View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8929_low_26 (Length: 361)

Name: NF8929_low_26
Description: NF8929
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8929_low_26
NF8929_low_26
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (4-347)||(27560741-27561084)
chr6 (1-341)||(28282943-28283283)
chr6 (4-347)||(10468973-10469316)
chr6 (1-340)||(22796763-22797102)
chr6 (4-347)||(24364226-24364569)
chr6 (1-341)||(8766278-8766618)
chr6 (78-347)||(14381591-14381860)
chr6 (70-347)||(17415366-17415643)
chr6 (4-347)||(21471415-21471758)
chr6 (1-347)||(15459147-15459493)
chr6 (20-341)||(25768021-25768342)
chr6 (106-347)||(18800858-18801099)
chr6 (1-278)||(25750620-25750897)
chr6 (1-308)||(21564295-21564602)
chr6 (1-308)||(34645749-34646056)
chr6 (1-289)||(14131361-14131649)
chr6 (1-308)||(19879109-19879416)
chr6 (1-308)||(18794501-18794808)
chr6 (1-308)||(11287761-11288068)
chr6 (1-308)||(11280668-11280975)
chr6 (22-320)||(27331584-27331882)
chr6 (22-320)||(27392324-27392622)
chr6 (4-287)||(5839403-5839686)
chr6 (40-322)||(19864537-19864819)
chr6 (121-320)||(1543235-1543434)
chr6 (121-287)||(16626901-16627067)
chr6 (144-267)||(25750900-25751023)
chr6 (121-320)||(29592071-29592270)
chr6 (133-301)||(1640715-1640883)
chr6 (22-322)||(18197696-18197996)
chr6 (121-284)||(25112483-25112646)
chr6 (97-320)||(27187343-27187566)
chr6 (97-320)||(27261674-27261897)
chr6 (121-320)||(28263348-28263547)
chr6 (121-320)||(28342097-28342296)
chr6 (22-320)||(12497858-12498156)
chr6 (22-320)||(12510745-12511043)
chr6 (70-320)||(23078349-23078599)
chr6 (4-290)||(25610042-25610328)
chr6 (40-322)||(25765439-25765720)
chr6 (121-320)||(24313319-24313518)
chr6 (52-322)||(16963516-16963786)
chr6 (41-293)||(22078866-22079118)
chr6 (121-287)||(2874987-2875153)
chr6 (40-290)||(18408124-18408374)
chr6 (119-320)||(28292523-28292724)
chr6 (22-350)||(12505187-12505515)
chr6 (93-293)||(16927818-16928018)
chr6 (22-200)||(17032394-17032572)
chr6 (4-290)||(22762636-22762922)
chr6 (22-200)||(21833252-21833430)
chr6 (1-110)||(1640610-1640719)
chr6 (1-109)||(18787699-18787807)
chr6 (145-346)||(15078489-15078690)
chr6 (163-311)||(25655456-25655604)
chr6 (145-308)||(23996203-23996366)
chr6 (145-290)||(16098005-16098150)
chr6 (204-285)||(18571665-18571746)
chr6 (281-354)||(19453511-19453584)
chr6 (208-308)||(1648947-1649047)
chr6 (208-308)||(16382536-16382636)
chr6 (250-322)||(22433929-22434001)
chr6 (22-109)||(22433829-22433916)
chr6 (208-293)||(16233227-16233312)
chr6 (208-293)||(18838086-18838171)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-347)||(12573931-12574277)
chr2 (1-341)||(27787319-27787659)
chr2 (1-347)||(23293536-23293882)
chr2 (4-347)||(11358393-11358736)
chr2 (1-347)||(23276354-23276700)
chr2 (4-347)||(31830239-31830582)
chr2 (4-341)||(20832566-20832903)
chr2 (4-347)||(1063332-1063675)
chr2 (1-265)||(24653923-24654187)
chr2 (1-221)||(24944945-24945165)
chr2 (1-308)||(27365637-27365944)
chr2 (1-301)||(23087028-23087328)
chr2 (4-322)||(24675070-24675388)
chr2 (22-290)||(22757039-22757307)
chr2 (40-313)||(21325819-21326092)
chr2 (13-290)||(23063667-23063944)
chr2 (88-320)||(24825828-24826060)
chr2 (121-320)||(9609834-9610033)
chr2 (121-320)||(16924958-16925157)
chr2 (121-320)||(16998698-16998897)
chr2 (121-320)||(21145576-21145775)
chr2 (22-293)||(23138636-23138907)
chr2 (22-293)||(23550426-23550697)
chr2 (121-320)||(24709731-24709930)
chr2 (121-287)||(24878574-24878740)
chr2 (121-320)||(16981850-16982049)
chr2 (121-320)||(17063415-17063614)
chr2 (121-320)||(17067073-17067272)
chr2 (55-322)||(24708026-24708293)
chr2 (121-320)||(27217714-27217913)
chr2 (121-320)||(27370967-27371166)
chr2 (121-278)||(44386157-44386314)
chr2 (124-320)||(24262071-24262267)
chr2 (22-322)||(30211461-30211761)
chr2 (121-320)||(22325402-22325601)
chr2 (121-278)||(10868548-10868705)
chr2 (37-354)||(45529131-45529442)
chr2 (22-287)||(23188607-23188872)
chr2 (52-233)||(27377104-27377285)
chr2 (145-308)||(22276001-22276164)
chr2 (97-156)||(41609054-41609113)
chr2 (22-59)||(25128246-25128283)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (1-347)||(17269494-17269840)
chr5 (4-347)||(22381063-22381406)
chr5 (4-347)||(22502543-22502886)
chr5 (4-354)||(23080243-23080593)
chr5 (1-347)||(22236081-22236427)
chr5 (4-347)||(14887152-14887495)
chr5 (4-347)||(20342146-20342489)
chr5 (4-347)||(25847939-25848282)
chr5 (1-347)||(20821314-20821660)
chr5 (4-347)||(37545657-37546001)
chr5 (4-347)||(24798558-24798901)
chr5 (4-332)||(21890935-21891263)
chr5 (4-347)||(22461816-22462159)
chr5 (1-347)||(23442454-23442800)
chr5 (1-341)||(28923935-28924275)
chr5 (1-341)||(28895109-28895449)
chr5 (1-341)||(20773621-20773961)
chr5 (1-308)||(24735811-24736118)
chr5 (1-308)||(24749754-24750061)
chr5 (1-278)||(24737015-24737292)
chr5 (22-320)||(26738893-26739191)
chr5 (40-293)||(23516459-23516712)
chr5 (121-322)||(22134667-22134868)
chr5 (5-301)||(21564173-21564469)
chr5 (22-322)||(23573642-23573942)
chr5 (40-290)||(21984523-21984773)
chr5 (4-227)||(20573403-20573626)
chr5 (22-292)||(23471129-23471399)
chr5 (121-320)||(14999927-15000126)
chr5 (121-320)||(16356501-16356700)
chr5 (121-320)||(19769959-19770158)
chr5 (22-293)||(20468311-20468582)
chr5 (121-320)||(34566493-34566692)
chr5 (121-287)||(22333108-22333274)
chr5 (121-287)||(27685621-27685787)
chr5 (98-293)||(21498251-21498446)
chr5 (121-320)||(27610353-27610552)
chr5 (97-320)||(27668678-27668901)
chr5 (121-320)||(40708779-40708978)
chr5 (97-320)||(41770817-41771040)
chr5 (121-320)||(27518406-27518605)
chr5 (4-322)||(18775659-18775977)
chr5 (52-322)||(20798690-20798960)
chr5 (41-290)||(25423108-25423357)
chr5 (4-251)||(21662297-21662543)
chr5 (93-320)||(23440196-23440423)
chr5 (41-201)||(21343665-21343825)
chr5 (40-251)||(21665758-21665968)
chr5 (121-322)||(37291682-37291883)
chr5 (121-209)||(22348424-22348512)
chr5 (123-263)||(29476318-29476458)
chr5 (4-151)||(21404718-21404865)
chr5 (145-346)||(11210856-11211057)
chr5 (145-308)||(21937388-21937551)
chr5 (208-346)||(23503511-23503649)
chr5 (220-320)||(21339474-21339574)
chr5 (256-308)||(21831943-21831995)
chr5 (145-308)||(24581216-24581379)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (1-347)||(8759289-8759635)
chr3 (1-347)||(13941600-13941946)
chr3 (1-341)||(41177098-41177438)
chr3 (1-347)||(44776823-44777169)
chr3 (1-341)||(16381143-16381480)
chr3 (1-347)||(16836717-16837057)
chr3 (1-341)||(12360755-12361095)
chr3 (1-347)||(18134553-18134899)
chr3 (4-347)||(16329866-16330209)
chr3 (1-347)||(15953175-15953521)
chr3 (1-347)||(11303980-11304326)
chr3 (4-347)||(10383548-10383891)
chr3 (4-347)||(11961241-11961584)
chr3 (4-347)||(47123523-47123866)
chr3 (1-347)||(14571424-14571770)
chr3 (1-347)||(10420252-10420598)
chr3 (1-288)||(13972386-13972673)
chr3 (1-347)||(13322859-13323205)
chr3 (1-301)||(15227225-15227525)
chr3 (48-301)||(12850532-12850785)
chr3 (1-288)||(14086249-14086536)
chr3 (22-290)||(14876774-14877042)
chr3 (22-322)||(12497835-12498135)
chr3 (22-320)||(15208478-15208776)
chr3 (4-290)||(17489419-17489705)
chr3 (40-320)||(15247752-15248032)
chr3 (22-293)||(9522306-9522577)
chr3 (121-320)||(15348490-15348689)
chr3 (121-320)||(16412527-16412726)
chr3 (1-130)||(31945048-31945177)
chr3 (121-320)||(10905896-10906095)
chr3 (121-320)||(16635459-16635658)
chr3 (121-320)||(26792644-26792843)
chr3 (1-128)||(31689049-31689176)
chr3 (121-320)||(43162783-43162982)
chr3 (121-320)||(10005286-10005485)
chr3 (121-320)||(15589637-15589836)
chr3 (121-320)||(48425133-48425332)
chr3 (56-322)||(16371034-16371300)
chr3 (4-290)||(16492456-16492742)
chr3 (119-320)||(16756830-16757031)
chr3 (119-320)||(53385263-53385464)
chr3 (121-320)||(5425175-5425373)
chr3 (121-320)||(13252376-13252575)
chr3 (100-287)||(15338934-15339121)
chr3 (121-320)||(20062299-20062498)
chr3 (97-287)||(15402788-15402978)
chr3 (121-287)||(15725211-15725377)
chr3 (119-320)||(6600431-6600632)
chr3 (22-322)||(16691747-16692047)
chr3 (52-322)||(16807169-16807439)
chr3 (145-308)||(8274656-8274819)
chr3 (190-313)||(15015996-15016119)
chr3 (284-347)||(17492489-17492552)
chr3 (163-346)||(18748403-18748586)
chr3 (145-346)||(16742922-16743123)
chr3 (208-290)||(17192877-17192959)
chr3 (208-308)||(13975302-13975402)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (1-354)||(14129810-14130163)
chr7 (1-354)||(14433628-14433981)
chr7 (1-347)||(23199709-23200055)
chr7 (1-347)||(23505836-23506182)
chr7 (1-347)||(18053919-18054265)
chr7 (1-347)||(16950437-16950783)
chr7 (4-354)||(13021297-13021647)
chr7 (1-347)||(14286342-14286688)
chr7 (1-332)||(6413448-6413779)
chr7 (1-347)||(1373-1719)
chr7 (4-347)||(11306229-11306572)
chr7 (4-354)||(12455643-12455992)
chr7 (4-341)||(8212100-8212437)
chr7 (1-346)||(15102568-15102913)
chr7 (1-309)||(26288041-26288348)
chr7 (4-347)||(49152241-49152584)
chr7 (1-347)||(14264210-14264556)
chr7 (1-347)||(16072260-16072606)
chr7 (1-347)||(19147148-19147494)
chr7 (1-330)||(13665490-13665814)
chr7 (1-347)||(20746547-20746893)
chr7 (115-347)||(26118571-26118803)
chr7 (1-308)||(11388433-11388739)
chr7 (1-290)||(12206823-12207112)
chr7 (1-142)||(15340433-15340574)
chr7 (225-354)||(12456940-12457069)
chr7 (22-320)||(15154667-15154965)
chr7 (207-341)||(15340574-15340708)
chr7 (22-320)||(11553117-11553415)
chr7 (22-322)||(12687458-12687758)
chr7 (88-322)||(14954643-14954877)
chr7 (22-293)||(15203836-15204107)
chr7 (52-290)||(15624539-15624777)
chr7 (121-320)||(8707661-8707860)
chr7 (97-320)||(23516784-23517007)
chr7 (121-287)||(11237261-11237427)
chr7 (121-287)||(15161105-15161271)
chr7 (22-322)||(17329-17629)
chr7 (4-320)||(14037746-14038062)
chr7 (4-320)||(14347776-14348092)
chr7 (121-320)||(8198684-8198883)
chr7 (121-320)||(10871051-10871250)
chr7 (124-287)||(13686123-13686286)
chr7 (121-320)||(14332453-14332652)
chr7 (121-320)||(18551773-18551972)
chr7 (1-128)||(15479323-15479450)
chr7 (121-320)||(44791366-44791565)
chr7 (121-320)||(18177798-18177997)
chr7 (145-290)||(4440008-4440153)
chr7 (4-94)||(26118803-26118893)
chr7 (169-320)||(35964865-35965016)
chr7 (204-354)||(11772222-11772372)
chr7 (278-347)||(13968634-13968703)
chr7 (145-290)||(14936427-14936572)
chr7 (163-230)||(41251-41318)
chr7 (145-308)||(15364020-15364183)
chr7 (37-308)||(21661936-21662204)
chr7 (208-308)||(7824043-7824143)
chr7 (208-308)||(27107801-27107901)
chr7 (22-59)||(21674809-21674846)
chr7 (22-59)||(45146513-45146550)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (1-341)||(51606166-51606506)
chr4 (1-347)||(16145859-16146205)
chr4 (4-354)||(1649249-1649599)
chr4 (1-256)||(42702850-42703105)
chr4 (4-354)||(33222868-33223218)
chr4 (4-347)||(11207210-11207553)
chr4 (4-347)||(3264773-3265116)
chr4 (4-347)||(44661845-44662188)
chr4 (4-347)||(20890933-20891275)
chr4 (4-341)||(29453522-29453859)
chr4 (1-347)||(15245871-15246217)
chr4 (1-349)||(15003341-15003689)
chr4 (103-347)||(15359069-15359313)
chr4 (126-332)||(16752665-16752871)
chr4 (4-347)||(15070363-15070706)
chr4 (127-347)||(27900459-27900679)
chr4 (22-313)||(14851119-14851410)
chr4 (22-320)||(12523644-12523942)
chr4 (22-320)||(14652276-14652574)
chr4 (22-322)||(15149750-15150050)
chr4 (52-290)||(14159490-14159728)
chr4 (121-320)||(23955814-23956013)
chr4 (52-322)||(16252189-16252459)
chr4 (41-182)||(18164333-18164474)
chr4 (4-320)||(7090383-7090698)
chr4 (88-320)||(19778539-19778771)
chr4 (121-320)||(18297272-18297471)
chr4 (121-320)||(29039150-29039349)
chr4 (121-287)||(12476667-12476833)
chr4 (22-322)||(14680535-14680835)
chr4 (22-322)||(16355189-16355489)
chr4 (121-320)||(8386479-8386678)
chr4 (121-320)||(27711403-27711602)
chr4 (121-287)||(14303757-14303922)
chr4 (121-287)||(40473107-40473273)
chr4 (121-320)||(8053369-8053568)
chr4 (88-322)||(18227190-18227424)
chr4 (121-320)||(14266645-14266844)
chr4 (244-347)||(15077825-15077928)
chr4 (121-200)||(15364453-15364532)
chr4 (1-96)||(15415209-15415304)
chr4 (1-109)||(15319530-15319638)
chr4 (158-301)||(15415051-15415194)
chr4 (204-320)||(1640171-1640287)
chr4 (22-174)||(14927151-14927303)
chr4 (196-311)||(8706060-8706175)
chr4 (208-290)||(55375394-55375476)
chr4 (1-57)||(15359326-15359382)
chr4 (145-308)||(16445230-16445393)
chr4 (223-322)||(16676447-16676546)
chr4 (204-290)||(13247795-13247881)
chr4 (22-59)||(12132676-12132713)
chr4 (208-293)||(14997470-14997555)
chr4 (204-308)||(9290985-9291089)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (1-341)||(260286-260626)
scaffold0005 (22-320)||(164718-165016)
scaffold0005 (22-322)||(278837-279137)
scaffold0005 (121-287)||(308757-308923)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (1-341)||(31571270-31571610)
chr8 (1-347)||(1266252-1266597)
chr8 (1-347)||(22061855-22062201)
chr8 (1-347)||(31416896-31417242)
chr8 (1-349)||(21324829-21325178)
chr8 (4-347)||(12304774-12305117)
chr8 (4-347)||(29303848-29304191)
chr8 (4-347)||(804095-804438)
chr8 (1-347)||(23654940-23655286)
chr8 (4-347)||(6603674-6604017)
chr8 (4-347)||(6679127-6679470)
chr8 (1-347)||(21681892-21682238)
chr8 (4-347)||(14565158-14565501)
chr8 (1-349)||(20007863-20008211)
chr8 (1-304)||(20010365-20010668)
chr8 (4-260)||(16265127-16265383)
chr8 (1-349)||(21840430-21840778)
chr8 (1-349)||(19851424-19851772)
chr8 (1-349)||(19857460-19857808)
chr8 (133-347)||(22051008-22051222)
chr8 (4-266)||(28982373-28982635)
chr8 (4-266)||(28987593-28987855)
chr8 (4-187)||(27347242-27347425)
chr8 (1-301)||(20388112-20388412)
chr8 (4-322)||(19977983-19978301)
chr8 (22-322)||(15533414-15533714)
chr8 (40-290)||(21167016-21167266)
chr8 (4-289)||(21250958-21251243)
chr8 (47-320)||(23650100-23650373)
chr8 (70-290)||(22987283-22987503)
chr8 (22-322)||(30313591-30313891)
chr8 (22-322)||(32600178-32600478)
chr8 (121-320)||(17674472-17674671)
chr8 (121-320)||(19112823-19113022)
chr8 (21-293)||(21922211-21922483)
chr8 (121-320)||(20018199-20018398)
chr8 (53-320)||(20396574-20396841)
chr8 (52-349)||(16408465-16408762)
chr8 (255-347)||(16271646-16271738)
chr8 (119-313)||(19485326-19485520)
chr8 (40-253)||(23948941-23949154)
chr8 (22-322)||(22046407-22046707)
chr8 (121-287)||(22120656-22120822)
chr8 (22-320)||(22133490-22133788)
chr8 (22-320)||(22164640-22164938)
chr8 (145-346)||(20652756-20652957)
chr8 (47-290)||(21394344-21394587)
chr8 (47-290)||(21788837-21789080)
chr8 (143-293)||(22377929-22378079)
chr8 (143-293)||(22384104-22384254)
chr8 (226-320)||(23949158-23949252)
chr8 (52-182)||(15441245-15441375)
chr8 (70-287)||(22032114-22032331)
chr8 (145-308)||(22315348-22315511)
chr8 (163-230)||(19863232-19863299)
chr8 (163-230)||(19867869-19867936)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-354)||(248591-248944)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (1-347)||(57799-58144)
scaffold0053 (1-341)||(49021-49361)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (1-344)||(12766-13109)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-347)||(13883-14229)
scaffold0034 (58-347)||(4935-5224)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (1-354)||(42761-43114)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (1-347)||(21653-21999)
scaffold0235 (208-308)||(25991-26091)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (1-354)||(20100-20453)
scaffold0114 (1-354)||(43483-43836)
scaffold0114 (1-354)||(44495-44848)
scaffold0114 (3-189)||(36035-36221)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (4-347)||(26242-26585)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (1-354)||(49182-49535)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (1-347)||(13343-13689)
scaffold0298 (1-347)||(17113-17459)
scaffold0298 (1-341)||(19961-20301)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (1-347)||(322682-323028)
scaffold0004 (1-347)||(117546-117892)
scaffold0004 (4-347)||(385800-386143)
scaffold0004 (40-293)||(112038-112291)
scaffold0004 (4-308)||(203489-203793)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (4-329)||(20075128-20075453)
chr1 (1-347)||(19664927-19665273)
chr1 (1-347)||(19854276-19854622)
chr1 (1-355)||(22433159-22433513)
chr1 (4-347)||(20294377-20294720)
chr1 (1-347)||(20940114-20940460)
chr1 (4-347)||(37677044-37677388)
chr1 (1-276)||(20244162-20244437)
chr1 (4-347)||(31550232-31550575)
chr1 (1-332)||(20856827-20857158)
chr1 (48-341)||(20835945-20836241)
chr1 (112-347)||(11382667-11382902)
chr1 (105-349)||(41307891-41308135)
chr1 (4-218)||(20395173-20395387)
chr1 (22-320)||(20249833-20250131)
chr1 (40-292)||(50620350-50620602)
chr1 (85-320)||(19106413-19106648)
chr1 (22-322)||(17045091-17045391)
chr1 (22-293)||(16369280-16369551)
chr1 (121-320)||(33391107-33391306)
chr1 (121-320)||(16350677-16350876)
chr1 (46-293)||(19760971-19761218)
chr1 (22-320)||(21747518-21747815)
chr1 (121-287)||(21830385-21830551)
chr1 (124-320)||(51333571-51333767)
chr1 (22-320)||(20136761-20137059)
chr1 (121-287)||(21837032-21837198)
chr1 (119-313)||(41354554-41354748)
chr1 (40-209)||(50612605-50612774)
chr1 (22-200)||(16078831-16079009)
chr1 (4-83)||(24476945-24477024)
chr1 (208-308)||(20831482-20831582)
chr1 (145-308)||(20914316-20914479)
chr1 (244-322)||(16078728-16078806)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (1-341)||(19098-19438)
scaffold0058 (70-292)||(58443-58665)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-347)||(76-422)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (1-347)||(10866-11212)
scaffold0124 (1-347)||(381-727)
scaffold0124 (145-308)||(7831-7994)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (1-347)||(2729-3075)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (1-347)||(148548-148894)
scaffold0011 (1-347)||(195685-196030)
scaffold0011 (1-194)||(68575-68768)
scaffold0011 (22-320)||(26542-26840)
scaffold0011 (145-290)||(121989-122134)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (1-347)||(42315-42661)
scaffold0010 (1-347)||(47381-47727)
scaffold0010 (125-182)||(2252-2309)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (1-341)||(25853-26193)
scaffold0113 (4-293)||(16657-16946)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (1-347)||(14233-14579)
scaffold0203 (1-167)||(9039-9205)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (1-349)||(52159-52507)
scaffold0067 (1-349)||(61193-61541)
scaffold0067 (19-349)||(67581-67911)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (1-347)||(47102-47448)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (40-349)||(4767-5076)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-346)||(1152-1497)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (4-347)||(16695-17038)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-347)||(10065-10411)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-347)||(27204-27549)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-347)||(27497-27843)
scaffold0139 (1-349)||(1129-1476)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (1-347)||(31388-31734)
scaffold0106 (88-320)||(14104-14336)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (9-341)||(1512-1844)
scaffold0120 (22-290)||(6022-6290)
scaffold0120 (145-346)||(22816-23017)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-341)||(39717-40057)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (1-329)||(90932-91260)
scaffold0001 (40-320)||(448076-448356)
scaffold0001 (46-286)||(162136-162376)
scaffold0001 (121-188)||(175361-175428)
scaffold0001 (145-267)||(78691-78813)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-347)||(7220-7562)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (119-347)||(5309-5537)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (1-329)||(18537-18865)
scaffold0326 (1-55)||(3629-3683)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (4-347)||(38869-39212)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (1-347)||(3869-4215)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (1-251)||(4217-4467)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-347)||(51845-52191)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (1-347)||(95984-96330)
scaffold0029 (1-301)||(112537-112837)
scaffold0029 (121-320)||(109820-110019)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (91-354)||(10837-11100)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-349)||(9776-10119)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (1-341)||(14064-14403)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (1-347)||(6161-6508)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (1-347)||(26120-26466)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (1-305)||(5026-5330)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (1-347)||(3853-4199)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (1-347)||(37180-37526)
scaffold0026 (103-347)||(38156-38400)
scaffold0026 (103-293)||(27373-27563)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (1-305)||(169-473)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (1-301)||(7064-7364)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (1-301)||(5942-6241)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (1-307)||(18827-19133)
scaffold0090 (112-307)||(23100-23295)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (1-182)||(136097-136278)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (1-308)||(506-813)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (22-322)||(180216-180516)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-288)||(33718-34005)
scaffold0076 (208-308)||(40443-40543)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (40-320)||(693-973)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (1-231)||(1155-1385)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (163-347)||(10-194)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-301)||(10767-11067)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (22-320)||(4031-4329)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (22-287)||(27966-28231)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (1-288)||(50555-50842)
scaffold0028 (121-320)||(43252-43451)
scaffold0028 (121-349)||(8583-8811)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (22-320)||(3139-3437)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (1-290)||(28808-29097)
scaffold0064 (1-290)||(40799-41088)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (137-305)||(1908-2076)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (4-320)||(219426-219742)
scaffold0012 (94-320)||(229114-229340)
scaffold0012 (208-308)||(33016-33116)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (22-293)||(15115-15386)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (22-320)||(14876-15174)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (4-308)||(25092-25396)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (22-320)||(269-567)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (22-320)||(6013-6311)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (228-354)||(5427-5553)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (100-293)||(9047-9240)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (22-293)||(16986-17257)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (22-293)||(25755-26026)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (22-290)||(1-269)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (97-322)||(7451-7676)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (21-206)||(13376-13561)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (22-285)||(26-289)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (49-292)||(16502-16745)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (178-347)||(1216-1385)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (22-322)||(65404-65704)
scaffold0042 (22-187)||(39931-40096)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (1-156)||(2039-2193)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (22-320)||(32761-33059)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (22-320)||(127208-127506)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (40-293)||(925-1178)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (202-347)||(3337-3482)
scaffold0222 (1-114)||(3483-3596)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (22-322)||(64038-64338)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (212-347)||(78-213)
scaffold1710 (145-290)||(949-1094)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (88-322)||(7855-8089)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (52-322)||(14389-14659)
scaffold0044 (124-322)||(721-919)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (121-278)||(512-669)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (40-293)||(5238-5491)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (40-293)||(116941-117194)
scaffold0037 (145-308)||(98137-98300)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (46-320)||(15516-15789)
scaffold0333 (220-320)||(15852-15952)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (88-290)||(21932-22134)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (22-320)||(16425-16723)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (121-289)||(6470-6638)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (124-320)||(789-985)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (121-287)||(7036-7203)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (1-95)||(871-965)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (48-290)||(1164-1406)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (4-322)||(86511-86829)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (40-313)||(5607-5879)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (40-320)||(12986-13266)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (40-320)||(49510-49790)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (46-313)||(710-976)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (8-119)||(45830-45941)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (40-290)||(9360-9610)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (46-320)||(1028-1301)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (148-320)||(7522-7694)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-76)||(18991-19066)
scaffold0023 (46-187)||(4567-4708)
scaffold0023 (244-293)||(4490-4539)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (121-313)||(839-1030)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (145-308)||(24002-24165)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (22-187)||(16956-17121)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (145-308)||(3896-4059)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (145-290)||(3281-3426)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (145-290)||(5863-6008)
scaffold0447 (145-290)||(10477-10622)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (145-290)||(8472-8617)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (70-322)||(4412-4664)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (208-308)||(26178-26278)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (70-322)||(8643-8895)
scaffold0109 (22-322)||(33580-33880)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (145-290)||(13030-13175)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (145-346)||(14779-14980)
scaffold0132 (208-344)||(43723-43859)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (145-308)||(407-570)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (204-287)||(8276-8359)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (238-313)||(3735-3810)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (61-116)||(8768-8823)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (221-308)||(23592-23679)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (145-308)||(46276-46439)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (21-59)||(10654-10692)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (145-290)||(1093-1238)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (145-290)||(14645-14790)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (210-290)||(8930-9010)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (1-101)||(9197-9297)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (298-354)||(6312-6368)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27561084 - 27560741
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27561084 acatgcgaagggtctgctacatacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccg 27560985  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27560984 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 27560885  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  27560884 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcatc 27560785  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    || ||||| |  |||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  27560784 ttgactttttctgtagtctcctgaactaaatccggtcccaacac 27560741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28283283 - 28282943
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28283283 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcgtgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgcca 28283184  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28283183 ccgtcccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactct 28283084  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||    
T  28283083 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatc 28282984  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    ||||| ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  28282983 atcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcc 28282943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10469316 - 10468973
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  10469316 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 10469217  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| || || ||    
T  10469216 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 10469117  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  10469116 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaac 10469017  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10469016 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacac 10468973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22797102 - 22796763
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  22797102 ataacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 22797003  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22797002 ctgttccaaccctctcagatatatgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 22796903  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22796902 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtagactttgcgacgctttcatcttttcccttatc 22796803  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtc 340  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  22796802 atcttaaccttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtc 22796763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 24364226 - 24364569
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  24364226 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 24364325  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||||| || ||||||||||  ||||| || || ||    
T  24364326 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 24364425  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  24364426 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaac 24364525  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24364526 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacac 24364569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8766618 - 8766278
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  8766618 ataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagcca 8766519  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| | |||||| ||    
T  8766518 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccct 8766419  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| || |||    
T  8766418 cagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgccttcatcttttctctgatc 8766319  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8766318 atcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcc 8766278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 78 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14381860 - 14381591
Alignment:
Q  78 tggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcct 177  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14381860 tggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcct 14381761  T
Q  178 acacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcg 277  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||    
T  14381760 acacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcg 14381661  T
Q  278 aagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||| |||||    
T  14381660 acgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgatcccaacac 14381591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 70 - 347
Target Start/End: Original strand, 17415366 - 17415643
Alignment:
Q  70 agatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaag 169  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| |    
T  17415366 agatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatg 17415465  T
Q  170 cacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttg 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  17415466 cacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcg 17415565  T
Q  270 actctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  17415566 actctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 17415643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 21471415 - 21471758
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||| |    
T  21471415 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 21471514  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  ||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  21471515 ttccaactctctcagatatctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactctcag 21471614  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| | |    
T  21471615 aaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattaac 21471714  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    || || ||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  21471715 ttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 21471758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 15459147 - 15459493
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  15459147 ataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgatacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcccactctatacgcca 15459246  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  15459247 cagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccct 15459346  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  15459347 cagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatc 15459446  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||| | |||||||  |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  15459447 atcctgactttctccgtagtctcgtgaaccaaatccggtcccaacac 15459493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 341
Target Start/End: Original strand, 25768021 - 25768342
Alignment:
Q  20 ctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctga 119  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||| ||    
T  25768021 ctacatacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcaga 25768120  T
Q  120 aatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccc 219  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||| ||     
T  25768121 tatctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctcct 25768220  T
Q  220 tcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtag 319  Q
    ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||  ||||    
T  25768221 tcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcaacttgaccttctccgtag 25768320  T
Q  320 tctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    | | |||||| || ||||||||    
T  25768321 tttgatgaactaaatccggtcc 25768342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 106 - 347
Target Start/End: Original strand, 18800858 - 18801099
Alignment:
Q  106 ccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaa 205  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |||| |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18800858 ccaaccctctctgatatctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaa 18800957  T
Q  206 atacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatctt 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  18800958 atacatgatccccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatctt 18801057  T
Q  306 aactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  18801058 gactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 18801099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 25750620 - 25750897
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  25750620 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 25750719  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||| |||||||||||   |||| |||||    
T  25750720 ctgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgtcacaagagtgactct 25750819  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcga 278  Q
     ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25750820 cagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcga 25750897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21564602 - 21564295
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  21564602 ataatatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgcca 21564503  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||    
T  21564502 ctgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactct 21564403  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || || |||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  21564402 caagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactctacgacgctttcatctgttctcttatc 21564303  T
Q  301 atcttaac 308  Q
    | ||||||    
T  21564302 aacttaac 21564295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34646056 - 34645749
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  34646056 ataacatgcgaaggatcaggtacgtacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgcca 34645957  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| | ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||    
T  34645956 cagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccct 34645857  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||||||    
T  34645856 caagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttatc 34645757  T
Q  301 atcttaac 308  Q
    | ||||||    
T  34645756 aacttaac 34645749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14131649 - 14131361
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  14131649 ataacaggcgaaggatccgttacatacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgcca 14131550  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||    
T  14131549 ctgttccaactctctcagatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccct 14131450  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatct 289  Q
     ||||| |||||||| || || |||||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  14131449 cagaaacacatgatctccttcctgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 14131361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 19879109 - 19879416
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || || || || || ||||| ||||    
T  19879109 ataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagcca 19879208  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| |||||    
T  19879209 ctgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactct 19879308  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||     
T  19879309 caagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgaccctttcatctgttctcttatt 19879408  T
Q  301 atcttaac 308  Q
    | ||||||    
T  19879409 aacttaac 19879416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 18794501 - 18794808
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || |||| ||| ||||    
T  18794501 ataacatgcgacggatccggtacatactttcgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgcca 18794600  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||  || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  18794601 ctgttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactct 18794700  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |  || |||||||| ||||||||||||| |||| | || || || |||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  18794701 caagaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatc 18794800  T
Q  301 atcttaac 308  Q
    | ||||||    
T  18794801 aacttaac 18794808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11288068 - 11287761
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || || || || || ||||| ||||    
T  11288068 ataacatgcgaagaatccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagcca 11287969  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  11287968 ctgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactct 11287869  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||     
T  11287868 caagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttatt 11287769  T
Q  301 atcttaac 308  Q
    | ||||||    
T  11287768 aacttaac 11287761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11280975 - 11280668
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || || || || || ||||| ||||    
T  11280975 ataacatgcgaagaatccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagcca 11280876  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| | ||||| || ||| |||||||||| ||||| || || | |||    
T  11280875 ctgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattct 11280776  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||     
T  11280775 caagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttatt 11280676  T
Q  301 atcttaac 308  Q
    | ||||||    
T  11280675 aacttaac 11280668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27331882 - 27331584
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| | ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  ||||||||||||||||  || ||||| |    
T  27331882 acatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 27331783  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| ||||| || ||    
T  27331782 tctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttc 27331683  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||    ||||| |||||||||| ||||||    
T  27331682 ttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagt 27331584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27392622 - 27392324
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| | ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  ||||||||||||||||  || ||||| |    
T  27392622 acatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 27392523  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| ||||| || ||    
T  27392522 tctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttc 27392423  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||    ||||| |||||||||| ||||||    
T  27392422 ttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagt 27392324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5839686 - 5839403
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||| |  || ||||| || || |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  5839686 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatacgccactg 5839587  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  || || || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |     
T  5839586 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcaa 5839487  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    |||    || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5839486 aaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 5839403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 322
Target Start/End: Original strand, 19864537 - 19864819
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| |    
T  19864537 gacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaaatctttccgatatctgatacggaccaataa 19864636  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    |  |||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||||||||||||||  | ||    
T  19864637 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 19864736  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| ||||||||    
T  19864737 tctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 19864819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1543434 - 1543235
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || || || |    
T  1543434 atctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctcctt 1543335  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| || ||    |||||||||||||||| ||||||    
T  1543334 cctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgggacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 1543235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16627067 - 16626901
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  16627067 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 16626968  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  16626967 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 16626901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 267
Target Start/End: Original strand, 25750900 - 25751023
Alignment:
Q  144 cggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctc 243  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||     
T  25750900 cggagtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttcta 25750999  T
Q  244 cgcttgtcatggtaactcttctgt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  25751000 cgcttgtcatggtaactcttctgt 25751023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 29592270 - 29592071
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  29592270 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 29592171  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  29592170 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 29592071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 301
Target Start/End: Original strand, 1640715 - 1640883
Alignment:
Q  133 ccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaa 232  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  || || ||||||||||| |||||||| || || | ||| ||||    
T  1640715 ccaataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaa 1640814  T
Q  233 gggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatca 301  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  1640815 ggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctcttatca 1640883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18197996 - 18197696
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||  ||| || || || |    
T  18197996 acatacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaattctttccgata 18197897  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| | || |||||  | ||||||||||  ||||   |||| ||| | |||||||||||||  |||||    
T  18197896 tcttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacatgatatccctc 18197797  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
    |||||||| |||| | || |  ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||    |||||||| || |||| |||||||    
T  18197796 ttgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcatctttaccttctcagtagtc 18197697  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  18197696 t 18197696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 284
Target Start/End: Original strand, 25112483 - 25112646
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || || || |    
T  25112483 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctcctt 25112582  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagcttt 284  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  25112583 cctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttttgtcgactctgcgacgcttt 25112646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 320
Target Start/End: Original strand, 27187343 - 27187566
Alignment:
Q  97 gccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaa 196  Q
    |||||||||||||  || ||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  27187343 gccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtga 27187442  T
Q  197 ctcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttccct 296  Q
    |||| | ||| || || || || || | ||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || || |     
T  27187443 ctctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcg 27187542  T
Q  297 tatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     ||||||| |||||||| ||||||    
T  27187543 gatcatctgaactttctcagtagt 27187566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27261897 - 27261674
Alignment:
Q  97 gccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaa 196  Q
    |||||||||||||  || ||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  27261897 gccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtga 27261798  T
Q  197 ctcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttccct 296  Q
    |||| | ||| || || || || || | ||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || || |     
T  27261797 ctctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcg 27261698  T
