View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8938_high_6 (Length: 446)

Name: NF8938_high_6
Description: NF8938
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8938_high_6
NF8938_high_6
[»] scaffold0402 (1 HSPs)
scaffold0402 (2-439)||(6231-6668)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (4-439)||(22289384-22289822)
chr8 (1-439)||(22830246-22830684)
chr8 (1-439)||(21942886-21943324)
chr8 (1-427)||(22368304-22368730)
chr8 (1-427)||(11348389-11348815)
chr8 (4-423)||(21100285-21100703)
chr8 (6-422)||(21825734-21826150)
chr8 (8-427)||(22034962-22035381)
chr8 (170-423)||(19765980-19766236)
chr8 (273-423)||(29333200-29333350)
chr8 (66-427)||(22101057-22101418)
chr8 (228-361)||(21267909-21268042)
chr8 (66-427)||(21380514-21380875)
chr8 (183-427)||(21954617-21954861)
chr8 (298-427)||(17132452-17132581)
chr8 (367-427)||(8313190-8313250)
chr8 (367-427)||(8324283-8324343)
chr8 (3-427)||(16420032-16420456)
chr8 (369-427)||(22097947-22098005)
chr8 (66-153)||(8324557-8324644)
chr8 (6-129)||(25735370-25735493)
chr8 (99-145)||(20000746-20000792)
chr8 (66-151)||(17132220-17132305)
chr8 (2-51)||(45562294-45562343)
chr8 (77-129)||(20040806-20040858)
chr8 (1-49)||(20040886-20040934)
chr8 (1-49)||(21855589-21855637)
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (1-439)||(17386112-17386539)
chr3 (3-423)||(4369020-4369440)
chr3 (3-423)||(20157901-20158321)
chr3 (3-423)||(16654035-16654456)
chr3 (3-423)||(22165779-22166199)
chr3 (12-413)||(10604018-10604419)
chr3 (4-412)||(12423834-12424241)
chr3 (99-423)||(14447010-14447334)
chr3 (3-367)||(18979465-18979829)
chr3 (87-427)||(13693309-13693649)
chr3 (7-422)||(12161540-12161955)
chr3 (206-439)||(3278019-3278252)
chr3 (6-422)||(3340668-3341084)
chr3 (2-214)||(3273077-3273289)
chr3 (6-422)||(13505991-13506406)
chr3 (6-423)||(15643401-15643818)
chr3 (6-423)||(10161663-10162080)
chr3 (6-199)||(11876010-11876203)
chr3 (66-427)||(13137601-13137962)
chr3 (267-427)||(13196861-13197021)
chr3 (183-427)||(15630388-15630632)
chr3 (235-422)||(15945139-15945326)
chr3 (258-427)||(7598969-7599138)
chr3 (258-427)||(12188507-12188676)
chr3 (258-427)||(12194921-12195090)
chr3 (258-427)||(13188849-13189018)
chr3 (358-427)||(10145724-10145793)
chr3 (367-427)||(16374911-16374971)
chr3 (66-153)||(13197135-13197222)
chr3 (1-153)||(12188781-12188933)
chr3 (1-153)||(12195195-12195347)
chr3 (66-153)||(13189123-13189210)
chr3 (66-153)||(15630662-15630749)
chr3 (1-49)||(13090624-13090672)
[»] scaffold0059 (2 HSPs)
scaffold0059 (6-439)||(10510-10929)
scaffold0059 (6-439)||(18511-18930)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (6-439)||(234469-234888)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (1-436)||(8651369-8651804)
chr1 (2-433)||(8948879-8949313)
chr1 (3-423)||(3988427-3988848)
chr1 (1-427)||(19877118-19877544)
chr1 (1-422)||(19783350-19783771)
chr1 (31-412)||(20072391-20072772)
chr1 (3-173)||(22139001-22139171)
chr1 (6-423)||(21800149-21800566)
chr1 (4-425)||(16383739-16384169)
chr1 (333-422)||(20392141-20392230)
chr1 (358-427)||(20236194-20236263)
chr1 (2-49)||(22626844-22626891)
chr1 (79-145)||(21786165-21786231)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (2-427)||(20106621-20107046)
chr7 (1-427)||(15921433-15921858)
chr7 (1-427)||(823974-824400)
chr7 (1-427)||(15064108-15064534)
chr7 (3-423)||(16150978-16151398)
chr7 (1-422)||(16530359-16530783)
chr7 (1-422)||(16634879-16635303)
chr7 (1-422)||(16761252-16761670)
chr7 (228-439)||(48803279-48803490)
chr7 (6-423)||(18594744-18595161)
chr7 (6-423)||(18616523-18616940)
chr7 (6-423)||(13672179-13672596)
chr7 (4-427)||(13656292-13656715)
chr7 (183-427)||(16467047-16467291)
chr7 (62-115)||(12768768-12768821)
chr7 (66-427)||(18286046-18286407)
chr7 (66-427)||(8716285-8716646)
chr7 (3-72)||(15460464-15460533)
chr7 (1-65)||(12760868-12760932)
chr7 (1-145)||(13740768-13740912)
chr7 (367-427)||(14549818-14549878)
chr7 (8-145)||(4311083-4311220)
chr7 (1-145)||(8783811-8783955)
chr7 (3-51)||(11956667-11956715)
chr7 (75-145)||(12565423-12565493)
chr7 (3-161)||(48803557-48803714)
chr7 (69-145)||(14223348-14223424)
chr7 (1-49)||(23513417-23513465)
chr7 (77-129)||(23513493-23513545)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (1-439)||(18446551-18446990)
chr6 (1-422)||(21561926-21562347)
chr6 (6-423)||(20017715-20018132)
chr6 (6-423)||(22167030-22167447)
chr6 (1-137)||(11218205-11218341)
chr6 (6-413)||(20168555-20168962)
chr6 (258-427)||(18010461-18010630)
chr6 (54-423)||(22768605-22768974)
chr6 (3-427)||(8725433-8725857)
chr6 (1-89)||(22581109-22581197)
chr6 (1-89)||(22583899-22583987)
chr6 (1-89)||(22588730-22588818)
chr6 (367-427)||(24856676-24856736)
chr6 (3-89)||(29684883-29684969)
chr6 (3-148)||(18010225-18010370)
chr6 (76-144)||(19587281-19587349)
chr6 (1-40)||(19589371-19589410)
chr6 (1-49)||(17817866-17817914)
chr6 (1-49)||(18189384-18189432)
chr6 (1-49)||(18852369-18852417)
chr6 (77-129)||(18852446-18852498)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (3-423)||(11800-12220)
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (3-423)||(3352938-3353358)
chr4 (3-408)||(15863851-15864256)
chr4 (6-422)||(15261535-15261951)
chr4 (1-310)||(16680712-16681021)
chr4 (6-423)||(13821231-13821648)
chr4 (183-427)||(15252883-15253127)
chr4 (2-145)||(11918419-11918562)
chr4 (367-427)||(22109682-22109742)
chr4 (1-145)||(45240580-45240724)
chr4 (66-153)||(15252766-15252853)
chr4 (6-151)||(12513575-12513720)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (3-423)||(21202-21622)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-427)||(7938-8363)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (2-439)||(43788-44216)
scaffold0037 (2-439)||(51177-51605)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-427)||(131974-132400)
scaffold0026 (1-129)||(16718-16846)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (6-423)||(20597315-20597732)
chr5 (6-423)||(20603612-20604029)
chr5 (3-423)||(26845986-26846406)
chr5 (6-423)||(20609931-20610348)
chr5 (3-423)||(18071230-18071650)
chr5 (3-439)||(22946777-22947213)
chr5 (10-423)||(20792258-20792671)
chr5 (4-423)||(23520623-23521042)
chr5 (1-422)||(25117622-25118043)
chr5 (1-422)||(25176713-25177134)
chr5 (6-423)||(20439639-20440056)
chr5 (1-310)||(30764692-30765001)
chr5 (6-423)||(24954652-24955069)
chr5 (3-427)||(21386656-21387077)
chr5 (66-427)||(22318916-22319276)
chr5 (228-427)||(23746634-23746833)
chr5 (183-427)||(25008215-25008459)
chr5 (66-427)||(15733955-15734316)
chr5 (367-427)||(20620885-20620945)
chr5 (75-145)||(18487790-18487860)
chr5 (4-129)||(20446581-20446706)
chr5 (1-49)||(21282726-21282774)
chr5 (1-49)||(24218184-24218232)
chr5 (373-405)||(30764599-30764631)
chr5 (66-153)||(23746472-23746559)
chr5 (66-153)||(25008489-25008576)
chr5 (77-129)||(24218260-24218312)
chr5 (1-49)||(24938890-24938938)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (3-423)||(22468-22888)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (3-423)||(23677-24097)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (1-427)||(5035-5461)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (6-423)||(24821559-24821966)
chr2 (223-439)||(25372396-25372612)
chr2 (6-422)||(115854-116270)
chr2 (6-422)||(23160851-23161267)
chr2 (6-422)||(23572108-23572524)
chr2 (6-422)||(27629829-27630245)
chr2 (6-253)||(22870088-22870335)
chr2 (6-423)||(16773979-16774396)
chr2 (7-439)||(24169702-24170134)
chr2 (6-423)||(24796770-24797187)
chr2 (230-427)||(25369017-25369214)
chr2 (3-161)||(25369250-25369408)
chr2 (350-427)||(17867491-17867568)
chr2 (66-427)||(22046092-22046453)
chr2 (66-427)||(25355933-25356294)
chr2 (183-427)||(13046-13290)
chr2 (6-152)||(20306429-20306575)
chr2 (367-427)||(27626316-27626376)
chr2 (77-129)||(24500756-24500808)
chr2 (66-153)||(13308-13395)
chr2 (3-51)||(25372784-25372832)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (3-423)||(121709-122119)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (1-422)||(3517-3938)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (6-423)||(19725-20128)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (6-423)||(19423-19840)
scaffold0004 (108-427)||(253240-253573)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (1-271)||(20234-20504)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (6-341)||(1513-1848)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (3-423)||(465-906)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (1-420)||(25859-26274)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (6-422)||(28831-29247)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (6-422)||(23892-24308)
[»] scaffold1400 (1 HSPs)
scaffold1400 (6-295)||(49-338)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (3-437)||(32975-33409)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (175-423)||(8457-8705)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (249-427)||(1870-2046)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (3-439)||(10887-11323)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (3-439)||(115001-115441)
scaffold0020 (3-439)||(119305-119745)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (3-427)||(39166-39590)
[»] scaffold1879 (1 HSPs)
scaffold1879 (3-439)||(336-773)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (228-439)||(10000-10211)
scaffold0216 (2-153)||(9782-9932)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (66-393)||(4619-4947)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (3-427)||(12396-12820)
[»] scaffold1620 (1 HSPs)
scaffold1620 (183-425)||(423-665)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (297-439)||(54893-55035)
scaffold0091 (4-148)||(54596-54740)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (4-391)||(41388-41775)
[»] scaffold1756 (1 HSPs)
scaffold1756 (1-103)||(1001-1103)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (1-79)||(7836-7914)
scaffold0326 (1-79)||(15738-15816)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (359-441)||(21620-21702)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (358-427)||(4819-4888)
[»] scaffold1571 (1 HSPs)
scaffold1571 (367-427)||(1344-1404)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (66-340)||(32347-32621)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (117-168)||(37500-37551)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (75-145)||(18249-18319)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (257-340)||(50288-50371)
scaffold0080 (66-153)||(50475-50562)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (6-85)||(195735-195814)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (69-130)||(11632-11693)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-49)||(12130-12178)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-49)||(13260-13308)
scaffold0012 (1-49)||(9151-9199)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (75-145)||(1029-1099)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (6-151)||(7187-7332)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (1-49)||(14888-14936)
[»] scaffold0242 (2 HSPs)
scaffold0242 (3-51)||(15824-15872)
scaffold0242 (3-51)||(24659-24707)


Alignment Details
Target: scaffold0402 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0402
Description:

Target: scaffold0402; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 2 - 439
Target Start/End: Original strand, 6231 - 6668
Alignment:
Q  2 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6231 tgtgcttaggtaccttcaaagagtgatggcttgcaccatttggggtaggactgaattgtggaacactaggacagatgagctttttatgttatgggctatg 6330  T
Q  102 cttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggca 201  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6331 cttaataaccaccccgttaacatttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtctgatggtaaaggagagatagtagtgggtggca 6430  T
Q  202 tcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctat 301  Q
    |||| || |||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  6431 tcatcacctatatagctagccaattgggagtgggtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttaattctat 6530  T
Q  302 gaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtg 401  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6531 gaacttcattaagcatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtggctatattaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtg 6630  T
Q  402 gaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  6631 gaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggt 6668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 4 - 439
Target Start/End: Original strand, 22289384 - 22289822
Alignment:
Q  4 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 103  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22289384 tgcttaggtaccttcaaagagtgatggcttgcaccatttggggtaggactgaattggggaacactaggacatatgagcttttcttgttgtgggctatgct 22289483  T
Q  104 taataacca---ccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22289484 taataaccaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataagtctgatggtaagggagagatagtagtgggtggt 22289583  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| || |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22289584 atcatcacctatatagctaggcaattgagagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctcta 22289683  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22289684 tgaacttcattaatcatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctatctcatctcggactaacaccgaggt 22289783  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  22289784 ggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggt 22289822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Original strand, 22830246 - 22830684
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  22830246 ctgtccttaggtaccttcaaagagttatggctgacaccatttggggtaggactgaattggggaacactaggacagatgagcttttcatgctgtgggctat 22830345  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22830346 gcttaataaccaccctgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtctgatggtaagggagagatagtagtgggtggt 22830445  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| ||||||||| | | | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22830446 atcatcacatatatagcaaggcaattgagagtgagtgagaaccaagggataaacaagattgagggaaacaataagcttaacatagagacccttatctcta 22830545  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22830546 tgaacttcattaagcatcgtccacccatgacatatacactcaaactcaatgtgcatattttaattatacttcctaacccatctcggactaataccgaggt 22830645  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  22830646 ggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggt 22830684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21943324 - 21942886
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21943324 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcacaatttggggtaggattgaattggggaacactagaactgatgaactcttcatgttgtgggctat 21943225  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || || | |||||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||     
T  21943224 gtttaacaaccaccccgttaacactttcttttccttgcttgattaccttccccatctcggtaataggtctaatggtaggggagagatagtggtaggtggt 21943125  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| ||||| |||  || | |||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21943124 atcatcacatacatagttaggcaattgggagtgggtgaagaccaatggattaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaggcccttatctcta 21943025  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    |||||||||| || | ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21943024 tgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 21942925  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  21942924 ggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggttcgcaggt 21942886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Original strand, 22368304 - 22368730
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||     
T  22368304 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcacaatttggggtaggattgaattggggaacactagaactgatgaactcttcatgttgtgggctac 22368403  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||| | |||||| ||||||| |||| || |||||     
T  22368404 gcttaacaaccaccccgttaacacttgcttttccttgcttgattacctttcccatctcggtaataggtctaatggtaggggagagttagtggtaggtggt 22368503  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| ||||| |||  || | ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22368504 atcatcacatacatagttaggcaattgagagtgggtgaagaccaagggattaacaagattgagggaaaaaataggcttaacatagaggcccttatctcta 22368603  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    ||||||| || || | |   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22368604 tgaactttataaaaccttgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 22368703  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||    
T  22368704 ggaagaaaatttgttgtatgttggtga 22368730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 11348815 - 11348389
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11348815 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcacaatttggggtaggattgaattggggaacactagaactgatgaactcttcatgttgtgggctat 11348716  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || |  ||||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||     
T  11348715 gcttaacaaccaccccgttaacacttacttttccatgcttgattacctttcccatctcagtaataggtctaatggtaggggagagatagtggtaggtggt 11348616  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| ||| | |||  || | |||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  11348615 atcatcacagacatagttaggcaattgggagtgggtgaagaccaatggattaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaggcccttatctctt 11348516  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    |||| ||||| || | ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348515 tgaaattcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 11348416  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||    
T  11348415 ggaagaaaatttgttgtatgttggtga 11348389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 21100703 - 21100285
Alignment:
Q  4 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 103  Q
    ||||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||     
T  21100703 tgcttaggtaccttcaacgagtgatggcttgcactatttggggaagaactgaattgggaaacactaggacggatgaactttttatgctgtgggctatgcc 21100604  T
Q  104 taataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatc 203  Q
    ||| ||||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    | ||||||| |||||||| || || ||||||    
T  21100603 taacaaccgtcccgtaaa-acttgcttttatttgcttgattacctttcccatgtaggtactaggtccactagtaagggggagatagtggtaggaggcatc 21100505  T
Q  204 ataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatga 303  Q
    || || || ||| ||| | |||| || || |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  21100504 atcacttacatagctaggcaatttggggttggtgaggaccaaggaattaaaaggattgagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatga 21100405  T
Q  304 acttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 403  Q
    ||||||| || | || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21100404 acttcatcaaacctcgtccacccatgtcctatacactcaagctcaatgtgcctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 21100305  T
Q  404 agaaaatttgctatatgttg 423  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  21100304 agaaaatttgttgtatgttg 21100285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 422
Target Start/End: Original strand, 21825734 - 21826150
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  21825734 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggagtgaattagggaacactaggagtgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 21825833  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| || ||||| ||||| |||||    
T  21825834 acaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatcgtagttggtggtatcat 21825933  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||| |   || || ||| |||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||     
T  21825934 aacatacatagctaggcggttcggcgtgagtgaagatcaagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaat 21826033  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| ||    |     ||| |    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21826034 ttcataaaaacccgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 21826133  T
Q  406 aaaatttgctatatgtt 422  Q
    |||||||| | ||||||    
T  21826134 aaaatttgttgtatgtt 21826150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22035381 - 22034962
Alignment:
Q  8 taggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaat 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| |  | ||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||  |     
T  22035381 taggtaccttcaaagggttatggcttgcactattaggggaaggactgaactacgaaacactaggaacgatgaactcttcatgttatgggctatgctacac 22035282  T
Q  108 aaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataa 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || | |||||||   || ||| |||||| || ||||| ||||| | |||||    
T  22035281 aaccaacccgttaacacttgcttttacttgcttgactacctttcccttataagaaataggtccaatagtaggggagaaatcgtagttggtggtaccataa 22035182  T
Q  208 catatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaactt 307  Q
    |||| ||| ||| ||| || || ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||| |  ||||||| ||    
T  22035181 catacatagctaggaagttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagaaacccttgttgctatgaattt 22035082  T
Q  308 cattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaa 407  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  | ||     | ||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  22035081 cattaagattcacccacccatgacttatgcacttcagctttgcatacctcttttgtttctacttcctaacccatctcgtactaaccccgaggtggaggaa 22034982  T
Q  408 aatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||| | |||||||||||    
T  22034981 aatttgttgtatgttggtga 22034962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 423
Target Start/End: Original strand, 19765980 - 19766236
Alignment:
Q  170 tgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg---a 266  Q
    |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |     |    
T  19765980 tgatagtaggggagagatagttgtgggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaaaattgagaagaaa 19766079  T
Q  267 aacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatta 366  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  19766080 aaaaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagcctcgtccacccatgtcctacacactcaaactaaatgtgcctattttgattt 19766179  T
Q  367 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19766180 tactttctaacccatctcagactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 19766236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 273 - 423
Target Start/End: Original strand, 29333200 - 29333350
Alignment:
Q  273 aggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttc 372  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  29333200 aggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccatccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatacttt 29333299  T
Q  373 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29333300 ctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 29333350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22101418 - 22101057
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 165  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||   |||||  |     
T  22101418 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgcttctacctacttgattacctttcctccataggtgctc 22101319  T
Q  166 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 265  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  22101318 gacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggg 22101219  T
Q  266 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 365  Q
     |||||||||||||  || || |||||| |  ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||   | | ||| ||||| ||    
T  22101218 caacaataggcttaatattgaaacccttgttactatgaatttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttttgttt 22101119  T
Q  366 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  22101118 atacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 22101057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 361
Target Start/End: Original strand, 21267909 - 21268042
Alignment:
Q  228 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21267909 ggagtgggtgaggacaaagggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaacccttatttctatgaatttcattaagcatcatccaccca 21268008  T
Q  328 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgtttt 361  Q
