View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8944_low_8 (Length: 222)

Name: NF8944_low_8
Description: NF8944
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8944_low_8
NF8944_low_8
[»] chr8 (55 HSPs)
chr8 (1-206)||(14807723-14807929)
chr8 (1-206)||(27826958-27827164)
chr8 (1-206)||(27829269-27829475)
chr8 (1-206)||(18810680-18810886)
chr8 (1-206)||(28251724-28251930)
chr8 (1-206)||(4423990-4424196)
chr8 (5-206)||(15072686-15072888)
chr8 (1-206)||(44720815-44721022)
chr8 (1-198)||(15067953-15068151)
chr8 (29-198)||(33541553-33541723)
chr8 (28-206)||(32339304-32339487)
chr8 (29-206)||(27107054-27107232)
chr8 (6-198)||(13858649-13858842)
chr8 (1-206)||(18812865-18813060)
chr8 (28-206)||(1225165-1225344)
chr8 (29-206)||(14477276-14477454)
chr8 (28-205)||(26775200-26775378)
chr8 (28-206)||(27911014-27911192)
chr8 (28-206)||(27957433-27957611)
chr8 (28-206)||(15809214-15809396)
chr8 (28-206)||(28283376-28283561)
chr8 (29-206)||(30480660-30480838)
chr8 (6-206)||(14419348-14419549)
chr8 (30-205)||(36865538-36865715)
chr8 (5-129)||(3886153-3886277)
chr8 (28-197)||(24873347-24873523)
chr8 (29-208)||(5622893-5623073)
chr8 (28-206)||(41384744-41384922)
chr8 (28-206)||(3874005-3874188)
chr8 (5-140)||(12517248-12517385)
chr8 (28-206)||(22684813-22685002)
chr8 (38-206)||(608735-608912)
chr8 (28-175)||(41382672-41382819)
chr8 (29-206)||(5372335-5372512)
chr8 (77-197)||(43079650-43079771)
chr8 (69-197)||(43082013-43082142)
chr8 (29-206)||(25952521-25952698)
chr8 (29-187)||(35872559-35872713)
chr8 (1-101)||(2468361-2468461)
chr8 (3-204)||(15185869-15186072)
chr8 (28-204)||(43530123-43530291)
chr8 (28-124)||(181536-181632)
chr8 (62-185)||(37214369-37214512)
chr8 (29-206)||(21482322-21482488)
chr8 (3-206)||(31162186-31162387)
chr8 (2-198)||(31035041-31035236)
chr8 (2-57)||(17847501-17847556)
chr8 (119-198)||(15956051-15956127)
chr8 (62-206)||(21480547-21480680)
chr8 (62-206)||(3005789-3005929)
chr8 (28-72)||(6375988-6376032)
chr8 (1-57)||(43079558-43079614)
chr8 (1-57)||(43081930-43081986)
chr8 (85-206)||(31573884-31574000)
chr8 (6-54)||(31574054-31574100)
[»] chr1 (87 HSPs)
chr1 (1-206)||(51749955-51750161)
chr1 (1-206)||(13214997-13215203)
chr1 (1-206)||(13761753-13761959)
chr1 (1-206)||(15823462-15823668)
chr1 (1-206)||(6823800-6824007)
chr1 (1-206)||(6822931-6823136)
chr1 (5-206)||(20302379-20302581)
chr1 (1-206)||(38925637-38925843)
chr1 (1-206)||(28840594-28840802)
chr1 (5-198)||(28842413-28842609)
chr1 (1-206)||(10399987-10400193)
chr1 (3-197)||(16226085-16226280)
chr1 (1-198)||(41646836-41647034)
chr1 (1-206)||(28207225-28207431)
chr1 (1-206)||(51752281-51752486)
chr1 (29-206)||(2617460-2617638)
chr1 (1-175)||(47451564-47451738)
chr1 (18-206)||(20291390-20291579)
chr1 (31-206)||(21948347-21948526)
chr1 (1-206)||(39462435-39462641)
chr1 (3-197)||(47179627-47179826)
chr1 (3-195)||(47177276-47177473)
chr1 (7-206)||(14098129-14098329)
chr1 (5-208)||(3579773-3579979)
chr1 (28-206)||(24325599-24325785)
chr1 (30-206)||(18307054-18307231)
chr1 (31-206)||(39932017-39932195)
chr1 (29-206)||(17186287-17186465)
chr1 (28-206)||(6995859-6996038)
chr1 (28-206)||(31735680-31735863)
chr1 (28-206)||(12302664-12302848)
chr1 (28-206)||(28998412-28998591)
chr1 (28-206)||(29004128-29004307)
chr1 (29-206)||(50307705-50307884)
chr1 (28-198)||(9463411-9463588)
chr1 (29-206)||(18839531-18839709)
chr1 (28-206)||(27337098-27337280)
chr1 (29-206)||(50076831-50077009)
chr1 (28-206)||(17324795-17324974)
chr1 (30-204)||(25251436-25251611)
chr1 (29-198)||(31489859-31490027)
chr1 (28-198)||(2510491-2510666)
chr1 (28-198)||(9459584-9459761)
chr1 (2-206)||(16428569-16428775)
chr1 (28-206)||(47906207-47906392)
chr1 (28-206)||(48665114-48665299)
chr1 (29-206)||(50078980-50079158)
chr1 (29-206)||(50248731-50248909)
chr1 (28-205)||(27339290-27339472)
chr1 (28-198)||(6756470-6756642)
chr1 (31-206)||(15294993-15295183)
chr1 (69-206)||(4131538-4131676)
chr1 (77-206)||(46431866-46431996)
chr1 (28-206)||(9241245-9241424)
chr1 (28-206)||(2949390-2949569)
chr1 (29-206)||(11457634-11457812)
chr1 (50-198)||(31425185-31425335)
chr1 (1-125)||(16231517-16231641)
chr1 (30-185)||(17318838-17318994)
chr1 (28-206)||(31423032-31423212)
chr1 (69-206)||(25127856-25127994)
chr1 (29-207)||(17324009-17324186)
chr1 (78-206)||(40133937-40134066)
chr1 (30-124)||(25248756-25248850)
chr1 (3-206)||(42922151-42922352)
chr1 (28-204)||(18800734-18800907)
chr1 (1-101)||(30790658-30790759)
chr1 (2-198)||(8349219-8349414)
chr1 (29-206)||(14183751-14183923)
chr1 (28-208)||(8347430-8347607)
chr1 (76-206)||(16432396-16432516)
chr1 (28-97)||(49495468-49495537)
chr1 (35-206)||(26520279-26520449)
chr1 (28-206)||(15669553-15669729)
chr1 (35-198)||(13125626-13125787)
chr1 (1-67)||(23783467-23783533)
chr1 (3-100)||(26613503-26613603)
chr1 (1-41)||(49687456-49687496)
chr1 (62-101)||(6115344-6115383)
chr1 (2-80)||(16431017-16431096)
chr1 (152-197)||(16231630-16231676)
chr1 (3-160)||(27916415-27916571)
chr1 (35-160)||(13127837-13127959)
chr1 (29-101)||(30738890-30738963)
chr1 (28-57)||(43104102-43104131)
chr1 (28-57)||(46432037-46432066)
chr1 (4-57)||(49958963-49959016)
[»] chr4 (90 HSPs)
chr4 (1-203)||(11434925-11435128)
chr4 (1-198)||(5198390-5198588)
chr4 (1-206)||(22044547-22044753)
chr4 (1-206)||(22802891-22803097)
chr4 (1-206)||(48486289-48486495)
chr4 (1-206)||(51015216-51015422)
chr4 (1-206)||(22046842-22047048)
chr4 (1-206)||(24888766-24888972)
chr4 (1-206)||(9148221-9148429)
chr4 (1-208)||(22801017-22801225)
chr4 (5-206)||(40091572-40091774)
chr4 (1-206)||(5637622-5637832)
chr4 (1-206)||(38409169-38409381)
chr4 (5-206)||(24878963-24879165)
chr4 (1-206)||(24880421-24880627)
chr4 (1-206)||(47274697-47274902)
chr4 (1-197)||(18847123-18847320)
chr4 (1-206)||(31849755-31849962)
chr4 (1-206)||(36919741-36919950)
chr4 (28-197)||(44600004-44600174)
chr4 (1-197)||(16934309-16934506)
chr4 (1-208)||(37089526-37089737)
chr4 (28-206)||(40637071-40637250)
chr4 (1-198)||(9174311-9174509)
chr4 (3-206)||(619604-619808)
chr4 (1-206)||(7941289-7941499)
chr4 (28-206)||(8631576-8631759)
chr4 (1-206)||(36921650-36921858)
chr4 (1-197)||(9176640-9176837)
chr4 (1-197)||(16931955-16932152)
chr4 (1-206)||(52942603-52942810)
chr4 (28-206)||(2485029-2485209)
chr4 (28-206)||(6764836-6765020)
chr4 (28-206)||(24348211-24348394)
chr4 (28-206)||(14633317-14633495)
chr4 (28-206)||(47868398-47868577)
chr4 (28-206)||(14787588-14787769)
chr4 (29-206)||(38928334-38928513)
chr4 (1-197)||(11006403-11006604)
chr4 (1-197)||(11008732-11008933)
chr4 (1-198)||(3824735-3824936)
chr4 (28-206)||(16453306-16453485)
chr4 (29-206)||(19095880-19096059)
chr4 (29-206)||(12396002-12396180)
chr4 (28-205)||(36378289-36378467)
chr4 (30-206)||(37313223-37313400)
chr4 (30-198)||(56030443-56030612)
chr4 (29-206)||(12400964-12401142)
chr4 (69-206)||(18709320-18709458)
chr4 (30-206)||(33415645-33415821)
chr4 (29-206)||(3937366-3937543)
chr4 (69-197)||(22780539-22780668)
chr4 (69-197)||(22782904-22783033)
chr4 (33-205)||(41997494-41997667)
chr4 (28-206)||(22132548-22132735)
chr4 (28-206)||(17662402-17662574)
chr4 (28-206)||(53405124-53405305)
chr4 (29-187)||(38270162-38270321)
chr4 (28-164)||(47210940-47211082)
chr4 (69-206)||(22134773-22134909)
chr4 (28-167)||(5100994-5101133)
chr4 (1-205)||(8756411-8756613)
chr4 (29-187)||(24446760-24446914)
chr4 (29-206)||(6132871-6133048)
chr4 (29-205)||(18409505-18409681)
chr4 (35-206)||(19322701-19322869)
chr4 (30-206)||(13543953-13544135)
chr4 (29-148)||(2891314-2891434)
chr4 (104-206)||(26086133-26086236)
chr4 (29-206)||(18537632-18537806)
chr4 (3-150)||(15032752-15032898)
chr4 (29-206)||(18534990-18535164)
chr4 (107-198)||(36380425-36380517)
chr4 (114-198)||(27499128-27499213)
chr4 (3-157)||(40999156-40999308)
chr4 (28-101)||(16186099-16186173)
chr4 (2-101)||(25357607-25357713)
chr4 (144-206)||(16455354-16455417)
chr4 (111-208)||(38890381-38890476)
chr4 (29-101)||(12102088-12102162)
chr4 (30-206)||(28453686-28453858)
chr4 (28-100)||(16455284-16455356)
chr4 (3-57)||(52043737-52043791)
chr4 (1-58)||(22780687-22780744)
chr4 (1-58)||(22783052-22783109)
chr4 (35-198)||(9863712-9863874)
chr4 (28-58)||(22134936-22134966)
chr4 (85-160)||(9022362-9022433)
chr4 (85-160)||(54906631-54906702)
chr4 (167-206)||(47151052-47151092)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (1-206)||(2805-3011)
[»] chr5 (84 HSPs)
chr5 (1-206)||(25921630-25921836)
chr5 (1-206)||(38882021-38882228)
chr5 (1-206)||(4236545-4236751)
chr5 (1-197)||(31542651-31542848)
chr5 (3-206)||(16776075-16776280)
chr5 (1-196)||(31544996-31545192)
chr5 (1-206)||(2174835-2175041)
chr5 (1-206)||(21947943-21948148)
chr5 (1-206)||(2818492-2818699)
chr5 (1-197)||(31179537-31179734)
chr5 (2-206)||(12556080-12556285)
chr5 (28-203)||(39854427-39854602)
chr5 (28-206)||(10529256-10529435)
chr5 (29-206)||(17072827-17073005)
chr5 (1-198)||(6756410-6756608)
chr5 (29-206)||(20042994-20043172)
chr5 (29-206)||(25904047-25904225)
chr5 (1-206)||(36402485-36402690)
chr5 (28-206)||(18468950-18469133)
chr5 (28-206)||(40221465-40221644)
chr5 (28-206)||(26097676-26097854)
chr5 (1-206)||(31466135-31466341)
chr5 (1-206)||(21684608-21684824)
chr5 (1-161)||(20507665-20507825)
chr5 (31-206)||(18511369-18511547)
chr5 (29-206)||(20044954-20045132)
chr5 (29-206)||(31472770-31472948)
chr5 (31-206)||(18509475-18509652)
chr5 (30-206)||(18466625-18466806)
chr5 (29-206)||(1189766-1189949)
chr5 (29-206)||(34530823-34531001)
chr5 (28-206)||(18596590-18596767)
chr5 (32-206)||(10474480-10474655)
chr5 (28-206)||(37705937-37706116)
chr5 (28-206)||(27912473-27912658)
chr5 (69-197)||(34477220-34477349)
chr5 (69-197)||(34479585-34479714)
chr5 (28-206)||(26098408-26098587)
chr5 (28-206)||(6747247-6747427)
chr5 (69-206)||(25804009-25804147)
chr5 (28-206)||(27910388-27910572)
chr5 (29-206)||(39398150-39398327)
chr5 (69-206)||(16092357-16092495)
chr5 (69-197)||(15552229-15552358)
chr5 (37-205)||(2954368-2954538)
chr5 (69-206)||(6745053-6745190)
chr5 (36-206)||(17818647-17818817)
chr5 (29-206)||(24126800-24126978)
chr5 (29-206)||(695833-695999)
chr5 (36-198)||(21288715-21288883)
chr5 (28-125)||(4410000-4410101)
chr5 (34-206)||(6661343-6661512)
chr5 (107-206)||(658510-658610)
chr5 (28-206)||(10586782-10586954)
chr5 (29-101)||(36208524-36208597)
chr5 (28-124)||(41585946-41586042)
chr5 (1-55)||(39798004-39798058)
chr5 (72-206)||(20053834-20053965)
chr5 (1-72)||(23665054-23665125)
chr5 (1-72)||(23793462-23793533)
chr5 (28-73)||(3373332-3373377)
chr5 (1-69)||(15354777-15354845)
chr5 (1-69)||(15357053-15357121)
chr5 (1-72)||(23667329-23667400)
chr5 (1-72)||(38960334-38960405)
chr5 (1-66)||(10757180-10757245)
chr5 (28-72)||(23742057-23742101)
chr5 (1-57)||(34477379-34477435)
chr5 (2-160)||(42770690-42770845)
chr5 (152-206)||(4410090-4410145)
chr5 (4-57)||(29748260-29748313)
chr5 (1-57)||(34479740-34479796)
chr5 (2-65)||(10749704-10749767)
chr5 (147-206)||(2723964-2724024)
chr5 (85-206)||(17413325-17413441)
chr5 (3-57)||(2144899-2144954)
chr5 (152-206)||(41585901-41585956)
chr5 (29-79)||(2723911-2723961)
chr5 (99-133)||(13295755-13295789)
chr5 (161-206)||(39798123-39798169)
chr5 (30-160)||(9020167-9020295)
chr5 (28-57)||(15552178-15552207)
chr5 (28-57)||(25803959-25803988)
chr5 (85-160)||(29748352-29748423)
[»] chr3 (112 HSPs)
chr3 (1-206)||(3859424-3859630)
chr3 (1-206)||(5191549-5191755)
chr3 (1-198)||(11170300-11170498)
chr3 (1-206)||(22114460-22114666)
chr3 (1-173)||(11163046-11163218)
chr3 (1-197)||(6065960-6066158)
chr3 (1-197)||(35777317-35777514)
chr3 (1-206)||(38889935-38890142)
chr3 (1-206)||(45882835-45883041)
chr3 (28-206)||(4308436-4308615)
chr3 (1-206)||(18097055-18097262)
chr3 (1-206)||(18099325-18099531)
chr3 (1-206)||(24979603-24979809)
chr3 (1-206)||(10084544-10084754)
chr3 (1-197)||(6063610-6063809)
chr3 (1-175)||(26720444-26720618)
chr3 (1-206)||(32264194-32264404)
chr3 (1-205)||(48361827-48362031)
chr3 (1-197)||(50493895-50494092)
chr3 (5-206)||(10191464-10191670)
chr3 (1-206)||(18162560-18162765)
chr3 (28-206)||(43228214-43228393)
chr3 (1-206)||(10958478-10958684)
chr3 (35-206)||(6561740-6561912)
chr3 (5-206)||(12268119-12268323)
chr3 (1-206)||(15780756-15780973)
chr3 (28-206)||(51727162-51727340)
chr3 (1-206)||(10956182-10956388)
chr3 (1-206)||(5522781-5522976)
chr3 (28-206)||(43226009-43226187)
chr3 (29-206)||(43423618-43423796)
chr3 (28-206)||(51943294-51943473)
chr3 (29-206)||(1626838-1627016)
chr3 (29-206)||(3314608-3314786)
chr3 (28-206)||(4104050-4104233)
chr3 (28-205)||(1313333-1313510)
chr3 (28-206)||(27101336-27101519)
chr3 (28-206)||(53917819-53917998)
chr3 (29-206)||(28102157-28102335)
chr3 (69-206)||(30005805-30005943)
chr3 (28-206)||(35918098-35918283)
chr3 (28-197)||(455826-456000)
chr3 (28-197)||(458203-458377)
chr3 (2-197)||(38210265-38210463)
chr3 (29-206)||(5926919-5927097)
chr3 (28-198)||(25533357-25533536)
chr3 (28-197)||(746674-746850)
chr3 (30-206)||(43421570-43421747)
chr3 (29-206)||(880606-880785)
chr3 (29-198)||(28100204-28100374)
chr3 (69-206)||(42990268-42990406)
chr3 (28-206)||(42992205-42992388)
chr3 (28-206)||(53915651-53915830)
chr3 (29-198)||(28180948-28181116)
chr3 (28-206)||(39715393-39715571)
chr3 (29-198)||(36011751-36011921)
chr3 (29-206)||(53468611-53468788)
chr3 (29-198)||(54691737-54691906)
chr3 (69-197)||(10621694-10621823)
chr3 (6-206)||(28761584-28761784)
chr3 (28-206)||(9604762-9604946)
chr3 (69-206)||(29956650-29956788)
chr3 (29-159)||(47701798-47701928)
chr3 (1-197)||(25388794-25388998)
chr3 (1-105)||(1321337-1321441)
chr3 (1-206)||(32218991-32219186)
chr3 (29-206)||(47149050-47149233)
chr3 (1-206)||(24177175-24177378)
chr3 (70-196)||(41849117-41849244)
chr3 (30-206)||(51674921-51675087)
chr3 (30-159)||(27635830-27635959)
chr3 (29-206)||(889927-890104)
chr3 (30-158)||(6231374-6231502)
chr3 (95-198)||(28413195-28413299)
chr3 (29-206)||(54884081-54884257)
chr3 (29-195)||(28137472-28137628)
chr3 (3-206)||(23633357-23633556)
chr3 (29-206)||(31151271-31151447)
chr3 (29-206)||(53591119-53591286)
chr3 (28-206)||(53597164-53597338)
chr3 (109-206)||(1321483-1321581)
chr3 (30-148)||(3306724-3306842)
chr3 (30-206)||(23636952-23637125)
chr3 (1-83)||(53896475-53896557)
chr3 (28-206)||(13420341-13420506)
chr3 (28-125)||(4560502-4560599)
chr3 (1-77)||(6719396-6719472)
chr3 (127-206)||(7606742-7606822)
chr3 (1-62)||(5886181-5886242)
chr3 (35-206)||(36871457-36871624)
chr3 (1-59)||(13893289-13893347)
chr3 (1-62)||(5899656-5899717)
chr3 (76-206)||(561932-562058)
chr3 (28-208)||(1673898-1674076)
chr3 (68-204)||(4666488-4666614)
chr3 (28-93)||(6484308-6484373)
chr3 (1-57)||(46966940-46966996)
chr3 (3-101)||(1618916-1619018)
chr3 (118-206)||(6484372-6484462)
chr3 (156-206)||(25688316-25688367)
chr3 (28-67)||(25690651-25690690)
chr3 (149-198)||(4560447-4560497)
chr3 (84-195)||(13419864-13419970)
chr3 (3-57)||(26762863-26762917)
chr3 (28-57)||(10621847-10621876)
chr3 (112-206)||(17795269-17795360)
chr3 (112-206)||(19103709-19103800)
chr3 (30-59)||(31021450-31021479)
chr3 (28-57)||(42990205-42990234)
chr3 (112-206)||(25633930-25634022)
chr3 (112-206)||(25635391-25635483)
chr3 (28-64)||(27101558-27101594)
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (1-206)||(24162369-24162575)
chr2 (1-206)||(40032215-40032421)
chr2 (1-206)||(42064407-42064613)
chr2 (1-206)||(13910201-13910407)
chr2 (1-206)||(19504502-19504708)
chr2 (1-206)||(27104691-27104896)
chr2 (1-206)||(19502168-19502374)
chr2 (5-205)||(22287494-22287695)
chr2 (1-206)||(21520850-21521058)
chr2 (1-206)||(6258972-6259178)
chr2 (1-175)||(22407598-22407772)
chr2 (1-206)||(6264306-6264508)
chr2 (28-206)||(23452394-23452577)
chr2 (29-206)||(31732922-31733100)
chr2 (28-206)||(45280141-45280321)
chr2 (28-206)||(42452702-42452879)
chr2 (29-198)||(19007560-19007730)
chr2 (29-193)||(22163117-22163282)
chr2 (29-206)||(11739717-11739895)
chr2 (29-206)||(28196557-28196735)
chr2 (28-206)||(42923666-42923847)
chr2 (29-206)||(14837193-14837371)
chr2 (30-206)||(15539632-15539809)
chr2 (32-206)||(3022086-3022261)
chr2 (37-206)||(34979736-34979906)
chr2 (28-197)||(35215752-35215932)
chr2 (29-206)||(17848365-17848542)
chr2 (29-206)||(17849037-17849215)
chr2 (1-139)||(43623793-43623931)
chr2 (69-197)||(35218129-35218258)
chr2 (69-206)||(38020162-38020300)
chr2 (29-198)||(44289233-44289403)
chr2 (28-162)||(5377631-5377769)
chr2 (69-206)||(45239134-45239271)
chr2 (1-206)||(18800471-18800665)
chr2 (29-206)||(11578266-11578439)
chr2 (30-123)||(38020064-38020157)
chr2 (1-152)||(35107192-35107341)
chr2 (28-101)||(37963190-37963263)
chr2 (28-205)||(22874061-22874227)
chr2 (28-206)||(17897403-17897578)
chr2 (2-100)||(12342673-12342772)
chr2 (30-206)||(20146766-20146941)
chr2 (1-72)||(36559067-36559138)
chr2 (1-72)||(36561344-36561415)
chr2 (17-72)||(45332384-45332439)
chr2 (1-57)||(28462593-28462649)
chr2 (119-206)||(28459347-28459435)
chr2 (29-124)||(38414281-38414365)
chr2 (4-59)||(45156946-45157001)
chr2 (30-72)||(20147040-20147082)
chr2 (3-57)||(35028473-35028527)
chr2 (3-77)||(40699203-40699278)
chr2 (85-157)||(39287188-39287256)
chr2 (85-126)||(41304627-41304667)
chr2 (29-57)||(20589581-20589609)
chr2 (3-55)||(33603818-33603870)
[»] chr7 (84 HSPs)
chr7 (1-206)||(1049452-1049658)
chr7 (1-206)||(27306387-27306592)
chr7 (1-206)||(40836899-40837105)
chr7 (1-206)||(35555-35761)
chr7 (7-206)||(31435204-31435404)
chr7 (1-198)||(44490-44688)
chr7 (3-206)||(25542459-25542661)
chr7 (7-192)||(18567545-18567731)
chr7 (1-206)||(3878497-3878709)
chr7 (1-206)||(26804499-26804704)
chr7 (5-197)||(31156077-31156271)
chr7 (28-206)||(38393935-38394118)
chr7 (28-206)||(13099633-13099812)
chr7 (29-206)||(44724533-44724711)
chr7 (31-206)||(7470179-7470359)
chr7 (31-206)||(7472137-7472317)
chr7 (28-206)||(42331156-42331335)
chr7 (28-206)||(3035670-3035853)
chr7 (29-206)||(21678020-21678198)
chr7 (29-206)||(21679981-21680159)
chr7 (29-206)||(11355212-11355390)
chr7 (28-208)||(443548-443729)
chr7 (29-208)||(20137264-20137444)
chr7 (13-175)||(22251731-22251893)
chr7 (29-206)||(25276095-25276273)
chr7 (30-206)||(37412284-37412462)
chr7 (28-206)||(48457602-48457785)
chr7 (31-206)||(20625990-20626170)
chr7 (31-206)||(20629881-20630061)
chr7 (31-206)||(20642300-20642480)
chr7 (29-206)||(24748548-24748726)
chr7 (28-206)||(28485515-28485698)
chr7 (28-197)||(7349439-7349615)
chr7 (28-205)||(40946277-40946459)
chr7 (29-206)||(4296091-4296271)
chr7 (69-206)||(1047081-1047219)
chr7 (28-206)||(18345490-18345673)
chr7 (28-197)||(7351818-7351994)
chr7 (35-206)||(24258423-24258595)
chr7 (29-206)||(42223110-42223290)
chr7 (69-198)||(1849975-1850105)
chr7 (28-206)||(20297311-20297494)
chr7 (30-206)||(21990106-21990282)
chr7 (28-206)||(11757177-11757362)
chr7 (28-206)||(20299407-20299592)
chr7 (29-206)||(9680768-9680952)
chr7 (1-206)||(22392399-22392593)
chr7 (29-206)||(39146144-39146322)
chr7 (28-206)||(28487502-28487685)
chr7 (62-206)||(21592300-21592445)
chr7 (28-208)||(43253672-43253860)
chr7 (29-206)||(27832790-27832969)
chr7 (28-206)||(22828790-22828969)
chr7 (3-206)||(7188470-7188671)
chr7 (30-206)||(9679009-9679191)
chr7 (31-206)||(24817511-24817682)
chr7 (3-206)||(20091702-20091903)
chr7 (31-124)||(7094662-7094759)
chr7 (31-124)||(7092414-7092512)
chr7 (75-129)||(38396316-38396370)
chr7 (28-77)||(1606423-1606472)
chr7 (85-208)||(11081522-11081640)
chr7 (1-72)||(22108087-22108158)
chr7 (1-72)||(22137098-22137169)
chr7 (30-206)||(24465503-24465669)
chr7 (1-72)||(40549847-40549918)
chr7 (1-72)||(40552125-40552196)
chr7 (1-72)||(9027396-9027467)
chr7 (1-71)||(2935279-2935349)
chr7 (104-206)||(24813656-24813755)
chr7 (30-97)||(3677235-3677301)
chr7 (145-206)||(7092369-7092431)
chr7 (1-55)||(45366472-45366526)
chr7 (28-72)||(1849918-1849962)
chr7 (35-160)||(6348778-6348903)
chr7 (28-87)||(30906327-30906386)
chr7 (85-206)||(6048885-6049002)
chr7 (153-206)||(38396713-38396767)
chr7 (1-58)||(1047238-1047295)
chr7 (145-205)||(7094618-7094678)
chr7 (28-97)||(6332179-6332248)
chr7 (29-133)||(26210500-26210603)
chr7 (28-57)||(38396239-38396268)
chr7 (3-55)||(42006493-42006545)
[»] chr6 (57 HSPs)
chr6 (3-206)||(14507332-14507536)
chr6 (1-206)||(19227565-19227771)
chr6 (1-206)||(11983186-11983392)
chr6 (28-206)||(28241478-28241657)
chr6 (1-206)||(9019877-9020083)
chr6 (1-206)||(15541297-15541503)
chr6 (28-206)||(1230406-1230585)
chr6 (28-197)||(12195681-12195851)
chr6 (1-206)||(15530279-15530485)
chr6 (1-206)||(30728985-30729191)
chr6 (1-206)||(15532838-15533044)
chr6 (1-174)||(1072067-1072240)
chr6 (36-206)||(14458924-14459093)
chr6 (1-206)||(32279948-32280153)
chr6 (28-206)||(3390357-3390536)
chr6 (29-206)||(13057173-13057351)
chr6 (1-197)||(20915522-20915721)
chr6 (29-206)||(25477253-25477431)
chr6 (29-206)||(3630021-3630199)
chr6 (1-149)||(8995430-8995578)
chr6 (28-206)||(30967176-30967358)
chr6 (1-206)||(4816388-4816608)
chr6 (31-205)||(3632096-3632271)
chr6 (34-197)||(19704735-19704905)
chr6 (28-206)||(2629042-2629226)
chr6 (28-198)||(30034768-30034943)
chr6 (29-206)||(3233887-3234065)
chr6 (29-206)||(13039733-13039911)
chr6 (29-175)||(32447504-32447651)
chr6 (69-206)||(26065005-26065140)
chr6 (69-206)||(26084974-26085109)
chr6 (29-198)||(24338612-24338783)
chr6 (28-158)||(17852520-17852650)
chr6 (28-197)||(26932728-26932906)
chr6 (29-187)||(12161733-12161889)
chr6 (36-175)||(13870611-13870749)
chr6 (28-206)||(3028011-3028186)
chr6 (29-206)||(22490618-22490797)
chr6 (6-194)||(15346347-15346524)
chr6 (1-73)||(26068590-26068662)
chr6 (3-73)||(26066319-26066389)
chr6 (2-206)||(16455583-16455786)
chr6 (29-141)||(10584105-10584212)
chr6 (35-160)||(17012029-17012152)
chr6 (3-101)||(12186330-12186431)
chr6 (29-206)||(14466312-14466480)
chr6 (3-205)||(19696394-19696595)
chr6 (1-77)||(29754983-29755059)
chr6 (62-206)||(15719666-15719799)
chr6 (149-197)||(5273382-5273431)
chr6 (1-62)||(33308905-33308966)
chr6 (1-62)||(33311174-33311235)
chr6 (28-72)||(18318004-18318048)
chr6 (3-101)||(12911710-12911812)
chr6 (3-101)||(12937457-12937559)
chr6 (145-205)||(15367129-15367187)
chr6 (90-160)||(17904566-17904632)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (1-206)||(14944-15150)
scaffold0131 (41-206)||(14539-14707)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (1-206)||(69448-69658)
scaffold0025 (1-175)||(73212-73390)
scaffold0025 (141-187)||(73163-73210)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (28-206)||(41640-41819)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (1-198)||(6124-6322)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (1-206)||(3922-4127)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (31-206)||(79140-79316)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (28-206)||(183797-183975)
scaffold0005 (28-206)||(51961-52142)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (1-206)||(29086-29302)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (28-206)||(11630-11809)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (28-206)||(1988-2172)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (69-197)||(34-163)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (29-206)||(79812-79991)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (28-142)||(1053-1167)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (29-206)||(35593-35770)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (29-198)||(85184-85353)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (3-206)||(15979-16180)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (30-198)||(16816-16981)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (38-130)||(1866-1958)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (143-206)||(1609-1673)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (1-72)||(22135-22206)
scaffold0140 (1-72)||(24410-24481)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (35-87)||(4773-4825)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 14807723 - 14807929
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807723 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 14807822  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  14807823 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 14807922  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  14807923 tctcttg 14807929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 27826958 - 27827164
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27826958 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 27827057  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  27827058 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27827157  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  27827158 tctcttg 27827164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 27829269 - 27829475
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829269 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 27829368  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  27829369 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27829468  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  27829469 tctcttg 27829475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 18810680 - 18810886
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810680 gcagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 18810779  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  18810780 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 18810879  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  18810880 tctcttg 18810886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28251930 - 28251724
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28251930 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaa 28251831  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  28251830 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 28251731  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  28251730 tctcttg 28251724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 4423990 - 4424196
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4423990 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaa 4424089  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||     
T  4424090 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgag 4424189  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  4424190 tctcttg 4424196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Original strand, 15072686 - 15072888
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072686 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 15072785  T
Q  105 aacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctc 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  15072786 aacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctc 15072885  T
Q  204 ttg 206  Q
    |||    
T  15072886 ttg 15072888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 44720815 - 44721022
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44720815 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 44720914  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttggg-aaacactgttaggattga 198  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  44720915 aggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattga 44721014  T
Q  199 ctctcttg 206  Q
     |||||||    
T  44721015 gtctcttg 44721022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 15067953 - 15068151
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15067953 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaa 15068052  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  15068053 aggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattga 15068151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541553
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 33541624  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33541623 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattga 33541553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 32339304 - 32339487
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339304 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 32339403  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  32339404 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttg 32339487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27107054
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27107133  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27107132 gagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 27107054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13858842 - 13858649
Alignment:
Q  6 tttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 105  Q
    |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13858842 tttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggca 13858743  T
Q  106 acaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13858742 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 13858649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 18812865 - 18813060
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18812865 gcagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaa 18812964  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  18812965 aggcaacaacaaaac-----------tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 18813053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 1225165 - 1225344
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  1225165 acttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 1225264  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1225265 agagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 1225344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477454
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14477375  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
     | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  14477376 aagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttg 14477454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 205
Target Start/End: Original strand, 26775200 - 26775378
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26775200 acttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtat 26775299  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctctt 205  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  26775300 atagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 27911014 - 27911192
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27911014 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtat 27911112  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27911113 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 27911192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 27957433 - 27957611
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27957433 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtat 27957531  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27957532 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 27957611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 15809214 - 15809396
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809214 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 15809313  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  15809314 gtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 15809396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28283561 - 28283376
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28283561 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 28283462  T
Q  122 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28283461 ttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttg 28283376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30480838 - 30480660
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30480838 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtata 30480739  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30480738 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 30480660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14419549 - 14419348
Alignment:
Q  6 tttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 105  Q
    |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419549 tttgttccaatttatgagtgatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 14419450  T
Q  106 acaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctct 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  14419449 acaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctct 14419350  T
Q  205 tg 206  Q
    ||    
T  14419349 tg 14419348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865715
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctctt 205  Q
    || |||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 36865715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3886277 - 3886153
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886277 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 3886178  T
Q  105 aacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3886177 aacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24873523 - 24873347
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873523 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 24873424  T