Q  297 tatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     ||||||| |||||||| ||||||    
T  27261697 gatcatctgaactttctcagtagt 27261674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28263547 - 28263348
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  28263547 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 28263448  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | | ||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || || |  ||||||| |||||||| ||||||    
T  28263447 ccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagt 28263348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28342296 - 28342097
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  28342296 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 28342197  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | | ||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || || |  ||||||| |||||||| ||||||    
T  28342196 ccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagt 28342097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 12497858 - 12498156
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  12497858 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 12497957  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  12497958 tctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 12498057  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    |||||||||||||||| ||||||    
T  12498058 ctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 12498156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12511043 - 12510745
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  12511043 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 12510944  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  12510943 tctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 12510844  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    |||||||||||||||| ||||||    
T  12510843 ctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 12510745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 320
Target Start/End: Original strand, 23078349 - 23078599
Alignment:
Q  70 agatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaag 169  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||  ||  || || || |||||||||| || ||| ||  |||||||||||||| | || ||||| |    
T  23078349 agatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtttaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatg 23078448  T
Q  170 cacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttg 269  Q
    | || || ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |    
T  23078449 cgcgcccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcg 23078548  T
Q  270 actctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||    
T  23078549 agtctgcgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagt 23078599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25610328 - 25610042
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||| |  || ||||| |||||||||||  |||| || || ||||| ||||| || ||||| | |||||||||||    
T  25610328 acatgggatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacgatacgccaccg 25610229  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  || || || |||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  || || ||||| |     
T  25610228 ttccaactctttccgatatctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggtgtgactctcaa 25610129  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    ||| |  || || || ||||||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||    
T  25610128 aaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatctt 25610042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25765720 - 25765439
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||| ||||||||||||  || || || ||||||||| ||||||| |    
T  25765720 gacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacaccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataa 25765621  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    |  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||| | | || ||||| | ||  || || || || ||||||||||||||  | ||    
T  25765620 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca-cagcgtgactctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 25765522  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||| || ||    |||||||| ||||||| ||||||||    
T  25765521 tctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctttactttctcagtagtct 25765439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24313518 - 24313319
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  24313518 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 24313419  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | || ||  |||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  24313418 cttggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 24313319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16963786 - 16963516
Alignment:
Q  52 acatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtca 151  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| | |||||||| ||||||||   | || || |||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  16963786 acatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacacgatacgccatcgttccaactatttccgatatctgatatggaccaataaatctcggagtca 16963687  T
Q  152 acttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 251  Q
    ||||| |  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||    
T  16963686 acttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatc 16963587  T
Q  252 atggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||| |||||||  |||||||    
T  16963586 atgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatctttactttctctgtagtct 16963516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22079118 - 22078866
Alignment:
Q  41 acacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaa 140  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||| ||||  || || || ||||||||||||| ||| ||    
T  22079118 acacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtaccaactctttccgatatctgatacggacgaataaa 22079019  T
Q  141 cttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttt 240  Q
      | |||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||  |||  ||||| ||||| | |||||| || || || ||||||||||||||  | ||     
T  22079018 tctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttc 22078919  T
Q  241 ctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    ||  |||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  22078918 ctaagcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttttc 22078866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2875153 - 2874987
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||  | || || || |    
T  2875153 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaactcgtggtctcctt 2875054  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    ||||||||||||   | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||| || |||||    
T  2875053 cttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcat 2874987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18408374 - 18408124
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || || || || ||||| || || || | |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| |    
T  18408374 gacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataa 18408275  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    |  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | |||||| || ||  | ||||||||||||||  | ||    
T  18408274 atctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttt 18408175  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     || ||||| ||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  18408174 cctacgcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttcatctt 18408124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28292724 - 28292523
Alignment:
Q  119 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcacc 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || ||    
T  28292724 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 28292625  T
Q  219 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagta 318  Q
     || | ||| |||||  | ||||| | ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || || |  ||||||| |||||||| ||||    
T  28292624 ttccttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagta 28292525  T
Q  319 gt 320  Q
    ||    
T  28292524 gt 28292523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 350
Target Start/End: Original strand, 12505187 - 12505515
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || |||||||| ||  | || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  12505187 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 12505286  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  12505287 tctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 12505386  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
     |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||||||| |||| ||||||     
T  12505387 ctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatattctcttgaatcatcttaacattctcagtagta 12505486  T
Q  322 tcatgaaccaagtccggtcctaacaccaa 350  Q
    | |||||| |  || |||||||| |||||    
T  12505487 tgatgaacaatctcgggtcctaagaccaa 12505515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16928018 - 16927818
Alignment:
Q  93 atacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcgga 192  Q
    |||||||||||||||||  || ||  | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||||   ||    
T  16928018 atacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagtcacaaga 16927919  T
Q  193 gtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctttt 292  Q
    || ||||| | ||| || || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| | | |||||||||  |||||||||||||    
T  16927918 gtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctgcggcgctttcatctttt 16927819  T
Q  293 c 293  Q
    |    
T  16927818 c 16927818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 200
Target Start/End: Original strand, 17032394 - 17032572
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  || |||||||||||||  || || || |    
T  17032394 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccgata 17032493  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  17032494 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagtcataggagtgactct 17032572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22762922 - 22762636
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||| |  || ||||| |||||||||   ||||| || || ||||| ||||| || || |||  |||||||| ||    
T  22762922 acatgggagggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgccatcg 22762823  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  || || || ||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |     
T  22762822 ttccaactctttccgatatctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcac 22762723  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||  |  | || ||||| |||| ||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  22762722 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactctccgaaactttcatctt 22762636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21833430 - 21833252
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||| ||||||  || || || |    
T  21833430 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccattccaactctttccgata 21833331  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||| ||||  ||||| |||||    
T  21833330 tctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagtcacaggagtgactct 21833252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 1640610 - 1640719
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  | |||||||| ||||    
T  1640610 ataacatgtgaaggatccgctacgtacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgcca 1640709  T
Q  101 ccgttccaat 110  Q
    | || |||||    
T  1640710 ctgtcccaat 1640719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 18787699 - 18787807
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||| || |||||||||||||| || || | ||||| |||||| || |||||||| ||||    
T  18787699 ataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaatatgtgatggcaaacccactctatatgcca 18787798  T
Q  101 ccgttccaa 109  Q
    | |||||||    
T  18787799 ctgttccaa 18787807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15078690 - 15078489
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||  ||| | | ||| | |||||||||||||||  | |||||||| |   ||||||||     
T  15078690 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcgatatcctttctct 15078591  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaa 344  Q
     ||| ||||| |||||||| |||  |||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |  |||||||| || || |  |||||||||||    
T  15078590 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttttctcggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 15078491  T
Q  345 ca 346  Q
    ||    
T  15078490 ca 15078489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Original strand, 25655456 - 25655604
Alignment:
Q  163 ttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactct 262  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||| || | ||||| | ||| |||||||||||  | |||||||||| | ||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  25655456 ttcaaagcacgaccaacaccagttatcagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttattatgataactct 25655555  T
Q  263 tctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaacttt 311  Q
    |||||  |||||| || ||||||||||| ||    ||||||||||||||    
T  25655556 tctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttt 25655604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Original strand, 23996203 - 23996366
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||| ||| | || |||| ||| || ||||||||  ||||||||||||   |||| ||||    
T  23996203 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 23996302  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||   |||||||||||    
T  23996303 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 23996366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 290
Target Start/End: Original strand, 16098005 - 16098150
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||  ||  | ||||| | ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||||||||    
T  16098005 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 16098104  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||  || |||||||||||    
T  16098105 tcttatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatctt 16098150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 285
Target Start/End: Original strand, 18571665 - 18571746
Alignment:
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttc 285  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||    
T  18571665 aaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttc 18571746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 354
Target Start/End: Original strand, 19453511 - 19453584
Alignment:
Q  281 ctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||    
T  19453511 ctttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacaccacactc 19453584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1649047 - 1648947
Alignment:
Q  208 acatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaa 307  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| || |||||||||  |||||| || || ||||||||||||   ||||||||||    
T  1649047 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaa 1648948  T
Q  308 c 308  Q
    |    
T  1648947 c 1648947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16382636 - 16382536
Alignment:
Q  208 acatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaa 307  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||   ||||||||||    
T  16382636 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 16382537  T
Q  308 c 308  Q
    |    
T  16382536 c 16382536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 322
Target Start/End: Original strand, 22433929 - 22434001
Alignment:
Q  250 tcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| ||||||||    
T  22433929 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 22434001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 22433829 - 22433916
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaa 109  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||    
T  22433829 acatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaa 22433916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 293
Target Start/End: Original strand, 16233227 - 16233312
Alignment:
Q  208 acatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||| || || || |||||||||||    
T  16233227 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgccttcatcttttc 16233312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18838171 - 18838086
Alignment:
Q  208 acatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| |||||||||| |  |||||| || || |||||||||||    
T  18838171 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctatgtactctgagacgccttcatcttttc 18838086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 12573931 - 12574277
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12573931 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgcca 12574030  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12574031 ccgtcccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaaccct 12574130  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||    
T  12574131 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatc 12574230  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| ||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  12574231 atcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacac 12574277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 27787319 - 27787659
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27787319 ataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgcca 27787418  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27787419 ccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactct 27787518  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||    
T  27787519 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatc 27787618  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    | ||| ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  27787619 accttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcc 27787659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 23293536 - 23293882
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23293536 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 23293635  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23293636 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 23293735  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  23293736 cagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatc 23293835  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||   |||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  23293836 atcttgactttctctatagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 23293882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11358736 - 11358393
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  11358736 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 11358637  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  11358636 taccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactctcag 11358537  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  11358536 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaac 11358437  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11358436 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacac 11358393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 23276354 - 23276700
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23276354 ataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 23276453  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |||    
T  23276454 ctgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccatcataggagtaaatct 23276553  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  23276554 cagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatc 23276653  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||| | |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  23276654 atcatgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 23276700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 31830239 - 31830582
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  31830239 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 31830338  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  31830339 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcag 31830438  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  31830439 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaac 31830538  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  31830539 ctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtcccaacac 31830582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 20832566 - 20832903
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  20832566 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 20832665  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||    
T  20832666 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 20832765  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||      
T  20832766 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcaat 20832865  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20832866 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcc 20832903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 1063332 - 1063675
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||| |    
T  1063332 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccacag 1063431  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||    
T  1063432 taccaattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 1063531  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  1063532 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttctcttatcaac 1063631  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  1063632 cttactttctcagtagtctcatgtaccaaatctggtcccaacac 1063675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 24653923 - 24654187
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24653923 ataacatgcgaaggatccgctaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24654022  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  24654023 ctgttccaaccttcactgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccct 24654122  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttct 265  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  24654123 cagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttct 24654187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 24944945 - 24945165
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||| |||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24944945 ataacatgcgaaggctccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24945044  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  24945045 ctgttccaaccctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccct 24945144  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctc 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  24945145 cagaaatacatgatcaccctc 24945165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27365944 - 27365637
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  27365944 ataatatgcgaaggattcggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgcca 27365845  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||    
T  27365844 cagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccct 27365745  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||     
T  27365744 caagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatt 27365645  T
Q  301 atcttaac 308  Q
    | ||||||    
T  27365644 aacttaac 27365637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 23087028 - 23087328
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  23087028 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacacactctatacgcca 23087127  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  ||||| || |||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||   |||| |||||    
T  23087128 ctgttccaactctctcagatatctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaagagtgactct 23087227  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | ||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||||    
T  23087228 caaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctctcttatc 23087327  T
Q  301 a 301  Q
    |    
T  23087328 a 23087328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 322
Target Start/End: Original strand, 24675070 - 24675388
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||    
T  24675070 acatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccg 24675169  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  || || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  || || ||||| |     
T  24675170 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaa 24675269  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||||| || ||    ||||||    
T  24675270 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatc 24675369  T
Q  304 ttaactttcttagtagtct 322  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  24675370 ttaactttctcagtagtct 24675388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22757307 - 22757039
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  22757307 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 22757208  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || |  ||    
T  22757207 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttc 22757108  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  22757107 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 22757039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21326092 - 21325819
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||| ||||  || || || ||||||||||||| ||| |    
T  21326092 gacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacggactaataa 21325993  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    |  |||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||||||||||||||  | ||    
T  21325992 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 21325893  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttct 313  Q
     || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  21325892 cctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttct 21325819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 23063667 - 23063944
Alignment:
Q  13 ggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcc 112  Q
    ||||||| |||||||||| | |  || ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||| || || |||| |||||||||||||||||  |    
T  23063667 ggatctggtacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 23063766  T
Q  113 tctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatg 212  Q
    | || || |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || ||    
T  23063767 tttcagatatctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaacgtg 23063866  T
Q  213 atcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     || || ||||||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||    
T  23063867 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatctt 23063944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24826060 - 24825828
Alignment:
Q  88 actctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 187  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||    
T  24826060 actcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtca 24825961  T
Q  188 tcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
      ||||| ||||||| |||||||| ||| || || | |||||||||| | || || ||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||| ||||||||    
T  24825960 caggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacgctttcat 24825861  T
Q  288 cttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||||||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  24825860 cttttcttggatcatcttaaccttctcagtagt 24825828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 9609834 - 9610033
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  9609834 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 9609933  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  9609934 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 9610033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 16924958 - 16925157
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  16924958 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 16925057  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  16925058 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 16925157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 16998698 - 16998897
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  16998698 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 16998797  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  16998798 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 16998897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21145775 - 21145576
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    ||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  21145775 atctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 21145676  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  21145675 cctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagt 21145576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Original strand, 23138636 - 23138907
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||| ||||||| || || ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||||||  || ||||| |    
T  23138636 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttctgata 23138735  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||   |||| ||||| | |||||| || || || ||    
T  23138736 tctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttc 23138835  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    ||||||||| ||| | ||  | ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23138836 ttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 23138907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Original strand, 23550426 - 23550697
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||| ||||||| || || ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||||||  || ||||| |    
T  23550426 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttctgata 23550525  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||   |||| ||||| | |||||| || || || ||    
T  23550526 tctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttc 23550625  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    ||||||||| ||| | ||  | ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23550626 ttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 23550697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 24709731 - 24709930
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  24709731 atctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 24709830  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  24709831 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 24709930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24878740 - 24878574
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || || || |    
T  24878740 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctcctt 24878641  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  24878640 cctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 24878574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 16981850 - 16982049
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  16981850 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 16981949  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| || |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  16981950 cttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 16982049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 17063415 - 17063614
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  17063415 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 17063514  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| || |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  17063515 cttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 17063614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 17067073 - 17067272
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  17067073 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 17067172  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| || |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  17067173 cttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 17067272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24708293 - 24708026
Alignment:
Q  55 tcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaact 154  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||  ||  | ||||||||||    
T  24708293 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaact 24708194  T
Q  155 tcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 254  Q
    || | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||||||||||||||  |||| || ||||| |||||    
T  24708193 tctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatg 24708094  T
Q  255 gtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
     ||  |||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    |||||||||||||||| ||||||||    
T  24708093 atatttcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 24708026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 27217714 - 27217913
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  27217714 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 27217813  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  27217814 cctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgtatcatctgaactttctcagtagt 27217913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 27370967 - 27371166
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  27370967 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 27371066  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  27371067 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 27371166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 44386314 - 44386157
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  44386314 atctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 44386215  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcga 278  Q
    | ||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  44386214 cctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcga 44386157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 320
Target Start/End: Original strand, 24262071 - 24262267
Alignment:
Q  124 tgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctctt 223  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || ||||    
T  24262071 tgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttctt 24262170  T
Q  224 gaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  24262171 ggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 24262267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 30211761 - 30211461
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||| |||   ||||   | || ||||    
T  30211761 acatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccactttatacgcaaccaccccaactttttccgaaa 30211662  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||  ||| | ||||| |  || ||||| ||||| ||||   | || ||||| | ||| ||||| || || ||    
T  30211661 tctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggtcacatgggtgactctaaaaaacacatggtctccttc 30211562  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
    ||||||||||||  |||| || ||||| ||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||| |||||||    
T  30211561 ttgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtc 30211462  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  30211461 t 30211461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22325601 - 22325402
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  22325601 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 22325502  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  22325501 cctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 22325402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 278
Target Start/End: Original strand, 10868548 - 10868705
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  10868548 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 10868647  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcga 278  Q
    | ||||| |||||  | || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  10868648 cctgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcga 10868705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 354
Target Start/End: Original strand, 45529131 - 45529442
Alignment:
Q  37 tgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaa 136  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||  | |||||  |||| || || ||||||||||| ||||| ||||  || || ||||||||||| ||  |||    
T  45529131 tgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaactctttccgaaatctgatatgggtcaa 45529230  T
Q  137 tgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggc 236  Q
    | ||| |||||||||  ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| ||||| ||      || |||||||||  |    
T  45529231 taaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataaacacatggtc------ttcaaactcaagatc 45529324  T
Q  237 ctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtcc 336  Q
    ||| ||  |||| ||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||  ||||| | ||||    
T  45529325 cttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttctctaatcaacttaaccttcttagtagtctgttgaacaatgtcc 45529424  T
Q  337 ggtcctaacaccaaactc 354  Q
    ||||| || |||| ||||    
T  45529425 ggtcccaataccacactc 45529442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 287
Target Start/End: Original strand, 23188607 - 23188872
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || |  |||| |||||||| ||||||||  || || || |    
T  23188607 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgccatcgttccaactctttccgata 23188706  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| |  || || || ||    
T  23188707 tctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttc 23188806  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
     ||| |||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  23188807 ctgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 23188872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27377285 - 27377104
Alignment:
Q  52 acatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtca 151  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  27377285 acatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtca 27377186  T
Q  152 acttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaag 233  Q
    ||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || || |||||||||||    
T  27377185 acttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaag 27377104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Original strand, 22276001 - 22276164
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||| || ||||| ||||  ||| | ||||| | ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||||||||    
T  22276001 ggagtcaacttcctacccttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 22276100  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||   |||||||||||    
T  22276101 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 22276164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41609113 - 41609054
Alignment:
Q  97 gccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttc 156  Q
    |||||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41609113 gccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttc 41609054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 59
Target Start/End: Original strand, 25128246 - 25128283
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatg 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25128246 acatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatg 25128283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17269840 - 17269494
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17269840 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccggagttgtgacacgtgaaatacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgcca 17269741  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17269740 ccgtcccgatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 17269641  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  17269640 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatc 17269541  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| ||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  17269540 atcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacac 17269494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 22381063 - 22381406
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22381063 acatgtgacggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccaccg 22381162  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  22381163 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccctcag 22381262  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22381263 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatt 22381362  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22381363 ttgaccttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacac 22381406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 22502543 - 22502886
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  22502543 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 22502642  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||    
T  22502643 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 22502742  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22502743 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttcccttatcaac 22502842  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22502843 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtctggtcccaacac 22502886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 23080593 - 23080243
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  23080593 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaaccaactctataagccactg 23080494  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || || ||    
T  23080493 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccctcag 23080394  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23080393 aaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctgcgacgctttcatcttttcccttatcatc 23080294  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  23080293 ttgactttctcagtagtctcatgcaccaagtctggtcccaacaccacactc 23080243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22236427 - 22236081
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  22236427 ataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgaca 22236328  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  22236327 ctgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccct 22236228  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || | |    
T  22236227 cagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgacc 22236128  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  22236127 atcttgactttctctgtagtctgatgaaccaactccggtcccaacac 22236081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14887495 - 14887152
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  14887495 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 14887396  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||    
T  14887395 taccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 14887296  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14887295 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaac 14887196  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  14887195 ctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtcccaacac 14887152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 20342146 - 20342489
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  20342146 acatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactg 20342245  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  || || ||||| ||    
T  20342246 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtcaaaggggtgactctcag 20342345  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  20342346 aaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaac 20342445  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20342446 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacac 20342489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 25847939 - 25848282
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| | | ||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |    
T  25847939 acatgtgaaggatccgcaacatacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctgtatgccacag 25848038  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |     
T  25848039 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcaa 25848138  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  25848139 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaat 25848238  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25848239 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacac 25848282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 20821314 - 20821660
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  20821314 ataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgcca 20821413  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20821414 cagttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccct 20821513  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||  | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  20821514 cagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatc 20821613  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  20821614 atcctaactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggccccaacac 20821660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37546001 - 37545657
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  37546001 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 37545902  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||    
T  37545901 taccaactctctcagaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 37545802  T
Q  204 -aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcat 302  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  37545801 aaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaa 37545702  T
Q  303 cttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    | | ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  37545701 ccttactttctcagtagtctcatgtaccaaatccggtcccaacac 37545657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24798901 - 24798558
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  24798901 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 24798802  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  24798801 taccaactctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcag 24798702  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24798701 aaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttcccttatcatt 24798602  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||    
T  24798601 ctgactttctcagtagtctcgtgaaccaaatccagtcccaacac 24798558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21891263 - 21890935
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||| |    
T  21891263 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 21891164  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  21891163 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcag 21891064  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21891063 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 21890964  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaa 332  Q
    || |||||||  ||||||| |||||||||    
T  21890963 ttgactttctctgtagtctgatgaaccaa 21890935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 22461816 - 22462159
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22461816 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 22461915  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||    
T  22461916 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 22462015  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| ||||| ||||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22462016 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatc 22462115  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  22462116 ttgactttctctgtagtttcatgaaccaattccggccccaacac 22462159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23442800 - 23442454
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||| | || ||||    
