  373 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21561524 agctaagggttcagtaactacttctctcgtttgt 21561557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 174 - 399
Target Start/End: Original strand, 21631699 - 21631924
Alignment:
Q  174 gtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 273  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    | |||||||||  | || |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21631699 gtgggaaagtgtttgctttgactggtacacagacagtgaatgaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattat 21631798  T
Q  274 agatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 373  Q
      ||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||| | ||| | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  21631799 taatactggtgctacgcattgttttattgctgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactcca 21631898  T
Q  374 gctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    ||||||||||| || |||||||||||    
T  21631899 gctaagggttcggtgactacttctct 21631924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 25429454 - 25429279
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | | ||||  ||||||||    
T  25429454 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattttgctactaagttgg 25429355  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25429354 gtcttgttatgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 25429279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 26736080 - 26736255
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||| || |||||    
T  26736080 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgcttctatgttgg 26736179  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  26736180 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggtttggtgactacttctcttgt 26736255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 185 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 23474270 - 23474053
Alignment:
Q  185 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 284  Q
    |||||||||||||||| ||||||    | |||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| || |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  23474270 tttgcattgactggtatgcagacagaaaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgattgtacacctttagttgctattattgataccggtg 23474171  T
Q  285 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 384  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||| | | | |  |  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23474170 ctacacattgttttattgctattgattgtacttctaagttgggtctggctatgacgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 23474071  T
Q  385 agtaactacttctcttgt 402  Q
     || ||||||||||||||    
T  23474070 ggtgactacttctcttgt 23474053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16359535 - 16359363
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16359535 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16359436  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16359435 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16359363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21882807 - 21882635
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  21882807 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttggtattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 21882708  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21882707 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21882635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 29473426 - 29473598
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  29473426 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 29473525  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29473526 gtcttgatttgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 29473598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 34569527 - 34569355
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  34569527 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 34569428  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  34569427 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 34569355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 40711813 - 40711641
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  40711813 atcagaggtacttgctatcttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 40711714  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  40711713 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 40711641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 14997092 - 14997264
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||| || |   ||||    
T  14997092 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttgg 14997191  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  14997192 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 14997264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18782147 - 18781975
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  18782147 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18782048  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18782047 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactacttctct 18781975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 22330240 - 22330412
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  22330240 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22330339  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22330340 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22330412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27521439 - 27521267
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  27521439 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27521340  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27521339 gtcttggtttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27521267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 37288849 - 37289021
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  37288849 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 37288948  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37288949 gtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 37289021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 41773875 - 41773703
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  41773875 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 41773776  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41773775 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 41773703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 19772993 - 19772821
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  19772993 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19772894  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  19772893 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 19772821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27613389 - 27613217
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  27613389 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27613290  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  27613289 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 27613217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 27682753 - 27682925
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  27682753 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27682852  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27682853 gtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27682925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 328
Target Start/End: Original strand, 21332339 - 21332440
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  21332339 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 21332438  T
Q  327 gt 328  Q
    ||    
T  21332439 gt 21332440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22350952 - 22350784
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  22350952 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 22350853  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 395  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22350852 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22350784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23461004 - 23460832
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||  ||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  23461004 atcagaggtacttgctgtattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacccatgtttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 23460905  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23460904 gtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23460832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 27665843 - 27666015
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  27665843 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27665942  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  27665943 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctct 27666015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 246 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 20803611 - 20803458
Alignment:
Q  246 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 345  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || ||  |||||| | | | | ||||||||    
T  20803611 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtctcgctttgtctgatat 20803512  T
Q  346 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  20803511 gaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctct 20803458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22137701 - 22137529
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  22137701 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgatacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22137602  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22137601 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22137529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21410180 - 21410090
Alignment:
Q  214 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  21410180 tgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactatcatagatactggtgctacatattgttttattgct 21410090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 399
Target Start/End: Original strand, 21342878 - 21342939
Alignment:
Q  338 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21342878 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21342939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23526084 - 23525952
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| |  | ||||||| || |||||    
T  23526084 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctacgttgg 23525985  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 359  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||    
T  23525984 gtcttgatatgtctgatatgaatggagagatgg 23525952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23508678 - 23508633
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23508678 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 23508633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24584204 - 24584159
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24584204 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 24584159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 28892076 - 28892137
Alignment:
Q  8 ggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaagg 69  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  28892076 ggccacaagagtaatgcttgcactcaagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaaagg 28892137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 110
Target Start/End: Original strand, 16258164 - 16258272
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |   || |||||||| |||||| | |||||  ||||||| || ||  ||  ||| |||||||||||||||     
T  16258164 gagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgata 16258263  T
Q  102 ttgtttgtt 110  Q
    |||||||||    
T  16258264 ttgtttgtt 16258272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 405
Target Start/End: Original strand, 24096636 - 24097036
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||| ||  |||    
T  24096636 aaaggccacaagagtaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgttttaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattg 24096735  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24096736 tttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcacagtgtactcagccgaagaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 24096835  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24096836 gactactaatgaggactgacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgct 24096935  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24096936 attgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgttt 24097035  T
Q  405 g 405  Q
    |    
T  24097036 g 24097036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 20832917 - 20833324
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | || |||    
T  20832917 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaattgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagaggggagat 20833016  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || || ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||  |||||||||    
T  20833017 gttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcacatcagttcgcagtgtacgcaaccgaggaaggttaggaccggtagtaaagtgtttgctctgactggta 20833116  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20833117 cgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatattattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 20833216  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20833217 tgttattgaatgttcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagataagggttcattaactacttctctt 20833316  T
Q  401 gtttgtct 408  Q
    ||||||||    
T  20833317 gtttgtct 20833324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 19857643 - 19857243
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| || ||  |||    
T  19857643 aaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgtaagcggggagacattg 19857544  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  19857543 tttgttataactacaatgaggaaggtcatattagttcgcagtgtactcaaccgaagaaggttatgaccagtggtaaagtgtttgctctgactggtacgca 19857444  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
     || |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19857443 aaccactagtgaggatcgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgtt 19857344  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857343 attgaatgtgcttataagttgggtatggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 19857244  T
Q  405 g 405  Q
    |    
T  19857243 g 19857243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 52989110 - 52988706
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| || |||||||| ||  |||    
T  52989110 aaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgtttcaggtgtggtcagaagggtcacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattg 52989011  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    | || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  52989010 tctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcacaatgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgca 52988911  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52988910 gactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgct 52988811  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52988810 attgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgttt 52988711  T
Q  405 gtctg 409  Q
    |||||    
T  52988710 gtctg 52988706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 401
Target Start/End: Original strand, 20074727 - 20075126
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||| | |   ||| ||||||||||| |||     
T  20074727 gagaaaggccacaagagcaatgtttgtagtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagcttggctgaatgcaagcgtggggata 20074826  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| || || |||||||||| |||||| ||||||| ||| || ||  || | ||||||||||||||||| || || ||  |||||||||||||||||||    
T  20074827 ttgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcaattcgcagtgtcctgagccgaagaaggttagaactgggggcaagatgtttgcattgactggtac 20074926  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20074927 gcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 20075026  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20075027 gctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 20075126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Original strand, 22015766 - 22016169
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||| || ||||||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  22015766 aaaggccaaaaaagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgcaagcgtggggatgttg 22015865  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||||||||||||||| || || |  ||||| ||||  || || || || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  22015866 tttgttataactgcaacgaggaagatcatattagtttgcagtgtacgcagccgaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgca 22015965  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
     ||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22015966 aacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgat 22016065  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
     || | ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22016066 gttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 22016165  T
Q  405 gtct 408  Q
    ||||    
T  22016166 gtct 22016169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 406
Target Start/End: Original strand, 21739054 - 21739458
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  21739054 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacaccttagttgattgtaagcgtggggatg 21739153  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    || |||| || ||||  |||||||| || ||||||||||| || || ||  | || ||||||||||| || ||||| ||  ||||| | |||||||||||    
T  21739154 ttttttgctacaactataatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacggagcctaagaaggttaggacaggtggcaagctgttttctttgactggtac 21739253  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739254 gcaaacggttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 21739353  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    ||| || | ||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21739354 gctgttgattgtgcatataagttgggtcttgttttatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttg 21739453  T
Q  402 tttgt 406  Q
    |||||    
T  21739454 tttgt 21739458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 48426245 - 48425838
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  48426245 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 48426146  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| ||  || | |||||||||  |||||  ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  48426145 ttgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtac 48426046  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  48426045 gcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 48425946  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48425945 gctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 48425846  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  48425845 tttgtctg 48425838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Original strand, 38909844 - 38910251