Q  122 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  24873423 ttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattg 24873347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5623073 - 5622893
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5623073 cttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 5622974  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttgat 208  Q
    || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | || ||||||| |||||||||    
T  5622973 gagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgat 5622893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 41384744 - 41384922
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41384744 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41384842  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  41384843 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttg 41384922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 3874005 - 3874188
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  3874005 acttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagttt 3874104  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  3874105 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttg 3874188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12517385 - 12517248
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517385 atttgttccaaattttaagcgatacttttactatatatatataccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 12517286  T
Q  103 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctct 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12517285 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22685002 - 22684813
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22685002 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaacta 22684903  T
Q  118 gggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22684902 gggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 22684813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Original strand, 608735 - 608912
Alignment:
Q  38 taaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  608735 taaatatagaccttatatcatagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatag 608834  T
Q  130 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  608835 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttg 608912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 175
Target Start/End: Original strand, 41382672 - 41382819
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41382672 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41382771  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41382772 agaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcac 41382819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372335
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatata 5372414  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5372413 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 5372335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 77 - 197
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079771
Alignment:
Q  77 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-c 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  176 ttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  43079750 ttgggaaacactattaggattg 43079771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 197
Target Start/End: Original strand, 43082013 - 43082142
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43082013 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 43082112  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  43082113 gattcaccttgggaaacactatcaggattg 43082142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 25952521 - 25952698
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  25952521 cttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattaggg-ttgtata 25952619  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
     | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||||||    
T  25952620 tagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttg 25952698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 35872713 - 35872559
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  35872713 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtata 35872619  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacact 187  Q
    || |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35872618 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 35872559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 2468461 - 2468361
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2468461 gcagatttgttccaaatgttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttagaa 2468362  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  2468361 a 2468361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15186072 - 15185869
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  15186072 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaa 15185973  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgact 200  Q
    |  || |||||||||| ||||| |||| | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||| |    
T  15185972 gaaaataacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagt 15185873  T
Q  201 ctct 204  Q
    ||||    
T  15185872 ctct 15185869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 204
Target Start/End: Original strand, 43530123 - 43530291
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                 
T  43530123 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac------------- 43530209  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctct 204  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43530210 gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct 43530291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 181536 - 181632
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  181536 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37214512 - 37214369
Alignment:
Q  62 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact-------------------agggtttgtatagaatttgtctcttt 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||| |||||||||||    
T  37214512 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtctcttt 37214413  T
Q  143 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaaca 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37214412 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 37214369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482488
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||||||    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttaga--------aatcaaactagggtttgtata 21482413  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
     | |||| ||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  21482414 aagtttg-ctcttggcaacaaacactagggt---tgggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttg 21482488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Original strand, 31162186 - 31162387
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct-gaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||    
T  31162186 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaa 31162285  T
Q  101 aggcaa-caacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    |  ||| |||| ||| ||| ||||||||| | |||| ||||| | |||||||||||  |||   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  31162286 a--caagcaac-aaattagtgtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 31162379  T
Q  199 ctctcttg 206  Q
     |||||||    
T  31162380 gtctcttg 31162387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 31035041 - 31035236
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga--tagagggggctgaaa-caagggttta 97  Q
    |||||||||||||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  ||||| |  |||||| ||| ||||||    
T  31035041 cagatttgttccaattttttag-gatatttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaactttgagaggtagagagt-ctgaaaacaatggttta 31035138  T
Q  98 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt 196  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  31035139 gaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaaacaccattaggatt 31035234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Original strand, 17847501 - 17847556
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847501 cagatttgttccaaattttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatca 17847556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 198
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956127
Alignment:
Q  119 ggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattga 15956127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 206
Target Start/End: Original strand, 21480547 - 21480680
Alignment:
Q  62 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggttt 161  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||| ||     
T  21480547 aaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt- 21480636  T
Q  162 gtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
      |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  21480637 --gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttg 21480680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3005929 - 3005789
Alignment:
Q  62 aaactttgagatagagggggct-gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtt 160  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |  ||||||| ||||||||||| |||| |||||   |||||||| ||||||     
T  3005929 aaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggt- 3005834  T
Q  161 tgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
      ||| ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||| |||||||    
T  3005833 --tggattgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttg 3005789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Original strand, 6375988 - 6376032
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  6375988 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacattgaga 6376032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 43079558 - 43079614
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079558 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 43079614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 43081930 - 43081986
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081930 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 43081986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31574000 - 31573884
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaa 183  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  ||||||||| |||||| ||   || |||||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||| ||||||||    
T  31574000 aaacaaaggtttagaa-gccaacacgaaaactaggatttgtagag---ttttctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaa 31573907  T
Q  184 cactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  31573906 cactgttaggattgagtctcttg 31573884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 31574100 - 31574054
Alignment:
Q  6 tttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgta 54  Q
    ||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31574100 tttgttccaaattttgagaga--cttttactataaatatagaccttgta 31574054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 87)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 51749955 - 51750161
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51749955 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 51750054  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  51750055 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 51750154  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  51750155 tctcttg 51750161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 13214997 - 13215203
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13214997 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 13215096  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||     
T  13215097 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgag 13215196  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  13215197 tctcttg 13215203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 13761753 - 13761959
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13761753 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaa 13761852  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattc-acttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  13761853 aggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgag 13761952  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  13761953 tctcttg 13761959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 15823462 - 15823668
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15823462 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 15823561  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||     
T  15823562 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgag 15823661  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  15823662 tctcttg 15823668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 6823800 - 6824007
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6823800 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttaga 6823899  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  6823900 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattga 6823999  T
Q  199 ctctcttg 206  Q
     |||||||    
T  6824000 atctcttg 6824007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 6822931 - 6823136
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6822931 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 6823030  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||     
T  6823031 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgag 6823129  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  6823130 tctcttg 6823136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Original strand, 20302379 - 20302581
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302379 atttgttccaaattttaagtgaaacttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 20302478  T
Q  105 aacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20302479 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 20302578  T
Q  204 ttg 206  Q
    |||    
T  20302579 ttg 20302581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38925843 - 38925637
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38925843 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaa 38925744  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||     
T  38925743 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 38925644  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  38925643 tctcttg 38925637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 28840594 - 28840802
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||    
T  28840594 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttag 28840693  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28840694 aaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 28840793  T
Q  198 actctcttg 206  Q
    | |||||||    
T  28840794 agtctcttg 28840802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Original strand, 28842413 - 28842609
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842413 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 28842512  T
Q  103 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28842513 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattga 28842609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10400193 - 10399987
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400193 gcagatttgttccaaattttaagcgaaactttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 10400094  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  10400093 tgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 10399994  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  10399993 tctcttg 10399987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 16226085 - 16226280
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 102  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  16226085 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaa 16226184  T
Q  103 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16226185 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 16226280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 41646836 - 41647034
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41646836 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaa 41646935  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41646936 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 41647034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28207431 - 28207225
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207431 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 28207332  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||      
T  28207331 agacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtg 28207232  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  28207231 tctcttg 28207225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 51752281 - 51752486
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51752281 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaa 51752380  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||     
T  51752381 aggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gattgag 51752479  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  51752480 tctcttg 51752486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 2617460 - 2617638
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2617460 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 2617559  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2617560 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 2617638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 47451564 - 47451738
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  47451564 gcagatttgttccaaatattaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaa 47451663  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 175  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47451664 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 47451738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 20291390 - 20291579
Alignment:
Q  18 tttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291390 tttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 20291489  T
Q  118 gggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20291490 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 20291579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21948526 - 21948347
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948526 tttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 21948427  T
Q  127 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21948426 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaacactattaggattgagtctcttg 21948347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 39462435 - 39462641
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  39462435 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaa 39462534  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  39462535 atgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 39462634  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  39462635 tctcttg 39462641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 47179627 - 47179826
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  47179627 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 47179726  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  47179727 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 47179826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Original strand, 47177276 - 47177473
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  47177276 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 47177375  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggat 195  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  47177376 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 47177473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14098329 - 14098129
Alignment:
Q  7 ttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 106  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  14098329 ttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaa 14098230  T
Q  107 caacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctctt 205  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  14098229 ctacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt 14098130  T
Q  206 g 206  Q
    |    
T  14098129 g 14098129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3579979 - 3579773
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg--ctgaaacaagggtttagaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  3579979 atttgttccaaattttaagcgatacttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaag 3579880  T
Q  103 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactc 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||    
T  3579879 gcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtc 3579780  T
Q  202 tcttgat 208  Q
    |||||||    
T  3579779 tcttgat 3579773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 24325599 - 24325785
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24325599 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagg 24325697  T
Q  120 gtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24325698 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttg 24325785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Original strand, 18307054 - 18307231
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18307054 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataa 18307153  T
Q  130 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18307154 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttg 18307231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Original strand, 39932017 - 39932195
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932017 tttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39932116  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  39932117 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttg 39932195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17186465 - 17186287
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17186465 cttttaatataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 17186366  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  17186365 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttg 17186287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6996038 - 6995859
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6996038 acttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6995939  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  6995938 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttg 6995859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31735863 - 31735680
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga----gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735863 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31735764  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||| |||||||    
T  31735763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttg 31735680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12302848 - 12302664
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12302848 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtt 12302749  T
Q  123 tgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12302748 tgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 12302664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28998591 - 28998412
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28998591 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 28998492  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28998491 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 28998412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29004307 - 29004128
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  29004307 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 29004208  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  29004207 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 29004128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 50307884 - 50307705
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50307884 cttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtata 50307785  T
Q  129 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  50307784 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 50307705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9463588 - 9463411
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463588 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 9463489  T
Q  122 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9463488 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 9463411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 18839531 - 18839709
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839531 cttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtata 18839630  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18839631 gagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 18839709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27337280 - 27337098
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337280 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27337181  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  27337180 ttatag-atttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttg 27337098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 50077009 - 50076831
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50077009 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 50076910  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
     | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  50076909 aagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 50076831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17324974 - 17324795
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || || |||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17324974 acttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtat 17324875  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17324874 agagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 17324795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251436
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 25251512  T
Q  130 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctct 204  Q
      |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  25251511 cgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctct 25251436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 198
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490027
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 31489958  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  31489959 g--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 31490027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2510666 - 2510491
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2510666 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggttt 2510567  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  2510566 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattga 2510491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9459761 - 9459584
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9459761 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggt 9459662  T
Q  122 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9459661 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 9459584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Original strand, 16428569 - 16428775
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||   || ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428569 cagatttgttcgaattttataagggatacttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 16428668  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||     
T  16428669 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 16428768  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  16428769 tctcttg 16428775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 47906207 - 47906392
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  47906207 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggt 47906306  T
Q  122 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  47906307 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 47906392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 48665114 - 48665299
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggc------tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665114 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 48665213  T
Q  122 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  48665214 ttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 48665299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 50079158 - 50078980
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  50079158 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcata 50079059  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | |||||||    
T  50079058 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttg 50078980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248731
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||    
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatata 50248810  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  50248809 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttg 50248731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27339472 - 27339290
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27339472 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggttt 27339373  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctctt 205  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||    
T  27339372 gtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctctt 27339290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Original strand, 6756470 - 6756642
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||   | |||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756470 acttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6756569  T
Q  128 agaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6756570 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 6756642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15295183 - 15294993
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295183 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagagagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 15295084  T
Q  117 agggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15295083 agggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 15294993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4131676 - 4131538
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4131676 gagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 4131577  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4131576 gatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 4131538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 46431996 - 46431866
Alignment:
Q  77 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-c 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46431996 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 46431897  T
Q  176 ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  46431896 ttgggaaacactattaggattgagtctcttg 46431866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9241424 - 9241245
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9241424 acttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 9241326  T
Q  127 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||||||    
T  9241325 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttg 9241245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2949569 - 2949390
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| |||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  2949569 acttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 2949470  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2949469 agagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 2949390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11457812 - 11457634
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11457812 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 11457713  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||  |||| | |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  11457712 gagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttg 11457634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31425335 - 31425185
Alignment:
Q  50 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg-aaca 148  Q