T  23442800 ataacatacgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgcca 23442701  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || | || |||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23442700 ctgttccaaccctctcagataactgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactct 23442601  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23442600 caaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 23442501  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  23442500 atcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 23442454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28924275 - 28923935
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  28924275 ataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgcca 28924176  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28924175 cagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 28924076  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| | || || ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  28924075 cagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatc 28923976  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    ||| | ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28923975 atcctgactttttccgtagtctcatgaaccaaatccggtcc 28923935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28895449 - 28895109
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  28895449 ataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgcca 28895350  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
      |||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28895349 gagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 28895250  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| | || || ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  28895249 cagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatc 28895150  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    ||| | ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28895149 atcctgactttttccgtagtctcatgaaccaaatccggtcc 28895109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 20773621 - 20773961
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  20773621 ataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgcca 20773720  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  20773721 cagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgtcataggagtaaccct 20773820  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||  | || || ||||||| |||  | || |  ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  20773821 cagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatc 20773920  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20773921 atcttgactttctctgtagtctcatgaaccaattccggtcc 20773961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24736118 - 24735811
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  24736118 ataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgcca 24736019  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  24736018 ctgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactct 24735919  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  24735918 caagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatc 24735819  T
Q  301 atcttaac 308  Q
    | ||||||    
T  24735818 aacttaac 24735811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24750061 - 24749754
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  24750061 ataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgcca 24749962  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  24749961 ctgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactct 24749862  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  24749861 caagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatc 24749762  T
Q  301 atcttaac 308  Q
    | ||||||    
T  24749761 aacttaac 24749754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24737292 - 24737015
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  24737292 ataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgcca 24737193  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  24737192 ctgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactct 24737093  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcga 278  Q
     |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  24737092 caagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcga 24737015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26739191 - 26738893
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || |||| |||||||||||||||||| || ||||| |    
T  26739191 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgata 26739092  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || ||||| |||| ||| ||||| ||||  ||||| || || | ||||| |||||| |  ||    
T  26739091 tctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccctcaaaaatatatgatctctttc 26738992  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||    
T  26738991 ttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagt 26738893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 293
Target Start/End: Original strand, 23516459 - 23516712
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||||| |    
T  23516459 gacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctaatacggaccaataa 23516558  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    |  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || || || ||||||||||||||| | ||    
T  23516559 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttt 23516658  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23516659 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 23516712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 322
Target Start/End: Original strand, 22134667 - 22134868
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || || || |    
T  22134667 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctcctt 22134766  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  22134767 cctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagt 22134866  T
Q  321 ct 322  Q
    ||    
T  22134867 ct 22134868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21564469 - 21564173
Alignment:
Q  5 catgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgt 104  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  21564469 catgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgt 21564370  T
Q  105 tccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaga 204  Q
     | ||  || || || |||||||| |||||||| |||   |||||||| ||| | || ||||||||||| |  ||||  ||||   |||| ||||| |||    
T  21564369 ccaaactctatcagatatctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcaga 21564270  T
Q  205 aatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatca 301  Q
    || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||  ||||| |||| || |||||||    
T  21564269 aacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgccgactttgcgacactttcgtcttctctcttatca 21564173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Original strand, 23573642 - 23573942
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  23573642 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 23573741  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  23573742 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 23573841  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    |||||||||||||||| |||||||    
T  23573842 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 23573941  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  23573942 t 23573942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21984773 - 21984523
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||||| || || |||| ||||||||||||||||   || || || ||||||||||||||||| |    
T  21984773 gacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccagctctttccgatatctgatacggaccaataa 21984674  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    |  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||  |||  ||||| ||||| | |||||| || || |||||||||||||||||  | ||    
T  21984673 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatcttt 21984574  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     || ||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||||||    
T  21984573 cctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 21984523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Original strand, 20573403 - 20573626
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||    
T  20573403 acatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccg 20573502  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |     
T  20573503 ttccaattctttccgatatctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcagtggagtgactctcaa 20573602  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaa 227  Q
    |||||||||||| || ||||||||    
T  20573603 aaatacatgatctccttcttgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Original strand, 23471129 - 23471399
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || |||| |||||||||||||||||| || ||||| |    
T  23471129 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgata 23471228  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
     ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | |||||||||||| || ||    
T  23471229 cctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttc 23471328  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctttt 292  Q
    ||||||||||||| | |  || ||||| ||||| | |||||| ||  ||||||| || |||||||||||||    
T  23471329 ttgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttttgccgactctgagacgctttcatctttt 23471399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15000126 - 14999927
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  15000126 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 15000027  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| | ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  15000026 cttggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 14999927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 16356501 - 16356700
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  16356501 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 16356600  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  16356601 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 16356700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 19769959 - 19770158
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  19769959 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 19770058  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  19770059 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 19770158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20468582 - 20468311
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||| ||||||||| ||| | || || ||| | |    
T  20468582 acatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcaatacgccactgtttctattctttctaata 20468483  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    ||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||||||||| || || ||    
T  20468482 tctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttc 20468383  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
     ||||| |||||| | || || || || ||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  20468382 ctgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttcagtcaactctgcgacgctttcatcttttc 20468311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 34566493 - 34566692
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  34566493 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 34566592  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  34566593 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 34566692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22333274 - 22333108
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  22333274 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 22333175  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||| || |||||    
T  22333174 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcat 22333108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27685787 - 27685621
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  27685787 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 27685688  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    |||| ||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  27685687 cttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 27685621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21498446 - 21498251
Alignment:
Q  98 ccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaac 197  Q
    ||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||  ||||||| ||||| ||||   |||| ||    
T  21498446 ccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaattcacgtccaacaccggtcacaagagtgac 21498347  T
Q  198 tcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    ||| | || ||||||||| |||||||||||||| | | |  | || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21498346 tctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 21498251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 27610353 - 27610552
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  27610353 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 27610452  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||  |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  27610453 cctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 27610552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27668901 - 27668678
Alignment:
Q  97 gccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaa 196  Q
    |||||||||||||  || ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  27668901 gccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtga 27668802  T
Q  197 ctcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttccct 296  Q
    |||| | ||| || || || || || ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||       
T  27668801 ctctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttg 27668702  T
Q  297 tatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     ||||||| |||||||| ||||||    
T  27668701 gatcatctgaactttctcagtagt 27668678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 40708779 - 40708978
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||  | || || |    
T  40708779 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgcggtctcctt 40708878  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  40708879 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 40708978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 320
Target Start/End: Original strand, 41770817 - 41771040
Alignment:
Q  97 gccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaa 196  Q
    |||||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  41770817 gccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtga 41770916  T
Q  197 ctcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttccct 296  Q
    |||| | ||| || || || || || ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| || || ||||| || ||       
T  41770917 ctctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttcattttctcttg 41771016  T
Q  297 tatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     ||||||| |||||||| ||||||    
T  41771017 gatcatctgaactttctcagtagt 41771040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 27518406 - 27518605
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||  | || || |    
T  27518406 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgaggtctcctt 27518505  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  27518506 cctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 27518605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 322
Target Start/End: Original strand, 18775659 - 18775977
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||| ||||  |||||    
T  18775659 acatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacatcaccg 18775758  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  || || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||  |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |     
T  18775759 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 18775858  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| || || || ||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||  | ||    ||||||    
T  18775859 aaagacgtggtctccctcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattctctcttgaatcatc 18775958  T
Q  304 ttaactttcttagtagtct 322  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  18775959 ttaactttctcagtagtct 18775977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 322
Target Start/End: Original strand, 20798690 - 20798960
Alignment:
Q  52 acatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtca 151  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| || || | || ||| ||||||| |||||  || ||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||    
T  20798690 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgatatttgatacggaccaataaatctcggagtca 20798789  T
Q  152 acttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 251  Q
    ||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||    
T  20798790 acttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatc 20798889  T
Q  252 atggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
    ||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||||| || ||    ||||||||||| |||| ||||||||    
T  20798890 atgataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 20798960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 290
Target Start/End: Original strand, 25423108 - 25423357
Alignment:
Q  41 acacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaa 140  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||   |||||||||||||||||  || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  25423108 acacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacctgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaa 25423207  T
Q  141 cttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttt 240  Q
      |||||||||||||| |  | ||||| |||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || || || ||||||||||||||  | ||     
T  25423208 tctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttc 25423307  T
Q  241 ctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  25423308 ctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 25423357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21662543 - 21662297
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    |||||||| ||||| | |||||| ||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||||| || |||||||||| ||  |    
T  21662543 acatgcgatggatccgatacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattg 21662444  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  || || || |||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||| ||||||||    
T  21662443 ttccaactctttccgatatctgataca-accaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttag 21662345  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 251  Q
    ||| ||||||||  | |||||||| |||||| | || || ||||||||    
T  21662344 aaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttgtc 21662297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 320
Target Start/End: Original strand, 23440196 - 23440423
Alignment:
Q  93 atacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcgga 192  Q
    |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   ||    
T  23440196 atacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaaga 23440295  T
Q  193 gtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctttt 292  Q
    || ||||| | ||| || || || || |||||||||| |||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || |    
T  23440296 gtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttct 23440395  T
Q  293 cccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |    ||||| |||||||||| ||||||    
T  23440396 cttgaatcattttaactttctcagtagt 23440423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21343825 - 21343665
Alignment:
Q  41 acacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaa 140  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||||| ||    
T  21343825 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaa 21343726  T
Q  141 cttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctt 201  Q
      |||||||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||||    
T  21343725 tctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctt 21343665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21665968 - 21665758
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||||| || |||||||||| ||  |||||||  || || || |||||||||  |||||| |    
T  21665968 gacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgatatctgataca-accaataa 21665870  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||||| |||||| | ||    
T  21665869 acctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtcttt 21665770  T
Q  240 tctccgcttgtc 251  Q
     || ||||||||    
T  21665769 cctacgcttgtc 21665758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 37291883 - 37291682
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  37291883 atctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 37291784  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | || || | ||| ||||| |||||||| ||| || ||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  37291783 cttggaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 37291684  T
Q  321 ct 322  Q
    ||    
T  37291683 ct 37291682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 209
Target Start/End: Original strand, 22348424 - 22348512
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatac 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  22348424 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatac 22348512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29476458 - 29476318
Alignment:
Q  123 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctct 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | ||| || || || || ||     
T  29476458 ctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 29476359  T
Q  223 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactctt 263  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  29476358 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 29476318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 21404718 - 21404865
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| || |    
T  21404718 acatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaacccactctatacgcaactg 21404817  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtca 151  Q
    | ||||  || || |||||||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  21404818 tcccaactctttccgaaatctgatacgagccaataaaccacggagtca 21404865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 11211057 - 11210856
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   | || ||||    
T  11211057 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcc 11210958  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaa 344  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |  |||||||| || || |  |||||||||||    
T  11210957 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 11210858  T
Q  345 ca 346  Q
    ||    
T  11210857 ca 11210856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21937551 - 21937388
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  21937551 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 21937452  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||   |||||||||||    
T  21937451 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 21937388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 346
Target Start/End: Original strand, 23503511 - 23503649
Alignment:
Q  208 acatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaa 307  Q
    |||||||||||   |||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||||| |||   ||||||||||    
T  23503511 acatgatcaccaatttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaa 23503610  T
Q  308 ctttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaaca 346  Q
    | || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||    
T  23503611 ccttttccgtagtctcttgcaccacttccggtcctaaca 23503649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 220 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21339574 - 21339474
Alignment:
Q  220 tcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtag 319  Q
    ||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||    ||||||||||| |||| |||||    
T  21339574 tcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtag 21339475  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  21339474 t 21339474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21831995 - 21831943
Alignment:
Q  256 taactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  21831995 taactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaac 21831943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Original strand, 24581216 - 24581379
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| | || |||| ||| || ||||||||  ||||||||||||   |||| ||||    
T  24581216 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 24581315  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||   |||||||||||    
T  24581316 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 24581379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8759635 - 8759289
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8759635 ataacatgtgaaggatctgctacatacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgcca 8759536  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8759535 ccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactct 8759436  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||    
T  8759435 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatc 8759336  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| ||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  8759335 atcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacac 8759289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 13941600 - 13941946
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13941600 ataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgcca 13941699  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13941700 ccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactct 13941799  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||    
T  13941800 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatc 13941899  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| ||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  13941900 atcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacac 13941946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 41177098 - 41177438
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41177098 ataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgcca 41177197  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41177198 ccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactct 41177297  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||    
T  41177298 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatc 41177397  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    ||||| ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  41177398 atcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcc 41177438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 44776823 - 44777169
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44776823 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgcca 44776922  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44776923 ccgttccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgtcatcggagtgactct 44777022  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  44777023 tagaaatacatgatcaccctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatc 44777122  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| ||||| |  |||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  44777123 atcttgactttttctgtagtctcctgaactaaatctggtcccaacac 44777169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16381480 - 16381143
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16381480 ataacatgcgaaggatctgctacatatttccgaagctgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgcca 16381381  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16381380 ccgtcccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 16381281  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
    || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  16381280 taaaaatacatgatcaccatcccgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaac---tctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatc 16381184  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    ||||| || || |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16381183 atcttgaccttttctgtagtctcatgaaccaaatccggtcc 16381143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16837057 - 16836717
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |      ||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  16837057 ataagatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagtgg------tgtggtggcaaaccaactctatatgtca 16836964  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16836963 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 16836864  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16836863 caaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatc 16836764  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16836763 atcttgaccttctcagtcgtctcatgaaccaaatctggtcccaacac 16836717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12361095 - 12360755
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12361095 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 12360996  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||||||    
T  12360995 ctgttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactct 12360896  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12360895 cagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttcccttatc 12360796  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    ||||| |||||||  ||||||  |||||||||||| |||||    
T  12360795 atcttgactttctctgtagtccgatgaaccaagtctggtcc 12360755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18134899 - 18134553
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18134899 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 18134800  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18134799 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactct 18134700  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |  |||    
T  18134699 cagaaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctccgatc 18134600  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    || || ||||| |  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  18134599 attttgactttatctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 18134553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16330209 - 16329866
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  16330209 acatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 16330110  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| || || ||    
T  16330109 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccctcag 16330010  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16330009 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtgaagctttcatcttttcccttatcaac 16329910  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16329909 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacac 16329866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15953521 - 15953175
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| | || ||||    
T  15953521 ataacatgcgaatgatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgcca 15953422  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  15953421 ctgttccaaccctctcagatatctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatct 15953322  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15953321 cagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 15953222  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  15953221 atcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 15953175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11304326 - 11303980
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |  || |||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11304326 ataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 11304227  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||   ||||||    
T  11304226 ctattccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcatagggaaaactct 11304127  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11304126 cagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttctcttatc 11304027  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| || ||||  |||| || ||||| ||| | |||||| |||||    
T  11304026 atctttaccttctccgtagcctgatgaatcaaattcggtcccaacac 11303980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 10383548 - 10383891
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  10383548 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 10383647  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||| || || ||    
T  10383648 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcag 10383747  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  10383748 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaac 10383847  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  10383848 ctgactttctcagtagtctcatgaactaaatccggtcccaacac 10383891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11961584 - 11961241
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||      
T  11961584 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaatcaactctataagccacta 11961485  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| || || ||    
T  11961484 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgaccctcag 11961385  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  11961384 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcaaagccttcatcttttcccttatcatt 11961285  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    || || || | ||| |||||||||||||  |||||||| |||||    
T  11961284 ttgaccttttcagtcgtctcatgaaccacatccggtcccaacac 11961241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 47123523 - 47123866
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || |||||| |||| | ||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  47123523 acatgagaaggatccgcaacatacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 47123622  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  47123623 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcag 47123722  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  47123723 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaac 47123822  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  47123823 ctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtcccaacac 47123866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 14571424 - 14571770
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| | |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  14571424 ataacatgcgaaggatccgctacgtacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagcccactctatatgcca 14571523  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14571524 ctgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 14571623  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14571624 caaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 14571723  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  || |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  14571724 atcttgactttctccgtggtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 14571770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10420598 - 10420252
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  10420598 ataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgcca 10420499  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  10420498 cagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccct 10420399  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  10420398 cagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatc 10420299  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||| | |||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10420298 atcctgactttctccgtggtctcatgaaccaaatccggtcccaacac 10420252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13972673 - 13972386
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  13972673 ataatatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgcca 13972574  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  13972573 cagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactct 13972474  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatc 288  Q
     |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13972473 caagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 13972386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13323205 - 13322859
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||    
T  13323205 ataacatgcgacggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaaccaatcctatatgcca 13323106  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13323105 ctgttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactct 13323006  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||  | || || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  | |||    
T  13323005 cagaaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatcctttctatgatc 13322906  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  13322905 atcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 13322859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 15227225 - 15227525
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  15227225 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 15227324  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| |||||    
T  15227325 ctgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactct 15227424  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | ||| ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  15227425 caaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttctctcttatc 15227524  T
Q  301 a 301  Q
    |    
T  15227525 a 15227525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12850785 - 12850532
Alignment:
Q  48 aaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcgga 147  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||    
T  12850785 aaacacatcatgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcgga 12850686  T
Q  148 gtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgct 247  Q
    ||||||||| | || ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  12850685 gtcaacttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgct 12850586  T
Q  248 tgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatca 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  12850585 tgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatca 12850532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 14086249 - 14086536
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || ||||| || || ||||| ||||    
T  14086249 ataatatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagcca 14086348  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | || || |  ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  14086349 ctgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactct 14086448  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatc 288  Q
     |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14086449 caagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 14086536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14877042 - 14876774
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| || || |||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  14877042 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 14876943  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | ||| || || || || ||    
T  14876942 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttc 14876843  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  14876842 ttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 14876774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Original strand, 12497835 - 12498135
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  12497835 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 12497934  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  12497935 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 12498034  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    |||||||||||||||| |||||||    
T  12498035 ttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 12498134  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  12498135 t 12498135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 15208478 - 15208776
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| || || || || ||||| ||| | || || |||| |||| ||||||||||||| || ||||| |    
T  15208478 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatactccaccgttccaattctttctgata 15208577  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |  | ||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||||||||| || ||    
T  15208578 tctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttc 15208677  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||||||||||| |   || || ||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  15208678 ttgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 15208776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 17489419 - 17489705
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||| || || |||| |||||||||||    
T  17489419 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 17489518  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  || || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |     
T  17489519 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 17489618  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  17489619 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 17489705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Original strand, 15247752 - 15248032
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||| | || || |||| |||||||||||||||||| || || || |||| ||||||||||||      
T  15247752 gacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatatctaatacggaccaatac 15247851  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    || |||||||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||  |   ||    
T  15247852 acctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcattgttttt 15247951  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     || ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  15247952 cctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 15248032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Original strand, 9522306 - 9522577
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||||| || || ||||  ||||||||||||||||  || | ||| |    
T  9522306 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttttgata 9522405  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  9522406 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 9522505  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    |||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  9522506 ttgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttc 9522577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15348689 - 15348490
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  15348689 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 15348590  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  15348589 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 15348490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16412726 - 16412527
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || || || |    
T  16412726 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctcctt 16412627  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||||||||||    
T  16412626 catgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttcttagtagt 16412527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 31945048 - 31945177
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  31945048 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgcca 31945147  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacg 130  Q
    | ||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  31945148 ctgttccaaccctttctgatatctgatacg 31945177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 10905896 - 10906095
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  10905896 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 10905995  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  10905996 cttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 10906095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 16635459 - 16635658
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  16635459 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 16635558  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  16635559 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 16635658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26792843 - 26792644
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||| || || || || |    
T  26792843 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcataggagtgactcttaaaaacacgtggtctcctt 26792744  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  26792743 cttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 26792644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31689176 - 31689049
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  31689176 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaaccaactctatatgcca 31689077  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgata 128  Q
    | ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  31689076 ctgttccaaccctttctgatatctgata 31689049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 43162783 - 43162982
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  43162783 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 43162882  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  43162883 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 43162982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 10005286 - 10005485
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  10005286 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 10005385  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  10005386 cctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 10005485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15589836 - 15589637
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  15589836 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 15589737  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  15589736 cctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 15589637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 48425133 - 48425332
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  48425133 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 48425232  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| || |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  48425233 cttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 48425332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 322
Target Start/End: Original strand, 16371034 - 16371300
Alignment:
Q  56 catgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactt 155  Q
    ||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  16371034 catgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcaatacgccaccgtcccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaactt 16371133  T
Q  156 cctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatgg 255  Q
    | | || |||||||||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || |  ||  | |||||||| |||||  | || || ||||| |||||     
T  16371134 ctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatga 16371233  T
Q  256 taactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| ||||||||    
T  16371234 taactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 16371300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16492742 - 16492456
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||    
T  16492742 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 16492643  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  || ||  | ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| | || || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |     
T  16492642 ttccaactctttccaatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 16492543  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  16492542 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 16492456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16757031 - 16756830
Alignment:
Q  119 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcacc 218  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| |  || || ||    
T  16757031 aaatatgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacatgtggtctcc 16756932  T
Q  219 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagta 318  Q
     || | ||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| || || |  ||||||| |||||||| ||||    
T  16756931 ttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagta 16756832  T