    |||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  21268009 tgacttatgcacttaaactcaacgtgcctctttt 21268042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 21380514 - 21380875
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 165  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||   ||||   ||    
T  21380514 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcctccataggagcta 21380613  T
Q  166 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 265  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||| | ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  21380614 gacttgataatagagctgagatagtagtcggtagtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggg 21380713  T
Q  266 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 365  Q
     |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  ||    
T  21380714 caacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttattt 21380813  T
Q  366 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  21380814 ctacttcctaacccttctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 21380875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 427
Target Start/End: Original strand, 21954617 - 21954861
Alignment:
Q  183 gagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatca 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  |  |||||||    |||| ||| |||||||||||||  |    
T  21954617 gagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagataggataaatccaattgagggcaacaataggcttaata 21954716  T
Q  283 tagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatc 382  Q
    | || || ||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||| || ||| ||||  ||||     | ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  21954717 ttgaaactctttttgctatgaacttcattaagattcacccacccattacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttgtttctacttcctaacccatc 21954816  T
Q  383 tcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  21954817 tcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 21954861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 427
Target Start/End: Original strand, 17132452 - 17132581
Alignment:
Q  298 ctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccga 397  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17132452 ctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatctcggactaaccccga 17132551  T
Q  398 ggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  17132552 ggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 17132581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 427
Target Start/End: Original strand, 8313190 - 8313250
Alignment:
Q  367 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  8313190 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 8313250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8324343 - 8324283
Alignment:
Q  367 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  8324343 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 8324283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16420456 - 16420032
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    |||||||| |||||  |||| || ||| |||| ||||||| |||||| || ||| | || |  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  16420456 gtgcttagatacctctaaagagtcatggcttgtaccatttagggtagaatagaagtaggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgc 16420357  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    ||  |||| |||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||||||   |||||  |||   ||||  ||  |   ||||||||||| |||| ||    
T  16420356 ttggtaacaaccccgttcatacttgcttctacctacttgattacctttcctccataggtgctagacctgataatagagctaagatagtagtcagtggtat 16420257  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| || |  ||  ||| ||| || |||||| |||| | | |||| |||||    |||| ||| ||||||||| |||  || || |||||  | ||||||    
T  16420256 catcaccttcatcgctaggaagtttggagtgagtgaagccgaaggaataaattcaattgagggcaacaataggtttaatattgaaaccctggtatctatg 16420157  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||  ||||   | | ||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16420156 aatttcattaagcttcatccatccatgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttttatttctgcttcctaacccatcttggactaacaccgaggtgg 16420057  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    | |  |||||| | |||||||||||    
T  16420056 aggcgaatttgttgtatgttggtga 16420032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 427
Target Start/End: Original strand, 22097947 - 22098005
Alignment:
Q  369 cttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | |||||||||||    
T  22097947 cttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggagaatttgttgtatgttggtga 22098005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8324644 - 8324557
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 153  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||    
T  8324644 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttaataacaaccccgttaatacttgtttctacctacttgactacctttcct 8324557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 129
Target Start/End: Original strand, 25735370 - 25735493
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | || |||||  ||| | || |  |  ||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||     
T  25735370 cttaggtactttcaaagggttatggcttgcaccatataggataggaaagaagtaggaatgatgaggactgttgagctgtatatgttgtgggttatgcttt 25735469  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgct 129  Q
    |||||||||| ||||||| |||||    
T  25735470 ataaccaccctgttaacatttgct 25735493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 145
Target Start/End: Original strand, 20000746 - 20000792
Alignment:
Q  99 atgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 145  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20000746 atgctttataaccaccacgttaacatttgctattacttgcttgatta 20000792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 151
Target Start/End: Original strand, 17132220 - 17132305
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttc 151  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  17132220 actaggactgatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttc 17132305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 45562343 - 45562294
Alignment:
Q  2 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtagga 51  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  45562343 tgtgtttaggtaccttcaaagggttatggtttgcaccatatagggtagga 45562294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20040858 - 20040806
Alignment:
Q  77 tgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgct 129  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  20040858 tgagctatttttgttgtgggctatgctttataaccaccatgttaacatttgct 20040806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 20040934 - 20040886
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 49  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  20040934 ctgtgcttaggtaccttcacacggttattgcttgcaccatatggggtag 20040886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 21855637 - 21855589
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 49  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  21855637 ctgtgcttaggtaccttcacacggttattgcttgcaccatatggggtag 21855589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Original strand, 17386112 - 17386539
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||    
T  17386112 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatttgaggtaggactgaattggggaacactaggacatacgagctcttcatgttatgggctat 17386211  T
Q  101 gcttaataaccacccc-gttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 199  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||            |||||||    
T  17386212 gcttaacaaccacccctgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaaaaggtctgatggtaagg------------tcggtgg 17386299  T
Q  200 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 299  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17386300 catcataacatatatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctct 17386399  T
Q  300 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 399  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17386400 atgaacttcattaagcatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 17386499  T
Q  400 tggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17386500 tggaagaaaaattaatatatgttggtgaaggttcacaggt 17386539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 423
Target Start/End: Original strand, 4369020 - 4369440
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  4369020 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 4369119  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  4369120 ttaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtcgataataggtttgatagtaggggagagatagttgtgggtggtat 4369219  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  4369220 catcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaacattgagggaatcaataggctttacatagagacccttatctttatg 4369319  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4369320 aacttcattaagccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcttattttaattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 4369419  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  4369420 aagaaaatttgttgtatgttg 4369440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20158321 - 20157901
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  20158321 gtgcatagttaccttcaaagggctatggcttgcactatttggggtatgactgaattggggaacactagggccgatgaactcttcatgttgtgggccatgc 20158222  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  20158221 ttaacaaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattaccttttccatgtcggtaataggtcagatggtaggggagagatagttgtgggtggtat 20158122  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20158121 catcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatg 20158022  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    ||||| ||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20158021 aactttattaagcactgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttatttgtacttcctaacccatcttggactaacaccgaggtga 20157922  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  20157921 aagaaaatttgttgtatgttg 20157901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 3 - 423
Target Start/End: Original strand, 16654035 - 16654456
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  16654035 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggatcgaattgtgtaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 16654134  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  16654135 ttaacaaccacccggttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtcggtaataggtttgatagtaggggagagatagttgtgggtggtat 16654234  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16654235 catcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattactaaatttgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatg 16654334  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactc-aaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtg 401  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16654335 aacttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtg 16654434  T
Q  402 gaagaaaatttgctatatgttg 423  Q
     ||||||||||| | |||||||    
T  16654435 taagaaaatttgttgtatgttg 16654456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 3 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22166199 - 22165779
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  22166199 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattgaggaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 22166100  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  22166099 ttaacaaccacctcgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgacggtaataggtttgatagtacgggagagatagttgtgggtggtat 22166000  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |  || |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22165999 catcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaatggattaccaaaattgaggaaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatg 22165900  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165899 aacttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattataccttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 22165800  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  22165799 aagaaaatttgttgtatgttg 22165779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 10604419 - 10604018
Alignment:
Q  12 taccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataacc 111  Q
    ||||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||    
T  10604419 taccttcaaaaagtaatgactggcactatttggggtaggaccgaagtggggaacactaggaaggatgaactcttcatgtcgtgggccatgcttaacaacc 10604320  T
Q  112 accccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacata 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  10604319 accccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgatggtaataggtttgatagtaggggagagatagttgtgggtggtatcatcacata 10604220  T
Q  212 tataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcatt 311  Q
     ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10604219 catagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattacaaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcatt 10604120  T
Q  312 aagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatt 411  Q
    ||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10604119 aagccccatccacccatgtcctacacactcaaactcattgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatt 10604020  T
Q  412 tg 413  Q
    ||    
T  10604019 tg 10604018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 12424241 - 12423834
Alignment:
Q  4 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 103  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  12424241 tgcttaggtgccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattgtggaacactaggatggatgaactcttcatgtcgtgggccatgct 12424142  T
Q  104 taataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatc 203  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||  || ||||| |||    
T  12424141 taacgaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttaattacctttcccatgtcggtaataggtctgatagta-gggagagataggtgtgggtggtatc 12424043  T
Q  204 ataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatga 303  Q
    || ||||| |||  || | |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12424042 atcacatacatagataggcaattgggagtgggtgaggaccacgggattaacaacattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatga 12423943  T
Q  304 acttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 403  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12423942 acttcattaagccccgtccacccatgtcctacacattcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacacatctcggactaacaccgaggtgga 12423843  T
Q  404 agaaaattt 412  Q
    |||||||||    
T  12423842 agaaaattt 12423834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 99 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 14447334 - 14447010
Alignment:
Q  99 atgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtg 198  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||  |||||||||||| || ||||    
T  14447334 atgctcaacaaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcccatgtaggtaataggtctgacagttggggagagatagttgtgggtg 14447235  T
Q  199 gcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctc 298  Q
    | || || ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14447234 gtattatcacatacatagctaggcaattgggggtgggtgaggaccaagggataaacaaaattgagggtaacaatagacttaacatagagacccttatctc 14447135  T
Q  299 tatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgag 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14447134 tatgaacttcattaagcatcatccacccatgtcctacacactcaaactcgatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgag 14447035  T
Q  399 gtggaagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||||||||||||||| | |||||||    
T  14447034 gtggaagaaaatttgttgtatgttg 14447010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18979829 - 18979465
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  18979829 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgtcttgggccatgc 18979730  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  18979729 ttaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtctgtaataggtttgatagtatgggagagatagttgtgggtggtat 18979630  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| ||||| ||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18979629 catcacatacatagctaggcaattgcgagttggtgaggaccaagggattaacaaaattgagggaaacaatagggttaacatagagacccttatctttatg 18979530  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattat 367  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18979529 aacttcattaagccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattat 18979465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 87 - 427
Target Start/End: Original strand, 13693309 - 13693649
Alignment:
Q  87 atgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagaga 186  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13693309 atgttgtgggccatgctaaacaaccaccccgttaatacttgcttttacatgcttgactacctttcccatgtaggtaataggtctgatggtaggggagaga 13693408  T
Q  187 tagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcataga 286  Q
    |||| || ||||| ||||||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||| ||||||    
T  13693409 tagttgtaggtggtatcataatatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggatcaacaagattgaggggaataataggcttaacataga 13693508  T
Q  287 gacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcgg 386  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13693509 gatccttgtctctatgaacttcattaaacctcgaccacccatgacttatacactcaagctcaacgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcag 13693608  T
Q  387 actaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  13693609 actaacaccgaggtggatgaaaatttgttgtatgttggtga 13693649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12161955 - 12161540
Alignment:
Q  7 ttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||  |    
T  12161955 ttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactattttgggaaggagtgaattagggaacactaggagcgatgaactcttcatgttatgggctatgctgca 12161856  T
Q  107 taaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcata 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  12161855 caaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatggtaagggagaaatagtagttggtggtatcatc 12161756  T
Q  207 acatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaact 306  Q
    ||||| ||| ||  |  | | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |    
T  12161755 acatacatagctgggctactaggagtgagtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggttaaacatagagacccttatctctatgaatt 12161656  T
Q  307 tcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaaga 406  Q
    |||| || | ||  |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12161655 tcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgatcttactgccttacccatctcggactaacaccgaggtggaaga 12161556  T
Q  407 aaatttgctatatgtt 422  Q
    ||||||| | ||||||    
T  12161555 aaatttgttgtatgtt 12161540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 206 - 439
Target Start/End: Original strand, 3278019 - 3278252
Alignment:
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | ||||||||||  ||| | |||||||||||| || ||||||||     
T  3278019 aacatatatagctaggcaattgggagtgggtgagaaccaagggataaacatgatcgagggaaacaatttgctaaacatagagaccctcatttctatgaat 3278118  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3278119 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctcttttatttatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 3278218  T
Q  406 aaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  3278219 aaaatttgatgtatgttggtgatggttcacaggt 3278252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3341084 - 3340668
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  3341084 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggagtgaattagggaacactaggagtgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 3340985  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  3340984 acaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 3340885  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||| |   || || ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||     
T  3340884 aacatacatagctaggcggttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaat 3340785  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| || | ||     ||| |    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3340784 ttcataaaacctcgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 3340685  T
Q  406 aaaatttgctatatgtt 422  Q
    |||||||| | ||||||    
T  3340684 aaaatttgttgtatgtt 3340668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 3273077 - 3273289
Alignment:
Q  2 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatg 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  3273077 tgtgcttaggtatcttcaaagggttatggcttgcaccatctggggtaggactgagttaggaaacactaggacatatgagcttttcatgttgtgggctatg 3273176  T
Q  102 cttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggca 201  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  3273177 cttaataaccatcatgtgaacacttgcttctactatcttgattatcttgcctatgtaggtaataggtctgacagtaagggagagatagtagtaggtggta 3273276  T
Q  202 tcataacatatat 214  Q
    |||| ||||||||    
T  3273277 tcatcacatatat 3273289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13506406 - 13505991
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || | ||||   || | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  13506406 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactattaggagaaggacaaaactagggaacactaggaacgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 13506307  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||  |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  13506306 acaacaaccc-gttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtcggggagaaatagtagttggtggtatcat 13506208  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||| |   || || |||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||     
T  13506207 aacatacatagctaggcggttaggcgtgattgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagaaacccttatctctatgaat 13506108  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| || |  |     ||| |    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13506107 ttcataaaaccccgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 13506008  T
Q  406 aaaatttgctatatgtt 422  Q
    |||||||| | ||||||    
T  13506007 aaaatttgttgtatgtt 13505991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Original strand, 15643401 - 15643818
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||  |||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  15643401 cttaggtaccttcaaagggttatagcttgtaccattaggggacggaaagaattagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 15643500  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  15643501 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 15643600  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  15643601 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 15643700  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15643701 ttcatcaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 15643800  T
Q  406 aaaatttgctatatgttg 423  Q
     ||||||| | |||||||    
T  15643801 caaatttgttgtatgttg 15643818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 10162080 - 10161663
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||  |||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| |      
T  10162080 cttaggtaccttcaaagggttatagcttgtaccattaggggacggaaagaattagggaacactaggaatgatgaactcttcatgatttgggctatgttgc 10161981  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  10161980 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 10161881  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  10161880 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatagagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 10161781  T
Q  306 ttcattaagcatc-atccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaa 404  Q
    ||||| ||   || |  | || |||  |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10161780 ttcataaaaactcgagtcccctatg-tctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgcactaacaccgaggtggaa 10161682  T
Q  405 gaaaatttgctatatgttg 423  Q
    | ||||||| | |||||||    
T  10161681 gcaaatttgttgtatgttg 10161663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11876203 - 11876010
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| | |    
T  11876203 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgtaccattaggggacggaaagaattagggaacactaggaatgatgaactcttcatgatttgggctatgttga 11876104  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 199  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| |||||    