    ||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  31425335 ttgtatcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaaca 31425236  T
Q  149 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  31425235 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 31425185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 16231517 - 16231641
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16231517 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaa 16231616  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  16231617 aagcaacaagaaaactagggtttgt 16231641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 185
Target Start/End: Original strand, 17318838 - 17318994
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17318838 ttttactataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttag 17318937  T
Q  130 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaaca 185  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  17318938 agtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaaca 17318994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31423212 - 31423032
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31423212 acttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatat 31423113  T
Q  128 agaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  31423112 agagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttg 31423032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 206
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25127994
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| |||| |||||||| || ||||||| |||||||    
T  25127956 gattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttg 25127994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 17324009 - 17324186
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||| ||||    
T  17324009 cttttattataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttata 17324106  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttga 207  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17324107 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttga 17324186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 206
Target Start/End: Original strand, 40133937 - 40134066
Alignment:
Q  78 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-ct 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  40133937 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 40134036  T
Q  177 tgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| |||  ||||||||| |||||||    
T  40134037 tgggaaatactactaggattgagtctcttg 40134066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 25248850 - 25248756
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248850 tttttctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Original strand, 42922151 - 42922352
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  42922151 agatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttag-aa 42922249  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgact 200  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | | ||||||||||||||||    |||||||||| |||| |||| ||| |||||||||| |    
T  42922250 gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt--gaggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagt 42922346  T
Q  201 ctcttg 206  Q
    ||||||    
T  42922347 ctcttg 42922352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18800907 - 18800734
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  18800907 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttag-aagtcaacaagaaaactacggtttgtat 18800809  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctct 204  Q
    ||| |||| ||||| |  ||||| |||||||||   ||||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||    
T  18800808 agagtttg-ctcttggccacaaatactagggtt--ggggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctct 18800734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 30790759 - 30790658
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  30790759 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttaga 30790660  T
Q  100 aa 101  Q
    ||    
T  30790659 aa 30790658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8349414 - 8349219
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 99  Q
    |||||||||||||| ||| | || || | ||||| |||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8349414 cagatttgttccaattttatgagggataattttattataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttag- 8349316  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||| |||||| |||| || |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8349315 aagtcaacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggtttattcaccttgggaaacactattaggattga 8349219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183751
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||||||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttag-aatgcaaca--caaactagggtttgtata 14183827  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||  ||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||| |||||||    
T  14183826 gaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttg 14183751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8347607 - 8347430
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8347607 acttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttgta 8347510  T
Q  127 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttgat 208  Q
    ||||  ||| ||||| | ||||||||| | ||||   ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  8347509 tagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgat 8347430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432516
Alignment:
Q  76 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca- 174  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg-----------tttgtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  175 cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  16432485 cttgggaaacattattaggattgaatctcttg 16432516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 49495537 - 49495468
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49495537 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggttta 49495468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26520449 - 26520279
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-ggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaat 132  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  26520449 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 26520351  T
Q  133 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| | ||    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  26520350 ttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--gaggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttg 26520279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15669729 - 15669553
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || | | |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| | | |||| || ||||| ||||||||||    
T  15669729 acttttactataaatacagaccttgtagcagatgtaaacattgggatagagggggctgaaaactagggtttggga-ggcagca-caaaagtagggtttgt 15669632  T
Q  126 atagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| | |||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15669631 ataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 15669553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13125787 - 13125626
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-gtatagaatt 133  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||  |||||| | |||||||||||||||||||| || ||| ||||||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  13125787 ctataaatagaaaccttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaag-aagccaacaaggaaactagggtttggtatagagtt 13125689  T
Q  134 tgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    || ||||| |  |||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13125688 tg-ctcttggcgacaaacactagggtt--gaggttgattcacattgggaaacgctgttaggattga 13125626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 23783467 - 23783533
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 67  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783467 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 23783533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 26613603 - 26613503
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctg-aaacaagggtttaga 99  Q
    ||||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26613603 agatttgttccaatttttgagggattcttttgctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagatagagggggctgaaaacaagggtttaga 26613504  T
Q  100 a 100  Q
    |    
T  26613503 a 26613503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 49687456 - 49687496
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaa 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49687456 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaa 49687496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 6115383 - 6115344
Alignment:
Q  62 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115383 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 80
Target Start/End: Original strand, 16431017 - 16431096
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg 80  Q
    |||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16431017 cagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataggttttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg 16431096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 197
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231676
Alignment:
Q  152 actagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 16231676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 27916415 - 27916571
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggc--tgaaacaagggtttaga 99  Q
    ||||||||||||| |||  || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | || | ||    ||||||||||||||     
T  27916415 agatttgttccaattttggagggatacttttactataaatatagacattgtatcaaatgtaaactgtgagaaacagagagccagaaaacaagggtttag- 27916513  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtt 160  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||  |||| |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  27916514 aagccagcaagaaaactagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt 27916571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13127959 - 13127837
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaattt 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||| || ||| |||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||| |||||| |||    
T  13127959 ctataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagagaggggt-tgaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaagtagggtttatatagagttt 13127862  T
Q  135 gtctctttggaacaaacactagggtt 160  Q
      || || | ||||||||||||||||    
T  13127861 -ccttttggcaacaaacactagggtt 13127837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 30738963 - 30738890
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  30738963 cttttactataaacatagtccttgtatcagatgaaaccttgagatacaggtgactgaaaacaagggtttagaaa 30738890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 57
Target Start/End: Original strand, 43104102 - 43104131
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43104102 acttttactataaatatagaccttgtatca 43104131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 46432066 - 46432037
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432066 acttttactataaatatagaccttgtatca 46432037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 49958963 - 49959016
Alignment:
Q  4 gatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    |||||||||||||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49958963 gatttgttccaaattttgtgggatgcttttgctataaatatagaccttgtatca 49959016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 90)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 11434925 - 11435128
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11434925 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 11435024  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  11435025 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 11435124  T
Q  200 tctc 203  Q
    ||||    
T  11435125 tctc 11435128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 5198390 - 5198588
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198390 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 5198489  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5198490 aggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattga 5198588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22044753 - 22044547
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044753 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22044654  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgatt-cacttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||     
T  22044653 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgag 22044554  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  22044553 tctcttg 22044547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22803097 - 22802891
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22803097 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22802998  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  22802997 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 22802898  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  22802897 tctcttg 22802891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 48486289 - 48486495
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486289 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 48486388  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  48486389 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 48486488  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  48486489 tctcttg 48486495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 51015216 - 51015422
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015216 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 51015315  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  51015316 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 51015415  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  51015416 tctcttg 51015422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22047048 - 22046842
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047048 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22046949  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  22046948 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 22046849  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  22046848 tctcttg 22046842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 24888766 - 24888972
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888766 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 24888865  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  24888866 aggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 24888965  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  24888966 tctcttg 24888972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 9148221 - 9148429
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  9148221 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttag 9148320  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  9148321 aaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 9148420  T
Q  198 actctcttg 206  Q
    | |||||||    
T  9148421 agtctcttg 9148429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22801225 - 22801017
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801225 gcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22801126  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||     
T  22801125 tgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 22801026  T
Q  200 tctcttgat 208  Q
    |||||||||    
T  22801025 tctcttgat 22801017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 40091774 - 40091572
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40091774 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagac 40091675  T
Q  105 aacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctc 203  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  40091674 aacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctc 40091575  T
Q  204 ttg 206  Q
    |||    
T  40091574 ttg 40091572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5637832 - 5637622
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||    
T  5637832 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagttt 5637733  T
Q  97 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggat 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5637732 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 5637633  T
Q  196 tgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||    
T  5637632 tgagtctcttg 5637622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 38409169 - 38409381
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||    
T  38409169 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggt 38409268  T
Q  95 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttagg 193  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  38409269 ttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 38409368  T
Q  194 attgactctcttg 206  Q
    ||||| |||||||    
T  38409369 attgagtctcttg 38409381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Original strand, 24878963 - 24879165
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  24878963 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagac 24879062  T
Q  105 aacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24879063 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 24879162  T
Q  204 ttg 206  Q
    |||    
T  24879163 ttg 24879165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 24880421 - 24880627
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  24880421 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaa 24880520  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  24880521 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgag 24880620  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  24880621 tctcttg 24880627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 47274697 - 47274902
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274697 gcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 47274796  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  47274797 aggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgag 47274895  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  47274896 tctcttg 47274902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 18847123 - 18847320
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18847123 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaa 18847222  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  18847223 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattg 18847320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31849962 - 31849755
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849962 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactagaaatataggtcttgtatcagagcaaactaggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 31849863  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacact-agggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  31849862 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 31849763  T
Q  199 ctctcttg 206  Q
     |||||||    
T  31849762 gtctcttg 31849755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 36919950 - 36919741
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga--gatagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36919950 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttag 36919851  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36919850 aaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 36919751  T
Q  197 gactctcttg 206  Q
    || |||||||    
T  36919750 gagtctcttg 36919741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44600174 - 44600004
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44600174 acttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 44600075  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  44600074 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 44600004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16934506 - 16934309
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16934506 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaa 16934407  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  16934406 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattg 16934309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37089737 - 37089526
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggttta 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089737 gcagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctgaaacaagggttta 37089638  T
Q  98 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37089637 gaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 37089538  T
Q  197 gactctcttgat 208  Q
    || |||||||||    
T  37089537 gagtctcttgat 37089526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 40637071 - 40637250
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637071 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 40637170  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  40637171 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttg 40637250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9174509 - 9174311
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174509 gcagatttgttacagtttttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 9174410  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9174409 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattga 9174311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 619808 - 619604
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 102  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  619808 agattttttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaag 619709  T
Q  103 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactc 201  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||     
T  619708 acaacaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactg 619609  T
Q  202 tcttg 206  Q
    |||||    
T  619608 tcttg 619604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 7941289 - 7941499
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaac--tttgagatagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941289 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacgttgtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaacaagggtttag 7941388  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa--cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggat 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7941389 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 7941488  T
Q  196 tgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||    
T  7941489 tgagtctcttg 7941499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8631759 - 8631576
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631759 actttcactataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 8631660  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  8631659 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 8631576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 36921858 - 36921650
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36921858 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttag 36921760  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36921759 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 36921660  T
Q  197 gactctcttg 206  Q
    || |||||||    
T  36921659 gagtctcttg 36921650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9176837 - 9176640
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| ||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176837 gcagatttgttacagtttttaagcaagacatttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 9176738  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  9176737 aagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 9176640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16932152 - 16931955
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16932152 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaa 16932053  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  16932052 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattg 16931955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 52942810 - 52942603
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat--caaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52942810 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttag 52942712  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  52942711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattg 52942612  T
Q  198 actctcttg 206  Q
    | |||||||    
T  52942611 agtctcttg 52942603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2485209 - 2485029
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga-gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485209 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 2485110  T
Q  127 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2485109 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 2485029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 6764836 - 6765020
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6764836 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6764935  T
Q  128 agaatttgtctc-----tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6764936 agagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttg 6765020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 24348211 - 24348394
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24348211 acttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 24348310  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24348311 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 24348394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 14633317 - 14633495
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14633317 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 14633415  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14633416 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 14633495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 47868398 - 47868577
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868398 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 47868497  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  47868498 agagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 47868577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14787769 - 14787588
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14787769 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 14787670  T
Q  126 atagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14787669 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 14787588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38928513 - 38928334
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928513 cttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 38928414  T
Q  129 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  38928413 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 38928334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11006604 - 11006403
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-----gagatagagggggctgaaacaagggtt 95  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  11006604 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaga-ctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtt 11006506  T
Q  96 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttagga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11006505 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 11006406  T
Q  195 ttg 197  Q
    |||    
T  11006405 ttg 11006403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11008933 - 11008732
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-----gagatagagggggctgaaacaagggtt 95  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  11008933 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag-gctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtt 11008835  T
Q  96 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttagga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11008834 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 11008735  T
Q  195 ttg 197  Q
    |||    
T  11008734 ttg 11008732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3824936 - 3824735
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaa-ctttgaga----tagagggggctgaaacaagggtt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||    |||||||||||||||||  ||||    
T  3824936 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtatttctttgagagagatagagggggctgaaaca--ggtt 3824839  T
Q  96 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttagga 194  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3824838 tagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 3824739  T
Q  195 ttga 198  Q
    ||||    
T  3824738 ttga 3824735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 16453306 - 16453485
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  16453306 acttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtac 16453405  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16453406 aaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 16453485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 19095880 - 19096059
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  19095880 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtata 19095979  T
Q  129 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  19095980 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttg 19096059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12396180 - 12396002
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396180 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12396081  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12396080 gagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 12396002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 205
Target Start/End: Original strand, 36378289 - 36378467
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36378289 acttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 36378388  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctctt 205  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | ||||||    
T  36378389 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctt 36378467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37313400 - 37313223
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37313400 ttttactataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 37313301  T
Q  130 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  37313300 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 37313223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 56030443 - 56030612
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  56030443 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 56030542  T
Q  130 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  56030543 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 56030612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12401142 - 12400964
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12401142 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12401043  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  12401042 gagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttg 12400964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18709458 - 18709320
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  18709458 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagtt 18709359  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  18709358 gattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttg 18709320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33415821 - 33415645
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33415821 ttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 33415722  T
Q  130 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||    
T  33415721 agtttgtctc-ttggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttg 33415645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937366
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3937543 cttttactataaatatagacttt-tatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtata 3937445  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| |||||||    
T  3937444 gagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttg 3937366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22780668 - 22780539
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22780668 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22780569  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22780568 gattcaccttgggaaacactgttaggattg 22780539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22783033 - 22782904