Q  319 gt 320  Q
    ||    
T  16756831 gt 16756830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 53385464 - 53385263
Alignment:
Q  119 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcacc 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || ||    
T  53385464 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 53385365  T
Q  219 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagta 318  Q
     || ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||    
T  53385364 ttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 53385265  T
Q  319 gt 320  Q
    ||    
T  53385264 gt 53385263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5425373 - 5425175
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||  || || || || |    
T  5425373 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctca-aagcacgtggtctcctt 5425275  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  5425274 cctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 5425175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 13252376 - 13252575
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  13252376 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 13252475  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  13252476 cctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 13252575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 287
Target Start/End: Original strand, 15338934 - 15339121
Alignment:
Q  100 accgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactc 199  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  15338934 accgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactc 15339033  T
Q  200 ttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    | | ||| || || || || || | |||||||||  | ||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  15339034 tcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 15339121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20062498 - 20062299
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  20062498 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 20062399  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  20062398 cctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 20062299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15402978 - 15402788
Alignment:
Q  97 gccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaa 196  Q
    |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  15402978 gccaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtga 15402879  T
Q  197 ctcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    |||| | ||| || || || || || ||||||||||   | ||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  15402878 ctctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 15402788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15725377 - 15725211
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  15725377 atctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctaaaaaacacgtggtctcctt 15725278  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||| || |||||    
T  15725277 cctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcat 15725211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 320
Target Start/End: Original strand, 6600431 - 6600632
Alignment:
Q  119 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcacc 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || ||    
T  6600431 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 6600530  T
Q  219 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagta 318  Q
     || |  || |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || || |  ||||||| |||||||| ||||    
T  6600531 ttccttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagta 6600630  T
Q  319 gt 320  Q
    ||    
T  6600631 gt 6600632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Original strand, 16691747 - 16692047
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || | ||| ||||||||||||| ||| || || |    
T  16691747 acatacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatatgccaccgttccaaccctttccgata 16691846  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    | |||||||  ||||| ||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  16691847 tttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 16691946  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
     |||||||||||  ||||  | ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||    |||||||||||||| | |||||||    
T  16691947 ctgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttcagtagtc 16692046  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  16692047 t 16692047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16807439 - 16807169
Alignment:
Q  52 acatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtca 151  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||   | |  || |||||||||||||| |  ||  || ||||||    
T  16807439 acatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaaattttttcgatatctgatacggaccgaaaaatctcagagtca 16807340  T
Q  152 acttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 251  Q
    ||||| | || |||||||||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  16807339 acttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcgcttatc 16807240  T
Q  252 atggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
    ||| ||| |||||||| |||| ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||||| ||||||||    
T  16807239 atgataattcttctgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcattttaactttctcagtagtct 16807169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8274819 - 8274656
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| | || || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  8274819 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8274720  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||   |||||||||||    
T  8274719 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 8274656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15016119 - 15015996
Alignment:
Q  190 ggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatct 289  Q
    ||||| ||||| | |||||| || || || ||||||||||||||  |||| || ||||| ||||| |||||||| |||  |||||| || ||||||||||    
T  15016119 ggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgctttcatct 15016020  T
Q  290 tttcccttatcatcttaactttct 313  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||    
T  15016019 tctccctaatcaacttaaccttct 15015996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 347
Target Start/End: Original strand, 17492489 - 17492552
Alignment:
Q  284 tcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  17492489 tcatcttttcccttatcatctttaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 17492552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 346
Target Start/End: Original strand, 18748403 - 18748586
Alignment:
Q  163 ttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactct 262  Q
    |||||||||||||| ||||| || |  ||  | ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |  ||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  18748403 ttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgttcttcctcctcttatcatgataactct 18748502  T
Q  263 tctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaaca 346  Q
    |||||  |||||| ||  |||||||||| ||    |||||||||||||| |  |||||||| || || |  |||||||||||||    
T  18748503 tctgtctactctgagacactttcatcttatcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaacctccggtcctaaca 18748586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16743123 - 16742922
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| | || || | ||| |||||||||||  ||||| ||||||   |||||||||    
T  16743123 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcc 16743024  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaa 344  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||   ||||||||||| || |  |||||||| || || |  |||||||||||    
T  16743023 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 16742924  T
Q  345 ca 346  Q
    ||    
T  16742923 ca 16742922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 290
Target Start/End: Original strand, 17192877 - 17192959
Alignment:
Q  208 acatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    |||||||||||  | ||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  17192877 acatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 17192959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13975402 - 13975302
Alignment:
Q  208 acatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaa 307  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| || |||||||||  |||||| || || |||||||| |||   ||||||||||    
T  13975402 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagatgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 13975303  T
Q  308 c 308  Q
    |    
T  13975302 c 13975302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 14129810 - 14130163
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14129810 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgcca 14129909  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14129910 tcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactct 14130009  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14130010 aaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatc 14130109  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    ||||| || |||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  14130110 atcttgaccttctcagtcatctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactc 14130163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 14433628 - 14433981
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14433628 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgcca 14433727  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14433728 tcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactct 14433827  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14433828 aaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatc 14433927  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    ||||| || |||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  14433928 atcttgaccttctcagtcatctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactc 14433981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23200055 - 23199709
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  23200055 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtca 23199956  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23199955 tcgttccgatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactct 23199856  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  23199855 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatc 23199756  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    | ||| ||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  23199755 agcttgactttttctgtagtctcctggaccaaatccggtcccaacac 23199709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23506182 - 23505836
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  23506182 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtca 23506083  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23506082 tcgttccgatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactct 23505983  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  23505982 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatc 23505883  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    | ||| ||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  23505882 agcttgactttttctgtagtctcctggaccaaatccggtcccaacac 23505836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18054265 - 18053919
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18054265 ataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgcca 18054166  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18054165 ccgttcctattctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactct 18054066  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||    
T  18054065 cagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatc 18053966  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| ||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  18053965 atcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacac 18053919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16950783 - 16950437
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16950783 ataacatgcaaatgatccgctacatacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgcca 16950684  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16950683 ctgttccaaccctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 16950584  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16950583 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatc 16950484  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  16950483 atcttgactttctcagtagtctgatgaaccaagtcctgtcccaacac 16950437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Original strand, 13021297 - 13021647
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  13021297 acatgtgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataagccactg 13021396  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || || ||    
T  13021397 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgtcataggagtgaccctcag 13021496  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13021497 aaaaacatgatcaccgtcttgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 13021596  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13021597 ttgaccttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccacactc 13021647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14286688 - 14286342
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14286688 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 14286589  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14286588 ctgttccaatcctatatgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactct 14286489  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14286488 caaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcccttatc 14286389  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| || |||| ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  14286388 atcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 14286342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 6413448 - 6413779
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6413448 ataacatgcgaaggatccactacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 6413547  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  6413548 ctgttccaaccctctctgaaatctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccct 6413647  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6413648 cagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatgttttcccttatc 6413747  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaa 332  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  6413748 atcttgactttctcagtagtctgatgaaccaa 6413779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1719 - 1373
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1719 ataacatgcgaatgatctgctacatccttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 1620  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
      ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  1619 gtgttccaaccctttcttaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaacttt 1520  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||    
T  1519 cacaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtgacgctttcatcttttcccttatc 1420  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| || |||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  1419 atcttgaccttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 1373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11306572 - 11306229
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  11306572 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 11306473  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||    
T  11306472 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 11306373  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11306372 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaac 11306273  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  11306272 ctgactttctcagtagtctcatgaactaaatccggtcccaacac 11306229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Original strand, 12455643 - 12455992
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |    
T  12455643 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaattctataagccactg 12455741  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||  ||||| || || ||    
T  12455742 ttctaactctctctgaaatctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 12455841  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  12455842 aaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcacc 12455941  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12455942 ttgactttctcagtagtctcatgtaccaagtccggtcccaacaccacactc 12455992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8212437 - 8212100
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| |  || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  8212437 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactg 8212338  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||    
T  8212337 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 8212238  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8212237 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaac 8212138  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  8212137 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcc 8212100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15102913 - 15102568
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  15102913 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 15102814  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15102813 ctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 15102714  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  15102713 caaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcattttttctcttatc 15102614  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaaca 346  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||    
T  15102613 atcttgactttctctgtagtctgatgaatcaaatccggtcccaaca 15102568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26288348 - 26288041
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || || | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26288348 ataacatgcgaaggatccactacatattttcgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 26288249  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  26288248 ctgttcaaaccctttctgaaatctgatacgtaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtcataggagtaaccct 26288149  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26288148 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaa-tctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatc 26288050  T
Q  301 atcttaact 309  Q
    |||||||||    
T  26288049 atcttaact 26288041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 49152241 - 49152584
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  49152241 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 49152340  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || || ||    
T  49152341 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 49152440  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  49152441 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaac 49152540  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  49152541 ctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtcccaacac 49152584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14264556 - 14264210
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |  || ||||| |||||||||||| |||| || || |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  14264556 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 14264457  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14264456 ctgttccaaccctttcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactct 14264357  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14264356 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcgcttatc 14264257  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| || ||||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||||    
T  14264256 atcttgacattcttcgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaacac 14264210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16072606 - 16072260
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |  | ||||    
T  16072606 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgcca 16072507  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16072506 ctgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 16072407  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16072406 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 16072307  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| || ||||   |||||| | ||||||| || ||||| |||||    
T  16072306 atcttgaccttctccatagtctgacgaaccaaatctggtcccaacac 16072260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 19147148 - 19147494
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |  ||||| || ||||    
T  19147148 ataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgcca 19147247  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19147248 ctgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactct 19147347  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19147348 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 19147447  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| || ||||  ||||||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  19147448 atcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacac 19147494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 13665490 - 13665814
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13665490 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 13665589  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||| |||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  13665590 ctgttccaaccctttctgaaatctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactct 13665684  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  13665685 cagaaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatc 13665784  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaacc 330  Q
    ||||| |||||||  ||||| | |||||||    
T  13665785 atcttgactttctctgtagtttgatgaacc 13665814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 20746547 - 20746893
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |  ||||| || ||||    
T  20746547 ataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgcca 20746646  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  20746647 ctgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactct 20746746  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20746747 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 20746846  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| || ||||  ||||||| |||||| || || ||||| |||||    
T  20746847 atcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacac 20746893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 115 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26118803 - 26118571
Alignment:
Q  115 tctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||  ||||| || || ||||| |||||||    
T  26118803 tctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgat 26118704  T
Q  215 caccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttctt 314  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | | |||||||     
T  26118703 caccctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcctttctcttatcaacctgactttctc 26118604  T
Q  315 agtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26118603 agtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacac 26118571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11388739 - 11388433
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  11388739 ataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgcca 11388640  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11388639 ctgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactct 11388540  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |  || ||||||||  |||||||||||||| || |||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  11388539 caagaacacatgatc-tcctcttgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatc 11388441  T
Q  301 atcttaac 308  Q
    | ||||||    
T  11388440 aacttaac 11388433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12207112 - 12206823
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  12207112 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 12207013  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||| |||  ||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| |||||    
T  12207012 ctgttgcaactctctcagatatctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactct 12206913  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     | ||| ||||| || || |||||||||| |||  ||||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  12206912 caaaaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 12206823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 15340433 - 15340574
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15340433 ataacatgcgaaagatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 15340532  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaact 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15340533 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaact 15340574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 225 - 354
Target Start/End: Original strand, 12456940 - 12457069
Alignment:
Q  225 aaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctca 324  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | ||||||| ||||||||||    
T  12456940 aaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatgaacctgactttctcagtagtctca 12457039  T
Q  325 tgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12457040 tgaaccaagtccggtcccaacaccacactc 12457069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15154965 - 15154667
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||  |||| || || ||||  || |||||||||||||  || ||||| |    
T  15154965 acatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgata 15154866  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || || || ||    
T  15154865 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 15154766  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||| | ||  |||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||    
T  15154765 ttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactcggtgacactttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagt 15154667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 207 - 341
Target Start/End: Original strand, 15340574 - 15340708
Alignment:
Q  207 tacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatctta 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||     
T  15340574 tacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatcagcttg 15340673  T
Q  307 actttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    || |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  15340674 accttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcc 15340708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11553415 - 11553117
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || || || ||||| || || ||||||||||| || || |||| ||| |||||||||||||  || || || |    
T  11553415 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgataagccaccgttccaactctttccgata 11553316  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  11553315 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 11553216  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||||| || ||    |||||||||||||||| ||||||    
T  11553215 ctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 11553117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Original strand, 12687458 - 12687758
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || || || ||||| || || ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||||||  || ||||| |    
T  12687458 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcgataagccaccgttccaactctttctgata 12687557  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  | ||| || || || || ||    
T  12687558 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactcgcaaaaacacgtggtctccttc 12687657  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
     |||||||||||  |||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    |||||||||||||||| |||||||    
T  12687658 ctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 12687757  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  12687758 t 12687758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 322
Target Start/End: Original strand, 14954643 - 14954877
Alignment:
Q  88 actctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 187  Q
    |||| ||| |||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  14954643 actcgataagccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtca 14954742  T
Q  188 tcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    | ||||| ||||| | ||| || || || || || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  14954743 taggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 14954842  T
Q  288 cttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
     || ||    |||||||||||||||| ||||||||    
T  14954843 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 14954877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Original strand, 15203836 - 15204107
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||| | ||||||||||| || |||| ||    
T  15203836 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatactctaccgttccaattctttctgtaa 15203935  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| || || || ||||| ||||    ||| ||||| | ||| ||||| || || ||    
T  15203936 tctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagtcacaaaagtgactctaaaaaacacatggtctccttc 15204035  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    ||||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15204036 ttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 15204107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 15624539 - 15624777
Alignment:
Q  52 acatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtca 151  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| || || ||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||| ||| |||||||||    
T  15624539 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtca 15624638  T
Q  152 acttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 251  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||||||||| || || || |||||||||||| | || ||  |||| ||    
T  15624639 atttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatc 15624738  T
Q  252 atggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  15624739 atgataactcttctatcgactctgcgacgctttcatctt 15624777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 8707661 - 8707860
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  8707661 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 8707760  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  8707761 cttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 8707860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23517007 - 23516784
Alignment:
Q  97 gccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaa 196  Q
    |||||||||||||  || ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  23517007 gccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtga 23516908  T
Q  197 ctcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttccct 296  Q
    |||| | ||| || || || || || ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || || |     
T  23516907 ctctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgccttcattttctctcg 23516808  T
Q  297 tatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     ||||||| |||||||| ||||||    
T  23516807 gatcatctgaactttctcagtagt 23516784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11237427 - 11237261
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  11237427 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 11237328  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||| || |||||    
T  11237327 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcat 11237261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15161271 - 15161105
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  15161271 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 15161172  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    |||| ||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  15161171 cttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 15161105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 17629 - 17329
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  17629 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 17530  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||| ||||| ||  || ||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  17529 tctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 17430  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
    ||||||||||||  |||| || ||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||| || ||    |||||||||||||||| |||||||    
T  17429 ttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 17330  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  17329 t 17329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Original strand, 14037746 - 14038062
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||     
T  14037746 acatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccacca 14037845  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||| ||  || || || |||||||| | |||||| ||  | || ||||||||| | || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |     
T  14037846 ttcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaa 14037945  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    |||||     
T  14037946 aaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatt 14038045  T
Q  304 ttaactttcttagtagt 320  Q
    |||||||||| ||||||    
T  14038046 ttaactttctcagtagt 14038062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Original strand, 14347776 - 14348092
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||     
T  14347776 acatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccacca 14347875  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||| ||  || || || |||||||| | |||||| ||  | || ||||||||| | || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |     
T  14347876 ttcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaa 14347975  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    |||||     
T  14347976 aaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatt 14348075  T
Q  304 ttaactttcttagtagt 320  Q
    |||||||||| ||||||    
T  14348076 ttaactttctcagtagt 14348092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 8198684 - 8198883
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  8198684 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 8198783  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| || |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  8198784 cttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 8198883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 10871051 - 10871250
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  10871051 atctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 10871150  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  10871151 cctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 10871250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 287
Target Start/End: Original strand, 13686123 - 13686286
Alignment:
Q  124 tgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || ||||    
T  13686123 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttctt 13686222  T
Q  224 gaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    | ||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  13686223 ggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcat 13686286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 14332453 - 14332652
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  14332453 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 14332552  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||| |||||  | ||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  14332553 cctgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 14332652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18551972 - 18551773
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  18551972 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 18551873  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  18551872 cttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 18551773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15479450 - 15479323
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| || || ||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  15479450 ataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacatgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgcca 15479351  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgata 128  Q
    | |||||||  ||||| || ||||||||    
T  15479350 cagttccaactctctcagagatctgata 15479323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 44791565 - 44791366
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  44791565 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 44791466  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| || |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  44791465 cttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 44791366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 18177798 - 18177997
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| || || ||||| ||||| |  || || || || || |    
T  18177798 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagttataggagtgactctcaagaacacgtggtctcctt 18177897  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || || |  ||||||| |||||||| ||||||    
T  18177898 cctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcgaatcatctaaactttctcagtagt 18177997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 290
Target Start/End: Original strand, 4440008 - 4440153
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| | ||| |||||||||||  | |||||||||| | |||| ||||    
T  4440008 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcc 4440107  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || ||||||||    
T  4440108 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 4440153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 26118893 - 26118803
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctat 94  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  26118893 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctat 26118803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 35965016 - 35964865
Alignment:
Q  169 gcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtt 268  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||||||  |||| || ||||| ||||| |||||||| |||     
T  35965016 gcacgtcatacactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 35964917  T
Q  269 gactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     ||||||||| || ||||||||||| || |||| |||||| |||| ||||||    
T  35964916 tactctgcgacgccttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagt 35964865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 11772372 - 11772222
Alignment:
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||| | ||||||| ||||    ||||||    
T  11772372 aaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcatc 11772273  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    ||||| |||| |||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||| ||||    
T  11772272 ttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttccggtcctaaaaccacactc 11772222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13968703 - 13968634
Alignment:
Q  278 aagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  13968703 aagctttcatcttttcccttatcaatctgactttctcagtagtctcatgaactaaatccggtcccaacac 13968634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 290
Target Start/End: Original strand, 14936427 - 14936572
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    |||||||||||||   | ||||||||||| || ||||| ||||   || | ||||| | ||| |||||||||||  | |||||||||| | |||||||||    
T  14936427 ggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcc 14936526  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  14936527 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 14936572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41318 - 41251
Alignment:
Q  163 ttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactc 230  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  41318 ttcaaagcacgtccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactc 41251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Original strand, 15364020 - 15364183
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    |||||||||||||   | ||||||||||| || ||||| ||||   || | ||||| | ||| |||||||||||  | |||||||||| | |||||||||    
T  15364020 ggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcc 15364119  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||   |||||||||||    
T  15364120 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 15364183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 308
Target Start/End: Original strand, 21661936 - 21662204
Alignment:
Q  37 tgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaa 136  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||  ||||||| ||||  ||||  || |  |||||||||||||| ||||    
T  21661936 tgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccacgttatacgcaaccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggccaa 21662035  T
Q  137 tgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggc 236  Q
    | ||| ||||||| |  ||| | ||||| |  || ||||| ||||| || |  || || ||||| | ||| ||||| || ||   ||||||||||||  |    
T  21662036 taaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggtaagaggggtgactctcaaaaacacatggtctcc---ttgaaactcaagatc 21662132  T
Q  237 ctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||| |||  |||||| || |||||||||||||| || |||| ||||||    
T  21662133 cttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacgctttcatcttttctctaatcaacttaac 21662204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 308
Target Start/End: Original strand, 7824043 - 7824143
Alignment:
Q  208 acatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaa 307  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||   ||||||||||    
T  7824043 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 7824142  T
Q  308 c 308  Q
    |    
T  7824143 c 7824143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27107901 - 27107801
Alignment:
Q  208 acatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaa 307  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||   ||||||||||    
T  27107901 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 27107802  T
Q  308 c 308  Q
    |    
T  27107801 c 27107801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 21674846 - 21674809
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatg 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21674846 acatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatg 21674809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 59
Target Start/End: Original strand, 45146513 - 45146550
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatg 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45146513 acatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatg 45146550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 51606506 - 51606166
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51606506 ataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgcca 51606407  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51606406 ccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactct 51606307  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||    
T  51606306 tataaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatc 51606207  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    ||||| ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  51606206 atcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcc 51606166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 16145859 - 16146205
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16145859 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 16145958  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16145959 cagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 16146058  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16146059 cagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatc 16146158  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    | ||| |||||||  ||||||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  16146159 accttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacac 16146205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1649599 - 1649249
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  1649599 acatgtgaaggatccgctacatacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacccaactctatatgccacag 1649500  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1649499 ttccaatcctctctgatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttag 1649400  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || || |||    
T  1649399 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgattatc 1649300  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  1649299 ttgactttcttcgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactc 1649249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 42702850 - 42703105
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42702850 ataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgcca 42702949  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42702950 ccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactct 42703049  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggt 256  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42703050 tataaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggt 42703105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Original strand, 33222868 - 33223218
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  33222868 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgccactg 33222967  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| || || ||    
T  33222968 ttccaactctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccctcag 33223067  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33223068 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaac 33223167  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  33223168 ttgactttctcagtagtttcatgaaccaagtctggtcccaacaccacactc 33223218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11207553 - 11207210
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  11207553 acatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactg 11207454  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  11207453 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcag 11207354  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  11207353 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaac 11207254  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11207253 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacac 11207210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3265116 - 3264773
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  3265116 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 3265017  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||    
T  3265016 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 3264917  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  3264916 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaac 3264817  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3264816 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacac 3264773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44662188 - 44661845
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  44662188 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 44662089  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||||| || ||||||||||  |||||||| || ||    
T  44662088 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccctcag 44661989  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  44661988 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaac 44661889  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44661888 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacac 44661845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 20890933 - 20891275
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | ||||| ||||| |    
T  20890933 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttggaaacccatc-ctatatgccactg 20891031  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| || || ||    
T  20891032 ttccaaccctctctgaaatctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 20891131  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20891132 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaac 20891231  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  20891232 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaaattcggtcccaacac 20891275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29453859 - 29453522
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  29453859 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 29453760  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||    
T  29453759 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 29453660  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  29453659 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaac 29453560  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  29453559 cttactttctcagtagtctcatgaaccaaatcccgtcc 29453522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 15245871 - 15246217
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |  || ||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |  ||||| || ||||    
T  15245871 ataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacgcactctgtatgcca 15245970  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15245971 ctgttccaaccctctctgttatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggggtaactct 15246070  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15246071 cagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 15246170  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  15246171 atctttaccttcttcgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 15246217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15003689 - 15003341
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  15003689 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 15003590  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  ||||| || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15003589 ctgttccaactctctcagatatctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactct 15003490  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15003489 caaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 15003390  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacacca 349  Q
    ||||| |||||||  ||||||| |||||| || || ||||| |||||||    
T  15003389 atcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacacca 15003341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 103 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15359313 - 15359069
Alignment:
Q  103 gttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctta 202  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  15359313 gttccaaccctctctgatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcg 15359214  T
Q  203 gaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcat 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15359213 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcat 15359114  T
Q  303 cttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||| || ||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  15359113 ctttaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 15359069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 126 - 332
Target Start/End: Original strand, 16752665 - 16752871
Alignment:
Q  126 atacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  16752665 atacggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctga 16752764  T
Q  226 aactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcat 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || | ||    
T  16752765 aactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtttgat 16752864  T
Q  326 gaaccaa 332  Q
    |||||||    
T  16752865 gaaccaa 16752871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 15070363 - 15070706
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || || || ||||| |    
T  15070363 acatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaccctgtatgccactg 15070462  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  |||||  | ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| |  | |||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  15070463 ttccaactctctcaaatatctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactctcag 15070562  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15070563 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 15070662  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    || || ||||  ||||||| |||||| || || ||||| |||||    
T  15070663 ttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacac 15070706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 347
Target Start/End: Original strand, 27900459 - 27900679
Alignment:
Q  127 tacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaa 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27900459 tacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaa 27900558  T
Q  227 actcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatg 326  Q
    |||||||| | || || ||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  27900559 actcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatg 27900658  T
Q  327 aaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    |||||| |||||||| |||||    
T  27900659 aaccaaatccggtcccaacac 27900679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14851410 - 14851119
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||| || ||  | |    
T  14851410 acatacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcctata 14851311  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | |||||||||||| || ||    
T  14851310 tctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttc 14851211  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttct 313  Q
    |||||||||||||   || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||| ||||    
T  14851210 ttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcatcttaaccttct 14851119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 12523644 - 12523942
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  12523644 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 12523743  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  12523744 tctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 12523843  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||||||||||||  | || || || || ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    |||||||||||||||| ||||||    
T  12523844 ttgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 12523942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 14652276 - 14652574
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||  ||||||||||  ||||| || || ||||| |||||  | || |||| |||||||||||||||||| || ||||| |    
T  14652276 acatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgata 14652375  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | |||||| ||||| || ||    
T  14652376 tctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttc 14652475  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  14652476 ttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 14652574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15150050 - 15149750
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| ||||| |||||||||||  || || || |    
T  15150050 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccgata 15149951  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  || ||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  15149950 tctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 15149851  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||    
T  15149850 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtc 15149751  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  15149750 t 15149750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 14159490 - 14159728
Alignment:
Q  52 acatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtca 151  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  14159490 acatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggggtca 14159589  T
Q  152 acttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 251  Q
    ||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||  ||||||| |||||  | ||||| ||||| ||    
T  14159590 acttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcatgggagtaactctcaggaacacatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgcttatc 14159689  T
Q  252 atggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  14159690 atgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatctt 14159728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 23955814 - 23956013
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  23955814 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 23955913  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  23955914 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 23956013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16252459 - 16252189
Alignment:
Q  52 acatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtca 151  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  16252459 acatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtca 16252360  T
Q  152 acttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 251  Q
    ||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || || || ||||||||||||||  |||| || ||||| ||    
T  16252359 acttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatc 16252260  T
Q  252 atggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| || || ||    ||||||||||| |||| ||||||||    
T  16252259 atgataactcttttgtcgactctgcgacgcttttattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 16252189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164333
Alignment:
Q  41 acacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaa 140  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  141 cttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacc 182  Q
    ||| ||||||| |||| | || ||||| |||| |||||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcacatcctacacc 18164333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Original strand, 7090383 - 7090698
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  ||||||||||    
T  7090383 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccg 7090482  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  || || || |||||||||| | |||| ||  |||||||||||||| | || |||||||| | ||| ||||| ||||  ||||| ||||| |     
T  7090483 ttccaactctttccgatatctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 7090581  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| ||    ||||||    
T  7090582 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactcttcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 7090681  T
Q  304 ttaactttcttagtagt 320  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  7090682 ttaaccttctcagtagt 7090698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 88 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19778771 - 19778539
Alignment:
Q  88 actctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 187  Q
    |||| ||| |||||||||||||  || ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||    
T  19778771 actcgataagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtca 19778672  T
Q  188 tcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    | ||||| ||||| | ||| || || || || ||||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  19778671 taggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 19778572  T
Q  288 cttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  19778571 tttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 19778539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 18297272 - 18297471
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  18297272 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 18297371  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  18297372 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 18297471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 29039349 - 29039150
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  29039349 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 29039250  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  29039249 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 29039150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Original strand, 12476667 - 12476833
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  12476667 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 12476766  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    |||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  12476767 cttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 12476833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Original strand, 14680535 - 14680835
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  14680535 acatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 14680634  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||  | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || |  ||    
T  14680635 tctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcgttc 14680734  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
     |||||||||||  |||| || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||  ||||||| || ||    |||||||||||||||| |||||||    
T  14680735 ctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 14680834  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  14680835 t 14680835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16355489 - 16355189
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  16355489 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaagtctttccgata 16355390  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || |  || ||    
T  16355389 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttc 16355290  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
    |||||| |||||  | || || ||||| ||||| ||| | || ||| |||||||||| |||||||| || ||    |||||||||||||||| |||||||    
T  16355289 ttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 16355190  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  16355189 t 16355189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 8386479 - 8386678
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  8386479 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 8386578  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  8386579 cctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 8386678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 27711403 - 27711602
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  27711403 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 27711502  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  27711503 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 27711602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14303922 - 14303757
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  14303922 atctgatacggaccaatgaacttcgg-gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 14303824  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||| || |||||    
T  14303823 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcat 14303757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Original strand, 40473107 - 40473273
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || || || |    
T  40473107 atctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctcctt 40473206  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||    
T  40473207 cctgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctacgacgctttcat 40473273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8053568 - 8053369
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  8053568 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 8053469  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||| |||||  |  |||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  8053468 cctgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 8053369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18227424 - 18227190
Alignment:
Q  88 actctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 187  Q
    |||| ||||||||| |||||||  || || || ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  18227424 actcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtca 18227325  T
Q  188 tcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
      ||||| ||||| | ||| || || || || || |||||||||||   ||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  18227324 caggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 18227225  T
Q  288 cttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
     || ||    |||||||||||||||||||||||||    
T  18227224 tttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtct 18227190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14266844 - 14266645
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||| || || ||||| | ||| |  || || || |    
T  14266844 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagtcataggggtgactctcaaaaacatgtggtctcctt 14266745  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || || |  ||||||| ||| |||| ||||||    
T  14266744 cctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctcagatcatctgaaccttctcagtagt 14266645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Original strand, 15077825 - 15077928
Alignment:
Q  244 cgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtccta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||| |||||| || || ||||| |    
T  15077825 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtccca 15077924  T
Q  344 acac 347  Q
    ||||    
T  15077925 acac 15077928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 200
Target Start/End: Original strand, 15364453 - 15364532
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15364453 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactct 15364532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15415304 - 15415209
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatac 96  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||    
T  15415304 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtggcaaacccactctatac 15415209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 15319530 - 15319638
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||  |||||||||||||||  || || ||||||| |||||| || ||||| || ||||    
T  15319530 ataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgtgacacaggaaacacatcatgcagatttgaaagatgtgctggcaaacccactctgtatgcca 15319629  T
Q  101 ccgttccaa 109  Q
    | |||||||    
T  15319630 ctgttccaa 15319638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15415194 - 15415051
Alignment:
Q  158 tcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggta 257  Q
    |||||||||| ||||| || |||||  |||   |||| ||||| | ||| ||||| || || |||||||| |||||| | || || ||||| ||||| ||    
T  15415194 tcgatttcaaggcacgaccaacacctatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcatgata 15415095  T
Q  258 actcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatca 301  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15415094 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcccttatca 15415051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1640287 - 1640171
Alignment:
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||  |||| ||||| |||||||| |||  ||||||||| || |||||||||||    ||||||    
T  1640287 aaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatcttttcttgaatcatc 1640188  T
Q  304 ttaactttcttagtagt 320  Q
    |||||||||| ||||||    
T  1640187 ttaactttctcagtagt 1640171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14927303 - 14927151
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| |||||||  || || || |    
T  14927303 acatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtacgccactgttccaactctttccgata 14927204  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgt 174  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||| ||| | || ||||| ||||||    
T  14927203 tctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaatgcacgt 14927151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 311
Target Start/End: Original strand, 8706060 - 8706175
Alignment:
Q  196 actcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttccc 295  Q
    ||||||||||| |||| ||| || || | ||| |||||| | || || |||||||| || |||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |    
T  8706060 actcttagaaacacataatctccttccttaaattcaaggtctttcctacgcttgtcgtgataactcttgtgtcgattctgcgacgctttcatcttttctc 8706159  T
Q  296 ttatcatcttaacttt 311  Q
    |||| | |||||||||    
T  8706160 ttattagcttaacttt 8706175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 55375476 - 55375394
Alignment:
Q  208 acatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  55375476 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 55375394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15359382 - 15359326
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatca 57  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||    
T  15359382 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatca 15359326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16445393 - 16445230
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| | || || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||| ||||    
T  16445393 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 16445294  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||   |||||||||||    
T  16445293 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 16445230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16676546 - 16676447
Alignment:
Q  223 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||  ||||||| || ||    |||||||||||||||| ||||||||    
T  16676546 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttaaatcatcttaactttctcagtagtct 16676447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 290
Target Start/End: Original strand, 13247795 - 13247881
Alignment:
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||   | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || ||||||||    
T  13247795 aaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 13247881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 12132713 - 12132676
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatg 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12132713 acatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatg 12132676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 293
Target Start/End: Original strand, 14997470 - 14997555
Alignment:
Q  208 acatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| | ||||||||||  |||||| || || |||||||||||    
T  14997470 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatgactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttc 14997555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 308
Target Start/End: Original strand, 9290985 - 9291089
Alignment:
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    |||||| ||||||||  | ||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||   ||||||    
T  9290985 aaatacctgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatc 9291084  T
Q  304 ttaac 308  Q
    |||||    
T  9291085 ttaac 9291089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 260286 - 260626
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  260286 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaacaaactctatatgcca 260385  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  260386 ccgttctaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 260485  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  260486 caaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatc 260585  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    ||||| || |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  260586 atcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcc 260626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 165016 - 164718
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||  ||||||||||  ||||| || || ||||| |||||  | || |||| |||||||||||||||||| || ||||| |    
T  165016 acatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgata 164917  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | |||||| ||||| || ||    
T  164916 tctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttc 164817  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  164816 ttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 164718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 279137 - 278837
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  279137 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 279038  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||||||||||| | || ||||||||  |||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  279037 tctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 278938  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    |||||||||||||||| |||||||    
T  278937 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 278838  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  278837 t 278837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Original strand, 308757 - 308923
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  308757 atctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 308856  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  308857 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 308923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31571610 - 31571270
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31571610 ataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgcca 31571511  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31571510 ccgttcctattctctctgaaatctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactct 31571411  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||    
T  31571410 cagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatc 31571311  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    ||||| ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31571310 atcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcc 31571270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 1266252 - 1266597
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1266252 ataacatgcgaaggatccgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 1266351  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1266352 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 1266451  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1266452 cagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatc 1266551  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| || |||| ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  1266552 atctt-accttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 1266597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22062201 - 22061855
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22062201 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 22062102  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  22062101 cagttccaaccctctctgatatttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccct 22062002  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || |||    
T  22062001 cagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttttctgatc 22061902  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22061901 atcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacac 22061855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31417242 - 31416896
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  31417242 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgcca 31417143  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31417142 ctgttccaaccctttctgaaatctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactct 31417043  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31417042 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcaccttttcccttatc 31416943  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| || || |||||||| |||||    
T  31416942 atcttgactttctcagtagtctgatgcactaaatccggtcccaacac 31416896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21325178 - 21324829
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggata-gatgtggtggcaagccaactctatacgcc 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  21325178 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaaccaactctatatgcc 21325079  T
Q  100 accgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactc 199  Q
    || ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21325078 actgttccaaccctctatgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccc 21324979  T
Q  200 ttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttat 299  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  21324978 tcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgttttcatcttttctcttat 21324879  T
Q  300 catcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacacca 349  Q
    |||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  21324878 catcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacca 21324829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 12304774 - 12305117
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  12304774 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 12304873  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| || || ||    
T  12304874 tttcaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctaag 12304973  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12304974 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaac 12305073  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12305074 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacac 12305117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29304191 - 29303848
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  29304191 acatgtgaaggatcctctacatacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactg 29304092  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||    
T  29304091 ttccaattctctctgaaatctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccctcag 29303992  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29303991 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatt 29303892  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  29303891 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacac 29303848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 804438 - 804095
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  804438 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 804339  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||    
T  804338 taccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 804239  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  804238 aaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaac 804139  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  804138 ctgactttcttagtagtctcgtgaaccaaatccggtcccaacac 804095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 23654940 - 23655286
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || | | ||||  |||    
T  23654940 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaatatatatacca 23655039  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23655040 ctgttcaaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 23655139  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23655140 cagaaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 23655239  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| || ||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  23655240 atcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 23655286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 6603674 - 6604017
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  6603674 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 6603773  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||    
T  6603774 taccaattctctctgaaatttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 6603873  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  6603874 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaac 6603973  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6603974 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacac 6604017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 6679127 - 6679470
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  6679127 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 6679226  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||| || || ||    
T  6679227 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 6679326  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  6679327 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaac 6679426  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6679427 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacac 6679470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21682238 - 21681892
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||| |  || ||||| ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  21682238 ataacatgcgaaggatccgtttcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 21682139  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21682138 ctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 21682039  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  21682038 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatc 21681939  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  21681938 atcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacac 21681892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 14565158 - 14565501
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  14565158 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 14565257  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||    
T  14565258 taccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 14565357  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14565358 aaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaac 14565457  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  14565458 ctgactttctcagtagtctcgtgaaccaaatccggtcccaacac 14565501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 20007863 - 20008211
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  20007863 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgcca 20007962  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20007963 ctgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 20008062  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20008063 cagaaacacatgatctccctcttggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactatgcgacgctttcatcttttctcttatc 20008162  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacacca 349  Q
    ||||| || ||||  ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||    
T  20008163 atctttaccttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacacca 20008211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20010668 - 20010365
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  20010668 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 20010569  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  20010568 ctgttccaaccctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactct 20010469  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20010468 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 20010369  T
Q  301 atct 304  Q
    ||||    
T  20010368 atct 20010365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16265383 - 16265127
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  16265383 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 16265284  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||| || || ||    
T  16265283 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 16265184  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaact 260  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  16265183 aaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 21840430 - 21840778
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| || ||||    
T  21840430 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgcca 21840529  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||  |||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  21840530 ctgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgttataggagtaactct 21840629  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  21840630 tagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgcttttatcttttctcttatc 21840729  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacacca 349  Q
    ||||| || ||||  ||||||| |||||| || || ||||| |||||||    
T  21840730 atcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacacca 21840778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 19851424 - 19851772
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  || ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| | || ||||    
T  19851424 ataacatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgcca 19851523  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||| |||||| |||||| |||||    
T  19851524 ctgttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactct 19851623  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  19851624 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatc 19851723  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacacca 349  Q
    ||||| || ||||  ||||||| |||||| || || ||||| |||||||    
T  19851724 atcttgaccttctatgtagtctaatgaactaaatctggtcccaacacca 19851772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 19857460 - 19857808
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  || ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| | || ||||    
T  19857460 ataacatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgcca 19857559  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||| |||||| |||||| |||||    
T  19857560 ctgttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactct 19857659  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  19857660 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatc 19857759  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacacca 349  Q
    ||||| || ||||  ||||||| |||||| || || ||||| |||||||    
T  19857760 atcttgaccttctatgtagtctaatgaactaaatctggtcccaacacca 19857808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 133 - 347
Target Start/End: Original strand, 22051008 - 22051222
Alignment:
Q  133 ccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaa 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22051008 ccaatgaacttcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaa 22051107  T
Q  233 gggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaa 332  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||  ||||||||    
T  22051108 gggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctctgtcgtctgttgaaccaa 22051207  T
Q  333 gtccggtcctaacac 347  Q
     || ||||| |||||    
T  22051208 atctggtcccaacac 22051222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Original strand, 28982373 - 28982635
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||| || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  28982373 acatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 28982472  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| || || ||    
T  28982473 taccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcag 28982572  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctg 266  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28982573 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctg 28982635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Original strand, 28987593 - 28987855
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||| || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  28987593 acatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 28987692  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| || || ||    
T  28987693 taccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcag 28987792  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctg 266  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28987793 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctg 28987855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Original strand, 27347242 - 27347425
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |    
T  27347242 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactttatatgccactg 27347341  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 187  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27347342 tcccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtca 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 20388112 - 20388412
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| | ||||||||||||||  || || |||||||||||||| || |||||||| | ||    
T  20388112 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtca 20388211  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | || ||||  ||||| || |||| ||| |||||||| |||   || ||||||||| | || ||||||||||| || ||||| ||||   |||| |||||    
T  20388212 ctgtcccaactctctcagatatctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactct 20388311  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||||    
T  20388312 cagaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttctctcttatc 20388411  T
Q  301 a 301  Q
    |    
T  20388412 a 20388412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 322
Target Start/End: Original strand, 19977983 - 19978301
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||||| || || ||||  ||||||||||    
T  19977983 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgttacgccaccg 19978082  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||   | || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |     
T  19978083 ttccaactatttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 19978182  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||    
T  19978183 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 19978282  T
Q  304 ttaactttcttagtagtct 322  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  19978283 ttaactttctcagtagtct 19978301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Original strand, 15533414 - 15533714
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  15533414 acatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 15533513  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| | ||  ||||| ||||| | ||| |  || ||||| ||    
T  15533514 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttc 15533613  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||||| |||||||    
T  15533614 ttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcattttaactttctcagtagtc 15533713  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  15533714 t 15533714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21167266 - 21167016
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||  || || || ||||||||||||||||| |    
T  21167266 gacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacccaactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataa 21167167  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    |  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||||||||||||||  | ||    
T  21167166 atctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 21167067  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  21167066 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 21167016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 289
Target Start/End: Original strand, 21250958 - 21251243
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||    
T  21250958 acatgggatggatctggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 21251057  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  || || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |     
T  21251058 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 21251157  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatct 289  Q
    ||| || || || || | ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||    
T  21251158 aaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcatct 21251243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 320
Target Start/End: Original strand, 23650100 - 23650373
Alignment:
Q  47 gaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcgg 146  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||  || |  || ||||||||||||||||| ||  ||||    
T  23650100 gaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgataagccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcgg 23650199  T
Q  147 agtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgc 246  Q
    |||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| | ||| |  || || || ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  23650200 agtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 23650299  T
Q  247 ttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  23650300 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgcttttatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 23650373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 290
Target Start/End: Original strand, 22987283 - 22987503
Alignment:
Q  70 agatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaag 169  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | || ||||| |    
T  22987283 agatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttatgatatctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatg 22987382  T
Q  170 cacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttg 269  Q
    || |||| ||| | ||||  ||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||| | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |    
T  22987383 catgtccaacatcagtcactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcg 22987482  T
Q  270 actctgcgaagctttcatctt 290  Q
    | ||||||| |||||||||||    
T  22987483 attctgcgacgctttcatctt 22987503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 30313891 - 30313591
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  30313891 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 30313792  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  30313791 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 30313692  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
     |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||  ||||||| || ||    |||||||||||||||| |||||||    
T  30313691 ctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 30313592  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  30313591 t 30313591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Original strand, 32600178 - 32600478
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || ||||| || ||||| || || ||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  32600178 acatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 32600277  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  32600278 tctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 32600377  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
     |||||||||||  |||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||||||| |||| |||||||    
T  32600378 ctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtc 32600477  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  32600478 t 32600478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17674671 - 17674472
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  17674671 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 17674572  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  17674571 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 17674472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 19112823 - 19113022
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  19112823 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 19112922  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  19112923 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 19113022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21922483 - 21922211
Alignment:
Q  21 tacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaa 120  Q
    |||||||||||| |  || ||||| |||||||| || ||||| || || | ||| ||||| || || ||||  ||||||||||||||||  || || ||     
T  21922483 tacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgat 21922384  T
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||| ||||   |||| ||||| | |||||| || || || |    
T  21922383 atctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtggtctcctt 21922284  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  21922283 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtggactctgcgacactttcatcttttc 21922211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20018398 - 20018199
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  20018398 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 20018299  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | | ||| |||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  20018298 cctcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 20018199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20396841 - 20396574
Alignment:
Q  53 catcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaa 152  Q