T  11876103 aaaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtgg 11876010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13137962 - 13137601
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 165  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||   ||||   ||    
T  13137962 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcctccataggagcta 13137863  T
Q  166 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 265  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  || |||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  13137862 gacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcactaggaaatttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggg 13137763  T
Q  266 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 365  Q
     |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  ||    
T  13137762 caacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttattt 13137663  T
Q  366 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  13137662 ctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 13137601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 267 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13197021 - 13196861
Alignment:
Q  267 aacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatta 366  Q
    |||||||||||||  || || |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||   | | ||| ||||| ||     
T  13197021 aacaataggcttaatattgaaacccttgtatctatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttttgtttc 13196922  T
Q  367 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||    
T  13196921 tgcttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaggcaaatttgttgtatgttggtga 13196861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15630632 - 15630388
Alignment:
Q  183 gagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatca 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | |||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |    
T  15630632 gagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaacacaattgagggcaacaataggcttaata 15630533  T
Q  283 tagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatc 382  Q
    | || |||||| |  | |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || ||||||||||||||||    
T  15630532 ttgaaacccttgttgcgatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatc 15630433  T
Q  383 tcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  15630432 tcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 15630388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 235 - 422
Target Start/End: Original strand, 15945139 - 15945326
Alignment:
Q  235 gtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgaccta 334  Q
    |||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||     ||| |    ||    
T  15945139 gtgaagaccaagggctatacaagattgagggaaacaataggctgaacatagaaacccttatctctatgaatttcattaaaactcgaatcccctttgttta 15945238  T
Q  335 tacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 422  Q
    ||| ||||| || ||||| ||| |||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15945239 tacgctcaagcttaatgtacctattttgatattattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 15945326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 427
Target Start/End: Original strand, 7598969 - 7599138
Alignment:
Q  258 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 357  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||| || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||      
T  7598969 attgagggcaacaatagacttaacattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcataccac 7599068  T
Q  358 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  7599069 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 7599138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12188676 - 12188507
Alignment:
Q  258 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 357  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||| || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||   | | ||      
T  12188676 attgagggcaacaatagacttaacattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgtataccac 12188577  T
Q  358 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  12188576 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgtagtatgttggtga 12188507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12195090 - 12194921
Alignment:
Q  258 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 357  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||| || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||   | | ||      
T  12195090 attgagggcaacaatagacttaacattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgtataccac 12194991  T
Q  358 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  12194990 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgtagtatgttggtga 12194921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13189018 - 13188849
Alignment:
Q  258 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 357  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||| || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||      
T  13189018 attgagggcaacaatagacttaacattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcataccac 13188919  T
Q  358 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  13188918 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 13188849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 427
Target Start/End: Original strand, 10145724 - 10145793
Alignment:
Q  358 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  10145724 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 10145793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16374971 - 16374911
Alignment:
Q  367 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  16374971 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttcttgtatgttggtga 16374911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13197222 - 13197135
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 153  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||| |||| | |||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  13197222 actaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgcttagtaacaacctcgttcatacttgcttctacctacttgattacctttcct 13197135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12188933 - 12188781
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||| |||| || ||||||||||| |  ||| | || |  |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||    
T  12188933 ctgtgcttagatacctccagagagtcatggcttgtacaatttggggtagaaaagaagtaggaacaactaggacggatgaactttttatgctttgggcaat 12188834  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 153  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||    
T  12188833 gcttaataacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgactacctttcct 12188781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12195347 - 12195195
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||| |||| || ||||||||||| |  ||| | || |  |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||    
T  12195347 ctgtgcttagatacctccagagagtcatggcttgtacaatttggggtagaaaagaagtaggaacaactaggacggatgaactttttatgctttgggcaat 12195248  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 153  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||    
T  12195247 gcttaataacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgactacctttcct 12195195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13189210 - 13189123
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 153  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||    
T  13189210 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttaataacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgactacctttcct 13189123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15630749 - 15630662
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 153  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  15630749 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttatacctacttgattacctttcct 15630662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 13090672 - 13090624
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 49  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  13090672 ctgtgcttaggtaccttcacacggttattgcttgcaccatatggggtag 13090624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 6 - 439
Target Start/End: Original strand, 10510 - 10929
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||     
T  10510 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatttggggtaggactgaattggggaacactaggacatatgagcttttcatgttgtgggctatgcttt 10609  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10610 ataaccaccccgttaacacttgctt--------------acctttcctatgtaggtaataggtctgatggtaagggagagatagtagtcggtggtatcat 10695  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
     ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10696 cacatatatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaac 10795  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10796 ttcattaaacatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaacgaggtggaag 10895  T
Q  406 aaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  10896 aaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggt 10929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 6 - 439
Target Start/End: Original strand, 18511 - 18930
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||     
T  18511 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatttggggtaggactgaattggggaacactaggacatatgagcttttcatgttgtgggctatgcttt 18610  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18611 ataaccaccccgttaacacttgctt--------------acctttcctatgtaggtaataggtctgatggtaagggagagatagtagtcggtggtatcat 18696  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
     ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18697 cacatatatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaac 18796  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18797 ttcattaaacatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaacgaggtggaag 18896  T
Q  406 aaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  18897 aaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggt 18930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 6 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 234888 - 234469
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||     
T  234888 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatttggggtaggactgaattggggaacactaggacatatgagcttttcatgttgtgggctatgcttt 234789  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  234788 ataaccaccccgttaacacttgctt--------------acctttcctatgtaggtaataggtctgatggtaagggagagatagtagtcggtggtatcat 234703  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
     ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  234702 cacatatatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaac 234603  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  234602 ttcattaaacatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaacgaggtggaag 234503  T
Q  406 aaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  234502 aaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggt 234469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 8651369 - 8651804
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  8651369 ctgtgcttaggtaccttaaaagggttatggcttgcaccatttggggtagtactgaattggggaacactaggacaaatgacctcttaatgttgtgggctat 8651468  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  8651469 gcttaacaaccaccccgttaacacttacttttccatgcttgattacctttcccatgtaggtaataggtctgatggtaagggagatatagtagtaggtggt 8651568  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8651569 atcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctcta 8651668  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    ||||||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8651669 tgaacttcattaaacctcgtccccccatggcctatacactcaaattcaatgtgcctattttaattatacttcctaacctatctcggactaacactgaggt 8651768  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcaca 436  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  8651769 ggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcaca 8651804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 2 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8949313 - 8948879
Alignment:
Q  2 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8949313 tgtgcttaggtaccttcaaaggtttatggcttgcaacatttggggaaggactgaattggggaacactaggacagatgaactctttatgttgtgggctatg 8949214  T
Q  102 cttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggca 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  | ||||| |    
T  8949213 cttaacaaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcccatgtaggtaatagttctgatggtaagggagagatagtgataggtggta 8949114  T
Q  202 tcataacatatataactat--gaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaa-aagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctc 298  Q
    |||| ||||| ||| ||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  8949113 tcatcacatacatagctataggcaattgggagtggatgaagaccaagggataaaacaagattgagggaaacaataagcttaacatagagaccctcatctc 8949014  T
Q  299 tatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgag 398  Q
    ||||||||||||||| | || ||| | |||| | |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8949013 tatgaacttcattaaacctcgtccccacatggcatatacatttaaactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgag 8948914  T
Q  399 gtggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttc 433  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  8948913 gttgaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttc 8948879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 423
Target Start/End: Original strand, 3988427 - 3988848
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  3988427 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 3988526  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaa-cacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggca 201  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| |    
T  3988527 ttaacaaccaccccattaaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtcggtaataggtttgatagtaggggagagatagttgtgggtggta 3988626  T
Q  202 tcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctat 301  Q
    |||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  3988627 tcatcacatacctagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaagcaataggcttaacatagagacccttatctttat 3988726  T
Q  302 gaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtg 401  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3988727 gaacttcattaagccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgtctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccaaggtg 3988826  T
Q  402 gaagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||||||||| || | |||||||    
T  3988827 gaagaaaatatgttgtatgttg 3988848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19877544 - 19877118
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19877544 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatatggggtaggactgagttgggaaacactaggacatatgagctttttatgttgtgggctat 19877445  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  19877444 gcttcataaccatcctgtgaacacttgcttttacttgcttgattatcttgcccatgttggtaatagggatgattgtaagggagagatagtagtgggtggt 19877345  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| || |||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||| ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||||    
T  19877344 atcatcacctataaagctaggaaattgggagtggatgagaaccaagggataaaccggattgagggcaacaatatgcttaacataccgaccctcatttcta 19877245  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    ||||||||||| | | ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19877244 tgaacttcattcaacctcatccacctatgaaatatacactcaaactcaatgtgcctcttttatttctactttctaacctatctcggactaacaccgaggt 19877145  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||    
T  19877144 ggaagaaaacttgttgtatgttggtga 19877118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 19783350 - 19783771
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||  | ||||||||    
T  19783350 ctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggactgaattagggaacactaggagtgatgaactcttcatactatgggctat 19783449  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  19783450 gttgcacaaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtctgatggtaagggagaaatagtagttggtggt 19783549  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| | ||| ||| ||  | || | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  19783550 atcatcatatacatagctgggcaactaggagtgagtgaggaccaaggtataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctcta 19783649  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    |||||||||| || | ||  |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19783650 tgaacttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttactttctaacctatctctgactaacaccgaggt 19783749  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgtt 422  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  19783750 ggaagaaaatttgttgtatgtt 19783771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 31 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 20072772 - 20072391
Alignment:
Q  31 cttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgctt 130  Q
    ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  20072772 cttgcactatttgaggtagaaccgaattgggaaacactaggacggatgaaccttttatgttgtgggctatgcttaacaaccatcccgtaaatacttgctt 20072673  T
Q  131 ttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattggga 230  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    |||||||||||||||||  || || |||||||| || || ||| ||| | |||| ||     
T  20072672 ttatttgcttgattacctttcccatgtaggtactaggtcaactggtaagggagagatagaggtaggaggcatcatcacttacatagctaggcaatttggg 20072573  T
Q  231 gtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatga 330  Q
    || |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| || | || ||||||||||     
T  20072572 gttggtgaggaccaaggaattaaaaggattgagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatgaacttcatcaaacctcgtccacccatgt 20072473  T
Q  331 cctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaattt 412  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072472 cctatacactcaagctcaatgtgcctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaattt 20072391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 22139001 - 22139171
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  22139001 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgtcatgggccatgc 22139100  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgat 173  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  22139101 ttaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtcggtaataggtctgat 22139171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 21800566 - 21800149
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||  |||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| |      
T  21800566 cttaggtaccttcaaagggttatagcttgtaccattaggggacggaaagaattagggaacactaggaatgatgaactcttcatgatttgggctatgttgc 21800467  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  21800466 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 21800367  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  21800366 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 21800267  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21800266 ttcatcaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 21800167  T
Q  406 aaaatttgctatatgttg 423  Q
     ||||||| | |||||||    
T  21800166 caaatttgttgtatgttg 21800149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16384169 - 16383739
Alignment:
Q  4 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 103  Q
    |||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||  || || ||    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16384169 tgcttaggtatcttgtaagggttatggcttgcaccatctggggtaggaaagagttaggaccaactaggacagatgagctctttatgctttgggctatgct 16384070  T
Q  104 taataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatc 203  Q
    |||| | || || || ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||| ||||| |||| |||| | ||||| |||||||| || ||||| |||    
T  16384069 taatgatcatcctgtgaacactttcttttacatgcttgattatctttcttctgttggtaagaggtctgatagaaagggtgagatagtggtaggtggtatc 16383970  T
Q  204 ataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatga 303  Q
    || || | |||  ||| ||| || || |||||||||||  |   ||||||  | |||| ||| ||||||||||||   ||||| ||||| ||| ||||||    
T  16383969 atcacttttattgctaggaagtttggtgtgggtgaggaaaacatgataaatcaaattgagggcaacaataggcttgatatagacaccctcatcactatga 16383870  T
Q  304 acttcattaagcatcatccacc------catgacctatacactcaaactcaatgtgcctg---ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacac 394  Q
     ||| ||||||| |||| | ||       |||||||||   || || |||||| ||||||    |||| |||| |||| ||||||| |||| ||| ||||    
T  16383869 cctttattaagcctcattcgccttataatatgacctatgagcttaagctcaatttgcctggatgtttgtttattcttcataacccacctcgaactgacac 16383770  T
Q  395 cgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 425  Q
    || |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16383769 cggggtggaagaaaatttgctttattttggt 16383739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 333 - 422
Target Start/End: Original strand, 20392141 - 20392230
Alignment:
Q  333 tatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 422  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20392141 tatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 20392230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 427
Target Start/End: Original strand, 20236194 - 20236263
Alignment:
Q  358 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  20236194 ttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccaaggtggagaaaaatttgttgtatgttggtga 20236263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 22626891 - 22626844
Alignment:
Q  2 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 49  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22626891 tgtgcttaggtaccttgaaagagttttgacttgcaccatatggggtag 22626844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21786231 - 21786165
Alignment:
Q  79 agctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  21786231 agctgtttatgttgtgggctatgctttataaccatcttattaacatttgctattatttgcttgatta 21786165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 2 - 427
Target Start/End: Original strand, 20106621 - 20107046
Alignment:
Q  2 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatg 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  20106621 tgtgcttaggtaccttcagagggttatggcttgcaccattttgggtaggactgaattgaggaacactaggacagatgaaatcttcatgtcgtgggctatg 20106720  T
Q  102 cttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggca 201  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |    
T  20106721 cttaacaaccaccccattaacacttgcttttacttgcttgattacctttcccatgtaggtaataggtctgatggtaagggagagatggtggtaggtggta 20106820  T
Q  202 tcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctat 301  Q
    |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  20106821 tcatcacatacatagctaggaaattgggagtgggtgaagaccaggggataaacaagattgaggaaaacaataggcttaacatagagactctcatctctat 20106920  T
Q  302 gaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtg 401  Q
    |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20106921 gaacttcattaaacctcgtccccccatgacctatacacttaaactcaatgtgcccgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtg 20107020  T
Q  402 gaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||||| | |||||||||||    
T  20107021 gaagaaaatttgttgtatgttggtga 20107046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15921858 - 15921433
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15921858 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcacaatttggggtaggattgaattggggaacactagaactgatgaactcttcatgttgtgggctat 15921759  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || | |||||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||     
T  15921758 gcttaacaaccaccccgttaacacttacttttccatgcttgattacctttcccatctcggtaataggtctaatggtaggggagagatagtggtaggtggt 15921659  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| ||||| |||  || | |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15921658 atcatcacatacatagttaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggat-aacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctt 15921560  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    |||||||||| || | ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15921559 tgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 15921460  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||    