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22783033 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22782934  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22782933 gattcaccttgggaaacactgttaggattg 22782904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 205
Target Start/End: Original strand, 41997494 - 41997667
Alignment:
Q  33 tactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaat 132  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  41997494 tactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagt 41997593  T
Q  133 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctctt 205  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  41997594 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt 41997667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22132735 - 22132548
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag---------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22132735 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttg 22132636  T
Q  119 ggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22132635 ggtttgtatagagtttgtctc-ttcgaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 22132548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17662574 - 17662402
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17662574 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt-- 17662477  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
             ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17662476 ---------ttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 17662402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 53405124 - 53405305
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga---gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405124 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 53405223  T
Q  125 tatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||    
T  53405224 tatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttg 53405305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270162
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 38270222  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacact 187  Q
    || ||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  38270221 gagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacact 38270162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 47211082 - 47210940
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47211082 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 47210983  T
Q  122 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtg 164  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47210982 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 47210940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22134909 - 22134773
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22134909 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc-ttcaaacaaacactagggtttgtgggtt 22134812  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22134811 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 22134773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 5100994 - 5101133
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5100994 acttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 5101093  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggt 167  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5101094 agagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8756613 - 8756411
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttaga 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  8756613 gcagatttgttccaaattataaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttag- 8756515  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||| |||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  8756514 aagtcaacaagaaaattaggatttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttgggaaacactactaggattga 8756418  T
Q  199 ctctctt 205  Q
     ||||||    
T  8756417 gtctctt 8756411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24446914 - 24446760
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  24446914 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtata 24446820  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacact 187  Q
    || |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24446819 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 24446760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6133048
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtata 6132969  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6132970 gagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttg 6133048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409505
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18409583  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctctt 205  Q
    || |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||| || |||||| |||||||||| ||||||    
T  18409582 gagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctctt 18409505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 206
Target Start/End: Original strand, 19322701 - 19322869
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaattt 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19322701 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt 19322799  T
Q  135 gtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19322800 g-ctcttggcaacaaacactagggtt--tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 19322869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Original strand, 13543953 - 13544135
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||    |||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13543953 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 13544052  T
Q  125 tatagaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13544053 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 13544135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 148
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891434
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgta-tcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2891413  T
Q  128 agaatttgtctctttggaaca 148  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  2891414 agagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26086133
Alignment:
Q  104 caacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  203 cttg 206  Q
    ||||    
T  26086136 cttg 26086133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18537806 - 18537632
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  18537806 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaa-caaacaac-aaactagggtttgtat 18537709  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||| ||||| | ||||| ||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18537708 agagtttg-ctcttggcaacaaccactagggtt--ggggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttg 18537632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15032898 - 15032752
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| | ||| || || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15032898 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttag-aa 15032800  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 150  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  15032799 gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaa 15032752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18535164 - 18534990
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||   |||||| ||||||||||||||||    
T  18535164 cttttacaataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgttta-aaaacaaacaac-aaactagggtttgtat 18535067  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  18535066 agagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 18534990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 198
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380517
Alignment:
Q  107 caacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || || || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 36380517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 198
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499213
Alignment:
Q  114 actagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattga 27499213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40999308 - 40999156
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||||| |||| | | ||| |||||||||||||| |     
T  40999308 agatttgttccaaattttaagggttatttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtaga-gagtctgaaaacaagggtttag-ac 40999211  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagg 157  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||   |||||||||||||    
T  40999210 gtcaacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactagg 40999156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 16186173 - 16186099
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct-gaaacaagggtttagaaa 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16186173 acttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaaa 16186099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 101
Target Start/End: Original strand, 25357607 - 25357713
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaatttta--agcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-----ggggctg-aaacaaggg 93  Q
    |||||||||||||| |||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||     ||||||| |||||||||    
T  25357607 cagatttgttccaa-ttttacgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagagtgagaggggctgaaaacaaggg 25357705  T
Q  94 tttagaaa 101  Q
    ||||||||    
T  25357706 tttagaaa 25357713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 206
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455417
Alignment:
Q  144 gaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 16455417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890381
Alignment:
Q  111 aaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttgat 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgat 38890381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 101
Target Start/End: Original strand, 12102088 - 12102162
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga-gggggctg-aaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12102088 cttttactataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaagggtttagaaa 12102162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Original strand, 28453686 - 28453858
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| |     
T  28453686 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgcag 28453783  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||  |||| ||||| | || ||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28453784 ag--tttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttg 28453858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 100
Target Start/End: Original strand, 16455284 - 16455356
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16455284 acttttgctattaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 52043791 - 52043737
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||| |||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52043791 agatttgttccaattttttagggatgcttttactataaatatagaccttgtatca 52043737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22780744 - 22780687
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaa 58  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22780744 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaa 22780687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22783109 - 22783052
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaa 58  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22783109 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaa 22783052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Original strand, 9863712 - 9863874
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatag-agggggctg--aaacaagggtttagaaaggcaacaac-aaaactagggtttgtataga 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||    
T  9863712 ctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttag-aagccaaaaacaaaaactagggtttg--taga 9863808  T
Q  131 atttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
     ||||| |||| | ||||||||||| ||||   || |||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  9863809 gtttgt-tcttggcaacaaacactaaggtt--gggtttgattcaccttgggaaaccctattaggattga 9863874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22134966 - 22134936
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaa 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134966 acttttactataaatatagaccttgtatcaa 22134936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 160
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022433
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtt 160  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||| | ||||||||||| ||||    
T  9022362 aaacaagggtttagaa-gtcaacatcaaaactagggtttgtagagaat---tctcttggcaacaaacactatggtt 9022433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 160
Target Start/End: Original strand, 54906631 - 54906702
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtt 160  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||| ||   || |||||||| ||||||||||||||||    
T  54906631 aaacaagggcttagaa-gccaacaataaaactagggtttgtaaag---ttttctctttgcaacaaacactagggtt 54906702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47151052
Alignment:
Q  167 ttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttg 47151052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 2805 - 3011
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2805 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 2904  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||     
T  2905 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 3004  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  3005 tctcttg 3011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 84)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25921836 - 25921630
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921836 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 25921737  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||     
T  25921736 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgag 25921637  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  25921636 tctcttg 25921630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 38882021 - 38882228
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38882021 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttaga 38882120  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38882121 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 38882220  T
Q  199 ctctcttg 206  Q
     |||||||    
T  38882221 gtctcttg 38882228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 4236545 - 4236751
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4236545 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaa 4236644  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||     
T  4236645 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 4236744  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  4236745 tctcttg 4236751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 31542651 - 31542848
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542651 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 31542750  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31542751 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 31542848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Original strand, 16776075 - 16776280
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaa-tatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16776075 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaaatatagaccttgtatctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaa 16776174  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  16776175 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 16776274  T
Q  201 ctcttg 206  Q
    ||||||    
T  16776275 ctcttg 16776280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 31544996 - 31545192
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31544996 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 31545095  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31545096 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 31545192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 2174835 - 2175041
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2174835 gcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatacaggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 2174934  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||     
T  2174935 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgag 2175034  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  2175035 tctcttg 2175041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 21947943 - 21948148
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21947943 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaa 21948041  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  21948042 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 21948141  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  21948142 tctcttg 21948148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2818699 - 2818492
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818699 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 2818600  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggg-ttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  2818599 aggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattga 2818500  T
Q  199 ctctcttg 206  Q
     |||||||    
T  2818499 gtctcttg 2818492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31179734 - 31179537
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31179734 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaa 31179635  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31179634 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 31179537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12556285 - 12556080
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  12556285 cagatttgtttcaaaatttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaat 12556186  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgact 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |    
T  12556185 gacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgt 12556086  T
Q  201 ctcttg 206  Q
    ||||||    
T  12556085 ctcttg 12556080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 203
Target Start/End: Original strand, 39854427 - 39854602
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854427 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 39854525  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctc 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  39854526 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 39854602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10529435 - 10529256
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10529435 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttat 10529336  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10529335 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 10529256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073005
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17072926  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17072927 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttg 17073005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6756410 - 6756608
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6756410 gcagatttattccaaattttaagttatacttttactattaatatagatcttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaa 6756509  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattc-acttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  6756510 aggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattga 6756608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043172
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20043093  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20043094 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 20043172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904225
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtata 25904146  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25904147 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 25904225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 36402690 - 36402485
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36402690 gcagatttgttc-aaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 36402592  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
     | |||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||     
T  36402591 tgacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaa 36402492  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  36402491 tctcttg 36402485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 18468950 - 18469133
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468950 acttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18469049  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18469050 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 18469133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 40221465 - 40221644
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40221465 acttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 40221564  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  40221565 agagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 40221644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 26097676 - 26097854
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  26097676 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggat 26097775  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  26097776 agagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttggaaacactattaggaatgagtctcttg 26097854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31466341 - 31466135
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||    
T  31466341 gcagatttgttccaaattttaagcgacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaa 31466242  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||| | ||||||||||     
T  31466241 aagtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgag 31466142  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  31466141 tctcttg 31466135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21684824 - 21684608
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaa 90  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  21684824 gcagatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaa 21684725  T
Q  91 gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattc-acttgggaaacactgt 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  21684724 gggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactat 21684625  T
Q  190 taggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||| |||||||    
T  21684624 taggattgagtctcttg 21684608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20507825 - 20507665
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20507825 gcagatttgttccaagatttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 20507726  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggttt 161  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20507725 aggcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaagggttt 20507665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18511547 - 18511369
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18511547 tttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 18511448  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18511447 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 18511369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045132
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 20045053  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  20045054 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttg 20045132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31472948 - 31472770
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472948 cttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31472849  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31472848 gagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 31472770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18509652 - 18509475
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18509652 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatag 18509553  T
Q  130 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18509552 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 18509475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Original strand, 18466625 - 18466806
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18466625 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgg 18466724  T
Q  126 atagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18466725 atagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 18466806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189766
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttg 1189766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530823
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 34530902  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  34530901 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 34530823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 18596590 - 18596767
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18596590 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggtata--aagacaacaacaaaactagggtttgtat 18596687  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18596688 agagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttg 18596767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10474655 - 10474480
Alignment:
Q  32 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaa 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  10474655 ttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagag 10474556  T
Q  132 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  10474555 tttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttg 10474480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37706116 - 37705937
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37706116 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtat 37706017  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  37706016 agactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 37705937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 27912473 - 27912658
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912473 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 27912572  T
Q  122 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27912573 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 27912658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477220
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  34477249 gattcaccttgggaaacactattatgattg 34477220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479585
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  34479614 gattcaccttgggaaacactattatgattg 34479585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26098587 - 26098408
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  26098587 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtat 26098488  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||||| |||||||    
T  26098487 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttg 26098408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 6747247 - 6747427
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6747247 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaagagaaagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgt 6747346  T
Q  126 atagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6747347 ataaaatttgtctctttgaaacaaacacta-ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 6747427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 206
Target Start/End: Original strand, 25804009 - 25804147
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25804009 gagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 25804108  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25804109 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 25804147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 27910388 - 27910572
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||      ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27910388 acttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagagagatagcgggggctgaaacaagg-tttaaaaaggcaacaacaaaactagggt 27910486  T
Q  122 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27910487 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttg 27910572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39398327 - 39398150
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |   | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398327 cttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39398229  T
Q  129 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  39398228 gagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 39398150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 69 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16092495 - 16092357
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16092495 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggtt 16092396  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16092395 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 16092357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 197
Target Start/End: Original strand, 15552229 - 15552358
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15552229 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 15552328  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15552329 gattcaccttgggaaacactattaggattg 15552358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 205
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954538
Alignment:
Q  37 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgt 136  Q
    |||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  137 ctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctctt 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctctt 2954538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 206
Target Start/End: Original strand, 6745053 - 6745190
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6745053 gagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacacta-ggtttgagggtt 6745151  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6745152 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 6745190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17818817 - 17818647
Alignment:
Q  36 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttg 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  17818817 tataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagggg-ctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcg 17818719  T
Q  136 tctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||| || ||| |||||||    
T  17818718 tctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttg 17818647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24126978
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24126899  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||||||   |||||| |||||||||||  | |||||| | ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  24126900 gagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttg 24126978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 695833 - 695999
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |  | |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta-- 695930  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
             ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  695931 ---------tctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaacactattaggattgagtctcttg 695999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 198
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21288883
Alignment:
Q  36 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttg 135  Q
    ||||||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttg 21288814  T
Q  136 tctctttggaacaaacac------tagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||    
T  21288815 tctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttgaaaacactattaggattga 21288883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 125
Target Start/End: Original strand, 4410000 - 4410101
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410000 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4410099  T
Q  124 gt 125  Q
    ||    
T  4410100 gt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6661512 - 6661343