    |||||||||| || || ||||| ||| | || || |||| |||||||||  || |||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||  |  ||||||     
T  20396841 catcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgccactatttcaattctttctgatatctgatacagaccaataaatcttagagtcag 20396742  T
Q  153 cttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtca 252  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| | ||||||||| || || || |||||||||||| | ||||| ||||| |||    
T  20396741 tttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttttctacgcttatca 20396642  T
Q  253 tggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    || |||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||| |||||| |||| ||||||    
T  20396641 tgataacacttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcgcatcaacttaaccttctcagtagt 20396574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16408762 - 16408465
Alignment:
Q  52 acatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtca 151  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  16408762 acatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtca 16408663  T
Q  152 acttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 251  Q
    ||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| |  ||||| || || || ||||| |||| |||  | || || ||||| ||    
T  16408662 acttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttggaacttaagatctttcctgcgcttatc 16408563  T
Q  252 atggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacacca 349  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||  ||||||| || ||    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||    
T  16408562 atgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctccggtcctaagacca 16408465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 255 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16271738 - 16271646
Alignment:
Q  255 gtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16271738 gtaactcctctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgaccttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacac 16271646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19485520 - 19485326
Alignment:
Q  119 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcacc 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || ||    
T  19485520 aaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 19485421  T
Q  219 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttct 313  Q
     || | ||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || || |  ||||||| ||||||||    
T  19485420 ttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttct 19485326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 253
Target Start/End: Original strand, 23948941 - 23949154
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || || ||||  ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||  |    
T  23948941 gacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgctacgccaccgtactaattctttctgatatctgatacggaccaacaa 23949040  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||| ||||  ||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||    
T  23949041 acctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctt 23949140  T
Q  240 tctccgcttgtcat 253  Q
     || ||||| ||||    
T  23949141 cctacgcttatcat 23949154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Original strand, 22046407 - 22046707
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  22046407 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 22046506  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  22046507 tctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 22046606  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
     | |||||||||  |||| || || || ||||| |||||||| ||| |||| |||||  ||||||| || ||    |||||||||||||||| |||||||    
T  22046607 ctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgactatgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 22046706  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  22046707 t 22046707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22120822 - 22120656
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || || || |    
T  22120822 atctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctcctt 22120723  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||| || |||||    
T  22120722 cctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcat 22120656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22133788 - 22133490
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |  || |||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  22133788 acatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattccgactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 22133689  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||   ||||  |||| | ||| |||   || || ||    
T  22133688 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttc 22133589  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     |||||||||||  | || || | ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    |||||||||||||||| ||||||    
T  22133588 ctgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 22133490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22164938 - 22164640
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||| || ||||||||||||||  || || || |    
T  22164938 acatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatgcgccaccgttccaactctttccgata 22164839  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||   |||| ||| | | ||| |||   || || ||    
T  22164838 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttc 22164739  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    |||||||||||||||| ||||||    
T  22164738 ctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 22164640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20652957 - 20652756
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||   || | ||||| | |||||||||||||||  |||||||||| |   |||||||||    
T  20652957 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcc 20652858  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaa 344  Q
     ||| | ||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||||| ||    ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||  |||||||||||    
T  20652857 tcttataatgataactcttctgtccactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttctccgtagtctcttgcaccacctccggtcctaa 20652758  T
Q  345 ca 346  Q
    ||    
T  20652757 ca 20652756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21394587 - 21394344
Alignment:
Q  47 gaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcgg 146  Q
    |||||||||| ||||| ||  | ||||| ||||| || || ||||  |||||||||||| | |  || || || ||||||||||||||||| ||  ||||    
T  21394587 gaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgg 21394488  T
Q  147 agtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgc 246  Q
    |||||||||| | || ||||||| |||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||||| ||||||||  | ||  | |||    
T  21394487 agtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgc 21394388  T
Q  247 ttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    || ||||| |||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  21394387 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatctt 21394344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21789080 - 21788837
Alignment:
Q  47 gaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcgg 146  Q
    |||||||||| ||||| ||  | ||||| ||||| || || ||||  |||||||||||| | |  || || || ||||||||||||||||| ||  ||||    
T  21789080 gaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgg 21788981  T
Q  147 agtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgc 246  Q
    |||||||||| | || ||||||| |||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||||| ||||||||  | ||  | |||    
T  21788980 agtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgc 21788881  T
Q  247 ttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    || ||||| |||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  21788880 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatctt 21788837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22378079 - 22377929
Alignment:
Q  143 tcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttct 242  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| || || | ||||||||||||  | || ||||||||||   | || ||    
T  22378079 tcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcct 22377980  T
Q  243 ccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22377979 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 22377929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22384254 - 22384104
Alignment:
Q  143 tcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttct 242  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| || || | ||||||||||||  | || ||||||||||   | || ||    
T  22384254 tcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcct 22384155  T
Q  243 ccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22384154 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 22384104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 320
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949252
Alignment:
Q  226 aactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctcagtagt 23949252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 182
Target Start/End: Original strand, 15441245 - 15441375
Alignment:
Q  52 acatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtca 151  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  15441245 acatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcaaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtca 15441344  T
Q  152 acttcctcgatttcaaagcacgtcctacacc 182  Q
    ||||| | || ||||| |||||||| |||||    
T  15441345 acttctttgacttcaaggcacgtccaacacc 15441375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 287
Target Start/End: Original strand, 22032114 - 22032331
Alignment:
Q  70 agatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaag 169  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||||||| |||| |||  || || || |||||||||  |||||| ||  |||||||||| ||| | || |||||||    
T  22032114 agatgcggtggtaatcctactcgatacgccaacgtttcaactctttccgatatctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaag 22032213  T
Q  170 cacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttg 269  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || || | |||||||||  |||| || || || ||||| |||||||| ||| |    
T  22032214 cacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcg 22032313  T
Q  270 actctgcgaagctttcat 287  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  22032314 actctgcgacgctttcat 22032331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Original strand, 22315348 - 22315511
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    |||||||||||||   | ||||||||||| |||||||| || |  ||| | ||||| | ||| |||||||||||  | |||||||||| | |||| ||||    
T  22315348 ggagtcaacttccgacacttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcc 22315447  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||   |||||||||||    
T  22315448 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 22315511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 230
Target Start/End: Original strand, 19863232 - 19863299
Alignment:
Q  163 ttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactc 230  Q
    ||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  19863232 ttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactc 19863299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 230
Target Start/End: Original strand, 19867869 - 19867936
Alignment:
Q  163 ttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactc 230  Q
    ||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  19867869 ttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactc 19867936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 248591 - 248944
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  248591 ataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 248690  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    |  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  248691 cttttccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccct 248790  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  248791 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatc 248890  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  248891 atcttgactttcttagtagtctcatgaaccaagttcggtcccaacaccacactc 248944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 58144 - 57799
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  58144 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 58045  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58044 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 57945  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  57944 caaaaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact-ttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcccttatc 57846  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| ||  ||| ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  57845 atcttgaccctctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 57799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 49361 - 49021
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||| ||| || || || |||||||||||||| || ||| | || |||     
T  49361 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccg 49262  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||| ||||| || || |||||    
T  49261 ctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgtcataggtgttactct 49162  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49161 cagaaacacatgatttccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatc 49062  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    ||||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  49061 atcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccagtcc 49021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13109 - 12766
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13109 ataacatgcgaaggatccactacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgcca 13010  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13009 ccgttccaatcctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactct 12910  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12909 caaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactctacgacgctttcatcttttcccttatc 12810  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaa 344  Q
    ||||| || |||| ||| |||| ||||||||| || ||||||||    
T  12809 atcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatctggtcctaa 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14229 - 13883
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14229 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacccaactctatatgcca 14130  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14129 ctgttccaatcctttctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 14030  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
    || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14029 taaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatc 13930  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  13929 atcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 13883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 58 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 4935
Alignment:
Q  58 tgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcc 157  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  158 tcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggta 257  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  258 actcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  5024 actcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctaatgaaccaaatccggtcccaacac 4935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 42761 - 43114
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42761 ataacatgtgaaggatccgctagatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 42860  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  42861 ctgttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccct 42960  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42961 aagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatc 43060  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43061 atcttgactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacaccacactc 43114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21999 - 21653
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21999 ataacatccgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 21900  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21899 ctgttccaaccctctccgatatcttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccct 21800  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21799 cagaaatacatggttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatc 21700  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21699 atcttgactttctcagtagtctgatgaaccaagtccggtcccaacac 21653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 308
Target Start/End: Original strand, 25991 - 26091
Alignment:
Q  208 acatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaa 307  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||| || || || |||||||| |||   ||||||||||    
T  25991 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactatgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 26090  T
Q  308 c 308  Q
    |    
T  26091 c 26091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 20100 - 20453
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20100 ataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggcca 20199  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    |  ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||    
T  20200 caattccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccct 20299  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  20300 cagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatc 20399  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  20400 atcttgacttttttcgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactc 20453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 43483 - 43836
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  43483 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggcca 43582  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  43583 cagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccct 43682  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| || |||    
T  43683 cagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatc 43782  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||    
T  43783 atcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaatccgttcccaacaccacactc 43836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 44495 - 44848
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  44495 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggcca 44594  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  44595 cagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccct 44694  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| || |||    
T  44695 cagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatc 44794  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||    
T  44795 atcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaatccgttcccaacaccacactc 44848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 36035 - 36221
Alignment:
Q  3 aacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccacc 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  36035 aacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccaca 36134  T
Q  103 gttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatc 189  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36135 attccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcatc 36221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 26242 - 26585
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |    
T  26242 acatgcgaaagatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccagctctataagccactg 26341  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||    
T  26342 ttcccaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 26441  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26442 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaac 26541  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  26542 ctaactttctcagtagtctcatgaaccaaatctggtcccaacac 26585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 49535 - 49182
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| || || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  49535 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggcca 49436  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | || ||    
T  49435 cagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccct 49336  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  49335 cagaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatc 49236  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||    
T  49235 atcttgactttttctgtagtctcatgaaccaaatctggtcccaacaccacactc 49182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13689 - 13343
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13689 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 13590  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13589 ctgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 13490  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  13489 tagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatc 13390  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  13389 atcttgactttctctgtagtctgatgaatcaattccggtcccaacac 13343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17459 - 17113
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17459 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 17360  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17359 ctgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccct 17260  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  17259 aagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatc 17160  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  17159 atcttgactttctctgtagtctgatgaatcaattccggtcccaacac 17113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 19961 - 20301
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  19961 ataacatgcaaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 20060  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20061 ctgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 20160  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20161 cagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgggacgctttcatcttttcccttatc 20260  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    ||||| | |||||   |||||| ||||||||| ||||||||    
T  20261 atcttgagtttctctatagtctgatgaaccaaatccggtcc 20301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 322682 - 323028
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  322682 ataacatgcgaaggatccactacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 322781  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
      ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  322782 ttgttccaaccctctctgatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 322881  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  322882 cagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatc 322981  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||| || |||||    
T  322982 atcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggacccaacac 323028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 117546 - 117892
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  117546 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 117645  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||    
T  117646 ctgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtcataggagtaaccct 117745  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||| || || |||    
T  117746 cagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtgacgctttcatcttctctctgatc 117845  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||| | ||||||||| |||||||| |||||    
T  117846 atcttgactttctccgtagtatgatgaaccaaatccggtcccaacac 117892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 385800 - 386143
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||| |    
T  385800 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 385899  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  ||||| || ||||| || | ||| || |||||||||||||||||| |  | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| ||    
T  385900 ttccaactctctcagatatctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactctcag 385999  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  386000 aaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 386099  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| ||||  ||||||| |||||| || || ||||| |||||    
T  386100 ttaaccttctccgtagtctaatgaactaaatctggtcccaacac 386143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 293
Target Start/End: Original strand, 112038 - 112291
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  112038 gacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataa 112137  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    || | |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||||||||| || || || |||||||||||| ||||    
T  112138 acctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcctt 112237  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
      | ||||| ||||| || ||||| ||| ||||||| || ||| ||||||||||    
T  112238 cttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgctatcatcttttc 112291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 203793 - 203489
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    |||||||| |||||   |||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  203793 acatgcgatggatccaatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 203694  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  || |  || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| | |  ||||||||||| ||  |||| ||||   |||| ||||||||    
T  203693 ttccaactcttttagatatctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgtcacaagagtgactcttag 203594  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| ||||| || || |||||||| |||||| | || || ||||| || || ||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |    
T  203593 aaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttattagc 203494  T
Q  304 ttaac 308  Q
    |||||    
T  203493 ttaac 203489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20075453 - 20075128
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |    
T  20075453 acatgcgaaggatctgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 20075354  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||    
T  20075353 ttcccactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacccttag 20075254  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20075253 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactttgcgaagctttcatcttttcccttatcaac 20075154  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaac 329  Q
     | ||||||| |||||||||||||||    
T  20075153 ctgactttctcagtagtctcatgaac 20075128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19665273 - 19664927
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19665273 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 19665174  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19665173 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactct 19665074  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  19665073 cagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatc 19664974  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||| |||||    
T  19664973 atcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgatcccaacac 19664927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 19854276 - 19854622
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19854276 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaaccaactctatatgcca 19854375  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  19854376 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactct 19854475  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || |||    
T  19854476 cagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttctctctgatc 19854575  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  19854576 atcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 19854622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22433513 - 22433159
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22433513 ataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggcca 22433414  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  22433413 cagttgcaaccctctctgaaatctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccct 22433314  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  22433313 caggaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatc 22433214  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactcg 355  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||    
T  22433213 atcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaattcggtcccaacaccacactcg 22433159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 20294377 - 20294720
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  20294377 acatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 20294476  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||    
T  20294477 taccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 20294576  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20294577 aaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatt 20294676  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20294677 ctgaccttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacac 20294720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20940460 - 20940114
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20940460 ataacgtgcgaaagatacgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20940361  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20940360 ctgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 20940261  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  20940260 cagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatc 20940161  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||   |||| | ||||||||| |||||||| |||||    
T  20940160 atcttgactttctctatagtttgatgaaccaaatccggtcccaacac 20940114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 37677044 - 37677388
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  37677044 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactg 37677143  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct-ta 202  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||  |    
T  37677144 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcaa 37677243  T
Q  203 gaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcat 302  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37677244 gaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaa 37677343  T
Q  303 cttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37677344 cctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacac 37677388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 20244162 - 20244437
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  20244162 ataacatgcgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggcca 20244261  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  20244262 ctgttccaaccctctctgaaatctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccct 20244361  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgc 276  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20244362 cagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20244437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31550575 - 31550232
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  31550575 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactg 31550476  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||    
T  31550475 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 31550376  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  31550375 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgaagctttcatcttttctcttatcaac 31550276  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | |||||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  31550275 ctgactttctccgtagtctcatgaactaaatccggtcccaacac 31550232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20857158 - 20856827
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20857158 ataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgcca 20857059  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  20857058 cagttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccct 20856959  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| ||||| ||||| || |||||| ||||| |||| || |||||||| || || ||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||||| |||    
T  20856958 cagaaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctccctaatc 20856859  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaa 332  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  20856858 atcttgactttctccgtagtttcatgaaccaa 20856827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20836241 - 20835945
Alignment:
Q  48 aaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcgga 147  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20836241 aaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttgga 20836142  T
Q  148 gtcaacttcctc---gatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||| ||   || || || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||| |  |    
T  20836141 gtcaacttcttcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaac 20836042  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| || |||||    
T  20836041 gcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcc 20835945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 112 - 347
Target Start/End: Original strand, 11382667 - 11382902
Alignment:
Q  112 ctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||    
T  11382667 ctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacat 11382766  T
Q  212 gatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaacttt 311  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||||    
T  11382767 gatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaatctgacttt 11382866  T
Q  312 cttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  11382867 ctcagtagtctcatgtaccaaatccggtcccaacac 11382902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 349
Target Start/End: Original strand, 41307891 - 41308135
Alignment:
Q  105 tccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaga 204  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| || |||    
T  41307891 tccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcaga 41307990  T
Q  205 aatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatct 304  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |    
T  41307991 aacacatggtctccctcttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattattt 41308090  T
Q  305 taactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacacca 349  Q
    | |||||||  ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  41308091 tgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccagtcccaacacca 41308135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20395387 - 20395173
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  20395387 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacta 20395288  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||| || || ||    
T  20395287 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctaag 20395188  T
Q  204 aaatacatgatcacc 218  Q
    ||| |||||||||||    
T  20395187 aaaaacatgatcacc 20395173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 20249833 - 20250131
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||| || || ||||  ||||||||||||||||  || ||||| |    
T  20249833 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 20249932  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| || || || ||    
T  20249933 tcttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 20250032  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||    
T  20250033 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagt 20250131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 50620602 - 50620350
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||||| || || |||| ||| |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  50620602 gacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataa 50620503  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    || |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||    
T  50620502 acctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtcttt 50620403  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctttt 292  Q
     || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||    
T  50620402 cctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatctttt 50620350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 320
Target Start/End: Original strand, 19106413 - 19106648
Alignment:
Q  85 ccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccg 184  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  || || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| |    
T  19106413 ccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccag 19106512  T
Q  185 tcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagcttt 284  Q
    |||| ||||| ||||| | ||| || || || || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  19106513 tcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttt 19106612  T
Q  285 catcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||| || ||    |||||||||||||||| ||||||    
T  19106613 cattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 19106648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 17045391 - 17045091
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  17045391 acatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 17045292  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| ||||| || || ||    
T  17045291 tctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 17045192  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
     |||||||||||  |||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    |||||||||||||||| |||||||    
T  17045191 ctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 17045092  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  17045091 t 17045091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Original strand, 16369280 - 16369551
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |  ||||||||||||||||  || ||||| |    
T  16369280 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttccaactctttctgata 16369379  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||| | || ||||| |||||||| ||||  ||||  ||||| ||||| | |||||||||||| || ||    
T  16369380 tctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttc 16369479  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    ||| || |||||| | || || ||||| ||||| |||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  16369480 ttggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttc 16369551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 33391306 - 33391107
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  33391306 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 33391207  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  33391206 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 33391107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16350876 - 16350677
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  16350876 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 16350777  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  16350776 cttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 16350677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19761218 - 19760971
Alignment:
Q  46 tgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcg 145  Q
    ||||||| ||||||||| || || || || ||||| || || |||| |||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||  |||    
T  19761218 tgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcggatatctgatacggtccaataaatctcg 19761119  T
Q  146 gagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccg 245  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||  |||   |||| ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||||||| | || || ||    
T  19761118 gagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacg 19761019  T
Q  246 cttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    ||| ||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  19761018 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttc 19760971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 21747518 - 21747815
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||  || || || |    
T  21747518 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgata 21747617  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    ||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | | |||  || || || ||    
T  21747618 tctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaacatatgtggtctccttc 21747717  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||||||| |  |||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  21747718 tagaaactcaa-gatctttctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 21747815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Original strand, 21830385 - 21830551
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  21830385 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 21830484  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    |||||||||||||  | ||||  ||||| || || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  21830485 cttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 21830551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 51333767 - 51333571
Alignment:
Q  124 tgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || | ||    
T  51333767 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttatt 51333668  T
Q  224 gaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  51333667 ggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 51333571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 20136761 - 20137059
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  |||| || ||||| | ||||||||| || ||||  || || || |    
T  20136761 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaaccaacacgatacgccactgtcccaactctttccgata 20136860  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| ||  | || || ||    
T  20136861 tctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttc 20136960  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  20136961 ttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 20137059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Original strand, 21837032 - 21837198
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  21837032 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 21837131  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||  ||||| |||||||| ||| |||| ||||| || |||||    
T  21837132 cttggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttcat 21837198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41354748 - 41354554
Alignment:
Q  119 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcacc 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || ||    
T  41354748 aaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 41354649  T
Q  219 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttct 313  Q
     || | ||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || || |  ||||||| ||||||||    
T  41354648 ttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttct 41354554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 50612774 - 50612605
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||||| || || |||| ||| |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  50612774 gacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataa 50612675  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatac 209  Q
    || |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||||||    
T  50612674 acctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatac 50612605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16079009 - 16078831
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||| ||||||  || || || |    
T  16079009 acatacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccattccaactctttccgata 16078910  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||||    
T  16078909 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 16078831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 24476945 - 24477024
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaa 83  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  24476945 acatgcgagggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgaaaattcgagagatgtggtggcaa 24477024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20831582 - 20831482
Alignment:
Q  208 acatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaa 307  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||   ||||||||||    
T  20831582 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 20831483  T
Q  308 c 308  Q
    |    
T  20831482 c 20831482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Original strand, 20914316 - 20914479
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || || | |||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  20914316 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20914415  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
      || | ||| |||||||||| |  |||||| || || |||||||| |||   |||||||||||    
T  20914416 atttataatgataactcttctctctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 20914479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16078806 - 16078728
Alignment:
Q  244 cgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    |||||||||||||||| ||||||||    
T  16078806 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 16078728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 19098 - 19438
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  || ||||| ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19098 ataacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 19197  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  19198 ctgttccaaccctctccgatatctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccct 19297  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19298 cagaaatacatgatcaccatcctgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttccctgatc 19397  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19398 atcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcc 19438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 58665 - 58443
Alignment:
Q  70 agatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaag 169  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  ||| | |||||||  |    
T  58665 agatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttcagtg 58566  T
Q  170 cacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttg 269  Q
    || |||| ||||| ||||   ||||  |||| | ||| ||||| || || ||||||||||||||  |||| ||  |||| ||||| |||||||| |||      
T  58565 catgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttgtct 58466  T
Q  270 actctgcgaagctttcatctttt 292  Q
    ||| ||||| |||||||||||||    
T  58465 actatgcgacgctttcatctttt 58443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 76 - 422
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  76 ataacatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactctgtatgcca 175  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  176 ctgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactct 275  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  276 cagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttttcccttatc 375  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  376 atcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 10866 - 11212
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10866 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 10965  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  10966 ctgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccct 11065  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  11066 aagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatc 11165  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  11166 atcttgactttctctgtagtctgatgaatcaattccggtcccaacac 11212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 727 - 381
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  727 ataacatgcaaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 628  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  627 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccct 528  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  527 aagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatc 428  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  427 atcttgactttctctgtagtctgatgaatcaattccggtcccaacac 381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7994 - 7831