T  15921459 ggaagaaaatttgttgtatgttggtga 15921433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Original strand, 823974 - 824400
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| |||||||     
T  823974 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcacaatttggggtaggattgaattggggaacactataactgatgaactcttcatgttatgggctac 824073  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||     
T  824074 gcttaacaaccaccccattaacacttacttttccttgcttgattacctttcccatctcggtaataggtctaatggtaggggagagatagtggtaggtggt 824173  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| ||||| |||  || | |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  824174 atcatcacatacatagttaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggattaacaagattgaggaaaacaataggcttaacatagaggcccttatcttta 824273  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    |||||||||| || | ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  824274 tgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 824373  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||    
T  824374 ggaagaaaatttgttttatattggtga 824400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Original strand, 15064108 - 15064534
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15064108 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcacaatttggggtaggattgaattggggaacactagaactgatgaactcttcatgttgtgggctat 15064207  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || | |||||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||     
T  15064208 gcttaacaaccaccccgttaacacttacttttccatgcttgattacttttcccatctcggtaataggtctaatggtaggggagagatagtggtaggtggt 15064307  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| | ||| |||  || | |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  15064308 atcatcatatacatagttaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggattaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaggcccttatctctt 15064407  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    |||||||||| || | ||  ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15064408 tgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaacccaacgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggt 15064507  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||    
T  15064508 ggaagaaaatttgttgtatgttggtga 15064534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 3 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16151398 - 16150978
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  16151398 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 16151299  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||| ||| || ||||||||| || ||||| ||    
T  16151298 ttaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccgtgacggtaataggtttgatagtagggaagagatagttgtgggtggtat 16151199  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    |||  |||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16151198 catcgcatacatagctaggcaattgagagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatg 16151099  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16151098 aacttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactccatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 16150999  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  16150998 aagaaaatttgttgtatgttg 16150978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 16530359 - 16530783
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaa---cactaggacagatgagctctttatgttgtgggc 97  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||   ||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||    
T  16530359 ctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggagtgaattagggaattacactaggagcgatgaactcttcatgctttgggc 16530458  T
Q  98 tatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggt 197  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| |||    
T  16530459 tatgctgcacaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggt 16530558  T
Q  198 ggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatct 297  Q
    || ||||||||||| |||  || | || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  16530559 ggtatcataacatacatagttaggcaactaggagtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatct 16530658  T
Q  298 ctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccga 397  Q
    ||||||| ||||| || | ||  |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16530659 ctatgaatttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgatattactgcctaacccatctcagactaacaccga 16530758  T
Q  398 ggtggaagaaaatttgctatatgtt 422  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  16530759 ggtggaagaaaatttgttgtatgtt 16530783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16635303 - 16634879
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaa---cactaggacagatgagctctttatgttgtgggc 97  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||   ||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||    
T  16635303 ctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggagtgaattagggaattacactaggagcgatgaactcttcatgctttgggc 16635204  T
Q  98 tatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggt 197  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| |||    
T  16635203 tatgctgcacaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggt 16635104  T
Q  198 ggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatct 297  Q
    || ||||||||||| |||  || | || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  16635103 ggtatcataacatacatagttaggcaactaggagtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatct 16635004  T
Q  298 ctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccga 397  Q
    ||||||| ||||| || | ||  |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16635003 ctatgaatttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgatattactgcctaacccatctcagactaacaccga 16634904  T
Q  398 ggtggaagaaaatttgctatatgtt 422  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  16634903 ggtggaagaaaatttgttgtatgtt 16634879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16761670 - 16761252
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16761670 ctgtacttaggtaccttcaaatggttatggcttgcac---ttggggaaggagtgaattagggaacactaggagcgatgaactcttcatgttttgggctat 16761574  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||  | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||  |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| |||||     
T  16761573 gctgcacaaccaccccgttaacacttgtttttacttacttgactacctttcccatatagtaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggt 16761474  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||||||||| ||| ||| | || | |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||    
T  16761473 atcataacatacatagctaggcaactaggagtgagtgaagaccaagagataaacaagattaagggaaacaataggctaaacataaacacccttatctcta 16761374  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    |||| ||||| || | ||  |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16761373 tgaatttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttactgcctaacccatctcggactaacaccgaggt 16761274  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgtt 422  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  16761273 ggaagaaaatttgttgtatgtt 16761252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 228 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 48803490 - 48803279
Alignment:
Q  228 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 327  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  48803490 ggagtgggtgaggacgaggggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaaccctcatttctatgaatttcattaagcatcgtccaccca 48803391  T
Q  328 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  48803390 tgacttatgcacttaaactcaatgtgcctcttttgtttctacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttggtga 48803291  T
Q  428 aggttcacaggt 439  Q
     |||||||||||    
T  48803290 tggttcacaggt 48803279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18595161 - 18594744
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  18595161 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 18595062  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18595061 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtcagatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 18594962  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  18594961 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 18594862  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18594861 ttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 18594762  T
Q  406 aaaatttgctatatgttg 423  Q
     ||||||| | |||||||    
T  18594761 caaatttgttgtatgttg 18594744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Original strand, 18616523 - 18616940
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  18616523 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 18616622  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18616623 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtcagatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 18616722  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  18616723 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 18616822  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18616823 ttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 18616922  T
Q  406 aaaatttgctatatgttg 423  Q
     ||||||| | |||||||    
T  18616923 caaatttgttgtatgttg 18616940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Original strand, 13672179 - 13672596
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| |      
T  13672179 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgttgc 13672278  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  13672279 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 13672378  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  13672379 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 13672478  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13672479 ttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 13672578  T
Q  406 aaaatttgctatatgttg 423  Q
     ||||||| | |||||||    
T  13672579 caaatttgttgtatgttg 13672596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 427
Target Start/End: Original strand, 13656292 - 13656715
Alignment:
Q  4 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 103  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||| |  ||  | || |  |||||||| ||||| |||||| || | ||||| |||||    
T  13656292 tgcttagatacctccaaagagtcatggcttgtaccatttggggtagaaaagaggtaggaacaactaggacggatgaactctttctgctttgggcaatgct 13656391  T
Q  104 taataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatc 203  Q
    || |||| |||||| | | |||||||| ||| | ||||||||||||||||   |||||  |||   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| |||    
T  13656392 tagtaacaaccccgctcatacttgcttctacctacttgattacctttcctccataggttctagacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatc 13656491  T
Q  204 ataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatga 303  Q
    || || |  ||  ||| ||| || |||||| |||| | | |||| |||||    |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| | |||||||    
T  13656492 atcaccttcatcgctaggaagtttggagtgagtgaagccgaaggaataaatccaattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgtatctatga 13656591  T
Q  304 acttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 403  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||   | | ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656592 atttcattaagcttcatccacccatgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttttgtttctgcttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 13656691  T
Q  404 agaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
     |  |||||| | |||||||||||    
T  13656692 ggcgaatttgttgtatgttggtga 13656715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16467291 - 16467047
Alignment:
Q  183 gagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatca 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |  || |||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||| |||||||||||||  |    
T  16467291 gagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcactaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgagggcaacaataggcttaata 16467192  T
Q  283 tagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatc 382  Q
    | || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||| || |||||| |||||||||    
T  16467191 ttgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttgtttctacttcgtaacccatc 16467092  T
Q  383 tcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16467091 tcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 16467047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 115
Target Start/End: Original strand, 12768768 - 12768821
Alignment:
Q  62 gaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12768768 gaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccc 12768821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 18286046 - 18286407
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 165  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||   ||||   ||    
T  18286046 actaggacggatgaactttttatggtttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcctccataggagcta 18286145  T
Q  166 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 265  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  18286146 gacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggg 18286245  T
Q  266 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 365  Q
     |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| | ||  ||||     | ||| ||||  ||    
T  18286246 caacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcccttcaacttcgcatacctcttttattt 18286345  T
Q  366 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  18286346 ctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 18286407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 8716285 - 8716646
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 165  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||   ||||   ||    
T  8716285 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcctccataggagcta 8716384  T
Q  166 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 265  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  8716385 gacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggg 8716484  T
Q  266 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 365  Q
     |||||||| ||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||  ||||  ||    
T  8716485 caacaatagacttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcataccacttttattt 8716584  T
Q  366 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  8716585 ctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 8716646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 72
Target Start/End: Original strand, 15460464 - 15460533
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactagga 72  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15460464 gtgcttaggtatcttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactagga 15460533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 12760868 - 12760932
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaac 65  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||    
T  12760868 ctgtgcttaagtaccttcaaagggttatgacttgcactatttagagtaggactgaattggggaac 12760932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 13740768 - 13740912
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||  | || |  |  ||||| | || ||| |||||| ||||||||||    
T  13740768 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatatggggtagaaaagaggtaggaatgatgaggactgttgtgctatttatgatgtgggctat 13740867  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 145  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  13740868 gctttataaccaccatgttaacatttgctattatttgctttatta 13740912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 427
Target Start/End: Original strand, 14549818 - 14549878
Alignment:
Q  367 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  14549818 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 14549878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Original strand, 4311083 - 4311220
Alignment:
Q  8 taggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaat 107  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||  ||  | || |  |  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  4311083 taggtaccttcaaagagttatcgcttgcaccatatggggtaggaaagatgtaggaatgatgaggaccaatgagctgtttatgttgtgggctatgctttat 4311182  T
Q  108 aaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 145  Q
    |||||||  ||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  4311183 aaccaccatgttaacatttgttattatttgcttgatta 4311220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8783955 - 8783811
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||  ||  | || |  |  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||     
T  8783955 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatataaggtaggaaagaggtaggaataatgaggactgatgagctgtttatcttgtgggctac 8783856  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 145  Q
      || |||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  8783855 aatttataaccaccatgttaacatttgctattatttgcttgatta 8783811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 11956715 - 11956667
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtagga 51  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11956715 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtagga 11956667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 145
Target Start/End: Original strand, 12565423 - 12565493
Alignment:
Q  75 gatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  12565423 gatgagctgtttatgttgtgggctatgctttataaccatcctattaaaatttgctattatttgcttgatta 12565493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 48803714 - 48803557
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||  ||  | || |  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  48803714 gtgcttaggtaccttcaaagagtcatg-cttgtaccatttggggtaggaaagaggtaggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgc 48803616  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggt 161  Q
    ||| |||  ||| ||| || ||||| || ||| | |||||||||||| ||| | |||||    
T  48803615 ttagtaataacctcgtgaatacttgtttctacctacttgattaccttgcctctataggt 48803557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14223424 - 14223348
Alignment:
Q  69 aggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 145  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  14223424 aggactgatgagctatttatgttatgagacatgctttataaccaccatgttaacatttgctattatttgcttgatta 14223348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 23513417 - 23513465
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 49  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  23513417 ctgtgcttaggtaccttcacatggttattgcttgcaccatatggggtag 23513465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 129
Target Start/End: Original strand, 23513493 - 23513545
Alignment:
Q  77 tgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgct 129  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  23513493 tgagctatttttgttgtgggctatgctttataaccaccatgttaacatttgct 23513545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Original strand, 18446551 - 18446990
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaa-gggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 99  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||    
T  18446551 ctgtgcttaagtaccttcaaaagggttatggcttgcataatttggggtaggattgaattggggaacactagaactgatgaactcttcacgttgtgggcta 18446650  T
Q  100 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 199  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||    
T  18446651 tgcttaacaaccaccccattaacacttgcttttccttgcttgattacctttcccaggtaggtaataggtctgatggtaggggagagatagtggtaggtgg 18446750  T
Q  200 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 299  Q
     ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18446751 tatcatcacataaatagctaggaaattgggagtgggtgaagaccaagggatcaacaagattgaggtaaacaataggcttaacatagagacccttatctct 18446850  T
Q  300 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 399  Q
    ||||||||||| || | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18446851 atgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacactcaaactcaatgtgcctgttttcattatacttcctaacccatctcgaactaacaccgagg 18446950  T
Q  400 tggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  18446951 tggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcgcaggt 18446990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21562347 - 21561926
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21562347 ctgtacttaggtacctttaaagggttatggcttgcactatttgcggaaggactgaattagggaacactaggagcgatgaactcttcatgttatgggctat 21562248  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    | |  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  21562247 gttgtacaaccaccccgttaacacttgcttttactttcttgactacctttcccatataggaaataggtctgatggtaagggagaaatagtagttggtggt 21562148  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| ||||| ||| ||  | || | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||  ||||||| ||||    
T  21562147 atcatcacatacatagctgggcaactaggagtgagtgaggaccaaggaataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacgcccttatttcta 21562048  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    |||||||||| || | |   |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21562047 tgaacttcataaaaccttgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttacttcctaacccatttcggactaacaccgaggt 21561948  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgtt 422  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  21561947 ggaagaaaatttgttgtatgtt 21561926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20018132 - 20017715
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  20018132 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 20018033  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  20018032 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 20017933  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  20017932 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 20017833  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20017832 ttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 20017733  T
Q  406 aaaatttgctatatgttg 423  Q
     ||||||| | |||||||    
T  20017732 caaatttgttgtatgttg 20017715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22167447 - 22167030
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  22167447 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 22167348  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  22167347 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 22167248  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  22167247 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 22167148  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22167147 ttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 22167048  T
Q  406 aaaatttgctatatgttg 423  Q
     ||||||| | |||||||    
T  22167047 caaatttgttgtatgttg 22167030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 11218205 - 11218341
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11218205 ctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggattgaattagggaacactaggagcgatgaactcttcatgttatgggctat 11218304  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttg 137  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11218305 gctgcataaccaccccgttaacacttgcttttacttg 11218341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 413
Target Start/End: Original strand, 20168555 - 20168962
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||  |||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| |      
T  20168555 cttaggtaccttcagagggttatagcttgtaccattaggggacggaaagaattagggaacactaggaatgatgaactcttcatgatttgggctatgttgt 20168654  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
      ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  20168655 gcaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 20168754  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
     ||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| || || | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  20168755 cacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaaaatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 20168854  T