Alignment:
Q  34 actataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatt 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||| |||||||| ||    
T  6661512 actataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtt 6661414  T
Q  134 tgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||| | |||||||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6661413 tgt-tcttggcaacaaacactagagtt--ggggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttg 6661343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658510
Alignment:
Q  107 caacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctctt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||| || ||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  206 g 206  Q
    |    
T  658510 g 658510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 10586782 - 10586954
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga---gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             
T  10586782 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaac--------- 10586872  T
Q  125 tatagaatttgtctcttt-ggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
      |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  10586873 --tagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttg 10586954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 101
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208597
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaa 36208597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 41586042 - 41585946
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  41586042 acttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 39798004 - 39798058
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798004 gcagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtat 39798058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 206
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20053965
Alignment:
Q  72 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgat 171  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||    |||||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttag-aaggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gaggttgat 20053929  T
Q  172 tca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 20053965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 23665054 - 23665125
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665054 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23665125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23793533 - 23793462
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23793533 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23793462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 3373377 - 3373332
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373377 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 3373332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15354845 - 15354777
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 69  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354845 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15354777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15357121 - 15357053
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 69  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357121 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15357053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 23667329 - 23667400
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23667329 gcagatttgttatagattttaagcatgactttaactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23667400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 38960405 - 38960334
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38960405 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 38960334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 10757180 - 10757245
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact 66  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757180 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact 10757245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23742101 - 23742057
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23742101 acttttactataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga 23742057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 34477435 - 34477379
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34477435 gcagatttgttacagattttaagcgagacttttactataaaaatagaccttgtatca 34477379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 42770690 - 42770845
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttaga 99  Q
    |||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||| || |||||||  || |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |     
T  42770690 cagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatc-gagtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggttt-gg 42770787  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtt 160  Q
    |||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    
T  42770788 aaggcaac-acaaaatta-ggtttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt 42770845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 206
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410145
Alignment:
Q  152 actagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 4410145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 29748260 - 29748313
Alignment:
Q  4 gatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29748260 gatttgttccaaattttgagggatgcttttactataaatatagaccttgtatca 29748313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 34479796 - 34479740
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34479796 gcagatttgttacagattttaagcgagacctttactataaaaatagaccttgtatca 34479740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 10749704 - 10749767
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaac 65  Q
    ||||||||||  | |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749704 cagatttgttatagattttaagcaggacttttagtataaatatagaccttgtatcaaagcaaac 10749767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724024
Alignment:
Q  147 caaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttg 2724024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17413441 - 17413325
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaa 183  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  ||||||| |||||||| ||  |||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||    
T  17413441 aaacaagggtttagaa-ggcagcactaaaactatggtttgtagag--tttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaa 17413348  T
Q  184 cactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||| |||||||||| |||||||    
T  17413347 cactattaggattgagtctcttg 17413325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 2144954 - 2144899
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaat-tttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2144954 agatttgttccaattatttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatca 2144899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585901
Alignment:
Q  152 actagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttg 41585901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 79
Target Start/End: Original strand, 2723911 - 2723961
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg 79  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||    
T  2723911 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 2723961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 133
Target Start/End: Original strand, 13295755 - 13295789
Alignment:
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatt 133  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13295755 aaagccaacaacaaaactagggtttgtatagaatt 13295789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Original strand, 39798123 - 39798169
Alignment:
Q  161 tgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  39798123 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 39798169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 160
Target Start/End: Original strand, 9020167 - 9020295
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| | | |||| ||| | ||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9020167 ttttactataaatacataccttgtatcagatgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggttt-gggaggcaac-acaaaagtagggtttgtat 9020264  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtt 160  Q
    ||| ||   ||||| | ||||||||||||||||    
T  9020265 agagtt--gctcttggcaacaaacactagggtt 9020295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 57
Target Start/End: Original strand, 15552178 - 15552207
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552178 acttttactataaatatagaccttgtatca 15552207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 57
Target Start/End: Original strand, 25803959 - 25803988
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803959 acttttactataaatatagaccttgtatca 25803988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 160
Target Start/End: Original strand, 29748352 - 29748423
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtt 160  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||   |||||| | |||||||| |||||||    
T  29748352 aaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtagagaat---tctcttggcaacaaacagtagggtt 29748423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 112)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 3859424 - 3859630
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859424 gcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 3859523  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  3859524 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 3859623  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  3859624 tctcttg 3859630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 5191549 - 5191755
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191549 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 5191648  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  5191649 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 5191748  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  5191749 tctcttg 5191755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 11170300 - 11170498
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170300 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 11170399  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11170400 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattga 11170498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22114666 - 22114460
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22114666 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaa 22114567  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  22114566 aggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 22114467  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  22114466 tctcttg 22114460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 11163046 - 11163218
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163046 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 11163145  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattc 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11163146 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6066158 - 6065960
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttaga 99  Q
    ||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6066158 gcagatttgttacagattttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttaga 6066059  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6066058 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 6065960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 35777317 - 35777514
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777317 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 35777416  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35777417 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 35777514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 38889935 - 38890142
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  38889935 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat---agcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 38890031  T
Q  97 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggat 195  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38890032 agaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 38890131  T
Q  196 tgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||    
T  38890132 tgagtctcttg 38890142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 45882835 - 45883041
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882835 gcagatttgttgaaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 45882934  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  45882935 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 45883034  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  45883035 tctcttg 45883041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4308615 - 4308436
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308615 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 4308516  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4308515 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 4308436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18097262 - 18097055
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttaga 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18097262 gcagatttgtttcaaattttaagcgagacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaacaagggtttaga 18097163  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18097162 atggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 18097063  T
Q  199 ctctcttg 206  Q
     |||||||    
T  18097062 gtctcttg 18097055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18099531 - 18099325
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099531 gcagatttgttccaaattttaagcgagacttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 18099433  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18099432 atggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 18099333  T
Q  199 ctctcttg 206  Q
     |||||||    
T  18099332 gtctcttg 18099325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 24979603 - 24979809
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979603 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 24979702  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||     
T  24979703 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgag 24979802  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  24979803 tctcttg 24979809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10084754 - 10084544
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||    
T  10084754 gcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggttt 10084655  T
Q  97 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggat 195  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10084654 agaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 10084555  T
Q  196 tgactctcttg 206  Q
     || |||||||    
T  10084554 cgagtctcttg 10084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6063809 - 6063610
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6063809 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttag 6063710  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6063709 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 6063610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 26720444 - 26720618
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26720444 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaa 26720543  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26720544 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 26720618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32264404 - 32264194
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca----aactttgagatagagggggctgaaacaagggttt 96  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32264404 gcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggttt 32264305  T
Q  97 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggat 195  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  32264304 agaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 32264205  T
Q  196 tgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||    
T  32264204 tgagtctcttg 32264194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 48362031 - 48361827
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  48362031 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaa-ggtttagaa 48361933  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  48361932 tgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgag 48361833  T
Q  200 tctctt 205  Q
    ||||||    
T  48361832 tctctt 48361827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 50493895 - 50494092
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50493895 gcagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 50493994  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  50493995 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 50494092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10191670 - 10191464
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    |||||||| |||||||||||||||    
T  10191670 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaa 10191571  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||     
T  10191570 aggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgag 10191471  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  10191470 tctcttg 10191464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 18162560 - 18162765
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaa-agcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18162560 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaacaagggtttaga 18162657  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18162658 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattga 18162757  T
Q  199 ctctcttg 206  Q
     |||||||    
T  18162758 gtctcttg 18162765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 43228214 - 43228393
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43228214 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtat 43228313  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  43228314 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 43228393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10958684 - 10958478
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958684 gcagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 10958585  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  10958584 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 10958485  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  10958484 tctcttg 10958478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 206
Target Start/End: Original strand, 6561740 - 6561912
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaattt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6561740 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6561839  T
Q  135 gtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6561840 gtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 6561912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12268323 - 12268119
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  12268323 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagac 12268224  T
Q  105 aacaac-aaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  12268223 aacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtc 12268124  T
Q  202 tcttg 206  Q
    |||||    
T  12268123 tcttg 12268119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 15780756 - 15780973
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780756 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 15780855  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatag-----------aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactg 188  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  15780856 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacacta 15780955  T
Q  189 ttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  15780956 ttacgattgagtctcttg 15780973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 51727340 - 51727162
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51727340 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtat 51727241  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  51727240 agagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 51727162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10956388 - 10956182
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956388 gcagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 10956289  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||     
T  10956288 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgag 10956189  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  10956188 tctcttg 10956182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5522976 - 5522781
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522976 gcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 5522877  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||           ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||     
T  5522876 aggcaacaacaaaactagggt-----------ttgtctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgag 5522788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 43226009 - 43226187
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43226009 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta-cgtttgtat 43226107  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  43226108 agagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 43226187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423618
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43423697  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  43423696 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 43423618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 51943294 - 51943473
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943294 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 51943393  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  51943394 agagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 51943473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626838
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1626917  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  1626916 gagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 1626838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 3314608 - 3314786
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3314608 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 3314707  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3314708 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 3314786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4104233 - 4104050
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104233 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4104134  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4104133 gtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 4104050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 205
Target Start/End: Original strand, 1313333 - 1313510
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1313333 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagg-tttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 1313431  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctctt 205  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1313432 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 1313510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27101519 - 27101336
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact----ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101519 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27101420  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27101419 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 27101336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 53917998 - 53917819
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  53917998 acttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53917899  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  53917898 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 53917819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28102335 - 28102157
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| | || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102335 cttttactataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28102236  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  28102235 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttg 28102157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 69 - 206
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30005943
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30005905 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttg 30005943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35918283 - 35918098
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918283 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 35918184  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaa------acactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||      ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  35918183 agagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttg 35918098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Original strand, 455826 - 456000
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455826 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 455925  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  455926 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 456000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Original strand, 458203 - 458377
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458203 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 458302  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  458303 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 458377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Original strand, 38210265 - 38210463
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||  || |  ||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210265 cagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatataggccttgtatcag-gctattttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 38210363  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38210364 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 38210463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5927097 - 5926919
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5927097 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtata 5926998  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattc-acttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5926997 gagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 5926919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Original strand, 25533357 - 25533536
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533357 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 25533456  T
Q  120 gtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25533457 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 25533536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Original strand, 746674 - 746850
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  746674 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 746773  T
Q  122 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  746774 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 746850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421570
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43421648  T
Q  130 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
      |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  43421647 tgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttg 43421570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 880785 - 880606
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  880785 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 880686  T
Q  129 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  880685 gagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttg 880606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100204
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 28100275  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  28100274 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattga 28100204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 206
Target Start/End: Original strand, 42990268 - 42990406
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  42990268 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 42990367  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42990368 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 42990406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 42992205 - 42992388
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42992205 acttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggttt 42992304  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  42992305 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 42992388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 53915830 - 53915651
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  53915830 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53915731  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | |||| |||||| | |||||||||| |||||||    
T  53915730 agattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttg 53915651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 198
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181116
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 28181045  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  28181046 gagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattga 28181116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 39715393 - 39715571
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  39715393 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtat 39715491  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  39715492 agagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 39715571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 198
Target Start/End: Original strand, 36011751 - 36011921
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  36011751 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtata 36011850  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36011851 gagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattga 36011921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 53468788 - 53468611
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  53468788 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaacca-ggtttgtata 53468690  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  53468689 gagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttg 53468611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691737
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtata 54691808  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  54691807 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 54691737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10621823 - 10621694
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10621823 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 10621724  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10621723 gattcaccttgggaaacactattaggattg 10621694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28761784 - 28761584
Alignment:
Q  6 tttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 105  Q
    |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  28761784 tttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagaca 28761685  T
Q  106 acaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  28761684 acaacaaaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctct 28761586  T
Q  205 tg 206  Q
    ||    
T  28761585 tg 28761584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9604946 - 9604762
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9604946 actttcactataaatatagaccttgtattagagaaaactctgagagagagatagagggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactaggat 9604848  T
Q  122 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9604847 ttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 9604762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 206
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956788