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| | ||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||| ||||    
T  7994 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 7895  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
     ||| ||||| || |||||||||  |||||| || || |||||||| |||   |||||||||||    
T  7894 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 7831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 2729 - 3075
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  2729 ataacatgcgaaggatcttctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 2828  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2829 ctgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 2928  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2929 cataaatacatgatatccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatc 3028  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  || |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  3029 atcttgactttctctgttgtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 3075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 148548 - 148894
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  148548 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgcca 148647  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  148648 ctgttccaaccctctctcatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 148747  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  148748 cagaaatacatgatcaccctcttagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatc 148847  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||| | |||||||   |||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  148848 atcctgactttctctatagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 148894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 196030 - 195685
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  196030 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 195931  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  195930 ctgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccct 195831  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| ||  | |||    
T  195830 cagaaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgtctctacgacgctttcatcttctctatgatc 195732  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  195731 atcttgactttctctgtagtctgatgaaccaagtccggtcccaacac 195685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 68768 - 68575
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  68768 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 68669  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagt 194  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  68668 ctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 68575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26840 - 26542
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| | |||||||||||| || || || ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  26840 acatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtttcaatcctttctgata 26741  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |  | ||||| || ||||| ||||| ||||  ||||||||||| | |||||| ||||| || ||    
T  26740 tctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaatacgtgatctccttc 26641  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     || ||||||||| | || || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  26640 ctggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 26542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 122134 - 121989
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || || | |||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  122134 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 122035  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || ||||||||    
T  122034 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42661 - 42315
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42661 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 42562  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  42561 cagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgtcataggagtaaccct 42462  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| || |||    
T  42461 cagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatc 42362  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| | |||||| |||||    
T  42361 atcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaacac 42315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 47727 - 47381
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  47727 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 47628  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  47627 cagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgtcataggagtaaccct 47528  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| || |||    
T  47527 cagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatc 47428  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| | |||||| |||||    
T  47427 atcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaacac 47381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 182
Target Start/End: Original strand, 2252 - 2309
Alignment:
Q  125 gatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacc 182  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  2252 gatacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgatttcaatgcacgtccaacacc 2309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26193 - 25853
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  || ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  26193 ataacatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 26094  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26093 ctgttccaaccctttttgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactct 25994  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  25993 cagaaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttcccttatc 25894  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    ||||| || ||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  25893 atctttaccttctccgtagtctgatggaccaaatccggtcc 25853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Original strand, 16657 - 16946
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||      
T  16657 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaacactatatgccacta 16756  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| || || ||    
T  16757 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 16856  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16857 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttc 16946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14579 - 14233
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  14579 ataacatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgcca 14480  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  14479 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccct 14380  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||    
T  14379 cagaaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatc 14280  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| ||| |||   |||||| || |||||| |||||||| |||||    
T  14279 atcttgactatctctatagtctgataaaccaaatccggtcccaacac 14233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9205 - 9039
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  9205 ataacatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgcca 9106  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaa 167  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9105 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 52507 - 52159
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  52507 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgcca 52408  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||| |  || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  52407 ctgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccct 52308  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  52307 cagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatc 52208  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacacca 349  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| || | ||| |||||||    
T  52207 atcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatcccaacacca 52159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 61541 - 61193
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  61541 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgcca 61442  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||| |  || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  61441 ctgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccct 61342  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  61341 cagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatc 61242  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacacca 349  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| || | ||| |||||||    
T  61241 atcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatcccaacacca 61193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 67911 - 67581
Alignment:
Q  19 gctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctg 118  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| |  |    
T  67911 gctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttag 67812  T
Q  119 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcacc 218  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| ||    
T  67811 atatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgcc 67712  T
Q  219 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagta 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||  |||    
T  67711 ctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgta 67612  T
Q  319 gtctcatgaaccaagtccggtcctaacacca 349  Q
    |||||||||||||| || | ||| |||||||    
T  67611 gtctcatgaaccaaatctgatcccaacacca 67581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 47102 - 47448
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  47102 ataacatgcgaaggatctgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 47201  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  47202 ctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccct 47301  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47302 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 47401  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  47402 atcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatccggtcccaacac 47448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 40 - 349
Target Start/End: Original strand, 4767 - 5076
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||    
T  4767 gacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacggaccaatga 4866  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    |||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4867 actttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctt 4966  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggt 339  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || |||    
T  4967 tctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatctggt 5066  T
Q  340 cctaacacca 349  Q
    || |||||||    
T  5067 cccaacacca 5076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1497 - 1152
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || | | | || ||||    
T  1497 ataacattcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgcca 1398  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1397 ctgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 1298  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||     
T  1297 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttctcttatt 1198  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaaca 346  Q
    ||||| || ||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  1197 atcttgaccttctccgtagtctaatgaaccaaatccggtcccaaca 1152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17038 - 16695
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  17038 acatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactg 16939  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||| || || ||    
T  16938 ttccaactctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcag 16839  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  16838 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctgcgaagctttcatcttttctcttatcaat 16739  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16738 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacac 16695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10411 - 10065
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  10411 ataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 10312  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  || |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  10311 cagttccaactctttctgaactctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccct 10212  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  10211 cagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctctctgatc 10112  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10111 atcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacac 10065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 27204 - 27549
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  27204 ataacatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgcca 27303  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27304 cggttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactct 27403  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  27404 cagaaatacatgatatccctcttgaaattcaa-ggccttcctacgctcgtcatggtaactcttctgtcgactctacggcgctttcatcttttctcttatc 27502  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  27503 atcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacac 27549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 27497 - 27843
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27497 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 27596  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27597 ctgttccaaccctctctgatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactct 27696  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||    
T  27697 cagaaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatc 27796  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||| | || ||||| |||||    
T  27797 atcttgactttctctgtagtctgatgaaccgaatctggtcccaacac 27843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1476 - 1129
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||| ||| || || |||||||||  ||| || ||| | || ||||    
T  1476 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaacctactttttatgcca 1377  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | | |||    
T  1376 ctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaat-aacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgtcataggaatgattct 1278  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1277 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 1178  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacacca 349  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||| || || ||||| |||||||    
T  1177 atcttgactttcttcgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacacca 1129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 31388 - 31734
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||   ||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31388 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 31487  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  31488 ctgttccaaacctatcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactct 31587  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  31588 cagaaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatc 31687  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||| | ||||||||| |||| ||| |||||    
T  31688 atcttgactttctatgtagtttgatgaaccaaatccgatcccaacac 31734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 320
Target Start/End: Original strand, 14104 - 14336
Alignment:
Q  88 actctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 187  Q
    |||| |||||||||||||||||  || || || |||| |||| ||||||| ||  |||||||||||| | | || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14104 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 14203  T
Q  188 tcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
      ||||| ||| | | ||| |  || || || ||||||||||||||  |  | || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  14204 caggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 14303  T
Q  288 cttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||| ||    ||||||||||| ||||| |||||    
T  14304 cttctcttgaatcatcttaaccttcttggtagt 14336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1844 - 1512
Alignment:
Q  9 cgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttcca 108  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  1844 cgaagaatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttcca 1745  T
Q  109 atcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaata 208  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  1744 accctttctgatatctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaata 1645  T
Q  209 catgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
    |||||||  || | ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1644 catgatcttccacctgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgac 1545  T
Q  309 tttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    |||||   |||||| ||||||||| ||||||||    
T  1544 tttctctctagtctgatgaaccaaatccggtcc 1512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 290
Target Start/End: Original strand, 6022 - 6290
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || |||||  |||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||| ||||  || || || |    
T  6022 acatacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgata 6121  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||| ||||| ||  | |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  || || ||||| | |||||| || || || ||    
T  6122 tctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 6221  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  6222 ttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttcatctt 6290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 346
Target Start/End: Original strand, 22816 - 23017
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  || ||||| ||||   || | ||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  22816 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 22915  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaa 344  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||  | |||||||| |||   ||||||||||| || |  |||||||| || || |  |||||||||||    
T  22916 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagactccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 23015  T
Q  345 ca 346  Q
    ||    
T  23016 ca 23017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 39717 - 40057
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  39717 ataacatgagaaggatccgctacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 39816  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | || || |  || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39817 ctgttccaaccctctcagatatcggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgtcataggagtaactct 39916  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  39917 cagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttata 40016  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    ||||| |||||||   |||||| ||||||||| ||||||||    
T  40017 atcttgactttctcgttagtctgatgaaccaaatccggtcc 40057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 91260 - 90932
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  91260 ataacatgcgaaggatttgctacatacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgcca 91161  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || |||| ||| |||| ||| ||||| | |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  91160 ctgttccaaccctctcagatatctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactct 91061  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  91060 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 90961  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaac 329  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  90960 atcttgactttctccgtagtctgatgaac 90932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Original strand, 448076 - 448356
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||  || ||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| |    
T  448076 gacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatttgatacggaccaataa 448175  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    || |||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||   || |  ||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||    
T  448176 acctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagttacaggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtcttt 448275  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  448276 cctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 448356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 286
Target Start/End: Original strand, 162136 - 162376
Alignment:
Q  46 tgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcg 145  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| ||  |||    
T  162136 tgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacgggccaataaatctcg 162235  T
Q  146 gagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccg 245  Q
    ||||||| ||| | || ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || ||  | ||||||||| ||||  | ||| | ||    
T  162236 gagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttcttgaaacacaagatcttttttacg 162335  T
Q  246 cttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttca 286  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  162336 cttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttca 162376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 188
Target Start/End: Original strand, 175361 - 175428
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcat 188  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  175361 atctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcat 175428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 78813 - 78691
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||   || | ||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  78813 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 78714  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgt 267  Q
     ||| ||||| ||||||||||||    
T  78713 tcttatcatgataactcttctgt 78691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7562 - 7220
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||| |  ||  |||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7562 ataacatgcgaag--tccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 7465  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||    
T  7464 ctgttccaa-cct-tctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccct 7367  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  7366 cagaaatacatgatcaccctcctgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatc 7267  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  |||| || ||||||||| |||||||| |||||    
T  7266 atcttgactttctctgtagactgatgaaccaaatccggtcccaacac 7220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 119 - 347
Target Start/End: Original strand, 5309 - 5537
Alignment:
Q  119 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcacc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5309 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcacc 5408  T
Q  219 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagta 318  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||     
T  5409 ctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctttttccttatcatcttgaccttctcagtc 5508  T
Q  319 gtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  5509 gtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 5537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18865 - 18537
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  18865 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaacccactctgtatgcca 18766  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||| || ||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18765 ctgttctaaccctctctgatatctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactct 18666  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18665 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatc 18566  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaac 329  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  18565 atcttgactttctccgtagtctgatgaac 18537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 3683 - 3629
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacat 55  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||    
T  3683 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacat 3629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39212 - 38869
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  39212 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 39113  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  39112 ctccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtcaaaggagtgactctcag 39013  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  39012 aaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgaagctttcatctttttccttatcaac 38913  T
Q  304 ttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  38912 ctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacac 38869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 3869 - 4215
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||  ||||| | || ||||    
T  3869 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgcca 3968  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3969 ctgttccaaccctctcagatatctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 4068  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  4069 cagaaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatc 4168  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| |||||||  ||||||| || ||| || |||||||| |||||    
T  4169 atcttgactttctccgtagtctgataaactaaatccggtcccaacac 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4467 - 4217
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4467 ataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 4368  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4367 cagttccaaccctctttgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 4268  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 251  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4267 taaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 4217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 52191 - 51845
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||  |||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  52191 ataacatgcgaatgatcagctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 52092  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||| || || |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| | || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  52091 ctgttccaaccctttcagatatctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactct 51992  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  51991 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatc 51892  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |||||||| |||||    
T  51891 atcttgaccttctccgtagtttgatgaaccaaatccggtcccaacac 51845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 96330 - 95984
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  96330 ataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgcca 96231  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  96230 cagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccct 96131  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | ||| ||||| ||||| || ||||| |||||| | || || ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  96130 caaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatc 96031  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    | | |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  96030 accctaactttctccgtagtctcatgaaccaagtccggccccaacac 95984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 112537 - 112837
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || || || || || ||||| ||||    
T  112537 ataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagcca 112636  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  112637 ctgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactct 112736  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |  || |||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  112737 caagaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatc 112836  T
Q  301 a 301  Q
    |    
T  112837 a 112837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 110019 - 109820
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || || || |    
T  110019 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctcctt 109920  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  109919 cctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 109820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 354
Target Start/End: Original strand, 10837 - 11100
Alignment:
Q  91 ctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcg 190  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| |    
T  10837 ctataggccactgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatag 10936  T
Q  191 gagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||    
T  10937 aagtaaccctaagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctaagacgcattcatctt 11036  T
Q  291 ttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    ||| || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  11037 ttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactc 11100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 9776 - 10119
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  9776 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 9875  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9876 ctgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgccataggagtaactct 9975  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||     | | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9976 cagaaacacatgatctccctcttgaaactca-----cgtcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 10070  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacacca 349  Q
    ||||| || ||||  ||||||| |||||| || || ||||| |||||||    
T  10071 atcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacacca 10119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 14064 - 14403
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| | |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| | || ||||    
T  14064 ataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgcca 14163  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||| || || ||||  |||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  14164 ctgttccaa-cctttcagatatctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgtcataggagtgactct 14262  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14263 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 14362  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcc 341  Q
    ||||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14363 atcttgacattctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcc 14403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 6161 - 6508
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || ||| | | |||||| |||| |||||| ||||    
T  6161 ataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgcca 6260  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  6261 cagttccaaatctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccct 6360  T
Q  201 ta-gaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttat 299  Q
     | |||| ||||| ||||| || |||||||||||| | || || ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||  | ||    
T  6361 caggaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctatgat 6460  T
Q  300 catcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6461 catcttgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacac 6508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 26120 - 26466
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  26120 ataacttgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 26219  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  26220 ctgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactct 26319  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  26320 caaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttgatcttttctcttatc 26419  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| || ||||  ||||||| ||||||||| |||| ||| |||||    
T  26420 atcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccgctcccaacac 26466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5330 - 5026
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| || ||| | || ||||    
T  5330 ataacatgcgaatgatctgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgcca 5231  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
      ||||||| |||||  || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | || |||||  |||  |||||||||||||| ||||| | |||    
T  5230 gtgttccaaccctcttagatatctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattct 5131  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5130 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 5031  T
Q  301 atctt 305  Q
    |||||    
T  5030 atctt 5026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 3853 - 4199
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  3853 ataacatgcgaaggaaccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagcca 3952  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |    
T  3953 ctgttccaacactctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactat 4052  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  4053 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgattctccgacgctttcatcttttctcttatc 4152  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||| || ||||  ||||||| |||||| || || ||||| |||||    
T  4153 atcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacac 4199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 37180 - 37526
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |  || || || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  37180 ataacatgtgaaggatccactacatacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgcca 37279  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| ||| || || ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||    
T  37280 ctgttccaaccctttcagatatctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactct 37379  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| | | |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37380 aagaaacacatgatctctcccttgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 37479  T
Q  301 atcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  37480 atcttaactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 37526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 103 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38400 - 38156
Alignment:
Q  103 gttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctta 202  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  38400 gttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctca 38301  T
Q  203 gaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcat 302  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||    
T  38300 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctctaatcat 38201  T
Q  303 cttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||| |||||||  ||||||| ||||  ||| |||||||| |||||    
T  38200 cttgactttctccgtagtctgatgattcaaatccggtcccaacac 38156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 103 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27563 - 27373
Alignment:
Q  103 gttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctta 202  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27563 gttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctca 27464  T
Q  203 gaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  27463 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttc 27373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 169 - 473
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  169 ataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgcca 268  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || | ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  269 cagttccaactctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccct 368  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  369 cagaaaaacatggtcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatc 468  T
Q  301 atctt 305  Q
    |||||    
T  469 atctt 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7364 - 7064
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  7364 ataacttgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagcca 7265  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  7264 ctgttccaactctctcagatatctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccct 7165  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  7164 cagaaacacatgatctccctcttgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatc 7065  T
Q  301 a 301  Q
    |    
T  7064 a 7064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6241 - 5942
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |  || ||||| ||||| |||||| |||| || || |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  6241 ataacatgcgaaggatcctctacatacttccgaagttgcgacacatgaaa-acatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 6143  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||  ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  6142 cagttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccct 6043  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  6042 cagaaacacatgagctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatc 5943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 18827 - 19133
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  18827 ataacatgcgaaggatccggtacatacttccacaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgcca 18926  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | || ||||  ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  18927 ctgtcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactct 19026  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |  || ||||| || |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||    
T  19027 caagaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatc 19126  T
Q  301 atcttaa 307  Q
    | |||||    
T  19127 aacttaa 19133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 307
Target Start/End: Original strand, 23100 - 23295
Alignment:
Q  112 ctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacat 211  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || ||||    
T  23100 ctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacat 23199  T
Q  212 gatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaa 307  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| |||||    
T  23200 ggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaacttaa 23295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 136097 - 136278
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  136097 ataacatccgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctatatgcca 136196  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacc 182  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  136197 cagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 506 - 813
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||  | |  |  ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  506 ataacatgtgaaggatccgctacatactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagcca 605  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||||||||    
T  606 ctgttccaaccctctctgaaatttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactct 705  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| | || ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||  ||||||    
T  706 caagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctgcgacgctttcatctgttttcttatc 805  T
Q  301 atcttaac 308  Q
    | ||||||    
T  806 aacttaac 813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Original strand, 180216 - 180516
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||  || ||||| |    
T  180216 acatacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagccaactcgatacgccactgttctaactctttctgata 180315  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  180316 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctc 180415  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||    
T  180416 ttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtc 180515  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  180516 t 180516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 34005 - 33718
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || ||||| || || ||||| ||||    
T  34005 ataatatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagcca 33906  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | || || |  ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  33905 ctgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactct 33806  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatc 288  Q
     |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33805 caagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 33718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 308
Target Start/End: Original strand, 40443 - 40543
Alignment:
Q  208 acatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaa 307  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||   ||||||||||    
T  40443 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 40542  T
Q  308 c 308  Q
    |    
T  40543 c 40543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Original strand, 693 - 973
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| | |||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| |    
T  693 gacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagccaacacgatacgccaccattccaaccctttccgatatctgatacggaccaataa 792  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    |  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| || || || ||||||||||||||  | ||    
T  793 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 892  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||    
T  893 tctatgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagt 973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 1155 - 1385
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  1155 ataacatacgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 1254  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | ||||||| |||||  || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  1255 ctgttccaaccctctaagatatctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactct 1354  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactca 231  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1355 cagaaacacatgatctccctcttgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 163 - 347
Target Start/End: Original strand, 10 - 194
Alignment:
Q  163 ttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactct 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10 ttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactct 109  T
Q  263 tctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||  ||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  110 tctgccgactctatgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11067 - 10767
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||  | |||||||| ||||    
T  11067 ataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgcca 10968  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | |||||||   |||| || |||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||||  ||||| |||||    
T  10967 ctgttccaactttctcagatatctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactct 10868  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 300  Q
     | ||| ||||| || || ||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  10867 caaaaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttatc 10768  T
Q  301 a 301  Q
    |    
T  10767 a 10767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 4031 - 4329
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| ||| | || || |||  ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4031 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccacttgatacgccaccgttccaatcctttctgata 4130  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||||||||| || ||    
T  4131 tctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttc 4230  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    || |||||||||| | || || ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  4231 ttaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagt 4329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 287
Target Start/End: Original strand, 27966 - 28231
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||  || || || |    
T  27966 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatacgccactgttccaactctttccgata 28065  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||| |||||||| | || |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  28066 tctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctc 28165  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  28166 ttgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 28231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 50842 - 50555
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || ||||| || || ||||| ||||    
T  50842 ataatatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactacgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagcca 50743  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | || || |  ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  50742 ctgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactct 50643  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatc 288  Q
     |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||  | ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  50642 caagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatgacagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 50555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 43252 - 43451
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || || || |    
T  43252 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctcctt 43351  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | |||||||||||  | ||||| | ||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| || ||    |||||||||||||||| ||||||    
T  43352 cctgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 43451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 349
Target Start/End: Original strand, 8583 - 8811
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || || || |    
T  8583 atctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctcctt 8682  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | | |||||||||  | ||||| || || || || |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  8683 cctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagt 8782  T
Q  321 ctcatgaaccaagtccggtcctaacacca 349  Q
    ||  ||||| |  ||||||||||| ||||    
T  8783 ctgctgaacaatctccggtcctaagacca 8811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 3139 - 3437
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| || ||  | |    
T  3139 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcaaata 3238  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||||||||| || ||    
T  3239 tctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttc 3338  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    |||||||| |||| | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  3339 ttgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagt 3437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29097 - 28808
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||||| |||| |||||||||||| || || ||||||| |||  | || |||||||| ||||    
T  29097 ataacatgcgaaggatctgctacatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgcca 28998  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | || ||||  ||||| || |||||||| |||||||| |||   |||||||||||| | || ||||||||||| |  ||||| ||||   |||| |||||    
T  28997 ctgtcccaactctctcagagatctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactct 28898  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     | ||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  28897 caaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatctt 28808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 41088 - 40799