Q  306 ttcattaagcatc-atccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaa 404  Q
    ||||| ||   || |  | || |||  |||| ||||| |||| ||||||||  | |||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20168855 ttcataaaaactcgagtcccctatg-tctatgcactccaactaaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccacctcgaactaacaccgaggtggaa 20168953  T
Q  405 gaaaatttg 413  Q
    | |||||||    
T  20168954 gcaaatttg 20168962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 427
Target Start/End: Original strand, 18010461 - 18010630
Alignment:
Q  258 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 357  Q
    |||| ||||||||| | ||| | ||| || ||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| | |||     
T  18010461 attgagggaaacaacatgctaaacattgaaaccctcatttctatgaatttcatcaaacttcatccacccatgacttatgcactccaacttaatataccta 18010560  T
Q  358 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18010561 ttttctttctacttcctaacccatctcggactaacaccaaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtga 18010630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22768974 - 22768605
Alignment:
Q  54 gaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 153  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| |  | |||||  || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  22768974 gaattggggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgttgcacaaccaaaccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttccc 22768875  T
Q  154 atgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaa 253  Q
     | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| || || || |||||||| ||| ||  |  ||| || |||  ||| |||| |||||||||    
T  22768874 ttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagtggggggtattataacatacatagctgggcgattcggtgtgaatgaagacctagggataaa 22768775  T
Q  254 aaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtg 353  Q
     ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || ||||||||||| ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||| ||||||    
T  22768774 caagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaatttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactgaatgtg 22768675  T
Q  354 cctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||  | || ||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  22768674 cccatcttaattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttg 22768605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8725857 - 8725433
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||| |  ||  | || |  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  8725857 gtgcttagatacctccaaagagtcatggcttgtaccatttggggtagaaaagaggtaggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgc 8725758  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    ||| |||| | ||  || | |||||||| ||| | ||||||||||||||||   |||||  |||   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||    
T  8725757 ttagtaacaatcctttttatacttgcttctacctacttgattacctttcctccataggtgctagacctgataatatagctgagatagtagtcggtggtat 8725658  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| || |  || |||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||||    |||| ||| ||||||||| |||  || || |||||| |  |||||    
T  8725657 cattaccttcatcactaggaagtttggagtgggtgaggaagaagggataaatccaattgagggcaacaataggtttaatattgaaacccttgttgctatg 8725558  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    || |||||||||  ||  || |||||||| ||| ||||  || |   | | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8725557 aatttcattaagattctccctcccatgacttatgcacttcaatttcgtttacctcttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtgg 8725458  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    | ||||||||| | |||||||||||    
T  8725457 aggaaaatttgttgtatgttggtga 8725433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22581197 - 22581109
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatg 89  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22581197 ctgtgcttaggtacctttaaagggttatggtttgcaccatctggggttggactgagttagggaacactgggacagatgagctttttatg 22581109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22583987 - 22583899
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatg 89  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22583987 ctgtgcttaggtacctttaaagggttatggtttgcaccatctggggttggactgagttagggaacactgggacagatgagctttttatg 22583899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22588818 - 22588730
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatg 89  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22588818 ctgtgcttaggtacctttaaagggttatggtttgcaccatctggggttggactgagttagggaacactgggacagatgagctttttatg 22588730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 24856736 - 24856676
Alignment:
Q  367 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  24856736 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 24856676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 89
Target Start/End: Original strand, 29684883 - 29684969
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatg 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| | |||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  29684883 gtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggtaggaaggaaataggggcaactaggactgatgagctatttatg 29684969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 148
Target Start/End: Original strand, 18010225 - 18010370
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||  | || |  ||||| || ||||| || |||||| | ||||| ||||    
T  18010225 gtgcttaggtacctacaaagggtcatggcttgtaccatttggggtaggaaagacgtaggaacaactagaacggatgaactttttatgctttgggcgatgc 18010324  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacct 148  Q
    ||| |||| ||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  18010325 ttagtaacaaccccgtgaatacttgtttctacttacttgattacct 18010370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19587349 - 19587281
Alignment:
Q  76 atgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatt 144  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  19587349 atgagctgtttatgttgtgggctatgctttataaccaccatgttaaaatttgctattatttgcttgatt 19587281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 19589410 - 19589371
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19589410 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccat 19589371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 17817866 - 17817914
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 49  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17817866 ctgtgcttaggtaccttcacacggttatggcttgcaccatatggggtag 17817914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 18189432 - 18189384
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||    
T  18189432 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcataatatggggtag 18189384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 18852369 - 18852417
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 49  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18852369 ctgtgcttaggtaccttcacatggttatggcttgcaccatatggggtag 18852417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 129
Target Start/End: Original strand, 18852446 - 18852498
Alignment:
Q  77 tgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgct 129  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  18852446 tgagctgtttatgttgtgggttatgctttataaccaccatgttaacatttgct 18852498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 3 - 423
Target Start/End: Original strand, 11800 - 12220
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  11800 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 11899  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  11900 ttaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgacggtaataggtttgatagtaggggagagatagttgtgggtggtat 11999  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12000 catcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatg 12099  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12100 aacttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 12199  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  12200 aagaaaatttgttgtatgttg 12220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 3 - 423
Target Start/End: Original strand, 3352938 - 3353358
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||    
T  3352938 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatggcttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgttgtgggtcatgc 3353037  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  3353038 ttaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttgcttacctttcccatgtcggtaataggtcggatggtaggggagagatagttgtgggtggtat 3353137  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3353138 catcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatg 3353237  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3353238 aacttcattaagccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattgtacttcctaacccatctcgaactaacaccgaggtgg 3353337  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  3353338 aagaaaatttgttgtatgttg 3353358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 408
Target Start/End: Original strand, 15863851 - 15864256
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||    
T  15863851 gtgcttaggtaccttcaacgggttatggcttgcactatttgggggagaattgaattaggaaacactaggacggatgaactattcatgttgtgggccatgc 15863950  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  15863951 ttaacaaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcccatgtaggtaatatgtctgatggtaaggaagagatagttgtgggtggtat 15864050  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| || || ||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15864051 catcacgtacatatctaggcaattgggagtgggtgaggactaagggataaacaaaattgagggtaacaataggcttaacatagagacccttatttctatg 15864150  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15864151 aacttcattaagcatcatacacccatttcctacacactcaaactcaatgtgcctgttttaattgtacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 15864250  T
Q  403 aagaaa 408  Q
    ||||||    
T  15864251 aagaaa 15864256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15261951 - 15261535
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  15261951 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggagtggattagggaacactaggagtgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 15261852  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| || ||||| ||||| |||||    
T  15261851 acaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttaacaacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatcgtagttggtggtatcat 15261752  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||| |   || || ||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||     
T  15261751 aacatacatagctaggcggttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagatcgagggtaacaataggctgaacatagaaaccgttatctctatgaat 15261652  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| ||   ||     ||| |    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15261651 ttcataaaaactcgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 15261552  T
Q  406 aaaatttgctatatgtt 422  Q
    |||||||| | ||||||    
T  15261551 aaaatttgttgtatgtt 15261535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 16680712 - 16681021
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  |||||  |||| ||| | ||||||||    
T  16680712 ctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttttactatttggggaaggagtgaattagggaacactaggagtgatgaaatcttcatgctttgggctat 16680811  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||  | || | ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||| |||||||   || ||| |||||| |||||||| |||||     
T  16680812 gctgcacaagccccccgttaacacttgtttttacttgcttggctacctttcccatataggaaataggtccaatagtaggggagaaatagtagttggtggt 16680911  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||||||||| ||| ||| | || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  16680912 atcataacatacatagctaggcaactaggagtgagtgaagaccaagggataaagaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctcta 16681011  T
Q  301 tgaacttcat 310  Q
    |||| |||||    
T  16681012 tgaatttcat 16681021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Original strand, 13821231 - 13821648
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  13821231 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 13821330  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  13821331 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 13821430  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  13821431 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 13821530  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13821531 ttcatcaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 13821630  T
Q  406 aaaatttgctatatgttg 423  Q
     ||||||| | |||||||    
T  13821631 caaatttgttgtatgttg 13821648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 427
Target Start/End: Original strand, 15252883 - 15253127
Alignment:
Q  183 gagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatca 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |  ||| ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||| |||||||||||||  |    
T  15252883 gagatagtagtcggtggtatcattaccttcatagctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgagggtaacaataggcttaata 15252982  T
Q  283 tagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatc 382  Q
    | || || ||| |  | ||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||| || |||||||||| |||||    
T  15252983 ttgaaactcttgttgccatgaatttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttgtttctacttcctaatccatc 15253082  T
Q  383 tcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  15253083 tcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 15253127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11918562 - 11918419
Alignment:
Q  2 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  ||| ||||||  |  ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||    
T  11918562 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatatagggtaggaaagaagtggggatgatgaggactgatgaactgtttatgttatgggcaatg 11918463  T
Q  102 cttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 145  Q
    ||  | |||| ||| || ||||||||||  || |||||||||||    
T  11918462 ctctacaaccgccctgtgaacacttgctactatttgcttgatta 11918419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 427
Target Start/End: Original strand, 22109682 - 22109742
Alignment:
Q  367 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  22109682 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 22109742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 45240724 - 45240580
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||| |  ||  | || |  |  ||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  45240724 ctgtgcttaggtaccttcacacggttatggcttgcaccatatggggtagaaaagaggtaggaatgatgaggactgttgagctgtttatgttgtgggctat 45240625  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 145  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  45240624 gctttataaccaccatgttaacatttgctattatttgctttatta 45240580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Original strand, 15252766 - 15252853
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 153  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  15252766 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcct 15252853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 151
Target Start/End: Original strand, 12513575 - 12513720
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    ||||| ||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||   || ||||    |||||  | |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12513575 cttagatacattcaaagttttatggcatgcaccatttggggtaggacgaaagtgggaccgactagagcggatgagttgtttatgttgtgggctatgctta 12513674  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttc 151  Q
    | || | | | || ||||| || |||||||||||| |||| |||||    
T  12513675 acaatctctctgtgaacacctgtttttacttgcttaattatctttc 12513720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 3 - 423
Target Start/End: Original strand, 21202 - 21622
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||  ||||| ||||    
T  21202 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggaaggataaactcttcatgtcatgggccatgc 21301  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  21302 ttaacaacaaccccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtcggtaataggtctgatagtaggggagagatagttgtgggtggtat 21401  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21402 catcacatacatagctaggaaattgggagtgggtaaggaccaagggattaacaacattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatg 21501  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21502 aacttcattaagccccatccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacactgaggtgg 21601  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  21602 aagaaaatttgttgtatgttg 21622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8363 - 7938
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    
T  8363 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatctagggtaggatcgaattggggaacactaggacaaatgaactcttcatgttgtgggccat 8264  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || |||||     
T  8263 gctaaacaaccaccccgttaatacttgcttttacatgcttgactacctttcccatgtaggtagtaggtctgatggtaggggagagatagttgtaggtggt 8164  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| || |||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  8163 atcataacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggatcaacaagattaaggggaataataggcttaacatagagatccttgtctcta 8064  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8063 tgaacttcattaaacctcgaccacccatggcttatacactcaaa-tcaacgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagct 7965  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||    
T  7964 ggaagaaaatttgttgtatgttggtga 7938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 439
Target Start/End: Original strand, 43788 - 44216
Alignment:
Q  2 tgtgcttaggtaccttcaaa-gggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  43788 tgtgcttaggtaccttcaaaagggttatggcttgcataatttggggtaggattgaattggggagcactagaactgatgaactcttcatgctgtgggctat 43887  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||     
T  43888 gcttaacaaccaccccgtcaacactt----------gcttgattacctttcctatgtaggtaataggtctgatggtaggggagagatagtggtaggtggt 43977  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43978 atcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctcta 44077  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    |||||||||| || | ||  ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44078 tgaacttcataaaacctcgaccacccatggcatatacactaaaaatcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 44177  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  44178 ggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcgcaggt 44216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 439
Target Start/End: Original strand, 51177 - 51605
Alignment:
Q  2 tgtgcttaggtaccttcaaa-gggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  51177 tgtgcttaggtaccttcaaaagggttatggcttgcataatttggggtaggattgaattggggagcactagaactgatgaactcttcatgctgtgggctat 51276  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||     
T  51277 gcttaacaaccaccccgtcaacactt----------gcttgattacctttcctatgtaggtaataggtctgatggtaggggagagatagtggtaggtggt 51366  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51367 atcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctcta 51466  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    |||||||||| || | ||  ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51467 tgaacttcataaaacctcgaccacccatggcatatacactaaaaatcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 51566  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  51567 ggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcgcaggt 51605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Original strand, 131974 - 132400
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  131974 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcacaatttggggtaggattgaattggggaacactagaactgatgaactcttcatgttgtgggctat 132073  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||     
T  132074 gcttaacaaccaccccgttaacacatgcttttccttgcttgattacctttcccatctcggtaataggtctaatggtaggggagagatagtggtaggtggt 132173  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| || || |||  || | ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||     
T  132174 atcatcacgtacatagttaggcaattgagagtgggtgaagaccaagggattaacaagattgagggtaacaataggcttaacatagaggcccttttctctt 132273  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    |||||||||| || | ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132274 tgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 132373  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||    
T  132374 ggaagaaaatttgttgtatgttggtga 132400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 16718 - 16846
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||  |  | |  |  ||||| | |||||  |||||||||||||||||    
T  16718 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatatggggtagcaaagaggtatgaatgataaggactgttgagccgtttatgttgtgggctat 16817  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgct 129  Q
    |||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  16818 gctttataaccaccatgttaacatttgct 16846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20597732 - 20597315
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  20597732 cttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattgaggaacactaggatggatgaactcttcatgtcgtgggccatgctta 20597633  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||    
T  20597632 acaaccacctcgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgacggtaataggtttgatagtacgggagagatagttgtgggtggtatcat 20597533  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
     ||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20597532 cacatacatagctaggcaattgagagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaac 20597433  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20597432 ttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 20597333  T
Q  406 aaaatttgctatatgttg 423  Q
    |||||||| | |||||||    
T  20597332 aaaatttgttgtatgttg 20597315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20604029 - 20603612
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  20604029 cttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattgaggaacactaggatggatgaactcttcatgtcgtgggccatgctta 20603930  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||    
T  20603929 acaaccacctcgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgacggtaataggtttgatagtacgggagagatagttgtgggtggtatcat 20603830  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
     ||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20603829 cacatacatagctaggcaattgagagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaac 20603730  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20603729 ttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 20603630  T
Q  406 aaaatttgctatatgttg 423  Q
    |||||||| | |||||||    
T  20603629 aaaatttgttgtatgttg 20603612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 3 - 423
Target Start/End: Original strand, 26845986 - 26846406
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  26845986 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtatgaccgaattggggaatactagaacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 26846085  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  26846086 taaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtcagtaataggtctgatagtaggggagagatagttgtgggtggtat 26846185  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26846186 catcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaacattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatg 26846285  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26846286 aacttcattaagccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatcttggaataacaccgaggtgg 26846385  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  26846386 aagaaaatttgttgtatgttg 26846406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20610348 - 20609931
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  20610348 cttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattgaggaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgctta 20610249  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||    
T  20610248 acaaccacctcgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgacggtaataggtttgatagtacgggagagatagttgtgggtggtatcat 20610149  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