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  29956750 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttg 29956788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47701829  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggt 159  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47701828 gagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 25388794 - 25388998
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---------gagatagagggggctgaaacaag 91  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||          |||| |||| | |||||||||||    
T  25388794 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag-gctattttgagagagagagagagagagagagctgaaacaag 25388892  T
Q  92 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgtta 191  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  25388893 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaacactatta 25388992  T
Q  192 ggattg 197  Q
    ||||||    
T  25388993 ggattg 25388998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 1321337 - 1321441
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321337 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 1321436  T
Q  101 aggca 105  Q
    |||||    
T  1321437 aggca 1321441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 32218991 - 32219186
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32218991 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcagtataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaa 32219090  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||     
T  32219091 aggcaacaacaaaac-----------tagagtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgag 32219179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 47149233 - 47149050
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |  | ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149233 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaggccttgagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 47149134  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||  ||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  47149133 gtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttggaaacactattatgattgagtctcttg 47149050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 24177175 - 24177378
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||     
T  24177175 gcagatttgttccaaattttaagggatacttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttag- 24177273  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  24177274 atgtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 24177370  T
Q  199 ctctcttg 206  Q
     |||||||    
T  24177371 gtctcttg 24177378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 196
Target Start/End: Original strand, 41849117 - 41849244
Alignment:
Q  70 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41849117 agatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 41849216  T
Q  170 attca-cttgggaaacactgttaggatt 196  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||    
T  41849217 attcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674921
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||             
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaagg--------- 51674997  T
Q  130 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  51674996 --tttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 51674921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27635959 - 27635830
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  27635959 ttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatag 27635860  T
Q  130 aatttgtctctttggaacaaacactagggt 159  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27635859 agtttgtctcttgggaacaaacactagggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 890104 - 889927
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  890104 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaaca--aaacctagggtttgtata 890007  T
Q  129 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  890006 gagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 889927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231502
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6231473  T
Q  130 aatttgtctctttggaacaaacactaggg 158  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||    
T  6231474 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 95 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413195
Alignment:
Q  95 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttagg 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  194 attga 198  Q
    |||||    
T  28413199 attga 28413195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 54884081 - 54884257
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||||  | |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||    
T  54884081 cttttaccataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttg--ta 54884178  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  54884179 gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttg 54884257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28137628 - 28137472
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||    
T  28137628 cttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaac-----------ta 28137540  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggat 195  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28137539 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggat 28137472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Original strand, 23633357 - 23633556
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  23633357 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttag-aa 23633455  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgttaggattgactc 201  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||    
T  23633456 gccaacaagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgatttac-cgggaaacactattaggattgagtc 23633551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 31151271 - 31151447
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  31151271 cttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaa-tcaacaagaaaactagggtttgta 31151369  T
Q  127 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31151370 tagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggtt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 31151447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 53591119 - 53591286
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||            
T  53591119 cttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactaggg-------- 53591210  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
       ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| |||||||    
T  53591211 ---tttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttg 53591286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 53597164 - 53597338
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  53597164 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagataga-ggggatgaaacaagggttta-taagtcaacaagaaaactaggggttgtat 53597261  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||| |||||| | ||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  53597262 agagttt-tctcttggcaacaaacactagggtt--gaagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 53597338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 206
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321581
Alignment:
Q  109 acaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 1321581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306842
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  130 aatttgtctctttggaaca 148  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3306824 agtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Original strand, 23636952 - 23637125
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  23636952 ttttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaactagggtttgtatag 23637050  T
Q  130 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    | | || ||||| | ||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  23637051 agtctg-ctcttggcaacaaacactagggtt--tgggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 23637125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 53896557 - 53896475
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 83  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53896557 gcagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 53896475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13420506 - 13420341
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||          ||  ||||||||||||||||    
T  13420506 acttttactataaatataggttttgtatcaaagcaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggttta----------aatcaaactagggtttgtat 13420417  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||| |||||  | |||||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13420416 agagttt-tctctaggcaacaaacactagggt---tgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 13420341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 4560599 - 4560502
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4560599 actttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaaactagagtttgt 4560502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 6719472 - 6719396
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 77  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6719472 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagag 6719396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606742
Alignment:
Q  127 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 7606742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 5886181 - 5886242
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 62  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5886181 gcagatttgttacagattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttttatcagagca 5886242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 36871624 - 36871457
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaattt 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||| | | |  || |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  36871624 ctataaatataaaccttgtatcatagtaaacctagggggag-gggggctgaaacaagggttta-caagccaacaagaaaactagggcttgtatagagttt 36871527  T
Q  135 gtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    | ||||| | ||||||||| ||||||   || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  36871526 g-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttg 36871457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 13893289 - 13893347
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa 59  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13893289 gcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatatagacattgtatcaaa 13893347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 5899656 - 5899717
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 62  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5899656 gcagatttgttacagattttaagcgagacttttactataaatatagaccttttatcagagca 5899717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 562058 - 561932
Alignment:
Q  76 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 175  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||    |||||||||||    
T  562058 agggggttgaaacaagggtttag-aagtcaac-atgaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggtt--caggttgattcac 561964  T
Q  176 -ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
     |||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  561963 attgggaaacactattaggatttagtctcttg 561932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 208
Target Start/End: Original strand, 1673898 - 1674076
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||  ||||| |  ||||||  |||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||    
T  1673898 acttttactataaatatagaacttgtatcaaaagtaaaccttgatgtagagagt-ctgaaaataagggtttagaa-gttaacaagaaaactagtgtttgt 1673995  T
Q  126 atagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcact-tgggaaacactgttaggattgactctcttgat 208  Q
    ||| | |||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1673996 atatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttag--gattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgat 1674076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 204
Target Start/End: Original strand, 4666488 - 4666614
Alignment:
Q  68 tgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggt 167  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||           ||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||    
T  4666488 tgagatagagggggctgaaagaagggtctagtaagacaacaacaaaaataggg-----------tttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggt 4666576  T
Q  168 tgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctct 204  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  4666577 tgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctct 4666614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 93
Target Start/End: Original strand, 6484308 - 6484373
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg 93  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6484308 acttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaggg 6484373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 46966996 - 46966940
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  46966996 gcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaacattgtatca 46966940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 1619018 - 1618916
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctg-aaacaagggtttag 98  Q
    ||||||||||||| ||| | || || ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1619018 agatttgttccaattttatgagggatactttgactataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgagagacagagggggctgaaaacaagggtttag 1618919  T
Q  99 aaa 101  Q
    |||    
T  1618918 aaa 1618916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484462
Alignment:
Q  118 gggtttgtatagaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||| |||| |||||||||| || |||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttg 6484462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688316
Alignment:
Q  156 gggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 25688316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 25690690 - 25690651
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 67  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25690690 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactt 25690651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560447
Alignment:
Q  149 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 4560447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Original strand, 13419864 - 13419970
Alignment:
Q  84 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaa 182  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||||| | ||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||    
T  13419864 gaaacaaaggttta-aaagccaacaagaaaactagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaa 13419957  T
Q  183 acactgttaggat 195  Q
    ||||| |||||||    
T  13419958 acactattaggat 13419970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Original strand, 26762863 - 26762917
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26762863 agatttgttccaattttttagggatgcttttactataaatataaaccttgtatca 26762917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 10621876 - 10621847
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621876 acttttactataaatatagaccttgtatca 10621847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 206
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795360
Alignment:
Q  112 aaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| || |||||||| |||| || || | |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggt---tgggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttg 17795360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 206
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103800
Alignment:
Q  112 aaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| || |||||||| |||| || || | |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggt---tgggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttg 19103800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 31021479 - 31021450
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31021479 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa 31021450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 57
Target Start/End: Original strand, 42990205 - 42990234
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990205 acttttactataaatatagaccttgtatca 42990234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 206
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634022
Alignment:
Q  112 aaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| |   || |||||||| ||||||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggct--gggattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttg 25634022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 206
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635483
Alignment:
Q  112 aaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||   || ||| |||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttg 25635483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 27101594 - 27101558
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaa 64  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27101594 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaa 27101558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24162575 - 24162369
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162575 gcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 24162476  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||     
T  24162475 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgag 24162376  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  24162375 tctcttg 24162369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 40032421 - 40032215
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032421 gcagatttgttccaagttttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 40032322  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  40032321 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 40032222  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  40032221 tctcttg 40032215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 42064407 - 42064613
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42064407 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaa 42064506  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  42064507 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 42064606  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  42064607 tctcttg 42064613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13910407 - 13910201
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910407 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 13910308  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||     
T  13910307 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgag 13910208  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  13910207 tctcttg 13910201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19504708 - 19504502
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504708 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 19504609  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  19504608 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 19504509  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  19504508 tctcttg 19504502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 27104691 - 27104896
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27104691 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaa 27104790  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  27104791 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27104889  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  27104890 tctcttg 27104896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19502374 - 19502168
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19502374 gcagatttgatccaaattttaagggaaaattttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaa 19502275  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  19502274 aggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 19502175  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  19502174 tctcttg 19502168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22287695 - 22287494
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287695 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 22287596  T
Q  105 aacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||    
T  22287595 aacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctc 22287496  T
Q  204 tt 205  Q
    ||    
T  22287495 tt 22287494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21521058 - 21520850
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  21521058 gcagatttgttccaaaatttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttag 21520959  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  21520958 aaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattg 21520859  T
Q  198 actctcttg 206  Q
    | |||||||    
T  21520858 agtctcttg 21520850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6259178 - 6258972
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  6259178 gcagacttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaa 6259079  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  6259078 aggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 6258979  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  6258978 tctcttg 6258972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22407772 - 22407598
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22407772 gcagatttgttcaaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaa 22407673  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22407672 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 22407598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6264508 - 6264306
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6264508 gcagatttgttccaaattttaagcgatatttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaa 6264409  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |     
T  6264408 aggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaag 6264313  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  6264312 tctcttg 6264306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23452577 - 23452394
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452577 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 23452478  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  23452477 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 23452394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31733100 - 31732922
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31733100 cttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 31733001  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31733000 gagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttg 31732922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 45280321 - 45280141
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttag-aaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45280321 actttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 45280222  T
Q  127 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  45280221 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttg 45280141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 42452702 - 42452879
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42452702 acttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 42452801  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    | | ||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42452802 aaagtttgtctc--tgtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 42452879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 198
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19007730
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtata 19007659  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  19007660 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattga 19007730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163117
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtata 22163183  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttagg 193  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  22163182 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg 22163117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739717
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatg 11739796  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11739795 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttg 11739717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 28196557 - 28196735
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196557 cttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28196656  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28196657 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 28196735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 42923847 - 42923666
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  42923847 acttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgt 42923748  T
Q  126 atagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  42923747 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 42923666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837371
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtaca 14837292  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14837293 tagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 14837371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539632
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 15539710  T
Q  130 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15539709 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttg 15539632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 206
Target Start/End: Original strand, 3022086 - 3022261
Alignment:
Q  32 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaa 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  3022086 ttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagag 3022185  T
Q  132 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3022186 tttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttg 3022261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979736
Alignment:
Q  37 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgt 136  Q
    |||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgt 34979807  T
Q  137 ctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  34979806 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttg 34979736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35215932 - 35215752
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----------gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35215932 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 35215833  T
Q  118 gggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35215832 gggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 35215752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 17848365 - 17848542
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  | || | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17848365 cttttactataaatataggctttgtatca--gtaatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17848462  T
Q  129 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17848463 gagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttg 17848542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 17849037 - 17849215
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  17849037 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtata 17849136  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||    
T  17849137 gagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttg 17849215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 43623931 - 43623793
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  43623931 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaa 43623832  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43623831 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 43623793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35218258 - 35218129
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35218258 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35218159  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35218158 gattcaccttgggaaacactattaggattg 35218129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 206
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020300
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  38020262 gattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttg 38020300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 44289403 - 44289233
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44289403 cttttactataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 44289304  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44289303 gagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 44289233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5377769 - 5377631
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5377769 actttcactataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 5377670  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttg 162  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5377669 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttg 5377631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 45239271 - 45239134
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggt 167  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  45239271 gagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagactt--tctctttggcaacaaacactagggtttgagggt 45239174  T
Q  168 tgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45239173 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 45239134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18800665 - 18800471
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18800665 gcagatttgttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttaga- 18800567  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
           ||  || ||||||||||||||||  ||| ||||| | |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  18800566 -------aatcaagctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggt---tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 18800478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578266
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaaaaaaactagggtttgtata 11578341  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||   ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11578340 gaatttttctcttggcaacaa--actagggtt--ggggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttg 11578266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 123
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   | |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 35107192 - 35107341
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||| |||| | | || ||| |||| ||||||     
T  35107192 gcagatttgttccaaattttaagggatacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtaga-gagtctaaaaccaagagtttag- 35107289  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaaca 152  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||    
T  35107290 aagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca 35107341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 37963263 - 37963190
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37963263 acttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 37963190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 205
Target Start/End: Original strand, 22874061 - 22874227
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||        ||  ||||||||||||||||    
T  22874061 acttttgctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctgaaacaagggtttaga--------aatcaaactagggtttgtat 22874152  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctctt 205  Q
    ||| |||| ||||| | ||||||||||| |||   |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||    
T  22874153 agagtttg-ctcttggcaacaaacactatggt---tgggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctctt 22874227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17897578 - 17897403
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctga-aacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||  ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  17897578 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-ctgagaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagggtttgt 17897481  T
Q  126 atagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||| |||| ||||| | |||||||||||||  |||  | |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17897480 atagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttg-agattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 17897403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 12342772 - 12342673