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  38909844 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 38909943  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| ||  || | |||||||||  |||||  ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  38909944 ttgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtttttgccttgactggtac 38910043  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38910044 gcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 38910143  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38910144 gctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 38910243  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  38910244 tttgtctg 38910251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Original strand, 31537015 - 31537422
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  31537015 gagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgatagaaaatgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 31537114  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||  || |||||||| |||||||| ||  || | |||||||||  |||||  ||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  31537115 ttgtctgttacaactgcaatggggaaggccatattagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtac 31537214  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31537215 gcagactcctaatgaagaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 31537314  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31537315 gctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 31537414  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  31537415 tttgtctg 31537422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 37680421 - 37680014
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  37680421 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 37680322  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| || ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||  || | |||| ||||  |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  37680321 ttgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaggaagactagaattggtgggaaggtgtttgctttgactggtac 37680222  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  37680221 gcagactcctaatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctattcattgttttatt 37680122  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37680121 gctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 37680022  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  37680021 tttgtctg 37680014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 20297755 - 20297346
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||  ||| ||||||||||| ||      
T  20297755 gagaaatgccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacagcctagctgaatgcaagcgtggggaca 20297656  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattga-ctggta 200  Q
    |||| || || |||||||||| ||| || ||||| |||||| | ||  || |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||| |||||     
T  20297655 ttgtctgctacaactgcaatggagaaggtcatattagttcatagtgtcctgagtcgaagaaggttagaactggtgggaaggtgtttggtttgagctggtt 20297556  T
Q  201 cgcag-actactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttca 299  Q
       |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20297555 attaccactaccaatgaggaccgacttatcagaggtactggtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 20297456  T
Q  300 ttgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297455 ttgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 20297356  T
Q  400 tgtttgtctg 409  Q
    ||||||||||    
T  20297355 tgtttgtctg 20297346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 406
Target Start/End: Original strand, 21742570 - 21742974
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||| |||    
T  21742570 gagaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgag-atgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggat 21742668  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  21742669 gttgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggta 21742768  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||| ||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21742769 cgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 21742868  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    || | || | ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21742869 tgttgttgattgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaactacgtctctt 21742968  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  21742969 gtttgt 21742974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 173 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18710586 - 18710351
Alignment:
Q  173 ggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 272  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710586 ggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 18710487  T
Q  273 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 372  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18710486 taaacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgcgtctggttgtatctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactcc 18710387  T
Q  373 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710386 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 18710351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 402
Target Start/End: Original strand, 20853784 - 20854178
Alignment:
Q  8 ggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgttt 107  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |   |   ||| ||||||||||| ||| | ||||    
T  20853784 ggccacaagagtaatgcttgcacccaagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaagggtcatatgttggctgaatgcaagcgtggagatatcgttt 20853883  T
Q  108 gttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagac 207  Q
    ||| ||| ||    || |||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||| |||||  | ||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  20853884 gttttaattgtggcgatgagggccacattagctcgcagtgcacgcaacctaagaaggtcagaacttgagggaaggttttcgctttgactggtacccagac 20853983  T
Q  208 tactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctatt 307  Q
    ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  20853984 taccaacgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgcttta 20854083  T
Q  308 aaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
     ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20854084 gaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgt 20854178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21961396 - 21961135
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||  ||| || |||||||| ||| |||    
T  21961396 aaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacagtttagctgaatgtaagcgtggggatattg 21961297  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    | || || |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  21961296 tctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcgcagtgccctgagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtatttgctttgactggtacgca 21961197  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 266  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21961196 gactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 21961135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16379210 - 16379031
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16379210 atcagaggtacatgttactttgatggtactcctttaattgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16379111  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    ||   | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16379110 gtcatgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgt 16379031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21752163 - 21751988
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  21752163 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 21752064  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | | | | ||| ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21752063 gtcttgctatgtctaatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 21751988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 22496499 - 22496671
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  22496499 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctacattgg 22496598  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22496599 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22496671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 336 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12200556 - 12200483
Alignment:
Q  336 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 409  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12200556 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 12200483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 16347838 - 16348010
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16347838 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16347937  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16347938 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16348010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 20081619 - 20081791
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  20081619 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtactacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 20081718  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20081719 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 20081791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 24785100 - 24785272
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| |   ||||    
T  24785100 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgctacacattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgg 24785199  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24785200 gtcttgttttatctgatatgaatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttcggtgactacttctct 24785272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 51330735 - 51330907
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  51330735 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 51330834  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  51330835 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 51330907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 246 - 399
Target Start/End: Original strand, 33388291 - 33388444
Alignment:
Q  246 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 345  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  33388291 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 33388390  T
Q  346 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  33388391 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 33388444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 17042258 - 17042430
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  17042258 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17042357  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    |  | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17042358 gccttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 17042430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21833418 - 21833246
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  | |||| || |   ||||    
T  21833418 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatggctttcgattgtgtttctgctttgg 21833319  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21833318 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21833246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21842328 - 21842156
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| || | |||| || |   || |    
T  21842328 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttag 21842229  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21842228 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21842156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 19109484 - 19109312
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||   | | ||||||| |   |||     
T  19109484 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggtgctatgcattgttttattgcctatgattgtgcttctgctttga 19109385  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19109384 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 19109312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 384
Target Start/End: Original strand, 41350911 - 41351068
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  41350911 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 41351010  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 384  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41351011 gtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 41351068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 288
Target Start/End: Original strand, 21045372 - 21045428
Alignment:
Q  232 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctac 288  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21045372 aggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 21045428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 21228799 - 21228947
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  21228799 atcagaggtacttgctatattaatattactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgg 21228898  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 375  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21228899 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21228947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 20828656 - 20828701
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20828656 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20828701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20928149 - 20928104
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20928149 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20928104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22401708 - 22401631
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    ||||||| ||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22401708 atcagagatacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 22401631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 227 - 282
Target Start/End: Original strand, 22435976 - 22436031
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgg 282  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22435976 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactgg 22436031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20528148 - 20528103
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  20528148 aatagtactcctttgattgcaattattgatcctggtgctactcatt 20528103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 263582 - 263177
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    ||   |||||||||  |||||||    
T  263582 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaaggatggtgat 263483  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  263482 gttgtatgttataactgtaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagtcgaagaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgactggta 263383  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  263382 cgcagactactaatgaggacaggcttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 263283  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  263282 tgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 263183  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  263182 gtttgt 263177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 5)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Original strand, 39282 - 39689
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  | |||| ||||| || ||||    
T  39282 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatg 39381  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || | ||||||||| || || || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  39382 ttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcgtatcagttcgcagtgtacacaatcgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtac 39481  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39482 gcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 39581  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39582 gctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 39681  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  39682 tttgtctg 39689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 282 - 408
Target Start/End: Original strand, 44656 - 44782
Alignment:
Q  282 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44656 gtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaaggg 44755  T
Q  382 ttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  44756 ttcagtaactacttctcttgtttgtct 44782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 5081 - 4870
Alignment:
Q  191 ttgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactc 290  Q
    |||||||||||||||||    | |||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  5081 ttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattaattagaggtacatgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacac 4982  T
Q  291 attgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaac 390  Q
    ||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4981 attgttttatttctattgattgtgcttctaagttgggttttgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttagtaac 4882  T
Q  391 tacttctcttgt 402  Q
    ||||||||||||    
T  4881 tacttctcttgt 4870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14554 - 14382
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| |  | || | || |   ||||    
T  14554 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgcgtttctgctttgg 14455  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14454 gtcttgatttgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Original strand, 180794 - 180951
Alignment:
Q  8 ggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgttt 107  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||     |   ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  180794 ggccacaagagtaatgcttgcactcaagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaagggtcatgtgttggctgattgcaagcgtggagatattgttt 180893  T
Q  108 gttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggt 165  Q
    ||| ||||||   ||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  180894 gttttaactgtggtgatgagggtcacattagttcgcagtgcactcaacctaagaaggt 180951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Original strand, 514302 - 514709
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||| || ||| |||| ||      