     ||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20610148 cacatacatagctaggcaattgagagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaac 20610049  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20610048 ttcattaagccctatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatatgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 20609949  T
Q  406 aaaatttgctatatgttg 423  Q
    |||||||| | |||||||    
T  20609948 aaaatttgttgtatgttg 20609931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 423
Target Start/End: Original strand, 18071230 - 18071650
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  18071230 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattgaggaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 18071329  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  18071330 ttaacaaccacctcgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgacgataataggtttgatagtacgggagagatagttgtgggtggtat 18071429  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| ||||| ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||    
T  18071430 catcacatacatacctaggcaattaggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaccaataggcttaacataaagacccttctctttatg 18071529  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18071530 aacttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 18071629  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  18071630 aagaaaatttgttgtatgttg 18071650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Original strand, 22946777 - 22947213
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  22946777 gtgcataggtaccttaaaagggttatggcttgcaccatctggggtaggactgagttagggaagactaggacagatgagttttttatattgtgggctatgc 22946876  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  22946877 ttaataaccaccctgtgaacacttgctattacttgcttgattatatcgcctatgtatgtaataggtctgacggtaagggagagatagtaatgggtggtat 22946976  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| || |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22946977 catcacctatatagctaggaagttgggagtgggtgaggaccaagggataaatcagattgagggcaacaataggcttaacatagagacccttatttctatg 22947076  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    |||||||| |||| |||||| ||  || | |||  |||||| |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22947077 aacttcatcaagcctcatccgcctgtggcatatgaactcaagctcaatgtgcctcttttatttatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 22947176  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  22947177 aagaaaatttgttgtatgttggtgatggtccacaggt 22947213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20792671 - 20792258
Alignment:
Q  10 ggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataa 109  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||    
T  20792671 ggtaccttcaaaaggtaatgactagcactatttggggtaggaccgaagaggggaacactaggaaggatgaactcttcatgtcgtgggccatgcttaacaa 20792572  T
Q  110 ccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataaca 209  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||   | ||||| ||||| |||    
T  20792571 ccaccccgttaacacatgtttttatttgcttgattacctttcccatgatggtaataggtttgatagtaggggagagatagctatgggtggtatcatcaca 20792472  T
Q  210 tatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttca 309  Q
    || ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20792471 tacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggagtacaaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttca 20792372  T
Q  310 ttaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaa 409  Q
    ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20792371 ttaagccccatccacccatgtcctacacactcaaactcattgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaa 20792272  T
Q  410 tttgctatatgttg 423  Q
    |||| | |||||||    
T  20792271 tttgttgtatgttg 20792258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 23521042 - 23520623
Alignment:
Q  4 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 103  Q
    |||||||| |||||||| | || | | ||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||| ||| |||||||||    
T  23521042 tgcttaggcaccttcaacgagtgacggcttgcactatttggggtagaaccgaattgggaaacactaggacggatgaacctttcatgctgtaggctatgct 23520943  T
Q  104 taataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatc 203  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    |||||||||||||||||  || || ||||||    
T  23520942 taacaaccatcccgtaaatacttgcttttatttgcttgattacctttcccatgtaggtactaggtcaactggtaagggagagataggggtaggaggcatc 23520843  T
Q  204 ataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatga 303  Q
    || || || ||| ||| | |||| || || |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  23520842 atcacttacatagctaggcaatttggggttggtgaggaccaaggaattaaaaggattgagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatga 23520743  T
Q  304 acttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 403  Q
    ||||||| || | || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23520742 acttcatcaaacctcgtccacccatgtcctatacactcaagctcaatgtgcctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 23520643  T
Q  404 agaaaatttgctatatgttg 423  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  23520642 agaaaatttgttgtatgttg 23520623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25118043 - 25117622
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  25118043 ctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgtactatttggggaaggagtgaattagggaacactaggagtgatgaactcttcatgctttgggctat 25117944  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| |||||     
T  25117943 gctgcacaaccaccccgtcaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggt 25117844  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||| | |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  25117843 atcataacatacatagctaggaaactaggagtgagtgaagaccaagagataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctcta 25117744  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    |||| ||||| || | ||     ||| |    ||||||||||||||||| |||||   ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25117743 tgaatttcataaaacctcgaatcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccactttgatattactgcctaacccatctcggactaacaccgaggt 25117644  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgtt 422  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  25117643 ggaagaaaatttgttgtatgtt 25117622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25177134 - 25176713
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  25177134 ctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgtactatttggggaaggagtgaattagggaacactaggagtgatgaactcttcatgctttgggctat 25177035  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| |||||     
T  25177034 gctgcacaaccaccccgtcaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggt 25176935  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||| | |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  25176934 atcataacatacatagctaggaaactaggagtgagtgaagaccaagagataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctcta 25176835  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    |||| ||||| || | ||     ||| |    ||||||||||||||||| |||||   ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176834 tgaatttcataaaacctcgaatcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccactttgatattactgcctaacccatctcggactaacaccgaggt 25176735  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgtt 422  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  25176734 ggaagaaaatttgttgtatgtt 25176713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20440056 - 20439639
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  20440056 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgtactatttggggaaggagtgaattagggaacagtaggagcgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 20439957  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  ||| ||   ||||| |||||||| | ||| |||||    
T  20439956 acaaccaccccgtttacacttgtttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatagtcgaggagaaatagtagttgatggtatcat 20439857  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||| | || | || ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||     
T  20439856 aacatacatagctaggcaactaggcgtgagtgatgaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaat 20439757  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| || | ||     ||| |    ||||  ||||| || ||||||||   ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20439756 ttcataaaacctcgaatcccctttgtttatatgctcaagcttaatgtgcccactttgatattattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 20439657  T
Q  406 aaaatttgctatatgttg 423  Q
    |||||||| | |||||||    
T  20439656 aaaatttgttgtatgttg 20439639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30765001 - 30764692
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| | |||||||||||||  || || ||||| ||||| ||||||||    
T  30765001 ctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactattaggggaaggactgaactagggaacactaggaacgacgaactcttcatgttatgggctat 30764902  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| |||||| || ||||| |||||     
T  30764901 gctgcacaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatagtaggggagaaatcgtagttggtggt 30764802  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||||||||| ||| ||| | || | |||||  |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||    
T  30764801 atcataacatacatagctaggcaactaggagttagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatagcta 30764702  T
Q  301 tgaacttcat 310  Q
    |||| |||||    
T  30764701 tgaatttcat 30764692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 24955069 - 24954652
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  24955069 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 24954970  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  24954969 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 24954870  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  24954869 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 24954770  T
Q  306 ttcat-taagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaa 404  Q
    |||||  || | | |  | ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24954769 ttcatcaaaacttgagtc-ccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaa 24954671  T
Q  405 gaaaatttgctatatgttg 423  Q
    | ||||||| | |||||||    
T  24954670 gcaaatttgttgtatgttg 24954652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 427
Target Start/End: Original strand, 21386656 - 21387077
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||  ||  | || |  |||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||    
T  21386656 gtgcttaggtaacttcaaagggttatggattgtaccatttgaggtaggaaagaggtaggaacaactaggacggatgagctcttaattctttgggcaatgc 21386755  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    ||| |||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | |||||  ||||   ||   ||  |  |||||||| || ||||| ||    
T  21386756 ttagtaacaaccccattaatacttgtttttacttgcttgattatcttgcctctataggtgctaggcccgacaatagagctgagatagtggtaggtggtat 21386855  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| || |  |   ||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| |||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||    
T  21386856 cattaccttaagtgctaggaagtttggagtgggtgaggacaaagggataaatccaattgagggcaacaatagacttaacattgaaaccctcatttctatg 21386955  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||| | |||  ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  21386956 aacttcattaagcatcgtccgcctatggcatatgaactcaaactcaatgtgcctattttatttctacttcctaacc---cttggactaacaccgaggtgg 21387052  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||| ||||||  | |||||||||||    
T  21387053 aagcaaattttttgtatgttggtga 21387077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22319276 - 22318916
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 165  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||   |||||  ||    
T  22319276 actaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgcttagtaacaaccccgttcatacttgcttttacctacttgattacctttcctccataggtgcta 22319177  T
Q  166 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 265  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||| ||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  22319176 gacctgataatagagctgagatagtagttggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagaggggataaatccaattgaggg 22319077  T
Q  266 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 365  Q
     |||||||||||||  || || |||||| |  ||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||   | | ||| ||||| ||    
T  22319076 caacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaatttcattaagattcacccacc-atgacctatgcacttcaacttcgtatacctcttttgttt 22318978  T
Q  366 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||    
T  22318977 ctatttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaggcaaatttgttgtatgttggtga 22318916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 427
Target Start/End: Original strand, 23746634 - 23746833
Alignment:
Q  228 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 327  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  23746634 ggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgttactatgaacttcattaagattcacccaccca 23746733  T
Q  328 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  23746734 tgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 23746833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 25008459 - 25008215
Alignment:
Q  183 gagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatca 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||  |||||||||||||  |    
T  25008459 gagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggacaacaataggcttaata 25008360  T
Q  283 tagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatc 382  Q
    | || |||||| |  | |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || ||||||||||||||||    
T  25008359 ttgaaacccttgttgcgatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatc 25008260  T
Q  383 tcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  25008259 tcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 25008215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 15733955 - 15734316
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 165  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||   ||||   ||    
T  15733955 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcctccataggagcta 15734054  T
Q  166 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 265  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || |||| |||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  15734055 gacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagcgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggg 15734154  T
Q  266 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 365  Q
     |||||||| ||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||  ||||  ||    
T  15734155 caacaatagacttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcataccacttttattt 15734254  T
Q  366 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  15734255 ctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 15734316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 427
Target Start/End: Original strand, 20620885 - 20620945
Alignment:
Q  367 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  20620885 tacttcctaacccatctcggactaaccccaaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 20620945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18487860 - 18487790
Alignment:
Q  75 gatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  18487860 gatgagctgtttatgttgtgggctatgctttataaccatcctattaacatttgctattatttgcttgatta 18487790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20446706 - 20446581
Alignment:
Q  4 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 103  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||| |  ||  | || |  |  ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||    
T  20446706 tgcttaggtaccttcacatggttatggcttgcaccatatggggtagaaaagaggtaggaatgatgaggactgttgagctgtttatgttgtaggctatgct 20446607  T
Q  104 taataaccaccccgttaacacttgct 129  Q
    | |||||||||  ||||||| |||||    
T  20446606 ttataaccaccatgttaacatttgct 20446581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 21282774 - 21282726
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 49  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21282774 ctgtgcttaggtaccttcacacggttatggcttgcaccatatggggtag 21282726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 24218184 - 24218232
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 49  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24218184 ctgtgcttaggtaccttcacacggttatggcttgcaccatatggggtag 24218232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 30764631 - 30764599
Alignment:
Q  373 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30764631 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 30764599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Original strand, 23746472 - 23746559
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 153  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  23746472 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcct 23746559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 25008576 - 25008489
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 153  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  25008576 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcct 25008489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 129
Target Start/End: Original strand, 24218260 - 24218312
Alignment:
Q  77 tgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgct 129  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  24218260 tgagctgtttatattgtgggctatgctttataaccaccatgttaacatttgct 24218312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 24938890 - 24938938
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 49  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  24938890 ctgtgcttaggtaccttcacacggttattgcttgcaccatatggggtag 24938938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22888 - 22468
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || |||| |||||| ||||    
T  22888 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaacttttcatgtcgtgggccatgc 22789  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  22788 ttaacaaccaccctgttaacacatgcttttacttgcttgattacttttcccatgtcggtaataggtctgatagtaggggagagatagttgtgggtggtat 22689  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| ||||| ||| |||   | ||||||| |||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  22688 catcacatacatagctagacacttgggagagggtgaggaccaagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacctttatctttatg 22589  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    |||||||||||||  | | | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22588 aacttcattaagccccgttcgcccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 22489  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  22488 aagaaaatttgttgtatgttg 22468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 423
Target Start/End: Original strand, 23677 - 24097
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  23677 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggcaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 23776  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | |  ||||||||||  || ||||| ||    
T  23777 ttaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttacttgattacctttcccatgtcggtaataggtttgatagaagaggagagatagatgtgggtggtat 23876  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23877 catcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaattaataggcttaacatagagacccttatctttatg 23976  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23977 aacttcattaggccccgtccacccatgtcttacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 24076  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  24077 aagaaaatttgttgtatgttg 24097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 5461 - 5035
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  5461 ctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggtaggaccgaattggggaacactaggaccgacgaactcttcatgttgtgggctat 5362  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  5361 gctgcacaaccaccccgttaacacttgcttttacttacttgactacctttccaatataggtaataggtctgatggtaagggagaaatagtagttggtggt 5262  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||    
T  5261 atcatcacatacatagctaggcaattgggagtgagtgaagaccaatggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaaactcttgtctcta 5162  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    |||||||||| || | ||  | |||| |    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5161 tgaacttcatcaaacctcgactaccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcctattttaattttacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 5062  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||    
T  5061 ggaagagaatttgttgtatgttggtga 5035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 24821966 - 24821559
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||  | || ||||||||||| || |       
T  24821966 cttaggtaccttcaaagggtaatagcttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggatggatgaagttttcatgttgtgggccatac--- 24821870  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| |||||    
T  24821869 --aaccaccccgttaacacatgcttttacttgtttgattacctttcctatgtcagtaataggtctgatggtaggggagagatagttgtgggtggtatcat 24821772  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
     ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  24821771 cacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaa-----agacccttatctctatgaac 24821677  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24821676 ttcattaagcctcgtccacccatgttctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattgtacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 24821577  T
Q  406 aaaatttgctatatgttg 423  Q
    |||||||| | |||||||    
T  24821576 aaaatttgttgtatgttg 24821559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 223 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 25372612 - 25372396
Alignment:
Q  223 aattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatcc 322  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25372612 aattgagagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggtttaacatatagacccttatctctatgaacttcattaagcatcgtcc 25372513  T
Q  323 acccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25372512 acccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgatatatgtt 25372413  T
Q  423 ggtgaaggttcacaggt 439  Q
    |||||||||||||||||    
T  25372412 ggtgaaggttcacaggt 25372396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 422
Target Start/End: Original strand, 115854 - 116270
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  115854 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggtaggagtgaattagggaacactaggagtgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 115953  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  | |||| |||||||  ||| ||| ||| || || ||||| ||||| |||||    
T  115954 acaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctctcccttataggaaataggtccgatagtaggggcgaaatcgtagttggtggtatcat 116053  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||| |   || || ||| |||| || ||||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||     
T  116054 aacatacatagctaggcggttaggcgtgagtgaagatcaagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaat 116153  T
Q  306 ttcat--taagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 403  Q
    |||||   || ||  |||  ||| |    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  116154 ttcataaaaaccagaatc--ccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaactcatctcggactaacaccgaggtgga 116251  T
Q  404 agaaaatttgctatatgtt 422  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  116252 agaaaatttgttgtatgtt 116270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23161267 - 23160851
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| ||||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  23161267 cttaggtaccttcaaagggtaatggcttgcactattaggggaaggacagaactagggaacactaggaacgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 23161168  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  23161167 acaaccaacccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 23161068  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||      || || ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||     