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||    || |||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12342772 cagatttgttccaatttttttaggatacttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaagggtttagaa 12342673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20146941 - 20146766
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| |     |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  20146941 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttaagaggtagagagtttgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtat 20146843  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||| | ||| | ||||||||||| ||||   || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  20146842 agagtttg-cccttggcaacaaacactatggtt--gggattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttg 20146766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 36559138 - 36559067
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36559138 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36559067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 36561415 - 36561344
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36561415 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36561344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 45332439 - 45332384
Alignment:
Q  17 ttttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45332439 ttttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 45332384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 28462649 - 28462593
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28462649 gcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtatca 28462593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459347
Alignment:
Q  119 ggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttg 28459347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 38414365 - 38414281
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    |||||||||||||||||| | |||||     | |||| ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38414365 cttttactataaatataggctttgta-----gtaaaccttgagatagagggggctgaaac------ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 38414281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Original strand, 45156946 - 45157001
Alignment:
Q  4 gatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa 59  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45156946 gatttgttccaaattttgagggatgcttttactataaatatagaccttatatcaaa 45157001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20147082 - 20147040
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20147082 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgaga 20147040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Original strand, 35028473 - 35028527
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35028473 agatttgttccaattttttagggatacttttactataaatatagacattgtatca 35028527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 40699203 - 40699278
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 77  Q
    ||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||    
T  40699203 agatttgttccaattttctgagggatacttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagagag 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 157
Target Start/End: Original strand, 39287188 - 39287256
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagg 157  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||   |||||| | |||||||||||||    
T  39287188 aaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtagagaat---tctcttagcaacaaacactagg 39287256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 41304667 - 41304627
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41304667 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgta 41304627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 57
Target Start/End: Original strand, 20589581 - 20589609
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589581 cttttactataaatatagaccttgtatca 20589609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Original strand, 33603818 - 33603870
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat 55  Q
    ||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33603818 agatttgttccaatttgttagggatacttttactataaatataaaccttgtat 33603870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 84)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1049658 - 1049452
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049658 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 1049559  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||     
T  1049558 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgag 1049459  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  1049458 tctcttg 1049452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27306592 - 27306387
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306592 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 27306493  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  27306492 aggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27306394  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  27306393 tctcttg 27306387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 40837105 - 40836899
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  40837105 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaa 40837006  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  40837005 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 40836906  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  40836905 tctcttg 40836899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 35555 - 35761
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35555 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaa 35654  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||     
T  35655 agacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgag 35754  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  35755 tctcttg 35761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31435404 - 31435204
Alignment:
Q  7 ttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435404 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 31435305  T
Q  107 caacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctctt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31435304 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 31435205  T
Q  206 g 206  Q
    |    
T  31435204 g 31435204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 44490 - 44688
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44490 gcagatttgtaccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 44589  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||    
T  44590 aggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattga 44688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Original strand, 25542459 - 25542661
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25542459 agatttattccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaag 25542557  T
Q  103 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgttaggattgactct 202  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||    
T  25542558 gtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaagactattaggattgagtct 25542657  T
Q  203 cttg 206  Q
    ||||    
T  25542658 cttg 25542661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 18567545 - 18567731
Alignment:
Q  7 ttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567545 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 18567644  T
Q  107 caacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttag 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18567645 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 3878497 - 3878709
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaat----atagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3878497 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaattaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggt 3878596  T
Q  95 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttagg 193  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  3878597 ttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattagg 3878696  T
Q  194 attgactctcttg 206  Q
    ||||| |||||||    
T  3878697 attgagtctcttg 3878709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 26804499 - 26804704
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804499 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtg----agtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 26804594  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacac---tagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26804595 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 26804694  T
Q  197 gactctcttg 206  Q
     | |||||||    
T  26804695 tagtctcttg 26804704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31156271 - 31156077
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagg 103  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156271 atttgttccaaatttatgagctatacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagg 31156172  T
Q  104 caacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31156171 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 31156077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 38393935 - 38394118
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38393935 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38394034  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  38394035 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 38394118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13099812 - 13099633
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13099812 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 13099713  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  13099712 agagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttg 13099633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44724711
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 44724632  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  44724633 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 44724711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7470359 - 7470179
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470359 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 7470260  T
Q  127 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  7470259 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttg 7470179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7472317 - 7472137
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7472317 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 7472218  T
Q  127 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7472217 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 7472137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 42331335 - 42331156
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  42331335 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtat 42331236  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42331235 agagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 42331156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 3035670 - 3035853
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035670 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 3035769  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3035770 ttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 3035853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678198
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtata 21678119  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21678120 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 21678198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680159
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 21680080  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21680081 gagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttg 21680159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 11355212 - 11355390
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355212 cttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 11355311  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11355312 gagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 11355390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 208
Target Start/End: Original strand, 443548 - 443729
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  443548 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 443647  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttgat 208  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  443648 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgat 443729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20137444 - 20137264
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20137444 cttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 20137345  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttgat 208  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  20137344 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgat 20137264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22251893 - 22251731
Alignment:
Q  13 caaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22251893 caaattttaagcgacacttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaa 22251794  T
Q  113 aactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 175  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22251793 aactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcac 22251731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276273
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 25276194  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25276195 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttg 25276273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37412462 - 37412284
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412462 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 37412363  T
Q  130 aatttgtctcttt-ggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  37412362 agtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 37412284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 48457602 - 48457785
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457602 actttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 48457701  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48457702 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttg 48457785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Original strand, 20625990 - 20626170
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20625990 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20626089  T
Q  127 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20626090 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 20626170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Original strand, 20629881 - 20630061
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629881 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20629980  T
Q  127 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20629981 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 20630061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Original strand, 20642300 - 20642480
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642300 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20642399  T
Q  127 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20642400 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 20642480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 24748548 - 24748726
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24748548 cttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 24748647  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  24748648 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttg 24748726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 28485515 - 28485698
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485515 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 28485614  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28485615 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttg 28485698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7349615 - 7349439
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349615 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 7349516  T
Q  122 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7349515 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 7349439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 205
Target Start/End: Original strand, 40946277 - 40946459
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946277 actttcactataaatataaaccttgtttcatagcaaactttgagagggacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 40946376  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctctt 205  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  40946377 gtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggattgagtctctt 40946459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4296271 - 4296091
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagacctt-gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4296271 cttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 4296172  T
Q  128 agaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4296171 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 4296091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 69 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1047219 - 1047081
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1047219 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 1047120  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1047119 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 1047081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 18345490 - 18345673
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag----atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345490 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgagggagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18345589  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18345590 gtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 18345673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7351994 - 7351818
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7351994 acttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggct 7351895  T
Q  122 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7351894 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 7351818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 206
Target Start/End: Original strand, 24258423 - 24258595
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaattt 134  Q
    ||||||||||||   |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  24258423 ctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagttt 24258522  T
Q  135 gtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  24258523 gtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 24258595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 42223110 - 42223290
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagg-gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42223110 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 42223209  T
Q  128 agaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  42223210 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 42223290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 198
Target Start/End: Original strand, 1849975 - 1850105
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1849975 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggtt 1850074  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  1850075 gattcaccttggaaaacactattaggattga 1850105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 20297311 - 20297494
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20297311 acttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggttt 20297410  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20297411 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 20297494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Original strand, 21990106 - 21990282
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  21990106 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatag 21990204  T
Q  130 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  21990205 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttg 21990282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 11757177 - 11757362
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11757177 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 11757276  T
Q  123 tgtatagaatttgtctctttggaacaaacactaggg-tttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11757277 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 11757362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 20299407 - 20299592
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20299407 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 20299506  T
Q  123 tgtatagaatttgtctctttggaacaaacactaggg-tttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20299507 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 20299592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 9680768 - 9680952
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9680768 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggttt 9680867  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9680868 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttg 9680952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 22392399 - 22392593
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22392399 gcagatttgttccaaattgtaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttata- 22392497  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
           ||  |||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  22392498 -------aatcaaactagggtttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggt---tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 22392586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39146322 - 39146144
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  39146322 cttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtata 39146223  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||    
T  39146222 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttg 39146144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 28487502 - 28487685
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28487502 acttttcctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagttt 28487601  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28487602 gtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttg 28487685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21592445 - 21592300
Alignment:
Q  62 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggttt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592445 aaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 21592346  T
Q  162 gtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    | ||||||||||| ||||| || |||| |||||||| | |||||||    
T  21592345 gagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttg 21592300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43253860 - 43253672
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg--------ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||| |        ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  43253860 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagg 43253761  T
Q  120 gtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttgat 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43253760 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacta-ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgat 43253672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27832969 - 27832790
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27832969 cttttactataaatataggttgtgtatcagagcaaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtat 27832870  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27832869 agagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 27832790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22828969 - 22828790
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22828969 acttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtat 22828870  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||| ||||||   |||||||||||| |||||  ||||||||||  || | ||||||| |||||||||| |||||||    
T  22828869 agagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttg 22828790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Original strand, 7188470 - 7188671
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7188470 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttag-aa 7188568  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgact 200  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |    
T  7188569 gtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 7188665  T
Q  201 ctcttg 206  Q
    ||||||    
T  7188666 ctcttg 7188671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Original strand, 9679009 - 9679191
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||    |||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9679009 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 9679108  T
Q  125 tatagaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9679109 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 9679191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24817682 - 24817511
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  24817682 tttaatataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttag-aagtcaacaagagaactagggtttgtatag 24817585  T
Q  130 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||| || || | |||||||||| |||||||    
T  24817584 agtttg-ctctttgcaacaaacactagggt---tgggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttg 24817511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20091903 - 20091702
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |      
T  20091903 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcg-g 20091805  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || || | |||||| | |||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |     
T  20091804 aggcaac-acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggtt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaa 20091709  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  20091708 tctcttg 20091702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7094759 - 7094662
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  7094759 tttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7092512 - 7092414
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa-actagggtttg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  7092512 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggtttg 7092414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 129
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396370
Alignment:
Q  75 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 38396370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 77
Target Start/End: Original strand, 1606423 - 1606472
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606423 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 1606472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 208
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081640
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaa 183  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||| ||||||||    
T  11081522 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagagaat---tctcttggcaacaaacactagggtt--gagattgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  184 cactgttaggattgactctcttgat 208  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  11081616 cactattaggattgagtctcttgat 11081640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 22108087 - 22108158
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108087 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22108158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 22137098 - 22137169
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137098 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22137169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465669
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||||||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga--------aatcaaactagggtttgtata 24465594  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |  |||| ||||| | |||||||||||||||   ||  |||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggt---tgaattgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttg 24465669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 40549847 - 40549918
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549847 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40549918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 40552125 - 40552196
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552125 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40552196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 9027467 - 9027396
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9027467 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 9027396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 2935279 - 2935349
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag 71  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2935279 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgag 2935349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813656
Alignment:
Q  104 caacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactct 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggt---tgggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Original strand, 3677235 - 3677301
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta 97  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3677235 ttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggagataga-ggggctgaaacaagggttta 3677301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092369
Alignment:
Q  145 aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttg 7092369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 45366472 - 45366526
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat 55  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  45366472 gcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtat 45366526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Original strand, 1849918 - 1849962
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1849918 acttttactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 1849962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Original strand, 6348778 - 6348903
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatca-aagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaat 132  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||  || || ||||||||||||||||| || |    
T  6348778 ctataaatataaaccttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttag-aagtaaaaaagaaaactagggtttgtatcgagt 6348876  T
Q  133 ttgtctctttggaacaaacactagggtt 160  Q
    ||| ||||| | |||||||| |||||||    
T  6348877 ttg-ctcttggcaacaaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 30906386 - 30906327
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa 87  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||||||    
T  30906386 acttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaa 30906327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 206
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049002
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgg--gaa 182  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||| | ||||||||||| |||||| || ||||||||| | |  |||    
T  6048885 aaacaagggtttagaa-gccaacatcaaaactagggtttgtaaagaat---tctcttggcaacaaacacta-ggtttg-ggattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  183 acactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||| |||||||||| |||||||    
T  6048979 acactattaggattgaatctcttg 6049002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 206
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396767
Alignment:
Q  153 ctagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttg 38396767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 1047295 - 1047238
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaa 58  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1047295 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaa 1047238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094618
Alignment:
Q  145 aacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctctt 205  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 7094618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 97