T  514302 gagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagacgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacagcttaactgaatgtaagtgtggggaca 514401  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| || || |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  514402 ttgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtac 514501  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  514502 gcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 514601  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  514602 gctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 514701  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  514702 tttgtctg 514709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 496192 - 495975
Alignment:
Q  185 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 284  Q
    ||||| |||||||||||||||||    | |||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  496192 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtagacctttagttgctattattgatactagtg 496093  T
Q  285 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 384  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||| | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  496092 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttcgaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 495993  T
Q  385 agtaactacttctcttgt 402  Q
     || ||||||||||||||    
T  495992 ggtgactacttctcttgt 495975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 251 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 441759 - 441602
Alignment:
Q  251 agtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaag 350  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| || | ||||||| ||| |||||| |   | | ||  ||||||| |    
T  441759 agtactcctttagttgctattattgatactggtgctacggattgttttattgctcttgattgtgcttctaaattgggtcttactatgtcaaatatgaatg 441660  T
Q  351 gagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  441659 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtct 441602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 441912 - 441860
Alignment:
Q  97 tgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgca 149  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||    
T  441912 tgatgttgtgtgttttaactgcaatgaagagggtcatattggttcgcaatgca 441860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 36 - 405
Target Start/End: Original strand, 5128 - 5497
Alignment:
Q  36 atgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccatat 135  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||| ||||| || |||||    
T  5128 atgagaggaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaacgaagaaggtcatat 5227  T
Q  136 cagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggt 235  Q
    ||||||| | || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5228 cagttcatagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggt 5327  T
Q  236 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttg 335  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||    
T  5328 acttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtatggatg 5427  T
Q  336 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 405  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5428 tatctgatatgaaaagagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttg 5497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 9735 - 10139
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||    ||   ||||||||||||||||||    
T  9735 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcaccttttagcggattgcaagcgtggtgat 9834  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9835 gttgtatgttataactgcaacgaagagtgccatatcagtacacagtgcacactgccgaagaaggttagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggta 9934  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| |||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9935 cgcagactactaatgat-ataggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 10033  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  || |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10034 tgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctctt 10133  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  10134 gtttgt 10139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Original strand, 1901 - 2307
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||| || || |    
T  1901 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcggggagacg 2000  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  2001 ttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtac 2100  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    |||  | |||| |||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2101 gcaacccactagtgagaagatgcttatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 2200  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2201 gctattgaatgttcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggatatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 2300  T
Q  402 tttgtct 408  Q
    |||||||    
T  2301 tttgtct 2307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 70725 - 70323
Alignment:
Q  4 gaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgtt 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||     |   ||| ||||||||||| ||| ||    
T  70725 gaaaggccacaagggtaatgtctgcaccaaagatgagaagaagtgtttcagatgcggtcataaaggtcatgtgttggctgaatgcaagcgtggagatatt 70626  T
Q  104 gtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgc 203  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||||||||    
T  70625 gtttgttataactgtaatgaggagggccacattagttcacagtgcacgcaacctaagaaggtcagaactggaggaaaagtatttgttttgactggtacgc 70526  T
Q  204 agactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 303  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  70525 agactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttctttgc 70426  T
Q  304 tattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 403  Q
    | |  ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  70425 tttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctctagtt 70326  T
Q  404 tgt 406  Q
    |||    
T  70325 tgt 70323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 11854 - 11994
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  11854 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgac 11953  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttc 141  Q
     |||||||||| |  || || ||||| || |||||||||||    
T  11954 attgtttgttacatttggaacgaagaaggtcatatcagttc 11994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 40414 - 40013
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||   ||   |||||||||||| |||||    
T  40414 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgataagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagcggattgcaagcgttgtgat 40315  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40314 gttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactggta 40215  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  40214 cgcagactaccaatgaggaccgtcttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacaggtgctactcattgttttat 40115  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  || |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  40114 tgctttagaaagtgcatataagttggggttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctctt 40015  T
Q  401 gt 402  Q
    ||    
T  40014 gt 40013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 17523 - 17698
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||  | | ||||||  ||||||||    
T  17523 atcagaggtacttgttatattaataatacacctttagttgctattattgatacaggtgctacgcattgtttcatttcttatgattgtgctactaagttgg 17622  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || |  |  |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  17623 gtcttatcatgcctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgctgactacttctcttgt 17698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 65246 - 65651
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| ||| | || |||    
T  65246 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaaaaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacgttggctaattgtaagagaggagat 65345  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||||||||| ||  |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  65346 gttgtttgttataattgtgatgaggaaggccacatcagttcacagtgcacccagccaaagaaggttaggaccggtggaaaagtgtatgcattgactggta 65445  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  65446 cgcagactaccaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcct 65545  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65546 tgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 65645  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  65646 gtttgt 65651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 62721 - 62950
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||  |||||| |||||||| ||||    
T  62721 gagaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccatgatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaagtacacactttagctgattgtaagcgtggggatg 62820  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    ||||||  || ||||| |||||| | || ||||||||||| || || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  62821 ttgttttctacaactgtaatgaataaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaagaaagttaggacaggtggcaaagtgtttgctttgactggtac 62920  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcag 231  Q
    ||| ||    | ||||||||||||||||||    
T  62921 gcaaacagtgaatgaggaccgacttatcag 62950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 493 - 898
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |   | | |||||| |   ||||    
T  493 cgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggaatgat 592  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  593 gttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgcactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagtgtttgcgttgactggta 692  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  693 cgcagactactaatgaggacaagcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcat 792  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  793 tgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagagatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttccctt 892  T
Q  401 gtttgt 406  Q
    ||||||    
T  893 gtttgt 898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10916 - 10744
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||  ||||||||    
T  10916 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgg 10817  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10816 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 402
Target Start/End: Original strand, 4799 - 5198
Alignment:
Q  3 agaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||   ||  |||||||||||||||||||||    
T  4799 agaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgt 4898  T
Q  103 tgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacg 202  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| | || || || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||    
T  4899 tgtatgttataactgcaacgaggagggccatatcagtactcagtgtacacagccgaggaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgctttgactatgacg 4998  T
Q  203 cagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 302  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4999 cagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatactactcctttaattgatattatagacactggtgctacacattgtttcattg 5098  T
Q  303 ctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5099 ctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgt 5198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Original strand, 17432 - 17833
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || || |||||  ||   |||| || ||||||||||    
T  17432 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaagtgctttaggtgtgatcaaaagggtcacacattagcggattacatgcgtggtgat 17531  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || || || || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17532 gttgtatgttacaattgcaacgaagagggccatatcagtactcagtgtacacagccgaagaaggttagaactggtgggaaaatgtttgctttgactggta 17631  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  17632 cgcagactactaatgaggatcgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacattggtgctacttattgtttcat 17731  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17732 tgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctt 17831  T
Q  401 gt 402  Q
    ||    
T  17832 gt 17833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 37295 - 36888
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||| |||| |||    
T  37295 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacacactagctgattgtaagtgtggggat 37196  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
     ||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| || ||||| || |||||| | ||||| ||||    
T  37195 attgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcacagtgtacgcagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgttttctttgaccggta 37096  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||| || |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37095 cgcaaacaactaatgaagacagacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 36996  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    || | || | ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36995 tgatgttgattgtgcatacaagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctctt 36896  T
Q  401 gtttgtct 408  Q
    ||||||||    
T  36895 gtttgtct 36888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 6157 - 5754
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||  |||    
T  6157 aaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcagatgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggggacattg 6058  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||| ||||||    
T  6057 tttgttataactgcaacgaggaaggacatattagttcacagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctaactgatacgca 5958  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
     || ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5957 aaccactagcgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattatagatactagtgctactcattgtttcattgct 5858  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5857 atttaatgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctcttgttt 5758  T
Q  405 gtct 408  Q
    ||||    
T  5757 gtct 5754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 397
Target Start/End: Original strand, 41282 - 41452
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | | |||| ||  || ||||    
T  41282 atcagaggtacatgttacattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgg 41381  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 397  Q
    || | ||| | ||   |||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  41382 gtcttgttatgtcatctatgaatggggaaatggttgtcgaaacttcggctaagggttcggtgactacttct 41452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Original strand, 1263 - 1666
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| || |||||||| ||| |||    
T  1263 aaaggccacaagagtaatgcttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgaatgtaagcgtggggatattg 1362  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||| || |  |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| | |||    
T  1363 tttgctacacttgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtactcagcctaagaaggttaggacaggtggtaaagtgttcgcgttgactggcatgca 1462  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1463 gactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 1562  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1563 attgactgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgttt 1662  T
Q  405 gtct 408  Q
    ||||    
T  1663 gtct 1666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 8096 - 7693
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| || |||||||| ||| |||    
T  8096 aaaggccacaagagtaatgcttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgaatgtaagcgtggggatattg 7997  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||| || |  |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| | |||    
T  7996 tttgctacacttgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtactcagcctaagaaggttaggacaggtggtaaagtgttcgcgttgactggcatgca 7897  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7896 gactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 7797  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7796 attgactgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgttt 7697  T
Q  405 gtct 408  Q
    ||||    
T  7696 gtct 7693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 813 - 409
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||   ||  ||| || |||||||| ||  |||    
T  813 aaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgcggtcagaagggtcacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattg 714  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    | || || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  713 tctgctacaactgcaatggagagggtcatataagttcacagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgca 614  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  613 gactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctagtcattgttttattgct 514  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  513 attgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 414  T
Q  405 gtctg 409  Q
    |||||    
T  413 gtctg 409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 35 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 251941 - 251574
Alignment:
Q  35 gatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccata 134  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||| ||  ||||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  251941 gatgagaggaaatgttttaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctaaaactgcaacgaagaaggtcata 251842  T
Q  135 tcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagagg 234  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||   | ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  251841 tcagttcacagtgtactcagccgaag---gctaggaccggtggggaagtgtttgcatggactggtacgcagactactaatgaggaccggcttatcagagg 251745  T
Q  235 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  251744 tacttgtttctttaatagtacttctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggat 251645  T
Q  335 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  251644 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttg 251574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 294
Target Start/End: Original strand, 230026 - 230093
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 294  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  230026 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 230093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Original strand, 835 - 1238
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| ||  |||    
T  835 aaaggccacaagagtaacgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggatacactctagctgattgtaagcgtggggacattg 934  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  935 tttattataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaaccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgca 1034  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
     || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1035 aacaactaatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagctactggtgctactcattatttcattgtt 1134  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
     || | |||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1135 gttgattgtgcgcataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 1234  T
Q  405 gtct 408  Q
    ||||    
T  1235 gtct 1238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Original strand, 6205 - 6606
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||   |||  |||||| |||||||| |||    
T  6205 cgagaaaggccacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacgtgctagctgattgtaagcgtggcgat 6304  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
     |||| || ||||| || || ||| ||||||| |||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  6305 attgtatgctataattgtaacgaatagggccacatcagtactcagtgcacacaacagaagaaggttagaactggtggaaaggtatttgctttgactggta 6404  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6405 cacagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctataatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 6504  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6505 tgctttagaaagtgcttataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctctt 6604  T
Q  401 gt 402  Q
    ||    
T  6605 gt 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 5 - 404
Target Start/End: Original strand, 767 - 1166
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||| ||  |||    
T  767 aaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacacactagctgattgtaagcgtggggacattg 866  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  867 tttgttataactgcaacgaggaaggacatatcagttcgcagtgtacgcagccaaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgca 966  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
     || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  967 aacaactaatgaggacagacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcccttaattgctattatagacactagtgctactcattgttttattgct 1066  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| | ||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1067 attgattgtgcatataagttgggtctggctgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 1166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 30289 - 29882
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||| || || ||||||  ||  ||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| || |||||||| ||      
T  30289 gagaaaggccacaaaagcaacgtttgtggtagagatgagaggaagtgattcaggtgtggtcagaaaagacacaacctagctgaatgtaagcgtggggaca 30190  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  || | ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  30189 ttgtctgttacaactgcaatggagagggtcatatcagttcgcagtgtcctgagccgaagaaggttagaaatggtggaaaggtgtttgcattgattggtac 30090  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30089 gcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 29990  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  29989 gctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaagaaccacttctcttg 29890  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  29889 tttgtctg 29882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 11329 - 10928
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||  ||| || |||||||| ||  |||    
T  11329 aaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacgcactagctgaatgtaagcgtggggacattg 11230  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    | || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11229 tctgctacaactgcaatgaagagggtcatatcagctcacagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggagggaaggtgtttgcgttgactggtacgca 11130  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  11129 gactattaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattttt 11030  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
     |  || |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11029 ttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatacttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgttt 10930  T
Q  405 gt 406  Q
    ||    
T  10929 gt 10928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 50457 - 50054
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgtt 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||  || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| ||| ||    
T  50457 aaagaccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacaccttagctgattgtaagcgtggggatatt 50359  T
Q  104 gtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgc 203  Q
    ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||  | || || || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  50358 gtttgctacaactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacccagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgc 50259  T
Q  204 agactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 303  Q
    | ||    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50258 aaacagtgaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 50159  T
Q  304 tattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 403  Q
    | || | ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50158 tgttgattgtgcatataagttggggctagttgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 50059  T
Q  404 tgtct 408  Q
    |||||    
T  50058 tgtct 50054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 406
Target Start/End: Original strand, 30278 - 30679
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||  ||| ||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||  |||  ||| || |||  ||| ||  |||    
T  30278 aaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagataagaggaaatgttttaggtgtggtaagaaaggacacaaactagctgaatgtaagaatggggacattg 30377  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    | || || |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30378 tatgctacaactgcaaagaagaaggtcatatcagttcgaagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 30477  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  30478 gacaacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaaaagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgat 30577  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30578 attgaatgtgcatataagttgggtttggttgtatctgatatgaaaggggtaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 30677  T
Q  405 gt 406  Q
    ||    
T  30678 gt 30679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 13081 - 12678
Alignment:
Q  3 agaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||      || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||| |||||    
T  13081 agaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgacgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgt 12982  T
Q  103 tgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacg 202  Q
    |||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| || || || || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||||    
T  12981 tgtttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcgttaactggtacg 12882  T
Q  203 cagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 302  Q
    || ||    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12881 caaacggtgaatgaggaccaacttatcaggggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 12782  T
Q  303 ctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || || | ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12781 ctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 12682  T
Q  403 ttgt 406  Q
    ||||    
T  12681 ttgt 12678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 42090 - 41683
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  42090 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 41991  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| ||  || | |||||||||  |||||  || || || |||||||| |||||||||||    
T  41990 ttgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtac 41891  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41890 gcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 41791  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41790 gctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 41691  T
Q  402 tttgtctg 409  Q
    ||||||||    
T  41690 tttgtctg 41683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 34692 - 34286
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||| |||||||| || |    
T  34692 gagaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaaaggacacacattagttgattgtaagcgtggggacg 34593  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  34592 ttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatattagttcgtagtgtacgcagccgaagaaggttaggacaggtggaaaggtgtttgccttgactggtac 34493  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| ||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34492 gcaaacagttaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 34393  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    ||| || ||| ||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34392 gctgttgaatatgtatataagttgggtccggttgtatctgatatgaaagtggaaatggttgttgaaattccagctaagggttcagtagctatttctcttg 34293  T
Q  402 tttgtct 408  Q
    |||||||    
T  34292 tttgtct 34286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 115918 - 115508
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||    ||  |||||||||||||||||||    
T  115918 cgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgcaagcgtggtgat 115819  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
     | || || ||||| |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  115818 atagtatgctataattgcaatggggagggtcatatcagttctcagtgcactcaaccgaagaaggttaggaccggtgggaaagtgtttgccttggctggta 115719  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
     ||| || || | ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  115718 tgcaaaccacaaatgaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcat 115619  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    |||| |  | ||||| |||||  | |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  115618 tgctttagagtgtgcatataaactaggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctt 115519  T
Q  401 gtttgtctgat 411  Q
    |||||| ||||    
T  115518 gtttgtttgat 115508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 408
Target Start/End: Original strand, 93849 - 94249
Alignment:
Q  8 ggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgttt 107  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||     |    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  93849 ggccacaagagtaatgcttgcactcaagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaaaggtcatgtgttggcggattgcaagcgtggagatattgttt 93948  T
Q  108 gttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagac 207  Q
    ||| ||||||   ||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  93949 gttttaactgtggtgatgagggtcacattagttcgcagtgcactcaacctaagaaggtcaggactggaggaaaagtatttgctttgactggtacgcagac 94048  T
Q  208 tactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctatt 307  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  94049 tactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgcttta 94148  T
Q  308 aaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtc 407  Q
     ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  94149 gaatgtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctggtgtgtc 94248  T
Q  408 t 408  Q
    |    
T  94249 t 94249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 365
Target Start/End: Original strand, 8970 - 9333
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  | |||| ||||| || ||||    
T  8970 gagaaaagccacaagagtaatgtctgtgataaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatg 9069  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || || |||| ||| || || || ||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  9070 ttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcaaatcaattcgcagtgtacacaaacgaagaaggttaggaccggtggtaatgtgtttgctctgactggtac 9169  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9170 gcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcatt 9269  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 365  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9270 gctattgaatgtgcttataagttgggtcaggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttg 9333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 406
Target Start/End: Original strand, 67060 - 67461
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||   |||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||  ||| || |||| ||| ||  |||    
T  67060 aaaggccacaagagcaatgtttgtggtagacatgagaggaaatgtttcaggtgtggtcaaaagggacacaacctagctgaatgtaagcttggggacattg 67159  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    | || || |||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| | | | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  67160 tctgctacaactgcaatggagaaggtcatattagttcgcaatgtagtgagccgaagagggttagaactggtggaaaagtgtttgcattgactggtatgca 67259  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  67260 gactaccaatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgcc 67359  T
Q  305 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 404  Q
     |  || |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67360 ttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatccgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 67459  T
Q  405 gt 406  Q
    ||    
T  67460 gt 67461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 406
Target Start/End: Original strand, 63471 - 63872
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||| ||| ||| ||    
T  63471 aaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcatggggatatt 63569  T
Q  104 gtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgc 203  Q
    ||||| || ||||  ||||| || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||  |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  63570 gtttgctacaactataatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaagtggcaaggtgtttgctttgactggtacgc 63669  T
Q  204 agactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 303  Q
    | ||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  63670 aaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtgttactcattgtttcattgt 63769  T
Q  304 tattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 403  Q
    | || | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63770 tgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 63869  T
Q  404 tgt 406  Q
    |||    
T  63870 tgt 63872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 5533 - 5130
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||| ||||||    
T  5533 aaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgtt 5435  T
Q  104 gtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgc 203  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| || || || || || ||||||  |||  | ||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  5434 gtttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaagaagtctaggtcaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgc 5335  T
Q  204 agactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 303  Q
    | ||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5334 aaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 5235  T
Q  304 tattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 403  Q
    | || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5234 tgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctgaggtttcagtaactatttctcttgtt 5135  T
Q  404 tgtct 408  Q
    |||||    
T  5134 tgtct 5130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 7)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 149 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 151775 - 151516
Alignment:
Q  149 actcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttcttta 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  151775 actcaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggacaggcttattagaggtatttgtttcttta 151676  T
Q  249 atagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaa 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  151675 atagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatcttatatgaa 151576  T
Q  349 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  151575 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 151516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 23707 - 23882
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  23707 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 23806  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23807 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 23882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 153840 - 153726
Alignment:
Q  9 gccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgtttg 108  Q
    |||| ||||||||||| |||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  153840 gccataagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcgtggagacattgtttg 153741  T
Q  109 ttataactgcaatga 123  Q
     ||||||||||||||    
T  153740 ctataactgcaatga 153726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Original strand, 73792 - 73841
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 297  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  73792 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttt 73841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Original strand, 78173 - 78222
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 297  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  78173 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttt 78222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Original strand, 175708 - 175760
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  175708 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattctttcat 175760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 182099 - 182054
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  182099 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 182054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 152 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 788 - 532
Alignment:
Q  152 caaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaata 251  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  788 caaccgaagaaggttaggatcggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtaaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaata 689  T
Q  252 gtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagg 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  688 gtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagg 589  T
Q  352 agaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  588 ggaaatggttgttgaaactccatctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 858 - 799
Alignment:
Q  3 agaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtc 62  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  858 agaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtacttcaggtgtggtc 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 43053 - 42647
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||   ||||  |||||||| |||    
T  43053 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgctttaggtgtagtcagaaaggacacactttagcggattttaagcgtggggat 42955  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||| || || || |||| ||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||| |||| || ||||| || |||||||| || ||||||     
T  42954 gttgtttgctacaattgtaatgcagaaggtcatattagttcgcagtgtacgcaacctaagaagattaggacaggtggcaaggtgtttgctttcactggtg 42855  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42854 cgcaaacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttatttgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 42755  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    ||   || | ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42754 tgtagttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctctt 42655  T
Q  401 gtttgtct 408  Q
    ||||||||    
T  42654 gtttgtct 42647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 214 - 399
Target Start/End: Original strand, 50506 - 50691
Alignment:
Q  214 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 313  Q
    |||||| || || ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||    
T  50506 tgaggatcgcctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgt 50605  T
Q  314 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    |||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50606 gcttctaccttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 50691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 35 - 399
Target Start/End: Original strand, 4286 - 4650
Alignment:
Q  35 gatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccata 134  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||| || || ||||    
T  4286 gatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacata 4385  T
Q  135 tcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagagg 234  Q
    | ||||| || || || || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||    
T  4386 ttagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcagacggtgaatgaggaccgacttatcagagg 4485  T
Q  235 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||   |||    
T  4486 tacttgtttctttaatagtactcatttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcgggtt 4585  T
Q  335 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4586 atatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 4650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12282 - 11911
Alignment:
Q  35 gatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccata 134  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  |   |||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  12282 gatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattggctgattgcaagtgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaagaaggacata 12183  T
Q  135 tcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagagg 234  Q
    | |||||||| || || || || ||||||||| | || ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||||    
T  12182 ttagttcacagtgtacgcagcctaagaaggttcggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagagg 12083  T
Q  235 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| | |||    
T  12082 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggcgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggtt 11983  T
Q  335 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
     | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11982 atgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 11911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 1796 - 2125
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |   | | |||||| | ||||||    
T  1796 cgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgat 1895  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1896 gttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcccagtgcactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactagta 1995  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1996 cgcagactgctattgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcat 2095  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggttt 330  Q
    |||| |  | ||||| ||||||||||||||    
T  2096 tgctttagagtgtgcatataagttgggttt 2125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 155 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12011 - 11757
Alignment:
Q  155 ccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 254  Q
    |||||||||  |||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12011 ccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 11912  T
Q  255 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggaga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  11911 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 11812  T
Q  355 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11811 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 11757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 12152 - 12032
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  12152 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 12053  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatg 122  Q
    || | ||||| ||||||||||    
T  12052 ttatctgttacaactgcaatg 12032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Original strand, 43374 - 43772
Alignment:
Q  8 ggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgttt 107  Q
    ||||||||||||||||| |||  |   ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||  |||||| |||||||| ||||||||||    
T  43374 ggccacaagagtaatgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggacagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgttt 43473  T
Q  108 gttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagac 207  Q
    | ||||| ||  |||||||||| ||||| || || || ||||   | || ||||||||| | || ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||    
T  43474 gctataattgtgatgaagagggtcatattagctcgcagtgcaagaagcccaagaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaac 43573  T
Q  208 tactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctatt 307  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  43574 agtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgtt 43673  T
Q  308 aaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
     | ||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43674 gattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgt 43772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 70463 - 70079
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  || |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  |   ||||||||||||||| |||    
T  70463 gagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgaccgag-atgagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggat 70365  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
     ||||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  70364 attgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggta 70265  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||| ||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70264 cgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 70165  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 386  Q
    |||| || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70164 tgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 70079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 239 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 60857 - 60690
Alignment:
Q  239 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 338  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  60857 tgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatat 60758  T
Q  339 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60757 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 60690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29876 - 29478
Alignment:
Q  8 ggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttgttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| || ||| |||||||   ||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29876 ggccacaagagtaatgtttgtaaccatgatgagaagaagtgtttccggtgtgggacgaaaggacacacaatagctgagtgcaagcgtggtgatgttgttt 29777  T
Q  108 gttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagac 207  Q
    | || || ||  ||||||| || ||||| || || || ||||   | || ||||||| |   || ||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  29776 gctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctctgactggtacgcaaac 29677  T
Q  208 tactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctatt 307  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  29676 tgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgcagtt 29577  T
Q  308 aaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
     | ||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29576 gattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcacttgtttgt 29478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 5957 - 5553
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |   ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||    
T  5957 gagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgattgagataagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtggggatg 5858  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| || || || ||  | ||||   |||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||  | | ||||||    
T  5857 ttgtttgttataattgtgatgaagagggacacattagctcgtagtgcaagaaacctaagaaggttcgaaccggtggcatggtgtttgctctaattggtac 5758  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 301  Q
    ||| ||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757 gcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 5658  T
Q  302 gctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 401  Q
    | | ||   | ||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  5657 gttgttgtttatgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctctta 5558  T
Q  402 tttgt 406  Q
    |||||    
T  5557 tttgt 5553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 179 - 408
Target Start/End: Original strand, 9353 - 9582
Alignment:
Q  179 aaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagata 278  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9353 aaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcattaatagtactcctttaattgctattatagaca 9452  T
Q  279 ctggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaa 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9453 ctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtacttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaacgggaaatagttgttgaaactccagctaa 9552  T
Q  379 gggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9553 gggttcagtaactacttctcttgtttgtct 9582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 2075 - 1672
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  || |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  |||||| |||||||| |||    
T  2075 gagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgaccgag-atgagaagaagtgctttaggtgtggacagaaaggacatactttagctgattgtaagcgtgg-gat 1978  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||| || ||||| ||  |||||||||| ||||| || || || ||||   | || |||||| || | || ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  1977 gttgtatgctataattgtgatgaagagggacatattagctcgcagtgcaagaagcccaagaagtttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggta 1878  T
Q  201 cgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||| ||    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1877 cgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 1778  T
Q  301 tgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctt 400  Q
    || | || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1777 tgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttcttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctttt 1678  T
Q  401 gtttgt 406  Q
     |||||    
T  1677 ctttgt 1672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 199 - 406
Target Start/End: Original strand, 1 - 208
Alignment:
Q  199 tacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttc 298  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1 tacgcaaacaactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatacgggtgctactcattgtttc 100  T
Q  299 attgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctc 398  Q
    |||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 attgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctc 200  T
Q  399 ttgtttgt 406  Q
    ||||||||    
T  201 ttgtttgt 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 173 - 406
Target Start/End: Original strand, 1392 - 1625
Alignment:
Q  173 ggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 272  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1392 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 1491  T
Q  273 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| |  || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1492 tagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactcc 1591  T
Q  373 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1592 agctaagggttcagtaattacttctcttgtttgt 1625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 173 - 406
Target Start/End: Original strand, 28405 - 28638
Alignment:
Q  173 ggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 272  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28405 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 28504  T
Q  273 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| |  || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28505 tagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactcc 28604  T
Q  373 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28605 agctaagggttcagtaattacttctcttgtttgt 28638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 224 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 1253 - 1069
Alignment:
Q  224 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1253 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagt 1154  T
Q  324 tgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1153 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 1069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5409 - 5190
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||  | |||| ||||| || ||     
T  5409 cgagaaaggccacaggagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagac 5310  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  5309 gttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtactcaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggta 5210  T
Q  201 cgcagactactactgaggac 220  Q
    |||| || |||| |||||||    
T  5209 cgcaaaccactagtgaggac 5190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 200 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15280 - 15072
Alignment:
Q  200 acgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttca 299  Q
    ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15280 acgcaaaccactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcttttatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttca 15181  T
Q  300 ttgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15180 ttgctattgaatgtgcatataagttgggtttgattgtatttgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctct 15081  T
Q  400 tgtttgtct 408  Q
     ||||||||    
T  15080 agtttgtct 15072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15428 - 15279
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15428 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggacgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaatgacacactctagctgattgcaagcgtggtgat 15329  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcac 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15328 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacagtgcac 15279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 230 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6240 - 6071
Alignment:
Q  230 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 329  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||     
T  6240 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactgatgctacgcattgttttaatgctatttattgtgcttctaagttgggtc 6141  T
Q  330 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    |   | | ||  ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6140 ttactatgtcgaatatgaaaggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 6071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 110 - 346
Target Start/End: Original strand, 19026 - 19262
Alignment:
Q  110 tataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagacta 209  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |    
T  19026 tataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaacca 19125  T
Q  210 ctactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaa 309  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19126 ctagtgaggacaggcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattga 19225  T
Q  310 atgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19226 atgtgcttataagttgggtttggttgtatctgttatg 19262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 278
Target Start/End: Original strand, 1556 - 1832
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||  ||| ||||||||||| ||      
T  1556 gagaaaggacacaagagtaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacagtttagctgaatgcaagcgtggggaca 1655  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    || | || || |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  1656 ttatctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcccgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaagtgtttgcattgactggtac 1755  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagata 278  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1756 gcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 1832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 214 - 408
Target Start/End: Original strand, 20689 - 20883
Alignment:
Q  214 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 313  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  20689 tgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgt 20788  T
Q  314 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    || ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20789 gcatataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 20883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 214 - 408
Target Start/End: Original strand, 12509 - 12703
Alignment:
Q  214 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 313  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  12509 tgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgt 12608  T
Q  314 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    || ||||| |||| | | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12609 gcatataaattggatctggttgtatcaaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 12703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 12360 - 12500