T  23161067 aacatacatagctggacggttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagatacccttatctctatgaat 23160968  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| || |  |     ||| |    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23160967 ttcataaaaccccgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 23160868  T
Q  406 aaaatttgctatatgtt 422  Q
    |||||||| | ||||||    
T  23160867 aaaatttgttgtatgtt 23160851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23572524 - 23572108
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| ||||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  23572524 cttaggtaccttcaaagggtaatggcttgcactattaggggaaggacagaactagggaacactaggaacgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 23572425  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  23572424 acaaccaacccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 23572325  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||      || || ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||     
T  23572324 aacatacatagctggacggttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagatacccttatctctatgaat 23572225  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| || |  |     ||| |    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572224 ttcataaaaccccgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 23572125  T
Q  406 aaaatttgctatatgtt 422  Q
    |||||||| | ||||||    
T  23572124 aaaatttgttgtatgtt 23572108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 422
Target Start/End: Original strand, 27629829 - 27630245
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| ||||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  27629829 cttaggtaccttcaaagggtaatggcttgcactattaggggaaggacagaactagggaacactaggaacgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 27629928  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||| | |||||||| ||||| |||||    
T  27629929 acaaccaacccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggaaaaatagtagttggtggtatcat 27630028  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| |||     || || ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||     
T  27630029 aacatacatagctagacggttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagaaacccttatctctatgaat 27630128  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| || |  |     ||| |    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27630129 ttcataaaaccccgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 27630228  T
Q  406 aaaatttgctatatgtt 422  Q
    |||||||| | ||||||    
T  27630229 aaaatttgttgtatgtt 27630245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 22870088 - 22870335
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||      
T  22870088 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggagtgaattagggaacactaggagcgatgaactctttatgctatgggctatgctgc 22870187  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || |||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  22870188 acaaccacccccttaacacttgcttttacttacttaactacctttcccatataggaaataggtccgatggtaagggagaaatagtagttggtggtatcat 22870287  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaa 253  Q
     ||||| ||| ||  | || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  22870288 cacatacatagctgggcaactaggagtgagtgaggaccaagggataaa 22870335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Original strand, 16773979 - 16774396
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  16773979 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 16774078  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16774079 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 16774178  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  16774179 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 16774278  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| ||   ||     ||  |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16774279 ttcatcaaaactcgagtcccttttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 16774378  T
Q  406 aaaatttgctatatgttg 423  Q
     ||||||| | |||||||    
T  16774379 caaatttgttgtatgttg 16774396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 439
Target Start/End: Original strand, 24169702 - 24170134
Alignment:
Q  7 ttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattgg--ggaaca-ctaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 103  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||   ||| ||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  24169702 ttaggtacctacaaagggtcatggcttgtaccatttggggtagga---aataggtaggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgct 24169798  T
Q  104 taataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatc 203  Q
    || |||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||||||  ||| | ||||   ||||  ||||  ||  |  ||||||||||| ||||| |||    
T  24169799 tagtaacaaccccgtgaatacttgtttctacttgcttgattacctcgcctttataggagctaggcctgataatagagctgagatagtagtaggtggtatc 24169898  T
Q  204 ataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatga 303  Q
    || || |  ||  ||| ||| || ||||||||||| ||| | |||||||     |||| ||||| ||||||||| | ||| || ||||| || |||||||    
T  24169899 attaccttcattgctaggaagtttggagtgggtgaagacgaggggataactccaattgagggaatcaataggctaaacattgaaaccctcatttctatga 24169998  T
Q  304 acttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 403  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| || || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24169999 atttcattaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaacgtacctattttgtttctacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 24170098  T
Q  404 agaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    || ||||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  24170099 agcaaattttttgtatgttggtgatggttcacaggt 24170134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 24797187 - 24796770
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  24797187 cttaggtaccttcaacgggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 24797088  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||   || ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  24797087 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccaatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 24796988  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  24796987 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 24796888  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24796887 ttcatcaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 24796788  T
Q  406 aaaatttgctatatgttg 423  Q
     ||||||| | |||||||    
T  24796787 caaatttgttgtatgttg 24796770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 25369214 - 25369017
Alignment:
Q  230 agtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatg 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25369214 agtgggtgaggacgaagggataaattcaattgagggcaacaataggcttaacatagggaccctcatttccatgaacttcattaagcgtcatccgcccatg 25369115  T
Q  330 acctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
     | ||| ||||||| |||||||||  | | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  25369114 gcttatgcactcaagctcaatgtgattctattatttatgcttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagacaatttgttgtatgttggtga 25369017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25369408 - 25369250
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||  ||  | || |  |||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  25369408 gtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgtaccatttgagataggaaagaggtaggaacaactaggatggatgagctctttatgctttgggcaatgc 25369309  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggt 161  Q
    ||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25369308 ttagtaacaaccccgtgaatacttgtttttacttgcttgattaccttacctctgtaggt 25369250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 350 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 17867568 - 17867491
Alignment:
Q  350 tgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17867568 tgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtga 17867491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22046453 - 22046092
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 165  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||   ||||   ||    
T  22046453 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcctccataggagcta 22046354  T
Q  166 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 265  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  22046353 gacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggg 22046254  T
Q  266 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 365  Q
     |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  ||    
T  22046253 caacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttattt 22046154  T
Q  366 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  22046153 ctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 22046092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 25355933 - 25356294
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 165  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||   ||||   ||    
T  25355933 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcctccataggagcta 25356032  T
Q  166 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 265  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  25356033 gacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggg 25356132  T
Q  266 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 365  Q
     |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  ||    
T  25356133 caacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttattt 25356232  T
Q  366 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  25356233 ctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 25356294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13290 - 13046
Alignment:
Q  183 gagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatca 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||||||||||||||||  |    
T  13290 gagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgagggaaacaataggcttaata 13191  T
Q  283 tagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatc 382  Q
    | || |||||| |  ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || ||||||||||||||||    
T  13190 ttgaaacccttgttgctatgaatttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatc 13091  T
Q  383 tcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  13090 tcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 13046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20306575 - 20306429
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  | | ||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||| ||||||      
T  20306575 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactattagaagaaagacagaactagggaacactaggaacgatgaactcttcatgctctgggatatgctgc 20306476  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcc 152  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  20306475 acaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacatttcc 20306429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 427
Target Start/End: Original strand, 27626316 - 27626376
Alignment:
Q  367 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  27626316 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 27626376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 129
Target Start/End: Original strand, 24500756 - 24500808
Alignment:
Q  77 tgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgct 129  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||    
T  24500756 tgagctgtttatgttgtgggctatgctttataaccaccctattaacatttgct 24500808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13395 - 13308
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 153  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  13395 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcct 13308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 25372832 - 25372784
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtagga 51  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  25372832 gtgcttaggtaccttcaaagagtcatggcttgtaccatttagggtagga 25372784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 423
Target Start/End: Original strand, 121709 - 122119
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  121709 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgttgtgggccatgc 121808  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||          |||||||||| | |||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||| || ||||| ||    
T  121809 ttaacaaccaccgcgttaacacatgctt----------gattaccttttccatgtcggtaataggtttgatagtaggggagcgatagttgtgggtggtat 121898  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
     || ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| || |  || |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  121899 aatcacatacatagctcggcaattgggagtgggtgaggaccaaggaattaccaaaattaagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatg 121998  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121999 aacctcattaagcctcgtccacccatgtcttacacactcaaactcaatgtgcctatattgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 122098  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  122099 aagaaaatttgttgtatgttg 122119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3938 - 3517
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||  | ||||||||    
T  3938 ctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggactgaattagggaacactaggagtgatgaactcttcatactatgggctat 3839  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  3838 gttgcacaaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtctgatggtaagggagaaatagtagttggtggt 3739  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| ||||| ||| ||  | || | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  3738 atcatcacatacatagctgggcaactaggagtgagtgaggaccaaggaataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctcta 3639  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    |||||||||| || | ||  |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3638 tgaacttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 3539  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatgtt 422  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  3538 ggaagaaaatttgttgtatgtt 3517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20128 - 19725
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||  | || ||||||||| | || |       
T  20128 cttaggtaccttcaaagggtaatagcttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggatggatgaagttttcatgttgtggtccatac--- 20032  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| |||||    
T  20031 --aaccaccccgttaacacatgcttttacttgtttgattacctttcctatgtctgtaataggtctgatggtaggggagagatagttgtgggtggtatcat 19934  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
     ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| ||         ||||||||||||||    
T  19933 cacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaaca---------ttatctctatgaac 19843  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19842 ttcattaagcctcgtccacccatgttctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattgtactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 19743  T
Q  406 aaaatttgctatatgttg 423  Q
    |||||||| | |||||||    
T  19742 aaaatttgttgtatgttg 19725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 19840 - 19423
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||  | |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||      
T  19840 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggactgatatagggaacactaggagcgatgaactcttcatgttgtgggctatgctgc 19741  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  19740 acaaccaccccgttaacactcgcttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtctgatggtaagggagaaatagtagttggtggtatcat 19641  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
     ||||| ||| ||  | |||| |||||  || |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||     
T  19640 cacatacatagctgggtaattaggagttagttaggaccaagggataaacaagattgagggtaacaataggctaaacatagatacccttatctctatgaat 19541  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| || | ||  |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19540 ttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 19441  T
Q  406 aaaatttgctatatgttg 423  Q
    |||||||| | |||||||    
T  19440 aaaatttgttgtatgttg 19423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 108 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 253573 - 253240
Alignment:
Q  108 aaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |    
T  253573 aaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgactatctttcccatataggtaataggtctgatggtaagggggaaatagtagtccgtggtatcatca 253474  T
Q  208 catatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagac------cct--------t 293  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||      |||        |    
T  253473 catacatagctaggaaattgggagtgggtgaggacctagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacaaggtgcctgtggaaact 253374  T
Q  294 atctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaaca 393  Q
     |||||||||||||||| || | ||  || ||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  253373 gtctctatgaacttcataaaacctcgaccccccttggattatacactcaaactcaacgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaaca 253274  T
Q  394 ccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  253273 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtga 253240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 183; Significance: 8e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20504 - 20234
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20504 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatttggggtaggactgaattggaaaacactaggacagatgaactcttcatgttgtgggctat 20405  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20404 gcttaacaaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattatctttcccatgtaggtaataggtctgatggtaagggagagatagtagtaggtggt 20305  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaa 271  Q
    ||||| ||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||    
T  20304 atcatcacatacatagctagtcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaaaatcgagggaaacaa 20234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 1513 - 1848
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| || | |||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  1513 cttagatacctccaacgggttatggcttgcactatttggggaagaactgaattaggaaacactaggacggatgaactgttcatgttgtgggccatgctta 1612  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  1613 acaaccaccccgttaatacttgcttttacttgcttgattacctttcccttgtaggtaataggtctgacggtaagggagagatagttgtgggtggtatcat 1712  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
     ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1713 cacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaaaattgagggtaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaac 1812  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactc 341  Q
    |||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||    
T  1813 ttcattaatcatcatacacccacgtcctacacactc 1848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 423
Target Start/End: Original strand, 465 - 906
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||| ||||    
T  465 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattgtggaacactaggacggatgaactcttcatatcgtgggccatgc 564  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | | |||||||||||  || ||||| ||    
T  565 ttaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtcggtaataggtttgatagcaggggagagatagctgtgggtggtat 664  T
Q  203 ---------------------cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatc 281  Q
                         ||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || ||  ||||||| || |    
T  665 gagatagctgtgggtgggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaacattgaggaaattaataggcataac 764  T
Q  282 atagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccat 381  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  765 atagagacacttatctttatgaacttcattaggccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccat 864  T
Q  382 ctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  865 ctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 26274 - 25859
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| |||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  26274 ctgtacttaggtaccttcaaagggttatggtttgcactatttggggaaggactgaactagggaacactaggagcgatgaactcttcatgttatgggctat 26175  T
Q  101 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 200  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||     
T  26174 gctgcacaaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatggtaggggagaaatagtagttggtggt 26075  T
Q  201 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 300  Q
    ||||| ||||| ||| ||  | |||| |||    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  26074 atcatcacatacatagctgggcaattagga----gtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagaaacccttatctcta 25979  T
Q  301 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 400  Q
    |||||||||| || | ||  |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25978 tgaacttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgatcttactgcctaacccatctcggactaacaccgaggt 25879  T
Q  401 ggaagaaaatttgctatatg 420  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  25878 ggaagaaaatttgctgtatg 25859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 422
Target Start/End: Original strand, 28831 - 29247
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||  ||||| || || ||| | |||||||||||      
T  28831 cttaggtaccttcaacgggttatggcttgtactatttggggaaggagcgaattagggaacactaggagtgatgaactattcatgctttgggctatgctgc 28930  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28931 acaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 29030  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||| |||| | || ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||     
T  29031 aacatacatagctaggaaactaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagaaacccttatctctatgaat 29130  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||||| || | ||     ||| |    ||||| ||||| |||||||||||   ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29131 ttcataaaacctcgaatcccctttgtttatacgctcaagctcaatgtgccaactttgatattattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 29230  T
Q  406 aaaatttgctatatgtt 422  Q
    |||||||| | ||||||    
T  29231 aaaatttgttgtatgtt 29247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 422
Target Start/End: Original strand, 23892 - 24308
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  23892 cttaggtaccttcaaacggttatggcttgcaccattaggggacggacagaactagggaacactaggaacgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 23991  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  23992 acaaccaccccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttctaggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 24091  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 305  Q
    |||||| ||| ||| |   || || ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||     
T  24092 aacatacatagctaggcggttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaat 24191  T
Q  306 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 405  Q
    ||| | || | ||     ||| |    ||||||||||| || ||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24192 ttcctaaaacctcgaatcccctttgtttatacactcaagcttaatgtgcctattttgatattattacctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 24291  T
Q  406 aaaatttgctatatgtt 422  Q
    |||||||| | ||||||    
T  24292 aaaatttgttgtatgtt 24308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1400 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1400
Description:

Target: scaffold1400; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 338 - 49
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||      
T  338 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactattaggggaaggactgaactagggaacactaggaacgatgaactcttcatgttatgggctatgctgc 239  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 205  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| || ||||| ||||| |||||    
T  238 acaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaattgtagttggtggtatcat 139  T
Q  206 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttat 295  Q
    |||||| |||  || | || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  138 aacatacatagttaggcaactaggagtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttat 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 33409 - 32975