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||||| |||| |||||||||||| || || ||||||| |||  | || |||||||| ||||    
T  41088 ataacatgcgaaggatctgctacatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgcca 40989  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct 200  Q
    | || ||||  ||||| || |||||||| |||||||| |||   |||||||||||| | || ||||||||||| |  ||||| ||||   |||| |||||    
T  40988 ctgtcccaactctctcagagatctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactct 40889  T
Q  201 tagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     | ||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  40888 caaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatctt 40799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 137 - 305
Target Start/End: Original strand, 1908 - 2076
Alignment:
Q  137 tgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggc 236  Q
    ||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1908 tgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggc 2007  T
Q  237 ctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatctt 305  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||    
T  2008 cttcctatgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgtcgctttcaccttttctcttatcatctt 2076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 219742 - 219426
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |  || || || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||  || || |||  |||||||||||    
T  219742 acatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccacttgatacgccaccg 219643  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |     
T  219642 ttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 219543  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    |||||| |||||  | ||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||    
T  219542 aaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 219443  T
Q  304 ttaactttcttagtagt 320  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  219442 ttaaccttctcagtagt 219426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 320
Target Start/End: Original strand, 229114 - 229340
Alignment:
Q  94 tacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggag 193  Q
    ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| || || ||||    
T  229114 tacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagtaataggag 229213  T
Q  194 taactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  229214 tgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 229313  T
Q  294 ccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
        ||||||||||| |||| ||||||    
T  229314 ttgaatcatcttaaccttctcagtagt 229340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33116 - 33016
Alignment:
Q  208 acatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaa 307  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||   ||||||||||    
T  33116 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaa 33017  T
Q  308 c 308  Q
    |    
T  33016 c 33016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15386 - 15115
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||| || ||||| |    
T  15386 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgata 15287  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | | |||||||||| || ||    
T  15286 tctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttc 15187  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
     |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15186 ctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttttc 15115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 14876 - 15174
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  14876 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagcccactcggtacgccaccgttccaattctttctgata 14975  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| ||| | | |||||||||||| || ||    
T  14976 tttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttc 15075  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     |||||||||||| | || ||  |||| ||||| |||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  15076 atgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctgagacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 15174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25396 - 25092
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  25396 acatgtgatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 25297  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
    ||||||  || || || ||||||||||  ||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  25296 ttccaactctttccgatatctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactcttag 25197  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| ||||| || ||  ||||||| |||||  | || || || ||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| | |    
T  25196 aaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttattagc 25097  T
Q  304 ttaac 308  Q
    |||||    
T  25096 ttaac 25092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 567 - 269
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  567 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattccaatcctttctgata 468  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| || |  ||| | ||||| | ||| ||||| || || ||    
T  467 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgactctcaaaaacacatggtccccttc 368  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||||||||||| | | || || ||||| ||||||||  | || ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  367 ttgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagt 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 6013 - 6311
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||||| |||||||||| ||||||  || ||| | |    
T  6013 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatccaactcgatacgccaccattccaactctttctaata 6112  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||  ||||| ||||  ||||| ||||||| ||| || || || |||||    
T  6113 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagtcacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctc 6212  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||||||||||||  |||  || ||||| | ||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| ||||||    
T  6213 ttgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 6311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 228 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 5553 - 5427
Alignment:
Q  228 ctcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatga 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||   |||||||||||    
T  5553 ctcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtctcatga 5454  T
Q  328 accaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  5453 accaaatccggtcccaacaccacactc 5427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 293
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9240
Alignment:
Q  100 accgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactc 199  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  200 ttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    | | |||||||||||| || ||||||||||||||| | || || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 9240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Original strand, 16986 - 17257
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||  |||||||||||||||||| || ||||| |    
T  16986 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgccaccgttccaattctttctgata 17085  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||   |||   |||| ||||| | |||||| ||||| || ||    
T  17086 tctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaatcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttc 17185  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    ||||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  17186 ttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacactttcatcttttc 17257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26026 - 25755
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||| ||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  26026 acatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccacggttccaattctttctgata 25927  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| |  ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| | ||||||||| |  || ||    
T  25926 tctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactctaaaaaatacatggtttccttc 25827  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
     |||||||||| | |||| || ||||| ||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25826 ctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 25755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 290
Target Start/End: Original strand, 1 - 269
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||| ||| |||||  ||||||  || || || |    
T  1 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgata 100  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |  | |||||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||| | ||| ||||||| ||||||    
T  101 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctc 200  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    ||||||||||||  ||||||| || || ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  201 ttgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 322
Target Start/End: Original strand, 7451 - 7676
Alignment:
Q  97 gccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaa 196  Q
    |||||||||||||  |||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  7451 gccaccgttccaactctctccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtga 7550  T
Q  197 ctcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttccct 296  Q
    |||| | |||||| || || || || |||||||||||  | ||||| || || || || |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||       
T  7551 ctctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttg 7650  T
Q  297 tatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||    
T  7651 aatcatctgaactttctcagtagtct 7676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13561 - 13376
Alignment:
Q  21 tacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaa 120  Q
    |||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || | ||| ||||||| |||||| ||     
T  13561 tacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagat 13462  T
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaa 206  Q
    |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13461 atctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaa 13376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 289 - 26
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || |  |||| |||||||||||||||||  || || || |    
T  289 acatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgatacgccaccgttccaacactttccgata 190  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  || ||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | |||||||||||| || ||    
T  189 tctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttc 90  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttc 285  Q
    ||||||||||||| | || || ||||| ||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  89 ttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16745 - 16502
Alignment:
Q  49 aacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggag 148  Q
    |||| ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || |  || ||||||||||||||| | ||| || |||    
T  16745 aacatatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgag 16646  T
Q  149 tcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgctt 248  Q
    |||||||| | || ||||| |  ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||| | || || |||||    
T  16645 tcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgctt 16546  T
Q  249 gtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctttt 292  Q
     |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  16545 atcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatctttt 16502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1216
Alignment:
Q  178 acacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcg 277  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | || || ||||||||||| || ||||| |||  ||||||||    
T  1385 acacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcg 1286  T
Q  278 aagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  1285 acgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagtctcatgaaccaaatccggccccaacac 1216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Original strand, 65404 - 65704
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||||||  || ||||| |    
T  65404 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgataagccaccgttccaactctttctgata 65503  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| || || ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  65504 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 65603  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    |||||||||||||||| |||||||    
T  65604 ttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 65703  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  65704 t 65704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40096 - 39931
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||  || ||  | |    
T  40096 acatacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatccaactcaatacgccaccgttccaactctttcccata 39997  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 187  Q
    || ||||||||||||| ||  |||||||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  39996 tccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtca 39931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2193 - 2039
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || || ||||| || ||||    
T  2193 ataacatgcgaagg-tccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgcca 2095  T
Q  101 ccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttc 156  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2094 ctgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttc 2039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 33059 - 32761
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || || ||||  ||||||||||||||||  || || || |    
T  33059 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgata 32960  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| |  | ||||| ||| |||| ||||| ||||   |||| ||||| | |||||| ||||| || ||    
T  32959 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttc 32860  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    || |||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| ||| || ||| ||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||    
T  32859 ttaaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgaccctacgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcttagtagt 32761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 127506 - 127208
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || || || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || || |||| |||||||||| ||||||  || ||||| |    
T  127506 acatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattccaactctttctgata 127407  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || ||||| || ||    
T  127406 tctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttc 127307  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||| ||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  127306 ttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctggaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 127208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 293
Target Start/End: Original strand, 925 - 1178
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||| || || | || ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |    
T  925 gacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgccactgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataa 1024  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    || ||||| |||| ||| |  ||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||||||||| || || || |||||||||||| | ||    
T  1025 acctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttt 1124  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
     || ||||| ||||| |||||||| |||  | ||||||| ||||| ||||||||    
T  1125 cctacgcttatcatgataactcttttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttc 1178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 202 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3482 - 3337
Alignment:
Q  202 agaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatca 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| || || || ||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||    
T  3482 agaaatacatgatcaccctcctgaaacaaaagggccttcctacgtttatcacgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatca 3383  T
Q  302 tcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||| |||||    
T  3382 tcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgttcccaacac 3337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3483
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |   | ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  3596 ataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 3497  T
Q  101 ccgttccaatcctc 114  Q
    | ||||||| ||||    
T  3496 ctgttccaaccctc 3483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 64338 - 64038
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||  || ||||| |    
T  64338 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttctgata 64239  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||||||  ||  |||||||||| | || |||||||||||||| || || | ||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  64238 tctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagccacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 64139  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
    ||| ||||||||  | || || ||||| ||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||| ||||| |||||||    
T  64138 ttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 64039  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  64038 t 64038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 212 - 347
Target Start/End: Original strand, 78 - 213
Alignment:
Q  212 gatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaacttt 311  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  78 gatcacactcctaaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttctctctgatcatcttgacttt 177  T
Q  312 cttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacac 347  Q
    ||  ||||||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  178 ctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacac 213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1094 - 949
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  1094 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 995  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     ||| ||||| |||||||| |||  |||||| || || ||||||||    
T  994 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatctt 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 322
Target Start/End: Original strand, 7855 - 8089
Alignment:
Q  88 actctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 187  Q
    |||| |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  7855 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtca 7954  T
Q  188 tcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
     || ||| ||||| | ||| || || || || || |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7955 ccgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 8054  T
Q  288 cttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
     || ||    ||||||||||| |||| ||||||||    
T  8055 tttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 8089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 322
Target Start/End: Original strand, 14389 - 14659
Alignment:
Q  52 acatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtca 151  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || | |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  14389 acatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtca 14488  T
Q  152 acttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 251  Q
    ||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || |  || || |||||||||||  |||| || ||||| ||    
T  14489 acttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatc 14588  T
Q  252 atggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||    |||||||||||||||| ||||||||    
T  14589 atgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 14659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 322
Target Start/End: Original strand, 721 - 919
Alignment:
Q  124 tgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctctt 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || ||||    
T  721 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttctt 820  T
Q  224 gaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
    ||||||||||  | ||||| ||||| |  || |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||| |||||||||| ||||||    
T  821 gaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttcttactagtct 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 278
Target Start/End: Original strand, 512 - 669
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  512 atctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 611  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcga 278  Q
    | ||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  612 cctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcga 669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 293
Target Start/End: Original strand, 5238 - 5491
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  |||| || || |||| |||||||||||||||||  || ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  5238 gacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacagaccaataa 5337  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    |  |||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||  || || || |||| |||||||||  | ||    
T  5338 atctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactcaagatcttt 5437  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
     || || ||  |||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  5438 cctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 5491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 117194 - 116941
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || | ||  ||||| || || |||| ||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||||| |    
T  117194 gacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgccaccgttacaattctttctgatatttgatacggaccaataa 117095  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    || |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||   |||   |||| ||||| | |||||| || || |  ||||||||||||||| | ||    
T  117094 acctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactctcaaaaatacttgttctctttcttgaaactcaaggtcttt 116995  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
     || || || ||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  116994 cctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttc 116941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Original strand, 98137 - 98300
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||| ||| | || |||| ||| || ||||||||  ||||||||||||   |||| ||||    
T  98137 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcc 98236  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||   |||||||||||    
T  98237 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 98300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 320
Target Start/End: Original strand, 15516 - 15789
Alignment:
Q  46 tgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcg 145  Q
    ||||||||||| ||||| || || | ||||||||| || || |||| ||| |||||||||||||  || || || |||||||||| |||||| ||  | |    
T  15516 tgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctag 15614  T
Q  146 gagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccg 245  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   || | ||| | | |||||| || || || ||||||||||| |||   || || ||    
T  15615 gagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacg 15714  T
Q  246 cttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||| |||||||||| ||||||    
T  15715 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagt 15789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 220 - 320
Target Start/End: Original strand, 15852 - 15952
Alignment:
Q  220 tcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtag 319  Q
    ||||||||||| |||   || || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||| |||||||||| |||||    
T  15852 tcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtag 15951  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  15952 t 15952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 290
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22134
Alignment:
Q  88 actctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 187  Q
    |||| |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  188 tcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
      ||||| ||||| | ||| || || || || ||||||||||||||  |||| || | ||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcat 22131  T
Q  288 ctt 290  Q
    |||    
T  22132 ctt 22134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16723 - 16425
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| | ||| || || ||||| ||||| || || ||   |||||||||| ||||||| || ||||| |    
T  16723 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaacctacatgatacgccaccattccaattctttctgata 16624  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||  |||  ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  16623 tcttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaatcactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttc 16524  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||||||   |||  |||  || ||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||    
T  16523 ttgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 16425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 289
Target Start/End: Original strand, 6470 - 6638
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || || || |    
T  6470 atctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 6569  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatct 289  Q
    |||||||||||||  | ||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  6570 cttgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 6638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 789
Alignment:
Q  124 tgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || || || || |    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  224 gaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     |||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||||| || ||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagt 789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Original strand, 7036 - 7203
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactct-tagaaatacatgatcaccc 219  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||| || || || ||     
T  7036 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaaacacgtggtctcct 7135  T
Q  220 tcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    ||||||||||||||  | ||||  ||||| || || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  7136 tcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 7203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 965 - 871
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctata 95  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  965 ataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctata 871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 290
Target Start/End: Original strand, 1164 - 1406
Alignment:
Q  48 aaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcgga 147  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||  | ||||  ||||||||||||||||  || || || |||||||||||| |||| ||  |||||    
T  1164 aaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaacaataaatctcgga 1263  T
Q  148 gtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgct 247  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||  ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| || || || ||||||||||||||  | || || | ||    
T  1264 gtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacact 1363  T
Q  248 tgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    | ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||    
T  1364 tatcatggtaacttttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 1406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 86829 - 86511
Alignment:
Q  4 acatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccg 103  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| | ||| || || || ||||| || || ||||||||||| ||||    
T  86829 acatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaacccactctatacgcaaccg 86730  T
Q  104 ttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttag 203  Q
      ||||  || || ||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||  ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||   |||| ||||| |     
T  86729 acccaactctttccgaaatttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctaaa 86630  T
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatc 303  Q
    ||| ||||| |  || ||||||||||||||  |||| || || || ||||| |||||||| |||  |||||| || |||| ||||||||| ||||||| |    
T  86629 aaacacatggtatccttcttgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtgacgcttccatcttttctcttatcaac 86530  T
Q  304 ttaactttcttagtagtct 322  Q
    ||||| |||| ||||||||    
T  86529 ttaaccttctcagtagtct 86511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5879 - 5607
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |  ||||||||||| || || ||||  || | |||||| ||||||| |||| | |    
T  5879 gacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaactcactctatacgcaactgtcccaactctttatgaaatatgatacgaaccattaa 5780  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    || |||||| ||  ||| |||| || |  || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||  ||||    
T  5779 acctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatcctt 5680  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttct 313  Q
    | | ||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| || || |||| |||||| ||||    
T  5679 t-tgcgcttatcatgataactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctctctaatcaacttaaccttct 5607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13266 - 12986
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  | || |||||||| || || |||| |||||| ||| |||| || || ||||| |||||||||| || ||| |    
T  13266 gacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaacccactccatacgctaccattcccattctttctgatatctgatacgaactaataa 13167  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    |  ||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |  || ||||| || || |||||||| |||||  | ||    
T  13166 atctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaagatcttt 13067  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||||    
T  13066 cctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatctaaactttctcagtagt 12986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Original strand, 49510 - 49790
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  ||||||||||||||||  || || || ||||||||||| ||||| |    
T  49510 gacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataa 49609  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    |  | |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||| |  |||  ||||| ||||| | |||||  || || || ||||||||||||||| | ||    
T  49610 atctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttt 49709  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
     || ||||| ||||| ||| |||| ||   ||||||||| |||||| |||||||    |||||||||||||||| ||||||    
T  49710 cctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagt 49790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 976 - 710
Alignment:
Q  46 tgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcg 145  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || | |||||||||||||||||  || |  || ||||||||||||||||| ||  |||    
T  976 tgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcg 877  T
Q  146 gagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccg 245  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||  ||||| | ||| || || || || |||||||||| |||  | || || ||    
T  876 gagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacacgagggactctca-aaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctacg 778  T
Q  246 cttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttct 313  Q
    ||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  777 cttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttct 710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 119
Target Start/End: Original strand, 45830 - 45941
Alignment:
Q  8 gcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttcc 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  45830 gcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaaccaactctatatgccactgttcc 45929  T
Q  108 aatcctctctga 119  Q
    || |||||||||    
T  45930 aaccctctctga 45941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 290
Target Start/End: Original strand, 9360 - 9610
Alignment:
Q  40 gacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 139  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  ||||||||||||||||  || || || ||||||||| ||||||| |    
T  9360 gacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataa 9459  T
Q  140 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 239  Q
    |  | ||||||| |||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |  ||||| || || || ||||||||||||||| | ||    
T  9460 atctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttt 9559  T
Q  240 tctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||    
T  9560 cctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgccttcatctt 9610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 320
Target Start/End: Original strand, 1028 - 1301
Alignment:
Q  46 tgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcg 145  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  ||||||| ||||||||  || || || ||| ||||||||||||| ||  |||    
T  1028 tgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaacgttccaactctttccgatatccgatacggaccaataaatctcg 1127  T
Q  146 gagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccg 245  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||  || || ||||| |  ||||||||||| || ||||  ||||||||| | ||||| ||    
T  1128 gagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttctttgaactcaaggtcttttctacg 1227  T
Q  246 cttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    ||| ||||| |||||||| ||  |||||||||| | ||||| ||||| | | ||| ||||||| |||| ||||||    
T  1228 cttatcatgataactcttttgccgactctgcgacgatttca-ctttttcttaatcgtcttaaccttctcagtagt 1301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 320
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7694
Alignment:
Q  148 gtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgct 247  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || || || || |||||||||||  | ||||| ||||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 7621  T
Q  248 tgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagt 320  Q
    | ||||| |||||| | ||| |||| ||||| |||||||| || ||    |||||||||||||||| ||||||    
T  7622 tatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 7694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 19066 - 18991
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtg 76  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  19066 ataacatgcgagggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtg 18991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4708 - 4567
Alignment:
Q  46 tgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcg 145  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| | ||| || || |||| |||||||||||||||||| || || || | ||||||||||||||| ||  |||    
T  4708 tgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaataaatctcg 4609  T
Q  146 gagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 187  Q
    |||| |||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  4608 gagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4539 - 4490
Alignment:
Q  244 cgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttc 293  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4539 cgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 4490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1030 - 839
Alignment:
Q  121 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccct 220  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || |    
T  1030 atctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctca-aaaaacgtggtctcctt 932  T
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttct 313  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| || |||| |||||| ||    ||||||||||||||||    
T  931 cttggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttccatcttctcttgaatcatcttaactttct 839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Original strand, 24002 - 24165
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||| | ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||||||||    
T  24002 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 24101  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  ||| || || ||||| ||||| |||   |||||||||||    
T  24102 tcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgctttaatcttctcctgaatcatcttaac 24165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Original strand, 16956 - 17121
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||  ||  || || || |    
T  16956 acatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcaatacgccaccgttaaaactctttccgata 17055  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 187  Q
    ||||||||| || ||| ||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  17056 tctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtca 17121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4059 - 3896
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||| || ||||| ||||  ||| | ||||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||   |||||||||    
T  4059 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctcc 3960  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||    
T  3959 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaac 3896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 290
Target Start/End: Original strand, 3281 - 3426
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || | ||| ||||  ||| | ||||| | ||| |||||||||||  | |||||||| | | |||||||||    
T  3281 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcc 3380  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  3381 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 3426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 290
Target Start/End: Original strand, 5863 - 6008
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | || || | ||| |||||||||||  ||||| ||||||   |||||||||    
T  5863 ggagtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcc 5962  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  5963 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 6008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 290
Target Start/End: Original strand, 10477 - 10622
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  10477 ggagtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 10576  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  10577 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 10622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 290
Target Start/End: Original strand, 8472 - 8617
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | || || | ||| |||||||||||  ||||| ||||||   |||||||||    
T  8472 ggagtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcc 8571  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  8572 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 8617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4664 - 4412
Alignment:
Q  70 agatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaag 169  Q
    ||||| ||||| || || |||| ||||||||| |||||||  || |  || ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| | || ||||| |    
T  4664 agatgcggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaagg 4565  T
Q  170 cacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttg 269  Q
    ||||||| ||||| ||||   |||| ||| | |  || || || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |    
T  4564 cacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcg 4465  T
Q  270 actctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
    ||||||||| || ||||| || ||    ||||||||||||||||  |||||||    
T  4464 actctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtct 4412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26278 - 26178
Alignment:
Q  208 acatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaa 307  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||   ||||||||||    
T  26278 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaa 26179  T
Q  308 c 308  Q
    |    
T  26178 c 26178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 322
Target Start/End: Original strand, 8643 - 8895
Alignment:
Q  70 agatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaag 169  Q
    ||||| ||||| || || |||| ||||||||| |||||||  || |  || ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| | || ||||| |    
T  8643 agatgcggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaagg 8742  T
Q  170 cacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttg 269  Q
    ||||||| ||||| ||||   |||| ||| | |  || || || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |    
T  8743 cacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcg 8842  T
Q  270 actctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtct 322  Q
    ||||||||| || ||||| || ||    ||||||||||||||||  |||||||    
T  8843 actctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtct 8895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33880 - 33580
Alignment:
Q  22 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctctgaaa 121  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||| | || || |||| ||||||||| |||||||  || |  || |    
T  33880 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgata 33781  T
Q  122 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 221  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||   |||| ||| | |  || || || || || ||    
T  33780 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttc 33681  T
Q  222 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtc 321  Q
     |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || ||    ||||||||||||||||  ||||||    
T  33680 ctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtc 33581  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  33580 t 33580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 290
Target Start/End: Original strand, 13030 - 13175
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||  ||  | ||||| |  || |||||||||||  | ||||||||||   |||||||||    
T  13030 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 13129  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  13130 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 13175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 346
Target Start/End: Original strand, 14779 - 14980
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  14779 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14878  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaa 344  Q
     ||| ||||| ||||| ||||||  |||||| ||  | |||||||| |||   ||||||||||| || |  |||||||| || || |  |||||||||||    
T  14879 tcttatcatgataacttttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctaaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 14978  T
Q  345 ca 346  Q
    ||    
T  14979 ca 14980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 344
Target Start/End: Original strand, 43723 - 43859
Alignment:
Q  208 acatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaa 307  Q
    |||||||||||   |||||||||||   ||||||||| ||| ||||| |||||||| |||  |||||| || ||||||||||| |||   ||||||||||    
T  43723 acatgatcaccaagttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaa 43822  T
Q  308 ctttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaa 344  Q
    | || |  |||||||| || || |  |||||||||||    
T  43823 ccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 43859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 570 - 407
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | | ||||||||| || ||||| ||||  ||| | || || | ||| |||||| ||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  570 ggagtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 471  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||   |||||||||||    
T  470 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 287
Target Start/End: Original strand, 8276 - 8359
Alignment:
Q  204 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcat 287  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||  |||||| || ||||||||    
T  8276 aaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataagtcttctgtctactctgagacgctttcat 8359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3810 - 3735
Alignment:
Q  238 tttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaactttct 313  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  3810 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttct 3735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 116
Target Start/End: Original strand, 8768 - 8823
Alignment:
Q  61 aagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgccaccgttccaatcctctc 116  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  8768 aagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatactctc 8823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 308
Target Start/End: Original strand, 23592 - 23679
Alignment:
Q  221 cttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||    
T  23592 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaac 23679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Original strand, 46276 - 46439
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || |  ||| | || || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  46276 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 46375  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttaac 308  Q
     ||| ||||| |||||||| |||  |||||| || || |||||||| |||   |||||||||||    
T  46376 tcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 46439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 59
Target Start/End: Original strand, 10654 - 10692
Alignment:
Q  21 tacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatg 59  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10654 tacatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatg 10692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1238 - 1093
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    |||||||||||||   | ||||||||||| || ||||| ||||  ||| | ||||| | |||||||||||| ||  |  |||||||||   | |||||||    
T  1238 ggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctcc 1139  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  1138 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 1093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 290
Target Start/End: Original strand, 14645 - 14790
Alignment:
Q  145 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 244  Q
    |||||||||||||   | |||||||||||||| ||||| ||||   || | ||||| | ||| |||||||| ||  | |||||||||| | |||| ||||    
T  14645 ggagtcaacttccgacacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcc 14744  T
Q  245 gcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||    
T  14745 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagactctttcatctt 14790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9010 - 8930
Alignment:
Q  210 atgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgttgactctgcgaagctttcatctt 290  Q
    |||||||||  | |||||||||| | |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  9010 atgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 8930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 9197 - 9297
Alignment:
Q  1 ataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttggatagatgtggtggcaagccaactctatacgcca 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| | |  || ||||  |||| |||||||||||| || || |||| ||||||||| || ||||| || ||||    
T  9197 ataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacatatgaaccacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaatcccactctgtatgcca 9296  T
Q  101 c 101  Q
    |    
T  9297 c 9297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 6368 - 6312
Alignment:
Q  298 atcatcttaactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccaaactc 354  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  6368 atcatcttgactttttctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactc 6312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University