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||  |||||| |||||||| ||     
T  12360 cgagaaaggccacaagagtaatgtttttcgtaaagatgagaagaagtgctttaggtgtgctcagaaaggacacacattagatgattgtaagcgtggggac 12459  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttc 141  Q
     |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  12460 attgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcagttc 12500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 20540 - 20680
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||  |||||| |||||||| ||     
T  20540 cgagaaaggccacaagagtaatgtttttcgtaaagatgagaagaagtgctttaggtgtgctcagaaaggacacacattagatgattgtaagcgtggggac 20639  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttc 141  Q
     |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  20640 attgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcagttc 20680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 273
Target Start/End: Original strand, 1439 - 1707
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||  |||| || |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| || ||| |||| ||  |||    
T  1439 aaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgtgaggaaatgttttaggtgtggttagaagggacacaccctagctgaatgtaagtgtggggacattg 1538  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 204  Q
    |||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1539 tttgctacaactgcaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtactcagccgaagaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgcattgactggtacgca 1638  T
Q  205 gactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1639 gactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 1707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 2998 - 2822
Alignment:
Q  230 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||   ||||| ||||||||||||     
T  2998 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggggctactcattgtttcattgttgttgcttgtgcatataagttgggtc 2899  T
Q  330 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2898 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 2822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 11693 - 11968
Alignment:
Q  3 agaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||   |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||  |||  |||||||||| ||  |    
T  11693 agaaaggccacaagagtaatgtatgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaaagcaagcgtggggacat 11792  T
Q  103 tgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacg 202  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||  || |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11793 tgtctgttacaactgcaatggagaaggtcatattagtacacagtgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacg 11892  T
Q  203 cagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagata 278  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11893 caaactaccagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 11968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5795 - 5562
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||  |   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||| ||||    
T  5795 gagaaaggccacaagagtaacgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatg 5696  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    ||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5695 ttgtttgctacaattgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggttaggacaggtggcaaagtgtttgcgttgactggtac 5596  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggt 235  Q
    ||| ||    | ||||||||||||||||||||||    
T  5595 gcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagaggt 5562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 220 - 406
Target Start/End: Original strand, 1 - 187
Alignment:
Q  220 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |  || |||| |||    
T  1 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctattcattgtttcattgctttagaaagtgcatat 100  T
Q  320 aagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  101 aagttgagtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgt 187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 173 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12012 - 11781
Alignment:
Q  173 ggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 272  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12012 ggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagacaattaatgaggaccgacttattagagatacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 11913  T
Q  273 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 372  Q
    ||||   ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |  |||  || | |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11912 tagaccatggtgctacacattgtttcattgctattgattgtgcatataagttgggtctgattg--tcaggtatgagtggagaaatggttgttgaaactcc 11815  T
Q  373 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11814 agctaagggttcaataactacttctcttgtttgt 11781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Original strand, 824 - 1125
Alignment:
Q  5 aaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  |||    
T  824 aaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcatgtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgtaagcgtggtgacattg 923  T
Q  105 tttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttca-----caatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggt 199  Q
    |||| ||||||||||| || || || || |||||||||     || || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||    
T  924 tttgctataactgcaacgaggaaggtcacatcagttcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgactggt 1023  T
Q  200 acgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttca 299  Q
    ||||| || |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  1024 acgcaaacaactagtaaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaataatacgcctttaattgctattatagacactagtgttactcattgtttca 1123  T
Q  300 tt 301  Q
    ||    
T  1124 tt 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 214 - 406
Target Start/End: Original strand, 4250 - 4442
Alignment:
Q  214 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  4250 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgt 4349  T
Q  314 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    || |||||||||||| || || | ||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4350 gcatataagttgggtctacttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgt 4442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 240 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 110727 - 110559
Alignment:
Q  240 gtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatc 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||||| ||    
T  110727 gtttctttaatagtactcctttaattgctgttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtgtc 110628  T
Q  340 tgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110627 tgatatgaaaggagaaatggttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 110559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 52006 - 51716
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |   ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||  ||  | ||||||||| ||||||||    
T  52006 gagaaaggccacaagagtaatgtatgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtaagaaaggacacactttagcttattgcaagcatggtgatg 51907  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    ||||||  ||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||| || || || || ||||||||| | || ||||| || |||||| | |||||||||||    
T  51906 ttgttttctataactgtgatgaagaaggtaatattagttcacagtgtacgcagccaaagaaggttcggacaggtggcaaggtgtttactttgactggtac 51807  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcat 292  Q
    ||||| |   | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51806 gcagattgtgaatgaggactgacttatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactcgtgctactcat 51716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 270
Target Start/End: Original strand, 752 - 1020
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||   ||  ||| || |||||||| ||      
T  752 gagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagacgagaggaagtgcttcaggtgtggtcaaaagggacacagtttagctgaatgtaagcgtggggaca 851  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    |||| || |||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||  || |||||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||    
T  852 ttgtctgctataactgaaatggagagggtcatattagttcgcagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactaggggcaaggtgtttgcattgactggtac 951  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 270  Q
    |||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  952 gcagtctaccaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2985 - 2754
Alignment:
Q  3 agaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||  ||  |||||| ||||| || ||  |    
T  2985 agaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagttcttcaggtgtggacagaagggacacacattagctgattgtaagcggggagacat 2886  T
Q  103 tgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacg 202  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  2885 agtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgtgcacaaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacg 2786  T
Q  203 cagactactactgaggaccgacttatcagagg 234  Q
    || || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  2785 caaaccactagtgaggatcgacttatcagagg 2754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 173 - 406
Target Start/End: Original strand, 4012 - 4242
Alignment:
Q  173 ggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 272  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  4012 ggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacagacggttaatgaggaccgacttataagaggtacttgtttctttaatagtactc---taattgctatta 4108  T
Q  273 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 372  Q
    | || ||||||||||| | ||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4109 ttgacactggtgctacactttgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactcc 4208  T
Q  373 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4209 agctaagggttcagtaactacttatcttgtttgt 4242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 399
Target Start/End: Original strand, 7972 - 8125
Alignment:
Q  246 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 345  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| || | || | || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  7972 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgggtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8071  T
Q  346 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||    
T  8072 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactacttctct 8125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 406
Target Start/End: Original strand, 49086 - 49230
Alignment:
Q  262 aattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 361  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49086 aattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 49185  T
Q  362 gttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49186 gttgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 49230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 232 - 435
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||||||| ||     
T  232 cgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcatgtgtggtcagaaaagacacacactagctgattgtaagcgtggggac 331  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggta 200  Q
     |||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  332 attgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatattagttcgcaatgtacgcaaccgaagaaggttaggaccggtggcaaggtgtttgctttgactggta 431  T
Q  201 cgca 204  Q
    ||||    
T  432 cgca 435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 262 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21946 - 21802
Alignment:
Q  262 aattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 361  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||     
T  21946 aattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataaattgggtttgattatatctgatatgaaaggagaaatggtc 21847  T
Q  362 gttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21846 gttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgt 21802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 174 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 5271 - 5037
Alignment:
Q  174 gtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 273  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    | | |||||||  | || |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5271 gtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagacattgaataaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcttttaattgctattat 5172  T
Q  274 agatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 373  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||| | || | ||||||| |||||||||| | ||| | |   ||||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  5171 tgatactggtgctacgcattgttttattggtgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgttaaatatgaatggagatatggtcgtcgaaactcca 5072  T
Q  374 gctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  5071 gctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtct 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4564 - 4389
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  4564 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 4465  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  4464 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgactacttctcttgt 4389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 227 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 1
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  147 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 48  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 373  Q
    || | | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  47 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 175 - 402
Target Start/End: Original strand, 55592 - 55819
Alignment:
Q  175 tgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattata 274  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||   |  ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||     
T  55592 tgggagagtttttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattatt 55691  T
Q  275 gatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccag 374  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| |   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  55692 gatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccag 55791  T
Q  375 ctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||    
T  55792 ctaagggttcggtgactacttctcttgt 55819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 2437 - 2612
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||  | ||||||||  ||||||||    
T  2437 atcagaggtacttgctatattaataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattcttttattgcttatgaatgtgctactaagttgg 2536  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2537 gtcttgttatgtctgatatgaatggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 2612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 8540 - 8365
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  ||||||||    
T  8540 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 8441  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  8440 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctcttgt 8365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 175 - 402
Target Start/End: Original strand, 14388 - 14615
Alignment:
Q  175 tgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattata 274  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    | |||||| ||  | ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||     
T  14388 tgggagagtttttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatattactcctttaatagcttttatt 14487  T
Q  275 gatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccag 374  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  14488 gatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgctcctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccag 14587  T
Q  375 ctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||    
T  14588 ctaagggttcggtgactacttctcttgt 14615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 13653 - 13828
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13653 atcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattgatgctacacattgttctattgctattgattgtgcttctaagttgg 13752  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  13753 gtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagagttcggtgactacttctcttgt 13828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 175 - 402
Target Start/End: Original strand, 216542 - 216769
Alignment:
Q  175 tgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattata 274  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    | |||||| | | | ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  216542 tgggagagtttttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcaattgatcagaggtacatgttactttgatagtactactttaattgctattatt 216641  T
Q  275 gatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccag 374  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||| | ||| |||  ||||| ||| | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  216642 gatactggtgctacacattgttttattgttattgattgtacttcaaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtagaaactccag 216741  T
Q  375 ctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||    
T  216742 ctaagggttcggtgactacttctcttgt 216769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 185 - 397
Target Start/End: Original strand, 15111 - 15323
Alignment:
Q  185 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 284  Q
    ||||| |||||||||||||||||    | |||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  15111 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagttgctattattaatactggtg 15210  T
Q  285 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 384  Q
    |||| |||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||| |   | | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15211 ctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 15310  T
Q  385 agtaactacttct 397  Q
     || |||||||||    
T  15311 ggtgactacttct 15323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 36628 - 36456
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  36628 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttcattgctttcgattgtgtttctactttgg 36529  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  36528 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 36456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 36853 - 36706
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| | ||||||||| ||| |||||||  |||| || || ||  ||  ||||||||||||| |||||     