Target Start/End: Original strand, 6332179 - 6332248
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct-gaaacaagggttta 97  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6332179 acttttactataaatataaaacttgtatcagag-taaccttgagagagagggggctggaaacaagggttta 6332248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Original strand, 26210500 - 26210603
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| || |||||  ||||||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||||||||     
T  26210500 cttttagtataaatatagaacttgtatcaaatgtaaaccttgagagag-gggggaggaaacaaggttttag-aatccaacctcaaaactagggtttgtag 26210597  T
Q  128 agaatt 133  Q
    ||||||    
T  26210598 agaatt 26210603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 57
Target Start/End: Original strand, 38396239 - 38396268
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396239 acttttactataaatatagaccttgtatca 38396268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Original strand, 42006493 - 42006545
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat 55  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  42006493 agatttgttccatattttaagggttacttttactataaatataaaccgtgtat 42006545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14507536 - 14507332
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14507536 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaag 14507437  T
Q  103 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14507436 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 14507337  T
Q  202 tcttg 206  Q
    |||||    
T  14507336 tcttg 14507332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19227771 - 19227565
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19227771 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaa 19227672  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  19227671 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 19227572  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  19227571 tctcttg 19227565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11983392 - 11983186
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11983392 gcagatttgtttcaaattttaaacgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaa 11983293  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  11983292 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 11983193  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  11983192 tctcttg 11983186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28241657 - 28241478
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241657 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 28241558  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28241557 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 28241478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 9019877 - 9020083
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9019877 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaa 9019976  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  9019977 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 9020076  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  9020077 tctcttg 9020083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15541503 - 15541297
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541503 gcagatttgttccaaattttaagttacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 15541404  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||     
T  15541403 aggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgag 15541304  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  15541303 tctcttg 15541297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1230585 - 1230406
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230585 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1230486  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1230485 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttg 1230406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12195851 - 12195681
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12195851 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 12195752  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12195751 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 12195681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15530485 - 15530279
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15530485 gcaggtttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaa 15530386  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  15530385 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 15530286  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  15530285 tctcttg 15530279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30729191 - 30728985
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  30729191 gcagatttgttccaaattttaagcggtacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaa 30729092  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  30729091 agacaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgac 30728992  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  30728991 tctcttg 30728985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15533044 - 15532838
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533044 gcagatttgttccaaattttaagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 15532945  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||     
T  15532944 aggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 15532845  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  15532844 tctcttg 15532838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1072240 - 1072067
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1072240 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaa 1072141  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1072140 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458924
Alignment:
Q  36 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttg 135  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  136 tctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc-cttgggaaacactattaggattgagtctcttg 14458924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 32279948 - 32280153
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  32279948 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttcctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagatagagggg-ctgaaacaagggtttaaaa 32280046  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  32280047 aggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 32280146  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  32280147 tctcttg 32280153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 3390357 - 3390536
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390357 acttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 3390456  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3390457 agagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 3390536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057351
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtata 13057272  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  13057273 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttg 13057351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20915721 - 20915522
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggttta 97  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915721 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag-gctaaattgagagagatagagggggctgaaacaagggttta 20915623  T
Q  98 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt 196  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20915622 gaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 20915523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 25477253 - 25477431
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25477253 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatata 25477352  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25477353 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 25477431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3630199 - 3630021
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630199 cttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3630100  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3630099 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttg 3630021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 8995430 - 8995578
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8995430 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaa 8995529  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8995530 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 30967176 - 30967358
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagc-aaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30967176 acttttactataaatatagaccttgtat--aggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtt 30967273  T
Q  123 tgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30967274 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 30967358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4816608 - 4816388
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------------tagagggggctgaa 86  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||              ||||||||||||||    
T  4816608 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagagagatagagggggctgaa 4816509  T
Q  87 acaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaaca 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4816508 acaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaaca 4816409  T
Q  186 ctgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  4816408 ctattaggattgagtctcttg 4816388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3632271 - 3632096
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632271 tttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 3632172  T
Q  131 atttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctctt 205  Q
     |||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3632171 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctt 3632096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19704905 - 19704735
Alignment:
Q  34 actataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704905 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19704806  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19704805 agagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 19704735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2629226 - 2629042
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629226 acttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 2629127  T
Q  123 tgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2629126 tgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 2629042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30034943 - 30034768
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30034943 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagttt 30034844  T
Q  124 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30034843 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 30034768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233887
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3234065 cttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtata 3233967  T
Q  129 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3233966 tagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 3233887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13039911
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtata 13039832  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | |||||||    
T  13039833 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttg 13039911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447504
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 32447552  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactag-ggtttgtgggttgattcac 175  Q
    || |||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  32447551 gagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcac 32447504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 206
Target Start/End: Original strand, 26065005 - 26065140
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  26065005 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttgg---aaacactagggtttgagggtt 26065101  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26065102 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 26065140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 206
Target Start/End: Original strand, 26084974 - 26085109
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  26084974 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttgg---aaacactagggtttgagggtt 26085070  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26085071 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 26085109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338612
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcata 24338684  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacacta-gggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
     | ||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  24338683 aagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattga 24338612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Original strand, 17852520 - 17852650
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  17852520 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 17852619  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactaggg 158  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17852620 agagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26932906 - 26932728
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  26932906 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagagagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagg 26932807  T
Q  120 gtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  26932806 gtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattg 26932728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12161889 - 12161733
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12161889 cttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 12161791  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacact 187  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  12161790 gagtttgtctc--tggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacact 12161733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870611
Alignment:
Q  36 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttg 135  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttg 13870651  T
Q  136 tctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 175  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13870650 tctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcac 13870611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3028186 - 3028011
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3028186 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggttt-ggaaggcaac-acaaaactagggtttgta 3028089  T
Q  127 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||| |||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3028088 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 3028011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 22490618 - 22490797
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta-gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22490618 cttttaccataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 22490717  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    | | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    || || |||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  22490718 atagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttg 22490797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 194
Target Start/End: Original strand, 15346347 - 15346524
Alignment:
Q  6 tttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 105  Q
    |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||          
T  15346347 tttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttaga------ 15346440  T
Q  106 acaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttagga 194  Q
      |   ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15346441 --attcaaactagggtttgtataaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggt---tgggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 26068662 - 26068590
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 73  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068662 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26068590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 26066389 - 26066319
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 73  Q
    ||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066389 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26066319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16455786 - 16455583
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaa-caagggtttag 98  Q
    |||||||||||||| |||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||   | |||| ||||||  ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  16455786 cagatttgttccaatttttcagggatacctttactataaatatataccttgtatcggtgtaaaccttgagaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttag 16455688  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    || | |||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  16455687 aa-gtcaacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaacactgttaggatta 16455592  T
Q  198 actctcttg 206  Q
    | |||||||    
T  16455591 agtctcttg 16455583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 141
Target Start/End: Original strand, 10584105 - 10584212
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||||||||||     |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10584105 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg-----aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtata 10584199  T
Q  129 gaatttgtctctt 141  Q
    || ||||||||||    
T  10584200 gagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Original strand, 17012029 - 17012152
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaa-acaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  17012029 ctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttag-aagtaaacaac-aaactagggtttgtataaagtt 17012126  T
Q  134 tgtctctttggaacaaacactagggtt 160  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||    
T  17012127 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt 17012152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12186431 - 12186330
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaa-acttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttaga 99  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12186431 agatttgttccaattttttagcgattacttttactataaatataaaccttgtatcacatgtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttaga 12186332  T
Q  100 aa 101  Q
    ||    
T  12186331 aa 12186330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 14466312 - 14466480
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||           ||    
T  14466312 cttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaac-----------ta 14466400  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactaggg-tttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||| || | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14466401 gagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttg 14466480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 19696394 - 19696595
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagg--gggctg-aaacaagggtttaga 99  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||   |  |||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||||||    
T  19696394 agatttgttccaatttttgaaggattcttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttaga 19696493  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    ||   |||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||| ||||||||||      |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19696494 aa-caaacaac-aaattagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggtt--caaattgattcaccttgggaaacactgttaggattga 19696588  T
Q  199 ctctctt 205  Q
     ||||||    
T  19696589 gtctctt 19696595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29755059 - 29754983
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 77  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29755059 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgagagagag 29754983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 206
Target Start/End: Original strand, 15719666 - 15719799
Alignment:
Q  62 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggttt 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||  ||||||||||||||||||| |||| || || | |||||||||||||||      
T  15719666 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga--------aatcaaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggt-- 15719754  T
Q  162 gtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
     || ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  15719755 -tgagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 15719799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273382
Alignment:
Q  149 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 5273382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 33308905 - 33308966
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 62  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33308905 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 33308966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 33311174 - 33311235
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 62  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33311174 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 33311235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Original strand, 18318004 - 18318048
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18318004 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 18318048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12911812 - 12911710
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaa--tatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagag-ggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||   |||| |||||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  12911812 agatttattccaaatttttagggatacttttactataaatatatagacattgtatcaaatataaaccttgagatacagaggggctgaaaacagggtttag 12911713  T
Q  99 aaa 101  Q
    |||    
T  12911712 aaa 12911710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12937559 - 12937457
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaa--tatagaccttgtatca-aagcaaactttgagatagag-ggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||||| | | |||| |||||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  12937559 agatttattccaaatttttagggatacttttactataaatatatagacattgtatcagatgtaaaccttgagatacagaggggctgaaaacagggtttag 12937460  T
Q  99 aaa 101  Q
    |||    
T  12937459 aaa 12937457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 205
Target Start/End: Original strand, 15367129 - 15367187
Alignment:
Q  145 aacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctctt 205  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15367129 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctctt 15367187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17904632 - 17904566
Alignment:
Q  90 agggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtt 160  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||   || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  17904632 agggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagag---ttttctctttgcaacaaacactaaggtt 17904566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 14944 - 15150
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14944 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaa 15043  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  15044 aggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 15143  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  15144 tctcttg 15150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14707 - 14539
Alignment:
Q  41 atatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtct 138  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14707 atatagaccttgttttagagcaaactttgagagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 14608  T
Q  139 ctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  14607 ctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttg 14539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 69658 - 69448
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  69658 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 69559  T
Q  97 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggat 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  69558 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 69459  T
Q  196 tgactctcttg 206  Q
    ||| |||||||    
T  69458 tgagtctcttg 69448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 73390 - 73212
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  73390 gcagatttgttccaaattttaagagatacttttactataaatatagaccgtgtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 73291  T
Q  97 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 175  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  73290 agaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 73212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 73210 - 73163
Alignment:
Q  141 ttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacact 187  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  73210 ttggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 73163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41819 - 41640
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41819 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 41720  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41719 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 41640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6124 - 6322
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6124 gcagatttgttacagtttttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 6223  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6224 aagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 6322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 3922 - 4127
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3922 gcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 4021  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  4022 aggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgag 4120  T
Q  200 tctcttg 206  Q
    |||||||    
T  4121 tctcttg 4127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Original strand, 79140 - 79316
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79140 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 79239  T
Q  131 atttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  79240 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 79316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 183975 - 183797
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  183975 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 183877  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  183876 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 183797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 51961 - 52142
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51961 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 52060  T
Q  126 atagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  52061 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 52142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 29086 - 29302
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaa 90  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  29086 gcagatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaa 29185  T
Q  91 gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattc-acttgggaaacactgt 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  29186 gggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactat 29285  T
Q  190 taggattgactctcttg 206  Q
    ||||||||| |||||||    
T  29286 taggattgagtctcttg 29302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11809 - 11630
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  11809 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 11710  T
Q  128 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttga-ttcacttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11709 agagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 11630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2172
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaaagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 2087  T
Q  122 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2088 ttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 2172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 197
Target Start/End: Original strand, 34 - 163
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  169 gattca-cttgggaaacactgttaggattg 197  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  134 gattcaccttgggaaacactattaggattg 163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 79812 - 79991
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  79812 cttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 79911  T
Q  129 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  79912 gagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttg 79991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1167 - 1053
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1167 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1068  T
Q  128 agaatttgtctcttt 142  Q
    ||| |||||||||||    
T  1067 agagtttgtctcttt 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 35593 - 35770
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||   | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35593 cttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 35691  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||||| | |||||||    
T  35692 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttg 35770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 198
Target Start/End: Original strand, 85184 - 85353
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| | ||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  85184 cttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 85282  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    || |||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||    
T  85283 gagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattga 85353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16180 - 15979
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  16180 agatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttag-aa 16082  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgact 200  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | | ||||||||||||||||    |||||||||| |||| |||| ||| |||||||||| |    
T  16081 gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt--gaggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagt 15985  T
Q  201 ctcttg 206  Q
    ||||||    
T  15984 ctcttg 15979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16981 - 16816
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16981 ttttaatataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaac-acaaaactagggtttgtata 16884  T
Q  129 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 198  Q
    || |||| ||||| | ||||||||||||||||   || |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  16883 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttaggaaacactattaggattga 16816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1866
Alignment:
Q  38 taaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 130  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1958 taaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttgtataga 1866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1609
Alignment:
Q  143 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 1609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 22135 - 22206
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22135 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 22206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 24410 - 24481
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24410 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 24481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 4773 - 4825
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||    
T  4773 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaa 4825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University