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||| |||  ||  | || |  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  33409 gtgcttaggtaccttcaaagagtcatggcttgtaccatttggggtgggaaagaggtaggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgc 33310  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    ||| |||| |||| || || ||||| || ||||||||||||| |||| ||| | |||||  ||||  |||   ||  |   ||||| |  | ||||| ||    
T  33309 ttagtaacaaccctgtgaatacttgtttctacttgcttgattgccttgcctctataggtgctaggcctgacaatagagctaagatattgataggtggtat 33210  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||    
T  33209 cattaccttcattgctaggaagtttggagtgggtgaggacgaatggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaaccctcatttctatg 33110  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33109 aacttcattaagcatcgtccacccatgacttatgcactcaaactcaatatgcctcttttgtttctacttcctaacccatctcgcactaacaccgaggtgg 33010  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacag 437  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  33009 aagcaaatttgttgtatgttggtgatggttcacag 32975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 175 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 8705 - 8457
Alignment:
Q  175 gtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaatag 274  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| || || ||| ||| | |||| || || ||| |||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||    
T  8705 gtaagggagagatagtggtaggaggcatcatcacttacatagctaggcaatttggggttggtaaggaccaaggaattaaaaggatttagggaaacaatag 8606  T
Q  275 gcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcct 374  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| || | || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | |||  |||||||    
T  8605 gcttaacatagatacccttgtctctatgaacttcatcaaacctcgtccacccatgtcctatacactcaagctcaatgtgcctattctaattgcacttcct 8506  T
Q  375 aacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8505 aacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 8457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 249 - 427
Target Start/End: Original strand, 1870 - 2046
Alignment:
Q  249 ataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactca 348  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| || | ||  || |||||| | ||||||||||||||||    
T  1870 ataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttgtct--atgaacttcataaaacctcgaccccccatggcttatacactcaaactca 1967  T
Q  349 atgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1968 atgtgactgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtga 2046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Original strand, 10887 - 11323
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||  ||| | || |  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  10887 gtgcttaggtaccttcaaagagtcatggcttgtaccatttggggtaggaaagaaatcggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgc 10986  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    ||| |||| ||||||| || ||||| || || || |||||||||||| ||| | |||||  ||||  |||   ||  |  ||||||||  | ||||| ||    
T  10987 ttagtaacaaccccgtgaatacttgtttctatttacttgattaccttgcctctataggtgctaggcctgacaatagagctgagatagtgataggtggtat 11086  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| || |  ||   ||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||| || || || || ||||||    
T  11087 cattaccttcattgttagtaaatttggagtgggtgaggacgaggggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaacactcatttctatg 11186  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    || |||||||||| || |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11187 aatttcattaagcttcgtccacccatgacttatgcacttaaactaaatgtgccccttttgtttctactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 11286  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    |||  |||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  11287 aagcgaatttgttgtatgttggtgatggatcacaggt 11323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Original strand, 115001 - 115441
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |  ||  | || |  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  115001 gtgcttagataccttcaaagagtcatggcttgtaccatttggggtagaaaagaggtaggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggctatgc 115100  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    ||| |||| |||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||||||   ||||| || ||  ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||    
T  115101 ttagtaacaaccccgttcatacttgcttctacctacttgattacctttcctccataggtgatgggcctgataatagagctgagatagtagtcggtggtat 115200  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaata----ggcttatcatagagacccttatctc 298  Q
    ||| || |  ||| ||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| |||||||    |||||| ||| || |||||  | ||    
T  115201 cattaccttcatagctaggaagtttggagtgggtgaggacgaagggataaatccaattgagggcaacaatatataggcttaacattgaaaccctcttttc 115300  T
Q  299 tatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgag 398  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||   | | ||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  115301 tatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcacttaaacttcgtatacctcttttgtttctgcttcctaacccatctcggattaacaccgag 115400  T
Q  399 gtggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    ||||| | ||||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  115401 gtggaggcaaatttgttgtatgttggtgatggatcacaggt 115441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Original strand, 119305 - 119745
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |  ||  | || |  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  119305 gtgcttagataccttcaaagagtcatggcttgtaccatttggggtagaaaagaggtaggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggctatgc 119404  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    ||| |||| |||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||||||   ||||| || ||  ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||    
T  119405 ttagtaacaaccccgttcatacttgcttctacctacttgattacctttcctccataggtgatgggcctgataatagagctgagatagtagtcggtggtat 119504  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaata----ggcttatcatagagacccttatctc 298  Q
    ||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| |||||||    |||||| ||| || |||||  | ||    
T  119505 cattaccttcattgctaggaagtttggagtgggtgaggacgaagggataaatccaattgagggcaacaatatataggcttaacattgaaaccctcttttc 119604  T
Q  299 tatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgag 398  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||   | | ||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  119605 tatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcacttaaacttcgtatacctcttttgtttctgcttcctaacccatctcggattaacaccgag 119704  T
Q  399 gtggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    ||||| | ||||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  119705 gtggaggcaaatttgttgtatgttggtgatggatcacaggt 119745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 39590 - 39166
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||  ||  | || |  |||| ||| ||||| || |||||| | ||||| ||||    
T  39590 gtgcttaggtacctacaaaggatcatggcttgtaccatttggggtaggaaagaggtaggaacaactaagacggatgaactttttatgctttgggcaatgc 39491  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    ||| | || ||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||  ||| | ||||   ||||  ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||    
T  39490 ttagtgacaaccccgtgaatacttgtttctacttacttgattacctcgcctctataggagctaggcctgataatagagctgagatagtagtcggtggtat 39391  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| || |  ||| ||| ||| || ||| ||||||| ||  |||||||||     |||| |||||||||||| || | ||| || ||||| || ||||||    
T  39390 cattaccttcatagctaggaagtttggaatgggtgaagaagaagggataactccaattgagggaaacaatagactaaacattgaaaccctcatttctatg 39291  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    || |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| || || ||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39290 aatttcattaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaacgtacctcttttgtttctacttcctaacccatcttggactaacaccgaggtgg 39191  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||    
T  39190 aagcaaatttgttgtatgttggtga 39166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1879 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1879
Description:

Target: scaffold1879; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 773 - 336
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttgggg-taggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatg 101  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||  ||  | || |  ||||| || ||||| || |||||| | ||||| |||    
T  773 gtgcttaggtacctacaaagggtcatggcttgtaccatttgggggtaggaaagaggtaggaacaactagaacggatgaactttttatgctttgggcgatg 674  T
Q  102 cttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggca 201  Q
    |||| |||| ||||||  || ||||| || ||||| |||||||||||| ||| | |||| | ||||  ||||  ||  |  | ||||||||| ||||| |    
T  673 cttagtaacaaccccgcgaatacttgtttctacttacttgattaccttgcctctataggaactaggcctgatattagagctgggatagtagtaggtggta 574  T
Q  202 tcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctat 301  Q
    |||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||| ||  | |||||||     |||| ||||||||| | ||| | ||| || ||||| || |||||    
T  573 tcattaccttcatttctaggaagtttggagtgggtgaagaagaggggataactccaattgagggaaacaacatgctaaacattgaaaccctcatttctat 474  T
Q  302 gaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtg 401  Q
    ||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  473 gaatttcatcaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaatatacctattttgtttctacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtg 374  T
Q  402 gaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  373 gaagaaaatttgttgtatgttggtgatggtccacaggt 336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 228 - 439
Target Start/End: Original strand, 10000 - 10211
Alignment:
Q  228 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 327  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||| || ||| |  | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10000 ggagtgggtgaggacgaacggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaaccttcctttctatgaatttcattaagcttcatccaccca 10099  T
Q  328 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||| |||  | | ||||||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  10100 tgacatatgaaattaaactcaatatacctcttttgtttctacttcctgacccatctcggactaacactgaggtggaagcaaatttgttgtatgttggtga 10199  T
Q  428 aggttcacaggt 439  Q
     || ||||||||    
T  10200 tggatcacaggt 10211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Original strand, 9782 - 9932
Alignment:
Q  2 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatg 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||  | || |  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||    
T  9782 tgtgcttaagtaccttcaaagggctatgacttgtaccatttggggtagaaaagaggtaggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggcaatg 9881  T
Q  102 cttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 153  Q
    |||  |||| ||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||    
T  9882 ctt-gtaacaaccccgtgaatacctgtttatacttacttgattacctttcct 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 4947 - 4619
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 165  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||  ||    
T  4947 actaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgcttagtaacaaccccgttcatacttgcttctacctacttgattacctttcttccataggtgtta 4848  T
Q  166 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 265  Q
    ||  ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    |||| |||    
T  4847 ggcctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcattaccttcattgctaggaagtttggagtgggtgaggacgaagggataaatccaattgaggg 4748  T
Q  266 aaacaataggcttatc-atagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgat 364  Q
     |||||||||||||   || || |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||   | | ||| ||||| |    
T  4747 caacaataggcttaaatattgaaacccttgtttctatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttttgtt 4648  T
Q  365 tatacttcctaacccatctcggactaaca 393  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||    
T  4647 tctgcttcctaacccatctcggactaaca 4619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 427
Target Start/End: Original strand, 12396 - 12820
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 102  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||| |  ||  | || |  |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||      
T  12396 gtgcttagatacctccaaagagtcatggcttgtaccatttggggtagaaaagaggtaggaacaactaggacagatgaactctttatgctttgggcaattg 12495  T
Q  103 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 202  Q
    ||| |||| | |||||||| ||||||||  || | ||||||||||||||||   |||||  |||   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||    
T  12496 ttagtaacaatcccgttaatacttgcttccacctacttgattacctttcctccataggtgctagacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtat 12595  T
Q  203 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 302  Q
    ||| || |  || |||| ||| || ||||||||||||||  |||| ||||||   |||| ||| |||||||||||||  || || || ||| |  |||||    
T  12596 cattaccttcatcactaggaagtttggagtgggtgaggaagaaggaataaaaccaattgagggcaacaataggcttaatattgaaacacttgttgctatg 12695  T
Q  303 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 402  Q
    || |||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||  ||||   | | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12696 aatttcattaagattcacccgcccatgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtgg 12795  T
Q  403 aagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    | ||||||| | | |||||||||||    
T  12796 aggaaaattagttgtatgttggtga 12820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1620 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1620
Description:

Target: scaffold1620; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 665 - 423
Alignment:
Q  183 gagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatca 282  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    |||| ||| ||||||| ||| | ||    
T  665 gagatagtagtaggtggtatcattaccttcattgctaggaagtttggagtgggtgaagacaaagggataaatccaattgaggggaacaatatgctaaaca 566  T
Q  283 tagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatc 382  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||  ||| | ||||| || ||||||||||||||||    
T  565 ttgaaaccctcatttctatgaatttcataaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaacatgcttcttttgtttctacttcctaacccatc 466  T
Q  383 tcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 425  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  465 tcggactaacacggaggtggaagcaaatttgttgtatgttggt 423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 297 - 439
Target Start/End: Original strand, 54893 - 55035
Alignment:
Q  297 tctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccg 396  Q
    |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54893 tctatgaatttcataaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaatatacctattttgtttctacttcctaacccatctcggattaacaccg 54992  T
Q  397 aggtggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 439  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  54993 aggtggaagcaaatttgttgtatgttggtgatggtccacaggt 55035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 148
Target Start/End: Original strand, 54596 - 54740
Alignment:
Q  4 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||| | || |  ||||| || ||||| || |||||| | ||||| |||||    
T  54596 tgcttaggtacctacaaagggtcatggcttgtaccatttggggtaggaaagaagtaggaacaactagaacggatgaactttttatgctttgggcgatgct 54695  T
Q  104 taataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacct 148  Q
    || |||| ||||||| || ||||| || ||| | |||||||||||    
T  54696 tagtaacaaccccgtgaatacttgtttctacatacttgattacct 54740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 391
Target Start/End: Original strand, 41388 - 41775
Alignment:
Q  4 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 103  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||| | || |  ||||| |||||||| || |||||| | ||||| |||||    
T  41388 tgcttaggtacctacaaagggtcatggcttgtaccatttggggtaggaaagaagtaggaacaactagaacagatgaactttttatgctttgggcgatgct 41487  T
Q  104 taataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatc 203  Q
    || |||| ||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||  ||| | |||| | |||   ||||  ||  |  ||||||||||| ||||| |||    
T  41488 tagtaacaaccccgtgaatacttgtttctacttacttgattacctcgcctctataggaactagacctgatattagagttgagatagtagtaggtggtatc 41587  T
Q  204 ataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatga 303  Q
    || || |  ||  ||| ||| || |||||| |||| ||  | |||||||     |||| ||||||||| | ||| | ||| || ||||| || |||||||    
T  41588 attaccttcattgctaggaagtttggagtgagtgaagaggaggggataactccaattgagggaaacaacatgctcaacattgaaaccctcatttctatga 41687  T
Q  304 acttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaa 391  Q
    | ||||| || | ||||||||||||||| |||  |||| |||| ||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  41688 atttcatcaaacttcatccacccatgacttatgaactccaacttaatatacctattttgtttctacttcctaacccatctcggactaa 41775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1756 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1756
Description:

Target: scaffold1756; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 1001 - 1103
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  1001 ctgtacttagataccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggagtgaattagggaacactaggagcgatgaactcttcatgttatgggctat 1100  T
Q  101 gct 103  Q
    |||    
T  1101 gct 1103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 7836 - 7914
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatga 79  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  7836 ctgtgattaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatctagggtaggaccgaattgaggaacactaggacagatga 7914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 15738 - 15816
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatga 79  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  15738 ctgtgattaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatctagggtaggaccgaattgaggaacactaggacagatga 15816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 359 - 441
Target Start/End: Original strand, 21620 - 21702
Alignment:
Q  359 tttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggttc 441  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | |||||||||    
T  21620 tttgattatctttcctaacccatctcggaataacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatgttccacaggttc 21702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 427
Target Start/End: Original strand, 4819 - 4888
Alignment:
Q  358 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  4819 ttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1571 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1571
Description:

Target: scaffold1571; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 427
Target Start/End: Original strand, 1344 - 1404
Alignment:
Q  367 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  1344 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 1404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 32621 - 32347
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 165  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| |||   |||||  ||    
T  32621 actaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgcttagtaacaaccccgttaatacttgcttctacctacttgattaccttacctccataggtggta 32522  T
Q  166 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 265  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || | |||| |||| | | |||| |||||    |||| |||    
T  32521 gacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcatcaccttcatcgctaggaagtttgtagtgagtgaagccaaaggaataaatccaattgaggg 32422  T
Q  266 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacact 340  Q
     |||||||||||||  || || |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  32421 caacaataggcttaatattgaaacccttgtatctatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcact 32347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 168
Target Start/End: Original strand, 37500 - 37551
Alignment:
Q  117 gttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggt 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37500 gttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtcggtaataggt 37551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 145
Target Start/End: Original strand, 18249 - 18319
Alignment:
Q  75 gatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  18249 gatgagctgtttatgttgtgggctatgctttataaccatcctattaacatttgctattatttgcttgatta 18319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 50371 - 50288
Alignment:
Q  257 gattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacact 340  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  || || |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  50371 gattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgtttctatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcact 50288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 50562 - 50475
Alignment:
Q  66 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 153  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  50562 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgcttctacctacttgattacctttcct 50475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 195814 - 195735
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctt 85  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| | |||||||||||||  ||||| |||||    
T  195814 cttaggtaccttcagagggttatggcttgcactattaggggaaggactgaactagggaacactaggaacgatgaactctt 195735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11693 - 11632
Alignment:
Q  69 aggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgctt 130  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  11693 aggactgatgaactgttaatgttgtgggctatgctttataaccaccctgttaacatttgctt 11632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 12178 - 12130
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 49  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12178 ctgtgcttaggtaccttcacacggttatggcttgcaccatatggggtag 12130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 13308 - 13260
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 49  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13308 ctgtgcttaggtaccttcacacggttatggcttgcaccatatggggtag 13260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 9199 - 9151
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 49  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  9199 ctgtgcttaggtaccttcacacggttattgcttgcaccatatggggtag 9151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 145
Target Start/End: Original strand, 1029 - 1099
Alignment:
Q  75 gatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 145  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||  |||||| || || ||| |||||||||||    
T  1029 gatgagctgtttatgttatgggctatgctttataaccatcctattaacattttctattatttgcttgatta 1099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 7332 - 7187
Alignment:
Q  6 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 105  Q
    ||||| ||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||   || ||||    |||||  | |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7332 cttagatacattcaaagttttatggcatgcaccatttggggtaggacgaaagtgggaccgactagagcggatgagttgtttatgttgtgggctatgctta 7233  T
Q  106 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttc 151  Q
    | || | | | || ||||| || |||||||||||| |||| |||||    
T  7232 acaatctctctgtgaacacctgtttttacttgcttaattatctttc 7187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 14936 - 14888
Alignment:
Q  1 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 49  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  14936 ctgtgcttaggtaccttcacacggttattgcttgcaccatatggggtag 14888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 15872 - 15824
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtagga 51  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  15872 gtgcttaggtacctacaacgggtcatggcttgtaccatttggggtagga 15824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 24707 - 24659
Alignment:
Q  3 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtagga 51  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  24707 gtgcttaggtacctacaacgggtcatggcttgtaccatttggggtagga 24659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University