T  36853 gagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaggaggtgaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtcatacgttagctgattgcaagcgtagtgata 36754  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgca 149  Q
    |||| || | ||| ||||| |||||||| |||||  |||| |||||||    
T  36753 ttgtgtgctttaattgcaaggaagagggtcatattggttctcaatgca 36706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 230 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 18005 - 17833
Alignment:
Q  230 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 329  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| | ||||||||||     
T  18005 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctgttgattgtgcgtctaagttgggtc 17906  T
Q  330 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    |   | | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  17905 ttactatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgt 17833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 111081 - 111256
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  111081 atcagaggtacatgttattttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 111180  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  111181 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtttgttgactacttctcttgt 111256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 214 - 402
Target Start/End: Original strand, 23459 - 23647
Alignment:
Q  214 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 313  Q
    |||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||| || |  ||    
T  23459 tgaggatcgattaatcagaggtacgtgttattttgatagtactcctttagttgctattattgataatagtgctacgcattgttttattgctcttgatagt 23558  T
Q  314 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    |||| |||||||||| | | | | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  23559 gcttctaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggcgactacttctcttgt 23647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 251 - 408
Target Start/End: Original strand, 9549 - 9706
Alignment:
Q  251 agtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaag 350  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||| |     | ||  ||||||| |    
T  9549 agtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatg 9648  T
Q  351 gagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  9649 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtct 9706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 7003 - 6828
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| ||||  | | || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  7003 atcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 6904  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | | | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  6903 gtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgt 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 14133 - 13958
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| ||||  | | || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  14133 atcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 14034  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | | | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  14033 gtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgt 13958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 214 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 2142 - 1959
Alignment:
Q  214 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 313  Q
    |||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  | | |||    
T  2142 tgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctacgcattgttttattgttgctgattgt 2043  T
Q  314 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 397  Q
    |||  |||||||||| |  || | ||  ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  2042 gctactaagttgggtcttattatgtcatatatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttct 1959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 40681 - 40856
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  40681 atcagaggtacttgctattttgatagtacacctttagttgccattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 40780  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | ||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  40781 gtcttgttatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgt 40856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 248 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 14193 - 14039
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatga 347  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||  |||||||||| | | | | ||||||||||    
T  14193 aatagtacacctttagttgctattattgatagtggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatga 14094  T
Q  348 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14093 atggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 14039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11394 - 11293
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  11394 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 11295  T
Q  327 gt 328  Q
    ||    
T  11294 gt 11293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25287 - 25242
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25287 aatagtactcctttaattgcaattattgatactggtgctactcatt 25242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 309 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26160 - 26063
Alignment:
Q  309 aatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    ||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26160 aatgtgcatataagttgggcctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgt 26063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 10332 - 10504
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  10332 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgccacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 10431  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || ||  | | |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10432 gtctacatatgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctct 10504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 15582 - 15377
Alignment:
Q  185 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 284  Q
    ||||| |||||||||||||| ||    | |||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15582 tttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgattgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtg 15483  T
Q  285 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 384  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||            ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15482 ctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttg------------tcaaatatgaaaggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttc 15395  T
Q  385 agtaactacttctcttgt 402  Q
     || ||||||||||||||    
T  15394 ggtgactacttctcttgt 15377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 552 - 727
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  ||| ||||    
T  552 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaaattgg 651  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  652 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttctgtgactacttcacttgt 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 2119 - 1944
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  2119 atcagaagtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 2020  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || |   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2019 gtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 1944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3723 - 3524
Alignment:
Q  185 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   |  ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||    
T  3723 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctatcattgatactggtg 3624  T
Q  285 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 384  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| | | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3623 ctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttc 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 57788 - 57963
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||| |||||| |    
T  57788 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgttattgattgtgcttctaagttag 57887  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  57888 gtcttgctatgtcgaatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 57963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Original strand, 3450 - 3523
Alignment:
Q  333 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3450 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgt 3523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15041 - 14873
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  ||||||||    
T  15041 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 14942  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 395  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14941 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 29102 - 29274
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  29102 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgctacgcattgatttattgctttcgattgtgtttctactttgg 29201  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29202 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 29274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 28876 - 29024
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||| ||| |||||||  |||| || |||||  ||  ||| ||||||| |||||||    
T  28876 cgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctaaggaggtaaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtcacacattagctgaatgcaagcatggtgat 28975  T
Q  101 gttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgca 149  Q
     |||  ||||  |||||||| | |||||| |||||  |||| |||||||    
T  28976 attgcgtgtttcaactgcaaagtagagggtcatattggttcccaatgca 29024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22377 - 22205
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  22377 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22278  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22277 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 7366 - 7194
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  7366 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 7267  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7266 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 7194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 5)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 17240 - 17412
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  17240 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 17339  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17340 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 17412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 4401 - 4501
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||    
T  4401 cgagaaaggccaaaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcgtggtgat 4500  T
Q  101 g 101  Q
    |    
T  4501 g 4501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 253 - 399
Target Start/End: Original strand, 195038 - 195184
Alignment:
Q  253 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 352  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||  |||    
T  195038 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattgga 195137  T
Q  353 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  195138 gagatagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 195184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 230 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24433 - 24264
Alignment:
Q  230 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 329  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| | || | |||| ||  || |||| |     
T  24433 agaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactagggctacacattgttttattgttgttgattgtgtttcgaaattggatc 24334  T
Q  330 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    | ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  24333 ttgttatgtcatatatgaatggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggttcagtgactacttctct 24264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 17015 - 17148
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |  |||| | ||||||||| ||| |||||||  |||| || |||||  ||  ||| ||||||| |||||||     
T  17015 gagaaaggccacaagagcactgtttgtccagaggaggtgaagaaatgtttctggtgtggcaagaagggtcacacattagctgactgcaagcatggtgata 17114  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatat 135  Q
    | || ||||  |||||||| |||||||| |||||    
T  17115 tcgtgtgtttcaactgcaaagaagagggtcatat 17148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 230 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 104354 - 104182
Alignment:
Q  230 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 329  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| || ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||     
T  104354 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagtttctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaatttgggtc 104255  T
Q  330 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
      ||| | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  104254 ctgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctcttgt 104182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 1093 - 942
Alignment:
Q  246 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 345  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  1093 ttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttcttttttgggtcttgttttgtctgatat 994  T
Q  346 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 397  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  993 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 11054 - 11229
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  ||||||||    
T  11054 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagtttctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 11153  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11154 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 11229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Original strand, 7913 - 8088
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||  |||| |||    
T  7913 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctattgattgtgctactaaggtgg 8012  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | | | | ||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  8013 gtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgt 8088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 8353 - 8178
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| || | ||||||  | ||| ||    
T  8353 atcagaggtacttgttattgtgatagtacgcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttttgattgtgctacttagtcgg 8254  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    |  | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8253 gacttgatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 8178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 26535 - 26301
Alignment:
Q  174 gtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 273  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||    | |||||| ||| | || |||||||  ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  26535 gtgggagagtgtttgcttttactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtaaatgttattttgatagtactcttttagttgctattat 26436  T
Q  274 agatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 373  Q
     |||| ||||||||| || ||||| |||| | || | ||||||| |||||||||| |   | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26435 tgatattggtgctacgcaatgttttattgttgttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactcca 26336  T
Q  374 gctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 408  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  26335 gctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtct 26301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 253 - 399
Target Start/End: Original strand, 37020 - 37166
Alignment:
Q  253 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 352  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | ||||||||||||| |||    
T  37020 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatgga 37119  T
Q  353 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37120 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 37166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1512 - 1364
Alignment:
Q  125 gagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgac 224  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||| |||||  | ||||| || || || ||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||    
T  1512 gagggccacattagctcgcagtgcacgcaacctaagaaggtcagaacttgagggaaggtattcgctttgactggtacacagactaccaacgaggatcgac 1413  T
Q  225 ttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1412 ttatcagaggtacttgtttcttgaatagtactcctttaatagctattat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 41762 - 41590
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  41762 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 41663  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | |   |||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41662 gtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 41590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 75482 - 75310
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  75482 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 75383  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | |   |||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  75382 gtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 75310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 399
Target Start/End: Original strand, 34915 - 35061
Alignment:
Q  253 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 352  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| | |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  34915 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 35014  T
Q  353 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  35015 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctct 35061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 253 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 144 - 1
Alignment:
Q  253 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 352  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | | ||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  144 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattatgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 45  T
Q  353 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttc 396  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16992 - 16761
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctatttgattgcaagcgtggtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||| |||     
T  16992 gagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggata 16893  T
Q  102 ttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacaatgcactcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtac 201  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||| ||||||     
T  16892 ttgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagactaagaaggttaggacaggtggcaaggtattttcgttgtctggtat 16793  T
Q  202 gcagactactactgaggaccgacttatcagag 233  Q
    ||| |||   | ||||||||||||||||||||    
T  16792 gcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagag 16761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 289
Target Start/End: Original strand, 7057 - 7098
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctact 289  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7057 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctact 7098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 32012 - 31841
Alignment:
Q  228 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 327  Q
    ||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| |   |||||    
T  32012 tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttggg 31913  T
Q  328 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    | | ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31912 tcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctct 31841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 54767 - 54592
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  ||||||||    
T  54767 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 54668  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || |  |  | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  54667 gtcttttcatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 54592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 37478 - 37307
Alignment:
Q  228 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 327  Q
    ||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| |   |||||    
T  37478 tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttggg 37379  T
Q  328 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    | | ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37378 tcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctct 37307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 10412 - 10584
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| || |  | |||| || |   ||||    
T  10412 atcagaggtacttgctatattaataacactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattactttcgattgtgtttctgctttgg 10511  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10512 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 13067 - 13239
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||   |||  | |||| || |   ||||    
T  13067 atcagaggtacttgctatattaataaaactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgatttataaatatcgattgtgtttctgctttgg 13166  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13167 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 13239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 284
Target Start/End: Original strand, 16730 - 16840
Alignment:
Q  174 gtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 273  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    | |||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16730 gtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgatcagaggtacatgtttctttaattgtactcctttaattgctattat 16829  T
Q  274 agatactggtg 284  Q
     ||||||||||    
T  16830 tgatactggtg 16840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 410
Target Start/End: Original strand, 21413 - 21542
Alignment:
Q  281 ggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 380  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||  | ||| | ||   |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21413 ggtgctacgcattgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggccttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagg 21512  T
Q  381 gttcagtaactacttctcttgtttgtctga 410  Q
    |||| || ||||||||||| || |||||||    
T  21513 gttcggtgactacttctctagtgtgtctga 21542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 249 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4691 - 4538
Alignment:
Q  249 atagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaa 348  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||  |||||||||| | | | | ||| |||||||    
T  4691 atagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaa 4592  T
Q  349 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||    
T  4591 tggagagatggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgt 4538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 9077 - 8905
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||||  | | ||||||  ||||||||    
T  9077 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacacatttt---attgcttattattgtgctactaagttgg 8981  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8980 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgt 8905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 402
Target Start/End: Original strand, 24916 - 25061
Alignment:
Q  257 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 356  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  |||||  ||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  24916 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagtcaggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 25015  T
Q  357 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  25016 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgt 25061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 1147 - 1192
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1147 aatagtactcctttgattgcaattatagatactggtgctactcatt 1192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 229 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17892
Alignment:
Q  229 cagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggt 328  Q
    |||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||   | | |||| || |   ||| ||    
T  18065 cagaggtacttgctatattaataatactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagt 17966  T
Q  329 ttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
     | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17965 cttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 17892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 11599 - 11424
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||   | | |||| || |   |||     
T  11599 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttga 11500  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11499 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 11424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 55134 - 55058
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 303  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  55134 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgc 55058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 53719 - 53682
Alignment:
Q  365 gaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  53719 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 53682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10498 - 10326
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  10498 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 10399  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10398 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3554 - 3382
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  3554 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgg 3455  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  3454 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctct 3382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 17290 - 17118
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||||||||   ||||||  ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  17290 atcagaggtacttgttatattaataaaactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17191  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  17190 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctct 17118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1259 - 1185
Alignment:
Q  309 aatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtt 383  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1259 aatgtgcatataagttgggtctggttgtatccgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggtt 1185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18822 - 18608
Alignment:
Q  185 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   |  ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||| |||    
T  18822 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgatattattgatactagtg 18723  T
Q  285 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 384  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18722 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 18623  T
Q  385 agtaactacttctct 399  Q
     || |||||||||||    
T  18622 ggtgactacttctct 18608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 1206 - 1378
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||| |||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||| |  | | || || ||  ||||    
T  1206 atcagaggaacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgtattgctttattgctttcgactttgtttctactttgg 1305  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1306 gtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 1378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 13298 - 13470
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  13298 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgg 13397  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13398 gtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 13470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 41285 - 41113
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||| |  | | || || |   ||||    
T  41285 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggggctacgcattgctttattgctttggattatgtttctgctttgg 41186  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41185 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 41113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 943 - 1115
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  943 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 1042  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | | | | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  1043 gtcttgatttgtctgacatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctct 1115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8388 - 8216
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | ||||  | |   || |    
T  8388 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtatctgctttag 8289  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8288 gtcttgaattgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21734 - 21566
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  21734 atcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgg 21635  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 395  Q
    || | ||| | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  21634 gtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 21566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 37158 - 36990
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 326  Q
    ||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  37158 atcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgg 37059  T
Q  327 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 395  Q
    || | ||| | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37058 gtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 36990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11204 - 11078
Alignment:
Q  181 agtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatact 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||    | |||||| ||  | || |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  11204 agtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcatttaattgttattattgatact 11105  T
Q  281 ggtgctactcattgtttcattgctatt 307  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11104 ggtactactcattgttttattgctatt 11078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 490 - 564
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacac 75  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  490 cgagaaaggccacaaaagtagtgtttgtgatacagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacac 564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 99
Alignment:
Q  230 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 329  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| |  | |||| || |   ||||||     
T  268 agaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 169  T
Q  330 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||  || |||||||||||    
T  168 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtttggtgactacttctct 99  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Original strand, 11533 - 11698
Alignment:
Q  230 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 329  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||||     
T  11533 agaggtacttgttatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 11632  T
Q  330 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 395  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11633 ttgatttgtctgatatgaatggagatatggttttttaaactccagctaagggttcggtgactactt 11698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 399
Target Start/End: Original strand, 674 - 826
Alignment:
Q  247 taatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatg 346  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | |||||||||    
T  674 taataatactcattaagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 773  T
Q  347 aaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  774 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctct 826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 304
Target Start/End: Original strand, 15753 - 15830
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 304  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15753 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgcaattattgatactggtgctacgcattgtttaattgct 15830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 48795 - 48719
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 303  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  48795 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgc 48719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2994 - 2924
Alignment:
Q  227 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 297  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2994 atcagaggtacttgttatattaataatactccattagttgctattattgatactggtgctacgcattgttt 2924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1914 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1914
Description:

Target: scaffold1914; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 1178 - 1243
Alignment:
Q  1 cgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaa 66  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  1178 cgagaaaggtcacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaa 1243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12621
Alignment:
Q  342 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 399  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 12621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 293
Target Start/End: Original strand, 13502 - 13571
Alignment:
Q  224 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13502 cttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 816 - 861
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  816 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3620 - 3556
Alignment:
Q  338 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 402  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  3620 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgt 3556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 5499 - 5544
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5499 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 5544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26505 - 26460
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26505 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 26460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 35194 - 35149
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35194 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 35149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24072 - 24027
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24072 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 24027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8266 - 8221
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8266 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 8221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 90611 - 90566
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  90611 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 90566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 21071 - 21116
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21071 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcatt 21116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 30647 - 30692
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  30647 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcatt 30692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3608 - 3556
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 300  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  3608 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcattctttcat 3556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2680 - 2635
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2680 aataatactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 2635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 4097 - 4142
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4097 aatagtactccgttgattgcaattatcgatactggtgctactcatt 4142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 5000 - 5045
Alignment:
Q  248 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 293  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5000 aataatactcctttgattgcaattatcgatactggtgctactcatt 5045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 171229 - 171188
Alignment:
Q  246 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 287  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  171229 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 171188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 23872 - 23936
Alignment:
Q  2 gagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaa 66  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   |  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  23872 gagaaaggccacaagagtaatgtatgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaa 23936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University